View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15642_low_19 (Length: 443)

Name: NF15642_low_19
Description: NF15642
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15642_low_19
NF15642_low_19
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (16-222)||(43803916-43804122)
chr8 (222-427)||(29938059-29938265)
chr8 (230-427)||(18594544-18594741)
chr8 (220-427)||(14422699-14422907)
chr8 (230-427)||(144401-144598)
chr8 (230-427)||(2042527-2042724)
chr8 (230-427)||(24113169-24113366)
chr8 (230-427)||(39206593-39206790)
chr8 (222-427)||(35118034-35118240)
chr8 (230-423)||(10836762-10836955)
chr8 (230-427)||(13110411-13110608)
chr8 (230-427)||(22260633-22260830)
chr8 (230-427)||(7791418-7791615)
chr8 (230-427)||(33278407-33278604)
chr8 (230-426)||(38167159-38167355)
chr8 (230-425)||(34679462-34679657)
chr8 (233-427)||(7774774-7774968)
chr8 (230-427)||(34842368-34842565)
chr8 (230-427)||(39218784-39218981)
chr8 (233-427)||(7812005-7812199)
chr8 (230-427)||(4035854-4036051)
chr8 (230-427)||(41575520-41575717)
chr8 (230-427)||(6144276-6144473)
chr8 (234-427)||(44804947-44805140)
chr8 (222-427)||(5320562-5320768)
chr8 (231-427)||(34998899-34999095)
chr8 (230-427)||(8021726-8021915)
chr8 (230-427)||(42571601-42571795)
chr8 (234-427)||(28639289-28639484)
chr8 (230-427)||(36491164-36491361)
chr8 (230-379)||(40117903-40118052)
chr8 (230-427)||(33287040-33287225)
chr8 (230-362)||(26783801-26783933)
chr8 (302-428)||(9807339-9807465)
chr8 (233-427)||(66182-66377)
chr8 (230-374)||(2322068-2322212)
chr8 (230-351)||(5005173-5005294)
chr8 (234-374)||(39220267-39220407)
chr8 (230-310)||(9806880-9806960)
[»] chr3 (39 HSPs)
chr3 (230-427)||(8042609-8042806)
chr3 (230-427)||(37698132-37698329)
chr3 (220-427)||(25999379-25999587)
chr3 (230-425)||(32244122-32244317)
chr3 (230-427)||(20842337-20842534)
chr3 (230-427)||(42307894-42308091)
chr3 (230-425)||(54870165-54870360)
chr3 (230-427)||(15520131-15520328)
chr3 (230-427)||(22174979-22175176)
chr3 (230-423)||(38856095-38856288)
chr3 (230-427)||(46452151-46452348)
chr3 (230-425)||(29445490-29445685)
chr3 (234-427)||(12117647-12117840)
chr3 (230-427)||(21581044-21581241)
chr3 (230-427)||(35226449-35226646)
chr3 (230-427)||(38933948-38934144)
chr3 (230-427)||(50528931-50529128)
chr3 (220-427)||(25494274-25494482)
chr3 (230-427)||(32359261-32359458)
chr3 (230-427)||(44609322-44609519)
chr3 (232-424)||(42104963-42105155)
chr3 (230-427)||(15520638-15520835)
chr3 (230-427)||(20699151-20699348)
chr3 (230-427)||(26122816-26123013)
chr3 (230-427)||(48924992-48925187)
chr3 (230-427)||(54534317-54534512)
chr3 (233-423)||(34700346-34700536)
chr3 (252-427)||(44688785-44688959)
chr3 (230-423)||(24835692-24835885)
chr3 (234-427)||(2895191-2895388)
chr3 (230-380)||(35643219-35643369)
chr3 (230-427)||(53028227-53028416)
chr3 (272-423)||(16354390-16354541)
chr3 (252-427)||(12915931-12916105)
chr3 (230-362)||(50529827-50529959)
chr3 (344-427)||(24366145-24366228)
chr3 (349-427)||(13696914-13696992)
chr3 (230-356)||(49128051-49128177)
chr3 (384-425)||(50528873-50528914)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (220-427)||(33359083-33359291)
chr7 (234-427)||(933295-933488)
chr7 (230-427)||(3511329-3511526)
chr7 (230-427)||(5280866-5281063)
chr7 (230-427)||(43067966-43068163)
chr7 (230-427)||(12097583-12097780)
chr7 (230-427)||(12101171-12101368)
chr7 (230-427)||(20346494-20346691)
chr7 (230-427)||(24792325-24792522)
chr7 (230-427)||(30181017-30181214)
chr7 (230-427)||(42964989-42965186)
chr7 (220-423)||(22649691-22649895)
chr7 (230-425)||(7164190-7164385)
chr7 (230-427)||(33846522-33846714)
chr7 (233-427)||(6394760-6394954)
chr7 (222-423)||(25748484-25748686)
chr7 (230-427)||(42204160-42204358)
chr7 (230-427)||(1803032-1803229)
chr7 (230-427)||(4477314-4477511)
chr7 (230-427)||(9452596-9452793)
chr7 (230-427)||(32041548-32041745)
chr7 (230-427)||(43156719-43156916)
chr7 (230-427)||(15655918-15656115)
chr7 (256-427)||(48865662-48865836)
chr7 (230-427)||(8630672-8630869)
chr7 (230-427)||(36890823-36891019)
chr7 (230-423)||(38866550-38866743)
chr7 (230-427)||(42673471-42673664)
chr7 (230-423)||(46891336-46891530)
chr7 (230-427)||(4347279-4347475)
chr7 (230-427)||(46134297-46134494)
chr7 (218-427)||(17753593-17753803)
chr7 (256-425)||(16894502-16894671)
chr7 (230-427)||(43021573-43021766)
chr7 (234-369)||(19828280-19828415)
chr7 (230-374)||(37005857-37006001)
chr7 (230-319)||(37704986-37705075)
chr7 (234-374)||(43405030-43405170)
chr7 (230-358)||(20163825-20163953)
chr7 (280-367)||(36849590-36849677)
chr7 (230-374)||(15655458-15655602)
chr7 (220-374)||(30075277-30075429)
chr7 (234-318)||(27691428-27691512)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (230-427)||(3347526-3347723)
chr6 (230-427)||(26946879-26947076)
chr6 (230-427)||(6086602-6086799)
chr6 (230-427)||(9459570-9459767)
chr6 (230-427)||(2837552-2837749)
chr6 (230-427)||(11167247-11167444)
chr6 (230-427)||(30691858-30692055)
chr6 (230-427)||(26704342-26704539)
chr6 (230-427)||(17261076-17261273)
chr6 (230-427)||(18613545-18613742)
chr6 (240-427)||(21893472-21893659)
chr6 (233-427)||(1153603-1153797)
chr6 (220-427)||(20726787-20726991)
chr6 (230-427)||(34887295-34887492)
chr6 (230-414)||(3955782-3955966)
chr6 (230-425)||(30698934-30699129)
chr6 (230-423)||(16307015-16307208)
chr6 (230-427)||(28199511-28199709)
chr6 (234-427)||(35198295-35198487)
chr6 (293-427)||(33464399-33464533)
chr6 (230-379)||(52843-52992)
chr6 (316-427)||(53001-53112)
chr6 (230-301)||(33463708-33463779)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (230-427)||(1165604-1165801)
chr5 (230-427)||(1579044-1579241)
chr5 (230-427)||(1605574-1605771)
chr5 (230-427)||(9008060-9008257)
chr5 (230-427)||(24105674-24105871)
chr5 (230-426)||(27420866-27421062)
chr5 (230-427)||(8374342-8374538)
chr5 (230-427)||(16069361-16069558)
chr5 (234-427)||(16737450-16737643)
chr5 (230-427)||(27679172-27679369)
chr5 (230-427)||(31883152-31883349)
chr5 (230-423)||(3386493-3386686)
chr5 (230-427)||(33491199-33491396)
chr5 (230-427)||(4120945-4121142)
chr5 (230-427)||(19358534-19358731)
chr5 (234-427)||(33991152-33991345)
chr5 (230-427)||(38598453-38598650)
chr5 (220-427)||(5202969-5203177)
chr5 (230-427)||(3921589-3921786)
chr5 (234-427)||(20992149-20992342)
chr5 (230-427)||(35782647-35782844)
chr5 (256-427)||(26602945-26603116)
chr5 (271-427)||(27025005-27025161)
chr5 (230-427)||(31410484-31410681)
chr5 (230-357)||(20992354-20992485)
chr5 (230-363)||(33284642-33284775)
chr5 (252-358)||(31638175-31638281)
chr5 (376-427)||(35420427-35420478)
chr5 (288-357)||(41818536-41818605)
chr5 (392-423)||(27024822-27024853)
chr5 (233-374)||(25634593-25634732)
chr5 (272-356)||(19516044-19516128)
[»] chr4 (64 HSPs)
chr4 (221-427)||(19913621-19913828)
chr4 (230-427)||(15241019-15241216)
chr4 (230-427)||(20877052-20877249)
chr4 (219-427)||(38055150-38055359)
chr4 (230-427)||(53717455-53717652)
chr4 (230-427)||(54189550-54189747)
chr4 (230-425)||(14987797-14987992)
chr4 (230-427)||(1617089-1617286)
chr4 (230-427)||(1756755-1756952)
chr4 (230-427)||(23776450-23776647)
chr4 (218-423)||(50353793-50353999)
chr4 (230-427)||(6611351-6611548)
chr4 (230-427)||(16700786-16700983)
chr4 (230-427)||(23704200-23704397)
chr4 (234-427)||(33703850-33704043)
chr4 (234-427)||(37464730-37464923)
chr4 (230-427)||(53875662-53875859)
chr4 (230-427)||(54412633-54412830)
chr4 (230-425)||(45424527-45424722)
chr4 (230-421)||(50055098-50055289)
chr4 (233-423)||(28032707-28032897)
chr4 (230-427)||(27488639-27488836)
chr4 (230-427)||(30423556-30423752)
chr4 (230-427)||(44379178-44379375)
chr4 (240-427)||(31969696-31969883)
chr4 (230-428)||(52139208-52139406)
chr4 (230-427)||(2481399-2481596)
chr4 (230-427)||(15669188-15669385)
chr4 (230-427)||(30171585-30171782)
chr4 (234-427)||(40428711-40428904)
chr4 (230-427)||(43289951-43290148)
chr4 (230-427)||(44784908-44785105)
chr4 (230-427)||(48909851-48910048)
chr4 (235-427)||(8591083-8591275)
chr4 (233-427)||(37968748-37968942)
chr4 (230-427)||(11639569-11639766)
chr4 (230-427)||(35490764-35490961)
chr4 (230-427)||(27536095-27536288)
chr4 (230-420)||(19164971-19165160)
chr4 (230-427)||(6688618-6688809)
chr4 (230-427)||(47632039-47632237)
chr4 (230-427)||(8932169-8932366)
chr4 (247-428)||(16703843-16704024)
chr4 (230-427)||(40680029-40680226)
chr4 (230-421)||(44375850-44376041)
chr4 (230-427)||(53353060-53353265)
chr4 (230-427)||(27583623-27583820)
chr4 (230-396)||(28360435-28360602)
chr4 (234-427)||(55344816-55345009)
chr4 (234-414)||(38071327-38071504)
chr4 (302-427)||(23269037-23269162)
chr4 (230-374)||(50053448-50053592)
chr4 (344-427)||(53408138-53408222)
chr4 (230-310)||(23265865-23265945)
chr4 (327-427)||(9595893-9595982)
chr4 (291-373)||(51780763-51780845)
chr4 (367-427)||(23261877-23261937)
chr4 (239-374)||(44548185-44548320)
chr4 (384-427)||(50055304-50055347)
chr4 (364-427)||(48748197-48748260)
chr4 (232-374)||(17493340-17493482)
chr4 (396-427)||(55344684-55344715)
chr4 (220-358)||(46257269-46257407)
chr4 (316-369)||(55344724-55344777)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (230-427)||(36710-36907)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (230-427)||(6174831-6175028)
chr2 (230-427)||(42937724-42937922)
chr2 (219-427)||(31517218-31517427)
chr2 (230-427)||(18806887-18807084)
chr2 (230-427)||(3873247-3873444)
chr2 (230-423)||(33906054-33906247)
chr2 (230-427)||(4016044-4016241)
chr2 (230-427)||(39635457-39635654)
chr2 (233-427)||(5733407-5733601)
chr2 (230-427)||(26323189-26323386)
chr2 (223-410)||(1108277-1108464)
chr2 (230-423)||(4232149-4232342)
chr2 (230-423)||(30270686-30270879)
chr2 (239-427)||(19383938-19384126)
chr2 (234-422)||(16066302-16066490)
chr2 (230-425)||(28329844-28330037)
chr2 (230-425)||(19901143-19901337)
chr2 (233-427)||(1482906-1483099)
chr2 (230-427)||(30420182-30420367)
chr2 (272-427)||(2178772-2178927)
chr2 (230-427)||(851002-851199)
chr2 (230-423)||(16588783-16588976)
chr2 (234-427)||(44947552-44947738)
chr2 (272-426)||(429863-430017)
chr2 (230-374)||(42446625-42446769)
chr2 (272-367)||(22101210-22101305)
chr2 (272-374)||(3585337-3585439)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (230-427)||(33510489-33510686)
chr1 (222-427)||(42370798-42371004)
chr1 (230-427)||(1170447-1170644)
chr1 (230-427)||(16052101-16052298)
chr1 (230-427)||(20089476-20089673)
chr1 (230-427)||(29078521-29078718)
chr1 (230-427)||(38829074-38829271)
chr1 (230-427)||(19715164-19715361)
chr1 (230-427)||(25897379-25897576)
chr1 (230-427)||(26663263-26663460)
chr1 (230-427)||(39260349-39260546)
chr1 (230-427)||(29288154-29288349)
chr1 (230-427)||(1168508-1168705)
chr1 (230-427)||(1940750-1940947)
chr1 (230-427)||(8120874-8121071)
chr1 (230-427)||(46760971-46761168)
chr1 (230-427)||(52753150-52753347)
chr1 (230-427)||(2347661-2347859)
chr1 (230-423)||(5215390-5215583)
chr1 (230-423)||(26580277-26580470)
chr1 (230-427)||(41928498-41928695)
chr1 (230-427)||(17591696-17591890)
chr1 (222-427)||(970527-970735)
chr1 (234-427)||(23498469-23498662)
chr1 (230-423)||(40092496-40092689)
chr1 (230-423)||(52696796-52696989)
chr1 (230-425)||(6765464-6765659)
chr1 (230-427)||(8079712-8079909)
chr1 (230-427)||(12682825-12683022)
chr1 (230-427)||(32671584-32671781)
chr1 (230-423)||(43905659-43905852)
chr1 (256-427)||(40149494-40149665)
chr1 (222-427)||(51359220-51359425)
chr1 (230-427)||(7145212-7145409)
chr1 (230-427)||(2473727-2473924)
chr1 (241-425)||(17587510-17587694)
chr1 (230-427)||(13996726-13996923)
chr1 (230-427)||(49146177-49146374)
chr1 (220-427)||(15203106-15203314)
chr1 (230-427)||(46409440-46409639)
chr1 (230-427)||(15717790-15717986)
chr1 (230-427)||(15554155-15554344)
chr1 (230-391)||(29695680-29695842)
chr1 (234-427)||(38171841-38172021)
chr1 (238-373)||(23322897-23323032)
chr1 (230-354)||(52086272-52086396)
chr1 (230-374)||(5217840-5217983)
chr1 (230-296)||(5675110-5675176)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (230-425)||(22956-23151)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (230-427)||(298-495)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (230-427)||(145248-145445)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (230-427)||(10243-10440)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (234-427)||(9-202)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (230-427)||(3715-3912)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (230-427)||(9-207)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 43804122 - 43803916
Alignment:
Q  16 aaatatacacacaaagcctggatgttatttttacaaataatgaaaaacctcaacataaaaagcctggatatctttctaacctatcaagaaaaacctggat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43804122 aaatatacacacaaagcctggatgttatttttacaaataatgaaaaacctcaacataaaaagcctggatatctttctaacctatcaagaaaaacctggat 43804023  T
Q  116 annnnnnnnacaaataatgaggtagacttgatatctctcattaatcccatctcaacaaatattgaaaagccgcaatcatctccttttatattatctaaag 215  Q
    |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43804022 attttttttacaaataatgaggtagacttgatatctctcattaatcccatctcaataaatattgaaaagccgcaatcatctccttttatattatctaaag 43803923  T
Q  216 actatat 222  Q
    |||||||    
T  43803922 actatat 43803916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 222 - 427
Target Start/End: Original strand, 29938059 - 29938265
Alignment:
Q  222 tggccccgtt-ggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29938059 tggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatc 29938158  T
Q  321 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938159 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 29938258  T
Q  421 attctct 427  Q
    |||||||    
T  29938259 attctct 29938265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 18594544 - 18594741
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18594544 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 18594643  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594644 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 18594741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 220 - 427
Target Start/End: Original strand, 14422699 - 14422907
Alignment:
Q  220 tatggccccgtt-ggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 318  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14422699 tatggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 14422798  T
Q  319 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 418  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422799 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 14422898  T
Q  419 cgattctct 427  Q
    |||||||||    
T  14422899 cgattctct 14422907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 144401 - 144598
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  144401 ttggattgacttattttgagcatatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagtttatcatagtttca 144500  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144501 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 144598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 2042724 - 2042527
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  2042724 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttca 2042625  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2042624 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 2042527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 24113366 - 24113169
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24113366 ttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaccctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagattatcatagtttca 24113267  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24113266 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 24113169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 39206593 - 39206790
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39206593 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 39206692  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206693 taagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 39206790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 222 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 35118240 - 35118034
Alignment:
Q  222 tggccccgtt-ggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35118240 tggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 35118141  T
Q  321 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35118140 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcattcg 35118041  T
Q  421 attctct 427  Q
    |||||||    
T  35118040 attctct 35118034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 10836955 - 10836762
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10836955 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 10836856  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 423  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10836855 taaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgatt 10836762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 13110411 - 13110608
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  13110411 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatatgcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttaa 13110510  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13110511 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacctccttcgattctct 13110608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22260830 - 22260633
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22260830 ttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatcctagtttca 22260731  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22260730 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 22260633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 7791418 - 7791615
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7791418 ttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttca 7791517  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7791518 taagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 7791615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 33278407 - 33278604
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278407 ttggattggcttattttgagtttatatggacttatctactttcataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagtttca 33278506  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278507 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 33278604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 230 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 38167355 - 38167159
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||| |||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38167355 ttggattggcctattttgagtttatgtgggcttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaactagtttatcatagtttca 38167256  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 426  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38167255 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 38167159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 230 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 34679657 - 34679462
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34679657 ttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagtttca 34679558  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 425  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34679557 taagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 34679462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 233 - 427
Target Start/End: Original strand, 7774774 - 7774968
Alignment:
Q  233 gattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataa 332  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7774774 gattggcttattttgagcttatgcgggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataa 7774873  T
Q  333 gctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7774874 gctgcttatgtcatattttattaagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 7774968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 34842565 - 34842368
