View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF15705_high_1 (Length: 804)
Name: NF15705_high_1
Description: NF15705
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF15705_high_1 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 744; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 744; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 5842340 - 5841569
Alignment:
| Q |
19 |
atttcgatgccagattcctacccaatcaaaatccaattatacctgaaatagtactaccatctaatccttcctcttgtgaagatacatggtcattggattg |
118 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
5842340 |
atttcaatgccagattcctacccaatcaaaatccaattatacctgaaatagtactaccatctaatccttcctcttgtgaagatacatggtcattggattg |
5842241 |
T |
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| Q |
119 |
tgtagctcttgatctcaatccaagtcaattggaaaatcaaatttcaaaaagtggcaccactccatttaatattgatgacacatcaatcaaccaaagttca |
218 |
Q |
| |
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| T |
5842240 |
tgtagctcttgatctcaatccaagtcaattggaaaatcaaatttcaaaaaatggcaccactccatttaatattggtgacacatcaatcaaccaaagttca |
5842141 |
T |
|
| Q |
219 |
ttaatgcagcaatatgatcaatatcatgatcataacttggttgaacatgaagccattttgcctaaattactcaatgatcaaagccttgaaaattatgcat |
318 |
Q |
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|
| T |
5842140 |
ttaatgcagcaatatgatcaatatcatgatcataacttggttgaacatgaagccattgtgcctaaattactcaatgatcaaagccttgaaaattatgcat |
5842041 |
T |
|
| Q |
319 |
gtagcatcctagattattcatctgattccaaggaacaagtgatcctaaactccaatcatcatcatcaagatcagttctaccttccaacttcatctccaaa |
418 |
Q |
| |
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|
| T |
5842040 |
gtagcatcctagattattcatctgattccaaggaacaaatgatcctaaactccaatcatcatcatcaagatcagttctaccttccaacctcatctccaaa |
5841941 |
T |
|
| Q |
419 |
tctacaaggaaatttttaccaaattgatacaaatgtagacatgatcaataaccattataatcccaatttccttgacattgagaatcaaataccatctaat |
518 |
Q |
| |
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|
|
| T |
5841940 |
tctacaaggaaatttttaccaaattgatacaaatgtagacatgatcaataaccattataatcccaatttccttgacattgagaatcaaataccatctaat |
5841841 |
T |
|
| Q |
519 |
cctttccctgatgaagatacatggtcattagagtgtgtggctcttcatatcaatagaaataaagaaaatccaagtgatactacccaacatcacaatttag |
618 |
Q |
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|
| T |
5841840 |
cctttccctgatgaagatacatggtcattagagtgtgtggctcttcatatcaatagaaataaagaaaatccaagtgatactacccaacatcacaatttag |
5841741 |
T |
|
| Q |
619 |
tcaacccaattgcatcaatggcacaacaatatgatcaatgtcatgatcatcacttgattgaaactgaacccaatattttgcctcaattagtcaatgatca |
718 |
Q |
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|
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|
|
| T |
5841740 |
tcaacccaattgcatcaatggcacaacaatatgatcaatgtcatgatcatcacttggttgaaactgaacccaatattttgcctcaattagtcaatgatca |
5841641 |
T |
|
| Q |
719 |
aagccttgaggaccatgattgttgcatcctagattcatttgattccaaggaacatgaagctcttagtattat |
790 |
Q |
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|
|
| T |
5841640 |
aagccttgaggaccatgattgttgcatcctagattcatttgattccaaggaacatgaagctcttagtattat |
5841569 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 744; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 5849050 - 5848279
Alignment:
| Q |
19 |
atttcgatgccagattcctacccaatcaaaatccaattatacctgaaatagtactaccatctaatccttcctcttgtgaagatacatggtcattggattg |
118 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5849050 |
atttcaatgccagattcctacccaatcaaaatccaattatacctgaaatagtactaccatctaatccttcctcttgtgaagatacatggtcattggattg |
5848951 |
T |
|
| Q |
119 |
tgtagctcttgatctcaatccaagtcaattggaaaatcaaatttcaaaaagtggcaccactccatttaatattgatgacacatcaatcaaccaaagttca |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5848950 |
tgtagctcttgatctcaatccaagtcaattggaaaatcaaatttcaaaaaatggcaccactccatttaatattggtgacacatcaatcaaccaaagttca |
5848851 |
T |
|
| Q |
219 |
