View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15632_high_11 (Length: 374)

Name: NF15632_high_11
Description: NF15632
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15632_high_11
NF15632_high_11
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (37-374)||(3795539-3795877)
chr5 (43-374)||(33881133-33881464)
chr5 (42-374)||(30174471-30174804)
chr5 (43-374)||(18369355-18369686)
chr5 (64-374)||(11555382-11555691)
chr5 (41-374)||(37746151-37746484)
chr5 (48-374)||(43084270-43084596)
chr5 (25-374)||(37352467-37352816)
chr5 (41-374)||(37760987-37761321)
chr5 (63-368)||(6880331-6880636)
chr5 (25-368)||(28953609-28953952)
chr5 (43-374)||(8659295-8659625)
chr5 (25-368)||(33298522-33298869)
chr5 (42-368)||(41680710-41681037)
chr5 (25-374)||(9323466-9323814)
chr5 (42-374)||(13318651-13318982)
chr5 (58-374)||(18494591-18494906)
chr5 (25-374)||(12138165-12138513)
chr5 (43-374)||(24729977-24730308)
chr5 (65-374)||(30158063-30158372)
chr5 (41-374)||(28655247-28655581)
chr5 (42-374)||(40467376-40467708)
chr5 (25-374)||(32590099-32590447)
chr5 (64-374)||(9544530-9544842)
chr5 (42-374)||(13180616-13180944)
chr5 (25-374)||(31820233-31820580)
chr5 (41-368)||(37665315-37665642)
chr5 (41-374)||(15752681-15753008)
chr5 (36-374)||(33522382-33522721)
chr5 (43-374)||(11329644-11329977)
chr5 (25-374)||(22894405-22894753)
chr5 (41-374)||(30035431-30035763)
chr5 (41-374)||(13436497-13436836)
chr5 (25-374)||(2517054-2517404)
chr5 (64-374)||(23631997-23632309)
chr5 (64-374)||(5643828-5644136)
chr5 (25-374)||(26486385-26486723)
chr5 (42-374)||(34622524-34622857)
chr5 (41-368)||(18122245-18122572)
chr5 (41-374)||(31437469-31437795)
chr5 (25-374)||(25206266-25206622)
chr5 (25-374)||(25270422-25270778)
chr5 (41-368)||(22992953-22993272)
chr5 (41-368)||(15652589-15652914)
chr5 (64-374)||(23897902-23898206)
chr5 (41-368)||(33783492-33783814)
chr5 (64-368)||(24975877-24976175)
chr5 (41-365)||(24608250-24608570)
chr5 (42-374)||(30940642-30940968)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (25-374)||(32296574-32296924)
chr3 (42-374)||(5727940-5728273)
chr3 (42-374)||(47029415-47029748)
chr3 (42-374)||(5717030-5717363)
chr3 (42-374)||(5764095-5764428)
chr3 (25-374)||(28109917-28110271)
chr3 (63-374)||(31958421-31958734)
chr3 (42-374)||(10649033-10649365)
chr3 (63-374)||(5603279-5603592)
chr3 (63-374)||(24334156-24334469)
chr3 (25-374)||(29658934-29659283)
chr3 (41-374)||(8217593-8217928)
chr3 (36-374)||(4340642-4340980)
chr3 (42-374)||(51787984-51788316)
chr3 (25-368)||(4629730-4630072)
chr3 (25-368)||(21680646-21680988)
chr3 (25-368)||(29142726-29143072)
chr3 (41-374)||(5472949-5473281)
chr3 (42-374)||(4422880-4423212)
chr3 (25-374)||(18248683-18249032)
chr3 (42-374)||(4790599-4790932)
chr3 (25-374)||(28027236-28027583)
chr3 (41-374)||(10402110-10402442)
chr3 (42-374)||(18231155-18231487)
chr3 (41-368)||(22381553-22381879)
chr3 (41-374)||(22864814-22865145)
chr3 (41-374)||(22879873-22880204)
chr3 (25-374)||(20570812-20571161)
chr3 (63-374)||(28345154-28345464)
chr3 (25-374)||(48471872-48472225)
chr3 (42-374)||(5019675-5020006)
chr3 (74-374)||(5590327-5590627)
chr3 (41-374)||(17970832-17971163)
chr3 (36-374)||(17978916-17979255)
chr3 (49-368)||(18286327-18286645)
chr3 (49-368)||(18301628-18301946)
chr3 (25-374)||(16422128-16422477)
chr3 (41-374)||(20071994-20072329)
chr3 (41-374)||(6536709-6537042)
chr3 (58-374)||(11104327-11104644)
chr3 (25-374)||(16618455-16618808)
chr3 (41-374)||(7079183-7079521)
chr3 (74-368)||(31030217-31030504)
chr3 (43-368)||(18336591-18336910)
chr3 (64-368)||(6207884-6208184)
chr3 (42-374)||(18057222-18057557)
chr3 (25-374)||(19700431-19700792)
chr3 (48-368)||(32445122-32445433)
chr3 (64-368)||(4727617-4727915)
chr3 (42-368)||(15735072-15735393)
chr3 (41-374)||(5658095-5658425)
chr3 (64-368)||(35886748-35887048)
chr3 (42-374)||(4689613-4689939)
chr3 (42-368)||(8283430-8283767)
chr3 (41-151)||(15886894-15887006)
chr3 (42-127)||(8002522-8002607)
chr3 (180-374)||(15886707-15886895)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (41-374)||(12034-12366)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (25-374)||(3102-3453)
scaffold0159 (186-374)||(17949-18139)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (43-374)||(13518064-13518395)
chr6 (25-374)||(27284232-27284581)
chr6 (26-368)||(27623583-27623927)
chr6 (25-374)||(8899569-8899918)
chr6 (25-374)||(27355981-27356330)
chr6 (25-374)||(29555537-29555886)
chr6 (25-374)||(34458378-34458725)
chr6 (41-374)||(16755815-16756149)
chr6 (41-374)||(27063477-27063809)
chr6 (25-374)||(33370301-33370650)
chr6 (74-374)||(4763791-4764091)
chr6 (65-374)||(26110281-26110589)
chr6 (43-374)||(27491130-27491461)
chr6 (58-374)||(28166506-28166823)
chr6 (65-374)||(26772499-26772807)
chr6 (25-374)||(4539628-4539978)
chr6 (41-374)||(26791811-26792144)
chr6 (49-374)||(29579018-29579342)
chr6 (25-368)||(4531267-4531609)
chr6 (36-374)||(30551870-30552208)
chr6 (25-374)||(27200165-27200515)
chr6 (25-374)||(27248718-27249068)
chr6 (25-374)||(28213433-28213783)
chr6 (43-374)||(16680136-16680468)
chr6 (25-374)||(22928751-22929102)
chr6 (63-374)||(16937895-16938205)
chr6 (42-368)||(4778876-4779203)
chr6 (74-374)||(29507444-29507746)
chr6 (64-364)||(13292831-13293125)
chr6 (41-352)||(26926763-26927073)
chr6 (41-374)||(27013728-27014054)
chr6 (41-374)||(14139270-14139597)
chr6 (127-374)||(26666528-26666774)
chr6 (42-368)||(27031019-27031342)
chr6 (41-368)||(24869705-24870026)
chr6 (41-374)||(27208899-27209228)
chr6 (41-374)||(27240000-27240329)
chr6 (64-365)||(27025163-27025460)
chr6 (64-368)||(20174567-20174881)
chr6 (64-368)||(22161110-22161424)
chr6 (42-368)||(24299636-24299957)
chr6 (64-374)||(15406403-15406709)
chr6 (64-374)||(15418190-15418496)
chr6 (25-122)||(23851450-23851547)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (42-374)||(20332345-20332678)
chr4 (25-374)||(39856630-39856977)
chr4 (42-374)||(40099559-40099892)
chr4 (42-374)||(27157235-27157569)
chr4 (42-374)||(24586284-24586617)
chr4 (43-374)||(14104554-14104884)
chr4 (25-374)||(18794540-18794889)
chr4 (43-374)||(30759775-30760104)
chr4 (43-374)||(33667726-33668055)
chr4 (41-374)||(54839400-54839732)
chr4 (41-368)||(34182893-34183218)
chr4 (41-374)||(5700549-5700882)
chr4 (41-368)||(14753423-14753749)
chr4 (36-374)||(21975708-21976046)
chr4 (25-374)||(5011870-5012220)
chr4 (41-368)||(24118672-24118998)
chr4 (64-374)||(31120433-31120744)
chr4 (41-368)||(36338455-36338774)
chr4 (25-374)||(1906245-1906599)
chr4 (64-368)||(6575894-6576190)
chr4 (25-374)||(15276552-15276904)
chr4 (25-374)||(15380161-15380510)
chr4 (25-374)||(15233809-15234162)
chr4 (64-368)||(1673892-1674199)
chr4 (122-368)||(36324246-36324484)
chr4 (42-368)||(14671026-14671349)
chr4 (42-368)||(17019062-17019384)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (63-374)||(28355835-28356148)
chr8 (41-374)||(9360620-9360952)
chr8 (42-374)||(31360527-31360859)
chr8 (63-374)||(31483755-31484068)
chr8 (42-368)||(33248365-33248690)
chr8 (37-374)||(29835317-29835653)
chr8 (41-374)||(18796704-18797038)
chr8 (25-374)||(19680430-19680778)
chr8 (25-374)||(12086608-12086958)
chr8 (74-374)||(33264762-33265061)
chr8 (64-374)||(44567002-44567314)
chr8 (41-374)||(18715478-18715813)
chr8 (74-374)||(15773605-15773905)
chr8 (25-374)||(19202260-19202598)
chr8 (64-374)||(21342055-21342366)
chr8 (68-374)||(19911047-19911355)
chr8 (25-301)||(16260205-16260480)
chr8 (25-374)||(22074814-22075164)
chr8 (25-368)||(27602805-27603141)
chr8 (41-374)||(19655232-19655562)
chr8 (42-368)||(2131159-2131479)
chr8 (42-368)||(19694094-19694416)
chr8 (41-374)||(22138904-22139231)
chr8 (67-368)||(14569180-14569479)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (42-374)||(254565-254897)
chr2 (42-374)||(37945778-37946111)
chr2 (41-374)||(27809697-27810032)
chr2 (42-374)||(13930457-13930791)
chr2 (64-374)||(12661558-12661867)
chr2 (63-374)||(22922056-22922369)
chr2 (42-374)||(16167475-16167807)
chr2 (41-374)||(12592806-12593143)
chr2 (42-374)||(37931369-37931708)
chr2 (41-374)||(3788490-3788822)
chr2 (63-374)||(39896087-39896397)
chr2 (63-374)||(19410397-19410710)
chr2 (25-374)||(12710514-12710863)
chr2 (25-368)||(40239489-40239831)
chr2 (41-374)||(37383673-37384006)
chr2 (25-374)||(27782212-27782561)
chr2 (74-374)||(27122554-27122852)
chr2 (43-374)||(34867681-34868011)
chr2 (25-374)||(37679804-37680155)
chr2 (25-374)||(37695069-37695420)
chr2 (42-374)||(9343900-9344232)
chr2 (42-374)||(39045735-39046067)
chr2 (36-374)||(16823250-16823588)
chr2 (36-374)||(16897892-16898230)
chr2 (25-374)||(21671083-21671435)
chr2 (41-374)||(32055798-32056130)
chr2 (41-374)||(34160840-34161175)
chr2 (25-368)||(11629104-11629446)
chr2 (42-374)||(31882284-31882615)
chr2 (36-374)||(21697086-21697427)
chr2 (93-371)||(31868702-31868979)
chr2 (41-374)||(34297152-34297478)
chr2 (25-374)||(27396303-27396662)
chr2 (41-374)||(34268839-34269167)
chr2 (25-374)||(19450331-19450689)
chr2 (41-368)||(28888275-28888597)
chr2 (42-368)||(23122497-23122818)
chr2 (41-374)||(27428366-27428692)
chr2 (64-368)||(20843931-20844235)
chr2 (293-374)||(23117044-23117125)
chr2 (42-98)||(31887682-31887738)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (74-374)||(10968698-10968999)
chr1 (42-374)||(3647147-3647479)
chr1 (58-374)||(10951108-10951425)
chr1 (25-374)||(51644204-51644555)
chr1 (43-374)||(28591085-28591415)
chr1 (42-374)||(41787232-41787566)
chr1 (41-374)||(28155726-28156061)
chr1 (25-374)||(20334338-20334689)
chr1 (25-374)||(16201950-16202307)
chr1 (25-374)||(20466761-20467118)
chr1 (25-368)||(21891691-21892020)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (63-374)||(4139054-4139367)
chr7 (25-374)||(16745329-16745679)
chr7 (31-371)||(26441238-26441579)
chr7 (42-374)||(26663721-26664054)
chr7 (42-374)||(26678913-26679246)
chr7 (25-374)||(5141143-5141493)
chr7 (42-374)||(39206948-39207280)
chr7 (63-374)||(24586344-24586654)
chr7 (42-374)||(31558203-31558535)
chr7 (25-374)||(11446867-11447216)
chr7 (42-374)||(26518789-26519119)
chr7 (64-374)||(5164402-5164712)
chr7 (41-374)||(26509504-26509839)
chr7 (65-374)||(45393238-45393547)
chr7 (25-374)||(4205368-4205717)
chr7 (25-374)||(26313658-26314006)
chr7 (25-374)||(3451297-3451647)
chr7 (41-374)||(5154079-5154411)
chr7 (25-374)||(31084431-31084781)
chr7 (41-374)||(45737296-45737631)
chr7 (25-374)||(26268894-26269247)
chr7 (64-374)||(11418588-11418898)
chr7 (25-374)||(16047294-16047640)
chr7 (128-374)||(26595750-26595998)
chr7 (39-368)||(16443818-16444148)
chr7 (42-374)||(2160566-2160900)
chr7 (41-374)||(2779247-2779574)
chr7 (41-374)||(31129900-31130227)
chr7 (25-374)||(10847562-10847915)
chr7 (41-368)||(16512255-16512576)
chr7 (64-374)||(10910735-10911039)
chr7 (42-127)||(26531926-26532011)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (41-374)||(9565-9897)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (25-374)||(1639-1988)
scaffold0322 (25-374)||(12028-12388)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (41-374)||(8852-9184)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (42-374)||(18584-18918)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (25-374)||(13931-14281)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (25-374)||(15551-15907)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (41-374)||(9912-10244)
scaffold0143 (41-368)||(33295-33619)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (41-374)||(4526-4862)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (25-374)||(25097-25454)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (42-368)||(6065-6388)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (64-368)||(24835-25135)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (25-203)||(359-537)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (25-187)||(26243-26405)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (257-374)||(1-118)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (90-181)||(40759-40855)
scaffold0099 (322-368)||(40559-40606)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 37 - 374
Target Start/End: Original strand, 3795539 - 3795877
Alignment:
Q  37 tctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 136  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795539 tctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 3795638  T
Q  137 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-tttttcttctactttcaaagctatat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3795639 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttttcttctactttcaaagctatat 3795738  T
Q  236 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795739 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 3795838  T
Q  336 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795839 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 3795877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 43 - 374
Target Start/End: Original strand, 33881133 - 33881464
Alignment:
Q  43 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 142  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881133 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 33881232  T
Q  143 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  33881233 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttttccactttcaaagctatatacaaaac 33881332  T
Q  243 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881333 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 33881432  T
Q  343 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881433 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 33881464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Original strand, 30174471 - 30174804
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174471 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 30174570  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30174571 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 30174670  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174671 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 30174770  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30174771 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatg 30174804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 43 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18369686 - 18369355
Alignment:
Q  43 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 142  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369686 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 18369587  T
Q  143 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 242  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369586 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaccttcgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 18369487  T
Q  243 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 342  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369486 attttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 18369387  T
Q  343 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369386 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 18369355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 64 - 374
Target Start/End: Original strand, 11555382 - 11555691
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccacc 163  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11555382 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 11555481  T
Q  164 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataa 263  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555482 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataa 11555580  T
Q  264 tgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555581 tgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttcttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 11555680  T
Q  364 gcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||    
T  11555681 gcgagagtatg 11555691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37746484 - 37746151
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37746484 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 37746385  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  37746384 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttctttttactttcaaagctatatacaaa 37746285  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746284 acattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 37746185  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37746184 acattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatg 37746151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 48 - 374
Target Start/End: Original strand, 43084270 - 43084596
Alignment:
Q  48 gaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 147  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084270 gaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 43084369  T
Q  148 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  43084370 cctttggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctattttcaaagttatatacaaaaatattt 43084468  T
Q  247 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084469 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaagttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 43084568  T
Q  347 aaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43084569 aaatgaaacatgcatgaacgagagtatg 43084596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37352816 - 37352467
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||| ||| |||||  |||||| ||||| | |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352816 tcatcaaaagcttctgcacttgtggattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 37352717  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37352716 ctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 37352618  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37352617 caaagctatatacaaaacattttccttccatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagca 37352518  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352517 aacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 37352467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 37760987 - 37761321
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  37760987 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgcgg 37761086  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761087 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 37761185  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37761186 acattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 37761285  T
Q  339 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761286 gcacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 37761321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 63 - 368
Target Start/End: Original strand, 6880331 - 6880636
Alignment:
Q  63 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccac 162  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6880331 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 6880430  T
Q  163 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgata 262  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6880431 cactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aagactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttcttcctattttgata 6880529  T
Q  263 atgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 361  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880530 atgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 6880629  T
Q  362 gagcgag 368  Q
    |||||||    
T  6880630 gagcgag 6880636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 25 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 28953952 - 28953609
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953952 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28953853  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28953852 ctttgtaaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 28953754  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28953753 caaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgggaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagc 28953654  T
Q  323 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28953653 aaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 28953609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 43 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 8659625 - 8659295
Alignment:
Q  43 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 142  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8659625 cttgtgaattcaaagtttc-gggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattcgccaagctttgtgaatccgtggag 8659527  T
Q  143 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 242  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8659526 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgtttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 8659428  T
Q  243 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8659427 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 8659328  T
Q  342 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8659327 caatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 8659295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 25 - 368
Target Start/End: Original strand, 33298522 - 33298869
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298522 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 33298621  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-tttttcttctactt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  33298622 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttttttctactt 33298721  T
Q  224 tcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctatttt--gaaaa 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  33298722 tcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaaa 33298821  T
Q  321 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298822 acaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 33298869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 42 - 368
Target Start/End: Original strand, 41680710 - 41681037
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680710 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 41680809  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 240  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41680810 gtcgtgcccttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 41680909  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 339  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680910 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 41681009  T
Q  340 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41681010 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 41681037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 9323466 - 9323814
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttcc-gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 123  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323466 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 9323565  T
Q  124 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  9323566 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattt 9323663  T
Q  224 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9323664 tcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagca 9323763  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9323764 aacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatg 9323814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13318982 - 13318651
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13318982 gcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgttatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 13318883  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  13318882 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 13318784  T
Q  242 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318783 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 13318684  T
Q  342 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318683 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 13318651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 58 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18494906 - 18494591
Alignment:
Q  58 tttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctg 157  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  18494906 tttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccg 18494807  T
Q  158 accaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   | |||||| ||||||    
T  18494806 accaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttt-cttctactttcaaagctatatacaatttactttcttcctattt 18494708  T
Q  258 tgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacat 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494707 tgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacat 18494608  T
Q  358 gcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||    
T  18494607 gcatgagcgagagtatg 18494591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 12138165 - 12138513
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttcc-gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 123  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||| | |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138165 tcatctgaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 12138264  T
Q  124 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  12138265 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattt 12138362  T
Q  224 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12138363 tcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagca 12138462  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12138463 aacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatg 12138513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 43 - 374
Target Start/End: Original strand, 24729977 - 24730308
Alignment:
Q  43 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 142  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24729977 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 24730076  T
Q  143 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 242  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24730077 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttg-aaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaat 24730174  T
Q  243 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24730175 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 24730274  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24730275 acaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 24730308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 65 - 374
Target Start/End: Original strand, 30158063 - 30158372
Alignment:
Q  65 gaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccacca 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30158063 gaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccacca 30158162  T
Q  165 ctcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 264  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30158163 ctcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctacctttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataat 30158261  T
Q  265 gacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 363  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30158262 gacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatga 30158361  T
Q  364 gcgagagtatg 374  Q
    |||||| ||||    
T  30158362 gcgagaatatg 30158372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 28655247 - 28655581
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655247 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 28655346  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655347 agtcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 28655444  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgtaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 337  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655445 acattttctttctattttaataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 28655544  T
Q  338 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655545 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 28655581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 40467708 - 40467376
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  40467708 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgtgga 40467609  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  40467608 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaa 40467510  T
Q  242 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467509 cattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 40467410  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467409 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 40467376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 32590447 - 32590099
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||| | ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590447 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 32590348  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  32590347 ctttgtgaattcgtggggtcatgcctttggccgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ctttcttctacttt 32590250  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 323  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590249 caaagctatatacaaatcattttctttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 32590150  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590149 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 32590099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 64 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9544842 - 9544530
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccacc 163  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9544842 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 9544743  T
Q  164 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataa 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9544742 actcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataa 9544645  T
Q  264 tgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgc 359  Q
    |||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544644 tgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgc 9544545  T
Q  360 atgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||    
