View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15637_high_20 (Length: 343)

Name: NF15637_high_20
Description: NF15637
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15637_high_20
NF15637_high_20
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (1-315)||(2041-2355)
scaffold0234 (1-315)||(10932-11246)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (1-315)||(17684189-17684503)
chr6 (1-315)||(27380972-27381286)
chr6 (1-315)||(27471355-27471669)
chr6 (1-315)||(11651896-11652210)
chr6 (1-315)||(17691160-17691474)
chr6 (1-315)||(29309063-29309377)
chr6 (1-315)||(29316023-29316336)
chr6 (1-315)||(188697-189011)
chr6 (76-315)||(27296877-27297116)
chr6 (42-315)||(16394165-16394438)
chr6 (74-311)||(25536915-25537152)
chr6 (93-314)||(16559193-16559414)
chr6 (1-298)||(13359010-13359303)
chr6 (1-98)||(16566257-16566354)
chr6 (11-305)||(2669476-2669768)
chr6 (8-315)||(16789071-16789373)
chr6 (8-315)||(22859888-22860190)
chr6 (8-315)||(27508347-27508649)
chr6 (8-315)||(1586108-1586410)
chr6 (8-301)||(27527947-27528235)
chr6 (8-315)||(14074480-14074782)
chr6 (8-271)||(18019885-18020143)
chr6 (1-293)||(10359073-10359358)
chr6 (8-315)||(8612915-8613221)
chr6 (9-137)||(27925935-27926062)
chr6 (9-212)||(17850321-17850521)
chr6 (78-230)||(20736413-20736562)
chr6 (26-131)||(28172754-28172859)
chr6 (1-132)||(20553492-20553621)
chr6 (61-246)||(8510155-8510338)
chr6 (202-315)||(33317055-33317167)
chr6 (76-315)||(17120505-17120740)
chr6 (8-103)||(13995151-13995245)
chr6 (76-218)||(21994655-21994794)
chr6 (6-218)||(19218427-19218630)
chr6 (22-143)||(19347092-19347212)
chr6 (7-187)||(22560311-22560487)
chr6 (1-46)||(25537148-25537193)
chr6 (174-237)||(28172899-28172963)
chr6 (159-298)||(28756145-28756283)
chr6 (83-230)||(5758565-5758709)
chr6 (6-218)||(4073574-4073781)
chr6 (8-44)||(20736594-20736630)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (1-315)||(24695186-24695500)
chr5 (1-315)||(19714218-19714532)
chr5 (1-315)||(19706939-19707252)
chr5 (1-315)||(18569581-18569897)
chr5 (24-315)||(17298621-17298912)
chr5 (9-193)||(39538769-39538953)
chr5 (24-315)||(17285470-17285759)
chr5 (1-228)||(18806843-18807068)
chr5 (153-319)||(27347252-27347417)
chr5 (208-315)||(24701950-24702057)
chr5 (8-315)||(20941027-20941329)
chr5 (8-315)||(25805385-25805687)
chr5 (8-315)||(31899-32201)
chr5 (8-315)||(12789663-12789965)
chr5 (8-315)||(22941250-22941552)
chr5 (8-315)||(23545922-23546224)
chr5 (5-139)||(22546912-22547046)
chr5 (8-315)||(24933306-24933608)
chr5 (10-303)||(20100255-20100543)
chr5 (8-315)||(31096816-31097118)
chr5 (8-315)||(12764990-12765296)
chr5 (8-315)||(5097651-5097953)
chr5 (8-315)||(7865430-7865736)
chr5 (8-315)||(9811733-9812039)
chr5 (8-315)||(12703874-12704180)
chr5 (90-228)||(18806483-18806619)
chr5 (90-228)||(18806663-18806799)
chr5 (1-88)||(27347425-27347512)
chr5 (230-319)||(28719471-28719558)
chr5 (66-315)||(18829281-18829530)
chr5 (8-315)||(26245102-26245404)
chr5 (76-319)||(26129689-26129928)
chr5 (234-315)||(39538954-39539035)
chr5 (11-140)||(33477193-33477321)
chr5 (9-53)||(39535465-39535509)
[»] chr4 (56 HSPs)
chr4 (1-315)||(18262385-18262699)
chr4 (1-315)||(18269246-18269560)
chr4 (1-315)||(55612856-55613170)
chr4 (1-315)||(26963813-26964127)
chr4 (1-315)||(26970636-26970950)
chr4 (1-315)||(868770-869084)
chr4 (1-315)||(19926480-19926794)
chr4 (1-315)||(5707493-5707807)
chr4 (1-315)||(5714121-5714435)
chr4 (1-315)||(8858340-8858654)
chr4 (1-315)||(10621053-10621367)
chr4 (1-315)||(10628132-10628446)
chr4 (1-315)||(28392854-28393168)
chr4 (1-315)||(8845376-8845690)
chr4 (1-315)||(4426336-4426638)
chr4 (1-315)||(35223733-35224047)
chr4 (4-315)||(5667849-5668156)
chr4 (1-319)||(20311465-20311781)
chr4 (83-315)||(10677303-10677534)
chr4 (83-315)||(10890943-10891174)
chr4 (8-315)||(15461497-15461799)
chr4 (8-315)||(34975551-34975853)
chr4 (8-315)||(2677013-2677315)
chr4 (8-315)||(15815021-15815323)
chr4 (8-315)||(18111043-18111345)
chr4 (8-315)||(3369023-3369325)
chr4 (8-315)||(17299959-17300261)
chr4 (8-315)||(18163162-18163464)
chr4 (8-315)||(20243937-20244239)
chr4 (8-315)||(26531613-26531915)
chr4 (8-315)||(4675983-4676285)
chr4 (4-140)||(56516232-56516368)
chr4 (9-315)||(5870419-5870720)
chr4 (64-214)||(21453961-21454110)
chr4 (8-299)||(19365519-19365806)
chr4 (8-315)||(1941724-1942026)
chr4 (29-315)||(32646523-32646807)
chr4 (76-298)||(19362477-19362695)
chr4 (83-315)||(9487625-9487853)
chr4 (8-213)||(32636484-32636685)
chr4 (76-299)||(5528495-5528714)
chr4 (1-299)||(5616388-5616681)
chr4 (12-90)||(24700213-24700291)
chr4 (95-315)||(30040489-30040705)
chr4 (83-299)||(9538033-9538244)
chr4 (8-230)||(4546080-4546298)
chr4 (98-315)||(11421096-11421309)
chr4 (187-237)||(24701361-24701411)
chr4 (64-218)||(33888594-33888743)
chr4 (55-182)||(34777850-34777975)
chr4 (9-52)||(10677538-10677581)
chr4 (9-52)||(10891178-10891221)
chr4 (206-287)||(9937745-9937826)
chr4 (1-66)||(9937933-9937998)
chr4 (85-176)||(9937830-9937923)
chr4 (8-44)||(11421016-11421052)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (1-315)||(6110237-6110551)
chr3 (1-315)||(16482203-16482517)
chr3 (1-315)||(10579075-10579389)
chr3 (1-315)||(15600604-15600918)
chr3 (1-315)||(15607149-15607463)
chr3 (1-315)||(10572312-10572626)
chr3 (4-315)||(15341939-15342250)
chr3 (9-315)||(8490676-8490982)
chr3 (1-315)||(18520148-18520462)
chr3 (1-311)||(18522836-18523146)
chr3 (4-315)||(15357306-15357617)
chr3 (1-315)||(17780838-17781152)
chr3 (1-315)||(13211475-13211789)
chr3 (1-315)||(13248780-13249094)
chr3 (1-315)||(32056619-32056934)
chr3 (1-319)||(17199900-17200218)
chr3 (1-315)||(13516984-13517294)
chr3 (1-315)||(1647241-1647555)
chr3 (4-315)||(17136535-17136840)
chr3 (1-315)||(29925144-29925458)
chr3 (1-315)||(29974297-29974611)
chr3 (25-315)||(16200627-16200917)
chr3 (8-315)||(21034238-21034540)
chr3 (8-315)||(15846536-15846838)
chr3 (8-315)||(20147554-20147856)
chr3 (8-315)||(21398792-21399094)
chr3 (1-297)||(24253130-24253422)
chr3 (8-315)||(14890391-14890693)
chr3 (8-315)||(55427021-55427323)
chr3 (8-315)||(12299911-12300212)
chr3 (76-315)||(25978728-25978963)
chr3 (1-217)||(14147014-14147226)
chr3 (83-281)||(15526827-15527021)
chr3 (157-315)||(28088251-28088408)
chr3 (76-315)||(11787654-11787889)
chr3 (11-315)||(15317176-15317472)
chr3 (47-176)||(28953965-28954093)
chr3 (49-241)||(32280313-32280507)
chr3 (4-46)||(19089734-19089776)
chr3 (5-93)||(9504460-9504548)
chr3 (4-119)||(8251933-8252048)
chr3 (162-277)||(30464147-30464261)
chr3 (25-67)||(16200321-16200363)
chr3 (154-218)||(36138033-36138097)
chr3 (87-139)||(4189223-4189275)
chr3 (154-218)||(36142816-36142880)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (1-315)||(18252203-18252517)
chr1 (1-315)||(18532234-18532548)
chr1 (1-315)||(27131130-27131443)
chr1 (1-315)||(27310297-27310611)
chr1 (1-315)||(16358755-16359069)
chr1 (1-315)||(3855639-3855953)
chr1 (1-315)||(36816354-36816667)
chr1 (34-315)||(22641594-22641871)
chr1 (1-315)||(27277278-27277591)
chr1 (1-187)||(21171081-21171267)
chr1 (8-315)||(19706439-19706741)
chr1 (8-315)||(43802365-43802667)
chr1 (8-315)||(28134723-28135025)
chr1 (24-315)||(23507096-23507385)
chr1 (8-315)||(9456116-9456418)
chr1 (122-315)||(9916497-9916689)
chr1 (8-315)||(20391239-20391541)
chr1 (8-315)||(20779645-20779947)
chr1 (8-315)||(22670257-22670559)
chr1 (8-315)||(42816989-42817291)
chr1 (9-237)||(12014084-12014310)
chr1 (1-148)||(22657108-22657255)
chr1 (8-315)||(22612492-22612794)
chr1 (8-295)||(633934-634216)
chr1 (1-117)||(9917837-9917952)
chr1 (8-315)||(8727667-8727969)
chr1 (8-315)||(47667485-47667776)
chr1 (76-299)||(29096789-29097008)
chr1 (8-140)||(35930582-35930713)
chr1 (24-113)||(12006461-12006550)
chr1 (202-315)||(28145723-28145835)
chr1 (83-215)||(21881475-21881604)
chr1 (63-228)||(24301691-24301855)
chr1 (16-142)||(26923553-26923678)
chr1 (83-136)||(51997353-51997406)
chr1 (168-248)||(12006332-12006413)
chr1 (154-213)||(10852402-10852461)
chr1 (97-176)||(31236402-31236478)
[»] chr8 (42 HSPs)
chr8 (1-314)||(21940838-21941151)
chr8 (1-315)||(22171660-22171974)
chr8 (1-315)||(6094296-6094610)
chr8 (5-315)||(24642826-24643135)
chr8 (52-315)||(15326422-15326685)
chr8 (52-315)||(15506791-15507054)
chr8 (174-315)||(28548393-28548534)
chr8 (5-248)||(14983710-14983950)
chr8 (8-315)||(21969333-21969635)
chr8 (1-315)||(8371253-8371562)
chr8 (3-200)||(24797224-24797419)
chr8 (8-315)||(12562123-12562425)
chr8 (8-315)||(27007517-27007819)
chr8 (8-315)||(27014660-27014962)
chr8 (8-315)||(27880487-27880789)
chr8 (8-315)||(28020668-28020970)
chr8 (8-315)||(22130609-22130911)
chr8 (8-315)||(25611195-25611497)
chr8 (1-299)||(38232115-38232411)
chr8 (9-315)||(22659494-22659795)
chr8 (8-315)||(21916676-21916978)
chr8 (8-315)||(45534273-45534575)
chr8 (8-315)||(26240484-26240786)
chr8 (1-218)||(18835343-18835556)
chr8 (76-315)||(6430953-6431188)
chr8 (1-135)||(32872741-32872875)
chr8 (84-230)||(8781959-8782102)
chr8 (31-117)||(2375214-2375300)
chr8 (208-305)||(24796731-24796826)
chr8 (153-299)||(20535226-20535371)
chr8 (76-315)||(2962932-2963171)
chr8 (11-105)||(29645537-29645631)
chr8 (202-320)||(36970439-36970556)
chr8 (202-319)||(2375411-2375528)
chr8 (8-115)||(36970265-36970371)
chr8 (166-288)||(29645675-29645797)
chr8 (55-107)||(10920427-10920479)
chr8 (27-82)||(24535514-24535569)
chr8 (254-315)||(8968015-8968076)
chr8 (1-29)||(28555056-28555084)
chr8 (255-303)||(41368106-41368154)
chr8 (255-303)||(41375077-41375125)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (1-315)||(7280-7594)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (1-315)||(6654-6968)
scaffold0390 (1-315)||(13670-13984)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (1-311)||(15152616-15152926)
chr7 (1-315)||(29327957-29328271)
chr7 (1-315)||(11535782-11536096)
chr7 (1-315)||(11542700-11543014)
chr7 (1-315)||(12750999-12751313)
chr7 (1-315)||(12738709-12739023)
chr7 (1-315)||(18561180-18561485)
chr7 (4-315)||(13392326-13392637)
chr7 (3-321)||(18257559-18257874)
chr7 (8-315)||(2204552-2204854)
chr7 (8-315)||(8464999-8465301)
chr7 (8-315)||(18400104-18400406)
chr7 (8-315)||(18407088-18407390)
chr7 (8-315)||(48808496-48808798)
chr7 (8-315)||(15729751-15730053)
chr7 (8-315)||(18139338-18139640)
chr7 (8-315)||(19230888-19231190)
chr7 (8-303)||(30254138-30254428)
chr7 (75-315)||(2365169-2365407)
chr7 (76-315)||(41680968-41681203)
chr7 (8-315)||(10668901-10669204)
chr7 (8-303)||(47166871-47167161)
chr7 (9-293)||(24443349-24443628)
chr7 (83-315)||(34128647-34128875)
chr7 (1-230)||(19388545-19388774)
chr7 (8-315)||(28130561-28130863)
chr7 (27-117)||(10235361-10235451)
chr7 (6-293)||(25845498-25845780)
chr7 (6-293)||(25845917-25846199)
chr7 (8-277)||(19393462-19393726)
chr7 (76-315)||(18259124-18259359)
chr7 (9-117)||(47833875-47833983)
chr7 (167-304)||(39112138-39112275)
chr7 (1-49)||(15148315-15148363)
chr7 (8-108)||(19859122-19859221)
chr7 (3-141)||(3132849-3132986)
chr7 (13-131)||(7662569-7662686)
chr7 (83-315)||(14591924-14592153)
chr7 (83-315)||(16011515-16011744)
chr7 (90-229)||(31190524-31190660)
chr7 (1-86)||(7396362-7396450)
chr7 (83-215)||(22969024-22969153)
chr7 (166-241)||(22948499-22948574)
chr7 (127-315)||(15169290-15169474)
chr7 (73-131)||(7396469-7396527)
chr7 (42-97)||(29983179-29983234)
chr7 (5-108)||(39111989-39112092)
chr7 (4-46)||(2365070-2365112)
chr7 (161-225)||(29984308-29984372)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (1-315)||(18461-18774)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (1-319)||(25706-26024)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (1-315)||(21329968-21330282)
chr2 (1-315)||(18796679-18796993)
chr2 (1-321)||(18619977-18620296)
chr2 (9-315)||(36270347-36270650)
chr2 (5-315)||(22183206-22183513)
chr2 (44-315)||(20978091-20978360)
chr2 (3-301)||(6991847-6992146)
chr2 (24-303)||(18822279-18822556)
chr2 (8-315)||(30174377-30174679)
chr2 (8-315)||(24250032-24250334)
chr2 (8-315)||(24229215-24229517)
chr2 (1-140)||(19279461-19279600)
chr2 (9-117)||(18851977-18852085)
chr2 (76-303)||(15342014-15342237)
chr2 (9-317)||(29800468-29800775)
chr2 (152-315)||(17241034-17241196)
chr2 (14-117)||(36801899-36802003)
chr2 (8-230)||(19616435-19616653)
chr2 (168-248)||(36799745-36799826)
chr2 (83-217)||(40301034-40301164)
chr2 (10-117)||(28741220-28741326)
chr2 (248-315)||(41661694-41661761)
chr2 (85-290)||(41316305-41316506)
chr2 (83-218)||(21626824-21626955)
chr2 (154-230)||(28740910-28740986)
chr2 (79-142)||(28718943-28719006)
chr2 (4-44)||(12098609-12098649)
chr2 (1-117)||(24763751-24763866)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (1-296)||(1166-1461)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (1-319)||(5702-6013)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (59-315)||(230111-230367)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (8-315)||(183-485)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (8-315)||(3675-3977)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (8-315)||(119730-120032)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (8-303)||(12961-13251)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (8-277)||(130262-130526)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (8-315)||(67374-67676)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (8-315)||(39988-40290)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (8-218)||(8305-8511)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (76-315)||(26609-26844)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (1-117)||(90033-90150)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (125-315)||(102-288)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (85-287)||(8807-9005)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (83-315)||(11526-11758)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (83-218)||(83111-83243)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (9-315)||(53766-54066)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (47-138)||(45956-46051)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2355 - 2041
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2355 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 2256  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2255 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 2156  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2155 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 2056  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  2055 actccatgaatcatg 2041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11246 - 10932
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11246 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 11147  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11146 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 11047  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11046 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 10947  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  10946 actccatgaatcatg 10932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17684503 - 17684189
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684503 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 17684404  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684403 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 17684304  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684303 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 17684204  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  17684203 actccatgaatcatg 17684189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27381286 - 27380972
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381286 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 27381187  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381186 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 27381087  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381086 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 27380987  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  27380986 actccatgaatcatg 27380972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27471669 - 27471355
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471669 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 27471570  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471569 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 27471470  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471469 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 27471370  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  27471369 actccatgaatcatg 27471355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 11651896 - 11652210
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11651896 aagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 11651995  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11651996 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcataatgatagtggtgtattccaccctt 11652095  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652096 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 11652195  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  11652196 actccatgaatcatg 11652210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17691474 - 17691160
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691474 aagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 17691375  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691374 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 17691275  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691274 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 17691175  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  17691174 actccatgaatcatg 17691160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 29309063 - 29309377
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309063 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 29309162  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309163 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 29309262  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309263 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaggtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 29309362  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  29309363 actccatgaatcatg 29309377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 29316023 - 29316336
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316023 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 29316122  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316123 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 29316222  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316223 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc-agtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 29316321  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  29316322 actccatgaatcatg 29316336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 189011 - 188697
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189011 aagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 188912  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188911 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 188812  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  188811 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgttatcattcaaatattgtctgtaacagaatgactataaagttgattgatggat 188712  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    ||||||| |||||||    
T  188711 actccataaatcatg 188697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 76 - 315
Target Start/End: Original strand, 27296877 - 27297116
Alignment:
Q  76 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 175  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27296877 acattgatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 27296976  T
Q  176 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296977 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 27297076  T
Q  276 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297077 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27297116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 42 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16394438 - 16394165
Alignment:
Q  42 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagt 141  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  16394438 tcacatatcatggataaacagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtagt 16394339  T
Q  142 aaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16394338 aaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggaatcgagt 16394239  T
Q  242 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16394238 gctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 16394165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 74 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25537152 - 25536915
Alignment:
Q  74 tcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctc 173  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25537152 tcacatagatataaatattaggtgtcatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 25537053  T
Q  174 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 273  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537052 atagtgacagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatttaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 25536953  T
Q  274 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 311  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25536952 ggatgattataaagttggttgatgggtactccatgaat 25536915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 93 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16559414 - 16559193
Alignment:
Q  93 aggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559414 aggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 16559315  T
Q  193 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 292  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559314 ccacccttcgacctgaaaccgctatgtaccgtagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 16559215  T
Q  293 tgatgggtactccatgaatcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16559214 tgatgggtactccatgaatcat 16559193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13359303 - 13359010
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||     
T  13359303 aagcgtagagactattatatggatagactgatgatcacatctcgcaaatcatggataaaaagttatcaaatcttcacttagatataagtattagaagtag 13359204  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccaccct 199  Q
    ||||||||||| ||||   |  |||||  ||||||||| | |||  ||||  ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13359203 tatttatattgaattgtctcaccatga--atactacattgaaaa--ttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccaccct 13359109  T
Q  200 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||  || | ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13359108 tcgacctgaaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtattttgttgccgtacaaacatcgtccgtaacaggatgactataaagtcggttgatgg 13359010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 16566354 - 16566257
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566354 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 16566257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Original strand, 2669476 - 2669768
Alignment:
Q  11 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 110  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2669476 actattatatgggtagattgatgatcacatctcatgaatcattgattaagagttatcatgtattcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 2669575  T
Q  111 ggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtga-tagtggtgtattccacccttcgacctgaa 209  Q
     ||||||  | |||||| ||||||||||||  || ||| |   |||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||  || ||||||||    
T  2669576 tgattgacacatcatgaaaatactacatag--aatgttgt-ttaagtatcataagttattctcatagtgacaagttgtgtattccactatttgacctgaa 2669672  T
Q  210 accactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 305  Q
    | || ||||||| |||||||| ||||||  || ||||||   | |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  2669673 atcattatgtactctagatgtaggagtccggtactttgttgtcgttcaaatgttatctataacaggatgactataaagtcagttgattggtactcc 2669768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 16789071 - 16789373
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16789071 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 16789169  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  16789170 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 16789266  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  16789267 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 16789365  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  16789366 gaatcatg 16789373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22860190 - 22859888
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22860190 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22860092  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22860091 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22859995  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  22859994 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 22859896  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  22859895 gaatcatg 22859888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27508649 - 27508347
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27508649 gagactgttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 27508551  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27508550 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27508454  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  27508453 aaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggtacttgat 27508355  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  27508354 gaatcatg 27508347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 1586410 - 1586108
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1586410 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 1586312  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  1586311 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 1586215  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  1586214 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 1586116  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  1586115 gaatcatg 1586108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27528235 - 27527947
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27528235 gagactgttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 27528137  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27528136 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27528040  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 301  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  27528039 aaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggta 27527947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 14074480 - 14074782
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14074480 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattgggagtaatatttat 14074578  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    | |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||| ||| | |||||   ||||||    | ||| ||||||    
T  14074579 aatggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattttcacaatgataaaagtgtatattgctcttagacctg 14074675  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||||  || ||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  14074676 aaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgcctttctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 14074774  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  14074775 gaatcatg 14074782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18020143 - 18019885
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18020143 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18020045  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18020044 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 18019948  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaa 271  Q
    ||| |||||||  | ||||||| | || || ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  18019947 aaatcactatgatctctagatg-tcgactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaa 18019885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10359358 - 10359073
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  | ||||| ||   ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||   ||||    
T  10359358 aagcgtagagactattatatatgtagagtgatgaccacatctcatgg-tcatgaatgt-gagatattaagtctatacatagatataaatattataggtaa 10359261  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    |||||||| ||||| || ||  | ||| ||||||||||||||   ||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| |||    
T  10359260 tatttatactggatcgacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaa--gtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactctt 10359165  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 293  Q
     ||| |||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||    
