View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15705_low_14 (Length: 520)

Name: NF15705_low_14
Description: NF15705
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15705_low_14
NF15705_low_14
[»] chr3 (94 HSPs)
chr3 (22-515)||(32287180-32287686)
chr3 (22-515)||(54723573-54724073)
chr3 (22-515)||(2873396-2873896)
chr3 (22-504)||(50461424-50461911)
chr3 (22-501)||(7486402-7486887)
chr3 (18-455)||(16184610-16185054)
chr3 (22-426)||(2775313-2775726)
chr3 (22-501)||(53815660-53816145)
chr3 (30-515)||(538666-539158)
chr3 (22-426)||(2778556-2778969)
chr3 (22-515)||(11190358-11190858)
chr3 (22-501)||(24125331-24125815)
chr3 (22-501)||(24128608-24129092)
chr3 (30-426)||(45896220-45896625)
chr3 (22-455)||(43809411-43809851)
chr3 (22-485)||(8461382-8461849)
chr3 (22-426)||(43926667-43927079)
chr3 (22-501)||(6434655-6435140)
chr3 (22-515)||(30690568-30691067)
chr3 (22-426)||(49742869-49743282)
chr3 (22-426)||(29343824-29344237)
chr3 (22-419)||(3840348-3840754)
chr3 (22-410)||(52199745-52200141)
chr3 (22-452)||(47054757-47055194)
chr3 (22-426)||(25584519-25584921)
chr3 (30-452)||(47051335-47051764)
chr3 (30-428)||(17039970-17040376)
chr3 (22-426)||(16243705-16244117)
chr3 (22-410)||(11784597-11784994)
chr3 (22-426)||(27091726-27092138)
chr3 (26-417)||(9392570-9392969)
chr3 (25-426)||(20728597-20729006)
chr3 (22-428)||(28008019-28008432)
chr3 (23-485)||(35412348-35412811)
chr3 (18-410)||(55034822-55035226)
chr3 (22-485)||(10106494-10106961)
chr3 (22-485)||(10884690-10885157)
chr3 (22-419)||(10881312-10881717)
chr3 (18-410)||(54719799-54720199)
chr3 (18-428)||(22416782-22417200)
chr3 (18-429)||(34983800-34984219)
chr3 (22-428)||(12561182-12561596)
chr3 (18-427)||(30219954-30220375)
chr3 (137-501)||(23298492-23298863)
chr3 (23-406)||(48064005-48064396)
chr3 (137-501)||(18644644-18645016)
chr3 (22-356)||(19301534-19301867)
chr3 (22-356)||(19304718-19305051)
chr3 (33-427)||(35751297-35751686)
chr3 (18-427)||(46884780-46885185)
chr3 (22-356)||(15195331-15195664)
chr3 (18-428)||(17141236-17141654)
chr3 (22-349)||(32367165-32367491)
chr3 (22-424)||(41976847-41977243)
chr3 (137-426)||(31549118-31549416)
chr3 (30-428)||(25442807-25443214)
chr3 (19-327)||(22993756-22994063)
chr3 (65-350)||(18542426-18542711)
chr3 (18-357)||(3292987-3293327)
chr3 (30-428)||(17528709-17529111)
chr3 (22-319)||(28265712-28266005)
chr3 (22-284)||(52988237-52988498)
chr3 (18-427)||(22783420-22783847)
chr3 (18-427)||(22787784-22788211)
chr3 (186-485)||(54461010-54461316)
chr3 (212-501)||(18641648-18641945)
chr3 (137-428)||(17531604-17531897)
chr3 (147-427)||(17545812-17546102)
chr3 (204-410)||(55031962-55032181)
chr3 (280-501)||(28266006-28266234)
chr3 (137-283)||(282293-282439)
chr3 (272-426)||(52309565-52309728)
chr3 (24-178)||(31857650-31857804)
chr3 (22-187)||(52309754-52309920)
chr3 (56-250)||(27308157-27308349)
chr3 (363-496)||(6922701-6922832)
chr3 (18-253)||(27298594-27298828)
chr3 (18-101)||(17544444-17544526)
chr3 (160-253)||(27308717-27308809)
chr3 (23-101)||(6922579-6922657)
chr3 (303-428)||(52990812-52990946)
chr3 (375-426)||(10902133-10902184)
chr3 (363-428)||(37408862-37408927)
chr3 (22-101)||(11636666-11636743)
chr3 (19-102)||(22360275-22360357)
chr3 (373-428)||(32367078-32367133)
chr3 (19-127)||(22370178-22370285)
chr3 (137-219)||(6030758-6030840)
chr3 (459-515)||(12541162-12541219)
chr3 (315-356)||(31857847-31857888)
chr3 (375-427)||(3292908-3292959)
chr3 (378-426)||(18542750-18542798)
chr3 (364-428)||(22993644-22993708)
chr3 (137-189)||(55032183-55032235)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (18-515)||(45155145-45155649)
chr8 (22-515)||(38248274-38248774)
chr8 (18-485)||(14421484-14421959)
chr8 (34-491)||(25230836-25231302)
chr8 (22-504)||(18824283-18824770)
chr8 (22-491)||(23643563-23644039)
chr8 (22-515)||(25591355-25591854)
chr8 (30-504)||(18825776-18826255)
chr8 (22-485)||(18721188-18721657)
chr8 (22-515)||(10663643-10664142)
chr8 (22-515)||(16953520-16954019)
chr8 (22-452)||(36710575-36711012)
chr8 (22-428)||(17930725-17931139)
chr8 (22-426)||(22173886-22174299)
chr8 (22-426)||(25594620-25595033)
chr8 (22-485)||(43681776-43682246)
chr8 (22-427)||(5980275-5980688)
chr8 (23-426)||(12582753-12583167)
chr8 (22-429)||(21279729-21280144)
chr8 (22-428)||(13196601-13197015)
chr8 (22-428)||(10498175-10498589)
chr8 (18-410)||(8911387-8911789)
chr8 (22-428)||(31284414-31284832)
chr8 (145-429)||(12516412-12516706)
chr8 (30-428)||(23619325-23619731)
chr8 (22-428)||(33419400-33419814)
chr8 (57-485)||(5538681-5539114)
chr8 (18-427)||(5613680-5614107)
chr8 (18-428)||(30784669-30785078)
chr8 (247-455)||(33883286-33883501)
chr8 (51-356)||(2560325-2560630)
chr8 (149-410)||(44027072-44027341)
chr8 (65-357)||(4868041-4868331)
chr8 (22-101)||(23613284-23613363)
chr8 (321-452)||(14589560-14589698)
chr8 (333-426)||(20887589-20887691)
chr8 (363-426)||(5584359-5584422)
[»] chr6 (58 HSPs)
chr6 (22-515)||(14281394-14281896)
chr6 (22-501)||(13004937-13005425)
chr6 (30-515)||(2378986-2379478)
chr6 (22-515)||(9953712-9954210)
chr6 (22-429)||(6513001-6513420)
chr6 (23-504)||(1125623-1126110)
chr6 (22-480)||(3596693-3597157)
chr6 (18-515)||(2846046-2846552)
chr6 (18-427)||(9839356-9839774)
chr6 (23-426)||(5738042-5738459)
chr6 (22-501)||(11402005-11402491)
chr6 (22-501)||(26942325-26942810)
chr6 (26-426)||(30655196-30655605)
chr6 (22-429)||(28107747-28108164)
chr6 (31-426)||(20185502-20185905)
chr6 (31-426)||(22150086-22150489)
chr6 (22-416)||(11125670-11126071)
chr6 (22-428)||(22561124-22561539)
chr6 (22-426)||(10289721-10290133)
chr6 (22-356)||(28111808-28112140)
chr6 (18-356)||(5259681-5260016)
chr6 (111-501)||(23384642-23385040)
chr6 (20-410)||(28230341-28230740)
chr6 (18-410)||(19475747-19476147)
chr6 (139-426)||(17106573-17106868)
chr6 (22-428)||(24399928-24400342)
chr6 (22-428)||(24410048-24410461)
chr6 (18-429)||(11247506-11247925)
chr6 (22-428)||(18855986-18856400)
chr6 (49-410)||(13946794-13947163)
chr6 (22-428)||(4512221-4512639)
chr6 (52-247)||(2372104-2372295)
chr6 (22-327)||(12988196-12988499)
chr6 (22-337)||(13021315-13021628)
chr6 (164-428)||(7128190-7128462)
chr6 (145-356)||(23007932-23008143)
chr6 (145-356)||(23780221-23780432)
chr6 (309-460)||(2372293-2372448)
chr6 (23-349)||(28848592-28848917)
chr6 (384-515)||(2372448-2372579)
chr6 (65-288)||(24371065-24371289)
chr6 (22-315)||(31072053-31072332)
chr6 (26-319)||(11192657-11192949)
chr6 (189-428)||(26896220-26896467)
chr6 (22-183)||(11188130-11188291)
chr6 (22-167)||(23388327-23388472)
chr6 (18-195)||(26898071-26898248)
chr6 (290-426)||(23847785-23847932)
chr6 (291-426)||(32109685-32109829)
chr6 (429-515)||(28107629-28107715)
chr6 (430-515)||(28111681-28111766)
chr6 (22-101)||(28665560-28665639)
chr6 (290-426)||(23842762-23842906)
chr6 (297-347)||(23667721-23667771)
chr6 (363-428)||(24155327-24155392)
chr6 (432-475)||(6514189-6514232)
chr6 (32-78)||(7918025-7918071)
chr6 (479-515)||(5260020-5260056)
[»] chr2 (56 HSPs)
chr2 (22-468)||(22020797-22021251)
chr2 (22-515)||(9185301-9185801)
chr2 (22-515)||(9188529-9189029)
chr2 (22-515)||(25959566-25960065)
chr2 (22-515)||(37279553-37280053)
chr2 (22-504)||(31427430-31427918)
chr2 (22-429)||(11347856-11348272)
chr2 (22-515)||(25870513-25871012)
chr2 (22-504)||(33310395-33310882)
chr2 (49-496)||(30274665-30275118)
chr2 (22-504)||(38015247-38015734)
chr2 (22-426)||(5105455-5105868)
chr2 (22-426)||(31585904-31586317)
chr2 (18-485)||(25138840-25139312)
chr2 (22-428)||(24234824-24235239)
chr2 (22-426)||(42368675-42369087)
chr2 (18-485)||(25820755-25821226)
chr2 (22-452)||(45456890-45457327)
chr2 (22-426)||(43207854-43208266)
chr2 (22-501)||(8888364-8888850)
chr2 (22-496)||(36808339-36808818)
chr2 (22-428)||(27266517-27266932)
chr2 (22-426)||(40781201-40781613)
chr2 (22-428)||(24238096-24238511)
chr2 (22-515)||(25873904-25874409)
chr2 (22-454)||(45493092-45493532)
chr2 (22-454)||(45500834-45501274)
chr2 (22-426)||(43723430-43723841)
chr2 (30-426)||(5666255-5666658)
chr2 (22-490)||(26365662-26366136)
chr2 (22-426)||(13971858-13972270)
chr2 (22-452)||(45453603-45454039)
chr2 (22-428)||(1386384-1386798)
chr2 (22-419)||(6826501-6826905)
chr2 (22-428)||(40259101-40259515)
chr2 (22-410)||(16178856-16179252)
chr2 (173-515)||(29440375-29440723)
chr2 (21-428)||(37937181-37937596)
chr2 (111-428)||(9966331-9966657)
chr2 (19-428)||(16790719-16791138)
chr2 (18-428)||(12219520-12219939)
chr2 (18-428)||(22630566-22630984)
chr2 (27-410)||(3875020-3875412)
chr2 (22-356)||(17876835-17877168)
chr2 (18-356)||(30926272-30926603)
chr2 (111-356)||(17874630-17874869)
chr2 (18-198)||(17876211-17876391)
chr2 (23-229)||(10600676-10600876)
chr2 (22-337)||(35521423-35521740)
chr2 (255-406)||(10600876-10601036)
chr2 (215-356)||(34682622-34682762)
chr2 (363-426)||(13137019-13137082)
chr2 (22-101)||(29440252-29440331)
chr2 (373-426)||(15470546-15470599)
chr2 (137-281)||(11187929-11188073)
chr2 (140-182)||(38427436-38427478)
[»] chr4 (75 HSPs)
chr4 (22-504)||(56195273-56195760)
chr4 (22-501)||(52530826-52531311)
chr4 (22-504)||(34319805-34320293)
chr4 (22-515)||(34017659-34018157)
chr4 (22-514)||(27014009-27014507)
chr4 (22-501)||(24150418-24150904)
chr4 (22-504)||(44808843-44809331)
chr4 (22-429)||(39501394-39501810)
chr4 (23-515)||(19859379-19859895)
chr4 (18-515)||(53094249-53094755)
chr4 (22-501)||(48637251-48637737)
chr4 (22-504)||(29324571-29325057)
chr4 (22-515)||(5672628-5673141)
chr4 (22-426)||(40903046-40903459)
chr4 (22-452)||(15812075-15812515)
chr4 (22-419)||(44164529-44164934)
chr4 (22-426)||(19820474-19820886)
chr4 (22-426)||(52006494-52006906)
chr4 (30-452)||(56198607-56199036)
chr4 (30-482)||(5681182-5681637)
chr4 (30-515)||(5670318-5670823)
chr4 (22-452)||(15405020-15405460)
chr4 (22-485)||(15431825-15432292)
chr4 (22-426)||(48415488-48415905)
chr4 (30-429)||(19864477-19864879)
chr4 (22-426)||(15429819-15430231)
chr4 (22-426)||(24044104-24044516)
chr4 (30-485)||(33408223-33408685)
chr4 (22-426)||(38283452-38283864)
chr4 (137-501)||(40616698-40617069)
chr4 (22-452)||(33926713-33927155)
chr4 (22-426)||(40794748-40795161)
chr4 (30-485)||(12238022-12238479)
chr4 (22-426)||(15436433-15436845)
chr4 (22-426)||(46955441-46955854)
chr4 (22-426)||(27677018-27677430)
chr4 (22-427)||(15163938-15164353)
chr4 (18-410)||(40493346-40493747)
chr4 (22-426)||(12782651-12783063)
chr4 (34-410)||(37103195-37103578)
chr4 (22-428)||(11195421-11195836)
chr4 (21-428)||(21419534-21419949)
chr4 (30-404)||(3718878-3719260)
chr4 (110-485)||(3797718-3798095)
chr4 (145-455)||(18911368-18911683)
chr4 (49-426)||(49270456-49270837)
chr4 (18-354)||(35509707-35510042)
chr4 (18-428)||(18673043-18673450)
chr4 (18-410)||(29544853-29545253)
chr4 (18-356)||(8874803-8875141)
chr4 (18-428)||(53009519-53009937)
chr4 (18-427)||(8877462-8877881)
chr4 (18-428)||(25961800-25962219)
chr4 (18-428)||(30392315-30392729)
chr4 (22-349)||(22172422-22172751)
chr4 (22-279)||(19827236-19827492)
chr4 (111-342)||(15446792-15447022)
chr4 (22-337)||(37739820-37740136)
chr4 (111-285)||(27679338-27679511)
chr4 (235-501)||(5706347-5706625)
chr4 (137-337)||(33493756-33493956)
chr4 (22-283)||(48014167-48014424)
chr4 (19-194)||(8448745-8448921)
chr4 (213-337)||(5677470-5677594)
chr4 (313-429)||(39498346-39498471)
chr4 (22-99)||(27691442-27691519)
chr4 (22-101)||(15438439-15438518)
chr4 (363-426)||(15445328-15445391)
chr4 (363-426)||(19827511-19827574)
chr4 (22-88)||(18911300-18911366)
chr4 (421-515)||(19864272-19864367)
chr4 (329-428)||(35510044-35510152)
chr4 (160-200)||(24410206-24410246)
chr4 (373-427)||(8871727-8871781)
chr4 (22-106)||(5677700-5677783)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (22-485)||(13449687-13450156)
chr7 (22-501)||(23224800-23225286)
chr7 (22-504)||(6603192-6603679)
chr7 (22-501)||(45286964-45287449)
chr7 (30-485)||(2441190-2441651)
chr7 (22-426)||(8276719-8277132)
chr7 (22-452)||(16165482-16165919)
chr7 (22-426)||(17730548-17730960)
chr7 (22-409)||(48645208-48645603)
chr7 (22-426)||(4595977-4596389)
chr7 (22-426)||(9864694-9865107)
chr7 (22-428)||(13842374-13842788)
chr7 (32-426)||(20594007-20594409)
chr7 (22-410)||(9132744-9133140)
chr7 (22-419)||(4546603-4547008)
chr7 (22-426)||(26557234-26557645)
chr7 (38-480)||(37415340-37415789)
chr7 (23-485)||(5242061-5242532)
chr7 (30-426)||(14683412-14683816)
chr7 (18-428)||(26136094-26136512)
chr7 (18-428)||(26144474-26144892)
chr7 (18-410)||(3067961-3068361)
chr7 (18-409)||(10468874-10469273)
chr7 (18-428)||(20080684-20081102)
chr7 (22-410)||(37166131-37166527)
chr7 (18-428)||(13809483-13809897)
chr7 (18-356)||(7227257-7227595)
chr7 (22-285)||(11398143-11398406)
chr7 (217-501)||(45290375-45290665)
chr7 (18-285)||(10344944-10345210)
chr7 (22-259)||(4695258-4695494)
chr7 (22-327)||(5796287-5796590)
chr7 (160-426)||(9271433-9271700)
chr7 (247-426)||(11919833-11920021)
chr7 (38-277)||(37423083-37423321)
chr7 (65-349)||(18562586-18562871)
chr7 (18-238)||(22611771-22611991)
chr7 (225-426)||(4542734-4542943)
chr7 (274-408)||(35961076-35961219)
chr7 (299-424)||(4695491-4695625)
chr7 (22-153)||(9273369-9273500)
chr7 (137-286)||(24918043-24918192)
chr7 (373-452)||(11397993-11398070)
chr7 (29-101)||(45290715-45290787)
chr7 (363-428)||(10345278-10345343)
chr7 (18-81)||(9080907-9080970)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (22-504)||(26752589-26753077)
chr5 (18-491)||(43491498-43491978)
chr5 (22-504)||(7624849-7625337)
chr5 (22-504)||(14016027-14016514)
chr5 (22-426)||(41876727-41877140)
chr5 (22-480)||(41306438-41306902)
chr5 (22-428)||(18952440-18952854)
chr5 (25-485)||(22936842-22937310)
chr5 (22-419)||(7270763-7271168)
chr5 (22-426)||(17664299-17664710)
chr5 (23-428)||(20055522-20055935)
chr5 (22-485)||(21332586-21333057)
chr5 (18-480)||(31863442-31863925)
chr5 (31-485)||(42062677-42063137)
chr5 (22-428)||(26895565-26895979)
chr5 (22-419)||(33551868-33552273)
chr5 (22-426)||(34831510-34831923)
chr5 (22-455)||(21335634-21336073)
chr5 (18-428)||(34132944-34133362)
chr5 (18-428)||(34143175-34143593)
chr5 (18-429)||(26907415-26907834)
chr5 (18-428)||(12087701-12088119)
chr5 (22-410)||(40582996-40583392)
chr5 (18-471)||(14375715-14376189)
chr5 (22-410)||(4099496-4099897)
chr5 (22-428)||(12058453-12058867)
chr5 (43-327)||(2837071-2837355)
chr5 (19-515)||(18239383-18239874)
chr5 (42-426)||(39192095-39192489)
chr5 (22-409)||(17748187-17748582)
chr5 (22-406)||(26292538-26292930)
chr5 (22-282)||(30066089-30066348)
chr5 (56-350)||(21914903-21915197)
chr5 (30-265)||(32837775-32838007)
chr5 (205-427)||(22131159-22131390)
chr5 (22-353)||(28787374-28787698)
chr5 (21-410)||(11959157-11959546)
chr5 (250-501)||(37215019-37215276)
chr5 (22-232)||(23043912-23044121)
chr5 (30-209)||(22130020-22130198)
chr5 (18-284)||(18765756-18766019)
chr5 (18-101)||(28441431-28441514)
chr5 (22-356)||(31575165-31575497)
chr5 (297-428)||(23044163-23044303)
chr5 (159-285)||(563372-563498)
chr5 (315-424)||(30066348-30066466)
chr5 (393-480)||(40916069-40916155)
chr5 (397-511)||(32838007-32838118)
chr5 (434-501)||(28441342-28441410)
chr5 (463-515)||(10629407-10629459)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (18-485)||(292766-293239)
[»] chr1 (42 HSPs)
chr1 (22-504)||(31204586-31205073)
chr1 (22-515)||(28110805-28111304)
chr1 (22-504)||(37183752-37184239)
chr1 (22-504)||(45960633-45961120)
chr1 (22-515)||(2793976-2794475)
chr1 (22-485)||(6070860-6071329)
chr1 (22-426)||(45941164-45941577)
chr1 (22-428)||(673031-673448)
chr1 (22-504)||(20398601-20399089)
chr1 (18-501)||(49498393-49498877)
chr1 (22-480)||(23021835-23022299)
chr1 (18-515)||(34732236-34732739)
chr1 (22-426)||(21107254-21107666)
chr1 (22-410)||(41058281-41058677)
chr1 (22-410)||(1950434-1950830)
chr1 (23-426)||(21018430-21018840)
chr1 (18-356)||(49853120-49853457)
chr1 (22-410)||(905664-906064)
chr1 (18-428)||(3796787-3797205)
chr1 (30-428)||(29643182-29643588)
chr1 (22-426)||(2405258-2405670)
chr1 (19-327)||(7635391-7635698)
chr1 (145-356)||(27355729-27355941)
chr1 (19-252)||(11668171-11668404)
chr1 (19-284)||(27331883-27332148)
chr1 (111-350)||(21434523-21434763)
chr1 (247-426)||(21111121-21111309)
chr1 (175-356)||(27354986-27355165)
chr1 (212-485)||(42022578-42022860)
chr1 (19-240)||(34066599-34066818)
chr1 (362-504)||(27536419-27536558)
chr1 (313-426)||(21114461-21114583)
chr1 (216-336)||(13431021-13431141)
chr1 (19-101)||(42022420-42022502)
chr1 (246-343)||(11667056-11667153)
chr1 (219-337)||(16055629-16055747)
chr1 (22-101)||(27536583-27536661)
chr1 (243-356)||(34065204-34065317)
chr1 (219-327)||(16056874-16056982)
chr1 (219-337)||(16061030-16061148)
chr1 (18-81)||(37907562-37907624)
chr1 (377-429)||(13430917-13430969)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (22-501)||(3678-4164)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (22-485)||(62264-62729)
scaffold0035 (18-428)||(63611-64020)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (22-452)||(89516-89953)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (22-514)||(5276-5775)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (22-429)||(19142-19558)
[»] scaffold0520 (3 HSPs)
scaffold0520 (22-426)||(8182-8594)
scaffold0520 (170-356)||(1590-1775)
scaffold0520 (22-190)||(4187-4355)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (18-485)||(3189-3661)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (30-428)||(57550-57957)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (42-426)||(197914-198306)
[»] scaffold0757 (1 HSPs)
scaffold0757 (17-426)||(5094-5511)
[»] scaffold0270 (3 HSPs)
scaffold0270 (22-452)||(3-439)
scaffold0270 (22-88)||(3733-3799)
scaffold0270 (22-88)||(10863-10929)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (22-356)||(67567-67900)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (146-429)||(1-293)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (22-410)||(30841-31238)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (18-429)||(2965-3391)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (18-409)||(58661-59062)
[»] scaffold1755 (1 HSPs)
scaffold1755 (160-426)||(6-280)
[»] scaffold1208 (2 HSPs)
scaffold1208 (180-501)||(89-416)
scaffold1208 (68-157)||(1-90)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (18-356)||(19098-19429)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (19-356)||(118487-118824)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (22-428)||(29112-29526)
scaffold0084 (22-428)||(19042-19441)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (51-407)||(10185-10549)
[»] scaffold2073 (1 HSPs)
scaffold2073 (258-515)||(741-1007)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (170-426)||(248413-248677)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (171-426)||(27005-27268)
scaffold0080 (22-91)||(26935-27004)
[»] scaffold1063 (1 HSPs)
scaffold1063 (168-481)||(2385-2713)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (19-350)||(9682-10014)
[»] scaffold1785 (2 HSPs)
scaffold1785 (18-356)||(1001-1329)
scaffold1785 (363-485)||(3-119)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (22-410)||(2052-2448)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (209-428)||(241434-241661)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (56-337)||(48464-48743)
[»] scaffold1809 (1 HSPs)
scaffold1809 (210-426)||(1-224)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (137-285)||(14101-14248)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (309-504)||(7599-7801)
[»] scaffold0191 (2 HSPs)
scaffold0191 (18-101)||(1489-1572)
scaffold0191 (363-410)||(4012-4059)
[»] scaffold0048 (2 HSPs)
scaffold0048 (297-428)||(15433-15573)
scaffold0048 (22-101)||(24568-24647)
[»] scaffold0126 (2 HSPs)
scaffold0126 (364-426)||(14282-14344)
scaffold0126 (23-71)||(1-49)
[»] scaffold0187 (1 HSPs)
scaffold0187 (18-81)||(31453-31515)
[»] scaffold0996 (1 HSPs)
scaffold0996 (469-515)||(1796-1842)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 94)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 32287686 - 32287180
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32287686 catgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatattgacaccatataaacatg 32287587  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32287586 atttcgtgagaatgaatgactactaaccatagcttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttat 32287487  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  32287486 tagtgatattaggttaacatacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggattatagtttgagaagagggccctaactcaagggat 32287387  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32287386 tgattatgactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 32287287  T
Q  413 gatctca----gctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcactagaat 508  Q
    |||||||     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  32287286 gatctcatctctctctctctcctaatcttttccaaaactatctttattttctgtttatttaattttatgcaatcaaaactattgcctcgggcactaaaat 32287187  T
Q  509 aatttac 515  Q
    |||||||    
T  32287186 aatttac 32287180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 22 - 515
Target Start/End: Original strand, 54723573 - 54724073
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  54723573 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 54723672  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  54723673 atttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 54723772  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  54723773 taatgatattaggttaacgtgcataaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaaataggggctgtagtttgagaagagggttctaactcaagggat 54723872  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |    
T  54723873 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattatgggaacatagatgattcggaagacct 54723972  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactagaataat 511  Q
    ||||||| ||||||   |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  54723973 gatctcatctctct---cttattctttccaaaactatctttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcaggcactaaaataat 54724069  T
Q  512 ttac 515  Q
    ||||    
T  54724070 ttac 54724073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 22 - 515
Target Start/End: Original strand, 2873396 - 2873896
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  2873396 catgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 2873495  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  2873496 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaagaatggataatcgtttgt 2873595  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2873596 tagtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 2873694  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2873695 tgattaggactattttgttaactatcgtggaattagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 2873794  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactagaataat 511  Q
    ||||||| |||||||| |||||  |||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  2873795 gatctcatctctctct-cttattctttccaactctatctttatattctg-ttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcaggcattaaaataat 2873892  T
Q  512 ttac 515  Q
    ||||    
T  2873893 ttac 2873896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 22 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 50461911 - 50461424
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  50461911 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 50461812  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  50461811 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtttgt 50461712  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50461711 tagtgatattaggttaatgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 50461612  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||     ||||||    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  50461611 tgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaagacct 50461512  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcacta 504  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50461511 gatctca--tctctctccttgtcttttccaaaactatc-ttattttctg-ttatttaaatttatgcaatcaaaactactgcctcgggcacta 50461424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 22 - 501
Target Start/End: Original strand, 7486402 - 7486887
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  7486402 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 7486501  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  7486502 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 7486601  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7486602 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 7486701  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7486702 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 7486801  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaa-tcaaaactacttcctcgggca 501  Q
    ||||||| ||||||   |||||  |||||||  ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||    
T  7486802 gatctcatctctct---cttattctttccaactctatctttatattctg-ttatttaattttatgcaacccaaaactactgcctagggca 7486887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 18 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 16185054 - 16184610
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  16185054 gaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctaatttttattcaattcaattgttgttaatgttttttatatcctgatcaaatataaa 16184955  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  16184954 catgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatctt 16184855  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16184854 ttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttaagaaaaaggtcctaactcaag 16184755  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16184754 ggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaag 16184655  T
Q  409 acatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttat 455  Q
    || ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16184654 acctgatctca--tctctctcctattcttttccaaaactatctttat 16184610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Original strand, 2775313 - 2775726
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  2775313 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 2775412  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  2775413 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 2775512  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  2775513 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaattcaagggat 2775612  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2775613 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 2775712  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  2775713 gatctcatctctct 2775726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 22 - 501
Target Start/End: Original strand, 53815660 - 53816145
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  53815660 catgttgctgtaaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 53815759  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  53815760 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttat 53815859  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  53815860 tagtgatactaggttaacgttcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaactcaagggat 53815958  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53815959 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 53816058  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
    ||||||| ||||||   |||||  |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  53816059 gatctcatctctct---cttattctttccaactctatctttattttctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcgggca 53816145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 30 - 515
Target Start/End: Original strand, 538666 - 539158
Alignment:
Q  30 tgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcg 129  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||||| | |    
T  538666 tgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtg 538765  T
Q  130 agaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgata 229  Q
    |||||  || |||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||||||| | ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  538766 agaatgaattactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgtttaaataaacaggtttagtctagcaatggatattcgtttgttagtgata 538865  T
Q  230 ttaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaag 329  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  538866 ttaggttaacgttcttaaaacattcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagg 538965  T
Q  330 actattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcag 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||     ||||||     ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||     
T  538966 actattttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaataggtgtagtataccaattagggaaacatatatgattcgaaagacctaatctcat 539065  T
Q  421 ctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactagaataatttac 515  Q
    ||||||   |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  539066 ctctct---cttatactttccaaaactatctttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcgggcattaaaataatttac 539158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Original strand, 2778556 - 2778969