T  9544544 atgagcgagagtatg 9544530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13180944 - 13180616
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13180944 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 13180845  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180844 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 13180745  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180744 acattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 13180650  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180649 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 13180616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31820580 - 31820233
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820580 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 31820481  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  31820480 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctatttt 31820383  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31820382 caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaa 31820283  T
Q  325 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31820282 acctgagcaacaaggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 31820233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 41 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 37665642 - 37665315
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37665642 tgcttgcgaattcaaaatttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 37665543  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37665542 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaa 37665444  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  37665443 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttaaaaagcaaacctgagcaacagg 37665344  T
Q  339 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37665343 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 37665315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15753008 - 15752681
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15753008 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 15752909  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752908 agtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 15752811  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752810 acattttctttc----ttgataatgacaatacttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 15752715  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752714 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 15752681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 36 - 374
Target Start/End: Original strand, 33522382 - 33522721
Alignment:
Q  36 ttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 135  Q
    |||||| |||||| ||||| | || || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522382 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 33522481  T
Q  136 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctata 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||||||||||    
T  33522482 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttg-aaactctgttttcttttttactttcaaagctata 33522580  T
Q  235 tac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 333  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33522581 tacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagca 33522680  T
Q  334 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33522681 acagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 33522721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 43 - 374
Target Start/End: Original strand, 11329644 - 11329977
Alignment:
Q  43 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 142  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329644 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 11329743  T
Q  143 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct--atatacaaa 240  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  11329744 tcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgttttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctaaatatacaat 11329842  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 339  Q
      |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329843 ttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 11329942  T
Q  340 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329943 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 11329977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 22894405 - 22894753
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894405 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 22894504  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||    
T  22894505 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aaactctactttctttctacttt 22894603  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaa-ctttttgtctattttgaaaagca 323  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  22894604 caaagctatgtacaaaatattttctttctattttgataatgaccatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaggtttttgtctattttg-aaagca 22894702  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  22894703 aacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtatg 22894753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 30035431 - 30035763
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30035431 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 30035530  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30035531 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 30035628  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30035629 acattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 30035728  T
Q  340 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30035729 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 30035763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13436836 - 13436497
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 139  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436836 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtg 13436737  T
Q  140 gagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatataca 238  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13436736 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttttcttctactttcaaagctatataca 13436638  T
Q  239 aaacatttt-ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgt----aaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 333  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436637 aaacatttttctttctattttgataatggcaacgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 13436538  T
Q  334 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436537 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 13436497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 2517054 - 2517404
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517054 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 2517153  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | | |||| ||||||||||||||    
T  2517154 ctttgtgaatccgtggagtcatgccctcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-agattcta-ttttcttctacttt 2517251  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517252 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 2517351  T
Q  322 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  2517352 caaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatg 2517404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 64 - 374
Target Start/End: Original strand, 23631997 - 23632309
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccacc 163  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23631997 ggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagcttcgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 23632096  T
Q  164 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataa 263  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632097 actcttatgcatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataa 23632195  T
Q  264 tgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaa--ctttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 360  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632196 tgacaatgcttgaaataaacatcttgaaaattgaaaaagctttttgtctatttttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 23632295  T
Q  361 tgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||| |||||    
T  23632296 tgagcgagtgtatg 23632309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 64 - 374
Target Start/End: Original strand, 5643828 - 5644136
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccacc 163  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5643828 ggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 5643927  T
Q  164 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5643928 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta-ttttcttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataa 5644025  T
Q  264 tgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 362  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5644026 tgacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaatcgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatg 5644124  T
Q  363 agcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||    
T  5644125 agcgagagtatg 5644136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 26486385 - 26486723
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttcc-gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 123  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486385 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 26486484  T
Q  124 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||           ||    
T  26486485 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctat-----------tt 26486572  T
Q  224 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26486573 tcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagca 26486672  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  26486673 aacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatg 26486723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Original strand, 34622524 - 34622857
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    ||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34622524 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtgg 34622623  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||  || ||||||||||||||||||||||    
T  34622624 agtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaa 34622722  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622723 acattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 34622822  T
Q  340 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622823 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 34622857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 41 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18122572 - 18122245
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18122572 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 18122473  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaa 239  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18122472 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttttttctactttcaaagctatatacaa 18122374  T
Q  240 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 338  Q
       |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122373 tttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgagaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 18122274  T
Q  339 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18122273 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 18122245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 31437469 - 31437795
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31437469 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 31437568  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||    
T  31437569 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaa 31437667  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437668 acattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 31437761  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31437762 acattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatg 31437795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 25206266 - 25206622
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 123  Q
    |||||||||| | || || ||| ||||||||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25206266 tcatcagaagctcctatgtttgcgaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 25206365  T
Q  124 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 223  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || |||||    
T  25206366 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttactt 25206464  T
Q  224 tcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaa-----ctttttgtctatttt 315  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||      ||||||||||||||    
T  25206465 tcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctatttt 25206564  T
Q  316 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  25206565 g-aaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatg 25206622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 25270422 - 25270778
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 123  Q
    |||||||||| | || || ||| ||||||||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25270422 tcatcagaagctcctatgtttgcgaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 25270521  T
Q  124 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 223  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || |||||    
T  25270522 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttactt 25270620  T
Q  224 tcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaa-----ctttttgtctatttt 315  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||      ||||||||||||||    
T  25270621 tcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctatttt 25270720  T
Q  316 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  25270721 g-aaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatg 25270778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 41 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22993272 - 22992953
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||| | |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22993272 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtatcgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 22993173  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||    
T  22993172 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaa 22993074  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22993073 acattttctttctattttgataatgatgatgctcgaaacaagcattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 22992980  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22992979 acattcaaatg-aacatgcatgagcgag 22992953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 41 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15652914 - 15652589
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15652914 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 15652815  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||    
T  15652814 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaa 15652716  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| | | |    ||||||||||||||||||||||||    
T  15652715 acattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttttttttttaaaaaaaagcaaacctgagcaacagggt 15652616  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15652615 acattcaaatg-aacatgcatgagcgag 15652589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 64 - 374
Target Start/End: Original strand, 23897902 - 23898206
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccacc 163  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||    
T  23897902 ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaattcatggagtcacgccttcggctgaccacc 23898001  T
Q  164 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac----aaaacattttctttctattttg 259  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||     
T  23898002 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaaaacattttctttctatttta 23898100  T
Q  260 ataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatg 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23898101 ataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttg----------aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatg 23898190  T
Q  359 catgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||| |||||    
T  23898191 catgagcgagtgtatg 23898206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 368
Target Start/End: Original strand, 33783492 - 33783814
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33783492 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 33783591  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 239  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||    
T  33783592 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaa 33783690  T
Q  240 aacattttctttcta--ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 336  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||       |||||||||||||||| ||||||||    
T  33783691 aacattttccttctattttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaaccggagcaaca 33783783  T
Q  337 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  33783784 gggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 33783814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 64 - 368
Target Start/End: Original strand, 24975877 - 24976175
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccacc 163  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24975877 ggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 24975976  T
Q  164 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgat 261  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||    
T  24975977 actcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaat 24976075  T
Q  262 aatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 360  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||| |||  |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24976076 aatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattggaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaatatgca 24976167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 41 - 365
Target Start/End: Original strand, 24608250 - 24608570
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 139  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24608250 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 24608349  T
Q  140 gagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaa 239  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||   |||  || ||||||||||| ||| |||||    
T  24608350 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgcttttgtttgaaa-ctccgctttctttttactttcaaagttatgtacaa 24608448  T
Q  240 aa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 336  Q
    || ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||    
T  24608449 aaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaaca 24608541  T
Q  337 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagc 365  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24608542 gggtacattcaaacaaaacatgcatgagc 24608570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Original strand, 30940642 - 30940968
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  30940642 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtgg 30940741  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||  |||  || ||||||||||| ||| ||||||    
T  30940742 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctgtgcttttgtttgaaat-tctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaa 30940840  T
Q  241 a-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 337  Q
    | ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |        ||||||||||||||||||||||||||    
T  30940841 aacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacag 30940932  T
Q  338 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  30940933 ggtacattcaaaag-aacatgcatgagcgagtgtatg 30940968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 32296574 - 32296924
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296574 tcatcagaagtttctgcgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 32296673  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-tttttcttctactt 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  32296674 ctttgtgaatccgtggagtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttttcttctactt 32296773  T
Q  224 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296774 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 32296873  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32296874 aacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagtgagagtatg 32296924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Original strand, 5727940 - 5728273
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5727940 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5728039  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5728040 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5728139  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728140 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 5728239  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5728240 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatg 5728273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Original strand, 47029415 - 47029748
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029415 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 47029514  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47029515 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 47029614  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029615 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 47029714  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47029715 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatg 47029748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Original strand, 5717030 - 5717363
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717030 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5717129  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5717130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5717229  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717230 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 5717329  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5717330 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatg 5717363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5764428 - 5764095
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764428 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5764329  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5764328 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5764229  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764228 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 5764129  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5764128 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatg 5764095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 28110271 - 28109917
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttcc-gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 123  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110271 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 28110172  T
Q  124 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28110171 gctttatgaatccgtggagtcatgccttgggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactt 28110072  T
Q  224 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac----attttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110071 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacgttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 28109972  T
Q  320 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28109971 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 28109917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 63 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31958734 - 31958421
Alignment:
Q  63 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccac 162  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31958734 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 31958635  T
Q  163 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958634 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 31958535  T
Q  261 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31958534 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgca 31958435  T
Q  361 tgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||    
T  31958434 tgagcgagagtatg 31958421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Original strand, 10649033 - 10649365
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649033 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 10649132  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  10649133 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaa 10649231  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649232 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 10649331  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10649332 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatg 10649365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 63 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5603592 - 5603279
Alignment:
Q  63 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccac 162  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5603592 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 5603493  T
Q  163 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603492 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 5603393  T
Q  261 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5603392 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaataaaacatgca 5603293  T
Q  361 tgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||    
T  5603292 tgagcgagagtatg 5603279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 63 - 374
Target Start/End: Original strand, 24334156 - 24334469
Alignment:
Q  63 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccac 162  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24334156 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 24334255  T
Q  163 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24334256 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttga 24334355  T
Q  261 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24334356 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgca 24334455  T
Q  361 tgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||    
T  24334456 tgagcgagagtatg 24334469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 29659283 - 29658934
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659283 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29659184  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29659183 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 29659085  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  29659084 caaagttatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagca 29658985  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658984 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 29658934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 8217593 - 8217928
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8217593 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtggatccgtgg 8217692  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8217693 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaa 8217791  T
Q  240 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 337  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217792 aatattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 8217891  T
Q  338 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217892 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 8217928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 36 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4340980 - 4340642
Alignment:
Q  36 ttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 135  Q
    |||||| |||||| ||||| | ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340980 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 4340881  T
Q  136 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatat 235  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4340880 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatat 4340782  T
Q  236 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 334  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4340781 acaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaa 4340682  T
Q  335 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340681 cagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 4340642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Original strand, 51787984 - 51788316
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51787984 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 51788083  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788084 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 51788182  T
Q  242 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788183 tattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 51788282  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788283 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 51788316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 25 - 368
Target Start/End: Original strand, 4629730 - 4630072
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629730 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 4629829  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4629830 ctttgttaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 4629928  T
Q  225 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 323  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629929 caaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 4630028  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4630029 aacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 4630072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 25 - 368