T  10359164 agacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcgtgtgctttattgtcattcaaacattgtccgtaacaggataaccattaagttggtt 10359073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 8612915 - 8613221
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8612915 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 8613013  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 204  Q
    | ||||| || ||  | ||||||||||||||||||   ||||| | |   | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  8613014 actggatagacccaccgtgagaatactacatagtac--gttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 8613111  T
Q  205 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 304  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||     
T  8613112 ctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggttgatgggtactt 8613210  T
Q  305 catgaatcatg 315  Q
     ||||||||||    
T  8613211 gatgaatcatg 8613221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Original strand, 27925935 - 27926062
Alignment:
Q  9 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 108  Q
    |||||||||||| | || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  27925935 agactattatgtggataaactgatgatctcatctcacggatcatggataaagatttatgaagttttcacatagatattaa-attaggaataatatttata 27926033  T
Q  109 ttggattgatccgtcatgagaatactaca 137  Q
    ||| |||||  || ||||| |||||||||    
T  27926034 ttgaattgactcgccatgataatactaca 27926062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17850521 - 17850321
Alignment:
Q  9 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 108  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||||| || || ||||||||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17850521 agactattatatgggtagactgatgatcatatcttatagatcattgacaacgagttatcgtgtattcacataggtataaatattatgagtaatatatata 17850422  T
Q  109 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttata-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    ||||||||| ||  | | |||||||||||| |     ||| ||   |||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  17850421 ttggattgaccctccttaagaatactacattg----ggttttatgtaagtatcataagttattcttatagtgatagtgatgtataccaccctttgacctg 17850326  T
Q  208 aaacc 212  Q
    |||||    
T  17850325 aaacc 17850321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20736562 - 20736413
Alignment:
Q  78 atagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatag 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |  | | ||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  20736562 ataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgatccatcgtgagaatactacatatt--atgctatgaaaa-tgtcataagatattctcacag 20736466  T
Q  178 tgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 230  Q
    ||||| | ||||||  ||| ||| ||||| |||| ||||||  ||||||||||    
T  20736465 tgataatagtgtatatcactcttagacctaaaactactatgatccctagatgt 20736413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 131
Target Start/End: Original strand, 28172754 - 28172859
Alignment:
Q  26 gactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcat 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| ||  |||    
T  28172754 gactgatgatcacatcttacagatcattgttaaaaagttatcaagtctttacatagatataaatattaagggtagtgtttatattggattgaccctccat 28172853  T
Q  126 gagaat 131  Q
    ||||||    
T  28172854 gagaat 28172859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20553621 - 20553492
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||   ||||||||||||| ||||||| || |||    
T  20553621 aagcataaagatttttatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatcgataaagaaatatcaaacattcacatagatat-aatattaagaataa 20553523  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaata 132  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  20553522 tatttatatt-gattgacccatcatgagaata 20553492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 246
Target Start/End: Original strand, 8510155 - 8510338
Alignment:
Q  61 agttatcaagtcttcacatagatataaa-tattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgt 159  Q
    ||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |    |||| ||||||||||||  || |||||  || ||||    
T  8510155 agttatcatttcttcatatagataaaaaatattagaagtaatatttatatttgattgacctacaatgataatactacatag--aatgttatgtaa-gtgt 8510251  T
Q  160 cataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 246  Q
    ||| || || |||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  8510252 cattagttactctcatagtgatggtggtgcattacatgcttcggcctggaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtacttt 8510338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 315
Target Start/End: Original strand, 33317055 - 33317167
Alignment:
Q  202 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 301  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  33317055 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggta 33317153  T
Q  302 ctccatgaatcatg 315  Q
    ||  ||||||||||    
T  33317154 cttgatgaatcatg 33317167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17120740 - 17120505
Alignment:
Q  76 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 175  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||    ||||||| ||| ||||||   ||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  17120740 acataggtataaatactaggagtagtatttatactggattgacccactgtgagaatgctaaatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcac 17120644  T
Q  176 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 275  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| || | |||    
T  17120643 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctatatgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtcaaagg 17120545  T
Q  276 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    || || |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  17120544 ataaccataacgttggttgatgggtgcttgatgaatcatg 17120505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 13995245 - 13995151
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13995245 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatat 13995151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Original strand, 21994655 - 21994794
Alignment:
Q  76 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 175  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||| |||     
T  21994655 acatagctataaacattacgagtaatatttatactggaatgacccaccatgagaatactaaatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattttcac 21994751  T
Q  176 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 218  Q
    | ||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||    
T  21994752 aatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaacgactatg 21994794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 218
Target Start/End: Original strand, 19218427 - 19218630
Alignment:
Q  6 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  | ||||| || | ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  19218427 tagagactattatgtatgtagactgatgaccacacctcatgggtcatgaat-atgagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaaaattt 19218525  T
Q  106 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 205  Q
    ||     ||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||||| |||| | |||||||||||||||| | ||||| || | ||| | || ||| ||||    
T  19218526 at-----attgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tttcataagatattctcagaatgataatgatatatactactcttagacc 19218617  T
Q  206 tgaaaccactatg 218  Q
    |||||||||||||    
T  19218618 tgaaaccactatg 19218630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19347212 - 19347092
Alignment:
Q  22 ggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccg 121  Q
    |||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||  |||||| |||| || |||||||| || |||||||| | |    
T  19347212 ggtagattgatgaccatatctcacatatcattgataaagagttgtcatgttttcacataagtataaacatta-gaataatatttgtaatggattgaactg 19347114  T
Q  122 tcatgagaatactacatagtaa 143  Q
     ||| |||||||||||||||||    
T  19347113 ccattagaatactacatagtaa 19347092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22560487 - 22560311
Alignment:
Q  7 agagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattta 106  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||  | |||||||||  ||| ||| |||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22560487 agagactattatgcatgtagaccgatgaccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtttatacataggtttaaatattaggagtaatattta 22560389  T
Q  107 tattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 187  Q
    || || ||||| |    ||||||| ||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  22560388 tactgtattgacctactatgagaacactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggt 22560311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 25537193 - 25537148
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 46  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537193 aagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 25537148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 237
Target Start/End: Original strand, 28172899 - 28172963
Alignment:
Q  174 atagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  28172899 atagtgataagtggtgtattccacccttcgaccggaaaccagtatgtaccctagatataggagtc 28172963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28756283 - 28756145
Alignment:
Q  159 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 258  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||  || |||  |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||  || |||| |||||| ||||    
T  28756283 tcataaaatattctcatagtgataatgatttatctcatcctatgacctgaaaccactgtgtaccatatatgtaggagtcatgtactttatcacca-tcaa 28756185  T
Q  259 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 298  Q
    | |||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  28756184 atgttgtatgtaacaagatgcctataaagtcggttgatgg 28756145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5758709 - 5758565
Alignment:
Q  83 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    |||||||||||||||||  | |||||  | | || ||||||||||||||| | | |||    
T  5758709 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccactgtgagaatactacatagt--acgttat-gagattgccataagatattctcacaattata 5758613  T
Q  183 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 230  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5758612 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt 5758565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 218
Target Start/End: Original strand, 4073574 - 4073781
Alignment:
Q  6 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 105  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||| || || ||||| |||  ||| ||| ||||||  |||||  | ||||||||||  |||||||||    
T  4073574 tagagactattatgtttgtagattgaggatcacatcccataggtcatgaatat-gagatattaagtctatacataagtgtaaatattagaggtaatattt 4073672  T
Q  106 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 205  Q
    ||||| |||||| |   | |||||||||||||||  | | ||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||  ||| ||||    
T  4073673 atatttgattgacctaccgtgagaatactacata--atatgttatgaaaa--ttcataagatattctcataatgataacgatgtataccaatcttagacc 4073768  T
Q  206 tgaaaccactatg 218  Q
    | |||||||||||    
T  4073769 taaaaccactatg 4073781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 20736630 - 20736594
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 44  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20736630 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctca 20736594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24695500 - 24695186
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695500 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 24695401  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695400 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 24695301  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695300 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 24695201  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  24695200 actccatgaatcatg 24695186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19714532 - 19714218
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714532 aagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 19714433  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19714432 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccaccctt 19714333  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714332 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 19714233  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    ||| |||||||||||    
T  19714232 actacatgaatcatg 19714218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19707252 - 19706939
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19707252 aagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaaatcttcacatagatataaatactaggagtaa 19707153  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19707152 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagattttctcatagtgataattgtgtattccaccctt 19707053  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19707052 cgacctg-aataactatgtaccctagatattggagtcgagtgctctgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggt 19706954  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  19706953 actccatgaatcatg 19706939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18569897 - 18569581
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggata--aagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 98  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569897 aagcataaagactattatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatggatataaagagatatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 18569798  T
Q  99 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18569797 aatatttatattggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattatcatagtgatagtggtgtattccaccc 18569698  T
Q  199 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18569697 ttcgacctgaaaccactatgtaccctacatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaaattggttgatgg 18569598  T
Q  299 gtactccatgaatcatg 315  Q
    ||||| |||||||||||    
T  18569597 gtacttcatgaatcatg 18569581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17298912 - 17298621
Alignment:
Q  24 tagactgatgatcaca--tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccg 121  Q
    ||||||||||||||||  | |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  17298912 tagactgatgatcacacatatcacgggtcatggataaagagttattaaatcttcacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgaccca 17298813  T
Q  122 tcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgta 220  Q
     |||||||||||||| |||  ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17298812 ccatgagaatactacgtag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggcgtattccacccttcaacctgaaaccaatatgta 17298716  T
Q  221 ccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    |||||| | | |||||||||| ||||||  || | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17298715 ccctaggtttaggagtcgagtactttgtttccgtacaaacgttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatg 17298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 39538769 - 39538953
Alignment:
Q  9 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39538769 agactattatgtgggtagactgatggtcatatttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 39538868  T
Q  109 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 193  Q
    ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39538869 ttggattgacccaccatgaaaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataaaatattctcatagtgatagtggtatattc 39538953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17285759 - 17285470
Alignment:
Q  24 tagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtc 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||       
T  17285759 tagactgatgatcacatatcacaggtcatggataaagagttatcaagtctttacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaca 17285660  T
Q  124 atgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacc 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  | | | ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  17285659 atgagaatactacatag--aaagttatgtata-tatcataagttattatcatagtgataagtggtatattccactcttcgacctgaaatcaatatgtacc 17285563  T
Q  223 ctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    |||| | | ||| |||||| ||||||  || | ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17285562 ctaggtttaggattcgagtactttgtttccgtacaaactttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatg 17285470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18807068 - 18806843
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18807068 aagcatagagactattatgcgggtagactgatgatcacatttcatatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagtaa 18806969  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccct 199  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| |   || ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18806968 tgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagtt-ttgtaactgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtattccaccct 18806872  T
Q  200 tcgacctgaaaccactatgtaccctagat 228  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806871 tcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 27347417 - 27347252
Alignment:
Q  153 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcacc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27347417 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccaccctttgacacgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgttttgtcacc 27347318  T
Q  253 attcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 319  Q
    ||||||| ||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27347317 attcaaatgttatctttaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 27347252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 208 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24702057 - 24701950
Alignment:
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702057 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 24701958  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  24701957 gaatcatg 24701950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 20941027 - 20941329
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20941027 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 20941125  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  20941126 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 20941222  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  20941223 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 20941321  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  20941322 gaatcatg 20941329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 25805687 - 25805385
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25805687 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 25805589  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |||  |||||    
T  25805588 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttacacctg 25805492  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  25805491 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 25805393  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  25805392 gaatcatg 25805385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 31899 - 32201
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31899 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 31997  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  31998 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 32094  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  32095 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 32193  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  32194 gaatcatg 32201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12789965 - 12789663
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12789965 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 12789867  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||| |  | ||| ||||||    
T  12789866 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatactgctcttagacctg 12789770  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  12789769 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 12789671  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  12789670 gaatcatg 12789663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 22941250 - 22941552
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||  | |||| ||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22941250 gagactattatgtatgtagactgatgaccgtatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtttatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22941348  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22941349 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22941445  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  22941446 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 22941544  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  22941545 gaatcatg 22941552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 23545922 - 23546224
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23545922 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 23546020  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  23546021 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 23546117  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  23546118 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 23546216  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  23546217 gaatcatg 23546224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22547046 - 22546912
Alignment:
Q  5 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 104  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22547046 atagagactattatgtggatagaccgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttatcaagttttcatatagatataaatattatgagtaatatt 22546947  T
Q  105 tatattggattgatccgtcatgagaatactacata 139  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  22546946 tatattggattgaccagccatgagaatactacata 22546912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24933608 - 24933306
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24933608 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 24933510  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  24933509 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 24933413  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  24933412 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 24933314  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  24933313 gaatcatg 24933306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20100543 - 20100255
Alignment:
Q  10 gactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatat 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  | |||| ||| |||||||||||||||| |||||     
T  20100543 gactattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgggtcatgaatat-gagatattaagtctatagataggtatcaatattaggagtaatacttatac 20100445  T
Q  110 tggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaa 209  Q
    ||| |||| ||  | |||||| |||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  20100444 tggcttgacccaacgtgagaaaactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacatgaa 20100348  T
Q  210 accactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 303  Q
    |||||||||  ||| ||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  20100347 accactatgatcccaagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggttgatgggtact 20100255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 31096816 - 31097118
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  31096816 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaattataggagtaatatttat 31096914  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  31096915 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 31097011  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||| ||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  31097012 aaaccattatgatccctagatg-tggaatcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 31097110  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  31097111 gaatcatg 31097118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12765296 - 12764990
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12765296 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaatatttat 12765198  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 204  Q
    ||||||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||   |  || |||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  12765197 attggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgagattaattgtcataagacattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 12765100  T
Q  205 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 304  Q
    ||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||||||||||     
T  12765099 ctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtactt 12765001  T
Q  305 catgaatcatg 315  Q
     ||||||||||    
T  12765000 gatgaatcatg 12764990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 5097651 - 5097953
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  5097651 gagactattatgtatgtagactgatgactacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattatgagtaatatttat 5097749  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||| | ||  | |||||||||||||||||  | |||||  ||| ||||||||| |||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  5097750 attggattaacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-gaaattgtcataagttattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 5097846  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||   ||    
T  5097847 aaaccactatgatcccgagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgtttgttgatgggtacatgat 5097945  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  5097946 gaatcatg 5097953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7865736 - 7865430
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7865736 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 7865638  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 204  Q
    | ||||| || ||  | ||||||||||||||||||   ||||| | |   | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  7865637 actggatagacccaccgtgagaatactacatagtac--gttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 7865540  T
Q  205 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 304  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||     
T  7865539 ctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggttgatgggtactt 7865441  T
Q  305 catgaatcatg 315  Q
     ||||||||||    
T  7865440 gatgaatcatg 7865430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9812039 - 9811733
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9812039 gagactactatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaatatttat 9811941  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 204  Q
    ||||||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||   |  || ||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  9811940 attggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 9811843  T
Q  205 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 304  Q
    ||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||||||||||     
T  9811842 ctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtactt 9811744  T
Q  305 catgaatcatg 315  Q
     ||||||||||    
T  9811743 gatgaatcatg 9811733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12704180 - 12703874
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12704180 gagactactatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaatatttat 12704082  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 204  Q
    ||||||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||   |  || ||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  12704081 attggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 12703984  T
Q  205 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 304  Q
    ||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||||||||||     
T  12703983 ctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtactt 12703885  T
Q  305 catgaatcatg 315  Q
     ||||||||||    
T  12703884 gatgaatcatg 12703874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18806619 - 18806483
Alignment:
Q  90 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 188  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| |  ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18806619 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806523  T
Q  189 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806522 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18806799 - 18806663
Alignment:
Q  90 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 188  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| |  ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18806799 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806703  T
Q  189 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806702 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 27347512 - 27347425
