View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15632_high_38 (Length: 302)

Name: NF15632_high_38
Description: NF15632
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15632_high_38
NF15632_high_38
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (1-302)||(6547-6847)
scaffold0621 (8-299)||(8481-8774)
[»] chr7 (74 HSPs)
chr7 (1-302)||(18005658-18005958)
chr7 (4-300)||(67759-68054)
chr7 (5-302)||(44014190-44014481)
chr7 (2-299)||(16219527-16219823)
chr7 (5-302)||(810943-811240)
chr7 (4-300)||(47831821-47832117)
chr7 (4-299)||(16056343-16056636)
chr7 (6-298)||(15754702-15754992)
chr7 (4-300)||(22072927-22073224)
chr7 (5-298)||(34200802-34201091)
chr7 (5-298)||(11995843-11996132)
chr7 (5-302)||(28505114-28505407)
chr7 (22-299)||(12901338-12901620)
chr7 (22-295)||(20220018-20220290)
chr7 (147-295)||(16495421-16495567)
chr7 (4-207)||(9389508-9389710)
chr7 (4-145)||(16324175-16324314)
chr7 (137-299)||(2280061-2280225)
chr7 (22-126)||(15113131-15113235)
chr7 (8-173)||(15116622-15116785)
chr7 (123-299)||(1867923-1868101)
chr7 (128-299)||(14044761-14044935)
chr7 (128-299)||(14354791-14354965)
chr7 (154-295)||(13647344-13647487)
chr7 (200-302)||(38227493-38227594)
chr7 (211-292)||(12255809-12255892)
chr7 (200-300)||(18456420-18456519)
chr7 (200-302)||(3564371-3564473)
chr7 (237-302)||(12698843-12698907)
chr7 (154-300)||(17061919-17062066)
chr7 (188-296)||(10063813-10063921)
chr7 (119-296)||(19486668-19486847)
chr7 (137-291)||(15008441-15008597)
chr7 (237-298)||(16386292-16386353)
chr7 (200-300)||(48273403-48273503)
chr7 (242-302)||(9509201-9509260)
chr7 (200-298)||(26212012-26212110)
chr7 (154-300)||(456332-456479)
chr7 (154-300)||(11393291-11393438)
chr7 (154-300)||(11972507-11972654)
chr7 (154-300)||(14949126-14949273)
chr7 (154-300)||(15376717-15376864)
chr7 (154-300)||(16232531-16232678)
chr7 (154-300)||(18430723-18430870)
chr7 (154-300)||(18640283-18640430)
chr7 (154-300)||(20385127-20385274)
chr7 (154-300)||(21189599-21189746)
chr7 (154-300)||(24702249-24702396)
chr7 (154-300)||(32125502-32125649)
chr7 (154-300)||(41522928-41523075)
chr7 (154-300)||(41525390-41525537)
chr7 (200-300)||(24275182-24275281)
chr7 (243-295)||(40443410-40443462)
chr7 (244-295)||(27847881-27847932)
chr7 (154-300)||(16410070-16410217)
chr7 (154-300)||(24704699-24704843)
chr7 (154-300)||(27216871-27217018)
chr7 (154-300)||(44116520-44116667)
chr7 (237-298)||(10589055-10589115)
chr7 (200-300)||(16213695-16213794)
chr7 (252-300)||(3386344-3386391)
chr7 (251-299)||(15144096-15144143)
chr7 (261-300)||(13869357-13869396)
chr7 (261-300)||(20110567-20110606)
chr7 (203-286)||(14036282-14036366)
chr7 (203-286)||(14346312-14346396)
chr7 (5-65)||(2529866-2529926)
chr7 (5-65)||(9751363-9751423)
chr7 (261-300)||(13831384-13831423)
chr7 (245-296)||(18154894-18154944)
chr7 (261-300)||(38898489-38898528)
chr7 (6-65)||(39267460-39267519)
chr7 (242-288)||(48991206-48991252)
chr7 (245-293)||(9177718-9177766)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (1-302)||(2453-2754)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (4-302)||(19276-19574)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (2-302)||(22921678-22921978)
chr1 (1-299)||(22237642-22237941)
chr1 (4-299)||(33681022-33681317)
chr1 (1-302)||(20248291-20248588)
chr1 (4-299)||(52927794-52928076)
chr1 (22-302)||(21754057-21754327)
chr1 (8-295)||(21861385-21861672)
chr1 (22-295)||(21896087-21896358)
chr1 (5-298)||(20918620-20918909)
chr1 (1-207)||(35981496-35981701)
chr1 (22-295)||(16368115-16368388)
chr1 (4-207)||(49261447-49261649)
chr1 (22-295)||(50686630-50686905)
chr1 (22-295)||(50613945-50614219)
chr1 (22-295)||(50621773-50622047)
chr1 (147-294)||(14295507-14295652)
chr1 (4-186)||(20636977-20637158)
chr1 (38-295)||(41049880-41050138)
chr1 (201-295)||(35261086-35261180)
chr1 (8-117)||(12271744-12271852)
chr1 (216-299)||(16758664-16758749)
chr1 (95-302)||(21161728-21161932)
chr1 (154-295)||(45574846-45574989)
chr1 (200-302)||(50210220-50210322)
chr1 (200-302)||(34509792-34509894)
chr1 (147-261)||(22130863-22130975)
chr1 (136-295)||(16093825-16093987)
chr1 (200-300)||(21840778-21840877)
chr1 (245-300)||(20454606-20454660)
chr1 (243-298)||(20847205-20847259)
chr1 (154-300)||(13988877-13989024)
chr1 (154-300)||(21923295-21923442)
chr1 (154-296)||(22123071-22123215)
chr1 (238-288)||(38801433-38801483)
chr1 (147-246)||(51130632-51130729)
chr1 (154-300)||(433023-433168)
chr1 (237-298)||(21026696-21026756)
chr1 (237-298)||(27250774-27250834)
chr1 (200-302)||(22532281-22532383)
chr1 (154-300)||(21475091-21475238)
chr1 (154-300)||(23593739-23593886)
chr1 (154-300)||(29298148-29298294)
chr1 (154-300)||(29776699-29776846)
chr1 (252-300)||(31612324-31612371)
chr1 (261-300)||(13212974-13213013)
chr1 (261-300)||(21342107-21342146)
chr1 (261-300)||(21346972-21347011)
chr1 (261-300)||(21707178-21707217)
chr1 (261-300)||(21711720-21711759)
chr1 (154-293)||(26064959-26065100)
chr1 (263-300)||(16361928-16361965)
chr1 (261-300)||(15860121-15860160)
chr1 (261-300)||(21714556-21714595)
chr1 (245-300)||(22468749-22468803)
chr1 (261-300)||(16275476-16275515)
chr1 (50-110)||(16381388-16381448)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (4-302)||(14508-14806)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (1-302)||(39982-40283)
scaffold0023 (5-302)||(100386-100683)
scaffold0023 (241-298)||(119891-119948)
scaffold0023 (21-109)||(101599-101686)
scaffold0023 (237-302)||(101511-101576)
scaffold0023 (154-300)||(94422-94569)
scaffold0023 (154-300)||(17444-17591)
scaffold0023 (252-300)||(44465-44512)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (4-302)||(5655-5952)
[»] chr2 (63 HSPs)
chr2 (5-302)||(28405988-28406286)
chr2 (35-302)||(25175862-25176129)
chr2 (38-295)||(7577-7835)
chr2 (5-302)||(22134029-22134315)
chr2 (39-299)||(18786748-18787009)
chr2 (22-295)||(23791292-23791567)
chr2 (22-295)||(23207296-23207570)
chr2 (22-295)||(25108906-25109181)
chr2 (153-300)||(7679599-7679746)
chr2 (147-298)||(23071905-23072054)
chr2 (137-299)||(23708561-23708725)
chr2 (154-296)||(19671848-19671991)
chr2 (154-300)||(22105423-22105571)
chr2 (8-173)||(22459377-22459540)
chr2 (200-300)||(298821-298922)
chr2 (154-295)||(20520152-20520295)
chr2 (200-302)||(23060525-23060627)
chr2 (188-302)||(23076454-23076568)
chr2 (216-298)||(38138-38219)
chr2 (237-302)||(23285877-23285941)
chr2 (200-302)||(23660035-23660136)
chr2 (242-295)||(20309127-20309180)
chr2 (137-295)||(22413078-22413240)
chr2 (188-302)||(22337127-22337241)
chr2 (154-300)||(18808954-18809101)
chr2 (244-302)||(22731286-22731343)
chr2 (237-295)||(23103440-23103497)
chr2 (154-300)||(23130873-23131020)
chr2 (154-300)||(23133340-23133487)
chr2 (154-300)||(23709536-23709683)
chr2 (154-300)||(23712017-23712164)
chr2 (154-300)||(24367785-24367932)
chr2 (154-300)||(26505390-26505537)
chr2 (154-300)||(26507868-26508015)
chr2 (154-300)||(34402526-34402673)
chr2 (154-300)||(39682324-39682471)
chr2 (237-302)||(8946669-8946733)
chr2 (250-302)||(23040247-23040298)
chr2 (160-295)||(23004767-23004905)
chr2 (157-300)||(23135601-23135745)
chr2 (216-298)||(23654409-23654491)
chr2 (154-300)||(571408-571555)
chr2 (154-300)||(6726006-6726153)
chr2 (154-300)||(21155064-21155211)
chr2 (125-295)||(24697536-24697709)
chr2 (154-300)||(28577110-28577257)
chr2 (154-300)||(32214925-32215072)
chr2 (252-300)||(24643054-24643101)
chr2 (252-300)||(43137310-43137357)
chr2 (261-300)||(22738247-22738286)
chr2 (154-300)||(24898199-24898347)
chr2 (154-300)||(24900682-24900830)
chr2 (154-300)||(24903159-24903307)
chr2 (154-300)||(24905636-24905784)
chr2 (154-300)||(24908111-24908259)
chr2 (261-300)||(38967385-38967424)
chr2 (261-300)||(45029966-45030005)
chr2 (154-300)||(32039502-32039649)
chr2 (245-295)||(32451981-32452031)
chr2 (261-300)||(24529641-24529680)
chr2 (243-293)||(23287384-23287433)
chr2 (244-293)||(26392403-26392451)
chr2 (5-73)||(23071776-23071843)
[»] chr8 (64 HSPs)
chr8 (1-299)||(23760650-23760950)
chr8 (5-302)||(21673716-21674012)
chr8 (4-300)||(38855063-38855358)
chr8 (22-300)||(6520382-6520659)
chr8 (4-300)||(21285611-21285906)
chr8 (1-302)||(26355508-26355807)
chr8 (5-295)||(5866090-5866376)
chr8 (5-298)||(21491011-21491300)
chr8 (5-298)||(17140932-17141221)
chr8 (22-295)||(37116366-37116641)
chr8 (39-299)||(983248-983512)
chr8 (5-298)||(21249400-21249689)
chr8 (6-298)||(21255238-21255526)
chr8 (38-295)||(20498581-20498839)
chr8 (22-295)||(17266821-17267096)
chr8 (22-295)||(24353039-24353316)
chr8 (22-233)||(22364744-22364954)
chr8 (137-296)||(13508027-13508188)
chr8 (125-295)||(17439436-17439609)
chr8 (200-302)||(22626748-22626849)
chr8 (137-296)||(13597559-13597720)
chr8 (154-296)||(17612069-17612213)
chr8 (188-302)||(16092337-16092451)
chr8 (200-302)||(28649051-28649153)
chr8 (201-302)||(6759270-6759371)
chr8 (201-302)||(7372790-7372891)
chr8 (188-302)||(22875077-22875190)
chr8 (201-302)||(23406391-23406492)
chr8 (216-298)||(31971273-31971354)
chr8 (237-302)||(18818454-18818518)
chr8 (237-302)||(18879276-18879340)
chr8 (216-295)||(16199668-16199746)
chr8 (200-298)||(21919007-21919105)
chr8 (154-300)||(14409448-14409595)
chr8 (244-302)||(21923980-21924037)
chr8 (237-302)||(20536220-20536284)
chr8 (242-295)||(21396029-21396082)
chr8 (242-295)||(21790522-21790575)
chr8 (154-300)||(1484413-1484560)
chr8 (154-300)||(5853296-5853443)
chr8 (154-300)||(16413320-16413467)
chr8 (154-300)||(20046199-20046346)
chr8 (154-300)||(20403238-20403385)
chr8 (154-300)||(22001764-22001911)
chr8 (242-295)||(21389499-21389552)
chr8 (242-295)||(21778825-21778878)
chr8 (188-300)||(26219728-26219838)
chr8 (243-295)||(45131047-45131098)
chr8 (125-295)||(19154816-19154989)
chr8 (154-300)||(41598199-41598346)
chr8 (252-300)||(4542477-4542524)
chr8 (252-300)||(19896276-19896323)
chr8 (261-300)||(26225359-26225398)
chr8 (261-300)||(45290807-45290846)
chr8 (154-300)||(4483292-4483438)
chr8 (154-300)||(15203235-15203382)
chr8 (261-298)||(15070571-15070608)
chr8 (155-295)||(19801387-19801527)
chr8 (261-300)||(19937118-19937157)
chr8 (261-300)||(18678170-18678209)
chr8 (245-300)||(23648567-23648621)
chr8 (261-300)||(25484380-25484419)
chr8 (186-233)||(40492844-40492891)
chr8 (119-183)||(37515837-37515901)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (5-302)||(2616-2915)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (5-256)||(2030-2281)
[»] chr3 (90 HSPs)
chr3 (4-299)||(15470939-15471233)
chr3 (1-302)||(16097340-16097641)
chr3 (5-302)||(16103792-16104088)
chr3 (4-300)||(14234501-14234799)
chr3 (5-302)||(32307689-32307976)
chr3 (5-298)||(13210141-13210432)
chr3 (5-302)||(49667897-49668185)
chr3 (5-302)||(9512932-9513216)
chr3 (5-302)||(9520907-9521191)
chr3 (83-302)||(12174152-12174368)
chr3 (5-302)||(1644496-1644782)
chr3 (38-295)||(37251012-37251270)
chr3 (16-186)||(49389453-49389622)
chr3 (4-207)||(1465222-1465424)
chr3 (38-295)||(22110196-22110454)
chr3 (137-295)||(52523669-52523831)
chr3 (5-123)||(12934124-12934242)
chr3 (188-300)||(27165261-27165373)
chr3 (188-300)||(53301545-53301658)
chr3 (119-296)||(24340647-24340826)
chr3 (22-144)||(43927304-43927425)
chr3 (154-295)||(43925977-43926121)
chr3 (188-296)||(23274705-23274813)
chr3 (1-79)||(12171914-12171992)
chr3 (201-302)||(11424768-11424868)
chr3 (200-298)||(12399225-12399323)
chr3 (200-302)||(14972866-14972968)
chr3 (200-302)||(18438546-18438648)
chr3 (188-296)||(42386428-42386536)
chr3 (119-296)||(37642189-37642368)
chr3 (154-300)||(17672637-17672784)
chr3 (216-301)||(14572602-14572686)
chr3 (237-302)||(20698480-20698544)
chr3 (154-295)||(43550482-43550625)
chr3 (200-300)||(24153216-24153315)
chr3 (188-300)||(36166609-36166719)
chr3 (249-300)||(28194704-28194755)
chr3 (154-300)||(7781351-7781498)
chr3 (200-295)||(12377940-12378037)
chr3 (154-300)||(29172587-29172734)
chr3 (237-302)||(13442286-13442350)
chr3 (237-302)||(23083406-23083470)
chr3 (188-300)||(21618460-21618570)
chr3 (201-299)||(26686902-26687000)
chr3 (200-295)||(606332-606428)
chr3 (154-300)||(9707611-9707758)
chr3 (154-300)||(12567571-12567718)
chr3 (154-300)||(13544036-13544183)
chr3 (154-300)||(16282815-16282962)
chr3 (154-300)||(17463189-17463336)
chr3 (154-300)||(34159337-34159484)
chr3 (154-300)||(38961895-38962042)
chr3 (154-300)||(45606911-45607058)
chr3 (154-300)||(50242833-50242980)
chr3 (154-300)||(55476502-55476649)
chr3 (237-302)||(17487868-17487932)
chr3 (237-302)||(17499350-17499414)
chr3 (200-302)||(25476392-25476494)
chr3 (157-300)||(28848618-28848762)
chr3 (154-300)||(8899105-8899252)
chr3 (154-300)||(16454285-16454432)
chr3 (201-302)||(43840944-43841045)
chr3 (200-300)||(6469186-6469285)
chr3 (200-301)||(14576840-14576940)
chr3 (137-296)||(22147467-22147628)
chr3 (200-300)||(40213728-40213827)
chr3 (154-295)||(53070657-53070799)
chr3 (200-300)||(55500953-55501052)
chr3 (137-252)||(2051141-2051260)
chr3 (252-300)||(15977526-15977573)
chr3 (252-300)||(17737247-17737294)
chr3 (261-300)||(8499529-8499568)
chr3 (261-300)||(10556996-10557035)
chr3 (154-300)||(13151794-13151942)
chr3 (154-300)||(13154259-13154407)
chr3 (6-65)||(14665853-14665912)
chr3 (6-65)||(14735366-14735425)
chr3 (261-300)||(15412440-15412479)
chr3 (261-300)||(41123901-41123940)
chr3 (261-300)||(45577950-45577989)
chr3 (154-300)||(10247727-10247874)
chr3 (154-300)||(17446659-17446805)
chr3 (6-65)||(4588602-4588661)
chr3 (261-300)||(12119837-12119876)
chr3 (6-65)||(14669008-14669067)
chr3 (261-300)||(44494820-44494859)
chr3 (6-65)||(12340000-12340059)
chr3 (261-300)||(46822279-46822318)
chr3 (243-293)||(13919350-13919399)
chr3 (22-67)||(324481-324526)
[»] chr5 (64 HSPs)
chr5 (2-300)||(21329306-21329604)
chr5 (28-300)||(21501989-21502263)
chr5 (1-302)||(21565554-21565855)
chr5 (1-302)||(22959343-22959641)
chr5 (2-299)||(26011845-26012141)
chr5 (1-302)||(19668910-19669210)
chr5 (40-295)||(20026787-20027043)
chr5 (5-298)||(19660651-19660940)
chr5 (38-295)||(22178064-22178323)
chr5 (4-207)||(21741356-21741546)
chr5 (154-295)||(22144068-22144211)
chr5 (213-295)||(36314596-36314678)
chr5 (200-302)||(1096479-1096581)
chr5 (200-298)||(21729071-21729169)
chr5 (200-298)||(21808396-21808494)
chr5 (208-302)||(21997549-21997643)
chr5 (200-302)||(24493581-24493682)
chr5 (237-302)||(8286888-8286952)
chr5 (188-300)||(22412198-22412309)
chr5 (200-302)||(24529232-24529334)
chr5 (119-296)||(40725871-40726050)
chr5 (200-302)||(13025323-13025424)
chr5 (200-302)||(13095507-13095608)
chr5 (201-302)||(25421544-25421645)
chr5 (237-302)||(23390541-23390605)
chr5 (200-302)||(9077964-9078066)
chr5 (200-298)||(22075035-22075133)
chr5 (154-300)||(264772-264919)
chr5 (154-300)||(10732944-10733091)
chr5 (154-300)||(11581203-11581350)
chr5 (154-299)||(20902012-20902159)
chr5 (154-300)||(20909023-20909170)
chr5 (154-300)||(29329945-29330092)
chr5 (154-300)||(39363395-39363542)
chr5 (160-261)||(29448055-29448159)
chr5 (242-295)||(37723922-37723975)
chr5 (200-294)||(25431414-25431508)
chr5 (154-300)||(42245369-42245516)
chr5 (154-300)||(36154787-36154931)
chr5 (252-300)||(20918052-20918099)
chr5 (243-295)||(21293020-21293071)
chr5 (252-300)||(39245147-39245194)
chr5 (261-300)||(2154726-2154765)
chr5 (6-65)||(22120007-22120066)
chr5 (261-300)||(23064522-23064561)
chr5 (261-300)||(38619445-38619484)
chr5 (154-300)||(29345991-29346138)
chr5 (263-300)||(10775790-10775827)
chr5 (261-300)||(18319146-18319185)
chr5 (6-65)||(24767151-24767210)
chr5 (261-300)||(31061079-31061118)
chr5 (6-48)||(5888990-5889032)
chr5 (244-298)||(26732884-26732937)
chr5 (154-300)||(29348464-29348611)
chr5 (154-300)||(29350937-29351084)
chr5 (38-109)||(27988774-27988845)
chr5 (39-295)||(15796438-15796696)
chr5 (261-300)||(20806854-20806893)
chr5 (38-109)||(25743925-25743996)
chr5 (261-296)||(26704089-26704124)
chr5 (244-295)||(26740697-26740747)
chr5 (261-296)||(26973822-26973857)
chr5 (261-300)||(32027404-32027443)
chr5 (216-300)||(18418594-18418677)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (1-302)||(129917-130218)
scaffold0010 (191-295)||(60713-60818)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (1-302)||(6824-7122)
scaffold0556 (30-232)||(8097-8299)
[»] chr4 (69 HSPs)
chr4 (4-300)||(39706100-39706395)
chr4 (5-302)||(12774019-12774306)
chr4 (39-299)||(12288055-12288316)
chr4 (1-302)||(8846368-8846685)
chr4 (38-295)||(13695-13953)
chr4 (29-298)||(15551833-15552098)
chr4 (5-276)||(16596686-16596953)
chr4 (4-207)||(15190423-15190625)
chr4 (22-299)||(43198384-43198661)
chr4 (4-207)||(15099456-15099658)
chr4 (22-295)||(53081979-53082254)
chr4 (22-295)||(46640285-46640558)
chr4 (191-299)||(52243192-52243302)
chr4 (200-302)||(16377530-16377630)
chr4 (201-302)||(52873375-52873476)
chr4 (237-302)||(7088889-7088953)
chr4 (237-302)||(7798786-7798850)
chr4 (200-302)||(6899903-6900004)
chr4 (208-302)||(16270251-16270344)
chr4 (154-300)||(18215278-18215425)
chr4 (154-300)||(19618176-19618323)
chr4 (154-300)||(44615299-44615446)
chr4 (154-300)||(51463872-51464019)
chr4 (237-298)||(3096309-3096369)
chr4 (237-298)||(12902773-12902833)
chr4 (188-300)||(14280327-14280438)
chr4 (242-295)||(17046506-17046559)
chr4 (188-300)||(54798749-54798861)
chr4 (200-298)||(23374366-23374464)
chr4 (154-300)||(12311-12458)
chr4 (201-302)||(7893715-7893816)
chr4 (154-300)||(15118356-15118503)
chr4 (200-302)||(16239977-16240078)
chr4 (154-300)||(44773091-44773238)
chr4 (154-300)||(44928883-44929031)
chr4 (154-300)||(52312521-52312668)
chr4 (200-300)||(23803317-23803416)
chr4 (200-302)||(14038660-14038762)
chr4 (245-295)||(6190481-6190531)
chr4 (244-302)||(22636447-22636504)
chr4 (154-300)||(50222343-50222490)
chr4 (188-297)||(8574864-8574971)
chr4 (237-302)||(44052841-44052905)
chr4 (252-300)||(1837613-1837660)
chr4 (252-300)||(7641286-7641333)
chr4 (252-300)||(12610961-12611008)
chr4 (261-300)||(15355437-15355476)
chr4 (261-300)||(18239531-18239570)
chr4 (261-300)||(19242710-19242749)
chr4 (6-65)||(24028989-24029048)
chr4 (261-300)||(44102225-44102264)
chr4 (154-300)||(3515018-3515165)
chr4 (56-122)||(14164741-14164807)
chr4 (5-65)||(22634026-22634086)
chr4 (216-295)||(14053325-14053403)
chr4 (261-300)||(14970819-14970858)
chr4 (6-65)||(20157104-20157163)
chr4 (56-122)||(14158036-14158102)
chr4 (245-295)||(22353852-22353901)
chr4 (6-47)||(3332151-3332192)
chr4 (6-65)||(13812623-13812682)
chr4 (261-296)||(15367708-15367743)
chr4 (261-296)||(15370036-15370071)
chr4 (261-296)||(15371220-15371255)
chr4 (261-296)||(15373501-15373536)
chr4 (261-296)||(15402721-15402756)
chr4 (261-296)||(16223550-16223585)
chr4 (191-232)||(15464929-15464970)
chr4 (263-295)||(21815699-21815731)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (5-302)||(12778-13075)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (22-299)||(10542-10819)
[»] chr6 (75 HSPs)
chr6 (1-302)||(19652207-19652506)
chr6 (22-295)||(23019425-23019698)
chr6 (5-297)||(28496287-28496575)
chr6 (5-297)||(29808698-29808986)
chr6 (6-298)||(1561319-1561609)
chr6 (22-299)||(19668386-19668664)
chr6 (16-255)||(22080562-22080800)
chr6 (38-299)||(9098370-9098620)
chr6 (38-299)||(20109153-20109417)
chr6 (213-300)||(27333238-27333325)
chr6 (213-300)||(27393978-27394065)
chr6 (23-302)||(4185654-4185930)
chr6 (22-295)||(23076749-23077024)
chr6 (22-295)||(35008167-35008442)
chr6 (22-147)||(27333114-27333238)
chr6 (22-147)||(27393854-27393978)
chr6 (208-302)||(4186379-4186473)
chr6 (201-302)||(20076712-20076812)
chr6 (6-259)||(4668028-4668277)
chr6 (6-259)||(4674875-4675124)
chr6 (22-302)||(31155228-31155506)
chr6 (211-299)||(25644335-25644424)
chr6 (200-298)||(16496260-16496358)
chr6 (200-302)||(29060552-29060654)
chr6 (8-295)||(18199231-18199519)
chr6 (119-298)||(8227435-8227616)
chr6 (154-300)||(22782238-22782385)
chr6 (200-302)||(18409834-18409936)
chr6 (200-302)||(19303548-19303649)
chr6 (154-300)||(30676714-30676861)
chr6 (201-300)||(17287804-17287903)
chr6 (39-295)||(18177517-18177775)
chr6 (39-295)||(18204096-18204354)
chr6 (246-293)||(22831524-22831571)
chr6 (200-302)||(25629362-25629464)
chr6 (154-300)||(1595560-1595707)
chr6 (154-300)||(2291184-2291331)
chr6 (154-300)||(12742328-12742475)
chr6 (154-300)||(18334596-18334743)
chr6 (154-300)||(19005057-19005204)
chr6 (154-300)||(19858923-19859070)
chr6 (154-300)||(24422558-24422705)
chr6 (154-300)||(25754820-25754967)
chr6 (154-300)||(33861805-33861952)
chr6 (154-300)||(33864289-33864436)
chr6 (242-291)||(16920679-16920728)
chr6 (245-302)||(20361013-20361069)
chr6 (237-302)||(20638328-20638392)
chr6 (208-300)||(25656640-25656731)
chr6 (242-295)||(35245605-35245658)
chr6 (200-302)||(20593785-20593887)
chr6 (154-300)||(8055040-8055187)
chr6 (154-300)||(26924644-26924791)
chr6 (251-295)||(11185524-11185568)
chr6 (252-300)||(25714431-25714478)
chr6 (91-183)||(28103796-28103887)
chr6 (250-300)||(25688513-25688562)
chr6 (125-293)||(33443068-33443235)
chr6 (154-300)||(34963384-34963531)
chr6 (154-295)||(18456735-18456877)
chr6 (261-302)||(22780295-22780336)
chr6 (252-300)||(1541015-1541062)
chr6 (252-300)||(3852121-3852168)
chr6 (252-300)||(20556996-20557043)
chr6 (261-300)||(16448639-16448678)
chr6 (252-295)||(18461895-18461937)
chr6 (252-295)||(18821904-18821946)
chr6 (125-262)||(18706356-18706495)
chr6 (127-233)||(18696569-18696675)
chr6 (261-300)||(19848063-19848102)
chr6 (39-117)||(23539165-23539243)
chr6 (267-300)||(22080799-22080832)
chr6 (6-66)||(4189203-4189262)
chr6 (262-302)||(4738626-4738666)
chr6 (135-183)||(18896256-18896304)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (4-300)||(5934-6230)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (22-299)||(10370-10647)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-302)||(45600-45901)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-302)||(160696-160996)
scaffold0001 (154-300)||(501095-501242)
scaffold0001 (261-300)||(85692-85731)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (4-299)||(32551-32844)
scaffold0034 (245-295)||(51936-51985)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (4-300)||(6625-6921)
scaffold0333 (4-300)||(14005-14301)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (5-296)||(62216-62503)
scaffold0028 (6-302)||(132670-132959)
scaffold0028 (154-300)||(136691-136838)
scaffold0028 (154-300)||(139160-139307)
scaffold0028 (154-300)||(144098-144245)
scaffold0028 (154-300)||(134222-134369)
scaffold0028 (154-300)||(141629-141776)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (4-300)||(1096-1391)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (4-300)||(846-1141)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (4-302)||(141-438)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (28-299)||(22509-22776)
scaffold0037 (154-300)||(82083-82230)
scaffold0037 (6-65)||(80146-80205)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (4-299)||(12954-13248)
scaffold0138 (22-233)||(18066-18277)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (4-299)||(7888-8180)
scaffold0218 (5-267)||(29093-29354)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (5-300)||(15675-15966)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (5-298)||(11308-11598)
scaffold0046 (75-298)||(2013-2233)
scaffold0046 (200-302)||(28426-28528)
scaffold0046 (258-298)||(4568-4608)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (22-295)||(136196-136471)
scaffold0021 (22-295)||(144904-145179)
scaffold0021 (242-295)||(174785-174838)
scaffold0021 (244-302)||(121778-121835)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (22-295)||(12587-12860)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (38-295)||(53393-53651)
scaffold0075 (5-65)||(8107-8167)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (22-295)||(6111-6386)
scaffold0420 (248-295)||(13793-13840)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (22-299)||(103467-103737)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (21-298)||(34139-34413)
scaffold0175 (261-302)||(285-326)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (32-295)||(128809-129072)
scaffold0022 (22-291)||(78345-78614)
scaffold0022 (188-300)||(116441-116551)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (23-295)||(97024-97297)
scaffold0006 (23-295)||(106302-106575)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (23-293)||(7888-8161)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (5-302)||(32110-32390)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (28-291)||(38339-38604)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (22-264)||(54-298)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (147-295)||(1025-1171)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (5-123)||(28623-28741)
scaffold0211 (230-302)||(28806-28879)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (4-122)||(15643-15761)
scaffold0020 (208-300)||(15792-15884)
scaffold0020 (261-296)||(178912-178947)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (22-295)||(19713-19987)
scaffold0080 (209-302)||(39925-40017)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (208-299)||(23898-23989)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (22-295)||(569-841)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (5-245)||(2258-2494)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (188-300)||(38697-38809)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (188-295)||(1051-1158)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (38-295)||(1642-1900)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (154-299)||(25121-25268)
scaffold0123 (125-233)||(619-727)
scaffold0123 (22-67)||(25353-25398)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (59-295)||(267679-267916)
[»] scaffold0357 (5 HSPs)
scaffold0357 (200-295)||(13147-13242)
scaffold0357 (191-299)||(16098-16206)
scaffold0357 (243-295)||(2680-2732)
scaffold0357 (4-65)||(15911-15971)
scaffold0357 (2-63)||(13381-13441)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (188-302)||(3146-3259)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (5-97)||(2115-2207)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (191-299)||(27747-27855)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (188-302)||(39489-39602)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (188-302)||(75210-75323)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (119-296)||(17951-18130)
scaffold0247 (261-300)||(2241-2280)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (6-259)||(9133-9382)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (137-296)||(11482-11643)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (137-296)||(38198-38359)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (200-302)||(3193-3295)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (188-302)||(25908-26021)
scaffold0026 (188-302)||(39870-39983)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (200-298)||(4865-4963)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (200-302)||(26072-26174)
scaffold0122 (188-300)||(44702-44814)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (200-302)||(17222-17326)
scaffold0056 (252-295)||(79388-79430)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (200-302)||(38773-38874)
scaffold0145 (208-302)||(32954-33047)
scaffold0145 (252-300)||(9760-9807)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (200-302)||(32964-33065)
scaffold0120 (200-302)||(45940-46041)
scaffold0120 (237-302)||(16125-16189)
scaffold0120 (252-302)||(17389-17438)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (242-295)||(51601-51654)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (244-295)||(1308-1359)
scaffold0106 (242-295)||(7285-7338)
scaffold0106 (245-300)||(15291-15345)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (228-298)||(13513-13582)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (201-302)||(51925-52026)
scaffold0011 (237-298)||(168023-168083)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (200-300)||(10784-10883)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (242-295)||(16301-16354)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (237-302)||(13223-13287)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (237-302)||(1863-1927)
scaffold0016 (6-65)||(207333-207392)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (242-298)||(10472-10528)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (201-302)||(8541-8638)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (154-295)||(20383-20524)
scaffold0031 (260-300)||(128765-128805)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (216-299)||(339972-340053)
scaffold0003 (154-300)||(158454-158601)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (243-298)||(32083-32137)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (199-295)||(2694-2791)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (237-296)||(24348-24406)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (154-300)||(4705-4852)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (154-300)||(20758-20905)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (154-300)||(16795-16942)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (154-300)||(37832-37979)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (216-298)||(15487-15568)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (237-298)||(1093-1153)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (237-298)||(4728-4788)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (237-302)||(3482-3546)
scaffold0292 (237-296)||(361-419)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (237-302)||(6166-6233)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (248-295)||(5183-5230)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (157-300)||(13403-13547)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (188-302)||(4520-4633)
scaffold0228 (188-302)||(12102-12215)
scaffold0228 (188-302)||(22054-22167)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (244-295)||(47014-47065)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (154-300)||(13958-14105)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (201-302)||(16608-16709)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (200-300)||(4308-4407)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (237-302)||(8491-8555)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (242-295)||(1098-1151)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (200-300)||(9253-9352)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (200-300)||(22897-22996)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (200-296)||(20928-21025)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (200-295)||(1971-2066)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (1-48)||(3196-3243)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (247-302)||(4888-4942)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (154-300)||(117-264)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (154-300)||(40411-40558)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (154-300)||(11299-11446)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (237-298)||(11488-11548)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (252-297)||(29946-29990)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (252-300)||(12353-12400)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (5-65)||(10158-10218)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (252-295)||(11982-12024)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (6-53)||(288-335)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (261-300)||(23853-23892)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (6-65)||(9648-9707)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (261-300)||(36464-36503)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (261-300)||(1393-1432)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (238-293)||(4545-4599)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (39-181)||(157-297)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (263-300)||(4225-4262)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (267-300)||(12075-12108)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (265-298)||(161206-161239)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (109-183)||(675-749)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (243-293)||(206575-206624)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (137-256)||(225465-225585)


Alignment Details
Target: scaffold0621 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 6847 - 6547
Alignment:
Q  1 actagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgct 100  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  6847 actagttacaaaatgccttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtt-atcttgct 6749  T
Q  101 gttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  6748 gttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgt 6649  T
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6648 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6549  T
Q  301 ga 302  Q
    ||    
T  6548 ga 6547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8774 - 8481
Alignment:
Q  8 acagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttg 107  Q
    |||||||||||| || ||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8774 acagaatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgaattgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgttg 8676  T
Q  108 tttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataat--tgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagagattgt 203  Q
    || ||||||| ||||| || |||||  | ||||||||  |||||  |||||||  |||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||  |||     
T  8675 ttccagtaagactgatgta-tatgaattgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttga 8577  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8576 tgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 74)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18005958 - 18005658
Alignment:
Q  1 actagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgct 100  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005958 actagttacaaaatgccttgtttaggataa-tgcgatctttgtcgcacaagttgatatgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgct 18005860  T
Q  101 gttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  18005859 gttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgt 18005760  T
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005759 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttccatactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18005660  T
Q  301 ga 302  Q
    ||    
T  18005659 ga 18005658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 4 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 68054 - 67759
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68054 agttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 67955  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgt 203  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  67954 gttgtttcagtgagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgata-ttgagatgttgt 67856  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67855 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 67759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 44014481 - 44014190
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  44014481 gttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatcattgtcgcacgaattgatgtgagttgatc--agaggttaaaaactaagttgtt-atcttgctgttg 44014385  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgtt 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  44014384 ttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtttttaatggtatataactgtatatacattatatgaattatgttgatatttgaga---tgtt 44014288  T
Q  205 gatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014287 gatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 44014190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 299
Target Start/End: Original strand, 16219527 - 16219823
Alignment:
Q  2 ctagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctg 101  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16219527 ctagttacagaatgccttgtt-aggttaaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgttagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgctg 16219625  T
Q  102 ttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagagat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||  |    
T  16219626 ttgttgtttcagtaagcctgaatt-atataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttaagatgt 16219724  T
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16219725 tgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 16219823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Original strand, 810943 - 811240
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    |||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  810943 gttacaaaatgccttgtttaagttaaatgcgatctttgtcgcgcaagttgatgtgagttgaccttggaagttagaaactaagttatttatcttgctgttg 811042  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagagattgt 203  Q
    | |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||  ||  ||      
T  811043 tagtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttaa 811141  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811142 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 811240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 47832117 - 47831821
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  47832117 agttacagaatgctttgtttaggttaaatgtgatctttgtcggacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgttgtt 47832018  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagagattg 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||  |||    
T  47832017 gttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgtcgctaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtttgatgtttatgatgttg 47831919  T
Q  203 ttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831918 atgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatatgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 47831821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16056636 - 16056343
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16056636 agttacagaatgccttgtt-aggttaaatgcgatctttgtagcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgtt 16056538  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagagattg 202  Q
    |||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  |||    
T  16056537 gttgtttcggtaagcctga-atgatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttg 16056439  T
Q  203 ttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16056438 ttgatttgcatttgatattgttatatcatgttg-tttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 298
Target Start/End: Original strand, 15754702 - 15754992
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgt 105  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15754702 ttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaa 15754801  T
Q  106 tgtttcagtaagcctgatttaatatga-tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgt 203  Q
    | || ||||||| |||||  | ||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||    
T  15754802 tattccagtaagactgatgca-tatgaatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgag---ttgt 15754897  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15754898 tgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 15754992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22073224 - 22072927
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    ||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  22073224 agttacagaatgctttgtt-aggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttacaggtaaggaactaagttgtttgtcttgatgtt 22073126  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagagatt 201  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||  ||    
T  22073125 gttgtttcagtaagcctgaatt-atataatctaatgttgttgttaatgttatataattgcatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgtt 22073027  T
Q  202 gttgatttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22073026 gttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgat 22072927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 34201091 - 34200802
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||  ||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  34201091 gttacataatgcctt-tttaggttaaatgcgatccctgtcattcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgtta 34200993  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgt 203  Q
