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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF15672_low_20 (Length: 389)
Name: NF15672_low_20
Description: NF15672
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF15672_low_20 |
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Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Original strand, 3431837 - 3432155
Alignment:
| Q |
10 |
aagaaaatagtcagtaattggttcgtaattcgcttcgctacttgatacgagctctagtacacaaccatcaaagtattaggtacgaaggagtacatatagt |
109 |
Q |
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||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
3431837 |
aagaacatagtcaataattggttcgtaattcgcttcgctacttgatacgagttctagtacacaaccctcaaagtattaggtacgaaggagtacatatagt |
3431936 |
T |
|
| Q |
110 |
cgatacactattttaattcatggtatgatttaatatattcaacgctacatatatatgaatatgttttcaaattatacaaatgtaaagccatatttacaca |
209 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
3431937 |
cgatacactattttaattcatggtatgatttaatatattcaacgctacatat----gaatatgttttcaaattatacaaatgtaaagccatatttacaca |
3432032 |
T |
|
| Q |
210 |
gatgaaataatcaatataaatacaagatacacacacataaatatatactgtattttactgtaagaaatacgtatatatttaccggtcaacacacgggcaa |
309 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
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| T |
3432033 |
gatgaaataatcaatataaatacaagatacacacacataaatatatactgtattttactgtaagaaatacgtatatatttaccggtcaacacacgagcaa |
3432132 |
T |
|
| Q |
310 |
tataaatacatatactttacctc |
332 |
Q |
| |
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| T |
3432133 |
tataaatacatatactttacctc |
3432155 |
T |
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Target: chr4 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 34 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 11913643 - 11913357
Alignment:
| Q |
34 |
gtaattcgcttcgctacttgatacgagctctagtacacaaccatcaaagtatta---ggtacgaaggagtacat----atagtcgatacactattttaat |
126 |
Q |
| |
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||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| || |
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| T |
11913643 |
gtaattcgcttcgttccttgatacgagctctattacacaaccctcaaagtattattaggtatgaaggagtacatgcatatagtcgatgcactatttcaaa |
11913544 |
T |
|
| Q |
127 |
tcatggtatgatttaatatattcaacgctacatatatatgaatatgttttcaaattatacaaatgtaaagccatatttacacagatgaaataatcaatat |
226 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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| T |
11913543 |
ttatggtatgatttaatatattaaacggcacct---tatgaatatgtttttaaattatacaaatgtaaagccatatttacac---tgaaataatcaatat |
11913450 |
T |
|
| Q |
227 |
aaatacaagatacacacacataaatatatactgtattttactgtaagaaatacgtatatatttaccggtcaacacacgggcaatataaataca |
319 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
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| T |
11913449 |
aaatacaagatacacacacataaatatatactgtattttactgtaagaaatacatatatatttactggtcaacacacgagcaatataaataca |
11913357 |
T |
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