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  2778556 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 2778655  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  2778656 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 2778755  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  2778756 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaattcaagggat 2778855  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2778856 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 2778955  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  2778956 gatctcatctctct 2778969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 22 - 515
Target Start/End: Original strand, 11190358 - 11190858
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  11190358 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 11190457  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || |    
T  11190458 atttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtcgaggaatggataatcacttgt 11190557  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  11190558 tagtgatattaggttaacgtgcataaaaccttcaagaattattagaccacctaaggaattaggggttgtaggttgagaagagggttctaactcaagggat 11190657  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaac-----tatcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||    ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11190658 tgattaggactattttgttaactatcgtggaacaagaaaatcattcataagaataggtgcaatataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 11190757  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactagaataat 511  Q
    ||||||| ||||||   |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| || ||||||    
T  11190758 gatctcatctctct---cttattctttccaaaactatctttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaacaactgcctcgggcattaaaataat 11190854  T
Q  512 ttac 515  Q
    ||||    
T  11190855 ttac 11190858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 501
Target Start/End: Original strand, 24125331 - 24125815
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  24125331 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 24125430  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  24125431 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 24125530  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24125531 tagtgatattaggttaacatgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 24125629  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  24125630 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattagggaaacatagatgattcgaaagacct 24125729  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
    ||||||| ||||||   |||||  |||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  24125730 gatctcatctctct---cttattctttccaactctatctttatattctg-ttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctagggca 24125815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 501
Target Start/End: Original strand, 24128608 - 24129092
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  24128608 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 24128707  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  24128708 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 24128807  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24128808 tagtgatattaggttaacatgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 24128906  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  24128907 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattagggaaacatagatgattcgaaagacct 24129006  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
    ||||||| ||||||   |||||  |||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  24129007 gatctcatctctct---cttattctttccaactctatctttatattctg-ttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctagggca 24129092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 30 - 426
Target Start/End: Original strand, 45896220 - 45896625
Alignment:
Q  30 tgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcg 129  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||||| | |    
T  45896220 tgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtg 45896319  T
Q  130 agaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgata 229  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  45896320 agaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgagttgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgata 45896419  T
Q  230 ttaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaag 329  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  45896420 ttaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagg 45896519  T
Q  330 actattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcag 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  45896520 actattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctgatctcat 45896619  T
Q  421 ctctct 426  Q
    ||||||    
T  45896620 ctctct 45896625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 22 - 455
Target Start/End: Original strand, 43809411 - 43809851
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  43809411 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 43809510  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | | |||   ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  43809511 atttagtgtgaacgaatgactactgaccataactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcctttat 43809610  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43809611 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagaccacctaaggaattagggggtgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 43809710  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  43809711 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagagtaggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaagacct 43809810  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttat 455  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  43809811 gatctca--tctctctcctattcttttccaaaactatctttat 43809851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 22 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 8461849 - 8461382
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  8461849 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgtgcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 8461750  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  8461749 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttat 8461650  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    |||||||| || ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | | |||| |||||||||    
T  8461649 tagtgatactaggttaacgtttttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggatactaaatcaagggat 8461551  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  8461550 tgattaggactattttgttaactatcatggaactatagaatcattcacaagaataggtgcagtataccaattagggaaacatagatgattcgaaagacct 8461451  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaa 485  Q
     ||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8461450 aatctca----tctctctttatcttttccaaaactatctttattttctgtttatttaattttatgcaatcaaa 8461382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Original strand, 43926667 - 43927079
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  43926667 catgttgctgtgaaactctatttattgtaaatgacaatctagtttttattcaattcagttgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 43926766  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  43926767 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacaaggttagtctaggaatggataatcgtttgt 43926866  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43926867 tagtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 43926965  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926966 tgattaggactattttgttaactatcatggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 43927065  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  43927066 gatctcatctctct 43927079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 22 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 6435140 - 6434655
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    |||||||| ||    
T  6435140 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaacatg 6435041  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  6435040 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcctttat 6434941  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  6434940 tagtgatactaggttaacgttcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctatctcaagggat 6434842  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||     |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6434841 tgattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataaaaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 6434742  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
     |||||| ||||||   |||||  |||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  6434741 aatctcatctctct---cttattctttcaaactctatctttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctagggca 6434655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 515
Target Start/End: Original strand, 30690568 - 30691067
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||  ||    
T  30690568 catgttgctgtgaaactctatttactgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatg 30690667  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  30690668 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttataataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 30690767  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30690768 tagtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtaatttgagaagagggtcctaactcaagggat 30690866  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||| ||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  30690867 tgattagaattattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattagggaaacatagatgattcgaaagacct 30690966  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactagaataat 511  Q
    ||||| | ||||||   |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||| |||| || ||||||    
T  30690967 gatcttatctctct---cttattctttccaaaactatctttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgtctcaggcattaaaataat 30691063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 49743282 - 49742869
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  49743282 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 49743183  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| | |    
T  49743182 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtttaggaatggataatcgtctgt 49743083  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49743082 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 49742983  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta---------tcattcgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||         ||||  ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  49742982 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcgttcataagaataggtgcaatataccaattaggggaacataaatgattcgaaagacct 49742883  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  49742882 gatctcatctctct 49742869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 29344237 - 29343824
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  29344237 catgttgctgtcaaactctatttattgtgaatgacaatccagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 29344138  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| |  |||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  29344137 atttagttagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattattctaataatcatggttagtctaggaatgaataatcttttat 29344038  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29344037 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 29343938  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29343937 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcaatataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 29343838  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  29343837 gatctcatctctct 29343824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 22 - 419
Target Start/End: Original strand, 3840348 - 3840754
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  3840348 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 3840447  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  3840448 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattattctaataatcatggttagtctaggaatggataatcctttat 3840547  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3840548 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccatctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtactaactcaagggat 3840647  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||     ||||||     ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  3840648 tgattaggactgttttgttaactatcgtggaactagaaaatcatttataagaataggtgtagtatatcaattaggggaacatggatgattcgaaagacct 3840747  T
Q  413 gatctca 419  Q
    |||||||    
T  3840748 gatctca 3840754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 22 - 410
Target Start/End: Original strand, 52199745 - 52200141
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  52199745 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 52199844  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  52199845 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 52199944  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  52199945 tagtgatattaggttaacatgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaattcaagggat 52200043  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagac 410  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  52200044 tgattaggactattttgttaattatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatcaatgattcgaaagac 52200141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 22 - 452
Target Start/End: Original strand, 47054757 - 47055194
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  ||     |||||||| ||    
T  47054757 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttattaatgttttttatatcctggtcaaatataaacatg 47054856  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |    
T  47054857 atttagtgagaatgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaaaggataaccgtttgt 47054956  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    || |||||||| |||||||| ||| |||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47054957 tactgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctatggaattaggggctttagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 47055056  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||     ||||||    |||||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  47055057 tgattagagctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcagtatactagttatgggaacatagatgattcgaaagacct 47055156  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctt 452  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47055157 gatctca--tctctctccttgtcttttccaaaactatctt 47055194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Original strand, 25584519 - 25584921
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  25584519 catgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatg 25584618  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||           || |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |    
T  25584619 atttagtga-----------tactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtccaggaatggataatcgtttgt 25584707  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25584708 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaagaaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 25584807  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25584808 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 25584907  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  25584908 gatctcatctctct 25584921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 30 - 452
Target Start/End: Original strand, 47051335 - 47051764
Alignment:
Q  30 tgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcg 129  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  ||     |||||||| |||||| | |    
T  47051335 tgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttattaatgttttttatatcctggtcaaatataaacatgatttagtg 47051434  T
Q  130 agaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgata 229  Q
    |||||  ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||    
T  47051435 agaatgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaaaggataaccgtttgttactgata 47051534  T
Q  230 ttaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaag 329  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  47051535 ttaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctatggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaga 47051634  T
Q  330 actattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcag 420  Q
     |||||||||||||||||||||||||     ||||||    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  47051635 gctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcagtataccagttaggggaacatagatgattcgaaagacctgatctca- 47051733  T
Q  421 ctctctctccttatcttttccaaaactatctt 452  Q
     |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  47051734 -tctctctcattgtcttttccaaaactatctt 47051764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 30 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17040376 - 17039970
Alignment:
Q  30 tgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcg 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||  |||    |||||||| |||||| | |    
T  17040376 tgtgaaactttatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatactatttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtg 17040277  T
Q  130 agaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgata 229  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  17040276 agaacgaatgactactgaccatagcttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataattgtttgttagtgata 17040177  T
Q  230 ttaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaag 329  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  17040176 ttaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagatcatctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaacttaagggattgattagg 17040078  T
Q  330 actattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcag 420  Q
    |||||||||||||||||| || ||||     |||||||    ||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  17040077 actattttgttaactatcatgaaactaaagaatcattcataagaataagtgttgtataccaattaagggaacatcgatgattcgaaagacctgatctcat 17039978  T
Q  421 ctctctct 428  Q
     |||||||    
T  17039977 ttctctct 17039970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Original strand, 16243705 - 16244117
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattga-caccatataaacgt 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||| || |   ||||| |    
T  16243705 catgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgatttttatatcctgatcaaccg-taaacat 16243803  T
Q  121 gatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgttta 220  Q
    ||||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||     
T  16243804 gatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaatagggttagtctaggaatagataatcgtttg 16243903  T
Q  221 ttagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaaggga 320  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  16243904 ttagtgatattaggttaacatgcttaaa-ccttcaaagattattagaacacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcttaagtcaaggga 16244002  T
Q  321 ttgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagaca 411  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16244003 ttgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacc 16244102  T
Q  412 tgatctcagctctct 426  Q
    |||||||| ||||||    
T  16244103 tgatctcatctctct 16244117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 410
Target Start/End: Original strand, 11784597 - 11784994
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||   ||||||||  ||    
T  11784597 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcacatataaatatg 11784696  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11784697 atttagtgagaacgaatgactactgaccttagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttat 11784796  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | || |  || |||| ||||||||||||||||||    
T  11784797 tagtgatattagattaacgtgcttaaaaccttcaacgattattagaccacctaaggaattaggggttgtaatccgataagagggtcctaactcaagggat 11784896  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagac 410  Q
    | |||| | |||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11784897 ttattagggctattttgttaactatcgtggaactagtgaatcattcataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaagac 11784994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Original strand, 27091726 - 27092138
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  27091726 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagttttaattcaattcaattgttgttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatg 27091825  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   || |||| |||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27091826 atttagtgagaacgaataactactgaccatagctttcgacttagacctaattaacttgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttat 27091925  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27091926 tagtgataaaaggttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccgcctaagaaattaggggatgtagtttgagaag-aggtcctaactcaagggat 27092024  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||||     ||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  27092025 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaataagaataggtgcagtataccaattaggagaacatcgatgattcgaaagacct 27092124  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  27092125 gatctcatctctct 27092138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 417
Target Start/End: Original strand, 9392570 - 9392969
Alignment:
Q  26 ttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgattt 125  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||||||    
T  9392570 ttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgattt 9392669  T
Q  126 cgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagt 225  Q
     | |||||   ||||||| ||| | |||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  9392670 agtgagaacgaatgactactgatcctagctttcgacttagatctaattgatttgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagt 9392769  T
Q  226 gatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgat 325  Q
    |||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9392770 gatattagtttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacttaaggaattaggggctagagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgat 9392868  T
Q  326 taagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatc 416  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||     |||||||    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9392869 tatgactattttgttaactattgtggaactagaaaatcattcataagtataggtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcaaaagacctgatc 9392968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 20729006 - 20728597
Alignment:
Q  25 gttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatt 124  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  | |    |||||||| |||||    
T  20729006 gttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatccttatcaaatataaacatgatt 20728907  T
Q  125 tcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattag 224  Q
    | | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  20728906 tagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcttttgttag 20728807  T
Q  225 tgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattga 324  Q
    |||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20728806 tgatattaggttaatgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattagaggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattga 20728708  T
Q  325 ttaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgat 415  Q
    ||| | |||||||||||| |||| | |||||     |||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20728707 ttagggctattttgttaaatatcatcgaactagaaaatcattcataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctgat 20728608  T
Q  416 ctcagctctct 426  Q
    |||| ||||||    
T  20728607 ctcatctctct 20728597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 28008432 - 28008019
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  28008432 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattaaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 28008333  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   || |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28008332 atttagtgagaacaaataactactaaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaatatggttagtctaggaatggataatcgtttat 28008233  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    |||||||| ||  |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28008232 tagtgataatagat--acgtacttacaacattcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcataactcaagggat 28008135  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta---------tcattcgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||         ||||  ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  28008134 tgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagagaataattcataagaataggtgcagtatacaaatttggggaacatagatgattcgaaagacct 28008035  T
Q  413 gatctcagctctctct 428  Q
     |||||| ||||||||    
T  28008034 aatctcatctctctct 28008019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 485
Target Start/End: Original strand, 35412348 - 35412811
Alignment:
Q  23 atgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtga 122  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||    
T  35412348 atgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatga 35412447  T
Q  123 tttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttatt 222  Q
    ||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||| ||    
T  35412448 tttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtct------ggataatcgtttgtt 35412541  T
Q  223 agtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggatt 322  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  35412542 agtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagaatattagctaacctaaggaattagggactgtaatctgagaagagggtcctaactcaagggatt 35412641  T
Q  323 gattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatg 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |     
T  35412642 gattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattagaggaacattgatgactcgaaagaccta 35412741  T
Q  414 atctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaa 485  Q
     |||||  ||||||    ||| ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35412742 gtctca--tctctccatatatattttccaaaactatccttattttctatttatttaattttatgcaatcaaa 35412811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 55035226 - 55034822
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |   ||  |||||||    
T  55035226 gaaacatgttgttgtgaaactctatttgttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatctgatcaa-atataaa 55035128  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  55035127 catgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacatgattagtctaggaatggataatcgt 55035028  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    || |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  | ||||||||||||| | | ||||||||||    
T  55035027 ttgttagtgatattaggttaacgtgcataaaaccttcaaagattactaaaccacctaaggaattaggggatgtagtttgagaagaggattctaactcaag 55034928  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc--------gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcg 404  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||        ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55034927 ggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaatgaataggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcg 55034828  T
Q  405 aaagac 410  Q
    ||||||    
T  55034827 aaagac 55034822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 10106961 - 10106494
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||| | ||    
T  10106961 catgttgctatgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataagcatg 10106862  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  10106861 atttagtgagaatgaatgactactgaccataactttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcatttgt 10106762  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  10106761 tagtgatattaggttaacgtgcttaca-ccttcaaatattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaagtcaagggat 10106663  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |    
T  10106662 tgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaatta-ggaaacatagatgattcaaaagacct 10106564  T
Q  413 gatctcagctctctctcct-tatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaa 485  Q
      |||||    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10106563 agtctca----tctctcatatatattttccaaaactatctttattttctgtttatttaattttatgcaatcaaa 10106494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 485
Target Start/End: Original strand, 10884690 - 10885157
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||   ||    |||||||| ||    