     |||  ||||||| |||||    |||||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||    
T  34200992 atgtcccagtaagactgatgct-tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgt 34200897  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200896 tgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 34200802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 298
Target Start/End: Original strand, 11995843 - 11996132
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  11995843 gttacagaatgcctt-tttaggttaaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagtttatcttagaggttagaaactaatttgtttaccttgctgtta 11995941  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgt 203  Q
     |||  ||||||| |||||    |||||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||   ||||    
T  11995942 atgtcccagtaagactgatgct-tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgatatttgag---ttgt 11996037  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11996038 tgatttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttg 11996132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Original strand, 28505114 - 28505407
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||      
T  28505114 gttacagaatgcctt-tttaggttgaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgtca 28505212  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgt 203  Q
     |||| ||||||| |||||    |||||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   |||     
T  28505213 atgttccagtaagactgatgct-tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgc 28505308  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||  || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28505309 tgatttatatccgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatga 28505407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12901620 - 12901338
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggt---ta-gaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaag 117  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12901620 ttaggttaaatgtgacatttgtcgtacgagttgatgtgagttgatcttggaggtacgtaggaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaag 12901521  T
Q  118 cctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcg 216  Q
    | ||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||  ||| || |||||||| |    
T  12901520 cttgaatt-atatgatttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtatgat-gttgtgatgttgctgttttgcatttg 12901423  T
Q  217 atattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||||||||  |  |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12901422 atattgttatatcatgaattattttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Original strand, 20220018 - 20220290
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20220018 ttaggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgaggtgatcacaggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcctg 20220117  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    |||| | ||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||   |||||||||||||| |||||    
T  20220118 attt-agatgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgaga---tgttgatttgcatttgatat 20220213  T
Q  221 tgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||  || |||   |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20220214 tgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 147 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16495567 - 16495421
Alignment:
Q  147 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 245  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16495567 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 16495471  T
Q  246 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495470 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16495421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Original strand, 9389508 - 9389710
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  | |||| ||||    
T  9389508 agttacagaatgccttgtttaggttaaaagcgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatcgaccttgatgtt 9389607  T
Q  104 gttgtttcagtaagcct-gatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattg 202  Q
    ||  || |||||||||| ||||  ||||  |||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||    
T  9389608 gtcattccagtaagcctggattgtatat--tctaatattgatgataatgttatataattgtatatacattgtatgaattatgttgatatatgagatgttg 9389705  T
Q  203 ttgat 207  Q
    |||||    
T  9389706 ttgat 9389710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16324314 - 16324175
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16324314 agttacagaatgccttgtt-aggttaaatgtgatccttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgttgatcttgctgtt 16324216  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttg 145  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||    
T  16324215 gttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttg 16324175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 137 - 299
Target Start/End: Original strand, 2280061 - 2280225
Alignment:
Q  137 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  |||||  |||||||| |||||  ||||| |||||||| | ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  2280061 atgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgct 2280160  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2280161 gttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 2280225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 15113235 - 15113131
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  15113235 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaagactg 15113136  T
Q  122 attta 126  Q
    |||||    
T  15113135 attta 15113131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15116785 - 15116622
Alignment:
Q  8 acagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttg 107  Q
    |||||||||||| || ||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  15116785 acagaatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctactgttattg 15116687  T
Q  108 tttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacatta 173  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||  | ||||| ||  |||||  ||||||||||||||| ||||    
T  15116686 tttcagtaagactgatgt-atatgagttgatgttatttataatgtgatataattgtatatatatta 15116622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 299
Target Start/End: Original strand, 1867923 - 1868101
Alignment:
Q  123 tttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatatt 221  Q
    ||||| ||||| | ||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  1867923 tttaagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgcatt-gatatt 1868021  T
Q  222 gttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||  || |||  ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868022 gttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14044935 - 14044761
Alignment:
Q  128 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattg-ttgatttgcattcgatattgtta 225  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||  ||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  14044935 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgtta 14044837  T
Q  226 tatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||| ||  || |||   |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044836 tatcaggagctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14354965 - 14354791
Alignment:
Q  128 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattg-ttgatttgcattcgatattgtta 225  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||  ||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  14354965 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgtta 14354867  T
Q  226 tatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||| ||  || |||   |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354866 tatcaggagctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 154 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13647487 - 13647344
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |||||||||||    
T  13647487 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcct 13647388  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647387 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 38227594 - 38227493
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38227594 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtaga 38227496  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  38227495 tga 38227493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 211 - 292
Target Start/End: Original strand, 12255809 - 12255892
Alignment:
Q  211 cattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255809 catttgatattgttatatcatgaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 300
Target Start/End: Original strand, 18456420 - 18456519
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456420 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18456518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Original strand, 3564371 - 3564473
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564371 ttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 3564469  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  3564470 atga 3564473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12698907 - 12698843
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698907 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 12698843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 17061919 - 17062066
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 251  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||| ||| ||||||  ||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||||||  |    
T  17061919 atataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctattttgtatactgctga 17062018  T
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17062019 -gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17062066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 296
Target Start/End: Original strand, 10063813 - 10063921
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||  ||||| | |||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10063813 atatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtc 10063912  T
Q  288 ggtctaagt 296  Q
     ||||||||    
T  10063913 agtctaagt 10063921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 296
Target Start/End: Original strand, 19486668 - 19486847
Alignment:
Q  119 ctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagagattgttgatttgcattcg 216  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||| | |||| ||||||||  ||||| | || | | ||    
T  19486668 ctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcg 19486767  T
Q  217 atattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19486768 atattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 19486847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 291
Target Start/End: Original strand, 15008441 - 15008597
Alignment:
Q  137 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga-- 233  Q
    ||||||||  |||||  ||||| |||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  15008441 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaac 15008539  T
Q  234 tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 291  Q
    || |||  ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15008540 tgttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 15008597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 298
Target Start/End: Original strand, 16386292 - 16386353
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386292 tttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16386353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 48273503 - 48273403
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48273503 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttg 48273405  T
Q  299 at 300  Q
    ||    
T  48273404 at 48273403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 9509260 - 9509201
Alignment:
Q  242 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509260 atactgcctatgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 9509201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26212110 - 26212012
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26212110 ttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttg 26212012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 456479 - 456332
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  456479 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 456381  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456380 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 456332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 11393291 - 11393438
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  11393291 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 11393389  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393390 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 11393438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11972654 - 11972507
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  11972654 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 11972556  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972555 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 11972507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 14949126 - 14949273
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  14949126 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 14949224  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949225 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14949273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 15376717 - 15376864
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  15376717 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 15376815  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376816 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15376864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16232678 - 16232531
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  16232678 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16232580  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232579 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16232531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18430870 - 18430723
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||  |    
T  18430870 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-t 18430772  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430771 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18430723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18640430 - 18640283
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  18640430 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 18640332  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640331 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18640283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 20385127 - 20385274
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  20385127 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20385225  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385226 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20385274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 21189599 - 21189746
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  21189599 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21189697  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189698 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21189746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24702396 - 24702249
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  24702396 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 24702298  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702297 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24702249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 32125649 - 32125502
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  32125649 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 32125551  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125550 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32125502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41523075 - 41522928
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  41523075 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 41522977  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41522976 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 41522928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41525537 - 41525390
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  41525537 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 41525439  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525438 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 41525390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24275281 - 24275182
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275281 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24275184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 243 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 40443462 - 40443410
Alignment:
Q  243 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40443462 tactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 40443410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 295
Target Start/End: Original strand, 27847881 - 27847932
Alignment:
Q  244 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27847881 actgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaag 27847932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16410217 - 16410070
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  16410217 atataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16410119  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410118 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16410070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24704843 - 24704699
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 251  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| || || |  |||| ||||||  |     
T  24704843 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtt--tttgtatactgt-tg 24704747  T
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704746 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24704699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27217018 - 27216871
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  27217018 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 27216920  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27216919 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 27216871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 44116667 - 44116520
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| ||||   ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  44116667 atataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-t 44116569  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44116568 gtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44116520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10589115 - 10589055
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10589115 tttgtatactgcatatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 10589055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16213794 - 16213695
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213794 ttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16213697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3386391 - 3386344
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386391 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3386344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 299
Target Start/End: Original strand, 15144096 - 15144143
Alignment:
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144096 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13869396 - 13869357
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13869357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110567
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20110567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14036366 - 14036282
Alignment:
Q  203 ttgatttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 286  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14036366 ttgatttgtatt-gatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14346396 - 14346312
Alignment:
Q  203 ttgatttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 286  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14346396 ttgatttgtatt-gatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 65
Target Start/End: Original strand, 2529866 - 2529926
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttga 65  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  2529866 gttacagaatgccttaattaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 2529926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 65
Target Start/End: Original strand, 9751363 - 9751423
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttga 65  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  9751363 gttacagaatgccttgtttagtttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 9751423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13831423 - 13831384
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13831423 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgat 13831384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 296
Target Start/End: Original strand, 18154894 - 18154944
Alignment:
Q  245 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18154894 ctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 18154944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 38898489 - 38898528
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38898489 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 38898528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Original strand, 39267460 - 39267519
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttga 65  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  39267460 ttacagaatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 39267519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 48991252 - 48991206
Alignment:
Q  242 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48991252 atactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 48991206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 293
Target Start/End: Original strand, 9177718 - 9177766
Alignment:
Q  245 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9177718 ctgcatatgttgttgtttattattgaattaagctgcatgagtcggtcta 9177766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 2453 - 2754
Alignment:
Q  1 actagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2453 actagttacagaatgccttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaattaagttgtttatcttgct 2552  T
Q  101 gttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagat 200  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  2553 gatgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgt 2652  T
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653 tgttgatttgcattcaatattgttataacatgatgatttacatactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 2752  T
Q  301 ga 302  Q
    ||    
T  2753 ga 2754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19574 - 19276
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    |||||||||||| |||  ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19574 agttacagaatgtcttgcttatgttaaatgcgatccttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgatgtt 19475  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgt 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  19474 gttgtttcagtaaccctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgt 19375  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19374 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 19276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 2 - 302
Target Start/End: Original strand, 22921678 - 22921978
Alignment:
Q  2 ctagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctg 101  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921678 ctagttacagaatgccttgtttgggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctg 22921777  T
Q  102 ttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  22921778 ttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaattttgttgatatttgagatgtt 22921877  T
Q  202 gttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22921878 gttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatg 22921977  T
Q  302 a 302  Q
    |    
T  22921978 a 22921978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22237941 - 22237642
Alignment:
Q  1 actagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgct 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22237941 actagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttttcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgct 22237842  T
Q  101 g-ttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagag 198  Q
    | |||||||| |||  || |||||  | |||||  | ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  22237841 gattgttgttccagcgagactgataca-tatgaattgatgttgtttctaaagttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagat 22237743  T
Q  199 attgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
     ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22237742 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttg 22237643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33681317 - 33681022
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    ||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33681317 agttacagagtgccttgcttatgttaaatgcgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgtt 33681218  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattg 202  Q
    ||||||  |||||| |||||  | |||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||    
T  33681217 gttgttctagtaagactgatgca-tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttg 33681119  T
Q  203 ttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33681118 acgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 33681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20248588 - 20248291
Alignment:
Q  1 actagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgct 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  20248588 actagttacagaatgccttatttaggttaaatgcgattcttgtcgcacaagttgatgtaaattgatcttagaggttagaaactaagttatttatcttgat 20248489  T
Q  101 gttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagaga 199  Q
    ||||||||  ||||||| |||||  | |||||    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||       
T  20248488 gttgttgtc-cagtaagactgatgca-tatgaatccatgttgtttataatgatatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaag--- 20248394  T
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20248393 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 20248294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 52927794 - 52928076
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52927794 agttacagaatgccttgtt-aggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctatt 52927892  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagagattg 202  Q
    |||||| ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||    
T  52927893 gttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgaga---tg 52927988  T
Q  203 ttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52927989 ---------attcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21754327 - 21754057
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||    
T  21754327 ttaggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatctcagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactg 21754228  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatatt 221  Q
    ||  | |||||  | ||||||||  |||||        |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||||    
T  21754227 atgca-tatgaattgatgttgtttataatg--------ttgtatatacattaaatggattatgttgataattgagatgttgttgatt-gcatttgatatt 21754138  T
Q  222 gttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754137 gttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 21754057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 295
Target Start/End: Original strand, 21861385 - 21861672
Alignment:
Q  8 acagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttg 107  Q
    |||||||||||| || ||| |||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21861385 acagaatgccttgtt-aggttaaatgtgacatttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctattgttg 21861483  T
Q  108 tttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tg-atatttgagagattgttg 205  Q
    |||||||||||||||  || |||||| | ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| | || || |||||||  ||| ||    
T  21861484 tttcagtaagcctga-atattatgatatgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatg 21861582  T
Q  206 atttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21861583 acttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Original strand, 21896087 - 21896358
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  21896087 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagatgtaagaaactaagttgtttatcttg---ttgttgtttcagtaagcctg 21896183  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagagattgttgatttgcattcgata 219  Q
    | | | |||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | |||||||  ||| ||| ||||||| ||||    
T  21896184 aat-attatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgata 21896282  T
Q  220 ttgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896283 ttgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20918909 - 20918620
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    |||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||     
T  20918909 gttaaagaatgcctt-tttaggttgaatgcgatctttgtcgttcgacttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtcgtttaccttgttgtta 20918811  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgt 203  Q
     |||| ||||||| || ||    |||||  | |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||    
T  20918810 atgttccagtaagactcatgct-tatgaattgatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgt 20918715  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918714 tgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 35981496 - 35981701
Alignment:
Q  1 actagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgct 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  35981496 actagttacagaatgccttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcacgaattgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgat 35981595  T
Q  101 gttgttgtttcagtaagcct-gatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagaga 199  Q
    |||||  || |||||||||| ||||  ||||  |||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  35981596 gttgtcattccagtaagcctggattgtatat--tctaatgttgatgataatgttatataattgcatatacattatatgaattatgttgatatttgagatg 35981693  T
Q  200 ttgttgat 207  Q
    ||||||||    
T  35981694 ttgttgat 35981701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Original strand, 16368115 - 16368388
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16368115 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcataggggtaagaaattaagttgtttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 16368214  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat-gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    | || ||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||    |||  ||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  16368215 aatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgat-gttgagatgttgttgatttgcatt-gatat 16368311  T
Q  221 tgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||  || |||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368312 tgttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 49261649 - 49261447
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  49261649 agttacagaatgccttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgtt 49261550  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgt 203  Q
    ||  || ||||||||| || ||  |||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  49261549 gtccttccagtaagccggaatt-gtatattctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatataaattatgttgatatttgagatgttgt 49261451  T
Q  204 tgat 207  Q
    ||||    
T  49261450 tgat 49261447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 50686905 - 50686630
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50686905 ttaggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgacgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 50686806  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    | || ||||||||  ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||| || ||    
T  50686805 aatt-atatgatccgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgacat 50686707  T
Q  221 tgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||  |  |||    |||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  50686706 tgttatatcatgaactattttatgaactgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaag 50686630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Original strand, 50613945 - 50614219
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||   | ||| |||||||||||||||| |||| | ||||||  |||||||||||||    
T  50613945 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgaattgatc-agggggtaagaaactaagttgtttgtcttaccgttgttacttcagtaagcctg 50614043  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat-gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    | || ||||||| | |||||| | ||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||    ||| |||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  50614044 aatt-atatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatat 50614142  T
Q  221 tgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614143 tgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Original strand, 50621773 - 50622047
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||   | ||| |||||||||||||||| |||| | ||||||  |||||||||||||    
T  50621773 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgaattgatc-agggggtaagaaactaagttgtttgtcttaccgttgttacttcagtaagcctg 50621871  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat-gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    | || ||||||| | |||||| | ||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||    ||| |||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  50621872 aatt-atatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatat 50621970  T
Q  221 tgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621971 tgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 147 - 294
Target Start/End: Original strand, 14295507 - 14295652
Alignment:
Q  147 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 245  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14295507 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 14295603  T
Q  246 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 294  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295604 tacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14295652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20637158 - 20636977
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  20637158 agttacagaatgtcttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgtt 20637059  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt 186  Q
    ||  || |||||||||||| ||  |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20637058 gtcattccagtaagcctgaatt-gtattttttaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt 20636977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 295
Target Start/End: Original strand, 41049880 - 41050138
Alignment:
Q  38 ctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaa 137  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |    
T  41049880 ctttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcataggggtaaggaactaggtttcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttga 41049978  T
Q  138 tgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga--t 234  Q
     ||||||  |||||  ||||| |||||||| |||||  |||||||| | ||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  41049979 cgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgat-gttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact 41050077  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
      |||  |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  41050078 attttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 201 - 295
Target Start/End: Original strand, 35261086 - 35261180
Alignment:
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261086 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12271852 - 12271744
Alignment:
Q  8 acagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttg 107  Q
    |||||||||||| || ||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  12271852 acagaatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattg 12271754  T
Q  108 tttcagtaag 117  Q
    ||||||||||    
T  12271753 tttcagtaag 12271744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16758749 - 16758664
Alignment:
Q  216 gatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16758749 gatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21161932 - 21161728
Alignment:
Q  95 cttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgat-attt 193  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||| ||||  | | ||| |||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| || |    
T  21161932 cttgctgttgatgttccagtgagcctaatttgtt-taatccaatgatgtcgttgatgttatataagtgtataaacattgtatgatttatgttgatgatat 21161834  T
Q  194 gagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    || || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |    
T  21161833 ga-ag-ttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgatttgcatactg-ttttgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatcca 21161737  T
Q  294 agttgatga 302  Q
    |||||||||    
T  21161736 agttgatga 21161728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 154 - 295
Target Start/End: Original strand, 45574846 - 45574989
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||| ||| ||||||  ||||||| ||||||| | |||| |||| ||||| || ||| |||||||||||    
T  45574846 atataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcct 45574945  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45574946 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Original strand, 50210220 - 50210322
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210220 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 50210318  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  50210319 atga 50210322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 34509894 - 34509792
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||  |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509894 ttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 34509796  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  34509795 atga 34509792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 261
Target Start/End: Original strand, 22130863 - 22130975
Alignment:
Q  147 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 245  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||| |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  22130863 taatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttggatac 22130959  T
Q  246 tgcctatgttgctgtt 261  Q
    ||||||||||||||||    
T  22130960 tgcctatgttgctgtt 22130975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 295
Target Start/End: Original strand, 16093825 - 16093987
Alignment:
Q  136 aatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgtt-gatttgcattcgatattgttatatcatga 233  Q
    ||||||| | ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16093825 aatgttgattttaatgtgatatatttgtatatacattacatgaattacctatgatgtttgagatgttgtttgatttgcatt-gatattgttatatcatga 16093923  T
Q  234 --tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