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34842565 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 34842466  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  34842465 taagctgcttatgccatatttcaataagcctaaatttccagcttacccaccgtcttaacaaggagcttattaatttatgtgacctccttcgattctct 34842368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 39218784 - 39218981
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  39218784 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatggtttatcatagcttca 39218883  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39218884 taagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctgatgaatttatgtgacctccttcgattctct 39218981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 233 - 427
Target Start/End: Original strand, 7812005 - 7812199
Alignment:
Q  233 gattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataa 332  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7812005 gattggcttattttgagtttatgtgagtttatctacttccattagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataa 7812104  T
Q  333 gctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7812105 gctgcttatgtcatatttcaataagcttaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctct 7812199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 4035854 - 4036051
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| || |||||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4035854 ttggattggtttatttttagcttatatgggcttatctactcccataagttttattaaaggtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatcatagtttca 4035953  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4035954 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 4036051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 41575520 - 41575717
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  41575520 ttggattggcttattttgagcttatgtagacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaattgcttatcatagtttca 41575619  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41575620 taagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctct 41575717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 6144473 - 6144276
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| || |||||| |||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6144473 ttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccatatgcctttttaacagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 6144374  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144373 taagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 6144276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 234 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 44805140 - 44804947
Alignment:
Q  234 attggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 333  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44805140 attggcttattttgagcttatgtaggtttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttagataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 44805041  T
Q  334 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44805040 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 44804947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 222 - 427
Target Start/End: Original strand, 5320562 - 5320768
Alignment:
Q  222 tggccccgtt-ggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  5320562 tggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaagttgttttggtaaataaataaaaataatttatc 5320661  T
Q  321 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 420  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| | || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5320662 atagtttcataagttgcttatgtcatgtttcaataagcctaaattttcaacttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 5320761  T
Q  421 attctct 427  Q
    |||||||    
T  5320762 attctct 5320768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 231 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 34999095 - 34998899
Alignment:
Q  231 tggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcat 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||  | | |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34999095 tggattggcttattttgagcttatacgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcttagtttcat 34998996  T
Q  331 aagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34998995 aagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttgccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatttaatctccttcgattctct 34998899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 8021726 - 8021915
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8021726 ttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 8021825  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  8021826 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttca--------tccggcttaacaaggagcttatgagtttatataacctacttcgattctct 8021915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 42571601 - 42571795
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  42571601 ttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaat-aataaaaatagcttatcatagtttca 42571699  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  42571700 taagctgcttatgtcatatttcaat--gcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaaggaacttatgaatttatgcaacctctttcgattctct 42571795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 234 - 427
Target Start/End: Original strand, 28639289 - 28639484
Alignment:
Q  234 attggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccat----aagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| | ||    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28639289 attggcttattttaagcttatgtgagcttatctactcctatatacaagcttttttaaaggtgttttggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 28639388  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28639389 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacatagagcttatga--ttatgtaacctccttcgattctct 28639484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 36491164 - 36491361
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| | |||| || |  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  36491164 ttggattggcttattttaagcttatgtgggattatctaatcgcataagtctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttca 36491263  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36491264 taacttgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctctttcgattctct 36491361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 230 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 40118052 - 40117903
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40118052 ttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 40117953  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctc 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  40117952 taagctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagcttaccctc 40117903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 33287225 - 33287040
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33287225 ttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccatatgcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagtttca 33287126  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33287125 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctc------------tagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 33287040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 230 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26783933 - 26783801
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26783933 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagtttca 26783834  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaa 362  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26783833 taagctgcttatgccatattttaataagcctaa 26783801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 302 - 428
Target Start/End: Original strand, 9807339 - 9807465
Alignment:
Q  302 taaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatga 401  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  9807339 taaataaaaatagcttatcatagcttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatga 9807438  T
Q  402 atttatgtaacctccttcgattctctg 428  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9807439 atttatgaaacctccttcgtttctctg 9807465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 233 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 66377 - 66182
Alignment:
Q  233 gattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataa 332  Q
    |||||||||||||||||  | |||  |||||| || | ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  66377 gattggcttattttgagtttctgtaggcttatctattcccatatgtctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaataacttataatagtttcataa 66278  T
Q  333 gctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcc-tccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  66277 gctgcttatgccatatttcaataagtttaaattttcagcttaccctttcggcttaacaaggagcttatgaatttacgtgacctccttcgattctct 66182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 230 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2322212 - 2322068
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| ||   |||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| | |||||    
T  2322212 ttggattggcttattcggagcttatatggatttatctactaacataagcttttttaaaggtgtttgggtaaatcaataaaaacagcttatcacaatttca 2322113  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctta 374  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2322112 taagctgcttatatcatattttgataagcctaaattttaagctta 2322068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 230 - 351
Target Start/End: Original strand, 5005173 - 5005294
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  || | |||    
T  5005173 ttggattggcttatcttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatgctactctca 5005272  T
Q  330 taagctgcttatgtcatatttt 351  Q
    ||| |||||||||  |||||||    
T  5005273 taaactgcttatgctatatttt 5005294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 234 - 374
Target Start/End: Original strand, 39220267 - 39220407
Alignment:
Q  234 attggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 333  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||   | |||||||||    
T  39220267 attgacttattttgagcttatatgaacttatctacatccatatgtctttttaaaggtgtttgagtaaatcaataaaaatagcttattccaatttcataag 39220366  T
Q  334 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctta 374  Q
    ||||| ||   ||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  39220367 ctgctcatactatattttaataagctcaaattttgagctta 39220407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 310
Target Start/End: Original strand, 9806880 - 9806960
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 310  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| || |||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9806880 ttggattgacttattttgagtttatatgtgcttatctactcccatatgcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaa 9806960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 8042609 - 8042806
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8042609 ttggatgggcttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttca 8042708  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8042709 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 8042806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 37698329 - 37698132
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37698329 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 37698230  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698229 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 37698132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 220 - 427
Target Start/End: Original strand, 25999379 - 25999587
Alignment:
Q  220 tatggccccgtt-ggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 318  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25999379 tatggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 25999478  T
Q  319 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 418  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25999479 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttctt 25999578  T
Q  419 cgattctct 427  Q
    |||||||||    
T  25999579 cgattctct 25999587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 230 - 425
Target Start/End: Original strand, 32244122 - 32244317
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244122 ttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 32244221  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 425  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244222 taagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 32244317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20842534 - 20842337
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  20842534 ttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcatagtttca 20842435  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20842434 taagctgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 20842337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 42308091 - 42307894
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42308091 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggcgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 42307992  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42307991 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattctct 42307894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 230 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 54870360 - 54870165
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  54870360 ttggattggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatcgtttca 54870261  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54870260 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 54870165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 15520328 - 15520131
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  15520328 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatcgtttca 15520229  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15520228 taaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctct 15520131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22175176 - 22174979
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22175176 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttca 22175077  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22175076 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 22174979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 423
Target Start/End: Original strand, 38856095 - 38856288
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38856095 ttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 38856194  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 423  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38856195 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgatt 38856288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 46452348 - 46452151
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||||||||  |||||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46452348 ttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 46452249  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46452248 taagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctcaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 46452151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 230 - 425
Target Start/End: Original strand, 29445490 - 29445685
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29445490 ttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 29445589  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 425  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29445590 taagctgtttatgccctattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttccattct 29445685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 234 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 12117840 - 12117647
Alignment:
Q  234 attggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 333  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12117840 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 12117741  T
Q  334 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12117740 ttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctct 12117647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 21581044 - 21581241
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21581044 ttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttca 21581143  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21581144 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacatccttcgattctct 21581241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 35226449 - 35226646
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  35226449 ttggattggcctattttgagcttatgtgggcttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaatcagcttatcatagtttca 35226548  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226549 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcctaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 35226646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 38933948 - 38934144
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  38933948 ttggattggcttattttgagcttatgtg-gcttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttca 38934046  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38934047 taagctgcttatgtcatattttaataagtctaaatttccagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 38934144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 50528931 - 50529128
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  50528931 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttca 50529030  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529031 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 50529128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 220 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 25494482 - 25494274
Alignment:
Q  220 tatggccccgtt-ggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 318  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| | |||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25494482 tatggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 25494383  T
Q  319 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 418  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25494382 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctcctt 25494283  T
Q  419 cgattctct 427  Q
    |||||||||    
T  25494282 cgattctct 25494274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 32359261 - 32359458
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||   |||| || |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32359261 ttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctatttccataagcttttataaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 32359360  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32359361 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 32359458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 44609519 - 44609322
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  44609519 ttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctacttgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttca 44609420  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44609419 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctctttcgattctct 44609322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 232 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 42105155 - 42104963
Alignment:
Q  232 ggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcata 331  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42105155 ggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacatttttaaaggtgtttggataaaaaaataaaaatagtttatcatagtttcata 42105056  T
Q  332 agctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42105055 agctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcatgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 42104963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 15520638 - 15520835