Target Start/End: Original strand, 21680646 - 21680988
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680646 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 21680745  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21680746 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 21680844  T
Q  225 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 323  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680845 caaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 21680944  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21680945 aacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 21680988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 25 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 29143072 - 29142726
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29143072 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29142973  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  29142972 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttttttctacttt 29142873  T
Q  225 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctatttt--gaaaag 321  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||     
T  29142872 caaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaaaa 29142773  T
Q  322 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142772 caaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 29142726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 5472949 - 5473281
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5472949 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 5473048  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473049 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5473147  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 339  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473148 acattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 5473246  T
Q  340 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473247 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 5473281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Original strand, 4422880 - 4423212
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4422880 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 4422979  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 241  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4422980 gtcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaat 4423078  T
Q  242 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423079 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 4423178  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423179 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 4423212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 18248683 - 18249032
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18248683 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgag 18248782  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18248783 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccatcactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttg-gaactctatttttcttctacttt 18248881  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 323  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18248882 caaagctacatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagca 18248981  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248982 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 18249032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4790932 - 4790599
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    ||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4790932 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 4790833  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790832 attcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 4790734  T
Q  241 a-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 339  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790733 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 4790634  T
Q  340 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790633 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 4790599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 28027236 - 28027583
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||| | ||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027236 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28027335  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  28027336 ctttgtgaatccgtggagtcaggcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaattctatttt-cttctacttt 28027433  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 324  Q
    |||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027434 caaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 28027533  T
Q  325 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027534 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 28027583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 10402110 - 10402442
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10402110 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 10402209  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10402210 agtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaattctattttt-ttctactttcaaagctatatacaaa 10402307  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402308 acattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 10402407  T
Q  340 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402408 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 10402442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Original strand, 18231155 - 18231487
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18231155 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagatttgcgaatccgtgga 18231254  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18231255 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgttt-aaaactctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaa 18231353  T
Q  242 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18231354 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggt 18231453  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18231454 acagtcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 18231487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 41 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22381879 - 22381553
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381879 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 22381780  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381779 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 22381681  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  22381680 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacagtg 22381581  T
Q  340 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22381580 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 22381553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22865145 - 22864814
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22865145 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 22865046  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatt-tttcttctactttcaaagctatatacaa 239  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22865045 agtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa---ctatgctttcttctactttcaaagctgtatacaa 22864949  T
Q  240 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22864948 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 22864849  T
Q  340 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22864848 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 22864814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22880204 - 22879873
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22880204 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 22880105  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatt-tttcttctactttcaaagctatatacaa 239  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22880104 agtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa---ctatgctttcttctactttcaaagctgtatacaa 22880008  T
Q  240 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880007 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 22879908  T
Q  340 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22879907 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 22879873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 20571161 - 20570812
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20571161 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 20571062  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  20571061 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctatttt 20570963  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20570962 caaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagca 20570863  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20570862 aacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcaagtgtatg 20570812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 63 - 374
Target Start/End: Original strand, 28345154 - 28345464
Alignment:
Q  63 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccac 162  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28345154 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 28345253  T
Q  163 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgata 262  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28345254 cactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgata 28345351  T
Q  263 atgacaatgcttgaaacaaacattttg-taaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345352 atgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 28345451  T
Q  362 gagcgagagtatg 374  Q
    ||||||| |||||    
T  28345452 gagcgagggtatg 28345464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 48471872 - 48472225
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||| ||||| ||  ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48471872 tcatcaaaagttcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 48471971  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48471972 ctttgtaaatccatggagtcacgccctcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 48472070  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgt-----aaattgaaaactttttgtctattttgaaa 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48472071 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttttaaaaattgaaaactttctgtctattttgaaa 48472170  T
Q  320 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472171 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 48472225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Original strand, 5019675 - 5020006
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5019675 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 5019774  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 241  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  5019775 gtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactcta-ctttcttctactttcaaagctatatacaaat 5019872  T
Q  242 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019873 cattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 5019972  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019973 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 5020006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 74 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5590627 - 5590327
Alignment:
Q  74 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatac 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5590627 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 5590528  T
Q  174 atcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgc 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590527 atcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgc 5590429  T
Q  273 ttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 372  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5590428 ttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagta 5590329  T
Q  373 tg 374  Q
    ||    
T  5590328 tg 5590327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17971163 - 17970832
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971163 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 17971064  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  17971063 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaat 17970966  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970965 ttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 17970866  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970865 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 17970832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 36 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17979255 - 17978916
Alignment:
Q  36 ttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 135  Q
    |||||| |||||| ||||| | || || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979255 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 17979156  T
Q  136 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatat 235  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  17979155 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttg-aaactctgttttctttttactttcaaagctatat 17979057  T
Q  236 ac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctgagca 333  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17979056 acaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagcaaacctgagca 17978957  T
Q  334 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  17978956 acagggtacattcaaaggaaatatgcatgagcgagggtatg 17978916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 49 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18286645 - 18286327
Alignment:
Q  49 aattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 148  Q
    |||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18286645 aattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 18286546  T
Q  149 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 248  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286545 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 18286448  T
Q  249 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18286447 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattc 18286348  T
Q  347 aaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  18286347 aaatg-aacatgcatgagcgag 18286327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 49 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18301946 - 18301628
Alignment:
Q  49 aattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 148  Q
    |||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18301946 aattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 18301847  T
Q  149 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 248  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301846 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 18301749  T
Q  249 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18301748 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattc 18301649  T
Q  347 aaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  18301648 aaatg-aacatgcatgagcgag 18301628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 16422128 - 16422477
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422128 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccgg-aaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16422226  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||    
T  16422227 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aaactctactttctttctacttt 16422325  T
Q  225 caaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaag 321  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||| ||||||| ||||    
T  16422326 caaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtgtattttg-aaag 16422424  T
Q  322 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16422425 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatg 16422477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 20071994 - 20072329
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20071994 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 20072093  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072094 agtcacaccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 20072191  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 336  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072192 acattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 20072291  T
Q  337 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072292 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 20072329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6537042 - 6536709
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6537042 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 6536943  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||    
T  6536942 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaa 6536844  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536843 acattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 6536744  T
Q  340 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6536743 tacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatg 6536709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 58 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 11104644 - 11104327
Alignment:
Q  58 tttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctg 157  Q
    ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  11104644 tttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagccacgccttcggctg 11104545  T
Q  158 accaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagcta--tatacaaaacattttctttctat 255  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||  |||||||   |||||| ||||||    
T  11104544 actaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctattttctttttactttcaaagctaaatatacaatttattttccttctat 11104446  T
Q  256 tttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaac 355  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104445 tttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaac 11104346  T
Q  356 atgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11104345 atgcatgagcgagagtatg 11104327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16618808 - 16618455
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618808 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16618709  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  |||||||||    
T  16618708 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactttctttctacttt 16618610  T
Q  225 caaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattg---aaaactttttgtctattttgaa 318  Q
    ||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   |||| |||||||| |||||| |    
T  16618609 caaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtccattttg-a 16618511  T
Q  319 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16618510 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatg 16618455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 7079183 - 7079521
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7079183 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 7079282  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagc----tatata 236  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| ||||  || ||||||||||||    ||||||    
T  7079283 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctg-aaactctgttttctttttactttcaaagctatatatata 7079381  T
Q  237 caaaacattttctttctatt-ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaatt-gaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 334  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079382 caaaacattttctttctattcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattaaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 7079481  T
Q  335 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079482 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 7079521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 74 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 31030504 - 31030217
Alignment:
Q  74 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatac 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  31030504 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 31030405  T
Q  174 atcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgct 273  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31030404 gtcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgct 31030306  T
Q  274 tgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31030305 cgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 31030217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 43 - 368
Target Start/End: Original strand, 18336591 - 18336910
Alignment:
Q  43 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    |||| ||||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18336591 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 18336690  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 241  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18336691 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 18336789  T
Q  242 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18336790 cattttctttctattatgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 18336884  T
Q  342 cattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18336885 cattcaaatg-aacatgcatgagcgag 18336910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 64 - 368
Target Start/End: Original strand, 6207884 - 6208184
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccac 162  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6207884 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 6207983  T
Q  163 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttcta-ttttgat 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  6207984 cactcttatacgtcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctatttttaat 6208083  T
Q  262 aatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 360  Q
    |||||| || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6208084 aatgacaaaggctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgca 6208176  T
Q  361 tgagcgag 368  Q
    ||||||||    
T  6208177 tgagcgag 6208184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Original strand, 18057222 - 18057557
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18057222 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 18057321  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 239  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||    
T  18057322 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaa 18057420  T
Q  240 aacattttctttcta-ttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 337  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18057421 aacattttccttctatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacag 18057520  T
Q  338 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18057521 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatg 18057557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 19700431 - 19700792
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||||||| | || || ||| ||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19700431 tcatcagaagctcctatgtttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 19700530  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||    
T  19700531 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttaagcctgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttacttt 19700629  T
Q  225 caaagctatatac-----------aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaa--ctttttgtct 310  Q
    ||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||    
T  19700630 caaagctatgtacaaaaaaaaaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtct 19700729  T
Q  311 attttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19700730 attttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatg 19700792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 48 - 368
Target Start/End: Original strand, 32445122 - 32445433
Alignment:
Q  48 gaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 147  Q
    ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  32445122 gaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 32445221  T
Q  148 cctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttt 247  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32445222 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatatacaaaacatttt 32445320  T
Q  248 ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 347  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32445321 ctttctgttttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 32445413  T
Q  348 aatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  32445414 aatg-aacatgcatgagcgag 32445433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 64 - 368
Target Start/End: Original strand, 4727617 - 4727915
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccacc 163  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4727617 ggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 4727716  T
Q  164 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttcta-ttttgata 262  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  4727717 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatttttaata 4727815  T
Q  263 atgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 361  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4727816 atgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcat 4727908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 42 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15735393 - 15735072
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735393 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 15735294  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 240  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||| ||||||||||| ||| ||| |||    
T  15735293 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct-gctttcttttactttcaaagttatgtacaaaa 15735196  T
Q  241 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 338  Q
    |||||| | ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  15735195 acatttcccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 15735101  T
Q  339 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15735100 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 15735072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 5658095 - 5658425
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5658095 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 5658194  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatac--atcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac- 237  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||| |||     
T  5658195 agtcaggccttcggctgaccaccactcttatacatatcattttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctattttccttttactttcaacgttatgtaca 5658293  T
Q  238 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 335  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||  |||      ||||||||||||||||| ||||||    
T  5658294 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctaagcaac 5658387  T
Q  336 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  5658388 agggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatg 5658425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 64 - 368
Target Start/End: Original strand, 35886748 - 35887048
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccac 162  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  35886748 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 35886847  T
Q  163 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttga 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |    
T  35886848 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaa 35886946  T
Q  261 taatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgc 359  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||      |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| |    
T  35886947 taatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgtgtaacagggtacattcaaacg-aacatac 35887039  T
Q  360 atgagcgag 368  Q
    |||||||||    
T  35887040 atgagcgag 35887048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Original strand, 4689613 - 4689939
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  4689613 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgcgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtgg 4689712  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 239  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||| ||||||| ||| ||| ||| ||    
T  4689713 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct-gctttcttttactttctaagttatgtacaaa 4689810  T
Q  240 aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 337  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  4689811 aacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacag 4689903  T
Q  338 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  4689904 ggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatg 4689939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 8283767 - 8283430
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283767 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 8283668  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||   |||  || ||||||||||| ||| |||||||    
T  8283667 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgtttttgtttgaaa-ctccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 8283569  T
Q  242 -cattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaa---------ctttttgtctattttgaaaagcaaacctg 329  Q
     ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||          ||||| | | ||||| ||||||||||||    
T  8283568 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttttttttttttttttttttggaaagcaaacctg 8283469  T
Q  330 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8283468 agcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgag 8283430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15887006 - 15886894
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgt-gaatccgt 138  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15887006 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaaatccgt 15886907  T
Q  139 ggagtcatgcctt 151  Q
    ||||||| |||||    
