View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15637_high_2 (Length: 616)

Name: NF15637_high_2
Description: NF15637
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15637_high_2
NF15637_high_2
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (22-588)||(10847557-10848131)
chr7 (33-588)||(16443594-16444156)
chr7 (22-588)||(16047289-16047859)
chr7 (22-584)||(2160544-2161114)
chr7 (22-588)||(5154058-5154629)
chr7 (27-588)||(26268676-26269247)
chr7 (27-588)||(11418370-11418937)
chr7 (22-588)||(5140925-5141498)
chr7 (43-588)||(31129900-31130445)
chr7 (27-585)||(5164363-5164927)
chr7 (22-588)||(24586126-24586698)
chr7 (27-588)||(26518772-26519337)
chr7 (43-588)||(45737296-45737849)
chr7 (22-588)||(16745111-16745684)
chr7 (54-589)||(4138835-4139378)
chr7 (22-588)||(26313440-26314011)
chr7 (44-588)||(31557985-31558535)
chr7 (43-588)||(2779247-2779792)
chr7 (22-588)||(4205363-4205935)
chr7 (44-588)||(26678695-26679246)
chr7 (27-588)||(11446867-11447434)
chr7 (27-588)||(10910517-10911078)
chr7 (44-588)||(26663503-26664054)
chr7 (34-588)||(45393205-45393765)
chr7 (22-588)||(31084213-31084786)
chr7 (22-588)||(16512031-16512597)
chr7 (22-588)||(26509286-26509860)
chr7 (33-579)||(26441238-26441791)
chr7 (44-588)||(39206731-39207280)
chr7 (27-569)||(3451297-3451846)
chr7 (134-588)||(26595754-26596216)
chr7 (468-588)||(22152542-22152662)
chr7 (468-588)||(22208457-22208577)
chr7 (44-129)||(26531926-26532011)
chr7 (476-560)||(1890269-1890352)
chr7 (481-566)||(27971370-27971455)
chr7 (475-566)||(4943003-4943094)
chr7 (475-566)||(9472637-9472727)
chr7 (475-522)||(13836690-13836737)
chr7 (475-566)||(27439558-27439649)
chr7 (475-522)||(38409027-38409074)
chr7 (475-513)||(8815980-8816018)
chr7 (475-513)||(15768612-15768650)
chr7 (475-513)||(23881267-23881305)
chr7 (111-169)||(29027283-29027341)
chr7 (475-513)||(30366676-30366714)
chr7 (475-513)||(42632942-42632980)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (22-588)||(25092-25671)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (22-588)||(1906240-1906820)
chr4 (22-588)||(15276334-15276909)
chr4 (22-588)||(15379943-15380515)
chr4 (22-588)||(15233804-15234380)
chr4 (27-588)||(39856630-39857195)
chr4 (51-588)||(1673877-1674421)
chr4 (22-588)||(54839379-54839951)
chr4 (45-588)||(14104554-14105102)
chr4 (45-588)||(30759775-30760322)
chr4 (45-588)||(33667508-33668055)
chr4 (44-588)||(40099341-40099892)
chr4 (43-589)||(14753198-14753749)
chr4 (27-588)||(27157017-27157586)
chr4 (44-588)||(20332128-20332678)
chr4 (22-589)||(6575850-6576416)
chr4 (27-588)||(5011870-5012438)
chr4 (43-588)||(24118672-24119222)
chr4 (43-588)||(5700549-5701100)
chr4 (27-588)||(14671009-14671573)
chr4 (43-588)||(34182669-34183218)
chr4 (27-588)||(17019045-17019609)
chr4 (34-588)||(21975704-21976264)
chr4 (34-588)||(31120215-31120776)
chr4 (27-588)||(24586066-24586634)
chr4 (43-588)||(36338230-36338774)
chr4 (27-579)||(18794331-18794889)
chr4 (124-588)||(36324021-36324484)
chr4 (487-560)||(1878928-1879001)
chr4 (475-551)||(9189178-9189254)
chr4 (475-516)||(33184026-33184067)
chr4 (475-559)||(22709707-22709791)
chr4 (475-522)||(8097855-8097902)
chr4 (475-516)||(20558764-20558805)
chr4 (477-566)||(55791648-55791736)
[»] chr2 (51 HSPs)
chr2 (22-588)||(27396298-27396883)
chr2 (22-588)||(19450113-19450694)
chr2 (34-588)||(21696881-21697431)
chr2 (27-588)||(27122505-27123070)
chr2 (27-588)||(37383657-37384224)
chr2 (22-588)||(39896043-39896615)
chr2 (43-588)||(34160840-34161393)
chr2 (44-588)||(16167475-16168025)
chr2 (22-588)||(27809676-27810250)
chr2 (44-588)||(254347-254897)
chr2 (44-588)||(9343682-9344232)
chr2 (44-588)||(37945560-37946111)
chr2 (22-588)||(12592785-12593361)
chr2 (27-588)||(40239489-40240055)
chr2 (27-588)||(12710296-12710863)
chr2 (34-588)||(16823032-16823592)
chr2 (34-588)||(16897888-16898448)
chr2 (44-588)||(31882284-31882833)
chr2 (22-588)||(11628880-11629451)
chr2 (43-588)||(34297152-34297696)
chr2 (22-587)||(37679587-37680160)
chr2 (22-587)||(37694852-37695425)
chr2 (54-588)||(19410179-19410721)
chr2 (54-588)||(22921838-22922380)
chr2 (22-587)||(21670865-21671440)
chr2 (27-588)||(23122271-23122835)
chr2 (22-584)||(34268625-34269188)
chr2 (44-588)||(37931369-37931926)
chr2 (43-588)||(27428148-27428692)
chr2 (44-588)||(20843909-20844461)
chr2 (95-588)||(31868481-31868979)
chr2 (27-502)||(12661519-12662000)
chr2 (22-516)||(3788469-3788969)
chr2 (44-569)||(39045534-39046067)
chr2 (27-579)||(27782212-27782771)
chr2 (44-569)||(13930258-13930791)
chr2 (45-502)||(34867681-34868144)
chr2 (22-502)||(32055777-32056263)
chr2 (43-587)||(28888275-28888800)
chr2 (298-588)||(23117053-23117344)
chr2 (476-560)||(26721085-26721168)
chr2 (532-588)||(34868125-34868181)
chr2 (27-100)||(31887682-31887755)
chr2 (534-588)||(32056246-32056300)
chr2 (475-566)||(42569232-42569323)
chr2 (534-588)||(3788938-3788992)
chr2 (532-588)||(12661981-12662038)
chr2 (474-522)||(21854704-21854752)
chr2 (475-513)||(12386860-12386898)
chr2 (475-513)||(20276776-20276814)
chr2 (481-566)||(3761105-3761190)
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (22-588)||(20334120-20334694)
chr1 (22-588)||(16201740-16202312)
chr1 (22-588)||(20466756-20467337)
chr1 (45-588)||(28591085-28591632)
chr1 (43-588)||(28155726-28156279)
chr1 (27-588)||(51644204-51644773)
chr1 (22-588)||(3647125-3647698)
chr1 (45-588)||(10951093-10951643)
chr1 (22-588)||(21891463-21892025)
chr1 (27-587)||(10968649-10969216)
chr1 (27-588)||(41787014-41787583)
chr1 (475-517)||(2389935-2389977)
chr1 (475-560)||(13457093-13457177)
chr1 (477-550)||(13469050-13469123)
chr1 (475-513)||(5625850-5625888)
chr1 (476-522)||(31545354-31545400)
chr1 (476-513)||(21454697-21454734)
chr1 (477-513)||(9297885-9297921)
[»] chr5 (67 HSPs)
chr5 (22-588)||(22894400-22894972)
chr5 (22-588)||(25206261-25206840)
chr5 (22-588)||(25270417-25270996)
chr5 (22-589)||(26486380-26486942)
chr5 (27-588)||(11555343-11555909)
chr5 (27-588)||(23631958-23632527)
chr5 (27-588)||(28655231-28655799)
chr5 (44-588)||(13180398-13180944)
chr5 (45-588)||(18369137-18369686)
chr5 (44-588)||(13318433-13318982)
chr5 (22-589)||(9323461-9324033)
chr5 (44-588)||(30174471-30175022)
chr5 (45-587)||(33881133-33881681)
chr5 (22-589)||(12138160-12138732)
chr5 (43-588)||(37745927-37746484)
chr5 (43-588)||(9544312-9544864)
chr5 (27-588)||(18494373-18494939)
chr5 (22-588)||(33298517-33299093)
chr5 (27-588)||(2517054-2517622)
chr5 (44-588)||(40467156-40467708)
chr5 (27-584)||(15652369-15652930)
chr5 (22-588)||(33783471-33784038)
chr5 (44-588)||(34622524-34623076)
chr5 (27-588)||(41680693-41681261)
chr5 (22-588)||(23897858-23898425)
chr5 (43-588)||(31437469-31438013)
chr5 (34-588)||(3795534-3796095)
chr5 (22-588)||(24608229-24608797)
chr5 (22-589)||(6880287-6880861)
chr5 (43-588)||(18122021-18122572)
chr5 (45-588)||(24729977-24730526)
chr5 (52-588)||(30158048-30158590)
chr5 (34-588)||(33522378-33522939)
chr5 (27-579)||(31820024-31820580)
chr5 (27-588)||(22992729-22993288)
chr5 (27-588)||(32589881-32590447)
chr5 (22-588)||(15752463-15753029)
chr5 (22-588)||(24975833-24976399)
chr5 (27-588)||(37352249-37352816)
chr5 (43-588)||(37665090-37665642)
chr5 (43-588)||(5643805-5644354)
chr5 (22-579)||(37760966-37761530)
chr5 (22-588)||(30035410-30035982)
chr5 (45-587)||(11329644-11330194)
chr5 (27-588)||(30940625-30941187)
chr5 (29-588)||(13436275-13436850)
chr5 (27-588)||(43084247-43084813)
chr5 (27-587)||(8659078-8659643)
chr5 (27-588)||(28953383-28953952)
chr5 (532-588)||(23726735-23726791)
chr5 (473-566)||(21990745-21990838)
chr5 (473-566)||(33840002-33840095)
chr5 (475-566)||(21862457-21862548)
chr5 (475-517)||(20374430-20374472)
chr5 (473-513)||(21693353-21693393)
chr5 (475-522)||(28849191-28849238)
chr5 (475-513)||(1803677-1803715)
chr5 (475-513)||(7256637-7256675)
chr5 (475-513)||(7792375-7792413)
chr5 (475-513)||(11941199-11941237)
chr5 (475-513)||(15781445-15781483)
chr5 (475-513)||(31523692-31523730)
chr5 (479-560)||(12175679-12175760)
chr5 (481-566)||(20382384-20382469)
chr5 (481-566)||(27228719-27228804)
chr5 (475-516)||(29899064-29899105)
chr5 (475-522)||(24064596-24064644)
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (22-588)||(16422123-16422696)
chr3 (22-588)||(16618251-16618813)
chr3 (27-588)||(18057205-18057775)
chr3 (43-588)||(7079183-7079739)
chr3 (27-588)||(4790381-4790949)
chr3 (43-589)||(17970613-17971163)
chr3 (27-588)||(32296574-32297142)
chr3 (44-588)||(5727940-5728491)
chr3 (44-588)||(47029415-47029966)
chr3 (43-588)||(22864596-22865145)
chr3 (43-588)||(22879655-22880204)
chr3 (34-587)||(22381330-22381888)
chr3 (27-588)||(29658716-29659283)
chr3 (34-588)||(5590105-5590669)
chr3 (44-588)||(5717030-5717581)
chr3 (44-588)||(5763877-5764428)
chr3 (22-588)||(4629725-4630296)
chr3 (43-588)||(6536491-6537042)
chr3 (43-588)||(20071994-20072547)
chr3 (22-588)||(29142502-29143077)
chr3 (44-588)||(8283206-8283767)
chr3 (27-588)||(21680646-21681212)
chr3 (44-588)||(4422880-4423430)
chr3 (27-589)||(10402094-10402661)
chr3 (44-588)||(10649033-10649583)
chr3 (34-588)||(4340424-4340984)
chr3 (44-588)||(5019675-5020224)
chr3 (43-588)||(5472949-5473499)
chr3 (43-588)||(18286103-18286653)
chr3 (43-588)||(18301404-18301954)
chr3 (22-498)||(19700426-19700921)
chr3 (27-588)||(31029992-31030553)
chr3 (44-588)||(48471889-48472443)
chr3 (54-588)||(5603061-5603603)
chr3 (34-588)||(17978696-17979259)
chr3 (54-588)||(31958203-31958745)
chr3 (27-588)||(18336573-18337135)
chr3 (43-588)||(32445115-32445661)
chr3 (27-572)||(4727578-4728124)
chr3 (44-588)||(11104110-11104660)
chr3 (54-588)||(24334145-24334687)
chr3 (27-589)||(8217577-8218149)
chr3 (27-588)||(28027236-28027801)
chr3 (22-588)||(28109699-28110276)
chr3 (27-588)||(4689596-4690157)
chr3 (27-587)||(35886709-35887271)
chr3 (27-588)||(18248683-18249249)
chr3 (54-588)||(28345143-28345682)
chr3 (44-588)||(51787984-51788533)
chr3 (27-572)||(6207845-6208393)
chr3 (44-588)||(18231155-18231705)
chr3 (22-588)||(5658074-5658643)
chr3 (44-588)||(15734861-15735393)
chr3 (27-579)||(20570602-20571161)
chr3 (254-588)||(15886489-15886814)
chr3 (22-153)||(15886894-15887027)
chr3 (44-129)||(8002522-8002607)
chr3 (476-517)||(27560722-27560763)
chr3 (474-515)||(18904179-18904220)
chr3 (475-522)||(72518-72565)
chr3 (475-566)||(17931128-17931218)
chr3 (475-517)||(4453039-4453081)
chr3 (534-579)||(19700908-19700953)
chr3 (473-513)||(15581010-15581050)
chr3 (475-513)||(5947688-5947726)
chr3 (475-513)||(6199974-6200012)
chr3 (475-513)||(8621987-8622025)
chr3 (475-513)||(8810060-8810098)
chr3 (475-513)||(15531814-15531852)
chr3 (475-513)||(15921802-15921840)
chr3 (475-513)||(46383679-46383717)
chr3 (475-513)||(46395177-46395215)
chr3 (475-516)||(23283773-23283814)
chr3 (481-566)||(25268909-25268994)
chr3 (475-516)||(30091508-30091549)
chr3 (474-522)||(9549968-9550016)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (27-588)||(22074596-22075164)
chr8 (27-588)||(19910829-19911398)
chr8 (22-588)||(19202042-19202603)
chr8 (22-588)||(18796683-18797256)
chr8 (27-588)||(33248348-33248914)
chr8 (27-588)||(21341837-21342405)
chr8 (27-588)||(15773556-15774123)
chr8 (22-588)||(28355617-28356192)
chr8 (22-588)||(19655012-19655583)
chr8 (22-588)||(19680425-19680996)
chr8 (27-588)||(44566962-44567532)
chr8 (22-588)||(29835300-29835871)
chr8 (43-588)||(18715478-18716031)
chr8 (44-589)||(31360527-31361078)
chr8 (22-588)||(27602581-27603146)
chr8 (54-588)||(31483537-31484079)
chr8 (27-588)||(12086390-12086958)
chr8 (22-589)||(33264708-33265273)
chr8 (27-588)||(19694077-19694640)
chr8 (27-587)||(2130935-2131496)
chr8 (43-579)||(9360620-9361150)
chr8 (22-588)||(22138883-22139436)
chr8 (27-588)||(14569139-14569704)
chr8 (27-294)||(16260205-16260479)
chr8 (476-560)||(16771675-16771758)
chr8 (476-560)||(25794043-25794126)
chr8 (475-516)||(21477865-21477906)
chr8 (475-522)||(6668218-6668265)
chr8 (475-520)||(39840343-39840388)
chr8 (476-516)||(22158805-22158845)
[»] chr6 (59 HSPs)
chr6 (22-588)||(22928532-22929107)
chr6 (22-588)||(27284014-27284586)
chr6 (27-588)||(33370083-33370650)
chr6 (22-588)||(16755794-16756367)
chr6 (27-588)||(27355763-27356330)
chr6 (27-588)||(29507395-29507964)
chr6 (22-588)||(29555532-29556104)
chr6 (28-588)||(27623359-27623927)
chr6 (27-588)||(28166473-28167041)
chr6 (27-588)||(13292601-13293164)
chr6 (45-587)||(13517847-13518395)
chr6 (43-588)||(14139052-14139597)
chr6 (27-588)||(26110061-26110629)
chr6 (45-588)||(29579012-29579560)
chr6 (27-588)||(4539410-4539978)
chr6 (27-588)||(27031002-27031566)
chr6 (22-587)||(8899352-8899923)
chr6 (45-588)||(16680136-16680685)
chr6 (27-588)||(34458160-34458725)
chr6 (44-588)||(4763759-4764309)
chr6 (43-588)||(27013728-27014272)
chr6 (27-588)||(27208883-27209446)
chr6 (27-588)||(27239782-27240345)
chr6 (22-587)||(24869684-24870250)
chr6 (43-588)||(27063477-27064027)
chr6 (27-588)||(27200165-27200733)
chr6 (27-588)||(27248500-27249068)
chr6 (34-588)||(30551652-30552212)
chr6 (27-572)||(27025124-27025671)
chr6 (27-588)||(26791795-26792362)
chr6 (27-588)||(26772281-26772847)
chr6 (22-588)||(27491107-27491678)
chr6 (27-588)||(28213433-28214001)
chr6 (43-588)||(26926763-26927298)
chr6 (44-588)||(4778876-4779427)
chr6 (27-588)||(24299412-24299974)
chr6 (27-588)||(4531267-4531834)
chr6 (44-588)||(15406185-15406731)
chr6 (44-588)||(15417972-15418518)
chr6 (28-588)||(16937677-16938243)
chr6 (129-588)||(26666310-26666774)
chr6 (65-588)||(20174566-20175108)
chr6 (65-588)||(22160883-22161425)
chr6 (22-124)||(23851450-23851552)
chr6 (476-560)||(27548248-27548331)
chr6 (475-551)||(25710257-25710332)
chr6 (473-566)||(28308730-28308823)
chr6 (475-522)||(174314-174361)
chr6 (475-566)||(16584627-16584718)
chr6 (475-566)||(16610662-16610753)
chr6 (475-566)||(18947666-18947756)
chr6 (475-566)||(27515726-27515816)
chr6 (475-513)||(617847-617885)
chr6 (475-513)||(1547641-1547679)
chr6 (475-513)||(24145377-24145415)
chr6 (475-516)||(18752987-18753028)
chr6 (481-522)||(27053523-27053564)
chr6 (111-189)||(5991426-5991506)
chr6 (474-522)||(25501248-25501296)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (27-588)||(4307-4878)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (22-588)||(9347-9918)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (22-588)||(12023-12593)
scaffold0322 (22-586)||(1634-2204)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (22-588)||(2884-3458)
scaffold0159 (236-588)||(18007-18357)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (43-588)||(12034-12584)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (43-588)||(8634-9184)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (22-588)||(9891-10463)
scaffold0143 (43-588)||(33295-33844)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (27-587)||(6048-6611)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (27-588)||(13931-14499)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (27-588)||(15551-16125)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (27-516)||(24682-25174)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (251-588)||(1-323)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (27-466)||(18567-19015)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (27-208)||(359-540)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (22-191)||(26241-26410)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (317-588)||(40321-40606)
scaffold0099 (51-197)||(40744-40898)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (475-566)||(15200-15291)
[»] scaffold1837 (1 HSPs)
scaffold1837 (476-517)||(577-618)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (475-559)||(5523-5607)
[»] scaffold1418 (1 HSPs)
scaffold1418 (475-566)||(1405-1496)
[»] scaffold0257 (1 HSPs)
scaffold0257 (475-566)||(141-232)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (476-522)||(173131-173177)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (473-522)||(20999-21048)
scaffold0016 (111-189)||(20638-20718)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (474-522)||(175-223)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (473-513)||(20517-20557)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (475-566)||(3376-3467)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (476-515)||(33006-33045)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (475-566)||(28319-28409)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (475-513)||(1284-1322)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (475-513)||(758-796)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (475-513)||(8252-8290)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (480-566)||(69116-69202)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (475-513)||(90367-90405)
[»] scaffold0799 (1 HSPs)
scaffold0799 (477-566)||(5231-5319)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (475-516)||(11148-11189)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (475-516)||(15248-15289)
[»] scaffold1691 (1 HSPs)
scaffold1691 (475-523)||(1148-1196)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (473-513)||(32121-32161)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (111-193)||(20592-20676)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 10847557 - 10848131
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10847557 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccatttt 10847656  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------- 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||               
T  10847657 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtctgaaactctattttctctcta 10847756  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaa-gttttttgtctgtt 309  Q
    |||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10847757 ctttcaaagctatgtacaaaaaaa-cattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaagttttttgtctgtt 10847855  T
Q  310 ttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 409  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  10847856 ttgaaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaat--gtgttacaagcaggctcttcc 10847953  T
Q  410 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10847954 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaataaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataagctcgctcagttgaaaacccgaaagggcgacttag 10848053  T
Q  510 gcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10848054 gc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcggttcacgcaaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 10848131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 16444156 - 16443594
Alignment:
Q  33 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgt 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16444156 gaagcttatgtgcttgcgaattcaaagtttctaagaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 16444057  T
Q  133 aaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc-----------aaagct 221  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||           ||||||    
T  16444056 aaatccgtggagtcacgccttcgcctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaactctactttctttctactttcaaagct 16443957  T
Q  222 atgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaac 321  Q
    ||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16443956 atgtacaaaaaa--cattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt-gtctattttgaaagcaaac 16443860  T
Q  322 ctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtct 421  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16443859 ctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 16443760  T
Q  422 gtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgag 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16443759 gtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca-aaaatgag 16443661  T
Q  522 cacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  16443660 caccccgctggattgataacccgaaagggcagtttaggcaaaaatggggcaagcaaaagaatttatt 16443594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 16047289 - 16047859
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16047289 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 16047388  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc------ 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||          
T  16047389 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttcta 16047488  T
Q  216 -----aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
         ||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||| |||    
T  16047489 ctgtcaaagctatgtacaaaa-----attttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcctgaaaattgaaaag--tttttgtctattt 16047581  T
Q  311 tgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccc 410  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16047582 tgaaagcaagcctgagcaacaggatacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccc 16047681  T
Q  411 caggatagtctgtggtcaatggcaagaat-gaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 509  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16047682 cgggatagtctgtggtcaatggcaagaatggaaaaaacagaataaaaatgcatgaaaatgaataagctcgccaagttgaaaacccgaaagggcaacttag 16047781  T
Q  510 gcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16047782 gc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 16047859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 584
Target Start/End: Original strand, 2160544 - 2161114
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2160544 catcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 2160643  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------- 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||               
T  2160644 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttccttttta 2160743  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
    |||||||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  2160744 ctttcaaagctatgtacaaaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt-gtctattt 2160840  T
Q  311 t-gaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 409  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2160841 ttgaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcc 2160940  T
Q  410 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  2160941 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccagaagggcggcttag 2161040  T
Q  510 gcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatt 584  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2161041 gc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatt 2161114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 5154058 - 5154629
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5154058 catcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 5154157  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------a 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||           |    
T  5154158 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttcttttta 5154257  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
    ||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||    
T  5154258 ctttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattt 5154351  T
Q  311 tgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 409  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |     
T  5154352 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcct 5154451  T
Q  410 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5154452 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttag 5154551  T
Q  510 gcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5154552 gc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 5154629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 26269247 - 26268676
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26269247 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26269148  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||           ||||||    
T  26269147 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttc 26269048  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt----gaaaattgaaaaagttttttgtctgtttt 311  Q
    ||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||   ||||||||| ||||    
T  26269047 aaagctatgtacaaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaac--tttttgtctatttt 26268953  T
Q  312 gaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccc 410  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |    
T  26268952 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctc 26268853  T
Q  411 caggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttagg 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26268852 caggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaattgaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttagg 26268753  T
Q  511 caaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26268752 ca-aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 26268676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 11418937 - 11418370
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11418937 tcatcaaaagctcctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 11418838  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc----------- 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||               
T  11418837 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttc 11418738  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 314  Q
    |||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| |||||||||||||    
T  11418737 aaagctatatacaaaa----cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttctgtctgttttgaa 11418644  T
Q  315 a-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  || | ||||    
T  11418643 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggtcctcctccag 11418544  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  11418543 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaataaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggca- 11418445  T
Q  514 aaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11418444 aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagtccaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 11418370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 5141498 - 5140925
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5141498 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 5141399  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tcta 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            ||||    
T  5141398 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttcta 5141299  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
    ||||||||| ||| |||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||    
T  5141298 ctttcaaagttatatacaaaaat---attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattt 5141204  T
Q  311 tgaaa--gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 408  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |    
T  5141203 tgaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcc 5141104  T
Q  409 cccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactta 508  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5141103 tccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaagtgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggctta 5141004  T
Q  509 ggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  5141003 ggca-aaaatgagcacctcgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattggaaagaatttatt 5140925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Original strand, 31129900 - 31130445
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31129900 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 31129999  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||           |||||||||||||| |||        
T  31130000 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 31130099  T
Q  232 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaaca 331  Q
        |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||      ||  |||||||||||||||||||    
T  31130100 ----cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttttt------ttgaaaagcaaacctgagcaaca 31130189  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     ||||||||||||  | ||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||    
T  31130190 gggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggataatctgtggtcaatg 31130289  T
Q  432 gcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctc 531  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||     
T  31130290 gcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccgctg 31130388  T
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31130389 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaagagaatttatt 31130445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 27 - 585
Target Start/End: Original strand, 5164363 - 5164927
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5164363 tcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 5164462  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttc 215  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||           |||||    
T  5164463 ctttgtgaatccgtggagtcacgctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 5164562  T
Q  216 aaagc-tatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 314  Q
    ||||| ||| |||        |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||    
T  5164563 aaagcctatatacaaaa----cattttctttctattttgataataacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaa 5164656  T
Q  315 a-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||    
T  5164657 aagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccag 5164756  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  5164757 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatggaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-a 5164855  T
Q  514 aaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaattt 585  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5164856 aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaaaggcagttcaggcaaaaatggggcaatgaaaagaattt 5164927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 24586698 - 24586126
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctagg-aaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattt 120  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24586698 catcttcatctgaatcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 24586599  T
Q  121 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta---------- 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  | ||||||              
T  24586598 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctttcgtttaagactctatttttcttct 24586499  T
Q  211 -ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtt 309  Q
     ||||||||||||| |||        ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||    
T  24586498 actttcaaagctatatacaaaa----cattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctatt 24586405  T
Q  310 ttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 408  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  24586404 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcc 24586305  T
Q  409 cccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactta 508  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24586304 tccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggctta 24586205  T
Q  509 ggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24586204 ggca-aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaacttatt 24586126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 26518772 - 26519337
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26518772 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26518871  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc----------a 216  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||          |    
T  26518872 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctattttca 26518971  T
Q  217 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa- 315  Q
    ||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||     
T  26518972 aagctatatacaaat----cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaa 26519065  T
Q  316 gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagga 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  26519066 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagga 26519165  T
Q  416 tagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  26519166 tagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaa 26519264  T
Q  516 aatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26519265 aatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 26519337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Original strand, 45737296 - 45737849
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737296 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 45737395  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||          ||||||||||||| |||         
T  45737396 agtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctactttcaaagctatatacaaaa- 45737494  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt----gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagc 327  Q
       ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  45737495 ---cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 45737589  T
Q  328 aacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtc 427  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  45737590 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatatctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtc 45737689  T
Q  428 aatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccc 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  45737690 aatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaattgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcacccc 45737788  T
Q  528 cctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  45737789 gctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 45737849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 16745684 - 16745111
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16745684 catcttcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 16745585  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tcta 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            ||||    
T  16745584 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttcta 16745485  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt--gaaaattgaaaaagttttttgtctgt 308  Q
    ||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||||||| |    
T  16745484 ctttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac--tttttgtctat 16745391  T
Q  309 tttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctctt 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||     
T  16745390 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtatattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaagttctc 16745291  T
Q  408 ccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactt 507  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16745290 cttcaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggctt 16745191  T
Q  508 aggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16745190 aggca-aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcggttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 16745111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 54 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 4139378 - 4138835
Alignment:
Q  54 tcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgcctt 153  Q
    ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4139378 tcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctt 4139279  T
Q  154 cggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaact--------------ctactttcaaagctatgtacnnnnnnnncatt 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |              |||||||||||||||| |||        ||||    
T  4139278 cggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaa----catt 4139183  T
Q  240 ttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtaca 338  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4139182 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 4139085  T
Q  339 ttcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaa 438  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4139084 ttcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggtcaatggcaagaa 4138985  T
Q  439 tgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgac 538  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  4138984 tgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttgggc-aaaaatgagcaccccgctggattgac 4138886  T
Q  539 aacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttattg 589  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4138885 aacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttattg 4138835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 26314011 - 26313440
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctagg-aaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattt 120  Q
    |||| ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26314011 catcttcatctgaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 26313912  T
Q  121 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc----- 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||         
T  26313911 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttcta 26313812  T
Q  216 -----aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
         |||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||    
T  26313811 ttttcaaagctatatacaaat----cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattt 26313718  T
Q  311 tgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 409  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |     
T  26313717 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcct 26313618  T
Q  410 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 509  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313617 ccaagataatctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 26313518  T
Q  510 gcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26313517 gca-aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 26313440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 31558535 - 31557985
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558535 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 31558436  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||||||| |||         
T  31558435 gtcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttcaaagctatatacaaat- 31558337  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaac 330  Q
       ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31558336 ---cattttccttctattttgataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 31558242  T
Q  331 aaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 430  Q
    | ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  31558241 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggtcaat 31558142  T
Q  431 ggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccct 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  31558141 ggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggca-aaaatgagcaccccgct 31558043  T
Q  531 cgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31558042 ggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaagagaatttatt 31557985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Original strand, 2779247 - 2779792
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779247 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 2779346  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||           |||||||||||||| |||        
T  2779347 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 2779446  T
Q  232 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaaca 331  Q
        |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||      ||  |||||||||||||||||||    
T  2779447 ----cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttttt------ttgaaaagcaaacctgagcaaca 2779536  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     ||||||||||||  | ||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||    
T  2779537 gggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggtcaatg 2779636  T
Q  432 gcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctc 531  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| ||     
T  2779637 gcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaagggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aagaatgagcaccccgctg 2779735  T
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  2779736 gattgaaaacccgaaagggaagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 2779792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 4205363 - 4205935
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctagg-aaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattt 120  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4205363 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 4205462  T
Q  121 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc----- 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||         
T  4205463 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttcta 4205562  T
Q  216 -----aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaa-ttgaaaaagttttttgtctgtt 309  Q
         |||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| ||    
T  4205563 ttttcaaagctatatacaaat----cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaacctttt--gtctatt 4205656  T
Q  310 ttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 408  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  4205657 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcc 4205756  T
Q  409 cccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactta 508  Q
     ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4205757 tccaagataatctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggctta 4205856  T
Q  509 ggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4205857 ggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaccccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 4205935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 26679246 - 26678695
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26679246 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 26679147  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagctatgtacnnn 230  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||              ||||||||||||||||| |||       
T  26679146 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 26679047  T
Q  231 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 329  Q
         |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26679046 a----cattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 26678953  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    |  ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  26678952 cggggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 26678853  T
Q  430 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccc 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| |    
T  26678852 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aagaatgagcaccccgc 26678754  T
Q  530 tcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26678753 tggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 26678695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 11446867 - 11447434
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11446867 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 11446966  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttca 216  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||          ||||||    
T  11446967 ctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctattttcttctactttca 11447066  T
Q  217 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttg--aaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 314  Q
    ||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  11447067 aagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaa 11447160  T
Q  315 a-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    | |||||||||||||||| |||||| ||||   ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |  |||    
T  11447161 aagcaaacctgagcaacagggtacaatcaagtgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcag 11447260  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  11447261 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-a 11447359  T
Q  514 aaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||    
T  11447360 aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggtaaaaatggggcattggaaagaatttatt 11447434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 10911078 - 10910517
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  10911078 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaatacaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcactaacccataaaattaccattttccaag 10910979  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||           |||||    
T  10910978 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttc 10910879  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 313  Q
    |||| |||||||        ||||||| |||||| || | ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||         |    
T  10910878 aaagttatgtacaaaaa---cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttttga--------a 10910790  T
Q  314 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||    
T  10910789 aagcaaacctgagcaacatggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 10910691  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  10910690 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggca- 10910592  T
Q  514 aaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10910591 aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 10910517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 26664054 - 26663503
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26664054 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 26663955  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagctatgtacnnn 230  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||              ||||||||||||||||| |||       
T  26663954 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 26663855  T
Q  231 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 329  Q
         |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26663854 a----cattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 26663761  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    |  ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  26663760 cggggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcccctccaggatagtctgtggtcaa 26663661  T
Q  430 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccc 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| |    
T  26663660 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aagaatgagcaccccgc 26663562  T
Q  530 tcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26663561 tggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 26663503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 34 - 588
Target Start/End: Original strand, 45393205 - 45393765
Alignment:
Q  34 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 133  Q
    |||||| ||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  45393205 aagcttatgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 45393304  T
Q  134 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctacttt-----------caaagcta 222  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||           ||||||||    
T  45393305 aatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctacttttcttctactttcaaagcta 45393404  T
Q  223 tgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaa 320  Q
    |  ||        ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||    
T  45393405 tacacaaat----cattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaa 45393498  T
Q  321 cctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtc 420  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||  |||||| |||||| ||| ||| ||||||||| ||| |  ||||||||||    
T  45393499 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatggtgatgtccatttcagtatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtc 45393598  T
Q  421 tgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatga 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45393599 tgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc-aaaaatga 45393697  T
Q  521 gcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  45393698 gcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 45393765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 31084786 - 31084213
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattt 120  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  31084786 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 31084687  T
Q  121 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta---------- 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||              
T  31084686 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggttgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctatttttcttct 31084587  T
Q  211 -ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgt 308  Q
     ||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||   |||||||||| |    
T  31084586 actttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaat--ttttttgtctat 31084493  T
Q  309 tttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctctt 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||     
T  31084492 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctc 31084393  T
Q  408 ccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactt 507  Q
    | ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  31084392 ctccaagataatctgtggtcaatggcaggaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatagataggctcgctaagtcgaaaacccggaagggcggctt 31084293  T
Q  508 aggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  31084292 aggca-aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatctatt 31084213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 16512597 - 16512031
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16512597 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 16512498  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------a 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||           |    
T  16512497 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttaagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttcttttta 16512398  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgt 308  Q
    ||||||||| |||||||        ||||||| |||||| || | ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||           
T  16512397 ctttcaaagttatgtacaaaaa---cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgataattggaaaagtttttga----- 16512306  T
Q  309 tttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 408  Q
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | ||||||| ||| || ||| | |||||||||||| || ||| ||||||||| ||| |    
T  16512305 ----aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcc 16512210  T
Q  409 cccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactta 508  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16512209 tccaggatagtctgtgatcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggctta 16512110  T
Q  509 ggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16512109 gg-aaaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatcgggcaatgaaaagaatttatt 16512031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 26509860 - 26509286
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattt 120  Q
    |||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  26509860 catcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 26509761  T
Q  121 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac------------tc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||             ||    
T  26509760 tccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaaactccatttttcttc 26509661  T
Q  209 tactttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgt 308  Q
    ||||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| |    
T  26509660 tactttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttt-gtctat 26509566  T
Q  309 tttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctctt 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||  ||     
T  26509565 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatacatgtcacaagcaggacctc 26509466  T
Q  408 ccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactt 507  Q
    ||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26509465 ccccgaggtggtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaagtgaataggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcgactt 26509366  T
Q  508 aggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaa-cccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26509365 aggca-aaaatgagcaccccgctggattgacaaccccaaaagggtagttcaggcaaaaatggggcaa-gaaaagaatctatt 26509286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 33 - 579
Target Start/End: Original strand, 26441238 - 26441791
Alignment:
Q  33 gaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgt 132  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26441238 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctatgaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 26441337  T
Q  133 aaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-ctc------------tactttcaaag 219  Q
     ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||            |||||||||||    
T  26441338 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccgccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaaactccattttttcttttactttcaaag 26441437  T
Q  220 ctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gca 318  Q
    |||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||    
T  26441438 ctatatacaaaa----cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagca 26441531  T
Q  319 aacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatag 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||    
T  26441532 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatag 26441631  T
Q  419 tctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaat 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  26441632 tctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaataaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagaacgacttaggc-aaaaat 26441730  T
Q  519 gagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaa 579  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  26441731 gagcacctcgctggattgacaacctgaaaaggcagttcaggcaaaaatggggcaataaaaa 26441791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 39207280 - 39206731
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39207280 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 39207181  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||||||| |||         
T  39207180 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttcaaagctatatacaaaat 39207081  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaac 330  Q
        |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  39207080 ----attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaac 39206987  T
Q  331 aaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 430  Q
    | ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  39206986 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaat 39206887  T
Q  431 ggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccct 530  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  39206886 ggcaagaatgaaaaaacagaat-aaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccgct 39206789  T
Q  531 cgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39206788 ggattgataacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 39206731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 27 - 569
Target Start/End: Original strand, 3451297 - 3451846
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3451297 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 3451396  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttca 216  Q
     ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||          ||||||    
T  3451397 ttttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagctggtgcttttgtttgaaattctattttcttctactttca 3451496  T
Q  217 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt---gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 313  Q
    ||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  3451497 aagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttga 3451590  T
Q  314 aa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    || |||||||||||||||| |||||| |||||   |||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  3451591 aaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatggaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctattccaatatatgttacaagcaggttctcctcca 3451690  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  3451691 ggatagtatgtggtcaatgacaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcgacttaggc- 3451789  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggg 569  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  3451790 aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcgatccaggcaaaaatggg 3451846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 134 - 588