      || |||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16093924 gctgttttctatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 16093987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21840877 - 21840778
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840877 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21840780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 300
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454660
Alignment:
Q  245 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20454660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 243 - 298
Target Start/End: Original strand, 20847205 - 20847259
Alignment:
Q  243 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20847205 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20847259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13989024 - 13988877
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  13989024 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 13988926  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988925 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13988877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 21923295 - 21923442
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  21923295 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21923393  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923394 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21923442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 296
Target Start/End: Original strand, 22123071 - 22123215
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaatta--tgttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||  |||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||||  |    
T  22123071 atataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-t 22123169  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123170 gtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22123215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 238 - 288
Target Start/End: Original strand, 38801433 - 38801483
Alignment:
Q  238 ttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 288  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38801433 ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 38801483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 51130729 - 51130632
Alignment:
Q  147 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 245  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  51130729 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 51130633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 433168 - 433023
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||  |||| |||||||||    
T  433168 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcct 433069  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433068 gtgttgc----cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 433023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21026756 - 21026696
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026756 tttgtatactgcctatattgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21026696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 298
Target Start/End: Original strand, 27250774 - 27250834
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250774 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 27250834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22532383 - 22532281
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  22532383 ttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttg 22532285  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  22532284 atga 22532281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 21475091 - 21475238
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  21475091 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21475189  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21475190 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 21475238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 23593739 - 23593886
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  23593739 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23593837  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593838 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23593886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29298294 - 29298148
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  29298294 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgt-t 29298197  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298196 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29298148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29776846 - 29776699
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||||  |    
T  29776846 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgt-t 29776748  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776747 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29776699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31612371 - 31612324
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612371 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 31612324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 13212974 - 13213013
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212974 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13213013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21342146 - 21342107
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21342107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21347011 - 21346972
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347011 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21346972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21707217 - 21707178
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707217 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21707178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21711759 - 21711720
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711759 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21711720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26065100 - 26064959
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcct 250  Q
    ||||| ||||||||  ||||  |||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |  |||   ||||||||    
T  26065100 atatatttgtatatgtattacttgaattatatatgatctttgagatgttgttgatttgcattgg-tattgttatatcatgaattattttatgtactgcct 26065002  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||    
T  26065001 atgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtcta 26064959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16361965 - 16361928
Alignment:
Q  263 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361965 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16361928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 15860121 - 15860160
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15860121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 15860160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21714595 - 21714556
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21714595 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21714556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 300
Target Start/End: Original strand, 22468749 - 22468803
Alignment:
Q  245 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22468749 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 22468803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 16275476 - 16275515
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16275476 ttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgat 16275515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 16381448 - 16381388
Alignment:
Q  50 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttt 110  Q
    |||||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  16381448 agttgatgtgagttgatcatgagggtaagaaactaagttgtttatatttctattgttgttt 16381388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 14508 - 14806
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14508 agttacagaatgccttgtttaggataaatgcgatcttggtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtatatcttgctgtt 14607  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  14608 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgtttttgttaatggtatataatagtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgt 14707  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14708 tgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttcttactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 14806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 39982 - 40283
Alignment:
Q  1 actagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgct 100  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  39982 actagttacaaaatgccttatttaggttaaatgcgatctttgttgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgat 40081  T
Q  101 gttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  40082 gttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatcttatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgt 40181  T
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40182 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 40281  T
Q  301 ga 302  Q
    ||    
T  40282 ga 40283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 100683 - 100386
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    |||||| |||||||| | || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  100683 gttacaaaatgccttgtctaagttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgacttgctcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttg 100584  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgtt 204  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  100583 ttgtttcagtaagcctaaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttaatatttgagatgttgtt 100484  T
Q  205 gatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100483 gatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 100386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 241 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 119948 - 119891
Alignment:
Q  241 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119948 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 119891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 101686 - 101599
Alignment:
Q  21 tttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtt 109  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  101686 tttaggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttg-ttctcttgttgttgttgtt 101599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101511
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatga 101511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 94569 - 94422
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  94569 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 94471  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94470 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 94422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 17444 - 17591
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  17444 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 17542  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17543 gtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 44512 - 44465
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44512 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 5952 - 5655
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  5952 agttacagaatgccttatttaggctaaatgtgattcttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagtt-tttatcttgttgtt 5854  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgt 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  5853 gttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgt 5754  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5753 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttcatactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 63)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28406286 - 28405988
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28406286 gttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 28406187  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgtt 204  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  28406186 ttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaagttgatatttgagatgttgtt 28406087  T
Q  205 gatttgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28406086 gatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatga 28405988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 35 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 25176129 - 25175862
Alignment:
Q  35 gatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatc 134  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25176129 gatctttgtcgcacgaattgatgtaagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatc 25176030  T
Q  135 taatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25176029 taatgttgttgttaatgttatataattatatatacgttatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat 25175930  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25175929 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatga 25175862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 38 - 295
Target Start/End: Original strand, 7577 - 7835
Alignment:
Q  38 ctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaa 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  7577 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttaa 7675  T
Q  138 tgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tg-atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatg 235  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| | || || |||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  7676 tgttgttgttaatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg 7775  T
Q  236 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7776 ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Original strand, 22134029 - 22134315
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  22134029 gttacagactgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtca 22134128  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgtt 204  Q
    || || ||||||| |||| |  ||||||  |  |||||||  |||||        |||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||  || ||    
T  22134129 tttttccagtaagactga-tgcatatgaattggtgttgtttataatg--------ttgtatatacattaaatggattatgttgataaatgagatgttatt 22134219  T
Q  205 gatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22134220 ga-ttgcattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctg-ttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatga 22134315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Original strand, 18786748 - 18787009
Alignment:
Q  39 tttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||  |||    
T  18786748 tttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgctgttgttgtttcagtaagcctaaatt-atatgattgaat 18786846  T
Q  139 gttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga--tg 235  Q
    ||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| ||  ||||||| ||||||| || |||||||||||||||  ||    
T  18786847 gttattgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgat-gttgtgacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactg 18786945  T
Q  236 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
     |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786946 gtttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23791567 - 23791292
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23791567 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttgggggttggaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctg 23791468  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    | || ||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | | || |||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  23791467 aatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatataatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatat 23791369  T
Q  221 tgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    | |||||||||||  || |||   |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23791368 ttttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23207570 - 23207296
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  23207570 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttcaagtaagcctg 23207471  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatatt 221  Q
    | || ||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| |  |   ||||||  | ||||||||||||| ||||||    
T  23207470 aatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttataatgttgagatgtcgttgatttgcatttgatatt 23207372  T
Q  222 gttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||  || |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207371 gttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25109181 - 25108906
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||| | | | | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25109181 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtaagttgatcatggggataagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 25109082  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    | || ||||||| | ||||||||  ||||   |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||   || |||||    
T  25109081 aatt-atatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatattgttgattttgctttgatat 25108983  T
Q  221 tgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||  |  |||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25108982 tgttatatcatgaactattttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 153 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7679746 - 7679599
Alignment:
Q  153 tatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 251  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||  ||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7679746 tatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 7679648  T
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7679647 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 7679599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 147 - 298
Target Start/End: Original strand, 23071905 - 23072054
Alignment:
Q  147 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 245  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23071905 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgctgatttatattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 23072001  T
Q  246 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23072002 tgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttg 23072054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 137 - 299
Target Start/End: Original strand, 23708561 - 23708725
Alignment:
Q  137 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttg--atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| ||   || |||||||  | | ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  23708561 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgtt 23708660  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23708661 gttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga 23708725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 154 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19671991 - 19671848
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctat 252  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||   ||||||  ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19671991 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgcatactgcctat 19671892  T
Q  253 gttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19671891 gttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 19671848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22105571 - 22105423
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |||||||||||    
T  22105571 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcct 22105472  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105471 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22105423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 173
Target Start/End: Original strand, 22459377 - 22459540
Alignment:
Q  8 acagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttg 107  Q
    |||||||||||| || ||| |||||| || |||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22459377 acagaatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcctacgagttgatgtgagttgaccttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttattg 22459475  T
Q  108 tttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacatta 173  Q
    |||||||||| ||||| | ||| ||  | ||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  22459476 tttcagtaagactgatgt-atacgagttgatgttatttataatgtgatataattgtatatacatta 22459540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 300
Target Start/End: Original strand, 298821 - 298922
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298821 ttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298920  T
Q  299 at 300  Q
    ||    
T  298921 at 298922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 295
Target Start/End: Original strand, 20520152 - 20520295
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcct 250  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||| |    
T  20520152 atatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcat 20520250  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520251 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23060627 - 23060525
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060627 ttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 23060529  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  23060528 atga 23060525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23076568 - 23076454
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 286  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23076568 atatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 23076470  T
Q  287 cggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||| |||||    
T  23076469 cggtctaagtggatga 23076454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 298
Target Start/End: Original strand, 38138 - 38219
Alignment:
Q  216 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38138 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 38219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23285941 - 23285877
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285941 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 23285877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23660136 - 23660035
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||  || || | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23660136 ttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttga 23660038  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  23660037 tga 23660035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20309180 - 20309127
Alignment:
Q  242 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309180 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20309127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 22413078 - 22413240
Alignment:
Q  137 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatat--tgttatatcatga 233  Q
    ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| || ||||  ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  22413078 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatgtt-gagatgttgttgatttgcatttgatatattgttatatcatga 22413176  T
Q  234 --tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
      || |||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22413177 gctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22337241 - 22337127
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 286  Q
    ||||||||||  ||||||  ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22337241 atatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 22337143  T
Q  287 cggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||||    
T  22337142 cggtctaagttgatga 22337127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18809101 - 18808954
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  18809101 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 18809003  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809002 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18808954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 244 - 302
Target Start/End: Original strand, 22731286 - 22731343
Alignment:
Q  244 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22731286 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatga 22731343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 237 - 295
Target Start/End: Original strand, 23103440 - 23103497
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103440 tttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 23103497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23131020 - 23130873
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  23131020 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23130922  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130921 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23130873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23133487 - 23133340
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  23133487 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23133389  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133388 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23133340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 23709536 - 23709683
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  23709536 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23709634  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709635 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23709683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 23712017 - 23712164
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  23712017 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23712115  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712116 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23712164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24367932 - 24367785
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  24367932 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24367834  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367833 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24367785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26505537 - 26505390
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||||| |    
T  26505537 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-t 26505439  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505438 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26505390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26508015 - 26507868
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||||| |    
T  26508015 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-t 26507917  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507916 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26507868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 34402526 - 34402673
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  34402526 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 34402624  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402625 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 34402673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 39682471 - 39682324
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  39682471 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 39682373  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682372 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39682324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8946733 - 8946669
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8946733 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 8946669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040298
Alignment:
Q  250 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 23040298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23004905 - 23004767
Alignment:
Q  160 ttgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 256  Q
    |||||||| |||||| || ||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  |  |||   |||| |||||||||    
T  23004905 ttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcctgaactattttatgtactacctatgttg 23004806  T
Q  257 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23004805 ctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 23004767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23135745 - 23135601
Alignment:
Q  157 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatg 253  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||    
T  23135745 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 23135647  T
Q  254 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135646 ttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23135601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 298
Target Start/End: Original strand, 23654409 - 23654491
Alignment:
Q  216 gatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||| || ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654409 gatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 23654491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 571555 - 571408
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  | | ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  571555 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 571457  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571456 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 571408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6726153 - 6726006
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  6726153 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 6726055  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726054 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6726006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 21155064 - 21155211
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  21155064 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21155162  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155163 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21155211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 295
Target Start/End: Original strand, 24697536 - 24697709
Alignment:
Q  125 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgt 223  Q
    ||||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||| | | |||  |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  24697536 taatatgattttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgt 24697635  T
Q  224 tatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||  || ||    ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24697636 tatatcatgaactgtttgatgtactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 24697709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28577257 - 28577110
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||  ||||||| |||||| |||||||||| || ||| | ||||||  |    
T  28577257 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgt-t 28577159  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577158 gcgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28577110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 32214925 - 32215072
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  32214925 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 32215023  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215024 gtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32215072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643101
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643054 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24643101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 43137357 - 43137310
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137357 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 43137310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 22738247 - 22738286
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738247 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22738286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 24898199 - 24898347
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  24898199 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24898297  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24898298 gtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24898347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 24900682 - 24900830
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  24900682 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24900780  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24900781 gtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24900830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 24903159 - 24903307
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  24903159 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24903257  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24903258 gtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24903307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 24905636 - 24905784
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  24905636 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24905734  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24905735 gtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24905784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 24908111 - 24908259
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  24908111 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24908209  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24908210 gtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24908259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967385
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 45029966 - 45030005
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029966 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45030005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 32039502 - 32039649
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  32039502 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 32039600  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32039601 gtgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgat 32039649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 295
Target Start/End: Original strand, 32451981 - 32452031
Alignment:
Q  245 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451981 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 24529641 - 24529680
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24529641 ttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgat 24529680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  243 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  244 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 73
Target Start/End: Original strand, 23071776 - 23071843
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagag 73  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  23071776 gttacaaaatgcctt-tttaggttgaatgagatctttttcgttcgagttgatgtgagttgatcttagag 23071843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 64)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 23760650 - 23760950
Alignment:
Q  1 actagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgct 100  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  23760650 actagttacaaaatgccttgtt-aggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgtt 23760748  T
Q  101 gtt---gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgaga 197  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760749 gttgttgttgtttcagtaagcctgaataaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgaga 23760848  T
Q  198 gattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 297  Q
      ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760849 tgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgatttacatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23760948  T
Q  298 ga 299  Q
    ||    
T  23760949 ga 23760950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21674012 - 21673716
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  21674012 gttacagaatgccttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttaatgtgagttgatattagaggttaaaaactaagttgtt-atcttgttgttg 21673914  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgtt 204  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||  |||||    
T  21673913 ttgtttcagtaagcttgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattaaataaattatattgatatttgagatgttgtt 21673814  T
Q  205 gatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21673813 gatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttgatga 21673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 300
Target Start/End: Original strand, 38855063 - 38855358
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38855063 agttacagaatgccttgcttaggttaaacacgatctttgtcgcacgagttgatgtgaattgatcttggacattaggaactaagttgtttatcttgctgtt 38855162  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgt 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  38855163 gttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgt 38855261  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855262 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38855358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6520659 - 6520382
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520659 ttaggttaaatgcgatctttgttgcatgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 6520560  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatatt 221  Q
    | ||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  6520559 aattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatatt 6520461  T
Q  222 gttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520460 gttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6520382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21285906 - 21285611
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||    
T  21285906 agttacagaatgctttgtt-aggttaaatgcgatctttatcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagtgctttatcttgttgtt 21285808  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattg 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||  |||    
T  21285807 gttgtttcagtaagcctgaatta-tataatctaatattgttgttaatgatatataattgtatatacattacatgaactatgtttgatgtttgagatgttg 21285709  T
Q  203 ttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21285708 ttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21285611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 26355508 - 26355807
Alignment:
Q  1 actagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgct 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  26355508 actagttacagaatgccttgtttatgttaaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttttt 26355607  T
Q  101 gttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagat 200  Q
    ||| |||||  |||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||   |||||  |    
T  26355608 gttattgttctagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatggaatatgttgatggctgagatgt 26355706  T
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355707 tgttga-ttgcattcgatattgttatatcgtgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26355805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 295
Target Start/End: Original strand, 5866090 - 5866376
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  5866090 gttacagaatgcctt-tttaggttgaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgtta 5866188  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgt 203  Q
     |||| ||||||| |||||    |||||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||    
T  5866189 atgttccagtaagactgatgct-tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgt 5866284  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866285 tgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 5866376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21491300 - 21491011
