View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15637_high_12 (Length: 372)

Name: NF15637_high_12
Description: NF15637
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15637_high_12
NF15637_high_12
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (23-275)||(25175563-25175815)
chr6 (23-275)||(27653983-27654235)
chr6 (23-275)||(16825752-16826006)
chr6 (34-362)||(23153458-23153787)
chr6 (27-360)||(14626045-14626377)
chr6 (27-366)||(1650016-1650352)
chr6 (34-287)||(1657748-1657999)
chr6 (23-287)||(35009439-35009702)
chr6 (34-287)||(15862484-15862734)
chr6 (292-362)||(23148266-23148336)
chr6 (91-287)||(29665941-29666137)
chr6 (202-287)||(27751603-27751688)
chr6 (329-364)||(23995247-23995282)
chr6 (329-362)||(18002394-18002427)
chr6 (329-362)||(26090059-26090092)
chr6 (187-271)||(29605612-29605696)
chr6 (329-360)||(4991396-4991427)
chr6 (331-362)||(15742119-15742150)
chr6 (329-364)||(27751742-27751777)
chr6 (329-364)||(32276656-32276691)
chr6 (329-363)||(1657659-1657693)
chr6 (329-363)||(15862789-15862823)
chr6 (329-362)||(18823282-18823315)
chr6 (329-362)||(18839137-18839170)
chr6 (329-361)||(19983192-19983224)
chr6 (329-361)||(35015057-35015089)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (23-275)||(25426628-25426880)
chr5 (23-275)||(12374-12626)
chr5 (23-275)||(22366481-22366733)
chr5 (23-250)||(18778017-18778244)
chr5 (23-275)||(19499899-19500151)
chr5 (23-275)||(21073595-21073847)
chr5 (23-364)||(23506965-23507305)
chr5 (23-250)||(43443420-43443647)
chr5 (23-362)||(27182470-27182810)
chr5 (23-250)||(4200010-4200237)
chr5 (23-250)||(27009841-27010068)
chr5 (23-364)||(22053750-22054096)
chr5 (23-364)||(18530985-18531330)
chr5 (34-287)||(34939289-34939540)
chr5 (75-275)||(29188284-29188483)
chr5 (140-287)||(20623085-20623232)
chr5 (140-287)||(21233528-21233675)
chr5 (141-285)||(25900408-25900552)
chr5 (140-287)||(16536313-16536460)
chr5 (140-287)||(37052860-37053007)
chr5 (329-366)||(20623286-20623323)
chr5 (329-366)||(21233437-21233474)
chr5 (329-366)||(25900315-25900352)
chr5 (329-366)||(37053061-37053098)
chr5 (329-363)||(16105967-16106001)
chr5 (329-366)||(16536514-16536551)
chr5 (27-67)||(29190482-29190522)
chr5 (329-364)||(108725-108760)
chr5 (329-362)||(9730277-9730310)
chr5 (23-64)||(17471803-17471844)
chr5 (329-366)||(21651018-21651055)
chr5 (187-271)||(29918127-29918212)
chr5 (191-280)||(32950862-32950951)
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (23-275)||(19886661-19886913)
chr2 (28-364)||(462743-463078)
chr2 (23-364)||(8891242-8891584)
chr2 (23-364)||(36982361-36982704)
chr2 (23-361)||(20627238-20627576)
chr2 (23-361)||(19794629-19794967)
chr2 (23-287)||(17396653-17396916)
chr2 (23-361)||(43642881-43643220)
chr2 (23-364)||(24341306-24341652)
chr2 (23-237)||(7507894-7508107)
chr2 (23-287)||(25265390-25265653)
chr2 (265-364)||(22863169-22863270)
chr2 (140-287)||(19689401-19689548)
chr2 (140-287)||(23820187-23820334)
chr2 (140-287)||(14906440-14906587)
chr2 (140-287)||(20015127-20015274)
chr2 (329-366)||(9652791-9652828)
chr2 (329-366)||(14906349-14906386)
chr2 (329-366)||(23820388-23820425)
chr2 (329-366)||(17396562-17396599)
chr2 (329-366)||(19689310-19689347)
chr2 (329-366)||(20015328-20015365)
chr2 (329-361)||(22284278-22284310)
chr2 (329-360)||(25213372-25213403)
chr2 (189-270)||(68156-68238)
chr2 (329-362)||(7507756-7507789)
chr2 (329-366)||(12641554-12641591)
chr2 (329-362)||(28031133-28031166)
chr2 (295-362)||(31146072-31146138)
chr2 (329-362)||(33128372-33128405)
chr2 (329-361)||(22275045-22275077)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (25-364)||(3505-3843)
scaffold0266 (23-364)||(1124-1465)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (23-275)||(47357654-47357906)
chr4 (23-364)||(13246430-13246772)
chr4 (23-361)||(54118168-54118507)
chr4 (23-250)||(10644219-10644446)
chr4 (123-364)||(121989-122229)
chr4 (31-287)||(13048221-13048477)
chr4 (23-364)||(15675006-15675352)
chr4 (91-364)||(10104167-10104445)
chr4 (23-287)||(26680201-26680463)
chr4 (23-260)||(31115629-31115865)
chr4 (224-364)||(33240900-33241046)
chr4 (140-287)||(10488678-10488825)
chr4 (140-287)||(16327926-16328073)
chr4 (23-119)||(111395-111491)
chr4 (255-364)||(31132545-31132660)
chr4 (189-271)||(40885570-40885652)
chr4 (329-366)||(16609008-16609045)
chr4 (329-366)||(26680517-26680554)
chr4 (329-364)||(15135904-15135939)
chr4 (329-364)||(15272208-15272243)
chr4 (329-363)||(14952085-14952119)
chr4 (329-366)||(16327835-16327872)
chr4 (23-67)||(10104450-10104494)
chr4 (330-369)||(22738577-22738616)
chr4 (189-270)||(15044992-15045074)
chr4 (330-364)||(55376491-55376525)
chr4 (329-362)||(8045272-8045305)
chr4 (329-362)||(16523146-16523179)
chr4 (331-368)||(18248527-18248564)
chr4 (329-369)||(8378493-8378533)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (23-363)||(14842485-14842824)
chr3 (23-275)||(55316219-55316471)
chr3 (23-364)||(2049810-2050150)
chr3 (23-364)||(12030070-12030410)
chr3 (23-275)||(41270075-41270327)
chr3 (34-366)||(13838905-13839237)
chr3 (23-250)||(16821139-16821366)
chr3 (23-287)||(13975722-13975985)
chr3 (23-324)||(15858986-15859287)
chr3 (23-287)||(45860805-45861068)
chr3 (22-297)||(51158008-51158282)
chr3 (23-287)||(13954890-13955153)
chr3 (23-280)||(15936634-15936890)
chr3 (23-361)||(16744041-16744377)
chr3 (26-280)||(15938476-15938729)
chr3 (27-366)||(15614838-15615174)
chr3 (23-287)||(17912483-17912744)
chr3 (241-364)||(19260746-19260869)
chr3 (224-361)||(19231981-19232121)
chr3 (140-287)||(2449238-2449385)
chr3 (329-366)||(2449147-2449184)
chr3 (329-366)||(23492696-23492733)
chr3 (329-366)||(38168237-38168274)
chr3 (187-271)||(4145814-4145898)
chr3 (329-364)||(16261777-16261812)
chr3 (329-364)||(17912395-17912430)
chr3 (329-364)||(53771365-53771400)
chr3 (191-368)||(54651625-54651803)
chr3 (329-366)||(13954799-13954836)
chr3 (23-64)||(15468555-15468596)
chr3 (329-362)||(16933868-16933901)
chr3 (329-366)||(30153265-30153302)
chr3 (329-366)||(33342204-33342241)
chr3 (329-366)||(45861122-45861159)
chr3 (23-136)||(47984650-47984763)
chr3 (23-136)||(47993937-47994050)
chr3 (23-136)||(48003224-48003337)
chr3 (23-136)||(48012510-48012623)
chr3 (329-361)||(17955884-17955916)
chr3 (329-364)||(11986077-11986112)
chr3 (329-364)||(14285289-14285324)
chr3 (326-361)||(15857163-15857198)
chr3 (329-364)||(51961028-51961063)
chr3 (191-280)||(11986173-11986262)
chr3 (230-271)||(14080715-14080756)
chr3 (329-362)||(19947026-19947059)
chr3 (23-64)||(22275209-22275250)
chr3 (329-361)||(2844514-2844546)
chr3 (329-361)||(3992873-3992905)
chr3 (329-361)||(54038024-54038056)
chr3 (329-361)||(55513193-55513225)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (23-364)||(5987-6326)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (23-364)||(20931345-20931685)
chr1 (23-361)||(41394222-41394559)
chr1 (23-364)||(20913037-20913370)
chr1 (23-250)||(18601143-18601370)
chr1 (23-275)||(5072388-5072640)
chr1 (23-362)||(20893550-20893889)
chr1 (23-364)||(37844371-37844714)
chr1 (23-364)||(20445679-20446022)
chr1 (23-364)||(20531444-20531786)
chr1 (23-237)||(22227809-22228022)
chr1 (23-237)||(22232506-22232719)
chr1 (27-250)||(2116258-2116481)
chr1 (89-366)||(45051489-45051763)
chr1 (140-287)||(51452608-51452755)
chr1 (329-366)||(51452809-51452846)
chr1 (329-360)||(15861327-15861358)
chr1 (329-361)||(21860334-21860366)
chr1 (329-361)||(44034871-44034903)
chr1 (27-67)||(45051446-45051486)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (23-363)||(880-1218)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (23-362)||(48598-48936)
scaffold0023 (23-250)||(36093-36320)
scaffold0023 (329-362)||(61121-61154)
[»] chr8 (32 HSPs)
chr8 (22-364)||(16193640-16193980)
chr8 (23-275)||(30120722-30120974)
chr8 (23-364)||(43373389-43373731)
chr8 (23-213)||(222753-222943)
chr8 (23-213)||(736376-736566)
chr8 (23-213)||(860271-860461)
chr8 (23-275)||(16674392-16674644)
chr8 (34-364)||(24928713-24929043)
chr8 (23-250)||(21844597-21844824)
chr8 (23-250)||(21851990-21852217)
chr8 (23-361)||(16404900-16405235)
chr8 (27-275)||(6774258-6774505)
chr8 (27-275)||(24548986-24549233)
chr8 (23-287)||(22907214-22907476)
chr8 (34-287)||(17345581-17345832)
chr8 (140-287)||(5238203-5238350)
chr8 (140-287)||(24661248-24661395)
chr8 (140-287)||(43685662-43685809)
chr8 (151-213)||(691908-691970)
chr8 (329-366)||(5238404-5238441)
chr8 (329-366)||(22907123-22907160)
chr8 (329-366)||(24385647-24385684)
chr8 (329-366)||(24661157-24661194)
chr8 (329-366)||(43685863-43685900)
chr8 (329-361)||(24716762-24716794)
chr8 (329-362)||(2545265-2545298)
chr8 (329-362)||(3431175-3431208)
chr8 (329-362)||(22886654-22886687)
chr8 (329-361)||(274766-274798)
chr8 (329-361)||(641051-641083)
chr8 (329-361)||(826857-826889)
chr8 (230-270)||(38533855-38533895)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (23-275)||(10989410-10989661)
chr7 (23-250)||(2437457-2437684)
chr7 (25-366)||(16211768-16212108)
chr7 (23-360)||(3059966-3060302)
chr7 (23-364)||(13036935-13037277)
chr7 (23-364)||(36052667-36053006)
chr7 (23-250)||(13911049-13911277)
chr7 (28-364)||(11580658-11580997)
chr7 (23-250)||(13572676-13572903)
chr7 (23-280)||(18253842-18254098)
chr7 (29-287)||(25292338-25292595)
chr7 (23-287)||(47481031-47481294)
chr7 (23-250)||(16478987-16479213)
chr7 (23-287)||(7293017-7293279)
chr7 (23-286)||(13321014-13321278)
chr7 (140-287)||(11516343-11516490)
chr7 (140-287)||(15441564-15441711)
chr7 (140-287)||(30262129-30262276)
chr7 (166-359)||(295893-296087)
chr7 (329-366)||(7293333-7293370)
chr7 (329-366)||(11516544-11516581)
chr7 (329-366)||(14113898-14113935)
chr7 (329-366)||(15441473-15441510)
chr7 (329-366)||(30262038-30262075)
chr7 (255-364)||(36024372-36024488)
chr7 (329-364)||(2029244-2029279)
chr7 (292-364)||(15709428-15709504)
chr7 (329-364)||(42056185-42056220)
chr7 (330-366)||(25292247-25292283)
chr7 (329-364)||(3049905-3049940)
chr7 (330-369)||(10000279-10000318)
chr7 (329-364)||(13321334-13321369)
chr7 (329-364)||(25124450-25124485)
chr7 (329-364)||(47480941-47480976)
chr7 (189-270)||(13377693-13377775)
chr7 (329-362)||(371417-371450)
chr7 (329-366)||(14423549-14423585)
chr7 (329-361)||(126738-126770)
chr7 (329-357)||(15516765-15516793)
chr7 (329-361)||(32493946-32493978)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (23-364)||(8878-9218)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (23-364)||(12115-12453)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (34-364)||(171916-172245)
scaffold0001 (34-364)||(177619-177948)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (23-366)||(26335-26678)
scaffold0162 (140-287)||(8180-8327)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (23-250)||(42997-43224)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (23-351)||(4996-5324)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (27-364)||(41733-42069)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (34-364)||(247363-247694)
scaffold0012 (329-366)||(34070-34107)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (23-364)||(128092-128431)
scaffold0008 (23-250)||(31700-31928)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (23-361)||(36837-37176)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (23-358)||(19206-19543)
scaffold0195 (23-287)||(21290-21553)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (29-364)||(272031-272365)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (23-362)||(123086-123427)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (47-280)||(5552-5785)
scaffold0772 (329-366)||(5846-5883)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (23-250)||(35-262)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (23-219)||(64584-64780)
scaffold0026 (23-280)||(107747-108003)
scaffold0026 (230-272)||(89863-89905)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (23-280)||(48187-48443)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (141-364)||(51105-51328)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (23-250)||(21141-21367)
scaffold0139 (23-250)||(14086-14312)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (23-313)||(148721-149012)
scaffold0025 (23-364)||(8849-9195)
scaffold0025 (266-364)||(146843-146941)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (141-364)||(89375-89600)
scaffold0028 (236-364)||(107705-107835)
scaffold0028 (329-360)||(130880-130911)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (23-237)||(5254-5466)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (23-237)||(3722-3936)
[»] scaffold0215 (4 HSPs)
scaffold0215 (27-250)||(9374-9596)
scaffold0215 (27-250)||(16272-16494)
scaffold0215 (329-369)||(9257-9297)
scaffold0215 (329-369)||(16155-16195)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (129-275)||(1304-1450)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (23-287)||(534-797)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (23-287)||(34460-34724)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (23-287)||(37066-37328)
scaffold0078 (329-366)||(36975-37012)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (23-287)||(41648-41911)
scaffold0125 (321-362)||(41957-41998)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (23-129)||(9-115)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (27-276)||(2966-3215)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (154-287)||(13636-13769)
scaffold0132 (329-364)||(13824-13859)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (23-129)||(48514-48620)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (121-250)||(13350-13478)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (140-287)||(26911-27058)
scaffold0141 (140-280)||(22656-22796)
scaffold0141 (329-366)||(22857-22894)
scaffold0141 (329-366)||(27112-27149)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (140-287)||(1582-1729)
scaffold0124 (329-366)||(1491-1528)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (23-119)||(9382-9478)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (194-287)||(3360-3453)
scaffold0361 (25-79)||(3210-3264)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (329-366)||(873-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (329-366)||(9877-9914)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (329-366)||(108070-108107)
scaffold0032 (329-364)||(55904-55939)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (329-364)||(6440-6475)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (329-364)||(13282-13317)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (124-280)||(56106-56262)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (329-364)||(57389-57424)
scaffold0058 (230-271)||(70307-70348)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (318-364)||(18015-18061)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (329-366)||(193392-193429)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (329-365)||(17300-17336)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (329-361)||(80187-80219)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (330-369)||(12036-12075)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (189-271)||(8174-8257)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (329-364)||(34305-34340)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (329-364)||(45338-45373)
scaffold0066 (191-237)||(45198-45244)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (329-364)||(12415-12450)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (191-368)||(10249-10427)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (329-363)||(17207-17241)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (189-270)||(2317-2399)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (330-364)||(339-373)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (330-364)||(25532-25566)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (329-362)||(5475-5508)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (329-362)||(4345-4378)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (329-362)||(5549-5582)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Original strand, 25175563 - 25175815
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25175563 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25175662  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175663 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25175762  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||    
T  25175763 acatcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagca 25175815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27654235 - 27653983
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  27654235 catcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaat 27654136  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654135 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 27654036  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 275  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  27654035 acatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagca 27653983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16826006 - 16825752
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16826006 catcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 16825907  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatta--tacaac 220  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16825906 taacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaac 16825807  T
Q  221 taacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  16825806 taacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 16825752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 34 - 362
Target Start/End: Original strand, 23153458 - 23153787
Alignment:
Q  34 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 133  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || || ||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  23153458 catgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 23153557  T
Q  134 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 233  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  23153558 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 23153656  T
Q  234 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 331  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23153657 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 23153756  T
Q  332 attatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23153757 attatgatgaagactaacccccttaccttag 23153787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14626377 - 14626045
Alignment:
Q  27 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||  |||||    
T  14626377 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaac 14626278  T
Q  127 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 226  Q
    |||||||||| | || ||||||  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  14626277 aacaacttagcataa-ttcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 14626179  T
Q  227 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatga 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  ||| |||    
T  14626178 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaattcaaacaacatttgagaatttgtaaagtga 14626079  T
Q  327 tgatgattatgataaagactaacccccttacctt 360  Q
     ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  14626078 agatgattgtgataataactaacccccttacctt 14626045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1650352 - 1650016
Alignment:
Q  27 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  1650352 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 1650253  T
Q  127 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 226  Q
     | ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  1650252 cataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 1650154  T
Q  227 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatg 325  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||  ||| |||||| |||||  |||  | ||| || | |  ||||||||||||  |||||  | ||||||     
T  1650153 caattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatt 1650056  T
Q  326 atgatgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1650055 a-catgattatgataaagactaacccccttaccttaaatga 1650016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1657999 - 1657748
Alignment:
Q  34 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 133  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  1657999 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactca-attcacaataact 1657901  T
Q  134 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 233  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  1657900 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 1657802  T
Q  234 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1657801 tgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 1657748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35009702 - 35009439
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  |  |    
T  35009702 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 35009603  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  35009602 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 35009504  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  35009503 tcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 35009439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Original strand, 15862484 - 15862734