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa 88  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27347512 aagcatagagactattttgtggataggccgatgatcacatctcacagatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaa 27347425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 230 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 28719558 - 28719471
Alignment:
Q  230 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28719558 ttggagtcgagtgctttatcaccgt-caaacgttgtctgtaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 28719471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18829530 - 18829281
Alignment:
Q  66 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataag 165  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||  ||||||||   ||||  ||||||    
T  18829530 tcaagtgttctcatatatataaatattaggaccaatatttatattggattgacccaccatgagaatgatacatag--aaagttat-gtaagttccataag 18829434  T
Q  166 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttg 264  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||| || ||||||   | | |||| ||      
T  18829433 ttattctcataatgataagtggtgtattccatcatttgacctaaaaccactatgtacact-gatgtgagagtcgtgtactttgttgtcgtacaaatgtca 18829335  T
Q  265 tccgtaacaggatgactataaagttgg---ttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    ||  ||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  18829334 tctataaaatgatgactataaagttggttattgatgggtactccatggatcatg 18829281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 26245102 - 26245404
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  | |||| ||||  ||| ||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26245102 gagactattatgtatgtagactgatgattgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtttatacataggtataaatattaggagtaatatttat 26245200  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    | | |||||||||    | |||||||| ||||||  | |||||  ||| |||||||||||||||||| | || || | ||||||  | | ||| ||||||    
T  26245201 acttgattgatccactgtcagaatactgcatagt--atgttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgttaatagtgtatatcgctcttagacctg 26245297  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||| ||||  | ||||||  |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||  |||||||||||||||||  ||    
T  26245298 aaaccattatgatctctagat-atggacttaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccatagcgttggttgatgggtacttgat 26245396  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  26245397 gaatcatg 26245404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 26129928 - 26129689
Alignment:
Q  76 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 175  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | ||| ||||| |||||||  | ||||| |||| ||| ||||||||||||||     
T  26129928 acatatatacaaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgaaaataccacatagt--atgttatgaaaa-tgtaataagatattctcac 26129832  T
Q  176 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 275  Q
    | ||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||  | ||||||| |||| || |||||||| |  |||||| ||| |||||  ||| | |    
T  26129831 attgataatggtgtatatcactcttagacatgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttattgccattctaacattgtctataaaaag 26129733  T
Q  276 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 319  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||    
T  26129732 ataaccataacgttggctaatgggtacttaatgaatcatgatga 26129689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 234 - 315
Target Start/End: Original strand, 39538954 - 39539035
Alignment:
Q  234 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||  | || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  39538954 agtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtttggaataggatgattataaagttggttggtaggtactccacgaatcatg 39539035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 33477321 - 33477193
Alignment:
Q  11 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 110  Q
    ||||||||||  ||| |||||| ||||||| ||| || |||||||||  ||  |||||| ||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||      
T  33477321 actattatgtgagtaaactgataatcacatatcaaaggtcatggatat-gaaatatcaaatctacaaataaatattaatattaagagtaatatttataca 33477223  T
Q  111 ggattgatccgtcatgagaatactacatag 140  Q
      ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  33477222 taattgatctgccataagaatactacatag 33477193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 53
Target Start/End: Original strand, 39535465 - 39535509
Alignment:
Q  9 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatg 53  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  39535465 agactattatgtatgtagactgatgaccacatctcataggtcatg 39535509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 56)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 18262385 - 18262699
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262385 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 18262484  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262485 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 18262584  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262585 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 18262684  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  18262685 actccatgaatcatg 18262699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 18269246 - 18269560
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269246 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 18269345  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269346 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 18269445  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269446 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 18269545  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  18269546 actccatgaatcatg 18269560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 55612856 - 55613170
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612856 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 55612955  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612956 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 55613055  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613056 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 55613155  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  55613156 actccatgaatcatg 55613170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 26963813 - 26964127
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26963813 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagcagtaa 26963912  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963913 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 26964012  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964013 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 26964112  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  26964113 actccatgaatcatg 26964127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 26970636 - 26970950
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26970636 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagcagtaa 26970735  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970736 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 26970835  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970836 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 26970935  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  26970936 actccatgaatcatg 26970950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 868770 - 869084
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868770 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 868869  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  868870 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattccaccctt 868969  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868970 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 869069  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  869070 actccatgaatcatg 869084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19926794 - 19926480
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19926794 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcaaatagatataaatattaggagtaa 19926695  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926694 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 19926595  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926594 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 19926495  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  19926494 actccatgaatcatg 19926480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 5707493 - 5707807
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5707493 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaa 5707592  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5707593 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccatcctt 5707692  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707693 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 5707792  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  5707793 actccatgaatcatg 5707807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 5714121 - 5714435
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5714121 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaa 5714220  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5714221 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccatcctt 5714320  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714321 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 5714420  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  5714421 actccatgaatcatg 5714435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 8858340 - 8858654
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8858340 aagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcatatagatataaatattaggagtaa 8858439  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858440 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 8858539  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858540 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 8858639  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  8858640 actccatgaatcatg 8858654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10621367 - 10621053
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10621367 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaattttaggagtaa 10621268  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10621267 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgttttccaccctt 10621168  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621167 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 10621068  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  10621067 actccatgaatcatg 10621053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10628446 - 10628132
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628446 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 10628347  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10628346 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgttttccaccctt 10628247  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628246 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 10628147  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  10628146 actccatgaatcatg 10628132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28393168 - 28392854
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28393168 aagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagtaa 28393069  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393068 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 28392969  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28392968 caacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgagt 28392869  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  28392868 actccatgaatcatg 28392854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 8845376 - 8845690
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  8845376 aagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattctttatatagatataaatattaggagtaa 8845475  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8845476 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccatcctt 8845575  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8845576 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgggt 8845675  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  8845676 actccatgaatcatg 8845690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4426638 - 4426336
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426638 aagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 4426539  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426538 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaatctatgaaaag------------ttctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 4426451  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426450 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgttaccattcaaacattgtccgtaataggatgactataaagttggttgatgggt 4426351  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  4426350 actccatgaatcatg 4426336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 35223733 - 35224047
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  35223733 aagcatatagactattatgtgggtagacggatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtctttacatatgtataaatattaggagtaa 35223832  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35223833 tatttatactggattgaaccaccatgagaatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgttgtattccaccctt 35223932  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
     ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  35223933 tgacctgaaaccacgatgtaccttagatgttggagtcgagtgctttatcaacattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgtgt 35224032  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||| ||||||||    
T  35224033 actccacgaatcatg 35224047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5668156 - 5667849
Alignment:
Q  4 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 103  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  5668156 catagagactattatgtggatagaccgatgatca--tctcacggatcatagataaagagttatcatatcttcacgtaggtataaatattaggagtaatat 5668059  T
Q  104 ttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 203  Q
    ||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5668058 ttatactggattgactcaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttaga 5667959  T
Q  204 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5667958 cctgaaaccactatgtaccctagatgttg--gtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtact 5667861  T
Q  304 ccatgaatcatg 315  Q
    ||| ||||||||    
T  5667860 ccacgaatcatg 5667849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 20311465 - 20311781
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20311465 aagcatagagactattttgtgggtagattgatgatcacatatcatggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatgtaaatattaggagtaa 20311564  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccct 199  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||||   || | |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20311565 tttttatattggattgacctgtcatgagaatactacatag--acagttat-gtaactatcatacattattctcatagtgataagtggtgtattccaccct 20311661  T
Q  200 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 299  Q
    || || |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||    
T  20311662 tctacttgaaaccactatttaccctagatgtaggattcgagtactttgttcccgtacaaacgttgtccgtagcaggatgactataaagtcggttaatcgg 20311761  T
Q  300 tactccatgaatcatgatga 319  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  20311762 tactccacgaatcatgatga 20311781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 83 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10677534 - 10677303
Alignment:
Q  83 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677534 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10677435  T
Q  183 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 282  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10677434 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10677336  T
Q  283 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10677335 taaagttggtagatgggtactccatgaaccatg 10677303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 83 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10891174 - 10890943
Alignment:
Q  83 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891174 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10891075  T
Q  183 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 282  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10891074 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10890976  T
Q  283 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10890975 taaagttggtagatgggtactccatgaaccatg 10890943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 15461497 - 15461799
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461497 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 15461595  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  15461596 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 15461692  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  15461693 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 15461791  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  15461792 gaatcatg 15461799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 34975551 - 34975853
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34975551 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 34975649  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  34975650 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 34975746  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  34975747 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 34975845  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  34975846 gaatcatg 34975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 2677013 - 2677315
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677013 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 2677111  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  2677112 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 2677208  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  2677209 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 2677307  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  2677308 gaatcatg 2677315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 15815021 - 15815323
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15815021 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 15815119  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  15815120 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 15815216  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  15815217 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 15815315  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  15815316 gaatcatg 15815323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18111345 - 18111043
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111345 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18111247  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18111246 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 18111150  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  18111149 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 18111051  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  18111050 gaatcatg 18111043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3369325 - 3369023
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3369325 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 3369227  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  3369226 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 3369130  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  3369129 aaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 3369031  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  3369030 gaatcatg 3369023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17300261 - 17299959
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17300261 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 17300163  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  17300162 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 17300066  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||| | |||  ||    
T  17300065 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgagcacttgat 17299967  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  17299966 gaatcatg 17299959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 18163162 - 18163464
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18163162 gagactattatgtatgtagactgatgatcgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 18163260  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||| | ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  18163261 attggattcacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 18163357  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  18163358 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 18163456  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  18163457 gaatcatg 18163464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 20243937 - 20244239
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20243937 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 20244035  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  20244036 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 20244132  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  20244133 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 20244231  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  20244232 gaatcatg 20244239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 26531613 - 26531915
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26531613 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaaggctatacataaatataaatattaggagtaatatttat 26531711  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  26531712 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 26531808  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  26531809 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 26531907  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  26531908 gaatcatg 26531915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4676285 - 4675983
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4676285 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 4676187  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  4676186 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 4676090  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||  ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  4676089 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattataacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 4675991  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  4675990 gaatcatg 4675983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 56516232 - 56516368
Alignment:
Q  4 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  56516232 catagagactattatgtaggtagattaatgatcaaatctcacagataatggataaagagttatcaagtcttcacatacgtataaatatcatgagtaatat 56516331  T
Q  104 ttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 140  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||    
T  56516332 ttatattggattgactcgctatgagaacactacatag 56516368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 315
Target Start/End: Original strand, 5870419 - 5870720
Alignment:
Q  9 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5870419 agactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttata 5870517  T
Q  109 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 208  Q
    ||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||| |||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  5870518 ttggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcatatgatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 5870614  T
Q  209 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 308  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||   ||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||  |||    
T  5870615 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgtcattctaacgttgtctataataggataacaataacgttggttgatgagtacttgatg 5870713  T
Q  309 aatcatg 315  Q
    |||||||    
T  5870714 aatcatg 5870720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21454110 - 21453961
Alignment:
Q  64 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 163  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||  ||||||  ||| | |||||    
T  21454110 tatcaagttttcacatacatataaatattaggagtaatatttatattgaattgacccaccatgagaatactacata-tatgagttatgtaaaatatcata 21454012  T
Q  164 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac 214  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21454011 agatattttcattgtgatagtggtgtatgtcacccttcgacctgaaaccac 21453961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 299
Target Start/End: Original strand, 19365519 - 19365806
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  | |||||  ||  ||| ||| || |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19365519 gagactattatatacgtagactgatgaccacatctcatgggtcatgagtat-gagatattaaatctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 19365617  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctca-tagtgatagtggtgtattccacccttcgacct 206  Q
    | |||||||| ||  | ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  19365618 actggattgacccaccgtgagagtactacatagt--atgttat-gaaagtgtcataagatattctcaccaatgataatggtgtataccactcttagacct 19365714  T
Q  207 gaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 299  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||    
T  19365715 gaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacaggatgaccataacgttagttaatggg 19365806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 1941724 - 1942026
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1941724 gagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 1941822  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||| | ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  1941823 attggattaacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcatgagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 1941919  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| || |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  1941920 aaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaatgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 1942018  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  1942019 gaatcatg 1942026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 32646807 - 32646523
Alignment:
Q  29 tgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgag 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |   ||| ||    
T  32646807 tgatgatcacatctcacggatcattgataaaggaatatcgagtcttcacatagatataaatattaggaataatatttacattggattgacctaccataag 32646708  T
Q  129 aatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 227  Q
    ||| |||||||  ||| |||||  | |  |||| | || |||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||    
T  32646707 aatgctacata--aaaggttatgtata-agtcacatgacattcccgtagtgataagtggtgtattttacccttcgacctgaaacaactctgtatcctgga 32646611  T
Q  228 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    |||  |||||| || ||||||   | | |||||||  ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  32646610 tgtatgagtcgggtactttgttgtcgtacaaacgtcatccataacaggatgattatgaagtcggttgatgggtaccggatgaatcatg 32646523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 298
Target Start/End: Original strand, 19362477 - 19362695
Alignment:
Q  76 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 175  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||     
T  19362477 acataggtattaatattaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactacatagt--atgttat-caaagtgtcataagatattctcac 19362573  T
Q  176 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 275  Q
    | ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||  || |||||| |||| |  | |||||| |   ||||||||||||||| ||||||||    
T  19362574 aatgataatggtgtataccactcttaaacctgaaaccactatgatccttagatg-tggacttaaatgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacagg 19362672  T
Q  276 atgactataaagttggttgatgg 298  Q
    ||||| |||| | ||||| ||||    
T  19362673 atgaccataacggtggttaatgg 19362695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 315
Target Start/End: Original strand, 9487625 - 9487853
Alignment:
Q  83 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||  | | |||||||||||||||||| | |||||    
T  9487625 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccatcgtgagaatactacatagt--aagttat-gagattgtcataagatattctcacaatgata 9487721  T
Q  183 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 282  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||   ||||  ||||||||| |||| ||||| || |    
T  9487722 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgttgtcattataacgttgtctgtaataggataacca 9487820  T
