View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15637_high_25 (Length: 326)

Name: NF15637_high_25
Description: NF15637
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15637_high_25
NF15637_high_25
[»] chr5 (95 HSPs)
chr5 (5-300)||(10463737-10464032)
chr5 (5-300)||(8336843-8337137)
chr5 (5-300)||(8313209-8313503)
chr5 (5-300)||(27307819-27308114)
chr5 (5-300)||(37103032-37103327)
chr5 (5-300)||(4426022-4426317)
chr5 (5-298)||(1683165-1683458)
chr5 (5-300)||(34785250-34785544)
chr5 (5-300)||(27335630-27335925)
chr5 (5-300)||(40158265-40158559)
chr5 (5-296)||(621626-621917)
chr5 (5-300)||(8404394-8404690)
chr5 (5-300)||(24636938-24637234)
chr5 (5-300)||(13920063-13920358)
chr5 (5-300)||(17742333-17742621)
chr5 (5-300)||(4462756-4463051)
chr5 (8-300)||(41139025-41139318)
chr5 (58-300)||(2003952-2004194)
chr5 (5-300)||(42877612-42877905)
chr5 (55-300)||(41193026-41193272)
chr5 (5-300)||(8218011-8218293)
chr5 (5-300)||(31211187-31211484)
chr5 (5-300)||(34527030-34527313)
chr5 (5-198)||(38693466-38693659)
chr5 (129-305)||(22023191-22023367)
chr5 (5-197)||(34010025-34010217)
chr5 (5-197)||(42852826-42853018)
chr5 (8-300)||(30394080-30394372)
chr5 (5-185)||(28456624-28456803)
chr5 (5-183)||(9687531-9687710)
chr5 (5-300)||(43440873-43441155)
chr5 (57-300)||(2005023-2005267)
chr5 (5-269)||(37446436-37446695)
chr5 (57-300)||(18261230-18261471)
chr5 (5-300)||(4461962-4462245)
chr5 (5-300)||(26865706-26865975)
chr5 (57-293)||(2262845-2263081)
chr5 (8-141)||(21837098-21837231)
chr5 (217-300)||(9687715-9687798)
chr5 (5-293)||(10674648-10674936)
chr5 (54-291)||(22166923-22167161)
chr5 (8-195)||(30733927-30734113)
chr5 (57-293)||(43210678-43210914)
chr5 (5-109)||(22023097-22023201)
chr5 (92-298)||(40272459-40272665)
chr5 (8-174)||(3548350-3548514)
chr5 (55-140)||(9924401-9924486)
chr5 (166-279)||(9924280-9924393)
chr5 (5-149)||(14049755-14049899)
chr5 (8-195)||(30698685-30698872)
chr5 (157-300)||(16965878-16966021)
chr5 (57-293)||(19332468-19332704)
chr5 (85-171)||(9168631-9168717)
chr5 (5-95)||(18950869-18950959)
chr5 (91-195)||(24334012-24334117)
chr5 (212-300)||(6365421-6365508)
chr5 (55-281)||(36875874-36876099)
chr5 (91-195)||(6450138-6450243)
chr5 (91-195)||(14711580-14711685)
chr5 (91-195)||(19928521-19928626)
chr5 (231-300)||(26865232-26865301)
chr5 (91-167)||(5597738-5597814)
chr5 (91-195)||(22981985-22982089)
chr5 (8-193)||(27280258-27280445)
chr5 (96-195)||(27432463-27432563)
chr5 (5-195)||(28616025-28616218)
chr5 (95-260)||(43209932-43210097)
chr5 (91-195)||(7234513-7234618)
chr5 (91-195)||(7572982-7573087)
chr5 (235-300)||(8217510-8217575)
chr5 (91-195)||(8315563-8315668)
chr5 (91-195)||(18404367-18404471)
chr5 (91-195)||(27189067-27189172)
chr5 (259-300)||(28456585-28456626)
chr5 (91-195)||(34818914-34819019)
chr5 (91-195)||(41906859-41906964)
chr5 (91-195)||(42992488-42992593)
chr5 (96-195)||(4291691-4291790)
chr5 (214-261)||(42852775-42852822)
chr5 (5-116)||(6365297-6365408)
chr5 (91-195)||(4034668-4034773)
chr5 (91-195)||(4123195-4123300)
chr5 (91-195)||(20453030-20453135)
chr5 (91-195)||(24090058-24090163)
chr5 (91-195)||(2567415-2567519)
chr5 (214-293)||(32537608-32537687)
chr5 (91-195)||(33010407-33010511)
chr5 (213-293)||(37812678-37812757)
chr5 (245-300)||(38693676-38693731)
chr5 (215-269)||(14049943-14049997)
chr5 (91-195)||(18740683-18740788)
chr5 (91-175)||(19000586-19000671)
chr5 (91-195)||(22670979-22671083)
chr5 (61-140)||(34876101-34876181)
chr5 (256-300)||(37446329-37446373)
[»] chr8 (101 HSPs)
chr8 (5-303)||(38706441-38706739)
chr8 (5-303)||(36470823-36471121)
chr8 (5-300)||(25101960-25102255)
chr8 (5-300)||(5250388-5250684)
chr8 (5-300)||(44265446-44265741)
chr8 (54-300)||(17498541-17498787)
chr8 (5-300)||(21135321-21135616)
chr8 (5-300)||(5695911-5696205)
chr8 (5-305)||(27875445-27875745)
chr8 (5-305)||(28015626-28015926)
chr8 (5-300)||(33322531-33322826)
chr8 (5-300)||(6590263-6590559)
chr8 (5-300)||(6018037-6018332)
chr8 (5-300)||(24451482-24451777)
chr8 (5-300)||(41590337-41590631)
chr8 (5-300)||(42499379-42499673)
chr8 (5-300)||(43622789-43623087)
chr8 (5-300)||(35369188-35369483)
chr8 (5-300)||(37967533-37967830)
chr8 (5-300)||(8784576-8784871)
chr8 (5-300)||(35863039-35863334)
chr8 (5-300)||(18839916-18840211)
chr8 (55-282)||(17062413-17062639)
chr8 (55-282)||(17585719-17585945)
chr8 (5-300)||(41281300-41281593)
chr8 (5-300)||(17842463-17842756)
chr8 (120-300)||(6413383-6413563)
chr8 (5-300)||(36063434-36063718)
chr8 (72-303)||(21159845-21160077)
chr8 (5-293)||(37706722-37707009)
chr8 (5-300)||(39336991-39337273)
chr8 (54-300)||(9252645-9252890)
chr8 (5-290)||(30968670-30968957)
chr8 (5-194)||(23483448-23483637)
chr8 (92-300)||(30658524-30658731)
chr8 (8-300)||(5765717-5766012)
chr8 (5-235)||(18304664-18304896)
chr8 (57-300)||(28755225-28755469)
chr8 (90-300)||(13323634-13323845)
chr8 (5-300)||(16472990-16473276)
chr8 (5-300)||(16477561-16477847)
chr8 (208-300)||(14121946-14122038)
chr8 (5-174)||(43936514-43936683)
chr8 (5-260)||(32514042-32514299)
chr8 (59-198)||(43988207-43988347)
chr8 (5-300)||(36018109-36018406)
chr8 (57-171)||(6244224-6244338)
chr8 (5-260)||(42024251-42024504)
chr8 (57-293)||(3865698-3865934)
chr8 (92-298)||(32244484-32244690)
chr8 (92-260)||(3866478-3866647)
chr8 (57-195)||(6243575-6243715)
chr8 (57-293)||(44894464-44894698)
chr8 (96-195)||(34050586-34050685)
chr8 (85-195)||(28701748-28701859)
chr8 (246-300)||(41255335-41255389)
chr8 (91-195)||(7637046-7637151)
chr8 (91-195)||(28174241-28174346)
chr8 (57-293)||(32243684-32243920)
chr8 (232-300)||(39337745-39337813)
chr8 (5-137)||(10410010-10410142)
chr8 (214-260)||(2826919-2826965)
chr8 (90-195)||(11385567-11385673)
chr8 (98-195)||(41219667-41219765)
chr8 (91-195)||(2060974-2061079)
chr8 (91-195)||(4517044-4517149)
chr8 (91-195)||(18365254-18365359)
chr8 (91-195)||(27923717-27923822)
chr8 (91-195)||(34058759-34058864)
chr8 (91-195)||(36765595-36765700)
chr8 (91-195)||(42219315-42219420)
chr8 (91-195)||(44090484-44090589)
chr8 (214-290)||(10409789-10409864)
chr8 (95-189)||(27000886-27000980)
chr8 (245-300)||(35369929-35369984)
chr8 (130-196)||(1663854-1663920)
chr8 (5-43)||(30658453-30658491)
chr8 (91-195)||(4136983-4137088)
chr8 (91-195)||(7419829-7419934)
chr8 (91-195)||(13082866-13082971)
chr8 (91-195)||(24541845-24541950)
chr8 (91-195)||(30378191-30378296)
chr8 (91-195)||(35209551-35209656)
chr8 (91-195)||(36051920-36052025)
chr8 (91-195)||(41724881-41724986)
chr8 (91-178)||(22849500-22849588)
chr8 (76-144)||(28695091-28695159)
chr8 (97-195)||(16729111-16729210)
chr8 (97-195)||(42175204-42175303)
chr8 (102-195)||(8076328-8076422)
chr8 (5-43)||(12469454-12469492)
chr8 (91-195)||(12616480-12616586)
chr8 (91-195)||(13699506-13699609)
chr8 (91-195)||(27519670-27519775)
chr8 (91-195)||(39106860-39106964)
chr8 (99-195)||(41315451-41315548)
chr8 (91-195)||(43470555-43470660)
chr8 (150-198)||(2826981-2827029)
chr8 (91-159)||(17918802-17918870)
chr8 (212-280)||(28694963-28695031)
chr8 (119-167)||(36333227-36333275)
[»] chr1 (102 HSPs)
chr1 (5-300)||(30719479-30719775)
chr1 (1-300)||(51561343-51561642)
chr1 (1-300)||(13501206-13501503)
chr1 (5-300)||(19791239-19791533)
chr1 (5-298)||(26020399-26020692)
chr1 (5-300)||(33708945-33709240)
chr1 (5-305)||(35530781-35531081)
chr1 (55-279)||(47008697-47008920)
chr1 (5-300)||(52493528-52493824)
chr1 (5-300)||(30982382-30982677)
chr1 (5-300)||(26805491-26805786)
chr1 (63-300)||(28700954-28701192)
chr1 (5-300)||(36367890-36368185)
chr1 (5-296)||(11999722-12000013)
chr1 (8-300)||(43504775-43505059)
chr1 (5-297)||(10041240-10041532)
chr1 (5-192)||(46517172-46517359)
chr1 (5-296)||(12368243-12368521)
chr1 (8-300)||(31400219-31400512)
chr1 (5-300)||(46596776-46597070)
chr1 (5-300)||(36248333-36248619)
chr1 (54-300)||(15053640-15053873)
chr1 (54-298)||(33707419-33707663)
chr1 (7-300)||(21091051-21091342)
chr1 (8-198)||(39681895-39682087)
chr1 (54-195)||(7565228-7565370)
chr1 (57-293)||(12251420-12251656)
chr1 (8-162)||(2059484-2059636)
chr1 (5-130)||(37986744-37986869)
chr1 (59-294)||(31024109-31024345)
chr1 (212-297)||(21794413-21794498)
chr1 (57-195)||(52881692-52881831)
chr1 (57-293)||(49767693-49767929)
chr1 (57-193)||(12897143-12897280)
chr1 (92-293)||(27550800-27551001)
chr1 (213-300)||(37986902-37986989)
chr1 (57-195)||(52882360-52882499)
chr1 (57-171)||(27551561-27551675)
chr1 (225-298)||(2059078-2059151)
chr1 (5-123)||(21794511-21794629)
chr1 (5-194)||(48410250-48410439)
chr1 (57-293)||(11397039-11397275)
chr1 (92-238)||(49768495-49768642)
chr1 (8-195)||(5430567-5430754)
chr1 (57-171)||(25352083-25352197)
chr1 (91-195)||(4574069-4574173)
chr1 (231-300)||(12367703-12367772)
chr1 (91-195)||(47632647-47632752)
chr1 (12-107)||(42972161-42972256)
chr1 (95-195)||(4486934-4487035)
chr1 (91-195)||(10383083-10383188)
chr1 (91-195)||(14421270-14421375)
chr1 (91-195)||(17964112-17964217)
chr1 (8-194)||(18996977-18997161)
chr1 (91-195)||(31861617-31861722)
chr1 (91-195)||(34076052-34076157)
chr1 (54-171)||(35188303-35188419)
chr1 (91-195)||(35767019-35767124)
chr1 (91-195)||(45336445-45336550)
chr1 (91-195)||(48624258-48624363)
chr1 (91-195)||(48723525-48723630)
chr1 (214-298)||(13083446-13083529)
chr1 (214-298)||(42971953-42972036)
chr1 (245-300)||(29231884-29231939)
chr1 (97-195)||(36796033-36796132)
chr1 (80-171)||(52009992-52010083)
chr1 (91-195)||(4647182-4647287)
chr1 (231-300)||(15054418-15054487)
chr1 (91-195)||(25136942-25137047)
chr1 (91-195)||(26451181-26451286)
chr1 (91-195)||(26507607-26507712)
chr1 (232-297)||(36249086-36249151)
chr1 (231-300)||(37986209-37986278)
chr1 (154-196)||(2059154-2059196)
chr1 (102-195)||(14007043-14007137)
chr1 (218-260)||(48410160-48410202)
chr1 (91-195)||(2207588-2207693)
chr1 (91-195)||(10371577-10371682)
chr1 (91-195)||(14410934-14411039)
chr1 (91-195)||(46667617-46667722)
chr1 (100-195)||(15358344-15358440)
chr1 (91-178)||(52526859-52526947)
chr1 (214-293)||(25351963-25352041)
chr1 (91-177)||(26136191-26136278)
chr1 (214-293)||(48218060-48218138)
chr1 (91-177)||(52760518-52760604)
chr1 (158-195)||(1297017-1297055)
chr1 (102-195)||(14743945-14744039)
chr1 (61-115)||(20357120-20357174)
chr1 (61-115)||(20562781-20562835)
chr1 (215-269)||(26207493-26207547)
chr1 (5-39)||(29231368-29231402)
chr1 (102-195)||(31266968-31267062)
chr1 (99-195)||(48468233-48468331)
chr1 (245-298)||(1297104-1297156)
chr1 (91-195)||(4008803-4008908)
chr1 (91-195)||(7603718-7603823)
chr1 (91-195)||(10658611-10658716)
chr1 (91-195)||(26911163-26911268)
chr1 (91-195)||(32037258-32037363)
chr1 (91-195)||(45583556-45583660)
chr1 (91-151)||(42972086-42972146)
[»] chr4 (101 HSPs)
chr4 (5-300)||(53323774-53324070)
chr4 (5-300)||(30331278-30331573)
chr4 (5-300)||(33177421-33177716)
chr4 (1-300)||(19522712-19523011)
chr4 (5-300)||(47309434-47309729)
chr4 (5-300)||(22068097-22068392)
chr4 (5-298)||(28448391-28448677)
chr4 (75-300)||(38114282-38114507)
chr4 (5-293)||(31316547-31316836)
chr4 (8-300)||(51876007-51876302)
chr4 (8-300)||(3873155-3873468)
chr4 (5-293)||(55938075-55938362)
chr4 (5-300)||(4850094-4850389)
chr4 (12-305)||(43937996-43938291)
chr4 (62-305)||(20177933-20178175)
chr4 (5-300)||(25422067-25422361)
chr4 (5-300)||(33689293-33689588)
chr4 (5-300)||(53423563-53423859)
chr4 (5-266)||(1870140-1870400)
chr4 (5-300)||(51395612-51395907)
chr4 (5-291)||(7490707-7490988)
chr4 (5-300)||(10321695-10321990)
chr4 (90-300)||(13718060-13718271)
chr4 (5-300)||(53571542-53571824)
chr4 (12-300)||(10085485-10085772)
chr4 (5-300)||(11670119-11670401)
chr4 (8-300)||(44289677-44289970)
chr4 (5-300)||(47379178-47379471)
chr4 (54-300)||(35060875-35061120)
chr4 (5-255)||(42972734-42972983)
chr4 (5-300)||(44209495-44209777)
chr4 (8-300)||(48082443-48082736)
chr4 (5-300)||(23473478-23473773)
chr4 (5-195)||(47463469-47463661)
chr4 (94-300)||(37329487-37329695)
chr4 (5-123)||(7617418-7617536)
chr4 (55-296)||(35821128-35821357)
chr4 (224-300)||(7617535-7617611)
chr4 (12-298)||(52947767-52948054)
chr4 (61-299)||(48219943-48220180)
chr4 (57-195)||(44452189-44452328)
chr4 (8-195)||(55283212-55283399)
chr4 (57-293)||(34513070-34513305)
chr4 (80-260)||(38499327-38499508)
chr4 (8-122)||(3862491-3862606)
chr4 (8-122)||(3871248-3871363)
chr4 (5-298)||(13603785-13604077)
chr4 (56-167)||(20650555-20650666)
chr4 (57-171)||(28163777-28163891)
chr4 (225-299)||(50824407-50824481)
chr4 (91-195)||(8949622-8949727)
chr4 (91-195)||(29445636-29445741)
chr4 (92-255)||(44452893-44453056)
chr4 (91-195)||(343918-344023)
chr4 (91-195)||(6203170-6203275)
chr4 (231-300)||(11670860-11670929)
chr4 (91-195)||(19320816-19320921)
chr4 (91-195)||(22515662-22515767)
chr4 (91-195)||(24281869-24281974)
chr4 (91-195)||(28756315-28756420)
chr4 (91-195)||(31312146-31312251)
chr4 (91-195)||(38698827-38698932)
chr4 (91-195)||(39269759-39269864)
chr4 (91-195)||(42931154-42931259)
chr4 (91-195)||(52224544-52224649)
chr4 (91-195)||(52788856-52788960)
chr4 (80-192)||(35351739-35351853)
chr4 (91-195)||(9428068-9428172)
chr4 (5-46)||(13717994-13718035)
chr4 (91-195)||(15636919-15637024)
chr4 (91-195)||(25768018-25768123)
chr4 (91-195)||(34680329-34680434)
chr4 (91-195)||(53237972-53238077)
chr4 (91-171)||(10386696-10386776)
chr4 (91-178)||(11152325-11152413)
chr4 (5-45)||(38114237-38114277)
chr4 (96-195)||(47016247-47016347)
chr4 (245-300)||(31470962-31471017)
chr4 (91-195)||(4553373-4553478)
chr4 (91-195)||(23708873-23708978)
chr4 (91-195)||(28540858-28540963)
chr4 (91-175)||(35015448-35015533)
chr4 (91-195)||(42642996-42643100)
chr4 (91-195)||(47500210-47500315)
chr4 (91-195)||(50642603-50642708)
chr4 (91-195)||(53231213-53231317)
chr4 (91-178)||(1776634-1776722)
chr4 (3-43)||(8770669-8770709)
chr4 (91-177)||(18092735-18092821)
chr4 (97-195)||(29246903-29247002)
chr4 (97-195)||(47875938-47876036)
chr4 (102-195)||(16618859-16618953)
chr4 (231-300)||(53571008-53571078)
chr4 (91-195)||(6488525-6488629)
chr4 (212-293)||(6818007-6818087)
chr4 (91-195)||(23064058-23064163)
chr4 (91-175)||(23624507-23624592)
chr4 (91-195)||(28706115-28706219)
chr4 (91-195)||(34509756-34509861)
chr4 (232-300)||(53569155-53569224)
chr4 (215-295)||(47939788-47939867)
[»] chr7 (81 HSPs)
chr7 (5-300)||(43597484-43597779)
chr7 (5-300)||(4926372-4926670)
chr7 (5-300)||(22378458-22378753)
chr7 (5-300)||(38158948-38159247)
chr7 (5-300)||(47791838-47792133)
chr7 (5-300)||(7238576-7238871)
chr7 (5-300)||(6588687-6588982)
chr7 (8-300)||(18059006-18059296)
chr7 (5-300)||(1961897-1962193)
chr7 (5-300)||(35482059-35482351)
chr7 (5-296)||(14990548-14990837)
chr7 (5-296)||(15420159-15420448)
chr7 (5-298)||(15652796-15653085)
chr7 (8-300)||(43574239-43574532)
chr7 (5-293)||(46044291-46044580)
chr7 (5-200)||(6330995-6331191)
chr7 (5-277)||(10620520-10620793)
chr7 (54-200)||(36019811-36019957)
chr7 (9-300)||(38199062-38199340)
chr7 (54-300)||(46330799-46331045)
chr7 (5-300)||(4899864-4900158)
chr7 (5-300)||(43083855-43084137)
chr7 (5-299)||(11396958-11397252)
chr7 (5-301)||(3495655-3495938)
chr7 (8-300)||(1544478-1544769)
chr7 (5-260)||(27727226-27727485)
chr7 (5-300)||(44167794-44168074)
chr7 (111-300)||(21109452-21109642)
chr7 (167-300)||(4883775-4883908)
chr7 (5-300)||(29155962-29156260)
chr7 (8-300)||(38598967-38599260)
chr7 (5-300)||(44080958-44081253)
chr7 (5-235)||(37539849-37540081)
chr7 (5-151)||(33624936-33625080)
chr7 (92-293)||(1066490-1066691)
chr7 (55-151)||(15130859-15130955)
chr7 (81-298)||(1260142-1260358)
chr7 (60-195)||(1065795-1065931)
chr7 (57-293)||(8081814-8082048)
chr7 (5-298)||(9633169-9633461)
chr7 (22-186)||(10463312-10463475)
chr7 (215-300)||(36020005-36020090)
chr7 (57-293)||(12621625-12621861)
chr7 (57-195)||(8832813-8832952)
chr7 (8-171)||(47139739-47139903)
chr7 (57-171)||(37107808-37107922)
chr7 (218-300)||(33624788-33624869)
chr7 (57-171)||(38594642-38594756)
chr7 (245-298)||(27727998-27728051)
chr7 (212-300)||(45958865-45958953)
chr7 (5-94)||(45958726-45958815)
chr7 (90-195)||(2510672-2510778)
chr7 (91-195)||(9900532-9900637)
chr7 (91-195)||(23023517-23023622)
chr7 (91-195)||(39035838-39035943)
chr7 (59-291)||(42974161-42974394)
chr7 (5-94)||(16080779-16080868)
chr7 (245-301)||(38199808-38199864)
chr7 (97-195)||(45986190-45986289)
chr7 (90-195)||(7207993-7208099)
chr7 (91-195)||(11620047-11620152)
chr7 (91-195)||(21202276-21202380)
chr7 (91-195)||(34651581-34651686)
chr7 (91-195)||(23064446-23064552)
chr7 (8-192)||(28924600-28924784)
chr7 (215-293)||(38593281-38593358)
chr7 (91-195)||(5029205-5029310)
chr7 (91-195)||(28642485-28642590)
chr7 (245-300)||(3496423-3496478)
chr7 (81-172)||(17018437-17018528)
chr7 (231-298)||(37537487-37537553)
chr7 (212-293)||(16080975-16081055)
chr7 (215-300)||(17018571-17018656)
chr7 (91-195)||(17314701-17314806)
chr7 (91-195)||(33772380-33772484)
chr7 (91-195)||(46158057-46158162)
chr7 (264-300)||(15131588-15131624)
chr7 (92-194)||(37108485-37108589)
chr7 (131-163)||(41571631-41571663)
chr7 (245-300)||(43083327-43083383)
chr7 (132-195)||(45983628-45983692)
[»] chr6 (51 HSPs)
chr6 (5-300)||(15721062-15721360)
chr6 (5-300)||(26356528-26356826)
chr6 (5-300)||(10915301-10915598)
chr6 (5-300)||(5974309-5974604)
chr6 (5-300)||(8709836-8710130)
chr6 (8-300)||(30660778-30661071)
chr6 (5-295)||(17697386-17697676)
chr6 (5-300)||(5087190-5087485)
chr6 (5-300)||(1820983-1821274)
chr6 (5-300)||(844106-844402)
chr6 (5-299)||(29691911-29692205)
chr6 (5-299)||(938845-939139)
chr6 (9-300)||(861362-861655)
chr6 (54-297)||(33518406-33518648)
chr6 (80-300)||(2087438-2087657)
chr6 (5-300)||(22731997-22732293)
chr6 (5-300)||(5079506-5079802)
chr6 (5-249)||(30492761-30493004)
chr6 (54-300)||(20510491-20510725)
chr6 (5-300)||(18502992-18503274)
chr6 (8-300)||(33744665-33744958)
chr6 (5-300)||(14256151-14256440)
chr6 (8-253)||(12481801-12482047)
chr6 (5-195)||(20977467-20977658)
chr6 (5-163)||(17245717-17245875)
chr6 (5-300)||(28476187-28476486)
chr6 (5-195)||(20977101-20977292)
chr6 (5-195)||(3375394-3375585)
chr6 (59-300)||(11400122-11400364)
chr6 (5-142)||(34046544-34046682)
chr6 (57-293)||(3914474-3914709)
chr6 (57-293)||(21108119-21108355)
chr6 (5-139)||(20897811-20897947)
chr6 (131-300)||(20898115-20898275)
chr6 (90-293)||(289005-289207)
chr6 (216-300)||(17244540-17244624)
chr6 (5-130)||(30353126-30353252)
chr6 (86-293)||(289438-289647)
chr6 (91-195)||(12783434-12783539)
chr6 (91-195)||(13400275-13400380)
chr6 (97-195)||(16270286-16270385)
chr6 (245-300)||(17246321-17246376)
chr6 (91-195)||(19693146-19693251)
chr6 (91-178)||(31280029-31280117)
chr6 (97-195)||(2857444-2857543)
chr6 (3-194)||(8235174-8235365)
chr6 (80-159)||(30916776-30916855)
chr6 (98-195)||(15053905-15054003)
chr6 (91-195)||(945850-945955)
chr6 (8-44)||(16736655-16736691)
chr6 (245-298)||(5079000-5079053)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (5-297)||(5917-6209)
[»] chr3 (96 HSPs)
chr3 (1-300)||(25250016-25250313)
chr3 (5-300)||(38173902-38174197)
chr3 (5-300)||(45419785-45420078)
chr3 (5-300)||(53517784-53518079)
chr3 (55-300)||(21749566-21749811)
chr3 (5-300)||(29348275-29348567)
chr3 (5-300)||(44808839-44809135)
chr3 (5-293)||(23883390-23883678)
chr3 (5-300)||(40762600-40762895)
chr3 (5-300)||(27492313-27492609)
chr3 (5-300)||(37178941-37179237)
chr3 (25-300)||(32146996-32147271)
chr3 (5-300)||(23917328-23917615)
chr3 (3-298)||(11045404-11045700)
chr3 (5-300)||(50615084-50615366)
chr3 (5-300)||(117447-117729)
chr3 (5-300)||(11293800-11294089)
chr3 (12-300)||(19669699-19669988)
chr3 (54-300)||(53397095-53397343)
chr3 (5-300)||(45235344-45235641)
chr3 (8-294)||(39562552-39562839)
chr3 (8-274)||(45406701-45406955)
chr3 (54-300)||(53439324-53439556)
chr3 (5-300)||(32943000-32943281)
chr3 (8-300)||(46295051-46295345)
chr3 (5-261)||(44557579-44557822)
chr3 (61-300)||(19601549-19601790)
chr3 (106-303)||(28685303-28685495)
chr3 (82-298)||(54268922-54269138)
chr3 (5-152)||(23921075-23921220)
chr3 (60-195)||(9018125-9018260)
chr3 (59-293)||(31991074-31991308)
chr3 (5-269)||(44287768-44288027)
chr3 (92-298)||(33475471-33475677)
chr3 (8-267)||(34995564-34995823)
chr3 (85-293)||(41927919-41928126)
chr3 (92-298)||(44555919-44556125)
chr3 (57-293)||(52701168-52701404)
chr3 (57-293)||(8575953-8576191)
chr3 (144-298)||(15772003-15772157)
chr3 (57-260)||(25232695-25232900)
chr3 (57-196)||(41927361-41927501)
chr3 (215-298)||(3173719-3173802)
chr3 (212-300)||(37481262-37481351)
chr3 (57-293)||(33476241-33476477)
chr3 (146-263)||(45387449-45387566)
chr3 (57-152)||(44556687-44556782)
chr3 (212-296)||(53377326-53377412)
chr3 (55-136)||(53377430-53377511)
chr3 (80-262)||(26268645-26268826)
chr3 (85-195)||(28055253-28055364)
chr3 (85-195)||(28065678-28065789)
chr3 (231-300)||(116924-116993)
chr3 (91-195)||(869446-869551)
chr3 (91-195)||(3078374-3078479)
chr3 (91-195)||(4994099-4994204)
chr3 (91-195)||(10182227-10182332)
chr3 (91-195)||(30778753-30778858)
chr3 (91-195)||(34226026-34226131)
chr3 (91-195)||(36777869-36777974)
chr3 (231-300)||(44555364-44555433)
chr3 (91-195)||(45454337-45454442)
chr3 (91-195)||(50362393-50362498)
chr3 (231-300)||(50614546-50614615)
chr3 (91-195)||(51324695-51324800)
chr3 (91-195)||(53328515-53328620)
chr3 (96-195)||(16644630-16644729)
chr3 (91-174)||(53658005-53658088)
chr3 (91-195)||(1486948-1487053)
chr3 (91-195)||(15490756-15490861)
chr3 (91-195)||(31269587-31269692)
chr3 (91-195)||(40126885-40126990)
chr3 (91-195)||(47198987-47199092)
chr3 (91-195)||(49612279-49612384)
chr3 (12-105)||(8575373-8575466)
chr3 (96-195)||(45344025-45344125)
chr3 (91-195)||(23878600-23878706)
chr3 (98-195)||(55006152-55006250)
chr3 (91-195)||(24342668-24342773)
chr3 (91-195)||(33391028-33391133)
chr3 (91-195)||(43127682-43127787)
chr3 (91-195)||(43660412-43660517)
chr3 (91-195)||(43729766-43729870)
chr3 (91-195)||(50133524-50133629)
chr3 (91-195)||(53947560-53947664)
chr3 (5-46)||(54268854-54268895)
chr3 (8-44)||(20078100-20078136)
chr3 (91-178)||(32245747-32245835)
chr3 (91-167)||(32799933-32800008)
chr3 (91-174)||(4735774-4735857)
chr3 (102-194)||(34442130-34442224)
chr3 (91-195)||(37126874-37126980)
chr3 (91-191)||(16128533-16128634)
chr3 (91-195)||(19878390-19878494)
chr3 (91-195)||(30786571-30786676)
chr3 (91-195)||(42367748-42367853)
[»] chr2 (85 HSPs)
chr2 (5-297)||(10357318-10357610)
chr2 (5-300)||(7439220-7439515)
chr2 (5-300)||(3043361-3043656)
chr2 (8-300)||(42274304-42274596)
chr2 (56-300)||(25666038-25666282)
chr2 (5-300)||(33832124-33832418)
chr2 (5-300)||(43932734-43933029)
chr2 (5-297)||(8737811-8738104)
chr2 (21-300)||(41120738-41121016)
chr2 (80-300)||(30784185-30784404)
chr2 (5-300)||(31771316-31771611)
chr2 (5-293)||(31436045-31436332)
chr2 (5-300)||(25100585-25100879)
chr2 (62-300)||(6457266-6457505)
chr2 (5-300)||(40364884-40365179)
chr2 (5-300)||(44286684-44286978)
chr2 (5-300)||(20721229-20721511)
chr2 (5-300)||(44492883-44493179)
chr2 (55-298)||(36512025-36512269)
chr2 (55-300)||(37592929-37593171)
chr2 (5-177)||(13371995-13372167)
chr2 (5-300)||(42487668-42487963)
chr2 (120-300)||(35498588-35498768)
chr2 (5-300)||(21439832-21440114)
chr2 (5-186)||(33031165-33031345)
chr2 (5-300)||(20719949-20720236)
chr2 (5-289)||(44879718-44879995)
chr2 (80-242)||(29809405-29809567)
chr2 (54-300)||(34073621-34073865)
chr2 (56-269)||(33000913-33001125)
chr2 (5-298)||(14200964-14201260)
chr2 (5-149)||(18672342-18672486)
chr2 (220-298)||(33031087-33031165)
chr2 (85-293)||(32318223-32318432)
chr2 (62-300)||(8392382-8392622)
chr2 (8-193)||(23496666-23496852)
chr2 (212-300)||(20719238-20719326)
chr2 (57-293)||(3117981-3118216)
chr2 (59-293)||(32318997-32319232)
chr2 (218-300)||(7654925-7655007)
chr2 (5-171)||(19058643-19058808)
chr2 (92-298)||(9111571-9111777)
chr2 (226-300)||(20701256-20701330)
chr2 (91-194)||(9737488-9737593)
chr2 (91-195)||(12620337-12620442)
chr2 (91-195)||(13803289-13803394)
chr2 (91-195)||(16709142-16709247)
chr2 (91-195)||(20973247-20973352)
chr2 (235-300)||(23787773-23787838)
chr2 (91-195)||(45301262-45301367)
chr2 (96-195)||(35516308-35516408)
chr2 (209-298)||(4327812-4327898)
chr2 (8-293)||(13027445-13027735)
chr2 (97-195)||(41178709-41178808)
chr2 (91-195)||(7401657-7401762)
chr2 (91-195)||(14542151-14542256)
chr2 (57-293)||(32319572-32319809)
chr2 (5-46)||(35498806-35498847)
chr2 (91-195)||(36218630-36218735)
chr2 (91-195)||(37850322-37850427)
chr2 (91-171)||(3854934-3855014)
chr2 (5-78)||(29809254-29809327)
chr2 (245-300)||(21439296-21439351)
chr2 (91-195)||(3201797-3201900)
chr2 (91-195)||(10214809-10214914)
chr2 (91-195)||(17614941-17615046)
chr2 (91-195)||(18549513-18549618)
chr2 (247-300)||(18672259-18672312)
chr2 (91-195)||(31653361-31653466)
chr2 (12-105)||(3118639-3118732)
chr2 (245-284)||(36881116-36881155)
chr2 (85-195)||(39670399-39670510)
chr2 (101-195)||(44713106-44713200)
chr2 (155-193)||(25100388-25100426)
chr2 (91-195)||(38063070-38063176)
chr2 (7-40)||(37592894-37592927)
chr2 (91-195)||(37741919-37742024)
chr2 (91-195)||(42520911-42521016)
chr2 (218-258)||(13890872-13890912)
chr2 (218-258)||(14030997-14031037)
chr2 (218-250)||(18917280-18917312)
chr2 (264-300)||(20720809-20720845)
chr2 (227-299)||(24951214-24951285)
chr2 (56-140)||(36881180-36881264)
chr2 (96-195)||(39375071-39375171)
[»] scaffold1160 (1 HSPs)
scaffold1160 (5-298)||(1159-1455)
[»] scaffold1191 (1 HSPs)
scaffold1191 (5-300)||(669-964)
[»] scaffold0651 (1 HSPs)
scaffold0651 (5-293)||(6862-7151)
[»] scaffold0562 (1 HSPs)
scaffold0562 (8-300)||(3974-4287)
[»] scaffold0707 (1 HSPs)
scaffold0707 (54-297)||(6950-7192)
[»] scaffold0148 (2 HSPs)
scaffold0148 (5-300)||(35273-35568)
scaffold0148 (235-300)||(38609-38674)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (5-298)||(17377-17669)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (5-200)||(158028-158222)
[»] scaffold0097 (4 HSPs)
scaffold0097 (5-300)||(25057-25339)
scaffold0097 (5-300)||(23787-24074)
scaffold0097 (212-300)||(23076-23164)
scaffold0097 (264-300)||(24647-24683)
[»] scaffold0514 (1 HSPs)
scaffold0514 (28-300)||(6197-6470)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (5-300)||(6931-7227)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (5-300)||(240012-240294)
scaffold0003 (231-300)||(239492-239561)
[»] scaffold1190 (1 HSPs)
scaffold1190 (5-300)||(202-486)
[»] scaffold0640 (1 HSPs)
scaffold0640 (8-300)||(3895-4188)
[»] scaffold0385 (2 HSPs)
scaffold0385 (5-300)||(9960-10245)
scaffold0385 (232-300)||(9424-9491)
[»] scaffold0571 (2 HSPs)
scaffold0571 (154-300)||(8430-8575)
scaffold0571 (5-156)||(8596-8748)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (5-141)||(21750-21886)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (14-195)||(47860-48041)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (119-293)||(3260-3436)
scaffold0734 (8-116)||(2854-2962)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (214-300)||(48967-49053)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (212-300)||(6204-6292)
scaffold0199 (130-194)||(6298-6361)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (80-171)||(283312-283403)
scaffold0005 (157-293)||(282940-283076)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (59-137)||(52512-52590)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (18-171)||(123198-123351)
[»] scaffold0618 (1 HSPs)
scaffold0618 (91-195)||(9319-9424)
[»] scaffold0493 (1 HSPs)
scaffold0493 (91-195)||(6864-6969)
[»] scaffold0991 (1 HSPs)
scaffold0991 (91-195)||(883-988)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (91-195)||(48160-48265)
scaffold0029 (91-195)||(42042-42147)
[»] scaffold0245 (2 HSPs)
scaffold0245 (158-195)||(24927-24965)
scaffold0245 (245-298)||(25014-25066)
[»] scaffold0809 (1 HSPs)
scaffold0809 (5-34)||(759-788)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 95)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10464032 - 10463737
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10464032 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 10463933  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        
T  10463932 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 10463833  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10463832 tttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 10463737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8337137 - 8336843
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||       ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8337137 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttt-gagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 8337039  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||        
T  8337038 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaactgcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctagacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 8336939  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8336938 tttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtcagtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 8336843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8313503 - 8313209
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  8313503 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgaggcaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattcagaattt 8313404  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        
T  8313403 tt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaaaataaaattaacaaaatatggacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 8313305  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8313304 tttgcataagaacttttaataatgttcttaacacgtatgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 8313209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27308114 - 27307819
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||| | ||||||||||||    
T  27308114 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaaaactatgaaagattcatttaccacaatttagaattt 27308015  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||        
T  27308014 tttaacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatcttgacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 27307915  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27307914 tttgcatagaaactttcagtaatgtttttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 27307819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37103327 - 37103032
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37103327 aagtttatttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 37103228  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |        
T  37103227 tctaacatgaaacgaattaaaaatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaattaaattttgagataattt 37103128  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  37103127 tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtttgtaaaaaattattcaaaaattcaagagtttatgcataaattaaacaaatttgaattga 37103032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4426317 - 4426022
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4426317 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactatgaaatattcatttactaaaatttagaattt 4426218  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||| |||| ||||||||| |||        
T  4426217 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaatttaactaaatctagacgtaaaaattaaattttgcaacaattt 4426118  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4426117 tgcgcataggaacttttagtaatgttcttaagacgtatgtaaaaaattattcaaaaactcagaagtttaaacataaattaaacaaaattgaattga 4426022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 298
Target Start/End: Original strand, 1683165 - 1683458
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1683165 aagtttgtttaactatccttaaactcttaaatttttgaacgatttctttaagacaagtttagaacactatgaaaagttcatttactaaaatttagaattt 1683264  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||        
T  1683265 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaatgataaaagtaataaaatatggacgtataaatcaaattttgtgacaattt 1683364  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
       |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1683365 tttgcataggagcttttagtaatgttgttaacatgtctgcaaaaaattatccaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaatt 1683458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 34785250 - 34785544
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||        ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  34785250 aagtttgtttaattatccttaaattcttaaattttttaacgattttttttagacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttaaatttt 34785349  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        
T  34785350 tttaacataaaacgaattaaatataaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtaaaaatcaaattttgcgacaattt 34785449  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34785450 tttgcaaaggaacttttagtaatattcttaacacgtctg-aaaaaattgtacaaaaactcaaaagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 34785544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27335925 - 27335630
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |        ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| | |||    
T  27335925 aagtttatttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttttaagacaagtttaaaacattatgaaaggttcatttaccaaaatttatatttt 27335826  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||        
T  27335825 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatatgggcgtaaaaatcaaattttgcgacaattt 27335726  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27335725 tttacagaggaacttttagtaatgttcttaacacatatgcaaaaaattgtttaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 27335630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 40158559 - 40158265
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         |||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40158559 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttatgacaagtttataacc-tatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 40158461  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |        
T  40158460 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaaattaacaaattatggacgtagatatcaaattttgcgaaatttt 40158361  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       | | |||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  40158360 tttgtagaggaactttttgtaatgttcttaacacgtatgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 40158265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 296
Target Start/End: Original strand, 621626 - 621917
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||       ||||||  ||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  621626 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttagaacgatttttatgagacagatttagaacactataaaaggttcatttactagaatttacaattt 621725  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||        
T  621726 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaacttaaagataaaattaacaaaatctggatgtagaaatcacattttgcgacaattt 621825  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaa 296  Q
       ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||    
T  621826 tttgcagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctgccaaaaattgttcaaaaactcaaaagtttaagcataaattaaagaaatttgaa 621917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 8404394 - 8404690
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  8404394 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacactaaaaaaggttcatttaccaaaatttagatttt 8404493  T
Q  105 ttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||       
T  8404494 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaataaaatttgaacttaaaaatcaaattttgcgacaact 8404593  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8404594 ttttgcagatgaatttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgtttaaaaattcaagagtttaagcataaattaaacaaacttgaattga 8404690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 24636938 - 24637234
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnng-agacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24636938 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 24637037  T
Q  104 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |       
T  24637038 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaacttaaagataaaagtaataaaatctggaagtagaaatcaaattttgcgataatt 24637137  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  24637138 ttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaatcaaatttgaattga 24637234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13920358 - 13920063
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13920358 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaatgttcaattattaaaatttagaattt 13920259  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||  ||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |        
T  13920258 tttaacatgaaattaattaaatatgaatatttgaaaatgataaaagttaaagataaaagtaataaaatttggacatataaatcaaattttgcgataattt 13920159  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13920158 tttgcggaggaacttttattaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaatagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 13920063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17742621 - 17742333
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||| |||    
T  17742621 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagataagtttagaacactatgaaaggttcatttaccaaaacttagatttt 17742522  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaatttttt-aaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       
T  17742521 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaata 17742422  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
         || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  17742421 ttttacagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaatcgtttaaaaactcaagag--------taaattaaacaaatttgaattga 17742333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4463051 - 4462756
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||       ||||||||||||||  | |||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  4463051 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgattttttcgagacaagtttagagtactatgaaagattcattgactaaaatttagaattt 4462952  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||        
T  4462951 gttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatcaggatgtagaaatcaaattttgcaacaattt 4462852  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       | | ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||    
T  4462851 tttgtagagggactattaataatgttcttaacacgtctgcaaataattgttcaaaaactcaagagttaaagcataaatgaaacaaatttgaattga 4462756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41139318 - 41139025
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||       ||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41139318 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacattgtgaaaggttcaattactaaaatttagaatttttt 41139219  T
Q  108 aat-atgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnn 206  Q
     || |||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |          
T  41139218 tatcatgaaatgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattttt 41139119  T
Q  207 ngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41139118 tgcggaggaacttttagtaatgttcttaacatgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagattaagcataaattaaacaaatttgaattga 41139025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 58 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2004194 - 2003952
Alignment:
Q  58 caagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaaga 157  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2004194 caagtttagaacactatgaaaggttcattttctacaatttagaattgttaaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaaga 2004095  T
Q  158 taaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttca 257  Q
    |||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||       ||| | |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||    
T  2004094 taaagttaacaaaatctggacataaaaatcaaattttgcgacaattttttgcagatgaacttttagtaatgttcttaacacgtacgcaaaaagttgttca 2003995  T
Q  258 aaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2003994 aaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 2003952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 42877612 - 42877905
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||        ||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||||||||   |||    
T  42877612 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaaggatatttttaagacaagtttagaatgccatgaaaggttcatttaccaaaatttaattttt 42877711  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||        
T  42877712 tttaagatgaaacgaattaaatatgaatttt-taaaacgacaaaagataaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaataaaattttgcgacaattt 42877810  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  42877811 tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtct-acaaaaattgtttaaaaactcaagagtttaagcatgaattaaacaaatttgaattga 42877905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 55 - 300
Target Start/End: Original strand, 41193026 - 41193272
Alignment:
Q  55 agacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaa 154  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41193026 agacaagtttagaacactatcaaaggttcatttacaaaaatttagaattttttaacataaaacgaattgaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaa 41193125  T
Q  155 agataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaa-ttg 253  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |       ||| |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||| |||    
T  41193126 agataaaattaactaaatctggacgtagaattcaaattttgcgataattttttgcagaggaacttttagcaacattcttaacacggctgtaaaaaagttg 41193225  T
Q  254 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41193226 ttcaaaaaatcaaaagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 41193272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 8218011 - 8218293
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||       |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8218011 aagtttgtttaattatccttaaagtcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 8218110  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||             ||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| | |        
T  8218111 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaac-------------gataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcaataattt 8218197  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8218198 tttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 8218293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31211484 - 31211187
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnng-agacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||    
T  31211484 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttaaacaagtttagaacaatatgaaaggtttatttacaaaaatttagattt 31211385  T
Q  104 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||||  |||||||||||||||||||||| | |       
T  31211384 ttttaatatgaaacgaattcaataggagttttttaaaacagcaaaagttaaagatataagtaataaaatcgggacgtagaaatcaaattttgcaataatt 31211285  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtct-gtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||| |||||||||||||||||||||||||   |||   ||||||||||||||||||| ||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  31211284 ttatgcagaggaacttttagtaatgttcttaactaatctacaaaaaaattgttcaaaaacttaagaatttaagtataaattaaacaaatttaaattga 31211187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 34527313 - 34527030
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  34527313 aagtttgtttaattatccttaaattcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaattt 34527214  T
Q  105 ttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    ||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |        
T  34527213 ttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttaaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcggc---- 34527118  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
             ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| |||||  |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34527117 ---------ggaacatttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaacaacttaagagtataagaataaattaaacaaatttgaattga 34527030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 198
Target Start/End: Original strand, 38693466 - 38693659
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  38693466 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaatactatgaaaggttcaattactaaaatttataattt 38693565  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcga 198  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  38693566 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaatgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcga 38693659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 129 - 305
Target Start/End: Original strand, 22023191 - 22023367
Alignment:
Q  129 gaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatg 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        |  |||||||||||||||||    
T  22023191 gaattttttaaaacgaaaaaagttaaagctaaaattaacaaaattcggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttaccgaggaacttttagtaatg 22023290  T
Q  229 ttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattgatgatg 305  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22023291 ttcttaacacgtctacaaaaaattgttcaaaaattcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgaggatg 22023367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34010217 - 34010025
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |       ||||||||||||||| | || |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  34010217 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgtactatttttttgagacaagtttagaatactaagaaaggttcattaactaaaatttagaattt 34010118  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcg 197  Q
    ||||  || |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  34010117 tttaccataaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagtttaagataaaattaacaaaatctgaacgtagaaatcaaattttgcg 34010025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 42853018 - 42852826
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||        |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  42853018 aagtttgtttaattattcttaaattcttgaatttttgaacgttttttatgagataagtttagaacaatatgaaagattcatttactaaaatttaaaattt 42852919  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcg 197  Q
    || ||  |||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42852918 ttcaacgtgaaacgaatttaaaatgaattttttaaaacgactaaagttaaaaataaaagtaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcg 42852826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30394372 - 30394080
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||        | ||||||||| |||| ||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||    
T  30394372 tttgcttaattatccttaaactcttaacttttttaacgattctttttatacaagtttataacactatgaag-gttcatttgctaaaatctataatttttt 30394274  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcgacannnnn 205  Q
    || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |         
T  30394273 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttt 30394174  T
Q  206 nngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       |  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  30394173 tt-cggaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 30394080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28456803 - 28456624
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||       ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||   |||    
T  28456803 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttgtgagacaagtttagaatactatgaaaagttcattaactaaaatttacttttt 28456704  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaa 185  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28456703 tttaacatgaaactaattaaatatgaatttttt-aaacgaaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaa 28456624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 183
Target Start/End: Original strand, 9687531 - 9687710
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||       || | |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9687531 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaatcgatttttttgatataagtttagaacactataaaaggttcgtttactaaaatttagaattt 9687630  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacg-acaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtaga 183  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9687631 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaaaaagttaaagataaaattaataaaattttgacgtaga 9687710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 43440873 - 43441155
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||       |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  43440873 aagtttgtttgattatccttaaattcttaaatttttgaatgatttttttgagataagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttataattt 43440972  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||             ||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |        
T  43440973 tttaacatgaaacgaattcaatatgaatttttgaaaac-------------gataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcgataattt 43441059  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43441060 tttgcggaggaacttttaataatgttcttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 43441155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 57 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2005267 - 2005023
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    ||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2005267 acaagattataacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaag 2005168  T
Q  157 ataaaattaa-caaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgt 254  Q
    ||| || |||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |        |  |||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2005167 atataagtaagaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttttt-cggaggacctttaaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgt 2005069  T
Q  255 tcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    | ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  2005068 tgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 2005023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 37446695 - 37446436
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||        | ||||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  37446695 aagtttgtttaattatccttgaactcttaaattgttgaaagattttttaaa-acaagtttagaaccatataaatggttcacttactaaaatttagaattt 37446597  T
Q  105 ttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |     ||| || | | |||||||||||||||| | |       
T  37446596 ttttaatgtgaaacgaattaaatataaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaagt-----aatctgtatgcagaaatcaaattttgcaataaaa 37446502  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagag 269  Q
        ||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37446501 ctttgcgaaggaacttttagtaacgttcttaacatgtctgtaaaaaattgttcaaaaacttaagag 37446436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 57 - 300
Target Start/End: Original strand, 18261230 - 18261471
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    ||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || || |   |||||| |||||||||||||| |||    
T  18261230 acaagtttataacactatgaaaggtccatttactaaaatttagaattttttaacatgaaatgaacta-attt---tttttttaaacgacaaaagttcaag 18261325  T
Q  157 ataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnn--gcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 253  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |         ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  18261326 ataaaactaacaaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgataattttttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtttgtaaaagaatg 18261425  T
Q  254 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||  |||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18261426 tttgaaaacttaagaatttaagcat-aattaaacaaatttgaattga 18261471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 4461962 - 4462245
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatg-ttcatttactaaaatttagaatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||  ||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  4461962 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttt-gagacaagtttaatacactataaaaaggttcatttactaaaatttagaact 4462060  T
Q  104 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||              |||  |||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| |       
T  4462061 ttctaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgac--------------aaagcaacaaaatctggatgtagaaatctaattttacgataagt 4462146  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacg--tctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||  ||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  4462147 ttttgcggaggaacttttagtaatgttctaaacacgtatatgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacacatttgaattga 4462245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 26865706 - 26865975
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||        |||||||||||||||| ||||||| || || ||| ||||||||| | |||    
T  26865706 aagtttgtttaattatccttaagctcttaaatttttgaatgaatttttttagacaagtttagaacactatgaaaggtccaattaataaaatttaaatttt 26865805  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||             || ||||| ||||| || ||||||||||||||| |         
T  26865806 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagt-------------aataaaatatggacatataaatcaaattttgcggc----- 26865887  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26865888 --------ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 26865975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Original strand, 2262845 - 2263081
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||| ||     
T  2262845 acaagtttagaacattataaaaacttcgtttactaaaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatataaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 2262944  T
Q  157 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 255  Q
    |||||| |||| ||||| || ||| | |||| |||||||| || |       ||| | |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  2262945 ataaaagtaacaaaaatctgtacgcataaataaaattttgagataattttttgcagatgaactttttgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgtt 2263044  T
Q  256 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    |||||  | || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  2263045 caaaattttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 2263081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21837231 - 21837098
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||       || |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  21837231 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaatgattttttcgatacaagtttagaacactataaaaggttcatttactaaaatttagaattttct 21837132  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaa 141  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21837131 aacatgaaacgaattaaatatgaatttcttaaaa 21837098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 9687715 - 9687798
Alignment:
Q  217 cttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9687715 cttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 9687798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10674936 - 10674648
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||| | |||||||||||||||| || ||| ||| |||||       |||||||||||||||||  |  ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10674936 aagtttctctaattatccttaaacttttaaatctttaaacgatttttttgagacaagtttagaacaccacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattt 10674837  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
     |||| || ||| |||||| |||||||| |||| |||  || |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||  |||||||| ||         
T  10674836 attaacataaaatgaattaaatatgaatatttttaaaataccaaagttcaagataaaagtaacaaaaatatggacgtagaaacaaaattttgagatgatt 10674737  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
        | ||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| || || || |||| ||| ||||| ||||||||    
T  10674736 ttttgtatatgaacttttagtaatgtttttaacacttttgtaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattatacaaattt 10674648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 291
Target Start/End: Original strand, 22166923 - 22167161
Alignment:
Q  54 gagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaa-ttttttaaaacgacaaaagtt 152  Q
    ||||||| ||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||  ||||||| |||||| ||| || |||| ||    
T  22166923 gagacaaatttagaacactacgaaaggttcatttagtaaaatttagaattttttaacaagaaatgagtttaatatgaattttttttaaatgaaaaaattt 22167022  T
Q  153 aaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaat 251  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  | |        |  | |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  22167023 caagataaaattaacaaaaatatggacatagaaatcaaattttgaaataattttttacggatgaacttttagtaatgttcttaatacgtctacaaaaaat 22167122  T
Q  252 tgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaat 291  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22167123 tgttcaaaagcataagagtttaaacat-aattaaacaaat 22167161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 195
Target Start/End: Original strand, 30733927 - 30734113
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    ||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||| |       |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30733927 tttgtttaattactcttgaattcttaaatttttgaacaattttttggagacatgtttagaacattataaaatgttcatttactaaaaaatagaatttttt 30734026  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    || |||| | |||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||| || | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30734027 aacatgacaagaattaaatatgaattttt--aaacgtcaaaagttcaagaaaagagtaacaaaaatctggacgtagaaatcaaattttg 30734113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Original strand, 43210678 - 43210914
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||  ||  |||||||||| ||     
T  43210678 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttaaaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttctaagagacaaaagttcaaa 43210777  T
Q  157 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 255  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || |       ||||| ||||||||  ||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  43210778 ataaaagtaacaaaaatctggacgaagaaataaaattttgagataattttttgcataagaacttttcttaatgttcttaacacttgtacaaaaaattgtt 43210877  T
Q  256 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  43210878 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 43210914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 109
Target Start/End: Original strand, 22023097 - 22023201
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22023097 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttaaaacaccatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 22023196  T
Q  105 tttaa 109  Q
    |||||    
T  22023197 tttaa 22023201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 40272665 - 40272459
Alignment:
Q  92 aaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||| || |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||    
T  40272665 aaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagtttaaaataaaagtaacaaaattctggacgcagaaataaaa 40272566  T
Q  191 ttttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaa 290  Q
    ||||| || |       | | | |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || || || |||| ||| |||||||||||    
T  40272565 ttttgagataattttttgtagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaa 40272467  T
Q  291 tttgaatt 298  Q
    ||| ||||    
T  40272466 tttaaatt 40272459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Original strand, 3548350 - 3548514
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||        |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  3548350 tttgtttaattatccttaaacacttaaacatttgaacgatttattttagacaaatttagaacattatgaaaggttcatttactaaaattta-aattattt 3548448  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaattt 174  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  3548449 aatgtgaaatgaattaaatatgaatttttt-aaatgccaaaagttcaagataaaagtaaccaaattt 3548514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 9924486 - 9924401
Alignment:
Q  55 agacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaa 140  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  9924486 agacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaaaatgaaacaaattaaatatgaaatttttaaa 9924401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 166 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 9924393 - 9924280
Alignment:
Q  166 acaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactca 265  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||       ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9924393 acaaaatctagacgtagaattcaaattttgtgacaatattttgcagaggaactttaagtaatgttcttaacaagtctgtaaaaaattgttcaaaaactca 9924294  T
Q  266 agagcttaaacata 279  Q
    |||| |||||||||    
T  9924293 agagtttaaacata 9924280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 149
Target Start/End: Original strand, 14049755 - 14049899
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||        | ||| |||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  14049755 aagtttgtttaatcatccttaaactcttaaatttttgaacgattttcttaatacacgtttagaacattacgaaaagttcatttactaatatttaaaattt 14049854  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaa 149  Q
    ||||| || ||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  14049855 tttaacatcaaatgaattaaatataaatttttttaaacgacaaaa 14049899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 195
Target Start/End: Original strand, 30698685 - 30698872
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||       |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  30698685 tttgtttaattattcttgaattcttaaatttttgaacgattttttggagacatgtttagaacattataaaatgttcatttactaaaaaatataatttttt 30698784  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaatta-acaaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    || | || | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||| || | ||   ||||| || |||||||||||||||||||    
T  30698785 aacaggagaagaattaaatatgaatttttt-aaacgacaaaaattcaagaaaagagtagtaaaaatctgaacgtagaaatcaaattttg 30698872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Original strand, 16965878 - 16966021
Alignment:
Q  157 ataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttc 256  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |       ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||     
T  16965878 ataaaagtaataaaatctggacataaaaatcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaatattgtta 16965977  T
Q  257 aaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16965978 aaaaacgtaagactttaaacataaattaaacaaatttaaattga 16966021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19332704 - 19332468
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  19332704 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaagttagaattatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 19332605  T
Q  157 ataaaa-ttaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 255  Q
    |||||| | || ||||| |||||| |||||| |||||||| || |         | | |||||||| |||||||||||||||| | |  |||||||| ||    
T  19332604 ataaaagtaaaaaaaatctggacgcagaaataaaattttgagataattttttcgagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtacaaaaaattatt 19332505  T
Q  256 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  19332504 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 19332468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 171
Target Start/End: Original strand, 9168631 - 9168717
Alignment:
Q  85 tttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||| ||| |||||||||| || |||||| ||||||||    
T  9168631 tttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatttgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaa 9168717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 95
Target Start/End: Original strand, 18950869 - 18950959
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaat 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||        |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  18950869 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttctgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaat 18950959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24334117 - 24334012
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||| || |||| ||    
T  24334117 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatatgaattttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttagacctaaaaataaa 24334018  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  24334017 attttg 24334012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 300
Target Start/End: Original strand, 6365421 - 6365508
Alignment:
Q  212 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||  |||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6365421 aggaacttttactaatgttcttaacgcatctgcgaaaaat-gttcaaaaacttaatagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 6365508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 36876099 - 36875874
Alignment:
Q  55 agacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaa 154  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||| |||| |||| | |||| ||||    
T  36876099 agacaagtttggaacattattaaaggtttatttactaaaattcagaattttttaacatgaaataaattaaatat-aatctttttaaacaaaaaaatttaa 36876001  T
Q  155 agataaaattaacaaa-atttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctg-taaaaaatt 252  Q
     | ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||         |    ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  36876000 -gttaaaagtaacaaatatttggatgta-aaatcaaattttgagatgattttttgtggtggaacttttagtagtgttcttaacacatctgcaaaaaaatt 36875903  T
Q  253 gttcaaaaactcaagagcttaaacataaa 281  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  36875902 gttcaaaaacttaagagtttaaccataaa 36875874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6450243 - 6450138
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  6450243 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 6450144  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  6450143 attttg 6450138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14711685 - 14711580
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  14711685 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaatttaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 14711586  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  14711585 attttg 14711580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 19928521 - 19928626
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||    
T  19928521 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgcaaaaaattcaagataaaattaacgaaaatttggacctaaaaataaa 19928620  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  19928621 attttg 19928626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26865301 - 26865232
Alignment:
Q  231 cttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26865301 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 26865232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 167
Target Start/End: Original strand, 5597738 - 5597814
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac 167  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5597738 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaagttcaagataaaattaac 5597814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22982089 - 22981985
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaa 190  Q
    |||| |||||||||||||| | | || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||||| || |||| |||    
T  22982089 aaaaattagaattttttaacacgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaatttaagataaaactaacgaaatttggacttaaaaataaaa 22981990  T
Q  191 ttttg 195  Q
    |||||    
T  22981989 ttttg 22981985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27280445 - 27280258
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   |        |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  27280445 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaa---attttttttagacaagtttagaacattattaaaggttcatttactaaaattcggaatttttt 27280349  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaa-----ttttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaaca-aaatttggacgtagaaatcaaattt 193  Q
     | |||||| |||||| ||||  |     ||||||||||| | |||| || ||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27280348 gacatgaaatgaattaaatatatatttttttttttaaaac-aaaaaatttcaagttaaaagtaacagaaatttggatgtagaaatcaaattt 27280258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 195
Target Start/End: Original strand, 27432463 - 27432563
Alignment:
Q  96 ttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaatttt 194  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |||||||    
T  27432463 ttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 27432562  T
Q  195 g 195  Q
    |    
T  27432563 g 27432563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 195
Target Start/End: Original strand, 28616025 - 28616218
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaat-atgaaatgttcatttactaaaatttagaatt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||         || ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||| | || ||| ||    
T  28616025 aagtttgttttattatccttaaactcttaaatctttgaacggatttttttaggcaaatttagaacatttatgaaaggttcatttactagagttaagattt 28616124  T
Q  104 ttttaatatgaaacgaattagatatgaa-ttttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    |||||| ||||||  ||||| ||||||| |||||| ||| ||||||| || || |||||| || | |||||  | |||||||||||||||||||    
T  28616125 ttttaaaatgaaataaattaaatatgaattttttttaaatgacaaaacttcaacataaaagtagcaaaaatcagaacgtagaaatcaaattttg 28616218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 43210097 - 43209932
Alignment:
Q  95 tttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaatttt 194  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||  | | ||| | |  ||||| |||||| |||||| |||||||    
T  43210097 tttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgattttttttaaaagacaaaagttcgaaaaaaagtaagaaaaatctggacgaagaaataaaatttt 43209998  T
Q  195 gcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaa 260  Q
    | || |       ||||| |||||||| ||||||||||||| || | || ||||||||||||||||    
T  43209997 gagataattttttgcataagaacttttggtaatgttcttaatacttgtgcaaaaaattgttcaaaa 43209932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 7234513 - 7234618
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  7234513 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgcaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 7234612  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  7234613 attttg 7234618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 7572982 - 7573087
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||  ||    
T  7572982 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaacaaa 7573081  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  7573082 attttg 7573087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8217575 - 8217510
Alignment:
Q  235 acacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||  || |||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8217575 acacgtctacaagaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 8217510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 8315563 - 8315668
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||| |||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  8315563 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttaaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 8315662  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  8315663 attttg 8315668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18404471 - 18404367
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||| || |||| ||    
T  18404471 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatat-aattttttaaaatgccaaaaattaaagataaaactaacaaaaatttagacctaaaaataaa 18404373  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  18404372 attttg 18404367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27189172 - 27189067
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||| ||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  27189172 aaaaattagaactttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaatttcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 27189073  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  27189072 attttg 27189067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28456626 - 28456585
Alignment:
Q  259 aaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28456626 aaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 28456585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 34819019 - 34818914
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||| | |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  34819019 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaatcaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 34818920  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  34818919 attttg 34818914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41906964 - 41906859
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||| || || |||| ||    
T  41906964 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttgtacctaaaaataaa 41906865  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  41906864 attttg 41906859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 42992593 - 42992488
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa-caaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||  ||||||||||| || |||| ||    
T  42992593 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaatttaagataaaactaatgaaaatttggacctaaaaataaa 42992494  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  42992493 attttg 42992488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 195
Target Start/End: Original strand, 4291691 - 4291790
Alignment:
Q  96 ttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaatttt 194  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |||||||    
T  4291691 ttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacg-caaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 4291789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 42852822 - 42852775
Alignment:
Q  214 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaa 261  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  42852822 gaacttttagtaacgttcttaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaa 42852775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Original strand, 6365297 - 6365408
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | || ||        |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||  || |||||    
T  6365297 aagtttgtataattatccttaaactcttgaatttgttaaagatttatttaagacaagtttagaaaactatgaaatgttcatttactagaacctataattt 6365396  T
Q  105 tttaatatgaaa 116  Q
    | ||| ||||||    
T  6365397 tataacatgaaa 6365408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4034773 - 4034668
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||| || |||| ||    
T  4034773 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttagacctaaaaataaa 4034674  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  4034673 attttg 4034668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4123300 - 4123195
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||  ||||| |||| | |||||||||| | ||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||    
T  4123300 aaaaattagaattttttaacatgtaatcaattaaatataatttttttaaaatgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttagacctagaaataaa 4123201  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  4123200 attttg 4123195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20453135 - 20453030
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |||||| |||| | ||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||| ||||||| || |||| ||    
T  20453135 aaaaattagaattttttaatatataatgaattaaatataattttattaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaattttggacctaaaaataaa 20453036  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  20453035 attttg 20453030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 24090058 - 24090163
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||  || |||| ||    
T  24090058 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaataaa 24090157  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  24090158 attttg 24090163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 2567415 - 2567519
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaa 190  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||  ||||| || ||||||||| |||| ||||||  || || |||| |||    
T  2567415 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaatttaagataaaactaacgaaatttaaacttaaaaataaaa 2567514  T
Q  191 ttttg 195  Q
    |||||    
T  2567515 ttttg 2567519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 293
Target Start/End: Original strand, 32537608 - 32537687
Alignment:
Q  214 gaacttttagtaatgttc-ttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  32537608 gaacttttagtaatgttctttaacacttttgcaaaacattgttcaaaatctcaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 32537687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33010511 - 33010407
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaa 190  Q
    |||| |||||||||||| | | | || || ||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||| |||||| |||| |||    
T  33010511 aaaaattagaattttttgacacgtaatgagttaaatataatttttttaaaacgccaaaaatttaagataaaactaacgaaatttagacgtaaaaataaaa 33010412  T
Q  191 ttttg 195  Q
    |||||    
T  33010411 ttttg 33010407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 37812757 - 37812678
Alignment:
Q  213 ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  37812757 ggaaattttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 37812678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 300
Target Start/End: Original strand, 38693676 - 38693731
Alignment:
Q  245 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  38693676 aaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagtataaattaaacaaatatgaattga 38693731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 14049943 - 14049997
Alignment:
Q  215 aacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagag 269  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||||| |||||    
T  14049943 aacttttagtaatgttcttaacatgtgttccaaaaattgttcaaaaacttaagag 14049997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 18740683 - 18740788
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa-caaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||| ||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||| ||||| |||  ||||||||||| || |||| ||    
T  18740683 aaaaattagaagtttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagttaaaactaatgaaaatttggacctaaaaataaa 18740782  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  18740783 attttg 18740788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 175
Target Start/End: Original strand, 19000586 - 19000671
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttg 175  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||  ||||| || ||||||||| |||| ||||||||    
T  19000586 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttg 19000671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22671083 - 22670979
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||  |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  22671083 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatat-aatttttttaaacgccaaaaattcaaaataaacctaacgaaaatttggacttaaaaataaa 22670985  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  22670984 attttg 22670979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 34876181 - 34876101
Alignment:
Q  61 gtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaat-ttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaa 140  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  34876181 gtttagaacattataaaatgttcttttacaaaaaaattagaattttttattacgaaataaattaaatatgaaatttttaaa 34876101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37446373 - 37446329
Alignment:
Q  256 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  37446373 caaaaacttaagagttaaaacataaattaaacatatttgaattga 37446329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 101)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 303
Target Start/End: Original strand, 38706441 - 38706739
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38706441 aagtttgtttaattattcttaaacacttcaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacaatatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 38706540  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  38706541 tttaacatgaaacaaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 38706640  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattgatga 303  Q
       ||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38706641 tttgcacaagcacttttagtaacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgatga 38706739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 303
Target Start/End: Original strand, 36470823 - 36471121
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36470823 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgatttttttaagataagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 36470922  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  36470923 tttaacatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacagcgaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 36471022  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattgatga 303  Q
        ||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36471023 tttacataggaacttttggtaacgttcttaatacatctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgatga 36471121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 25101960 - 25102255
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |       |||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25101960 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaacttttgaacaatttttttgagacaagtttaaaacactatgaaaggttcacttactaaaatttagaattt 25102059  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||        
T  25102060 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttcaaaacggcaaaagttaaaaataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgtgacaattt 25102159  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25102160 tttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcgagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 25102255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 5250388 - 5250684
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||| || |||||  |  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5250388 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaaattcagaacgctgcgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 5250487  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaa-gttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||       
T  5250488 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctaaacgtagaaatcaaattttgcgacaatt 5250587  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5250588 tttggcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtcagtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 5250684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 44265741 - 44265446
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||       ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  44265741 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgattttttcgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttgctaaaatttagaattt 44265642  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||        
T  44265641 tttaacatgaaaagaattaaatatgagttttttaaaacgccaaaaattaaagataaaatcaacaaaatctggacttagaaatcaaattttgcaacaattt 44265542  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44265541 tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttaaattga 44265446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 300
Target Start/End: Original strand, 17498541 - 17498787
Alignment:
Q  54 gagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 153  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17498541 gagacaagtttagaacactataaaagattcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 17498640  T
Q  154 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 253  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||| ||||| | | ||||| |||||||||    
T  17498641 aagataaaattaacaaaatttgaacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgcagaggaacttttagtaattttctttatatgtctgcaaaaaattg 17498740  T
Q  254 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17498741 ttcaaaaactcaaaagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 17498787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21135616 - 21135321
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21135616 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaaatttagaacattatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 21135517  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |        
T  21135516 tttaaaatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattt 21135417  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21135416 tttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 21135321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 5695911 - 5696205
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||       |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5695911 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgattttttcgagacaagtttaaaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 5696010  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||        
T  5696011 tttaatatgagatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgaac-taaaaatcaaattttgtgacaattt 5696109  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5696110 tttgcagaggaactttcaataatgatcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactgaagagtttaatcataaattaaacaaatttgaattga 5696205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Original strand, 27875445 - 27875745
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||        |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27875445 aagtttgtttaattatttataaactcttaaatttttggacgattttttttagacaagtttagaacactattaaaggttcatttactaaaatttagaattt 27875544  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| || ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||        
T  27875545 tttaacattaaatgaattaaatatgaattttttaacacgacaaaagttaaagataaaataaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttacgacaattt 27875644  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattgatgat 304  Q
       ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||    
T  27875645 tttgcagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtttgtaaaaaattgttcaaaagctcaagagtttaagcataaaataaacaaatttgaattgaggat 27875744  T
Q  305 g 305  Q
    |    
T  27875745 g 27875745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Original strand, 28015626 - 28015926
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||        |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28015626 aagtttgtttaattatttataaactcttaaatttttggacgattttttttagacaagtttagaacactattaaaggttcatttactaaaatttagaattt 28015725  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| || ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||        
T  28015726 tttaacattaaatgaattaaatatgaattttttaacacgacaaaagttaaagataaaataaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttacgacaattt 28015825  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattgatgat 304  Q
       ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||    
T  28015826 tttgcagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtttgtaaaaaattgttcaaaagctcaagagtttaagcataaaataaacaaatttgaattgaggat 28015925  T
Q  305 g 305  Q
    |    
T  28015926 g 28015926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 33322826 - 33322531
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||        | |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  33322826 aagtttgtttaattatctttaaactcttaaaattttgaacgattttttcaatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttaccaaaatttagatttt 33322727  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||        
T  33322726 tttaacatgaaacgaattaaatataaattttttaaaacgaaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctagacgtaaaaatcaaattttgcgacaattt 33322627  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33322626 tttgcagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaaattgtttgaaaactcatgagtttaagtataaattaaacaaatttgaattga 33322531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6590559 - 6590263
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  6590559 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaaccatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagatttt 6590460  T
Q  105 ttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    ||| || ||||||  ||||| |||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||       
T  6590459 ttttaacatgaaaaaaattaaatatgatttttttaaaacgagaaaaataaaatataaaattaacaaaatctgagcctagaaatcaaattttgcgacaatt 6590360  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6590359 ttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctccaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 6590263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6018332 - 6018037
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  6018332 aagtttgtttaattattcttaaacttttaaatttttgaacaatttttatgagacaagtttagaacattatgaaaggttcatttactaaaatttataattt 6018233  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||        
T  6018232 tttaacatgaaacaaattaaatatgaatttattaaaacaacaaaagataaagataaaactaacaaaatctgaacgtaaaaattaaattttgcgacaattt 6018133  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6018132 tttgcagaggaacttttagtaatgtttttaacatgtctgcaaaaaactgttcaaaaactcaagagtttatgcataaattaaacaaatttgaattga 6018037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24451777 - 24451482
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24451777 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaaattttgaatgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 24451678  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |        
T  24451677 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattt 24451578  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24451577 tttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacacaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 24451482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 41590337 - 41590631
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |         |||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  41590337 aagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaatttttttatgacaagtttataacactatgaaaggttcatt-actaaaatttagaattt 41590435  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||        
T  41590436 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattctggaagtagaaatcaaattttgcgacaattt 41590535  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41590536 tttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtatgcgaaaaattgttcaaaagctcaagagtttaagcacaaattaaacaaatttgaattga 41590631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 42499379 - 42499673
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42499379 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacgatttttt-gagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 42499477  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||| |||| |||||||||||||        
T  42499478 tttaacataaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgacaaaagttaaagatacaattaaaacaatatggacgtaaaaattaaattttgcgacaattt 42499577  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || || |||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  42499578 tttgcatataagcttttagtaatgttcttaatacgtctgcaaaaaattgttcaaaaacttaatagtttatgcataaattaaacaaaattgaattga 42499673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 43622789 - 43623087
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttact-aaaatttagaatt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||         |||||||||| |||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  43622789 aagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttaaacgatttttttatgacaagtttataacactatgaaaggtgcatttacttaaaatttagaatt 43622888  T
Q  104 tttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaatt-aacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacan 201  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  43622889 tttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaaattaaacaaattatggacgtagaaatcaaattttgcgacaa 43622988  T
Q  202 nnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
          | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43622989 ttttttgaagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 43623087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35369483 - 35369188
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||       |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  35369483 aagtttgtttaattatccttaaagtcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactatgaaaggttcaattgctaaaatttagaattt 35369384  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| | |        
T  35369383 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatttggacatataaatcaaattttgcaataattt 35369284  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||  || |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  35369283 tttgcggagtaacttttagtaatgttgttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagttgaagcataaattaaacaaatttgaattga 35369188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37967830 - 37967533
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnnga-gacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatt 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||        | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||  |    
T  37967830 aagtttgtttaatcatccttaaactcttaaagttttgaacgattttttttaagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttaccaaaatttagatat 37967731  T
Q  104 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaa-cgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacann 202  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  37967730 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggaaaaaagttaaagataaaattaacaaaatatggacgtagaaatcaaattttgcgacaat 37967631  T
Q  203 nnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
         ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  37967630 tttttgcggaggaagttttagtaatgttctttacacgtctgcgaaaaattgtttaaaagctcaagagtttatgcataaattaaacaaatttgaattga 37967533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8784871 - 8784576
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| |       || | |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8784871 aagtttgtttaattatccgtaaactctcaaattttcgaacaatttttttgacataagtttagaacactataaaaggttcatttactaaaatttaaaattt 8784772  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||        
T  8784771 tttaacataaaaagaattaaatatgaattttttaaaacggctgaagttaaagataaaattaataaaatctgaacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 8784672  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8784671 tttgcagagaaacttttagtaatgttcttaacacgtcagcaaaaacttgtttaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 8784576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35863334 - 35863039
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  35863334 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaacttttgaacaatatttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttaaaattt 35863235  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||        
T  35863234 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaactataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcaacaattt 35863135  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||  || | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  35863134 tttgcggagaatcttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaataaatttgaattga 35863039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 18839916 - 18840211
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||         || | |||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  18839916 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttcgaacgattttttttggatatgtttagaacactatgaaaggttcatctactaaaacttagaattt 18840015  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |        
T  18840016 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaagagttaaagataaaagtaataaaatctggacatagaaatcaaattttgcgataattt 18840115  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||| |||||||| |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||  |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18840116 tttgcagaggaacttctagtaatgttcttaacacatgtacaaaaaattgttcaaaaacttgagagtttaagtataaattaaacaaatttgaattga 18840211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 55 - 282
Target Start/End: Original strand, 17062413 - 17062639
Alignment:
Q  55 agacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaa 154  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17062413 agacaagtttaaaacactatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaacatcaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgagaaaagttaa 17062512  T
Q  155 agataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgt 254  Q
    |||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||       ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17062513 agacgaaattaacaaaatctggacatagaaatcaaattttgcgaca-atttttgcagaagaacttttaataatgttcttaacacgtctatacaaaattgt 17062611  T
Q  255 tcaaaaactcaagagcttaaacataaat 282  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||    
T  17062612 tcaaaaactcaaaagtttaagcataaat 17062639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 55 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17585945 - 17585719
Alignment:
Q  55 agacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaa 154  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17585945 agacaagtttaaaacactatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaacatcaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgagaaaagttaa 17585846  T
Q  155 agataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgt 254  Q
    |||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||       ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17585845 agacgaaattaacaaaatctggacatagaaatcaaattttgcgaca-atttttgcagaagaacttttaataatgttcttaacacgtctatacaaaattgt 17585747  T
Q  255 tcaaaaactcaagagcttaaacataaat 282  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||    
T  17585746 tcaaaaactcaaaagtttaagcataaat 17585719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 41281300 - 41281593
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||        |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  41281300 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaagtttagaattt 41281399  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||| ||||  || |||||||||||||||| |        
T  41281400 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaatgaaatctggatatataaatcaaattttgcgataattt 41281499  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41281500 tttgctgaggaacttttagtaatgttcttaagacgtct-acaaaaattgtt-aaaaaattaagagtttaaacataaattaaacaaatttaaattga 41281593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17842756 - 17842463
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||       | |||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17842756 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttccaaacgattttttgg-gacatgtttagaacactataaaaagttcatttactaaaatttagaattt 17842658  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |        
T  17842657 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacgtagaaatcaaaatttgcgata-ttt 17842559  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||  | | |||| |||||||||| |||||| || |  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17842558 tttgctgatgtacttctagtaatgtttttaacatgtatacaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagtataaattaaacaaatttgaattga 17842463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 120 - 300
Target Start/End: Original strand, 6413383 - 6413563
Alignment:
Q  120 attagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaactt 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||       | | ||||||||    
T  6413383 attaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggatgtaggaatcaaattttgcgacaattttttgaagaggaactt 6413482  T
Q  220 ttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6413483 ttagtgatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 6413563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 36063434 - 36063718
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  36063434 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacattatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 36063533  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||             ||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |        
T  36063534 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaac-------------gataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattt 36063620  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtct--gtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36063621 tttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaaaattgttaaaaaacttaagaatttaaacataaattaaacaaatttgaattga 36063718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 303
Target Start/End: Original strand, 21159845 - 21160077
Alignment:
Q  72 tatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttt-ttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaa 170  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21159845 tatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttttaatatgaaacggattaaatataaattttttaaaatggcaaaagttaaagataaagttaacaaa 21159944  T
Q  171 atttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagc 270  Q
    || | || |||||||||||||| |||||||       ||  | ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||     
T  21159945 atctagatgtagaaatcaaattgtgcgacaactttttgcggatgaacttttagtgatgttcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaaaagt 21160044  T
Q  271 ttaaacataaattaaacaaatttgaattgatga 303  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21160045 ataagcataaattaaacaaatttgaattgatga 21160077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 293
Target Start/End: Original strand, 37706722 - 37707009
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        ||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  37706722 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttt-agacaagattagaacactatgaaaggttcaattattaaaatttagaattt 37706820  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | | ||||| || || || |||||||||||||||| |        
T  37706821 tctaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgataaaagttaaagataaaagtgataaaatctgaacatataaatcaaattttgcgataattt 37706920  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
       ||  ||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  37706921 tttgcggaggaacttttagtaatgttctcaatacgtctacaaaaaattgttaaaaaacataagagtttaagcataaattacacaaattt 37707009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 39337273 - 39336991
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| | |||    
T  39337273 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaatcttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttaaatttt 39337174  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |         
T  39337173 tttaacattaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaatagaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcggc----- 39337079  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  39337078 --------ggaacttttagtaatgttcttaacacgtcaacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 39336991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9252890 - 9252645
Alignment:
Q  54 gagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 153  Q
    ||||||| |||| || | ||||||| |||| || || |||||||| | |||||||| || |||| ||||| |||| ||||||  ||||||  ||||||||    
T  9252890 gagacaaatttaaaatactatgaaaggttcgttaacgaaaatttaaatttttttaacataaaacaaattaaatataaattttg-aaaacggtaaaagtta 9252792  T
Q  154 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 253  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||       ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9252791 aagataaaattaacaaaatctggaagtagaaatcaaattttgcggcaattttttgcaaaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattg 9252692  T
Q  254 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9252691 ttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 9252645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 30968957 - 30968670
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30968957 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacggttttttttagacaagtttagaacaatatgaaatgttcgtttactaaaatttagaattt 30968858  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagat-aaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| || | |||||||||| ||||||||| |       
T  30968857 tttaatatgtaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaatgataaaaagcaacaaaatctgaatgtagaaatcatattttgcgataatt 30968758  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaa-aattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaa 290  Q
        | | || |||||||||||||||| | ||||||| || |||| ||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||||||    
T  30968757 ttttgtagagaaacttttagtaatgttataaacacgtatgcaaaataattgtttaaaaacttaagagtttatgcataaattaaacaaa 30968670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23483637 - 23483448
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  23483637 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttattaaaatttagagttt 23483538  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaatttt 194  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  23483537 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaattgcaaaagttaaagatcaaattaaccaaatgtggacgtagaaatcaaatttt 23483448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 92 - 300
Target Start/End: Original strand, 30658524 - 30658731
Alignment:
Q  92 aaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaat 191  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30658524 aaatttagatttttttaacatgaaacaaattaattatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaat 30658623  T
Q  192 tttgcgaca-nnnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaa 290  Q
    ||||| |||        | | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  30658624 tttgcaacattttttttgaagaggaacttttagtaatgttcttaatacgtctgcaaaaaattgtttaaaaactcaagag-ttaagcat-aattaaacaaa 30658721  T
Q  291 tttgaattga 300  Q
    ||||||||||    
T  30658722 tttgaattga 30658731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Original strand, 5765717 - 5766012
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||        | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  5765717 tttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 5765816  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcgacannnnn 205  Q
    || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |         
T  5765817 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttt 5765916  T
Q  206 nngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgt--aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       |  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  5765917 tt-cgaaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaaaattgttgaaaaacttcagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 5766012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 18304664 - 18304896
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnng--agacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||          ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||| |    
T  18304664 aagtttgattaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttttaagacatgtttagaacactatgaaaggttcattttccaaaatttagatt 18304763  T
Q  103 tttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacann 202  Q
    ||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  18304764 tttgtaacttcaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaatttaaagataaaatcaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacaat 18304863  T
Q  203 nnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaa 235  Q
         ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18304864 tttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaa 18304896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 57 - 300
Target Start/End: Original strand, 28755225 - 28755469
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28755225 acaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaag 28755324  T
Q  157 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgt 254  Q
    ||| || |||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |        |  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28755325 atataagtaacaaaaatatgaacgtagaaatcaaatttttgcgatattttttt-cggaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgt 28755423  T
Q  255 tcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    | ||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  28755424 tgaaaaacttaagaatttaagcataaattaaacaaatttggattga 28755469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 90 - 300
Target Start/End: Original strand, 13323634 - 13323845
Alignment:
Q  90 taaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| || || || |||||||    
T  13323634 taaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaatgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctgaacatataaatcaa 13323733  T
Q  190 attttgcgacannnnnnngcataggaac-ttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaaca 288  Q
    ||||||||| |       |   |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  13323734 attttgcgataattttttgtggaggaactttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaaca 13323833  T
Q  289 aatttgaattga 300  Q
    ||||||||||||    
T  13323834 aatttgaattga 13323845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16473276 - 16472990
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaattta-gaatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||       ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    ||    
T  16473276 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaaatttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttatttttt 16473177  T
Q  104 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |       
T  16473176 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaa-aaaatctggacatataaatcaaattttgcgataatt 16473078  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||| ||||||||||| |||   |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||      | |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16473077 ttttgcagaggaacttttaataa---tcttaacacgtctacaaaaaatggttaaaaaac------gtttaagcataaattaaacaaatttgtattga 16472990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16477847 - 16477561
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaattta-gaatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||       ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    ||    
T  16477847 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaaatttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttatttttt 16477748  T
Q  104 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |       
T  16477747 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaa-aaaatctggacatataaatcaaattttgcgataatt 16477649  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||| ||||||||||| |||   |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||      | |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16477648 ttttgcagaggaacttttaataa---tcttaacacgtctacaaaaaatggttaaaaaac------gtttaagcataaattaaacaaatttgtattga 16477561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 208 - 300
Target Start/End: Original strand, 14121946 - 14122038
Alignment:
Q  208 gcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14121946 gcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 14122038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 174
Target Start/End: Original strand, 43936514 - 43936683
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||| ||||  |||||||  || |||||| ||||||||   |||    
T  43936514 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagttttgaacgctatgaaagatttatttaccaaaatttaattttt 43936613  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaattt 174  Q
    ||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43936614 tttaacatgaaacgaattaaaaataaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaattt 43936683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 260
Target Start/End: Original strand, 32514042 - 32514299
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||       ||||||||||||||||  ||  ||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  32514042 aagtttctctaattatccttaaactcttaaatttttaaacgattattttgagacaagtttagaacgttacaaaaggttcgtttactaaaatttagatttt 32514141  T
Q  105 ttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaattttgcgacann 202  Q
    ||| || |||||| |||||| |||| |||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||  || |      
T  32514142 ttttaacatgaaatgaattaaatataaatttttgtaaaggaaaaaagttaaagataaaagtaacaaaattctggacgtagatataaaattttcagataat 32514241  T
Q  203 nnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaa 260  Q
         ||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32514242 tttttgcagatgaactattagtaatgttcttaacacttctgtaaaaaattgtttaaaa 32514299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 198
Target Start/End: Original strand, 43988207 - 43988347
Alignment:
Q  59 aagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagat 158  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| || ||| || ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  43988207 aagtttagaacactatgaaaggtttatatactaaaatttagaattttttaacataaaatgagttaaatatgaattttttaaaacagcaaaagttaaagat 43988306  T
Q  159 aaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcga 198  Q
    |||| |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  43988307 aaaagtaacaaaaatctggatgtaaaaatcaaattttgcga 43988347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 36018406 - 36018109
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| |       ||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| |||    
T  36018406 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttcttaacaatttttttgagacaagttttgaacactataaaaggttcatttattaaaatctagatttt 36018307  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcga-can 201  Q
    ||||| ||||||  ||| | ||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||||| |||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||  |     
T  36018306 tttaacatgaaataaataaaatatgtatttttttaaaccaaaaaagtttaagataaaagtaacaaaaatatgaatgtagaaatcaaatttttgcgataat 36018207  T
Q  202 nnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
          ||  || |||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  36018206 gtttttgcggagaaacttttaatagcgttcttaacacgtct-aaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaatgaaacaaatttggattga 36018109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 171
Target Start/End: Original strand, 6244224 - 6244338
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  6244224 acaagtttagaacattacaaaatattcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 6244323  T
Q  157 ataaaattaacaaaa 171  Q
    |||||| ||||||||    
T  6244324 ataaaagtaacaaaa 6244338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 260
Target Start/End: Original strand, 42024251 - 42024504
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  42024251 aagtttctctaattatctttaaactcttaaatttttgaacgatttttt--agacaagtttagaacattaccaaaagtttgtttactaaaatttagaattt 42024348  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    | ||  |||||| |  ||| |||||||||||||  || |||||||||| ||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||||||| ||         
T  42024349 tataccatgaaatgggttaaatatgaatttttttgaaagacaaaagttcaagataaaagtaacaaaaatctcgacgtagaaataaaattttgaga-tttt 42024447  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaa 260  Q
        ||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  42024448 tcttgcagatgaaattttagtaatgttcttaacacttctgcaaaaaattgtttaaaa 42024504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 3865934 - 3865698
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  3865934 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaactttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 3865835  T
Q  157 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 255  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| || ||| |||||||| || |       | | |  ||||||| || |||||||||| || | || |||||||||||    
T  3865834 ataaaagtaacaaaaatctggacgcaggaataaaattttgagataattttttggagataaacttttcgtgatgttcttaatacttgtgcaaaaaattgtt 3865735  T
Q  256 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  3865734 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 3865698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 298
Target Start/End: Original strand, 32244484 - 32244690
Alignment:
Q  92 aaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |   |||||||||| || |||||| |||||||||| |||||| | |||| |||    
T  32244484 aaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatggatttttttagtagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacgcataaataaaa 32244583  T
Q  191 ttttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaa 290  Q
    ||||| || |       | | | |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || || || |||| ||| |||||||||||    
T  32244584 ttttgagataattttttgtagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaa 32244682  T
Q  291 tttgaatt 298  Q
    ||| ||||    
T  32244683 tttaaatt 32244690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 260
Target Start/End: Original strand, 3866478 - 3866647
Alignment:
Q  92 aaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||| || |||||| |||||||||| || ||  |||||| |||    
T  3866478 aaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctgaacacagaaataaaa 3866577  T
Q  191 ttttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaa 260  Q
    ||||| || |       ||||| |||||||| ||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  3866578 ttttgagataattttttgcatatgaacttttcgtaatattcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaa 3866647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6243715 - 6243575
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaa-tttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaa 155  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||||||| ||    
T  6243715 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaaatttagaattttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttttaaaagataaaagttcaa 6243616  T
Q  156 gataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
     |||||| |||| ||||| |||| | |||||| ||||||||    
T  6243615 aataaaagtaacaaaaatatggatgcagaaattaaattttg 6243575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Original strand, 44894464 - 44894698
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||  ||||| ||     
T  44894464 acaagtttagaacattacaaaatgttcgtttactaaaatttagaattatttagcttgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagac--aagtttaaa 44894561  T
Q  157 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 255  Q
    ||||   |||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || |       | | | |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  44894562 ataattgtaacaaaaatctggacgcagaaataaaattttgagataattttttggagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgtt 44894661  T
Q  256 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  44894662 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 44894698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 195
Target Start/End: Original strand, 34050586 - 34050685
Alignment:
Q  96 ttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  34050586 ttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaatttggacctaaaaataaaattttg 34050685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 195
Target Start/End: Original strand, 28701748 - 28701859
Alignment:
Q  85 tttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtaga 183  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| |||| ||| |||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  28701748 tttactaaaatttggaatttattaacatgaaatgaattaaatataaatatttttaaaagactaaagtttaagataaaagtaacaaaaatatggacgtaga 28701847  T
Q  184 aatcaaattttg 195  Q
    ||| ||| ||||    
T  28701848 aataaaaatttg 28701859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41255389 - 41255335
Alignment:
Q  246 aaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41255389 aaaaattgttcaaaaactcaagagattaaacactaattaaacaaatttgaattga 41255335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 7637046 - 7637151
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  7637046 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 7637145  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  7637146 attttg 7637151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 28174241 - 28174346
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  28174241 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacttaaaaattaa 28174340  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  28174341 attttg 28174346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 32243920 - 32243684
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  | ||| |||| | |||||| ||| |||||||||| ||     
T  32243920 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttataattttttaacatgaaataatttaaatataattttttttaaaagacaaaagttcaaa 32243821  T
Q  157 ataaaa-ttaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 255  Q
    |||||| | || ||||| | |||| || ||| |||||||| || |       ||| |  ||||||| || |||||||||| || | || |||||||||||    
T  32243820 ataaaagtaaaaaaaatctagacgcaggaataaaattttgagataattttttgcagataaacttttcgtgatgttcttaatacttgtgcaaaaaattgtt 32243721  T
Q  256 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  32243720 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 32243684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 300
Target Start/End: Original strand, 39337745 - 39337813
Alignment:
Q  232 ttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39337745 ttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 39337813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 10410142 - 10410010
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||| |||||||||||||        ||| ||||||| |||| ||  |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  10410142 aagtttctctaattatccttagagtcttaaatttttgaacgatttttttaagataagtttaaaacattacaaaagattcatttaccaaaatttagaattt 10410043  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaatttttt 137  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||| ||||||    
T  10410042 tttaacatgaaatgaattaaatatgattttttt 10410010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 2826965 - 2826919
Alignment:
Q  214 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaa 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2826965 gaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaa 2826919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11385673 - 11385567
Alignment:
Q  90 taaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatca 188  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||| || |||| |    
T  11385673 taaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaatttaagataaaactaacgaaaatttagacctaaaaataa 11385574  T
Q  189 aattttg 195  Q
    |||||||    
T  11385573 aattttg 11385567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41219765 - 41219667
Alignment:
Q  98 agaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    |||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  41219765 agaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaatttcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaattttg 41219667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2061079 - 2060974
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| || | ||||||||||| || |||| ||    
T  2061079 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactagcgaaaatttggacctaaaaataaa 2060980  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  2060979 attttg 2060974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4517149 - 4517044
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  4517149 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgctaaaaatttaagataaaactaacgaaaatttggacttaaaaataaa 4517050  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  4517049 attttg 4517044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18365359 - 18365254
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||  ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  18365359 aaaaattagaattttttatcatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 18365260  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  18365259 attttg 18365254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27923822 - 27923717
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| |  ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  27923822 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatatttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 27923723  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  27923722 attttg 27923717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 34058864 - 34058759
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| |||||  | ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  34058864 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaaattaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 34058765  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  34058764 attttg 34058759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 36765700 - 36765595
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||| || || |||| ||    
T  36765700 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaacttcaagataaaactaacgaaaatttgaacctaaaaataaa 36765601  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  36765600 attttg 36765595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 42219315 - 42219420
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  42219315 aaaaattaaaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacataaaaataaa 42219414  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  42219415 attttg 42219420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 44090484 - 44090589
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||| || || |||| ||    
T  44090484 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttgcacctaaaaataaa 44090583  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  44090584 attttg 44090589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10409864 - 10409789
Alignment:
Q  214 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  10409864 gaacttttagtaatgttcttaacacttccgcaagaaattgttcaaaatcttaaaagtttaaacat-aattaaacaaa 10409789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27000980 - 27000886
Alignment:
Q  95 tttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||| |||| |  ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  27000980 tttataattttttaacatgagataaattaaatatgaattttttaaa-cgagaaaagttcaatataaaagtcacgaaaatttggacgtagaaatcaa 27000886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 300
Target Start/End: Original strand, 35369929 - 35369984
Alignment:
Q  245 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||| || ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35369929 aaaaaattattaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 35369984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1663920 - 1663854
Alignment:
Q  130 aattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgc 196  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||    
T  1663920 aattttgttaaaagacaaaagttaaagataaaagtaacaaaatctggacatagaaataaatttttgc 1663854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 43
Target Start/End: Original strand, 30658453 - 30658491
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaa 43  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30658453 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaa 30658491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4137088 - 4136983
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||| |||||| || || || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  4137088 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttaaaaacgccataaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 4136989  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  4136988 attttg 4136983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7419934 - 7419829
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||| || || |||| ||    
T  7419934 aaaaattagaattttttaacatgtaataaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttgaacctaaaaataaa 7419835  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  7419834 attttg 7419829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13082971 - 13082866
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || | ||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  13082971 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgcaaaaaattcatgataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 13082872  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  13082871 attttg 13082866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 24541845 - 24541950
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||  ||    
T  24541845 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttgttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaacaaa 24541944  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  24541945 attttg 24541950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30378296 - 30378191
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||| ||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  30378296 aaaaattataattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaatacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 30378197  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  30378196 attttg 30378191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 35209551 - 35209656
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||   |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  35209551 aaaaattagaattttttaacaggtaatgaattaaatatattttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 35209650  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  35209651 attttg 35209656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 36052025 - 36051920
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa-ttaacaaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||| | |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || |||| ||    
T  36052025 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaatgaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaaagaaaatttggacttaaaaataaa 36051926  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  36051925 attttg 36051920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41724986 - 41724881
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||| || || |||| ||    
T  41724986 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttataaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttgaacctaaaaataaa 41724887  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  41724886 attttg 41724881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22849588 - 22849500
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggac 178  Q
    |||| ||||||| |||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  22849588 aaaaattagaatattttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaaaataaaattaacgaaaatttggac 22849500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 28695159 - 28695091
Alignment:
Q  76 aaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacga 144  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| | |||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  28695159 aaatgttcatttactaaaattttaaattgtttaagatgagatgaattaaataagaatttttttaaacga 28695091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 195
Target Start/End: Original strand, 16729111 - 16729210
Alignment:
Q  97 tagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||  |||||||||| || |||| ||||||||    
T  16729111 tagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacggaaatttggacctaaaaataaaattttg 16729210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 195
Target Start/End: Original strand, 42175204 - 42175303
Alignment:
Q  97 tagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa-caaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||  |||||||| || || |||| ||||||||    
T  42175204 tagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaatgaaaatttgaacctaaaaataaaattttg 42175303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8076422 - 8076328
Alignment:
Q  102 ttttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    |||||||| ||| || || ||| |||| | |||||||||| | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  8076422 ttttttaacatgtaatgagttaaatataatttttttaaaatgccaaaaattcaagataaaattaacgaaaatttggacctaaaaataaaattttg 8076328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 12469492 - 12469454
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaa 43  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12469492 aagtttgtttaattatccttaaactcctaaatttttgaa 12469454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12616586 - 12616480
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaatttttt-aaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatca 188  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| |||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |    
T  12616586 aaaaattaaaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaaacgtcaaaatttcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataa 12616487  T
Q  189 aattttg 195  Q
    |||||||    
T  12616486 aattttg 12616480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13699609 - 13699506
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| ||||||| |||||| ||| || |||||| |||| |  ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  13699609 aaaaattagaatattttaacatgtaatgaattaaatataa--tttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 13699512  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  13699511 attttg 13699506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27519775 - 27519670
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||  || |||| ||    
T  27519775 aaaaattagatttttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttcgatctaaaaataaa 27519676  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  27519675 attttg 27519670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 39106860 - 39106964
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || |||| | |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  39106860 aaaaattaaaattttttaacatgtaatgaataa-atataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 39106958  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  39106959 attttg 39106964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 195
Target Start/End: Original strand, 41315451 - 41315548
Alignment:
Q  99 gaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    ||||||||||| ||| || |||||| |||| || |||||||| || ||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  41315451 gaattttttaacatgtaatgaattaaatataaaatttttaaatcgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatatggacctaaaaataaaattttg 41315548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 43470660 - 43470555
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| ||||   | |||||||||| ||||| || | ||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  43470660 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatatagttattttaaaacgtcaaaaattcatgataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 43470561  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  43470560 attttg 43470555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2827029 - 2826981
Alignment:
Q  150 gttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcga 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |  |||||||||||||||||||    
T  2827029 gttaaagataaaagtaacaaaatctgaatatagaaatcaaattttgcga 2826981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 159
Target Start/End: Original strand, 17918802 - 17918870
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagata 159  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||    
T  17918802 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattgaagata 17918870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28695031 - 28694963
Alignment:
Q  212 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataa 280  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||   |  |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  28695031 aggaacttttagtaatgctcttaatacacgtacaaaaaattgttcaaaaactctagagtttaagcataa 28694963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 167
Target Start/End: Original strand, 36333227 - 36333275
Alignment:
Q  119 aattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac 167  Q
    ||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36333227 aattaaatataaatattttaaaatgataaaagttaaagataaaattaac 36333275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 102)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30719775 - 30719479
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30719775 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 30719676  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  30719675 tttaacatgaatcgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 30719576  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtc-tgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30719575 tttgcatagaaacttttagtaatgttcttaacacgtcttgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 30719479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 51561343 - 51561642
Alignment:
Q  1 attcaagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttaga 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51561343 attcaaatttgttaaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttaga 51561442  T
Q  101 attttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51561443 attttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaagttaaaaataaaataaacaaaatttgaacgtagaaatcaaattttgcgaca 51561542  T
Q  201 nnnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51561543 attttttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaagtaaacaaatttgaattga 51561642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13501503 - 13501206
Alignment:
Q  1 attcaagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttaga 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |       ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||    
T  13501503 attcaaatttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttttgagacaagtttagaacact--gaaaggttcatttactaaaatttaga 13501406  T
Q  101 attttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13501405 attttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaaaataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgaca 13501306  T
Q  201 nnnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
           ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13501305 attttttgcataggaacttttagtaatgttattaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 13501206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19791533 - 19791239
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||         | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19791533 aagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgatttttttatg-caagtttataacactatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 19791435  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||        
T  19791434 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttataacgacaaaagttaaagataaaattaacaaattttggaggtagaaatcaaattttgcgacaattt 19791335  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       | | | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19791334 tttgtagatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 19791239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 298
Target Start/End: Original strand, 26020399 - 26020692
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||       | |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26020399 aagtttgtttaattatcattaaactcttgaatttttgaacgatttttttgtgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 26020498  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||        
T  26020499 tttaacattaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaatttaaagataaaattaacaaaatctgaacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 26020598  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
       | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26020599 tatgtagaggagcttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagattttaagcataaattaaacaaatttgaatt 26020692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 33708945 - 33709240
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33708945 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 33709044  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||||| |        
T  33709045 tttaatatgaaaagaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatttagacatataaatcaaattttgcgataattt 33709144  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33709145 tttgcggaggaacttttaggaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaatcttaagagtttaagtataaattaaacaaatttgaattga 33709240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 35531081 - 35530781
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  35531081 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttta-agacaaatttagaacactatgaaatgttcatttaccaaaatttagatttt 35530983  T
Q  105 ttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    ||| || | ||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||       
T  35530982 ttttaacaagaaacgaattaaatataatttttttaaaatgataaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcaacattt 35530883  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattgatga 303  Q
        |||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35530882 ttttgcaggggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaagattgtttaaaagctcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgatga 35530783  T
Q  304 tg 305  Q
    ||    
T  35530782 tg 35530781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 55 - 279
Target Start/End: Original strand, 47008697 - 47008920
Alignment:
Q  55 agacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaa 154  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47008697 agacaagtttagaacactatgaaaggtttatttactaaaatttagaattttt-aacataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaa 47008795  T
Q  155 agataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgt 254  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47008796 agataaaattaacaaaatgtggacgtagaaattaaattttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgt 47008895  T
Q  255 tcaaaaactcaagagcttaaacata 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  47008896 tcaaaaactcaagagtttaaacata 47008920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 52493824 - 52493528
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnng-agacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52493824 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 52493725  T
Q  104 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |       
T  52493724 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaacttaaagataaaagtaataaaatctggaagtagaaatcaaattttgcgataatt 52493625  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  52493624 ttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaatcaaatttgaattga 52493528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 30982382 - 30982677
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30982382 aagtttgtttaaatatccttaaaatcttaaatttttgaacgattttttcgagacaagtttagaacaatatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 30982481  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||| || |        
T  30982482 tttaacatgaagcgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgtgataattt 30982581  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30982582 ttagcggaggaacttttagtaaagttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 30982677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 26805491 - 26805786
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |        |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  26805491 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaactatttttttaagacaagtttagaacactaagaaatgttcatttaccaaaatttatatttt 26805590  T
Q  105 ttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||         
T  26805591 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgaacgtaaaaatcaaattttgtgaatttt 26805690  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  26805691 ttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacacgtctacaaaaaattgtttaaaaattcaagagtttaagcat-aattaaacaaatttgaattga 26805786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 63 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28701192 - 28700954
Alignment:
Q  63 ttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa 162  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28701192 ttagaacactatgagaggttcatttactaaaatttagaactttttaacataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa 28701093  T
Q  163 ttaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctg-taaaaaattgttcaaaaa 261  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||       ||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  28701092 ttaacaaaatctggacgtggaaatcaaattttgctacaatttttcgcagaggaacttttagtaatattcttaacacatttgcaaaaaaattgttcaaaaa 28700993  T
Q  262 ctcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28700992 ctcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 28700954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 36367890 - 36368185
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  36367890 aagtttgtttaattatttttaaactcataaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggtttaattactaaaatttagaattt 36367989  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||| ||||||||||| |        
T  36367990 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaatttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaattaaattttgcgataattt 36368089  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||  || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36368090 tttgcggagaaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 36368185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12000013 - 11999722
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||       |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12000013 aagtttgtttaattatccttaaagtcttaaatttttgaacgattattttgagacatgtttagaacactatgaaatgttcaattactaaaatttagaattt 11999914  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||  ||||| ||||| || |||||||||||||  | |        
T  11999913 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgataaaaattaaagataaaagtactaaaatctggacatataaatcaaattttgaaatatttt 11999814  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaa 296  Q
       ||  | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  11999813 tttgcggatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattattaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaa 11999722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 43505059 - 43504775
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||          |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43505059 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaactgttttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttggaatttttt 43504960  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnn 207  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | |||           
T  43504959 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttagaacgacaaaagtt-------aaattaacaaaatctggacgtaaaaatcaaa-tttacaacaacttttt 43504868  T
Q  208 gcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    | | | |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43504867 gtagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttctgttaaaaattgttcaaaaactcaaaagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 43504775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Original strand, 10041240 - 10041532
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||        ||| ||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||| | |||    
T  10041240 aagtttgtttaattatctttaaactcttaaattttttaacgatttttttaagaaaagtttagaacaccatgaaaggttcatttaccaaaatttaaatttt 10041339  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| || | |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||        
T  10041340 tttaacattatacgaattaaatataaattttctaaaacggcaaaagttaaagataaaattaataaaatctgaacgtagaaattaaattttgcgacaattt 10041439  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaat 297  Q
       | | ||||||||||||||||||  |||||||  || |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10041440 ttcgaagaggaacttttagtaatgtgtttaacacacctataaaaaattgtttaaaaactcaagaatttaaacataaattaaacaaatttgaat 10041532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 192
Target Start/End: Original strand, 46517172 - 46517359
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||       | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  46517172 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaaattttgatcgatttttttgggacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagacttt 46517271  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaatt 192  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46517272 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaatt 46517359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 296
Target Start/End: Original strand, 12368243 - 12368521
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  12368243 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaattt 12368342  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| |||||||| |||| |||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| || || || ||||||||||||||| |         
T  12368343 tttaacatgaaacgtattaaatattaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatgaacatataaatcaaattttgcggc----- 12368437  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaa 296  Q
            |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  12368438 --------ggaacttttaataatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaa 12368521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31400512 - 31400219
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||        | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  31400512 tttgcttaattatccttaaactcttaaatattttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 31400413  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcgacannnnn 205  Q
    |  ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |         
T  31400412 atcatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttt 31400313  T
Q  206 nngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       |  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31400312 tt-cggaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 31400219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 46596776 - 46597070
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||         |||||||||||||||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||| |||    
T  46596776 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacggttttttttagacaagtttagaacactgtgaaaggttcaattattaaaatttagatttt 46596875  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||| ||||| ||  ||  ||||||||||| |        
T  46596876 tttaacataaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaa-taaatctggacatatcaactaaattttgcgataattt 46596974  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||  | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46596975 tttgcggatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 46597070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 36248619 - 36248333
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||       |||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
T  36248619 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgagacaagtttaaaacactatgaaaggttcaattaataaaatttaaaattt 36248520  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagata----aaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgaca 200  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    ||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  36248519 tttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaattaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcgac- 36248421  T
Q  201 nnnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
                ||||||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  36248420 ------------ggaacttttagtaatattcttaacatgtctacaagaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 36248333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15053873 - 15053640
Alignment:
Q  54 gagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||| | | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| | ||||||||    
T  15053873 gagacaagtttagaacactatgaaaggctcaatcaataaaatttagaatgttttaacatgaaacgaattaaatataaatttttgaaaacaataaaagtta 15053774  T
Q  154 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 253  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||| | |             ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15053773 aagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgtggc-------------ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattg 15053687  T
Q  254 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    || ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15053686 ttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 15053640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 298
Target Start/End: Original strand, 33707419 - 33707663
Alignment:
Q  54 gagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 153  Q
    |||||||||||| |||| ||  |||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||| |||||||     
T  33707419 gagacaagtttaaaacattacaaaagtttcatttactaaaatttaaatttttttaatatgaaatgtattaaatataaattttttcaaacgataaaagttc 33707518  T
Q  154 aagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaatt 252  Q
    |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |       ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  33707519 aagataaaagcaacaaaaatttgaacgtagaaatcaaattttgagataattttttgcgaaggaacttttagtaatgttctcaacacgtctgcaaaagatt 33707618  T
Q  253 gttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
    ||||||||| | ||||| ||||  || |||||||||||||| ||||    
T  33707619 gttcaaaaaattaagagtttaagaat-aattaaacaaatttaaatt 33707663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21091342 - 21091051
Alignment:
Q  7 gtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttt 106  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  21091342 gtttgtttgattatcctcaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactgtgaaaggttcatttattaaaatttataattttt 21091243  T
Q  107 taatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnn 206  Q
    |||   |||| |||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||| ||||| || || || ||||||||||||| || |          
T  21091242 taacgcgaaatgaattaaatatgaat-ttttaaaacatcaaaagttaaagattaaagtaataaaatctgaacatataaatcaaattttgagataatttat 21091144  T
Q  207 ngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
     |   | |||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21091143 tgtggatgaactttatgtaatgttcgtaacacgtctacaaaaaattgtt-taaaacttaagagtttaaacataaactaaacaaatttgaattga 21091051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 39682087 - 39681895
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |        ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682087 tttgtttaattatccttaaactcttaagtttatgaacaatttttttaagacaagtttaaaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 39681988  T
Q  108 -aatatgaaa-cgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcga 198  Q
     || |||||| || |||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  39681987 taacatgaaaacggattaaataggatttttttaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggatgtagaaatcaaattttgcga 39681895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 195
Target Start/End: Original strand, 7565228 - 7565370
Alignment:
Q  54 gagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 153  Q
    ||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||||||     
T  7565228 gagacaagtttagaacattacgaaaggtacatttactaaaatttagaattttttaacatgaaatgaatttaatatgaatttttttaaacgagaaaagttc 7565327  T
Q  154 aagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7565328 aagataaaattaacaaaaatatggacatagaaatcaaattttg 7565370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Original strand, 12251420 - 12251656
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    ||||||||| |||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||| ||     
T  12251420 acaagtttataacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaa 12251519  T
Q  157 ataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 255  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||| || |       ||| | |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  12251520 ataaaagtaacaaaattctggacgcagaaataaaattttgagataattttttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgtt 12251619  T
Q  256 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  12251620 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 12251656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 2059636 - 2059484
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||        ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2059636 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgattttttt-agataagtttagaacattataaaaggttcatttactaaaatttagaatttgtt 2059538  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa 162  Q
    || ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2059537 aacatgaaacaaattaaatatgaatattttaaaacga-aaaagttaaagataaaa 2059484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 37986744 - 37986869
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||     
T  37986744 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaattg 37986843  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatga 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37986844 tttaacatgaaacgaattaaatatga 37986869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 294
Target Start/End: Original strand, 31024109 - 31024345
Alignment:
Q  59 aagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaaga 157  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| | |||  ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  31024109 aagtttagaacactacgaaaggttcatttactaaaatctaggatttttttaacatgaaatgtatttaatatgaatttttttaaacgaaaaaagttcaaga 31024208  T
Q  158 taaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttc 256  Q
    |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||  || |        |  | ||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||    
T  31024209 taaaattaacaaaaatatgaacatagaaatcaaattttaagataatttgttacggatgaacttttagtaatggtcttaacacgtctacaagaaattgttc 31024308  T
Q  257 aaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttg 294  Q
    ||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  31024309 aaaaacataagagtttaaacat-aattgaacaaatttg 31024345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 212 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21794498 - 21794413
Alignment:
Q  212 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaat 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  21794498 aggaacttttattaatgttcttaacacgtgtgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaat 21794413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 52881831 - 52881692
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  52881831 acaagtttagaacattacaaaatattcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 52881732  T
Q  157 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  52881731 ataaaagtaacaaaaatctggacgtcgaaataaaattttg 52881692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 49767929 - 49767693
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||| ||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  49767929 acaagtctagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtttaaa 49767830  T
Q  157 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 255  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| |||||| || ||||| || |       ||| |  ||||||| || |||||||||| || | || |||||||||||    
T  49767829 ataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaatttttgagataattttttgcagataaacttttcgtgatgttcttaatacttgtgcaaaaaattgtt 49767730  T
Q  256 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  49767729 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 49767693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 193
Target Start/End: Original strand, 12897143 - 12897280
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||| ||     
T  12897143 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactgaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgattttttttaaaagacaaaagttcaaa 12897242  T
Q  157 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattt 193  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  12897243 ataaaagtaacaaaaatttggacgcagaaataaaattt 12897280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27551001 - 27550800
Alignment:
Q  92 aaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaa 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||| || |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||    
T  27551001 aaatttagaattttctaatatgaaataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacgcagaaataaaa 27550902  T
Q  191 ttttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaa 290  Q
    ||||| || |       ||| | |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || || || ||||  || |||||||||||    
T  27550901 ttttgagataattttttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagtat-aattaaacaaa 27550803  T
Q  291 ttt 293  Q
    |||    
T  27550802 ttt 27550800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 300
Target Start/End: Original strand, 37986902 - 37986989
Alignment:
Q  213 ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  37986902 ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaatttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 37986989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 195
Target Start/End: Original strand, 52882360 - 52882499
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| || ||     
T  52882360 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaattaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaatttcaaa 52882459  T
Q  157 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    |||||| |||| ||||| |||| | |||||| ||||||||    
T  52882460 ataaaagtaacaaaaatctggaggcagaaataaaattttg 52882499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 171
Target Start/End: Original strand, 27551561 - 27551675
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  27551561 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaatttttttacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 27551660  T
Q  157 ataaaattaacaaaa 171  Q
    |||||| ||||||||    
T  27551661 ataaaagtaacaaaa 27551675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2059151 - 2059078
Alignment:
Q  225 aatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2059151 aatgtgcttaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaatt 2059078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 21794629 - 21794511
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||       ||||||||||||||| | || |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21794629 aagtttgcttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgaattttttgagacaagtttagaatattaagaaaggttcattaactaaaatttagaattt 21794530  T
Q  105 tttaatatgaaacgaatta 123  Q
    ||||  || ||||||||||    
T  21794529 tttaccataaaacgaatta 21794511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 48410439 - 48410250
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||| || | ||  ||| ||||  | |||||||||||||||||    
T  48410439 aagtttctctaattatccttaaactcttaaatttttgaacagtctttttgagacaagtttaaaaaattacaaaaggttcggtcactaaaatttagaattt 48410340  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaatttt 194  Q
    ||||| |||||| | |||| |||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  48410339 tttaacatgaaatggattaaatat-aatttttttaaaagacaaaagttcaagataaaagtaacaaaaatctggacgtataaattaaatttt 48410250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11397275 - 11397039
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||| ||||||| ||  ||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||  ||     
T  11397275 acaagtgtagaacattacaaaaggttcgtttactaaattttagaattatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtgcaaa 11397176  T
Q  157 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 255  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || |       | | | |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  11397175 ataaaagtaacaaaaatatggacgcagaaataaaattttgagataattttttggagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgtt 11397076  T
Q  256 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    ||||| || ||  | |||| ||| ||||||||||||||    
T  11397075 caaaatcttaaatgtttaagcat-aattaaacaaattt 11397039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 238
Target Start/End: Original strand, 49768495 - 49768642
Alignment:
Q  92 aaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaa 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  49768495 aaatttagaattttttattatgaaataaattaaatatgaatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaataaaattctggacgtagaaataaaa 49768594  T
Q  191 ttttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacac 238  Q
    ||||| || |       ||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  49768595 ttttgagataattttttgcaaatgaacttttcgtaatgttcttaacac 49768642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 195
Target Start/End: Original strand, 5430567 - 5430754
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||         ||||||||||| |||| ||  |||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5430567 tttgtttaattatccttaaacttgtaaatttttgaacggtttttctaagacaagtttataacattacaaaagattcatttactgaaatttagaatttttt 5430666  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    || || ||| |||||| |||||| ||||||||| ||| |||| || | | |||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  5430667 aacataaaatgaattaaatatgatttttttaaa-cgataaaaattcatgttaaaagcaacaaaaaaatggacgtagaaatcaaattttg 5430754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 25352197 - 25352083
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    ||||||||| |||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  25352197 acaagtttaaaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttgaaa 25352098  T
Q  157 ataaaattaacaaaa 171  Q
    |||||| ||||||||    
T  25352097 ataaaagtaacaaaa 25352083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 4574069 - 4574173
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  4574069 aaaaattagaattttttaatatgtaatgaattaaatat-aattttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 4574167  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  4574168 attttg 4574173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12367772 - 12367703
Alignment:
Q  231 cttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12367772 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 12367703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 47632647 - 47632752
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||    