Alignment:
Q  34 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 133  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| || ||   ||||||| | | |||||||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  15862484 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataacataaat-gaacaagaatcataactca-attcacaataact 15862581  T
Q  134 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 233  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  15862582 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 15862680  T
Q  234 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  15862681 tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccat 15862734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 292 - 362
Target Start/End: Original strand, 23148266 - 23148336
Alignment:
Q  292 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23148266 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 23148336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 287
Target Start/End: Original strand, 29665941 - 29666137
Alignment:
Q  91 aacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat 189  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||  | ||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||| | |    
T  29665941 aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagtacaat-ttcataacttgacatttatgcatacttt 29666038  T
Q  190 gaa-catgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||  || |||||| || || | ||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  29666039 gaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccat 29666137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 287
Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751688
Alignment:
Q  202 tcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||| ||||||||||| ||| | ||||||    
T  27751603 tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccat 27751688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Original strand, 23995247 - 23995282
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995247 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 23995282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18002427 - 18002394
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002427 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 18002394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 362
Target Start/End: Original strand, 26090059 - 26090092
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090059 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 26090092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 271
Target Start/End: Original strand, 29605612 - 29605696
Alignment:
Q  187 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||  ||||||||||| |||||||| || |||| || ||| ||||||||    
T  29605612 tatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaattcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt 29605696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 360
Target Start/End: Original strand, 4991396 - 4991427
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttacctt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991396 atgattatgataaagactaacccccttacctt 4991427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 331 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15742150 - 15742119
Alignment:
Q  331 gattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742150 gattatgataaagactaacccccttaccttag 15742119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Original strand, 27751742 - 27751777
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27751742 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagat 27751777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 32276691 - 32276656
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32276691 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagat 32276656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 1657693 - 1657659
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 363  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1657693 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 1657659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 363
Target Start/End: Original strand, 15862789 - 15862823
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 363  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15862789 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 15862823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18823315 - 18823282
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18823315 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 18823282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18839170 - 18839137
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18839170 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 18839137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19983224 - 19983192
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19983224 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 19983192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 35015089 - 35015057
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35015089 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 35015057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Original strand, 25426628 - 25426880
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25426628 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25426727  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426728 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25426827  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  25426828 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 25426880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Original strand, 12374 - 12626
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12374 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 12473  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12474 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 12573  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  12574 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 12626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22366733 - 22366481
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22366733 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactcaaat 22366634  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366633 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 22366534  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  22366533 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 22366481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18778244 - 18778017
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18778244 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 18778145  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778144 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 18778045  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataaca 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778044 acatcaattcatgcatacaaacataaca 18778017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Original strand, 19499899 - 19500151
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19499899 catcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19499998  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19499999 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19500098  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  19500099 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19500151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21073847 - 21073595
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21073847 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 21073748  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073747 taacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 21073648  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 275  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  21073647 acatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 21073595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Original strand, 23506965 - 23507305
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  23506965 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 23507064  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23507065 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 23507163  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 322  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23507164 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaatcttacaaa 23507263  T
Q  323 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507264 atggagatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 23507305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 43443647 - 43443420
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  43443647 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagactcacatctcaaat 43443548  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43443547 caacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 43443448  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataaca 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443447 acatcaattcatgcatacaaacataaca 43443420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27182810 - 27182470
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  27182810 catcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 27182711  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  27182710 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaatta 27182612  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 320  Q
     ||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27182611 tcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 27182512  T
Q  321 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27182511 aaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 27182470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4200237 - 4200010
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  4200237 catcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 4200138  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4200137 caacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 4200038  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataaca 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4200037 acatcaattcatgcatacaaacataaca 4200010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 27009841 - 27010068
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  27009841 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 27009940  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||  |    
T  27009941 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatca 27010040  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataaca 250  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  27010041 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 27010068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22054096 - 22053750
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |    
T  22054096 catcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 22053997  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22053996 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 22053898  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 320  Q
     ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  22053897 tcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaatttca 22053798  T
Q  321 aa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22053797 aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttagat 22053750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18531330 - 18530985
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |    
T  18531330 catcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 18531231  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18531230 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18531132  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcc-ataatcaaa-attcatacaacatttgaaaatttaca 320  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||| || || ||| |||||||| ||||||||||| || ||    
T  18531131 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaacattcataccacatttgaaaaattgca 18531032  T
Q  321 aaatgatgat---gattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18531031 aaatgatgatgacgattatgatgaagactaacccccttaccttagat 18530985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Original strand, 34939289 - 34939540
Alignment:
Q  34 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 133  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||||  |||    
T  34939289 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactca-attcacaatgact 34939387  T
Q  134 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 233  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  34939388 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 34939486  T
Q  234 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  34939487 tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacagttatccat 34939540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29188483 - 29188284
Alignment:
Q  75 atcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttat 174  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||    
T  29188483 atcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttat 29188385  T
Q  175 catttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagc 274  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| |||||| ||||    
T  29188384 catttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagc 29188285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Original strand, 20623085 - 20623232
Alignment:
Q  140 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 239  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  20623085 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 20623184  T
Q  240 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20623185 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20623232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21233675 - 21233528
Alignment:
Q  140 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 239  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  21233675 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 21233576  T
Q  240 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21233575 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21233528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 25900552 - 25900408
Alignment:
Q  141 aattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 240  Q
    |||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   ||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  25900552 aattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 25900453  T
Q  241 aaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcc 285  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25900452 aaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcc 25900408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Original strand, 16536313 - 16536460
Alignment:
Q  140 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 239  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  || ||||||||||||    
T  16536313 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcata 16536412  T
Q  240 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16536413 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16536460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Original strand, 37052860 - 37053007
Alignment:
Q  140 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 239  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||   |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  37052860 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 37052959  T
Q  240 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37052960 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37053007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Original strand, 20623286 - 20623323
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623286 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 20623323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21233474 - 21233437
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233474 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 21233437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 25900352 - 25900315
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900352 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 25900315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Original strand, 37053061 - 37053098
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37053061 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 37053098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 363
Target Start/End: Original strand, 16105967 - 16106001
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105967 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 16106001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Original strand, 16536514 - 16536551
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16536514 atgattatgataaagactaacccccttatcttagatga 16536551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 29190522 - 29190482
Alignment:
Q  27 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 67  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29190522 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaa 29190482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 108760 - 108725
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  108760 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagat 108725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9730310 - 9730277
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9730310 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 9730277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 17471844 - 17471803
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 64  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17471844 catcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcat 17471803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Original strand, 21651018 - 21651055
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21651018 atgattatgataaatattaacccccttaccttagatga 21651055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 271
Target Start/End: Original strand, 29918127 - 29918212
Alignment:
Q  187 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt 271  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| || |||||| |||||| || |||||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  29918127 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtattcaaacatatcatcataattggagcacgaattt 29918212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 280
Target Start/End: Original strand, 32950862 - 32950951
Alignment:
Q  191 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 280  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||| |||| || || || |||||| || |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  32950862 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 32950951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19886913 - 19886661
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19886913 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19886814  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886813 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19886714  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  19886713 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19886661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 28 - 364
Target Start/End: Original strand, 462743 - 463078
Alignment:
Q  28 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaaca 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||   |||||    
T  462743 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 462842  T
Q  128 acaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 227  Q
    ||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||    
T  462843 acaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatc 462941  T
Q  228 aattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgat 327  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  462942 aattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgat 463041  T
Q  328 gatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  463042 gatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 463078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Original strand, 8891242 - 8891584
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  8891242 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 8891341  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  8891342 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaatta 8891440  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8891441 tcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 8891540  T