T  10884690 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttt-atatcccgatcatatataaacatg 10884788  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  10884789 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 10884888  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  10884889 tagtgatattaggttaacgtgtttaaa-ccttcgaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaagtcaagggat 10884987  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10884988 tgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 10885087  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaatttta-tgcaatcaaa 485  Q
      ||||| ||||   |   ||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  10885088 agtctcatctct---tatatatattttccaaaactatctttattttctg-ttatttacttttattgcaatcaaa 10885157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 419
Target Start/End: Original strand, 10881312 - 10881717
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  10881312 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttattagtgttttttatatcctgatcaaatataaacatg 10881411  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| | |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  10881412 atttagtgagaatgaatgactactaaccatagctttatacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttaatctaggaatggataatcgtttgt 10881511  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||| ||||    
T  10881512 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacttaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcttaagtcaaaggat 10881610  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10881611 tgattagaactattttgttaactattgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagactt 10881710  T
Q  413 gatctca 419  Q
    |||||||    
T  10881711 gatctca 10881717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 410
Target Start/End: Original strand, 54719799 - 54720199
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    |||||||    
T  54719799 gaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaa 54719898  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  54719899 catgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcct 54719998  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  | ||     |||||| ||||||||||||||    
T  54719999 ttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaag 54720097  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     |||||||    ||||| ||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  54720098 ggattgattaggactattttgttaactatcgtagaactagtgaatcattcacaagaataggtgcaatataccaattatggaaacatagatgattcgaaag 54720197  T
Q  409 ac 410  Q
    ||    
T  54720198 ac 54720199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22417200 - 22416782
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  22417200 gaaacatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 22417101  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | | |||| | |||||   ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22417100 cataatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcct 22417001  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||||||||||||    
T  22417000 ttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaag 22416902  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |     || |||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22416901 ggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaacgagtgactctttcacaagaataagtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 22416802  T
Q  409 acatgatctcagctctctct 428  Q
    || | | |||| ||||||||    
T  22416801 acctaaactcatctctctct 22416782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 34984219 - 34983800
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  34984219 gaaacatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 34984120  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | |||||   |||||||  |||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  34984119 catgatttagtgagaacgaatgactaccgactctaactttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaagaatggataatcat 34984020  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||||||||||||    
T  34984019 ttattagtgatattaggttaaagtgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagatggtcctaactcaag 34983921  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||     |||||||    ||||| |||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  34983920 ggattgattatgactcttttgttaactatcgtagaactagtgaatcattcacaagaataggtgcggtataccaatcaggggaacatagatcattcgaaag 34983821  T
Q  409 acatgatctcagctctctctc 429  Q
    || | | |||| |||||||||    
T  34983820 acctaaactcatctctctctc 34983800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 12561596 - 12561182
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||  ||    
T  12561596 catgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattgaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatg 12561497  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12561496 atttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttat 12561397  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||||||||||||||||    
T  12561396 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggat 12561298  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||     || |||    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12561297 tgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagggactctttcacaagaataggtgcagtatatcaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 12561198  T
Q  413 gatctcagctctctct 428  Q
     | |||| ||||||||    
T  12561197 aaactcatctctctct 12561182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 30220375 - 30219954
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  | |    |||||||    
T  30220375 gaaacatgttgctgtgaaactatatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctctttatatccttatcaaatataaa 30220276  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
      |||||| | |||| |  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30220275 gatgatttggtgagagtgaatgactactgaccatagctttcaacttaaacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 30220176  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaac---gtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactc 314  Q
    ||||| ||||||||||||||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  | | |  ||||| |||||||| ||    
T  30220175 ttatttgtgatattaagttaactatcaacttaaaagcttcaaagaatattagaccacctaaggaattaggggttacaatctatgaagagggtcctaagtc 30220076  T
Q  315 aagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcga 405  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||     |||||||    ||||| ||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30220075 aagggattgattagggctattttgttaactatcgtgaaactagagaatcattcataagaataggtgcagttgaccaattaggggaacttagatgattcga 30219976  T
Q  406 aagacatgatctcagctctctc 427  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  30219975 aagacatgatctcatctctctc 30219954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 137 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 23298863 - 23298492
Alignment:
Q  137 atgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagtt 236  Q
    ||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  23298863 atgactactgaccctagctttcgacttagacataattgaattgttctaataaacatcgttagtctaggaatggataatcgtttgttggtgatattaggtt 23298764  T
Q  237 aacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattt 336  Q
    || || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23298763 aatgttcttaaaaccttgaaagattcttagaccacctaagaaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaagactattt 23298664  T
Q  337 tgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctc 427  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||||    ||||| ||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||     
T  23298663 tgttaactatcgtggaactagaaagtcattcataagaataggtgcagcataccaattaagggaacttagatgattcgaaagacctaatctcatctctct- 23298565  T
Q  428 tccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
      |||||  |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  23298564 --cttattctttccaactctatctttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctagggca 23298492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 48064396 - 48064005
Alignment:
Q  23 atgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtga 122  Q
    |||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||    
T  48064396 atgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatga 48064297  T
Q  123 tttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttatt 222  Q
    ||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48064296 tttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagatctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcctttatt 48064197  T
Q  223 agtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggatt 322  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||     |||||| |||||||||||||||||||    
T  48064196 agtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggatt 48064098  T
Q  323 gattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaa 406  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||     ||||||    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48064097 gattaggactattttgttaactatcgtaaaactagggactcattcacaagaatagatgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaa 48064005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 137 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 18645016 - 18644644
Alignment:
Q  137 atgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagtt 236  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  18645016 atgactactgaccttagctttcgacttaaacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggacaatcgtttgttagtgatattaggtt 18644917  T
Q  237 aacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattt 336  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| || | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18644916 aacgtgcttaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagagtgtcctaactcaagggattgattaggactattt 18644817  T
Q  337 tgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctc 427  Q
    |||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |  |||||  ||||||    
T  18644816 tgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacattgatgactcgaaagacctagtctca--tctctc 18644719  T
Q  428 tccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
        ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||    
T  18644718 catatatattttccaaaactatctttattttctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcaggca 18644644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19301867 - 19301534
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||    |||||||| ||    
T  19301867 catgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttaaatcctgatcaaatataaacatg 19301768  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  |||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  19301767 atttagtgagaatgaatgactacagaccctagctttcaacttagacataattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcttttgt 19301668  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19301667 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattaaaccacctaagaaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 19301569  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta 356  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  19301568 ttattagaactattttgttaactatcgtagaacta 19301534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19305051 - 19304718
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||    |||||||| ||    
T  19305051 catgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttaaatcctgatcaaatataaacatg 19304952  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||| |    
T  19304951 atttagtgagaatgaatgactattgaccctagctttcaacttagacataaatgaattgttctaatgaacatggttagtataggaatggataatcatttgt 19304852  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    || |||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  19304851 taatgatgttaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcgtaactcaggggat 19304753  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta 356  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19304752 tgattatgactattttgttaactatcgtggaacta 19304718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 33 - 427
Target Start/End: Original strand, 35751297 - 35751686
Alignment:
Q  33 gaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcgaga 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    |||||||              |    
T  35751297 gaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaa--------------a 35751382  T
Q  133 attgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatatta 232  Q
    |   ||||||| |||   ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  35751383 acaaatgactactgagtctagctttcaacttagacctaattgagttgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtttgttaatgatatta 35751482  T
Q  233 agttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagact 332  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35751483 ggttaacgtgcttaaaatcttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggact 35751582  T
Q  333 attttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctc 423  Q
    ||||||||||||||||| |||||     ||||||    |||| | ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  35751583 attttgttaactatcgtagaactagaaaatcattaatacgaaaaggtgcagtatacaaattaggggaacatcgatgattcgaaagacctgatctcatctc 35751682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 427
Target Start/End: Original strand, 46884780 - 46885185
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||           |||    
T  46884780 gaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatat-----------aaa 46884868  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | |||||   ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |    
T  46884869 catgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttggtctagaaatggataatcct 46884968  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||| ||||||||    
T  46884969 ttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaacacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtcccaactcaag 46885067  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||     | |||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46885068 ggattgattaggactattttgctaactatcgt-gaactagaaaagcattcacaagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 46885166  T
Q  409 acatgatctcagctctctc 427  Q
    || | | |||| |||||||    
T  46885167 acctaaactcatctctctc 46885185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15195664 - 15195331
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  |||    |||||||  ||    
T  15195664 catgttgctatgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttattgctttttatatcctgattaaatataaatatg 15195565  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15195564 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgtgctaataaacatggttagtctaggaatggataatcttttat 15195465  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||   |||||| ||||||| ||||||||||    
T  15195464 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcgaagattattagaccacctaaggaattagaggttgtagtcctagaagagggtcctatctcaagggat 15195366  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta 356  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15195365 tgattaggactattttgttaactatcgtggaacta 15195331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 428
Target Start/End: Original strand, 17141236 - 17141654
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  17141236 gaaacatgttattgtgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 17141335  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | |||||   ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  17141336 catgatttagtgagaacgaatgactactgaccataactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggatgatcct 17141435  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||| || | ||||||||||||||||| |||| |||  | ||     |||||| ||||||||||||||    
T  17141436 ttattagtgatattaggttaacgtgatt-aaacctttaacggttattagaccacctaagaaatttggggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaag 17141534  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17141535 ggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagcgaatcattcataagaataggtgcaatataccaattaggggaacatagataattcaaaag 17141634  T
Q  409 acatgatctcagctctctct 428  Q
    || | | |||| ||||||||    
T  17141635 acctaagctcatctctctct 17141654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 32367491 - 32367165
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||  |||    |||||||  ||    
T  32367491 catgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttgtatcctgatcaaatataaatatg 32367392  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  32367391 atttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 32367292  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||||||||||||||||    
T  32367291 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggat 32367193  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgt 349  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32367192 tgattaggactattttgttaactatcgt 32367165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 424
Target Start/End: Original strand, 41976847 - 41977243
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  41976847 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgctcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 41976946  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  || |||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  41976947 atttagtgagaatgaataactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacatgattagtctatgaatggataatcgtttgt 41977046  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||              ||||||    
T  41977047 tagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaag--------------agggat 41977131  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |    
T  41977132 tgattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataagtgcagtataccaattaggagaacacagatgattcgaaagatct 41977231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 137 - 426
Target Start/End: Original strand, 31549118 - 31549416
Alignment:
Q  137 atgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagtt 236  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  31549118 atgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagaaatggataatcgtttattagtgataataggtt 31549217  T
Q  237 aacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattt 336  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31549218 aacattcataaaaccttcaaagattattagaccacctaagaaattagggtctgtagttttagaagagggtcctaagtcaagggattgattatgactattt 31549317  T
Q  337 tgttaactatcgtggaacta---------tcattcgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
    ||||||||||||||||||||         ||||  ||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| | ||||||    
T  31549318 tgttaactatcgtggaactagaaaattattcataagaataggtgcagtataccaattagggaaacttagatgattcaaaagacctgatcttatctctct 31549416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 25443214 - 25442807
Alignment:
Q  30 tgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcg 129  Q
    ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||||| | |    
T  25443214 tgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtg 25443115  T
Q  130 agaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgata 229  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25443114 agaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgata 25443015  T
Q  230 ttaagttaacgtacttaaaaccttcaaagatta-ttagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaa 328  Q
    |||  ||||||| ||| |||| ||| | | ||| ||||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25443014 ttagcttaacgtgctt-aaacattcgacggttatttagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattag 25442916  T
Q  329 gactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctca 419  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||     ||||||    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||    
T  25442915 gactattttgttaactatcgtaaaactagggactcattcacaagaataggtgcaatataccaattaggggaacataaatgattcgaaagacctaaactca 25442816  T
Q  420 gctctctct 428  Q
     ||||||||    
T  25442815 tctctctct 25442807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22994063 - 22993756
Alignment:
Q  19 aaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaac 118  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    ||||||||    
T  22994063 aaacatgttgctgtaaaactctatttattgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaatttttcttaatgttttttatatacttatcagatataaac 22993965  T
Q  119 gtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtt 218  Q
     ||| |||| |||| |  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  22993964 atgaattcgtgagagtgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggtaagtttaggaatggataatcgtt 22993865  T
Q  219 tattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagg 318  Q
    |||| |||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||    
T  22993864 tatttgtgatactaggttaacgttctaaaaaccttcaaagaatattagatcacctaaggaattagggactgtaatttgagaagagggtcctaagtcaagg 22993765  T
Q  319 gattgatta 327  Q
    |||||||||    
T  22993764 gattgatta 22993756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 350
Target Start/End: Original strand, 18542426 - 18542711
Alignment:
Q  65 ttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaactta 164  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||   ||||||| | ||| || | ||||||  ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  18542426 ttttattcaattcaattgttcttaatgatttttatatactgatcacatataa-catgaatttgtgagaatgaatgactaatgaccataactttcaactta 18542524  T
Q  165 gacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattatt 264  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18542525 gacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagaatatt 18542624  T
Q  265 agaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactatttt-gttaactatcgtg 350  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  18542625 agatcacctaagaaattagggactgtaatctgagaagaaggtcttaagtcaagggattgattaggactattttagttaaccatcgtg 18542711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3293327 - 3292987
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatatt-gacaccatataa 116  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||  | | ||  ||||||    
T  3293327 gaaacatgttgatgtgaaactctatctattgtgaatgacaatctagtttttattcaactcaaatgttcttaatgctttttatatcctagtcaa-atataa 3293229  T
Q  117 acgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcg 216  Q
    || |||||||| |||||   ||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3293228 acatgatttcgtgagaacgaatgactactaaccctagccttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatgaataatcg 3293129  T
Q  217 ttta-ttagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactca 315  Q
    |||| ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | || |  ||||||  |||| ||| |||    
T  3293128 tttatttttttatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagaccacctaaggaattaggggttgtaatcggagaagtgggtcttaagtca 3293029  T
Q  316 agggattgattaagactattttgttaactatcgtggaactat 357  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  3293028 agggattgattagggctattttgttaaccatcgtgaaactat 3292987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17529111 - 17528709
Alignment:
Q  30 tgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcg 129  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||    |||||||| |||||| | |    
T  17529111 tgtgaaactctatttattgtgaatgtcaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatactttttatattttgatcaaatataaacatgatttagtg 17529012  T
Q  130 agaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgata 229  Q
    | ||   ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||| |||||||||||||    
T  17529011 ataacgaatgactattgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga----ataatcctttattagtgata 17528916  T
Q  230 ttaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaag 329  Q
    ||| ||||| || ||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |  | ||     |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  17528915 ttaggttaatgtgctt-aaaccttcaacggttattaaaccacctaaggaattagtggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattagg 17528817  T
Q  330 actattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcag 420  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||     ||||||    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||     
T  17528816 actattttattaactatcgtaaaactagggactcattcacaagaatatgtgcagtatatcaattaggggaacatagatgattcgaacgacctaatctcat 17528717  T
Q  421 ctctctct 428  Q
    ||||||||    
T  17528716 ctctctct 17528709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 22 - 319
Target Start/End: Original strand, 28265712 - 28266005
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  28265712 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 28265811  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   || |||   |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  28265812 atttagtgagaacgaattact---gaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatgattagtctaggaatggataatcttttat 28265908  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaaggg 319  Q
    |||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  28265909 tagtgatactaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctatctcaaggg 28266005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 284
Target Start/End: Original strand, 52988237 - 52988498
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  52988237 catgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 52988336  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  52988337 atttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttat 52988436  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagg 284  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  52988437 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaactttcaacggttattagaccacctaaggaattagg 52988498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 427
Target Start/End: Original strand, 22783420 - 22783847
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   | |    |||||||    
T  22783420 gaaacatgttgatgtgaaactctatttattgtggatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatacccttatcaaatataaa 22783519  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattg-------ttctaataaacatggttagtctatgaatgga 210  Q
    | |||||||| ||||||  ||||||  |||||| | |||| ||||||||| |||||||||||       ||| |||||||||||||| |||| | ||| |    
T  22783520 catgatttcgtgagaatgaatgactgctgaccacaactttcaacttagacttaattgaattgttcaaaattcaaataaacatggttattctaggtatgca 22783619  T
Q  211 taatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttc-aaagattattagaccacctaaggaattagggac--tttagtttgagaagaaggtc 307  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||| |  | || | |||||||| ||||    
T  22783620 taatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaaaaaatattataccacctaaggaattaggggctatataatctgagaagagggtc 22783719  T
Q  308 ctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagat 398  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||     |||||||    |||||||||  || | ||||||||||||| | |||     
T  22783720 ctaagtcaagggatttattaggactattatgttaactatcgtgaaactagagaatcattcataagaatatgtgatgtgtgccaattaggggaa-acagag 22783818  T
Q  399 gattcgaaagacatgatctcagctctctc 427  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22783819 gattcgaaagacctgatctcatctctctc 22783847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 427
Target Start/End: Original strand, 22787784 - 22788211
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   | |    |||||||    
T  22787784 gaaacatgttgatgtgaaactctatttattgtggatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatacccttatcaaatataaa 22787883  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattg-------ttctaataaacatggttagtctatgaatgga 210  Q
    | |||||||| ||||||  ||||||  |||||| | |||| ||||||||| |||||||||||       ||| |||||||||||||| |||| | ||| |    
T  22787884 catgatttcgtgagaatgaatgactgctgaccacaactttcaacttagacttaattgaattgttcaaaattcaaataaacatggttattctaggtatgca 22787983  T
Q  211 taatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttc-aaagattattagaccacctaaggaattagggac--tttagtttgagaagaaggtc 307  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||| |  | || | |||||||| ||||    
T  22787984 taatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaaaaaatattataccacctaaggaattaggggctatataatctgagaagagggtc 22788083  T
Q  308 ctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagat 398  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||     |||||||    |||||||||  || | ||||||||||||| | |||     
T  22788084 ctaagtcaagggatttattaggactattatgttaactatcgtgaaactagagaatcattcataagaatatgtgatgtgtgccaattaggggaa-acagag 22788182  T
Q  399 gattcgaaagacatgatctcagctctctc 427  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22788183 gattcgaaagacctgatctcatctctctc 22788211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 186 - 485
Target Start/End: Original strand, 54461010 - 54461316
Alignment:
Q  186 taaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  54461010 taaacatggttagtctaggaatgtataatcctttactagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattaggg 54461109  T