T  15886906 ggagtcacgcctt 15886894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 127
Target Start/End: Original strand, 8002522 - 8002607
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 127  Q
    ||||| ||||||| | ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002522 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 8002607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15886895 - 15886707
Alignment:
Q  180 ttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttga-taatgacaa-tgcttga 276  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||| ||| |||||||  | |||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||    
T  15886895 ttgagcctgtgtttttgtttgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaatactttccttctatttttaataatgacaaatgctcga 15886797  T
Q  277 aacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||  ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  15886796 agcaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-------ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatg 15886707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 12034 - 12366
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12034 tgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 12133  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12134 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatataaa 12232  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12233 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 12332  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12333 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 12366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3102
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3453 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 3354  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattt--ttcttctact 222  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  3353 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctact 3254  T
Q  223 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3253 ttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagc 3154  T
Q  323 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3153 aaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 3102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 186 - 374
Target Start/End: Original strand, 17949 - 18139
Alignment:
Q  186 ctttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 283  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17949 ctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 18048  T
Q  284 attttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18049 attttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 18139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 43 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13518395 - 13518064
Alignment:
Q  43 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 142  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518395 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 13518296  T
Q  143 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13518295 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttttccactttcaaagctatatacaaaac 13518196  T
Q  243 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518195 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 13518096  T
Q  343 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518095 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 13518064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 27284581 - 27284232
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284581 tcatctgaagcttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27284482  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactt 223  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27284481 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttttcttctactt 27284383  T
Q  224 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284382 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 27284283  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284282 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 27284232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 26 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27623927 - 27623583
Alignment:
Q  26 catcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagc 125  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623927 catcagaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagc 27623828  T
Q  126 tttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctat-ttttcttctacttt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27623827 tttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctacttt 27623728  T
Q  225 caaagctatatacaaaaca-ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 323  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623727 caaagctatatacaaaacatttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 27623628  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623627 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 27623583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 8899918 - 8899569
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899918 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 8899819  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8899818 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 8899720  T
Q  225 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 323  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899719 caaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 8899620  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8899619 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 8899569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 27356330 - 27355981
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356330 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27356231  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27356230 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 27356132  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27356131 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagca 27356032  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356031 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 27355981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 29555537 - 29555886
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555537 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29555636  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| ||||  || ||||||    
T  29555637 ctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctg-aaactctgttttctttttacttt 29555735  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29555736 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttagaaaattaaaagctttttgtctattttgaaaagca 29555835  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555836 aacctgaacaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 29555886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 34458725 - 34458378
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458725 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 34458626  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  34458625 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctatttt 34458527  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 324  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34458526 ctaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatggttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaa 34458428  T
Q  325 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34458427 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatg 34458378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 16755815 - 16756149
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755815 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 16755914  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755915 agtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 16756013  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac--attttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756014 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatattttgacaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 16756113  T
Q  339 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756114 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 16756149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 27063477 - 27063809
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27063477 tgcttgtgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27063576  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063577 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 27063674  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 339  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063675 tcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 27063774  T
Q  340 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063775 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 27063809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 33370650 - 33370301
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370650 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 33370551  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33370550 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 33370452  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 323  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  33370451 caaagctatatacaaagcattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcg 33370352  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33370351 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatg 33370301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 74 - 374
Target Start/End: Original strand, 4763791 - 4764091
Alignment:
Q  74 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatac 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4763791 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 4763890  T
Q  174 atcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgct 273  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4763891 atctatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgct 4763989  T
Q  274 tgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 372  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763990 tgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 4764089  T
Q  373 tg 374  Q
    ||    
T  4764090 tg 4764091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 65 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26110589 - 26110281
Alignment:
Q  65 gaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccacca 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26110589 gaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacca 26110490  T
Q  165 ctcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 264  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110489 ctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 26110391  T
Q  265 gacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110390 gacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 26110291  T
Q  365 cgagagtatg 374  Q
    ||||||||||    
T  26110290 cgagagtatg 26110281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 43 - 374
Target Start/End: Original strand, 27491130 - 27491461
Alignment:
Q  43 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 142  Q
    |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491130 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 27491229  T
Q  143 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 242  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27491230 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaac 27491328  T
Q  243 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491329 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 27491428  T
Q  342 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491429 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 27491461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 58 - 374
Target Start/End: Original strand, 28166506 - 28166823
Alignment:
Q  58 tttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctg 157  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  28166506 tttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctg 28166605  T
Q  158 accaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattt 257  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||    
T  28166606 accaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattt 28166704  T
Q  258 tgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaac 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166705 tgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaac 28166804  T
Q  356 atgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28166805 atgcatgagcgagagtatg 28166823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 65 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26772807 - 26772499
Alignment:
Q  65 gaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccacca 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26772807 gaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccacca 26772708  T
Q  165 ctcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 264  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772707 ctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 26772610  T
Q  265 gacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 363  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26772609 gacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaacaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatga 26772510  T
Q  364 gcgagagtatg 374  Q
    ||||| |||||    
T  26772509 gcgagggtatg 26772499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4539978 - 4539628
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 123  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4539978 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 4539879  T
Q  124 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct-act 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  4539878 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-ctctatttttctttttact 4539780  T
Q  223 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4539779 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagc 4539680  T
Q  323 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539679 aaacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 4539628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 26791811 - 26792144
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26791811 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 26791910  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791911 aatcacgcctttggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 26792009  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 339  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792010 tcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 26792109  T
Q  340 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26792110 tacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 26792144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 49 - 374
Target Start/End: Original strand, 29579018 - 29579342
Alignment:
Q  49 aattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 148  Q
    |||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29579018 aattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 29579117  T
Q  149 ctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 248  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  29579118 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatcattttc 29579215  T
Q  249 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-taaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 347  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29579216 cttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatca 29579315  T
Q  348 aatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  29579316 aatgaaacatgcatgagcgagggtatg 29579342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 25 - 368
Target Start/End: Original strand, 4531267 - 4531609
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531267 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcgaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 4531366  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4531367 ctttgtgaatccgtggagtcgtgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctacttt 4531465  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 323  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531466 caaagctgtatacaaaacattctctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 4531565  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4531566 aacccgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 4531609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 36 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30552208 - 30551870
Alignment:
Q  36 ttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 135  Q
    |||||| |||||| ||||| | || || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552208 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 30552109  T
Q  136 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatat 235  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  30552108 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttg-aaactctgttttctttttactttcaaagctatat 30552010  T
Q  236 ac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 334  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30552009 acaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaa 30551910  T
Q  335 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30551909 cagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 30551870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 27200165 - 27200515
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 123  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||| | ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27200165 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 27200264  T
Q  124 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  27200265 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgatt-aaaactctatttt-cttctactt 27200362  T
Q  224 tcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 321  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200363 tcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 27200462  T
Q  322 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27200463 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatg 27200515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 27249068 - 27248718
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 123  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||| | ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27249068 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 27248969  T
Q  124 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  27248968 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgatt-aaaactctatttt-cttctactt 27248871  T
Q  224 tcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 321  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248870 tcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 27248771  T
Q  322 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27248770 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatg 27248718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 28213433 - 28213783
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 123  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28213433 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 28213532  T
Q  124 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28213533 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-ctctatttttcttctactt 28213631  T
Q  224 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  28213632 tcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaaaagc 28213731  T
Q  323 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28213732 aagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 28213783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 43 - 374
Target Start/End: Original strand, 16680136 - 16680468
Alignment:
Q  43 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 142  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16680136 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgaaaatccgtggag 16680235  T
Q  143 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaa 241  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16680236 tcacgccgtcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttttcttctactttcaaagttatatacaaaa 16680334  T
Q  242 c-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16680335 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacagggt 16680434  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680435 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 16680468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22929102 - 22928751
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22929102 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 22929003  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||  |||||||||    
T  22929002 ctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgtttg-aaactctactttctttctacttt 22928904  T
Q  225 caaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaag 321  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||  ||||    
T  22928903 caaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaag 22928804  T
Q  322 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22928803 caaacctgagcaatagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatg 22928751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 63 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16938205 - 16937895
Alignment:
Q  63 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccac 162  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  16938205 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccgaccac 16938106  T
Q  163 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgata 262  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  16938105 cactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaattattttccttctattttgata 16938008  T
Q  263 atgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 361  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16938007 atggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 16937908  T
Q  362 gagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||    
T  16937907 gagcgagagtatg 16937895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 42 - 368
Target Start/End: Original strand, 4778876 - 4779203
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    ||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4778876 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 4778975  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttc-aaagctatatacaa 239  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  4778976 agtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaaagctgtatacga 4779074  T
Q  240 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4779075 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 4779174  T
Q  339 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4779175 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 4779203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 74 - 374
Target Start/End: Original strand, 29507444 - 29507746
Alignment:
Q  74 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatac 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29507444 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 29507543  T
Q  174 atcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatg 271  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29507544 atcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttctttttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctcttttgataatgacaatg 29507642  T
Q  272 cttgaaacaaacatttt-gtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagag 370  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29507643 cttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatggaacatgcatgagcgagag 29507742  T
Q  371 tatg 374  Q
    ||||    
T  29507743 tatg 29507746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 64 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13293125 - 13292831
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccacc 163  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13293125 ggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 13293026  T
Q  164 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataa 263  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13293025 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataa 13292927  T
Q  264 tgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 363  Q
    ||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292926 tgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 13292832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 41 - 352
Target Start/End: Original strand, 26926763 - 26927073
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26926763 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 26926862  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  26926863 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaat 26926960  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 339  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26926961 ttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 26927060  T
Q  340 tacattcaaatga 352  Q
    |||||||||||||    
T  26927061 tacattcaaatga 26927073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 27013728 - 27014054
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27013728 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27013827  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||    
T  27013828 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaa 27013926  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27013927 acattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 27014020  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27014021 acattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatg 27014054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14139597 - 14139270
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14139597 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 14139498  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||    
T  14139497 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaa 14139399  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14139398 acattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacatggt 14139304  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14139303 acattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatg 14139270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 127 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26666774 - 26666528
Alignment:
Q  127 ttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttca 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  26666774 ttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-cttctactttca 26666677  T
Q  227 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26666676 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaacaaa 26666577  T
Q  326 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26666576 cctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 26666528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 42 - 368
Target Start/End: Original strand, 27031019 - 27031342
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||||||||||| | ||||  ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27031019 gcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtattcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 27031118  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aa 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||| ||| |||  ||    
T  27031119 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 27031217  T
Q  240 aacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 338  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  27031218 aacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt----ttttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 27031313  T
Q  339 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27031314 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 27031342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 368
Target Start/End: Original strand, 24869705 - 24870026
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24869705 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 24869804  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 239  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  || ||||||||||| ||| ||| ||    
T  24869805 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaa 24869903  T
Q  240 aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 337  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  24869904 aacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacag 24869996  T
Q  338 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24869997 ggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 24870026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 27208899 - 27209228
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27208899 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27208998  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 239  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||    
T  27208999 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaa 27209097  T
Q  240 aacattttctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 335  Q
    ||||||||| |||||   |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||       ||||||||||||||| ||||||||    
T  27209098 aacattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagcaac 27209190  T
Q  336 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27209191 agggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgagagtatg 27209228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 27240329 - 27240000