Q  321 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8891541 aaatgatgatgattatgataaagactaacccctttaccttagat 8891584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 36982704 - 36982361
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |    
T  36982704 catcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 36982605  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||    
T  36982604 caacaacaacttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaatta 36982506  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac- 319  Q
     |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||     
T  36982505 tcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 36982406  T
Q  320 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36982405 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 36982361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 23 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20627576 - 20627238
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || | ||| |||||  ||||| |||| |||||||||||| | | |||| ||    
T  20627576 catcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaat 20627477  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20627476 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20627378  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaa-tttacaa 321  Q
     ||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20627377 tcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccataatcataattcatacaatatttgaaaattttacaa 20627278  T
Q  322 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20627277 aatgatgatgattatgataaagactaaccccgttacctta 20627238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19794967 - 19794629
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |    
T  19794967 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 19794868  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19794867 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 19794769  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 320  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| | ||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19794768 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttg-aaatttaca 19794670  T
Q  321 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19794669 aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 19794629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17396916 - 17396653
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  17396916 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 17396817  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  17396816 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 17396717  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17396716 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17396653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 43643220 - 43642881
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||| ||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  43643220 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaat 43643121  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||| ||||||| || | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43643120 taataacaactaagaa-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43643022  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 320  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | |||||| || |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43643021 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaacaattatccactatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca 43642922  T
Q  321 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43642921 aaatgatgatgattatgataaagactaacctccttccctta 43642881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 24341652 - 24341306
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |    
T  24341652 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 24341553  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  24341552 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaatta 24341454  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 320  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  24341453 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgca 24341354  T
Q  321 aa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24341353 aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttagat 24341306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7508107 - 7507894
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaca 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | |||| |    
T  7508107 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctca-a 7508009  T
Q  122 ttaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 221  Q
    |||||||||||||||   |||||||||  || | |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  7508008 ttaacaacaacttagcc-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 7507910  T
Q  222 aacatcaattcatgca 237  Q
    | ||||||||||||||    
T  7507909 atcatcaattcatgca 7507894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25265653 - 25265390
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  |  |    
T  25265653 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 25265554  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25265553 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 25265455  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25265454 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 25265390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 265 - 364
Target Start/End: Original strand, 22863169 - 22863270
Alignment:
Q  265 cgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22863169 cgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttag 22863268  T
Q  363 at 364  Q
    ||    
T  22863269 at 22863270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19689548 - 19689401
Alignment:
Q  140 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 239  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  19689548 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 19689449  T
Q  240 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19689448 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 19689401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Original strand, 23820187 - 23820334
Alignment:
Q  140 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 239  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  23820187 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 23820286  T
Q  240 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23820287 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 23820334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14906587 - 14906440
Alignment:
Q  140 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 239  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  14906587 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 14906488  T
Q  240 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14906487 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14906440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Original strand, 20015127 - 20015274
Alignment:
Q  140 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 239  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| | |||| ||  ||||||||||||||     
T  20015127 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatg 20015226  T
Q  240 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20015227 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20015274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 9652828 - 9652791
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652828 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 9652791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14906386 - 14906349
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906386 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 14906349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Original strand, 23820388 - 23820425
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820388 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 23820425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 17396599 - 17396562
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17396599 atgattatggtaaagactaacccccttaccttagatga 17396562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19689347 - 19689310
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19689347 atgattatgataaagactaacccccttaccttaaatga 19689310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Original strand, 20015328 - 20015365
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20015328 atgatcatgataaagactaacccccttaccttagatga 20015365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 361
Target Start/End: Original strand, 22284278 - 22284310
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284278 atgattatgataaagactaacccccttacctta 22284310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 360
Target Start/End: Original strand, 25213372 - 25213403
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttacctt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213372 atgattatgataaagactaacccccttacctt 25213403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 270
Target Start/End: Original strand, 68156 - 68238
Alignment:
Q  189 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatt 270  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  68156 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 68238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7507789 - 7507756
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7507789 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 7507756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12641591 - 12641554
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12641591 atgattatgataataactaacccccttaccttagatga 12641554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28031166 - 28031133
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28031166 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 28031133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31146138 - 31146072
Alignment:
Q  295 attcatacaaca-tttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  31146138 attcatacaacaatttgaaaatttacacaa--aagatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 31146072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 362
Target Start/End: Original strand, 33128372 - 33128405
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33128372 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 33128405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 361
Target Start/End: Original strand, 22275045 - 22275077
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22275045 atgattatgataaaggctaacccccttacctta 22275077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 25 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3505
Alignment:
Q  25 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacatta 124  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||    
T  3843 tcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 3744  T
Q  125 acaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 224  Q
    |||||||||||| | ||||| |||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  3743 acaacaacttagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 3645  T
Q  225 atcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat 324  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3644 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatctataatcaaaattcatacaacttttgaaaatttacaaaat 3545  T
Q  325 gatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3544 gaagatgattatgacaaagactaacccccttaccttagat 3505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1465
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  1124 catcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 1223  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1224 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 1322  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaa 321  Q
      |||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1323 ttatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaa 1422  T
Q  322 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1423 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 1465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Original strand, 47357654 - 47357906
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47357654 catcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 47357753  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357754 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 47357853  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 275  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  47357854 acatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 47357906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Original strand, 13246430 - 13246772
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  13246430 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 13246529  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13246530 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 13246628  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttaca 320  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||| ||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246629 tcattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 13246728  T
Q  321 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246729 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 13246772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 54118507 - 54118168
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |||| |       
T  54118507 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatc 54118408  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||| || | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  54118407 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 54118309  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 320  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54118308 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca 54118209  T
Q  321 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54118208 aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 54118168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 10644219 - 10644446
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  10644219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 10644318  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  10644319 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 10644418  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataaca 250  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  10644419 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 10644446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 123 - 364
Target Start/End: Original strand, 121989 - 122229
Alignment:
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  121989 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 122087  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 322  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  122088 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 122187  T
Q  323 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  122188 atgatgatgattatgataaagactaatccccttaccttagat 122229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13048477 - 13048221
Alignment:
Q  31 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaaca 130  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||    
T  13048477 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaaca 13048378  T
Q  131 acttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 230  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||     
T  13048377 acttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaa 13048278  T
Q  231 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    ||||||||||||||||| ||    |||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  13048277 tcatgcatacaaacatatcattgaagttggagcatgaatttagcaacaattatccat 13048221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15675352 - 15675006
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |    
T  15675352 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 15675253  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15675252 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15675154  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 320  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  15675153 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgca 15675054  T
Q  321 aa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15675053 aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttagat 15675006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 91 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10104445 - 10104167
Alignment:
Q  91 aacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatg 190  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||  | ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||    
T  10104445 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg 10104347  T
Q  191 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--ta 288  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||  ||    
T  10104346 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatccaatta 10104247  T
Q  289 atcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
       ||||||||||| ||||||||||| ||  |||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10104246 tgaaaaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttagat 10104167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 26680201 - 26680463
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||  |    
T  26680201 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 26680300  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  26680301 caactacaacat--gtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 26680398  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26680399 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 26680463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Original strand, 31115629 - 31115865
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |    
T  31115629 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 31115728  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||||||||||||||| |||||||||  || |||| ||| |||| |||||  ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  31115729 caacaacaacttagga-aaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 31115827  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttgg 260  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  31115828 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 31115865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 224 - 364
Target Start/End: Original strand, 33240900 - 33241046
Alignment:
Q  224 catcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  33240900 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaa 33240999  T
Q  322 a----atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    |    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33241000 aaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttagat 33241046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Original strand, 10488678 - 10488825
Alignment:
Q  140 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 239  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  10488678 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 10488777  T
Q  240 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10488778 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 10488825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16328073 - 16327926
Alignment:
Q  140 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 239  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  16328073 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 16327974  T
Q  240 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16327973 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16327926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 119
Target Start/End: Original strand, 111395 - 111491
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactca 119  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  111395 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactca 111491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 255 - 364
Target Start/End: Original strand, 31132545 - 31132660
Alignment:
Q  255 agttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaa 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  31132545 agttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgataattatgatgaagactaa 31132644  T
Q  349 cccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||    