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  21491300 gttacagaatgcctt-tttaggttgaatgcgatctttgtagttcgagttaatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgtta 21491202  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgt 203  Q
     |||| ||||||| |||||    |||||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||    
T  21491201 atgttccagtaagactgatgcc-tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgt 21491106  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21491105 tgatttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21491011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 17141221 - 17140932
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  17141221 gttacagaacgcctt-tttaggttgaatgcgatctttgtcattcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgtta 17141123  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgt 203  Q
     |||| ||||||| |||||    |||||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   |||     
T  17141122 atgttccagtaagactgatgct-tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttga 17141027  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17141026 tgatttacattcgatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17140932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37116641 - 37116366
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    |||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37116641 ttaggataaatgtgacctttgtcgtacgagttgatgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 37116542  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    |||| | ||||| | ||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  37116541 attt-agatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatat 37116443  T
Q  221 tgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116442 tgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Original strand, 983248 - 983512
Alignment:
Q  39 tttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatc---ttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatct 135  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||      
T  983248 tttgtcgcacgagttgatatgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgttgtttcagtaagtctgaatt-atatgattg 983346  T
Q  136 aatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga- 233  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| ||  ||||||| ||||||| || |||||||||||||||     
T  983347 aatgttgttgataatgttatatagctgtatatacattacatgaattatgtttgat-gttgtgatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaa 983445  T
Q  234 -tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983446 cttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21249689 - 21249400
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||     
T  21249689 gttacagaatgcctt-tttaggttaaatgcgatctttgtcgttcaagttgatgtgagtttatcttagaggttaggaactaagttgtt-accctgctgtta 21249592  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgt 203  Q
     ||| ||| |||| |||||    |||||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||    
T  21249591 atgtctcactaagactgatgct-tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgt 21249496  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct-gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249495 tgatttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21249400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21255526 - 21255238
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgt 105  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||      
T  21255526 ttacagaatgcctt-tttaggttaaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagtttatcttagaggttaggaactaagttgtt-accctgctgttaa 21255429  T
Q  106 tgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgtt 204  Q
    ||| ||| |||| |||||    |||||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   |||||    
T  21255428 tgtctcactaagactgatgct-tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgtt 21255333  T
Q  205 gatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct-gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255332 gatttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21255238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 38 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20498839 - 20498581
Alignment:
Q  38 ctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaa 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| || |||||| | |    
T  20498839 ctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgttgatgtttcggtaagactgatgta-tatgatttga 20498741  T
Q  138 tgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatg 235  Q
    |||||||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| | |||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |     
T  20498740 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgcta 20498641  T
Q  236 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20498640 ttttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Original strand, 17266821 - 17267096
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17266821 ttaggttaaatgtgacctttatcgcacgagttgatgtgagttgatcacgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtgagcctg 17266920  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    | || ||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| | ||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  17266921 aatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatat 17267019  T
Q  221 tgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||   | |||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267020 tgttatatcatgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24353316 - 24353039
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgt---tgtttcagtaagc 118  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | | | | ||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||    
T  24353316 ttaggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatggggataagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttgtttcagtaagc 24353217  T
Q  119 ctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcga 217  Q
    |||| || ||||||| | ||||||||  ||||   |||||| ||||||| ||||| ||||||| | |  ||| |||||||  ||||||||||||||| ||    
T  24353216 ctgaatt-atatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatacgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-ga 24353119  T
Q  218 tattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353118 tattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22364954 - 22364744
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||   | | | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22364954 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcagggggataataaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 22364855  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    | || ||||||| | ||||||||  ||| |  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||  |||||||||| | || |||||    
T  22364854 aatt-atatgatttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgattttc-tttgatat 22364757  T
Q  221 tgttatatcatga 233  Q
    |||||||||||||    
T  22364756 tgttatatcatga 22364744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Original strand, 13508027 - 13508188
Alignment:
Q  137 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||||||  ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13508027 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 13508126  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    | | |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13508127 gttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13508188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 125 - 295
Target Start/End: Original strand, 17439436 - 17439609
Alignment:
Q  125 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgt 223  Q
    ||||||||| |||||||| |  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  17439436 taatatgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgt 17439535  T
Q  224 tatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||  || |||   |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17439536 tatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22626849 - 22626748
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626849 ttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22626751  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  22626750 tga 22626748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Original strand, 13597559 - 13597720
Alignment:
Q  137 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13597559 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 13597658  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    | ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13597659 gttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13597720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 296
Target Start/End: Original strand, 17612069 - 17612213
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 251  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||  ||||| | || | | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17612069 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactgccta 17612168  T
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17612169 tgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 17612213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 302
Target Start/End: Original strand, 16092337 - 16092451
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 286  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16092337 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 16092435  T
Q  287 cggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||||    
T  16092436 cggtctaagttgatga 16092451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Original strand, 28649051 - 28649153
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649051 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 28649149  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  28649150 atga 28649153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 201 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 6759371 - 6759270
Alignment:
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759371 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 6759273  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  6759272 tga 6759270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 201 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 7372891 - 7372790
Alignment:
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372891 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 7372793  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  7372792 tga 7372790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22875190 - 22875077
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  22875190 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtc 22875092  T
Q  288 ggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||| |||||||    
T  22875091 ggtctaaattgatga 22875077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 201 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23406492 - 23406391
Alignment:
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406492 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23406394  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  23406393 tga 23406391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31971354 - 31971273
Alignment:
Q  216 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971354 gatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 31971273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Original strand, 18818454 - 18818518
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818454 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 18818518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Original strand, 18879276 - 18879340
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879276 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 18879340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 295
Target Start/End: Original strand, 16199668 - 16199746
Alignment:
Q  216 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199668 gatattattatgtcatgttg-tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16199746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Original strand, 21919007 - 21919105
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21919007 ttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21919105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 14409448 - 14409595
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  14409448 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 14409546  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409547 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14409595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 244 - 302
Target Start/End: Original strand, 21923980 - 21924037
Alignment:
Q  244 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923980 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 21924037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20536284 - 20536220
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536284 tttgtatactgcctatgtttctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 20536220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 295
Target Start/End: Original strand, 21396029 - 21396082
Alignment:
Q  242 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21396029 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21396082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 295
Target Start/End: Original strand, 21790522 - 21790575
Alignment:
Q  242 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790522 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21790575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1484560 - 1484413
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  1484560 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 1484462  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484461 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1484413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 5853296 - 5853443
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  5853296 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 5853394  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853395 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 5853443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 16413320 - 16413467
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16413320 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 16413418  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413419 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16413467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 20046199 - 20046346
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  20046199 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 20046297  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046298 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20046346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20403385 - 20403238
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  20403385 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20403287  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403286 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20403238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22001911 - 22001764
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  22001911 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 22001813  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001812 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22001764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 295
Target Start/End: Original strand, 21389499 - 21389552
Alignment:
Q  242 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389499 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21389552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 295
Target Start/End: Original strand, 21778825 - 21778878
Alignment:
Q  242 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778825 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21778878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26219838 - 26219728
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  |  |||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26219838 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 26219741  T
Q  288 ggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||    
T  26219740 ggtctaagttgat 26219728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 243 - 295
Target Start/End: Original strand, 45131047 - 45131098
Alignment:
Q  243 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45131047 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45131098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 295
Target Start/End: Original strand, 19154816 - 19154989
Alignment:
Q  125 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgt 223  Q
    ||||||||| |||||||| |  |||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||| |  ||| ||| ||   ||||||||| ||| | |||||| |    
T  19154816 taatatgatttaatgttgatactaatgtaatatatttgtatatgcattatctgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattagcacttgatattat 19154915  T
Q  224 tatatcatgat--gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||  |||  | |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19154916 tatatctggatatgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41598346 - 41598199
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  41598346 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-t 41598248  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598247 gtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 41598199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Original strand, 4542477 - 4542524
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542477 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4542524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19896323 - 19896276
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896323 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19896276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 26225359 - 26225398
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225359 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26225398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 45290807 - 45290846
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290807 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45290846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4483438 - 4483292
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  4483438 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 4483340  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483339 gtgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4483292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 15203235 - 15203382
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  15203235 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 15203333  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15203334 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgat 15203382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15070608 - 15070571
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070608 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 295
Target Start/End: Original strand, 19801387 - 19801527
Alignment:
Q  155 tataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctat 252  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| |||| || |||||| |||| ||||| || |||| ||||||  | |    
T  19801387 tataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgt 19801485  T
Q  253 gttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801486 gttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937157
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 19937157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 18678170 - 18678209
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18678170 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 18678209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23648621 - 23648567
Alignment:
Q  245 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23648621 ctgcctatgttgctatt-gttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 23648567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 25484380 - 25484419
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25484380 ttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgat 25484419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 233
Target Start/End: Original strand, 40492844 - 40492891
Alignment:
Q  186 tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga 233  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40492844 tgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 40492891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 37515901 - 37515837
Alignment:
Q  119 ctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat 183  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  37515901 ctgatataatgtgatttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattat 37515837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Original strand, 2616 - 2915
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2616 gttacagaatgccttgtttaggaaaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 2715  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattg----tatatacattatatgaattatgttgatatttgagagat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  |    
T  2716 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctattgttgttgttaatgg--tataattgtatatatatacattttatgaattaagctgatatttgagatgt 2813  T
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2814 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 2913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 5 - 256
Target Start/End: Original strand, 2030 - 2281
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2030 gttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaaataagttgtttatcttgctgttg 2129  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgtt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  2130 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatccaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgctgatatttgagatgttgtt 2229  T
Q  205 gatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttg 256  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2230 gatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 90)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15471233 - 15470939
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15471233 agttacagaatgctttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgttagatgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgttgtt 15471134  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattg 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||  |||    
T  15471133 gttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatctaa-gttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttg 15471036  T
Q  203 ttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471035 atgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15470939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16097641 - 16097340
Alignment:
Q  1 actagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgct 100  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16097641 actagttacaaaatgtcttgtttatgttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagagattagaaactaagttgtttatcttgct 16097542  T
Q  101 gttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagaga 199  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  | |||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  16097541 gttgttgttccagtaagactgatgca-tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatg 16097443  T
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097442 ttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16097343  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  16097342 tga 16097340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16104088 - 16103792
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16104088 gttacagactgccttgtttaggttaaatgcgctctttgtcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 16103989  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgt 203  Q
    ||||| ||||||| || ||  | |||||  | ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  16103988 ttgttccagtaagactaatcca-tatgaattgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttgatatttgagatgttgt 16103890  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103889 tgatt-gcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 16103792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14234799 - 14234501
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14234799 agttacagaatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgaacaagttgatgttagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgttgtt 14234700  T
Q  104 gttgtt--tcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagat 200  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||  | | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||  |    
T  14234699 gttgttgttcagtaagcctgaattgtt-taatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgt 14234601  T
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  14234600 tgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgat 14234501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 32307976 - 32307689
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  32307976 gttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtca 32307877  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgtt 204  Q
    |||||  |||||| |||||    |||||  ||||||||||  |||||        |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||    
T  32307876 ttgttctagtaagactgatgct-tatgaattaatgttgtttataatg--------ttgtatatacattaaatggattatgttgataattgagatgttgtt 32307786  T
Q  205 gatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307785 gatt-gcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 32307689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 298
Target Start/End: Original strand, 13210141 - 13210432
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  13210141 gttacagaatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgtta 13210240  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatct-aatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattg 202  Q
       || ||||||| |||||  | |||||  | ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||   |||    
T  13210241 acattccagtaaggctgatgca-tatgaattcaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaag---ttg 13210336  T
Q  203 ttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210337 ttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13210432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Original strand, 49667897 - 49668185
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  49667897 gttacagactgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtca 49667996  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataat--tgtatatacattatatgaattatgttgatatttgaga-gatt 201  Q
    ||||| ||||||| |||||  | |||||      |||| ||||    |||||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||| | ||    
T  49667997 ttgttccagtaagactgatgca-tatga------gttgatgtt----gtatataatgctgtatatactttaaatggattatgttgataaatgagatgttt 49668085  T
Q  202 gttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49668086 gttgatt-gcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatg 49668184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 9513216 - 9512932
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    |||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  9513216 gttacagaatgccttgcttatgttaaatgcgatctttgtcgcacaagtttatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgtta 9513117  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgtt 204  Q
    ||||| ||||||| |||||  | |||||  | ||||||||  |||||        || ||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||   ||||    
T  9513116 ttgttccagtaagactgatgca-tatgaattgatgttgtttataatg--------ttttatatacattaaatggattatgttgataaatgaga---tgtt 9513029  T
Q  205 gatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9513028 gatt-gcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatga 9512932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 9521191 - 9520907
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    |||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  9521191 gttacagaatgccttgcttatgttaaatgcgatctttgtcgcacaagtttatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgtta 9521092  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgtt 204  Q
    ||||| ||||||| |||||  | |||||  | ||||||||  |||||        |  ||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||   ||||    
T  9521091 ttgttccagtaagactgatgca-tatgaattgatgttgtttataatg--------tgttatatacattaaatggattatgttgataaatgaga---tgtt 9521004  T
Q  205 gatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9521003 gatt-gcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatga 9520907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 83 - 302
Target Start/End: Original strand, 12174152 - 12174368
Alignment:
Q  83 taagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatta 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  | |||||   |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  12174152 taagttgtttagcttgctgttgttgttccagtaagactgatgca-tatgaatcaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgactta 12174250  T
Q  183 tgtt-gatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 281  Q
    |||| ||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174251 tgtttgatatttgag---ttgttgttttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 12174347  T
Q  282 tgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12174348 tgagtcggtctaagttgatga 12174368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Original strand, 1644496 - 1644782
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    |||||| | |||||| |||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  1644496 gttacaaactgccttgtttaagttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgtta 1644595  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgtt 204  Q
    ||||| ||||||| |||||  | |||||  | ||||||||  |||||        |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  1644596 ttgttccagtaagactgatgca-tatgaattgatgttgtttataatg--------ttgtatatacattaaatggattatgttgataattgagatattgtt 1644686  T
Q  205 gatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  1644687 gatt-gtattcgatattgttatataatgatgatttgcatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatga 1644782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 295
Target Start/End: Original strand, 37251012 - 37251270
Alignment:
Q  38 ctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaa 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || ||||||| | |    
T  37251012 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagtctgaatt-atatgatttga 37251110  T
Q  138 tgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga--t 234  Q
    |||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  37251111 tgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgat-gttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact 37251209  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37251210 gttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 186
Target Start/End: Original strand, 49389453 - 49389622
Alignment:
Q  16 ccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagta 115  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  49389453 ccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtgtgttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagta 49389552  T
Q  116 agcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt 186  Q
    || |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49389553 agactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatgaattatgtt 49389622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Original strand, 1465222 - 1465424
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| || |    
T  1465222 agttacagaatgccttgtttaggttaaaagtaatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgct 1465321  T
Q  104 gttgtttcagtaagcct-gatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattg 202  Q
    ||  || |||||||||| ||||   |||  |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||    
T  1465322 gtcattccagtaagcctggattgtttat--tctaatgttgatgataatgttatacaattgtatatacattacatgaattatgttgatatttgagatgttg 1465419  T
Q  203 ttgat 207  Q
    |||||    
T  1465420 ttgat 1465424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 295
Target Start/End: Original strand, 22110196 - 22110454
Alignment:
Q  38 ctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaa 137  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | |    
T  22110196 ctttgtcgcacgaattgatgtgagttgatcatgagggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtatgatttga 22110294  T
Q  138 tgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga--t 234  Q
     ||||||  |||||  |||||| ||||||  ||||| ||||||| | | ||||  ||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  22110295 agttgttaataatgtgatataaatgtatacgcattacatgaattctatatgat-gttgagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact 22110393  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    | |||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110394 gttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 52523669 - 52523831
Alignment:
Q  137 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga- 233  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52523669 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaa 52523768  T
Q  234 -tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523769 ctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 12934124 - 12934242
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  12934124 gttacagacttccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtca 12934223  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgat 123  Q
    ||||| ||||||| |||||    
T  12934224 ttgttccagtaagactgat 12934242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27165373 - 27165261
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165373 atatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 27165274  T
Q  288 ggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||    
T  27165273 ggtctaagttgat 27165261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Original strand, 53301545 - 53301658
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgt-tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 286  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  53301545 atatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagt 53301644  T
Q  287 cggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||    
T  53301645 cggtctaagttgat 53301658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 296
Target Start/End: Original strand, 24340647 - 24340826
Alignment:
Q  119 ctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcg 216  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||||||  ||||| | |||| ||||    
T  24340647 ctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcg 24340746  T
Q  217 atattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24340747 atattattatatcatgatgttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 24340826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 43927425 - 43927304
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43927425 ttaggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 43927326  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgtt 144  Q
    | || ||||||| | ||||||||    
T  43927325 aatt-atatgatttgatgttgtt 43927304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 154 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 43926121 - 43925977
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcct 250  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||| | | |||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||||||    
T  43926121 atataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcct 43926022  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926021 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 188 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 23274813 - 23274705
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||  ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23274813 atatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtc 23274714  T
Q  288 ggtctaagt 296  Q
     ||||||||    
T  23274713 agtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 12171914 - 12171992
Alignment:
Q  1 actagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttaga 79  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171914 actagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgattcttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttaga 12171992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 201 - 302
Target Start/End: Original strand, 11424768 - 11424868
Alignment:
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11424768 tgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 11424866  T
Q  301 ga 302  Q
    ||    
T  11424867 ga 11424868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12399323 - 12399225
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399323 ttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 12399225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 14972968 - 14972866
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972968 ttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 14972870  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  14972869 atga 14972866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18438648 - 18438546
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18438648 ttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 18438550  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  18438549 atga 18438546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 188 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 42386536 - 42386428
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 286  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  42386536 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagt 42386438  T
Q  287 cggtctaagt 296  Q
    ||||||||||    
T  42386437 cggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 296
Target Start/End: Original strand, 37642189 - 37642368
Alignment:
Q  119 ctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagagattgttgatttgcattcg 216  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||  ||||| | || | | ||    
T  37642189 ctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcg 37642288  T
Q  217 atattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37642289 atattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 37642368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17672784 - 17672637
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  17672784 atataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 17672686  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672685 atgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17672637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14572686 - 14572602
Alignment:
Q  216 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 301  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572686 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 14572602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Original strand, 20698480 - 20698544
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698480 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 20698544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 295
Target Start/End: Original strand, 43550482 - 43550625
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| ||||||||| |    