Target Start/End: Original strand, 26595754 - 26596216
Alignment:
Q  134 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagc 220  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||||||||||||||    
T  26595754 aatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagc 26595853  T
Q  221 tatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gca 318  Q
    ||| |||        |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||    
T  26595854 tatatacaaca----cattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagca 26595947  T
Q  319 aacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatag 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||    
T  26595948 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatag 26596047  T
Q  419 tctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaat 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||    
T  26596048 tctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttagac-aagaat 26596146  T
Q  519 gagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26596147 gagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 26596216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 468 - 588
Target Start/End: Original strand, 22152542 - 22152662
Alignment:
Q  468 tgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccg-aaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22152542 tgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaaagggcagttcaggcaaaaat 22152640  T
Q  567 ggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  22152641 ggggcattgaaaagaatttatt 22152662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 468 - 588
Target Start/End: Original strand, 22208457 - 22208577
Alignment:
Q  468 tgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccg-aaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22208457 tgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaaagggcagttcaggcaaaaat 22208555  T
Q  567 ggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  22208556 ggggcattgaaaagaatttatt 22208577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 26532011 - 26531926
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctt 129  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26532011 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 26531926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 476 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 1890352 - 1890269
Alignment:
Q  476 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggc 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  | |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1890352 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaaa-gagcatcccggtggattgaaaacccgaaagggcagtccaggc 1890269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 481 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 27971455 - 27971370
Alignment:
Q  481 taagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  27971455 taagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagcaaaaaatgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 27971370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 4943094 - 4943003
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| || ||||| ||||  |||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  4943094 gctcgctaagtcgaaaaccctaaagggcggcttaagccaaaaacgagcgtcccggtggattgagaacccgaaaaggcagtccaggcaaaaat 4943003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 566
Target Start/End: Original strand, 9472637 - 9472727
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  9472637 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaacaaa-gagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 9472727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 522
Target Start/End: Original strand, 13836690 - 13836737
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 522  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  13836690 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagc 13836737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 566
Target Start/End: Original strand, 27439558 - 27439649
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  27439558 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggtttaagccaaaaatgagcgtcccgatggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 27439649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 522
Target Start/End: Original strand, 38409027 - 38409074
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 522  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  38409027 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagc 38409074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Original strand, 8815980 - 8816018
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8815980 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 8816018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 15768650 - 15768612
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15768650 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 15768612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 23881305 - 23881267
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23881305 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 23881267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 169
Target Start/End: Original strand, 29027283 - 29027341
Alignment:
Q  111 attaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactc 169  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  29027283 attaccattttccaaacttttaaaatccgtggaaccacgcctttggcagaccaccactc 29027341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 30366714 - 30366676
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  30366714 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 30366676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 42632980 - 42632942
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  42632980 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 42632942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 392; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 25092 - 25671
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  25092 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccatttt 25191  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc------ 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||          
T  25192 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgcgcttttgtttgaaactctactttctttcta 25291  T
Q  216 -----aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa-----agttttttgtc 305  Q
         ||||||||||||        |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||    
T  25292 ctttcaaagctatgtacgaaaaaa-cattatctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagttttttgtc 25390  T
Q  306 tgttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctc 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25391 tgttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctc 25490  T
Q  406 ttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgac 505  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25491 ttccccaggatagtctgtggccaatggcaagaatg-aaaaacagaatgaaaatgcatgaaaaggaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgac 25589  T
Q  506 ttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25590 ttaggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccaaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 25671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 1906240 - 1906820
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1906240 catcttcatcagaagctcatgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 1906339  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctact--------- 212  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||             
T  1906340 ccaagctttgtatatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaactctactatctttcta 1906439  T
Q  213 --ttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtt 309  Q
      |||||||| ||||||        |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1906440 ctttcaaagccatgtacaaaagaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctatt 1906539  T
Q  310 ttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 409  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1906540 ttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttcc 1906639  T
Q  410 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatg--aaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactt 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1906640 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactt 1906739  T
Q  508 aggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1906740 aggcaaaaaacgagcaccccgctggattgacgacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 1906820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 15276909 - 15276334
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15276909 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccatttt 15276810  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------- 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||               
T  15276809 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctctcta 15276710  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagt-tttttgtctgtt 309  Q
    |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  15276709 ctttcaaagctatgtacaaaaaa--cattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtctgtt 15276612  T
Q  310 ttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 409  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15276611 ttgaaagtaaacttgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaaacaggctcttcc 15276512  T
Q  410 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15276511 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 15276412  T
Q  510 gcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15276411 gca-aaaatgagcaccccgctgaattgacatcctaaaagggcggttcaggcaaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 15276334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 15380515 - 15379943
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15380515 catcttcatccgaagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttcaaggaaatgtagtggttatcgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccatttt 15380416  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc------ 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||          
T  15380415 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttcta 15380316  T
Q  216 -----aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
         ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  15380315 ctttcaaagctatgtacaaaaaa--cattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaa-ttaaaaaagttttt-gtctgttt 15380220  T
Q  311 tgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccc 410  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15380219 tgaaagcaagcctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctttttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 15380120  T
Q  411 caggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttagg 510  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15380119 caggatagtctgtggccaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaattaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttagg 15380020  T
Q  511 caaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15380019 ca-aaaatgagcaccctgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 15379943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 15233804 - 15234380
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15233804 catcttcatcataagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttataggaaatgtagtggttactatgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 15233903  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc------ 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||          
T  15233904 ccaagctttgtaaatccgtagagtcacgccttcggctaaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttcta 15234003  T
Q  216 -----aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttt----gtct 306  Q
         ||||||||||||         | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    ||||    
T  15234004 ctttcaaagctatgtacaaaaa----aatttctttttatcttgataatgacaatgcttgaagcaaacatcttgaaacttgaaaaagttttttttttgtct 15234099  T
Q  307 gttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctct 406  Q
     ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  15234100 attttgaaagcaaacctgggcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttct 15234199  T
Q  407 tccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgact 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15234200 tccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggtgact 15234299  T
Q  507 taggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15234300 taggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacgcgaaagggtagttcaggcaaaattggggcaaggaaaagaatttatt 15234380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 39856630 - 39857195
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39856630 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 39856729  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct----------actttca 216  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||          |||||||    
T  39856730 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaactcttttttcttctactttca 39856829  T
Q  217 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa- 315  Q
    ||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||     
T  39856830 aagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaa 39856923  T
Q  316 gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagga 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  39856924 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagga 39857023  T
Q  416 tagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  39857024 tagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaa 39857122  T
Q  516 aatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39857123 aatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagtccaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 39857195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 51 - 588
Target Start/End: Original strand, 1673877 - 1674421
Alignment:
Q  51 aattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgc 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  1673877 aattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggtgtcactc 1673976  T
Q  151 cttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctact-----------ttcaaagctatgtacnnnnnnnncatt 239  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||           |||||||| ||||||         |||    
T  1673977 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactatctttctactttcaaagccatgtacaaaaaat--att 1674074  T
Q  240 ttctttctatcttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtaca 338  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1674075 ttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaagcaaacttgagcaacagggtaca 1674174  T
Q  339 ttcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaa 438  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1674175 ttcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttgatgtctatttcaat--gtgttacaagcaggttcttccctaggatagtctgtggtcaatggcaagaa 1674272  T
Q  439 tgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgac 538  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||| || || |||||||    
T  1674273 tgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaaccctaaagggcgtcttagtc-aaaaattagcactccgctggattgac 1674371  T
Q  539 aacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1674372 aatccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 1674421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 54839379 - 54839951
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54839379 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 54839478  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------c 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||          |    
T  54839479 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgcttgaaactctattttcttctac 54839578  T
Q  212 tttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
    |||||||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||    
T  54839579 tttcaaagctatatacaaat----cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattt 54839672  T
Q  311 tgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 409  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |     
T  54839673 tgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcct 54839772  T
Q  410 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatg-aaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactta 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  54839773 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaattgaataggctcgctaagttgagaacccgaaagggcggctta 54839872  T
Q  509 ggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  54839873 ggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccggaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 54839951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 45 - 588
Target Start/End: Original strand, 14104554 - 14105102
Alignment:
Q  45 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14104554 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 14104653  T
Q  145 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagctatgtacnnnnnn 233  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||           |||||||||||||| |||          
T  14104654 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaa-- 14104751  T
Q  234 nncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaa 332  Q
      |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  14104752 --cattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 14104847  T
Q  333 ggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatgg 432  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  14104848 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatgg 14104947  T
Q  433 caagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcg 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| || |    
T  14104948 caagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aagaatgagcaccccgctgg 14105046  T
Q  533 attgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14105047 attgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 14105102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 45 - 588
Target Start/End: Original strand, 30759775 - 30760322
Alignment:
Q  45 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30759775 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 30759874  T
Q  145 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc----------aaagctatgtacnnnnnnn 234  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||          |||||||| |||           
T  30759875 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctattttcaaagctatatacaaat--- 30759971  T
Q  235 ncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaag 333  Q
     ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  30759972 -cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 30760068  T
Q  334 gtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggc 433  Q
    |||| ||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30760069 gtactttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatggc 30760168  T
Q  434 aagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcga 533  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  30760169 aagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccgctgga 30760267  T
Q  534 ttgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30760268 ttgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 30760322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 45 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 33668055 - 33667508
Alignment:
Q  45 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33668055 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 33667956  T
Q  145 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc----------aaagctatgtacnnnnnnn 234  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||          |||||||| |||           
T  33667955 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctattttcaaagctatatacaaat--- 33667859  T
Q  235 ncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaag 333  Q
     ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  33667858 -cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 33667762  T
Q  334 gtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggc 433  Q
    |||| ||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  33667761 gtactttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatggc 33667662  T
Q  434 aagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcga 533  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||    
T  33667661 aagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggca-aaaatgagcaccccgctgga 33667563  T
Q  534 ttgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  33667562 ttgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 33667508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 40099892 - 40099341
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40099892 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 40099793  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagctatgtacnnn 230  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||              ||||||||||||||||| |||       
T  40099792 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 40099693  T
Q  231 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 329  Q
         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40099692 a----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 40099599  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    || ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  40099598 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 40099499  T
Q  430 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccc 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| |    
T  40099498 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aagaatgagcaccccgc 40099400  T
Q  530 tcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  40099399 tggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 40099341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 43 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 14753749 - 14753198
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753749 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 14753650  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||          ||||||||||||| |||         
T  14753649 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaactctattttcttctactttcaaagctatatacaaaa- 14753551  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt--gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 329  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  14753550 ---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaa 14753456  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    || ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  14753455 cagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 14753357  T
Q  430 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccc 529  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  14753356 tggcaagaatgaaaaaacagaataaaaatgcatgaaaataaataggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggca-aaaatgagcaccccgc 14753258  T
Q  530 tcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttattg 589  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14753257 tggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttattg 14753198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 27157586 - 27157017
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27157586 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27157487  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactt 213  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              |||||||    
T  27157486 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactt 27157387  T
Q  214 tcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 313  Q
    |||||||||| |||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  27157386 tcaaagctatatacaaaaat---attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttga 27157292  T
Q  314 aa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||    
T  27157291 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctcca 27157192  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27157191 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaataaaaatgcatgaaaataaacgagctcgctaagttgaaaacctgaaagggcggcttaggca 27157092  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27157091 -aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 27157017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 20332678 - 20332128
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20332678 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 20332579  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagctatgtacnnn 230  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||||||||||||||||| |||       
T  20332578 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 20332479  T
Q  231 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 329  Q
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20332478 at----attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 20332385  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    || ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  20332384 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 20332285  T
Q  430 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccc 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| |    
T  20332284 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aagaatgagcaccccgc 20332186  T
Q  530 tcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | |||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20332185 tggattgaaaacccaaaagggtagttcaggcaaaaatggggcaa-gaaaagaatctatt 20332128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 22 - 589
Target Start/End: Original strand, 6575850 - 6576416
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6575850 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 6575949  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------a 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||           |    
T  6575950 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttcttttta 6576049  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
    ||||||||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||       |    
T  6576050 ctttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttctt-------t 6576138  T
Q  311 tgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccc 410  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |    
T  6576139 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctc 6576237  T
Q  411 caggatagtctgtggtcaatgg-caagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 509  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6576238 caggatagtctgtggtcaatgggcaagaatgaaaaaacagaataaaaatgcatgaaaatgaatgagctcgctaagttgaaaacccggaagggcgacttag 6576337  T
Q  510 gcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttattg 589  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6576338 gc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttattg 6576416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 5011870 - 5012438
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5011870 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 5011969  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctacttt----------- 214  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||               
T  5011970 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctacttttcttctacttt 5012069  T
Q  215 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 313  Q
    ||||||||| |||        |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||   ||||||||| ||||||    
T  5012070 caaagctatatacaaat----cattttctttctacttggataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaac--tttttgtctattttga 5012163  T
Q  314 aa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    || |||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  5012164 aaagcaaacctgagcaacagggcacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 5012263  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||     
T  5012264 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagtcgaaaacccggaagggcggcttaggc- 5012362  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5012363 aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagctcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 5012438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Original strand, 24118672 - 24119222
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24118672 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 24118771  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||           |||||||||||||| |||        
T  24118772 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaa 24118871  T
Q  232 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 329  Q
        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||   ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  24118872 ----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaaccggagcaa 24118965  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    || ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||  | |||||||||||| || ||| ||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  24118966 cagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgctggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtccgtggtcaa 24119064  T
Q  430 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccc 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  24119065 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccgc 24119163  T
Q  530 tcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24119164 tggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 24119222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Original strand, 5700549 - 5701100
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaagctttgtaaatccgtg 141  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5700549 tgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtg 5700648  T
Q  142 gagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||          ||||||||||||| |||        
T  5700649 gagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctattttcttctactttcaaagctatatacaaaa 5700748  T
Q  232 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 329  Q
        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||   ||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  5700749 ----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaa 5700842  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    || ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  5700843 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 5700942  T
Q  430 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccc 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  5700943 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaagtgaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc-aaaaatgagcaccccgc 5701041  T
Q  530 tcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  5701042 tggattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcatggaaaagaatttatt 5701100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 14671009 - 14671573
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  14671009 tcatcaaaagctcctacgcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 14671108  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------acttt 214  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||           |||||    
T  14671109 gctttgtaaatccgtggagttacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttacttt 14671208  T
Q  215 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg 312  Q
    ||||| |||||||        ||||||| |||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |      
T  14671209 caaagttatgtacaagaa---cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttt-------tga 14671298  T
Q  313 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | | |    
T  14671299 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcta 14671398  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  14671399 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaacgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc- 14671497  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14671498 aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 14671573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 34183218 - 34182669
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183218 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 34183119  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||           ||||||||||||| |||        
T  34183118 agtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 34183019  T
Q  232 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 329  Q
        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  34183018 ----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac---ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 34182926  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    || ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  34182925 cagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggataatctgtggtcaa 34182827  T
Q  430 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccc 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  34182826 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcataaaaacaaatgagctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggca-aaaatgagcaccccgc 34182728  T
Q  530 tcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  34182727 tggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 34182669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 17019045 - 17019609
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  17019045 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaa 17019144  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc---------- 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||              
T  17019145 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctatgcttttgtttgaaactctgctttctttttacttt 17019244  T
Q  216 --aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg 312  Q
      ||||||||||||        ||||||| |||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||       |      
T  17019245 caaaagctatgtacaaaaa---cattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgagaattgaaaaagtttttt-------tga 17019334  T
Q  313 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  17019335 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 17019433  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaa-aacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17019434 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc 17019533  T
Q  512 aaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17019534 -aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggaaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 17019609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 34 - 588
Target Start/End: Original strand, 21975704 - 21976264
Alignment:
Q  34 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 133  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  21975704 aagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 21975803  T
Q  134 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagcta 222  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||           |||||||||||||    
T  21975804 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgcgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagcta 21975903  T
Q  223 tgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaac 321  Q
    | |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| ||||||    
T  21975904 tatacaaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaaac 21975998  T
Q  322 ctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtct 421  Q
    | |||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  21975999 ccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtct 21976098  T
Q  422 gtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgag 521  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21976099 atggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagtcgaaaactcgaaagggcggcttaggc-aaaaatgag 21976197  T
Q  522 cacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21976198 caccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaacttatt 21976264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 34 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 31120776 - 31120215
Alignment:
Q  34 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 133  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  31120776 aagcttctgtacttgtggattcgaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtg 31120677  T
Q  134 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagcta 222  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||           |||||||||||||    
T  31120676 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagcta 31120577  T
Q  223 tgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacc 322  Q
    | |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| | | | |||  ||||||||||    
T  31120576 tatacaaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttgaaaagcaaacc 31120480  T
Q  323 tgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctg 422  Q
     |||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  31120479 cgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctg 31120380  T
Q  423 tggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  31120379 tggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaattgaaaaggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggca-aaaatgagc 31120281  T
Q  523 acccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31120280 accccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaacttatt 31120215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 24586634 - 24586066
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24586634 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 24586535  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac------------tctactt 213  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||             |||||||    
T  24586534 gctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactt 24586435  T
Q  214 tcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 313  Q
    |||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  24586434 tcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataaggacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttga 24586341  T
Q  314 aa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    || |||||||||||||| | ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  24586340 aaagcaaacctgagcaatagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 24586241  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24586240 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagtcgaagacccgaaagggcgacttaggca 24586141  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaa-cccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24586140 -aaaatgagcaccccgctggattgacaaccccaaaagggtagttcaggcaaaaatggggcaa-gaaaagaatctatt 24586066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 36338774 - 36338230
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36338774 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccgccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 36338675  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||           ||||||||||||| |||        
T  36338674 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 36338575  T
Q  232 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaaca 331  Q
        |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||       |  |||||||||||||||||||    
T  36338574 ----cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttttt-------tgaaaagcaaacctgagcaaca 36338486  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| |||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  36338485 gggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 36338387  T
Q  432 gcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctc 531  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||     
T  36338386 gcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgagaacccgaaagggcgacctaggc-aaaaatgagcaccccgctg 36338288  T
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat-ggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36338287 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatgggggcattgaaaagaatttatt 36338230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 27 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 18794889 - 18794331
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18794889 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaaaaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 18794790  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 215  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            |||||||||    
T  18794789 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttc 18794690  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacat-cttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 314  Q
    |||||||| |||        ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||| | |||||||    
T  18794689 aaagctatatacaaaa----cattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaac--tttttgtttattttgaa 18794596  T
Q  315 a-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    | |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||    
T  18794595 aagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 18794496  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18794495 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaacaaaaatgcatgaaaacaaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca- 18794397  T
Q  514 aaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaa 579  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18794396 aaaatgagcaccccgctggattgacaacctgaaaaggcagttcaggcaaaaatggggcaataaaaa 18794331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 124 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 36324484 - 36324021
Alignment:
Q  124 aagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ct 212  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||           ||    
T  36324484 aagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctact 36324385  T
Q  213 ttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg 312  Q
    ||||||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||       |      
T  36324384 ttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttttt-------tga 36324296  T
Q  313 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| |||||| || ||| | |||    
T  36324295 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctcca 36324197  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  36324196 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgagaacccgaaagggcgacctaggc- 36324098  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat-ggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36324097 aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatgggggcattgaaaagaatttatt 36324021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 487 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 1879001 - 1878928
Alignment:
Q  487 gaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggc 560  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  | |||||| ||||||||||||| || |||||    
T  1879001 gaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaaaagagcatcccggtggattgaaaacccgaaagggcggtccaggc 1878928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 551
Target Start/End: Original strand, 9189178 - 9189254
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggc 551  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||  |||  | |||||| |||||||||||||    
T  9189178 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcggcttaggtaaaaaatgagcgtcccggtggattgaaaacccgaaagggc 9189254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 475 - 516
Target Start/End: Original strand, 33184026 - 33184067
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa 516  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33184026 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaa 33184067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 475 - 559
Target Start/End: Original strand, 22709707 - 22709791
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcagg 559  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  |||  | ||  || ||||||||||||| |||||||    
T  22709707 gctcgccaagttgaaaacctgaaaaggcggcttaggcaaaaaatgagcgtcccggtggaccgaaaacccgaaagggcggttcagg 22709791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 8097902 - 8097855
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 522  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  8097902 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagc 8097855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 475 - 516
Target Start/End: Original strand, 20558764 - 20558805
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa 516  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  20558764 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcggcttaggcaaaaa 20558805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 477 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 55791736 - 55791648
Alignment:
Q  477 tcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||||||||||||||| |||| || | |||||||| |||||||||  |||  | |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  55791736 tcgctaagttgaaaacctgaaaaggtggcttaggca-aaaatgagcgtcccggtggattgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 55791648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 383; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 27396298 - 27396883
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  27396298 catcttcatcagaagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccatttt 27396397  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc------ 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||          
T  27396398 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttcta 27396497  T
Q  216 -----aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa--------agtttttt 302  Q
         ||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||    
T  27396498 ctttcaaagctatgtacaaaaaa--cattttctttctatctttataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaaaaagtttttt 27396595  T
Q  303 gtctgttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcagg 402  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27396596 gtcctttttgaaagcaaacctaagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 27396695  T
Q  403 ctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatg---aaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27396696 ctcttccccaggatagtctgtggccaatggcaagaatgaaaaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaag 27396795  T
Q  500 ggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27396796 ggcgacttaggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccaaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 27396883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 19450694 - 19450113
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19450694 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccatttt 19450595  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------- 210  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||               
T  19450594 ccaagctttgtaaatccgtggaatcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaattcgagcatgtgcttttgtttgaaactctattttctctcta 19450495  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnn-cattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagt----tttttgtc 305  Q
    ||||||||| |||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||    
T  19450494 ctttcaaaggtatgtacaaaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagtttttgtc 19450395  T
Q  306 tgttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctc 405  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19450394 tgttttgaaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaatgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttataagcaggctc 19450295  T
Q  406 ttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgac 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19450294 ttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgac 19450195  T
Q  506 ttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19450194 ttaggca-aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagagcggttcaggcaaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 19450113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 21697431 - 21696881
Alignment:
Q  34 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21697431 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgta 21697332  T
Q  134 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctact-----------ttcaaagcta 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||           ||||||||||    
T  21697331 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactatcttcctactttcaaagcta 21697232  T
Q  223 tgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaac 321  Q
    |||||        |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21697231 tgtacaaaaaa--cattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttgaaagcaaac 21697134  T
Q  322 ctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtct 421  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21697133 ctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccaggatagtct 21697034  T
Q  422 gtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgag 521  Q
    ||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21697033 gtggtcaatggcaagaatgaaa-------------atgcatgaaaatgaatgggcttgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc-aaaaatgag 21696948  T
Q  522 cacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21696947 caccccactggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcgatgaaaagaatttatt 21696881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 27122505 - 27123070
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27122505 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27122604  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttca 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||          ||||||    
T  27122605 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctttgcttttgtttaaaactctattttcttctactttca 27122704  T
Q  217 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga-aa 315  Q
    ||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||    
T  27122705 aagctatatacaaaa----cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgagaa 27122798  T
Q  316 gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagga 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  27122799 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagga 27122898  T
Q  416 tagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  27122899 tagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaattgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaa 27122997  T
Q  516 aatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27122998 aatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 27123070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 37383657 - 37384224
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  37383657 tcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 37383756  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------cttt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||           ||||    
T  37383757 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 37383856  T
Q  215 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 314  Q
    ||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||    
T  37383857 caaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaa 37383950  T
Q  315 a-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||    
T  37383951 aagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccag 37384050  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  37384051 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-a 37384149  T
Q  514 aaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  37384150 aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 37384224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 39896043 - 39896615
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctagg-aaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattt 120  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39896043 catcgtcatctgaagcttctgtacttgagaattcaaagtttttggggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 39896142  T
Q  121 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta---------- 210  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||              
T  39896143 tccgagctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttct 39896242  T
Q  211 -ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtt 309  Q
     ||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| ||    
T  39896243 actttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctatt 39896336  T
Q  310 ttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 408  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  39896337 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcc 39896436  T
Q  409 cccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactta 508  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896437 tccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaataaaaatgcatgaaaatgaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactta 39896536  T
Q  509 ggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39896537 ggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 39896615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Original strand, 34160840 - 34161393
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34160840 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 34160939  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||           |||||||||||||| |||        
T  34160940 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 34161039  T
Q  232 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt---gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagc 327  Q
        |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  34161040 ----cattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 34161133  T
Q  328 aacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtc 427  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  34161134 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgtcacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtc 34161233  T
Q  428 aatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccc 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34161234 aatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aaaaatgagcacccc 34161332  T
Q  528 cctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  34161333 gctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatcgaaaagaatttatt 34161393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Original strand, 16167475 - 16168025
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16167475 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 16167574  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||| ||| |||         
T  16167575 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttcaaagttatatacaaaaa 16167674  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaaca 331  Q
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16167675 t---attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 16167769  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16167770 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagggtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 16167869  T
Q  432 gcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctc 531  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||     
T  16167870 gcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaattgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aagaatgagcaccccgctg 16167968  T
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16167969 gattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 16168025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 27809676 - 27810250