T  31132645 cccccttaccttagat 31132660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 40885652 - 40885570
Alignment:
Q  189 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  40885652 tgaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattt 40885570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16609045 - 16609008
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16609045 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 16609008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Original strand, 26680517 - 26680554
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680517 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 26680554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15135939 - 15135904
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135939 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 15135904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15272243 - 15272208
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272243 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 15272208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 363
Target Start/End: Original strand, 14952085 - 14952119
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952085 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 14952119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16327872 - 16327835
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16327872 atgattatgataaagactaacccccttaccttatatga 16327835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 10104494 - 10104450
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 67  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10104494 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaa 10104450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 369
Target Start/End: Original strand, 22738577 - 22738616
Alignment:
Q  330 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgatgt 369  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22738577 tgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgt 22738616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 270
Target Start/End: Original strand, 15044992 - 15045074
Alignment:
Q  189 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatt 270  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  15044992 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 15045074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 55376525 - 55376491
Alignment:
Q  330 tgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55376525 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagat 55376491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 362
Target Start/End: Original strand, 8045272 - 8045305
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8045272 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 8045305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 362
Target Start/End: Original strand, 16523146 - 16523179
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16523146 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 16523179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 368
Target Start/End: Original strand, 18248527 - 18248564
Alignment:
Q  331 gattatgataaagactaacccccttaccttagatgatg 368  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18248527 gattatgataataactaacccccttaccttagatgatg 18248564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 369
Target Start/End: Original strand, 8378493 - 8378533
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgatgt 369  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8378493 atgattatgataataactaatccccttaccttagatgatgt 8378533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 14842824 - 14842485
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  14842824 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 14842725  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  14842724 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaatta 14842626  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 322  Q
     | |||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14842625 tcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgcaaa 14842526  T
Q  323 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 363  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14842525 gtgaagatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 14842485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Original strand, 55316219 - 55316471
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |    
T  55316219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 55316318  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55316319 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 55316418  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  55316419 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 55316471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Original strand, 2049810 - 2050150
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||| | |||| ||    
T  2049810 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaat 2049909  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  2049910 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 2050008  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 322  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  2050009 tcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattgatacaacatttgaaatttcacaaa 2050108  T
Q  323 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2050109 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 2050150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 12030410 - 12030070
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |  ||| ||    
T  12030410 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaat 12030311  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||  || |||||||  |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  12030310 taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 12030212  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 322  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  12030211 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaagtcatacaacatttgaaatttcacaaa 12030112  T
Q  323 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12030111 atgatgatgattatgataatgattaacccccttaccttagat 12030070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Original strand, 41270075 - 41270327
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |    
T  41270075 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 41270174  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41270175 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaacta 41270274  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  41270275 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 41270327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 34 - 366
Target Start/End: Original strand, 13838905 - 13839237
Alignment:
Q  34 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 133  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||    ||| ||||||    
T  13838905 catgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 13839004  T
Q  134 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 233  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  13839005 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 13839103  T
Q  234 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatga 332  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13839104 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattattcataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatga 13839203  T
Q  333 ttatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13839204 ttatgatgaagactaacccccttaccttagatga 13839237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 16821139 - 16821366
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  16821139 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 16821238  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16821239 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16821338  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataaca 250  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16821339 tcatcaatttatgcatacaaacataaca 16821366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13975985 - 13975722
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  13975985 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13975886  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  13975885 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 13975786  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13975785 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13975722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15859287 - 15858986
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||  |    
T  15859287 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 15859188  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15859187 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15859089  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 320  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15859088 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattg-aaatttaca 15858990  T
Q  321 aaat 324  Q
    ||||    
T  15858989 aaat 15858986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 45860805 - 45861068
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  45860805 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 45860904  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  45860905 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 45861004  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  45861005 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 45861068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 51158282 - 51158008
Alignment:
Q  22 acatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaca 121  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||      
T  51158282 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 51158183  T
Q  122 ttaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 221  Q
     |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  51158182 ctaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 51158084  T
Q  222 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaatt 297  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  51158083 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaatt 51158008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13955153 - 13954890
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  13955153 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13955054  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  13955053 taatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 13954954  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13954953 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13954890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15936890 - 15936634
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  15936890 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 15936791  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15936790 taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15936692  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 280  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  15936691 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 15936634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16744377 - 16744041
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||  | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||  |    
T  16744377 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 16744278  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||| | ||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||| |||||  ||    
T  16744277 caactataacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacactta 16744180  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 322  Q
      ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744179 ttatcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttaacaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 16744080  T
Q  323 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  16744079 atgatgatgattatggtaaagactaacctcgttacctta 16744041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15938729 - 15938476
Alignment:
Q  26 catcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||    
T  15938729 catcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaa 15938630  T
Q  126 caacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 225  Q
    ||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  15938629 caacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 15938531  T
Q  226 tcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 280  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||  | |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  15938530 tcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaat 15938476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 366
Target Start/End: Original strand, 15614838 - 15615174
Alignment:
Q  27 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | || ||||||    
T  15614838 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 15614937  T
Q  127 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 226  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||    
T  15614938 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcat 15615036  T
Q  227 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatg 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||  ||| || ||| |||||  |||  | ||| || | |  ||||||||||||  |||||  | ||||||     
T  15615037 caattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatt 15615134  T
Q  326 atgatgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15615135 a-catgattatgataaagactaacccccttaccttaaatga 15615174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17912744 - 17912483
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||  ||||||| |||||| | ||||  |    
T  17912744 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaatt 17912645  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||| ||||| ||  |  |||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17912644 caactacaacatatca--aattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 17912547  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17912546 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca-agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17912483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 241 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19260869 - 19260746
Alignment:
Q  241 aaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 340  Q
    ||||||| || |||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19260869 aaacatatcatcataattagagcacgaatttagcaacaattatccataaaaaaaattcatacaacatttgaaaacttacaaaatgatgatgattatgata 19260770  T
Q  341 aagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  19260769 aagactaacccccttaccttagat 19260746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 224 - 361
Target Start/End: Original strand, 19231981 - 19232121
Alignment:
Q  224 catcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattt-aca 320  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19231981 catcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcaca 19232080  T
Q  321 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19232081 aaatgatgatgattaagataaagactaacccccttacctta 19232121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2449385 - 2449238
Alignment:
Q  140 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 239  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  2449385 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 2449286  T
Q  240 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  2449285 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 2449238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2449184 - 2449147
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449184 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 2449147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Original strand, 23492696 - 23492733
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492696 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 23492733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Original strand, 38168237 - 38168274
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168237 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 38168274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4145898 - 4145814
Alignment:
Q  187 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt 271  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||| || || ||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  4145898 tatgaacatgtaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaattcatgtattcaaacatatcaccataattggagtacgaattt 4145814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Original strand, 16261777 - 16261812
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261777 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 16261812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 17912430 - 17912395
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17912430 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 17912395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Original strand, 53771365 - 53771400
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771365 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 53771400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 368
Target Start/End: Original strand, 54651625 - 54651803
Alignment:
Q  191 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat-aa 289  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || || ||   ||| ||||||||||||||||| || ||| ||    
T  54651625 aacatgcaatttcactcacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaa 54651724  T
Q  290 tcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgatg 368  Q
     | |  ||||||||||||  |||| |  | ||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54651725 cccattttcatacaacatgagaaattgcaaaaattgaacatgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatg 54651803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13954836 - 13954799
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13954836 atgattatggtaaagactaacccccttaccttagatga 13954799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 15468596 - 15468555
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 64  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15468596 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcat 15468555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16933901 - 16933868
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933901 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 16933868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Original strand, 30153265 - 30153302
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30153265 atgattatgataaaaactaacccccttaccttagatga 30153302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Original strand, 33342204 - 33342241
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33342204 atgattatgataaagactaaccctcttaccttagatga 33342241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Original strand, 45861122 - 45861159
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45861122 atgattatggtaaagactaacccccttaccttagatga 45861159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 136
Target Start/End: Original strand, 47984650 - 47984763
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| ||||       
T  47984650 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47984749  T
Q  123 taacaacaacttag 136  Q
     |||||||||||||    
T  47984750 caacaacaacttag 47984763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 136
Target Start/End: Original strand, 47993937 - 47994050
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| ||||       
T  47993937 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47994036  T
Q  123 taacaacaacttag 136  Q
     |||||||||||||    
T  47994037 caacaacaacttag 47994050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 136
Target Start/End: Original strand, 48003224 - 48003337
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| ||||       
T  48003224 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48003323  T
Q  123 taacaacaacttag 136  Q
     |||||||||||||    
T  48003324 caacaacaacttag 48003337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 136
Target Start/End: Original strand, 48012510 - 48012623
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| ||||       
T  48012510 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48012609  T
Q  123 taacaacaacttag 136  Q
     |||||||||||||    
T  48012610 caacaacaacttag 48012623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17955916 - 17955884
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955916 atgattatgataaagactaacccccttacctta 17955884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11986112 - 11986077