T  43550482 atataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcat 43550581  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550582 atgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 300
Target Start/End: Original strand, 24153216 - 24153315
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153216 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 24153314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 36166719 - 36166609
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36166719 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 36166622  T
Q  288 ggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||    
T  36166621 ggtctaagttgat 36166609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194704
Alignment:
Q  249 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28194704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 7781351 - 7781498
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  7781351 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 7781449  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781450 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 7781498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12378037 - 12377940
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |  |||  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12378037 ttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 29172587 - 29172734
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  29172587 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 29172685  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172686 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29172734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13442350 - 13442286
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442350 tttgtatactgcctatgttgccgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 13442286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Original strand, 23083406 - 23083470
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083406 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 23083470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21618570 - 21618460
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21618570 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 21618473  T
Q  288 ggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||    
T  21618472 ggtctaagttgat 21618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 201 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26687000 - 26686902
Alignment:
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687000 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26686902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 295
Target Start/End: Original strand, 606332 - 606428
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||   | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  606332 ttgttgaattgcatt-gatattgttatatcatgaactgatttatgtgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataag 606428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 9707611 - 9707758
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  9707611 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 9707709  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707710 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 9707758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12567718 - 12567571
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| ||| |    
T  12567718 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-t 12567620  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567619 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12567571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13544183 - 13544036
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| ||| |    
T  13544183 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-t 13544085  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544084 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13544036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 16282815 - 16282962
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  16282815 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16282913  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282914 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16282962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17463336 - 17463189
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  17463336 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 17463238  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463237 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17463189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 34159484 - 34159337
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  34159484 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 34159386  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159385 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 34159337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 38961895 - 38962042
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  38961895 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 38961993  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961994 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38962042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 45606911 - 45607058
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  45606911 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 45607009  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45607010 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45607058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 50242980 - 50242833
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  50242980 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-t 50242882  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242881 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 50242833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 55476649 - 55476502
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  55476649 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 55476551  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476550 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 55476502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 17487932 - 17487868
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487932 tttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 17487868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 17499414 - 17499350
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499414 tttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 17499350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Original strand, 25476392 - 25476494
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25476392 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgtt-gttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 25476490  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  25476491 atga 25476494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Original strand, 28848618 - 28848762
Alignment:
Q  157 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatg 253  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||    
T  28848618 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 28848716  T
Q  254 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848717 ttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28848762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8899252 - 8899105
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  8899252 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 8899154  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8899153 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgat 8899105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 16454285 - 16454432
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  16454285 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16454383  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16454384 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 16454432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 43841045 - 43840944
Alignment:
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43841045 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 43840947  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  43840946 tga 43840944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 300
Target Start/End: Original strand, 6469186 - 6469285
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469186 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 6469283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 301
Target Start/End: Original strand, 14576840 - 14576940
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || | |  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  14576840 ttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttga 14576938  T
Q  300 tg 301  Q
    ||    
T  14576939 tg 14576940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147628
Alignment:
Q  137 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||  ||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 22147566  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22147567 gttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagt 22147628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 300
Target Start/End: Original strand, 40213728 - 40213827
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| || || ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40213728 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 40213825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 295
Target Start/End: Original strand, 53070657 - 53070799
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| || || || ||| | ||||||  |    
T  53070657 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-t 53070755  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070756 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 55501052 - 55500953
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501052 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 55500955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 252
Target Start/End: Original strand, 2051141 - 2051260
Alignment:
Q  137 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga- 233  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| | |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  2051141 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaa 2051240  T
Q  234 -tgatttgcatactgcctat 252  Q
     || ||||||||||||||||    
T  2051241 ctgttttgcatactgcctat 2051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15977573 - 15977526
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977573 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15977526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737247
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737294 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17737247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8499568 - 8499529
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499568 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 8499529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556996
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 10556996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 13151794 - 13151942
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  13151794 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 13151892  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13151893 gtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13151942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 13154259 - 13154407
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  13154259 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 13154357  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13154358 gtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13154407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 14665912 - 14665853
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttga 65  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  14665912 ttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 14665853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 14735425 - 14735366
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttga 65  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  14735425 ttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 14735366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15412479 - 15412440
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412479 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15412440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41123940 - 41123901
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 41123901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45577989
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45577989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 10247727 - 10247874
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  10247727 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 10247825  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10247826 gtgctgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgat 10247874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 17446659 - 17446805
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||  |||||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  17446659 atataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 17446757  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17446758 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgat 17446805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Original strand, 4588602 - 4588661
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttga 65  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  4588602 ttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgagctttgtcgcacgagttgttatgagttga 4588661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 12119837 - 12119876
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12119837 ttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12119876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 14669067 - 14669008
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttga 65  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  14669067 ttacagaatgccttgtttaggttaaattcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 14669008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 44494859 - 44494820
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44494859 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgat 44494820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 12340059 - 12340000
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttga 65  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  12340059 ttacataatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgttgagagttga 12340000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 46822318 - 46822279
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  46822318 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 46822279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919350
Alignment:
Q  243 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 324526 - 324481
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatc 67  Q
    ||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  324526 ttaggttaaatgtgacctttgtcgtacaagttgatgtgagttgatc 324481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 64)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 21329306 - 21329604
Alignment:
Q  2 ctagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctg 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  21329306 ctagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttg 21329405  T
Q  102 ttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagagat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||  ||  |    
T  21329406 ttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgt 21329504  T
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329505 tgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21329604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 21501989 - 21502263
Alignment:
Q  28 taaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaa-ctaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgattta 126  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21501989 taaatgcgatatttgtcgcacgagttgatgttagttgatcttggaagttagaaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatta 21502088  T
Q  127 atatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgtta 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||   || ||| ||||||||||||||||||    
T  21502089 atatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgtta 21502188  T
Q  226 tatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21502189 tatcatgctgatttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21502263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21565855 - 21565554
Alignment:
Q  1 actagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgct 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21565855 actagttacagaatgacttgtttatgtaaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgtt 21565756  T
Q  101 gttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagaga 199  Q
    |||||||||  |||||| |||||  | |||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |      
T  21565755 gttgttgttctagtaagactgatgca-tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgaaatg 21565657  T
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565656 ttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 21565557  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  21565556 tga 21565554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 22959343 - 22959641
Alignment:
Q  1 actagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgct 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  22959343 actagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgattcttgttgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaaccaagttgtttatcttgtt 22959442  T
Q  101 gttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagaga 199  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||  | |||||   ||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||       
T  22959443 gtttttgttccagtaagactgatgca-tatgaatcaatgttggttaaaatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgag--- 22959538  T
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959539 ttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22959638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 299
Target Start/End: Original strand, 26011845 - 26012141
Alignment:
Q  2 ctagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctg 101  Q
    ||||||||||||||| || || ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  26011845 ctagttacagaatgctttgtt-aggttaaatgtgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgtta 26011943  T
Q  102 ttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagat 200  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||  |    
T  26011944 ttgttgtttcagtaagcctgaacta-tataatctgatgttgttgttgatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgt 26012042  T
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012043 tgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgctttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26012141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19669210 - 19668910
Alignment:
Q  1 actagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgct 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  19669210 actagttacagaatgccttgtttaggataaatgtgattcttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtcgtttatcttgtt 19669111  T
Q  101 gttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatc--taatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgaga 197  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  | |||||    | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||     
T  19669110 gttgttgttccagtaagactgatgca-tatgaatattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacaggacttatgtttgatatttgag- 19669013  T
Q  198 gattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 297  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19669012 --ttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgatgatttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagtt 19668915  T
Q  298 gatga 302  Q
    |||||    
T  19668914 gatga 19668910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 40 - 295
Target Start/End: Original strand, 20026787 - 20027043
Alignment:
Q  40 ttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatg 139  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| | |||||    
T  20026787 ttgtcgcacgagtcgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgtagttgtttcagtaagcctgaatt-atatgttttaatg 20026885  T
Q  140 ttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga--tga 236  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| ||  ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||     
T  20026886 ttgttgataatgctatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgat-gttgtgatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgt 20026984  T
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026985 tttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 298
Target Start/End: Original strand, 19660651 - 19660940
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  19660651 gttacagaacgcctt-tttaggttgaatgcaatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgtta 19660749  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgt 203  Q
     |||| ||||||| |||||    |||||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||    
T  19660750 atgttccagtaagactgatgct-tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgt 19660845  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||  |||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19660846 tgatttatattcgatatcattatatcaagatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 19660940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 295
Target Start/End: Original strand, 22178064 - 22178323
Alignment:
Q  38 ctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaa 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| | || |||||||   |    
T  22178064 ctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaaacctaaatt-atatgattgga 22178162  T
Q  138 tgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga--t 234  Q
    |||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |    
T  22178163 tgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagct 22178262  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    | |||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22178263 gttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Original strand, 21741356 - 21741546
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    ||||||| |||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||    
T  21741356 agttacataatgtcttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttaattaccttgatgtt 21741455  T
Q  104 gttgtttcagtaagcct-gatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattg 202  Q
    ||  || |||||||||| ||||  ||||  ||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  21741456 gtcattccagtaagcctggattgtatat--tctaatgt------------tatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttg 21741541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 154 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22144211 - 22144068
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 251  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| | |||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  22144211 atataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactaccta 22144112  T
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144111 tgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 213 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 36314678 - 36314596
Alignment:
Q  213 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314678 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 36314596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1096581 - 1096479
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| | ||| || ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096581 ttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 1096483  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  1096482 atga 1096479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Original strand, 21729071 - 21729169
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729071 ttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21729169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Original strand, 21808396 - 21808494
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808396 ttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21808494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 208 - 302
Target Start/End: Original strand, 21997549 - 21997643
Alignment:
Q  208 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997549 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 21997643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24493682 - 24493581
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24493682 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttga 24493584  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  24493583 tga 24493581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Original strand, 8286888 - 8286952
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286888 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 8286952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22412309 - 22412198
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  22412309 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtc 22412211  T
Q  288 ggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||    
T  22412210 ggtctaagttgat 22412198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24529334 - 24529232
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||  |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529334 ttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24529236  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  24529235 atga 24529232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 40726050 - 40725871
Alignment:
Q  119 ctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagagattgttgatttgcattcg 216  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||  ||||| | || | | ||    
T  40726050 ctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcg 40725951  T
Q  217 atattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40725950 atattattatatcatgatgctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 40725871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13025424 - 13025323
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||| ||||||| |||||   ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13025424 ttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttga 13025326  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  13025325 tga 13025323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13095608 - 13095507
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||| ||||||| |||||   ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13095608 ttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttga 13095510  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  13095509 tga 13095507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 201 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 25421645 - 25421544
Alignment:
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421645 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25421547  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  25421546 tga 25421544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Original strand, 23390541 - 23390605
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390541 tttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 23390605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 9078066 - 9077964
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9078066 ttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttg 9077968  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  9077967 atga 9077964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22075133 - 22075035
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22075133 ttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttg 22075035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 264772 - 264919
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  264772 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 264870  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264871 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 264919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 10732944 - 10733091
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  10732944 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 10733042  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733043 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 10733091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 11581203 - 11581350
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  || |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  11581203 atataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 11581301  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581302 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 11581350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 299
Target Start/End: Original strand, 20902012 - 20902159
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatat--ttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcc 249  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||  ||||||  ||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  20902012 atataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc- 20902110  T
Q  250 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902111 tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20902159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20909170 - 20909023
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  20909170 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20909072  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909071 gtgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20909023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29330092 - 29329945
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  29330092 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 29329994  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329993 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29329945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 39363542 - 39363395
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  39363542 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 39363444  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363443 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39363395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 29448159 - 29448055
Alignment:
Q  160 ttgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 256  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||    
T  29448159 ttgtatatgcattacatgaattacgtatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttg 29448060  T
Q  257 ctgtt 261  Q
    |||||    
T  29448059 ctgtt 29448055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37723975 - 37723922
Alignment:
Q  242 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37723975 atactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 37723922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25431508 - 25431414
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431508 ttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 42245369 - 42245516
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  42245369 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 42245467  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42245468 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 42245516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 36154787 - 36154931
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  36154787 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 36154885  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154886 gtgttg----ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 36154931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918099
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918052 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20918099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 295
Target Start/End: Original strand, 21293020 - 21293071
Alignment:
Q  243 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21293020 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaag 21293071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 39245194 - 39245147
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245194 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39245147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 2154726 - 2154765
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154726 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 2154765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Original strand, 22120007 - 22120066
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttga 65  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  22120007 ttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 22120066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064522
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23064522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619445
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38619445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29346138 - 29345991
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  29346138 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 29346040  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29346039 gtgatgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgat 29345991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 300
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775827
Alignment:
Q  263 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 10775827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 18319146 - 18319185
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18319146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 18319185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Original strand, 24767151 - 24767210
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttga 65  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  24767151 ttacagaatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 24767210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31061118 - 31061079
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31061118 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 31061079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 48
Target Start/End: Original strand, 5888990 - 5889032
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcac 48  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5888990 ttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcac 5889032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 298
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  244 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29348611 - 29348464
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  29348611 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 29348513  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29348512 gtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgat 29348464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29351084 - 29350937
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  29351084 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 29350986  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29350985 gtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgat 29350937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 109
Target Start/End: Original strand, 27988774 - 27988845
Alignment:
Q  38 ctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggtt-agaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtt 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  27988774 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcat-gaggttaaggaactaagttgtttatatatctgttgttgtt 27988845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15796696 - 15796438
Alignment:
Q  39 tttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaat 138  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||| | | |||  ||||  |||||| ||||  | ||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  15796696 tttgtcgcacgagttgttgtgagatgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactactgctgctgtttcagtaagcctgatataa-atgatttgat 15796598  T
Q  139 gttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgaga--gattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga-- 233  Q
    |||| |  |||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||    ||| ||| |||  ||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||      
T  15796597 gttgctaataatgtgatataattgtatatacagtatgcgaattataagagatgtttaagattgat-gttgattatcatttgatattgctatatcatgagc 15796499  T
Q  234 tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    || |||   | |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  15796498 tgttttatgtgctgcctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaag 15796438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806893
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgat 20806893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 25743996 - 25743925
Alignment:
Q  38 ctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtt 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  25743996 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaataaactaagttgcttatgctgttgttgttgtt 25743925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 26704124 - 26704089
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26704124 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 26704089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 295
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  244 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 26973857 - 26973822
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26973857 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 26973822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 32027443 - 32027404
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  32027443 ttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgat 32027404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18418677 - 18418594
Alignment:
Q  216 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttattt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  18418677 gatattattatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgatgtt-gttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgat 18418594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 130218 - 129917
Alignment:
Q  1 actagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgct 100  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130218 actagttacaaaatgccttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgct 130119  T
Q  101 gttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagaga 199  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  | |||||  | ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  130118 gttgttgttccagtaagactgatgca-tatgaattgatgttgtttacaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatg 130020  T
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  130019 ttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttga 129920  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  129919 tga 129917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 191 - 295