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27240329 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27240230  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 239  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||    
T  27240229 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaa 27240131  T
Q  240 aacattttctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 335  Q
    ||||||||| |||||   |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||       ||||||||||||||| ||||||||    
T  27240130 aacattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagcaac 27240038  T
Q  336 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27240037 agggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgagagtatg 27240000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 365
Target Start/End: Original strand, 27025163 - 27025460
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccacc 163  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27025163 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 27025262  T
Q  164 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttcta-ttttga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||| |    
T  27025263 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaaacattttccttctatttttaa 27025361  T
Q  261 taatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgc 359  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27025362 taatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgagacatgc 27025454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 64 - 368
Target Start/End: Original strand, 20174567 - 20174881
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccacc 163  Q
    |||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  20174567 ggaaatatagtgtttaccatgctcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccacc 20174666  T
Q  164 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc--tactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttga 260  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20174667 actcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttg-aaactctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttga 20174765  T
Q  261 taatgacaatgcttg-aaacaaacattttgtaa------attgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatga 352  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| |  ||      ||  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||    
T  20174766 tgatgacaatgcttgaaaacaaacattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtga 20174865  T
Q  353 aacatgcatgagcgag 368  Q
    ||||||||||||||||    
T  20174866 aacatgcatgagcgag 20174881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 64 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22161424 - 22161110
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccacc 163  Q
    |||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  22161424 ggaaatatagtgtttaccatgctcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccacc 22161325  T
Q  164 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc--tactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttga 260  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22161324 actcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttg-aaactctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttga 22161226  T
Q  261 taatgacaatgcttg-aaacaaacattttgtaa------attgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatga 352  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| |  ||      ||  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||    
T  22161225 tgatgacaatgcttgaaaacaaacattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtga 22161126  T
Q  353 aacatgcatgagcgag 368  Q
    ||||||||||||||||    
T  22161125 aacatgcatgagcgag 22161110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 24299957 - 24299636
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24299957 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 24299858  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 240  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||  || |||| |||||| ||| ||| |||    
T  24299857 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactctcaaagttatgtacaaaa 24299759  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 339  Q
    || ||| | |||| |||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||| ||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24299758 acgtttcccttcttttttaataatgacaaatgctcggaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagtaacaggg 24299664  T
Q  340 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24299663 tacattcaaatg-aacatgcataagcgag 24299636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 64 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15406709 - 15406403
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccac 162  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15406709 ggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 15406610  T
Q  163 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttga 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |    
T  15406609 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaaacattttccttctatttttaa 15406511  T
Q  261 taatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgc 359  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| | | |||||| |||   ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15406510 taatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgc 15406418  T
Q  360 atgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||| |||||    
T  15406417 atgagcgagtgtatg 15406403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 64 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15418496 - 15418190
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccac 162  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15418496 ggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 15418397  T
Q  163 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttga 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |    
T  15418396 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaaacattttccttctatttttaa 15418298  T
Q  261 taatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgc 359  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| | | |||||| |||   ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15418297 taatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgc 15418205  T
Q  360 atgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||| |||||    
T  15418204 atgagcgagtgtatg 15418190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23851547 - 23851450
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttcca 122  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23851547 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttcca 23851450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 20332678 - 20332345
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332678 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 20332579  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20332578 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 20332479  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332478 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 20332379  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20332378 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatg 20332345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 39856630 - 39856977
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856630 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 39856729  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  39856730 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgttt-aaaactct-tttttcttctacttt 39856827  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856828 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 39856927  T
Q  325 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856928 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 39856977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 40099892 - 40099559
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099892 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 40099793  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40099792 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 40099693  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099692 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 40099593  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40099592 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatg 40099559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 27157569 - 27157235
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157569 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 27157470  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctat-ttttcttctactttcaaagctatatac-aa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27157469 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 27157370  T
Q  240 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 339  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157369 aatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 27157270  T
Q  340 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27157269 tacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatg 27157235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24586617 - 24586284
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586617 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 24586518  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586517 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 24586418  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24586417 acattttctttctattttgataaggacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaatagggt 24586318  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586317 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 24586284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 43 - 374
Target Start/End: Original strand, 14104554 - 14104884
Alignment:
Q  43 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 142  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104554 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 14104653  T
Q  143 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 242  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14104654 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaac 14104752  T
Q  243 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 342  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104753 attttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 14104852  T
Q  343 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14104853 attcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatg 14104884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18794889 - 18794540
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||    || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794889 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaaaaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 18794790  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18794789 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 18794691  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18794690 caaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagca 18794591  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794590 aacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 18794540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 43 - 374
Target Start/End: Original strand, 30759775 - 30760104
Alignment:
Q  43 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 142  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759775 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 30759874  T
Q  143 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 242  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  30759875 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatc 30759972  T
Q  243 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759973 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 30760072  T
Q  343 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30760073 tttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 30760104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 43 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 33668055 - 33667726
Alignment:
Q  43 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 142  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33668055 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 33667956  T
Q  143 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 242  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  33667955 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatc 33667858  T
Q  243 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33667857 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 33667758  T
Q  343 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33667757 tttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 33667726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 54839400 - 54839732
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54839400 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 54839499  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839500 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgcttg-aaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 54839597  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 339  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54839598 tcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacaggg 54839697  T
Q  340 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839698 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 54839732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 41 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 34183218 - 34182893
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34183218 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 34183119  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183118 agtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 34183020  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183019 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 34182921  T
Q  340 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34182920 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 34182893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 5700549 - 5700882
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 139  Q
    |||||| ||||||| | |||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700549 tgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtg 5700648  T
Q  140 gagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaa 239  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700649 gagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaa 5700746  T
Q  240 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5700747 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagg 5700846  T
Q  339 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700847 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 5700882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 41 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 14753749 - 14753423
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14753749 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 14753650  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753649 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 14753552  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14753551 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagg 14753452  T
Q  339 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14753451 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 14753423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 36 - 374
Target Start/End: Original strand, 21975708 - 21976046
Alignment:
Q  36 ttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 135  Q
    |||||| |||||| ||||| | || || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975708 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 21975807  T
Q  136 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatat 235  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  21975808 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgcgcttttgtttg-aaactctgttttctttttactttcaaagctatat 21975906  T
Q  236 ac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 334  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21975907 acaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaa 21976006  T
Q  335 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21976007 cagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 21976046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 5011870 - 5012220
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 123  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5011870 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 5011969  T
Q  124 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5011970 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctacttttcttctactt 5012068  T
Q  224 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 322  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5012069 tcaaagctatatacaaatcattttctttctacttggataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagc 5012168  T
Q  323 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  5012169 aaacctgagcaacagggcacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatg 5012220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 41 - 368
Target Start/End: Original strand, 24118672 - 24118998
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24118672 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 24118771  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  24118772 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctg-aaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaa 24118870  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24118871 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaaccggagcaacaggg 24118970  T
Q  340 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24118971 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 24118998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 64 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31120744 - 31120433
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccacc 163  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31120744 ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccacc 31120645  T
Q  164 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgata 262  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31120644 actcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttg-aaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgata 31120546  T
Q  263 atgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31120545 atgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcat 31120446  T
Q  362 gagcgagagtatg 374  Q
    ||||||| |||||    
T  31120445 gagcgagggtatg 31120433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 41 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 36338774 - 36338455
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338774 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccgccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 36338675  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338674 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 36338576  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338575 acattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 36338482  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36338481 acattcaaatg-aacatgcatgagcgag 36338455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 1906245 - 1906599
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1906245 tcatcagaagctcatgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 1906344  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    ||||||  ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| | |  |||||||||    
T  1906345 ctttgtatatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttg-aaactctactatctttctacttt 1906443  T
Q  225 caaagctatataca----aaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaa--ctttttgtctattttga 317  Q
    |||||| || ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||     
T  1906444 caaagccatgtacaaaagaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg- 1906542  T
Q  318 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1906543 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatg 1906599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 64 - 368
Target Start/End: Original strand, 6575894 - 6576190
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccacc 163  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  6575894 ggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 6575993  T
Q  164 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataa 263  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6575994 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataa 6576092  T
Q  264 tgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 363  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6576093 tgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ctttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatga 6576185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15276904 - 15276552
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15276904 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 15276805  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||    
T  15276804 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttg-aaactctattttctctctacttt 15276706  T
Q  225 caaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattg---aaaactttttgtctattttgaaa 319  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   |||| ||||||||| ||||| ||    
T  15276705 caaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtctgttttg-aa 15276607  T
Q  320 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    || |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||    
T  15276606 agtaaacttgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatg 15276552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15380510 - 15380161
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    ||||| |||| || |||||||| ||||||| | ||||  |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15380510 tcatccgaagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttcaaggaaatgtagtggttatcgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 15380411  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||  |||||||||    
T  15380410 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactttctttctacttt 15380312  T
Q  225 caaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 322  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  |||| ||||||||| ||||| |||||    
T  15380311 caaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaattaaaaaagtttttgtctgttttg-aaagc 15380213  T
Q  323 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  15380212 aagcctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatg 15380161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 15233809 - 15234162
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||| ||| || |||||||| ||||||| | |||   |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15233809 tcatcataagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttataggaaatgtagtggttactatgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 15233908  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||    
T  15233909 ctttgtaaatccgtagagtcacgccttcggctaaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aaactctactttctttctacttt 15234007  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaa------ctttttgtctattttgaa 318  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||       ||||||||||||||| |    
T  15234008 caaagctatgtacaaaaaaatttctttttatcttgataatgacaatgcttgaagcaaacatcttgaaacttgaaaaagttttttttttgtctattttg-a 15234106  T
Q  319 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  15234107 aagcaaacctgggcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatg 15234162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 64 - 368
Target Start/End: Original strand, 1673892 - 1674199
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccacc 163  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| |||||||||||    
T  1673892 ggaaatgtagtggttactgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggtgtcactccttcggctgaccacc 1673991  T
Q  164 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||||||||    
T  1673992 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactatctttctactttcaaagccatgtacaaaaaatattttctttctattttgat 1674090  T
Q  262 aatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatg 358  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1674091 aatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg-aaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaacgaaacatg 1674189  T
Q  359 catgagcgag 368  Q
    ||||||||||    
T  1674190 catgagcgag 1674199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 122 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 36324484 - 36324246
Alignment:
Q  122 aagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctac 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36324484 aagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctac 36324386  T
Q  222 tttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||      ||||||||||    
T  36324385 tttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaag 36324292  T
Q  322 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36324291 caaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 36324246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 42 - 368
Target Start/End: Original strand, 14671026 - 14671349
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    ||||||||||||| | ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14671026 gcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 14671125  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaa- 239  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| |||||     
T  14671126 agttacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaag 14671224  T
Q  240 aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 337  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||    
T  14671225 aacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacag 14671318  T
Q  338 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14671319 ggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgag 14671349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 42 - 368
Target Start/End: Original strand, 17019062 - 17019384
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17019062 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 17019161  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttc-aaagctatatac-a 238  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||| |||||||| ||| |    
T  17019162 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctatgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaaagctatgtacaa 17019260  T
Q  239 aaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 337  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||  |||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||    
T  17019261 aaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgagaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacag 17019354  T
Q  338 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17019355 ggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 17019384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 63 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 28356148 - 28355835
Alignment:
Q  63 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccac 162  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356148 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccac 28356049  T
Q  163 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt--cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356048 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctatttttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 28355949  T
Q  261 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355948 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 28355849  T
Q  361 tgagcgagagtatg 374  Q
    |||| |||||||||    
T  28355848 tgagtgagagtatg 28355835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 9360620 - 9360952
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360620 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 9360719  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9360720 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 9360818  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360819 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 9360918  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360919 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 9360952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Original strand, 31360527 - 31360859
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360527 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 31360626  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  31360627 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaa 31360725  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360726 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 31360825  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31360826 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatg 31360859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 63 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31484068 - 31483755
Alignment:
Q  63 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccac 162  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31484068 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 31483969  T
Q  163 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483968 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 31483869  T
Q  261 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31483868 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaaggtaccttcaaatgaaacatgca 31483769  T