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27809676 catcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 27809775  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac--------------t 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||               |    
T  27809776 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttttctt 27809875  T
Q  208 ctactttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctg 307  Q
    |||||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||     
T  27809876 ctactttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtcta 27809969  T
Q  308 ttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctct 406  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  27809970 ttttgaaaagcaaacctgagcaacaggttacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttct 27810069  T
Q  407 tccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgact 506  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27810070 cctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggct 27810169  T
Q  507 taggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||| || |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27810170 taggc-aagaatgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 27810250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 254897 - 254347
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  254897 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 254798  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagctatgtacnnn 230  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||||||||||||||||| |||       
T  254797 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 254698  T
Q  231 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 329  Q
         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  254697 a----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac---ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 254605  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    || ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  254604 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 254505  T
Q  430 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccc 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| |    
T  254504 tggcaagaatgaaaaaacagaatgagaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aagaatgagcaccccgc 254406  T
Q  530 tcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  254405 tggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 254347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 9344232 - 9343682
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344232 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 9344133  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||           ||||||||||||| |||         
T  9344132 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaa- 9344034  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaac 330  Q
       ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  9344033 ---cattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtccattttgaaaagcaaacctgagcaac 9343939  T
Q  331 aaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 430  Q
    | ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  9343938 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaat 9343839  T
Q  431 ggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccct 530  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  9343838 agcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcaacttaggca-aaaatgagcaccccgct 9343740  T
Q  531 cgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9343739 ggattgataacccaaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 9343682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 37946111 - 37945560
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37946111 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 37946012  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagctatgtacnnn 230  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||||||||||||||||| |||       
T  37946011 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 37945912  T
Q  231 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 329  Q
         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  37945911 a----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 37945818  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    || ||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  37945817 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtaagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 37945718  T
Q  430 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccc 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| |    
T  37945717 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aagaatgagcaccccgc 37945619  T
Q  530 tcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  37945618 tggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 37945560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 12592785 - 12593361
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12592785 catcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 12592884  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac------------tct 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||             |||    
T  12592885 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttct 12592984  T
Q  210 actttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt----gaaaattgaaaaagttttttgtc 305  Q
    |||||||||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||   ||||||||    
T  12592985 actttcaaagctatatacaaaa----cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaac--tttttgtc 12593078  T
Q  306 tgttttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggct 404  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12593079 tattttggaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggtt 12593178  T
Q  405 cttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcga 504  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  12593179 ctcctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcgg 12593278  T
Q  505 cttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||| || |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12593279 cttaggc-aagaatgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagtccaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 12593361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 40239489 - 40240055
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40239489 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 40239588  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 215  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            |||||||||    
T  40239589 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttc 40239688  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 315  Q
    |||| ||| |||         |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  40239689 aaagttatatacaaaaat---attttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaa 40239783  T
Q  316 -gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 414  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | |||||||||||| || ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  40239784 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccagg 40239882  T
Q  415 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaa 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  40239883 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aa 40239981  T
Q  515 aaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  40239982 aaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatcgaaaagaatttatt 40240055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 12710863 - 12710296
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12710863 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 12710764  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttca 216  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||          ||||||    
T  12710763 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctattttcttctactttca 12710664  T
Q  217 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt--gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 314  Q
    ||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  12710663 aagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaa 12710570  T
Q  315 a-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    | |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |  |||    
T  12710569 aagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcag 12710470  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  12710469 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggca- 12710371  T
Q  514 aaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12710370 aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 12710296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 34 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 16823592 - 16823032
Alignment:
Q  34 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 133  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  16823592 aagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 16823493  T
Q  134 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagcta 222  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||           |||||||||||||    
T  16823492 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagcta 16823393  T
Q  223 tgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaac 321  Q
    | |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| ||||||    
T  16823392 tatacaaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaaac 16823298  T
Q  322 ctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtct 421  Q
    | |||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  16823297 ccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtct 16823198  T
Q  422 gtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgag 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16823197 gtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggca-aaaatgag 16823099  T
Q  522 cacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16823098 caccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaacttatt 16823032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 34 - 588
Target Start/End: Original strand, 16897888 - 16898448
Alignment:
Q  34 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 133  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  16897888 aagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 16897987  T
Q  134 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagcta 222  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||           |||||||||||||    
T  16897988 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagcta 16898087  T
Q  223 tgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaac 321  Q
    | |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| ||||||    
T  16898088 tatacaaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaaac 16898182  T
Q  322 ctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtct 421  Q
    | |||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  16898183 ccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtct 16898282  T
Q  422 gtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgag 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16898283 gtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgag 16898381  T
Q  522 cacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16898382 caccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaacttatt 16898448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Original strand, 31882284 - 31882833
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882284 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 31882383  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttcaaagctatgtacnnnnnn 233  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||          ||||||||||||| |||          
T  31882384 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctattttcttctactttcaaagctatatacaaaa-- 31882481  T
Q  234 nncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaaca 331  Q
      |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||     
T  31882482 --cattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaatt-aaaaactttttt-tctattttgaaaagcaaacttgagcaacg 31882577  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||| |||  |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31882578 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 31882677  T
Q  432 gcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctc 531  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  31882678 gcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc-aaaaatgagcaccccgctg 31882776  T
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  31882777 gattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaagatggggcattgaaaagaatttatt 31882833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 11629451 - 11628880
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11629451 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 11629352  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc------ 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||          
T  11629351 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttttat 11629252  T
Q  216 ----aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
        |||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||   | ||||||| |||    
T  11629251 tttcaaagctatatacaaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaac--tctttgtctattt 11629157  T
Q  311 tgaaag-caaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 409  Q
    |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |     
T  11629156 tgaaaaacaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcct 11629058  T
Q  410 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  11629057 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaatgagctcgctaaggtgaaaacccgaaagggcggcttag 11628958  T
Q  510 gcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11628957 gca-aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 11628880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Original strand, 34297152 - 34297696
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34297152 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 34297251  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||           |||||||||||||| |||        
T  34297252 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 34297351  T
Q  232 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaaca 331  Q
        |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||       |  |||||||||||||||||||    
T  34297352 ----cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttcgaaaattgaaaaagtttttt-------tgaaaagcaaacctgagcaaca 34297440  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34297441 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 34297540  T
Q  432 gcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctc 531  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||| ||     
T  34297541 gcaagattgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaagc-aaaaatgagcaccccgctg 34297639  T
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  34297640 gattgacaacccaaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 34297696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 22 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 37680160 - 37679587
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattt 120  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  37680160 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 37680061  T
Q  121 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta---------- 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||              
T  37680060 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttcta 37679961  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt--gaaaattgaaaaagttttttgtctgt 308  Q
    ||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||   |||||||||| |    
T  37679960 ctttcaaagctatatacaaaaa---cattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaat--ttttttgtctat 37679866  T
Q  309 tttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctctt 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||     
T  37679865 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctc 37679766  T
Q  408 ccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactt 507  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  37679765 ctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaattgaataggctcgctaagttggaaacccgaaagggcggctt 37679666  T
Q  508 aggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttat 587  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  37679665 aggca-aaaatgagcaccccgctggattgacgacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttat 37679587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 22 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 37695425 - 37694852
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattt 120  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  37695425 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 37695326  T
Q  121 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta---------- 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||              
T  37695325 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttcta 37695226  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt--gaaaattgaaaaagttttttgtctgt 308  Q
    ||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||   |||||||||| |    
T  37695225 ctttcaaagctatatacaaaaa---cattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaat--ttttttgtctat 37695131  T
Q  309 tttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctctt 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||     
T  37695130 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctc 37695031  T
Q  408 ccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactt 507  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  37695030 ctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaattgaataggctcgctaagttggaaacccgaaagggcggctt 37694931  T
Q  508 aggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttat 587  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  37694930 aggca-aaaatgagcaccccgctggattgacgacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttat 37694852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 54 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 19410721 - 19410179
Alignment:
Q  54 tcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgcctt 153  Q
    ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19410721 tcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctt 19410622  T
Q  154 cggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaact--------------ctactttcaaagctatgtacnnnnnnnncatt 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |              ||||||||||||||||  ||        ||||    
T  19410621 cggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaa----catt 19410526  T
Q  240 ttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtaca 338  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| | |||     
T  19410525 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggatacc 19410428  T
Q  339 ttcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaa 438  Q
    ||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410427 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaa 19410328  T
Q  439 tgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgac 538  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  19410327 tgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggca-aaaatgagcaccccgctggattgac 19410229  T
Q  539 aacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19410228 aacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 19410179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 54 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 22922380 - 22921838
Alignment:
Q  54 tcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgcctt 153  Q
    ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22922380 tcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctt 22922281  T
Q  154 cggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaact--------------ctactttcaaagctatgtacnnnnnnnncatt 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |              |||||||||||||||| |||        ||||    
T  22922280 cggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaa----catt 22922185  T
Q  240 ttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtaca 338  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  22922184 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacc 22922087  T
Q  339 ttcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaa 438  Q
    ||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922086 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaa 22921987  T
Q  439 tgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgac 538  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||     
T  22921986 tgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggca-aaaatgagcaccccgctggattgaa 22921888  T
Q  539 aacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  22921887 aacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattaaaaagaatttatt 22921838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 22 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 21671440 - 21670865
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattt 120  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21671440 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 21671341  T
Q  121 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta---------- 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||              
T  21671340 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttcta 21671241  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt--gaaaattgaaaaagttttttgtctgt 308  Q
    ||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||   |||||||||| |    
T  21671240 ctttcaaagctatatacaaaaa---cattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaatt-ttttttgtctat 21671145  T
Q  309 tttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctctt 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||     
T  21671144 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctc 21671045  T
Q  408 ccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaa-aaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgact 506  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21671044 ctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaattgaataggctcgctaagttggaaacccgaaagggcggct 21670945  T
Q  507 taggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttat 587  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21670944 taggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacgacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttat 21670865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 23122835 - 23122271
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23122835 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaa 23122736  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------acttt 214  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||           |||||    
T  23122735 gctttgcaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttacttt 23122636  T
Q  215 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 313  Q
    ||||| |||||||        ||||||| |||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |  |    
T  23122635 caaagttatgtacaaaaa---cattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttt-------tgaa 23122546  T
Q  314 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| | ||||    
T  23122545 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccag 23122447  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaa--cagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23122446 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc 23122347  T
Q  512 aaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23122346 a-aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 23122271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 22 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 34269188 - 34268625
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  34269188 catcttcatcaaaagctcccatgcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattct 34269089  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------- 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||               
T  34269088 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcatgtgcttttgtttaaaactctattttcttttta 34268989  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgt 308  Q
    ||||||||| |||||||        ||||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         
T  34268988 ctttcaaagttatgtacaaaaa---cattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaaagttttttga---- 34268896  T
Q  309 tttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 408  Q
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||    
T  34268895 ----aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagattcttc 34268800  T
Q  409 cccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactta 508  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  34268799 tctaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggctta 34268700  T
Q  509 ggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatt 584  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34268699 ggca-aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatt 34268625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Original strand, 37931369 - 37931926
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37931369 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 37931468  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac------------------tctactttcaaagctatgt 225  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||                   ||||||||||||||||| |    
T  37931469 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttttttttcttctactttcaaagctatat 37931568  T
Q  226 acnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacct 323  Q
    ||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||    
T  37931569 acaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtttattttgaaaagcaaacct 37931662  T
Q  324 gagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgt 423  Q
    |||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | || |||||||||||    
T  37931663 gagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgt 37931762  T
Q  424 ggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagca 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37931763 ggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc-aaaaatgagca 37931861  T
Q  524 cccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  37931862 ccccgctggattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 37931926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 27428692 - 27428148
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27428692 tgcttgtgagttcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27428593  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||           ||||||||| ||||| |        
T  27428592 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttctttttactttcaaagttatgtgcaaaa 27428493  T
Q  232 nnnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaa 329  Q
        ||||||| |||||| || | ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||           |||||||||||||||||    
T  27428492 a---cattttccttctatttttaataatgacaaatgttcgaaacaaacatcttgaaaattgcaaaagtttttga---------aaagcaaacctgagcaa 27428405  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    || ||||||||||||| || |  ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27428404 cagggtacattcaaacgaa-cgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcccccaggatagtccgtggtcaa 27428306  T
Q  430 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccc 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  27428305 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggca-aaaatgagcaccccgc 27428207  T
Q  530 tcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27428206 tggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 27428148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Original strand, 20843909 - 20844461
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20843909 gcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 20844008  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc------------aaagctatgtacnnn 230  Q
    || ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||            |||| ||||| |       
T  20844009 agtcacgccttcggctggacaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttaccttcaaaagttatgttcaaa 20844108  T
Q  231 nnnnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagca 328  Q
         ||||||| |||||| || | ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||  ||||||||||||||||    
T  20844109 aaa--cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtttttt------ttgaaaagcaaacctgagca 20844200  T
Q  329 acaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtca 428  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  20844201 acagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtca 20844300  T
Q  429 atggcaagaatg--aaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcaccc 526  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20844301 atggcaagaatgaaaaaaaacagaatgaaaatacatggaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccc 20844399  T
Q  527 ccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20844400 cactggattgacaacccgaaggggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 20844461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 95 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 31868979 - 31868481
Alignment:
Q  95 accaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgct 194  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31868979 accaccaaccaataaaattaccatttttcaagcattgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgct 31868880  T
Q  195 tttgttggaaactcta----------ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-g 283  Q
    ||||||  ||||||||          ||||||||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  31868879 tttgtttaaaactctattttcttctactttcaaagctatatacaaat----cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttg 31868784  T
Q  284 aaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctattt 382  Q
    |||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||||    
T  31868783 aaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctattt 31868686  T
Q  383 caatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgcta 482  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  31868685 caatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaataaaaatgcatgaaaataaataagctcgcta 31868586  T
Q  483 agttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaa 582  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31868585 agttgaaaacccgaaagaacgacttaggca-aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaa 31868487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 27 - 502
Target Start/End: Original strand, 12661519 - 12662000
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12661519 tcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 12661618  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttc 215  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||           |||||    
T  12661619 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 12661718  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 315  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  12661719 aaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaa 12661812  T
Q  316 -gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 414  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  12661813 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagg 12661912  T
Q  415 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||    
T  12661913 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaagtgaataggctcgctggattgacaacccgaaagggc 12662000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 22 - 516
Target Start/End: Original strand, 3788469 - 3788969
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3788469 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 3788568  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tcta 210  Q
    ||||||||| |||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            ||||    
T  3788569 ccaagctttataaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttcta 3788668  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
    ||||||||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||    
T  3788669 ctttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattt 3788762  T
Q  311 tgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 409  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| |     
T  3788763 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcct 3788862  T
Q  410 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  3788863 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaattgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcaattcag 3788962  T
Q  510 gcaaaaa 516  Q
    |||||||    
T  3788963 gcaaaaa 3788969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 44 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 39046067 - 39045534
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39046067 gcttgcgaattcaaagtttccagaaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccactaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 39045968  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||           ||||||||||||| |||         
T  39045967 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaa- 39045869  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaac 330  Q
       ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  39045868 ---cattttctttccattttaataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 39045774  T
Q  331 aaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 430  Q
    | ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  39045773 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaat 39045674  T
Q  431 ggcaagaatgaa--aaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcaccccc 528  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||     
T  39045673 ggcaagaatgaaaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaagactcgctaagtcgaaaacccggaagggcggcttaggc-aagaatgagcaccccg 39045575  T
Q  529 ctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggg 569  Q
    || |||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  39045574 ctggattgaaaacccgaaagggcgatccaggcaaaaatggg 39045534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 27 - 579
Target Start/End: Original strand, 27782212 - 27782771
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27782212 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27782311  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctctactttc 215  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||            |||| ||||    
T  27782312 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactctattttcttctattttc 27782411  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-a 313  Q
    |||||||| |||        ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||| | ||||| |    
T  27782412 aaagctatatac----aaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtttattttgaa 27782505  T
Q  314 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| |||| |||| ||| | ||||    
T  27782506 aagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccag 27782605  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaa-tgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||   |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27782606 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaacaaaaatgcatgaaaacaaaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc- 27782704  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaa 579  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27782705 aaaaatgagcaccccgctggattgacaacctgaaaaggcagttcaggcaaaaatggggcaataaaaa 27782771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 44 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 13930791 - 13930258
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13930791 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 13930692  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac------------tctactttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
    | |  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||             ||||||||||||||||| |||        
T  13930691 gtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 13930592  T
Q  232 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 329  Q
        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13930591 a---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 13930497  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    || ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||    
T  13930496 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatgtgttacgagcaggttctcctccaagatagtctgtggtcaa 13930397  T
Q  430 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccc 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| || |    
T  13930396 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaaagtgcatgaaaataaatgagctcgctaagtcgaaaacccggaagggcggcttaggc-aagaatgagcactccgc 13930298  T
Q  530 tcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggg 569  Q
    | ||| || |||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  13930297 tggatcgaaaacccgaaagggcgatccaggcaaaaatggg 13930258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 45 - 502
Target Start/End: Original strand, 34867681 - 34868144
Alignment:
Q  45 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  34867681 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgaaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtagag 34867780  T
Q  145 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc----------aaagctatgtacnnnnnnn 234  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||          |||||||| |||           
T  34867781 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctattttcaaagctatatacaaaa--- 34867877  T
Q  235 ncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaa 332  Q
     ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  34867878 -cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 34867974  T
Q  333 ggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatgg 432  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  34867975 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatgg 34868074  T
Q  433 caagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||   |||| |||||||||||||    
T  34868075 caagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctggattgacaacccgaaagggc 34868144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 22 - 502
Target Start/End: Original strand, 32055777 - 32056263
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  32055777 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 32055876  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------c 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||          |    
T  32055877 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaattctattttcttctac 32055976  T
Q  212 tttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
    |||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||   ||||||| | |||    
T  32055977 tttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaac--tttttgtttattt 32056070  T
Q  311 tgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 409  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| || |||||| ||| |     
T  32056071 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcaggttctcct 32056170  T
Q  410 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggc 502  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  32056171 ccaagataatctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaattaatgagctcgctaagttgacaacccgaaagggc 32056263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 43 - 587
Target Start/End: Original strand, 28888275 - 28888800
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28888275 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 28888374  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           ||||||||||| |||||||        
T  28888375 agtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtac---a 28888471  T
Q  232 nnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaa 329  Q
        ||||||| ||||| | || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||    
T  28888472 aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-------tttgaaaagcaaacctgagcaa 28888564  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    || ||||||||||||   |||| ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  28888565 cagggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 28888663  T
Q  430 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccc 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||                    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  28888664 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaat--------------------gctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccgc 28888742  T
Q  530 tcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttat 587  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28888743 tggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaataaaaagaatttat 28888800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 298 - 588
Target Start/End: Original strand, 23117053 - 23117344
Alignment:
Q  298 tttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaaca 396  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  23117053 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgggcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 23117152  T
Q  397 agcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccga 496  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23117153 agcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgg 23117252  T
Q  497 aagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat-gaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  23117253 aagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattaaaaaagaatttatt 23117344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 476 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 26721168 - 26721085
Alignment:
Q  476 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggc 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  | |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  26721168 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaaa-gagcatcccggtggattgaaaacccgaaagggcagtccaggc 26721085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 532 - 588
Target Start/End: Original strand, 34868125 - 34868181
Alignment:
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  34868125 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 34868181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 31887755 - 31887682
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccacc 100  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  31887755 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccacc 31887682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 534 - 588
Target Start/End: Original strand, 32056246 - 32056300
Alignment:
Q  534 ttgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32056246 ttgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaacttatt 32056300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 475 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 42569323 - 42569232
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  ||   | |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  42569323 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagcgtcctggtggattgaaaacccgaaagggcagtccaggcaaaaat 42569232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 534 - 588
Target Start/End: Original strand, 3788938 - 3788992
Alignment:
Q  534 ttgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3788938 ttgaaaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 3788992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 532 - 588
Target Start/End: Original strand, 12661981 - 12662038
Alignment:
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca-atgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||    
T  12661981 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcatttaaaaagaatttatt 12662038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 474 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 21854752 - 21854704
Alignment:
Q  474 ggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 522  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  21854752 ggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagc 21854704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Original strand, 12386860 - 12386898
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12386860 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 12386898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 20276814 - 20276776
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20276814 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 20276776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 3761190 - 3761105
Alignment:
Q  481 taagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  3761190 taagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 3761105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 20334694 - 20334120
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20334694 catcttcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 20334595  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc------ 215  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||          
T  20334594 ccaagccttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaattgtgcttttgtttgaaactctactttctttcta 20334495  T
Q  216 -----aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
         ||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  20334494 ctttcaaagctatgtacaaaaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt-gtctattt 20334397  T
Q  311 tgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccc 410  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20334396 tgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 20334297  T
Q  411 caggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttagg 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334296 caggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttagg 20334197  T
Q  511 caaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20334196 ca-aaaatgagcaccctgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 20334120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 16202312 - 16201740
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16202312 catcttcatcagaagctcctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggacatgtagtaattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 16202213  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------- 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||               
T  16202212 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttcttttta 16202113  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnn-cattttctttctatctt-gataatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttt-gtct 306  Q
    |||||||||| ||||||         |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16202112 ctttcaaagccatgtacaaaaaaaaacattttctttctatttttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttcgtct 16202013  T
Q  307 gttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctct 406  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  16202012 attttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttct 16201913  T
Q  407 tccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgact 506  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||    
T  16201912 tctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagtt--------gaaagggcgact 16201821  T
Q  507 taggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16201820 taggc-aaaaatgagcaccccgctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 16201740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 20466756 - 20467337
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20466756 catcttcatcagaagcttctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 20466855  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc------ 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||          
T  20466856 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttcca 20466955  T
Q  216 -----aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattg------aaaaagttttttgt 304  Q
         ||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||       |||||  ||  |||    
T  20466956 ctttcaaagctatgtacaaaaac--cattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatcttcaaaattagaaaaaaaaaaagttcctgt 20467053  T
Q  305 ctgttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggct 404  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20467054 ctattttgaaagcaaacctgagcagcaaggtacattcaaacgaaacatgcgtgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggct 20467153  T
Q  405 cttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatg-aaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcg 503  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20467154 cttccccatgatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaaatagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcg 20467253  T
Q  504 acttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20467254 acttaggc-aaaactgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaattgggcaaggaaaagaatttatt 20467337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 45 - 588
Target Start/End: Original strand, 28591085 - 28591632
Alignment:
Q  45 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28591085 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 28591184  T
Q  145 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagctatgtacnnnnnn 233  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||           |||||||||||||| |||          
T  28591185 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa-- 28591282  T
Q  234 nncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaa 332  Q
      |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  28591283 --cattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 28591378  T
Q  333 ggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatgg 432  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  28591379 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcagtgg 28591478  T
Q  433 caagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcg 532  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  28591479 caagaatgaaaaaacagaat-aaaatgcatgaaaatgaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc-aaaaatgagcaccccgctgg 28591576  T
Q  533 attgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  28591577 attgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaacttatt 28591632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Original strand, 28155726 - 28156279
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155726 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 28155825  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||          ||||||||||||| |||         
T  28155826 agtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctactttcaaagctatatacaaaa- 28155924  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt----gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagc 327  Q
       ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  28155925 ---cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 28156019  T
Q  328 aacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtc 427  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  28156020 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtc 28156119  T
Q  428 aatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccc 527  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  28156120 aatggcaagaatgaaaaaacaaaatgaaaatgcatgaaattgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcacccc 28156218  T
Q  528 cctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28156219 gctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 28156279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 51644204 - 51644773
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51644204 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 51644303  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactt 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||              |||||||    
T  51644304 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactt 51644403  T
Q  214 tcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 313  Q
    |||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  51644404 tcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttttgtctattttga 51644498  T
Q  314 aa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  | |||    
T  51644499 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcacctcca 51644598  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  51644599 agataatctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaattgaatgagctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc- 51644697  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  51644698 aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatctatt 51644773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 3647125 - 3647698
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3647125 catcttcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 3647224  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac------------tct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||             |||    
T  3647225 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttct 3647324  T
Q  210 actttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtt 309  Q
    |||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||    
T  3647325 actttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctatt 3647418  T
Q  310 ttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 408  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |    
T  3647419 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcc 3647518  T
Q  409 cccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatg--aaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgact 506  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  3647519 tccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaaaacagaat-aaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacacgaaagggcagct 3647617  T
Q  507 taggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3647618 taggc-aaaaatgagcaccccgctggattgataacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 3647698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 45 - 588
Target Start/End: Original strand, 10951093 - 10951643
Alignment:
Q  45 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 144  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10951093 cttgcggattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggag 10951192  T
Q  145 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
     || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||||||||||||||||| |||        
T  10951193 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 10951292  T
Q  232 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaac 330  Q
        |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  10951293 ----cattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaac 10951386  T
Q  331 aaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 430  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||    
T  10951387 agggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggtcaat 10951486  T
Q  431 ggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccct 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  10951487 ggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc-aaaaatgagcaccccgct 10951585  T
Q  531 cgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10951586 ggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 10951643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 21892025 - 21891463
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21892025 catcttcatcagaagcttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 21891926  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttcaaagct 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     |    
T  21891925 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttt 21891826  T
Q  222 atgtacnnnnnnnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaa 319  Q
    |||| |        ||||||| |||||| || | ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||     |||  |||||||    