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11986112 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagat 11986077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Original strand, 14285289 - 14285324
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14285289 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagat 14285324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 326 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15857198 - 15857163
Alignment:
Q  326 atgatgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15857198 atgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 15857163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 51961063 - 51961028
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51961063 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagat 51961028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11986262 - 11986173
Alignment:
Q  191 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 280  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || ||| || ||||||| || || |||||| || |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  11986262 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 11986173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 271
Target Start/End: Original strand, 14080715 - 14080756
Alignment:
Q  230 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt 271  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  14080715 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 14080756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 362
Target Start/End: Original strand, 19947026 - 19947059
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19947026 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 19947059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 64
Target Start/End: Original strand, 22275209 - 22275250
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 64  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22275209 catcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcat 22275250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 361
Target Start/End: Original strand, 2844514 - 2844546
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2844514 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 2844546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 361
Target Start/End: Original strand, 3992873 - 3992905
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3992873 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 3992905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 54038056 - 54038024
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54038056 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 54038024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 361
Target Start/End: Original strand, 55513193 - 55513225
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55513193 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 55513225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 6326 - 5987
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  6326 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctca-at 6228  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| || | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6227 taacaacaacttagca-aaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 6129  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 322  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6128 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgcaaa 6029  T
Q  323 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6028 gtgaaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 5987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Original strand, 20931345 - 20931685
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  20931345 catcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 20931444  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  20931445 taacaacaatttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 20931543  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 322  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20931544 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaacttcatacaacaattgaaaatttgcaaa 20931643  T
Q  323 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20931644 atgaggatgattatgataaaggctaacccccttaccttagat 20931685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 23 - 361
Target Start/End: Original strand, 41394222 - 41394559
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | ||||       
T  41394222 catcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaca 41394321  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  41394322 taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaatta 41394420  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 322  Q
     |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394421 tcatcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 41394520  T
Q  323 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394521 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 41394559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Original strand, 20913037 - 20913370
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |       |    
T  20913037 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaa-------t 20913129  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  20913130 taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 20913228  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 322  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20913229 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccgtaagcaaaattcatacaacaattgaaaatttgcaaa 20913328  T
Q  323 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20913329 atgaggatgattacgataaagactaacccccttaccttagat 20913370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18601370 - 18601143
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |    
T  18601370 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 18601271  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18601270 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 18601171  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataaca 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601170 acatcaattcatgcatacaaacataaca 18601143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5072640 - 5072388
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |    
T  5072640 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 5072541  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5072540 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 5072441  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 275  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  5072440 acatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 5072388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20893889 - 20893550
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||       
T  20893889 catcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatc 20893790  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  20893789 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaatta 20893691  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 320  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20893690 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaa-ttaca 20893592  T
Q  321 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20893591 aaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 20893550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 37844714 - 37844371
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  37844714 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 37844615  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttca-taacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 221  Q
    |||||||||||||| | |||||||    || |||||||| |||| ||  ||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  37844614 taacaacaacttagca-aaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 37844516  T
Q  222 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttac 319  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37844515 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcac 37844416  T
Q  320 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37844415 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 37844371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Original strand, 20445679 - 20446022
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||  |    
T  20445679 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20445778  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20445779 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20445877  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattt-ac 319  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20445878 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcac 20445977  T
Q  320 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20445978 aaaatgatgatgattatgataaagactaactcccttaccttagat 20446022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Original strand, 20531444 - 20531786
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||  |    
T  20531444 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20531543  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20531544 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20531642  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||  | || | |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20531643 tcatcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca 20531742  T
Q  321 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  20531743 aaatgatgatgattatgataaagactaatttccttaccttagat 20531786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 237
Target Start/End: Original strand, 22227809 - 22228022
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  22227809 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22227908  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  22227909 taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 22228007  T
Q  223 acatcaattcatgca 237  Q
     ||||||||||||||    
T  22228008 tcatcaattcatgca 22228022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 237
Target Start/End: Original strand, 22232506 - 22232719
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  22232506 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22232605  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  22232606 taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 22232704  T
Q  223 acatcaattcatgca 237  Q
     ||||||||||||||    
T  22232705 tcatcaattcatgca 22232719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 2116258 - 2116481
Alignment:
Q  27 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaac-tcacattaa 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||  ||| |||||    
T  2116258 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaa 2116357  T
Q  126 caacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 225  Q
    ||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  2116358 caataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 2116456  T
Q  226 tcaattcatgcatacaaacataaca 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2116457 tcaattcatgcatacaaacataaca 2116481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 89 - 366
Target Start/End: Original strand, 45051489 - 45051763
Alignment:
Q  89 ataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatata 188  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||| | ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| |||||     
T  45051489 ataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatt 45051587  T
Q  189 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat- 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| || |||  ||  |||||| |||||  |||  | |||     
T  45051588 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagaacacgaatctagcatgaattgttcatc 45051687  T
Q  288 aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    || | |  ||||||||||||  |||||  | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45051688 aacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatca-catgattatgataaagactaacccccttaccttaaatga 45051763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Original strand, 51452608 - 51452755
Alignment:
Q  140 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 239  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  51452608 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 51452707  T
Q  240 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  51452708 caaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagcaacaattatccat 51452755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Original strand, 51452809 - 51452846
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51452809 atgattaagataaagactaacccccttaccttagatga 51452846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15861358 - 15861327
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttacctt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861358 atgattatgataaagactaacccccttacctt 15861327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 361
Target Start/End: Original strand, 21860334 - 21860366
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21860334 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 21860366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 44034903 - 44034871
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44034903 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 44034871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 67
Target Start/End: Original strand, 45051446 - 45051486
Alignment:
Q  27 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 67  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  45051446 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaa 45051486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 880
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||| | | |||| ||    
T  1218 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctca-at 1120  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  || |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1119 taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 1021  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 322  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||    
T  1020 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgtaaa 921  T
Q  323 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 363  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  920 gtgaagatgattatgataaagactaacccccttaccttaga 880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 23 - 362
Target Start/End: Original strand, 48598 - 48936
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  48598 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 48697  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    || ||||||||||| | |||||||||   | |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  48698 tagcaacaacttagca-aaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 48796  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 322  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48797 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 48896  T
Q  323 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48897 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttag 48936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 36093 - 36320
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||| ||    
T  36093 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctcaaat 36192  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36193 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 36292  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataaca 250  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  36293 acatcaattcatacatacaaacataaca 36320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 61154 - 61121
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  61154 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 61121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 32)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16193980 - 16193640
Alignment:
Q  22 acatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaca 121  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||| |    
T  16193980 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaa 16193881  T
Q  122 ttaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 221  Q
    |||||||||| || | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  16193880 ttaacaacaatttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaatt 16193782  T
Q  222 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 321  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  16193781 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataagcaaaattcatacaatatttgaaaatttacca 16193682  T
Q  322 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16193681 aatgatgatgattatgataaagactaa-ccccttaccttagat 16193640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Original strand, 30120722 - 30120974
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  30120722 catcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 30120821  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30120822 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 30120921  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 275  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  30120922 acataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 30120974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 43373731 - 43373389
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  43373731 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 43373632  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  43373631 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataatta 43373533  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 320  Q
     ||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  43373532 tcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaatttcaca 43373433  T
Q  321 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43373432 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 43373389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 222943 - 222753
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  222943 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 222844  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222843 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 222753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 736566 - 736376
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  736566 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 736467  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736466 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 736376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 860461 - 860271
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  860461 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 860362  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860361 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 860271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16674644 - 16674392
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |    
T  16674644 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 16674545  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16674544 taacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 16674445  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 275  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  16674444 acataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagca 16674392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 34 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 24929043 - 24928713
Alignment:
Q  34 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||| ||| ||||||||||  || ||||||    ||| ||||||    
T  24929043 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaact 24928944  T
Q  134 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 233  Q
    |||  ||||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  24928943 tagc-gaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 24928845  T
Q  234 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatga 332  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24928844 tgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgacgatga 24928745  T
Q  333 ttatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24928744 ttatgataaagactaaccccattaccttagat 24928713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21844824 - 21844597
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  21844824 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaat 21844725  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  21844724 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 21844625  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataaca 250  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  21844624 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 21844597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21852217 - 21851990