Q  361 tgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||    
T  31483768 tgagcgagagtatg 31483755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 42 - 368
Target Start/End: Original strand, 33248365 - 33248690
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248365 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 33248464  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248465 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 33248563  T
Q  242 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248564 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 33248663  T
Q  342 cattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  33248664 cattcaaatgaaacatgcatgagcgag 33248690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 37 - 374
Target Start/End: Original strand, 29835317 - 29835653
Alignment:
Q  37 tctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 136  Q
    ||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29835317 tctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 29835416  T
Q  137 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 236  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29835417 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaaactccatttt-cttctactttcaaagctatata 29835515  T
Q  237 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 336  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835516 caaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 29835615  T
Q  337 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835616 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 29835653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 18796704 - 18797038
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 139  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18796704 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttataaatccgtg 18796803  T
Q  140 gagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaa 239  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796804 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaa 18796902  T
Q  240 aa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 338  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796903 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 18797002  T
Q  339 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797003 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 18797038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 19680430 - 19680778
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttcc-gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 123  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680430 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 19680529  T
Q  124 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  19680530 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattt 19680627  T
Q  224 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19680628 tcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagca 19680727  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19680728 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatg 19680778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12086958 - 12086608
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 123  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12086958 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 12086859  T
Q  124 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12086858 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-ctctatttttcttctactt 12086760  T
Q  224 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12086759 tcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagc 12086660  T
Q  323 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12086659 aagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 12086608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 74 - 374
Target Start/End: Original strand, 33264762 - 33265061
Alignment:
Q  74 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatac 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33264762 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatac 33264861  T
Q  174 atcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgct 273  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264862 atcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacgaaacattttctttctattttgataatgacaatgct 33264959  T
Q  274 tgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 372  Q
    |||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264960 tgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 33265059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 64 - 374
Target Start/End: Original strand, 44567002 - 44567314
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccacc 163  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  44567002 ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 44567101  T
Q  164 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataa 263  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44567102 actctcatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataa 44567199  T
Q  264 tgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgc 359  Q
    |||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567200 tgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgc 44567299  T
Q  360 atgagcgagagtatg 374  Q
    || ||||||||||||    
T  44567300 ataagcgagagtatg 44567314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 18715478 - 18715813
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18715478 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 18715577  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715578 agtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 18715675  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgt----aaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 336  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715676 acattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 18715775  T
Q  337 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715776 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 18715813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 74 - 374
Target Start/End: Original strand, 15773605 - 15773905
Alignment:
Q  74 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatac 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15773605 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 15773704  T
Q  174 atcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgct 273  Q
     ||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15773705 gtcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcagagctatatacaaaacattttctttctcttttgataatgacaatgct 15773803  T
Q  274 tgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 372  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773804 tgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 15773903  T
Q  373 tg 374  Q
    ||    
T  15773904 tg 15773905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19202598 - 19202260
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaat-ttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 123  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| | | ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19202598 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtcttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 19202499  T
Q  124 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||              
T  19202498 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt---------- 19202410  T
Q  224 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 323  Q
     |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19202409 -caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagca 19202311  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19202310 aacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatg 19202260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 64 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21342366 - 21342055
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccac 162  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21342366 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 21342267  T
Q  163 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgata 262  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21342266 cactcttatacatcgatttgagcctgtgcttctgtttgaaa-ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgata 21342168  T
Q  263 atgacaatgcttgaaacaaacatttt-gtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 361  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342167 atgacaatgcttgaaacaagcatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 21342068  T
Q  362 gagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||    
T  21342067 gagcgagagtatg 21342055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 68 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19911355 - 19911047
Alignment:
Q  68 atgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactc 167  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  19911355 atgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacctttttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactc 19911256  T
Q  168 ttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatg 265  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911255 ttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatg 19911157  T
Q  266 acaatgcttgaaacaaacattttgtaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911156 acaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 19911057  T
Q  365 cgagagtatg 374  Q
    |||| |||||    
T  19911056 cgagtgtatg 19911047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 25 - 301
Target Start/End: Original strand, 16260205 - 16260480
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||| | ||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260205 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16260304  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16260305 ctttgtaaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 16260403  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaac 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16260404 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaatcgaaaac 16260480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22075164 - 22074814
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||||||| | ||||  |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22075164 tcatcagaagcttttgtgtttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttgccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 22075065  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||    
T  22075064 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctaggcttttgtttg-aaactctactttctttctacttt 22074966  T
Q  225 caaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 321  Q
    ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  22074965 caaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacttcttgaaaataaaaaagtttttgtctgttttg-aaag 22074867  T
Q  322 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  22074866 caagcatgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatg 22074814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27603141 - 27602805
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603141 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27603042  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||    
T  27603041 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttagacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttacttt 27602943  T
Q  225 caaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 321  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||        ||||||||||    
T  27602942 caaagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaagtt--------ttttgaaaag 27602851  T
Q  322 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27602850 caaacctgtgcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 27602805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19655562 - 19655232
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa--ttaccattttccaagctttgtgaatccgt 138  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19655562 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgt 19655463  T
Q  139 ggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac- 237  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  || ||||||||||| ||| |||     
T  19655462 ggagtctcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactttctttttactttcaaagttatgtaca 19655364  T
Q  238 aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 335  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||      ||||| ||||||||||||||||||    
T  19655363 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaagtttt------ttttg-aaagcaaacctgagcaac 19655271  T
Q  336 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||    
T  19655270 agggtacattcaaacaaaacgtgcatgagcgagtgtatg 19655232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 2131479 - 2131159
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2131479 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 2131380  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 240  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  2131379 gtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 2131281  T
Q  241 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 338  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  2131280 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ctttgaaaagcaaacctgagcaacagg 2131188  T
Q  339 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2131187 gtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 2131159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 368
Target Start/End: Original strand, 19694094 - 19694416
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19694094 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 19694193  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 239  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||  || ||||||||||| ||| ||| ||    
T  19694194 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaa 19694292  T
Q  240 aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 337  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||    
T  19694293 aacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacag 19694386  T
Q  338 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19694387 ggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 19694416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 22138904 - 22139231
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 139  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22138904 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 22139003  T
Q  140 gagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-a 238  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| |    
T  22139004 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaa 22139102  T
Q  239 aaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 336  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||  |        ||||| ||||||||| |||||||||    
T  22139103 aaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacgtcttgaaaattgaaaaagt--------ttttg-aaagcaaacttgagcaaca 22139193  T
Q  337 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22139194 gggtacattgaaatgaaacgtgcatgagcgagtgtatg 22139231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 67 - 368
Target Start/End: Original strand, 14569180 - 14569479
Alignment:
Q  67 aatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccact 166  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14569180 aatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccact 14569279  T
Q  167 cttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctat-----atacaaaacattttctttcta-ttttga 260  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| |||     | | ||||||||||| ||||| |||| |    
T  14569280 cttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatgttcaaaaaaaaacattttccttctatttttaa 14569378  T
Q  261 taatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgc 359  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||  ||       ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14569379 taatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaagacaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgc 14569470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 254897 - 254565
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254897 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 254798  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctat-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254797 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 254698  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254697 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 254599  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  254598 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatg 254565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37946111 - 37945778
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37946111 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 37946012  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37946011 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 37945912  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945911 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 37945812  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37945811 acattcaaatgaaacatgcatgagtaagagtatg 37945778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 27809697 - 27810032
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809697 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 27809796  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatataca 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27809797 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttttcttctactttcaaagctatataca 27809896  T
Q  239 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809897 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 27809996  T
Q  339 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27809997 ttacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatg 27810032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13930791 - 13930457
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930791 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 13930692  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 240  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13930691 gtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 13930592  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930591 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 13930492  T
Q  340 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930491 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 13930457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 64 - 374
Target Start/End: Original strand, 12661558 - 12661867
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccacc 163  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12661558 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 12661657  T
Q  164 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataa 263  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661658 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataa 12661756  T
Q  264 tgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 363  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661757 tgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 12661856  T
Q  364 gcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||    
T  12661857 gcgagagtatg 12661867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 63 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22922369 - 22922056
Alignment:
Q  63 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccac 162  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22922369 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 22922270  T
Q  163 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922269 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 22922170  T
Q  261 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22922169 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgca 22922070  T
Q  361 tgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||    
T  22922069 tgagcgagagtatg 22922056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Original strand, 16167475 - 16167807
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167475 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 16167574  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16167575 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaa 16167673  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167674 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 16167773  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16167774 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagggtatg 16167807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 12592806 - 12593143
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592806 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 12592905  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592906 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 12593005  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 336  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12593006 acattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttggaaagcaaacctgagcaaca 12593105  T
Q  337 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12593106 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatg 12593143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Original strand, 37931369 - 37931708
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931369 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 37931468  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta------tttttcttctactttcaaagctatat 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||    
T  37931469 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttttttttcttctactttcaaagctatat 37931568  T
Q  236 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37931569 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaa 37931668  T
Q  335 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931669 cagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 37931708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 3788490 - 3788822
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  3788490 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgcgg 3788589  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3788590 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 3788688  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788689 acattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 3788788  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3788789 acattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatg 3788822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 63 - 374
Target Start/End: Original strand, 39896087 - 39896397
Alignment:
Q  63 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccac 162  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  39896087 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgagctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccac 39896186  T
Q  163 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgata 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896187 cactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgata 39896285  T
Q  263 atgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896286 atgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 39896385  T
Q  363 agcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||    
T  39896386 agcgagagtatg 39896397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 63 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19410710 - 19410397
Alignment:
Q  63 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccac 162  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19410710 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 19410611  T
Q  163 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19410610 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttga 19410511  T
Q  261 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19410510 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggataccttcaaatgaaacatgca 19410411  T
Q  361 tgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||    
T  19410410 tgagcgagagtatg 19410397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12710863 - 12710514
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710863 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 12710764  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  12710763 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaattcta-ttttcttctacttt 12710666  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710665 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 12710566  T
Q  323 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12710565 aaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 12710514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 25 - 368
Target Start/End: Original strand, 40239489 - 40239831
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239489 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 40239588  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40239589 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 40239687  T
Q  225 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 323  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239688 caaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 40239787  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40239788 aacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 40239831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 37383673 - 37384006
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 139  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383673 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtg 37383772  T
Q  140 gagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaa 239  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383773 gagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaa 37383871  T
Q  240 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383872 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 37383971  T
Q  340 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383972 tacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 37384006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 27782212 - 27782561
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27782212 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27782311  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  27782312 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctatttt 27782410  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27782411 caaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagca 27782510  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27782511 aacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatg 27782561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 74 - 374
Target Start/End: Original strand, 27122554 - 27122852
Alignment:
Q  74 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatac 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27122554 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatac 27122653  T
Q  174 atcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgct 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27122654 atcaaattgagcctttgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgct 27122751  T
Q  274 tgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 373  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122752 tgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgagaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 27122851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 43 - 374
Target Start/End: Original strand, 34867681 - 34868011
Alignment:
Q  43 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 142  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34867681 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgaaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtagag 34867780  T
Q  143 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 242  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34867781 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaaac 34867878  T
Q  243 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867879 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 34867978  T
Q  342 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867979 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 34868011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37680155 - 37679804
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 123  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37680155 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 37680056  T
Q  124 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 223  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37680055 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctactt 37679958  T
Q  224 tcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37679957 tcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaa 37679858  T
Q  321 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37679857 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 37679804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37695420 - 37695069
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 123  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37695420 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 37695321  T
Q  124 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 223  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37695320 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctactt 37695223  T
Q  224 tcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37695222 tcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaa 37695123  T