T  21891825 atgttcaaaaa---cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaaagttttt-----tttgaaaagcaa 21891734  T
Q  320 acctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagt 419  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||    
T  21891733 acctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtgtgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagt 21891635  T
Q  420 ctgtggtcaatggcaagaatgaa----aaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa 515  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||    
T  21891634 ctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggtggcttaggc-aaa 21891536  T
Q  516 aatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21891535 aatgagcaccccgctggactgacaacctgaaaaggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 21891463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 27 - 587
Target Start/End: Original strand, 10968649 - 10969216
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10968649 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcctgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 10968748  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactt 213  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              |||||||    
T  10968749 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactt 10968848  T
Q  214 tcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 313  Q
    |||||||||| |||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  10968849 tcaaagctatatacaaaat----attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttga 10968942  T
Q  314 aa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||| | |||    
T  10968943 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctcca 10969042  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10969043 ggatggtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataattgagctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggca 10969142  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttat 587  Q
    ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10969143 aaaaa-gagcaccccgctgaattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttat 10969216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 41787583 - 41787014
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  41787583 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 41787484  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttc 215  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||          |||||    
T  41787483 gctttgtgaatccgtggggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttcttctactttc 41787384  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt---gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg 312  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||   ||||||||| |||||    
T  41787383 aaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttg 41787290  T
Q  313 aaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccc 411  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||    
T  41787289 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcc 41787190  T
Q  412 aggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41787189 aggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaataaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc 41787090  T
Q  512 aaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  41787089 a-aaaatgagcaccctgctggattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 41787014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 475 - 517
Target Start/End: Original strand, 2389935 - 2389977
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaa 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2389935 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaa 2389977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 475 - 560
Target Start/End: Original strand, 13457093 - 13457177
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggc 560  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||  |||  | |||||| ||||||||||||| || |||||    
T  13457093 gctcgctaagttgaaaacccaaaagggcggctttggcaaaaaa-gagcgtcccggtggattgaaaacccgaaagggcggtccaggc 13457177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 477 - 550
Target Start/End: Original strand, 13469050 - 13469123
Alignment:
Q  477 tcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaaggg 550  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||  | |||||| ||||||||||||    
T  13469050 tcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagcgtcccggtggattgaaaacccgaaaggg 13469123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 5625888 - 5625850
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  5625888 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 5625850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 476 - 522
Target Start/End: Original strand, 31545354 - 31545400
Alignment:
Q  476 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 522  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31545354 ctcgctaagtcgaaaacctgaaagggcggcttaagcaaaaaatgagc 31545400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 21454734 - 21454697
Alignment:
Q  476 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21454734 ctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 21454697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 477 - 513
Target Start/End: Original strand, 9297885 - 9297921
Alignment:
Q  477 tcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9297885 tcgctaagttgaaaacctgaaagggcggcttaggcaa 9297921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 67)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 22894400 - 22894972
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22894400 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 22894499  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc------ 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||          
T  22894500 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttcta 22894599  T
Q  216 -----aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
         ||||||||||||         ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  22894600 ctttcaaagctatgtacaaaat----attttctttctattttgataatgaccatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaggttttt-gtctattt 22894694  T
Q  311 tgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccc 410  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || ||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  22894695 tgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtatgttgatgtctatttcgatatgtgttacaagcagactcttccc 22894794  T
Q  411 caggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatg-aaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894795 caggatagtctgtggtcaatggcaaaaatgaaaaaacagaataaaaatgcatgaaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 22894894  T
Q  510 gcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22894895 gc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaaggaaaagagtttatt 22894972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 25206261 - 25206840
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattt 120  Q
    |||| |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25206261 catcttcatcagaagctcctatgtttgcgaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 25206360  T
Q  121 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta---------- 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||              
T  25206361 tccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttcttttt 25206460  T
Q  211 -ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttt---gtc 305  Q
     |||||||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  25206461 actttcaaagctatgtacaaaaaa--cattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtc 25206558  T
Q  306 tgttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctc 405  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  25206559 tattttgaaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaaattc 25206658  T
Q  406 ttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgac 505  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25206659 ttccctaggataaactgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgac 25206758  T
Q  506 ttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25206759 ttaggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 25206840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 25270417 - 25270996
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattt 120  Q
    |||| |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25270417 catcttcatcagaagctcctatgtttgcgaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 25270516  T
Q  121 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta---------- 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||              
T  25270517 tccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttcttttt 25270616  T
Q  211 -ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttt---gtc 305  Q
     |||||||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  25270617 actttcaaagctatgtacaaaaaa--cattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtc 25270714  T
Q  306 tgttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctc 405  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  25270715 tattttgaaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaaattc 25270814  T
Q  406 ttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgac 505  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25270815 ttccctaggataaactgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgac 25270914  T
Q  506 ttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25270915 ttaggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 25270996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 589
Target Start/End: Original strand, 26486380 - 26486942
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctagg-aaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattt 120  Q
    |||| ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26486380 catcttcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 26486479  T
Q  121 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttcaaagc 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  26486480 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcaaagc 26486579  T
Q  221 tatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaa 319  Q
    ||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| ||||    
T  26486580 tatatacaaat----cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaa 26486673  T
Q  320 acctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagt 419  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||| |||| |    
T  26486674 acctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataat 26486773  T
Q  420 ctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatg 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26486774 ctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc-aaaaatg 26486872  T
Q  520 agcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttattg 589  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26486873 agcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttattg 26486942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 11555343 - 11555909
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11555343 tcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 11555442  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttc 215  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||           |||||    
T  11555443 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 11555542  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 315  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   || |||||| ||||||||    
T  11555543 aaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--ttcttgtctattttgaaa 11555636  T
Q  316 -gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 414  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||    
T  11555637 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagg 11555736  T
Q  415 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaa 514  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11555737 atagtcggtggtcaatggcaagaatgaaaaaatagaataaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaa 11555836  T
Q  515 aaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11555837 aaa-gagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 11555909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 23631958 - 23632527
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23631958 tcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 23632057  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttc 215  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||           |||||    
T  23632058 cttcgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 23632157  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg--a 313  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |    
T  23632158 aaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatcttgaaaattgaaaaagctttttgtctatttttgaa 23632253  T
Q  314 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||| || ||| | ||||    
T  23632254 aagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttataagccggttctcctccag 23632353  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  23632354 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatggaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-a 23632452  T
Q  514 aaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23632453 aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 23632527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 28655231 - 28655799
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28655231 tcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28655330  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttca 216  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||          ||||||    
T  28655331 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctactttca 28655430  T
Q  217 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt--gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 314  Q
    ||||||| |||        |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  28655431 aagctatatacaaaa----cattttctttctattttaataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac-ttttttgtctattttgaa 28655525  T
Q  315 a-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||    
T  28655526 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 28655625  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  28655626 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaattgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-a 28655724  T
Q  514 aaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  28655725 aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcgttgaaaagaatttatt 28655799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 13180944 - 13180398
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180944 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 13180845  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac------------tctactttcaaagctatgtacnnn 230  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||             ||||||||||||||||| |||       
T  13180844 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 13180745  T
Q  231 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaac 330  Q
         |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||  ||||||||||||||||||    
T  13180744 a----cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttt------ttgaaaagcaaacctgagcaac 13180655  T
Q  331 aaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 430  Q
    | ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  13180654 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcccctccaggatagtctgtggtcaat 13180555  T
Q  431 ggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccct 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  13180554 ggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggca-aaaatgagcaccccgct 13180456  T
Q  531 cgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13180455 ggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 13180398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 45 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 18369686 - 18369137
Alignment:
Q  45 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18369686 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 18369587  T
Q  145 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac------------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||             ||||||||||||||||| |||         
T  18369586 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaccttcgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa- 18369488  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaaca 331  Q
       |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18369487 ---cattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 18369393  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18369392 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 18369293  T
Q  432 gcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctc 531  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||     
T  18369292 gcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggca-aaaatgagcaccccgctg 18369194  T
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18369193 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 18369137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 13318982 - 13318433
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318982 gcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgttatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 13318883  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||           |||||||||||||| |||         
T  13318882 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa- 13318784  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaaca 331  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13318783 ---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaaca 13318689  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||| |||| |||||||||||||    
T  13318688 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggtcaatg 13318589  T
Q  432 gcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctc 531  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| ||     
T  13318588 gcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaatgagctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aagaatgagcaccccgctg 13318490  T
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13318489 gattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 13318433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 22 - 589
Target Start/End: Original strand, 9323461 - 9324033
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctagg-aaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattt 120  Q
    |||| ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9323461 catcttcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 9323560  T
Q  121 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc----- 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||         
T  9323561 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttcta 9323660  T
Q  216 -----aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
         |||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||    
T  9323661 ttttcaaagctatatacaaat----cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattt 9323754  T
Q  311 tgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 409  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |     
T  9323755 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcct 9323854  T
Q  410 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 509  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323855 ccaagataatctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 9323954  T
Q  510 gcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttattg 589  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9323955 gc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttattg 9324033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Original strand, 30174471 - 30175022
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30174471 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 30174570  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagctatgtacnnn 230  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||||||||||||||||| |||       
T  30174571 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 30174670  T
Q  231 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 329  Q
         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30174671 a----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 30174764  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    || ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  30174765 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 30174864  T
Q  430 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccc 529  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| |    
T  30174865 tggcaagaatgaaaaagcagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aagaatgagcaccccgc 30174963  T
Q  530 tcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30174964 tggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 30175022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 45 - 587
Target Start/End: Original strand, 33881133 - 33881681
Alignment:
Q  45 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33881133 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 33881232  T
Q  145 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-ctcta-----------ctttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
     || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||           ||||||||||||| |||         
T  33881233 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttttccactttcaaagctatatacaaaa- 33881331  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaaca 331  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  33881332 ---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 33881426  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  33881427 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggtcaatg 33881526  T
Q  432 gcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctc 531  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||     
T  33881527 gcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccgctg 33881625  T
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttat 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33881626 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttat 33881681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 22 - 589
Target Start/End: Original strand, 12138160 - 12138732
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctagg-aaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattt 120  Q
    |||| ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12138160 catcttcatctgaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 12138259  T
Q  121 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc----- 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||         
T  12138260 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttcta 12138359  T
Q  216 -----aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
         |||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||    
T  12138360 ttttcaaagctatatacaaat----cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattt 12138453  T
Q  311 tgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 409  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |     
T  12138454 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcct 12138553  T
Q  410 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 509  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138554 ccaagataatctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 12138653  T
Q  510 gcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttattg 589  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12138654 gc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttattg 12138732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 37746484 - 37745927
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746484 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 37746385  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-ctcta-----------ctttcaaagctatgtacnnn 230  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||           ||||||||||||| |||       
T  37746384 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttctttttactttcaaagctatatacaaa 37746285  T
Q  231 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 329  Q
         |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37746284 a----cattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaa 37746191  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgt------ctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgt 423  Q
    || ||||||||||||  || || ||||||| ||| ||||||  ||||      |||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  37746190 cagggtacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttaatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgt 37746091  T
Q  424 ggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagca 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  37746090 ggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgatttaggca-aaaatgagca 37745992  T
Q  524 cccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  37745991 ccccgctggattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcaatgaaaggaatttatt 37745927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 9544864 - 9544312
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544864 tgcttgcgaattcaaagtttc-aggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 9544766  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||          ||||||||||||| |||         
T  9544765 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctactttcaaagctatatacaaaa- 9544667  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt----gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagc 327  Q
       ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||   ||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  9544666 ---cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagtaaacctgagc 9544572  T
Q  328 aacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtc 427  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||    
T  9544571 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggtc 9544472  T
Q  428 aatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccc 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  9544471 aatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aagaatgagcacccc 9544373  T
Q  528 cctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9544372 gctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 9544312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 18494939 - 18494373
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| || |||| |||||||| ||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18494939 tcatcaaaagctcctatgctggcgaattcgaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 18494840  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 215  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||            |||||||||    
T  18494839 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttcttctactttc 18494740  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 315  Q
    |||||||| |||         | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  18494739 aaagctatatacaattt----actttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaa 18494646  T
Q  316 -gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 414  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | |||||    
T  18494645 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcgggttctcctccagg 18494546  T
Q  415 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaa 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  18494545 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaagtgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggca-a 18494447  T
Q  515 aaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18494446 aaatgagcacctcgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 18494373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 33298517 - 33299093
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33298517 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 33298616  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tc 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||    
T  33298617 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttttttc 33298716  T
Q  209 tactttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgt 308  Q
    ||||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |    
T  33298717 tactttcaaagctatatacaaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctat 33298811  T
Q  309 tttg---aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctc 405  Q
    |||    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  33298812 ttttgaaaaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttc 33298911  T
Q  406 ttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgac 505  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  33298912 tcctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgagaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcagc 33299011  T
Q  506 ttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  33299012 ttaggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 33299093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 2517054 - 2517622
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2517054 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 2517153  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttca 216  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||          ||||||    
T  2517154 ctttgtgaatccgtggagtcatgccctcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgagattctattttcttctactttca 2517253  T
Q  217 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt---gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 313  Q
    ||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  2517254 aagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttga 2517347  T
Q  314 aa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||| | |||    
T  2517348 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtctatttcaacgtgtgttacaagcaggttctcctcca 2517447  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||     
T  2517448 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggtggcttaggc- 2517546  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  2517547 aaaaatgagcaccccgctgaattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 2517622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 40467708 - 40467156
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40467708 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgtgga 40467609  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||           ||||||||||||| |||         
T  40467608 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaa- 40467510  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaac 330  Q
       ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  40467509 ---cattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 40467415  T
Q  331 aaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 430  Q
    | ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  40467414 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaat 40467315  T
Q  431 ggcaagaatgaa--aaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcaccccc 528  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  40467314 ggcaagaatgaaaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcaacttaggc-aaaaatgagcaccccg 40467216  T
Q  529 ctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  40467215 ctggattgataacccaaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 40467156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 27 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 15652930 - 15652369
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15652930 tcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaag 15652831  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||           ||||||    
T  15652830 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttc 15652731  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 315  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |      |||    
T  15652730 aaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttttttttttaaaaa-aaa 15652636  T
Q  316 gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagga 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  15652635 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagga 15652537  T
Q  416 tagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  15652536 tagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggca-aa 15652438  T
Q  516 aatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatt 584  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15652437 aatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatt 15652369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 33783471 - 33784038
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  33783471 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccatttt 33783570  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------- 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||               
T  33783571 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttcttttta 33783670  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttg--ataatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctg 307  Q
    ||||||||| |||||||        ||||||| |||||| ||   |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  33783671 ctttcaaagttatgtacaaaaa---cattttccttctattttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttga--- 33783764  T
Q  308 ttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctctt 407  Q
         |||||||||| |||||||| ||||||||||||| || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||     
T  33783765 -----aaagcaaaccggagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctc 33783858  T
Q  408 ccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactt 507  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  33783859 ctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggctt 33783958  T
Q  508 aggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  33783959 aggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 33784038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Original strand, 34622524 - 34623076
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34622524 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtgg 34622623  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||           |||||||||||||| |||        
T  34622624 agtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 34622723  T
Q  232 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 329  Q
        |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34622724 ----cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaac--tttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaa 34622817  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    || ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  34622818 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcttctcaaggatagtctgtggtcaa 34622917  T
Q  430 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccc 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  34622918 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggcaaaaaatgagtaccccgc 34623017  T
Q  530 tcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  34623018 tggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 34623076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 41680693 - 41681261
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41680693 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 41680792  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac------------tctacttt 214  Q
    |||||| ||||||||||| |  ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||             ||||||||    
T  41680793 ctttgtgaatccgtggagtcgtgcccttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctacttt 41680892  T
Q  215 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 314  Q
    ||||||||| |||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| | | | |||  ||    
T  41680893 caaagctatatacaaaaat---attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaa 41680989  T
Q  315 agcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 414  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  41680990 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatttatgttacaagcaggttctcctccagg 41681088  T
Q  415 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaa 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  41681089 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aa 41681187  T
Q  515 aaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  41681188 aaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 41681261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 23897858 - 23898425
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23897858 catcttcatcaaaagctcctatgcttccgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 23897957  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------- 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||               
T  23897958 ccaagctttgtaaattcatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttcttttta 23898057  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtt 309  Q
    |||||||||||||||||        |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  23898058 ctttcaaagctatgtacaaaaaaaacattttctttctattttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt---------- 23898147  T
Q  310 ttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 409  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| |||  |||||||  |||||     
T  23898148 -tgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttgcaagcagattcttct 23898246  T
Q  410 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaa-cagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactta 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23898247 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaaccaaaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcactaagttgaaaacccggaagggcggctta 23898346  T
Q  509 ggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23898347 ggc-aaaaatgagcaccccgctggaccgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 23898425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Original strand, 31437469 - 31438013
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437469 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 31437568  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||           |||||||||||||| |||        
T  31437569 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 31437668  T
Q  232 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaaca 331  Q
        |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||       |  |||||||||||||||||||    
T  31437669 ----cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttttt-------tgaaaagcaaacctgagcaaca 31437757  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     ||||||||||||  | ||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||    
T  31437758 gggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggtcaatg 31437857  T
Q  432 gcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctc 531  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||| | ||     
T  31437858 gcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aagaatgagcacctcgctg 31437956  T
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31437957 gattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 31438013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 34 - 588
Target Start/End: Original strand, 3795534 - 3796095
Alignment:
Q  34 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 133  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  3795534 aagcctctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 3795633  T
Q  134 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaact-------------ctactttcaaagc 220  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |             |||||||||||||    
T  3795634 aatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttttcttctactttcaaagc 3795733  T
Q  221 tatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaa 319  Q
    ||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| ||||    
T  3795734 tatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaa 3795827  T
Q  320 acctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagt 419  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| | ||||||||||    
T  3795828 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagt 3795927  T
Q  420 ctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatg 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3795928 ctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaacgaaaacgcatgaaaacaaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatg 3796026  T
Q  520 agcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3796027 agcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 3796095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 24608229 - 24608797
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattt 120  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24608229 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 24608328  T
Q  121 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------t 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||           |    
T  24608329 tccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgcttttgtttgaaactccgctttcttttt 24608428  T
Q  210 actttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctg 307  Q
    |||||||||| |||||||        ||||||| |||||| || | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  24608429 actttcaaagttatgtacaaaaa---cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttga--- 24608522  T
Q  308 ttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctctt 407  Q
         ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || || ||| | |||||||||||| || ||| ||||||||| |||     
T  24608523 -----aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcaagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctc 24608617  T
Q  408 ccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactt 507  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  24608618 ctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaacgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggctt 24608717  T
Q  508 aggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24608718 aggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 24608797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 22 - 589
Target Start/End: Original strand, 6880287 - 6880861
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctagg-aaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattt 120  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6880287 catcttcatctgaatcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 6880386  T
Q  121 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta---------- 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||              
T  6880387 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaagactctatttttcttct 6880486  T
Q  211 -ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgt 308  Q
     ||||||||||||| |||        ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| |    
T  6880487 actttcaaagctatatacaaaa----cattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctat 6880580  T
Q  309 tttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctctt 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||     
T  6880581 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatgtgtgttacaagcaggttctc 6880680  T
Q  408 ccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactt 507  Q
    | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6880681 ctccaagataatctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaattgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggctt 6880780  T
Q  508 aggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttattg 589  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6880781 aggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttattg 6880861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 18122572 - 18122021
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122572 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 18122473  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta------------ctttcaaagctatgtacnnn 230  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||            ||||||||||||| |||       
T  18122472 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttttttctactttcaaagctatatacaat 18122373  T
Q  231 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagca 328  Q
          |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18122372 tt----attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgagaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 18122279  T
Q  329 acaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtca 428  Q
    ||| ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  18122278 acagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagtttctcctccaggatagtctgtggtca 18122180  T
Q  429 atggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcaccccc 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||     
T  18122179 atggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcagcttaggca-aaaatgagcaccccg 18122081  T
Q  529 ctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18122080 ctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 18122021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 45 - 588
Target Start/End: Original strand, 24729977 - 24730526
Alignment:
Q  45 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24729977 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 24730076  T
Q  145 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttcaaagctatgtacnnnnnnn 234  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||          ||||||||||||| |||           
T  24730077 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaattctattttcttctactttcaaagctatatacaaaat-- 24730174  T
Q  235 ncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt--gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaaca 331  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24730175 --attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 24730270  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     |||||| |||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||    
T  24730271 gggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggtcaatg 24730370  T
Q  432 gcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctc 531  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||     
T  24730371 gcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccgctg 24730469  T
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24730470 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 24730526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 52 - 588
Target Start/End: Original strand, 30158048 - 30158590
Alignment:
Q  52 attcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgcc 151  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  30158048 attcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcc 30158147  T
Q  152 ttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctac-----------tttcaaagctatgtacnnnnnnnncattt 240  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||           |||||||||||| |||        |||||    
T  30158148 tttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctacctttcttctactttcaaagctatatacaaaa----cattt 30158243  T
Q  241 tctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtaca 338  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  30158244 tccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtaca 30158341  T
Q  339 ttcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaa 438  Q
    ||||||  ||||| ||||||| |||  |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158342 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaa 30158441  T
Q  439 tgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgac 538  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  30158442 tgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc-aaaaatgagcaccccgctggattgac 30158540  T
Q  539 aacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30158541 aacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 30158590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 34 - 588
Target Start/End: Original strand, 33522378 - 33522939
Alignment:
Q  34 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 133  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  33522378 aagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 33522477  T
Q  134 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct------------actttcaaagct 221  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||            ||||||||||||    
T  33522478 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttcttttttactttcaaagct 33522577  T
Q  222 atgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaa 320  Q
    || |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| |||||    
T  33522578 atatacaaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaaa 33522672  T
Q  321 cctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtc 420  Q
    || |||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| | |||||||||||    
T  33522673 cccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtc 33522772  T
Q  421 tgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatga 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33522773 tgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatga 33522871  T
Q  521 gcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33522872 gcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaacttatt 33522939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 27 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 31820580 - 31820024
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31820580 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 31820481  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc----------a 216  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||          |    
T  31820480 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctattttca 31820381  T
Q  217 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa- 315  Q
    ||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||     
T  31820380 aagctatatacaaat----cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaa 31820287  T
Q  316 gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagga 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |  |||||    
T  31820286 gcaaacctgagcaacaaggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcagga 31820187  T
Q  416 tagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  31820186 tagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggca-aa 31820088  T
Q  516 aatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaa 579  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  31820087 aatgagcaccccgctggattgacaacctgaaaaggcagttcaggcaaaaatggggcaataaaaa 31820024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 22993288 - 22992729
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22993288 tcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtatcgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 22993189  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||           ||||||    
T  22993188 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttc 22993089  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 315  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||       |  |||    
T  22993088 aaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgatgatgctcgaaacaagcattttgaaaattgaaaaagtttttt-------tgaaaa 22993000  T
Q  316 gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagga 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  22992999 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagga 22992901  T
Q  416 tagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  22992900 tagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggca-aa 22992802  T
Q  516 aatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22992801 aatgagcaccctgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 22992729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 32590447 - 32589881
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32590447 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 32590348  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc----------a 216  Q
    |||||| ||| ||||| | || ||||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||          |    
T  32590347 ctttgtgaattcgtggggtcatgcctttggccgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctactttcttctactttca 32590248  T
Q  217 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 315  Q
    ||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  32590247 aagctatatacaaat----cattttctttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaa 32590154  T
Q  316 -gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 414  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  32590153 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagg 32590054  T
Q  415 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaa 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  32590053 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaattgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggca-a 32589955  T
Q  515 aaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  32589954 aaatgagcaccccgctggattgataacccgaaaggacaattcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 32589881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 15753029 - 15752463
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15753029 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 15752930  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------c 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||          |    
T  15752929 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctattttcttctac 15752830  T
Q  212 tttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtttt 311  Q
    |||||||||||| |||        ||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| ||||    
T  15752829 tttcaaagctatatacaaaa----cattttctttct----tgataatgacaatacttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctatttt 15752740  T
Q  312 gaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccc 410  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| || |||||| ||| | |    
T  15752739 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcaggttctcctc 15752640  T
Q  411 caggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttagg 510  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15752639 caagataatctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttagg 15752540  T
Q  511 caaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15752539 ca-aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 15752463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 24975833 - 24976399
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24975833 catcttcatcaaaagctcctatgctcgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 24975932  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------a 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||           |    
T  24975933 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaactctgctttcttttta 24976032  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgt 308  Q
    ||||||||| |||||||        ||||||| |||||| || | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||           
T  24976033 ctttcaaagttatgtacaaaaa---cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattggaaaagtttttga----- 24976124  T
Q  309 tttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 408  Q
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| ||| || ||| | |||||||||||| || ||| ||||||||| ||| |    
T  24976125 ----aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcc 24976220  T
Q  409 cccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactta 508  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24976221 tccaggatagtatgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcgtctta 24976320  T
Q  509 ggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24976321 ggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 24976399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 37352816 - 37352249