Q  283 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9487821 taacattggttgatgggtacttgatgaatcatg 9487853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 213
Target Start/End: Original strand, 32636484 - 32636685
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | ||||| |||  ||| ||| |||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  32636484 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatgaatac-gagatattaagtccatgcataggtataaatattatgagtaatatttat 32636582  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| || |||| ||    
T  32636583 attggattgacccaatgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactctccgacgtg 32636679  T
Q  208 aaacca 213  Q
    ||||||    
T  32636680 aaacca 32636685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5528714 - 5528495
Alignment:
Q  76 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 175  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||  | ||||||||| || ||||| |  |||| |||| || ||||||||||||||||    
T  5528714 acataggtataaatattaggagtgatatttatattgtattaacccaacgtgagaataccacgtagtata--ttatgaaaa-tgccataagatattctcat 5528618  T
Q  176 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 275  Q
    | ||||| ||||||||  ||| |||  |||||||||  |||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||    
T  5528617 aatgataatggtgtataacactcttatacctgaaactgctatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaacgttatctgtaacagg 5528519  T
Q  276 atgactataaagttggttgatggg 299  Q
    || || |||| ||||||| |||||    
T  5528518 ataaccataatgttggttaatggg 5528495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 5616388 - 5616681
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||  | ||||  |||  ||| | | |||| |  || ||| |||||||||||| |||||    
T  5616388 aagcattgagactattatgtatgtagattgatgaccacatctcatgggtcataaatat-gagatgttaagtatatacgtaggtataaatattagaagtaa 5616486  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    |||||||| |||||||| |   | ||||||||||||| |||  |  |||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||  |||    
T  5616487 tatttatactggattgaccaaccgtgagaatactacagagttta--ttatgaaa-gtgtcataagatattcttacaatgataatggtgtataccaatctt 5616583  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 299  Q
     || ||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||  |||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  5616584 agatctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtttgtaacaagataactgtaacgttggttaatggg 5616681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 90
Target Start/End: Original strand, 24700213 - 24700291
Alignment:
Q  12 ctattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 90  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24700213 ctattatgtgggtagactgataatcacatcttacagatcttggataaagagatattaagtcttcacatagatataaata 24700291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30040705 - 30040489
Alignment:
Q  95 gagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 194  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||  ||||||| ||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  |    
T  30040705 gagtaatatttatactagattgacccaccatgagagtactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatc 30040609  T
Q  195 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 294  Q
    || ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| || |||||  |||| ||||| || |||| |||||||     
T  30040608 actcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaatgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggtta 30040510  T
Q  295 atgggtactccatgaatcatg 315  Q
    ||| |||||  ||||||||||    
T  30040509 atgagtacttgatgaatcatg 30040489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 299
Target Start/End: Original strand, 9538033 - 9538244
Alignment:
Q  83 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 182  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||   | |||||  |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  9538033 tataaatgttaggagtaatatttatactggattgacccagcgtgagaatactacatag--catgttat-gaaagtgtcataagatattctcacaatgata 9538129  T
Q  183 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 282  Q
     ||| ||  ||||  ||| ||||| ||||||| |||  || | |||| |||| || |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  9538130 atggcgt-gtccagtcttagacctcaaaccaccatgatccttggatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacattgtccgtaacaggataacca 9538227  T
Q  283 taaagttggttgatggg 299  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  9538228 taacgttggttaatggg 9538244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 230
Target Start/End: Original strand, 4546080 - 4546298
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4546080 gagactattatgtatgttgactgataatcgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 4546178  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    | ||||  || ||  | |||||||||||||||||  |||||||  | | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||     
T  4546179 actggacagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gagattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctctttgaccta 4546275  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgt 230  Q
    |||||||||||  ||||||||||    
T  4546276 aaaccactatgatccctagatgt 4546298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 315
Target Start/End: Original strand, 11421096 - 11421309
Alignment:
Q  98 taatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacc 197  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||| ||| || |||| |  |||||  |||     
T  11421096 taatatttatattggattgacccaccgttagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattatcacagggataataatgtatatcact 11421192  T
Q  198 cttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 297  Q
    | | |||||||||||||||||  || |||||| || | || |||||||| |   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||| | |||    
T  11421193 catagacctgaaaccactatgatccgtagatg-tgtactcaagtgctttattgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggctaatg 11421291  T
Q  298 ggtactccatgaatcatg 315  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  11421292 ggtactcgatgaatcatg 11421309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 24701361 - 24701411
Alignment:
Q  187 tgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 237  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24701361 tgtattccacccttcgacctaaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtc 24701411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Original strand, 33888594 - 33888743
Alignment:
Q  64 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 163  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||   || ||||| ||  ||||| ||||| |||||  |  | ||||  ||||||| |||    
T  33888594 tatcaagttttcacatagatataaatattatgtgtaatattta---tgaattgacccaccatgataataccacata--atgatttatgtaaagtgtgata 33888688  T
Q  164 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 218  Q
    ||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  33888689 agataatatcatattgacagtggtgtatgccacatttcgacctgaaatcactatg 33888743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 34777975 - 34777850
Alignment:
Q  55 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa 154  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||| | |   | ||||  ||    
T  34777975 ataaaaagttatcaagtcttcaaatatgtataaatataatgagtaatttttgtattagattgaccctccatgagaatactacacatt--gacttatgtaa 34777878  T
Q  155 agtgtcataagatattctcatagtgata 182  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  34777877 agtgtcataagatattttgatagtgata 34777850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 10677581 - 10677538
Alignment:
Q  9 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcat 52  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10677581 agactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacggatcat 10677538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 10891221 - 10891178
Alignment:
Q  9 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcat 52  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10891221 agactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacggatcat 10891178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9937826 - 9937745
Alignment:
Q  206 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 287  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| | |||| ||  | ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  9937826 tgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgaatactttatcgtcgttcaaacattgttcgtaaaaggatgactataaag 9937745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 9937998 - 9937933
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttat 66  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  9937998 aagcatatagactattgtgtgggtagagtcatgatcacatctcataaatcatgaataaagagttat 9937933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9937923 - 9937830
Alignment:
Q  85 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactaca---tagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcata 176  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    |||||  | |||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  9937923 taaataatagaagtaatatttatattgcagtga-ccgtcatgagaatactactacttagtatgaattatgaaatgtgccataagatattctcata 9937830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 44
Target Start/End: Original strand, 11421016 - 11421052
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 44  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11421016 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctca 11421052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 6110237 - 6110551
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110237 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 6110336  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110337 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 6110436  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110437 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 6110536  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  6110537 actccatgaatcatg 6110551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16482517 - 16482203
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482517 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 16482418  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482417 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 16482318  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482317 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 16482218  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  16482217 actccatgaatcatg 16482203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10579389 - 10579075
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579389 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 10579290  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579289 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 10579190  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579189 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 10579090  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  10579089 actccatgaatcatg 10579075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15600918 - 15600604
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600918 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 15600819  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600818 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 15600719  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600718 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 15600619  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    || ||||||||||||    
T  15600618 accccatgaatcatg 15600604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15607463 - 15607149
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607463 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 15607364  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607363 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 15607264  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607263 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 15607164  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    || ||||||||||||    
T  15607163 accccatgaatcatg 15607149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10572626 - 10572312
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572626 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 10572527  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572526 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaactgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 10572427  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572426 cgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 10572327  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  10572326 actccatgaatcatg 10572312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 4 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15342250 - 15341939
Alignment:
Q  4 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15342250 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatat 15342151  T
Q  104 ttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342150 ttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 15342051  T
Q  204 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342050 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 15341951  T
Q  304 ccatgaatcatg 315  Q
    ||||||||||||    
T  15341950 ccatgaatcatg 15341939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 9 - 315
Target Start/End: Original strand, 8490676 - 8490982
Alignment:
Q  9 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490676 agacgattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 8490775  T
Q  109 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490776 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 8490875  T
Q  209 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490876 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 8490975  T
Q  309 aatcatg 315  Q
    |||||||    
T  8490976 aatcatg 8490982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 18520148 - 18520462
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520148 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 18520247  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520248 tatttatatttgattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 18520347  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520348 cgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggttgatgggt 18520447  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  18520448 actccatgaatcatg 18520462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 18522836 - 18523146
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522836 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 18522935  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18522936 tatttatattggattgatccgccatgaaaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatttcaccctt 18523035  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523036 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 18523135  T
Q  301 actccatgaat 311  Q
    |||||||||||    
T  18523136 actccatgaat 18523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 4 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15357617 - 15357306
Alignment:
Q  4 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15357617 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatat 15357518  T
Q  104 ttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 203  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357517 ttatattgggttgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 15357418  T
Q  204 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357417 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 15357318  T
Q  304 ccatgaatcatg 315  Q
    ||||||||||||    
T  15357317 ccatgaatcatg 15357306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17781152 - 17780838
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781152 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacaaatcatagataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 17781053  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781052 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 17780953  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780952 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaataggatgactataaagttggttgatgggt 17780853  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  17780852 actccatgaatcatg 17780838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 13211475 - 13211789
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211475 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 13211574  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211575 tatttatattggattgatccgccatgagaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 13211674  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211675 cgacctgaaaccattatgtaacctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 13211774  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  13211775 actccatgaatcatg 13211789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 13248780 - 13249094
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248780 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 13248879  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248880 tatttatattggattgattcgccatgagaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 13248979  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248980 cgacctgaaaccactatgtaacctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 13249079  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  13249080 actccatgaatcatg 13249094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 32056934 - 32056619
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa-tattaggagta 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  32056934 aagcatagagactattatgtgggtagactaatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaaatattatgagta 32056835  T
Q  100 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056834 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 32056735  T
Q  200 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 299  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32056734 tcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgga 32056635  T
Q  300 tactccatgaatcatg 315  Q
    ||||||||||||||||    
T  32056634 tactccatgaatcatg 32056619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 17200218 - 17199900
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17200218 aagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcgtggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtag 17200119  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200118 tatttgtattggattgacccgctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 17200019  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200018 cgacctgaaaccactatgtaccttagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaatgttgttcgtatcaggatgactataaagttggttgatgggt 17199919  T
Q  301 actccatgaatcatgatga 319  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17199918 actccatgaatcatgatga 17199900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 13516984 - 13517294
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516984 aagcacagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 13517083  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||    
T  13517084 tatttatattggattgatcctccatgagaatactaaatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg----ccccaccctt 13517179  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13517180 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtagatgggt 13517279  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  13517280 actccatgaatcatg 13517294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 1647555 - 1647241
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1647555 aagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagtaa 1647456  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    | |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647455 tgtttatatttgattgactcgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcatacgatattcccatagtgatagtggtgtattccaccctt 1647356  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  1647355 cgacctaaaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgagt 1647256  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  1647255 actccatgaatcatg 1647241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 315
Target Start/End: Original strand, 17136535 - 17136840
Alignment:
Q  4 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||    
T  17136535 catagagactattatgtgggtagactgatgatcacatttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatat------taggagtaatat 17136628  T
Q  104 ttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 203  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136629 ttatattggattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttattgaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 17136728  T
Q  204 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 303  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17136729 cttgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttagtaaacattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatact 17136828  T
Q  304 ccatgaatcatg 315  Q
    ||||||||||||    
T  17136829 ccatgaatcatg 17136840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 29925144 - 29925458
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||| ||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29925144 aagcatggaggctattatgtggatagatcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 29925243  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||  |  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29925244 tatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccatt 29925343  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
     |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  29925344 tgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggttgatggat 29925443  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||| ||||||||    
T  29925444 actccacgaatcatg 29925458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 29974297 - 29974611
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||| ||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29974297 aagcatggaggctattatgtggatagatcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 29974396  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||  |  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29974397 tatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccatt 29974496  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
     |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  29974497 tgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggttgatggat 29974596  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||| ||||||||    
T  29974597 actccacgaatcatg 29974611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 25 - 315
Target Start/End: Original strand, 16200627 - 16200917
Alignment:
Q  25 agactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtca 124  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  ||    
T  16200627 agactgatgatcatatcttacagatcatggataaagaattatcaagtattcatatagatacaaatattaggtgtaatattcatattggattgacccacca 16200726  T
Q  125 tgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 224  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16200727 tgagaatactacatagtcaaaattatgtaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcaaccctttgacctgaaaccactatgtaccct 16200826  T
Q  225 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16200827 agatgttgaagtcgagtgctttgtcaccattcaaatgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 16200917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 21034238 - 21034540
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21034238 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 21034336  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21034337 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21034433  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  21034434 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 21034532  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  21034533 gaatcatg 21034540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15846838 - 15846536
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15846838 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 15846740  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  15846739 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 15846643  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  15846642 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 15846544  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  15846543 gaatcatg 15846536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 20147856 - 20147554
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20147856 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 20147758  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  20147757 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 20147661  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  20147660 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 20147562  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  20147561 gaatcatg 20147554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 21398792 - 21399094
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21398792 gagactattatgtatgtagacttatgacctcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 21398890  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||| | | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21398891 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattcttacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21398987  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  21398988 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 21399086  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  21399087 gaatcatg 21399094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24253422 - 24253130
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| |||| |    
T  24253422 aagcatagagactattatgtcggtagactaatgatcatatctcacgaattatggataaagagttatcaagttttcacatacttataaacattaagagtta 24253323  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    |||||||||||| |||| ||  |||||||||| | |||||  || |||||   |||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | ||    
T  24253322 tatttatattggtttgaccctccatgagaataatgcatag--aatgttat-ttaaggatcataagttattctcatagtgataacggtgtattcca-catt 24253227  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 297  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||| ||||||   | ||||||| |||||  | ||||  |||| |||||||| |||||||    
T  24253226 cgacctaaaaccactatgtaccttagatgtatgactcgagtactttgttgtcgttcaaacattgtcaattacagagtgaccataaagttagttgatg 24253130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 14890391 - 14890693
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890391 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 14890489  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  14890490 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 14890586  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    ||| |||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||  ||    
T  14890587 aaagcactgtgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataattataacgttggttgatgggtacttgat 14890685  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  14890686 gaatcatg 14890693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 55427021 - 55427323
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55427021 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 55427119  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  55427120 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 55427216  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  55427217 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 55427315  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  55427316 gaatcatg 55427323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 12299911 - 12300212
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12299911 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctat-catagatataaatgttaggagtaatatttat 12300008  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  12300009 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 12300105  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  12300106 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgatttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 12300204  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  12300205 gaatcatg 12300212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 25978963 - 25978728
Alignment:
Q  76 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 175  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  ||||||||||||||||||     