Target Start/End: Original strand, 60713 - 60818
Alignment:
Q  191 tttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  60713 tttgagatgttgttgatttgcatt-gatattggtatatcatgagctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 60811  T
Q  289 gtctaag 295  Q
    || ||||    
T  60812 gtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 7122 - 6824
Alignment:
Q  1 actagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgct 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122 actagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgattcttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgct 7023  T
Q  101 gttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagaga 199  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |  ||||||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||       
T  7022 gttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgag--- 6927  T
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  6926 ttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatga 6827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8299 - 8097
Alignment:
Q  30 aatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaata 129  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  8299 aatgtgatctttgtctcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttatcctgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-ata 8201  T
Q  130 tgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatat 228  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8200 taatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatat 8101  T
Q  229 catg 232  Q
    ||||    
T  8100 catg 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 69)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 300
Target Start/End: Original strand, 39706100 - 39706395
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  39706100 agttacagaatgctttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggagattaggaattaagttgtttatcttgctgtt 39706199  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgt 203  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||  ||      
T  39706200 gttgttttagtaagcctgaatta-tatgatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgttgatgtttatgatgttca 39706298  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706299 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39706395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12774306 - 12774019
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774306 gttacagactgccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 12774207  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgtt 204  Q
    ||||| ||||||| |||||  | |||||  | ||||||||  |||||        |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||    
T  12774206 ttgttccagtaagactgatgca-tatgaattgatgttgtttataatg--------ttgtatatacattaaatggattatgttgataattgagatgttgtt 12774116  T
Q  205 gatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774115 gatt-gtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 12774019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Original strand, 12288055 - 12288316
Alignment:
Q  39 tttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaat 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  12288055 tttgtcgcataagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttaat 12288153  T
Q  139 gttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga--tg 235  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  12288154 gttgttggtaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgat-gttgtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactg 12288252  T
Q  236 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288253 gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8846685 - 8846368
Alignment:
Q  1 actagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgct 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  8846685 actagttacagaatgtcttgtttatgttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgaacttagagattagaaactaagttgtttatcttgta 8846586  T
Q  101 gttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagaga 199  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  8846585 gttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatg 8846487  T
Q  200 ttgttga----------------tttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 283  Q
    ||| |||                || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  8846486 ttgatgacttgcattcgatattgttagcattcgatattgttatctcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaata 8846387  T
Q  284 agtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8846386 agtcggtctaagttgatga 8846368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 38 - 295
Target Start/End: Original strand, 13695 - 13953
Alignment:
Q  38 ctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaa 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||| |  |||||| | |    
T  13695 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtt-tatgatttga 13793  T
Q  138 tgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatg 235  Q
    |||||||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  13794 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg 13893  T
Q  236 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13894 ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15552098 - 15551833
Alignment:
Q  29 aaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaat 128  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||  |||  ||||||| |||||    |    
T  15552098 aaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtt-accctgctgttaatgtcccagtaagactgatgct-t 15552001  T
Q  129 atgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttata 227  Q
    ||||   ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  15552000 atgaatcaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttaccttcgatattattata 15551904  T
Q  228 tcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551903 tcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15551833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16596953 - 16596686
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  16596953 gttacagaatgcctt-tttaggttgaatgtgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgtta 16596855  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgt 203  Q
     ||||  |||||| |||||    ||| |  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   |||     
T  16596854 atgttcaagtaagactgatgct-tataaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttga 16596759  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 276  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596758 tgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15190625 - 15190423
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  15190625 agttacagaatgccttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttgggggttagaaactaagttatttaccttgatgtt 15190526  T
Q  104 gttgtttcagtaagcct-gatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattg 202  Q
    ||  || |||||||||| ||||  ||||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  15190525 gtcattccagtaagcctggattgtatat--tctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttg 15190428  T
Q  203 ttgat 207  Q
    |||||    
T  15190427 ttgat 15190423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 43198384 - 43198661
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |   |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||     
T  43198384 ttaggttaaatgcgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgct---agaggtaaaaaactaagttgtttatcttgttgttgatgttccagtaagacta 43198480  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagagattgttgatttgcattcgata 219  Q
    ||  | |||||  | ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||    
T  43198481 atgca-tatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgata 43198579  T
Q  220 ttgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    | ||||||||||||  || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198580 tggttatatcatgaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15099658 - 15099456
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  15099658 agttacagaatgtcttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgtt 15099559  T
Q  104 gttgtttcagtaagcct-gatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattg 202  Q
    ||  || |||||||||| ||||  ||||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  15099558 gtcattccagtaagcctggattgtatat--tctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttg 15099461  T
Q  203 ttgat 207  Q
    |||||    
T  15099460 ttgat 15099456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Original strand, 53081979 - 53082254
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggtta-gaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcct 120  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| | || || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53081979 ttaggttaaatgtgacatttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcct 53082078  T
Q  121 gatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgata 219  Q
    || || ||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||  || ||||||||| || ||||    
T  53082079 gaatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgata 53082176  T
Q  220 ttgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||  || |||   |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082177 ttgttatatcatgaactgttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Original strand, 46640285 - 46640558
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  46640285 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcat-ggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaaacctg 46640383  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    | || ||||||| | ||||||||  | |||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||  ||||||  || ||||||| |||| |||||    
T  46640384 aatt-atatgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgat-gttgagatgttattgattttcatttgatat 46640481  T
Q  221 tgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||  || |||  |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640482 tgttatatcatgaactgttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Original strand, 52243192 - 52243302
Alignment:
Q  191 tttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 288  Q
    |||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243192 tttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 52243291  T
Q  289 gtctaagttga 299  Q
    |||||||||||    
T  52243292 gtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Original strand, 16377530 - 16377630
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377530 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16377627  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  16377628 tga 16377630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 201 - 302
Target Start/End: Original strand, 52873375 - 52873476
Alignment:
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873375 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52873473  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  52873474 tga 52873476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 7088953 - 7088889
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088953 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 7088889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 7798850 - 7798786
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798850 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 7798786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 6900004 - 6899903
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||   ||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6900004 ttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttga 6899906  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  6899905 tga 6899903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 208 - 302
Target Start/End: Original strand, 16270251 - 16270344
Alignment:
Q  208 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16270251 ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatga 16270344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 18215278 - 18215425
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  18215278 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 18215376  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215377 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18215425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 19618176 - 19618323
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| |    
T  19618176 atataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-t 19618274  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618275 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19618323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 44615446 - 44615299
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  |    
T  44615446 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 44615348  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615347 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44615299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 51463872 - 51464019
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  51463872 atataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-t 51463970  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463971 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 51464019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3096369 - 3096309
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3096369 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 3096309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12902833 - 12902773
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902833 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 12902773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14280438 - 14280327
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 286  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14280438 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 14280341  T
Q  287 cggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||    
T  14280340 cggtctaagttgat 14280327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17046559 - 17046506
Alignment:
Q  242 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046559 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 17046506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Original strand, 54798749 - 54798861
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 286  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  54798749 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagt 54798847  T
Q  287 cggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||    
T  54798848 cggtctaagttgat 54798861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Original strand, 23374366 - 23374464
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23374366 ttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttg 23374464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 12311 - 12458
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  12311 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 12409  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12410 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 201 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 7893816 - 7893715
Alignment:
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7893816 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttga 7893718  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  7893717 tga 7893715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 15118356 - 15118503
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  15118356 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 15118454  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118455 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15118503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Original strand, 16239977 - 16240078
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16239977 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgctatt-gttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttga 16240075  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  16240076 tga 16240078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 44773091 - 44773238
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  44773091 atataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 44773189  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773190 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44773238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 44928883 - 44929031
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  || |||| ||||||| || ||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  44928883 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgctt 44928982  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928983 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44929031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 52312668 - 52312521
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  52312668 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 52312570  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312569 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 52312521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 300
Target Start/End: Original strand, 23803317 - 23803416
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803317 ttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 23803414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 14038762 - 14038660
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||  |||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14038762 ttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 14038664  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  14038663 atga 14038660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6190531 - 6190481
Alignment:
Q  245 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190531 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22636504 - 22636447
Alignment:
Q  244 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636504 actgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 22636447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 50222343 - 50222490
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||  |    
T  50222343 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgt-t 50222441  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222442 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 50222490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 297
Target Start/End: Original strand, 8574864 - 8574971
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||  ||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8574864 atatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 8574961  T
Q  288 ggtctaagtt 297  Q
    ||||||||||    
T  8574962 ggtctaagtt 8574971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 44052905 - 44052841
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44052905 tttgtatactgcctatgttgatgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatga 44052841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Original strand, 1837613 - 1837660
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837613 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1837660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641333
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641286 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 7641333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12611008 - 12610961
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611008 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12610961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 15355437 - 15355476
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355437 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15355476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 18239531 - 18239570
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239531 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18239570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19242749 - 19242710
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242749 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19242710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 24029048 - 24028989
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttga 65  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  24029048 ttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 24028989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102225
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44102225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3515165 - 3515018
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| || || || ||| | ||||||| |    
T  3515165 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgc-t 3515067  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515066 gtgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3515018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 14164807 - 14164741
Alignment:
Q  56 tgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 122  Q
    |||||| ||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14164807 tgtgagatgatcctaggggttgggaactaagttgtttatcttgctgttgttgttctagtaagcctga 14164741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 65
Target Start/End: Original strand, 22634026 - 22634086
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttga 65  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  22634026 gttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgatttgttatgagttga 22634086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 295
Target Start/End: Original strand, 14053325 - 14053403
Alignment:
Q  216 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14053325 gatattattatgtcatgctg-tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 14053403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 14970819 - 14970858
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14970819 ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 14970858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Original strand, 20157104 - 20157163
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttga 65  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  20157104 ttacagagtgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 20157163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 14158102 - 14158036
Alignment:
Q  56 tgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 122  Q
    |||||| ||||| ||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14158102 tgtgagatgatcctaggggttgggaactaagttttttatcttgctgttgttgttctagtaagcctga 14158036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22353901 - 22353852
Alignment:
Q  245 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22353901 ctgcctatgctgctgtt-gttatttacctaagctgcatgagtcggtctaag 22353852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 3332192 - 3332151
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgca 47  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3332192 ttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgca 3332151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Original strand, 13812623 - 13812682
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttga 65  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  13812623 ttacagaatgctttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 13812682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15367743 - 15367708
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15367743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15367708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15370071 - 15370036
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15370071 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15370036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15371255 - 15371220
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15371255 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15371220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15373536 - 15373501
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15373536 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15373501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15402756 - 15402721
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15402756 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15402721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16223585 - 16223550
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16223585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 16223550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 232
Target Start/End: Original strand, 15464929 - 15464970
Alignment:
Q  191 tttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatg 232  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15464929 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 15464970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 295
Target Start/End: Original strand, 21815699 - 21815731
Alignment:
Q  263 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815699 gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13075 - 12778
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13075 gttacaaaatgccttgtttaggttaaatgcaatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtggtttatcttgctgttg 12976  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagagattgt 203  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||  ||  |||     
T  12975 ttgttccagtaagcctgaatt-atatgatctaatgttgttattaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttga 12877  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12876 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 12778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10819 - 10542
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10819 ttaggttaaatgcgatctctgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 10720  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||    
T  10719 aatt-atataatctaatgttgttgttaatgtcatataattgtatatacattacatgaattatgttcgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatat 10621  T
Q  221 tgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10620 tgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 75)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19652506 - 19652207
Alignment:
Q  1 actagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgct 100  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652506 actagttacaaaataccttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgct 19652407  T
Q  101 gttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagat 200  Q
    ||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||  |    
T  19652406 gttattgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatactttaaatggattatgttgatgtttgagatgt 19652308  T
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652307 tgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19652209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23019698 - 23019425
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019698 ttaggttaaatgcgatctttgtcgaacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 23019599  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    |  | |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||| |||||    
T  23019598 aact-atataatctaatgtcgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatat 23019500  T
Q  221 tgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23019499 tgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Original strand, 28496287 - 28496575
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  28496287 gttacagaatgccttgtttaggttaa-tgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgtta 28496385  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgt 203  Q
     |||| ||||||| |||||  | |||||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||    
T  28496386 atgttccagtaagactgatgca-tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgag---ttgt 28496481  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496482 tgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Original strand, 29808698 - 29808986
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  29808698 gttacagaatgccttgtttaggttaa-tgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgtta 29808796  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgt 203  Q
     |||| ||||||| |||||  | |||||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||    
T  29808797 atgttccagtaagactgatgca-tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgag---ttgt 29808892  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808893 tgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 1561609 - 1561319
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgt 105  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  1561609 ttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaa 1561510  T
Q  106 tgtttcagtaagcctgatttaatatga-tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgt 203  Q
    | || ||||||| |||||  | ||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||    
T  1561509 tattccagtaagactgatgca-tatgaatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgag---ttgt 1561414  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1561413 tgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 1561319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19668664 - 19668386
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19668664 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctg 19668565  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    || | ||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||    
T  19668564 atgt-atatgatgtagtgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattacgtatgat-gttgtgatgttgttgatttgcatttgatat 19668467  T
Q  221 tgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668466 tgttatatcatgaactgttttgcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Original strand, 22080562 - 22080800
Alignment:
Q  16 ccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagta 115  Q
    |||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22080562 ccttgtttaggaataatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgcttatcttgctcttgttgtttcagta 22080661  T
Q  116 agcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgttgatttgcattc 215  Q
    ||||| | || |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||  |||||  | |||||||    
T  22080662 agcctaaattgatatgacctaatgatgttgttaatgttatataaatgtatatacattatattaattatgacgatgtttgagatgttgtt-ctgtgcattc 22080760  T
Q  216 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtt 255  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22080761 gatattgttatatcatgatgttttgcatactgcctatgtt 22080800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 299
Target Start/End: Original strand, 9098370 - 9098620
Alignment:
Q  38 ctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaa 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  9098370 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaatttgtttatcttgcagttattgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttaa 9098468  T
Q  138 tgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga--t 234  Q
    ||||            |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| || | ||  |||||||  |||||| ||||||||||||||||||  |    
T  9098469 tgtt------------atataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaatt 9098555  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098556 gttttgcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 38 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20109417 - 20109153
Alignment:
Q  38 ctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaa 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||  |||||| ||||| || ||| |  | |    
T  20109417 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgtctttctagtaagactgatgta-tatcaattga 20109319  T
Q  138 tgttgttgttaatggtatataat--tgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga 233  Q
    |||||||  |||||  |||||||  |||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||     
T  20109318 tgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgt 20109219  T
Q  234 tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109218 tgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20109153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 213 - 300
Target Start/End: Original strand, 27333238 - 27333325
Alignment:
Q  213 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333238 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 27333325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 213 - 300
Target Start/End: Original strand, 27393978 - 27394065
Alignment:
Q  213 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27393978 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 27394065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 302
Target Start/End: Original strand, 4185654 - 4185930
Alignment:
Q  23 taggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 122  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  || | || ||||| |||| |||| || || |    
T  4185654 taggttaaatgcgatccttgccgcacgagttgttgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgttgttgatgttccagtgagtctaa 4185753  T
Q  123 tttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgat-atttgagagattgttgatttgcattcgatatt 221  Q
    ||   ||  ||| |||| ||||| | ||| || | || |||||| |||||  |||| |||||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||    
T  4185754 ttgttta--atccaatgatgttgatgatgttaaacaaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatatga-ag-ttgatgaattgcattcgatatt 4185849  T
Q  222 gttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4185850 gttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4185930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23077024 - 23076749
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    |||||||||||| || |||||| |||  |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23077024 ttaggataaatgtgacctttgttgcatgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaatttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 23076925  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    || | | ||||| | ||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||| ||   |||||||||  || | |||||    
T  23076924 atat-agatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcacttgatat 23076826  T
Q  221 tgttatatcatg--atgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    | |||||||  |  ||| |||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076825 tattatatctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35008442 - 35008167
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    |||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35008442 ttaggataaatgtgacctttgttgcacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaagcctg 35008343  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    || | | ||||| | ||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||| ||   || ||||||  || | |||||    
T  35008342 atat-agatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatattcattacatgaattatatatgatgtttaagttgtttttgattatcacttgatat 35008244  T
Q  221 tgttatatcatg--atgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    | |||||||  |  ||| |||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008243 tattatatctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 147
Target Start/End: Original strand, 27333114 - 27333238
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27333114 ttaggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaaattgtttatcttgatgttgctgtttcagtaagcctg 27333213  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgtt 147  Q
    | ||  ||| ||| ||||||||||||    
T  27333214 aatt-gtataatccaatgttgttgtt 27333238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 147
Target Start/End: Original strand, 27393854 - 27393978
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27393854 ttaggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaaattgtttatcttgatgttgctgtttcagtaagcctg 27393953  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgtt 147  Q
    | ||  ||| ||| ||||||||||||    
T  27393954 aatt-gtataatccaatgttgttgtt 27393978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 208 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 4186473 - 4186379
Alignment:
Q  208 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4186473 ttgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4186379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 201 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076712
Alignment:
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20076714  T
Q  301 ga 302  Q
    ||    
T  20076713 ga 20076712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Original strand, 4668028 - 4668277
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgt 105  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  || | ||||||||     
T  4668028 ttacagaatgccttgct-aggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgttgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttga 4668126  T
Q  106 tgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgat-atttgagagattgtt 204  Q
    |||| |||| || || |||   ||  ||| |||| ||||| | ||| || | || |||||| |||||  |||| |||||||||| || ||| || ||| |    
T  4668127 tgttccagtgagtctaattgttta--atccaatgatgttgatgatgttaaacaaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatatga-ag-ttgat 4668222  T
Q  205 gatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 259  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4668223 gaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 4668277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Original strand, 4674875 - 4675124
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgt 105  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  || | ||||||||     
T  4674875 ttacagaatgccttgct-aggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgttgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttga 4674973  T
Q  106 tgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgat-atttgagagattgtt 204  Q
    |||| |||| || || |||   ||  ||| |||| ||||| | ||| || | || |||||| |||||  |||| |||||||||| || ||| || ||| |    
T  4674974 tgttccagtgagtctaattgttta--atccaatgatgttgatgatgttaaacaaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatatga-ag-ttgat 4675069  T
Q  205 gatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 259  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4675070 gaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 4675124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 302
Target Start/End: Original strand, 31155228 - 31155506
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||  ||||||||||  || |||||||||| |||| |||| || ||     
T  31155228 ttaggttaaatgcggtccttgtcgcacgagttgttgtgagatgattttagatgttaagaactaagttgcctagcttgctgttgatgttccagtgagtcta 31155327  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgat-atttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    | ||  | | |||  ||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||  |||| |||||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||    
T  31155328 aattttt-taatccgatgatgttgttgatgttatataaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatatga-ag-ttgatgaattgcattcgatat 31155424  T
Q  221 tgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||    
T  31155425 tgttatatcacgatgacttgcatactgttta-gttgctgttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatga 31155506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 211 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25644424 - 25644335
Alignment:
Q  211 cattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644424 catttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16496358 - 16496260
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496358 ttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16496260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 29060654 - 29060552