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  15520638 ttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagtttca 15520737  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15520738 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttttgtaacctccttcgattctct 15520835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 20699151 - 20699348
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  20699151 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagtttca 20699250  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20699251 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttaggaatttttgtaacctccttcgattctct 20699348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 26122816 - 26123013
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||| || | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26122816 ttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctattcccatgagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttca 26122915  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  26122916 taagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagtagcttatgaatttacgtaacattcttcgattctct 26123013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 48925187 - 48924992
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||||||||||| |||  ||| || | |||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48925187 ttggattggcttatttagagtttatatgggtttatctacttccataagcttttttaaaagt--ttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 48925090  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48925089 taagctgtttatgtcatattttaataagtctaaatttttagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 48924992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 54534512 - 54534317
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  54534512 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatggttt-a 54534414  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54534413 taagctgcttatgccata-ttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 54534317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 233 - 423
Target Start/End: Original strand, 34700346 - 34700536
Alignment:
Q  233 gattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataa 332  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34700346 gattggtttattttgagcttatgtgggtttatttacttccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataa 34700445  T
Q  333 gctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34700446 gctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaagaagcttatgaatttatataacctcctttgatt 34700536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 252 - 427
Target Start/End: Original strand, 44688785 - 44688959
Alignment:
Q  252 tatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatatttt 351  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44688785 tatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatg-catatttt 44688883  T
Q  352 aataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44688884 aataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgcaacctccttcgattctct 44688959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 230 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 24835885 - 24835692
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| |   |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24835885 ttggattgatttattttgagcttatatagacttatcaactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttattatagtttca 24835786  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 423  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24835785 taagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaactccttcgatt 24835692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 234 - 427
Target Start/End: Original strand, 2895191 - 2895388
Alignment:
Q  234 attggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 333  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  2895191 attgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaaattatcatagtttcataag 2895290  T
Q  334 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagct----tatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2895291 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatatatgaatttatataacctccttcgattctct 2895388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 230 - 380
Target Start/End: Original strand, 35643219 - 35643369
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35643219 ttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctacttccataagcctttttaaaggtgcttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 35643318  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctcc 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  35643319 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttgagcttaccctcc 35643369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 53028227 - 53028416
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| || | ||||||| ||||||| ||||        |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  53028227 ttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagtctttttagaggt--------aaataaataaaaatagcttatcatattttca 53028318  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53028319 taaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 53028416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 272 - 423
Target Start/End: Original strand, 16354390 - 16354541
Alignment:
Q  272 cataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 371  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16354390 cataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttcataagctgctaatgccatgttttaataagcctaaattttcagc 16354489  T
Q  372 ttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 423  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16354490 ttatcctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctgcgatt 16354541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 427
Target Start/End: Original strand, 12915931 - 12916105
Alignment:
Q  252 tatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatatttt 351  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  12915931 tatgtgggcttatttact-ccataaatctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcataatttcataaactgcttatgtcatattta 12916029  T
Q  352 aataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12916030 aataagcttaagttttcagcttaccctccggtttaagaaagagtttatgaatttatgtaacccccttcgattctct 12916105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 230 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 50529959 - 50529827
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50529959 ttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 50529860  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaa 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  50529859 taagctgcttatgccatattttaatgagcctaa 50529827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 344 - 427
Target Start/End: Original strand, 24366145 - 24366228
Alignment:
Q  344 catattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24366145 catattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttagattctct 24366228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 349 - 427
Target Start/End: Original strand, 13696914 - 13696992
Alignment:
Q  349 tttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  13696914 tttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttgtgtaacctcctttgattctct 13696992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 230 - 356
Target Start/End: Original strand, 49128051 - 49128177
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||| | | |||||| |||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||    
T  49128051 ttggattgacttattttaaacttatgtgggcttatctactcctataagtctttttaaagatgtttgggtaaatcaataaaaataacttatcgtaatttca 49128150  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataa 356  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||    
T  49128151 taagctgcttatgctatattttaataa 49128177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 384 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 50528914 - 50528873
Alignment:
Q  384 ttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50528914 ttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattct 50528873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 220 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 33359291 - 33359083
Alignment:
Q  220 tatggccccgtt-ggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 318  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33359291 tatggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 33359192  T
Q  319 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 418  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359191 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 33359092  T
Q  419 cgattctct 427  Q
    |||||||||    
T  33359091 cgattctct 33359083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 234 - 427
Target Start/End: Original strand, 933295 - 933488
Alignment:
Q  234 attggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 333  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933295 attggcttattttgagctcatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 933394  T
Q  334 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  933395 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgaatctct 933488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 3511329 - 3511526
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3511329 ttggattgtcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatagataaaaatagcttatcatagtttca 3511428  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3511429 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 3511526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 5280866 - 5281063
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5280866 ttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattcacataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 5280965  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5280966 taagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 5281063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 43068163 - 43067966
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43068163 ttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 43068064  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43068063 taagcttcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 43067966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 12097780 - 12097583
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12097780 ttggattggcttaagttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttca 12097681  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12097680 taagctacttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 12097583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 12101368 - 12101171
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12101368 ttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 12101269  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101268 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctatggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 12101171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 20346494 - 20346691
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20346494 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttca 20346593  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20346594 taagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgaaacctccttcgattctct 20346691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 24792522 - 24792325
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||||||||  |||||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24792522 ttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 24792423  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792422 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 24792325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 30181214 - 30181017
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30181214 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 30181115  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30181114 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacccccttcgattctct 30181017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 42965186 - 42964989
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42965186 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 42965087  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42965086 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 42964989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 220 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22649895 - 22649691
Alignment:
Q  220 tatggccccgttgga-ttggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 318  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22649895 tatggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 22649796  T
Q  319 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 418  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22649795 tcataatttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcatt 22649696  T
Q  419 cgatt 423  Q
    |||||    
T  22649695 cgatt 22649691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 230 - 425
Target Start/End: Original strand, 7164190 - 7164385
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7164190 ttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 7164289  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 425  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7164290 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattct 7164385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 33846714 - 33846522
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33846714 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 33846615  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33846614 taaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctta-----gggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 33846522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 233 - 427
Target Start/End: Original strand, 6394760 - 6394954
Alignment:
Q  233 gattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataa 332  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6394760 gattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatggtttcataa 6394859  T
Q  333 gctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6394860 gctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 6394954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 222 - 423
Target Start/End: Original strand, 25748484 - 25748686
Alignment:
Q  222 tggccccgtt-ggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 320  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||| ||| | || |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25748484 tggccccgtttggattggcttaagttgagcttatattagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 25748583  T
Q  321 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748584 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 25748683  T
Q  421 att 423  Q
    |||    
T  25748684 att 25748686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 42204160 - 42204358
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttt-taaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttc 328  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42204160 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagtttc 42204259  T
Q  329 ataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42204260 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgattctct 42204358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 1803032 - 1803229
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1803032 ttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 1803131  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1803132 taagctgcttatacgatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 1803229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 4477511 - 4477314
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4477511 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatggtttca 4477412  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4477411 taagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 4477314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 9452596 - 9452793
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9452596 ttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctattctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttca 9452695  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9452696 taagctgtctatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacactccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 9452793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 32041548 - 32041745
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32041548 ttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 32041647  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  32041648 taagctgcttatgtcatattttcataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttataaatttatgtaaccttattcgattctct 32041745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 43156719 - 43156916
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43156719 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 43156818  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43156819 taagctgtttatggcaaatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagaacttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 43156916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 15655918 - 15656115
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  15655918 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagtttca 15656017  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15656018 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 15656115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 256 - 427
Target Start/End: Original strand, 48865662 - 48865836
Alignment:
Q  256 tgagcttatatacttccataagcctttt---taaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatatttta 352  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48865662 tgagcttatctacttccataagccttttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatatttta 48865761  T
Q  353 ataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865762 ataagcctaaattttcagcttaacatcaggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 48865836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 8630672 - 8630869
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||| | ||||||||||  |||||| | | || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8630672 ttggatttgtttattttgaggttatgtgggttgatctactcccataagcctttttaaaggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 8630771  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  8630772 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaatccccttcgattctct 8630869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 36891019 - 36890823
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||  |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36891019 ttggattgacttattt-gagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 36890921  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36890920 taagttgcttatgccatatttcaataagcctaagttttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 36890823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 230 - 423
Target Start/End: Original strand, 38866550 - 38866743
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||| | |||| |||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38866550 ttggatcgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataattttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 38866649  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 423  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38866650 taagctgtttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 38866743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 42673471 - 42673664