Q  321 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37695122 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 37695069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9344232 - 9343900
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9344232 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 9344133  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9344132 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaa 9344034  T
Q  242 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344033 cattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtccattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 9343934  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9343933 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 9343900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 39046067 - 39045735
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39046067 gcttgcgaattcaaagtttccagaaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccactaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 39045968  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39045967 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaa 39045869  T
Q  242 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045868 cattttctttccattttaataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 39045769  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045768 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 39045735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 36 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16823588 - 16823250
Alignment:
Q  36 ttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 135  Q
    |||||| |||||| ||||| | || || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823588 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 16823489  T
Q  136 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatat 235  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  16823488 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttg-aaactctgttttctttttactttcaaagctatat 16823390  T
Q  236 ac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 334  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16823389 acaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaa 16823290  T
Q  335 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16823289 cagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 16823250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 36 - 374
Target Start/End: Original strand, 16897892 - 16898230
Alignment:
Q  36 ttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 135  Q
    |||||| |||||| ||||| | || || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16897892 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 16897991  T
Q  136 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatat 235  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  16897992 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttg-aaactctgttttctttttactttcaaagctatat 16898090  T
Q  236 ac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 334  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16898091 acaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaa 16898190  T
Q  335 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16898191 cagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 16898230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21671435 - 21671083
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 123  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21671435 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 21671336  T
Q  124 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 223  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21671335 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctactt 21671238  T
Q  224 tcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgtaaattgaaa-actttttgtctattttgaaa 319  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  21671237 tcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaattttttttgtctattttgaaa 21671138  T
Q  320 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21671137 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 21671083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 32055798 - 32056130
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32055798 tgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 32055897  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055898 agtcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 32055995  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055996 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 32056095  T
Q  340 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056096 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 32056130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 34160840 - 34161175
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34160840 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 34160939  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||    
T  34160940 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaa 34161038  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161039 acattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 34161138  T
Q  338 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161139 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 34161175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 11629446 - 11629104
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11629446 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 11629347  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||    
T  11629346 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttttatttt 11629249  T
Q  225 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 322  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  11629248 caaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactctttgtctattttgaaaaac 11629149  T
Q  323 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11629148 aaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 11629104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Original strand, 31882284 - 31882615
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31882284 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 31882383  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882384 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 31882481  T
Q  242 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31882482 cattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttttctattttgaaaagcaaacttgagcaacggggt 31882581  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31882582 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatg 31882615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 36 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21697427 - 21697086
Alignment:
Q  36 ttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 135  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21697427 ttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 21697328  T
Q  136 cgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatat 235  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |  | |||||||||||||||| |    
T  21697327 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactatcttcctactttcaaagctatgt 21697229  T
Q  236 ac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctga 330  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21697228 acaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg-aaagcaaacctga 21697130  T
Q  331 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21697129 gcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatg 21697086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 93 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31868979 - 31868702
Alignment:
Q  93 accaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgct 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31868979 accaccaaccaataaaattaccatttttcaagcattgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgct 31868880  T
Q  193 tttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gta 291  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  31868879 tttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaa 31868782  T
Q  292 aattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31868781 aattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagt 31868702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 34297152 - 34297478
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34297152 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 34297251  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||    
T  34297252 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaa 34297350  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297351 acattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttcgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 34297444  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297445 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 34297478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 27396303 - 27396662
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||| | ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27396303 tcatcagaagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 27396402  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  |||||||||    
T  27396403 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactttctttctacttt 27396501  T
Q  225 caaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaa----------ctttttgtctat 312  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||           ||||||||  |    
T  27396502 caaagctatgtacaaaaaacattttctttctatctttataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaaaaagttttttgtcctt 27396601  T
Q  313 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27396602 tttg-aaagcaaacctaagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatg 27396662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 34269167 - 34268839
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||||||||||| | ||||  ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  34269167 tgcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattctccaagctttgtaaatccgtgg 34269068  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 239  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||    
T  34269067 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcatgtgcttttgttt-aaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaa 34268969  T
Q  240 aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 337  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  34268968 aacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacag 34268876  T
Q  338 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  34268875 ggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatg 34268839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19450689 - 19450331
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19450689 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 19450590  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||    
T  19450589 ctttgtaaatccgtggaatcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaattcgagcatgtgcttttgtttg-aaactctattttctctctacttt 19450491  T
Q  225 caaagctatatac-----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattg------aaaactttttgtctatt 313  Q
    ||||| ||| |||     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||      |||| ||||||||| ||    
T  19450490 caaaggtatgtacaaaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagtttttgtctgtt 19450391  T
Q  314 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||| ||| |||||    
T  19450390 ttg-aaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaatgtgcatgagtgagcgtatg 19450331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 41 - 368
Target Start/End: Original strand, 28888275 - 28888597
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28888275 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 28888374  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 239  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||    
T  28888375 agtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaa 28888473  T
Q  240 aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 337  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||    
T  28888474 aacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacag 28888567  T
Q  338 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28888568 ggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 28888597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 42 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23122818 - 23122497
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  23122818 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgcaaatccgtgg 23122719  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 239  Q
    |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||| ||| ||| ||    
T  23122718 agtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaa 23122620  T
Q  240 aacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 338  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  23122619 aacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 23122526  T
Q  339 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23122525 gtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 23122497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 27428692 - 27428366
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    ||||||||| |||| | ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27428692 tgcttgtgagttcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27428593  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 239  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||| ||| | | ||    
T  27428592 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactctattttctttttactttcaaagttatgtgcaaa 27428494  T
Q  240 aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 337  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||| |||  |        ||||||||||||||||||||||||||    
T  27428493 aacattttccttctatttttaataatgacaaatgttcgaaacaaacatcttgaaaattgcaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacag 27428402  T
Q  338 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||    
T  27428401 ggtacattcaaacg-aacgtgcatgagcgagtgtatg 27428366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 64 - 368
Target Start/End: Original strand, 20843931 - 20844235
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccac 162  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||    
T  20843931 ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctggacac 20844030  T
Q  163 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttc-aaagctatat--acaaaacattttctttcta-tttt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  || ||| ||| |||| ||| |  | ||||||||||| ||||| ||||    
T  20844031 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactttctttttaccttcaaaagttatgttcaaaaaacattttccttctattttt 20844129  T
Q  259 gataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacat 357  Q
     |||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20844130 aataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacat 20844224  T
Q  358 gcatgagcgag 368  Q
    |||||||||||    
T  20844225 gcatgagcgag 20844235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 293 - 374
Target Start/End: Original strand, 23117044 - 23117125
Alignment:
Q  293 attgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23117044 attgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgggcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 23117125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 31887738 - 31887682
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccacc 98  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31887738 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccacc 31887682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 74 - 374
Target Start/End: Original strand, 10968698 - 10968999
Alignment:
Q  74 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatac 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968698 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatac 10968797  T
Q  174 atcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgc 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968798 atcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaatattttctttctattttgataatgacaatgc 10968897  T
Q  273 ttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 372  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968898 ttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 10968997  T
Q  373 tg 374  Q
    ||    
T  10968998 tg 10968999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Original strand, 3647147 - 3647479
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3647147 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 3647246  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 241  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647247 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 3647346  T
Q  242 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647347 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 3647446  T
Q  342 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647447 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 3647479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 58 - 374
Target Start/End: Original strand, 10951108 - 10951425
Alignment:
Q  58 tttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctg 157  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10951108 tttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcatgcctttggctg 10951207  T
Q  158 accaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10951208 accaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttttatt 10951307  T
Q  257 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaaca 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10951308 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaaca 10951407  T
Q  357 tgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  10951408 tgcataagcgagagtatg 10951425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 51644204 - 51644555
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644204 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 51644303  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-tttttcttctactt 223  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51644304 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactt 51644403  T
Q  224 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51644404 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagc 51644503  T
Q  323 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  51644504 aaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatg 51644555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 43 - 374
Target Start/End: Original strand, 28591085 - 28591415
Alignment:
Q  43 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 142  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591085 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 28591184  T
Q  143 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 242  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  28591185 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaac 28591283  T
Q  243 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 342  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591284 attctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 28591383  T
Q  343 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591384 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 28591415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 41787566 - 41787232
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787566 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 41787467  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
     |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41787466 ggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 41787369  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgt---aaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787368 acattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 41787269  T
Q  338 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787268 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 41787232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 28155726 - 28156061
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28155726 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 28155825  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155826 agtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 28155923  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 336  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155924 acattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 28156023  T
Q  337 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28156024 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 28156061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 20334689 - 20334338
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334689 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 20334590  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    | |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| |||||||| |||  |||||||||    
T  20334589 ccttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaattgtgcttttgtttg-aaactctactttctttctacttt 20334491  T
Q  225 caaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaa 320  Q
    ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  20334490 caaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttg-aaa 20334392  T
Q  321 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20334391 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatg 20334338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16202307 - 16201950
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16202307 tcatcagaagctcctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggacatgtagtaattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16202208  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||    
T  16202207 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttacttt 16202109  T
Q  225 caaagctatatac-----aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaa---ctttttgtctattt 314  Q
    |||||| || |||     ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    |||| ||||||||    
T  16202108 caaagccatgtacaaaaaaaaacattttctttctatttttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttcgtctattt 16202009  T
Q  315 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16202008 tg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatg 16201950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 20466761 - 20467118
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||||||| |||| ||||||  |||||| | ||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466761 tcatcagaagcttctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 20466860  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||| |||||    
T  20466861 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactttctttccacttt 20466959  T
Q  225 caaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaatt--------gaaaactttttgtctattt 314  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||         |||| ||  |||||||||    
T  20466960 caaagctatgtacaaaaaccattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatcttcaaaattagaaaaaaaaaaagttcctgtctattt 20467059  T
Q  315 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    || |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  20467060 tg-aaagcaaacctgagcagcaaggtacattcaaacgaaacatgcgtgagcgagtgtatg 20467118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 21892020 - 21891691
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21892020 tcatcagaagcttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 21891921  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-tttttcttctactt 223  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | || ||  |    
T  21891920 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactttcttttttatgt 21891822  T
Q  224 tcaaagctatatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 321  Q
    |||           ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||      || | ||||||||||    
T  21891821 tca-----------aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaa----aagttttttttgaaaag 21891737  T
Q  322 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21891736 caaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 21891691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 63 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4139367 - 4139054
Alignment:
Q  63 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccac 162  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4139367 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 4139268  T
Q  163 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139267 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 4139168  T
Q  261 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139167 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 4139068  T
Q  361 tgagcgagagtatg 374  Q
    |||| |||||||||    
T  4139067 tgagtgagagtatg 4139054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16745679 - 16745329
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| | |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745679 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16745580  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16745579 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 16745481  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745480 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 16745381  T
Q  323 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  16745380 aaacctgagcaacagggtatattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatg 16745329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 31 - 371
Target Start/End: Original strand, 26441238 - 26441579
Alignment:
Q  31 gaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 130  Q
    |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441238 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctatgaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 26441337  T
Q  131 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaag 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  26441338 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccgccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaaactccattttttcttttactttcaaag 26441437  T
Q  230 ctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 329  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441438 ctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 26441537  T
Q  330 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441538 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagt 26441579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26664054 - 26663721
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26664054 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 26663955  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctat-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663954 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 26663855  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26663854 acattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggt 26663755  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26663754 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatg 26663721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26679246 - 26678913
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679246 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 26679147  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctat-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679146 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 26679047  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26679046 acattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggt 26678947  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26678946 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatg 26678913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5141493 - 5141143
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141493 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 5141394  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5141393 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 5141295  T
Q  225 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagc 322  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5141294 caaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagc 5141195  T
Q  323 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5141194 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 5141143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 39207280 - 39206948
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207280 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 39207181  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207180 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 39207082  T
Q  242 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207081 tattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 39206982  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206981 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 39206948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 63 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24586654 - 24586344
Alignment:
Q  63 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccac 162  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24586654 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 24586555  T
Q  163 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgata 262  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24586554 cactcttatacatcaaattgagcctgtgctttcgttt-aagactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttcttcctattttgata 24586456  T
Q  263 atgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586455 atgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 24586356  T