T  25978963 acataggtataattattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 25978867  T
Q  176 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 275  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  25978866 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 25978768  T
Q  276 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25978767 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 25978728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 14147014 - 14147226
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||| ||    
T  14147014 aagcacagagactattatatatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggaggaa 14147112  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    |||||||| |||||||| | | | ||||||| |||||||||  | ||||| |||| |||| ||||||||||||| | |||||  |||||||  ||| |||    
T  14147113 tatttatactggattgacctgccgtgagaatgctacatagt--atgttatgaaaa-tgtcgtaagatattctcacattgataaaggtgtatatcactctt 14147209  T
Q  201 cgacctgaaaccactat 217  Q
     ||||||||||||||||    
T  14147210 agacctgaaaccactat 14147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 281
Target Start/End: Original strand, 15526827 - 15527021
Alignment:
Q  83 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 182  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||   | ||| |||| |||||||||||||||| | | || ||    
T  15526827 tataaatcttaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactaaatagtat--gctatgaaaa-tgtcataagatattcttacaatgtta 15526923  T
Q  183 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgact 281  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  || || ||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15526924 atggtgtataccactcttagacctgaaaccactatgatccatacatg-tggactcaagtgctttataaccattcaaacgttgtctgtaacagcatgact 15527021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 315
Target Start/End: Original strand, 28088251 - 28088408
Alignment:
Q  157 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 256  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || || |||||||  ||||||    
T  28088251 tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagggctttgttgccattc 28088349  T
Q  257 aaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
     ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  28088350 taacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatggatacttgatgaatcatg 28088408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 315
Target Start/End: Original strand, 11787654 - 11787889
Alignment:
Q  76 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 175  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||  | | | ||||||||||||||||     
T  11787654 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gatattttcataagatattctcac 11787750  T
Q  176 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 275  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||| ||||  ||||||||  |  | || ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||  ||    
T  11787751 aatgataatattgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatccctagat-ctataatcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaatgg 11787849  T
Q  276 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11787850 ataaccataacgttggttgatgggtacttaatgaatcatg 11787889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15317472 - 15317176
Alignment:
Q  11 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 110  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15317472 actattatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttatact 15317374  T
Q  111 ggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaa 210  Q
     ||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||  | | |||||||||||||||||| | ||||| | |||||   | | ||| |||||||||    
T  15317373 agatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttat-gagattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtaaatcgctcttagacctgaaa 15317277  T
Q  211 ccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaa 310  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| ||||  |||| |  |||| ||||||||| |||||||  |||||    
T  15317276 ccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgt---cattctaacgttgtctgtaaacggataatcataacgttggttgacgggtacttgatgaa 15317181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 176
Target Start/End: Original strand, 28953965 - 28954093
Alignment:
Q  47 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt-atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaa 145  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||  | ||||||| | || ||||||||||||||||||  | ||    
T  28953965 gatcattgataaagagttacaaagtcttcacatatgtatacacattaggagtaatatttgttgttggattaacccatcatgagaatactacata--ataa 28954062  T
Q  146 gttataaaaagtgtcataagatattctcata 176  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  28954063 gttatttaaagtgtcatatgatattctcata 28954093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Original strand, 32280313 - 32280507
Alignment:
Q  49 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagtt 148  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||| | | | |||| ||   ||||||||| |||||||| |  ||     
T  32280313 tcatggataaagagttatttaatcttcacataggtataatcattacgaataatatttacactcggttgacccacaatgagaataatacatagtga--gtc 32280410  T
Q  149 ataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac----tatgtaccctagatgttggagtcgagt 241  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||| ||  || |||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32280411 atgtaaagtgtcataagatattctcatagtgataatgatttattttaccttttcacttgaaaccactatatatgtaccctagatgtaggagtcgagt 32280507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 19089776 - 19089734
Alignment:
Q  4 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089776 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 19089734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 93
Target Start/End: Original strand, 9504460 - 9504548
Alignment:
Q  5 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 93  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| | |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||| ||||||||    
T  9504460 atagaaactattatgtgggtagactgataatcttatctcacgggtcatggataaggagttatcaagtattaacatacataaaaatatta 9504548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 8252048 - 8251933
Alignment:
Q  4 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 103  Q
    |||| ||||||| |||| | | |||||| |||||||||| || ||||||| |||||  |||||||| |||| ||||| || || |||||  |||||||||    
T  8252048 catatagactatcatgtggatggactgaagatcacatcttacggatcatgaataaaatgttatcaaatctttacataaatttacatatttcgagtaatat 8251949  T
Q  104 ttatattggattgatc 119  Q
    ||||||| ||||||||    
T  8251948 ttatatttgattgatc 8251933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 277
Target Start/End: Original strand, 30464147 - 30464261
Alignment:
Q  162 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacg 261  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||| |   ||||||||||    
T  30464147 taagatattctcataatgataatggtctataccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttattgacattcaaacg 30464245  T
Q  262 ttgtccgtaacaggat 277  Q
    ||||| |||| |||||    
T  30464246 ttgtctgtaaaaggat 30464261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 67
Target Start/End: Original strand, 16200321 - 16200363
Alignment:
Q  25 agactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatc 67  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16200321 agactgatgatcatatcttacagatcatggataaagagttatc 16200363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36138097 - 36138033
Alignment:
Q  154 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 218  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  36138097 aagtgccataagatatttccaaagtgataatggtgtataccacccttcaacctgaaatcactatg 36138033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 139
Target Start/End: Original strand, 4189223 - 4189275
Alignment:
Q  87 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacata 139  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  4189223 aatattatgagtaatatttatactatattgatctgtcatgagaatattacata 4189275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 218
Target Start/End: Original strand, 36142816 - 36142880
Alignment:
Q  154 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 218  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| || |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  36142816 aagtgccataagatatttccaaagtgataatgatgtatgtcacccttcaacctgaaaccactatg 36142880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 18252203 - 18252517
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252203 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 18252302  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252303 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 18252402  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252403 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 18252502  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  18252503 actccatgaatcatg 18252517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18532548 - 18532234
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532548 aagcatagagactattatgtagatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 18532449  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532448 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 18532349  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532348 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 18532249  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  18532248 actccatgaatcatg 18532234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27131443 - 27131130
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131443 aagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 27131344  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131343 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 27131244  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131243 cgacctgaaaccactatgta-cctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 27131145  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  27131144 actccatgaatcatg 27131130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27310611 - 27310297
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27310611 aagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagattatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatattaggagtaa 27310512  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27310511 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctt 27310412  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310411 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 27310312  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  27310311 actccatgaatcatg 27310297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16359069 - 16358755
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16359069 aagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagataatggataaagagttatcaagccttcacatagatataaatattatgagtaa 16358970  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358969 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgagaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 16358870  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16358869 cgtcttgaaaccaccatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactttaaagttggttgatgggt 16358770  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  16358769 actccatgaatcatg 16358755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3855953 - 3855639
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3855953 aagcatggagactattacgtgggtagactgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttataaagtcttcacataggtataaatattaggagtaa 3855854  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  3855853 tatttatattggattgacccgcaatgagaatactacatagtaaaggttatgaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccaccatt 3855754  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  3855753 cgacccgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagcgctttgtcaccattcaagcgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgaccggt 3855654  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  3855653 actccatgaatcatg 3855639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 36816667 - 36816354
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36816667 aagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagtaa 36816568  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36816567 tatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa-aaattatcatagtgatggtggtgtattccaccctt 36816469  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  36816468 tgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagcgttttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagataactataaagttggttgataggt 36816369  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    ||||||  |||||||    
T  36816368 actccacaaatcatg 36816354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 34 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22641871 - 22641594
Alignment:
Q  34 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 133  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||  |||||||| ||    
T  22641871 atcacatctcatagatcatggataaagagttattaagtgttcacatagatataa---ttaggaataatatttatactagattgacccaccatgagaa-ac 22641776  T
Q  134 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22641775 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttgg 22641676  T
Q  234 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22641675 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggtcgatgggtactccacgaatcatg 22641594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27277591 - 27277278
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27277591 aagcatagagactattatgtgggtagaccgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgttttcacataggtataaatattaggagtaa 27277492  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    |||||||| | |||||| ||  ||| |||||| | |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27277491 tatttatactagattgacccaccataagaatattgcatagtaaaagtcatgaaa-gtgccataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctt 27277393  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  27277392 tgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttatcataattcaaacattgtttgtaacaagatgaccataaagttggttgaagggt 27277293  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    ||||||| |||||||    
T  27277292 actccataaatcatg 27277278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21171267 - 21171081
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171267 aagcataaagactattatgtgggtagactgatgataacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 21171168  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 187  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171167 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 21171081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19706741 - 19706439
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19706741 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 19706643  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  19706642 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 19706546  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  19706545 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 19706447  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  19706446 gaatcatg 19706439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 43802667 - 43802365
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43802667 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 43802569  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  43802568 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 43802472  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  43802471 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 43802373  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  43802372 gaatcatg 43802365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28135025 - 28134723
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28135025 gagacaattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 28134927  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  28134926 attggattgatccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 28134830  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  ||||| ||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  28134829 aaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 28134731  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  28134730 gaatcatg 28134723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 315
Target Start/End: Original strand, 23507096 - 23507385
Alignment:
Q  24 tagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtc 123  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  |    
T  23507096 tagactgatgatcacatctcacggatcatggataaggagttatcaagttttcacatagatataaataataggagtaatatttatattggattaacccacc 23507195  T
Q  124 atgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacc 222  Q
    || ||||| ||||| || |     | |||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23507196 attagaatgctacagagaacgttgtgtaaaaag---cataagttattctcatagtgataagtggagtatgtcatccttcgacctgaaaccactgtgtacc 23507292  T
Q  223 ctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    ||||||||  || | |||| |||||| | ||| ||||    ||| |||| |||||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||    
T  23507293 ctagatgtaagatttgagtactttgttatcatacaaataccgtctgtaataggatgactataaattcgatttatgggtactccataaatcatg 23507385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 9456116 - 9456418
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9456116 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 9456214  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  9456215 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 9456311  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  9456312 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 9456410  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  9456411 gaatcatg 9456418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 122 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9916689 - 9916497
Alignment:
Q  122 tcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaa-ccactatgt 219  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9916689 tcatgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaaccactatgt 9916593  T
Q  220 accctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||    
T  9916592 accctagatgtaggagtcgagtactttgttaccgtccaaacgttgtccgtaacaaggtgactataaagttagtttatgagttctccacgaatcatg 9916497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 20391541 - 20391239
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20391541 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatgttaggagtaatatttat 20391443  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||||  ||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||| |  ||||| || | ||| ||||||    
T  20391442 attggattgacccactgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaattt-tcataagatattctcacaatgataataatgtataccgctcttagacctg 20391346  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  20391345 aaaccactatgatctctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 20391247  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  20391246 gaatcatg 20391239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 20779947 - 20779645
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20779947 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 20779849  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  20779848 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 20779752  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  20779751 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 20779653  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  20779652 gaatcatg 20779645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22670559 - 22670257
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670559 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22670461  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22670460 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22670364  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  22670363 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 22670265  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  22670264 gaatcatg 22670257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 42817291 - 42816989
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42817291 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 42817193  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  42817192 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 42817096  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  42817095 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 42816997  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  42816996 gaatcatg 42816989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12014310 - 12014084
Alignment:
Q  9 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 108  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  12014310 agaccattatgtgggtagaatgatgatcacatctcacggatcattgataaggagttatcaagtcttcacataaatataaatattaagagtaatattaata 12014211  T
Q  109 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    ||||||||| ||| |||||||||  ||||||| | ||  | ||||||   ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||     
T  12014210 ttggattgacccggcatgagaatgttacatagaacaatatgtaaaaa---tcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatttcacccttcaaccta 12014114  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtc 237  Q
    ||| |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  12014113 aaatcactgtgtactctagatgtaggagtc 12014084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22657255 - 22657108
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22657255 aagcatagagactatcatgtggatagactgatgatcacatctcatagctcatagataaagagttattaagtcttcacatagatataaatattatgagtaa 22657156  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagtt 148  Q
    |||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  22657155 tatttatattagattgacccaccatgtgaatactacatagtaaaagtt 22657108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 22612492 - 22612794
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||  ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22612492 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gatatatcaagtctatacatagatataaatattgggagtaatattttt 22612590  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22612591 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22612687  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| |  |||| |||||||||||| ||||  ||    
T  22612688 aaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataatcataacgttggttgatggctacttgat 22612786  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  22612787 gaatcatg 22612794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 295
Target Start/End: Original strand, 633934 - 634216
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| | ||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  633934 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagctat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 634032  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    | |||||| | ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  634033 actggattaacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 634129  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 295  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||    
T  634130 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttga 634216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 9917952 - 9917837
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9917952 aagcatagagaatactatgtcggtaggttgatgatcacatctcgtggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt-tgagtaa 9917854  T
Q  101 tatttatattggattga 117  Q
    |||||||||||||||||    
T  9917853 tatttatattggattga 9917837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 8727667 - 8727969
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  8727667 gagactattatctatgtagactgatgactacatctcatgggtcatatatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattagaagtaatatttat 8727765  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    | |||||||||||  | |||||||||||||||||  | ||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||   ||||||  ||| ||| ||||||    
T  8727766 actggattgatccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-taccataagatattctcttagtgataagagtgtatatcactcttagacctg 8727862  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
     ||||||||||  |||||||||  ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  |||| | |||||||||  ||    
T  8727863 gaaccactatgatccctagatg-cggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggctaatgggtacttgat 8727961  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  8727962 gaatcatg 8727969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 47667776 - 47667485
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47667776 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattatgagtaatatttat 47667678  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||  | |||           |||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  47667677 attggattgacccaccgtga-----------agt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 47667592  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  47667591 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 47667493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 299
Target Start/End: Original strand, 29096789 - 29097008
Alignment:
Q  76 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 175  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||  | || ||||||||||||| |   ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  29096789 acataggtatacatattaggaataatatttatactagattgatccaccgtgtgaatactacatagcat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcat 29096885  T
Q  176 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 275  Q
    | ||||| |||||| |  ||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||  |||| || |||| ||| |  | ||||||||||| || |||| |||    
T  29096886 aatgataatggtgtttcacactcttagacatgaaaccactatgatccctagat-atggactcaagtgttttatttcgattcaaacgttatctgtaatagg 29096984  T
Q  276 atgactataaagttggttgatggg 299  Q
    || || |||| ||||||| |||||    
T  29096985 ataaccataacgttggttaatggg 29097008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 140
Target Start/End: Original strand, 35930582 - 35930713
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35930582 gagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 35930680  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatag 140  Q
    |||||||||| |   | ||||||||||||||||    
T  35930681 attggattgacctaccgtgagaatactacatag 35930713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 12006550 - 12006461
Alignment:
Q  24 tagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgga 113  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||| ||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12006550 tagactgatgatcacaacttacgaatcattgataaggagttatcaagtgttcgcacagatataaatattaagagtaatatttatactgga 12006461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28145835 - 28145723
Alignment:
Q  202 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 301  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  28145835 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggta 28145737  T
Q  302 ctccatgaatcatg 315  Q
    ||  ||||||||||    
T  28145736 cttgatgaatcatg 28145723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21881604 - 21881475
Alignment:
Q  83 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 182  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  21881604 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 21881508  T
Q  183 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 215  Q
      ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  21881507 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 21881475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24301855 - 24301691
Alignment:
Q  63 ttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattta-tattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtca 161  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||   | || ||| |||||||| ||||||| |  |||||   |||| |||    
T  24301855 ttatcaagatttcacataggtatacatattaggagtaatatttgctattagaaatacccatcacgagaataccacatagtga--gttatgttaagtatca 24301758  T
Q  162 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| || ||||  ||||||||    
T  24301757 taagacattctcatagtgatagtggtgtatacaaccctttgacctaaaatcattatgatccctagat 24301691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 26923678 - 26923553
Alignment:
Q  16 tatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 115  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  26923678 tatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacattggtatgaatattaggagtaatatttatactgaatt 26923580  T