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    || || ||||||||||||||    
T  42673471 ttggattgacttatttggagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaa----aacagcttatcatagtttca 42673566  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42673567 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 42673664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 230 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 46891530 - 46891336
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagccttttt-aaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttc 328  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  |||||| |||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  46891530 ttggattggcttattttgagcttatataggcttatctactcctataaaccttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttgtcatagtttt 46891431  T
Q  329 ataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46891430 ataagctgcttatgtcatattttaattagcctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacctccttcgatt 46891336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 4347279 - 4347475
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| |||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4347279 ttggattgacttattttaagcttatgtgggcttatctactcccataaacttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaccatagtttca 4347378  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  4347379 taagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttaccctcgagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc-ccttctattctct 4347475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 46134494 - 46134297
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||| | ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46134494 ttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcctataactctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttattatagtttca 46134395  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  46134394 taagctgtttacgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttattaatttatgtaacctcattcgattctct 46134297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 218 - 427
Target Start/End: Original strand, 17753593 - 17753803
Alignment:
Q  218 tatatggccccgtt-ggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 316  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||   ||||||| |||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17753593 tatatgaccccgtttggattagcttattttgagcttatacaagcttatctactcctataagccttttagaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 17753692  T
Q  317 tatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 416  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |   |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17753693 taacatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttacccttcaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcc 17753792  T
Q  417 ttcgattctct 427  Q
    |||||||||||    
T  17753793 ttcgattctct 17753803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 256 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16894671 - 16894502
Alignment:
Q  256 tgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 355  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16894671 tgagcttatctactcccataagcttttttaaaggtatttgggtaaacaaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 16894572  T
Q  356 agcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 425  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |   |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16894571 agcctaaattttcagcttacccttcaacttaacagggagcttatgaatttatgtaacatccttcgattct 16894502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 43021766 - 43021573
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  43021766 ttggattggcttattttaagtttatgtggacttatctacttcaataagtctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaataacttattatagtttca 43021667  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||    |  | ||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43021666 taagctgcttatggcatatt----tcggtctaaattttcagcttactctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 43021573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 234 - 369
Target Start/End: Original strand, 19828280 - 19828415
Alignment:
Q  234 attggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 333  Q
    ||||||||||||||||  |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  19828280 attggcttattttgagtttatgttggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaa 19828379  T
Q  334 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttca 369  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  19828380 ttgcttatgccatattttaataagccaaaattttca 19828415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 230 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37006001 - 37005857
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| || |||||    
T  37006001 ttggattggcttattttaagcttatgtgagtttatctacttctataagtttttttaaaggcgtttgggtaaatcagtaaaaatagcttatcgtaatttca 37005902  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctta 374  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  37005901 taagctgcttatgctatattttaataaggctaattttttagctta 37005857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 230 - 319
Target Start/End: Original strand, 37704986 - 37705075
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 319  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37704986 ttgggttgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 37705075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 234 - 374
Target Start/End: Original strand, 43405030 - 43405170
Alignment:
Q  234 attggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 333  Q
    |||| |||||||| ||| |||||  |||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  43405030 attgacttattttaagcttatgttggcttatctactcctataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatcgtaatttcataag 43405129  T
Q  334 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctta 374  Q
     || || |   ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  43405130 ttgtttctactatattttaataagcccaattttttagctta 43405170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 358
Target Start/End: Original strand, 20163825 - 20163953
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| |||   ||||| ||||| | || | |||||||| ||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  20163825 ttggattgacttattttgggcttatatgagcttatttaccaacataatcctttgtgaatgcgtttgggtgaattaattaaaatagcttatcacagtttca 20163924  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagc 358  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  20163925 taagctgcttatagcatattttaacaagc 20163953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36849677 - 36849590
Alignment:
Q  280 tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttt 367  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  36849677 tttttaaaggtgtttggataaatcaataaaatcagcttatcacaatttcataaactgtttatgtcatattttaataagctcaaatttt 36849590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15655602 - 15655458
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||| | | | ||||||||||| | ||||  |||||| |||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||| ||| || | ||| |    
T  15655602 ttggattggcttattctaaacttatgtgagcttgtctactaacataagtctttttaaaactatttggataaatcaataaaaatagcttaccacaatttta 15655503  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctta 374  Q
    ||| ||||||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  15655502 taaactgcttataccaaattttaataagctcaaattttgagctta 15655458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30075429 - 30075277
Alignment:
Q  220 tatggccccgtt-ggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 318  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||| ||||  |||||||| ||| | |   |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  30075429 tatggccccgtttggattgacttattttaagcttatgtgagtttatctactaacataagccctttcagatacgtttgggtaaataa-taaaaatagctta 30075331  T
Q  319 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctta 374  Q
    | ||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  30075330 t-ata-tttcataaaccgcttataccatattttaataagccataattttgagctta 30075277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 27691512 - 27691428
Alignment:
Q  234 attggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 318  Q
    ||||| |||||||||   ||| || |||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27691512 attggtttattttgaatttatatgggcttatctactcccataaatctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatatttta 27691428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 3347723 - 3347526
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3347723 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatcatagtttca 3347624  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3347623 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 3347526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 26947076 - 26946879
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26947076 ttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 26946977  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26946976 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 26946879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 6086799 - 6086602
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6086799 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 6086700  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086699 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 6086602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 9459570 - 9459767
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9459570 ttggattggcttattttgagtttatgtgagcttatctatttccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 9459669  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9459670 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtatcctccttcgattctct 9459767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 2837552 - 2837749
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2837552 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 2837651  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837652 tgagctgctcatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 2837749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 11167247 - 11167444
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11167247 ttggattggcttattttgagcttatgtgtgcttatttattttcataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 11167346  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167347 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccaccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 11167444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 30691858 - 30692055
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30691858 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 30691957  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30691958 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 30692055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 26704539 - 26704342
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26704539 ttggattggtttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 26704440  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704439 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 26704342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 17261273 - 17261076
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  17261273 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttctaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttataatattttca 17261174  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17261173 taagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 17261076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 18613545 - 18613742
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  18613545 ttggattgacttattttgagcttatgcggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagttcca 18613644  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18613645 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 18613742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 240 - 427
Target Start/End: Original strand, 21893472 - 21893659
Alignment:
Q  240 ttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgctt 339  Q
    ||||||||||| |||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21893472 ttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatatataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 21893571  T
Q  340 atgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21893572 atgccatattttaataagcctaatttttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 21893659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 233 - 427
Target Start/End: Original strand, 1153603 - 1153797
Alignment:
Q  233 gattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataa 332  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1153603 gattggcttattttaagcttatgttggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagattatcatagtttcataa 1153702  T
Q  333 gctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1153703 gctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggtgcttatgtatttatgtaacctccttcgtttctct 1153797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 220 - 427
Target Start/End: Original strand, 20726787 - 20726991
Alignment:
Q  220 tatggccccgtt-ggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 318  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||    
T  20726787 tatggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa----taaaaataactta 20726882  T
Q  319 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 418  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20726883 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 20726982  T
Q  419 cgattctct 427  Q
    |||||||||    
T  20726983 cgattctct 20726991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 34887492 - 34887295
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| | |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34887492 ttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctcctcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 34887393  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34887392 taagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctaatgaatttatgtgacctccttcgattctct 34887295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 230 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 3955966 - 3955782
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3955966 ttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 3955867  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 414  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3955866 taaactgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 3955782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 230 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 30699129 - 30698934
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  30699129 ttggattgacttattatgagtttatgtgagcttatttatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttta 30699030  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 425  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30699029 ttagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 30698934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 230 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 16307208 - 16307015
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16307208 ttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatcatagtttca 16307109  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 423  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16307108 taagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgatt 16307015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 28199709 - 28199511
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatact--tccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 327  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28199709 ttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 28199610  T
Q  328 cataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28199609 catatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 28199511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 234 - 427
Target Start/End: Original strand, 35198295 - 35198487
Alignment:
Q  234 attggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 333  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35198295 attggcttattttgaacttatgtgggcttatctacttccataagc-tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 35198393  T
Q  334 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  35198394 ctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagtttactctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtgatctcattcgattctct 35198487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 293 - 427
Target Start/End: Original strand, 33464399 - 33464533
Alignment:
Q  293 ttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaagg 392  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33464399 ttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagg 33464498  T
Q  393 agcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33464499 agcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 33464533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 230 - 379
Target Start/End: Original strand, 52843 - 52992
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52843 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 52942  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctc 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52943 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctc 52992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 316 - 427
Target Start/End: Original strand, 53001 - 53112
Alignment:
Q  316 ttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53001 ttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 53100  T
Q  416 cttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||    
T  53101 cttcgattctct 53112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 230 - 301
Target Start/End: Original strand, 33463708 - 33463779
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33463708 ttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa 33463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 1165801 - 1165604
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1165801 ttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 1165702  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165701 taagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 1165604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 1579044 - 1579241
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579044 ttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 1579143  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579144 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 1579241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 1605771 - 1605574
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605771 ttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 1605672  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605671 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 1605574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 9008257 - 9008060
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9008257 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 9008158  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9008157 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 9008060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 24105871 - 24105674