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||||||||  |||| | ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37352816 tcatcaaaagcttctgcacttgtggattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 37352717  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 215  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            |||||||||    
T  37352716 ctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttc 37352617  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatctt-gataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 314  Q
    |||||||| |||        ||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| | |||||||    
T  37352616 aaagctatatacaaaa----cattttccttccatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtttattttgaa 37352523  T
Q  315 a-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    | |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||    
T  37352522 aagcaaacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 37352423  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||     
T  37352422 gataatctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagtcgaaaacccggaagggcggcttaggca- 37352324  T
Q  514 aaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37352323 aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 37352249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 37665642 - 37665090
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37665642 tgcttgcgaattcaaaatttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 37665543  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||           ||||||||||| | |||        
T  37665542 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaa 37665443  T
Q  232 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaac 330  Q
        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||| | | | |||  ||||||||||||||||||    
T  37665442 ----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttaaaaagcaaacctgagcaac 37665347  T
Q  331 aaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 430  Q
    | ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| |||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  37665346 agggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatagtctgtggtcaat 37665248  T
Q  431 ggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccct 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  37665247 ggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggca-aaaatgagcaccccgct 37665149  T
Q  531 cgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatg-aaaagaatttatt 588  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  37665148 ggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaaagaatttatt 37665090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Original strand, 5643805 - 5644354
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5643805 tgcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtgg 5643904  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          ||||||||||||| |||         
T  5643905 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttcttttactttcaaagctatatacaaaa- 5644003  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaac 330  Q
       ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5644004 ---cattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaatcgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 5644098  T
Q  331 aaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 430  Q
    | ||||||||||||  || || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||    
T  5644099 agggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttaaaagcaggttctcctccaagataatctgtggtcaat 5644197  T
Q  431 ggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccct 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5644198 ggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaattgaatgagctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccgct 5644296  T
Q  531 cgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5644297 ggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 5644354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 22 - 579
Target Start/End: Original strand, 37760966 - 37761530
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37760966 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 37761065  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tcta 210  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            ||||    
T  37761066 ccaagctttgtaaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttcta 37761165  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgtt 309  Q
    ||||||||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||| | | | ||    
T  37761166 ctttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctatttt 37761261  T
Q  310 ttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 409  Q
    |  ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |     
T  37761262 tgaaaagcaaacctgagcaacagggcacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcct 37761361  T
Q  410 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 509  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761362 ccaggatagactgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 37761461  T
Q  510 gcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaa 579  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  37761462 gc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacctgaaaaggcagttcaggcaaaaatggggcaataaaaa 37761530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 30035410 - 30035982
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  30035410 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 30035509  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------c 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||          |    
T  30035510 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaattctattttcttctac 30035609  T
Q  212 tttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
    |||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||   ||||||| | |||    
T  30035610 tttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaac--tttttgtttattt 30035703  T
Q  311 tgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 409  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| || |||||  ||| |     
T  30035704 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcagattctcct 30035803  T
Q  410 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatg-aaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactta 508  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30035804 ccaagataatctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggctta 30035903  T
Q  509 ggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30035904 ggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 30035982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 45 - 587
Target Start/End: Original strand, 11329644 - 11330194
Alignment:
Q  45 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11329644 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 11329743  T
Q  145 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnnnn 233  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||            ||||||||||||||||  ||           
T  11329744 tcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgttttaaaactctattttcttctactttcaaagctaaatatacaatt 11329843  T
Q  234 nncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaa-ttgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaaca 331  Q
       |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  11329844 t--attttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttaaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 11329939  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11329940 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 11330039  T
Q  432 gcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctc 531  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||     
T  11330040 gcaagaatgaaaaaacagaataaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctgagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcacctcgctg 11330138  T
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttat 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11330139 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttat 11330194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 30940625 - 30941187
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  30940625 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 30940724  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------acttt 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||           |||||    
T  30940725 gcttcgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctgtgcttttgtttgaaattctgctttctttttacttt 30940824  T
Q  215 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg 312  Q
    ||||| |||||||        ||||||| |||||| || | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  30940825 caaagttatgtacaaaaa---cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttga--------- 30940912  T
Q  313 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||| ||| |||||| | || |||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  30940913 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaa-agaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgcctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 30941011  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  30941012 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc- 30941110  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat-gaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  30941111 aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattaaaaaagaatttatt 30941187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 29 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 13436850 - 13436275
Alignment:
Q  29 atcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaagc 127  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13436850 atcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagc 13436751  T
Q  128 tttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta------------ctttc 215  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||            |||||    
T  13436750 tttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttttcttctactttc 13436651  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt----gaaaattgaaaaagttttttgtctgtttt 311  Q
    |||||||| |||          |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||    ||||||||||||   ||||||||| ||||    
T  13436650 aaagctatatacaaaacat---ttttctttctattttgataatggcaacgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaac--tttttgtctatttt 13436556  T
Q  312 gaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccc 410  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| | |    
T  13436555 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatattacaagcaggttctcctc 13436456  T
Q  411 caggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaa----aaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgact 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| || |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13436455 caggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaaaaaacagaataaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaaggacgact 13436356  T
Q  507 taggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13436355 taggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 13436275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 43084247 - 43084813
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| || |||| |||||||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43084247 tcatcaaaagctcctatgctggcgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 43084346  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 215  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||            |||| ||||    
T  43084347 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctattttc 43084446  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 315  Q
    |||| ||| |||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||| ||||||||    
T  43084447 aaagttatatacaaaaat---attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaagttgaaaac--tttttgtctattttgaaa 43084541  T
Q  316 -gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 414  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||| | |||||    
T  43084542 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgctacaagcaggttctcctccagg 43084641  T
Q  415 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaa 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43084642 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaat-aaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc-aa 43084739  T
Q  515 aaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  43084740 aaatgagcaccccgctggattgataaccagaaagggcaattcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 43084813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 27 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 8659643 - 8659078
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  8659643 tcatcaaaagctcttgtacttgtgaattcaaagtttcg-ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattcgccaag 8659545  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 215  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||            |||||||||    
T  8659544 ctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgtttttgtttgaaaactctattttcttctactttc 8659445  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 314  Q
    |||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||| | |||||||    
T  8659444 aaagctatatacaaaa----cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtttattttgaa 8659351  T
Q  315 a-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    | |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||    
T  8659350 aagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 8659251  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  8659250 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaacaaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggca- 8659152  T
Q  514 aaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttat 587  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8659151 aaaatgagcaccccgctggattgacgacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttat 8659078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 28953952 - 28953383
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28953952 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28953853  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 215  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            |||||||||    
T  28953852 ctttgtaaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttc 28953753  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 314  Q
    |||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||  |||| | | | |||  ||    
T  28953752 aaagctatatacaaaa----cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgggaattgaaaactttttgtctatttttgaaa 28953657  T
Q  315 agcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 414  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  28953656 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatttatgttacaagcaggttctcctccagg 28953558  T
Q  415 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaa--aaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||     
T  28953557 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaagtaaataggctcgctaagtcgaaaacccggaagggcggcttaggc- 28953459  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || |||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  28953458 aagaatgagcaccccgctggattgaaaacctgaaagggcagttcaggcaaaaatggggctttgaaaagaatttatt 28953383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 532 - 588
Target Start/End: Original strand, 23726735 - 23726791
Alignment:
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23726735 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 23726791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 473 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 21990838 - 21990745
Alignment:
Q  473 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  21990838 aggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 21990745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 473 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 33840095 - 33840002
Alignment:
Q  473 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  33840095 aggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaacgagcgtcccggtggattgaaaacccgaaaaggcagtccaggcaaaaat 33840002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 21862548 - 21862457
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||  | |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  21862548 gctcgctaaatcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagcgtcccggtggattgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 21862457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 475 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 20374472 - 20374430
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaa 517  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20374472 gctcgctaagttgaaaacccaaaagggcggcttaggcaaaaaa 20374430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 473 - 513
Target Start/End: Original strand, 21693353 - 21693393
Alignment:
Q  473 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21693353 aggctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 21693393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 522
Target Start/End: Original strand, 28849191 - 28849238
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 522  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  28849191 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagc 28849238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Original strand, 1803677 - 1803715
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1803677 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 1803715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 7256675 - 7256637
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  7256675 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 7256637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Original strand, 7792375 - 7792413
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  7792375 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 7792413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 11941237 - 11941199
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  11941237 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 11941199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 15781483 - 15781445
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15781483 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 15781445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Original strand, 31523692 - 31523730
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  31523692 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 31523730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 479 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 12175760 - 12175679
Alignment:
Q  479 gctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggc 560  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  12175760 gctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggc 12175679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 566
Target Start/End: Original strand, 20382384 - 20382469
Alignment:
Q  481 taagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  20382384 taagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaacgagcgtcccggtggattgaaaacccgaaaaggcagtccaggcaaaaat 20382469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 27228804 - 27228719
Alignment:
Q  481 taagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  27228804 taagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagcaaaaagtgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 27228719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 475 - 516
Target Start/End: Original strand, 29899064 - 29899105
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa 516  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  29899064 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcggcttaggcaaaaa 29899105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 475 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 24064644 - 24064596
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaa-gggcgacttaggcaaaaaatgagc 522  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24064644 gctcggtaagtcgaaaacccgaaaagggcggcttaggcaaaaaatgagc 24064596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 16422123 - 16422696
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16422123 catcttcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttcc-ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 16422221  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc------ 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||          
T  16422222 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttcta 16422321  T
Q  216 -----aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
         ||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  16422322 ctttcaaagctatgtacaaaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt-gtgtattt 16422418  T
Q  311 tgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccc 410  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16422419 tgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 16422518  T
Q  411 caggatagtctgtggtcaatggcaagaatg-aaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16422519 caggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttag 16422618  T
Q  510 gcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16422619 gc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacctgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 16422696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 16618813 - 16618251
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16618813 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 16618714  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctac---------- 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||              
T  16618713 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttcta 16618614  T
Q  212 -tttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattg-aaaaagttttttgtctgtt 309  Q
     ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||  ||    
T  16618613 ctttcaaagctatgtac-aaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtccatt 16618515  T
Q  310 ttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 409  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16618514 ttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaaggaggctcttcc 16618415  T
Q  410 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 509  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||             |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618414 ccaggatagtctgtggccaatggcaagaatgaaa-------------atgcataaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 16618328  T
Q  510 gcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16618327 gc-aaaaatgagcaccccgctggattgacgacccgaaagggcagtttaggcaaaaatggggcaatgaaaa-aatttatt 16618251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 18057205 - 18057775
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18057205 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 18057304  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------acttt 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||           |||||    
T  18057305 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttacttt 18057404  T
Q  215 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatctt-gataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtttt-g 312  Q
    ||||| |||||||        ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  18057405 caaagttatgtacaaaaa---cattttccttctatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt-gtctatttttg 18057500  T
Q  313 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18057501 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 18057600  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  18057601 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgagtaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc- 18057699  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18057700 aaaaaggagcaccccgctggagtgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 18057775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Original strand, 7079183 - 7079739
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079183 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 7079282  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||           |||||||||||||| ||         
T  7079283 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatatatac 7079382  T
Q  232 nnnncattttctttctat-cttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 329  Q
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7079383 aaaacattttctttctattcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattaaaaaacttttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 7079481  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    || ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  7079482 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 7079581  T
Q  430 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccc 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |    
T  7079582 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaatgggctcgctaagttgaaaacccgaaagggtggcttaggc-aaaaatgagcaccccgc 7079680  T
Q  530 tcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7079681 tggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 7079739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 4790949 - 4790381
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  4790949 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 4790850  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------cttt 214  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||           ||||    
T  4790849 gctttgtaaatccgtggattcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 4790750  T
Q  215 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 314  Q
    ||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  4790749 caaagctatatacaaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaa 4790655  T
Q  315 a-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||    
T  4790654 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccag 4790555  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  4790554 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcataaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggca- 4790456  T
Q  514 aaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4790455 aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 4790381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 43 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 17971163 - 17970613
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17971163 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 17971064  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc----------aaagctatgtacnnnnn 232  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||          |||||||| |||         
T  17971063 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctattttcaaagctatatacaattt 17970964  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaaca 331  Q
        |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  17970963 ----attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 17970870  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17970869 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgcgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 17970770  T
Q  432 gcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctc 531  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  17970769 gcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca-aaaatgagcaccccgctg 17970671  T
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttattg 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17970670 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttattg 17970613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 32296574 - 32297142
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32296574 tcatcagaagtttctgcgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 32296673  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaact-------------ctactt 213  Q
    |||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |             ||||||    
T  32296674 ctttgtgaatccgtggagtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttttcttctactt 32296773  T
Q  214 tcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 313  Q
    |||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  32296774 tcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttga 32296867  T
Q  314 aa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||    
T  32296868 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctcca 32296967  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||     
T  32296968 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgtaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttaaaaacccggaagggcggcttaggc- 32297066  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  32297067 aagaatgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 32297142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Original strand, 5727940 - 5728491
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5727940 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5728039  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagctatgtacnnn 230  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||||||||||||||||| |||       
T  5728040 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5728139  T
Q  231 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 329  Q
         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5728140 a----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 5728233  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    || ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  5728234 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 5728333  T
Q  430 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccc 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| |    
T  5728334 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aagaatgagcaccccgc 5728432  T
Q  530 tcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5728433 tggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 5728491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Original strand, 47029415 - 47029966
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47029415 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 47029514  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagctatgtacnnn 230  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||||||||||||||||| |||       
T  47029515 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 47029614  T
Q  231 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 329  Q
         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  47029615 a----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 47029708  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    || ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  47029709 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 47029808  T
Q  430 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccc 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| |    
T  47029809 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aagaatgagcaccccgc 47029907  T
Q  530 tcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  47029908 tggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 47029966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 22865145 - 22864596
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22865145 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 22865046  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaact----------ctactttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||          |||||||||||||| | |||         
T  22865045 agtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactatgctttcttctactttcaaagctgtatacaaaa- 22864947  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaaca 331  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22864946 ---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaaca 22864852  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  22864851 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccagggtagtctgtggtcaatg 22864752  T
Q  432 gcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctc 531  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||     
T  22864751 gcaagaatgaaaaaacagaacaaaaatgcatgaaattgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggca-aaaatgagcaccccgctg 22864653  T
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22864652 gatcgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 22864596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 22880204 - 22879655
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880204 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 22880105  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaact----------ctactttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||          |||||||||||||| | |||         
T  22880104 agtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactatgctttcttctactttcaaagctgtatacaaaa- 22880006  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaaca 331  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22880005 ---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaaca 22879911  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  22879910 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccagggtagtctgtggtcaatg 22879811  T
Q  432 gcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctc 531  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||     
T  22879810 gcaagaatgaaaaaacagaacaaaaatgcatgaaattgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggca-aaaatgagcaccccgctg 22879712  T
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22879711 gatcgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 22879655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 34 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 22381888 - 22381330
Alignment:
Q  34 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 133  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  22381888 aagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 22381789  T
Q  134 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttcaaagcta 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||           ||||||||||||    
T  22381788 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagcta 22381689  T
Q  223 tgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaa 320  Q
    | |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||    
T  22381688 tatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaa 22381595  T
Q  321 cctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtc 420  Q
    ||||||| |||  |||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||    
T  22381594 cctgagcgacagtgtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtc 22381496  T
Q  421 tgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatga 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22381495 tgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggca-aaaatga 22381397  T
Q  521 gcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttat 587  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22381396 gcaccccgttggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaatgaaaagaatttat 22381330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 29659283 - 29658716
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29659283 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29659184  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttc 215  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||           |||||    
T  29659183 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 29659084  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-a 313  Q
    |||| ||| |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    ||| |||| ||||| |    
T  29659083 aaagttatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--cctttggtctattttgaa 29658990  T
Q  314 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||    
T  29658989 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccag 29658890  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  29658889 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaagacagaatgaaaatgcatgaaagtgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-a 29658791  T
Q  514 aaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29658790 aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 29658716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 34 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 5590669 - 5590105
Alignment:
Q  34 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 133  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5590669 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgta 5590570  T
Q  134 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagcta 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||           |||||||||||||    
T  5590569 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagcta 5590470  T
Q  223 tgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaac 321  Q
    |||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||    
T  5590469 tgtacaaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaac 5590375  T
Q  322 ctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtct 421  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  5590374 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaataggtgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 5590275  T
Q  422 gtggtcaatggcaagaatgaa----aaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaa 517  Q
     ||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||    
T  5590274 atggtcaatggcaagaatgaaaaaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaacgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aagaa 5590176  T
Q  518 tgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5590175 tgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 5590105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Original strand, 5717030 - 5717581
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5717030 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5717129  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagctatgtacnnn 230  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||||||||||||||||| |||       
T  5717130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5717229  T
Q  231 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 329  Q
         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5717230 a----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 5717323  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    || ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  5717324 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 5717423  T
Q  430 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccc 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| |    
T  5717424 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aagaatgagcaccccgc 5717522  T
Q  530 tcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5717523 tggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 5717581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 5764428 - 5763877
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5764428 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5764329  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctactttcaaagctatgtacnnn 230  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||||||||||||||||| |||       
T  5764328 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5764229  T
Q  231 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 329  Q
         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5764228 a----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 5764135  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    || ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  5764134 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 5764035  T
Q  430 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccc 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| |    
T  5764034 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aagaatgagcaccccgc 5763936  T
Q  530 tcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5763935 tggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 5763877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 4629725 - 4630296
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4629725 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 4629824  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tcta 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            ||||    
T  4629825 ccaagctttgttaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttcta 4629924  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
    ||||||||| ||| |||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||    
T  4629925 ctttcaaagttatatacaaaaat---attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattt 4630019  T
Q  311 tgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 409  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | |||||||||||| || ||| ||||||||| ||| |     
T  4630020 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcct 4630118  T
Q  410 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4630119 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttag 4630218  T
Q  510 gcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  4630219 gc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattaaaaagaatttatt 4630296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 6537042 - 6536491
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6537042 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 6536943  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||           |||||||||||||| |||        
T  6536942 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 6536843  T
Q  232 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 329  Q
        |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6536842 ----cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaac--tttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaa 6536749  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    || ||||||||||||  || || ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  6536748 cagggtacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcttctcaaggatagtctgtggtcaa 6536649  T
Q  430 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccc 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  6536648 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca-aaaatgagcaccccgc 6536550  T
Q  530 tcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  6536549 tggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaatagaatctatt 6536491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Original strand, 20071994 - 20072547
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20071994 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 20072093  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    || ||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||          ||||||||||||| |||         
T  20072094 agtcacaccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctactttcaaagctatatacaaaa- 20072192  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt----gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagc 327  Q
       ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20072193 ---cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 20072287  T
Q  328 aacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtc 427  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  20072288 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtc 20072387  T
Q  428 aatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccc 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  20072388 aatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaattgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccct 20072486  T
Q  528 cctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20072487 gctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 20072547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 29143077 - 29142502
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29143077 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 29142978  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac------------tct 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||             |||    
T  29142977 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttttttct 29142878  T
Q  210 actttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtt 309  Q
    |||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||    
T  29142877 actttcaaagctatatacaaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctatt 29142783  T
Q  310 ttg---aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctct 406  Q
    ||    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  29142782 tttgaaaaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttct 29142683  T
Q  407 tccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgact 506  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  29142682 cctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgagaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggct 29142583  T
Q  507 taggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29142582 taggca-aaaatgagcatcccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 29142502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 8283767 - 8283206
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8283767 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 8283668  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tactttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||           ||||||||||| |||||||         
T  8283667 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgtttttgtttgaaactccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 8283568  T
Q  233 nnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtttt--------gaaagcaaacc 322  Q
       ||||||| |||||| || | ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||        |||||||||||    
T  8283567 ---cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttttttttttttttttttttggaaagcaaacc 8283471  T
Q  323 tgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctg 422  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  8283470 tgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctg 8283371  T
Q  423 tggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8283370 tggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggca-aaaatgagc 8283272  T
Q  523 acccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  8283271 accccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 8283206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 21680646 - 21681212
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21680646 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 21680745  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 215  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            |||||||||    
T  21680746 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttc 21680845  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 315  Q
    |||| ||| |||         |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  21680846 aaagttatatacaaaaat---attttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaa 21680940  T
Q  316 -gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 414  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | |||||||||||| || ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  21680941 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccagg 21681039  T
Q  415 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaa 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21681040 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aa 21681138  T
Q  515 aaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21681139 aaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 21681212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Original strand, 4422880 - 4423430
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4422880 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 4422979  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||||||| |||         
T  4422980 gtcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttcaaagctatatacaaat- 4423078  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaac 330  Q
       ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4423079 ---cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 4423173  T
Q  331 aaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 430  Q
    | ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  4423174 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggtcaat 4423273  T
Q  431 ggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccct 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||    
T  4423274 ggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccctgct 4423372  T
Q  531 cgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  4423373 ggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggtattgaaaagaatttatt 4423430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 27 - 589
Target Start/End: Original strand, 10402094 - 10402661
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10402094 tcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 10402193  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttca 216  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||          ||||||    
T  10402194 ctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaattctatttttttctactttca 10402293  T
Q  217 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 315  Q
    ||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  10402294 aagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaa 10402387  T
Q  316 -gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 414  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  10402388 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagg 10402487  T
Q  415 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaa 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10402488 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaataaaaatgcatgaaaataaacgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aa 10402586  T
Q  515 aaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttattg 589  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10402587 aaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttattg 10402661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Original strand, 10649033 - 10649583
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10649033 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 10649132  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||| ||| |||         
T  10649133 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttcaaagttatatacaaaaa 10649232  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaaca 331  Q
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  10649233 t---attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 10649327  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  10649328 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 10649427  T
Q  432 gcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctc 531  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||     
T  10649428 gcaagaatgaaaaaacagaataaaaatgtatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccgctg 10649526  T
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10649527 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 10649583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 34 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 4340984 - 4340424
Alignment:
Q  34 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 133  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  4340984 aagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 4340885  T
Q  134 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagcta 222  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||||||    
T  4340884 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttcaaagcta 4340785  T
Q  223 tgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaa 320  Q
    | |||        ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||| | |||||||| |||||    
T  4340784 tatacaaaa----cattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtttattttgaaaagcaaa 4340691  T
Q  321 cctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtc 420  Q
    ||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||    
T  4340690 cctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtc 4340591  T
Q  421 tgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatga 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4340590 tgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaattgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggca-aaaatga 4340492  T
Q  521 gcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  4340491 gcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatgaggcattgaaaagaatttatt 4340424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Original strand, 5019675 - 5020224
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019675 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 5019774  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc----------aaagctatgtacnnnnnn 233  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||          |||||||| |||          
T  5019775 gtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctactttcttctactttcaaagctatatacaaat-- 5019872  T
Q  234 nncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaaca 331  Q
      ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5019873 --cattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 5019968  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  5019969 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggtcaatg 5020068  T
Q  432 gcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctc 531  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  5020069 gcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc-aaaaatgagcaccccgctg 5020167  T
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5020168 gattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 5020224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Original strand, 5472949 - 5473499
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5472949 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 5473048  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||||||| |||        
T  5473049 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttcaaagctatatacaaaa 5473148  T
Q  232 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 329  Q
        ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5473149 ----cattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac---ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 5473241  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    || ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  5473242 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 5473341  T
Q  430 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccc 529  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  5473342 tggcaagaatgaaaagacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccgc 5473440  T
Q  530 tcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5473441 tggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 5473499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 18286653 - 18286103
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286653 tgcttgcaaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 18286554  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||          ||||||||||||| |||         
T  18286553 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaactctattttcttctactttcaaagctatatacaaaa- 18286455  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt--gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 329  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  18286454 ---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaa 18286360  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    || ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  18286359 cagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 18286261  T