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29060654 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctg 29060556  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  29060555 atga 29060552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 295
Target Start/End: Original strand, 18199231 - 18199519
Alignment:
Q  8 acagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttg 107  Q
    ||||| |||||| |||||| |  ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| | | |||  ||||  |||||| ||||  |||||||||||    
T  18199231 acagactgccttgtttagggtctatgcgat-tttgtcgcacgagttgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttg 18199329  T
Q  108 tttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgaga--gattgtt 204  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| |||||  |||||||| | |||| ||| |||  || ||||    
T  18199330 tttcagtaagtctgatataa-atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattga-tgtt 18199427  T
Q  205 gatttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||  || |||   | || ||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  18199428 gattatcatttgatattgttatatcatgagttgttttatgtgcttcctatgttgctgtttatta-ttgattaagctgcatgagtcggtctaag 18199519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 298
Target Start/End: Original strand, 8227435 - 8227616
Alignment:
Q  119 ctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagagattgttgatttgcattcg 216  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||  ||||| | || | | ||    
T  8227435 ctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcg 8227534  T
Q  217 atattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8227535 atattattatatcatgatgttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttg 8227616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22782385 - 22782238
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| || ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  22782385 atataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 22782287  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782286 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22782238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Original strand, 18409834 - 18409936
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18409834 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttg 18409932  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  18409933 atga 18409936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Original strand, 19303548 - 19303649
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19303548 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 19303646  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  19303647 tga 19303649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 30676714 - 30676861
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||| | ||||||| |    
T  30676714 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgc-t 30676812  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676813 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 30676861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 201 - 300
Target Start/End: Original strand, 17287804 - 17287903
Alignment:
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287804 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 17287902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 295
Target Start/End: Original strand, 18177517 - 18177775
Alignment:
Q  39 tttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaat 138  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| | | |||  ||||  |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | ||    
T  18177517 tttgtcgcacgagttgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatataa-atgatttgat 18177615  T
Q  139 gttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgaga--gattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga-- 233  Q
    ||||||  |||||  |||||| ||||||| |||||  |||||||| | |||| ||| |||  || ||||||||  |||| ||||||||||||||||||      
T  18177616 gttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattga-tgttgattatcatttgatattgttatatcatgagt 18177714  T
Q  234 tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    || |||   | || ||||||||| ||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  18177715 tgttttatgtgcttcctatgttgttgtttatta-ttgattaagctgcatgagtcggtctaag 18177775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18204354 - 18204096
Alignment:
Q  39 tttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaat 138  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| | | |||  ||||  |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | ||    
T  18204354 tttgtcgcacgagttgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtaa-atgatttgat 18204256  T
Q  139 gttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgaga--gattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga-- 233  Q
    ||||||  |||||  |||||| ||||||| |||||  |||||||| | |||| ||| |||  || ||||||||  |||| ||||||||||||||||||      
T  18204255 gttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattga-tgttgattatcatttgatattgttatatcatgagt 18204157  T
Q  234 tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    || |||   | || ||||||||| ||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  18204156 tgttttatgtgcttcctatgttgttgtttatta-ttgattaagctgcatgagtcggtctaag 18204096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 246 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22831571 - 22831524
Alignment:
Q  246 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831571 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22831524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Original strand, 25629362 - 25629464
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629362 ttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgtt-gtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 25629460  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  25629461 atga 25629464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1595707 - 1595560
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  1595707 atataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 1595609  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1595608 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 1595560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 2291184 - 2291331
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  2291184 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 2291282  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291283 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 2291331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12742475 - 12742328
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  12742475 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 12742377  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742376 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12742328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 18334596 - 18334743
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  18334596 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 18334694  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334695 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18334743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19005204 - 19005057
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  19005204 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 19005106  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005105 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19005057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 19858923 - 19859070
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  19858923 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 19859021  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859022 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19859070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24422705 - 24422558
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  24422705 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24422607  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422606 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24422558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25754967 - 25754820
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  25754967 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-t 25754869  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754868 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 25754820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 33861952 - 33861805
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  33861952 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 33861854  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861853 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 33861805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 33864436 - 33864289
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  33864436 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 33864338  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864337 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 33864289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 291
Target Start/End: Original strand, 16920679 - 16920728
Alignment:
Q  242 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 291  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16920679 atactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16920728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 302
Target Start/End: Original strand, 20361013 - 20361069
Alignment:
Q  245 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20361013 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatga 20361069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Original strand, 20638328 - 20638392
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20638328 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatga 20638392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 208 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25656731 - 25656640
Alignment:
Q  208 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656731 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 25656640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35245658 - 35245605
Alignment:
Q  242 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245658 atactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35245605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20593887 - 20593785
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  20593887 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttg 20593789  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  20593788 atga 20593785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8055187 - 8055040
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||   |    
T  8055187 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttt-t 8055089  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055088 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 8055040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 26924644 - 26924791
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||   |    
T  26924644 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-t 26924742  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924743 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26924791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11185568 - 11185524
Alignment:
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185568 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714431
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 25714431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Original strand, 28103796 - 28103887
Alignment:
Q  91 ttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat 183  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  28103796 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattatgtgaattat 28103887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25688562 - 25688513
Alignment:
Q  250 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25688562 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgat 25688513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 33443235 - 33443068
Alignment:
Q  125 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgt 223  Q
    ||||||||| |||||||| |  |||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||| |  ||| ||| ||   |||||||||   ||| ||||||||    
T  33443235 taatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaag---ttgttgattattatttgatattgt 33443139  T
Q  224 tatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    |||||| |||  || |||  ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33443138 tatatcttgagatgttttatatactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 34963531 - 34963384
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  34963531 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 34963433  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34963432 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 34963384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18456877 - 18456735
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||   |    
T  18456877 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-t 18456779  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456778 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 302
Target Start/End: Original strand, 22780295 - 22780336
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22780295 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 22780336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Original strand, 1541015 - 1541062
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1541015 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgat 1541062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Original strand, 3852121 - 3852168
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3852121 tgttgctgtt-gttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3852168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Original strand, 20556996 - 20557043
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20556996 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 20557043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 16448639 - 16448678
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16448639 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 16448678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18461937 - 18461895
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461937 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 295
Target Start/End: Original strand, 18821904 - 18821946
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821904 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18706495 - 18706356
Alignment:
Q  125 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgt 223  Q
    ||||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||| |||  || ||||||||| || ||||||||    
T  18706495 taatatgatttgatgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagatgttattgatttgcttt-gatattgt 18706397  T
Q  224 tatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgttt 262  Q
    ||||||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||    
T  18706396 tatatcatgaactgttttatatattgcctatgttgctgttt 18706356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18696675 - 18696569
Alignment:
Q  127 atatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgtta 225  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| || ||||  || ||||||||| || ||||||||||    
T  18696675 atatgatttaatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttggagatgttattgatttgcttt-gatattgtta 18696577  T
Q  226 tatcatga 233  Q
    ||||||||    
T  18696576 tatcatga 18696569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 19848063 - 19848102
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19848063 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 19848102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 23539243 - 23539165
Alignment:
Q  39 tttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaag 117  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| | | |||  ||||  ||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  23539243 tttgtcgcacgagttgttgtgagttgatccttggggtaggaaataaagttgtttatattacagttgttgtttcagtaag 23539165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 300
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080832
Alignment:
Q  267 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 22080832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 4189262 - 4189203
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgat 66  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4189262 ttacagaatgccttgct-aggttaaatgcgatcgttgtcgcacgagttgttgtgagttgat 4189203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 302
Target Start/End: Original strand, 4738626 - 4738666
Alignment:
Q  262 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4738626 tgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4738666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 183
Target Start/End: Original strand, 18896256 - 18896304
Alignment:
Q  135 taatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat 183  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18896256 taatgttgttagtaatgggatataattgtatatgcattatgtgaattat 18896304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 300
Target Start/End: Original strand, 5934 - 6230
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  5934 agttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcgcaagttgatgttagttgatcttggaggttaaaaactaagttatttatcttgctgtt 6033  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagagattg 202  Q
     |||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||  ||  ||     
T  6034 attgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgtta 6132  T
Q  203 ttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6133 atgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 10370 - 10647
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  10370 ttaggttaaatgcgatctttgttgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactg 10469  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    ||  | |||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||    
T  10470 atgca-tatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatat 10568  T
Q  221 tgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10569 tgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 45600 - 45901
Alignment:
Q  1 actagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgct 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45600 actagttacagaatgtcttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatattgct 45699  T
Q  101 gttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagaga 199  Q
    ||  ||||| ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||      
T  45700 gtaattgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttgataattgagatg 45798  T
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45799 ttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 45898  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  45899 tga 45901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 160996 - 160696
Alignment:
Q  1 actagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgct 100  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  160996 actagttacagaatgtcttggttaggataaatgtgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgtt 160897  T
Q  101 gttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagaga 199  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||| |      
T  160896 gttgttgtttcggtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatatattacatgacttatgtttgatatttgacatg 160798  T
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  160797 ttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 160699  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  160698 tga 160696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 501242 - 501095
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| |    
T  501242 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgc-t 501144  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501143 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 501095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 85692 - 85731
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  85692 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 85731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32844 - 32551
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    |||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  32844 agttacagaatgccttgttg-ggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgtt 32746  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagagattg 202  Q
     |||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  |||    
T  32745 attgtttcagtaagcctgaatt-atataatctaatgtttttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttg 32647  T
Q  203 ttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32646 ttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 32551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 295
Target Start/End: Original strand, 51936 - 51985
Alignment:
Q  245 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51936 ctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6921 - 6625
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    ||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6921 agttatagaatgcattgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgaacttggagattagaatctaagttgtttatcttgctgtt 6822  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagagattg 202  Q
    ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||   |   ||    
T  6821 gttgttttagtaagcttgaatt-atatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttataatgatg 6723  T
Q  203 ttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6722 ataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14301 - 14005
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    ||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14301 agttatagaatgcattgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgaacttggagattagaatctaagttgtttatcttgctgtt 14202  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagagattg 202  Q
    ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||   |   ||    
T  14201 gttgttttagtaagcttgaatt-atatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttataatgatg 14103  T
Q  203 ttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14102 ataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 62503 - 62216
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    ||||| ||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  62503 gttactgaatgccttgtttatgttaa-tgcgatccttgtcgcccgattcgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 62405  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgtt 204  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  62404 ttgtttcagtaagcctgaattgttatgaactaatgatgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgaga---tgtt 62308  T
Q  205 gatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    | | ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  62307 gttgtgcattcgatattattataccatgatgtttttcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 132959 - 132670
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgt 105  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  132959 ttacataatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgt 132860  T
Q  106 tgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgttg 205  Q
    |||| ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| | ||      ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| ||    
T  132859 tgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaaatggattatgttgataattgagacgttgatg 132767  T
Q  206 atttgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  132766 a-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatga 132670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 136838 - 136691
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  |    
T  136838 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 136740  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136739 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 136691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 139307 - 139160
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  |    
T  139307 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 139209  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139208 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 139160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 144245 - 144098
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  |    
T  144245 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 144147  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144146 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 144098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 134369 - 134222
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  |    
T  134369 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 134271  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  134270 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgat 134222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 141776 - 141629
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  |    
T  141776 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 141678  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  141677 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 141629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1391 - 1096
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1391 agttacagaatgccttgtt-aggttaaatgcgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttttttatcttgttgtt 1293  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattg 202  Q
    |||||| ||||||| ||||| || |||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| |  |||    
T  1292 gttgttccagtaagactgatgta-tatgatttgatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattccatgaattatgtttgatgtttgaaatgttg 1194  T
Q  203 ttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1193 atgacctgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 300
Target Start/End: Original strand, 846 - 1141
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  846 agttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcgcaagttgatgttagttgatcttggaagttagaaactaagttatttatcttgttgtt 945  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattg 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||   |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||  |||    
T  946 gttgtttcagtaagcctgaattgtaa--atctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttg 1043  T
Q  203 ttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1044 atgacttgcattcgatgttgttatatcatgatgatctgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 438 - 141
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    |||||||||||| |||  ||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  438 agttacagaatgtcttgcttatgttaaatgcgatctttgtcgtacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactgagttgtt-atcttgctgtt 340  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattg 202  Q
    ||||||  ||| || |||||  | |||||  | ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||    
T  339 gttgttctagtgagactgataca-tatgaattgatgttgtttataatattatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttg 241  T
Q  203 ttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  240 ttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatga 141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 22509 - 22776
Alignment:
Q  28 taaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| |||||  |     
T  22509 taaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttgtcttgatgttgctgttccagtaagactgatgca- 22607  T
Q  128 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttat 226  Q
    |||    | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22608 tat----tgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 22703  T
Q  227 atcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22704 atcatgatgatttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 82230 - 82083
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  82230 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-t 82132  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  82131 gtgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgat 82083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Original strand, 80146 - 80205
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttga 65  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||    
T  80146 ttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatcttcgtcgcacgagttgttatgagttga 80205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13248 - 12954
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13248 agttacagaatgccttgtt-aggttaaatgtgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcatggagattagaaactaagttatttatcttgctgtt 13150  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattg 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||   || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||  ||  |||    
T  13149 gttgtttcagtaagcctgaattgg-ataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttg 13051  T
Q  203 ttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13050 atgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 12954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Original strand, 18066 - 18277
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18066 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctg 18165  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    | || ||||| | | |||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  18166 aatt-atatgttttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatat 18264  T
Q  221 tgttatatcatga 233  Q
    ||| |||||||||    
T  18265 tgtcatatcatga 18277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 7888 - 8180
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |    
T  7888 agttacaaaatgccttgtt-agggtaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgc---t 7983  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattg 202  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||  ||| ||  |||    
T  7984 gttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttaatgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgat-gttgtgatgttg 8081  T
Q  203 ttgatttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8082 ttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggtttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 267
Target Start/End: Original strand, 29093 - 29354
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  29093 gttacagaatgcctt-tttaggttgaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgtta 29191  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgtta---atggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagagat 200  Q
     |||| ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |  ||   ||| |||||||||||||||||| || |||| ||| | |||||| |||||   |    
T  29192 atgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataattatgttatataattgtatatacagtacatgacttaagtttgataattgag---t 29287  T
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttat 267  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29288 tgctgatttacattcgatattattatatcatgatagtttgaatactacctatgttgctgtttgttat 29354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15966 - 15675
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  15966 gttacagaatgcctt-tttaggtggaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgtta 15868  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgt 203  Q
     || | ||||||| ||||||   |||||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||    
T  15867 atgatccagtaagactgattct-tatgaaataatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgt 15772  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15771 tgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgat 15675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11598 - 11308
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    ||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  11598 gttacagaatgccctttttaggttgaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttggtgtta 11499  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgt 203  Q
     ||||  |||||| |||||    |||||  |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||    
T  11498 atgttcaagtaagactgatgct-tatgaattaatgttgcttataatgttatataatagtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgt 11403  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11402 tgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 11308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2233 - 2013
Alignment:
Q  75 ttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattat 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||||    |||||  |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||     
T  2233 ttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagtctgatgct-tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattac 2135  T
Q  175 atgaattatgtt-gatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaact 273  Q
    |||| ||| ||| |||| |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2134 atgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaact 2038  T
Q  274 aagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2037 aagctgcatgagtcggtctaagttg 2013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28528 - 28426
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28528 ttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 28430  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  28429 atga 28426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4568
Alignment:
Q  258 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Original strand, 136196 - 136471
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136196 ttaggttaaatgtgacctttgtcgtacgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 136295  T
Q  122 atttaatatga-tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgata 219  Q
    | || |||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||   || ||  ||||||||||||||| ||||    
T  136296 aatt-atatgattttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtacgat-gatgtgatgttgttgatttgcatttgata 136393  T
Q  220 ttgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||  || ||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  136394 ttgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Original strand, 144904 - 145179
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144904 ttaggttaaatgtgacctttgtcgtacgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 145003  T
Q  122 atttaatatga-tctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgata 219  Q
    | || |||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||   || ||  ||||||||||||||| ||||    
T  145004 aatt-atatgattttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtacgat-gatgtgatgttgttgatttgcatttgata 145101  T
Q  220 ttgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||  || ||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  145102 ttgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 242 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 174838 - 174785
Alignment:
Q  242 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174838 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 244 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121778
Alignment:
Q  244 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 121778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12860 - 12587
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  12860 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagtggatgtgagttgatcttagaggtaataaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtcta 12761  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttga--tatttgagagattgttgatttgcattcgata 219  Q
    || |  ||| || | ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |  |  |||||||||  ||| ||| ||||||| ||||    
T  12760 atgt-gtattatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacatta-ctgaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgata 12663  T
Q  220 ttgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12662 ttgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 295
Target Start/End: Original strand, 53393 - 53651
Alignment:
Q  38 ctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaa 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||| |  |||||| | |    
T  53393 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtt-tatgatttga 53491  T
Q  138 tgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatg 235  Q
    |||||||  |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  53492 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg 53591  T
Q  236 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  53592 ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 65
Target Start/End: Original strand, 8107 - 8167
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttga 65  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  8107 gttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatatgggttga 8167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Original strand, 6111 - 6386
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6111 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctg 6210  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    | || ||||||| | |||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  6211 aatt-atatgatttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatat 6309  T
Q  221 tgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||| |||||||||  || |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6310 tgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 295
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13840
Alignment:
Q  248 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 103467 - 103737
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  103467 ttaggttaaatgtgacctttgtcgtacgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttctttatcttcctgttgttgtttcagtaagcctg 103566  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatatt 221  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||      ||  |||||| |||||||| ||||||    
T  103567 aatt-atatgatttaatgttgttgttaatgttatgtagttgtatatacattacatgaattatgt--at------gatgttgttgttttgcatttgatatt 103657  T
Q  222 gttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||  || |||  ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  103658 gttatatcatgaattgttttttatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaagttga 103737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 34413 - 34139
Alignment:
Q  21 tttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcct 120  Q
    |||||| | |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||||| ||    
T  34413 tttaggttgaatgcgatctttgttgttctagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaattttccagtaagact 34314  T
Q  121 gatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagagattgttgatttgcattcgata 219  Q
    |||    |||||  |||||||| |  ||||| |||||||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||| |||||   |||||||||| |||||||||    
T  34313 gatgct-tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatatattacttgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgata 34218  T
Q  220 ttgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    || |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34217 ttattatatcatgatgggttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttg 34139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 285
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatga 285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 295
Target Start/End: Original strand, 128809 - 129072