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24105871 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 24105772  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24105771 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattatcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 24105674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 230 - 426
Target Start/End: Original strand, 27420866 - 27421062
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27420866 ttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 27420965  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 426  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27420966 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctc 27421062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 8374538 - 8374342
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8374538 ttggattgccttattttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 8374439  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8374438 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatg-atttatgtaacctccttcgattctct 8374342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 16069361 - 16069558
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16069361 ttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 16069460  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069461 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 16069558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 234 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 16737643 - 16737450
Alignment:
Q  234 attggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 333  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16737643 attggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 16737544  T
Q  334 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737543 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 16737450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27679369 - 27679172
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27679369 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 27679270  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27679269 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgattctct 27679172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 31883152 - 31883349
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31883152 ttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 31883251  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31883252 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 31883349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 3386686 - 3386493
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3386686 ttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 3386587  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 423  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3386586 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcctatgaatttatgtaacctccttcgatt 3386493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 33491396 - 33491199
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33491396 ttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 33491297  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33491296 taagctgcttttgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 33491199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 4120945 - 4121142
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4120945 ttggaatggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcccttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaataatttatcatagtttca 4121044  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4121045 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgattctct 4121142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 19358534 - 19358731
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19358534 ttggattgccttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 19358633  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19358634 taagctgcttatgccatattttagtaagcctaaattttcagcttaccctccaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgattctct 19358731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 234 - 427
Target Start/End: Original strand, 33991152 - 33991345
Alignment:
Q  234 attggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 333  Q
    |||| |||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33991152 attgacttattttgagtttatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 33991251  T
Q  334 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33991252 ttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctct 33991345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 38598650 - 38598453
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  38598650 ttggattggcttactttgaacttatgtgagcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagtttca 38598551  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38598550 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 38598453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 220 - 427
Target Start/End: Original strand, 5202969 - 5203177
Alignment:
Q  220 tatggccccgtt-ggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 318  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||  | |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5202969 tatggccccgtttggattgacttattttgagtttatgttggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 5203068  T
Q  319 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 418  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  5203069 tcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtcaccttctt 5203168  T
Q  419 cgattctct 427  Q
    |||||||||    
T  5203169 cgattctct 5203177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 3921589 - 3921786
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||  ||||||||||  ||| || |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3921589 ttggattgatttattttgagtttatatgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttca 3921688  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3921689 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaaaaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 3921786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 234 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20992342 - 20992149
Alignment:
Q  234 attggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 333  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20992342 attggcttattttgagcttatgtggtcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcatatcatagtttcataag 20992243  T
Q  334 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20992242 ctgattatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttcgattctct 20992149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 35782844 - 35782647
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35782844 ttggattgccttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 35782745  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35782744 taagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcctaccctccgtgcttacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctct 35782647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 256 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 26603116 - 26602945
Alignment:
Q  256 tgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 355  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26603116 tgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaactgcttatgccatattttaata 26603017  T
Q  356 agcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||| ||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26603016 agcataatttttcagtttactctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattctct 26602945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 271 - 427
Target Start/End: Original strand, 27025005 - 27025161
Alignment:
Q  271 ccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcag 370  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27025005 ccataagactttttaaagatgttcgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccattttttaataagcctaaattttcag 27025104  T
Q  371 cttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27025105 cttaccctccggcttaacaaggagtttataaatttatgtaacctccttcgattctct 27025161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 31410484 - 31410681
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||  ||||||||||  ||| || | |||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |    
T  31410484 ttggattgatttattttgagtttatatgggtttatctacccccataagtctttttaaaggtgtttgagtaaacaaataaaaatagcttatcatagtttta 31410583  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31410584 taagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 31410681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 230 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20992485 - 20992354
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgt----gagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 325  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20992485 ttggattggcttattttgagcttatgtacatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcatatcatagt 20992386  T
Q  326 ttcataagctgcttatgtcatattttaataag 357  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20992385 ttcataagctgcttatgccatattttaataag 20992354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 230 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 33284775 - 33284642
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  33284775 ttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttaagtaaataaataaaaatagcttatcatagtttta 33284676  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaa 363  Q
    ||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  33284675 taaactgcttataccatatttcaataagcctaaa 33284642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 252 - 358
Target Start/End: Original strand, 31638175 - 31638281
Alignment:
Q  252 tatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatatttt 351  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||| |||||||| |||||  |||||||||  |||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31638175 tatgtgagcttacctactaacataagcctttgtaaaagtgtttggataaatcgataaaaataacttatcacaattttataagcttcttatgtcatatttt 31638274  T
Q  352 aataagc 358  Q
    |||||||    
T  31638275 aataagc 31638281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 376 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 35420478 - 35420427
Alignment:
Q  376 cctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35420478 cctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 35420427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 41818605 - 41818536
Alignment:
Q  288 ggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataag 357  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  41818605 ggtgtttaggtaaattaataaaaatagcttatcatatttttataagctgcttatattgtattttaataag 41818536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 423
Target Start/End: Original strand, 27024822 - 27024853
Alignment:
Q  392 gagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27024822 gagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 27024853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 374
Target Start/End: Original strand, 25634593 - 25634732
Alignment:
Q  233 gattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataa 332  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||||  |||||||  ||| |||   ||||||||||||||   ||||||| |||| | | ||||||||    
T  25634593 gattggcttattttaagcttatgagagtttatctactaacataagctctttcaaatacgtttgggtaaataat--aaaatagcttataacaatttcataa 25634690  T
Q  333 gctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctta 374  Q
    || ||||||  ||||||||||||| ||  |||||| ||||||    
T  25634691 gccgcttataccatattttaataaaccataattttgagctta 25634732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 272 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19516128 - 19516044
Alignment:
Q  272 cataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataa 356  Q
    |||||| |||||||| || ||||||  |||  ||||||||||| ||||   | |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19516128 cataagtctttttaacggcgtttggacaaagtaataaaaatagcttatatcaatttcataaactgcttatgtaatattttaataa 19516044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 221 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 19913828 - 19913621
Alignment:
Q  221 atggccccgtt-ggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 319  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  19913828 atggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaattaaaacagcttat 19913729  T
Q  320 catagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19913728 catagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 19913629  T
Q  420 gattctct 427  Q
    ||||||||    
T  19913628 gattctct 19913621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 15241216 - 15241019
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15241216 ttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagtttca 15241117  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15241116 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 15241019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 20877052 - 20877249
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20877052 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 20877151  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20877152 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttacgtaacctccttagattctct 20877249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 219 - 427
Target Start/End: Original strand, 38055150 - 38055359
Alignment:
Q  219 atatggccccgtt-ggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 317  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38055150 atatggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatttt 38055249  T
Q  318 atcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38055250 atcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcca 38055349  T
Q  418 tcgattctct 427  Q
    ||||||||||    
T  38055350 tcgattctct 38055359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 53717652 - 53717455
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53717652 ttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 53717553  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53717552 taagctgcttatgccctattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 53717455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 54189550 - 54189747
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54189550 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 54189649  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189650 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 54189747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 230 - 425
Target Start/End: Original strand, 14987797 - 14987992
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14987797 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagccattttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 14987896  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14987897 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcttgcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 14987992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 1617089 - 1617286
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1617089 ttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttca 1617188  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1617189 taagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 1617286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 1756952 - 1756755
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1756952 ttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttca 1756853  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1756852 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattctct 1756755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 23776647 - 23776450
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23776647 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 23776548  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23776547 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggatcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 23776450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 218 - 423
Target Start/End: Original strand, 50353793 - 50353999
Alignment:
Q  218 tatatggccccgtt-ggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 316  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50353793 tataaggccccgtttggattggcttattttgagcttctgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 50353892  T
Q  317 tatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 416  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50353893 tatgatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaatttttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 50353992  T
Q  417 ttcgatt 423  Q
    |||||||    
T  50353993 ttcgatt 50353999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 6611548 - 6611351
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6611548 ttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 6611449  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6611448 taagctgtttatgtcatattttgataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 6611351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 16700786 - 16700983
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16700786 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttca 16700885  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16700886 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctagcttaacaaggagcttataaatttatgtaacctccttcgattctct 16700983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 23704397 - 23704200
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23704397 ttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcacataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 23704298  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23704297 taagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcatttgattctct 23704200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 234 - 427
Target Start/End: Original strand, 33703850 - 33704043
Alignment:
Q  234 attggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 333  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  33703850 attgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcatagtttcataag 33703949  T
Q  334 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703950 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 33704043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 234 - 427
Target Start/End: Original strand, 37464730 - 37464923
Alignment:
Q  234 attggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 333  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37464730 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagtttcataag 37464829  T
Q  334 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37464830 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttaccctccggtttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 37464923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 53875662 - 53875859
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  53875662 ttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatatactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttta 53875761  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53875762 taagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgattctct 53875859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 54412633 - 54412830
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54412633 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttca 54412732  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54412733 taagctgcttatgtcatattctaataagtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacctccttcgattctct 54412830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 230 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 45424722 - 45424527