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  21852217 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctcaaat 21852118  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||  |    
T  21852117 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatca 21852018  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataaca 250  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  21852017 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 21851990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16405235 - 16404900
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |  |||  |    
T  16405235 catcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatt 16405136  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||   |||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16405135 taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16405040  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 320  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16405039 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccatcatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttac- 16404941  T
Q  321 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16404940 aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 16404900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6774505 - 6774258
Alignment:
Q  27 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  6774505 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 6774406  T
Q  127 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 226  Q
    || ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  6774405 aataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 6774307  T
Q  227 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||  ||| |||||| |||||    
T  6774306 caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 6774258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 275
Target Start/End: Original strand, 24548986 - 24549233
Alignment:
Q  27 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | || ||||||    
T  24548986 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 24549085  T
Q  127 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 226  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  24549086 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 24549184  T
Q  227 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||  ||| |||||| |||||    
T  24549185 caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 24549233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22907476 - 22907214
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||  |    
T  22907476 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 22907377  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  22907376 caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 22907279  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22907278 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 22907214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Original strand, 17345581 - 17345832
Alignment:
Q  34 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 133  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||| ||||  ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  17345581 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactca-attcacaataact 17345679  T
Q  134 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 233  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  17345680 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 17345778  T
Q  234 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    |||||| |||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  17345779 tgcatataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccat 17345832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Original strand, 5238203 - 5238350
Alignment:
Q  140 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 239  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  5238203 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 5238302  T
Q  240 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  5238303 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 5238350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24661395 - 24661248
Alignment:
Q  140 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 239  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  24661395 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 24661296  T
Q  240 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24661295 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 24661248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Original strand, 43685662 - 43685809
Alignment:
Q  140 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 239  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  43685662 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 43685761  T
Q  240 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  43685762 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 43685809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 151 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 691970 - 691908
Alignment:
Q  151 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691970 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 691908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Original strand, 5238404 - 5238441
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238404 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 5238441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22907160 - 22907123
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907160 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 22907123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24385684 - 24385647
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385684 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 24385647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24661194 - 24661157
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661194 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 24661157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Original strand, 43685863 - 43685900
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685863 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 43685900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24716794 - 24716762
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716794 atgattatgataaagactaacccccttacctta 24716762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 362
Target Start/End: Original strand, 2545265 - 2545298
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2545265 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 2545298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3431208 - 3431175
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3431208 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 3431175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 362
Target Start/End: Original strand, 22886654 - 22886687
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22886654 atgattatgattaagactaacccccttaccttag 22886687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 361
Target Start/End: Original strand, 274766 - 274798
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  274766 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 274798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 641083 - 641051
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  641083 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 641051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 826889 - 826857
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  826889 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 826857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 270
Target Start/End: Original strand, 38533855 - 38533895
Alignment:
Q  230 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatt 270  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  38533855 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagtacgaatt 38533895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Original strand, 10989410 - 10989661
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10989410 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 10989509  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    || |||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10989510 ta-caacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 10989608  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  10989609 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 10989661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 2437457 - 2437684
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  2437457 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatat 2437556  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2437557 taacaacaacttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 2437656  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataaca 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437657 acatcaattcatgcatacaaacataaca 2437684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 366
Target Start/End: Original strand, 16211768 - 16212108
Alignment:
Q  25 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacatta 124  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||| | |||| ||||    
T  16211768 tcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaatta 16211867  T
Q  125 acaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 224  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||| || |    
T  16211868 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatc 16211966  T
Q  225 atcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat 324  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16211967 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattgtccataagcaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaat 16212066  T
Q  325 gatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16212067 gatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 16212108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 23 - 360
Target Start/End: Original strand, 3059966 - 3060302
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  3059966 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 3060065  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| ||| |||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||    
T  3060066 taacaacaacttaaca-aaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaatta 3060164  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 322  Q
     |||||||| ||||||||||| |||  | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3060165 tcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatataacatttgaaaatttacaaa 3060264  T
Q  323 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3060265 atgatgatgattatgataaagacttacccccttacctt 3060302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13037277 - 13036935
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||       
T  13037277 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatc 13037178  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||    
T  13037177 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaatta 13037079  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 320  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13037078 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 13036979  T
Q  321 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13036978 aaatgatgatgattatggtgaagactaacccccttaccttagat 13036935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Original strand, 36052667 - 36053006
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  || ||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  36052667 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 36052766  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||   |||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||    
T  36052767 taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataatta 36052862  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 320  Q
     ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  36052863 tcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagtataaatttagcaacaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaatttcaca 36052962  T
Q  321 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36052963 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 36053006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13911277 - 13911049
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  13911277 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 13911178  T
Q  123 taacaacaactt-aggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 221  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  13911177 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 13911078  T
Q  222 aacatcaattcatgcatacaaacataaca 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911077 aacatcaattcatgcatacaaacataaca 13911049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11580997 - 11580658
Alignment:
Q  28 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaaca 127  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||   |||||    
T  11580997 tcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 11580898  T
Q  128 acaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 227  Q
    ||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  11580897 acaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 11580799  T
Q  228 aattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat---caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11580798 aattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccattatgcaaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaa 11580699  T
Q  324 tgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11580698 tgatgatgattatgataaagactaatccccttaccttagat 11580658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 13572676 - 13572903
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  13572676 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13572775  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||  |    
T  13572776 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatca 13572875  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataaca 250  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  13572876 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 13572903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18254098 - 18253842
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  18254098 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 18253999  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18253998 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18253900  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 280  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  18253899 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 18253842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25292595 - 25292338
Alignment:
Q  29 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaa 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  25292595 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacga 25292496  T
Q  129 caacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 228  Q
    |||| |||||| ||||||||  || |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||    
T  25292495 caacctaggag-aattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaaca 25292397  T
Q  229 attcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    |||||| |||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  25292396 attcatacatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaattatccat 25292338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 47481294 - 47481031
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |    
T  47481294 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 47481195  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  47481194 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 47481096  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  47481095 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 47481031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16479213 - 16478987
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||| ||    
T  16479213 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaat 16479114  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||| || ||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16479113 taaaaataacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16479015  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataaca 250  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  16479014 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 16478987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 7293017 - 7293279
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||  |    
T  7293017 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 7293116  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||||||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  7293117 caacaacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 7293214  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
      || |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7293215 ttattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 7293279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Original strand, 13321014 - 13321278
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |    
T  13321014 catcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 13321113  T
Q  123 taacaa-caacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaattatacaa 219  Q
     ||||| |||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||||||||  ||||| | |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13321114 caacaatcaacttagca-aaattcaccaattgagcacaat-ttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa 13321211  T
Q  220 ctaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca 286  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13321212 ttatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatcca 13321278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Original strand, 11516343 - 11516490
Alignment:
Q  140 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 239  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  11516343 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 11516442  T
Q  240 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11516443 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 11516490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15441711 - 15441564
Alignment:
Q  140 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 239  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  15441711 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 15441612  T
Q  240 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15441611 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 15441564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30262276 - 30262129
Alignment:
Q  140 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 239  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  30262276 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 30262177  T
Q  240 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30262176 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 30262129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 296087 - 295893
Alignment:
Q  166 ataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtac 265  Q
    ||||||| |||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||| |||  | || |||| ||||||||| |||||||||||| |  | || ||  ||    
T  296087 ataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaattagaacac 295988  T
Q  266 gaatttagcaacaatcatccataat-caaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacct 359  Q
    ||||||||||||||| || ||| || ||||| |||||||||  |||||||||  | ||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||    
T  295987 gaatttagcaacaattattcattatgcaaaatttcatacaaagtttgaaaatgca-aaaatgatgagaattatgttgaagacaaacccccttacct 295893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Original strand, 7293333 - 7293370
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293333 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 7293370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Original strand, 11516544 - 11516581
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516544 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 11516581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14113935 - 14113898
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113935 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 14113898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15441510 - 15441473