Q  286 actttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagta 376  Q
    ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| ||||    
T  54461110 actgtaatatgagaagagggtcctaactcaagggatgaattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagta 54461209  T
Q  377 taccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctctccttatct--tttccaaaactatctttatcatctgtttatttaatttt 474  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |  |||||    ||||||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  54461210 tacccatttggggaacattgatgactcgaaagacctagtctca----tctctccatatatagtttccaaaactatctttattttctgtttatttaatttt 54461305  T
Q  475 atgcaatcaaa 485  Q
    |||||||||||    
T  54461306 atgcaatcaaa 54461316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 212 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 18641945 - 18641648
Alignment:
Q  212 aatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaa 311  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||    
T  18641945 aatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagagtgtcctaa 18641846  T
Q  312 ctcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgatt 402  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  18641845 ctcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacattgatgact 18641746  T
Q  403 cgaaagacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
    |||||||| |  |||||  ||||||    ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||    
T  18641745 cgaaagacctagtctca--tctctccatatatattttccaaaactatctttattttctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcaggca 18641648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 137 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17531897 - 17531604
Alignment:
Q  137 atgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagtt 236  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  17531897 atgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaatt-----aataaacatggttagtctaggaatggataatc-tttattagtgatattaggtt 17531804  T
Q  237 aacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattt 336  Q
    |||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  | ||     |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17531803 aacgtgtttaaa-ccttcaacggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattt 17531705  T
Q  337 tgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctc 427  Q
    |||||||||||||  |||||     ||||||    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||| |||||||    
T  17531704 tgttaactatcgtaaaactagggactcattcacaagaataggtgcagtataccaattagaggaacatagatgattcgaacgacctaaactcatctctctc 17531605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 147 - 427
Target Start/End: Original strand, 17545812 - 17546102
Alignment:
Q  147 accatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtactta 246  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| ||||    
T  17545812 accatagttttcaacttagacctaattgaattattcaaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttatttatgatactaggttaacgtgctta 17545911  T
Q  247 aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactatttt-gttaacta 345  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| | || | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||| |    
T  17545912 aaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattagggattgtaatctgagaagagggtcataagtcaagggattgattagggctattttagttaacca 17546011  T
Q  346 tcgtggaact-----atcattc-----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctc 427  Q
    ||||| ||||     |||||||      |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||| |||||||    
T  17546012 tcgtgaaactagagaatcattcataagaaataggtgcagtataccaattaggggaac-cagaagattcgaaagatctgatctcatctctctc 17546102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 204 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 55032181 - 55031962
Alignment:
Q  204 gaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaa 303  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||     
T  55032181 gaatggataatcgtttgtcagtgatattaggttaacgtgcataaaagcttcaaagattactagaccacctaaggaatcaggggatgtagtttgagaagag 55032082  T
Q  304 ggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc--------gaatatgtgtagtataccaattagggga 390  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||        ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  55032081 ggttctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaatgaataggtgcagtataccaattagggga 55031982  T
Q  391 acatagatgattcgaaagac 410  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  55031981 acatcgatgattcgaaagac 55031962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 280 - 501
Target Start/End: Original strand, 28266006 - 28266234
Alignment:
Q  280 ttagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattcg----aatatgt 370  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     ||||||     |||| ||    
T  28266006 ttaggggctgtagtttgagaagagggttctatctcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataaaaataggt 28266105  T
Q  371 gtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaa 470  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||  |||||||  ||||||||||  |||||||||||||    
T  28266106 gcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctgatctcatctctct---cttattctttccaactctatctttatattctgtttatttaa 28266202  T
Q  471 ttttatgc-aatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  28266203 ttttatgcaaaccaaaactactgcctagggca 28266234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 137 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 282439 - 282293
Alignment:
Q  137 atgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagtt 236  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||     
T  282439 atgactactgaccctaacttttgacttagacctaattgaattgttcgaataaacatggttagtctaggaatggataattgtttattggtgatattatgtc 282340  T
Q  237 aacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 283  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  282339 aacgttcttaaaaccttcgaagaatattagatcacctaaggaattag 282293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 272 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 52309728 - 52309565
Alignment:
Q  272 ctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc---- 362  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||        
T  52309728 ctaaggaattaggggttgtagtttgagaagatggtcctagctcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataa 52309629  T
Q  363 gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  52309628 gaataggtgcaatataccaattaggggaacatagttgattcgaaagacctgatctcatctctct 52309565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 178
Target Start/End: Original strand, 31857650 - 31857804
Alignment:
Q  24 tgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgat 123  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    |||||||  ||||    
T  31857650 tgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaagatgat 31857749  T
Q  124 ttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaatt 178  Q
    || | ||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31857750 ttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattgaatt 31857804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 52309920 - 52309754
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatg-gtttttatatattgacaccatataaacgt 120  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |  |||    |||||||| |    
T  52309920 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttttatttcctgatcaaatataaacat 52309821  T
Q  121 gatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaata 187  Q
    ||||| | ||||||  ||||||| |||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52309820 gatttagtgagaatgaatgactactgacaatagttttctacttagacctaattgaattgttcaaata 52309754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27308349 - 27308157
Alignment:
Q  56 caatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagct 155  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| || |  |||    ||||||| ||||  ||| |    
T  27308349 caatctagtttt-attcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgacactatataa-cttgaattggtaagatcgaatgactactgactctagtt 27308252  T
Q  156 tttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaac 250  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  27308251 tatgactaagacctaattgaattgttcaaataaacaaggttaatcaaggaatagataatcgtttatttgtgttattaggttaacgttcttaaaac 27308157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 363 - 496
Target Start/End: Original strand, 6922701 - 6922832
Alignment:
Q  363 gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgt 462  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||  ||| |||  ||||||||||  |||||    
T  6922701 gaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctgatctcatctctctct---tattcttttcaactctatctttatattctgt 6922797  T
Q  463 ttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctc 496  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  6922798 ttatttaattttatgcaaaccaaaactactacctc 6922832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27298828 - 27298594
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggttttt-atatattgacaccatataa 116  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||  || |||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  27298828 gaaacatgtggctgtgaaactctattgcttgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttaatgcttttttatatattgacactatataa 27298730  T
Q  117 acgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcg 216  Q
     | | | || |  |||    |||| || ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| |||||||     
T  27298729 -cttaaattggtaagatcaaatgattactgaccctagcttacaacttagacataattgaattgttcaaataaatacggttagtttatgaatagataatca 27298631  T
Q  217 tttattagtgatattaagttaacgtacttaaaacctt 253  Q
    | ||   ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27298630 tatacctgtgatattatgttaacgttcttaaaacctt 27298594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 101
Target Start/End: Original strand, 17544444 - 17544526
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatat 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  17544444 gaaacatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctag-ttttattcaattcaattgatcttaatgttttttatat 17544526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27308809 - 27308717
Alignment:
Q  160 acttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaacctt 253  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27308809 acttagacctaattgagttgttcaaataaacatggt-agtctaggaatagataatcgcttatttgtgatattaggttaacgttcttaaaacctt 27308717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Original strand, 6922579 - 6922657
Alignment:
Q  23 atgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatat 101  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||    
T  6922579 atgttgatgtgaaactctatttattatgaatgacaatttagtttttattcaattcgattgtgcttaatgctttttatat 6922657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 303 - 428
Target Start/End: Original strand, 52990812 - 52990946
Alignment:
Q  303 aggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaaca 393  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||     ||||||    ||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  52990812 aggtcctaactcaatggattgattacgactattttgttaattatcgtaaaactagagactcattcacaagaataggtgcggtataccaattaggggaaca 52990911  T
Q  394 tagatgattcgaaagacatgatctcagctctctct 428  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  52990912 tagatgattcgaaagacctaaactcatctctctct 52990946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 426
Target Start/End: Original strand, 10902133 - 10902184
Alignment:
Q  375 tataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10902133 tataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctgatctcatctctct 10902184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 428
Target Start/End: Original strand, 37408862 - 37408927
Alignment:
Q  363 gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctct 428  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  37408862 gaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctaaactcatctctctct 37408927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 101
Target Start/End: Original strand, 11636666 - 11636743
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatat 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  11636666 catgttgctgtgaaactctatt-attgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttaatgctttttatat 11636743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 102
Target Start/End: Original strand, 22360275 - 22360357
Alignment:
Q  19 aaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatata 102  Q
    |||||||||| |||||||||  |||| || |||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22360275 aaacatgttgatgtgaaactcaatttcttgtgaatatcaatcta-tttatattcaattcaattgttcttaatgttttttatata 22360357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 373 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 32367133 - 32367078
Alignment:
Q  373 agtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctct 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  32367133 agtataccaattagggaaacatagatgattcgaaagacttaaactcatctctctct 32367078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 127
Target Start/End: Original strand, 22370178 - 22370285
Alignment:
Q  19 aaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaac 118  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |  |||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||   |||||||||    
T  22370178 aaacatgttgttgtgaaactcaatttctcgtgaatatcaatcta-tttatattcaattcaattgttcttaatgttttttgtataatgatcacatataaac 22370276  T
Q  119 gtgatttcg 127  Q
     ||| ||||    
T  22370277 atgaattcg 22370285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 219
Target Start/End: Original strand, 6030758 - 6030840
Alignment:
Q  137 atgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgttt 219  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||| || |||||| || ||||| | |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||    
T  6030758 atgactattgatcttagctttcaacttggatctaatttaactgttcaattaaacatggtcagtctaggaatgaataattgttt 6030840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 12541219 - 12541162
Alignment:
Q  459 ctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactagaataatttac 515  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||| || ||||||||||    
T  12541219 ctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcaggcattaaaataatttac 12541162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 356
Target Start/End: Original strand, 31857847 - 31857888
Alignment:
Q  315 aagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta 356  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  31857847 aaggaattgattagaactattttgttaactatcgtggaacta 31857888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 3292959 - 3292908
Alignment:
Q  375 tataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctc 427  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  3292959 tataccaattaggggaa-acagatgattcaaaagacctgatctcatctctctc 3292908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 426
Target Start/End: Original strand, 18542750 - 18542798
Alignment:
Q  378 accaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18542750 accaaataggggaactcagaggattcgaaagacatgatctcatctctct 18542798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22993708 - 22993644
Alignment:
Q  364 aatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctct 428  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||    
T  22993708 aataggtgcagtgtaccaattaggggaacttagaggattcgaaagacctagtctcatctctctct 22993644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 55032235 - 55032183
Alignment:
Q  137 atgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaa 189  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  55032235 atgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaactgttctaataaa 55032183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 45155649 - 45155145
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45155649 gaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgacaccatataaa 45155550  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||||| |  |||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45155549 catgatttcgtggaaatgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctattaaacatggttagtctaggaatggataatcgt 45155450  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  45155449 ttattagtgatattaggttaacgtacttaaaactttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttttagtttgagaagagggtcttaactcaag 45155350  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||     |||||||    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45155349 ggattgattaggactattttgttaactatcgcgaaactagagaatcattcataagaataggtgcaatataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 45155250  T
Q  409 acatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcactagaat 508  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  45155249 acctgatctcag--ctctctccttatcttttccaaaactatctttattttctgtttatttaattttatgcaatcaaaactactgcctcgggcactaaaat 45155152  T
Q  509 aatttac 515  Q
    |||||||    
T  45155151 aatttac 45155145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 22 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 38248774 - 38248274
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38248774 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgacaccatataaacatg 38248675  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||    
T  38248674 atttcgtgagaatgaatgactactgaccatagcttacgacttagacctaattgaattgttctaataaacatagatagtctaggtttggataatcgtttat 38248575  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  38248574 tagtgatattaggttaacgtac-taaaactttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagaatgtcctaactcaagagat 38248476  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||     |||||||    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38248475 tgattaggactattttgttagctatcgtggaactagagaatcattcataagaatatgtgcaatataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 38248376  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatc-tgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcactagaataat 511  Q
    |||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  38248375 gatcgca--tctctctctttatcttttccaaaactatctttattttcttgtttatttaattttatgcaatcaaaactactgcatcgggcactaaaataat 38248278  T
Q  512 ttac 515  Q
    ||||    
T  38248277 ttac 38248274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 485
Target Start/End: Original strand, 14421484 - 14421959
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  14421484 gaaacatgttgctgtgaaactctattaattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 14421583  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
      |||||| | |||||   ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14421584 gatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcct 14421683  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14421684 ttattagtgatactaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattatcagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaag 14421783  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc-----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaa 407  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||     ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14421784 ggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactaaaaaatcattcagtaagaataggtgcagtatatcaattaggggaacatagatgattcgaaa 14421883  T
Q  408 gacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaa 485  Q
    ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14421884 gacctgatctcatctctctctctttatcttttccaaaactatc-ttatttcctg-ttatttaattttatgcaatcaaa 14421959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 34 - 491
Target Start/End: Original strand, 25230836 - 25231302
Alignment:
Q  34 aaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataa-acgtgatttcgcgaga 132  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||| ||||    
T  25230836 aaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatactttttatatatc-acaccgtataatatatgatttcgtgaga 25230934  T
Q  133 attgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatatta 232  Q
    ||  ||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25230935 atgaatgactactgaccgtaactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagcttaggaatggataatcgtttattagtgatatta 25231034  T
Q  233 agttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagact 332  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25231035 ggttaacatacttaaaaccttcaaatattattagaacacccaaggaattagaggctttagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaagact 25231134  T
Q  333 attttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctc 423  Q
    |||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  25231135 attttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctgatctcaactc 25231234  T
Q  424 tctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactact 491  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25231235 tctctctttatcttttccaaaattatctttattttctgtttatttaactttatgcaatctaaactact 25231302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 22 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 18824770 - 18824283
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  18824770 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 18824671  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  18824670 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 18824571  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18824570 tagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 18824471  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||     ||||||    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  18824470 tgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaagatcattaatacgaataggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaatacct 18824371  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcacta 504  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18824370 gatctca--tctctctccttttcttttccaaaactatc-ttattttctg-ttatttaaatttatgcaatcaaaactactgcctcgggcacta 18824283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 22 - 491
Target Start/End: Original strand, 23643563 - 23644039
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  ||| |  | |||||| ||    
T  23643563 catgttgctgtgaaactgtatttattctgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctgtttatatcctgataaaaaataaacatg 23643662  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    | || | |||||   ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  23643663 acttagtgagaacgaatgactactgaccctagcttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatgtttagtctaggaatggataatcgtttgt 23643762  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || || | |||||||| |||| ||||||||| |||    
T  23643763 tagtgatattaggttaacgtgcttaaaacctttaaagattattagaccacctaaggaattagaggctgtaatctgagaagagggtcataactcaagagat 23643862  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta---------tcattcgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||         |||| | || | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  23643863 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcatacaaagaagtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaacgacct 23643962  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactact 491  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23643963 gatatca--tctctctccttatcttttccaaaactatctttattttctgtttatttaattttatgcaatcaaatctact 23644039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 22 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 25591854 - 25591355
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  25591854 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcacttgttcttaatgttttttatattatgatcaaatataaacatg 25591755  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  25591754 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttta-cttagacaaaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatggataatcctttat 25591656  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  25591655 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccatctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagagtcttaactcaagggat 25591556  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||     |||||||     |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  25591555 tgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataaaaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaacacct 25591456  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttattta-attttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactagaataa 510  Q
    |||||||    |||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  25591455 gatctca----tctctcttattcttttccaaaactatctttatattctgtttatttactttttatgcaaatcaaaactactacctcaggcactaaaataa 25591360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 18826255 - 18825776
Alignment:
Q  30 tgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcg 129  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||||| | |    
T  18826255 tgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtg 18826156  T
Q  130 agaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgata 229  Q
    ||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  18826155 agaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtttgttagtgata 18826056  T
Q  230 ttaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaag 329  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  18826055 ttaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagg 18825956  T
Q  330 actattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcag 420  Q
     |||||||||||||||||||||||||     ||||||    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  18825955 gctattttgttaactatcgtggaactagaagatcattaatacgaataggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaagacctgatctca- 18825857  T
Q  421 ctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcacta 504  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||    
T  18825856 -tctctctccttttcttttccaaaactatc-ttattttctg-ttatttaaatttatacaatcaaaattactgcctcaggcacta 18825776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 22 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 18721657 - 18721188
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    |||||||| ||    
T  18721657 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatactgatcaaatataaacatg 18721558  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  18721557 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattattctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 18721458  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||  ||| |||||||||||||    
T  18721457 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccaactaagaaattaggggctgtagtatgagaagagagtcataactcaagggat 18721358  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18721357 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 18721258  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaa 485  Q
      ||||| ||||   |   ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18721257 agtctcatctct---tatatatattttccaacactatctttattttctgtttatttaattttatgcaatcaaa 18721188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 515
Target Start/End: Original strand, 10663643 - 10664142
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  10663643 catgttgctgtgaaactctatttattctgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgatttttatatcatgatcaaatataaacatg 10663742  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10663743 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttat 10663842  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    |||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10663843 tagtgatactaggttaatgttcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaagggctgtagtttgagaagagggttctaactcaagggat 10663941  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||     |||||||    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  10663942 tgattaggactattttgttaactatcatagaactagagaatcattcataagaataggtgtagtataccaattagggaaacatagatgactcgaaagacct 10664041  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactagaataat 511  Q
    |||||||  |||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  10664042 gatctca--tctctctctttttc-tttccaaaactatctttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcaggcattaaaataat 10664138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 22 - 515
Target Start/End: Original strand, 16953520 - 16954019
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||  ||    
T  16953520 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatg 16953619  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| | |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  16953620 atttagtgagaatgaatgactacttaccatagctttctacttagacagaattgaattgttcttataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 16953719  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    || |||||||| ||||| || ||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16953720 taatgatattaggttaatgtgctttaaaccttcgagaattattagaccgcctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 16953819  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16953820 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 16953919  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactagaataat 511  Q