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424722 ttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 45424623  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 425  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424622 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 45424527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 230 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 50055289 - 50055098
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  50055289 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatggtttca 50055190  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 421  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055189 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 50055098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 233 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 28032897 - 28032707
Alignment:
Q  233 gattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataa 332  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28032897 gattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtatcataa 28032798  T
Q  333 gctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 423  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28032797 gctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 28032707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27488836 - 27488639
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||||||||  |||||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27488836 ttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 27488737  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488736 taagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 27488639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 30423752 - 30423556
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30423752 ttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 30423653  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30423652 taagctgcttatgccatatttcaataagcataaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagctta-gaatttatgtaacctccttcgattctct 30423556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 44379375 - 44379178
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44379375 ttggattgacttattttgagtttatataggcttatctacttccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 44379276  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44379275 taagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgattctct 44379178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 240 - 427
Target Start/End: Original strand, 31969696 - 31969883
Alignment:
Q  240 ttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgctt 339  Q
    ||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31969696 ttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgctt 31969795  T
Q  340 atgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31969796 atgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 31969883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 230 - 428
Target Start/End: Original strand, 52139208 - 52139406
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| | |||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52139208 ttggattggcttattttgaacttatgtgggtttatctatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 52139307  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctg 428  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139308 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctg 52139406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 2481596 - 2481399
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  2481596 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagtttca 2481497  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2481496 taagctgcttatgccatattttaataagccaaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 2481399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 15669188 - 15669385
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15669188 ttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctaatcacataagactttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttca 15669287  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15669288 taagctgcttatgtcatactttaataagcctaaattttcagcttaccgtccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttccattctct 15669385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 30171585 - 30171782
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  30171585 ttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatcttattccataagcttttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatagtttca 30171684  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30171685 taagctgcttataccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccttccggtttaacaaggagcttatgaatttatttaacctccttcgattctct 30171782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 234 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 40428904 - 40428711
Alignment:
Q  234 attggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 333  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40428904 attggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 40428805  T
Q  334 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40428804 ctgcttataccatattttgataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 40428711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 43290148 - 43289951
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| | | || |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43290148 ttggattggcttattttgagcttttatgtgcttatctactcacataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 43290049  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43290048 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 43289951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 44785105 - 44784908
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  44785105 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttgtaaaagtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatcatagtttca 44785006  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44785005 taagttgcttatgccatattttaataagcctaaactttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 44784908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 48909851 - 48910048
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48909851 ttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttca 48909950  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48909951 taagctgcttatgccatattttaacaaacctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgattctct 48910048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 235 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 8591275 - 8591083
Alignment:
Q  235 ttggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagc 334  Q
    |||||||||||||||  |||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8591275 ttggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttctataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagc 8591176  T
Q  335 tgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8591175 tgcttatgccatatgttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcggttctct 8591083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 233 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 37968942 - 37968748
Alignment:
Q  233 gattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataa 332  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37968942 gattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataa 37968843  T
Q  333 gctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37968842 gctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 37968748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 11639766 - 11639569
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11639766 ttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 11639667  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11639666 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttttgattctct 11639569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 35490961 - 35490764
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||  |||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35490961 ttggattggcttattttgagcttatatgggcttatccactctcataagcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttca 35490862  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35490861 taagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccaccttcgattctct 35490764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27536288 - 27536095
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  | |||||    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27536288 ttggattggcttattttgagcttatacgggctta----ctcccataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 27536193  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27536192 taaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 27536095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 230 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 19165160 - 19164971
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagccttttt-aaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttc 328  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19165160 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttc 19165061  T
Q  329 ataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 420  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19165060 ataagctgcttatgccata-tttaataagcctaaattttcagcttaccct-cggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 19164971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 6688809 - 6688618
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  6688809 ttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc- 6688711  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
         |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6688710 -----tgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 6688618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 47632039 - 47632237
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaa-ggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttc 328  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  47632039 ttggattggcttattttgagtttatgtggacttatctactctcataaacctttttaaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttctcatagtttc 47632138  T
Q  329 ataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47632139 ataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcaattctct 47632237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 8932366 - 8932169
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  8932366 ttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttaacgtagtttca 8932267  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8932266 taagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 8932169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 247 - 428
Target Start/End: Original strand, 16703843 - 16704024
Alignment:
Q  247 gagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcat 346  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16703843 gagcttatgtgaacttatctacttccataagcttttttaaagttgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccat 16703942  T
Q  347 attttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctg 428  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16703943 attttaataagcctaaattttcagtttatcctccggcttaacaaggagcctataaatttatgtaacccccttcgattctctg 16704024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 40680226 - 40680029
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40680226 ttggattgacttattttgaatttatgtgagcttatctacttccataagtctttttaaaggtatttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttca 40680127  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40680126 taagctgcttatgccatattttcataagcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctct 40680029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 230 - 421
Target Start/End: Original strand, 44375850 - 44376041
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcc-tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttc 328  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| || |||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44375850 ttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatcta-ttccaatagccatttttataggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttc 44375948  T
Q  329 ataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 421  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44375949 ataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaaaaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcga 44376041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 53353060 - 53353265
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcata----tgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 325  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    | || |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53353060 ttggattggcttattttgagcttaattatatgggcttatctactcccatatgtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 53353159  T
Q  326 ttcataagctgcttatgtcatatttta----ataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 421  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53353160 ttcataagctgcttatgccatattttaatatataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttatgtaacctccttcga 53353259  T
Q  422 ttctct 427  Q
    ||||||    
T  53353260 ttctct 53353265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27583820 - 27583623
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  27583820 ttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaagatgtttggataaataaataaaaataacttatcatagttgca 27583721  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27583720 taagctgcttatgccatattttcataagcctaaatttttagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcaattctct 27583623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 230 - 396
Target Start/End: Original strand, 28360435 - 28360602
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28360435 ttggattgacttattttgagcttatgtgggcttttctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttta 28360534  T
Q  330 taagctgcttatgtca-tattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagct 396  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28360535 taagctgcttatgccattatttttataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagct 28360602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 234 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 55345009 - 55344816
Alignment:
Q  234 attggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 333  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | |||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||    
T  55345009 attgacttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatatttgcatgag 55344910  T
Q  334 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
     || ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55344909 ttgtttataccatattttaataagccaaaattttcagcttaccatccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgattctct 55344816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 234 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 38071504 - 38071327
Alignment:
Q  234 attggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 333  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38071504 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataatcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 38071405  T
Q  334 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 414  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||      || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38071404 ctgcttatgccatattttaataagcctgaattttcagttta---cggggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 38071327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 302 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 23269162 - 23269037
Alignment:
Q  302 taaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatga 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23269162 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 23269063  T
Q  402 atttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  23269062 atttatgtaatctccttcgattctct 23269037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 230 - 374
Target Start/End: Original strand, 50053448 - 50053592
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50053448 ttggattggcttattttgagcttatatggacttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggcaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 50053547  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctta 374  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  50053548 taagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcatctta 50053592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 344 - 427
Target Start/End: Original strand, 53408138 - 53408222
Alignment:
Q  344 catattttaataagcctaaattttcagcttatcct-ccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53408138 catattttattaagcctaaattttcagcttacccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 53408222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 230 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23265945 - 23265865
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23265945 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 23265865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 327 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 9595982 - 9595893
Alignment:
Q  327 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |           |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9595982 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaact-----------ctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 9595894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 291 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 51780845 - 51780763
Alignment:
Q  291 gtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctt 373  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  51780845 gtttggataaatcaataaaaatagcttatcataatttcataagctgcttatgccatattttaataagcccaaattttaagctt 51780763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 367 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 23261937 - 23261877
Alignment:
Q  367 tcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23261937 tcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 23261877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 239 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 44548320 - 44548185
Alignment:
Q  239 cttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgct 338  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||| | ||| ||||| || |    
T  44548320 cttatttggagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttggataaatcaataaaaacatcttatcacaattttataagttgtt 44548221  T
Q  339 tatgtcatattttaataagcctaaattttcagctta 374  Q
    |||| | ||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  44548220 tatgccctattttattaagcccaaattttaagctta 44548185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 384 - 427
Target Start/End: Original strand, 50055304 - 50055347
Alignment:
Q  384 ttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055304 ttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 50055347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 427
Target Start/End: Original strand, 48748197 - 48748260
Alignment:
Q  364 ttttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||| || ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  48748197 ttttcagcataccctccgtcttaataaggagcttatgaatttatgtaatctccttcaattctct 48748260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 374
Target Start/End: Original strand, 17493340 - 17493482
Alignment:
Q  232 ggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcata 331  Q
    |||||| ||||||||||   ||| ||| | ||| |||| | |||||| ||||||| || ||||| |||||| ||||||||||  ||||  || ||| |||    
T  17493340 ggattgacttattttgaatttatatgaacatatctactcctataagcatttttaagggcgtttgagtaaatcaataaaaatatcttattctaattttata 17493439  T