T  47632647 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaattaacgaaaatttggacctaaaaataaa 47632746  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  47632747 attttg 47632752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 42972256 - 42972161
Alignment:
Q  12 tttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||       ||||||  ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42972256 tttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatttttcggagacacttttagaagattataaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 42972161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4487035 - 4486934
Alignment:
Q  95 tttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattt 193  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||    
T  4487035 tttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaatttaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaattt 4486936  T
Q  194 tg 195  Q
    ||    
T  4486935 tg 4486934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 10383083 - 10383188
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  10383083 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 10383182  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  10383183 attttg 10383188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14421375 - 14421270
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  14421375 aaaaattagaattttttaacatgtaaggaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 14421276  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  14421275 attttg 14421270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17964217 - 17964112
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  17964217 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaa 17964118  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  17964117 attttg 17964112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18997161 - 18996977
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||        |||||| || |||||| ||| ||| ||| ||||   |||||||||  ||||||    
T  18997161 tttgtttaattatctttaaacacttcaatatttgaaagattttttgcagacaatttcagaacattataaaaggtttattttacaaaatttagt-tttttt 18997063  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaatttt 194  Q
    ||| ||| | |||||| |||||||||||||| || | |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  18997062 aatgtgagatgaattaaatatgaattttttagaa-gccaaaagttcaagataaatgtaacaaaatttggacctaaaaataaaatttt 18996977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 31861617 - 31861722
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||    
T  31861617 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaattaacgaaaatatggacctaaaaataaa 31861716  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  31861717 attttg 31861722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 34076052 - 34076157
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  34076052 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacttaaaaataaa 34076151  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  34076152 attttg 34076157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 35188419 - 35188303
Alignment:
Q  54 gagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 153  Q
    |||||||||||| |||  | |||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| | |||||| |||| |||||||||     
T  35188419 gagacaagtttaaaactctctgaaagattcatatactaaaatatagaattttttaacatgaaataaattaaatat-attttttttaaacaacaaaagttt 35188321  T
Q  154 aagataaaattaacaaaa 171  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  35188320 aagataaaagtaacaaaa 35188303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 35767019 - 35767124
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  35767019 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattacatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 35767118  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  35767119 attttg 35767124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 45336550 - 45336445
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || || |||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  45336550 aaaaattagaattttttaatatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaacataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 45336451  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  45336450 attttg 45336445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 48624258 - 48624363
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  48624258 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 48624357  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  48624358 attttg 48624363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 48723630 - 48723525
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  48723630 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacttaaaaataaa 48723531  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  48723530 attttg 48723525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13083529 - 13083446
Alignment:
Q  214 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||  ||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  13083529 gaacttttagtaatgttcttaacacatctgaaaaaagttgttcaaaaacttgagagtataagcat-aattaaacaagtttgaatt 13083446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 42972036 - 42971953
Alignment:
Q  214 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  42972036 gaacttttagtaatattcttaacacgtctacaaaagatttttctaaaacttaagagtttaaacat-aattaaacagatttgaatt 42971953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 300
Target Start/End: Original strand, 29231884 - 29231939
Alignment:
Q  245 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29231884 aaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 29231939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 36796132 - 36796033
Alignment:
Q  97 tagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  36796132 tagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaagtaacgaaaatttggacctaaaaataaaattttg 36796033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 52010083 - 52009992
Alignment:
Q  80 gttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 171  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| || ||||||| || |||||| ||||||||    
T  52010083 gttcatttactaaaatttagaaatatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagaaaaaagttcaaaataaaagtaacaaaa 52009992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4647287 - 4647182
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||| || || |||| ||    
T  4647287 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttgcacctaaaaataaa 4647188  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  4647187 attttg 4647182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 300
Target Start/End: Original strand, 15054418 - 15054487
Alignment:
Q  231 cttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15054418 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaataaatttgaattga 15054487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 25136942 - 25137047
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||  || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  25136942 aaaaattagaattttttaacatataatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 25137041  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  25137042 attttg 25137047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26451286 - 26451181
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||  ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  26451286 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 26451187  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  26451186 attttg 26451181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26507712 - 26507607
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||  ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  26507712 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaa 26507613  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  26507612 attttg 26507607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 297
Target Start/End: Original strand, 36249086 - 36249151
Alignment:
Q  232 ttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaat 297  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  36249086 ttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaat 36249151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37986278 - 37986209
Alignment:
Q  231 cttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37986278 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaatttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 37986209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 2059196 - 2059154
Alignment:
Q  154 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgc 196  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2059196 aagataaaattaacaaaatcaggacgtagaaatcaaattttgc 2059154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14007137 - 14007043
Alignment:
Q  102 ttttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    |||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  14007137 ttttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaattttg 14007043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 48410202 - 48410160
Alignment:
Q  218 ttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  48410202 ttttagtaatgttcttaacacttctgcaaaaaattgttcaaaa 48410160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 2207588 - 2207693
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  2207588 aaaaattataattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgcaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 2207687  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  2207688 attttg 2207693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 10371577 - 10371682
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa-caaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||  |||||||| |||  ||||||||||| || |||| ||    
T  10371577 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcgagataaaactaagaaaaatttggacctaaaaataaa 10371676  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  10371677 attttg 10371682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14411039 - 14410934
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||  || |||| ||    
T  14411039 aaaaattagatttttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaatttaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaattaa 14410940  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  14410939 attttg 14410934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 46667722 - 46667617
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||| ||| || |||| ||    
T  46667722 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttagacctaaaaataaa 46667623  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  46667622 attttg 46667617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Original strand, 15358344 - 15358440
Alignment:
Q  100 aattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    |||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  15358344 aattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacgaaaattttgacctaaaaataaaattttg 15358440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 52526947 - 52526859
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggac 178  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  52526947 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgcaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggac 52526859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25352041 - 25351963
Alignment:
Q  214 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||||||||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  25352041 gaacttttcgtaatgtttttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 25351963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26136278 - 26136191
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttgga 177  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||    
T  26136278 aaaaattagatttttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttgga 26136191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 293
Target Start/End: Original strand, 48218060 - 48218138
Alignment:
Q  214 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||  | || |||| ||| ||||||||||||||    
T  48218060 gaactttttgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatctttaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 48218138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 52760604 - 52760518
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttgga 177  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||    
T  52760604 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacg-caaaaattcaagataaaactaacgaaaatttgga 52760518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 195
Target Start/End: Original strand, 1297017 - 1297055
Alignment:
Q  158 taaaattaacaaaa-tttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1297017 taaaattaacaaaaatttggacgtagaaatcaaattttg 1297055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 195
Target Start/End: Original strand, 14743945 - 14744039
Alignment:
Q  102 ttttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    |||||||| ||| || |||||| ||||   |||||||||| | ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14743945 ttttttaacatgtaatgaattaaatatagtttttttaaaatgccaaaaattgaagataaaactaacgaaaatttggacctagaaataaaattttg 14744039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 20357174 - 20357120
Alignment:
Q  61 gtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaa 115  Q
    |||||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20357174 gtttagaacattataaaaggtttatttaataaaatttagaattttttaacatgaa 20357120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 115
Target Start/End: Original strand, 20562781 - 20562835
Alignment:
Q  61 gtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaa 115  Q
    |||||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20562781 gtttagaacattataaaaggtttatttaataaaatttagaattttttaacatgaa 20562835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26207547 - 26207493
Alignment:
Q  215 aacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagag 269  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||| |||||| |||||    
T  26207547 aacttttagtaatgttcttaacatgtttcgaaaaaattgttctaaaacttaagag 26207493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 29231402 - 29231368
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttt 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29231402 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttt 29231368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 195
Target Start/End: Original strand, 31266968 - 31267062
Alignment:
Q  102 ttttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    |||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| | ||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  31266968 ttttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccgaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaaattttg 31267062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 195
Target Start/End: Original strand, 48468233 - 48468331
Alignment:
Q  99 gaattttttaatatgaaacgaattagatatgaat-tttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    ||||||||||| ||| || |||||| |||| | | ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  48468233 gaattttttaacatgtaatgaattaaatataattatttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacataaaaataaaattttg 48468331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Original strand, 1297104 - 1297156
Alignment:
Q  245 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
    |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1297104 aaaaaattattcaaaaatttaagagtttaaacataa-ttaaacaaatttgaatt 1297156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 4008803 - 4008908
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||| ||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||| | ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  4008803 aaaaattagaattttgtaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaatgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 4008902  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  4008903 attttg 4008908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7603823 - 7603718
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||  || |||||| |||| | ||||||||| ||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  7603823 aaaaattagaattttttaacatataatgaattaaatataatttttttaaatcgctaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaa 7603724  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  7603723 attttg 7603718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 10658611 - 10658716
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| |  |||||||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||  || |||| ||    
T  10658611 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatatttttaaaacgctaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggatataaaaataaa 10658710  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  10658711 attttg 10658716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 26911163 - 26911268
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| || || || |||||||||  ||| ||||||||||| || |||| ||    
T  26911163 aaaaattataattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccagaaattcaagataaaacaaacgaaaatttggacctaaaaataaa 26911262  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  26911263 attttg 26911268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 32037258 - 32037363
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||| ||||||| ||||| || ||||||| | |||| ||||||||||  || |||| ||    
T  32037258 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttataaaacgccaaaatttgaagataagactaacgaaaatttggatctaaaaataaa 32037357  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  32037358 attttg 32037363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 45583556 - 45583660
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | | |||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||  || |||| ||    
T  45583556 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaatta-atataattattttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaataaa 45583654  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  45583655 attttg 45583660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 42972146 - 42972086
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagt 151  Q
    |||| |||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||| | |||||||||||||    
T  42972146 aaaaattagaattttttaacatgagatgaattaaatatgatttttcttaaacgacaaaagt 42972086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 101)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 53324070 - 53323774
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53324070 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 53323971  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||        
T  53323970 tttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgtgacaattt 53323871  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgt-aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53323870 tttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtatgtaaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 53323774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 30331278 - 30331573
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||       || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30331278 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgaaacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 30331377  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        
T  30331378 tttaacataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 30331477  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30331478 tttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgcctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 30331573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 33177421 - 33177716
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33177421 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaatactatgaaaagttcatttactaaaatttagaattt 33177520  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||        
T  33177521 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaacgttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgagacaattt 33177620  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33177621 tttgcataggagcttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttaaattga 33177716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19523011 - 19522712
Alignment:
Q  1 attcaagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttaga 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19523011 attcaaatttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttaga 19522912  T
Q  101 attttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgaca 200  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19522911 attttttaacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaaaataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgaca 19522812  T
Q  201 nnnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
           ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19522811 attttttgcataggactttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 19522712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 47309729 - 47309434
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||       ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47309729 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgatttttttgagacaagtttagaacactgtgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 47309630  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||        
T  47309629 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatcttgacgtataaatcaaattttgctacaattt 47309530  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47309529 tttgcataggaacttttattaatgttcttaacatgtctgtaaataattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 47309434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22068392 - 22068097
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       |||| | |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  22068392 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagatatgtttagaacactatgaaaggttcattttctaaaatttagatttt 22068293  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||        
T  22068292 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagattaaattaacaaaattgggacgtaaaagtcaaattttgcgacaattt 22068193  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22068192 tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcagaaaactattcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 22068097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 298
Target Start/End: Original strand, 28448391 - 28448677
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  28448391 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttacaattt 28448490  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||        
T  28448491 tttaacatgaaacaaattgaatatgaatttttcaaaacgacaaaacttaaagataaaattaacaaa------acgtagaaatcaaattttgcgacaattt 28448584  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
       ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28448585 tttgcataggaacttttagtaatgttctcaacacgt-tgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaatt 28448677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 75 - 300
Target Start/End: Original strand, 38114282 - 38114507
Alignment:
Q  75 gaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaattt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38114282 gaaatgttcatttactaaaatttaaaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatct 38114381  T
Q  175 ggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaa 274  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  38114382 ggacatataaatcaaattttgtgacaattttttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaatttgttaaaaaactcaagagtttaa 38114481  T
Q  275 acataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  38114482 acataaattaaacaaatttgaattga 38114507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 31316836 - 31316547
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31316836 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttctgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 31316737  T
Q  105 ttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    ||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |       
T  31316736 ttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaaattaaagataaaaataataaaatttggacatataaatcaaattttgcgataatt 31316637  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
        ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31316636 ttttgcagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaattt 31316547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 51876302 - 51876007
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttaga--atttt 105  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||        ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||  | |||    
T  51876302 tttgattaattattcttaaactcttaaacttttgaacgaatttttttagacaagtttataacaatgtgaaatgttcatttattaaaatttagacaagttt 51876203  T
Q  106 ttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtt-aaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |        
T  51876202 ttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaaattttgtgataattt 51876103  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  51876102 tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctctaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 51876007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Original strand, 3873155 - 3873468
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873155 tttgtttaattatccttaaactcttacatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 3873254  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnn 207  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||           
T  3873255 aacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaacctgtacgtagaaatcaaattttgcgacaatttttt 3873354  T
Q  208 gcataggaact---------------------tttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaa 286  Q
    |||||||||||                     ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3873355 gcataggaacttttagtaattgcataggaacttttagtaatgttcttaacatgcctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaa 3873454  T
Q  287 caaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||||||    
T  3873455 caaatttgaattga 3873468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 55938362 - 55938075
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||       || | |||||||||||| || |||| || | ||||||| ||||||||||||    
T  55938362 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgatttttttgaaataagtttagaacactacgaaaggt-cgtttactagaatttagaattt 55938264  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| || |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||        
T  55938263 tttaacataaaacgaattaaatctgaattttttaaaacaacaaatgttaaagataaaattaacaaaatctgcacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 55938164  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
        || ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  55938163 ttcacagaggtacttttagtaatattcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaattt 55938075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4850389 - 4850094
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||       ||||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||    
T  4850389 aagtttgtttaattattcttaaactcttgaatttttgaacgattttattgagacacatttagaacaatatgaaagattcatttagtaatatttagaattt 4850290  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    || || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |        
T  4850289 ttcaacatgaaacgaatttaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaaataacaaaacttagacgtagaaatcaaattttgcgataattt 4850190  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||  || || |||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  4850189 tttgcggagaaatttttagtaacattcttaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacatatttgaattga 4850094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 43938291 - 43937996
Alignment:
Q  12 tttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt-aat 110  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||       |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  43938291 tttaattatcctttaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagcttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttttaac 43938192  T
Q  111 atgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgac-annnnnnngc 209  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| |       ||    
T  43938191 atgaaacgaattaaatatgaaaattttaaaacgaaaatagttcaagaaaaaattaacaaaatctgaacgtataaataaaattttgcgacaatttttttgc 43938092  T
Q  210 ataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattgatgatg 305  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43938091 agaggaacttttagtaatgttcttaacatgtctacaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgaggatg 43937996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 62 - 305
Target Start/End: Original strand, 20177933 - 20178175
Alignment:
Q  62 tttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaa 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20177933 tttagaacaatatggaaggttcatttactaaaattta-aattttttaacaagaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaa 20178031  T
Q  162 attaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaa 261  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||       | | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  20178032 agtaacaaaatctggacgtataaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacatgtatgtaaaaaattgttcaataa 20178131  T
Q  262 ctcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattgatgatg 305  Q
    | |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20178132 cccaagaatttaagcataaattaaacaaatttgaattgaggatg 20178175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25422361 - 25422067
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||       ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25422361 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgatttttttgagacaagtttagaacactatcaaaggttcaattactaaaatttagaattt 25422262  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |        
T  25422261 tttaacataaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaatgttaaagataaaagtaa-aaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattt 25422163  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||  | || ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25422162 tttgcggatgatcttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaaatgttaaaaaacttaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 25422067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 33689293 - 33689588
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||       |||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33689293 aagtttgtttaattattcttaaattcttaaatttttaaacgatttttttgagacaagtttagagcactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 33689392  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||| |||||||||||| |        
T  33689393 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaaccaaattttgcgataattt 33689492  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33689493 tttgcggaggaatttttagtaatgttcttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 33689588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 53423563 - 53423859
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |        |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53423563 aagtttgtttaactatccttaaactcttaaattttttaacaattcttttaagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 53423662  T
Q  105 ttt--aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacann 202  Q
    |||  || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||   || ||||||||||||||      
T  53423663 tttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttatagataaaagtaacaaaatatggacgtgtgaaacaaattttgcgacaat 53423762  T
Q  203 nnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
         ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  53423763 tttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacatgtctgcaaaaaattgtccaaaaactcaagag-tttagtataaattaaacaaatttgaattga 53423859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1870400 - 1870140
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||        |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1870400 aagtttgtttaactatccttaaactattaaatttttgaacgatttttta-agacaagtttagaacactataaaatgttcatttactaaaatttagaattt 1870302  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||        
T  1870301 tttaacataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaagtaacaaaatatggacgtataaatcaaattttgtgacaattt 1870202  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaa 266  Q
       ||  || |||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||    
T  1870201 tttgccgagaaacttttagtaatgtttttaacatgtctacaaaaaattgtcgaaaaactcaa 1870140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 51395612 - 51395907
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        ||||||||||| |||| |||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  51395612 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagttta-aacactatgagtgattcatttactaaaatttagaattt 51395710  T
Q  105 ttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    ||| || ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||| |||||||||||||       
T  51395711 ttttaacatgaaacaaattaaatatgaatatttcaaaacgaaaaaagttaaagataaaattaacaaaatcaggatgtagtaattaaattttgcgacaata 51395810  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        | | ||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51395811 ttttgtacaggaacttttagtaatgtgtttaacacgtctgcaagaaattattcaaaaactcatgagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 51395907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 7490988 - 7490707
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaa-tttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |        |||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||    
T  7490988 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaaatttttgaacaactttttttagacaagtttagaacactataaaaggttcaattactaaagtttagattt 7490889  T
Q  104 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||       
T  7490888 ttttaagatgaaacgaattaaatatgaatattttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaaatatgcgtcaatt 7490789  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaat 291  Q
        ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||     |||||  ||||||||||||||||||||    
T  7490788 ttttgcagaggaa-ttttagtaatgtgcttaacacgtctgtgaaaaattgttcaaa-----aagagtgtaaacataaattaaacaaat 7490707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10321990 - 10321695
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |       || |||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  10321990 aagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacaatttttttgacacaagtttagaacactgtgaaaggttcaattactaaaatttagaatat 10321891  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||  |||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |        
T  10321890 tttatcatgaaaagaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattt 10321791  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  10321790 tttgcggagggacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagtataaattaaacaaattttaattga 10321695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 90 - 300
Target Start/End: Original strand, 13718060 - 13718271
Alignment:
Q  90 taaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13718060 taaaatttagagttttttaacatgaaacgcattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagatcaagataaaattaacaaaatcaggacgtagaaatcaa 13718159  T
Q  190 attttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtct-gtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaaca 288  Q
    |||||||||||       ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13718160 attttgcgacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtctggaaaaaaattgttaaaaaactcaagagtttaagcataaattaaaca 13718259  T
Q  289 aatttgaattga 300  Q
    ||||| ||||||    
T  13718260 aatttaaattga 13718271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 53571542 - 53571824
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  53571542 aagtttgtttaatcatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaattt 53571641  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||| || || || ||||||||||||||| |         
T  53571642 tttaacatgaaacgaattaaatataaatttttgaaaataataaaagttaaagataaaagtaataaaatatgtacatataaatcaaattttgcggc----- 53571736  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
            |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  53571737 --------ggaacttttaataatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 53571824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10085772 - 10085485
Alignment:
Q  12 tttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaata 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||        | ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  10085772 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacggtttttttgtgacaaatttagaacactatgaaatcttcatttactaaaatttagaat-ttttaaca 10085674  T
Q  112 tgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagat-aaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngca 210  Q
    |||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||| |       ||     
T  10085673 tgaaacaaattaaat-taaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaaagtaacaaaatcaggatatagaaatcaaattttgcgataattttttgcg 10085575  T
Q  211 taggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  10085574 gaggaacttttagtaatgttctaaacatgtctgcaaaaaattattcacaaacttaagagttttagcataaattaaacaaatttgaattga 10085485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11670401 - 11670119
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||       ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  11670401 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaaattttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactacgaaaggttcaattaataaaatttagaattt 11670302  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |         
T  11670301 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcggc----- 11670207  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
            |||||||||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11670206 --------ggaacttttaataatgttcctaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagcgtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 11670119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 44289970 - 44289677
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||        | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  44289970 tttgcttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 44289871  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcgacannnnn 205  Q
    || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |         
T  44289870 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttt 44289771  T
Q  206 nngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       |  | || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  44289770 tt-cggatgaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 44289677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 47379178 - 47379471
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| |||       ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47379178 aagtttgtttaattatacttaaactct--aaattttgagcgaatattttgagacaagtttagaatactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 47379275  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    || || |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |       
T  47379276 ttaaaaatgaaatgaattaaatatgtattttttaaaatgacaaaacgtcaagataaaagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaattttgcgataatt 47379375  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   | ||| |||||| |||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  47379376 ttttgcggaggaacttttagtattgttcttaacacgtctgcaaaagcattttcgaaaacttaagagtataagcat-aattaaacaaatttgaattga 47379471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 300
Target Start/End: Original strand, 35060875 - 35061120
Alignment:
Q  54 gagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 153  Q
    |||||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  35060875 gagacaagtttagagcactttgaaatattcaattactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgattttttgaaaacgataaaagtta 35060974  T
Q  154 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 253  Q
    || |||||| ||| ||||| ||||  || |||||||||||||||| |       ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35060975 aaaataaaagtaataaaatctggatatataaatcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttaataatgttcttaacacgtctacaaaaaattg 35061074  T
Q  254 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    || |||| || ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  35061075 tt-aaaatcttaagagttttagaataaattaaacaaatttgaattga 35061120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 255
Target Start/End: Original strand, 42972734 - 42972983
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||        |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||  ||||   | | |||    
T  42972734 aagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacgagtttagaatactatgaaaggttcatttatcaaaaaaaa-atttt 42972832  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaatttt-ttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       
T  42972833 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttgttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttacgacaatt 42972932  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 255  Q
        |||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42972933 ttttgcagtggaac-tttagcaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgtt 42972983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 44209495 - 44209777
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||| |    
T  44209495 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaagattcaattactaaaatttagaatct 44209594  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| | |||| |||||| ||||| |||||| ||             || ||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |        
T  44209595 tttaacacgaaaagaattaaatatgtatttttgaa-------------aaggataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattt 44209681  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       || || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44209682 tttgcgtacgaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattattaaaaaacttaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 44209777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 48082736 - 48082443
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||        | |||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| || ||||||||    
T  48082736 tttgcttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaacggttcatttacaaaaatctataatttttt 48082637  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcgacannnnn 205  Q
    || ||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |         
T  48082636 aacatgaaataaattaaatatgaattttataaaacgacaaaagtttaagatataaataacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttt 48082537  T
Q  206 nngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       |  | || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  48082536 tt-cggatgaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 48082443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 23473478 - 23473773
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||       |||| |||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  23473478 aagtttgtttaattatcggtaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactgtgaaaggttcatt-actaaaatttaaaattt 23473576  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||| |        
T  23473577 tttaacatgaaacaaattaaatatgagtttttaaatacgtcaaaaattaaagatataagtaataaaatctggacataagaatcaaattttgcgataattt 23473676  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtct-gtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||   |||||||| |||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23473677 tttgcagaggaacttttggtaacgttcttgacacgtctacaaaaaaattattcaaaaacttaagactttaagcataaattaaacaaatttgcattga 23473773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 47463661 - 47463469
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaa---tatgaaatgttcatttactaaaatttagaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||       ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||       
T  47463661 aagtttgtttaattatctttaaactcttaaattttttaacgatttttt-gagacaagtttagaacaacactatgaaaggttcatttactaaaatttaatt 47463563  T
Q  102 ttttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    |||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47463562 ttttttaacattaaacaaattaaatatgaattttttaaaacagtaaaaattaaagataaaattaacaaaatatggacgtagaaatcaaattttg 47463469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37329695 - 37329487
Alignment:
Q  94 atttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtaga--aatcaaat 191  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  || |  ||| ||||    
T  37329695 atttataattttttaaaatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggatatatataaattaaat 37329596  T
Q  192 tttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaat 291  Q
    ||||| | |       ||  | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37329595 tttgcaataattttttgcggatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaatttaagagtttaaacataaattaaacaaat 37329496  T
Q  292 ttgaattga 300  Q
    |||||||||    
T  37329495 ttgaattga 37329487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 7617418 - 7617536
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7617418 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttaaaacattatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 7617517  T
Q  105 tttaatatgaaacgaatta 123  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  7617518 tttaacatgaaacgaatta 7617536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 35821357 - 35821128
Alignment:
Q  55 agacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 153  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| || |||||||  |||  ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  35821357 agacaagtttagaacatcatgaaaggttcatatactagaatttacaatttttttaacatgaaacttattgaatatgaattttataaaacgacaaaactta 35821258  T
Q  154 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 253  Q
    || |||||||||| ||||| |||||||||  ||  ||||||             ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35821257 aaaataaaattaataaaatctggacgtagcgat--aatttt----------tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattg 35821170  T
Q  254 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaa 296  Q
    ||| |||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  35821169 ttc-aaaatttaagagtttaagtataaattaaacaaatttgaa 35821128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 224 - 300
Target Start/End: Original strand, 7617535 - 7617611
Alignment:
Q  224 taatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7617535 taatgttcttaacatgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 7617611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 298
Target Start/End: Original strand, 52947767 - 52948054
Alignment:
Q  12 tttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnng-agacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaa-ttttttaa 109  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||       | |||||  ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52947767 tttaattatccttaaactgttaaattttagaacgatttttttggagacacttttagaacattataaaaagttcatttactaaaatttagaatttttttaa 52947866  T
Q  110 tatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnng 208  Q
     |||| |  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||| |||||    |       |    
T  52947867 catgagataaattaaatatgaatttttt-aaatgacaaaatttcaagataaaagtcacaaaagtttggtcgtagaaatcaatttttgaactaatttttcg 52947965  T
Q  209 cataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
       || |||||||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  52947966 gggagcaacttttagtaatgttttgaacacatatataaaaaattgttcaaaaattcaagagtttaaacat-aattaaacaaatttgaatt 52948054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 299
Target Start/End: Original strand, 48219943 - 48220180
Alignment:
Q  61 gtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataa 160  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||||| || || ||||    
T  48219943 gtttagaacattatgaaaggttcatttgttaaaatttagaattttttaacaagaaattaattaaatatgaatgttttaaaatgacaaaa-ttcaatataa 48220041  T
Q  161 aattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaa 259  Q
    || |||| |||||||||| |||||||| ||||||| | | |       ||  ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| | |||| |||    
T  48220042 aagtaacaaaaatttggatgtagaaattaaattttacaataattttttgcggaggaatttttagtaatgttcttaacatatctgcaaaagaatgttaaaa 48220141  T
Q  260 aactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattg 299  Q
    |||  ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  48220142 aacataagagtttaagcat-aattaaacaaatttgaattg 48220180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 44452328 - 44452189
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  44452328 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 44452229  T
Q  157 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| || ||| ||||||||    
T  44452228 ataaaagtaacaaaaatctggacgcaggaataaaattttg 44452189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 55283399 - 55283212
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||       |||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||| ||||||    
T  55283399 tttgtttaattattcttgaattcttaaatttttgaacgatttttaggagacatgtttagaacattataaaatgttcatttgctaaaaaatagattttttt 55283300  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    |||| || | || ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || | |||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  55283299 aataggagaagatttaaatatg-atttttttaaacgacaaaagttcaagaaaagagtaacaaaaatctgaacgtagaaatcaaattttg 55283212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Original strand, 34513070 - 34513305
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||  | | |||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  34513070 acaagtttagaacattacaagaggttcgtttactaaaatttagaattatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtttaa- 34513168  T
Q  157 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 255  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || |       | | | |||||||| ||||||||||| |||| | || |||||||||||    
T  34513169 ataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaaattttgagataattttttggagatgaacttttcgtaatgttcttgacacttgtgcaaaaaattgtt 34513268  T
Q  256 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  34513269 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 34513305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 38499508 - 38499327
Alignment:
Q  80 gttcatttactaaaatttaga-attttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggac 178  Q
    |||| |||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||  |||| ||||||||| ||| ||||| |||||    
T  38499508 gttcgtttactaaaatttaaattttttttaacatgaaatgaattaaatatgaatatttttaaaagacatgagttcaagataaaagtaaaaaaatctggac 38499409  T
Q  179 gtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaa 260  Q
     ||||||| |||||||| ||         ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  38499408 atagaaataaaattttgagattattttttgcagatgaacttttagtaatgttcttaacacttctgcaaaaaattgttcaaaa 38499327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 122
Target Start/End: Original strand, 3862491 - 3862606
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnn-gagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||        |||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3862491 tttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattttttttgagacaagtttagaatgcgatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttt 3862590  T
Q  107 taatatgaaacgaatt 122  Q
    ||| ||||||||||||    
T  3862591 taacatgaaacgaatt 3862606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 122
Target Start/End: Original strand, 3871248 - 3871363
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnn-gagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||        |||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3871248 tttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattttttttgagacaagtttagaatgcgatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttt 3871347  T
Q  107 taatatgaaacgaatt 122  Q
    ||| ||||||||||||    
T  3871348 taacatgaaacgaatt 3871363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13604077 - 13603785
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttg-aacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||        ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  13604077 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttttaatgatattttttagacaagtttataacattataaaaggttcatttactaaaattcataatt 13603978  T
Q  104 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tttggacgtagaaatcaaattttgcgacann 202  Q
    ||| | | |||||  ||||| ||||||||| ||| |||||| |    |||||| ||||| |||||||| ||||||  || |||||| |||||| || |      
T  13603977 tttaact-tgaaataaattaaatatgaattcttttaaacgaaattttttaaagttaaaagtaacaaaaatttggatataaaaatcacattttgagataaa 13603879  T
Q  203 nnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
         ||  |||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13603878 tttttgcggaggaacttttagtaatgttcataaaatatctgcaaaaaattgttc-aaaacttaagagtttaagcat-aattaaacaaatttgaatt 13603785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 167
Target Start/End: Original strand, 20650555 - 20650666
Alignment:
Q  56 gacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaa 155  Q
    ||||||||| |||||  | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||| ||    
T  20650555 gacaagtttggaacatcacgaaagattcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaatgaattaaatatgaattattttaatagacaaaagttcaa 20650654  T
Q  156 gataaaattaac 167  Q
    ||||||| ||||    
T  20650655 gataaaagtaac 20650666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 171
Target Start/End: Original strand, 28163777 - 28163891
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||  ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  28163777 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattatttagcatgaaataaatttaatatgaatttttttaaaagacaaaagttgaaa 28163876  T
Q  157 ataaaattaacaaaa 171  Q
    |||||| ||||||||    
T  28163877 ataaaagtaacaaaa 28163891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 225 - 299
Target Start/End: Original strand, 50824407 - 50824481
Alignment:
Q  225 aatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattg 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50824407 aatgttcttaacacgtctgaaaaatattgttcaaaaacttaagctattaagcataaattaaacaaatttgaattg 50824481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8949727 - 8949622
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||    
T  8949727 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaattaacgaaaatttggacctaaaaataaa 8949628  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  8949627 attttg 8949622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29445741 - 29445636
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  29445741 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctagaaataaa 29445642  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  29445641 attttg 29445636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 255
Target Start/End: Original strand, 44452893 - 44453056
Alignment:
Q  92 aaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || |||||| || ||||||| |||||| |||||  |||    
T  44452893 aaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatgaattttttaata-gacaaaagttcaaaataaaagtagcaaaattctggacgcagaaaaaaaa 44452991  T
Q  191 ttttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 255  Q
      ||| || |       ||| | |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  44452992 aattgagataattttttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgtt 44453056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 344023 - 343918
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  344023 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 343924  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  343923 attttg 343918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6203275 - 6203170
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  6203275 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaatttcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 6203176  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  6203175 attttg 6203170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 300
Target Start/End: Original strand, 11670860 - 11670929
Alignment:
Q  231 cttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11670860 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 11670929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 19320816 - 19320921
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  19320816 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaatttcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 19320915  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  19320916 attttg 19320921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22515767 - 22515662
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  22515767 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 22515668  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  22515667 attttg 22515662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 24281869 - 24281974
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  24281869 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 24281968  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  24281969 attttg 24281974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 28756420 - 28756315
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  28756420 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 28756321  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  28756320 attttg 28756315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31312251 - 31312146
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  31312251 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 31312152  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  31312151 attttg 31312146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 38698827 - 38698932
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  38698827 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 38698926  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  38698927 attttg 38698932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39269864 - 39269759
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||  || |||| ||    
T  39269864 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattatatatgaattttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttagaactaaaaataaa 39269765  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  39269764 attttg 39269759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 42931154 - 42931259
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  42931154 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 42931253  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  42931254 attttg 42931259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 52224649 - 52224544
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | || ||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||    
T  52224649 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttgtttaaaacgccaaaaattcaagataaaattaacgaaaatttggacctaaaaataaa 52224550  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  52224549 attttg 52224544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 52788856 - 52788960
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  52788856 aaaaattataattttttaacatgtaatgaattaaatat-aattttttaaaacgtcaaaagttcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 52788954  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  52788955 attttg 52788960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 192
Target Start/End: Original strand, 35351739 - 35351853
Alignment:
Q  80 gttcatttactaaaatttagaattttt-taatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaa-aatttgga 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| || |||||| |||||||||||||  | | ||||||||| ||||||||| || ||| | |||  |    
T  35351739 gttcatttactaaaatttaaaatttttgtaacatgtaatgaattaaatatgaatttttttcatcaacaaaagttcaagataaaagtatcaatactttata 35351838  T
Q  178 cgtagaaatcaaatt 192  Q
    |||||||||||||||    
T  35351839 cgtagaaatcaaatt 35351853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9428172 - 9428068
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  9428172 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatat-aattttttaaaacgcaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 9428074  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  9428073 attttg 9428068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 46
Target Start/End: Original strand, 13717994 - 13718035
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacga 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13717994 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacga 13718035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15637024 - 15636919
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  15637024 aaaaattataattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 15636925  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  15636924 attttg 15636919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 25768018 - 25768123
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa-ttaacaaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | |||||||| ||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || |||| ||    
T  25768018 aaaaattagaattttttaacatgtaacgaattaaatataatttttttaatacgccaaaaattcaagataaaactaaagaaaatttggacctaaaaataaa 25768117  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  25768118 attttg 25768123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 34680329 - 34680434
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| || | | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  34680329 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatttaatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 34680428  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  34680429 attttg 34680434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 53237972 - 53238077
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa-caaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||  ||||||||||| || |||| ||    
T  53237972 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaatgaaaatttggacctaaaaataaa 53238071  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  53238072 attttg 53238077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 171
Target Start/End: Original strand, 10386696 - 10386776
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 171  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  10386696 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatatcatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaa 10386776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11152413 - 11152325
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggac 178  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  11152413 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggac 11152325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 45
Target Start/End: Original strand, 38114237 - 38114277
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacg 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38114237 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacg 38114277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 195
Target Start/End: Original strand, 47016247 - 47016347
Alignment:
Q  96 ttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaatttt 194  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |||||||    
T  47016247 ttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaatttt 47016346  T
Q  195 g 195  Q
    |    
T  47016347 g 47016347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31471017 - 31470962
Alignment:
Q  245 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31471017 aaaaaattgttaaaaaacttacgagtttaaaaataaattaaacaaatttgaattga 31470962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4553478 - 4553373
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| || | | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||  ||    
T  4553478 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatttaatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaagaaa 4553379  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  4553378 attttg 4553373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 23708873 - 23708978
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||| | || || |||| ||    
T  23708873 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacgaaaattcgaacctaaaaataaa 23708972  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  23708973 attttg 23708978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 28540963 - 28540858
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa-caaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| ||||||||||||||  || || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||  ||||||||||| || |||| ||    
T  28540963 aaaaattagaattttttaacttgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaaggaaaatttggacctaaaaataaa 28540864  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  28540863 attttg 28540858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 35015533 - 35015448
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttg 175  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||    
T  35015533 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttg 35015448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 42642996 - 42643100
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||| | ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  42642996 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaatgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggac-taaaaataaa 42643094  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  42643095 attttg 42643100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 47500210 - 47500315
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||  || |||| ||    
T  47500210 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgcaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaataaa 47500309  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  47500310 attttg 47500315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 50642603 - 50642708
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa-ttaacaaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||| | |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || |||| ||    
T  50642603 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaatgaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaaagaaaatttggacttaaaaataaa 50642702  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  50642703 attttg 50642708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 53231213 - 53231317
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||| ||||  ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  53231213 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatat-aatttttttaaacaccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 53231311  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  53231312 attttg 53231317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 178
Target Start/End: Original strand, 1776634 - 1776722
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggac 178  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || ||| || |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  1776634 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaaataaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggac 1776722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 8770709 - 8770669
Alignment:
Q  3 tcaagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaa 43  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8770709 tcaagtttgtttaattatccttaaactcatgaatttttgaa 8770669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18092821 - 18092735
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttgga 177  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||    
T  18092821 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacg-caaaaattcaagataaaactaacgaaaatttgga 18092735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 195
Target Start/End: Original strand, 29246903 - 29247002
Alignment:
Q  97 tagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||  ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  29246903 tagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacaccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaattttg 29247002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 195
Target Start/End: Original strand, 47875938 - 47876036
Alignment:
Q  97 tagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa-caaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||  ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  47875938 tagaattttttaacatgtaatgaattaaatat-atttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaatgaaaatttggacctaaaaataaaattttg 47876036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 195
Target Start/End: Original strand, 16618859 - 16618953
Alignment:
Q  102 ttttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    |||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||  ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  16618859 ttttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaaattttg 16618953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 53571078 - 53571008
Alignment:
Q  231 cttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaa-ctcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||| || || || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53571078 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaaacttaacagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 53571008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6488629 - 6488525
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||  |||||||||| || |||| ||    
T  6488629 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaac-tcaaaaatttaagataaaactaacgtaaatttggacctaaaaataaa 6488531  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  6488530 attttg 6488525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 293
Target Start/End: Original strand, 6818007 - 6818087
Alignment:
Q  212 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    ||||||||| | | |||||||||| |||| |  |||||||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6818007 aggaactttaatttatgttcttaaaacgtatacaaaaaattgttcaaaaatgtaagagtttaaacat-aattaaacaaattt 6818087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23064163 - 23064058
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa-caaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || | |||| |||| | |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||  ||||||||||| || |||| ||    
T  23064163 aaaaattaaaattttttaacatgtaatgcattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaagttaatgaaaatttggacataaaaataaa 23064064  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  23064063 attttg 23064058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23624592 - 23624507
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttg 175  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||    
T  23624592 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttgaaacgccaaaatttcaagataaaactaacgaaaatttg 23624507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 28706219 - 28706115
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  28706219 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatat-attttttttaaacgccaaaaattcaagataaacctaacgaaaatttggacttaaaaataaa 28706121  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  28706120 attttg 28706115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 34509861 - 34509756
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||  ||||||||||| || |||| ||    
T  34509861 aaaaattagatttttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacgccaaaaattcaagataaaagtaatgaaaatttggacctaaaaataaa 34509762  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  34509761 attttg 34509756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 53569224 - 53569155
Alignment:
Q  232 ttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaa-ctcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||| || || || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53569224 ttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaaacttaacagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 53569155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 295
Target Start/End: Original strand, 47939788 - 47939867
Alignment:
Q  215 aacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttga 295  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||   || || |||| ||| ||||||||||||||||    
T  47939788 aacttttagtaatgttcttaacatgtctacaaaaaattgcttaaaaagctaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttga 47939867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 81)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 43597484 - 43597779
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43597484 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatttattttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 43597583  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |        
T  43597584 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgataattt 43597683  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43597684 tttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 43597779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4926670 - 4926372
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||       |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4926670 aagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 4926571  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||        
T  4926570 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcacaagttaaagataaaattaacaaaatctgaacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 4926471  T
Q  205 nnngca---taggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4926470 tttgcatagtaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtttaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 4926372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 22378458 - 22378753
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22378458 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactacgaaaggtacatttactaaaatttagaattt 22378557  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        
T  22378558 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacatttt 22378657  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  22378658 tttgcataggaacttttagtaacgttcttaacatgtctgtaaaaaactgttcaaaaactcaatagtttaagtataaattaaacaaatttaaattga 22378753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 38159247 - 38158948
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38159247 aagtttgtttaattatccttacactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 38159148  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||        
T  38159147 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagat-aaattaacaaaatctggaggtagaaatcaaattttgcgacaattt 38159049  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgt-aaaaaattgttcaaaaactcaagag----cttaaacataaattaaacaaatttgaattg 299  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38159048 tttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaaattgttcaaaaactcaagagttaatttaaacataaattaaacaaatttgaattg 38158949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 47792133 - 47791838
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |        |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| |||    
T  47792133 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatgtttttaagacaagtttagaacactatgaaaggttcatctaccaaaatttagatttt 47792034  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        
T  47792033 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 47791934  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47791933 tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgtttaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 47791838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 7238576 - 7238871
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||       ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7238576 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgatcgatttttttgagacaagtttagaacattatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 7238675  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||        
T  7238676 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaaagtttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattatgcgacaattt 7238775  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       | | |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7238776 tttgtagaggaccttttaataatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaacctcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 7238871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6588982 - 6588687
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         |||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6588982 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttatgacaagtttataacactaggaaaggttcatttactaaaatttagaattt 6588883  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||        
T  6588882 tttaacatgaaacgaattaaatataaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaaattaacaaattctggacgtagaaatcaaattttgcaacaattt 6588783  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       | | | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6588782 tttggagatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 6588687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18059296 - 18059006
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059296 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttgga--caagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 18059199  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnn 207  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || || ||||||||||||||||||           
T  18059198 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaaattaaagataaaattaacaaaatctaaacataaaaatcaaattttgcgacaatttttt 18059099  T
Q  208 gcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059098 gcagaggaacctttagtaactttcttaacacgtctgcaaaaatttgttcgaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 18059006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1962193 - 1961897
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||    
T  1962193 aagttcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatatttttgagacaagtatagaacactatgaaaggtcaatttattaaaatttagaattt 1962094  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaatttttta-aaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||       
T  1962093 tttaacatgaaacgaatgaaatatgtattttttttaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaattaaattttgcgacaatt 1961994  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1961993 ttttgcagatgaacttttagtaatgttctaaacacgtctgtgaaaaattgttcaaaaactcaaaaatttaagcataaatgaaacaaatttgaattga 1961897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 35482059 - 35482351
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35482059 aagtttgtttaattatctttaaactgttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 35482158  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    |||   || ||| |||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||        
T  35482159 ttt--cattaaatgaattaaatatgaatttttt-aaacgctaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttaggacaattt 35482255  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||| ||||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35482256 tttgcagaggaacttttaataattttcttaacatgtatgcaaaaaattgttcaaaaactcaatagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 35482351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 296
Target Start/End: Original strand, 14990548 - 14990837
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||       |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  14990548 aagtttgtttaattatccttaaactcttaagtttttgaatgatttttttgagagaagtttagaacactatgaaaggttcatt-actaaaatttataattt 14990646  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||| |        
T  14990647 tttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaa-ggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgaatgtagaaatcaaattttacgataattt 14990745  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaa 296  Q
       ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  14990746 tttgcagaggaacttttagtaatgttcctaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaa 14990837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 296
Target Start/End: Original strand, 15420159 - 15420448
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||       |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  15420159 aagtttgtttaattatccttaaactcttaagtttttgaatgatttttttgagagaagtttagaacactatgaaaggttcatt-actaaaatttataattt 15420257  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||| |        
T  15420258 tttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaa-ggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgaatgtagaaatcaaattttacgataattt 15420356  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaa 296  Q
       ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  15420357 tttgcagaggaacttttagtaatgttcctaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaa 15420448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 298
Target Start/End: Original strand, 15652796 - 15653085
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||       |||| | |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||    
T  15652796 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatttttttgagatacgtttagaacaatatgaaaggtttatttattaaaatttagatttt 15652895  T
Q  105 t--ttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacann 202  Q
    |  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |      
T  15652896 tttttaatatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagt------taaaagtaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttacgataat 15652989  T
Q  203 nnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
         |   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15652990 tttttgtggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtttgtaaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaatt 15653085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 43574532 - 43574239
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||       | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  43574532 tttgtttaattattcttaaactctaaaatgtttgaacgatttttttgtgacaagtttagaacactataaaatgttcatttattaaaatttagaattttct 43574433  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagat-aaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnn 206  Q
    ||  |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |          
T  43574432 aacttgaaacgaattaaatataaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaaaagtaataaaatttagatgtagaaatcaaattttgcgataattttt 43574333  T
Q  207 ngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
     ||  || ||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43574332 tgcgaagtaacttatagtaatgttctaaacatgtctgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 43574239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 293
Target Start/End: Original strand, 46044291 - 46044580
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  46044291 aagtttttttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 46044390  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcga-cannn 203  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||| |||||||||||  |       
T  46044391 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaatgataaaagttaaagataaaagtaataaaatttggacatataaataaaattttgcgataaatt 46044490  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
         || | |||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  46044491 ttttacagatgaacatttagtaatgtttttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcattaattaaacaaattt 46044580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6331191 - 6330995
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6331191 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttaaaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 6331092  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgaca 200  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6331091 tttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaaatctggacatagaaatcaaattttacgaca 6330995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 277
Target Start/End: Original strand, 10620520 - 10620793
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||        |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10620520 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacgatttcattaagacaagttttgaacactatgaaaagttcatttactaaaatttagaattt 10620619  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgac-annn 203  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||  || |       
T  10620620 tttaacatgaaacgaattaaatatgatttttttaaaacgacaaaagttaatgataaaagtaacaaaatatggacgtataaatcaaattttgtaacaattt 10620719  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaaca 277  Q
        ||| || | ||||||||||||||||||||| || |  |||| ||| | |||||||||||||| |||||||    
T  10620720 ttttgcagagaagcttttagtaatgttcttaacatgtatacaaaatattatccaaaaactcaagagattaaaca 10620793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 200
Target Start/End: Original strand, 36019811 - 36019957
Alignment:
Q  54 gagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 153  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36019811 gagacaagtttataacattatgaaatgttcatttactaaaatttagaactttttaacatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacggcaaaagtta 36019910  T
Q  154 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgaca 200  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  36019911 aagataaaattaacaaaatctagacgtagaaatcaaattttgcgaca 36019957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 38199340 - 38199062
Alignment:
Q  9 ttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||| | ||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||    
T  38199340 ttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaatactatgaaaggttcaatcaataaaatttagaatttttta 38199241  T
Q  109 atatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnng 208  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |             
T  38199240 acatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaaaaaaaattaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcggc--------- 38199150  T
Q  209 cataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38199149 ----ggaacttttaggaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 38199062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 54 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 46331045 - 46330799
Alignment:
Q  54 gagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  46331045 gagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattttttaacatgtaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagtta 46330946  T
Q  154 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 253  Q
    ||||||||| ||| ||||| | ||| || |||||||||||||||| |       ||  | ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  46330945 aagataaaagtaataaaatctcgacatataaatcaaattttgcgataattttttgcggatgaacttttagtaatgttcttaacgcgtctacaaaaaattg 46330846  T
Q  254 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    || |||||||  |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  46330845 ttaaaaaacttgagagtttaagcataaattaaacatatttgaattga 46330799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 4899864 - 4900158
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||       ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  4899864 aagtttatttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaaatttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa-tt 4899962  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagat-aaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |       
T  4899963 tctaacatgaaacaaattaaatatgaattttttcaaaccgcaaaacttaaagataaaaagtaacaaaatctggatgtagaaatcaaattttgcgataatt 4900062  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||  ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4900063 tttcgcgaaggaacttttattaatgttctaaacaagtctgcaaaaaattgtt-aaaaacttaagagtttaagtataaattaaacaaatttgaattga 4900158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 43083855 - 43084137
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  43083855 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaattt 43083954  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||  ||||| |||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||| ||| ||||| || |  || ||||||||||||||| |         
T  43083955 tttaacatgaaaaaaattaaatatgaatttttgaaaacaattaaagataaagataaaagtaataaaatatgaaaatataaatcaaattttgcggc----- 43084049  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
            || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43084050 --------ggtacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 43084137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 11396958 - 11397252
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        ||||| ||||| |||| | ||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  11396958 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttgtgtaagacaggtttataacactgtgaatggatcatttactaaaatttagaattt 11397057  T
Q  105 tttaata-tgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    ||| |   |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |  || ||||||||||||||| ||| |       
T  11397058 ttttagcgtgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacgtcaaaagttaaagataaaagtaacaaa-tctaaacatagaaatcaaattttccgatattt 11397156  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattg 299  Q
         || |||||||||||| |||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  11397157 ttttacaaaggaacttttagcaatgtttttaacacgtatgcaaaagattgttcaaaaacttaagagtttgaacataaattaaacaaatttgaattg 11397252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3495938 - 3495655
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||       ||| |||||||| |||| |||||||  |||| ||| ||||||||| | |||    
T  3495938 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgaggcaagtttaaaacactatgaaagattcaattaataaaatttaaatttt 3495839  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||| | |         
T  3495838 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgtggc----- 3495744  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattgat 301  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3495743 --------ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagcgtttaagaataaattaaacaaatttgaattgat 3495655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Original strand, 1544478 - 1544769
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||       ||| ||||||||||||| |||||||   |||||| |||| |||| |||||||||    
T  1544478 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgatatttttgagtcaagtttagaacactatgaaaaactcatttgctaagattttgaatttttt 1544577  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnn 207  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| ||| |           
T  1544578 aacttgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagatgaaagtaacaaaatcgggatgtagaaatcaaattttacgataagctttt 1544677  T
Q  208 gcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |   || |||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  | || |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1544678 gtgaagtaacttttaataatgttcttaacacgtatg-gaaaaattgttcaacaactttaaagtttaagcataaatcaaacaaatttgaattga 1544769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 260
Target Start/End: Original strand, 27727226 - 27727485
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||       ||||||||||||||| | || |||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  27727226 aagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgtacgatttttttgagacaagtttagaatactaagaaaggttcattaacttaaatttagaattt 27727325  T
Q  105 ttt--aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa-ttaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacan 201  Q
    |||  |  || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  27727326 tttttaccataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttcaagataaaatttaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaa 27727425  T
Q  202 nnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctg-taaaaaattgttcaaaa 260  Q
          | | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  27727426 ttttttgtagaggaatttttagtaatgttcttaacacgtgtgcaaaaaaattgttcaaaa 27727485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 44167794 - 44168074
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        ||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44167794 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttataacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 44167893  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||             ||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||| ||| |        
T  44167894 tttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaac-------------gataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttacgataattt 44167980  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||  ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44167981 tttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtc--tacaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 44168074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 111 - 300
Target Start/End: Original strand, 21109452 - 21109642
Alignment:
Q  111 atgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaat-taacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngc 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | || |||||||||||||||||| | |       ||    
T  21109452 atgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaaattaaagataaaaagtaacaaaatctcgatgtagaaatcaaattttgctataattttttgc 21109551  T
Q  210 ataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21109552 agaggaacttttagtaatgttctaaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaagcataaatgaaacaaatttgaattga 21109642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 167 - 300
Target Start/End: Original strand, 4883775 - 4883908
Alignment:
Q  167 caaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaa 266  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4883775 caaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgcataggaacgtttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattattcaaaaactcaa 4883874  T
Q  267 gagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4883875 gagtttaaacataaattaaacaaatttaaattga 4883908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 29155962 - 29156260
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaaca----atatgaaatgttcatttactaaaatttaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |        | ||||||||||||||    ||||| |  ||| |||||| ||||||||||    
T  29155962 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttatgaacaattttttttaaacaagtttagaacattatatatggacggtttatttacaaaaatttaga 29156061  T
Q  101 attttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgaca 200  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || | ||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  29156062 attttttaatttgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagctaaaagcaatagaatctggacatagaaatcaaattttgcgata 29156161  T
Q  201 nnnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
           |   |||| |||||| |||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  29156162 attttttgtggaggacctttta-taatgttcataacatgtctacaagaaattgttcaaaaacttaagagtttaagcataaattatataaatttgaattga 29156260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 38599260 - 38598967
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||        | |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| || ||||||||    
T  38599260 tttgcttaattatctttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaagattcatttactaaaatctataatttttt 38599161  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcgacannnnn 205  Q
    || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |         
T  38599160 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaattttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttt 38599061  T
Q  206 nngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
          |||| | |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  38599060 tt-tggaggaccatttaataacgttcttaacacgtctgtgaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 38598967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 44081253 - 44080958
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||        |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  44081253 aagtttgtttaattatacttaaattcttaaatttttgagcgaatttttttagacaaatttagaatactatgaaaggttcatttactaaaatttaaaattt 44081154  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    || ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||         
T  44081153 ttaaaattgaaattaattaaatatgaattttttaaaacgactaaacatcaagataaaagtaacaaaaatatggacgtagaaattaaattttgcgatcatt 44081054  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||  |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||   ||||  |||||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  44081053 ttttgcggaggaacttttagtattgttcttaacacgtttgcaaaagcatgtttgaaaacttaagagtttaagcat-aattaaacaagtttgaattga 44080958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37540081 - 37539849
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||       |||| |  ||||||||| |   ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37540081 aagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgatttttccgagatatatttagaacatttcaaaaggttcatttactaaaatttagaattt 37539982  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaatt-ttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacann 202  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||  ||| |||| || ||| | |||||||||||||| || |      
T  37539981 tttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttttaaacgacaaaagttcaagataaaagcaacaaaaaattagacttggaaatcaaattttgagataat 37539882  T
Q  203 nnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaa 235  Q
          || ||||||||||||||||||||||||    
T  37539881 tttttacagaggaacttttagtaatgttcttaa 37539849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 33625080 - 33624936
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||        | |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33625080 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttaga--gattttttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 33624983  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagt 151  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33624982 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagt 33624936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 293
Target Start/End: Original strand, 1066490 - 1066691
Alignment:
Q  92 aaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  1066490 aaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacgtagaaataaaa 1066589  T
Q  191 ttttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaa 290  Q
    ||||| ||         ||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || || || |||| ||| |||||||||||    
T  1066590 ttttgagatcattttttgcatatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaa 1066688  T
Q  291 ttt 293  Q
    |||    
T  1066689 ttt 1066691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15130955 - 15130859
Alignment:
Q  55 agacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagt 151  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15130955 agacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaatttttaaatattaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagt 15130859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 81 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 1260358 - 1260142
Alignment:
Q  81 ttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacg 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||   || |||||||| ||     
T  1260358 ttcatttattaaaatttagaattttttaatataaaatgaatta-atatgactttttttaaacaacaaaagttcaagataaaagccacaaaaatttgaaca 1260260  T
Q  180 tagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacata 279  Q
    ||||||| |||||| | || |       |   |||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| | ||||||| || || ||||||||     
T  1260259 tagaaattaaatttagagataattttttgtggaggaacttttagcaatgtttttaacacgtcttcaaaaaattgcttaaaaacttaaaagtttaaacat- 1260161  T
Q  280 aattaaacaaatttgaatt 298  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  1260160 aattaaacaattttgaatt 1260142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 1065931 - 1065795
Alignment:
Q  60 agtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagata 159  Q
    ||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || |||    
T  1065931 agtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaata 1065832  T
Q  160 aaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    ||| |||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||    
T  1065831 aaagtaacaaaaatctagacgtaggaataaaattttg 1065795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 8082048 - 8081814
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||  ||||| ||     
T  8082048 acaagtttagaacattacaaaatgttcgtttactaaaatttagaattatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagac--aagtttaaa 8081951  T
Q  157 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 255  Q
    ||||   |||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || |       | | | |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  8081950 ataattgtaacaaaaatatggacgcagaaataaaattttgagataattttttggagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgtt 8081851  T
Q  256 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  8081850 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 8081814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 298
Target Start/End: Original strand, 9633169 - 9633461
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttg-aacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||        ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  9633169 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttttaatgatattttttagacaagtttataacattataaaaggttcatttactaaaattcataatt 9633268  T
Q  104 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tttggacgtagaaatcaaattttgcgacann 202  Q
    ||| | | |||||  ||||| ||||||||| ||| |||||| |    |||||| ||||| |||||||| ||||||  || |||||| |||||| || |      
T  9633269 tttaact-tgaaataaattaaatatgaattcttttaaacgaaattttttaaagttaaaagtaacaaaaatttggatataaaaatcacattttgagataaa 9633367  T
Q  203 nnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
         ||  |||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9633368 tttttgcggaggaacttttagtaatgttcataaaatatctgcaaaaaattgttc-aaaacttaagagtttaagcat-aattaaacaaatttgaatt 9633461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 186
Target Start/End: Original strand, 10463312 - 10463475
Alignment:
Q  22 cttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaat 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||       |||||||||||| |||| ||  ||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||  |||    
T  10463312 cttaaactcttaaatttttgaacgatctttttgagacaagtttaaaacattacaaaaggttcgtttaccaa--tttagaattttttaaaatgaaattaat 10463409  T
Q  122 tagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaat 186  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  10463410 taaatatgaatttttttaaaagacaaaaatttaagataaaagtaacaaaaatctggacgtagaaat 10463475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 300
Target Start/End: Original strand, 36020005 - 36020090
Alignment:
Q  215 aacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  36020005 aacttttagtaatgttcttgacacatttgtaaaaaattgtttaaaaactcaagagtttaagtataaattaaacaaatttaaattga 36020090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Original strand, 12621625 - 12621861
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||     
T  12621625 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttaaaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacgaaagttcaaa 12621724  T
Q  157 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 255  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| || ||| |||||||| || |       ||| |  ||||||| || |||||||||| || | ||  ||||||||||    
T  12621725 ataaaagtaacaaaaatctggacgcaggaataaaattttgagataattttttgcagataaacttttcgtgatgttcttaatacttgtgctaaaaattgtt 12621824  T
Q  256 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  12621825 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 12621861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8832952 - 8832813
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  8832952 acaagtttagaacattacaaaaggttcatttactaaaatttagacctatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtttaaa 8832853  T
Q  157 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  8832852 ataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaaattttg 8832813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 171
Target Start/End: Original strand, 47139739 - 47139903
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttag-aattttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||       |||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||| | |||||    
T  47139739 tttgtttaattatccttaaacatttaaatttttgaatgatttttttgagacaagtttaaaacattatgcaaggttcatttactaaaatttagtatttttt 47139838  T
Q  107 taatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 171  Q
    | |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||| ||| |  | |||||| ||||||||    
T  47139839 ttatatgaaatgaattaaatatgaattgttttaaatgacagaaggtcgaaataaaaataacaaaa 47139903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 37107922 - 37107808
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||     
T  37107922 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaatttttcaacatgaaataaattaaatataaattttttaaaaagacaaaagttcaaa 37107823  T
Q  157 ataaaattaacaaaa 171  Q
    ||||||  |||||||    
T  37107822 ataaaagcaacaaaa 37107808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 33624869 - 33624788
Alignment:
Q  218 ttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  33624869 ttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaa-ttgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 33624788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 38594756 - 38594642
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||  ||| | ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  38594756 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattatttagcatgaaataaatcaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 38594657  T
Q  157 ataaaattaacaaaa 171  Q
    |||||| ||||||||    
T  38594656 ataaaagtaacaaaa 38594642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Original strand, 27727998 - 27728051
Alignment:
Q  245 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27727998 aaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaatt 27728051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 300
Target Start/End: Original strand, 45958865 - 45958953
Alignment:
Q  212 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtct-gtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  45958865 aggaacttttagtaatgttattaacacgtctacaaaaaaattgtt-aaaaacttaagagtttaagcagaaattaaacaaatttgaattga 45958953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Original strand, 45958726 - 45958815
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaa 94  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  45958726 aagtttgtttaattatttttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaa 45958815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2510778 - 2510672
Alignment:
Q  90 taaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatca 188  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |    
T  2510778 taaaatttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataa 2510679  T
Q  189 aattttg 195  Q
    |||||||    
T  2510678 aattttg 2510672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 9900532 - 9900637
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  9900532 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 9900631  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  9900632 attttg 9900637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 23023517 - 23023622
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  23023517 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 23023616  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  23023617 attttg 23023622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 39035838 - 39035943
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  39035838 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacttaaaaataaa 39035937  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  39035938 attttg 39035943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 291
Target Start/End: Original strand, 42974161 - 42974394
Alignment:
Q  59 aagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatga-attttttaaaacgacaaaagttaaaga 157  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  ||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||  | |    
T  42974161 aagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattatttaacatggaataaattaaatatgatttttttttaaaagacaaaagtttgaaa 42974260  T
Q  158 taaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttc 256  Q
    ||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || |       | | | |||||||| ||||||||||| |||| | || |||||||||||     
T  42974261 taaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaaattttgagataagtttttggagatgaacttttcgtaatgttcttgacacttgtgcaaaaaattgttt 42974360  T
Q  257 aaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaat 291  Q
    |||| || || || |||| ||| ||||||||||||    
T  42974361 aaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaat 42974394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Original strand, 16080779 - 16080868
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||       |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16080779 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttttatgatttctttgagaaaagtttagaacattaagaaatgttcatttactaaaa 16080868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 301
Target Start/End: Original strand, 38199808 - 38199864
Alignment:
Q  245 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattgat 301  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38199808 aaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgat 38199864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 195
Target Start/End: Original strand, 45986190 - 45986289
Alignment:
Q  97 tagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  45986190 tagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaattttg 45986289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 195
Target Start/End: Original strand, 7207993 - 7208099
Alignment:
Q  90 taaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatca 188  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||  ||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |    
T  7207993 taaaaattagaattttttaacatgtaataaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataa 7208092  T
Q  189 aattttg 195  Q
    |||||||    
T  7208093 aattttg 7208099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11620152 - 11620047
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  11620152 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaagctaacgaaaatttggacataaaaataaa 11620053  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  11620052 attttg 11620047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 21202276 - 21202380
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  21202276 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatat-aatttttttaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 21202374  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  21202375 attttg 21202380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 34651581 - 34651686
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| | ||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  34651581 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccgaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 34651680  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  34651681 attttg 34651686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23064552 - 23064446
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatat-gaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatca 188  Q
    |||| |||||||||||||| || | || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |    
T  23064552 aaaaattagaattttttaacattgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacttaaaaataa 23064453  T
Q  189 aattttg 195  Q
    |||||||    
T  23064452 aattttg 23064446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 28924784 - 28924600
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatt--tagaatttt 105  Q
    |||||||||||||| || || |||| || ||||||||||       |||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    || ||||||    
T  28924784 tttgtttaattatctttgaattcttaaagttttgaacgattttttggagacatgtttaaaacattataaaatgttcatttactaaaaaaaatataatttt 28924685  T
Q  106 ttaatatgaaacgaattagatatgaatttttta-aaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaatt 192  Q
    |||| | ||   |||| | |||||||||||||  |||||||||||||| |||| || | |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  28924684 ttaacaaga---gaataa-atatgaattttttttaaacgacaaaagttcaagaaaagagtaacaaaaatctggacgtagaaatcaaatt 28924600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 38593358 - 38593281
Alignment:
Q  215 aacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  38593358 aacttttcgtaatgttcttaacacttttgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 38593281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 5029205 - 5029310
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || | || ||    
T  5029205 aaaaattataattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaatataaa 5029304  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  5029305 attttg 5029310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 28642590 - 28642485
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||  || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  28642590 aaaaattagaattttttaacatataatgaattaaatataatttttttaaaacgttaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaa 28642491  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  28642490 attttg 28642485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 300
Target Start/End: Original strand, 3496423 - 3496478
Alignment:
Q  245 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  3496423 aaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcatgaattaaacaaatttaaattga 3496478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Original strand, 17018437 - 17018528
Alignment:
Q  81 ttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaat 172  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||| || || | ||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||| | || |||||||||||||    
T  17018437 ttcatttacttaaatttataatttcttaacatcaatctaattaaatatgaaagtttaaaaacgccaaaagttagatatcaaattaacaaaat 17018528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 37537553 - 37537487
Alignment:
Q  231 cttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  37537553 cttaacacgcatgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaagcat-aattaaccaaatttgaatt 37537487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 293
Target Start/End: Original strand, 16080975 - 16081055
Alignment:
Q  212 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    |||||||||||||||| || |||||| || |  ||| |||||||| |||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  16080975 aggaacttttagtaatatttttaacatgtatacaaataattgttcgaaaacttaagagtttaagcat-aattaaacaaattt 16081055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 300
Target Start/End: Original strand, 17018571 - 17018656
Alignment:
Q  215 aacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | ||| |||||   || ||||||||||||  |||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  17018571 aacttttaataatgttcttagcacatatgtcaaaaaccatttaaaaactcaagactttaatcataaattaaacaaatattaattga 17018656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17314806 - 17314701
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||| ||| ||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || |||||||||  ||| ||||||||||| || |||| ||    
T  17314806 aaaaattagaattttctaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgcgaaaaattcaagataaaacaaacgaaaatttggacctaaaaataaa 17314707  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  17314706 attttg 17314701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 33772380 - 33772484
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||| ||| | ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  33772380 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatat-aatttttttaaatgccaaaaattcaagataaacctaacaaaaatttggacttaaaaataaa 33772478  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  33772479 attttg 33772484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 46158057 - 46158162
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || ||| || |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||| |||  | |||| ||    
T  46158057 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaaataaatataatttttttaaaacgtcaaaaatttaagataaaactaacgaaaatttagaccaaaaaataaa 46158156  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  46158157 attttg 46158162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 300
Target Start/End: Original strand, 15131588 - 15131624
Alignment:
Q  264 caagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15131588 caagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 15131624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 194
Target Start/End: Original strand, 37108485 - 37108589
Alignment:
Q  92 aaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatat-gaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||  ||| || |||||| ||  |||||||||| || |||||| |||||||||| |||||| | |||| ||    
T  37108485 aaatttagaattttttattatgaaataaattaactatggattttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacggaaaaataaa 37108584  T
Q  190 atttt 194  Q
    |||||    
T  37108585 atttt 37108589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 41571663 - 41571631
Alignment:
Q  131 attttttaaaacgacaaaagttaaagataaaat 163  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41571663 attttttaaaacgacaaaagttcaagataaaat 41571631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 43083383 - 43083327
Alignment:
Q  245 aaaaaattgttcaaaaa-ctcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43083383 aaaaaattgttaaaaaaacttaagagtttaagtataaattaaacaaatttgaattga 43083327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 45983692 - 45983628
Alignment:
Q  132 ttttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  45983692 ttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacttaaaaataaaattttg 45983628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 51)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 15721062 - 15721360
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnn--gagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15721062 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaattttagaat 15721161  T
Q  103 ttttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacan 201  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  15721162 ttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaa 15721261  T
Q  202 nnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
          ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15721262 ttttttgcataggaacttttagtaaagtttttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 15721360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26356826 - 26356528
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  26356826 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttaaaattt 26356727  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||        
T  26356726 tttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgtgacaattt 26356627  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgt---aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26356626 tttgcatagaaacttttagtaatgttcttaacacgcgtgtaaaaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 26356528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10915598 - 10915301
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||       ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10915598 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgatcgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 10915499  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||        
T  10915498 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaaatgttaaagataaaattaacaaaatatggacgtagaaatcaaattatgcgacaattt 10915399  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctg--taaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       | | |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10915398 tttgtaaaggaccttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 10915301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 5974309 - 5974604
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||        |||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  5974309 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttttcagacaagtttagaatactatgaaaggttcattaactaaaatttaaaattt 5974408  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        
T  5974409 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggatgtagaaatcaaattttgcgacaattt 5974508  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       | | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  5974509 tttgtagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 5974604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8710130 - 8709836
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||        |||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  8710130 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttttaagacaagtttagaatactatgaaaggttcattaactaaaatttagaattt 8710031  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  8710030 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 8709931  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       | | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  8709930 tttgtagaggaacttttagtaatattcttaacacgtctgcaaaaaattgttc-aaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 8709836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30661071 - 30660778
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30661071 tttgtttaattatacttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 30660972  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaatt-ttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnn 206  Q
    || || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||          
T  30660971 aacataaaacgaattaaatatgaatttttttaaaacgacaaaagttaatgataaaattaacaaaatctggatgtagaaatcaaattttgcgacaattttt 30660872  T
Q  207 ngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
     ||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  30660871 tgcagatgaacttttagtaatattcttaacatgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 30660778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 295
Target Start/End: Original strand, 17697386 - 17697676
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||        ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17697386 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaacttttgaacgattttttttagaaaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 17697485  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||        
T  17697486 attaagatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttacgacaattt 17697585  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttga 295  Q
       | | |||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17697586 tatgaaaaggagctttttgtaatgttcttaacacgtcttcaaaaaattgttcaaaaactcacgagtttaagcataaattaaacaaatttga 17697676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 5087190 - 5087485
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||         |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5087190 aagtttgtttaattatccttaaactcttaactttttgaacggttgtttttagacaagtttagaacactatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 5087289  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||| || ||||||||||        
T  5087290 tttaacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgaatgtaaaaattaatttttgcgacaattt 5087389  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  5087390 tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttcaaaaagtcaagagtttaagcataaattaaacatatttgaattga 5087485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1821274 - 1820983
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||       |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1821274 aagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttataacattatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 1821175  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||        
T  1821174 tttaacattaaatgagttaaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaagataaaat--acaaaatttggacgtagaaatcaaattttgtgacaactt 1821077  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  1821076 tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaatacgtatgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaa--aaacaaatttgaattga 1820983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 844402 - 844106
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  844402 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 844303  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagat-aaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||| |       
T  844302 tttaacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaagttaaagataaaaagtaacaaaatctgaatgtagaaatcaaattttgcgataatt 844203  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||| ||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  844202 ttttgcagaggaacttttagtaatgttctaaatatgtctgcaaaaagttgttcaaaaacttaagagtttaaacataaattaagcaagtttgaattga 844106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 29691911 - 29692205
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       |||||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29691911 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaaacttaaaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 29692010  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
     |||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |        
T  29692011 attaacatgaaaagaattaaatatgaatttttcaaaacgacaaaagttaaagatataagtaacaaaatatggacgttgaaatcaaattttgtgagaattt 29692110  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattg 299  Q
       ||| |||||||||| ||||| |  |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29692111 tttgcagaggaactttttgtaatatgtttaacacgtctacaaaaaattgttgaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattg 29692205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 939139 - 938845
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||       |||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  939139 aagtttgtttaattatcctcaaactcctaaattttcgaacgatttttttgagacatgtttagaacactttgaaaggttcatttactaaaatttaaatttt 939040  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |        
T  939039 tttaacatgaaatgaattaaatatgattttttttaaaagacaaaagttaaagataaaagcaacaaagtctggacgtagaattcaaattttgcgataattt 938940  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattg 299  Q
       ||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  938939 attgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattg 938845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 300
Target Start/End: Original strand, 861362 - 861655
Alignment:
Q  9 ttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttta 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||       |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  861362 ttgtttaattatttttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagaaaagttttgaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttta 861461  T
Q  109 atatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagat-aaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnn 207  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |           
T  861462 acatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaaagtaacaaaatctggatgtagaaatcaaattttgcgataatttttt 861561  T
Q  208 gcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaa-cataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  861562 gccgaggaacttttagtaatgttctaaatatgtctgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaaagcataaattaagcatatttgaattga 861655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 54 - 297
Target Start/End: Original strand, 33518406 - 33518648
Alignment:
Q  54 gagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33518406 gagacaagtttagaacactatgaaaggtttattaactaaaatttagaattttt-aacctaaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagtta 33518504  T
Q  154 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33518505 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgtgacaattttttgcagatgaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaaattg 33518604  T
Q  254 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaat 297  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  33518605 ttcaaaaactcaagagtataagcatacattaaacaaatttgaat 33518648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 80 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2087657 - 2087438
Alignment:
Q  80 gttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2087657 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgagccgaattaaatatgaattttttaaaacgataaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacg 2087558  T
Q  180 tagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacata 279  Q
    |||||||||||||||  ||||       ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  2087557 tagaaatcaaattttatgacaattttttgcagatgaacttttagtaatgttcttaacatgtctgtaaaaatttgttcaaaaact-aagagtttaagcata 2087459  T
Q  280 aattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2087458 aattaaacaaatttgaattga 2087438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 22731997 - 22732293
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaat-ttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatt 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||        |||||||||||||||| | | | |||||||||||| |||||||||| ||    
T  22731997 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaaaattttgaacgaattttttaagacaagtttagaacactgtaatatgttcatttaccaaaatttagattt 22732096  T
Q  104 tttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacann 202  Q
    |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||      
T  22732097 tttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaatgttaaagataaaattaacaaagtctggccgtagaaatcaaattttgcgacaat 22732196  T
Q  203 nnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
         ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  22732197 tttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaatacgtatgt-aaaaattgtttaaaaactcaagagtttaagcatagtttaaacaaatttgaattga 22732293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 5079506 - 5079802
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnn-gagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatt 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||        ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||   ||    
T  5079506 aagtttgttaaattatccttaaagtcttaaatttttaaacgattttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttaatttt 5079605  T
Q  104 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| | |       
T  5079606 ttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcaataact 5079705  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5079706 ttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 5079802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30493004 - 30492761
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  30493004 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaagggttcatttactaaaatttataattt 30492905  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||        
T  30492904 tttaacatgaaacgagttaaatataatttttttaaaatgaaaaaagttaaagataaaataaacaaaatctggacgtagaaat-aaattttgcgacaattt 30492806  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaa 249  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30492805 ttagcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgaaaaaa 30492761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20510725 - 20510491
Alignment:
Q  54 gagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 153  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20510725 gagacaaatttagaacactatgaaaggttcattaactaaaatttagaattttttaacatgaatcgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 20510626  T
Q  154 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 253  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||       | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||              
T  20510625 aagataaaattaacaaaatctggacgtagaaattaaattttacgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacatctg---------- 20510536  T
Q  254 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
      |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20510535 --caaaaactcaagagtttaagcataaaataaacaaatttgaattga 20510491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 18502992 - 18503274
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| | |||    
T  18502992 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttaaatttt 18503091  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    |||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |         
T  18503092 tttaacctgaaacgaattacatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcggc----- 18503186  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  18503187 --------ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaagaaatttgaattga 18503274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Original strand, 33744665 - 33744958
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||        | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  33744665 tttgcttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattttttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 33744764  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa-caaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcgacannnnn 205  Q
    || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |         
T  33744765 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaataaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttt 33744864  T
Q  206 nngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       |  |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  33744865 tt-cggaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaacattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 33744958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 14256151 - 14256440
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |       | |||||  |   |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14256151 aagtttgtttaattatccttaaattcttaaatttttgaac-aattttttgtgacaaactcgaaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 14256249  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
     |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        
T  14256250 attaacatgaaaagaattaaatatgaatttttcaaaacgacaaaagttaaa------agtaacaaaatttggacgttgaaatcaaattttgcgacaattt 14256343  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt-caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14256344 tttgcagaggaacttttagtaatgtttttaacatgtctaccaaaaattgttaaaaaaactcaagagtttaagcataaattaaataaatttgaattga 14256440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12482047 - 12481801
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12482047 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttgctaaaatttagaatttttt 12481948  T
Q  108 -aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnn 206  Q
     || || |||  ||||| |||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||          
T  12481947 taacataaaataaattaaatataaatattttaaaacgaaagaagttaaagataaaattaacaaaatcaggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttt 12481848  T
Q  207 ngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 253  Q
     | |  |||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  12481847 tgtagcggaatttttagtattgtgcttaacacgtctgcaaaaaattg 12481801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20977658 - 20977467
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||       
T  20977658 aagtttgtttaactatccttaaactcttaaatttttgaacgatattttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaatatttaaaaaaa 20977559  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag-ataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    ||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20977558 tttaacatgaaaagaattaaatgtgaattttttaaaacgacaaaaattaaagaataaaaataacaaaatctggacgtagaaatcaaattttg 20977467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 17245875 - 17245717
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  17245875 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaattt 17245776  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaat 163  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  17245775 tttaacatgaaacgaaataaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaat 17245717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 28476187 - 28476486
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaat----ttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||    ||||||||||       |||||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28476187 aagtttgtttaattattcttaaattcttaaataaatttttgaacgatttttttgagacaaacttaaaacactatgaaaggttcatttactaaaatttaga 28476286  T
Q  101 attttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgaca 200  Q
    |||| |||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28476287 atttattaacatgaaaagaattaaatataaatttttcaaaacgacaaaagttaaagatataagtaacaaaatatggacgttgaaatcaaattttgtgaca 28476386  T
Q  201 nnnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtct-gtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattg 299  Q
            || || ||| ||||||||| |  |||| || |||   ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28476387 atttttt-cagagaaacatttagtaatatgtttaatacatctaccaaaaaattgttgaaaaactcaaaagtttaaacataaattaaacaaatttaaattg 28476485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20977292 - 20977101
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||       
T  20977292 aagtttgtttaactatccttaaactcttaaatttttgaacgattgttttaagacaagtttagaacactatgaaaggttcattttctaatatttaaaaaca 20977193  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag-ataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
     |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20977192 attaacatgaaaagaagtaaatatgaattttttaaaacgacaaaaattaaagaataaaaataacaaaatctagacgtagaaatcaaattttg 20977101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3375585 - 3375394
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||  ||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  3375585 aagtttctctaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacattacaaaatgctcgtatactaaaatttggaattt 3375486  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    ||||| || ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||||||||    
T  3375485 tttaacataaaatgaattaaatatgaatatttttaaacgacaaaagttcaagataaaattatcaaaaatctgaacgtagaaataaaattttg 3375394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 300
Target Start/End: Original strand, 11400122 - 11400364
Alignment:
Q  59 aagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagat 158  Q
    |||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  11400122 aagtttagaacactataaaacattcatttactaaaattaacaattttctaacatgaaactaattaaatataaattttttaaaacgccaaaagttacatat 11400221  T
Q  159 aaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcatag-gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaa-ttgttc 256  Q
    |||||||||||||| ||||| |  |||| ||| ||| |||||        || ||  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    ||     
T  11400222 aaaattaacaaaatctggacatttaaataaaagtttacgacaatttttt-caaagataatttttagtaatgttcttagcacgtatgtaaaaaaccattta 11400320  T
Q  257 aaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11400321 aaaaactcaagagtttaatcataaattaaacaaatttgaattga 11400364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 34046682 - 34046544
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatt- 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||     
T  34046682 aagtttgtttaattatccttaaattcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaattt 34046583  T
Q  104 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaac 142  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  34046582 ttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttaaaaac 34046544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Original strand, 3914474 - 3914709
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||     
T  3914474 acaagtttagaacattacaaaaagttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattagatatgaaattttttaaaagacaaaagttcaaa 3914573  T
Q  157 ataaaattaaca-aaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 255  Q
    |||||| ||||| |||| | ||||||||||| |||||||| || |       ||| | |||| ||| |||||||||||||||| | ||  ||||||| ||    
T  3914574 ataaaactaacagaaatctagacgtagaaataaaattttgagataattttttgcagatgaacattttgtaatgttcttaacacttgtg-caaaaattatt 3914672  T
Q  256 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    ||||| || || || |||||||| ||||||||||||||    
T  3914673 caaaatcttaaaagtttaaacat-aattaaacaaattt 3914709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Original strand, 21108119 - 21108355
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||| |||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  21108119 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttataattatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 21108218  T
Q  157 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 255  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || |       | | | ||| |||| |||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  21108219 ataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaaattttgagatatttttttggagatgaaattttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgtt 21108318  T
Q  256 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  21108319 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 21108355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Original strand, 20897811 - 20897947
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnng-agacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaa-t 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         |||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  20897811 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattattttttagacaagtttaagacgctatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 20897910  T
Q  103 tttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaa 139  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  20897911 tttttaacatgaaacgaattaaacatgaattttttaa 20897947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 300
Target Start/End: Original strand, 20898115 - 20898275
Alignment:
Q  131 attttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgtt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||| ||          |  ||||| |||||||||||||    
T  20898115 attttttaaaacgacaaaagttaaagataaaatt---------tggacgtagaaatcaaattttgtgattttttttttcggaggaagttttagtaatgtt 20898205  T
Q  231 cttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||| | ||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20898206 cttaagaagtcttaaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaagcataaattaaaaaaatttgaattga 20898275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 289207 - 289005
Alignment:
Q  90 taaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatca 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||| || |||||| |||| ||||| |||||| |||||| |    
T  289207 taaaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatggattttttaata-gacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataa 289109  T
Q  189 aattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaaca 288  Q
    ||||||| || |       ||| | ||| |||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || ||  | |||| ||| |||||||||    
T  289108 aattttgagataattttttgcagatgaagttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaatgtttaagcat-aattaaaca 289010  T
Q  289 aattt 293  Q
    |||||    
T  289009 aattt 289005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17244624 - 17244540
Alignment:
Q  216 acttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  17244624 acttttagtaatgttcttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacatatttgaattga 17244540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 30353126 - 30353252
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttaga--at 102  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||   |    
T  30353126 aagtttatttaattatctttaaacacttaaatttttgaacgattttttt-agacaagtttagaacattatgaaaggttcacttactaaaatttagagttt 30353224  T
Q  103 tttttaatatgaaacgaattagatatga 130  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30353225 tttttaacatgaaacgaattaaatatga 30353252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 293
Target Start/End: Original strand, 289438 - 289647
Alignment:
Q  86 ttactaaaatttagaatttttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac--aaaatttggacgtag 182  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  289438 ttactaaaaattagaatttttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaaatctggacgtag 289537  T
Q  183 aaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaat 282  Q
    |||| |||||||  || |       ||| |  |||||||  | ||||||||||||| | || |||||||||||||||| || || || |||| ||| |||    
T  289538 aaataaaattttaagataattttttgcagataaacttttcatgatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aat 289636  T
Q  283 taaacaaattt 293  Q
    |||||||||||    
T  289637 taaacaaattt 289647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 12783434 - 12783539
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  12783434 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataacttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 12783533  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  12783534 attttg 12783539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13400380 - 13400275
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  13400380 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 13400281  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  13400280 attttg 13400275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16270385 - 16270286
Alignment:
Q  97 tagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  16270385 tagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaattttg 16270286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 300
Target Start/End: Original strand, 17246321 - 17246376
Alignment:
Q  245 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17246321 aaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 17246376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 19693146 - 19693251
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  19693146 aaaaattataattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 19693245  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  19693246 attttg 19693251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 178
Target Start/End: Original strand, 31280029 - 31280117
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggac 178  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  31280029 aaaaattagaattttttaatatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgctaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggac 31280117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2857543 - 2857444
Alignment:
Q  97 tagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  2857543 tagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttagacctaaaaataaaattttg 2857444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 194
Target Start/End: Original strand, 8235174 - 8235365
Alignment:
Q  3 tcaagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaat 102  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||        | | | |||||||| | ||| |||  |||||||||||| ||||| |||    
T  8235174 tcaaatttgtttaattaaccttacactctttaatttttgaatgaattttcgtaaaaatgtttagaagattataaaaatttcatttactaatatttataat 8235273  T
Q  103 tttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa-ttaacaaaatttggacgtagaaatcaaatttt 194  Q
     | ||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||  | || |||||||||||||||    
T  8235274 ctcttaatatgacatgaattaaacatgaatttttt-aaacatcaaaagttcaagataaaagtaaacaaaatcagaacatagaaatcaaatttt 8235365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 159
Target Start/End: Original strand, 30916776 - 30916855
Alignment:
Q  80 gttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagata 159  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||| || | | |||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30916776 gttcatttattaaaatttaaaattttataacataagatgaattaaatataaatttttttaaacgaaaaaagttaaagata 30916855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15054003 - 15053905
Alignment:
Q  98 agaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    |||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||  ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  15054003 agaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaaattttg 15053905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 945850 - 945955
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||| ||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||| ||| || |||| ||    
T  945850 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttgttaaaacgaaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttagacctaaaaataaa 945949  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  945950 attttg 945955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 44
Target Start/End: Original strand, 16736655 - 16736691
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaac 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16736655 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaac 16736691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5079053 - 5079000
Alignment:
Q  245 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
    ||||||||||| ||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5079053 aaaaaattgttaaaaacttaaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaatt 5079000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Original strand, 5917 - 6209
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||       ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5917 aagtttgtttaattatccttaaactcttgattttttgaacgatttttttgagacaagtttggaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 6016  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||        
T  6017 tttaacatcaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgaacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 6116  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaat 297  Q
       |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6117 tttgcatagtaacttttagtaatgttcttaacacgtttgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaat 6209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 96)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25250313 - 25250016
Alignment:
Q  1 attcaagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttaga 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||       ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25250313 attcaaatttgttaaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttaga 25250214  T
Q  101 attttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25250213 attttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaaaataaaat--acaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgaca 25250116  T
Q  201 nnnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
           |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25250115 attttttgcatagaaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattattcaaaaactcaagagtttaaatataaattaaacaaatttgaattga 25250016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 38174197 - 38173902
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||       || |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| | |||    
T  38174197 aagtttatttaattatctttaaactcttaaattattgaacgatttttttgaaacaagtttagaacactatgaaaggttcatatactaaaatttaaatttt 38174098  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||        
T  38174097 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacagaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctagacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 38173998  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38173997 tttgtataggaacttttagtaatgttcttaacacgcctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 38173902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 45419785 - 45420078
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45419785 aagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacattatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 45419884  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        
T  45419885 tttaacattaaatgagttaaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaatataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 45419984  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  45419985 tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaa--aaacaaatttgaattga 45420078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 53517784 - 53518079
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||         || ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  53517784 aagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgatttttttatgataagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaaatt 53517883  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||        
T  53517884 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaaagacaaaagttaaagataaatttaacaaattctggacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 53517983  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       | | | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53517984 tttgtagatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaaaagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 53518079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 55 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21749811 - 21749566
Alignment:
Q  55 agacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaa 154  Q
    |||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21749811 agacaagtttagaatactgtgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattaaaaatgaattttttaaaacgacaaaagttaa 21749712  T
Q  155 agataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgt 254  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||       |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21749711 agataaaattaacaaaatctggacgtagaaattaaattttaagacaattttttgcatagaaacttttagtaatgttcttaacacgttcgtaaaaaattgt 21749612  T
Q  255 tcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21749611 tcaaaaactcaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 21749566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29348567 - 29348275
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||        |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29348567 aagtttgtttaattatatttaaactcttaaatttttgaacgattttttt-agacaaatttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 29348469  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||        
T  29348468 tttaacataaaacgaactaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtaaaaatcaaattttgcgacaattt 29348369  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29348368 tttgcaaaggaacttttagtaatattcttaacacttctgcaaaaaattgttcaaaaactca--agtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 29348275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 44808839 - 44809135
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnng-agacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatt 103  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||         ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44808839 aagtttgttcaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttagacaggtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 44808938  T
Q  104 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    |||||| || ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||       
T  44808939 ttttaacataaaatgaattaaatatgaatttttaaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaattttgacgtaaaaatcaaattttgcgacaact 44809038  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44809039 ttttgcaaaggaacttttagtaatattcttaacacgtgtgcaaaaaattgtttaaaaactccagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 44809135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 293
Target Start/End: Original strand, 23883390 - 23883678
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |        |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  23883390 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaattttagaacaattttttttagacaagtttagaacactataaaaggttcatttactaatatttacaattt 23883489  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||        
T  23883490 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaacttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgtaacaattt 23883589  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
       ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23883590 tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaactccagagtttaagcataaattaaacaaattt 23883678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 40762600 - 40762895
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||        | |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||| ||||||||    
T  40762600 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaaattttgaacgattttttttaaacaagtttagaacactatgaaagattcaattactaaaatctagaattt 40762699  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |        
T  40762700 tttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagatgaaattaacaaaatcttgacgtagaaatcaaattttacgataatat 40762799  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       | | |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40762800 tttgtagaggagcttttagtaatgttcttaacacgtctatcaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 40762895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27492609 - 27492313
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27492609 aagtttgtttaattatccttaaactcccaaatttttgaacgatatttttgagacaagtttagaacactatgaaatgttcatttattaaaatttagaattt 27492510  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagat-aaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |       
T  27492509 tctaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaaaagttaaagataaaaagtaacaaaatttggatgtagaaatcaaattttgcgataatt 27492410  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||  || |||||||||||||||| | |||| || || ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27492409 ttttgcggagaaacttttagtaatgttttaaacatgtatgcaaaaaattgttcaaaaacctaagaatttaaacataaattaaacaaatttgaattga 27492313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37179237 - 37178941
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37179237 aagtttgtttaattatccttaaattcttaaaattttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 37179138  T
Q  105 ttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    ||| || || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |       
T  37179137 ttttaacatcaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaatgtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataatt 37179038  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37179037 ttttgcggatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctataaaaaattgttaaaaaatttaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 37178941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 32147271 - 32146996
Alignment:
Q  25 aaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattag 124  Q
    |||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  32147271 aaactcttaaatttttgaacgattttttggagacaagtttagaacactatgaaatgttcaattactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaa 32147172  T
Q  125 atatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagt 224  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |       ||  |||||||||||||    
T  32147171 atatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataagagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttagt 32147072  T
Q  225 aatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  32147071 aatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattagacaaatttgaattga 32146996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23917615 - 23917328
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||       ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||| ||||   |||     ||    
T  23917615 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttttgagacaaatttagaatactatgaaaggttcattaactatttttt-----tt 23917521  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| |||||||||||   ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        
T  23917520 tttaacatgaaacgaat---ataggaatttcttaaaacgacaaaagttaaaaataaaattaacacaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 23917424  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  23917423 tttgcagagaaacttttagtaatgttcttaacacgtttgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaacttgaattga 23917328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11045700 - 11045404
Alignment:
Q  3 tcaagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaat 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||       ||||||||||||||| | |  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11045700 tcaagtttgtt-aattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttttgagacaagtttagaatagtgagaaaggttcatttactaaaatttagaat 11045602  T
Q  103 tttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacann 202  Q
    ||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  11045601 tttttaccataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttcaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaat 11045502  T
Q  203 nnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtc-tgt-aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
         ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||| | |||  ||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11045501 tttttgcagaggaacttttagcaattttcttaatacgacgtgtgcaaagaatgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaaattgaatt 11045404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 50615084 - 50615366
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||||    
T  50615084 aagtttgtttaattttccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaaaaaaatttagaattt 50615183  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |         
T  50615184 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcggc----- 50615278  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
            ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  50615279 --------ggaacttttagtaatattcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 50615366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 117447 - 117729
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| | |||    
T  117447 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttaaatttt 117546  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |         
T  117547 tttaacatgaaacgaattaaaaatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcggc----- 117641  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
            |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  117642 --------ggaacttttagtaatgttcttaacacatctaaaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 117729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11294089 - 11293800
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11294089 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgacttcttttacacaagtttagaacactatgaaaagttcatttactaaaatttagaattt 11293990  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtt-aaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||       
T  11293989 tttaagatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggtaaaagttaaaagataaaataaacaaaatctggacttagaaataaaattttgcaacaatt 11293890  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaaca---cgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        |||||||          |||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  11293889 ttttgcatagg----------aatgttcttaacacgtcgtctgcaaaaaattgttcaaaaattcaagagtttaagcatagattaaacagatttgaattga 11293800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19669988 - 19669699
Alignment:
Q  12 tttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt-aat 110  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||     
T  19669988 tttaattattcttgaactcttaaatttttgaacgattttttt-agacaagtttagaacactatcaaaggttcaattactaaaatttagaatttttttaac 19669890  T
Q  111 atgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngca 210  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| | |       ||     
T  19669889 atgaaacgaattaaatacgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcaataactttttgcg 19669790  T
Q  211 taggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaac-tcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19669789 gaggaacatttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 19669699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 53397343 - 53397095
Alignment:
Q  54 gagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaata--tgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagt 151  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  53397343 gagaaaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattttttaaaacatgaaacaaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagt 53397244  T
Q  152 taaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaat 251  Q
    |||||||| || ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |       ||  ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  53397243 taaagatagaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataaatttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtcgacaaaaaat 53397144  T