    ||||||| ||||||   |||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  16953920 gatctcatctctct---cttattctttccaaaactatctttatattctg-ttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcaggcactaaaataat 16954015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 22 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 36711012 - 36710575
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||| | ||    
T  36711012 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataagcatg 36710913  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  36710912 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttggacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 36710813  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36710812 tagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 36710713  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||     ||||||    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  36710712 tgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaagacct 36710613  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctt 452  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36710612 gatctca--tctctctccttgtcttttccaaaactatctt 36710575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Original strand, 17930725 - 17931139
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    |||||||| ||    
T  17930725 catgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaacatg 17930824  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  17930825 atttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctagtaaacatggttagtataggaatggataatcgtttgt 17930924  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||| |  | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17930925 tagtgatataagatcaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcgtaactcaagggat 17931023  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |    
T  17931024 tgattaagactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgcaatataccaattacggaaacatcgatgattcgaaagacct 17931123  T
Q  413 gatctcagctctctct 428  Q
     |||||| ||||||||    
T  17931124 aatctcatctctctct 17931139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 22174299 - 22173886
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  22174299 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgaccatctagtttttattcaattcaattattcttaatgctttttatatgctgatcaaatataaacatg 22174200  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  22174199 atttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattaaattgttctaataaacatggttaatctaggaatggataatcgtttgt 22174100  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22174099 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 22174000  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta---------tcattcgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||         | || | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  22173999 tgattagggctattttgttaactaacgttgaattagagaataattaatacaaataggtgtagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaagacct 22173900  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  22173899 gatctcatctctct 22173886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 25595033 - 25594620
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||     ||||||| ||    
T  25595033 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaagtataaacatg 25594934  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  25594933 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgatttgttctaataatcatggttagtctaggaatggataatcctttat 25594834  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  25594833 tactgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccatctaaggaattatgggctgtagtttgagaagagagtcttaactcaagggat 25594734  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||     |||||||    ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  25594733 tgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtatactaattaggggaagatagatgattcgaaagacct 25594634  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  25594633 gatctcatctctct 25594620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 43682246 - 43681776
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||  ||    
T  43682246 catgttgttgtgaaattttatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatg 43682147  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   |||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43682146 atttagtgagaacgaatgactaccgaccctagctttcgacttagacctaattgaaatgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttat 43682047  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  43682046 tagtgatattaggttaacatgcttaaaaccttcaaagaatattagctcacctacggaattagggactgtaatatgagaagagggtcctaactcaagggat 43681947  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||     |||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||| |    
T  43681946 tgattaggactattttgttaactattgtggaactagaaaatcattcataagaataagtgtagtataccaattaggggaaccttgaagactcgaaagacct 43681847  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaa 485  Q
      |||||  ||||||    ||| |||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43681846 agtctca--tctctccatatatatttttcaaaactatctttattttctatttatttaattttatgcaatcaaa 43681776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 5980688 - 5980275
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  5980688 catgttgctgtgaaaatctatttattgtgaatgtcaatctagtttttattcaattaaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 5980589  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||   |||||||||||||| |    
T  5980588 atttagtgagaacgaatgactactgaccataactttcgacttagacctaattgacttgttctaataaacaagtttagtctagatatggataatcgtttgt 5980489  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5980488 tagtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaagaaattacggactgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 5980390  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||     ||||| |    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5980389 tgattatgactattttgttaactattgtggaactagaaaatcatccataagaataggtgtagtataccaattaagggaacatagatgattcgaaagacat 5980290  T
Q  413 gatctcagctctctc 427  Q
    ||||||| |||||||    
T  5980289 gatctcatctctctc 5980275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 426
Target Start/End: Original strand, 12582753 - 12583167
Alignment:
Q  23 atgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtga 122  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||    
T  12582753 atgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatga 12582852  T
Q  123 tttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttatt 222  Q
    ||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||| ||    
T  12582853 tttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatagataattgtttgtt 12582952  T
Q  223 agtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggatt 322  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12582953 agtgatattaggttaacgttcttaaa-ccttcaaagattattacaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggatt 12583051  T
Q  323 gattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatag---atgattcgaaagac 410  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  12583052 gattaggactattttgtcaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatcatgattcgaaagac 12583151  T
Q  411 atgatctcagctctct 426  Q
     || ||||| ||||||    
T  12583152 ctggtctcatctctct 12583167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21280144 - 21279729
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  | |    |||||||| ||    
T  21280144 catgttgctgtgaaactctatttattgttaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatg 21280045  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  21280044 atttagtgagaacgaatgactactgaccctaactctcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttggtctaggaatggataatcgtttgt 21279945  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||  ||| |||||||||||||    
T  21279944 tagtgatattaggttaacatgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttaagaagagagtcttaactcaagggat 21279846  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || ||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  21279845 tgattaggactattttgttaactatcatgtaactagagaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaagaccc 21279746  T
Q  413 gatctcagctctctctc 429  Q
    |||| || |||||||||    
T  21279745 gatcacatctctctctc 21279729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Original strand, 13196601 - 13197015
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||    ||| |||| ||    
T  13196601 catgttgctgtgaaactatatttattgtgaacgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatactttttatatcctgatcaaataaaaacatg 13196700  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   |||||||  ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  13196701 atttagtgagaacgaatgactaccgaccataactttcgacttaaacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 13196800  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13196801 tagtgatattaggttaacgtgctcaaa-ccttcaaagattattagactacctaagaaattaggggttgtagttcgagaagagggtcctaactcaagggat 13196899  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  13196900 tgattatgactattttgttaactatcttggaactagaaaatcattcataagaataagtgcagtataccaattaagagaacatagatgatttgaaagacct 13196999  T
Q  413 gatctcagctctctct 428  Q
    ||||||| || |||||    
T  13197000 gatctcatctatctct 13197015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 10498589 - 10498175
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||  |     
T  10498589 catgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaagtcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatata 10498490  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   | ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  10498489 atttagtgagaacgaacgactactgatcatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtcttggaatggataatcctttat 10498390  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||||||||||||||||    
T  10498389 tagtgatattaggttaacgtactt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggat 10498291  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||     ||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10498290 tgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagggactcattcacaagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 10498191  T
Q  413 gatctcagctctctct 428  Q
     | |||| ||||||||    
T  10498190 aaactcatctctctct 10498175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 410
Target Start/End: Original strand, 8911387 - 8911789
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  8911387 gaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgtttttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 8911486  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
      |||||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  8911487 tatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgcataatcct 8911586  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactt-tagtttgagaagaaggtcctaactcaa 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||    |||||| ||||  ||||| |    
T  8911587 ttattagtgatattatgttaacgtgcttaaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattagggggttgtagccctagaagagggtctaaactcga 8911686  T
Q  317 gggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaa 407  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  8911687 gggatttattaggactattttgttaactatcatagaactagtgaatcattcacaagaataggtgcagtataccaattaggggaactcagaggattcgaaa 8911786  T
Q  408 gac 410  Q
    |||    
T  8911787 gac 8911789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Original strand, 31284414 - 31284832
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatat----tgacaccatataaa 117  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    |||    |||||||    
T  31284414 catgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatatatcctgatcaaatataaa 31284513  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | |||||   ||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  31284514 catgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagccttcgacttagacctaattgaattgttgtaataaacatggttagtctaggaatggataatcct 31284613  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  | ||     |||||| ||||||||||||||    
T  31284614 ttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattaggggatgtaaccctagaagagggtcctaactcaag 31284712  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||     ||||||    ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31284713 ggattgattaggactattttgttaactatcatagaactagggactcattcacaagaataggtgcggtataccaattaggggaacatagatgattcgaatg 31284812  T
Q  409 acatgatctcagctctctct 428  Q
    || | | |||| ||||||||    
T  31284813 acctaaactcatctctctct 31284832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 145 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 12516706 - 12516412
Alignment:
Q  145 tgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtact 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |     
T  12516706 tgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattatgttaaagtgca 12516607  T
Q  245 taaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaact 344  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| | || | | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12516606 taaaaccttcaaagaatattagatcaactaaggaattagggattgtaatctaagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaact 12516507  T
Q  345 atcgtggaact-----atcattc-----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctctc 429  Q
    |||||||||||     | |||||     ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  12516506 atcgtggaactagaaaaccattccaaaagaataggtgcagtataccaattaggggaatatagatgattcgaaagacctgatttcatctctctctc 12516412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 30 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23619731 - 23619325
Alignment:
Q  30 tgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcg 129  Q
    ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||  |||||| | |    
T  23619731 tgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtg 23619632  T
Q  130 agaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgata 229  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  23619631 agaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacataattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcatttattagtgaaa 23619532  T
Q  230 ttaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaag 329  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |     |||||| ||| ||||||||| | ||||||||      
T  23619531 ttaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggcttcaaccctagaagagggttctaactcaatgaattgattaga 23619433  T
Q  330 actattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcag 420  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||     || |||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||     
T  23619432 actattttgttaactatcgtaaaactagtgactctttcacaagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctaaactcat 23619333  T
Q  421 ctctctct 428  Q
    ||||||||    
T  23619332 ctctctct 23619325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Original strand, 33419400 - 33419814
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | | |||||||  |||    |||||||| ||    
T  33419400 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaatttaattgttcttaaagctctttatatcatgatcaaatataaacatg 33419499  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  33419500 atttagtgagaatgaatgactactgaccctagctttcgacttagaccgaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgtataatcctttat 33419599  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    |||||||||||  | ||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  | ||     |||||| ||||||||||||||||||    
T  33419600 tagtgatattagataaacatgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacataaggaattaggggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggat 33419698  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  33419699 tgattatgaatattttgttaactatcgtggaactagtgaatcattcataagaataggtgcagtatacaaattaggggaacataaatgattcgaaagacct 33419798  T
Q  413 gatctcagctctctct 428  Q
     | |||| ||||||||    
T  33419799 aaactcatctctctct 33419814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 57 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 5539114 - 5538681
Alignment:
Q  57 aatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagctt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    |||||||  |||||  | ||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  5539114 aatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatactgatcaaatataaaaatgattaagtgagaatgaatgactactgaccatagctt 5539015  T
Q  157 ttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaa 256  Q
    |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  5539014 tctacttagacaaaattgaattgttctaataaacatgattagtctaggaatgaataatcgtttgttagtgatattaggttaatgtgcataaaaccttcaa 5538915  T
Q  257 agattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact- 355  Q
    |||| | || |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  5538914 agatcactaaaccacctacggaattaggggttgtagtttgagaagagggttctaactcaaaggattgattaggactattttgttaactatcgtgcaacta 5538815  T
Q  356 ----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaact 447  Q
        |||||||    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |  |||||    ||||||| ||| |||||||||  |    
T  5538814 gagaatcattcataagaataggtgcagtataccaatttggggaacatcaatgattcaaaagacctagtctca----tctctccatatattttccaaacat 5538719  T
Q  448 atctttatcatctgtttatttaatttta-tgcaatcaaa 485  Q
    ||||||||  |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  5538718 atctttattttctg-ttatttacttttattgcaatcaaa 5538681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 5614107 - 5613680
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   | |    |||||||    
T  5614107 gaaacatgttgatgtgaaactctatttattgtggatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatacccttatcaaatataaa 5614008  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaa-------taaacatggttagtctatgaatgga 210  Q
    | |||||||| ||||||  ||||||  |||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||       |||||||||||| |||| | ||| |    
T  5614007 catgatttcgtgagaatgaatgactgctgaccacaactttcaacttagacttaattgaattgttcaaaattcaaataaacatggttattctaggtatgca 5613908  T
Q  211 taatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttc-aaagattattagaccacctaaggaattagggac--tttagtttgagaagaaggtc 307  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||| |  | || | |||||||| ||||    
T  5613907 taatcgtttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaaaaaatattataccacctaaggaattaggggctatataatctgagaagagggtc 5613808  T
Q  308 ctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagat 398  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||     |||||||    |||||||||  || | ||||||||||||| | |||     
T  5613807 ctaagtcaagggatttattaggactattatgttaactatcgtgaaactagagaatcattcataagaatatgtgatgtgtgccaattaggggaa-acagag 5613709  T
Q  399 gattcgaaagacatgatctcagctctctc 427  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5613708 gattcgaaagacctgatctcatctctctc 5613680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 428
Target Start/End: Original strand, 30784669 - 30785078
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    |||||||    
T  30784669 gaaacatgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaa 30784768  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | ||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||| |||||||           
T  30784769 catgaattcgtgagaatgaatgactattgaccatagctttctacttagacctaattgaattgttcaaataaacatgaataatctaggaatgga------- 30784861  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
        | ||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||   ||| | ||||||||||||||| |||| || |  ||||||| |||||||  || |     
T  30784862 ----ttgtgatattaggttaacgttcgtaaaaccttcagagaactttaaatcacctaaggaattagagactgtaatccgagaagagggtcctacgtccat 30784957  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattcg-----aatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaa 407  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||     ||||||||     |||| ||  | |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  30784958 ggattgattagggttattttgttaactatcgtgaaactagagaatcattcgtaagaaataggtacaatataccaattaggggaacttagaggattcgaaa 30785057  T
Q  408 gacatgatctcagctctctct 428  Q
    ||| |||||||| ||||||||    
T  30785058 gacctgatctcacctctctct 30785078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 247 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 33883501 - 33883286
Alignment:
Q  247 aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactat 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33883501 aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggttctaactcaagggattgattatgactattttgttaactat 33883402  T
Q  347 cgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctctccttatctt 437  Q
    |||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||  |||||||    
T  33883401 cgtggaactagagaatcattcataagaataggtgcagtataccaattagggaaacatagatgattcgaaagacttaaactcacctctctct--ttatctt 33883304  T
Q  438 ttccaaaactatctttat 455  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33883303 ttccaaaactatctttat 33883286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 51 - 356
Target Start/End: Original strand, 2560325 - 2560630
Alignment:
Q  51 aatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcgagaattgatgactattgacca 150  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||  |||    |||||||| |||||| | || ||   ||||||| ||||||    
T  2560325 aatgaaaatctagtttttattcaattcaattgtttataatcctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgataacgaatgactactgacca 2560424  T
Q  151 tagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaac 250  Q
    | | |||  |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| |||||| |    
T  2560425 tggttttcgacttagacctaactgaattgttctaatacagatggttagtctaggaatggataatcctttattaatgatattagtttaacgtgcttaaagc 2560524  T
Q  251 cttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcct-aactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgt 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || | ||||||||  ||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2560525 cttcaaagattattagaccacctaaggaattatgg-gtgtaatctgagaagagagtcttaaactcaagtgattgattatggctattttgttaactatcgt 2560623  T
Q  350 ggaacta 356  Q
    |||||||    
T  2560624 ggaacta 2560630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 149 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 44027341 - 44027072
Alignment:
Q  149 catagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaa 248  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||  || ||    
T  44027341 catagtttttgacttagacttaattgaatttttctaataaacatgattaggttaggaatgaataatcatttattagtgacattaggttaacgt-gtttaa 44027243  T
Q  249 accttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcg 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||     |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44027242 accttcaacgattattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcg 44027143  T
Q  349 tggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagac 410  Q
    | |||||     |||||||    ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44027142 tagaactagttaatcattcacaagaatatgtgcattatatcaattaggggaacatagatgattcgaaagac 44027072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 357
Target Start/End: Original strand, 4868041 - 4868331
Alignment:
Q  65 ttttattcaattcaatttttcttaatggtttttat-atat--tgacaccatataaacgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaac 161  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||    |||||||  ||| |||| ||||||  |||||||||||||||| |||| |||    
T  4868041 ttttattcaattcaattgttcttaatgctttttattatatcctgatcaaatataaagatgaattcgtgagaatgaatgactattgaccataactttcaac 4868140  T
Q  162 ttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagatt 261  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||     |||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |    
T  4868141 ttaggcctaattgaattgttcaaataaa-----ttagtctaggaatggataattttttatttgtgatattaggtgaacgttcttaaaaccttcaaagaat 4868235  T
Q  262 attagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaactat 357  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||| || |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||||    
T  4868236 attagatcacctaaggaattatgaactgtaatccgagaagagggtcctaagtcaagggattgattagggctatttagttaaccatcgtgaaactat 4868331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 101
Target Start/End: Original strand, 23613284 - 23613363
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatat 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  23613284 catgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 23613363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 321 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 14589698 - 14589560
Alignment:
Q  321 ttgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagaca 411  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||     |||||    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  14589698 ttgattagggctattttgttaacgatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaatacc 14589599  T
Q  412 tgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctt 452  Q
    | ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14589598 taatctca--tctctctccttgtcttttccaaaactatctt 14589560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 333 - 426
Target Start/End: Original strand, 20887589 - 20887691
Alignment:
Q  333 attttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctc 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||     ||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  20887589 attttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctgatctcatctc 20887688  T
Q  424 tct 426  Q
    |||    
T  20887689 tct 20887691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 363 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 5584422 - 5584359
Alignment:
Q  363 gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5584422 gaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctgatctcatctctct 5584359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 58)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 22 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 14281896 - 14281394
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14281896 catgttgttgtgaaactctatttattttgaataacaatctagtttttattcaattcaattgttcttattgctttttatatattgacaccatataaacatg 14281797  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    ||||||  |||||  ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14281796 atttcgttagaatgaatgactactgaccataactttcgacttagacctaattcaattgttctaataaacatggttagtctaggaattgataatcgtttat 14281697  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14281696 tagtgatattaggttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaacttaagggat 14281597  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaac-----tatcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||      |||||||    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14281596 tgattaggactattttgttaactatcgtgaaacaagagaatcattcataagaataggtgcagtatcccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 14281497  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcactagaataatt 512  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||    
T  14281496 gatgtcatctctctctccttttcttttccaaaactatctttattttctgtttatttaattttatgcaatcaaaactactgcgttgggcactaaaataatt 14281397  T
Q  513 tac 515  Q
    |||    
T  14281396 tac 14281394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 22 - 501
Target Start/End: Original strand, 13004937 - 13005425
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13004937 catgttgttgtgaaactctatttattgtaaatgacaatctagtttttattgaatttaattgttcttgatcctttttatatattgacaccatataaacatg 13005036  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||||| ||||||  ||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13005037 atttcgtgagaatgaatgactactggccataactttcgacttagacctaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatagataatcgtttat 13005136  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13005137 tagtgatattaggttaacgtacttaaaaaattcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcataactcaagggat 13005236  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  13005237 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgaagtataccaattaggggaacatagatgatttgaaagacct 13005336  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  13005337 gatctcatctctctctccttatcttttccaaaactatttttattttctgtttatttaattttctgcaatcaaaactactgcctcaggca 13005425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 515
Target Start/End: Original strand, 2378986 - 2379478
Alignment:
Q  30 tgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcg 129  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||||| | |    
T  2378986 tgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattattcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtg 2379085  T
Q  130 agaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgata 229  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  2379086 agaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgata 2379185  T
Q  230 ttaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaag 329  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  2379186 ttaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattacaggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagg 2379285  T
Q  330 actattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcag 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  2379286 actattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgatttgaaagacctgatctcat 2379385  T
Q  421 ctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactagaataatttac 515  Q
    ||||||   |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  2379386 ctctct---cttattctttccaaaactatctttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcaggcactaaaataatttac 2379478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 22 - 515
Target Start/End: Original strand, 9953712 - 9954210
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  9953712 catgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttgttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 9953811  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  9953812 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttat 9953911  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9953912 tagtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 9954010  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta---------tcattcgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||         ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  9954011 tgattaagactattttgttaactatcgtggaattagaaaattattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagagct 9954110  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactagaataat 511  Q
    |||||||    |||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  9954111 gatctca----tctctcttattcttttccaaaactatctttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcaggcactaaaataat 9954206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 22 - 429
Target Start/End: Original strand, 6513001 - 6513420
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatata----aa 117  Q
    |||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    ||    
T  6513001 catgttgttgtgac-ctctatttattgtgaatgacaatctagtttttactcaattcaattgttcttaatactttttatatattgacaccatatatataaa 6513099  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6513100 catgatttcatgagaatgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctacgaatgaataatcgt 6513199  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  6513200 ttattagtgatattaggttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggatgtagtttgagaagagagtcctaactcaag 6513299  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6513300 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgcagtatatcaattaggggaatatagatgattcgaaag 6513399  T
Q  409 acatgatctcagctctctctc 429  Q
    || |||||||| |||||||||    
T  6513400 acctgatctcatctctctctc 6513420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 23 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 1126110 - 1125623
Alignment:
Q  23 atgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtga 122  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||    
T  1126110 atgttgctgtgaaactctattcattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatga 1126011  T
Q  123 tttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttatt 222  Q
    ||| | |||||   || |||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1126010 tttagtgagaaggaataactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatggataatcctttatt 1125911  T
Q  223 agtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggatt 322  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1125910 agtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcttaactcaagggatt 1125811  T
Q  323 gattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatg 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||     |||||||    ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1125810 gattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtccagtataccaattaggagaacataaatgattcgaaagacatg 1125711  T
Q  414 atctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcacta 504  Q
     |||||    |||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||    
T  1125710 ctctca----tctctcttgttcttttccaaaactatctttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcaggcacta 1125623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 22 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 3597157 - 3596693
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  3597157 catgttgctgtgaaactctatttattttgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 3597058  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  3597057 atttagtgagaataaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 3596958  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3596957 tagtgatattaggttaatgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 3596858  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  3596857 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacataaatgattcgaaagacct 3596758  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaa 480  Q
     |||||| ||||||   |||||  |||||||   ||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  3596757 aatctcatctctct---cttattctttccaactatatctttacattctgtttatttaattttatgcaa 3596693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 515
Target Start/End: Original strand, 2846046 - 2846552
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||| |  |||||||    
T  2846046 gaaatatgttgttgtgaaactctatatattgtgaataacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcatgataaaatataaa 2846145  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||||| || |||  ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  2846146 catgatttcgtgataatgaatgactactgaccctagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatctt 2846245  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtac-ttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaa 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||  ||||    
T  2846246 ttatttgtgatattaagttaacgttctttaaaaccttcaaagaatattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctatgtcaa 2846345  T
Q  317 gggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattcg-----aatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaa 406  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||     ||||||||     |||| ||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  2846346 gggattgattatggctattttgttaaccatcgtgaaactagagaatcattcgtaagaaataggtgcagtataccaattagggggacttagaggattcgaa 2846445  T
Q  407 agacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcactaga 506  Q
    |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | |||||||||| |||||||| ||||| |||| | ||| | |    
T  2846446 agacttgatctca--tctatctccttatcttttccaaaactatctttattttctggtaaattaattttatacaatcaaatctactgcctcagacaccaaa 2846543  T
Q  507 ataatttac 515  Q
    |||||||||    
T  2846544 ataatttac 2846552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 9839774 - 9839356
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  | |    |||||||    
T  9839774 gaaacatgttgctgtgaaactctatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatccttatcaaatataaa 9839675  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | ||||||  ||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9839674 catgatttagtgagaatgaatgactactgactatagctttctacttagacctaattgaattgttcaaataaatatggttagtctaggaatggataatcgt 9839575  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9839574 ttatttgtgatattaagttaacgttcgtaaaactttcgaagattattagaccacctaaggaattagggactgtagtttgagaagagggtcctaagtcaag 9839475  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9839474 ggattgattagggctactttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 9839375  T
Q  409 acatgatctcagctctctc 427  Q
    || |||||||| |||||||    
T  9839374 acctgatctcatctctctc 9839356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 23 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 5738459 - 5738042
Alignment:
Q  23 atgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtga 122  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||    
T  5738459 atgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatga 5738360  T
Q  123 tttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttatt 222  Q
    ||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  5738359 tttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgtt 5738260  T
Q  223 agtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggatt 322  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5738259 agtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggatt 5738160  T
Q  323 gattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattagggg-----aacatagatgattcgaaag 408  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||     |||||||||||||||||||    
T  5738159 gattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacataacatagatgattcgaaag 5738060  T
Q  409 acatgatctcagctctct 426  Q
    || |||||||| ||||||    
T  5738059 acctgatctcatctctct 5738042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 22 - 501
Target Start/End: Original strand, 11402005 - 11402491
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  11402005 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 11402104  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  11402105 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacagggttaatctaggaatggataatcgtttgt 11402204  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  11402205 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaacacctaaggaattaggggatatagtataagaagagggtcctaactcaagggat 11402304  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta---------tcattcgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||         ||||  ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  11402305 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaaacattcataagaataggtgcagtataccaattagggaaacatagatgaatcgaaagacct 11402404  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
    ||||||| ||||||   |||||  |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  11402405 gatctcatctctct---cttattctttccaactctatctttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctagggca 11402491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 22 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 26942810 - 26942325
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  26942810 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctcgtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatg 26942711  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  26942710 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttttgataaacaaggttagtctaggaatggataatcgtttgt 26942611  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26942610 tagtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagtttattagaccacctaaggaattaggggctgtaatttgagaagagggtcctaactcaagggat 26942512  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  26942511 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataggaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgaatcgaaagacct 26942412  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
    ||||||| ||||||   |||||  |||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  26942411 gatctcatctctct---cttattctttccaactctatctttatattttgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctagggca 26942325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 26 - 426
Target Start/End: Original strand, 30655196 - 30655605
Alignment:
Q  26 ttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgattt 125  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   ||    |||||||| ||||||    
T  30655196 ttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcccgatcaaatataaacatgattt 30655295  T
Q  126 cgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagt 225  Q
     | ||||||  ||||||| |||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  30655296 agtgagaatgaatgactactgaccataactttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagt 30655395  T
Q  226 gatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgat 325  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30655396 gatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaattcaagggattgat 30655495  T
Q  326 taagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatc 416  Q
    || ||||||||||||||||||  |||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30655496 taggactattttgttaactattatggaactagagaatcattcataagaataagtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctgatc 30655595  T
Q  417 tcagctctct 426  Q
    ||| ||||||    
T  30655596 tcatctctct 30655605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 22 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 28108164 - 28107747
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  28108164 catgttgttgtgaaactctatttactatgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgacactatataaacatg 28108065  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  28108064 atttagagagaatgaatgactaatgatcatagc-tttgacttagacctaattgaattgttctaataaacacggttagtcatggaatggataatcgattat 28107966  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaag---attattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagg 318  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28107965 tagtcatattaggttaacgtactt-aaaccttcaaagaatattattagaccacgtaagaaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagg 28107867  T
Q  319 gattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaaga 409  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||     |||||||    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28107866 gattgattaggactattttgttaactattgtggaactagaaaatcattcataagaatagctgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaata 28107767  T
Q  410 catgatctcagctctctctc 429  Q
    | |||| ||| |||||||||    
T  28107766 cctgatatcatctctctctc 28107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 31 - 426
Target Start/End: Original strand, 20185502 - 20185905
Alignment:
Q  31 gtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcga 130  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||||| | ||    
T  20185502 gtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgatttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtga 20185601  T
Q  131 gaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatat 230  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20185602 gaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttattagtgatat 20185701  T
Q  231 taagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaaga 330  Q
    || |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  20185702 taggttaacattcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattatga 20185800  T
Q  331 ctattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagc 421  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |    
T  20185801 ctattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaaaacctgatcttatc 20185900  T
Q  422 tctct 426  Q
    |||||    
T  20185901 tctct 20185905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 31 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 22150489 - 22150086
Alignment:
Q  31 gtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcga 130  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||||| | ||    
T  22150489 gtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgatttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtga 22150390  T
Q  131 gaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatat 230  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22150389 gaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttattagtgatat 22150290  T
Q  231 taagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaaga 330  Q
    || |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22150289 taggttaacattcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattatga 22150191  T
Q  331 ctattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagc 421  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |    
T  22150190 ctattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaaaacctgatcttatc 22150091  T
Q  422 tctct 426  Q
    |||||    
T  22150090 tctct 22150086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 11126071 - 11125670
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  11126071 catgttgttgtgaaactttatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 11125972  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | || ||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  11125971 atttagtgaaaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttttaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 11125872  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    || |||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  11125871 tactgatatttggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaagaaaatatgggctttagtttgtgaagagggtcctaactcaagggac 11125773  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatg 413  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  11125772 tgatcaggactattttgttaactatcgtggaactagagatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaagacttg 11125673  T
Q  414 atc 416  Q
    |||    
T  11125672 atc 11125670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22561539 - 22561124
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  22561539 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaaggacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 22561440  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| | || ||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22561439 atttagtgagaatgaatgactactaacaatagctttctacttagacctaattgatttgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttat 22561340  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    |  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22561339 ttctgatattaagttaacgttcgtaaaaccttcaaagattatgagatcacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 22561240  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaac-----tatcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||      |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  22561239 tgattaagactattttgttgactatcgtgaaaccagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacgtagatgatttgaaagacct 22561140  T
Q  413 gatctcagctctctct 428  Q
    ||||||| ||||||||    
T  22561139 gatctcatctctctct 22561124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Original strand, 10289721 - 10290133
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  10289721 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaatacatttgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 10289820  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  10289821 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacaaggttagtctaggaatggataatcgtttgt 10289920  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| | || ||||    
T  10289921 tagtgatattaggttaatgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtaatttgagaagaaggtcctaagttaaaggat 10290019  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta---------tcattcgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||         ||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  10290020 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactaaaaaataattcataagaataagtgcagtataccaattcggggaacatagatgattcgaaagacct 10290119  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||| | ||||||    
T  10290120 gatcttatctctct 10290133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28112140 - 28111808
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  28112140 catgttgttgtgaaactctatttactgtgaatgacaaactagtttttattcaagtcaattgttcttaatgctttttatatattaacactatataaacatg 28112041  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||| |  ||||||| | ||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  28112040 atttagtgagattgaatgactactaaccatagcttcga-cttagaccaaattgaattgatctaataaacatggttagtctaggaatgaagaatcgtttat 28111942  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28111941 tagtgatattaggttaacgtacttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggatgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 28111843  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta 356  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28111842 tgattatgactattttgttaactatcgtagaacta 28111808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 356
Target Start/End: Original strand, 5259681 - 5260016
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5259681 gaaacatgttgttgtgaaactctatctattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttagatattgacaccatataaa 5259780  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||  |  |||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  5259781 catgattctgtaagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatgggtaatcgt 5259880  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    || ||| |||||| |||||||| |||||    
T  5259881 ttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaagagtattagaccacctaagaaaataggg---gtattttaagaagagggtcctaagtcaag 5259977  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta 356  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||    
T  5259978 ggattgattagggctattttgttaaccatcgtgaaacta 5260016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 111 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 23385040 - 23384642
Alignment:
Q  111 atataaacgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatgga 210  Q
    |||||||| |||||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23385040 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 23384941  T
Q  211 ta--atcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcc 308  Q
    ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  23384940 tataatcgtttattagtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaacaactaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcc 23384842  T
Q  309 taactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta---------tcattcgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatg 399  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||         ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23384841 taaatcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaaacattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatg 23384742  T
Q  400 attcgaaagacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgg 498  Q
    | ||||||||| | |||||| ||||||   |||||  |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||    
T  23384741 aatcgaaagacctaatctcatctctct---cttattctttccaactctatctttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctagg 23384645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 20 - 410
Target Start/End: Original strand, 28230341 - 28230740
Alignment:
Q  20 aacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacg 119  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||      
T  28230341 aacatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattattcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaata 28230440  T
Q  120 tgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgttt 219  Q
    |||||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  28230441 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgatttgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatccttt 28230540  T
Q  220 attagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaaggg 319  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||||||||||||||    
T  28230541 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaaggg 28230639  T
Q  320 attgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattagggg-aacatagatgattcgaaaga 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     || |||    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  28230640 attgattaagactattttgttaactatcgtaaaactagtgactctttcacaagaataggtgcagtataccaattaggggtaacataaatgattcgaaaga 28230739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 410
Target Start/End: Original strand, 19475747 - 19476147
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  19475747 gaaacatgttgctgtgaaactttattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcatttgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 19475846  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
      |||||| | |||||   | ||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  19475847 tatgatttagtgagaacgaacgactactgaccatagttttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagcctaggaatggataatcct 19475946  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    |||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||     |||||| ||||||||||||||    
T  19475947 ttattagtgatagtaggttaacgt-gttaaaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaag 19476045  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||     ||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19476046 ggactgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagagactcattcacaagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 19476145  T
Q  409 ac 410  Q
    ||    
T  19476146 ac 19476147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 139 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 17106868 - 17106573
Alignment:
Q  139 gactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaa 238  Q
    ||||| |||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17106868 gactactgaccataactttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgttttttagtgatattaggttaa 17106769  T
Q  239 cgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttg 338  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17106768 cgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattaggactattttg 17106670  T
Q  339 ttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
    |||||||||||||||||     |||||||    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17106669 ttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaatatgtgcaatataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacttgatctcatctctct 17106573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Original strand, 24399928 - 24400342
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  24399928 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 24400027  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24400028 atttagtgagaacgaatgactactaaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttat 24400127  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||  | ||   | || ||| |||||| ||| |||||||    
T  24400128 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcgacggttattagaccacctgaggaattaggggttgtaaccttaggagagggtcctcacttaagggat 24400226  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||     ||| |||    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  24400227 tgattaggactaatttgttaactatcgtagaactagtgaatcgttcacaagaataggtgcagtataccaattagggaaacatagatgattcgaaagacct 24400326  T
Q  413 gatctcagctctctct 428  Q
     | |||| ||||||||    
T  24400327 aaactcatctctctct 24400342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Original strand, 24410048 - 24410461
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |   ||  |||||||| ||    
T  24410048 catgttgctgtgaaactctatttatggtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatctgatcaa-atataaacatg 24410146  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24410147 atttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttat 24410246  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| || ||   | || ||| |||||| |||||||||||    
T  24410247 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaacctccgacggttattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccttaggagagggtcctgactcaagggat 24410345  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||| |||||     ||| |||    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  24410346 tgattaggacttatttgttaactatcgtagaactagtgaatcgttcacaagaataggtgcagtataccaattagggaaacatagatgattcgaaagacct 24410445  T
Q  413 gatctcagctctctct 428  Q
     | |||| ||||||||    
T  24410446 aaactcatctctctct 24410461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Original strand, 11247506 - 11247925
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  | |    |||||||    
T  11247506 gaaacatgttgctgtgaaagtctatctattgtgaatgataatctagtttttattaaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaa 11247605  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | ||||| || ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11247606 catgattacgtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacataattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatgaataatcgt 11247705  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || | ||| ||||  || |||| |||||    