Q  363 agcgagagtatg 374  Q
    || |||||||||    
T  24586355 agtgagagtatg 24586344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31558535 - 31558203
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31558535 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 31558436  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 241  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31558435 gtcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaat 31558337  T
Q  242 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558336 cattttccttctattttgataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 31558237  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558236 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 31558203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 11446867 - 11447216
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11446867 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 11446966  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  11446967 ctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaattcta-ttttcttctacttt 11447064  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447065 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 11447164  T
Q  323 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11447165 aaacctgagcaacagggtacaatcaagtgaaacatgcatgagcgagggtatg 11447216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Original strand, 26518789 - 26519119
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518789 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 26518888  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 241  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  26518889 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaat 26518986  T
Q  242 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518987 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 26519086  T
Q  342 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26519087 cattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatg 26519119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 64 - 374
Target Start/End: Original strand, 5164402 - 5164712
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccacc 163  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  5164402 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgctttcggctgaccacc 5164501  T
Q  164 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagc-tatatacaaaacattttctttctattttgata 262  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164502 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagcctatatacaaaacattttctttctattttgata 5164600  T
Q  263 atgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 362  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5164601 ataacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatg 5164700  T
Q  363 agcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||    
T  5164701 agcgagagtatg 5164712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26509839 - 26509504
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 139  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26509839 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 26509740  T
Q  140 gagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaa 239  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509739 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaa 26509640  T
Q  240 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaa-ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509639 aacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 26509540  T
Q  339 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26509539 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatg 26509504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 65 - 374
Target Start/End: Original strand, 45393238 - 45393547
Alignment:
Q  65 gaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccacca 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45393238 gaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccacca 45393337  T
Q  165 ctcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 264  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  45393338 ctcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctacttttcttctactttcaaagctatacacaaatcattttccttctattttgataat 45393436  T
Q  265 gacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 363  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393437 gacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 45393536  T
Q  364 gcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||    
T  45393537 gcgagagtatg 45393547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 4205368 - 4205717
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttcc-gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 123  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205368 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 4205467  T
Q  124 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  4205468 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctattt 4205565  T
Q  224 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-taaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 322  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4205566 tcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagc 4205665  T
Q  323 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205666 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 4205717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26314006 - 26313658
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttcc-gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 123  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||| | |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26314006 tcatctgaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 26313907  T
Q  124 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  26313906 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattt 26313809  T
Q  224 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26313808 tcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagca 26313709  T
Q  324 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  26313708 aacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatg 26313658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 3451297 - 3451647
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451297 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 3451396  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  3451397 ttttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagctggtgcttttgtttg-aaattcta-ttttcttctacttt 3451494  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451495 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 3451594  T
Q  322 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  3451595 caaacctgagcaacagggtacaatcaaatggaacatgcatgagcgagggtatg 3451647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 5154079 - 5154411
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5154079 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 5154178  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||  || ||||||||||||||||||||||    
T  5154179 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaa 5154277  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154278 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 5154377  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154378 acatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 5154411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31084781 - 31084431
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 123  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31084781 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 31084682  T
Q  124 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31084681 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggttgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttttcttctactt 31084583  T
Q  224 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31084582 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagc 31084483  T
Q  323 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31084482 aaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatg 31084431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 45737296 - 45737631
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45737296 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 45737395  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737396 agtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 45737493  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 336  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737494 acattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 45737593  T
Q  337 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737594 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 45737631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26269247 - 26268894
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269247 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26269148  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||    
T  26269147 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgttttctttttacttt 26269049  T
Q  225 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 319  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269048 caaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 26268949  T
Q  320 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26268948 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 26268894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 64 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 11418898 - 11418588
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccacc 163  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11418898 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 11418799  T
Q  164 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataa 263  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11418798 actcttatacatcgatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataa 11418700  T
Q  264 tgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 362  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11418699 tgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttctgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacg 11418600  T
Q  363 agcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||    
T  11418599 agcgagagtatg 11418588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 16047294 - 16047640
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16047294 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16047393  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| |    
T  16047394 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aaactctactttctttctactgt 16047492  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 324  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16047493 caaagctatgtacaaaa-attttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcctgaaaattgaaaagtttttgtctattttg-aaagcaa 16047590  T
Q  325 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
     ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16047591 gcctgagcaacaggatacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatg 16047640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 128 - 374
Target Start/End: Original strand, 26595750 - 26595998
Alignment:
Q  128 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-tttttcttctactttca 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26595750 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttca 26595849  T
Q  227 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 325  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26595850 aagctatatacaacacattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 26595949  T
Q  326 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26595950 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatg 26595998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 39 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16444148 - 16443818
Alignment:
Q  39 tgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 138  Q
    |||||||| ||||||| | ||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16444148 tgtgcttgcgaattcaaagtttctaagaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgt 16444049  T
Q  139 ggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac- 237  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||     
T  16444048 ggagtcacgccttcgcctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgttt-aaaactctactttctttctactttcaaagctatgtaca 16443950  T
Q  238 -aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 335  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16443949 aaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaac 16443851  T
Q  336 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16443850 agggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgag 16443818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Original strand, 2160566 - 2160900
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 141  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2160566 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 2160665  T
Q  142 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aa 239  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||||||| |||  ||    
T  2160666 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaa 2160764  T
Q  240 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  2160765 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaatctgagcaacagg 2160864  T
Q  339 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2160865 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatg 2160900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 2779247 - 2779574
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2779247 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 2779346  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||    
T  2779347 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaa 2779445  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779446 acattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 2779540  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2779541 acattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatg 2779574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 31129900 - 31130227
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31129900 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 31129999  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||    
T  31130000 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaa 31130098  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31130099 acattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 31130193  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31130194 acattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatg 31130227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 10847562 - 10847915
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10847562 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 10847661  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||   ||||||||    
T  10847662 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtctg-aaactctattttctctctacttt 10847760  T
Q  225 caaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaa---ctttttgtctattttgaa 318  Q
    ||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    ||||||||| ||||| |    
T  10847761 caaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaagttttttgtctgttttg-a 10847859  T
Q  319 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||    
T  10847860 aagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatg 10847915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16512576 - 16512255
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16512576 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 16512477  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 239  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||    
T  16512476 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttaagcctgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaa 16512378  T
Q  240 aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 337  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||| |||  |        ||||||||||||||||||||||||||    
T  16512377 aacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgataattggaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacag 16512286  T
Q  338 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16512285 ggtacattcaaatgaaatatgcatgagcgag 16512255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 64 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 10911039 - 10910735
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccacc 163  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  10911039 ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcactaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 10910940  T
Q  164 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||    
T  10910939 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaat 10910841  T
Q  262 aatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 360  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  10910840 aatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacatggtacattcaaacg-aacatgca 10910749  T
Q  361 tgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||| |||||    
T  10910748 tgagcgagtgtatg 10910735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 26532011 - 26531926
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 127  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26532011 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 26531926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9897 - 9565
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9897 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 9798  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9797 agtcacgctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 9699  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9698 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 9599  T
Q  341 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9598 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 9565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 1639 - 1988
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1639 tcatcagaagtttctgtgcttatgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 1738  T
Q  124 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 223  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  1739 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta-ttttcttctactt 1836  T
Q  224 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1837 tcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttactttgaaaagc 1936  T
Q  323 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1937 aaacctgagcaacagggtacgatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 1988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 12028 - 12388
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12028 tcatcagaagcttctgtacttgcgaactcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 12127  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaa-tttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 223  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| | |  ||||||||    
T  12128 ctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactatctttctactt 12226  T
Q  224 tcaaagctat-----------atacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattg-aaaactttttgtcta 311  Q
    ||||||||||           | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  12227 tcaaagctatgtaaaaaaaaaaaaaaaaacatttgctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtcta 12326  T
Q  312 ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  12327 ttttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagggtatg 12388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9184 - 8852
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | |||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9184 tgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 9085  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9084 agtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 8987  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8986 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacaggg 8887  T
Q  340 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8886 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 8852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 42 - 374
Target Start/End: Original strand, 18584 - 18918
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18584 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 18683  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
     |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18684 ggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 18781  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgt---aaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18782 acattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 18881  T
Q  338 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18882 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 18918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 13931 - 14281
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 123  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13931 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 14030  T
Q  124 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14031 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-ctctatttttcttctactt 14129  T
Q  224 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  14130 tcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaaaagc 14229  T
Q  323 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14230 aagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 14281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 15551 - 15907
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 15650  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15651 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 15749  T
Q  225 caaagctatatacaaaacattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaaca------ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttg- 316  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  15750 caaagctatatacaaaacattttccttctattttaaacgatgacaatgctcgaaacaaacattttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 15849  T
Q  317 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15850 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 15907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Original strand, 9912 - 10244
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  9912 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatga 10011  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 240  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10012 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaa 10109  T
Q  241 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10110 acattttccttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 10209  T
Q  340 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10210 tacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatg 10244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 41 - 368
Target Start/End: Original strand, 33295 - 33619
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtg 139  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33295 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 33394  T
Q  140 gagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-a 238  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||| ||| ||| |    
T  33395 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaa 33493  T
Q  239 aaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctgagcaaca 336  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||     ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33494 aaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgtaaaagcaaacctgagcaaca 33588  T
Q  337 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33589 gggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 33619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 41 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4862 - 4526
Alignment:
Q  41 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaa-ccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgt 138  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4862 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 4763  T
Q  139 ggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac- 237  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4762 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatataca 4664  T
Q  238 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4663 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaaca 4564  T
Q  337 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4563 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatg 4526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 25097 - 25454
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||| | ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25097 tcatcagaagcttctgtgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 25196  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 224  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||    
T  25197 ctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgcgcttttgtttg-aaactctactttctttctacttt 25295  T
Q  225 caaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaa-------ctttttgtctattt 314  Q
    ||||||||| |||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||        ||||||||| |||    
T  25296 caaagctatgtacgaaaaaacattatctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagttttttgtctgttt 25395  T
Q  315 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 374  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  25396 tg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatg 25454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 42 - 368
Target Start/End: Original strand, 6065 - 6388
Alignment:
Q  42 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 140  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6065 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccagtaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 6164  T
Q  141 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatat--aca 238  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||| |||  || ||||||||||| ||| |  | |    
T  6165 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcatattgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactttctttttactttcaaagttatgttcaaa 6263  T
Q  239 aaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 336  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||    
T  6264 aaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaaca 6356  T
Q  337 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6357 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 6388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 64 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 25135 - 24835
Alignment:
Q  64 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccac 162  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25135 ggaaatgtaatgattgctgggttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 25036  T
Q  163 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttga 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |    
T  25035 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaa 24937  T
Q  261 taatgac-aatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgc 359  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24936 taatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaattttt------ttttgaaaagaaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgc 24844  T
Q  360 atgagcgag 368  Q
    |||||||||    
T  24843 atgagcgag 24835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 203
Target Start/End: Original strand, 359 - 537
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  359 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 458  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  459 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26405 - 26243
Alignment:
Q  25 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 124  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||| | ||||  |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  26405 tcatcagaagcttctgtgcttgctaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgctcaatgtaccaccaacaaataaaatttccatttttcaag 26306  T
Q  125 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcct 187  Q
    |||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26305 ctttgtaaatctgtgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcct 26243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 257 - 374
Target Start/End: Original strand, 1 - 118
Alignment:
Q  257 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgtaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaac 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaac 99  T
Q  356 atgcatgagcgagagtatg 374  Q
    |||||||||| || |||||    
T  100 atgcatgagcaagtgtatg 118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 90 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 40855 - 40759
Alignment:
Q  90 tgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttt-ccaagcttt-gtgaatccgt-ggagtcatgcctttggct-gaccaccactcttatacatcaattt 181  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40855 tgtaccaccaaccaataaaaattaccatttttccaagcttttgtaaatccgttggagtcacgccttcggcttgaccaccactcttatacatcaattt 40759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 322 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 40606 - 40559
Alignment:
Q  322 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaa-catgcatgagcgag 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  40606 caaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaataatgcatgagcgag 40559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University