Q  252 tgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53397143 tgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 53397095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 45235344 - 45235641
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        ||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  45235344 aagtttgtttaattatccataaactcttaaattttttaacggttttattgagacaagtttagaacactttgaaaggttcaattactaaaatttagaatat 45235443  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaa-gttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcga-cann 202  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||| || |||  |||| ||||| || |||| |||||||||||  |      
T  45235444 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgataaaattttaaagatacaagtaattaaatctggacatataaataaaattttgcgataaat 45235543  T
Q  203 nnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
         ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45235544 tttttgcggaggaacttttaataatgttcttaacacgtctataaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 45235641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Original strand, 39562552 - 39562839
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |        | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  39562552 tttgcttaattatccttaaactcttaaattttttaacaattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 39562651  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcgacannnnn 205  Q
    || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |         
T  39562652 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataactaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttt 39562751  T
Q  206 nngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttg 294  Q
       |  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  39562752 tt-cggaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttg 39562839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 45406955 - 45406701
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  45406955 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttataagaaaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttct 45406856  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaaga-taaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnn 206  Q
    || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||             
T  45406855 aacatgaatcgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagattaaaagtaacaaaatctggatgtaaaaatcaaattttgcg--------- 45406765  T
Q  207 ngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaa 274  Q
         || |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  45406764 ----gagaaacttttagtaatgttctaaacatgtctgcaaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaa 45406701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 53439556 - 53439324
Alignment:
Q  54 gagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 153  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  53439556 gagaaaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaa-tttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagtta 53439458  T
Q  154 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 253  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| || |||| ||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  53439457 aagataaaagtaataaaatttggacatataaataaaattttgcg-------------gaggaacttttagtaatgttcttaacacgtcgaaaaaaaattg 53439371  T
Q  254 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    || ||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53439370 ttaaaaaacgtaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 53439324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 32943281 - 32943000
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32943281 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagttttgaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 32943182  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||| ||||||||     ||||||| ||         ||| || |||||||||||||||| |        
T  32943181 tttaatattaaaagaattaaatatgaat-ttttgaaacaacaaaagt----aataaaatcaa---------gacatataaatcaaattttgcgataattt 32943096  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32943095 tttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 32943000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 46295345 - 46295051
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||        | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  46295345 tttgcttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 46295246  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgac-aaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcgacannnn 204  Q
    || || |||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |        
T  46295245 aacattaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatatttt 46295146  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        |  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  46295145 ttt-cggaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaatttgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 46295051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 261
Target Start/End: Original strand, 44557579 - 44557822
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||   |||    
T  44557579 aagtttgtttaattatccttaatctcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttaattttt 44557678  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||              
T  44557679 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaataataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaatttt---------- 44557768  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaa 261  Q
       |||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  44557769 ---gcagcggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaa 44557822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19601790 - 19601549
Alignment:
Q  61 gtttagaaca--atatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagat 158  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  19601790 gtttagaacactatatgaaaggttcatttgctaaaatttagaattttttaacacgaaattaattaaatatgaatgttttaaaatgacaaaagttcaagat 19601691  T
Q  159 aaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttca 257  Q
    |||| |||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||| |       |   |||||||||||||||||||||||||| || || |||| | |||| |    
T  19601690 aaaagtaacaaaaatctggatgtagaaattaaattttgcgataattttttgtggaggaacttttagtaatgttcttaacatgtttgcaaaagaatgttaa 19601591  T
Q  258 aaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19601590 aaaacataagagtttaaacat-aattaaacaaatttgaattga 19601549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28685495 - 28685303
Alignment:
Q  106 ttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnn 205  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||              
T  28685495 ttaatattaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaagataaaattaataaaatttggacatataaattaaattttg-----atttt 28685401  T
Q  206 nngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattgatga 303  Q
       |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| || |||| |||||||||    
T  28685400 ttacggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaataattgttcaaaaacttaagagtttaagcataaattaatcacatttaaattgatga 28685303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 298
Target Start/End: Original strand, 54268922 - 54269138
Alignment:
Q  82 tcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgt 180  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||  ||| |||| |||||| |    
T  54268922 tcatttcctaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatataaatttttttaaacgacaaaaaatcaagataaaagcaacaaaaaattggactt 54269021  T
Q  181 agaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataa 280  Q
    ||||||||||||||| || |        || ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  54269022 agaaatcaaattttgagataattttttacagaggaacttttagtaatgttcttaacacgcatgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaagcat-a 54269120  T
Q  281 attaaacaaatttgaatt 298  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  54269121 attaaccaaatttgaatt 54269138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 152
Target Start/End: Original strand, 23921075 - 23921220
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        ||| ||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  23921075 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttt-agataagtttataacactatgaaaggctcattttctaaaatttagaattt 23921173  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtt 152  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23921174 tttaacatgaaa-gaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtt 23921220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9018260 - 9018125
Alignment:
Q  60 agtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagata 159  Q
    |||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9018260 agtttataacactgtgaaaggttcatttacaaaaatttagaattttttaacatgaaataaattcaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagata 9018161  T
Q  160 aaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    |||| |  ||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  9018160 aaataacaaaaatatggaagtaaaaatcaaattttg 9018125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 31991308 - 31991074
Alignment:
Q  59 aagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagat 158  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||    
T  31991308 aagtttagaacattacaaaaggtttgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaataagaatttttttaaaagacaaaagttcaaaat 31991209  T
Q  159 aaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttca 257  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||| || |       ||| |  ||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||||||||    
T  31991208 aaaagtaacaaaaatttggacgcagaaataaaattttgagataagtttttgcaaataaacttttcgtaatgtttttaacacttgtgcaaaaaattgttca 31991109  T
Q  258 aaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    ||| || || || |||||||| ||||||||||||||    
T  31991108 aaatcttaaaagtttaaacat-aattaaacaaattt 31991074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 269
Target Start/End: Original strand, 44287768 - 44288027
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||       ||| ||| ||||||| |  | | || |||||||| ||||||||||||||||    
T  44287768 aagtttgtttaattatccttaaattcat-aatttttgaacgatttttttgagtcaattttagaatatcacggaaggttcatttgctaaaatttagaattt 44287866  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||       | |       
T  44287867 tttaacatgaaatgaattaaatatgaatttttttaaacgacgaaggtttaagataaaagtaacaaaaaattggacgtagaattcaaa-------agataa 44287959  T
Q  204 nnnngcat--aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagag 269  Q
        | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  44287960 ttttgtatggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtcaaaagttgttcaaaaacttaagag 44288027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 92 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 33475677 - 33475471
Alignment:
Q  92 aaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  33475677 aaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacgtagaaataaaa 33475578  T
Q  191 ttttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaa 290  Q
    ||||| || |       | | | |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || || || |||| ||| |||||||||||    
T  33475577 ttttgtgataattttttgtagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaa 33475479  T
Q  291 tttgaatt 298  Q
    ||| ||||    
T  33475478 tttaaatt 33475471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 34995823 - 34995564
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnng-agacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||       | | |||  ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34995823 tttgtttaattatccttaaactattaaattttagaacgatttttttggaaacacttttagaacattataaaaggttcatttactaaaatttagaattttt 34995724  T
Q  107 taatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnn 206  Q
    ||| |||| | |||||| |||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||| | || ||  ||||||||||||||||| |||||    |          
T  34995723 taacatgagatgaattaaatatgattttttttaaatgacaaaatttcaagataaaagtcac-aagcttggacgtagaaatcaatttttgaactaattttt 34995625  T
Q  207 ngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaag 267  Q
     |   || |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34995624 cgtggagcaacttttagtaatgttttgaacacgtctataaaaaattgttcaaaaactcaag 34995564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 293
Target Start/End: Original strand, 41927919 - 41928126
Alignment:
Q  85 tttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtaga 183  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| || |||||| |||| |||||||||||| |||    
T  41927919 tttactaaaatttagaactttttaatatgaaataaattaaatatgaattttttaaa--gacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatttggacgcaga 41928016  T
Q  184 aatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttc-ttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaat 282  Q
    ||| ||||||||  | |       ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||| || || || |||| ||| |||    
T  41928017 aataaaattttgatataattttttgcatatgaacttttcgtaatgttctttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aat 41928115  T
Q  283 taaacaaattt 293  Q
    |||||||||||    
T  41928116 taaacaaattt 41928126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 92 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 44556125 - 44555919
Alignment:
Q  92 aaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaa 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  44556125 aaatttagaattttttattatgaaataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaattaacaaaattctggacgcagaaataaaa 44556026  T
Q  191 ttttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaa 290  Q
    ||||| || |       ||| | |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || || || |||| ||| |||||||||||    
T  44556025 ttttgagataattttttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaa 44555927  T
Q  291 tttgaatt 298  Q
    ||| ||||    
T  44555926 tttaaatt 44555919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 52701404 - 52701168
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  52701404 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaggacaaaagttcaaa 52701305  T
Q  157 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 255  Q
    |||||| |||| ||||| | |||| | |||| |||||||| || |       | | | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  52701304 ataaaagtaacaaaaatctagacgcataaataaaattttgagataattttttggagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgtaaaaaattgtt 52701205  T
Q  256 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  52701204 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 52701168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Original strand, 8575953 - 8576191
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaa-ttttttaaaacgacaaaagttaaa 155  Q
    |||||||||||||| ||  | | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||    
T  8575953 acaagtttagaacattacaagaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttttaaaagacaaaagttcaa 8576052  T
Q  156 gataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagt-aatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 253  Q
     |||||| |||| ||||| | |||  |||||| |||||||| || |       ||||| ||||||||  | |||||||||||||| | || |||||||||    
T  8576053 aataaaagtaacaaaaatctagacacagaaataaaattttgagataattttttgcatatgaacttttcctaaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattg 8576152  T
Q  254 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    ||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||    
T  8576153 ttcaaaatcttaaaagtttaaacat-aattaaacaaattt 8576191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 298
Target Start/End: Original strand, 15772003 - 15772157
Alignment:
Q  144 acaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtct 242  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |       ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15772003 acaaaagttcaagataaaagaaacaaaaatttcgacgtagaaatcaaattttgagataattttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtct 15772102  T
Q  243 gtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
      ||||||||||| ||||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15772103 acaaaaaattgtttaaaaacttaagattttaagcat-aattaaacaaatttgaatt 15772157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 25232900 - 25232695
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaa-ttttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaa 155  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  25232900 acaagtttagaacattagaaaaggttcgtttactaaaatttagaaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtttaa 25232801  T
Q  156 gataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgt 254  Q
     |||||| |||| ||||| |||||| | |||| |||||||| || |       | | | ||| |||| |||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  25232800 aataaaagtaacaaaaatctggacgcataaataaaattttgagataattttttgtagatgaaattttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgt 25232701  T
Q  255 tcaaaa 260  Q
    ||||||    
T  25232700 tcaaaa 25232695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 41927501 - 41927361
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  41927501 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactgaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 41927402  T
Q  157 ataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgc 196  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| |||||| || ||||||    
T  41927401 ataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaatttttgc 41927361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 215 - 298
Target Start/End: Original strand, 3173719 - 3173802
Alignment:
Q  215 aacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3173719 aacttatagtaatgttcttaacgcgtctgcaaaaaattgttcaaaaattcaagaatttaatcataaattaaacaaatttgaatt 3173802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 300
Target Start/End: Original strand, 37481262 - 37481351
Alignment:
Q  212 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaac-tcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  37481262 aggaacttttagtaatgttcttaacacatctataaaaaattgttaaaaaacattaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 37481351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Original strand, 33476241 - 33476477
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||| ||     
T  33476241 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatataaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 33476340  T
Q  157 ataaaa-ttaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 255  Q
    |||||| | || ||||| |||||| |  ||| |||||||| || |       ||| |  ||||||| || |||||||||| || | || |||||||||||    
T  33476341 ataaaagtaaaaaaaatctggacgcatgaataaaattttgagataattttttgcagataaacttttcgtgatgttcttaatacctgtgcaaaaaattgtt 33476440  T
Q  256 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  33476441 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 33476477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 45387566 - 45387449
Alignment:
Q  146 aaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgta 245  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |       || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  45387566 aaaagtaaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattttttgcgtaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctaca 45387467  T
Q  246 aaaaattgttcaaaaact 263  Q
    |||||||||| |||||||    
T  45387466 aaaaattgttaaaaaact 45387449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 152
Target Start/End: Original strand, 44556687 - 44556782
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtt 152  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44556687 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtt 44556782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 53377412 - 53377326
Alignment:
Q  212 aggaacttttagtaatgttctt--aacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaa 296  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  53377412 aggaacttttattaatgttcttttaacacgtctgcaaacaattgttcaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaa 53377326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 53377511 - 53377430
Alignment:
Q  55 agacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttt 136  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  53377511 agacaaatttagaacactctgaaaggttcatttactaaaatttagaattttctaacatggaacgaattaaatatgaattttt 53377430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 262
Target Start/End: Original strand, 26268645 - 26268826
Alignment:
Q  80 gttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa-caaaatttggac 178  Q
    |||||||||||||| |||    |||||||| || | | |||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||  ||||| ||| |    
T  26268645 gttcatttactaaattttttttttttttaacataagatgaattaaatatgaattttttaa--cgacaaaagttcaagataaaagtaataaaaatatgggc 26268742  T
Q  179 gtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaac 262  Q
    ||||||||||||||||| |  |       ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||    
T  26268743 gtagaaatcaaattttgagctaattttttgcagagaaacttttagtaatgttcttaatacgtctacaaaaaattgttcgaaaac 26268826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 28055364 - 28055253
Alignment:
Q  85 tttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtaga 183  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |    
T  28055364 tttattaaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaa 28055265  T
Q  184 aatcaaattttg 195  Q
    ||| ||||||||    
T  28055264 aataaaattttg 28055253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 28065789 - 28065678
Alignment:
Q  85 tttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtaga 183  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |    
T  28065789 tttattaaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaa 28065690  T
Q  184 aatcaaattttg 195  Q
    ||| ||||||||    
T  28065689 aataaaattttg 28065678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 116993 - 116924
Alignment:
Q  231 cttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  116993 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 116924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 869446 - 869551
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  869446 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 869545  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  869546 attttg 869551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 3078374 - 3078479
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  3078374 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 3078473  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  3078474 attttg 3078479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 4994099 - 4994204
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  4994099 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatgtttttaaaacgccaaaaattaaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 4994198  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  4994199 attttg 4994204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 10182332 - 10182227
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  10182332 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 10182233  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  10182232 attttg 10182227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30778858 - 30778753
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  30778858 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 30778759  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  30778758 attttg 30778753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 34226131 - 34226026
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  34226131 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaa 34226032  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  34226031 attttg 34226026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 36777869 - 36777974
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  36777869 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 36777968  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  36777969 attttg 36777974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 44555433 - 44555364
Alignment:
Q  231 cttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44555433 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 44555364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 45454337 - 45454442
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  45454337 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 45454436  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  45454437 attttg 45454442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 50362393 - 50362498
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  50362393 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 50362492  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  50362493 attttg 50362498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 50614615 - 50614546
Alignment:
Q  231 cttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50614615 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 50614546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 51324800 - 51324695
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| | ||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||||||| || || |||| ||    
T  51324800 aaaaattagaattttttaatatgtaatgaattaaatataatttttttaaaactacaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttgaacctaaaaataaa 51324701  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  51324700 attttg 51324695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 53328515 - 53328620
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  53328515 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 53328614  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  53328615 attttg 53328620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 195
Target Start/End: Original strand, 16644630 - 16644729
Alignment:
Q  96 ttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  16644630 ttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacgccaaaaattcaagataaaactaagaaaatttggacctaaaaataaaattttg 16644729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 174
Target Start/End: Original strand, 53658005 - 53658088
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaattt 174  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  53658005 aaaaattagaattttttaacatttaacgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaattt 53658088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 1487053 - 1486948
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||| | |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  1487053 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaatcaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 1486954  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  1486953 attttg 1486948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15490861 - 15490756
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||  || |||| ||    
T  15490861 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaataaa 15490762  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  15490761 attttg 15490756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 31269587 - 31269692
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa-ttaacaaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| | |  ||||||||||| || |||| ||    
T  31269587 aaaaattagaattttttaatatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactgatgaaaatttggacctaaaaataaa 31269686  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  31269687 attttg 31269692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40126990 - 40126885
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||| | ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  40126990 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaatgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 40126891  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  40126890 attttg 40126885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 47198987 - 47199092
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||  || |||| ||    
T  47198987 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaataaa 47199086  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  47199087 attttg 47199092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 49612279 - 49612384
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  49612279 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgctaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 49612378  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  49612379 attttg 49612384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 8575466 - 8575373
Alignment:
Q  12 tttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttt 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||       || |||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  8575466 tttaactatccttaaactcttaaattttttaacgaattttttgatacaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaatttt 8575373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 45344125 - 45344025
Alignment:
Q  96 ttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaatttt 194  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||| || || |||| |||||||    
T  45344125 ttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttataacgccaaaagttcaagataaaactaacgaaaatttgaacctaaaaataaaatttt 45344026  T
Q  195 g 195  Q
    |    
T  45344025 g 45344025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 23878600 - 23878706
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaatttt-ttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatca 188  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |    
T  23878600 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataa 23878699  T
Q  189 aattttg 195  Q
    |||||||    
T  23878700 aattttg 23878706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 55006250 - 55006152
Alignment:
Q  98 agaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    |||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||  ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  55006250 agaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaaattttg 55006152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 24342668 - 24342773
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||| | ||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  24342668 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttgaaacgccgaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 24342767  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  24342768 attttg 24342773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 33391028 - 33391133
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||| |||||| ||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  33391028 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttaaaaacgccaaaaatttgagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 33391127  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  33391128 attttg 33391133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 43127787 - 43127682
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa-caaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||| ||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||  ||||||||||| || |||| ||    
T  43127787 aaaaattagaactttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaatgaaaatttggacctaaaaataaa 43127688  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  43127687 attttg 43127682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 43660412 - 43660517
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||  |||||||| | || |||| ||    
T  43660412 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgtaaatttggtcctaaaaataaa 43660511  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  43660512 attttg 43660517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 43729766 - 43729870
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || | ||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  43729766 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatat-atttttttaaaacgccaaaaattcatgataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 43729864  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  43729865 attttg 43729870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 50133629 - 50133524
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||  ||| ||    
T  50133629 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaatctaacgaaaatttggacttaagaataaa 50133530  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  50133529 attttg 50133524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 53947560 - 53947664
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||||||||   ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  53947560 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatat-aattttttaaaaacgcaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 53947658  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  53947659 attttg 53947664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 46
Target Start/End: Original strand, 54268854 - 54268895
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacga 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  54268854 aagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacga 54268895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 20078136 - 20078100
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaac 44  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20078136 tttgtttaattattcttaaactcttcaatttttgaac 20078100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 32245835 - 32245747
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggac 178  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || || |||||| |||| |||||||||||    
T  32245835 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaatataaaactaacgaaaatttggac 32245747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32800008 - 32799933
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac 167  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||| |||    |||||||| ||||||||||||||    
T  32800008 aaaatttagaattttttaatatggaatgaattaagtatgaatttttgaaattt-caaaagtttaagataaaattaac 32799933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 174
Target Start/End: Original strand, 4735774 - 4735857
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaattt 174  Q
    |||| |||||||||||||| ||  || |||||| ||||  ||||||||||||| ||||| || || |||||| |||||||||||    
T  4735774 aaaaattagaattttttaacatctaatgaattaaatatatattttttaaaacgccaaaaattcaaaataaaactaacaaaattt 4735857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 34442224 - 34442130
Alignment:
Q  102 ttttttaatatgaaacgaattagatatgaatttttt-aaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaa-aatttggacgtagaaatcaaatttt 194  Q
    |||||||| ||| || |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||| || |||||| || || |||| |||||||    
T  34442224 ttttttaacatgtaatgaattaaatatgaatttttttaaaacgtcaaaattttaagataaaattaataagaatttgtacctaaaaattaaatttt 34442130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 37126874 - 37126980
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaatttt-ttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatca 188  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||| | |||| | |||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |    
T  37126874 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaatcaaatataattttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataa 37126973  T
Q  189 aattttg 195  Q
    |||||||    
T  37126974 aattttg 37126980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 191
Target Start/End: Original strand, 16128533 - 16128634
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||| |  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  16128533 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaatgcaaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 16128632  T
Q  190 at 191  Q
    ||    
T  16128633 at 16128634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 19878390 - 19878494
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  19878390 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacgccaaaaattcaagataaacctaacgaaaatttggactta-aaataaa 19878488  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  19878489 attttg 19878494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30786676 - 30786571
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||| ||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||  | ||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  30786676 aaaaattagaaatttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacatcgaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 30786577  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  30786576 attttg 30786571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 42367748 - 42367853
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||| ||||| || || |||||  |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  42367748 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacgccaaaaattcaaaataaacctaacaaaaatttggacttaaaaataaa 42367847  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  42367848 attttg 42367853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 85)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10357610 - 10357318
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10357610 aagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 10357511  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    |||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||        
T  10357510 tttaaccttaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgggcgtagaaatcaaatttttcgacaattt 10357411  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaat 297  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  10357410 tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaat 10357318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7439515 - 7439220
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  7439515 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttaaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttagtaaaatttagaattt 7439416  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||        
T  7439415 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaattaaattttgcgacaattt 7439316  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       | | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  7439315 tttgtagaggaacttttagtaatgttcttgacacgtcagtaaaaaattgttcaaaaacacaagagtttaagcataaattaaaaaaaattgaattga 7439220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 3043361 - 3043656
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  3043361 aagtttgtttaattatccttaaactcataaattttttaacgaattttttgagacaagtttagaacaatatgaaaggttcatttactaaaattcagaatat 3043460  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        
T  3043461 tttaacataaaactaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgccacaattt 3043560  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||| || | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3043561 tttgcagagtagcttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaaattgttcaataattcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 3043656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Original strand, 42274304 - 42274596
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  42274304 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacattatgaaaggttcatttaccaaaatttagattttttt 42274403  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnn 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||           
T  42274404 aatatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctagacatagaaatcaaattttgcgacaatttttt 42274503  T
Q  208 gcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42274504 gcagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaatttgtttgaaaactcatgagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 42274596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 56 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25666282 - 25666038
Alignment:
Q  56 gacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaa 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25666282 gacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttaattttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaaattaaa 25666183  T
Q  156 gataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 255  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25666182 agtaaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaatttttcgcataggaacttttagtaatgttcttaatacgtctgtaaaaaattgtt 25666083  T
Q  256 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  25666082 caaaaactcaagagtttaaatataaattaaataaatttgaattga 25666038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 33832124 - 33832418
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||         |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33832124 aagtctgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgatttttttatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 33832223  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||        
T  33832224 tttaa-atgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagtataagataaaattaacaaattctggacgtacaaatcaaattttgcgacaattt 33832322  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       | | |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33832323 tttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 33832418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 43932734 - 43933029
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  43932734 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagagaagtttagaacaatatgaaaggttcaattattaaaatttagaattt 43932833  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |        
T  43932834 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagtgaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattt 43932933  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43932934 tttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattattaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 43933029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Original strand, 8737811 - 8738104
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||         ||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||    
T  8737811 aagtttatttaattatccttaaaatcttaaatttttgaacggttttttttagaaaagtttagaacactatgaaaggttcgtttactaaaatttaaatttt 8737910  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgac-annn 203  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       
T  8737911 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacagcaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacaattt 8738010  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaat 297  Q
        ||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  8738011 ttttgcagagaaacttttcgtaatgtttttaacacgtctgtataaaattgttcaaaaactcaagaatttaagcataaattaaacaaatttgaat 8738104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41121016 - 41120738
Alignment:
Q  21 ccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaa 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  41121016 ccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacactatgaaaagttcatttaccaaaatttagacttttttaacatgaaacgaa 41120917  T
Q  121 ttagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttt 220  Q
    ||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||       ||| |||||||||    
T  41120916 ttaaataagaattttttaaa-cggcaaaaattaaagataaaattaacaaaatatggacgtagaaatcaaatttcacgacaattttttgcagaggaacttt 41120818  T
Q  221 tagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41120817 tagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgtttaaaaactcaaaagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 41120738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 80 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30784404 - 30784185
Alignment:
Q  80 gttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  30784404 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaatatggacg 30784306  T
Q  180 tagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacata 279  Q
    |||||||||||||||||||||       ||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||    
T  30784305 tagaaatcaaattttgcgacaattatttgcagatgagcttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttctaaaacttaagagtttaagcata 30784206  T
Q  280 aattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30784205 aattaaacaaatttgaattga 30784185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31771611 - 31771316
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       || |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  31771611 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgacacaagtttagaacactatgaaagtttcatttactaaaatttaaaattt 31771512  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| | |        
T  31771511 tttaacatgaaatgaattaaatatgaatttttgaaaacgacaaaagttaaagataaaagtaataaaatctggatgtagaaattaaattttgcaataattt 31771412  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  31771411 tttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtttacaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttatgcatcaattaaacaaatttgaattga 31771316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 31436332 - 31436045
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||         |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31436332 aagtttgtttaattatccttaaacacttaaatttttgaacgatttttttatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 31436233  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||        
T  31436232 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttt-aaatgacaaaagttaaagataaaattaacaaattctgaacgtagaaatcaaattttgcaacaattt 31436134  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
       | | | |||||||||||| ||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31436133 tttgtagatgaacttttagtattgttcttagtacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaattt 31436045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25100879 - 25100585
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||   |||    
T  25100879 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttt-gagacaagtttagaacactatgaaaggttcacttactaaaatttaattttt 25100781  T
Q  105 tttaat-atgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    ||| |  |||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||       
T  25100780 ttttagcatgaaacgaaataaatatgaatcttttaaaacggcaaaagttaaagctaaaattaacaaaatctgaacgtaaaaatcaaatttagcgacaatt 25100681  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25100680 ttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaatattgttcaaaaacttaagagattaca-ataaattaaacaaatttgaattga 25100585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 62 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6457505 - 6457266
Alignment:
Q  62 tttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataa 160  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6457505 tttagaacactatgaaaggttcatttactaaaacttagaatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataa 6457406  T
Q  161 aattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaa 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||         ||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  6457405 aattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttacgaattttttttgcagaggagcttttattaatgttctcaacacgtcttcaaaaaattgttcaaaa 6457306  T
Q  261 actcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6457305 actcaagagtttaaccataaattaaacaaatttgaattga 6457266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 40364884 - 40365179
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  40364884 aagtttgtttaactatcctcaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacactattgaaggttcatttactaaaatttagaattt 40364983  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||        
T  40364984 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaagtaacaaaatatggacgtataaatcaaattttgtgacaattt 40365083  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagag-cttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||  | ||||||||||||||||||||||||  |  | ||||||||| || |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40365084 tttgccgatgaacttttagtaatgttcttaacatataagcaaaaaattg-tccaaaactcaagggttttaaacataaattaaacaaatttaaattga 40365179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 44286684 - 44286978
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||       ||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  44286684 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaacttttgaacgatttttttgagacaaatttagaacactatgaaagattcatttactaaaatttacaattt 44286783  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| |||||||||||||    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||        
T  44286784 tttaacatgaaacgaatta----tgaattttttaaaacgccaaaacttaaagataaaattaacaaaatctgaacgtagaaatcaaatttagcgacaattt 44286879  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagctta---aacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
         | | |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||   |  ||||||||||||||||||||||||    
T  44286880 tttttaaatgaacttttagtaatgtgcttaacacgtccgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagtattataaattaaacaaatttgaattga 44286978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 20721229 - 20721511
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  20721229 aagtttgtttaattatcgttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaattt 20721328  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||| | |         
T  20721329 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgtggc----- 20721423  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20721424 --------ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 20721511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 44493179 - 44492883
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       |||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |    
T  44493179 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttattgagataagtttagaactctatgaaaggttcaattactaaaatttataatat 44493080  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacg-acaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |       
T  44493079 tttaacatcaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgaaaaaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataatt 44492980  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        |||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  44492979 ttttgcagggaaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttcaacataacttaaacaaatttgaattga 44492883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Original strand, 36512025 - 36512269
Alignment:
Q  55 agacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaa 154  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  36512025 agacaagtttagaacactatgaaatgtttattttctaaaatttagaattttgtaacataaaacaaattaaatatggattttttaaaacgacaaatgttaa 36512124  T
Q  155 agataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgt-ctgtaaaaaattg 253  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||        || || ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  36512125 agataaaattaataaaatctggatgtaaaaatcaaattttgcgacaattttttacagagaaacttttagtaatattcttaacacgtcctgcaaaaaattg 36512224  T
Q  254 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  36512225 ttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaattagaatt 36512269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 55 - 300
Target Start/End: Original strand, 37592929 - 37593171
Alignment:
Q  55 agacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaa 154  Q
    |||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||   |||| ||||||||||||    
T  37592929 agacaaatttagaacaccatgaaaagttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacggattaaatatgaattt---aaaatgacaaaagttaa 37593025  T
Q  155 agataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgt 254  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||       ||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||    
T  37593026 agataaaattaacaaaatttgaacgtaaaagtcaaattttgcggcaattttttgcaaaggaacttttagtaatattcttaacacagctgcaaaaaattgt 37593125  T
Q  255 tcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37593126 tcaaaaactcaggaatttaagcataaattaaacaaatttgaattga 37593171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 177
Target Start/End: Original strand, 13371995 - 13372167
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  13371995 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaaatt 13372094  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttgga 177  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13372095 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaataaacaaaatctgga 13372167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 42487668 - 42487963
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||       |||||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||||||||| | |||    
T  42487668 aagtttgtttgattatctttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaagtttaaaacgctatgaaaggttcaattactaaaatttaaatttt 42487767  T
Q  105 ttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    ||| || |||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||         
T  42487768 ttttaacatgaaatgaattcaatatgaattttttaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcgattatt 42487867  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42487868 ttttgcagaggaacttttaataatgttcttaacacatctacaaaaaattgtt-aaaaaattaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 42487963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 120 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35498768 - 35498588
Alignment:
Q  120 attagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaactt 219  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||       | | || |||||    
T  35498768 attaaatatgaatttttaaaaatgacaaaagttaaagataaaattaacaaattctggacgtagaaatcaaatttcgcgacaattttttgtagagaaactt 35498669  T
Q  220 ttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35498668 ttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaacaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 35498588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 21439832 - 21440114
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| | |||    
T  21439832 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttaaatttt 21439931  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    |||||  |||||||||||| |||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||  | |         
T  21439932 tttaacttgaaacgaattaaatataaatttttaaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttatggc----- 21440026  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
            |||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21440027 --------ggaacttttagtaatgttcttaacacgattacaaaaaattgtttaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 21440114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 33031345 - 33031165
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||        |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  33031345 aagtttgtttaattatccttaaattcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacactataaaaggttcatttaccaaaatttagatttt 33031246  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaat 186  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  33031245 tttaacatgaaacgaatta-atatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtaaaaat 33031165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20720236 - 20719949
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||       |||||||||||||||||         ||||| |||||||||||||||||||    
T  20720236 aagtttgtttaattatttttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacacg-------gttcaattactaaaatttagaattt 20720144  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcga-cannn 203  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| || || || ||||||||||||||||  |       
T  20720143 tttaatttgaaatgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctgaacatataaatcaaattttgcgattattt 20720044  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgt-aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20720043 ttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctataaaaaaattgttaaaaaact---tagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 20719949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 289
Target Start/End: Original strand, 44879718 - 44879995
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||        |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| |||    
T  44879718 aagtttgtttaactatctctaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaaatttagaacactatgaaaagttcatttaacaaaatttagatttt 44879817  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||        
T  44879818 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttt------tcaaaagttagagataaagttaagaaaatctggacata-aaatcaaattttgcgacaaatt 44879910  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaa 289  Q
       ||| |  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  44879911 tttgcacataaacttttagtaatgatcttaacacatctgcaaaaaattgtttaaaaactcaaaagtttaagcataaattaaacaa 44879995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 80 - 242
Target Start/End: Original strand, 29809405 - 29809567
Alignment:
Q  80 gttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  29809405 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaaggaattaaatatgatttttttaaaacgacaaaagttaatgataaaattaacaaaatttggatg 29809504  T
Q  180 tagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtct 242  Q
    ||||||||| ||||||||| |       | | | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29809505 tagaaatcagattttgcgataattttttgtagatgaacttttagtaatgttcttaacaagtct 29809567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 54 - 300
Target Start/End: Original strand, 34073621 - 34073865
Alignment:
Q  54 gagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 153  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34073621 gagacaagtttagaacactaagaaagattcatttaataaaatttagaattttctaacaagaaacgaattaaatatgaattttttaaaactacaaaagtta 34073720  T
Q  154 aagat-aaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaatt 252  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |           ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  34073721 aagataaaaagtaacaaaatatggatgtagaaattaaattttgcgataattttttatggaggaacttttagtaatgttctaaacatgtctgcaaaaaatt 34073820  T
Q  253 gttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||| |||||  |||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||    
T  34073821 gttgaaaaa--caagagtttaggcataaa-taaacaaatttaaattga 34073865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 269
Target Start/End: Original strand, 33000913 - 33001125
Alignment:
Q  56 gacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaa-ttttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33000913 gacaagtttagaacaatatgaaatgttcaattactaaaatttagaatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaa 33001012  T
Q  155 agataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgt 254  Q
    ||| |||| | |  |||| ||||| ||  ||||||||||||||| |       ||  || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33001013 agagaaaagt-attaaatctggacata-taatcaaattttgcgataattttttgcggagtaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgt 33001110  T
Q  255 tcaaaaactcaagag 269  Q
    | ||||||| |||||    
T  33001111 taaaaaacttaagag 33001125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 298
Target Start/End: Original strand, 14200964 - 14201260
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |       |||||||| |||||||| ||  ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  14200964 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttctgagacaagcttagaacattacaaaaggttcatttaataaaatttagaattt 14201063  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatat-gaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa-ttaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgaca-- 200  Q
    ||||| |||||| |||||| |||| || |||||| ||| |||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||| || |      
T  14201064 tttaacatgaaatgaattaaatatggattttttttaaatgacaaaagttcaagataaaagcaaaaaaaaattggacgtagaaatcaaattttgagataat 14201163  T
Q  201 nnnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
            |  | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14201164 tttttttacggatgaacttttagtaatgttcttaacacggctacaaaaaattattcacaaacttaagagtttaagcat-aattaaacaaatttgaatt 14201260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 18672486 - 18672342
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  18672486 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttataattt 18672387  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  18672386 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaagacgataaaa 18672342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 220 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 33031165 - 33031087
Alignment:
Q  220 ttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33031165 ttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgtttaaaaattcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 33031087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 32318432 - 32318223
Alignment:
Q  85 tttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtaga 183  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||| |||| ||||| |||||| |||    
T  32318432 tttaataaaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatgaatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgcaga 32318333  T
Q  184 aatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctg-taaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaat 282  Q
    ||| |||||||| || |       ||| | |||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| || || || |||| ||| |||    
T  32318332 aataaaattttgagataatcatttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aat 32318234  T
Q  283 taaacaaattt 293  Q
    |||||||||||    
T  32318233 taaacaaattt 32318223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 300
Target Start/End: Original strand, 8392382 - 8392622
Alignment:
Q  62 tttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaa 161  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||    
T  8392382 tttagaacaatataaaaggttcatttaataaaatctagaattttttaacgtgaaataaattaaatatgaatttttgtaaacgacaaaagtttcagataaa 8392481  T
Q  162 attaa-caaaatttggacgtagaaatcaa-attttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaa 259  Q
    | ||| |||||| |  || ||||||||||  ||||  || |           || |||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  8392482 agtaaccaaaatgtacacatagaaatcaattttttatgatattcttttatggagaaacttttaataacattcttaacacgtttgtaaaaaattgttgaaa 8392581  T
Q  260 aactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8392582 aacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 8392622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23496852 - 23496666
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| |       |||||| |||  ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23496852 tttgttttattatccttaaacttttgaattttttaacaattttttggagacacgttatgaacattataaaatgttcatttactaaaatatataatttttt 23496753  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattt 193  Q
    || |||| | |||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||| |||  |||| ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  23496752 aacatgagatgaattaaatttgaatttttttaaacgacaaaagtttaagacaaagataacaaaaatgtggaagtataaatcaaattt 23496666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 300
Target Start/End: Original strand, 20719238 - 20719326
Alignment:
Q  212 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20719238 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtcaacaaaaaattgttagaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 20719326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 3118216 - 3117981
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  3118216 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaa-tttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 3118118  T
Q  157 ataaaa-ttaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 255  Q
    |||||| | || ||||| | |||| |||||| |||||||| ||         ||| | |||||||| |||||||||||||||  | || || || |||||    
T  3118117 ataaaagtaaaaaaaatctagacgcagaaataaaattttgagattattttttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacatttgtgcaataatttgtt 3118018  T
Q  256 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    ||||| || || || |||||||| ||||||||||||||    
T  3118017 caaaatcttaaaagtttaaacat-aattaaacaaattt 3117981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 293
Target Start/End: Original strand, 32318997 - 32319232
Alignment:
Q  59 aagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaaga 157  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || |    
T  32318997 aagtttagaacattactaaaggttcatttactaaattttagaatttttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaa 32319096  T
Q  158 taaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttc 256  Q
    ||||| |||| ||||| |||||| || ||| || ||||| || |       ||| |  |||||||  | ||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  32319097 taaaagtaacaaaaatctggacgcaggaataaatttttgagataattttttgcagataaacttttcatgatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttc 32319196  T
Q  257 aaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    |||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  32319197 aaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 32319232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 300
Target Start/End: Original strand, 7654925 - 7655007
Alignment:
Q  218 ttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||||||||||||| | || || |||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  7654925 ttttagtaatgttcttaatatgtttgcaaaaaactattcaaaaactcaagagtttaaccataaattaaacaaatttaaattga 7655007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 171
Target Start/End: Original strand, 19058643 - 19058808
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |        |||||  | ||||||| ||| |||  | |||||| |||||||||||||||    
T  19058643 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacaatttttagtagacacatctagaacattataaaagatccatttattaaaatttagaattt 19058742  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 171  Q
    ||||| |||| |  || || |||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  19058743 tttaacatgagattaactaaatatgaatttgtttaaacgac-aaagtttaagataaaagtaacaaaa 19058808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9111777 - 9111571
Alignment:
Q  92 aaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||| || |||||| ||||||||||  ||| | | |||| |||    
T  9111777 aaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattcgggatgcaaaaataaaa 9111678  T
Q  191 ttttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaa 290  Q
    ||||| || |       | | | |||||||| |||||||||||||||| | || ||||| |||||| ||| || || || |||| ||| |||||||||||    
T  9111677 ttttgagataattttttgtagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaagttgttctaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaa 9111579  T
Q  291 tttgaatt 298  Q
    ||| ||||    
T  9111578 tttaaatt 9111571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20701330 - 20701256
Alignment:
Q  226 atgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20701330 atgttcttaatacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaaaagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 20701256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 194
Target Start/End: Original strand, 9737488 - 9737593
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaatttt-ttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatca 188  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |    
T  9737488 aaaacttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataaatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaattaacgaaaatttggacctaaaaataa 9737587  T
Q  189 aatttt 194  Q
    ||||||    
T  9737588 aatttt 9737593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12620442 - 12620337
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  12620442 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 12620343  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  12620342 attttg 12620337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13803394 - 13803289
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  13803394 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 13803295  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  13803294 attttg 13803289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16709247 - 16709142
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  16709247 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaatttaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 16709148  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  16709147 attttg 16709142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20973352 - 20973247
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  20973352 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataaa 20973253  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  20973252 attttg 20973247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 300
Target Start/End: Original strand, 23787773 - 23787838
Alignment:
Q  235 acacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23787773 acacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 23787838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 45301262 - 45301367
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||| |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || |||| ||    
T  45301262 aaaaattagaaatttttaacatgaaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataagattaacgaaaatttggacctaaaaataaa 45301361  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  45301362 attttg 45301367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 195
Target Start/End: Original strand, 35516308 - 35516408
Alignment:
Q  96 ttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaatttt 194  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||  || |||| |||||||    
T  35516308 ttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaagttcaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaataaaatttt 35516407  T
Q  195 g 195  Q
    |    
T  35516408 g 35516408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 298
Target Start/End: Original strand, 4327812 - 4327898
Alignment:
Q  209 cataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||   |||||||||| || || || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  4327812 cataggaatttttagtaatgttctaaatacgtctgcaaa---ttgttcaaaagcttaatagtttaagcataaattaaacaaatttgaatt 4327898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 293
Target Start/End: Original strand, 13027445 - 13027735
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaat-tttt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |       |||||| |||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||| | | | ||||    
T  13027445 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttcggagacacgtttagaacattataaaaggttcgtttactaaaattgaaattctttt 13027544  T
Q  107 taatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnn 206  Q
    ||| |||| | ||||||  ||| ||  |||||||  |||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||| |             
T  13027545 taacatgagatgaattaagtataaaaattttaaat-gacaaaagtttaagataaaataacaaaaatttggacgtaaagatcaaattttgtgctttttttt 13027643  T
Q  207 ngcat------aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
        |      |||||||| |||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||    
T  13027644 tttttttttggaggaacttatagtaatgttcttaacaaatgtataaaaaattgttcaaaaacttaagtgtttaagcat-aattaaacaaattt 13027735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41178808 - 41178709
Alignment:
Q  97 tagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  41178808 tagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaattttg 41178709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7401762 - 7401657
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||    
T  7401762 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattacatataattttttttaaacgccaaaaattcaagataaacttaacaaaaatttggacttaaaaataaa 7401663  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  7401662 attttg 7401657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 14542151 - 14542256
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaa-ttaacaaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || |||| ||    
T  14542151 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaaagaaaatttggacctaaaaataaa 14542250  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  14542251 attttg 14542256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Original strand, 32319572 - 32319809
Alignment:
Q  57 acaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaa-ttttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaa 155  Q
    |||||||| ||||| ||  ||| |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||| |||||| |||||| ||| |  ||||||| ||    
T  32319572 acaagttttgaacattactaaaagttcgtttactaaaatttataatttttttaacatgaaataaattaaatatgattttttttaaaagtgaaaagttcaa 32319671  T
Q  156 gataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgt 254  Q
     |||||| |||| ||||| |||||| || ||| |||||||| || |       ||| |  |||||||  | ||||||||||||| | || ||||||||||    
T  32319672 aataaaagtaacaaaaatctggacgcaggaataaaattttgagataattttttgcagataaacttttcatgatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgt 32319771  T
Q  255 tcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    |||||| |  || || |||||||| ||||||||||||||    
T  32319772 tcaaaatcataaaagtttaaacat-aattaaacaaattt 32319809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 35498847 - 35498806
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacga 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35498847 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacga 35498806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 36218735 - 36218630
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  36218735 aaaaattataattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 36218636  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  36218635 attttg 36218630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 37850427 - 37850322
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||  || |||| ||    
T  37850427 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacggcaaaaatttaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaataaa 37850328  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  37850327 attttg 37850322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 3855014 - 3854934
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 171  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  3855014 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacaaaa 3854934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 78
Target Start/End: Original strand, 29809254 - 29809327
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaa 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||       |||||||||||| |||| |||||||    
T  29809254 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttggaacgatttttttgagacaagtttaaaacactatgaaa 29809327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21439351 - 21439296
Alignment:
Q  245 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21439351 aaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaataaatttgaattga 21439296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3201900 - 3201797
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || || | ||    
T  3201900 aaaaattagaattttttaatatgcaatgaattaaatat-aatttttt-aaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaagtaaa 3201803  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  3201802 attttg 3201797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 10214809 - 10214914
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| ||||   |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||| || || |||| ||    
T  10214809 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatatattttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttgaacctaaaaataaa 10214908  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  10214909 attttg 10214914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17615046 - 17614941
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||  || |||| ||    
T  17615046 aaaaattagatttttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaataaa 17614947  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  17614946 attttg 17614941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18549618 - 18549513
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||| |||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||| || |||| ||    
T  18549618 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttaaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaattttgacctaaaaataaa 18549519  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  18549518 attttg 18549513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18672312 - 18672259
Alignment:
Q  247 aaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  18672312 aaaattgttaaaaaacttaagagttcaagcataaattaaacaaatttgaattga 18672259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31653466 - 31653361
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||||||| |||||||||| ||| || |||| | |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||| || |||| ||    
T  31653466 aaaatttaaaattttttaacatgtaatgaatcaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttagacctaaaaatgaa 31653367  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  31653366 attttg 31653361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 105
Target Start/End: Original strand, 3118639 - 3118732
Alignment:
Q  12 tttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttt 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||       || |||||||||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3118639 tttaactatccttaaactcttaaaatttttaacgaattttttgatacaagtttagaacattacaaaaggtttatttactaaaatttagaatttt 3118732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 36881155 - 36881116
Alignment:
Q  245 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaatta 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36881155 aaaaaattattcaaaaactcaagagattaaacataaatta 36881116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39670510 - 39670399
Alignment:
Q  85 tttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtaga 183  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| ||||| || || || ||||||||| |||| ||||||||||  || |    
T  39670510 tttacaaaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaacgccagaaattcaagataaaactaacgaaaatttggatctaaa 39670411  T
Q  184 aatcaaattttg 195  Q
    ||| ||||||||    
T  39670410 aataaaattttg 39670399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 101 - 195
Target Start/End: Original strand, 44713106 - 44713200
Alignment:
Q  101 attttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaatt-aacaaaatttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| || |||| |||||| || ||||||||||| || |||||||||||||    
T  44713106 attttttaaaatctaacgaattaaatatgaatttttt-aaatgccaaaatttcaagaaaaaattaaagaaaatttggacctaaaaatcaaattttg 44713200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Original strand, 25100388 - 25100426
Alignment:
Q  155 agataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattt 193  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25100388 agataaaattagcaaaatctggacgtagaaatcaaattt 25100426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 38063176 - 38063070
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaatttttt-aaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatca 188  Q
    |||| |||||| ||||||| ||| || |||||| |||| | |||||| |||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |    
T  38063176 aaaaattagaaatttttaacatgcaatgaattaaatataattttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttggacctaaaaataa 38063077  T
Q  189 aattttg 195  Q
    |||||||    
T  38063076 aattttg 38063070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Original strand, 37592894 - 37592927
Alignment:
Q  7 gtttgtttaattatccttaaactcttcaattttt 40  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37592894 gtttgtttaattatccttaaactcttaaattttt 37592927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 37741919 - 37742024
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| |||||  | ||||||||| |||| |||||||| || || |||| ||    
T  37741919 aaaaattataattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaagtcaagataaaactaacgaaaatttgaacctaaaaataaa 37742018  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  37742019 attttg 37742024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 42520911 - 42521016
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| || | | |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||| || |||| ||    
T  42520911 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatgtaattttttttaaacgccaaaaattcaagataaacttaacgaaaatttagacttaaaaataaa 42521010  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  42521011 attttg 42521016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 258
Target Start/End: Original strand, 13890872 - 13890912
Alignment:
Q  218 ttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaa 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  13890872 ttttagtaatgtttttaacacgtctatataaaattgttcaa 13890912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 258
Target Start/End: Original strand, 14030997 - 14031037
Alignment:
Q  218 ttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaa 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  14030997 ttttagtaatgtttttaacacgtctatataaaattgttcaa 14031037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18917312 - 18917280
Alignment:
Q  218 ttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18917312 ttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaa 18917280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 300
Target Start/End: Original strand, 20720809 - 20720845
Alignment:
Q  264 caagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20720809 caagagtttaaacataaattgaacaaatttgaattga 20720845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24951285 - 24951214
Alignment:
Q  227 tgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattg 299  Q
    ||||||||||||||||  |||| | ||||| ||||||  |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24951285 tgttcttaacacgtctccaaaagaatgttcgaaaacttgagagtttaagcataa-ttaaacaaatttgaattg 24951214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 36881264 - 36881180
Alignment:
Q  56 gacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaa 140  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||   |||||||| || ||| |||||| || ||||| |||||||    
T  36881264 gacaagtttagaacgctatgaaaggttcaataactaaaatttaattttttttaacataaaatgaattaaatgtgaatgttttaaa 36881180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 195
Target Start/End: Original strand, 39375071 - 39375171
Alignment:
Q  96 ttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaatttt 194  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||||||||  |||| || ||||||||  |||| ||||||||| | || |||| |||||||    
T  39375071 ttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtaaaaaattcaagataaatctaacgaaaatttgggcctaaaaataaaatttt 39375170  T
Q  195 g 195  Q
    |    
T  39375171 g 39375171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold1160
Description:

Target: scaffold1160; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 1455 - 1159
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1455 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgaggcaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 1356  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaatttttta---aaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacan 201  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  1355 tttaacatgaaacgaattaaatatgatttttttttttaaatggtaaaagctaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaa 1256  T
Q  202 nnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
          ||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1255 ttttttgcaaagaaactttaagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcatgagtttaagcataaataaaacaaatttgaatt 1159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1191 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold1191
Description:

Target: scaffold1191; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 964 - 669
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnng-agacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatt 103  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||         ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  964 aagtttgtttgattattcttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttagataagtttagaacactataaaaggttcatttactaaaatttagaatt 865  T
Q  104 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||  | ||||||||||||||||||       
T  864 ttttaagatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgaaaaaagttaaagataaaattaacaaattctggactcaaaaatcaaattttgcgaca-at 766  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  765 ttgtgcagatgaacttttagtaatgttcttatcacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0651 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0651
Description:

Target: scaffold0651; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 293
Target Start/End: Original strand, 6862 - 7151
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6862 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttctgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 6961  T
Q  105 ttt-aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    ||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |       
T  6962 ttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaaattaaagataaaaataataaaatttggacatataaatcaaattttgcgataatt 7061  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
        ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7062 ttttgcagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaattt 7151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0562
Description:

Target: scaffold0562; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Original strand, 3974 - 4287
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3974 tttgtttaattatccttaaactcttacatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 4073  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnn 207  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||           
T  4074 aacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaacctgtacgtagaaatcaaattttgcgacaatttttt 4173  T
Q  208 gcataggaact---------------------tttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaa 286  Q
    |||||||||||                     ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4174 gcataggaacttttagtaattgcataggaacttttagtaatgttcttaacatgcctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaa 4273  T
Q  287 caaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||||||    
T  4274 caaatttgaattga 4287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0707 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0707
Description:

Target: scaffold0707; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 54 - 297
Target Start/End: Original strand, 6950 - 7192
Alignment:
Q  54 gagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagtta 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6950 gagacaagtttagaacactatgaaaggtttattaactaaaatttagaattttt-aacctaaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagtta 7048  T
Q  154 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  7049 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgtgacaattttttgcagatgaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaaattg 7148  T
Q  254 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaat 297  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  7149 ttcaaaaactcaagagtataagcatacattaaacaaatttgaat 7192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35568 - 35273
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||       || |||||||||||  | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35568 aagtttgtttaattatccttaaagtcttaaatttttgaacgatttttttgaaacaagtttagattattatgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 35469  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| | |        
T  35468 tttaacatgaaacgaattaaatataaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcaataattt 35369  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
       ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35368 tttgcggaggaacttttactaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 35273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 300
Target Start/End: Original strand, 38609 - 38674
Alignment:
Q  235 acacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  38609 acacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagttcaagcataaattaaacaaatttgaattga 38674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 298
Target Start/End: Original strand, 17377 - 17669
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||       |||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  17377 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaaagatttttttgagacaagtttagaacaccatgatagattcatttactaaaatttagaattt 17476  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    || || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| | |        
T  17477 tt-aacatgaaacgaattaaatatgatttttttaaaacaacaaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacttaaaaatcaaattttgcaataattt 17575  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
        |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17576 tttacggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaactataaattaaacaaatttgaatt 17669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 200
Target Start/End: Original strand, 158028 - 158222
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  158028 aagtttgtttaattctccttaaactcttcaatttttgaacgatttttt-gagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 158126  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgaca 200  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  158127 tttaccatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaattaaattttgcgaca 158222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 4)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 25057 - 25339
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  25057 aagtttgtttaattatcgttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaattt 25156  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||| | |         
T  25157 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgtggc----- 25251  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25252 --------ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 25339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24074 - 23787
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||       |||||||||||||||||         ||||| |||||||||||||||||||    
T  24074 aagtttgtttaattatttttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacacg-------gttcaattactaaaatttagaattt 23982  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcga-cannn 203  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| || || || ||||||||||||||||  |       
T  23981 tttaatttgaaatgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctgaacatataaatcaaattttgcgattattt 23882  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgt-aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23881 ttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctataaaaaaattgttaaaaaact---tagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 23787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 300
Target Start/End: Original strand, 23076 - 23164
Alignment:
Q  212 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23076 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtcaacaaaaaattgttagaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 23164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 300
Target Start/End: Original strand, 24647 - 24683
Alignment:
Q  264 caagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24647 caagagtttaaacataaattgaacaaatttgaattga 24683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0514 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0514
Description:

Target: scaffold0514; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 6197 - 6470
Alignment:
Q  28 ctcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatg--aaacgaattaga 125  Q
    ||||| |||||||||||||       ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||| |    
T  6197 ctcttaaatttttgaacgattttttcgaggcaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaaaaaaaattaaa 6296  T
Q  126 tatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagta 225  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||       | | | ||||||||||||    
T  6297 tatgatttttttaaaaccagaaaaattaaagat-aaattaacaaagtttgggcctagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagatgaacttttagta 6395  T
Q  226 atgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6396 atgttcttaacacgtctccaaaaaattgttgaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 6470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7227 - 6931
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7227 aagtttgtttaattatcattaaactcttaaattttttaatgatttttttgagacaagtttagaacaatatgaaaagttcatttactaaaatttagaattt 7128  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagat-aaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    | ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |       
T  7127 tctaacacgaaacaaattaaatatgaattttttaaaaagataaaagttaaatataaaaattaacaaaatttggatgtagaaatcaaattttgctataatt 7028  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||  || |||||||||||||||||| |||| | | | |||||| | || ||||| | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7027 ttttgcggagaaacttttagtaatgttctaaacatgccagcaaaaaactattaaaaaatttaagaatttaagcataaattaaacaaatttgaattga 6931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 240012 - 240294
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  240012 aagtttgtttaattatccttcaactgttaaatttttgaacgacttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaattt 240111  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnn 204  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || | ||||||||||||| |         
T  240112 tttaacatgaaacgaattaaatatgaatatttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatatagatcaaattttgcggc----- 240206  T
Q  205 nnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
            |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  240207 --------ggaacttttagtaatgttcttaacacatctaaaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 240294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 239561 - 239492
Alignment:
Q  231 cttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  239561 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 239492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1190 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold1190
Description:

Target: scaffold1190; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 202 - 486
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       |||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  202 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttcgagacaagttcagaacactacgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 301  T
Q  105 tttaatatgaaacgaa-ttagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannn 203  Q
    ||||| ||||||  || ||| |||| | ||||| ||||||||||||            ||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||       
T  302 tttaaaatgaaaaaaaattaaatataattttttgaaaacgacaaaa------------attaacaaaatctgggcctagaaatcaaattttgtgacaatt 389  T
Q  204 nnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
        ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  390 ttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctccaaaaaattgttcaaaaactcatgtgtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0640 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0640
Description:

Target: scaffold0640; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 300
Target Start/End: Original strand, 3895 - 4188
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||        | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  3895 tttgcttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 3994  T
Q  108 aatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaaa-ttttgcgacannnnn 205  Q
    || ||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || |         
T  3995 aacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatgaacgtagaaatcaaatttttgtgatattttt 4094  T
Q  206 nngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
          ||||  ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4095 tt-tggaggacgttttaataacgttcttaacatgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 4188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 9960 - 10245
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnn-gagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaattta--gaa 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||        ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||         
T  9960 aagtttgtttaattattcttaaactcttaaattttttaatgaatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttaatttt 10059  T
Q  102 ttttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacan 201  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  || ||||| ||||| || ||||||||||||||| |      
T  10060 ttttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaaacaataaaatatggacatataaatcaaattttgcggc-- 10157  T
Q  202 nnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
               |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10158 -----------ggaacttttaataatgttcttaacacgtctacaaaaaattgtaaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 10245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9491 - 9424
Alignment:
Q  232 ttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9491 ttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaa-agtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 9424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0571 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0571
Description:

Target: scaffold0571; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8575 - 8430
Alignment:
Q  154 aagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||       ||| | |||||||||| |||||| ||| || ||||  |||||||||    
T  8575 aagataaaattaacaaaatttggacgcaaaaatcaaattttgcgacaatttgt-gcagatgaacttttagcaatgttgttaccatgtctacaaaaaattg 8477  T
Q  254 ttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8476 ttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 8430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0571; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8748 - 8596
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatg-ttcatttactaaaatttagaatt 103  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||        ||| ||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  8748 aagtttgtttgattattcttaaattcttaaatttttgaacgattttttttagataaggttagaacactatgaaaaggttcatttactaaaatttagaatt 8649  T
Q  104 ttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaag 156  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||| |||||    
T  8648 ttttaagatgaaacgaattaaatatgaatttcttaaaacggaaaaaggtaaag 8596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 141
Target Start/End: Original strand, 21750 - 21886
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21750 aagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgattttttcgagacaagtttagaacactataaaaggttcatttactaaaatttagaattt 21849  T
Q  105 tttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaa 141  Q
    | ||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  21850 tctaacatgaaacgaattaaatttgaatttcttaaaa 21886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 47860 - 48041
Alignment:
Q  14 taattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||  | | |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  47860 taattatccttaaactcttaaatttttgaacaattttcttgagacaagtttagaacattacaagaggttcgttttctaaaatttagaattttttaacatg 47959  T
Q  114 aaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaa-atttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    ||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||    
T  47960 aaatgaattaaatataaatttttt-aaacgacaaaagttcaagataaaagtaacaaatatccggacgtagaaataaaattttg 48041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 293
Target Start/End: Original strand, 3260 - 3436
Alignment:
Q  119 aattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaatttt-gcgacannnnnnngcataggaa 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| |        |  ||||     
T  3260 aattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggatgtagaaatcaaatttttgcgatattttttt-cggaggat 3358  T
Q  217 cttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaa-aattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3359 cttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaattt 3436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 116
Target Start/End: Original strand, 2854 - 2962
Alignment:
Q  8 tttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||        | |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  2854 tttgtttaattatcgttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagcacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt 2953  T
Q  108 aatatgaaa 116  Q
    || ||||||    
T  2954 aacatgaaa 2962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 214 - 300
Target Start/End: Original strand, 48967 - 49053
Alignment:
Q  214 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  48967 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 49053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6292 - 6204
Alignment:
Q  212 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaattga 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  6292 aggaacttttagtaacgttcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaacttaaaagtttaagcataaattaaacatatttgaattga 6204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 6361 - 6298
Alignment:
Q  130 aattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaatttt 194  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  6361 aattttgttaaaagacaaaagttaaagataaaagtaacaaaatctggacatagaaat-aaatttt 6298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 171
Target Start/End: Original strand, 283312 - 283403
Alignment:
Q  80 gttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 171  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||| ||||||||    
T  283312 gttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaa 283403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 283076 - 282940
Alignment:
Q  157 ataaaattaacaaaatt-tggacgtagaaatcaaattttgcgacannnnnnngcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 255  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||| || |       ||| | |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  283076 ataaaagtaacaaaattctggacgcagaaataaaattttgagataattttttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgtt 282977  T
Q  256 caaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaattt 293  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  282976 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 282940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 52590 - 52512
Alignment:
Q  59 aagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaatttttt 137  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||    
T  52590 aagtttagaacattataaaaggttcatttactaaaatttagatttttttaacttgaaatgaattaaatatgaatttttt 52512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 171
Target Start/End: Original strand, 123198 - 123351
Alignment:
Q  18 tatccttaaactcttcaatttttgaacgannnnnnngagacaagtttagaacaatatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaac 117  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||       ||||||  |||| |||||||| |||  | |||||||||||||||| ||||||||||  ||| |     
T  123198 tatccttaaactcttaaaatttttaacgatttttccgagacacatttaaaacaatataaaagctgcatttactaaaatttaaaattttttaacttgagat 123297  T
Q  118 gaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 171  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  123298 gaattaaatataaattttttcaaacagcaaatgtttaagataaaagtaacaaaa 123351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0618 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0618
Description:

Target: scaffold0618; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9424 - 9319
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||| || || |||| ||    
T  9424 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaaatttgcacctaaaaataaa 9325  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  9324 attttg 9319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0493 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0493
Description:

Target: scaffold0493; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6969 - 6864
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||| | ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  6969 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatattatttttttaaaaagccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 6870  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  6869 attttg 6864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0991 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0991
Description:

Target: scaffold0991; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 988 - 883
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| ||||||||||||||  || || |||||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || || | ||    
T  988 aaaaattagaattttttaacttgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaactaaa 889  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  888 attttg 883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 48265 - 48160
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||  || |||||| |||| | |||||||||||| | ||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  48265 aaaaattagaattttttaacatttaatgaattaaatataatttttttaaaacgcccaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 48166  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  48165 attttg 48160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 42147 - 42042
Alignment:
Q  91 aaaatttagaattttttaatatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatttggacgtagaaatcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||  || |||||| ||||   |||||||||||| | ||| || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||    
T  42147 aaaaattagaattttttaacatttaatgaattaaatatagtttttttaaaacgcccaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 42048  T
Q  190 attttg 195  Q
    ||||||    
T  42047 attttg 42042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0245 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0245
Description:

Target: scaffold0245; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 195
Target Start/End: Original strand, 24927 - 24965
Alignment:
Q  158 taaaattaacaaaa-tttggacgtagaaatcaaattttg 195  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24927 taaaattaacaaaaatttggacgtagaaatcaaattttg 24965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0245; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Original strand, 25014 - 25066
Alignment:
Q  245 aaaaaattgttcaaaaactcaagagcttaaacataaattaaacaaatttgaatt 298  Q
    |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  25014 aaaaaattattcaaaaatttaagagtttaaacataa-ttaaacaaatttgaatt 25066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0809
Description:

Target: scaffold0809; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 34
Target Start/End: Original strand, 759 - 788
Alignment:
Q  5 aagtttgtttaattatccttaaactcttca 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  759 aagtttgtttaattatccttaaactcttca 788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University