Q  116 gatccgtcatgagaatactacatagta 142  Q
    || ||  | ||||||||||||||||||    
T  26923579 gacccaccgtgagaatactacatagta 26923553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 136
Target Start/End: Original strand, 51997353 - 51997406
Alignment:
Q  83 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactac 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||    
T  51997353 tataaatattaggagtaatatttatattagattgacccaccatgagaatactac 51997406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12006413 - 12006332
Alignment:
Q  168 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 248  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| | |||| ||| ||||||    
T  12006413 attctcatactgataagtggtgttttccacccttcgacctgaaatcattgtgtactctagatgtagaagtcaagtactttgt 12006332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10852461 - 10852402
Alignment:
Q  154 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 213  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  10852461 aagtgtcataagatatttttaaagtgataatggtgtatgtcacccttcaacctgaaacca 10852402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31236478 - 31236402
Alignment:
Q  97 gtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcata 176  Q
    |||||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  31236478 gtaatacttatactgaattgatctatcatgagaatactacatagtata--ttat-gaaagtgtcgtaagatattctcata 31236402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 42)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 21940838 - 21941151
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940838 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 21940937  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940938 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 21941037  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941038 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 21941137  T
Q  301 actccatgaatcat 314  Q
    ||||||||||||||    
T  21941138 actccatgaatcat 21941151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 22171660 - 22171974
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22171660 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcatagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatattatgagtaa 22171759  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171760 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 22171859  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171860 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 22171959  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  22171960 actccatgaatcatg 22171974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 6094296 - 6094610
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094296 aagcatagagactattatatgggtagagtgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 6094395  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094396 tatttatattggattgatccgccatgagaatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 6094495  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6094496 cgaccagaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgttcgtaacaagatgactataaagttggttgatgggt 6094595  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  6094596 actccatgaatcatg 6094610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 5 - 315
Target Start/End: Original strand, 24642826 - 24643135
Alignment:
Q  5 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642826 atagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 24642925  T
Q  105 tatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 204  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24642926 tatattggattgatcctccatgagaatactacatagtaaaa-ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattccacccttcgaa 24643024  T
Q  205 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643025 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaagtgttttgtcaccattcaaacgtggtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 24643124  T
Q  305 catgaatcatg 315  Q
    |||||||||||    
T  24643125 catgaatcatg 24643135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 52 - 315
Target Start/End: Original strand, 15326422 - 15326685
Alignment:
Q  52 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttata 151  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15326422 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15326521  T
Q  152 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326522 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15326621  T
Q  252 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326622 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15326685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 52 - 315
Target Start/End: Original strand, 15506791 - 15507054
Alignment:
Q  52 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttata 151  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15506791 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15506890  T
Q  152 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506891 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15506990  T
Q  252 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506991 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15507054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 174 - 315
Target Start/End: Original strand, 28548393 - 28548534
Alignment:
Q  174 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548393 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 28548492  T
Q  274 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548493 gggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 28548534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14983950 - 14983710
Alignment:
Q  5 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 104  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  14983950 atagggactattatgtgggtagactaatgatcatatctcacggatcatggaaaaagtgttatcaagtcttcacatagatgtagatattaggagtaata-t 14983852  T
Q  105 tatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcga 203  Q
    |||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  14983851 tatattagaatgacccgccatgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggtgtattccgtccttcga 14983755  T
Q  204 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  14983754 cctgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgagtactttgt 14983710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 21969333 - 21969635
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969333 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggatcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 21969431  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21969432 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21969528  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  21969529 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 21969627  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  21969628 gaatcatg 21969635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8371562 - 8371253
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||    
T  8371562 aagcatcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaagagtaa 8371464  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |||    
T  8371463 tatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctctt 8371367  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  8371366 agacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggatgatcataacgttggttgatgggt 8371268  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||  ||||||||||    
T  8371267 acttgatgaatcatg 8371253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24797419 - 24797224
Alignment:
Q  3 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 102  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||||||  ||||||||  | ||||||||| || | ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| |    
T  24797419 gcatagagactattatgtgagtatattgatgactacatctcatgggtcatggatatag-gatatcatgtcttcacgtaggtataaatattatgagtaaaa 24797321  T
Q  103 tttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24797320 tttatactggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-gtggtgtattccaccctt 24797224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 12562123 - 12562425
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12562123 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 12562221  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  12562222 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 12562318  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  12562319 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 12562417  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  12562418 gaatcatg 12562425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27007819 - 27007517
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007819 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 27007721  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27007720 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27007624  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  27007623 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 27007525  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  27007524 gaatcatg 27007517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27014962 - 27014660
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27014962 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 27014864  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27014863 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27014767  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  27014766 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 27014668  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  27014667 gaatcatg 27014660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27880789 - 27880487
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27880789 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 27880691  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27880690 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27880594  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  27880593 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 27880495  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  27880494 gaatcatg 27880487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28020970 - 28020668
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28020970 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 28020872  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  28020871 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 28020775  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  28020774 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 28020676  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  28020675 gaatcatg 28020668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22130911 - 22130609
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22130911 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22130813  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22130812 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctg 22130716  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  22130715 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 22130617  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  22130616 gaatcatg 22130609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 25611195 - 25611497
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25611195 gagactattatgtatgtagactgatgactgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 25611293  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  ||| ||| ||||||    
T  25611294 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaactgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcactcttagacctg 25611390  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||  ||||||||||||| |||  ||    
T  25611391 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcatagtgttggttgatgggcacttgat 25611489  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  25611490 gaatcatg 25611497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 38232411 - 38232115
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||| | ||||    
T  38232411 aagcataaaaactattttgtgggtagactgataatcacatctcacggatcatggataaagagtgatccagtcttgacatagatacacatattatgggtaa 38232312  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccct 199  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||  ||| ||||| | | ||||| |||| |||| |||||||||||||| |||    
T  38232311 tatttatattggattgatccgccgtgagaatgctacatag--aaagttatgtaaa-tgtcacaggttattcgcataatgataagtggtgtattccatcct 38232215  T
Q  200 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 299  Q
      ||| |||||    | |||||||| ||||| | |||||||| ||||||   | | |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  38232214 cagacttgaaattgatgtgtacccttgatgtagaagtcgagtactttgttgtcgtacaaacgttgtccgtgacatgatggttataaagttggttgatggg 38232115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22659795 - 22659494
Alignment:
Q  9 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22659795 agactattatgtatgtagactgatgactgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatgtata 22659697  T
Q  109 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 208  Q
     |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||    
T  22659696 ctggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctga 22659600  T
Q  209 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 308  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  22659599 aaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatg 22659501  T
Q  309 aatcatg 315  Q
    |||||||    
T  22659500 aatcatg 22659494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 21916676 - 21916978
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21916676 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatgcatagatataaatattaggagtaatatttat 21916774  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||| ||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21916775 attggattgacccactgtgagaatactacattgt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21916871  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||  ||    
T  21916872 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataactttggttgatgggcacttgat 21916970  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  21916971 gaatcatg 21916978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 45534575 - 45534273
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45534575 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 45534477  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  45534476 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 45534380  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  45534379 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 45534281  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  45534280 gaatcatg 45534273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 26240484 - 26240786
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26240484 gagactattatgtatgaagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtatatacataggtataaatattaggagtaatatttat 26240582  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||  |  |||||  | | ||| |||||     
T  26240583 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgattataatgtatatcgctcttagaccta 26240679  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||  |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  26240680 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtttgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 26240778  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  26240779 gaatcatg 26240786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 18835343 - 18835556
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  18835343 aagcatcgagactattatgtatgtagactgattaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattaggagtaa 18835441  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    |||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||  ||| |||    
T  18835442 tatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttttaaaaa-tgtcataagatattcacacagtgataatggtgtatatcactctt 18835538  T
Q  201 cgacctgaaaccactatg 218  Q
     |||||||||||| ||||    
T  18835539 agacctgaaaccattatg 18835556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 315
Target Start/End: Original strand, 6430953 - 6431188
Alignment:
Q  76 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 175  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  ||||||||||||||||||     
T  6430953 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 6431049  T
Q  176 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 275  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  6431050 aatgataatagtgtatatcgctctaagacctgaaatcactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 6431148  T
Q  276 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6431149 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 6431188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 32872875 - 32872741
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||  | | |||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |  |||| |||||| | |||    
T  32872875 aagcatagagactattatgcggctggactcacgatcttatctcacagatcatgaataaagaggtatcaagtctttacatcggcataagtattagtaataa 32872776  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatacta 135  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32872775 tatttatattgaattgatctgtcatgagaatacta 32872741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8782102 - 8781959
Alignment:
Q  84 ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 183  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||     
T  8782102 ataaatattaggactaatatttatacttgattgatccaccgtgagaatactacatagtct--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataa 8782006  T
Q  184 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 230  Q
    |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  8782005 tggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatgt 8781959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 117
Target Start/End: Original strand, 2375214 - 2375300
Alignment:
Q  31 atgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 117  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2375214 atgatcacatcacacgtatcatggataatgagttatcaaattttcacataaatataaatattatgagtaatatgtatattggattga 2375300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 208 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24796826 - 24796731
Alignment:
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24796826 aaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaatcgt--tctgtaatataatggctataaaattggttgatgggtactcc 24796731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20535371 - 20535226
Alignment:
Q  153 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcacc 252  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||  || || ||  |||| || |||||||| |  ||    
T  20535371 aaagtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacctggaaccactatgatccttaaat-atggactcaagtgctttattgcc 20535273  T
Q  253 attcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 299  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  20535272 attcaaacgttgtctataacaggataaccataatgttggttaatggg 20535226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2963171 - 2962932
Alignment:
Q  76 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa---agtgtcataagatattct 172  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |   |  ||||||||||||||||| |  |||| | |   | ||||||||||||||||    
T  2963171 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacctaccgcgagaatactacatagtaca--ttatgagattaattgtcataagatattct 2963074  T
Q  173 catagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 272  Q
    || | ||||| | | ||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| | ||     
T  2963073 cacaatgataatagcgtatatccctcttagacctgaaaccactatgatccctagacgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgcaaa 2962975  T
Q  273 aggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    ||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  2962974 aggataaccataacgttggttgatggttacttgatgaatcatg 2962932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 29645537 - 29645631
Alignment:
Q  11 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 105  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||||||||  | ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  29645537 actattacgtgggtaaactgatgaccacatctcatggttcatgcataaagatttatcaactcttcacatatatataaacattaagagtaatattt 29645631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 320
Target Start/End: Original strand, 36970439 - 36970556
Alignment:
Q  202 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 301  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| |||||| |  |||| ||| | || |||| |||||||||||||||    
T  36970439 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttatatgtaaaagggtaacaataacgttggttgatgggta 36970537  T
Q  302 ctccatgaatcatgatgat 320  Q
    ||  |||||||||| ||||    
T  36970538 cttgatgaatcatgctgat 36970556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 319
Target Start/End: Original strand, 2375411 - 2375528
Alignment:
Q  202 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 301  Q
    |||||||||| | ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||  | || ||||| |  |||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||     
T  2375411 gacctgaaactattatttaccatagatgtaggagtcgagtactttgttgctatacaaacatcatccgcaattggataactataaagtcggttgatgggtg 2375510  T
Q  302 ctccatgaatcatgatga 319  Q
    |||||||||| |||||||    
T  2375511 ctccatgaattatgatga 2375528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 115
Target Start/End: Original strand, 36970265 - 36970371
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36970265 gagactatcatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 36970363  T
Q  108 attggatt 115  Q
    | ||||||    
T  36970364 actggatt 36970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 288
Target Start/End: Original strand, 29645675 - 29645797
Alignment:
Q  166 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgt 265  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||| | ||| || | | ||||||   | |||||| |||||    
T  29645675 atattctcatagtgatagtgatgtacttcaccattcgacctgaaacttctacgtatcctagatataggattcaatttctttgtagacgttcaaatgttgt 29645774  T
Q  266 ccgtaacaggatgactataaagt 288  Q
      |||| ||||||||||||||||    
T  29645775 ttgtaaaaggatgactataaagt 29645797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 107
Target Start/End: Original strand, 10920427 - 10920479
Alignment:
Q  55 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  10920427 ataaagagttatcaaatattcacatatgtataaatattatgagtaatatttat 10920479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Original strand, 24535514 - 24535569
Alignment:
Q  27 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataga 82  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24535514 actgatgatcatatcttacggatcatgaataatgagttatcaagttttcacataga 24535569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8968076 - 8968015
Alignment:
Q  254 ttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  8968076 ttcaaacgttgtccataaaaagatgattataaagtcgactgatgggtactccataaatcatg 8968015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 28555056 - 28555084
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagact 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28555056 aagcatagagactattatgtaggtagact 28555084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 41368154 - 41368106
Alignment:
Q  255 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 303  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41368154 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41368106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 41375125 - 41375077
Alignment:
Q  255 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 303  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41375125 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41375077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 7280 - 7594
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7280 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 7379  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7380 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 7479  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7480 cgacctgaaacaactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 7579  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  7580 actccatgaatcatg 7594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 6968 - 6654
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6968 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 6869  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6868 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 6769  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6768 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggttgatgggt 6669  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  6668 actccatgaatcatg 6654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13984 - 13670
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13984 aagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacaaagatataaatattaggagtaa 13885  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13884 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 13785  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13784 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggtt 13685  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  13684 actccatgaatcatg 13670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 15152616 - 15152926
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152616 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 15152715  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152716 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 15152815  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152816 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 15152915  T
Q  301 actccatgaat 311  Q
    |||||||||||    
T  15152916 actccatgaat 15152926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 29327957 - 29328271
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327957 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 29328056  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328057 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 29328156  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29328157 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgcttgatgggt 29328256  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  29328257 actccatgaatcatg 29328271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11536096 - 11535782
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11536096 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacaaagatataaatattaggagtaa 11535997  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  11535996 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattccaacatt 11535897  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535896 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 11535797  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  11535796 actccatgaatcatg 11535782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11543014 - 11542700
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11543014 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 11542915  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11542914 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattccaccctt 11542815  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542814 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgctggagtcgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 11542715  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  11542714 actccatgaatcatg 11542700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 12750999 - 12751313
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12750999 aagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattcttctcatagatataaatattatgagtaa 12751098  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751099 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 12751198  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12751199 cgacctgaaaccactaggtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggat 12751298  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  12751299 actccatgaatcatg 12751313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 12738709 - 12739023