Q  332 agctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctta 374  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||| ||||||    
T  17493440 agctgcttataccatgttttaataagctcaaattttgagctta 17493482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 55344715 - 55344684
Alignment:
Q  396 ttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55344715 ttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 55344684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 46257407 - 46257269
Alignment:
Q  220 tatggccccgttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 319  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| ||  ||||| || |||| ||||  ||||||| |||  |||  ||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  46257407 tatggcccgattgaattggcttattttaagtttatgtaagtttatctactgacataagcatttacaaaattgtttgggtaaatcaattgaaagagtttat 46257308  T
Q  320 catagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagc 358  Q
    || | |||||||||||| ||||   ||| ||||||||||    
T  46257307 cacaatttcataagctgtttattctatagtttaataagc 46257269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 55344777 - 55344724
Alignment:
Q  316 ttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttca 369  Q
    |||||||| |||||| || || ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  55344777 ttatcatattttcatgagttgtttatgccatattttaataagccaaaattttca 55344724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 36710 - 36907
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36710 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 36809  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36810 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 36907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 6175028 - 6174831
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6175028 ttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttca 6174929  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  6174928 taagctgcttatgtcatatttcattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttacgtgacctccttcgattctct 6174831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 42937724 - 42937922
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42937724 ttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 42937823  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaat-aagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42937824 taagctgcttatgccatattttaataaagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 42937922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 219 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 31517427 - 31517218
Alignment:
Q  219 atatggccccgtt-ggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31517427 atatggccccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctt 31517328  T
Q  318 atcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 417  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31517327 atcatagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctcct 31517228  T
Q  418 tcgattctct 427  Q
    ||||||||||    
T  31517227 tcgattctct 31517218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 18807084 - 18806887
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18807084 ttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 18806985  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18806984 taagctgcttatgctatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 18806887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 3873444 - 3873247
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3873444 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagtttca 3873345  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3873344 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatataacctcattcgattctct 3873247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 33906247 - 33906054
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33906247 ttggattgacttattttgaacttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 33906148  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 423  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906147 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 33906054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 4016044 - 4016241
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||    
T  4016044 ttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaataacgtatcatagtttca 4016143  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4016144 taagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 4016241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 39635457 - 39635654
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  39635457 ttggattagcttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagtttca 39635556  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39635557 taagctgcttatgtcatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaacgagcttatcaatttatgtaacctccttcgattctct 39635654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 233 - 427
Target Start/End: Original strand, 5733407 - 5733601
Alignment:
Q  233 gattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataa 332  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  5733407 gattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatcagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaacaacttatcatagtttcataa 5733506  T
Q  333 gctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5733507 gctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgattctct 5733601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 26323386 - 26323189
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26323386 ttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagtctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttca 26323287  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26323286 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctct 26323189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 223 - 410
Target Start/End: Original strand, 1108277 - 1108464
Alignment:
Q  223 ggccccgttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 322  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1108277 ggccccgtttggatggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 1108376  T
Q  323 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgta 410  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1108377 agtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgta 1108464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 4232342 - 4232149
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4232342 ttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 4232243  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 423  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4232242 taagctgcttatgccatattttcacaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcattcgatt 4232149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 30270879 - 30270686
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30270879 ttggattggcttattttaagcttatatgagtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttggataaataaaataaaatagtttatcatagtttca 30270780  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30270779 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgatt 30270686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 239 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 19384126 - 19383938
Alignment:
Q  239 cttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgct 338  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  19384126 cttattttgagtttatatgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgtt 19384027  T
Q  339 tatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19384026 tatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 19383938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 234 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 16066490 - 16066302
Alignment:
Q  234 attggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 333  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16066490 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctttcataagtcttttttaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 16066391  T
Q  334 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 422  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066390 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctgatttaataaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 16066302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 230 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 28330037 - 28329844
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28330037 ttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacacccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 28329938  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 425  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28329937 taaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccct--agcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacctccttcgattct 28329844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 230 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 19901337 - 19901143
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19901337 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttctctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataa-taaaaatagcttatcatagtttca 19901239  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 425  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19901238 taaactgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcccacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattct 19901143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 233 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 1483099 - 1482906
Alignment:
Q  233 gattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataa 332  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  1483099 gattggcttattttgagcttatgtgggcttatctact-ccataagcttttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattattgtttcataa 1483001  T
Q  333 gctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1483000 gctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttacccttcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacatccttcgattctct 1482906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 30420367 - 30420182
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  30420367 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcataggttca 30420268  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30420267 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc------------ttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttcgattctct 30420182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 272 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 2178927 - 2178772
Alignment:
Q  272 cataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 371  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178927 cataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagc 2178828  T
Q  372 ttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178827 ttaccctctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 2178772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 851002 - 851199
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||  |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||| |    
T  851002 ttggatttgcttattttaagcttatgtaggcttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaatagagcttatcataatttta 851101  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  851102 taagctgcttatgccatattttaataagcttaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 851199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 230 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 16588976 - 16588783
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16588976 ttggattggcttattttgtgtttatgtgggcttatctactttcataagtctttttaaagaagtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttca 16588877  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 423  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16588876 taagctgcttatgccatattttcataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaattaatgtaacctccgtcgatt 16588783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 234 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 44947738 - 44947552
Alignment:
Q  234 attggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 333  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||| || | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44947738 attggcttattttgatcttatgtgagtttatctagtgccataagcatttttaaaagtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 44947639  T
Q  334 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||| |||||||        |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44947638 ctgcttatgccatattt-------gctaaattttcagtttaccctccggcttaacaagaagtttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 44947552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 272 - 426
Target Start/End: Original strand, 429863 - 430017
Alignment:
Q  272 cataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 371  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  429863 cataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcataatttcataagttgcttatgcgatattttaataagcctaaattttcaac 429962  T
Q  372 ttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 426  Q
    |||   | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  429963 ttacaattcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattctc 430017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 230 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 42446769 - 42446625
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||||||||||  |||  |||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  |||||| | |||||    
T  42446769 ttggattggcttattcggagtttatgcgaacttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttaggtaaatcaataaaaacaacttatcacaatttca 42446670  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctta 374  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  42446669 taagctgcttatgccatattttaataagatcaaattttaagctta 42446625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 272 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22101305 - 22101210
Alignment:
Q  272 cataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttt 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22101305 cataagcctttttaaaggtatttgtataaatcaataaaaacaacttatcacaatttcataagctgcttatgtcatattttaataagcccaaatttt 22101210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 374
Target Start/End: Original strand, 3585337 - 3585439
Alignment:
Q  272 cataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagc 371  Q
    ||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||    
T  3585337 cataaaccttattaaatgtgttttggtaaattaataaaaacaatttatcacaatttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaattatgagc 3585436  T
Q  372 tta 374  Q
    |||    
T  3585437 tta 3585439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 33510489 - 33510686
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510489 ttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagtttca 33510588  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510589 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 33510686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 222 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 42371004 - 42370798
Alignment:
Q  222 tggccccgtt-ggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 320  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  42371004 tggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaacttatc 42370905  T
Q  321 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 420  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42370904 atagtttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 42370805  T
Q  421 attctct 427  Q
    |||||||    
T  42370804 attctct 42370798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 1170644 - 1170447
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1170644 ttggattggcttattttgagcttttgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttca 1170545  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1170544 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 1170447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 16052101 - 16052298
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16052101 ttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 16052200  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16052201 taagctgcttatgccatattttaataagcctgaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 16052298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 20089476 - 20089673
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20089476 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 20089575  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20089576 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 20089673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 29078521 - 29078718
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29078521 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 29078620  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078621 taagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 29078718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 38829074 - 38829271
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38829074 ttggattggcttattttgagcttatgtcggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 38829173  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38829174 taagctgcttgtgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccatcgattctct 38829271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 19715361 - 19715164
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19715361 ttggattggtttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcattgtttca 19715262  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19715261 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 19715164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 25897379 - 25897576
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25897379 ttggattgacttattttgagcttatgtgggcatatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 25897478  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897479 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 25897576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 26663263 - 26663460
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26663263 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttca 26663362  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663363 taagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 26663460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 39260546 - 39260349
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39260546 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 39260447  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39260446 taagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 39260349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 29288154 - 29288349
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29288154 ttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 29288253  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29288254 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaa--tatgtaacctccttcgattctct 29288349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 1168508 - 1168705
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1168508 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 1168607  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1168608 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctcctttgattctct 1168705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 1940947 - 1940750