ttaatgcagcaatatgatcaatatcatgatcataacttggttgaacatgaagccattttgcctaaattactcaatgatcaaagccttgaaaattatgcat |
318 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5848850 |
ttaatgcagcaatatgatcaatatcatgatcataacttggttgaacatgaagccattgtgcctaaattactcaatgatcaaagccttgaaaattatgcat |
5848751 |
T |
|
| Q |
319 |
gtagcatcctagattattcatctgattccaaggaacaagtgatcctaaactccaatcatcatcatcaagatcagttctaccttccaacttcatctccaaa |
418 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
5848750 |
gtagcatcctagattattcatctgattccaaggaacaaatgatcctaaactccaatcatcatcatcaagatcagttctaccttccaacctcatctccaaa |
5848651 |
T |
|
| Q |
419 |
tctacaaggaaatttttaccaaattgatacaaatgtagacatgatcaataaccattataatcccaatttccttgacattgagaatcaaataccatctaat |
518 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5848650 |
tctacaaggaaatttttaccaaattgatacaaatgtagacatgatcaataaccattataatcccaatttccttgacattgagaatcaaataccatctaat |
5848551 |
T |
|
| Q |
519 |
cctttccctgatgaagatacatggtcattagagtgtgtggctcttcatatcaatagaaataaagaaaatccaagtgatactacccaacatcacaatttag |
618 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5848550 |
cctttccctgatgaagatacatggtcattagagtgtgtggctcttcatatcaatagaaataaagaaaatccaagtgatactacccaacatcacaatttag |
5848451 |
T |
|
| Q |
619 |
tcaacccaattgcatcaatggcacaacaatatgatcaatgtcatgatcatcacttgattgaaactgaacccaatattttgcctcaattagtcaatgatca |
718 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5848450 |
tcaacccaattgcatcaatggcacaacaatatgatcaatgtcatgatcatcacttggttgaaactgaacccaatattttgcctcaattagtcaatgatca |
5848351 |
T |
|
| Q |
719 |
aagccttgaggaccatgattgttgcatcctagattcatttgattccaaggaacatgaagctcttagtattat |
790 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5848350 |
aagccttgaggaccatgattgttgcatcctagattcatttgattccaaggaacatgaagctcttagtattat |
5848279 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 201 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 5886483 - 5885874
Alignment:
| Q |
201 |
tcaatcaaccaaagttcattaatgcagcaatatgatcaatatcatgat---cataacttggttgaacatgaagccattttgcctaaattactcaatgatc |
297 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5886483 |
tcaatcaaccaaagttcattaatgcaacaatatgatcaatatcatgatgatcataatttggttaaacttgaagcccttgtgcctaaattagtcaatgatc |
5886384 |
T |
|
| Q |
298 |
aaagccttgaaaattatgcatgtagcatcctagattattcatctgattccaaggaacaagtgatcctaaactccaatcatcatcatca---agatcagtt |
394 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5886383 |
aaagccttgaggattatgcttgtagcatcctagattattcatctgattccaaggaacatgtgatcctaaactcctatcatcatcatcatcaagatcagtt |
5886284 |
T |
|
| Q |
395 |
ctaccttccaacttcatctccaaatctacaaggaaatttttaccaaattgatacaaatgtagacatgatcaataaccattataatcccaatttccttgac |
494 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5886283 |
ttaccttccaacctcatctctaaatctacaaggaaatttttaccaaattgatacaaaggtagacatgatcaataaccattataatcccaatttccttgac |
5886184 |
T |
|
| Q |
495 |
attgagaatcaaataccatctaatcctttccctgatgaagatacatggtcattagagtgtgtggctcttcatatcaatagaaataaagaaaatccaagtg |
594 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5886183 |
attgagaatcaaataccatctaatccttttcctgatgaagatccatggtcattagattgtgtggctcttcatatcaatcgaattaaagaaaatccaagtg |
5886084 |
T |
|
| Q |
595 |
atactacccaacatcacaatttagtcaacccaattgcatcaatggcacaacaatatgatcaatgtcatgatcatcacttgattgaaactgaacccaatat |
694 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
5886083 |
ataccagccaacatcacaatttagtcaacccaattgtattaatgccacaacaatatgatcaatgtcatgatcatcacttggttgaaatggaacccattat |
5885984 |
T |
|
| Q |
695 |
tttgcctcaattagtcaatgatcaaagccttgaggaccatgattgttgcatcctagattcatttgattccaaggaacatgaagctcttagtattatctac |
794 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
5885983 |
tgtgcctaaattagtcaatgatcaaagccttgaggaacatgattgttgcatcctggattcatctgattccaagaaacatgaagctcttagtattatttat |
5885884 |
T |
|
| Q |
795 |
ccacgagatc |
804 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |
|
|
| T |
5885883 |
ccacaagatc |