T  11247706 ttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagaccacctaaggaattaggg-ctgtaatctgataagagagttctaagtcaag 11247804  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattcg-----aatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaa 407  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| || ||||     ||||||||     |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  11247805 ggattgattaaggatattttgttaaccatcatgaaactagagaatcattcgtaagaaataagtgtagtatacaaattaggggaac-cagaggattcgaaa 11247903  T
Q  408 gacatgatctcagctctctctc 429  Q
     |  |||||||| |||||||||    
T  11247904 aaactgatctcatctctctctc 11247925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 18856400 - 18855986
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||  ||    
T  18856400 catgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatg 18856301  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18856300 atttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttat 18856201  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||   | ||     |||||| | ||||||||||||||||    
T  18856200 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttagcagaccacctaagaaattaggagttgtaaccctagaagaggttcctaactcaagggat 18856102  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||   |||||     || |||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18856101 tgattaggactatattgttaactatcgcaaaactagtgactctttcacaagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 18856002  T
Q  413 gatctcagctctctct 428  Q
     | |||| ||||||||    
T  18856001 aaactcatctctctct 18855986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 49 - 410
Target Start/End: Original strand, 13946794 - 13947163
Alignment:
Q  49 tgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcgagaattgatgactattgac 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||  |||||| | |||||   ||||||| ||||    
T  13946794 tgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacaaatgactactgac 13946893  T
Q  149 catagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaa 248  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| ||    
T  13946894 cataactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattagattaacgtgctt-aa 13946992  T
Q  249 accttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcg 348  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  | ||      ||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  13946993 accttcaaaggttattaaaccacctaaggaattaggggttgtaaccctcgaagagggtcataactcaagggattaattaggactattttgttaactatcg 13947092  T
Q  349 tggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagac 410  Q
    |  |||||     ||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13947093 taaaactagggactcattcacaagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagac 13947163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Original strand, 4512221 - 4512639
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |  |||    |||||||| ||    
T  4512221 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaattgttcttaatactttttatctcgtgatcaaatataaacatg 4512320  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  4512321 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagactgaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcatttat 4512420  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggact----ttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||     ||     |||||| ||||| |||||||     
T  4512421 tagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaaagttagtagaccacctaaggaattaggggctacaagtaaccctagaagagggtccgaactcaat 4512519  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4512520 ggattgattatgactattttgttaattatcgtggaactaatgaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 4512619  T
Q  409 acatgatctcagctctctct 428  Q
    || | | |||| ||||||||    
T  4512620 acctaaactcatctctctct 4512639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 52 - 247
Target Start/End: Original strand, 2372104 - 2372295
Alignment:
Q  52 atgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccat 151  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||       
T  2372104 atgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgttttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgtgagaattgatgactactgac--- 2372200  T
Q  152 agcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaa 247  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2372201 -gctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatgaataatcgtttattagtgatattaggttaacgtatttaa 2372295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12988499 - 12988196
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| |||||| || |||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  12988499 catgttgctgtgaagctctatt-attgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaatatttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 12988402  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12988401 atttcgtgagaatgaatgactactgaccataactttcaacttagacataattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttat 12988302  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    | ||||||||| |||| ||| ||| ||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | || ||||| |||||||| |||||||||    
T  12988301 ttgtgatattaggttagcgttcttcaaatcttctaagaatattagatcacctaaggaattagggactgtaatatgcgaagagggtcctaagtcaagggat 12988202  T
Q  322 tgatta 327  Q
    ||||||    
T  12988201 tgatta 12988196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 13021628 - 13021315
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    |||||||| ||    
T  13021628 catgttgttgtgaagctctatt-attgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaatatttcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaacatg 13021531  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    ||||||  |||||  ||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13021530 atttcgtaagaatgaatgactactgatcataactttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatcgttagtctaggaatggataatcgtttat 13021431  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    | ||||||||| ||||| || ||| ||| |||| |||| ||||||| ||| |||||| ||||||||| || | |||||||| |||||||| |||||||||    
T  13021430 ttgtgatattaggttaatgttcttcaaatcttctaagaatattagatcacttaaggagttagggactataatctgagaagagggtcctaagtcaagggat 13021331  T
Q  322 tgattaagactatttt 337  Q
    |||||| | |||||||    
T  13021330 tgattagggctatttt 13021315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 164 - 428
Target Start/End: Original strand, 7128190 - 7128462
Alignment:
Q  164 agacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattat 263  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||    
T  7128190 agacctaactgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaatgttat 7128288  T
Q  264 tagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tc 358  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||     ||    
T  7128289 tagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagtgactc 7128388  T
Q  359 attc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctct 428  Q
     |||     |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  7128389 tttcacaataatatgtgcattataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctaaactcatctctctct 7128462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 145 - 356
Target Start/End: Original strand, 23007932 - 23008143
Alignment:
Q  145 tgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtact 244  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||    
T  23007932 tgaccataactttcaacttagacctaactgaactgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatatcaggttaacgttct 23008031  T
Q  245 taaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaact 344  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | || || | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23008032 taaaacctttaaagaatattagaccacctaaggaattagaggctgtaatctgataagagggtcctaagtcaagggattgattagggctattttgttaact 23008131  T
Q  345 atcgtggaacta 356  Q
    |||||| |||||    
T  23008132 atcgtgaaacta 23008143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 145 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23780432 - 23780221
Alignment:
Q  145 tgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtact 244  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||    
T  23780432 tgaccataactttcaacttagacctaactgaactgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatatcaggttaacgttct 23780333  T
Q  245 taaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaact 344  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | || || | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23780332 taaaacctttaaagaatattagaccacctaaggaattagaggctgtaatctgataagagggtcctaagtcaagggattgattagggctattttgttaact 23780233  T
Q  345 atcgtggaacta 356  Q
    |||||| |||||    
T  23780232 atcgtgaaacta 23780221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 309 - 460
Target Start/End: Original strand, 2372293 - 2372448
Alignment:
Q  309 taactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaactatcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcg 404  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2372293 taactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactatcattcataagaatatgtgcagtataccaactaggggaacatagatgattcg 2372392  T
Q  405 aaagacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatct 460  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2372393 aaagagatgatctcagctctctctccttatctttttcaaaactatctttatcatct 2372448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 349
Target Start/End: Original strand, 28848592 - 28848917
Alignment:
Q  23 atgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatata-aacgtg 121  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||||  |||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||   |||||| ||| ||    
T  28848592 atgttgttgtgaaactctgtttcatatgaatatcaatataggttt-attcaattcaactgttcttaatgttttttatatactgat--catatataacctg 28848688  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    | |||| ||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28848689 aattcgtgagaatgaatgactgctgaacatagctttcaactcagacctaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctaggaatagataatcgtttat 28848788  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    | |||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||| |||||||||    
T  28848789 ttgtgataataggttaacgttctcaaaaccttcaaagaatatcagatcacctaaggaattagggactgtaatttgagaagagggccctaagtcaagggat 28848888  T
Q  322 tgattaagactatttt-gttaactatcgt 349  Q
    | || | ||||||||| |||||| |||||    
T  28848889 ttatcaggactattttagttaaccatcgt 28848917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 384 - 515
Target Start/End: Original strand, 2372448 - 2372579
Alignment:
Q  384 taggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatca 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2372448 taggggaacatagatgattcgaaagagatgatctcaactctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatca 2372547  T
Q  484 aaactacttcctcgggcactagaataatttac 515  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2372548 aaactacttcctcggacactaaaataatttac 2372579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 288
Target Start/End: Original strand, 24371065 - 24371289
Alignment:
Q  65 ttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaactta 164  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||| |   ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24371065 ttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatataatgagaatgaatgactactgaccatagctttcaactta 24371164  T
Q  165 gacctaattgaatt-gttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattat 263  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||| | |||    
T  24371165 gacctaattgaatttgttcaaataaaccgggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgataataggttaatgttcttaaaaccttcaaataatat 24371264  T
Q  264 tagaccacctaaggaattagggact 288  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  24371265 tagatcacctaaggaattagggact 24371289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 315
Target Start/End: Original strand, 31072053 - 31072332
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  31072053 catgttgctgcgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 31072152  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||      
T  31072153 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggctggtctaggaatggataatcgttt-- 31072250  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactca 315  Q
                |||||||| ||| |||||||| |  |||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||  | |||||||||    
T  31072251 ------------gttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaaaaattaggggctgtagtttgagaagagagccctaactca 31072332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 11192949 - 11192657
Alignment:
Q  26 ttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgattt 125  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||| |||||  | |    |||||||| ||||||    
T  11192949 ttgttgtgaaactctatt-attgtgaatatcaatctagtttt-attcaatttaattgttcttaatgctttctatatgctaatcaaatataaacatgattt 11192852  T
Q  126 cgcgagaattgatgactattgaccatagctttta-acttagacctaattgaattgttctaataaacatggtta----gtctatgaatggataatcgttta 220  Q
    || ||||||    ||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    ||||| || ||||||||||||||    
T  11192851 cgtgagaat----gactactgaccataggtttcacacttagacctaattgaaatgttcaaataaacagggttaattagtctaggattggataatcgttta 11192756  T
Q  221 ttagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaaggg 319  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||| ||| |||||||    
T  11192755 tttgtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaaggaattagggactgtagtctgagaagagagtcttaagtcaaggg 11192657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 189 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 26896467 - 26896220
Alignment:
Q  189 acatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggact 288  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  26896467 acatggttactctacgaatggataatcctttattagtgatattaggttaatgtgctt-aaaccttcaaaggttatgagaccacctaagaaattaggggct 26896369  T
Q  289 ttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtatac 379  Q
     ||     |||||| ||||  ||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||    
T  26896368 gtaaccctagaagagggtctaaactcaatggattgattatggctattttgttaattattgtggaactagtgaatcattcacaagaataggtgcagtatac 26896269  T
Q  380 caattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctct 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  26896268 caattaggggaacatagatgattcgaaagacctaaactcatctctctct 26896220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 11188291 - 11188130
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  11188291 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatg 11188192  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttct 183  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||    
T  11188191 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttaaacagaattgaattgttct 11188130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23388472 - 23388327
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  23388472 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatg 23388373  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagac 167  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  23388372 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagac 23388327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26898248 - 26898071
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  |||    || ||||    
T  26898248 gaaacatgttgctgtgaaactatatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttgttatatcctgatcaaatttaaa 26898149  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggt 195  Q
    | |||||| | || ||   ||||||| ||||| |||||||  | |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26898148 catgatttagtgacaacgaatgactactgaccctagctttcgaattagacctaattaagttgttctaataaacatggt 26898071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 290 - 426
Target Start/End: Original strand, 23847785 - 23847932
Alignment:
Q  290 tagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc---gaatatgtgtagtatacca 381  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||   ||||| ||| |||||||||    
T  23847785 tagtttgagaagagagacctaactcaagagattgattaagactattttgttaactattgtggaactagaaaatcattcatagaataggtgcagtatacca 23847884  T
Q  382 attaggggaacat---agatgattcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
    |||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23847885 attaggggaatataaaagatgattcgaaagacctgatctcatctctct 23847932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 291 - 426
Target Start/End: Original strand, 32109685 - 32109829
Alignment:
Q  291 agtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtatacca 381  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||     |||||||    ||||| ||| || |||| |    
T  32109685 agtttgagaagagggtcataactcaagggattgattagaactattttgttaattatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgcagcatacaa 32109784  T
Q  382 attaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  32109785 attaggggaacattgatgattcgaaagacctgatctcatctctct 32109829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 429 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 28107715 - 28107629
Alignment:
Q  429 ccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcactagaataatttac 515  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||    
T  28107715 ccttatattttccaaaactatctttattttctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacaacctagggcactaaaataatttac 28107629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 430 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 28111766 - 28111681
Alignment:
Q  430 cttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcactagaataatttac 515  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  28111766 cttatattttccaaaactatctttattttatgtttatttaattttatgcaatcaaaactactgcctagggcactaaaataatttac 28111681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 28665639 - 28665560
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatat 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  28665639 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatattttttatat 28665560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 290 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 23842906 - 23842762
Alignment:
Q  290 tagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtatacc 380  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||     ||||||     ||||| ||| | |||| |    
T  23842906 tagtttgagaagagggtcctaactcaaaggattgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcatttataagaataagtgcaatataac 23842807  T
Q  381 aattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||    
T  23842806 aattaggggaacatagat-attcgaaagaactgatctcatctctct 23842762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23667771 - 23667721
Alignment:
Q  297 agaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatc 347  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23667771 agaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatc 23667721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 24155392 - 24155327
Alignment:
Q  363 gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctct 428  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  24155392 gaataggtgcagtataccaattaggggaacatatatgattcgaaagacctaaactcatctctctct 24155327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 432 - 475
Target Start/End: Original strand, 6514189 - 6514232
Alignment:
Q  432 tatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaatttta 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6514189 tatcttttccaaaactatctttattttctgtttatttaatttta 6514232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 7918071 - 7918025
Alignment:
Q  32 tgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattca 78  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7918071 tgaaactctatctattatgaatggcaatctagtttttattcaattca 7918025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 479 - 515
Target Start/End: Original strand, 5260020 - 5260056
Alignment:
Q  479 aatcaaaactacttcctcgggcactagaataatttac 515  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5260020 aatcaaaactactgcctcgggcactaaaataatttac 5260056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 56)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 22 - 468
Target Start/End: Original strand, 22020797 - 22021251
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22020797 catgttgctgtgaaactctatt-attgtgaatgacaatctagtttttattcaactcaattgttcttaatgctttttatatattgacaccatataaacatg 22020895  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22020896 atttcgtgagaatgaatgactactgaccatagcttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttat 22020995  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22020996 tagtgatattaggttaacgtacttaaaacctttaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggttctaactcaagggat 22021095  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22021096 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgcagtataccaattagggtaacatagatgattcgaaagacct 22021195  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttattt 468  Q
     |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22021196 tatctcatctctctctccttatctttaccaaaactatctttattttctgtttattt 22021251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 22 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 9185801 - 9185301
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  9185801 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 9185702  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  9185701 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatgaataatcctttat 9185602  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9185601 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagagactgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 9185502  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9185501 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 9185402  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactagaataat 511  Q
    ||||||| ||||||   |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  9185401 gatctcatctctct---cttattctttccaaaactatctttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcaggcactaaaataat 9185305  T
Q  512 ttac 515  Q
    ||||    
T  9185304 ttac 9185301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 22 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 9189029 - 9188529
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  9189029 catgatgttgtgaaactctatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 9188930  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| ||||||||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  9188929 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagatttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatggataatcctttat 9188830  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9188829 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaagtaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 9188730  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9188729 tgattaggactattttgttgactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 9188630  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactagaataat 511  Q
    ||||||| ||||||   |||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  9188629 gatctcatctctct---cttattctttccaaaactatctttacattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcaggcactaaaataat 9188533  T
Q  512 ttac 515  Q
    ||||    
T  9188532 ttac 9188529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 22 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 25960065 - 25959566
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  25960065 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 25959966  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  25959965 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 25959866  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  25959865 tagtgatattaggttaacgttcttaaaacctttaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtctgagaagagggtcctaactcaagggat 25959766  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25959765 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 25959666  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactagaataat 511  Q
    |||||||    |||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||| ||||||    
T  25959665 gatctca----tctctcttattcttttccaaaactatctttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcaagcactaaaataat 25959570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 22 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37280053 - 37279553
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    |||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||  ||    
T  37280053 catgttgccgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatg 37279954  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  37279953 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 37279854  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  37279853 tagtgatattaggttaacattcttaaaaccttcaaagattattagaccacgtaaggaattaggggctgtagtttgagaagaggatcctaactcaagggat 37279754  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37279753 tgattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 37279654  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactagaataat 511  Q
    ||||||| ||||||   |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  37279653 gatctcatctctct---cttattctttccaaaactatctttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaaatactgcctcaggcactaaaataat 37279557  T
Q  512 ttac 515  Q
    ||||    
T  37279556 ttac 37279553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 22 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 31427918 - 31427430
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  31427918 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 31427819  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  31427818 atttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttaatctaggaatggataatcgtttgt 31427719  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31427718 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacttaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 31427619  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |     ||||||    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  31427618 tgattagggctattttgttaactatcgtggaattagaaaatcattaatacgaataggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaagacct 31427519  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttattta-attttatgcaatcaaaactacttcctcgggcacta 504  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  31427518 gatctca--tctctctccttgtcttttccaaaactatc-ttattttctg-ttatttactttttatgcaatcaaaaccactgcctcgggcacta 31427430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 11348272 - 11347856
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  11348272 catgttgctgtgaaactttatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 11348173  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  11348172 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 11348073  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11348072 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaagaaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 11347973  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11347972 tgattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaatagatgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 11347873  T
Q  413 gatctcagctctctctc 429  Q
    ||||||| || ||||||    
T  11347872 gatctcatctatctctc 11347856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 515
Target Start/End: Original strand, 25870513 - 25871012
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  25870513 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaattacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatg 25870612  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  25870613 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagacttgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataattgtttgt 25870712  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25870713 tagtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggatgtagtttgagaagacggtcctaactcaagggat 25870811  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  25870812 tgattaaaactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcacaagaataggtgtagcataccaattagggaaacatagatgactcgaaagacct 25870911  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactagaataat 511  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  25870912 gatctca--tctctctctttatcttttccaaaattatctttattttc-gtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcaggcattaaaataat 25871008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 504
Target Start/End: Original strand, 33310395 - 33310882