Q  430 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccc 529  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  18286260 tggcaagaatgaaaaaacagaataaaaatgcatgaaaataaataggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggca-aaaatgagcaccccgc 18286162  T
Q  530 tcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18286161 tggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 18286103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 18301954 - 18301404
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301954 tgcttgcaaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 18301855  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||          ||||||||||||| |||         
T  18301854 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaactctattttcttctactttcaaagctatatacaaaa- 18301756  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt--gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaa 329  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  18301755 ---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaa 18301661  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    || ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  18301660 cagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 18301562  T
Q  430 tggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccc 529  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  18301561 tggcaagaatgaaaaaacagaataaaaatgcatgaaaataaataggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggca-aaaatgagcaccccgc 18301463  T
Q  530 tcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18301462 tggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 18301404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 22 - 498
Target Start/End: Original strand, 19700426 - 19700921
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  19700426 catcttcatcagaagctcctatgtttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 19700525  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------- 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||               
T  19700526 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttaagcctgtgcttttgtttgaaactctattttcttttta 19700625  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnn-------cattttctttctatcttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttt 302  Q
    |||||||||||||||||               |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19700626 ctttcaaagctatgtacaaaaaaaaaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttt 19700725  T
Q  303 gtctgttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcagg 402  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||     
T  19700726 gtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacgagcaga 19700825  T
Q  403 ctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaa 498  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19700826 ttcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgacaacccgaaa 19700921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 31030553 - 31029992
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31030553 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 31030454  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||           |||||    
T  31030453 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 31030354  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 315  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||      ||  |||    
T  31030353 aaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttttt------ttgaaaa 31030264  T
Q  316 gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagga 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | |||||||||||| || ||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  31030263 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaagatatgttacaagcaggttctcctccagga 31030165  T
Q  416 tagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaa-cagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaa 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  31030164 tagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggca-a 31030066  T
Q  515 aaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31030065 aaatgagcaccccgctggattggcaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 31029992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Original strand, 48471889 - 48472443
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48471889 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatgga 48471988  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||           ||||||||||||| |||         
T  48471989 gtcacgccctcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa- 48472087  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttg-----aaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgag 326  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||   ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  48472088 ---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttttaaaaattgaaaac--tttctgtctattttgaaaagcaaacctgag 48472182  T
Q  327 caacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 426  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  48472183 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 48472282  T
Q  427 caatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcaccc 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  48472283 caatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaattgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccc 48472381  T
Q  527 ccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  48472382 cgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 48472443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 54 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 5603603 - 5603061
Alignment:
Q  54 tcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgcctt 153  Q
    ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5603603 tcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctt 5603504  T
Q  154 cggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaact--------------ctactttcaaagctatgtacnnnnnnnncatt 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |              |||||||||||||||| |||        ||||    
T  5603503 cggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaa----catt 5603408  T
Q  240 ttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtaca 338  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  5603407 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacc 5603310  T
Q  339 ttcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaa 438  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603309 ttcaaataaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaa 5603210  T
Q  439 tgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgac 538  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||     
T  5603209 tgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggca-aaaatgagcaccccgctggattgaa 5603111  T
Q  539 aacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  5603110 aacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattaaaaagaatttatt 5603061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 34 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 17979259 - 17978696
Alignment:
Q  34 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 133  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  17979259 aagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 17979160  T
Q  134 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagcta 222  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||           |||||||||||||    
T  17979159 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagcta 17979060  T
Q  223 tgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa--gcaaa 320  Q
    | |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||  |||||    
T  17979059 tatacaaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaaagcaaa 17978965  T
Q  321 cctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtc 420  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||| |||| ||    
T  17978964 cctgagcaacagggtacattcaaaggaaatatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatc 17978865  T
Q  421 tgtggtcaatggcaagaatgaa--aaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaat 518  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  17978864 tgtggtcaatggcaagaatgaaaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaattgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaaggacggcttaggc-aaaaat 17978766  T
Q  519 gagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17978765 gagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaacttatt 17978696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 54 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 31958745 - 31958203
Alignment:
Q  54 tcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgcctt 153  Q
    ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31958745 tcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctt 31958646  T
Q  154 cggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaact--------------ctactttcaaagctatgtacnnnnnnnncatt 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |              |||||||||||||||| |||        ||||    
T  31958645 cggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaa----catt 31958550  T
Q  240 ttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtaca 338  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  31958549 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacc 31958452  T
Q  339 ttcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaa 438  Q
    ||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958451 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaa 31958352  T
Q  439 tgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgac 538  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||     
T  31958351 tgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggca-aaaatgagcaccccgctggattgaa 31958253  T
Q  539 aacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  31958252 aacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattaaaaagaatttatt 31958203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 18336573 - 18337135
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18336573 tcatcaaaagctcctatacttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 18336672  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------cttt 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||           ||||    
T  18336673 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctacttt 18336772  T
Q  215 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 314  Q
    ||||||||| |||        ||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||  ||    
T  18336773 caaagctatatacaaaa----cattttctttctattatgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttt------ttgaaa 18336862  T
Q  315 agcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 414  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  18336863 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagg 18336961  T
Q  415 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaa 514  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  18336962 atagtctatggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaataaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aa 18337060  T
Q  515 aaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat-gaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  18337061 aaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattaaaaaagaatttatt 18337135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Original strand, 32445115 - 32445661
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32445115 tgctcgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 32445214  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||           |||||||||| ||| |||        
T  32445215 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatatacaaaa 32445314  T
Q  232 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaaca 331  Q
        |||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||    
T  32445315 ----cattttctttctgttttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttttttga--------aaagcaaacctgagcaaca 32445402  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  32445403 gggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 32445501  T
Q  432 gcaagaatgaaaa----aacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccc 527  Q
    |||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  32445502 gcaagaatgaaaaaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc-aaaaatgagcaaccc 32445600  T
Q  528 cctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  32445601 gctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 32445661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 572
Target Start/End: Original strand, 4727578 - 4728124
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4727578 tcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 4727677  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||           ||||||    
T  4727678 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttc 4727777  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 313  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |  |    
T  4727778 aaagctatatacaaaa----cattttctttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttt-------tgaa 4727866  T
Q  314 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4727867 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccag 4727965  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatg-aaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  4727966 gatggtctgtggtcaatggcaagaatggaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc- 4728064  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 572  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4728065 aaaaatgagcaccctgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 4728124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 11104660 - 11104110
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11104660 gcttgcgagttcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 11104561  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||           ||||||||||||  ||          
T  11104560 gccacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagctaaatatacaat 11104461  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaaca 331  Q
        |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  11104460 tt--attttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 11104365  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11104364 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 11104265  T
Q  432 gcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctc 531  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||     
T  11104264 gcaagaatgaaaaaacagaat-aaaatgcatgaagataaacgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccgctg 11104167  T
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11104166 gattgacaacctgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 11104110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 54 - 588
Target Start/End: Original strand, 24334145 - 24334687
Alignment:
Q  54 tcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgcctt 153  Q
    ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24334145 tcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctt 24334244  T
Q  154 cggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaact--------------ctactttcaaagctatgtacnnnnnnnncatt 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |              ||||||||||||||||  ||        ||||    
T  24334245 cggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaa----catt 24334340  T
Q  240 ttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtaca 338  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  24334341 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacc 24334438  T
Q  339 ttcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaa 438  Q
    ||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334439 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaa 24334538  T
Q  439 tgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgac 538  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||     
T  24334539 tgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccgctggattgaa 24334637  T
Q  539 aacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  24334638 aacccgaaggggcagttcaggcaaaaatggggcattaaaaagaatttatt 24334687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 27 - 589
Target Start/End: Original strand, 8217577 - 8218149
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8217577 tcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 8217676  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 215  Q
    ||||||  |||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            |||||||||    
T  8217677 ctttgtggatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttc 8217776  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt--gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 313  Q
    |||| ||| |||         ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  8217777 aaagttatatacaaaaat---attttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttga 8217871  T
Q  314 aa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  8217872 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 8217971  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatg--aaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttagg 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8217972 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaaaatagaatgacaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttagg 8218071  T
Q  511 caaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttattg 589  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8218072 c-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttattg 8218149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 28027236 - 28027801
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28027236 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28027335  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttca 216  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||          ||||||    
T  28027336 ctttgtgaatccgtggagtcaggcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaattctattttcttctactttca 28027435  T
Q  217 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa- 315  Q
    ||||||| |||         |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||     
T  28027436 aagctatatacaattt----attttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaa 28027529  T
Q  316 gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagga 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  28027530 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccagga 28027629  T
Q  416 tagtctgtggtcaatggcaagaatg-aaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaa 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  28027630 tagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaaacagaat-aaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aa 28027727  T
Q  515 aaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28027728 aaatgagcaccccgctggattgataacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 28027801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 28110276 - 28109699
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctagg-aaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattt 120  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28110276 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 28110177  T
Q  121 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac------------tc 208  Q
    |||||||||| | ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||             ||    
T  28110176 tccaagctttatgaatccgtggagtcatgccttgggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttc 28110077  T
Q  209 tactttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt----gaaaattgaaaaagttttttgt 304  Q
    ||||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    ||||||||||||   |||||||    
T  28110076 tactttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacgttttttttgaaaattgaaaac--tttttgt 28109983  T
Q  305 ctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggc 403  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  28109982 ctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggt 28109883  T
Q  404 tcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcg 503  Q
    ||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28109882 tctcctccaagataatctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcg 28109783  T
Q  504 acttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     |||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28109782 gcttaggca-aaaatgagcacctcgctggattgacaccccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 28109699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 4689596 - 4690157
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  4689596 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgcgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 4689695  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct----------actttc 215  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||          ||||||    
T  4689696 gcttcgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttcttttactttc 4689795  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 313  Q
     ||| |||||||        ||||||| |||||| || | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |    
T  4689796 taagttatgtacaaaaa---cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttga--------a 4689884  T
Q  314 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| | || |||||||||||| ||| ||||||||  ||| | ||||    
T  4689885 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtatgttggtgcctatttcaatatatgttacaagcagattctcctccag 4689983  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  4689984 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaatagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-a 4690082  T
Q  514 aaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4690083 agaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 4690157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 27 - 587
Target Start/End: Original strand, 35886709 - 35887271
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  35886709 tcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaa 35886808  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------acttt 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||           |||||    
T  35886809 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttacttt 35886908  T
Q  215 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg 312  Q
    |||||||||||||        ||||||| |||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |      
T  35886909 caaagctatgtacaaaaa---cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttt-------tga 35886998  T
Q  313 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||| || ||  |||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  35886999 aaagcaaacctgtgtaacagggtacattcaaacgaa-catacatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 35887097  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||     
T  35887098 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaataaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaatccgaaagggcggcttacgc- 35887196  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttat 587  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35887197 aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttat 35887271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 18248683 - 18249249
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  18248683 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgag 18248782  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttc 215  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||           |||||    
T  18248783 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccatcactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttggaactctatttttcttctactttc 18248882  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-a 313  Q
    |||||||  |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    ||| |||| ||||| |    
T  18248883 aaagctacatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--cctttggtctattttgaa 18248976  T
Q  314 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||    
T  18248977 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 18249076  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  18249077 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaat-aaaatgcatgaaaataaataagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-a 18249174  T
Q  514 aaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||| || |||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18249175 aaaatgagcaccccgctggattaataacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 18249249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 54 - 588
Target Start/End: Original strand, 28345143 - 28345682
Alignment:
Q  54 tcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgcctt 153  Q
    ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28345143 tcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctt 28345242  T
Q  154 cggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc----------aaagctatgtacnnnnnnnncattttct 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||          |||||||| |||        |||||||     
T  28345243 cggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgtttaaaactctattttcttctattttcaaagctatatacaaat----cattttcc 28345338  T
Q  244 ttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaa-ttgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattc 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  28345339 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 28345436  T
Q  342 aaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatga 441  Q
    |||  ||||| ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28345437 aaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggtcaatggcaagaatga 28345536  T
Q  442 aaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaac 541  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||    
T  28345537 aaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccgctggattgaaaac 28345635  T
Q  542 ccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  28345636 ccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattaaaaagaatttatt 28345682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Original strand, 51787984 - 51788533
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51787984 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 51788083  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||||||| |||         
T  51788084 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttcaaagctatatacaaaat 51788183  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaac 330  Q
        |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  51788184 ----attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaac 51788277  T
Q  331 aaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 430  Q
    | ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  51788278 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaat 51788377  T
Q  431 ggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccct 530  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  51788378 ggcaagaatgaaaaaacagaat-aaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccgct 51788475  T
Q  531 cgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  51788476 ggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 51788533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 572
Target Start/End: Original strand, 6207845 - 6208393
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6207845 tcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 6207944  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac------------tctactt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||             |||||||    
T  6207945 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 6208044  T
Q  214 tcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttga-taatgacaatg-cttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtttt 311  Q
    |||||||||| |||        ||||||| |||||| || | ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |     
T  6208045 tcaaagctatatacaaaa----cattttccttctatttttaataatgacaaaggctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttt-------tg 6208133  T
Q  312 gaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccc 411  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6208134 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttcccc 6208232  T
Q  412 aggatagtctgtggtcaatggcaagaatg-aaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttagg 510  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6208233 aggatggtctgtggtcaatggcaagaatggaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttagg 6208332  T
Q  511 caaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 572  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6208333 c-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 6208393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Original strand, 18231155 - 18231705
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  18231155 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagatttgcgaatccgtgga 18231254  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||           |||||||||||||| |||         
T  18231255 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaactctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaa- 18231353  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaac 330  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||  |||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  18231354 ---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaaacccgagcaac 18231448  T
Q  331 aaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 430  Q
    | |||||| |||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  18231449 agggtacagtcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaat 18231548  T
Q  431 ggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccct 530  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18231549 ggcaagaatgaaaaaacagagtgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccgct 18231647  T
Q  531 cgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||    
T  18231648 ggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatgaggcattgaaaagaacttatt 18231705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 5658074 - 5658643
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5658074 catcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 5658173  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacat--caatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta--------- 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||             
T  5658174 ccaagctttgtaaatccgtggagtcaggccttcggctgaccaccactcttatacatatcattttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttccttt 5658273  T
Q  211 --ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtct 306  Q
      ||||||| | |||||||        ||||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        
T  5658274 tactttcaacgttatgtacaaaaa---cattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaaagtttttt---- 5658366  T
Q  307 gttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctct 406  Q
       |  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||    ||| ||||||||| |||    
T  5658367 ---tgaaaagcaaacctaagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgcatgttacaagcaggttct 5658462  T
Q  407 tccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgact 506  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||    
T  5658463 cctcaaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcactaagttgaaaacccagaagggcggct 5658562  T
Q  507 taggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5658563 taggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 5658643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 15735393 - 15734861
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15735393 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 15735294  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc----------tactttcaaagctatgtacnnnnnn 233  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||          ||||||||||| |||||||          
T  15735293 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttcttttactttcaaagttatgtac---aaa 15735197  T
Q  234 nncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaaca 331  Q
      ||||| | ||||| | || |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||||||    
T  15735196 aacatttcccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttt------tttgaaaagcaaacctgagcaaca 15735103  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     ||||||||||||   |||| ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15735102 gggtacattcaaa-tgaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 15735004  T
Q  432 gcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctc 531  Q
    ||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||     
T  15735003 gcaagaatgaaa-------------atgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccagaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccgctg 15734918  T
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15734917 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 15734861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 27 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 20571161 - 20570602
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20571161 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 20571062  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctctactttc 215  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||            |||| ||||    
T  20571061 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactctattttcttctattttc 20570962  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-a 313  Q
    |||||||| |||        ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||   ||||||| | ||||| |    
T  20570961 aaagctatatac----aaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtttattttgaa 20570868  T
Q  314 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| |||||||  || |||||| | ||||||||||||||| ||| |||| |||| ||| | ||||    
T  20570867 aagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcaagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccag 20570768  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaa-tgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||   |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20570767 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaacaaaaatgcatgaaaacaaaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc- 20570669  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaa 579  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20570668 aaaaatgagcaccccgctggattgacaacctgaaaaggcagttcaggcaaaaatggggcaataaaaa 20570602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 254 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 15886814 - 15886489
Alignment:
Q  254 ataatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacac 352  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||     
T  15886814 ataatgacaaatgctcgaagcaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttga--------aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-cat 15886724  T
Q  353 gcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaat 452  Q
    ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15886723 gcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcccggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaat 15886624  T
Q  453 gaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggca 552  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15886623 ggaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggca-aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggca 15886525  T
Q  553 gttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  15886524 gttcaggcaaaaatggggctttgaaaagaatttatt 15886489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15887027 - 15886894
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aatattaccattt 120  Q
    |||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15887027 catcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 15886928  T
Q  121 tccaagctttgt-aaatccgtggagccacgcctt 153  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15886927 tccaagctttgtaaaatccgtggagtcacgcctt 15886894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 129
Target Start/End: Original strand, 8002522 - 8002607
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctt 129  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8002522 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 8002607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 27560763 - 27560722
Alignment:
Q  476 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaa 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27560763 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaa 27560722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 474 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 18904220 - 18904179
Alignment:
Q  474 ggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18904220 ggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaa 18904179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 522
Target Start/End: Original strand, 72518 - 72565
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  72518 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcggcttaggcaaaaaatgagc 72565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 566
Target Start/End: Original strand, 17931128 - 17931218
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||   | || ||| |||||||||||||| | ||||| |||||    
T  17931128 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcatcctggtggactgaaaacccgaaagggcaatccaggcaaaaat 17931218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 475 - 517
Target Start/End: Original strand, 4453039 - 4453081
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaa 517  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4453039 gctcactaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaaa 4453081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 534 - 579
Target Start/End: Original strand, 19700908 - 19700953
Alignment:
Q  534 ttgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaa 579  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19700908 ttgacaacccgaaaaggcagttcaggcaaaaatggggcaatcaaaa 19700953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 473 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 15581050 - 15581010
Alignment:
Q  473 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15581050 aggctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 15581010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 5947726 - 5947688
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  5947726 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 5947688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Original strand, 6199974 - 6200012
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  6199974 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 6200012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Original strand, 8621987 - 8622025
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8621987 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 8622025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Original strand, 8810060 - 8810098
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8810060 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 8810098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 15531852 - 15531814
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15531852 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 15531814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Original strand, 15921802 - 15921840
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15921802 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 15921840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Original strand, 46383679 - 46383717
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  46383679 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 46383717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 46395215 - 46395177
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  46395215 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 46395177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 475 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 23283814 - 23283773
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa 516  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  23283814 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcggcttaggcaaaaa 23283773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 566
Target Start/End: Original strand, 25268909 - 25268994
Alignment:
Q  481 taagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  25268909 taagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 25268994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 475 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 30091549 - 30091508
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa 516  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  30091549 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcggcttaggcaaaaa 30091508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 474 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 9550016 - 9549968
Alignment:
Q  474 ggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 522  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || |||||||    
T  9550016 ggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaagaatgagc 9549968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 367; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 22075164 - 22074596
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22075164 tcatcagaagcttttgtgtttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttgccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 22075065  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc----------- 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||               
T  22075064 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctaggcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 22074965  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 315  Q
    ||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  22074964 aaagctatgtacaaaaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacttcttgaaaat--aaaaaagtttttgtctgttttgaaa 22074868  T
Q  316 gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagga 415  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22074867 gcaagcatgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccctagga 22074768  T
Q  416 tagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa 515  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22074767 tagtctgtggccaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca-aa 22074669  T
Q  516 aatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22074668 aatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcagccaaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 22074596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 19911398 - 19910829
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19911398 tcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggagatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacctttttccaag 19911299  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||           |||||    
T  19911298 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttcctttttactttc 19911199  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtttt-gaa 314  Q
    ||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  19911198 aaagctatgtacaaaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt-gtctatttttgaa 19911102  T
Q  315 agcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 414  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| |    
T  19911101 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaag 19911002  T
Q  415 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaa 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  19911001 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgagaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aa 19910903  T
Q  515 aaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19910902 aattgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 19910829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 19202603 - 19202042
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagt-ttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattt 120  Q
    |||| ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| || | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19202603 catcttcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtcttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 19202504  T
Q  121 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttcaaagc 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  19202503 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcaaagc 19202404  T
Q  221 tatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaa 319  Q
    ||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| ||||    
T  19202403 tatatacaaat----cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaa 19202310  T
Q  320 acctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagt 419  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||| |||| |    
T  19202309 acctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctgtttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataat 19202210  T
Q  420 ctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatg 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  19202209 ctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggca-aaaatg 19202111  T
Q  520 agcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19202110 agcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 19202042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 18796683 - 18797256
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattt 120  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18796683 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 18796782  T
Q  121 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta---------- 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||              
T  18796783 tccaagctttataaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttct 18796882  T
Q  211 -ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtt 309  Q
     ||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||    
T  18796883 actttcaaagctatatacaaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctatt 18796977  T
Q  310 ttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 408  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  18796978 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcc 18797077  T
Q  409 cccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactta 508  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  18797078 tccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcataaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacctggaagggcggctta 18797177  T
Q  509 ggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18797178 ggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 18797256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 33248348 - 33248914
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33248348 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 33248447  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttc 215  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||           |||||    
T  33248448 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 33248547  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 315  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  33248548 aaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaa 33248641  T
Q  316 -gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 414  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| | |||||    
T  33248642 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccagg 33248741  T
Q  415 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaa 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  33248742 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagtcgaaaacccggaagggcggcttaggc-aa 33248840  T
Q  515 aaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  33248841 aaaggagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 33248914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 21342405 - 21341837
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21342405 tcatcaaaagctcctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 21342306  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------acttt 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||           |||||    
T  21342305 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttctgtttgaaactctgctttctttttacttt 21342206  T
Q  215 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 313  Q
    ||||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  21342205 caaagctatatacaaaa----cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaagcatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttga 21342112  T
Q  314 aa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||    
T  21342111 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctcca 21342012  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21342011 gaatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgagaatgaataggctcgctgagttgaaaacccgaaagggcggcttaggca 21341912  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21341911 -aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 21341837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 15773556 - 15774123
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15773556 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 15773655  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||           ||||||    
T  15773656 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttc 15773755  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 314  Q
    | |||||| |||        |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  15773756 agagctatatacaaaa----cattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaa 15773849  T
Q  315 a-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||    
T  15773850 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 15773949  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15773950 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaataaaaatgcatgaaagtaaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc-a 15774048  T
Q  514 aaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15774049 aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 15774123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 28356192 - 28355617
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctagg-aaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattt 120  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28356192 catcttcatctgaatcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 28356093  T
Q  121 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaact------------- 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |                 
T  28356092 tccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctatttttttct 28355993  T
Q  208 -ctactttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtct 306  Q
     |||||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  28355992 tctactttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtct 28355899  T
Q  307 gttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctc 405  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  28355898 attttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttc 28355799  T
Q  406 ttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgac 505  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  28355798 tcctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggc 28355699  T
Q  506 ttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28355698 ttaggca-aaaatgagcaccccgctggattgataacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 28355617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 19655583 - 19655012
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata--ttaccatt 119  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  19655583 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaaattaccatt 19655484  T
Q  120 ttccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc---- 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        
T  19655483 ttccaagctttgtaaatccgtggagtctcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttt 19655384  T
Q  216 -------aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtct 306  Q
           |||| |||||||        ||||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        
T  19655383 tactttcaaagttatgtacaaaaa---cattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa-gtttttt---- 19655292  T
Q  307 gttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctct 406  Q
       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  19655291 ---ttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagactct 19655195  T
Q  407 tccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaa--aaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcga 504  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  19655194 tccccaggatagtctttggtcaatgacaagaatgaaaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcgg 19655095  T
Q  505 cttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19655094 cttaggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatgggacaatgaaaagaatttatt 19655012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 19680425 - 19680996
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctagg-aaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattt 120  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19680425 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 19680524  T
Q  121 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc----- 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||         
T  19680525 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttcta 19680624  T
Q  216 -----aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
         |||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||    
T  19680625 ttttcaaagctatatacaaat----cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattt 19680718  T
Q  311 tgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 409  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |     
T  19680719 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcct 19680818  T
Q  410 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  19680819 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaa 19680918  T
Q  510 gcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19680919 gc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 19680996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 44566962 - 44567532
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttct-aggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44566962 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 44567061  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttc 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||          |||||    
T  44567062 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctactttc 44567161  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt----gaaaattgaaaaagttttttgtctgtttt 311  Q
    |||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||   ||||||||| ||||    
T  44567162 aaagctatatacaaaa----cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaac--tttttgtctatttt 44567255  T
Q  312 gaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccc 410  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |    
T  44567256 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctc 44567355  T
Q  411 caggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttagg 510  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567356 caagataatctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttagg 44567455  T
Q  511 caaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  44567456 c-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 44567532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 29835300 - 29835871
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||   ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29835300 catcttcatctgaagcctctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 29835399  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tcta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||            ||||    