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  12738709 aagcatagagactattatgtgggtagactgaagatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattactcataa 12738808  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12738809 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccgtt 12738908  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738909 cgacctgaaactactatgtaccctagatgttgtagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 12739008  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  12739009 actccatgaatcatg 12739023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 18561180 - 18561485
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561180 aagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 18561279  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  18561280 tatttatattggattgaccctctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa---------atagtgatagtggtgtattccaccctt 18561370  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  18561371 cgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgattgataggt 18561470  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    ||| || ||||||||    
T  18561471 actgcacgaatcatg 18561485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 315
Target Start/End: Original strand, 13392326 - 13392637
Alignment:
Q  4 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 103  Q
    ||||||||||||| | | ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  13392326 catagagactattgtattggtagatcgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcctgtcttcacataggaataaatattaggagaaatat 13392425  T
Q  104 ttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 203  Q
    ||||| |||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13392426 ttatactggattgacccaccatgcgaatattacatagtaaaatttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctttga 13392525  T
Q  204 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 303  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13392526 cctaaaatcactatgtaccatagatgttggagtcaggtgctttgtcaccatacaaacgttgtttgtaacaagatgactataaaattggttgatgggtact 13392625  T
Q  304 ccatgaatcatg 315  Q
    ||||||||||||    
T  13392626 ccatgaatcatg 13392637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18257874 - 18257559
Alignment:
Q  3 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 102  Q
    ||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257874 gcataaagactattatgtggatagattgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 18257775  T
Q  103 tttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcg 202  Q
    ||||||||||||| | ||  | | |||||| ||||||||  | || || |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||| ||| |    
T  18257774 tttatattggattaacccaccgtcagaatattacatagt--atgtcatgaaaaatgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatatcactcttag 18257677  T
Q  203 acctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtac 302  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18257676 acctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattcaaacgttgtgtgtaacaagataactataaagttggttgatgggtac 18257578  T
Q  303 tccatgaatcatgatgatg 321  Q
    |  | |||||||| |||||    
T  18257577 ttgaagaatcatgttgatg 18257559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 2204552 - 2204854
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2204552 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 2204650  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  2204651 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 2204747  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  2204748 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 2204846  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  2204847 gaatcatg 2204854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 8464999 - 8465301
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464999 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 8465097  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  8465098 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 8465194  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  || |||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  8465195 aaaccactatgatccttagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 8465293  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  8465294 gaatcatg 8465301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 18400104 - 18400406
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18400104 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18400202  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18400203 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctg 18400299  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  18400300 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 18400398  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  18400399 gaatcatg 18400406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 18407088 - 18407390
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18407088 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18407186  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18407187 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctg 18407283  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  18407284 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 18407382  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  18407383 gaatcatg 18407390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 48808798 - 48808496
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808798 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 48808700  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  48808699 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 48808603  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  48808602 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 48808504  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  48808503 gaatcatg 48808496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 15729751 - 15730053
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15729751 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 15729849  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  15729850 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 15729946  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  15729947 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 15730045  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  15730046 gaatcatg 15730053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18139640 - 18139338
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18139640 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaggtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 18139542  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18139541 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 18139445  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  18139444 aaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataataataacgttggttgatgggtacttgat 18139346  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  18139345 gaatcatg 18139338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 19230888 - 19231190
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19230888 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 19230986  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    | |||||||| ||  | |||||||||||||||  | |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  19230987 actggattgacccaccgtgagaatactacata--ataagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 19231083  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  ||||| ||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  19231084 aaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 19231182  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  19231183 gaatcatg 19231190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 303
Target Start/End: Original strand, 30254138 - 30254428
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30254138 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 30254236  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||   || ||| ||| ||    
T  30254237 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattactcttagacttg 30254333  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 303  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  30254334 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtact 30254428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 315
Target Start/End: Original strand, 2365169 - 2365407
Alignment:
Q  75 cacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctca 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||   |||||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  2365169 cacatagatatcaatattaggagtaatatttacattggattgacccaccatgaaaatgctacatag--gaagttatgtaaa-tgtcataagttattctca 2365265  T
Q  175 tagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 273  Q
    | ||||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||   | | ||||||| ||||||||||    
T  2365266 ttgtgataagtggtgtatttcaccattcgacctaaagccactatgtaccctagaccttggagtcaagtactttgttgtcgtacaaacgtcgtccgtaaca 2365365  T
Q  274 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    |  |||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||    
T  2365366 gattgactataaagtcggttgatgagtgctcaacgaatcatg 2365407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 76 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 41681203 - 41680968
Alignment:
Q  76 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  41681203 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcac 41681107  T
Q  176 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 275  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| |||    
T  41681106 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 41681008  T
Q  276 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    || || |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  41681007 ataaccataacgttggttgattggtacttgatgaatcatg 41680968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10669204 - 10668901
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10669204 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 10669106  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctc-atagtgatagtggtgtattccacccttcgacct 206  Q
    | | |||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||   | ||||| | ||||||  | | ||| |||||    
T  10669105 actagattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcgcaattgataatagtgtatatcgctcttagacct 10669009  T
Q  207 gaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcca 306  Q
    ||||||||||||  || || ||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |    
T  10669008 gaaaccactatgatccgtaaatg-tggactcaaatgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggtacttga 10668910  T
Q  307 tgaatcatg 315  Q
    |||||||||    
T  10668909 tgaatcatg 10668901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 47167161 - 47166871
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  47167161 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattatgagtaatatttat 47167063  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    | | ||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  47167062 actagatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 47166966  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 303  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  47166965 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtact 47166871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24443628 - 24443349
Alignment:
Q  9 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||| ||| | || ||| |||| |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24443628 agactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatgaatata-agatattaagtttatacataggtatgaatattaggagtaatatttata 24443530  T
Q  109 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 208  Q
     | |||| | ||  | ||||| ||||||||||||   ||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||    
T  24443529 ctagattaacccaccgtgagagtactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagttattctcacagtgataatggtgtataacactcttagacttga 24443433  T
Q  209 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 293  Q
    ||||| ||||  |||||||||| ||| || |||||||| |    |||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||    
T  24443432 aaccattatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttattgttattcaaacgttgtgtgtaacaggatgaccataacgttggtt 24443349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 315
Target Start/End: Original strand, 34128647 - 34128875
Alignment:
Q  83 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||   ||||| | |  |||||||||||||||||| | | |||    
T  34128647 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccattgtgagaatactacatagtac--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaattata 34128743  T
Q  183 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 282  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  34128744 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 34128842  T
Q  283 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34128843 taacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 34128875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19388545 - 19388774
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||| |||||| || ||||||| | ||||| |||  ||| ||| |||| |  ||| || ||||||||||||||||||    
T  19388545 aagcatagagattattatgtatatagattgatgaccatatctcacgggtcatgaatat-gagatattaagtttgtacaaaggtataaatattaggagtaa 19388643  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaa--aagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 198  Q
    |||||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||   |  | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| |    
T  19388644 tatttatactggattgcccaatcatgagaatactacatatatagtatgttat-gaaagtgtcataagatattctcatagtggtaatagtgtataccactc 19388742  T
Q  199 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 230  Q
    || |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  19388743 ttagacctgaaaccattatgagccctagatgt 19388774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 28130561 - 28130863
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| | |||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  28130561 gagactattatgcatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatatcaggagtaatatttat 28130659  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    | |||||||| ||    |||||||| |||||||||   ||||| |||  |||||||||||||||||| | | ||| | ||||||  ||  ||| ||||||    
T  28130660 actggattgacccactgtgagaatattacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaataataatagtgtatatcattcttagacctg 28130756  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    ||| |||||||  || ||||||| ||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  28130757 aaatcactatgatccgtagatgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttaat 28130855  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  28130856 gaatcatg 28130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 117
Target Start/End: Original strand, 10235361 - 10235451
Alignment:
Q  27 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10235361 actgatgatcacatctcacagatcattgataaagagttatcaggtgttcccatatgtataaatattaggaataatatttatatcggattga 10235451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25845780 - 25845498
Alignment:
Q  6 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 105  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  || ||  | | |||||||||||||||||||    
T  25845780 tagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctcatgaatat-gagatattaagtctatacgtatgtgtcaatattaggagtaatattt 25845682  T
Q  106 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 205  Q
    ||| ||||||||  |  | ||||||||||||||||||   ||||| |||| | |||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||| ||||    
T  25845681 atactggattgacacaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatgatgtataccactcttagacc 25845585  T
Q  206 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 293  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| ||||||| |||||||    
T  25845584 tgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataacgttggtt 25845498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25846199 - 25845917
Alignment:
Q  6 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 105  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  || ||  | | |||||||||||||||||||    
T  25846199 tagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctcatgaatat-gagatattaagtctatacgtatgtgtcaatattaggagtaatattt 25846101  T
Q  106 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 205  Q
    ||| ||||||||  |  | ||||||||||||||||||   ||||| |||| | |||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||| ||||    
T  25846100 atactggattgacacaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatgatgtataccactcttagacc 25846004  T
Q  206 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 293  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| ||||||| |||||||    
T  25846003 tgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataacgttggtt 25845917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19393726 - 19393462
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19393726 gagactattatgtatgtagactaatgaccacatttcatgggtcataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 19393628  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    | | |||||| |   | |||||||||||||||||  | ||||| |||| | |||||||||||||||| | ||||| | ||||||  ||| ||| ||||||    
T  19393627 actagattgaccgaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tctcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctg 19393531  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggat 277  Q
    || ||| ||||  ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||| || |||||| |||| |||||    
T  19393530 aatccagtatgatccctagatgtt-gactcaagtgctttgttacctttctaatgttgtctgtaaaaggat 19393462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18259359 - 18259124
Alignment:
Q  76 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 175  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||| ||||||||  ||||| | |  ||||||||||||||||||     
T  18259359 acataggtataaatattgaaagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactgcatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 18259263  T
Q  176 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 275  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||  ||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  18259262 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaacccttatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18259164  T
Q  276 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18259163 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 18259124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 47833983 - 47833875
Alignment:
Q  9 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 108  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    |||||||||||    
T  47833983 agactattacgtaggtaggctggtgatcagatctcaccgatcatgaataaagagttaccaagttttcacataggtataaatattactcataatatttata 47833884  T
Q  109 ttggattga 117  Q
    || ||||||    
T  47833883 tttgattga 47833875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 304
Target Start/End: Original strand, 39112138 - 39112275
Alignment:
Q  167 tattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtc 266  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||| || ||||| |||||||||| |||||||| ||| || |||  |||||   | |||||||||||||    
T  39112138 tattctcttagtgatagtggtgtattccattattcaacatgaaatcactatgtactctagatgtaggaatcaagtattttgttgtcgttcaaacgttgtc 39112237  T
Q  267 cgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 304  Q
     |||| | | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112238 tgtaataaggtgactataaagttggttgataggtactc 39112275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 15148315 - 15148363
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagat 49  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148315 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagat 15148363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 108
Target Start/End: Original strand, 19859122 - 19859221
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859122 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 19859220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Original strand, 3132849 - 3132986
Alignment:
Q  3 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 102  Q
    ||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||| |||| |  ||  | ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| |  |||||    
T  3132849 gcatagagactacaatgtgattagactgatgatcacatctcatagataaatgaatatgagatatcaagtcttcacatatgtataattattatgt-taata 3132947  T
Q  103 tttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagt 141  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  3132948 tttatattggattgacctgtcataagaatactacatagt 3132986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7662686 - 7662569
Alignment:
Q  13 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 112  Q
    |||||||| | || ||||||||||| |||| ||  |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |    
T  7662686 tattatgtggatacactgatgatcatatcttacgaatcatgtataaaaacttatcaagtcttcacatagatataaa-attataagtaatatttttattag 7662588  T
Q  113 attgatccgtcatgagaat 131  Q
    ||||| ||| |||||||||    
T  7662587 attgacccgccatgagaat 7662569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 315
Target Start/End: Original strand, 14591924 - 14592153
Alignment:
Q  83 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||| |||    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  14591924 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcagattgata 14592020  T
Q  183 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 282  Q
     | ||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||  ||||| |||| |   |  | | |||| |  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  14592021 atagtgtatatcactcttagacttgaaaccactatgatccctatatgtggacttacatttctttattgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 14592120  T
Q  283 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    ||| ||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  14592121 taacgttggctaatgggtacttgatgaatcatg 14592153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 315
Target Start/End: Original strand, 16011515 - 16011744
Alignment:
Q  83 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| | |||    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  16011515 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccatgagaatactatacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacattgata 16011611  T
Q  183 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 282  Q
     |  |||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| |   |  | | |||| |  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  16011612 ataatgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatgtggacttacatttctttattgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 16011711  T
Q  283 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    ||| ||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  16011712 taatgttggctaatgggtacttgatgaatcatg 16011744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 90 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31190660 - 31190524
Alignment:
Q  90 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgt 189  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| |||   ||||| || | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31190660 attaggagcaatatttatactggattgacccaccatgagaatactacattgtat--gttatgaata-tgtcttaagatattctcatagtgataatggtgt 31190564  T
Q  190 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 229  Q
    ||  |||  || ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  31190563 atatcactgttagacctgaaaccactaagatccctagatg 31190524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 7396362 - 7396450
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgta---ggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatata 86  Q
    ||||||||||||||||||||    |||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  7396362 aagcatagagactattatgtgcagggtgaactgatgatcacatctcacatatcatgaataaagaattatcaagtattcacataaatata 7396450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 215
Target Start/End: Original strand, 22969024 - 22969153
Alignment:
Q  83 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 182  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  22969024 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 22969120  T
Q  183 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 215  Q
      ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  22969121 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 22969153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22948574 - 22948499
Alignment:
Q  166 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 241  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  22948574 atattctcgtagtaatagtcgtgtatgccacccttcgacatgaaaccgctatgtaccttagatgtaggagttgagt 22948499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15169474 - 15169290
Alignment:
Q  127 agaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctag 226  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| | || ||| | ||| |||||||||||  ||| ||    
T  15169474 agaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatgctactcttagtcctaaaaccactatgatcccaag 15169378  T
Q  227 atgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    ||| |||| |  | |||||| |  ||||||||||||| ||  ||||||||| || |||| |||||||||| || |||  ||||||||||    
T  15169377 atg-tggacttaaatgctttattgccattcaaacgttatctataacaggataaccataacgttggttgataggcacttgatgaatcatg 15169290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 131
Target Start/End: Original strand, 7396469 - 7396527
Alignment:
Q  73 ttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaat 131  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  7396469 ttcacataaatataaatattatgggtaatatttatattggattaacccgtcataagaat 7396527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 97
Target Start/End: Original strand, 29983179 - 29983234
Alignment:
Q  42 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggag 97  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||    
T  29983179 tcacggatcatggataaagagttaacaaattttcacatatgtataaatattaggag 29983234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 108
Target Start/End: Original strand, 39111989 - 39112092
Alignment:
Q  5 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 104  Q
    ||||||||||||||   |||||||| ||| | | ||| || || |||||||||||||||||  |  |||||| ||| | |||||||||||||||| ||||    
T  39111989 atagagactattataagggtagactaatggtaatatcacataggtcatggataaagagttacaatttcttcatatatacataaatattaggagtattatt 39112088  T
Q  105 tata 108  Q
    ||||    
T  39112089 tata 39112092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 46
Target Start/End: Original strand, 2365070 - 2365112
Alignment:
Q  4 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 46  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2365070 catagagactatcatgtgggtcgactgatgatcacatctcaca 2365112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 225
Target Start/End: Original strand, 29984308 - 29984372
Alignment:
Q  161 ataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacccta 225  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || ||  |||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  29984308 ataagatattctcatagtggaagtgatgcatatcacccttcaacttgaaaccaccatgtacccta 29984372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 18461 - 18774
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 18560  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 18660  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18661 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgat-ggt 18759  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  18760 actccatgaatcatg 18774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 26024 - 25706
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26024 aagcatagcgactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagacttcacatagatataaatattaggagtaa 25925  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25924 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 25825  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25824 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 25725  T
Q  301 actccatgaatcatgatga 319  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  25724 actccataaatcatgatga 25706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21330282 - 21329968
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21330282 aagcatagagactattatgtaggtggactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaa 21330183  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330182 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 21330083  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  21330082 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtaggttgatgggg 21329983  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||    
T  21329982 actccatgaatcatg 21329968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 18796679 - 18796993