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441510 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 15441473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 30262075 - 30262038
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262075 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 30262038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 255 - 364
Target Start/End: Original strand, 36024372 - 36024488
Alignment:
Q  255 agttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaa----tgatgatgattatgataaagactaa 348  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||    |||||||||||||||| ||||||||    
T  36024372 agttggagcacgaatttagaaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaa 36024471  T
Q  349 -cccccttaccttagat 364  Q
     ||||||||||||||||    
T  36024472 ccccccttaccttagat 36024488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Original strand, 2029244 - 2029279
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029244 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 2029279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 364
Target Start/End: Original strand, 15709428 - 15709504
Alignment:
Q  292 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat----gatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  15709428 aaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaattgatgatgatgattatgatgaagactaatcctcttaccttagat 15709504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 42056220 - 42056185
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056220 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 42056185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 25292283 - 25292247
Alignment:
Q  330 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25292283 tgattatgataaagactaacccccttatcttagatga 25292247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Original strand, 3049905 - 3049940
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3049905 atgattatgataaaaactaacccccttaccttagat 3049940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 10000318 - 10000279
Alignment:
Q  330 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgatgt 369  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10000318 tgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgt 10000279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Original strand, 13321334 - 13321369
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13321334 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagat 13321369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Original strand, 25124450 - 25124485
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25124450 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagat 25124485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 47480976 - 47480941
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47480976 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagat 47480941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 270
Target Start/End: Original strand, 13377693 - 13377775
Alignment:
Q  189 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatt 270  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  13377693 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 13377775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 362
Target Start/End: Original strand, 371417 - 371450
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  371417 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 371450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14423585 - 14423549
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14423585 atgattatgataa-gactaacccccttaccttagatga 14423549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 361
Target Start/End: Original strand, 126738 - 126770
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  126738 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 126770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15516793 - 15516765
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttac 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516793 atgattatgataaagactaacccccttac 15516765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 32493978 - 32493946
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32493978 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 32493946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Original strand, 8878 - 9218
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  8878 catcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 8977  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  8978 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 9076  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 322  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  9077 tcatcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattttccataagcaaaattcgtacaacttttgaaaatttgcaaa 9176  T
Q  323 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9177 atgaagatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 9218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Original strand, 12115 - 12453
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  12115 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctca-at 12213  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    || ||||||||||  | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  12214 ta-caacaacttaaca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaatta 12311  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaa 321  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||    
T  12312 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaatttcatacagcatttg-aaagttacaa 12410  T
Q  322 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12411 aattaagatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 12453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 34 - 364
Target Start/End: Original strand, 171916 - 172245
Alignment:
Q  34 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||  | ||| ||||||    
T  171916 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 172015  T
Q  134 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 233  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  172016 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 172114  T
Q  234 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 333  Q
    | |||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172115 tccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 172214  T
Q  334 tatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172215 tatgataaagactaacccccttaccttagat 172245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 34 - 364
Target Start/End: Original strand, 177619 - 177948
Alignment:
Q  34 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||  | ||| ||||||    
T  177619 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 177718  T
Q  134 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 233  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  177719 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 177817  T
Q  234 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 333  Q
    | |||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177818 tccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 177917  T
Q  334 tatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177918 tatgataaagactaacccccttaccttagat 177948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 23 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 26678 - 26335
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  26678 catcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 26579  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||| ||    
T  26578 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaatta 26480  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaa 321  Q
     |||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26479 tcatcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatacattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 26380  T
Q  322 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26379 aatgatcatgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 26335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8327 - 8180
Alignment:
Q  140 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 239  Q
    |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  8327 aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcata 8228  T
Q  240 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  8227 caaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 42997 - 43224
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  42997 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaat 43096  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43097 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43196  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataaca 250  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43197 tcatcaattcatgcatagaaacataaca 43224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5324 - 4996
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  5324 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 5225  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||    
T  5224 taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaacaatcttacaatta 5126  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat-caaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 321  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5125 tcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaacaattatccattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 5026  T
Q  322 aatgatgatgattatgataaagactaaccc 351  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5025 aatgataatgattatgataaagactaaccc 4996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 364
Target Start/End: Original strand, 41733 - 42069
Alignment:
Q  27 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | || | ||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||    
T  41733 atcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaac 41832  T
Q  127 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 226  Q
    |||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||   |||| || |||    
T  41833 aacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcat 41931  T
Q  227 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatga 326  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41932 caattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatga 42031  T
Q  327 tgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42032 tgatgattatgataaagaccaacccccttaccttagat 42069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 34 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 247694 - 247363
Alignment:
Q  34 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  247694 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 247595  T
Q  134 taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 233  Q
    ||| | ||||| |||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||||  |||| |||||| || ||||||||||    
T  247594 tagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattca 247496  T
Q  234 tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 331  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247495 tgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 247396  T
Q  332 attatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247395 attatgataaagactaacccccttaccttagat 247363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 34107 - 34070
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34107 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagatga 34070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 128431 - 128092
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  128431 catcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctca-at 128333  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||| ||  | |||||| ||  || |||||||| |||| |||||| ||  ||| || || ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  128332 taacaacaacctaaca-aaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 128234  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 322  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  128233 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacttttgaaaatttgcaaa 128134  T
Q  323 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  128133 atgaagatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 128092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31928 - 31700
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||    
T  31928 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 31829  T
Q  123 taacaacaactt-aggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 221  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31828 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaact 31729  T
Q  222 aacatcaattcatgcatacaaacataaca 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31728 aacatcaattcatgcattcaaacataaca 31700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 37176 - 36837
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||       
T  37176 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatc 37077  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||| ||||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  37076 caaccacaacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaatta 36978  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 320  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  36977 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaatttcaca 36878  T
Q  321 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36877 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 36837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 358
Target Start/End: Original strand, 19206 - 19543
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |    
T  19206 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 19305  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  19306 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 19404  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac- 319  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19405 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 19504  T
Q  320 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacc 358  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19505 aaaattatgatgattatgatgaagactaacccccttacc 19543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 21290 - 21553
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |    
T  21290 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 21389  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  21390 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 21488  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21489 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 29 - 364
Target Start/End: Original strand, 272031 - 272365
Alignment:
Q  29 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaa 128  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   |||||| || |||||||||||||| ||||||    ||| |    
T  272031 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaacca 272130  T
Q  129 caacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 228  Q
    |||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||    
T  272131 caacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatca 272229  T
Q  229 attcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatg 328  Q
    |||||| |||||||||||| ||  | |||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  272230 attcattcatacaaacatatcattacagttggagtacgtatttagcaatatttatccataatcaaaatttatacaatatttgaaaatttacaaaatgatg 272329  T
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  272330 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 272365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 123427 - 123086
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| |       
T  123427 catcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatc 123328  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  123327 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 123229  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac- 319  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  123228 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgcaaatttaca 123129  T
Q  320 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  123128 aaaattatgatgattatggtgaagactaacccccttaccttag 123086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 47 - 280
Target Start/End: Original strand, 5552 - 5785
Alignment:
Q  47 acccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaacttaggagaaattca 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5552 acccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattca 5651  T
Q  147 cccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacat 246  Q
    ||  || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  5652 ccaattgagcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacat 5751  T
Q  247 aacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 280  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  5752 aacatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 5785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Original strand, 5846 - 5883
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5846 atgattatggtaaagactaacccccttaccttagatga 5883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 35 - 262
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  35 catcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 134  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  135 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 234  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataaca 250  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  235 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 64780 - 64584
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  64780 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 64681  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  64680 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa 64584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 280
Target Start/End: Original strand, 107747 - 108003
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  107747 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 107846  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  107847 taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 107945  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 280  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  107946 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 108003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 89905 - 89863
Alignment:
Q  230 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattta 272  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  89905 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 89863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 280
Target Start/End: Original strand, 48187 - 48443
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  48187 catcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 48286  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  48287 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 48385  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 280  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  48386 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaat 48443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 141 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 51328 - 51105
Alignment:
Q  141 aattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 240  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  51328 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatac 51229  T
Q  241 aaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 340  Q
    ||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51228 aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 51129  T
Q  341 aagactaacccccttaccttagat 364  Q
    |||||||| | |||||||| ||||    
T  51128 aagactaatctccttacctaagat 51105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21367 - 21141
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||| ||    
T  21367 catcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaat 21268  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  21267 taacaacaacttagga-aaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataatta 21169  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataaca 250  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21168 tcatcaattaatggatacaaacataaca 21141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14312 - 14086
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||  | |||| ||    
T  14312 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaat 14213  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    || ||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  14212 tatcaacaacttagga-aaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataatta 14114  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataaca 250  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14113 tcatcaattcatgcatacagacataaca 14086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 313