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1940947 ttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 1940848  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1940847 taagttgtttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcaattctct 1940750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 8120874 - 8121071
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8120874 ttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagtttca 8120973  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8120974 taagctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagtttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 8121071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 46760971 - 46761168
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46760971 ttggattgacttattttgaacttatatgagcttatctacttgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 46761070  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46761071 taaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacttccttcgattctct 46761168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 52753347 - 52753150
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52753347 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 52753248  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52753247 taagctacttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 52753150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 2347661 - 2347859
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||| | ||||||||||  |||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2347661 ttggatttgtttattttgagtttatgcgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 2347760  T
Q  330 taagctgcttatgtcata-ttttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2347761 taagctgcttatgtcatatttttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 2347859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 423
Target Start/End: Original strand, 5215390 - 5215583
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5215390 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactttcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagtttca 5215489  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 423  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5215490 taagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaacttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 5215583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 26580470 - 26580277
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26580470 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagcttatcatagtttca 26580371  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 423  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580370 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 26580277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 41928695 - 41928498
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41928695 ttggattggcttattttgaacttatgtggacttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 41928596  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41928595 taagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 41928498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 17591696 - 17591890
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17591696 ttggattggcttatt--gagcttatgtg-gcttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttca 17591792  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17591793 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttccagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 17591890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 222 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 970735 - 970527
Alignment:
Q  222 tggccccgtt-ggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 320  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  970735 tggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatc 970636  T
Q  321 ata--gtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 418  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  970635 atatagtttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcctt 970536  T
Q  419 cgattctct 427  Q
    |||||||||    
T  970535 cgattctct 970527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 234 - 427
Target Start/End: Original strand, 23498469 - 23498662
Alignment:
Q  234 attggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 333  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23498469 attggcttattttaagcttatgtgggcttatctacttccacaagcctttttcaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttcatcatagtttcataag 23498568  T
Q  334 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23498569 ttgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattctct 23498662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 423
Target Start/End: Original strand, 40092496 - 40092689
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  40092496 ttggattgacttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatcttatcatagtttca 40092595  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 423  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  40092596 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctttttcgatt 40092689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 423
Target Start/End: Original strand, 52696796 - 52696989
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  52696796 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagtttca 52696895  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 423  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52696896 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 52696989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 230 - 425
Target Start/End: Original strand, 6765464 - 6765659
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  |||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6765464 ttggattggcttattttgagtttatgtgaatttatctacttttataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatattttca 6765563  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 425  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6765564 tgagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctccttcgattct 6765659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 8079909 - 8079712
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8079909 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 8079810  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  8079809 taagctacttatgccatattttaataagcctaagttttcagcttaccctctggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctcctttgattctct 8079712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 12682825 - 12683022
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12682825 ttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 12682924  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12682925 taagctgcttatgccatattttcataagcctaaatctttagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 12683022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 32671584 - 32671781
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||   |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32671584 ttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 32671683  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32671684 taagctacttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttcgattctct 32671781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 423
Target Start/End: Original strand, 43905659 - 43905852
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43905659 ttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 43905758  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 423  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43905759 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttacgtaacctccttcgatt 43905852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 256 - 427
Target Start/End: Original strand, 40149494 - 40149665
Alignment:
Q  256 tgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaata 355  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40149494 tgagcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataatttatcatagttttataagctgcttatgtcatattttaata 40149593  T
Q  356 agcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40149594 agcctaaattttcagtttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 40149665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 222 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 51359425 - 51359220
Alignment:
Q  222 tggccccgtt-ggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  51359425 tggccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatttactgccataagccttcttaaaggt-tttgggtaaataattaaaaatagcttatc 51359327  T
Q  321 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 420  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51359326 atagtttcataaggtgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctccttcg 51359227  T
Q  421 attctct 427  Q
    |||||||    
T  51359226 attctct 51359220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 7145212 - 7145409
Alignment:
Q  230 ttggattggcttatttt-gagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttc 328  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||   |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7145212 ttggattgacttatttttgagcttatgtgtatttatctactcccataagcctttttaaaagtgtt-gggtaaataaacaaaaatagtttatcatagtttc 7145310  T
Q  329 ataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7145311 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 7145409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 2473727 - 2473924
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2473727 ttggatcggtttattttgagcttatgtgggcttatctacgcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttca 2473826  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  2473827 taagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctcctacttaacaaggagcttatgaatttatgttacctccttcgagtctct 2473924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 241 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 17587694 - 17587510
Alignment:
Q  241 tattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgctta 340  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  17587694 tattttgagcttatgtgagcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaacagcttatcatattttcataagctgctta 17587595  T
Q  341 tgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 425  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17587594 tgccatattttaataagcctaaattttcagcttacactctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 17587510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 13996923 - 13996726
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  13996923 ttggattggcttattttgaaattatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttataatggtttca 13996824  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13996823 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctcattcgattctct 13996726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 49146177 - 49146374
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49146177 ttggattggtttattttgagcttatgtggatttatatactcccataagtttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttca 49146276  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  49146277 taagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcatcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacgtcattcgattctct 49146374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 220 - 427
Target Start/End: Original strand, 15203106 - 15203314
Alignment:
Q  220 tatggccccgttgga-ttggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 318  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||| ||| | |||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15203106 tatggccccgtttgaattgacttattttaagcttttgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgttagggtaaataaataaaaatagctta 15203205  T
Q  319 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 418  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15203206 tcatagtttcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagccaaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttctt 15203305  T
Q  419 cgattctct 427  Q
    |||||||||    
T  15203306 cgattctct 15203314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 46409440 - 46409639
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46409440 ttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctaatctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 46409539  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccg--gtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46409540 taagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttacccttcgacaattaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 46409639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 15717790 - 15717986
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||  || ||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15717790 ttggattgacttattttgagtttatgttggcctatctaatttcataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctt-tcatagtttca 15717888  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15717889 taagctgcttatgccataatttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgattttatgtaacctccttcaattctct 15717986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 15554344 - 15554155
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||||||||  |||||| ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||   ||||    
T  15554344 ttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag-----cat---ttca 15554253  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15554252 taaactgctgatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 15554155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 230 - 391
Target Start/End: Original strand, 29695680 - 29695842
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataa-gcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttc 328  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| ||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29695680 ttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcccataatttttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaataatttatcatagtttc 29695779  T
Q  329 ataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaag 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  29695780 ataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaag 29695842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 234 - 427
Target Start/End: Original strand, 38171841 - 38172021
Alignment:
Q  234 attggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 333  Q
    |||| ||||||||||   ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38171841 attgacttattttgaatttatgtgaacttatctactcacataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagtttatcatagtttcataag 38171940  T
Q  334 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||             |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38171941 ctgcttatgt-------------gcctaaattttcagcttatcctccggcttaagaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 38172021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 238 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 23323032 - 23322897
Alignment:
Q  238 gcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgc 337  Q
    ||||||||||||| ||| |  |||||| |||| |||||| | ||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23323032 gcttattttgagcttatataggcttatctactcccataaactttttttaaggcgtttgaataaatcaataaaaatagtttatcataatttcataagctgc 23322933  T
Q  338 ttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctt 373  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||    
T  23322932 ttatgtcatactttaataagcgcaaattttaagctt 23322897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 230 - 354
Target Start/End: Original strand, 52086272 - 52086396
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| | |||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||| |||||    
T  52086272 ttggattgacttattttaagcttatgtgggtttatctgctcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaatcagtaaaaataacttatcataatttca 52086371  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaat 354  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||    
T  52086372 taagctgcttatgccataatttaat 52086396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5217983 - 5217840
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||  |||||||  ||| |||    ||||||||||| ||||||||||| ||||   | |||||    
T  5217983 ttggattggcttattttaagcttatgagagcttatctactaacataagctctttcaaatacatttgggtaaat-aataaaaatagcttataccaatttca 5217885  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctta 374  Q
    ||||| ||||||  |||||||| |||||||  |||||| ||||||    
T  5217884 taagccgcttataccatatttttataagccataattttgagctta 5217840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 296
Target Start/End: Original strand, 5675110 - 5675176
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgg 296  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||  ||||||| |||| |||| |||||||    
T  5675110 ttggattggcttattttaagcttatgttagcttatctactaacataagctttttgaaagatgtttgg 5675176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 230 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 23151 - 22956
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23151 ttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 23052  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 425  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23051 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 22956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 495 - 298
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  495 ttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttca 396  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  395 taagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 145445 - 145248
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  145445 ttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 145346  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  145345 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttataaatttatgtaacctccttcgattctct 145248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 10243 - 10440
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| || | |||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10243 ttggattgacttattttgagcttatatgggtttatctactctcataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 10342  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10343 taagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 10440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 234 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 202 - 9
Alignment:
Q  234 attggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 333  Q
    |||||||||  |||||  ||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  202 attggcttaagttgagtttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 103  T
Q  334 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  102 ctgcttatgccatattttaataatcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Original strand, 3715 - 3912
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttca 329  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3715 ttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 3814  T
Q  330 taagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3815 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttttgattctct 3912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 230 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 207 - 9
Alignment:
Q  230 ttggattggcttattttgagcatatgtgagcttatatact--tccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 327  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  207 ttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 108  T
Q  328 cataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 427  Q
    |||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107 catatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University