5885874 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 458 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 5848055 - 5847723
Alignment:
| Q |
458 |
catgatcaataaccattataatcccaatttccttgacattgagaatcaaataccatctaatcctttccctgatgaagatacatggtcattagagtgtgtg |
557 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5848055 |
catgatcaataaccattataatcccaatttccttgacattgagaatcaaataccatctaatcctttccctgatgaagatacatggtcattagagtgtgtg |
5847956 |
T |
|
| Q |
558 |
gctcttcatatcaatagaaataaagaaaatccaagtgatactacccaacatcacaatttagtcaacccaattgcatcaatggcacaacaatatgatcaat |
657 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5847955 |
gctcttcatatcaatagaaataaagaaaatccaagtgatactacccaacatcacaatttagtcaacccaattgcatcaatggcacaacaatatgatcaat |
5847856 |
T |
|
| Q |
658 |
gtcatgatcatcacttgattgaaactgaacccaatattttgcctcaattagtcaatgatcaaagccttgaggaccatgattgttgcatcctagattcatt |
757 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5847855 |
gtcatgatcatcacttggttgaaactgaacccaatattttgcctcaattagtcaatgatcaaagccttgaggaccatgattgttgcatcctagattcatt |
5847756 |
T |
|
| Q |
758 |
tgattccaaggaacatgaagctcttagtattat |
790 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5847755 |
tgattccaaggaacatgaagctcttagtattat |
5847723 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5886643 - 5886484
Alignment:
| Q |
17 |
caatttcgatgccagattcctacccaatcaaaatccaattatacctgaaatagtactaccatctaatccttcctcttgtgaagatacatggtcattggat |
116 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5886643 |
caatttcaatgccaagttcccacccaatcaaaatccaattatacctgaaatagtactaccatctaatccttcctcttgtgaagatacatggtcattggat |
5886544 |
T |
|
| Q |
117 |
tgtgtagctcttgatctcaatccaagtcaattggaaaatcaaatttcaaaaagtggcacc |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5886543 |
tgtgtagctcttgatctcaatccaagtcaattggaaaatcaaatttcaaaaagtggcacc |
5886484 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 401 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 5920478 - 5920367
Alignment:
| Q |
401 |
tccaacttcatctccaaatctacaaggaaatttttaccaaattgatacaaatgtagacatgatcaataaccattataatcccaatttccttgacattgag |
500 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
5920478 |
tccaacctcatctccaaatctacaaggtaattttcaccaaattgatacaaaggtagacatgatcaataaccattataatggcaatttccttcacattcaa |
5920379 |
T |
|
| Q |
501 |
aatcaaatacca |
512 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |
|
|
| T |
5920378 |
aatccaatacca |
5920367 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 403 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 5983660 - 5983554
Alignment:
| Q |
403 |
caacttcatctccaaatctacaaggaaatttttaccaaattgatacaaatgtagacatgatcaataaccattataatcccaatttccttgacattgagaa |
502 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| | || |
|
|
| T |
5983660 |
caacctcatctccaaatctacaaggtaattttcatcaaattgatacaaaggtagac---atcaatgaccattataatgccaatttccctcacattcaaaa |
5983564 |
T |
|
| Q |
503 |
tcaaatacca |
512 |
Q |
| |
|
|| ||||||| |
|
|
| T |
5983563 |
tccaatacca |
5983554 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5920348 - 5920128
Alignment:
| Q |
78 |
tctaatccttcctcttgtgaagatacatggtcattggattgtgtagctcttgatctcaatccaagtcaattggaaaatcaaatttcaaaaagtggcacca |
177 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
5920348 |
tctaatccttccccttatgaagatacatggtcattgggttgtttacctcttcatctcaatcaaaatcaa---gaaaatcaaatctcaaaaagtgatacca |
5920252 |
T |
|
| Q |
178 |
ctccatttaatattgatgacacatcaatcaaccaaagttcattaatgcagcaatatgatcaatatcatgatcataacttggttgaacatgaagccatttt |
277 |
Q |
| |
|
| ||| | | ||| | |||||||| || | ||||||| | ||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| | | |
|
|
| T |
5920251 |
ccccactca---------acaaaataatcaacccaattgaattaatggaacaatatgttcaatgtcatgat------ttggttgaacttgaagccactct |
5920167 |
T |
|
| Q |
278 |
gcctaaattactcaatgatcaaagccttgaaaattatgc |