Target Start/End: Original strand, 148721 - 149012
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||  |||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  148721 catcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 148820  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  148821 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 148919  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 313  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||| ||||||| ||| || ||   ||||||||||||||||||||||    
T  148920 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatcaattatgcaaaaattcatacaacatttgaaa 149012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Original strand, 8849 - 9195
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||  ||||| | ||||  |    
T  8849 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaatt 8948  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8949 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 9047  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 320  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||   ||||| ||||| ||||||||||| || ||    
T  9048 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaatacataccacatttgaaaaattgca 9147  T
Q  321 aa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  9148 aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacacacttaccttagat 9195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 266 - 364
Target Start/End: Original strand, 146843 - 146941
Alignment:
Q  266 gaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146843 gaatttaggaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 146941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 141 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 89600 - 89375
Alignment:
Q  141 aattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 240  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| ||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  89600 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 89501  T
Q  241 aaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatga 338  Q
    ||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  89500 aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatagaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatcatga 89401  T
Q  339 taaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  89400 tgaagactaacccccttaccttagat 89375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 236 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 107835 - 107705
Alignment:
Q  236 catacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 333  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107835 catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 107736  T
Q  334 tatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  107735 catgatgaagactaacccccttaccttagat 107705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 360
Target Start/End: Original strand, 130880 - 130911
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttacctt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130880 atgattatgataaagactaacccccttacctt 130911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5466 - 5254
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  5466 catcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 5368  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    ||||||||||| || | |||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5367 taacaacaactcagca-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 5269  T
Q  223 acatcaattcatgca 237  Q
     ||||||||||||||    
T  5268 tcatcaattcatgca 5254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 237
Target Start/End: Original strand, 3722 - 3936
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  3722 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 3821  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatca-tttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 221  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||   |||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3822 taacaacaacttagca-aaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 3920  T
Q  222 aacatcaattcatgca 237  Q
    | ||||||||||||||    
T  3921 atcatcaattcatgca 3936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9596 - 9374
Alignment:
Q  27 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  9596 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 9497  T
Q  127 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 226  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  9496 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 9398  T
Q  227 caattcatgcatacaaacataaca 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  9397 caattcatgcatacaaacataaca 9374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16494 - 16272
Alignment:
Q  27 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  16494 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 16395  T
Q  127 aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 226  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  16394 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 16296  T
Q  227 caattcatgcatacaaacataaca 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16295 caattcatgcatacaaacataaca 16272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9297 - 9257
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgatgt 369  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9297 atgattgtgataataactaacccccttaccttagatgatgt 9257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16195 - 16155
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgatgt 369  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16195 atgattgtgataataactaacccccttaccttagatgatgt 16155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 129 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1450 - 1304
Alignment:
Q  129 caacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 228  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1450 caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatca 1351  T
Q  229 attcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca 275  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||    
T  1350 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 1304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 797 - 534
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| || ||  |||||||||| || ||||||||||| |||| |       
T  797 catcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatc 698  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
    |||||  ||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  697 taacagtaacttagca-aaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 599  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  598 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 34724 - 34460
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaca 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | ||||      
T  34724 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat 34625  T
Q  122 ttaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 221  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||||   |||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  34624 tcaacaacaacttagca-aaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 34526  T
Q  222 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  34525 atcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccat 34460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 37328 - 37066
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||       
T  37328 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatc 37229  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  37228 caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 37131  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37130 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 37012 - 36975
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37012 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 36975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 41648 - 41911
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||  |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  |  |    
T  41648 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 41747  T
Q  123 taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 222  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  41748 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 41846  T
Q  223 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  41847 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccat 41911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 362
Target Start/End: Original strand, 41957 - 41998
Alignment:
Q  321 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41957 aaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 41998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 115 - 9
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||| ||    
T  115 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatcaaatatcaaat 16  T
Q  123 taacaac 129  Q
    |||||||    
T  15 taacaac 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 276
Target Start/End: Original strand, 2966 - 3215
Alignment:
Q  27 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcacattaa 125  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | ||||  | ||    
T  2966 atcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaa 3065  T
Q  126 caacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 225  Q
    ||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  3066 caacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 3164  T
Q  226 tcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaa 276  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||   ||| |||||||||||||    
T  3165 tcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa 3215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 154 - 287
Target Start/End: Original strand, 13636 - 13769
Alignment:
Q  154 agcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaaca 253  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13636 agcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 13735  T
Q  254 tagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13736 aagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 13769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Original strand, 13824 - 13859
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13824 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagat 13859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 129
Target Start/End: Original strand, 48514 - 48620
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||    
T  48514 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatcaaatctcaaat 48613  T
Q  123 taacaac 129  Q
    |||||||    
T  48614 taacaac 48620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13478 - 13350
Alignment:
Q  121 attaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaac 220  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  13478 attaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaat 13380  T
Q  221 taacatcaattcatgcatacaaacataaca 250  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  13379 tatcatcaattcatgcatacaaacataaca 13350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Original strand, 26911 - 27058
Alignment:
Q  140 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 239  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  26911 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 27010  T
Q  240 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27011 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 27058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 280
Target Start/End: Original strand, 22656 - 22796
Alignment:
Q  140 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 239  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  22656 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 22755  T
Q  240 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 280  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||    
T  22756 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 22796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Original strand, 22857 - 22894
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22857 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 22894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Original strand, 27112 - 27149
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27112 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 27149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1729 - 1582
Alignment:
Q  140 aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 239  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  1729 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 1630  T
Q  240 caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1629 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 1582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1528 - 1491
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1528 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 1491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 119
Target Start/End: Original strand, 9382 - 9478
Alignment:
Q  23 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactca 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9382 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactca 9478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 287
Target Start/End: Original strand, 3360 - 3453
Alignment:
Q  194 atgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| || || | ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  3360 atgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccat 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 79
Target Start/End: Original strand, 3210 - 3264
Alignment:
Q  25 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaa 79  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  3210 tcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaatcacaacatcaa 3264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 910 - 873
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  910 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 9914 - 9877
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9914 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 9877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 108107 - 108070
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108107 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 108070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Original strand, 55904 - 55939
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55904 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 55939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 6475 - 6440
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6475 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 6440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13317 - 13282
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13317 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 13282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 56262 - 56106
Alignment:
Q  124 aacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaa--catgtaatttcaccaacaattatacaact 221  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||  | ||  |||||||||||| | ||||| |||||| |    
T  56262 aacaacaacttagca-aaattcaccatttgagcacaat-ttcataacttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcagccacaatcatacaatt 56165  T
Q  222 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat 280  Q
    | |||||| ||||||| || || |||||| || |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  56164 atcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 56106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 57424 - 57389
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57424 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 57389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 70348 - 70307
Alignment:
Q  230 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt 271  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  70348 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaattt 70307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 364
Target Start/End: Original strand, 18015 - 18061
Alignment:
Q  318 acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18015 acaaaataattatgattatgatgaagactaacccccttaccttagat 18061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 193429 - 193392
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  193429 atgattatgataaagactaacccccttaccttaaatga 193392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17336 - 17300
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatg 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17336 atgattatgataaagactaacccgcttaccttagatg 17300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 361
Target Start/End: Original strand, 80187 - 80219
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttacctta 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80187 atgattatgataaagactaacccccttacctta 80219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12075 - 12036
Alignment:
Q  330 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgatgt 369  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12075 tgattatgataataactaacccccttaccttagatgatgt 12036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 189 - 271
Target Start/End: Original strand, 8174 - 8257
Alignment:
Q  189 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt 271  Q
    |||||||| || |||||||||||  || ||| || |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  8174 tgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 34340 - 34305
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34340 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagat 34305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Original strand, 45338 - 45373
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45338 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagat 45373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 237
Target Start/End: Original strand, 45198 - 45244
Alignment:
Q  191 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgca 237  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  45198 aacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgca 45244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12415
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12450 atgattatgataaaaactaacccccttaccttagat 12415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 10427 - 10249
Alignment:
Q  191 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat-aa 289  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| || || ||   ||| ||||||||||||||||| || ||| ||    
T  10427 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaa 10328  T
Q  290 tcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgatg 368  Q
     | |  ||||||||||||  ||||||  | ||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10327 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgaagaagacaaacccccttaccttagatgatg 10249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 17241 - 17207
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 363  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17241 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 17207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 2399 - 2317
Alignment:
Q  189 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatt 270  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  2399 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 2317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 364
Target Start/End: Original strand, 339 - 373
Alignment:
Q  330 tgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  339 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagat 373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 364
Target Start/End: Original strand, 25532 - 25566
Alignment:
Q  330 tgattatgataaagactaacccccttaccttagat 364  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25532 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagat 25566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5508 - 5475
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5508 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 5475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4378 - 4345
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4378 atgattatgataaagtctaacccccttaccttag 4345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 362
Target Start/End: Original strand, 5549 - 5582
Alignment:
Q  329 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5549 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 5582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University