T  29835400 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaaactccattttcttcta 29835499  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
    ||||||||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||    
T  29835500 ctttcaaagctatatacaaat----cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattt 29835593  T
Q  311 tgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 409  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||| ||| |     
T  29835594 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacgagcaggttctcct 29835693  T
Q  410 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 509  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29835694 ccaagataatctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaattaaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttag 29835793  T
Q  510 gcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  29835794 gc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatagggcattgaaaagaatttatt 29835871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Original strand, 18715478 - 18716031
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715478 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 18715577  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||          ||||||||||||| |||         
T  18715578 agtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctactttcaaagctatatacaaaa- 18715676  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttg----aaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagc 327  Q
       ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18715677 ---cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagc 18715771  T
Q  328 aacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtc 427  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||| ||| |||||| || ||| | ||||||||||||||||||    
T  18715772 aacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgactatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggtc 18715871  T
Q  428 aatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccc 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18715872 aatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc-aaaaatgagcacccc 18715970  T
Q  528 cctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18715971 gctggattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 18716031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 44 - 589
Target Start/End: Original strand, 31360527 - 31361078
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31360527 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 31360626  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||| ||| |||         
T  31360627 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttcaaagttatatacaaaaa 31360726  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaaca 331  Q
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31360727 t---attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 31360821  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31360822 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 31360921  T
Q  432 gcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctc 531  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||     
T  31360922 gcaagaatgaaaaaacagaataaaaatgcatgaaaataaacgagctcgctaagttgaaaacctgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccgctg 31361020  T
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttattg 589  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31361021 gattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttattg 31361078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 27603146 - 27602581
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27603146 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 27603047  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------a 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||           |    
T  27603046 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttagacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttcttttta 27602947  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgt 308  Q
    |||||||||||||||||        ||||||| |||||| || | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||         
T  27602946 ctttcaaagctatgtacaaaaa---cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa-gttttttga---- 27602855  T
Q  309 tttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 408  Q
        |||||||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  27602854 ----aaagcaaacctgtgcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcc 27602760  T
Q  409 cccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactta 508  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27602759 tccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggctta 27602660  T
Q  509 ggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27602659 ggca-aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 27602581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 54 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 31484079 - 31483537
Alignment:
Q  54 tcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgcctt 153  Q
    ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31484079 tcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctt 31483980  T
Q  154 cggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaact--------------ctactttcaaagctatgtacnnnnnnnncatt 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |              |||||||||||||||| |||        ||||    
T  31483979 cggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaa----catt 31483884  T
Q  240 ttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtaca 338  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  31483883 ttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaaggtacc 31483786  T
Q  339 ttcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaa 438  Q
    ||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483785 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacgagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaa 31483686  T
Q  439 tgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgac 538  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||     
T  31483685 tgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggca-aaaatgagcaccccgctggattgaa 31483587  T
Q  539 aacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31483586 aacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 31483537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 12086958 - 12086390
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  12086958 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 12086859  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------cttt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||           ||||    
T  12086858 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctacttt 12086759  T
Q  215 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 313  Q
    ||||||| | |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  12086758 caaagctgtatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctgttttga 12086665  T
Q  314 aa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    || |||| ||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  12086664 aaagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 12086565  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12086564 agataatctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggca 12086465  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12086464 -aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatctatt 12086390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 22 - 589
Target Start/End: Original strand, 33264708 - 33265273
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33264708 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgccatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 33264807  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------c 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||          |    
T  33264808 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctattttcttctac 33264907  T
Q  212 tttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
    |||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||   ||||||||| |||    
T  33264908 tttcaaagctatatacgaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaac--tttttgtctattt 33265001  T
Q  311 tgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 409  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||       |||||||| ||| |     
T  33265002 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcaatgtctatttcaata-------caagcaggttctcct 33265094  T
Q  410 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 509  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33265095 ccaggttagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaagtgaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttag 33265194  T
Q  510 gcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttattg 589  Q
    || ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33265195 gc-aaaaatgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttattg 33265273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 19694077 - 19694640
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  19694077 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 19694176  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------tacttt 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||           ||||||    
T  19694177 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactccgctttctttttacttt 19694276  T
Q  215 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg 312  Q
    ||||| |||||||        ||||||| |||||| || | ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |      
T  19694277 caaagttatgtacaaaaa---cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtttttt-------tga 19694366  T
Q  313 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||| | ||| | |||    
T  19694367 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaagttctcctcca 19694465  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  19694466 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacataatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc- 19694564  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19694565 aaaaatgagcacccctctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 19694640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 27 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 2131496 - 2130935
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2131496 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 2131397  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc----------- 215  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||               
T  2131396 ctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttc 2131297  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 313  Q
    |||| |||||||        ||||||| |||||| || | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |    
T  2131296 aaagttatgtacaaaaa---cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttctttga--------a 2131208  T
Q  314 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||    
T  2131207 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 2131109  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaa-cagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  2131108 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaactcggaagggcggcttaggca 2131009  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttat 587  Q
     |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2131008 -aaaaggagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaatgaaaagaatttat 2130935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 43 - 579
Target Start/End: Original strand, 9360620 - 9361150
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9360620 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 9360719  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||||||| |||        
T  9360720 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttcaaagctatatacaaaa 9360819  T
Q  232 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaac 330  Q
        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  9360820 ----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 9360913  T
Q  331 aaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 430  Q
    | ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  9360914 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaat 9361013  T
Q  431 ggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccct 530  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  9361014 ggcaagaatgaaaaaacagaacaaaaatgcatga----------gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc-aaaaatgagcaccccgct 9361102  T
Q  531 cgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaa 579  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9361103 ggattgacaacctgaaaaggcagttcaggc-aaaatggggcaataaaaa 9361150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 22138883 - 22139436
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattt 120  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22138883 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 22138982  T
Q  121 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc-----------t 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||           |    
T  22138983 tccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttcttttt 22139082  T
Q  210 actttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttcta-tcttgataatgac-aatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctg 307  Q
    |||||||||| |||||||        ||||||| ||||| | || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||              
T  22139083 actttcaaagttatgtac---aaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacgtcttgaaaattgaaaaagt---------- 22139169  T
Q  308 ttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctctt 407  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||  ||||  ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||     
T  22139170 ttttgaaagcaaacttgagcaacagggtacattgaaatgaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctc 22139269  T
Q  408 ccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactt 507  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  22139270 ctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaa-------------atgcatgaaaataaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggctt 22139356  T
Q  508 aggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22139357 aggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 22139436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 14569139 - 14569704
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| || || | ||||||||||||||| | |||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14569139 tcatcaaaagctcctatgatggcgaattcaaagtttttgggaa-tgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 14569237  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttc 215  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||           ||||||    
T  14569238 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttc 14569337  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnn-cattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg 312  Q
    |||| ||||| |         ||||||| |||||| || | ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  14569338 aaagttatgttcaaaaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttttg--------- 14569428  T
Q  313 aaag-caaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccc 411  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| | ||    
T  14569429 aaagacaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatacatgttacaagcaggttctcctcc 14569527  T
Q  412 aggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc 511  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||    
T  14569528 aggatattctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcagtttaggc 14569627  T
Q  512 aaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaat-gaaaagaatttatt 588  Q
     ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  14569628 -aaaaaggagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattaaaaaagaatttatt 14569704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 294
Target Start/End: Original strand, 16260205 - 16260479
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16260205 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16260304  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-----------ctctactttc 215  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            |||||||||    
T  16260305 ctttgtaaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttc 16260404  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 294  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16260405 aaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaatcgaaaa 16260479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 476 - 560
Target Start/End: Original strand, 16771675 - 16771758
Alignment:
Q  476 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggc 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  | |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16771675 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaaa-gagcatcccggtggattgaaaacccgaaagggcagtccaggc 16771758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 476 - 560
Target Start/End: Original strand, 25794043 - 25794126
Alignment:
Q  476 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggc 560  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||  | |||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  25794043 ctcgctaagttgaaaacccaaaagggcggcttaggcaaaaaa-gagcatcccggtggattgaaaacccaaaagggcggtccaggc 25794126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 475 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 21477906 - 21477865
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa 516  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21477906 gctcgctaagttgaaaacctgaaatggcgacttaggcaaaaa 21477865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 522
Target Start/End: Original strand, 6668218 - 6668265
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 522  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  6668218 gctcgctaagtcaaaaacccgaaagggcggcttaagcaaaaaatgagc 6668265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 475 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 39840388 - 39840343
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatga 520  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  39840388 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatga 39840343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 476 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 22158845 - 22158805
Alignment:
Q  476 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa 516  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  22158845 ctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcggcttaggcaaaaa 22158805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 22929107 - 22928532
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22929107 catcttcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 22929008  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc------ 215  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||          
T  22929007 ccaagctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgtttgaaactctactttctttcta 22928908  T
Q  216 -----aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
         ||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  22928907 ctttcaaagctatgtacaaaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt-gtctattt 22928811  T
Q  311 t-gaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 409  Q
    | |||||||||||||||||| | |||||| |||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22928810 ttgaaagcaaacctgagcaatagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcc 22928711  T
Q  410 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22928710 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggcttgctaagttgaaaacccggaagggcggcttag 22928611  T
Q  510 gcaaaaaatgagcaccccc-ctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22928610 gca-aaaaggagcacccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 22928532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 27284586 - 27284014
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27284586 catcttcatctgaagcttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 27284487  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------- 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||               
T  27284486 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttttcttct 27284387  T
Q  211 -ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtt 309  Q
     ||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||    
T  27284386 actttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctatt 27284293  T
Q  310 ttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 408  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27284292 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaaacaggctcttc 27284193  T
Q  409 cccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactta 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284192 cccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacaaaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactta 27284093  T
Q  509 ggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaa-cccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27284092 ggca-aaaatgagcaccccgctggattgacaaccccaaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaa-gaaaagaatctatt 27284014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 33370650 - 33370083
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33370650 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 33370551  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 215  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            |||||||||    
T  33370550 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttc 33370451  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 314  Q
    |||||||| |||        |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   |||||||||| |||||||    
T  33370450 aaagctatatacaaag----cattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaat--ttttttgtctattttgaa 33370357  T
Q  315 a-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||    
T  33370356 aagcgaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggctctcctccag 33370257  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33370256 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaatagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca- 33370158  T
Q  514 aaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  33370157 aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcactgaaaagaatttatt 33370083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 16755794 - 16756367
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16755794 catcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 16755893  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------- 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||               
T  16755894 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttcta 16755993  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt--gaaaattgaaaaagttttttgtctgt 308  Q
    ||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||   ||||||||| |    
T  16755994 ctttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatattttgacaattgaaaac--tttttgtctat 16756087  T
Q  309 tttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctctt 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||     
T  16756088 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctc 16756187  T
Q  408 ccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactt 507  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16756188 ctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggctt 16756287  T
Q  508 aggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16756288 aggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 16756367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 27356330 - 27355763
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27356330 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27356231  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttc 215  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||           |||||    
T  27356230 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 27356131  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg-a 313  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    ||| |||| ||||| |    
T  27356130 aaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--cctttggtctattttgaa 27356037  T
Q  314 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||    
T  27356036 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccag 27355937  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  27355936 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaagtgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-a 27355838  T
Q  514 aaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27355837 aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 27355763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 29507395 - 29507964
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29507395 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29507494  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-------------actt 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||             ||||    
T  29507495 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttttactt 29507594  T
Q  214 tcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg 312  Q
    |||||||||| |||        |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||    
T  29507595 tcaaagctatatacaaaa----cattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttg 29507688  T
Q  313 aaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccc 411  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||    
T  29507689 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatggaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcc 29507788  T
Q  412 aggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29507789 aggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaagaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc 29507888  T
Q  512 aaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29507889 -aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcactgaaaagaatttatt 29507964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 29555532 - 29556104
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29555532 catcttcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 29555631  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------a 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||           |    
T  29555632 ccaagctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaactctgttttcttttta 29555731  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgtt 309  Q
    ||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||| ||    
T  29555732 ctttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttagaaaatt--aaaagctttttgtctatt 29555825  T
Q  310 ttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 408  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  |    
T  29555826 ttgaaaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcccc 29555925  T
Q  409 cccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactta 508  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||| ||||    
T  29555926 tccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagctaaaaacccgagaaggcggctta 29556025  T
Q  509 ggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29556026 ggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcactgaaaagaatttatt 29556104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 28 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 27623927 - 27623359
Alignment:
Q  28 catcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagc 127  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27623927 catcagaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagc 27623828  T
Q  128 tttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-------------tctacttt 214  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||              ||||||||    
T  27623827 tttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctacttt 27623728  T
Q  215 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 314  Q
    ||||||||| |||          |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  27623727 caaagctatatacaaaacat---ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttaaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaa 27623633  T
Q  315 a-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27623632 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccag 27623533  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27623532 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca- 27623434  T
Q  514 aaaatgagcacccccctcgattgacaa-cccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27623433 aaaatgagcaccccgctggattgacaaccccaaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaa-gaaaagaatctatt 27623359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 28166473 - 28167041
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28166473 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaatccaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28166572  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttc 215  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||           |||||    
T  28166573 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 28166672  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt--gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 313  Q
    |||||||| |||         |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  28166673 aaagctatatacaattt----attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttga 28166766  T
Q  314 aa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  28166767 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 28166866  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  28166867 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc- 28166965  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28166966 aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaagagaatttatt 28167041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 13293164 - 13292601
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13293164 tcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 13293065  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttc 215  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||           |||||    
T  13293064 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 13292965  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 315  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||  |||    
T  13292964 aaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttt------ttgaaaa 13292875  T
Q  316 gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagga 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| | ||||||    
T  13292874 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccagga 13292775  T
Q  416 tagtctgtggtcaatggcaagaatgaa--aaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  13292774 tagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaaggtgaaaacccggaagggcggcttaggc-a 13292676  T
Q  514 aaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13292675 aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 13292601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 45 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 13518395 - 13517847
Alignment:
Q  45 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13518395 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 13518296  T
Q  145 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaa-ctcta-----------ctttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
     || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||           ||||||||||||| |||         
T  13518295 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttttccactttcaaagctatatacaaaa- 13518197  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaaca 331  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13518196 ---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 13518102  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  13518101 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggtcaatg 13518002  T
Q  432 gcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctc 531  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||     
T  13518001 gcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggca-aaaatgagcaccccgctg 13517903  T
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttat 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13517902 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttat 13517847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 14139597 - 14139052
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139597 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 14139498  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||           |||||||||||||| |||        
T  14139497 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 14139398  T
Q  232 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaaca 331  Q
        |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||      ||  |||||||||||||||||||    
T  14139397 ----cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttttt------ttgaaaagcaaacctgagcaaca 14139308  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     ||||||||||||  | ||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||    
T  14139307 tggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggtcaatg 14139208  T
Q  432 gcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctc 531  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| ||     
T  14139207 gcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aagaatgagcaccccgctg 14139109  T
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14139108 gattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 14139052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 26110629 - 26110061
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||||||||  |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26110629 tcatcaaaagcttctgcacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26110530  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttc 215  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||           ||||||    
T  26110529 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttc 26110430  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 315  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  26110429 aaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctgttttgaaa 26110336  T
Q  316 -gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 414  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||| | ||| |    
T  26110335 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttccatatatgttacaagcaggttctcctccaag 26110236  T
Q  415 atagtctgtggtcaatggcaagaatg--aaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  26110235 ataatctgtggtcaatggcaaaaatgaaaaaaaacagaatgcaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc- 26110137  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26110136 aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 26110061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 45 - 588
Target Start/End: Original strand, 29579012 - 29579560
Alignment:
Q  45 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 144  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29579012 cttgcaaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 29579111  T
Q  145 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc----------aaagctatgtacnnnnnnn 234  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||          |||||||| |||           
T  29579112 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttcttctattttcaaagctatatacaaat--- 29579208  T
Q  235 ncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaa-ttgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaa 332  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  29579209 -cattttccttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 29579305  T
Q  333 ggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatgg 432  Q
    |||||| |||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  29579306 ggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggtcaatgg 29579405  T
Q  433 caagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcg 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  29579406 caagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc-aaaaatgagcaccccgctgg 29579504  T
Q  533 attgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  29579505 attaacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattaaaaagaatttatt 29579560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 4539978 - 4539410
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  4539978 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 4539879  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta------------ctt 213  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||            |||    
T  4539878 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttctttttactt 4539779  T
Q  214 tcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 313  Q
    |||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  4539778 tcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctgttttga 4539685  T
Q  314 aa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    || |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  4539684 aaagcaaacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 4539585  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  4539584 agataatctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggca 4539485  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4539484 -aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatctatt 4539410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 27031002 - 27031566
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27031002 tcatcaaaagctcctacgcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtattcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27031101  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||           ||||||    
T  27031102 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttc 27031201  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 314  Q
    |||| |||||||        ||||||| |||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||  ||    
T  27031202 aaagttatgtacaaaaaa--cattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttt-----tttgaaa 27031294  T
Q  315 agcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 414  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  27031295 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagg 27031393  T
Q  415 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaa 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  27031394 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aa 27031492  T
Q  515 aaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27031493 aaaggagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 27031566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 22 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 8899923 - 8899352
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8899923 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 8899824  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tcta 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            ||||    
T  8899823 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttcta 8899724  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
    ||||||||| ||| |||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||    
T  8899723 ctttcaaagttatatacaaaaat---attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattt 8899629  T
Q  311 tgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 409  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||| |     
T  8899628 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcct 8899529  T
Q  410 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8899528 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataattgagctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttag 8899429  T
Q  510 gcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttat 587  Q
    ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8899428 gca-aaaatgagcaccccgctgaattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttat 8899352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 45 - 588
Target Start/End: Original strand, 16680136 - 16680685
Alignment:
Q  45 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16680136 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgaaaatccgtggag 16680235  T
Q  145 ccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta------------ctttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
     |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||            ||||||||| ||| |||         
T  16680236 tcacgccgtcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttttcttctactttcaaagttatatacaaaaa 16680335  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaaca 331  Q
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  16680336 t---attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgaca 16680430  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16680431 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtggtcaatg 16680530  T
Q  432 gcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctc 531  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||     
T  16680531 gcaagaatgaaaaaacagaataaag-tgcatgaaaatgaataggctagctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcacctcgctg 16680628  T
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16680629 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 16680685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 34458725 - 34458160
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34458725 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 34458626  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 215  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            |||| ||||    
T  34458625 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctattttc 34458526  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 315  Q
     ||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||||||    
T  34458525 taagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatggttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac---ttttgtctattttgaaa 34458433  T
Q  316 -gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 414  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||    
T  34458432 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagg 34458333  T
Q  415 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaa 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  34458332 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaacaaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aa 34458234  T
Q  515 aaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  34458233 gaatgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 34458160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Original strand, 4763759 - 4764309
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763759 gcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 4763858  T
Q  144 gccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||||||| |||         
T  4763859 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttcaaagctatatacaaat- 4763957  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaac 330  Q
       ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4763958 ---cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 4764052  T
Q  331 aaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 430  Q
    | ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  4764053 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtggtcaat 4764152  T
Q  431 ggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccct 530  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||    
T  4764153 ggcaagaatgaaaaaacagaataaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccctgct 4764251  T
Q  531 cgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  4764252 ggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggtattgaaaagaatttatt 4764309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Original strand, 27013728 - 27014272
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27013728 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27013827  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||           |||||||||||||| |||        
T  27013828 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 27013927  T
Q  232 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaaca 331  Q
        |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||       |  |||||||||||||||||||    
T  27013928 ----cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttttt-------tgaaaagcaaacctgagcaaca 27014016  T
Q  332 aggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatg 431  Q
     ||||||||||||  | ||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||    
T  27014017 gggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattttaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctttggtcaatg 27014116  T
Q  432 gcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctc 531  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| ||     
T  27014117 gcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aagaatgagcaccccgctg 27014215  T
Q  532 gattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27014216 gattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 27014272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 27208883 - 27209446
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27208883 tcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaag 27208982  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||           |||||    
T  27208983 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttc 27209082  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttg---ataatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtttt 311  Q
    |||| |||||||        ||||||| |||||| ||    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  27209083 aaagttatgtacaaaaa---cattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttga------- 27209172  T
Q  312 gaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccc 411  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || |  ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27209173 -aaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaa-cgtgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttcccc 27209270  T
Q  412 aggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  27209271 aggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgggagggcggcttaggc 27209370  T
Q  512 aaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27209371 -aaaaatgagcatcccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 27209446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 27240345 - 27239782
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27240345 tcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaag 27240246  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||           |||||    
T  27240245 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttc 27240146  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttg---ataatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtttt 311  Q
    |||| |||||||        ||||||| |||||| ||    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  27240145 aaagttatgtacaaaaa---cattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttga------- 27240056  T
Q  312 gaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccc 411  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || |  ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27240055 -aaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaa-cgtgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttcccc 27239958  T
Q  412 aggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  27239957 aggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgggagggcggcttaggc 27239858  T
Q  512 aaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    | |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27239857 a-aaaatgagcatcccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 27239782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 22 - 587
Target Start/End: Original strand, 24869684 - 24870250
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24869684 catcttcatcaaaagctcttatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 24869783  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc------ 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||          
T  24869784 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttcttttta 24869883  T
Q  216 -----aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgt 308  Q
         |||| |||||||        ||||||| |||||| || | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  24869884 ctttcaaagttatgtacaaaaa---cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttga---- 24869976  T
Q  309 tttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 408  Q
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |    
T  24869977 ----aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagtttctcc 24870071  T
Q  409 cccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaa-aacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactt 507  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  24870072 tccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggctt 24870171  T
Q  508 aggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttat 587  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24870172 aggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcaatgaaaagaatttat 24870250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Original strand, 27063477 - 27064027
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063477 tgcttgtgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27063576  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||          ||||||||||||| |||         
T  27063577 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctactttcaaagctatatacaaat- 27063675  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaac 330  Q
       ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27063676 ---cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 27063770  T
Q  331 aaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 430  Q
    | ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  27063771 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaat 27063870  T
Q  431 ggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccct 530  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||    
T  27063871 ggcaagaatgaaaaaacagaaaaagaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttagac-aaaaatgagcaccccgct 27063969  T
Q  531 cgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27063970 ggattgacaacccggaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 27064027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 27200165 - 27200733
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  27200165 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 27200264  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttc 215  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  ||||||||          |||||    
T  27200265 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgattaaaactctattttcttctactttc 27200364  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacat-cttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 314  Q
    ||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  27200365 aaagctatgtacaaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaa 27200459  T
Q  315 a-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||| | ||||    
T  27200460 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgtatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccag 27200559  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  27200560 g-tagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaatttgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcctaggc-a 27200657  T
Q  514 aaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatg-aaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  27200658 aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaaagaatttatt 27200733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 27249068 - 27248500
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  27249068 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 27248969  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttc 215  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  ||||||||          |||||    
T  27248968 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgattaaaactctattttcttctactttc 27248869  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacat-cttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 314  Q
    ||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  27248868 aaagctatgtacaaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaa 27248774  T
Q  315 a-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||| | ||||    
T  27248773 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgtatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccag 27248674  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  27248673 g-tagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaatttgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcctaggc-a 27248576  T
Q  514 aaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatg-aaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  27248575 aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaaagaatttatt 27248500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 34 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 30552212 - 30551652
Alignment:
Q  34 aagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgta 133  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  30552212 aagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 30552113  T
Q  134 aatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagcta 222  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||           |||||||||||||    
T  30552112 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagcta 30552013  T
Q  223 tgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaac 321  Q
    | |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| ||||||    
T  30552012 tatacaaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaaac 30551918  T
Q  322 ctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtct 421  Q
    | |||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  30551917 ccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtct 30551818  T
Q  422 gtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgag 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30551817 gtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagtcgaaaactcgaaagggcggcttaggca-aaaatgag 30551719  T
Q  522 cacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  30551718 caccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaacttatt 30551652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 27 - 572
Target Start/End: Original strand, 27025124 - 27025671
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27025124 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtctctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27025223  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||           ||||||    
T  27025224 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttc 27025323  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 313  Q
    |||| |||||||        ||||||| |||||| || | ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||         |    
T  27025324 aaagttatgtacaaaaaa--cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttttga--------a 27025413  T
Q  314 aagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||  || || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||    
T  27025414 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgagacatgcatgagctagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccag 27025513  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  27025514 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-a 27025612  T