316 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
5920166 |
gcctaaattagtcaatgatcaaagccttgaggattatgc |
5920128 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 403 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 5948059 - 5947976
Alignment:
| Q |
403 |
caacttcatctccaaatctacaaggaaatttttaccaaattgatacaaatgtagacatgatcaataaccattataatcccaatttcc |
489 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5948059 |
caacctcatctccaaatctacaaggtaattttcatcaaattgatacaaaggtagac---atcaatgaccattataatgccaatttcc |
5947976 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5847868 - 5847741
Alignment:
| Q |
228 |
caatatgatcaatatcatgatcataacttggttgaacatgaagcc---attttgcctaaattactcaatgatcaaagccttgaaaattatgcatgtagca |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||| ||| |
|
|
| T |
5847868 |
caatatgatcaatgtcatgatcatcacttggttgaaactgaacccaatattttgcctcaattagtcaatgatcaaagccttgaggaccatgattgttgca |
5847769 |
T |
|
| Q |
325 |
tcctagattattcatctgattccaaggaaca |
355 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
5847768 |
tcctag---attcatttgattccaaggaaca |
5847741 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 218 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5983425 - 5983316
Alignment:
| Q |
218 |
attaatgcagcaatatgatcaatatcatgatcataacttggttgaacatgaagccattttgcctaaattactcaatgatcaaagccttgaaaattatgca |
317 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || | | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
5983425 |
attaatgcaacaatatgatcaatatcatgat------ttggttgaacttgatgctactatgcctgaattagtcaatcatcaaagccttgaggattatgct |
5983332 |
T |
|
| Q |
318 |
tgtagcatcctagatt |
333 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |
|
|
| T |
5983331 |
tgtaacatcctagatt |
5983316 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 5959172 - 5959051
Alignment:
| Q |
373 |
atcatcatcatcaagatcagttctaccttccaacttcatctccaaatctacaaggaaatttttaccaaattgatacaaatgtagacatgatcaataacca |
472 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| | | |||| | |||| ||||||||||||| ||| | |||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
5959172 |
atcatcaccatcaagattacctataccattcaacctcatctccaaatcagcaaagtaattttcatcaaattgatacaaaggtagac---atcaatgacca |
5959076 |
T |
|
| Q |
473 |
ttataatcccaatttccttgacatt |
497 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5959075 |
ttataatgccaatttccttcacatt |
5959051 |
T |
|
Back To:
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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 697 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 5958830 - 5958747
Alignment:
| Q |
697 |
tgcctcaattagtcaatgatcaaagccttgaggaccatgattgttgcatcctagattcatttgattccaaggaacatgaagctc |
780 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
5958830 |
tgcctgaattagaaaatcatcaaagccttgaggattatgcttgtagcatcctagattcatctaattcccaagaacatgaagctc |
5958747 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 697 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 5983372 - 5983289
Alignment:
| Q |
697 |
tgcctcaattagtcaatgatcaaagccttgaggaccatgattgttgcatcctagattcatttgattccaaggaacatgaagctc |
780 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| | |||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
5983372 |
tgcctgaattagtcaatcatcaaagccttgaggattatgcttgtaacatcctagattcatctaattcgcaagaacatgaagctc |
5983289 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
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Query Start/End: Original strand, 697 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 5920167 - 5920134
Alignment:
| Q |
697 |
tgcctcaattagtcaatgatcaaagccttgagga |
730 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
5920167 |
tgcctaaattagtcaatgatcaaagccttgagga |
5920134 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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