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796679 aagcattgagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 18796778  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18796779 tatttatattggattgatcctctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatggtggtgtattccaccctt 18796878  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18796879 cgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtacgtaacaggatgactataaagtttgttgatgggt 18796978  T
Q  301 actccatgaatcatg 315  Q
    || ||||||||||||    
T  18796979 acaccatgaatcatg 18796993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 18619977 - 18620296
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18619977 aagcatatagactattatgtgggtaggccgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaatattaggagtaa 18620076  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    |||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  18620077 tatttatactagattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttat-gaaagtgtcataagatattctcatggtgatattggtgtatcccaccctt 18620175  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18620176 tgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtgctttatcaccattcacattatgtatgtaacaagatgaccataaagttggttgatgggt 18620275  T
Q  301 actccatgaatcatgatgatg 321  Q
    ||||||  ||||||| |||||    
T  18620276 actccactaatcatgctgatg 18620296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 315
Target Start/End: Original strand, 36270347 - 36270650
Alignment:
Q  9 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 108  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36270347 agactattgtgtgggtagactgatgatcacatctcacgagtcatagagaaagagttatcaagttttcacttcgatttaaatattaggagtaatatttata 36270446  T
Q  109 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||  || |||||||||  |||||||  ||| ||||  |||| |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  36270447 ttggattgactcgccatgagaatgttacatag--aaaattatgtaaag-gtcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatt-cacccttcgaccta 36270542  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| | ||||||  || | |||| || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  36270543 aaaccaccatgcaccctagatgtatgagtcgaatactttgttgccgtacaaaagtcgttcgtaacaggatgactataaagtcggttgttgggtactcaat 36270642  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  36270643 gaatcatg 36270650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22183513 - 22183206
Alignment:
Q  5 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 104  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22183513 atagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-t 22183415  T
Q  105 tatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcga 203  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||  ||||||   || |||||  |||  |||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  22183414 tatattggattgacccgccatgacaatgttacata--taatgttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttga 22183318  T
Q  204 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 303  Q
    ||||||||||   ||||| || ||||| |||||||||| ||||||     | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  22183317 cctgaaaccaacgtgtactcttgatgtaggagtcgagtactttgttgttgtacaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagtcgattgatgggtatt 22183218  T
Q  304 ccatgaatcatg 315  Q
      ||||||||||    
T  22183217 tgatgaatcatg 22183206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 44 - 315
Target Start/End: Original strand, 20978091 - 20978360
Alignment:
Q  44 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || || |  |    
T  20978091 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcaccgagatataattattatgagtaatatttatattggattgacccgccatgagaattttatatgg--a 20978188  T
Q  144 aagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 242  Q
    || |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  20978189 aaattatgaaaa-tgtcataagttattctcgtagtgataagtggtgtattccactctttgacatgacactactatgtaccctagatgtaggattcgagta 20978287  T
Q  243 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    |||||    |||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||    
T  20978288 ctttgatgtcatataaacgtagtccgtaacatgataactataaagtcgattgatggatactccacaaatcatg 20978360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6992146 - 6991847
Alignment:
Q  3 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagt--cttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  6992146 gcataaagattattatatgggtagactaatgatcatatctcacagattataaataaagatttatcaagtatcttcacataggtataaatctcaggagtaa 6992047  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccct 199  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||  ||| ||||   ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6992046 tatttatattggattgatcctccataagaacgctacatag--aaaattat-gtaagtgacataaactattctcatagtgataagtggtgtattccaccct 6991950  T
Q  200 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgc-tttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 298  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||  |  || ||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6991949 tcggcctgaaatcactatgttccctagatgtaggagtcgagtacttttgtttctgtttaaacgttgtctatgacacgatgactataaagtcggttgatgg 6991850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 303
Target Start/End: Original strand, 18822279 - 18822556
Alignment:
Q  24 tagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtc 123  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | |    
T  18822279 tagactgatgatcacatatcacggatcattgataaggagttatcaacttttcacatagatataaatattaatggtaatatttatattggattgatctgcc 18822378  T
Q  124 atgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacc 222  Q
    |||||| |  ||||||  ||| |||||  ||||  ||  |||  |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18822379 atgagattgttacata--aaacgttatgtaaag-atctcaagtcattctcatatagataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactgtgtacc 18822475  T
Q  223 ctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 303  Q
    |||||||| |||||| ||| |||| |   |||  ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18822476 ctagatgtaggagtcaagtacttttttgtcatataaacgtcatccgtaacacaatgactataaagttggttaatgggtact 18822556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 30174377 - 30174679
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174377 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 30174475  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  30174476 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 30174572  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  30174573 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 30174671  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  30174672 gaatcatg 30174679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24250334 - 24250032
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24250334 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 24250236  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  24250235 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 24250139  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  24250138 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 24250040  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  24250039 gaatcatg 24250032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24229517 - 24229215
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24229517 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggttcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 24229419  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    | |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| | | ||    
T  24229418 actggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagccttg 24229322  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||  ||    
T  24229321 aaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgaagggtacttgat 24229223  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  24229222 gaatcatg 24229215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 19279461 - 19279600
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||   || |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  19279461 aagcataaagactattatgcgagttgactaatgatcacatctcacgtatcatggataaaaagttatcaagttttcagatagatatagatatttggagtaa 19279560  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 140  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  19279561 tatttatattggattgacacgtcatgagaataccacatag 19279600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 18852085 - 18851977
Alignment:
Q  9 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 108  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18852085 agactattatgtcggtagactaatgatcccatctcacggatcatgaataaagagttatcaagtcttcaaatatgtataaatattaagagtaatatttata 18851986  T
Q  109 ttggattga 117  Q
    |||||||||    
T  18851985 ttggattga 18851977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15342237 - 15342014
Alignment:
Q  76 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 175  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||| |||||||||||||  | |||||  |||||||||||||||| |||||     
T  15342237 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgaaaatactacatagt--atgttat-gaaagtgtcataagatagtctcac 15342141  T
Q  176 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 275  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| || | || | |||||| |  | |||||||  ||||  ||||||||    
T  15342140 aatgatagtggtgtatgccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tgaactcaaatgctttattgcaattcaaaaattgtttgtaacagg 15342042  T
Q  276 atgactataaagttggttgatgggtact 303  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  15342041 atgaccataacgttggttaatgggtact 15342014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 317
Target Start/End: Original strand, 29800468 - 29800775
Alignment:
Q  9 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggat---aaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||   | | | | || |||| |  |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29800468 agactattatgtatgtagactgatgatcacatcccatgggtcatggatgtgagatattaattaagtatatacatgggtataaatattaggagtaatattt 29800567  T
Q  106 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 205  Q
    ||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| | | |||||||||| |  |||| |||||||| |||| ||| |||     
T  29800568 atactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-aaaagtgtaacatgatattctcacaaggataatggtgtataccactcttagact 29800664  T
Q  206 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 305  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||| ||||| |||||||||| |  |||| ||||||| ||||| |||      
T  29800665 tgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacattgtctgtaacaggataatcataatgttggttaatgggcacttg 29800763  T
Q  306 atgaatcatgat 317  Q
    | ||||||||||    
T  29800764 acgaatcatgat 29800775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 17241034 - 17241196
Alignment:
Q  152 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 251  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  17241034 aaaagtgtaataagatattctcatagtgataatggtgtatttcacc-ttcgacctaaaaccactatgtactgtagatgtaggagtcaagtactttatcac 17241132  T
Q  252 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    |  |||||||||||  |||||| || | ||||||| | ||| |||  ||||| |||||| ||||    
T  17241133 cgctcaaacgttgtgtgtaacatgaagcctataaaatcggtagatatgtacttcatgaaacatg 17241196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 36802003 - 36801899
Alignment:
Q  14 attatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacat-agatataaatattaggagtaatatttatattgg 112  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | |||||||||||||||     
T  36802003 attatgtgagtagactgatgatcacacctcacaaatcattgataatgagttatcaagtcttcgcataaaatataaatattaagggtaatatttatattga 36801904  T
Q  113 attga 117  Q
    |||||    
T  36801903 attga 36801899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 230
Target Start/End: Original strand, 19616435 - 19616653
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    ||||  |||   || ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  19616435 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgagtcataaatatt-agatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaacatttat 19616533  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
      || ||||| ||  | ||||||||||||||||||    |||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||  ||| ||| ||||||    
T  19616534 tctgaattgacccaccgtgagaatactacatagtatt--ttatgaaaa-tgtcatatgatattctcacagtgataatagtgtatatcactcttagacctg 19616630  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgt 230  Q
    |||||||||||  ||||||||||    
T  19616631 aaaccactatgatccctagatgt 19616653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36799826 - 36799745
Alignment:
Q  168 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  36799826 attctcatagtgataagtggtgtattctaccgtttgacctgaaaccactatgcgccctagatgtaggagtcaagtactttgt 36799745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40301164 - 40301034
Alignment:
Q  83 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 182  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||   |||||| ||  |||||||||||||||||  | | ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  40301164 tatacatattagaagtaatatttataccagattgacccaccatgagaatactacata--acatgttatgaa--gtgtcataagatagtctcatagtgata 40301069  T
Q  183 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactat 217  Q
     || ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  40301068 atgatgtataccactcttagacatgaaaccactat 40301034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 28741326 - 28741220
Alignment:
Q  10 gactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatat 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||| || | ||| ||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  28741326 gactattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgcgtcatgaat-atgagatattaagtatgtacataggtataaatattaggagtaatatttatac 28741228  T
Q  110 tggattga 117  Q
     |||||||    
T  28741227 cggattga 28741220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 315
Target Start/End: Original strand, 41661694 - 41661761
Alignment:
Q  248 tcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41661694 tcaccattcaaacgttgtctataataagatgatcataaagttggttgatgggtactccatgaaacatg 41661761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 41316506 - 41316305
Alignment:
Q  85 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 184  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  || || ||  |||||||||| || ||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||      
T  41316506 taaatattatgagtaatatttatacttaatcgacccaccatgagaatattatatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatactgataac 41316410  T
Q  185 ggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactata 284  Q
    || | || |||  ||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |  || ||||| |   |||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  41316409 ggagaataccattcttagacctgaatccactatgatccctagatg-tggacttaagggctttattgtcattcaaacgttatctgtaacaggataactata 41316311  T
Q  285 aagttg 290  Q
    ||||||    
T  41316310 aagttg 41316305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 218
Target Start/End: Original strand, 21626824 - 21626955
Alignment:
Q  83 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 182  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||   ||   ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21626824 tataaataatatgagtaatatttatattgaattga-ccaccatgagaatactacacgctat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgata 21626919  T
Q  183 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 218  Q
     | |||| | ||||  || ||||||||| |||||||    
T  21626920 atagtgtctaccactgttagacctgaaatcactatg 21626955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28740986 - 28740910
Alignment:
Q  154 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 230  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  28740986 aagtgtcataagacattctcataatgataatggtgtataccattcttagatctgaaaccactatgatccctagatgt 28740910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 28719006 - 28718943
Alignment:
Q  79 tagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | || ||||||||||||| ||||    
T  28719006 tagatataaatattaggagtaatatttatacttgattgactcatcgtgagaatactacacagta 28718943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 12098649 - 12098609
Alignment:
Q  4 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 44  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12098649 catagagactattatgtatgtagactgatgatcagatctca 12098609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 24763866 - 24763751
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||  | |||| || |  ||| ||| | ||||  |||||| ||||||||||| ||||||    
T  24763866 aagcatcgagactattatttatgtagactgatgaccacgtctcatgggtcatagacat-gagatattacgtctatacataggtataaatattatgagtaa 24763768  T
Q  101 tatttatattggattga 117  Q
    |||||||| ||||||||    
T  24763767 tatttatactggattga 24763751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 1166 - 1461
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  1166 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttgccatagatataaatattaagagtaa 1265  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 200  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1266 tatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 1365  T
Q  201 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1366 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggataaatataaagttggttgat 1461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 5702 - 6013
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5702 aagcataaagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacaggtcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 5801  T
Q  101 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca-ccc 198  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||| ||     
T  5802 tatttatattggattgatccgccatgtgaatactacatagtaaaagttatgaaaaagtgtcataagatattctcata---------gtgcattccatcct 5892  T
Q  199 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5893 ttcgacatgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 5992  T
Q  299 gtactccatgaatcatgatga 319  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  5993 gtactccatcaatcatgatga 6013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 59 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 230367 - 230111
Alignment:
Q  59 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  230367 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 230268  T
Q  159 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  230267 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattctacccttcgacctgaaaccattatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcactattcaa 230168  T
Q  259 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  230167 acgttgtctgtaacaagatgacaataaagttggttggtggatacaccatgaatcatg 230111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 183 - 485
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183 gagactattatgtatgtcgactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 281  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  282 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 378  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  379 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 477  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  478 gaatcatg 485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3977 - 3675
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3977 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 3879  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  3878 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 3782  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  3781 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 3683  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  3682 gaatcatg 3675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Original strand, 119730 - 120032
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119730 gagactattatgtacgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 119828  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  119829 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 119925  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  119926 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 120024  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  120025 gaatcatg 120032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13251 - 12961
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13251 gagactattatgtatgtagaccgatgaccacatctcatgggtcatatatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 13153  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |  ||||||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||| ||||||    
T  13152 accggattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcataatgataatagtgtatatcactcttagacctg 13056  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 303  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13055 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaattgctttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttggttgatgggtact 12961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 130526 - 130262
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130526 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 130428  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  130427 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 130331  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggat 277  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  130330 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggat 130262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 67676 - 67374
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  67676 gagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 67578  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  67577 attggattgacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcatgagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 67481  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  67480 aaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 67382  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  67381 gaatcatg 67374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 40290 - 39988
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40290 gagactattatgtatgtagactgatggccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 40192  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |  ||||||| ||    ||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   || ||| ||| ||    
T  40191 accggattgacccactgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacagtgataatggtgtatataactcttagacttg 40095  T
Q  208 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 307  Q
    |||||||||||  ||||| ||  |||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||| | |||| ||||  ||    
T  40094 aaaccactatgatccctaaat-atggactcaagtgctttatttccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttggctaatggttacttgat 39996  T
Q  308 gaatcatg 315  Q
    ||||||||    
T  39995 gaatcatg 39988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 218
Target Start/End: Original strand, 8305 - 8511
Alignment:
Q  8 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8305 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 8403  T
Q  108 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 207  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  8404 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 8500  T
Q  208 aaaccactatg 218  Q
    |||||||||||    
T  8501 aaaccactatg 8511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 315
Target Start/End: Original strand, 26609 - 26844
Alignment:
Q  76 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 175  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  26609 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccttgagaatactatatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 26705  T
Q  176 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 275  Q
    ||||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||| |   ||||  || |||||| |||| |||    
T  26706 agtgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatg-tggactcgagtgctttattgtcattttaatgttgtctgtaaaagg 26804  T
Q  276 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  26805 ataaccataacgttggataatgggtactcgatgaatcatg 26844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 90150 - 90033
Alignment:
Q  1 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaa-gagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 99  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||    
T  90150 aagcataaagactactatgtagatagactgataatcacatctcacggatcatgggtaaaagagttatcaacacttcacatagatataaatattacgtata 90051  T
Q  100 atatttatattggattga 117  Q
    | ||||||||||||||||    
T  90050 acatttatattggattga 90033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 315
Target Start/End: Original strand, 102 - 288
Alignment:
Q  125 tgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 224  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||  ||||    
T  102 tgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactctgatccct 198  T
Q  225 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    ||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  199 agatg-tggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 287
Target Start/End: Original strand, 8807 - 9005
Alignment:
Q  85 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||   ||||||||||||| |||||   ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  8807 taaatattaggagtaatatttatactagattgacccccaatgagaatactacttagtat--gttatgaaga-tgtcataagatattctcatagtgataat 8903  T
Q  185 ggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactata 284  Q
    ||||||| |||| | | ||||||||||||| |||  || || ||| ||||||| |||| ||| |   |||||||||||| || |||||| ||| ||||||    
T  8904 ggtgtataccactcctagacctgaaaccacaatgatccttaaatg-tggagtcaagtgttttattgtcattcaaacgttctctgtaacatgataactata 9002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11758 - 11526
Alignment:
Q  83 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    ||||||||||||||||||   |||||   |  || |||||||||||||||||| | ||    
T  11758 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccactgtgagaatactacatagtac--gttatgtgattaattgtcataagatattctcacaatg 11661  T
Q  180 atagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatga 279  Q
    |||   |||||   | | ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |    
T  11660 ataacagtgtacatcgctcttagacctgaaaccactttgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataa 11562  T
Q  280 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 315  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11561 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 11526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 83243 - 83111
Alignment:
Q  83 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 182  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||   ||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  83243 tataaatatcagaagtaatatttatactggattgacccacaatgagaatactacatagtat--gttacgaag-gtgtcataagatattatcatagtcata 83147  T
Q  183 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 218  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  83146 ttggtgtactccactcttagacctgaaaccagtatg 83111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 315
Target Start/End: Original strand, 53766 - 54066
Alignment:
Q  9 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 108  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| || |||  |||||| ||||||||||| |||||||||| | |    
T  53766 agactattatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gaggtattaattctatacataggtataaatattaagagtaatattcaca 53864  T
Q  109 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 208  Q
     ||| |||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||  ||||||||||||||||||   || || | || |||    | ||| |||||||    
T  53865 ctgggttgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcaacatgttaatagtttatattgctcttagacctga 53961  T
Q  209 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 308  Q
    ||||||||||  |||||| ||| ||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  53962 aaccactatgatccctaggtgt-ggactcaagtgctttatg-ccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatg 54059  T
Q  309 aatcatg 315  Q
    |||||||    
T  54060 aatcatg 54066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 138
Target Start/End: Original strand, 45956 - 46051
Alignment:
Q  47 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataa----atattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacat 138  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||    
T  45956 gatcatggataaaaagttgtcaaatattcatatagatataaatatatattatgagtaatatttatattgaattgacccaccattagaatgctacat 46051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University