Q  514 aaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggca 572  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27025613 aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggca 27025671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 26791795 - 26792362
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26791795 tcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26791894  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 215  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||            |||||||||    
T  26791895 ctttgtaaatccgtggaatcacgcctttggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttc 26791994  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 314  Q
    |||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  26791995 aaagctatatacaaat----cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaa 26792088  T
Q  315 a-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccag 413  Q
    | |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |  |||    
T  26792089 aagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcag 26792188  T
Q  414 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  26792189 gatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-a 26792287  T
Q  514 aaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26792288 aaaatgagcaccctgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 26792362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 26772847 - 26772281
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||||||||  |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26772847 tcatcaaaagcttctgcacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26772748  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttca 216  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||          ||||||    
T  26772747 ctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctattttcttctactttca 26772648  T
Q  217 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 315  Q
    ||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  26772647 aagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaac--tttttgtctattttgaaa 26772554  T
Q  316 g-caaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 414  Q
      ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| | |||||    
T  26772553 aacaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccagg 26772454  T
Q  415 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaa 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  26772453 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaataggctcgctaagtcgaaaacccggaagggcggcttaggca-a 26772355  T
Q  515 aaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||    
T  26772354 aaatgagcaccccgctggattgacgacccgaaagggcagttcaggcaaaaaaggggcattaaaaagaatttatt 26772281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 27491107 - 27491678
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| ||||| || | |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27491107 catcttcatcaaaagctcctatacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 27491206  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------- 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||               
T  27491207 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttcta 27491306  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtt 309  Q
    ||||||||||| | |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    ||| |||| ||    
T  27491307 ctttcaaagctgtatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--cctttggtctatt 27491400  T
Q  310 ttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 408  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||| |    
T  27491401 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaagttctcc 27491500  T
Q  409 cccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactta 508  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27491501 tccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaat-aaaatgcatgaaaataaataagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggctta 27491599  T
Q  509 ggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27491600 ggc-aaaaatgagcaccccgctggattgataacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatctatt 27491678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 28213433 - 28214001
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  28213433 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 28213532  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------cttt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||           ||||    
T  28213533 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctacttt 28213632  T
Q  215 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 313  Q
    ||||||| | |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||| ||||||||    
T  28213633 caaagctgtatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtgtgttttga 28213726  T
Q  314 aa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    || |||| ||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  28213727 aaagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 28213826  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  28213827 agataatctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc- 28213925  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28213926 aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatctatt 28214001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Original strand, 26926763 - 26927298
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26926763 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 26926862  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||          ||||||||||||| |||         
T  26926863 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctactttcaaagctatatacaattt 26926962  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaac 330  Q
        |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26926963 ----attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 26927056  T
Q  331 aaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 430  Q
    | ||||||||||||               |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||    
T  26927057 agggtacattcaaa---------------tgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctctaggatagtctgtggtcaat 26927141  T
Q  431 ggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccct 530  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  26927142 ggcaagaatgaaaaaacataatgaaaatgcatgaaaatgaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc-aagaatgagcaccccgct 26927240  T
Q  531 cgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26927241 ggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 26927298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Original strand, 4778876 - 4779427
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4778876 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 4778975  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttcaaa-gctatgtacnnn 230  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||           |||||||| ||| | |||       
T  4778976 agtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaaagctgtatacgaa 4779075  T
Q  231 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagca 328  Q
         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4779076 a----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagca 4779169  T
Q  329 acaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtca 428  Q
    ||| ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||||    
T  4779170 acagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtggtca 4779268  T
Q  429 atggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcaccccc 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  4779269 atggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccg 4779367  T
Q  529 ctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4779368 ctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaagagaatttatt 4779427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 24299974 - 24299412
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24299974 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaacccataaaattaccattttccaag 24299875  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc----------- 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||               
T  24299874 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactctc 24299775  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 314  Q
    |||| |||||||        | ||| | |||| | || |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||  ||    
T  24299774 aaagttatgtacaaaaa---cgtttcccttcttttttaataatgacaaatgctcggaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttt------ttgaaa 24299684  T
Q  315 agcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 414  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||  || || |||| || ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  24299683 agcaaacctgagtaacagggtacattcaaatgaa-catgcataagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagg 24299585  T
Q  415 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaa 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  24299584 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggca-a 24299486  T
Q  515 aaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24299485 aaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 24299412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 4531267 - 4531834
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4531267 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcgaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 4531366  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctttc 215  Q
    |||||| ||||||||||| |  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||           |||||    
T  4531367 ctttgtgaatccgtggagtcgtgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 4531466  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaa 314  Q
    |||||| | |||        |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  4531467 aaagctgtatacaaaa----cattctctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaa 4531560  T
Q  315 a-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctat-ttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | ||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  4531561 aagcaaacccgagcaacagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgtgggtgtctatcttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 4531659  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4531660 agataatctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc- 4531758  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4531759 aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 4531834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 15406731 - 15406185
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15406731 gcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 15406632  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||           |||||||||| |||||||        
T  15406631 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaa 15406532  T
Q  232 nnnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattg-aaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagca 328  Q
        ||||||| |||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  15406531 a---cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaagttttttga--------aaagcaaacctgagca 15406443  T
Q  329 acaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtca 428  Q
    ||| ||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||  | ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  15406442 acagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtca 15406344  T
Q  429 atggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcaccccc 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||     
T  15406343 atggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggtggcttaggca-aaaatgagcaccccg 15406245  T
Q  529 ctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15406244 ctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 15406185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 44 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 15418518 - 15417972
Alignment:
Q  44 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15418518 gcttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 15418419  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||           |||||||||| |||||||        
T  15418418 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaa 15418319  T
Q  232 nnnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattg-aaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagca 328  Q
        ||||||| |||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  15418318 a---cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaagttttttga--------aaagcaaacctgagca 15418230  T
Q  329 acaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtca 428  Q
    ||| ||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||  | ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  15418229 acagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtca 15418131  T
Q  429 atggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcaccccc 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||     
T  15418130 atggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggtggcttaggca-aaaatgagcaccccg 15418032  T
Q  529 ctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15418031 ctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 15417972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 28 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 16938243 - 16937677
Alignment:
Q  28 catcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctagg-aaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16938243 catctgaagcttttgtacttgcgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16938144  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc----------a 216  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||          |    
T  16938143 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctattttca 16938044  T
Q  217 aagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa 315  Q
    ||||||| |||         |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||   ||||||| | ||||||||    
T  16938043 aagctatatacaaatt----attttccttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaac--tttttgtttattttgaaa 16937950  T
Q  316 -gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccagg 414  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| || |||||| ||| | ||| |    
T  16937949 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcaggttctcctccaag 16937850  T
Q  415 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaa 514  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  16937849 ataatctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataattgggctcgctaagtcgaaaacccggaagggcggcttaggc-aa 16937751  T
Q  515 aaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16937750 gaatgagcaccccgccggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcagtgaaaagaatttatt 16937677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 129 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 26666774 - 26666310
Alignment:
Q  129 ttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttcaaa 218  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||          ||||||||    
T  26666774 ttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctattttcttctactttcaaa 26666675  T
Q  219 gctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaag- 316  Q
    ||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||   ||||||||| ||||||||      
T  26666674 gctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaac--tttttgtctattttgaaaaa 26666581  T
Q  317 caaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggat 416  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| | |||||||    
T  26666580 caaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggat 26666481  T
Q  417 agtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  26666480 agtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaataaataggctcgctaagtcgaaaacccggaagggcggcttaggca-aaa 26666382  T
Q  517 atgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||    
T  26666381 atgagcaccccgctggattgacgacccgaaagggcagttcaggcaaaaaaggggcattaaaaagaatttatt 26666310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 65 - 588
Target Start/End: Original strand, 20174566 - 20175108
Alignment:
Q  65 aggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctc 164  Q
    ||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| |    
T  20174566 aggaaatatagtgtttaccatgctcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccac 20174665  T
Q  165 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctacttt-------------caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatct 251  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||             ||||| |||||||        |||||||||||||| |    
T  20174666 cactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaactctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaaaa---cattttctttctattt 20174762  T
Q  252 tgataatgacaatgcttgaaa-caaacatcttgaaaat-----tgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaa 344  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||      | || ||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||     
T  20174763 tgatgatgacaatgcttgaaaacaaacattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaag 20174862  T
Q  345 caaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaa 444  Q
      ||||| ||||||| ||| |    || |||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  20174863 tgaaacatgcatgagcgagtgcgcatcaatgtatatctcaatatgtgttacaagcaagcttttccccaagacggtatgtggtcaatggcaagaatgaaaa 20174962  T
Q  445 aa--cagaatgaagatgcatgaaaa-tgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaac 541  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| |  ||||||||||    
T  20174963 aaaacagaatgaaaatgcatgaaaaatgaataagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcgacccgcgggattgacaac 20175061  T
Q  542 ccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || || ||| | | ||||| | ||||||  |||||||||||||||||    
T  20175062 cctaagggggaatccaggcaagaatgggataatgaaaagaatttatt 20175108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 65 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 22161425 - 22160883
Alignment:
Q  65 aggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctc 164  Q
    ||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| |    
T  22161425 aggaaatatagtgtttaccatgctcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccac 22161326  T
Q  165 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctacttt-------------caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatct 251  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||             ||||| |||||||        |||||||||||||| |    
T  22161325 cactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaactctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaaaa---cattttctttctattt 22161229  T
Q  252 tgataatgacaatgcttgaaa-caaacatcttgaaaat-----tgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaa 344  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||      | || ||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||     
T  22161228 tgatgatgacaatgcttgaaaacaaacattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaag 22161129  T
Q  345 caaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaa 444  Q
      ||||| ||||||| ||| |    || |||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  22161128 tgaaacatgcatgagcgagtgcgcatcaatgtatatctcaatatgtgttacaagcaagcttttccccaagacggtatgtggtcaatggcaagaatgaaaa 22161029  T
Q  445 aa--cagaatgaagatgcatgaaaa-tgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaac 541  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| |  ||||||||||    
T  22161028 aaaacagaatgaaaatgcatgaaaaatgaataagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggca-aaaatgagcgacccgcgggattgacaac 22160930  T
Q  542 ccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || || ||| | | ||||| | ||||||  |||||||||||||||||    
T  22160929 cctaagggggaatccaggcaagaatgggataatgaaaagaatttatt 22160883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 23851552 - 23851450
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23851552 catcttcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 23851453  T
Q  122 cca 124  Q
    |||    
T  23851452 cca 23851450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 476 - 560
Target Start/End: Original strand, 27548248 - 27548331
Alignment:
Q  476 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggc 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  | |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27548248 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaaa-gagcatcccggtggattgaaaacccgaaagggcagtccaggc 27548331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 551
Target Start/End: Original strand, 25710257 - 25710332
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggc 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||  | |||||| |||||||||||||    
T  25710257 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaaa-gagcgtcccggtggattgaaaacccgaaagggc 25710332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 473 - 566
Target Start/End: Original strand, 28308730 - 28308823
Alignment:
Q  473 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  28308730 aggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaacgagcgtcccggtggattgaaaacccgaaaaggcagtccaggcaaaaat 28308823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 522
Target Start/End: Original strand, 174314 - 174361
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 522  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  174314 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagc 174361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 566
Target Start/End: Original strand, 16584627 - 16584718
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  16584627 gctcgataagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 16584718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 16610753 - 16610662
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  16610753 gctcgataagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 16610662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 18947756 - 18947666
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | | |||| ||||  | || ||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18947756 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggtgacttaggcaataga-gagcgccccggtggactgaaaacccgaaagggcggttcaggcaaaaat 18947666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 566
Target Start/End: Original strand, 27515726 - 27515816
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  27515726 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcggcttaggc-aaaaatgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 27515816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 617885 - 617847
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  617885 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 617847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Original strand, 1547641 - 1547679
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1547641 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 1547679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 24145415 - 24145377
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  24145415 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 24145377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 475 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 18753028 - 18752987
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa 516  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18753028 gctcgctaagtcgaaaacccgtaagggcggcttaggcaaaaa 18752987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 27053564 - 27053523
Alignment:
Q  481 taagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 522  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27053564 taagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagcaaaaaatgagc 27053523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 189
Target Start/End: Original strand, 5991426 - 5991506
Alignment:
Q  111 attaccattttccaagctttgtaaa-tccgtggagccacgccttcggctgacctccact-cttatacatcaatttgagcct 189  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||| ||| |||| ||||| | | ||||| |||||||||||    
T  5991426 attaccattttccaaactttttaaaattcgtggagccacgcctttggcagaccaccactccatttacattaatttgagcct 5991506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 474 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 25501296 - 25501248
Alignment:
Q  474 ggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 522  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || |||||||    
T  25501296 ggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaagaatgagc 25501248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 4878 - 4307
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaa-ccaataata-ttaccattttcca 124  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  4878 tcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaaccaataaaaattaccattttcca 4779  T
Q  125 agctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------ctt 213  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||           |||    
T  4778 agctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactt 4679  T
Q  214 tcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtttt-g 312  Q
    |||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  4678 tcaaagctatatacaaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt-gtctatttttg 4583  T
Q  313 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4582 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 4483  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaat-gaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  4482 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatagaaaatgcatgaaaatgaataggcttgctaagttgaaaaccccgaagggcggcttaggc 4383  T
Q  512 aaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4382 -aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaaaggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 4307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 9918 - 9347
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  9918 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 9819  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------- 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||               
T  9818 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttcta 9719  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
    ||||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||    
T  9718 ctttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattt 9625  T
Q  311 tgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 409  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |     
T  9624 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcct 9525  T
Q  410 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9524 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttag 9425  T
Q  510 gcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  9424 gca-aaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcataaaaaagaatttatt 9347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 12023 - 12593
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12023 catcttcatcagaagcttctgtacttgcgaactcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 12122  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaattt-gagcctgtgcttttgttggaaactctac--------- 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||             
T  12123 ccaagctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactatctttct 12222  T
Q  212 --tttcaaagctatgtacnnnnnnnn-------cattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttt 302  Q
      |||||||||||||||                ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12223 actttcaaagctatgtaaaaaaaaaaaaaaaaacatttgctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt- 12321  T
Q  303 gtctgttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcagg 402  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12322 gtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 12421  T
Q  403 ctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggc 502  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12422 ctcttctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaa-------------atgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggc 12508  T
Q  503 gacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12509 gacttaggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggtagttcaggcaaaaatggggcaatgaaaagaatctatt 12593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 22 - 586
Target Start/End: Original strand, 1634 - 2204
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattt 120  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1634 catcttcatcagaagtttctgtgcttatgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 1733  T
Q  121 tccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta---------- 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||              
T  1734 tccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttcttcta 1833  T
Q  211 ctttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-tcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgtt 309  Q
    ||||||||||||| |||        ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||| |  |    
T  1834 ctttcaaagctatatacaaaa----cattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa--ctttttgtttact 1927  T
Q  310 ttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttc 408  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |    
T  1928 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacgatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcc 2027  T
Q  409 cccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactta 508  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  2028 tccgggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagtcgaaaacccggaagggcggctta 2127  T
Q  509 ggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaattta 586  Q
    ||| || |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2128 ggc-aagaatgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaattta 2204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 3458 - 2884
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3458 catcttcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 3359  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaact-------------- 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |                  
T  3358 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttctt 3259  T
Q  208 ctactttcaaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctg 307  Q
    |||||||||||||||| |||        |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  ||||     
T  3258 ctactttcaaagctatatacaaaa----cattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtcta 3165  T
Q  308 ttttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctct 406  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  3164 ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttct 3065  T
Q  407 tccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgact 506  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  3064 cctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaacaaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacctgaaagggcggct 2965  T
Q  507 taggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  2964 taggca-aaaatgagcaccccgctggattgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattaaaaagaatttatt 2884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 236 - 588
Target Start/End: Original strand, 18007 - 18357
Alignment:
Q  236 cattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaacaagg 334  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  18007 cattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttt--gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 18104  T
Q  335 tacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggca 434  Q
    ||| ||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18105 taccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaatggca 18204  T
Q  435 agaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgat 534  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  18205 agaatgaaaaaacagaacaaaaatgcatgaaaataaatgagctcgctaagttgaaaacctgaaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccgctggat 18303  T
Q  535 tgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  18304 tgaaaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattaaaaagaatttatt 18357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Original strand, 12034 - 12584
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12034 tgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 12133  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttcaaagctatgtacnnnn 231  Q
    || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||            ||||||||||||||||| ||         
T  12134 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttcaaagctatata----t 12229  T
Q  232 nnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaac 330  Q
        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  12230 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 12327  T
Q  331 aaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 430  Q
    | ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  12328 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaat 12427  T
Q  431 ggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccct 530  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  12428 ggcaagaatgaaaaaacagaacgaaaatgcacgaaaacaaatgagctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aaaaatgagcaccccgct 12526  T
Q  531 cgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12527 ggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 12584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 9184 - 8634
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 142  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9184 tgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 9085  T
Q  143 agccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttcaaagctatgtacnnnnn 232  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||          ||||||||||||| |||         
T  9084 agtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctattttcttctactttcaaagctatatacaaaa- 8986  T
Q  233 nnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaa-gcaaacctgagcaac 330  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||   ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  8985 ---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaac 8891  T
Q  331 aaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaat 430  Q
    | ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  8890 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaat 8791  T
Q  431 ggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccct 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  8790 ggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaagtgaatgagctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca-aaaatgagcaccccgct 8692  T
Q  531 cgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  8691 ggattgacaacccgaaagggcaattcaggcaaaaatggggcatggaaaagaatttatt 8634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 22 - 588
Target Start/End: Original strand, 9891 - 10463
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  9891 catcttcatcaaaagctcctatgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccatttt 9990  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc------ 215  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||          
T  9991 ccaagctttgtgaatccatgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttcttctat 10090  T
Q  216 ----aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttt 310  Q
        |||||||| |||        ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||    
T  10091 tttcaaagctatatacaaaa----cattttccttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattt 10184  T
Q  311 tgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcc 409  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |     
T  10185 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcct 10284  T
Q  410 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaac-agaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgactta 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10285 ccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacaagaatgaaaatgcatgaaaatgaatgagctcgctaagttgaaaacccggaagggcggctta 10384  T
Q  509 ggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  10385 ggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaagagaatttatt 10463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 43 - 588
Target Start/End: Original strand, 33295 - 33844
Alignment:
Q  43 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaagctttgtaaatccgtg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33295 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 33394  T
Q  142 gagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------actttcaaagctatgtacnnn 230  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||           |||||||||| |||||||       
T  33395 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaa 33494  T
Q  231 nnnnncattttctttctatcttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaa 329  Q
         ||||||| |||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  33495 aa---cattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttt-----ttgtaaaagcaaacctgagcaa 33586  T
Q  330 caaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaa 429  Q
    || ||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  33587 cagggtacattcaaatgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggtcaa 33685  T
Q  430 tggcaagaatgaaaa-aacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcaccccc 528  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||     
T  33686 tggcaagaatgaaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc-aaaaaggagcaccccg 33784  T
Q  529 ctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  33785 ctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 33844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 27 - 587
Target Start/End: Original strand, 6048 - 6611
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  6048 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccagtaaaaattaccattttccaa 6147  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactctactttc---------- 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||              
T  6148 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcatattgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttacttt 6247  T
Q  216 -aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg 312  Q
     |||| ||||| |        ||||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  6248 caaagttatgttcaaaaaa--cattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttga-------- 6337  T
Q  313 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  6338 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 6437  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  6438 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc- 6536  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttat 587  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6537 aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttat 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 13931 - 14499
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13931 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 14030  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta-----------cttt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||           ||||    
T  14031 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctacttt 14130  T
Q  215 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt-gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttga 313  Q
    ||||||| | |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||| ||||||||    
T  14131 caaagctgtatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac--tttttgtgtgttttga 14224  T
Q  314 aa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    || |||| ||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  14225 aaagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 14324  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  14325 agataatctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaaaaggctcgctaagttgaaaacccggaagggcggcttaggc- 14423  T
Q  513 aaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14424 aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatctatt 14499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 27 - 588
Target Start/End: Original strand, 15551 - 16125
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15551 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 15650  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaac-----------tctactttc 215  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||            |||||||||    
T  15651 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttcttctactttc 15750  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgata-atgacaatgcttgaaacaaacatctt------gaaaattgaaaaagttttttgtctgt 308  Q
    |||||||| |||        ||||||| |||||| || |   ||||||||||| ||||||||||| ||      ||||||||||||   ||||||||| |    
T  15751 aaagctatatacaaaa----cattttccttctattttaaacgatgacaatgctcgaaacaaacattttttttttgaaaattgaaaac--tttttgtctat 15844  T
Q  309 tttgaaa--gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctct 406  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  15845 tttgaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttct 15944  T
Q  407 tccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgact 506  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15945 cctccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaattgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggct 16044  T
Q  507 taggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16045 taggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccgaaagggcagttcaggcaaaaatggggcattgaaaagaatttatt 16125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 27 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 25174 - 24682
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25174 tcatcaaaagctcctacgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgggttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 25075  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactct-----------acttt 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||           |||||    
T  25074 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttacttt 24975  T
Q  215 caaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg 312  Q
    ||||| |||||||        ||||||| |||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||     |||      
T  24974 caaagttatgtacaaaaa---cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa--tttttt-----tttga 24885  T
Q  313 aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccca 412  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||| ||| || ||| | ||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  24884 aaagaaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctgtttcaatatatgttacaagcaggttctcctcca 24786  T
Q  413 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24785 ggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaaaatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccggaagggcgacttaggca 24686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 251 - 588
Target Start/End: Original strand, 1 - 323
Alignment:
Q  251 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctgttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaac 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt-gtctattttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaac 99  T
Q  351 acgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacaga 450  Q
    | |||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  100 atgcatgagcaagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccctaggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaa------- 192  T
Q  451 atgaagatgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaaggg 550  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  193 ------atgcatgaaaatgaataggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggc-aaaaatgagcaccccgctggattgacaacccggaaggg 285  T
Q  551 cagttcaggcgaaaatggggcaatgaaaagaatttatt 588  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  286 cagttcaggcaaaattggggcaaggaaaataatttatt 323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 18567 - 19015
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataata-ttaccattttccaa 125  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18567 tcatcaaaagctcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 18666  T
Q  126 gctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactcta----------ctttc 215  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||          |||||    
T  18667 gctttgtgaatccgtggggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttcttctactttc 18766  T
Q  216 aaagctatgtacnnnnnnnncattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatctt---gaaaattgaaaaagttttttgtctgttttg 312  Q
    |||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||   ||||||||| |||||    
T  18767 aaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaac--tttttgtctattttg 18860  T
Q  313 aaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacacgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtaacaagcaggctcttcccc 411  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||    
T  18861 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcc 18960  T
Q  412 aggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaatgaagatgcatgaaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  18961 aggatagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaacagaataaaaatgcatgaaa 19015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 208
Target Start/End: Original strand, 359 - 540
Alignment:
Q  27 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  359 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 458  T
Q  127 ctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttggaaactc 208  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  459 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactc 540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 118; Significance: 7e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26410 - 26241
Alignment:
Q  22 catcatcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataatattaccatttt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  26410 catcttcatcagaagcttctgtgcttgctaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgctcaatgtaccaccaacaaataaaatttccatttt 26311  T
Q  122 ccaagctttgtaaatccgtggagccacgccttcggctgacctccactcttatacatcaatttgagcctgt 191  Q
     ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26310 tcaagctttgtaaatctgtgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgt 26241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 317 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 40606 - 40321
Alignment:
Q  317 caaacctgagcaacaaggtacattcaaacaaaacac-gcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatg-tgtaacaagcaggctcttccccagg 414  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||| ||| || ||| | |||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  40606 caaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaataatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacataatgttacaagcaggttctcctccagg 40507  T
Q  415 atagtctgtggtcaatggcaagaatgaaaaaa-cagaa-tgaagatgcatg-aaaatgaat-aggctcgctaagttgaaaa-cccgaaagggcgacttag 509  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||     
T  40506 atagtatgtggtcaatggcaagaatgaaaaaaccagaactgaaaatgcatgaaaaatgaataaggctcgctaagttgaaaaccccggaagggcgtcttaa 40407  T
Q  510 gcaaaaaatgag-cacccccctcgattgacaacccgaaagggca-gttca--ggcgaaaatggggc---aatgaaaagaatttatt 588  Q
    |  ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||   | |||||||||||||||    
T  40406 ggcaaaaatgagccaccccgctggattgacaacccgaaagggcacgttcaccggcaaaaatggggcctaagtgaaaagaatttatt 40321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 40898 - 40744
Alignment:
Q  51 aattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtg-ttcaa-tgtaccaccaaccaat-aatattacca-ttttccaagc-tttgtaaatccg-tggag 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||  |||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  40898 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgtttcaattgtaccaccaaccaataaaaattaccatttttccaagcttttgtaaatccgttggag 40799  T
Q  145 ccacgccttcggc-tgacctccactcttatacatcaa-tttgagcctgtgctttt 197  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40798 tcacgccttcggcttgaccaccactcttatacatcaattttgagtctgtgctttt 40744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 15291 - 15200
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  15291 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaaaaaatgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 15200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1837 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1837
Description:

Target: scaffold1837; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 476 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 618 - 577
Alignment:
Q  476 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaa 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  618 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcggcttaggcaaaaaa 577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 5607 - 5523
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcagg 559  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  |||  | ||  || ||||||||||||| |||||||    
T  5607 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcggcttaggcaaaaaatgagcgtcccggtggaccgaaaacccgaaagggcggttcagg 5523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1418 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1418
Description:

Target: scaffold1418; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 1496 - 1405
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||||||||  |||  | |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  1496 gctcgctaagtcgaaaactcgaaagggcggcttaagccaaaaatgagcgtcccgatggattgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 1405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0257 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0257
Description:

Target: scaffold0257; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 566
Target Start/End: Original strand, 141 - 232
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  141 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 522
Target Start/End: Original strand, 173131 - 173177
Alignment:
Q  476 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 522  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  173131 ctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagcaaaaaatgagc 173177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 473 - 522
Target Start/End: Original strand, 20999 - 21048
Alignment:
Q  473 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 522  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  20999 aggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagc 21048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 189
Target Start/End: Original strand, 20638 - 20718
Alignment:
Q  111 attaccattttccaagctttgtaaa-tccgtggagccacgccttcggctgacctccact-cttatacatcaatttgagcct 189  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||| | || ||||| | | ||||| |||||||||||    
T  20638 attaccattttccaaactttttaaaatccgtggagccacgcctttggccggccaccactccatttacattaatttgagcct 20718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 474 - 522
Target Start/End: Original strand, 175 - 223
Alignment:
Q  474 ggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagc 522  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  175 ggctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagc 223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 473 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 20557 - 20517
Alignment:
Q  473 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20557 aggctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 20517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 3467 - 3376
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||   |||  | |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  3467 gctcgctaagtcgaaaacccgaaagggcagcttaagccaaaaatgagtgtcccggtggattgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 3376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 476 - 515
Target Start/End: Original strand, 33006 - 33045
Alignment:
Q  476 ctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa 515  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33006 ctcggtaagtcgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaa 33045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 566
Target Start/End: Original strand, 28319 - 28409
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  28319 gctcgataagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggc-aaaaatgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 28409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 1322 - 1284
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1322 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 1284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Original strand, 758 - 796
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  758 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 8290 - 8252
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8290 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 8252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 480 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 69202 - 69116
Alignment:
Q  480 ctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||  | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  69202 ctaagtcgaaaacccgaaagggcggcttaagccaaaaatgagcgtcccggtggactgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 69116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Original strand, 90367 - 90405
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  90367 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcgacttaggcaa 90405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0799 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0799
Description:

Target: scaffold0799; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 477 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 5319 - 5231
Alignment:
Q  477 tcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagcacccccctcgattgacaacccgaaagggcagttcaggcgaaaat 566  Q
    ||||||||||||||||| |||| || | |||||||| |||||||||  |||  | |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  5319 tcgctaagttgaaaacctgaaaaggtggcttaggca-aaaatgagcgtcccggtggattgaaaacccgaaagggcggtccaggcaaaaat 5231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 475 - 516
Target Start/End: Original strand, 11148 - 11189
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa 516  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  11148 gctcgctaagttgaaaacctgaaaaggcggcttaggcaaaaa 11189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 475 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 15289 - 15248
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaa 516  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15289 gctcgataagttgaaaacccgaaagggcagcttaggcaaaaa 15248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1691 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1691
Description:

Target: scaffold1691; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 475 - 523
Target Start/End: Original strand, 1148 - 1196
Alignment:
Q  475 gctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaaaaaatgagca 523  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||    
T  1148 gctcgctaagtcgaaaacccgcaagggcggcttaagccaaaaatgagca 1196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 473 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 32161 - 32121
Alignment:
Q  473 aggctcgctaagttgaaaacccgaaagggcgacttaggcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  32161 aggctcgctaagttgaaaacctcaaaaggcgacttaggcaa 32121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 193
Target Start/End: Original strand, 20592 - 20676
Alignment:
Q  111 attaccattttccaagctttgtaaa-tccgtggagccacgccttcggctgacctccact-cttatacatcaatttgagcctgtgc 193  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||| | || ||||| | | ||||| ||||||||| |||||    
T  20592 attaccattttccaaactttttaaaatccgtggagccacgcctttggcaggccaccactccatttacattaatttgagcatgtgc 20676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University