Alignment:
Q  32 tgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatg 131  Q
    ||||||||||||||||| || || | |||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  128809 tgcgatctttgtcgcacgagatgttatgagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgattt-agatg 128906  T
Q  132 atctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatca 230  Q
    || | ||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  128907 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 129006  T
Q  231 tga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||  || |||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  129007 tgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 78614 - 78345
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||| | | ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  78614 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagcaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 78515  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat-gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    | || ||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||    |||  ||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  78514 aatt-atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgat-gttgagatgttgttgatttgcatt-gatat 78418  T
Q  221 tgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 291  Q
    |||||||||||||  || |||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  78417 tgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 78345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 116551 - 116441
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||  |||| ||||| || |||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  116551 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 116454  T
Q  288 ggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||    
T  116453 ggtctaagttgat 116441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 97297 - 97024
Alignment:
Q  23 taggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  97297 taggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctga 97199  T
Q  123 tttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatatt 221  Q
    | | | ||||| | ||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  97198 tat-agatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 97100  T
Q  222 gttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  97099 gttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 106575 - 106302
Alignment:
Q  23 taggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  106575 taggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctga 106477  T
Q  123 tttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatatt 221  Q
    | | | ||||| | ||||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  106476 tat-agatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 106378  T
Q  222 gttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  106377 gttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 293
Target Start/End: Original strand, 7888 - 8161
Alignment:
Q  23 taggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||    
T  7888 taggttaaatgcgatctttgtcgcaagaattgatgtgagttgatcttagaggtatgaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtgagactga 7987  T
Q  123 tttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tg-atatttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    | | ||||||| | ||||||||  |||||  |||||||| |||||||||||  |||||||| | || || ||| |||  ||||||| || |||| |||||    
T  7988 tgt-atatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatat 8086  T
Q  221 tgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8087 tattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 32390 - 32110
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32390 gttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcactagttgat----------cttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttg 32301  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagagattgtt 204  Q
    ||||| ||||||| |||||  | |||||  | ||||||||  ||||| | ||||      ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| |    
T  32300 ttgttccagtaagactgatgca-tatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatggattatgttgataattgagacgttgat 32208  T
Q  205 gatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32207 gatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatga 32110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 38604 - 38339
Alignment:
Q  28 taaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaa 127  Q
    |||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  38604 taaatgagacctttatcgcacgagttgatgtgagttgatcacgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-a 38506  T
Q  128 tatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttat 226  Q
    |||||| | ||||||   ||||||  |||||  ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||  ||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  38505 tatgatttgatgttgagattaatgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcat 38406  T
Q  227 atcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 291  Q
    |||||||  || |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38405 atcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 54
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  298 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcatatcttactgttgttgtttcagtaagccta 199  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    | |||| ||||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||  || |||||||||||  |||||    
T  198 aattaa-atgatttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgcatctgatat 100  T
Q  221 tgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgt 264  Q
    |||||||||||||  || |||   ||||||||||||||||||||||    
T  99 tgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgt 54  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 147 - 295
Target Start/End: Original strand, 1025 - 1171
Alignment:
Q  147 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 245  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1025 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 1121  T
Q  246 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1122 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 28623 - 28741
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  28623 gttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtca 28722  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgat 123  Q
    ||||| ||||||| |||||    
T  28723 ttgttccagtaagactgat 28741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 230 - 302
Target Start/End: Original strand, 28806 - 28879
Alignment:
Q  230 atgatgatttgcatactgcctatgttgctgtt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28806 atgatgatttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 28879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Original strand, 15643 - 15761
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtt 103  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15643 agttacagaatgccttgtttatgttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggagattagaaactaagttgtttatcttgctgtt 15742  T
Q  104 gttgtttcagtaagcctga 122  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15743 gttgtttcagtaagcctga 15761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 208 - 300
Target Start/End: Original strand, 15792 - 15884
Alignment:
Q  208 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15792 ttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178912
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 178912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Original strand, 19713 - 19987
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  19713 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgggttgatatgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcatg 19812  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    | ||| |||||| | ||||| ||  |||||  |||||| ||||||| ||||| |||| |||| | ||||  | ||||  ||||||| ||||||| |||||    
T  19813 aatta-tatgatttgatgttattaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgagttatttatgatgct-gagatgttgttgaattgcatttgatat 19910  T
Q  221 tgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||  || |||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19911 tgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 40017 - 39925
Alignment:
Q  209 tgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40017 tgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatga 39925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 208 - 299
Target Start/End: Original strand, 23898 - 23989
Alignment:
Q  208 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23898 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 23989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 841 - 569
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 121  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  841 ttaggttaaatgagacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatat-ggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgttgtttcagtaagcctg 743  T
Q  122 atttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatat 220  Q
    | || ||||||| | || || |   ||||   |||| | ||||||| ||||| ||||||||| | ||||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||    
T  742 aatt-atatgatttgatcttttaaataatatgatattaatgtatatgcattacatgaattatatatgat-gttgggatgttgttgatttgcatt-gatat 646  T
Q  221 tgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||  || |||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  645 tgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 245
Target Start/End: Original strand, 2258 - 2494
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 104  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||     
T  2258 gttacagaatgcctt-tttaggttgaatgcgatctttgccgttcgagtttatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttttttaccttgctatta 2356  T
Q  105 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagagattgt 203  Q
     |||| ||||||| |||| |   |||||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| |||||   |||     
T  2357 atgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattaaatgacttaagtttgataattgag---ttgc 2452  T
Q  204 tgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 245  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2453 tgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 2494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Original strand, 38697 - 38809
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  38697 atatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagta 38796  T
Q  288 ggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||    
T  38797 ggtctaagttgat 38809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 188 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1051
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||  ||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 1059  T
Q  288 ggtctaag 295  Q
    ||||||||    
T  1058 ggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 295
Target Start/End: Original strand, 1642 - 1900
Alignment:
Q  38 ctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaa 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||  |||||| || |||||||| |||||||||||| || ||||||| | |    
T  1642 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttgagggtaagaaactaagttgcctatcttactattgttgttccagtaagcctgaatt-atatgatttga 1740  T
Q  138 tgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga--t 234  Q
     ||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| || |||||| | ||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  1741 cgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacataaattatatatgat-gttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact 1839  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
      |||  ||||| ||||||||  |||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  1840 attttatatactacctatgttaatgttagtttaataactaagctgcatgagtcggtctaag 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 154 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25268 - 25121
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcct 250  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  || |||  |||||||||    
T  25268 atatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcatgagctgttttatatactgcct 25170  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25169 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 727 - 619
Alignment:
Q  125 taatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgt 223  Q
    ||||||||| | ||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||  || ||||||||| || ||||||||    
T  727 taatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgcttt-gatattgt 629  T
Q  224 tatatcatga 233  Q
    ||||||||||    
T  628 tatatcatga 619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 25398 - 25353
Alignment:
Q  22 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatc 67  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25398 ttaggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgttgtgagttgatc 25353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 267916 - 267679
Alignment:
Q  59 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatata 158  Q
    ||||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||  | | |||||| | ||| ||||  |||||  |||||    
T  267916 gagttgatcataagggtaagaaactaagttgcttagcttactgctgttgtttcagtaagcctggatga-tatgatttgatggtgttaataatgtgatata 267818  T
Q  159 attgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgtt 255  Q
    | ||||||| ||||| ||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||||| ||||||    
T  267817 aatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt-gagatattgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcatatgtt 267719  T
Q  256 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    | ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  267718 gatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 5)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 200 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13242 - 13147
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13242 ttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Original strand, 16098 - 16206
Alignment:
Q  191 tttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 290  Q
    |||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16098 tttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 16197  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||||||||    
T  16198 ctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 243 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2680
Alignment:
Q  243 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 65
Target Start/End: Original strand, 15911 - 15971
Alignment:
Q  4 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttga 65  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15911 agttacagaatgccttgtttaggattt-tgcgatctttgtcgcacaagttgttatgagttga 15971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 13441 - 13381
Alignment:
Q  2 ctagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagtt 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  13441 ctagttacagaatgccttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagtt 13381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 302
Target Start/End: Original strand, 3146 - 3259
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3146 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 3244  T
Q  288 ggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||    
T  3245 ggtctaagttgatga 3259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 97
Target Start/End: Original strand, 2115 - 2207
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatctt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2115 gttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagtggatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttatctt 2207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 299
Target Start/End: Original strand, 27747 - 27855
Alignment:
Q  191 tttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 290  Q
    |||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27747 tttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 27846  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||||||||    
T  27847 ctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 39602 - 39489
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39602 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 39504  T
Q  288 ggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||    
T  39503 ggtctaagttgatga 39489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 302
Target Start/End: Original strand, 75210 - 75323
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  75210 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 75308  T
Q  288 ggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||    
T  75309 ggtctaagttgatga 75323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 296
Target Start/End: Original strand, 17951 - 18130
Alignment:
Q  119 ctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcg 216  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||||||||||  ||||| | |||| ||||    
T  17951 ctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcg 18050  T
Q  217 atattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18051 atattattatatcatgatgttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 2241 - 2280
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2241 ttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgat 2280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9382 - 9133
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgt 105  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  || | ||||||||     
T  9382 ttacagaatgccttgct-aggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgttgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttga 9284  T
Q  106 tgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgat-atttgagagattgtt 204  Q
    |||| |||| || || |||   ||  ||| |||| ||||| | ||| || | || |||||| |||||  |||| |||||||||| || ||| || ||| |    
T  9283 tgttccagtgagtctaattgttta--atccaatgatgttgatgatgttaaacaaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatatga-ag-ttgat 9188  T
Q  205 gatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 259  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9187 gaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 9133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 11643 - 11482
Alignment:
Q  137 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||  ||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  11643 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 11544  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11543 gttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagt 11482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Original strand, 38198 - 38359
Alignment:
Q  137 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-atttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| ||||||||  ||||| | || | | ||||||| ||||||||||||    
T  38198 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 38297  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  38298 gttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagt 38359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Original strand, 3193 - 3295
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| || |||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3193 ttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 3291  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  3292 atga 3295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26021 - 25908
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||  ||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  26021 atatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtc 25923  T
Q  288 ggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||    
T  25922 ggtctaagttgatga 25908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 39983 - 39870
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||  ||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||     
T  39983 atatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtt 39885  T
Q  288 ggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||    
T  39884 ggtctaagttgatga 39870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4963 - 4865
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4963 ttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttg 4865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Original strand, 26072 - 26174
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26072 ttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 26170  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  26171 atga 26174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Original strand, 44702 - 44814
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 286  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44702 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 44800  T
Q  287 cggtctaagttgat 300  Q
    | ||||||||||||    
T  44801 cagtctaagttgat 44814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Original strand, 17222 - 17326
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt---gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17222 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17320  T
Q  297 tgatga 302  Q
    ||||||    
T  17321 tgatga 17326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 295
Target Start/End: Original strand, 79388 - 79430
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79388 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 38874 - 38773
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  38874 ttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttga 38776  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  38775 tga 38773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 208 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 33047 - 32954
Alignment:
Q  208 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33047 ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatga 32954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9807 - 9760
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9807 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 9760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Original strand, 32964 - 33065
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32964 ttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 33062  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  33063 tga 33065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 46041 - 45940
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46041 ttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 45943  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  45942 tga 45940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16189 - 16125
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16189 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 16125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17438
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatga 17438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 242 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 51654 - 51601
Alignment:
Q  242 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51654 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 244 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1359 - 1308
Alignment:
Q  244 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1359 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7338 - 7285
Alignment:
Q  242 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7338 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 7285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 300
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15345
Alignment:
Q  245 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgat 15345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 228 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13582 - 13513
Alignment:
Q  228 tcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13582 tcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 201 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 52026 - 51925
Alignment:
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52026 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 51928  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  51927 tga 51925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 298
Target Start/End: Original strand, 168023 - 168083
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  168023 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 168083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10883 - 10784
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10883 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 10786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16354 - 16301
Alignment:
Q  242 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16354 atactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13287 - 13223
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13287 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 13223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1927 - 1863
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1927 tttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 1863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Original strand, 207333 - 207392
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttga 65  Q
    ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  207333 ttacacaatgctttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 207392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 298
Target Start/End: Original strand, 10472 - 10528
Alignment:
Q  242 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10472 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttg 10528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 201 - 302
Target Start/End: Original strand, 8541 - 8638
Alignment:
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8541 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgctgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 8636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 295
Target Start/End: Original strand, 20383 - 20524
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 251  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||  |     
T  20383 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactga-tg 20481  T
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20482 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 128805 - 128765
Alignment:
Q  260 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  128805 tttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgat 128765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 299
Target Start/End: Original strand, 339972 - 340053
Alignment:
Q  216 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339972 gatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 340053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Original strand, 158454 - 158601
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  158454 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 158552  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158553 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 158601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 243 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 32137 - 32083
Alignment:
Q  243 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32137 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 32083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 199 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2791 - 2694
Alignment:
Q  199 attgttgatttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||    
T  2791 attgttgatt-gcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 237 - 296
Target Start/End: Original strand, 24348 - 24406
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4852 - 4705
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  4852 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-t 4754  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4753 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20905 - 20758
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  20905 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20807  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20806 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16942 - 16795
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  16942 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-t 16844  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16843 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37979 - 37832
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  37979 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 37881  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37880 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 37832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 298
Target Start/End: Original strand, 15487 - 15568
Alignment:
Q  216 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15487 gatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctctt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 15568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 298
Target Start/End: Original strand, 1093 - 1153
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1093 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4788 - 4728
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4788 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 4728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 3546 - 3482
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3546 tttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatga 3482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 419 - 361
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  419 tttgtatactgcctatgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Original strand, 6166 - 6233
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6166 tttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 6233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 295
Target Start/End: Original strand, 5183 - 5230
Alignment:
Q  248 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5183 cctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 5230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13547 - 13403
Alignment:
Q  157 taattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatg 253  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||    
T  13547 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 13449  T
Q  254 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13448 ttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 4633 - 4520
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 286  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  4633 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagt 4536  T
Q  287 cggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||||    
T  4535 cggtctaagttgatga 4520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12215 - 12102
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 286  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12215 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagt 12118  T
Q  287 cggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||||    
T  12117 cggtctaagttgatga 12102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22167 - 22054
Alignment:
Q  188 atatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 286  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22167 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagt 22070  T
Q  287 cggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||||    
T  22069 cggtctaagttgatga 22054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 47065 - 47014
Alignment:
Q  244 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47065 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 47014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14105 - 13958
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  14105 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 14007  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14006 gtgttgctgtt-gttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 302
Target Start/End: Original strand, 16608 - 16709
Alignment:
Q  201 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16608 tgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattga 16706  T
Q  300 tga 302  Q
    |||    
T  16707 tga 16709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4407 - 4308
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4407 ttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 4310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8555 - 8491
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8555 tttgtatactacctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 8491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 242 - 295
Target Start/End: Original strand, 1098 - 1151
Alignment:
Q  242 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1098 atactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9352 - 9253
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9352 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 9255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22996 - 22897
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22996 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgg-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 22899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21025 - 20928
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    ||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21025 ttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagt 20928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2066 - 1971
Alignment:
Q  200 ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| ||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2066 ttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 3243 - 3196
Alignment:
Q  1 actagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcac 48  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3243 actagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcac 3196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4942
Alignment:
Q  247 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatga 4942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 264 - 117
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||   |    
T  264 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-t 166  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  165 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgat 117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 40558 - 40411
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaatt--atgttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||  ||||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||  |    
T  40558 atataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgt-t 40460  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40459 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgat 40411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11446 - 11299
Alignment:
Q  154 atataattgtatatacattatatgaat--tatgttgatatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 250  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  11446 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 11348  T
Q  251 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11347 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgat 11299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 298
Target Start/End: Original strand, 11488 - 11548
Alignment:
Q  237 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11488 tttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttg 11548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29990 - 29946
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29990 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Original strand, 12353 - 12400
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12353 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgat 12400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 10218 - 10158
Alignment:
Q  5 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttga 65  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||    
T  10218 gttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgtacgagttgttatgagttga 10158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  252 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 335 - 288
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagtt 53  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  335 ttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagtt 288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23892 - 23853
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23892 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Original strand, 9648 - 9707
Alignment:
Q  6 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttga 65  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  9648 ttacagaatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 9707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36464
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 36464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1432
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1393 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4599 - 4545
Alignment:
Q  238 ttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4599 ttgcatactgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 297 - 157
Alignment:
Q  39 tttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaat 138  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||| | | |||  ||||  ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  297 tttgtcgcacgagttgttgtgagtcgatccttggggtaggaaatgaagttgtttatattactattgttgtt-cagtaagcctgatatag-atgatttgat 200  T
Q  139 gttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt 181  Q
    ||||||  |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  199 gttgttaataatgtgatataattgtatatgcattatgtgaatt 157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4262 - 4225
Alignment:
Q  263 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4262 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 4225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12108 - 12075
Alignment:
Q  267 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12108 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 298
Target Start/End: Original strand, 161206 - 161239
Alignment:
Q  265 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  161206 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 161239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 183
Target Start/End: Original strand, 675 - 749
Alignment:
Q  109 ttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat 183  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |  |||||  ||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  675 ttcagtaagcctgatataatgtgatctgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 293
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  243 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 225585 - 225465
Alignment:
Q  137 atgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tga-tatttgagagattgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat 234  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| | |||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||||||| | |    
T  225585 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatt-gcatttgatattattatatcacgct 225487  T
Q  235 gatttgcatactgcctatgttg 256  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  225486 gttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University