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  33310395 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 33310494  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  33310495 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttggacttagacctaattgaattgttctaataaacatagttagtctaggaatggataatcgtttgt 33310594  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33310595 tagtgatattaggttaacttgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 33310694  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta---------tcattcgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||         | ||  |||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  33310695 tgattagggctattttgttaactaccgtggaactagaaaattattaatatgaatagttgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaagacct 33310794  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcacta 504  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33310795 gatctca--tctctctccttgtcttttccaaaactatc-ttattttctg-ttatttaaatttatgcaatcaaaactactgcctcgggcacta 33310882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 49 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 30275118 - 30274665
Alignment:
Q  49 tgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcgagaattgatgactattgac 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||||| | ||||||  ||||||| ||||    
T  30275118 tgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgac 30275019  T
Q  149 catagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaa 248  Q
    |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  30275018 catagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatggataatcctttatcagtgatattaggttaacgttcttaaa 30274919  T
Q  249 accttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcg 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30274918 accttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcttaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcg 30274819  T
Q  349 tggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctctccttatctttt 439  Q
    || ||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||| |  ||||||    
T  30274818 tgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggagaacatagatgattcgaaagacatgctctca----tctctcttattctttt 30274723  T
Q  440 ccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctc 496  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  30274722 ccaaaactatctttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctc 30274665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 504
Target Start/End: Original strand, 38015247 - 38015734
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  38015247 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcatgatcaaatataaacatg 38015346  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  38015347 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgactttgacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcatttgt 38015446  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38015447 tagtgatattaggttaaggtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 38015546  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||     ||||||    |||||| ||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  38015547 tgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggttcagtatatcaattaggggaacatcgatgattcgaaagacct 38015646  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcacta 504  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38015647 gatctca--tctctctccttgtcttttccaaaactatc-tcattttctg-ttatttaaatttatgcaatcaaaactactgcctcgggcacta 38015734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Original strand, 5105455 - 5105868
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |     
T  5105455 catgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacata 5105554  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  5105555 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtataggaatggataatcctttat 5105654  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5105655 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 5105754  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  5105755 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcatatgaataggtgcagtataccaattaggggaacatagataatttgaaagacct 5105854  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  5105855 gatctcatctctct 5105868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 31586317 - 31585904
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||| | ||    
T  31586317 catgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagttttgattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataatcatg 31586218  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| | |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31586217 atttagtgagaatgaatgactactaaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatggataatcctttat 31586118  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31586117 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 31586018  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31586017 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaatagatgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 31585918  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  31585917 gatctcatctctct 31585904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 25139312 - 25138840
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||  |||    || ||||    
T  25139312 gaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaatttaattgttcctaatgctttttatatcctgatcaaatgtaaa 25139213  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  25139212 catgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctcataatcatggttagtctaggaatggataatcct 25139113  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25139112 ttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaag 25139013  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||| |||    ||||| ||| |||||||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  25139012 ggattgattatgactattttgttaactatcgtggaacttgaaaatcgttcataagaataggtgcagtataccaattagggaaatatcgataattcgaaag 25138913  T
Q  409 acatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaa 485  Q
    || |||||||| ||||||   ||||| |||||||||   ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||    
T  25138912 acctgatctcatctctct---cttatattttccaaacaaatctttattttatg-ttatttaattttatgcaatcaaa 25138840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Original strand, 24234824 - 24235239
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  24234824 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 24234923  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  24234924 atttagtgagaatgaatgactactgaccatatctttctacttagacagaattgaattgttataataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 24235023  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24235024 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 24235123  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  24235124 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactaggaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagataattcgaaagacct 24235223  T
Q  413 gatctcagctctctct 428  Q
    ||||||| || |||||    
T  24235224 gatctcatctttctct 24235239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 42369087 - 42368675
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  42369087 catgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 42368988  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  42368987 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 42368888  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42368887 tagtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 42368789  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  42368788 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacataaatgatttgaaagacct 42368689  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||| | ||||||    
T  42368688 gatcttatctctct 42368675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 25821226 - 25820755
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  25821226 gaaacatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 25821127  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | |||||   ||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25821126 catgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcaacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgt 25821027  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    || ||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25821026 ttgttagtgatactaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaag 25820928  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25820927 ggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtatatcaattaggggaacatcgatgattcgaaag 25820828  T
Q  409 acatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaatttta-tgcaatcaaa 485  Q
    || |  |||||    ||||||| ||| |||||||||  |||||||||  |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  25820827 acctagtctca----tctctccatatattttccaaacatatctttattttctg-ttatttacttttattgcaatcaaa 25820755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 452
Target Start/End: Original strand, 45456890 - 45457327
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  45456890 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatccaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgattaaatataaacatg 45456989  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| |  ||||   ||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  45456990 atttagttagaacgaatgactactgaccctagttttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatctttttt 45457089  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  45457090 tagtgatattaggttaacgttctttaaaccttctattattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcttaactcaagggat 45457189  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||     ||||||    |||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  45457190 tgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcagtataacaattaggggaacttagatgattcgaaagacct 45457289  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctt 452  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45457290 gatctca--tctctctccttgtcttttccaaaactatctt 45457327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 43208266 - 43207854
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  43208266 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatactttttatatcctgatcaaatataaacatg 43208167  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  43208166 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgaataatcgtttgt 43208067  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  43208066 tagtgatattaggttaacgttcttacaaccttcaaagactattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcct-actcaagggat 43207968  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43207967 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaatagatgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 43207868  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  43207867 gatctcatctctct 43207854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 22 - 501
Target Start/End: Original strand, 8888364 - 8888850
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaa-tggtttttatatattgacaccatataaacgt 120  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||  |||    |||||||| |    
T  8888364 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaaatgctttttatatcctgatcaaatataaacat 8888463  T
Q  121 gatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgttta 220  Q
    ||||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||     
T  8888464 gatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgaataatcgtttg 8888563  T
Q  221 ttagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaaggga 320  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8888564 ttagtgatattaggttaacatgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaaggga 8888662  T
Q  321 ttgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagaca 411  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  8888663 ttgattagaactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgatttgaaagacc 8888762  T
Q  412 tgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
    | |||||| ||||||   |||||  |||||||  ||||||||||  | |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  8888763 taatctcatctctct---cttattctttccaactctatctttatattatgttgatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctagggca 8888850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 22 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 36808818 - 36808339
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  36808818 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctaatttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatg 36808719  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| |  |||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  36808718 atttagtaagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgtataatcgtttat 36808619  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    |||| |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  36808618 tagtaatattaggttaacgtgctt-aaactttcaaagattattagaccacctaaagaattagggtctgtagtttaagaagagggtcttaactcaagggat 36808520  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||     |||||||    ||||| ||| ||| |||||||||||||||| || | |||| ||||||| |    
T  36808519 tgattagaactattttgttaactattgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtgtaccaattaggggaacttaaaggatttgaaagacct 36808420  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctc 496  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||    
T  36808419 gatctca--tctctctccttatcttttccaaaactat-tttattttctgtttatttaattttatgcacacaaacctactgcctc 36808339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Original strand, 27266517 - 27266932
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  27266517 catgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattaaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatg 27266616  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   |||||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27266617 atttagtgagaacgaatgactaccgaccatagatttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaagaatggataatcgtttat 27266716  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  27266717 tagtgataataggttaacgtacttaaaactttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaaggaat 27266816  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||     ||||||    |||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  27266817 ttattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaagtcattcataagaatagctgcattataccaattaggggaacatagatgatttgaaagacct 27266916  T
Q  413 gatctcagctctctct 428  Q
    ||||||| ||||||||    
T  27266917 gatctcatctctctct 27266932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Original strand, 40781201 - 40781613
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  40781201 catgttgctctgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 40781300  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||| ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  40781301 atttagtgagaatgaatgactactgaccacagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 40781400  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    |||| |||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40781401 tagtaatattaggtcaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaagaaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 40781499  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40781500 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 40781599  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  40781600 gatctcatctctct 40781613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Original strand, 24238096 - 24238511
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  24238096 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 24238195  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||| ||| |||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  24238196 atttagtgagaatgaatggctactgaccatatctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 24238295  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24238296 tagtgatattaggttaacgttcttaaaatcttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 24238395  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  24238396 tgattaggtatattttgttaactatcgtggaactaggaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagataattcgaaagacct 24238495  T
Q  413 gatctcagctctctct 428  Q
    ||||||| || |||||    
T  24238496 gatctcatctttctct 24238511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 22 - 515
Target Start/End: Original strand, 25873904 - 25874409
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||  ||    
T  25873904 catgttggtgtgaaactctatttattgtgaattacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatattctgatcaaatataaatatg 25874003  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||| ||||  ||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  25874004 atttagtgagaatgaatgactactgaccataactttctacttagacagacttgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataattgtttgt 25874103  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaa------ttagggactttagtttgagaagaaggtcctaactca 315  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25874104 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggttaggggatgtagtttgagaagacggtcctaactca 25874202  T
Q  316 agggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaa 406  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25874203 agggattgattaaaactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgtagtataccaattagggaaacatagatgactcgaa 25874302  T
Q  407 agacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactag 505  Q
    |||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||||| || |||||||||| |||| | || ||     
T  25874303 agacctgatctca--tctctctctttatctttaccaaaattatctttattttc-gtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcagacattaa 25874399  T
Q  506 aataatttac 515  Q
    ||||||||||    
T  25874400 aataatttac 25874409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 22 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 45493532 - 45493092
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  45493532 catgttgctgtaaaactctatttattgtgaatgataatttagtttttattcagttcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 45493433  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  45493432 atttagtgagaacgaatgactactgaccctaactttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttat 45493333  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  45493332 tagtgatactaggttaacgttcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaactcaagggat 45493234  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |    
T  45493233 tgattaggactattttgttaactatcgtagaactagagaatcattcataagaataggtgcagtataccaattagggaaacatagatgactcgaaaaacct 45493134  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatcttta 454  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  45493133 gatctcatctctctctctttatcttttccaaaattatcttta 45493092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 22 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 45501274 - 45500834
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  45501274 catgttgctgtaaaactctatttattgtgaatgataatttagtttttattcagttcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 45501175  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  45501174 atttagtgagaacgaatgactactgaccctaactttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttat 45501075  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  45501074 tagtgatactaggttaacgttcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaactcaagggat 45500976  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |    
T  45500975 tgattaggactattttgttaactatcgtagaactagagaatcattcataagaataggtgcagtataccaattagggaaacatagatgactcgaaaaacct 45500876  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatcttta 454  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  45500875 gatctcatctctctctctttatcttttccaaaattatcttta 45500834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Original strand, 43723430 - 43723841
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |   ||  |||||||| ||    
T  43723430 catgttgttgtgaaactctatttattgtgaataacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatctgatcaa-atataaacatg 43723528  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  43723529 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaactgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 43723628  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| | || ||||    
T  43723629 tagtgatattaggttagcgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactatagtttgagacgagggtcctaagttaaaggat 43723727  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43723728 tgattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcaatataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 43723827  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  43723828 gatctcatctctct 43723841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 426
Target Start/End: Original strand, 5666255 - 5666658
Alignment:
Q  30 tgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcg 129  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||||| | |    
T  5666255 tgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtg 5666354  T
Q  130 agaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgata 229  Q
    ||||   | ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  5666355 agaacgaacgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaatagttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgata 5666454  T
Q  230 ttaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaag 329  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  5666455 ttaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggattgattatg 5666553  T
Q  330 actattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcag 420  Q
    |||||||||||||||||| |||||||     |||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  5666554 actattttgttaactatcttggaactagaaaatcattcataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacatagat-attcgaaagacctgatctcat 5666652  T
Q  421 ctctct 426  Q
    ||||||    
T  5666653 ctctct 5666658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 490
Target Start/End: Original strand, 26365662 - 26366136
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  26365662 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 26365761  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   || |||| ||||| || ||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |    
T  26365762 atttagtgagaacgaattactactgaccctaactttcgacttatacctaattgaatttttctaataaacatggttagtttaggaatgaataatcgtttgt 26365861  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26365862 tagtgatattaggttaacgtgcataaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 26365961  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  26365962 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtacactataccaattaggggaacatagataattcaaaagacct 26366061  T
Q  413 gatctcagctctctctcct-tatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaatttta-tgcaatcaaaactac 490  Q
      |||||    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  26366062 agtctca----tctctcatatatattttccaaaactatctttattttctg-ttatttacttttattgcaatcaaatctac 26366136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 13972270 - 13971858
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  13972270 catgttgctgtgaaactctatttattgtgattgacaatatagttattattcaattcaactgttcttaatgttttttatatcatgatcaaatataaacatg 13972171  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  13972170 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattggatttttctaaaaaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 13972071  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||||| | |||||||    
T  13972070 tagtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttttattttgagaagagtgtcctaagttaagggat 13971972  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13971971 tgattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 13971872  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||| ||| ||||||    
T  13971871 gatatcatctctct 13971858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 452
Target Start/End: Original strand, 45453603 - 45454039
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||| | ||    
T  45453603 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa-catg 45453701  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  45453702 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 45453801  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45453802 tagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 45453901  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    ||||||   ||||||||||||||||| |||||||     ||||||    |||||| ||| | |||||||||||| | ||| || |||||||||||||| |    
T  45453902 tgattagtgctattttgttaactatcatggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcattataccaattagagaaacttatatgattcgaaagacct 45454001  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctt 452  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  45454002 gatctca--tctctctccttgtctttttcaaaactatctt 45454039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 1386798 - 1386384
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||  ||    
T  1386798 catgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcatgatcaaatataaatatg 1386699  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   | ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  1386698 atttagtgagaacgaacgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagaaatggataatcctttat 1386599  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||||||||||||||||    
T  1386598 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggat 1386500  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||     ||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1386499 tgattaagactattttgttaactatcgtaaaactagggactcattcacaagaataagtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 1386400  T
Q  413 gatctcagctctctct 428  Q
     | |||| ||||||||    
T  1386399 aaactcatctctctct 1386384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 419
Target Start/End: Original strand, 6826501 - 6826905
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  6826501 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 6826600  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | || |||  ||||||| |||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  6826601 atttagtgaaaatgaatgactactgaccatagctttctacttagaaagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 6826700  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||   |||||| ||||||| |    
T  6826701 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaaattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagaatcctaagtcaagggtt 6826799  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||     |||||||     |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  6826800 tgattaggactattttgttaac-atcgtggaactagaaaatcattcataaaaataggtgcagtataccaattaggggagcatagatgattcgaaagacct 6826898  T
Q  413 gatctca 419  Q
    |||||||    
T  6826899 gatctca 6826905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 40259515 - 40259101
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  40259515 catgttgttgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 40259416  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  40259415 atttagtgagaacgaatgactactgaccatagttttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtttaggaatggataatcatttat 40259316  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||     | |||||||||||||||||||||||    
T  40259315 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacgattattataccacctaaggaattaggcgctgtaaccctataagaaggtcctaactcaagggat 40259217  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||     ||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  40259216 tgattaagactattttgttaactatcgtaaaactagggactcattcacaagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaacgacct 40259117  T
Q  413 gatctcagctctctct 428  Q
     | |||| ||||||||    
T  40259116 aaactcatctctctct 40259101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 22 - 410
Target Start/End: Original strand, 16178856 - 16179252
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||  ||    
T  16178856 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatg 16178955  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  16178956 atttagtgagaacgaatgactactgaccctaactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatccattat 16179055  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |   |||||| ||||||||||||||||||    
T  16179056 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggatgtaatcctagaagagggtcctaactcaagggat 16179154  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagac 410  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||     |||||||    |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16179155 tgattagagctattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaatatatgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaagac 16179252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 173 - 515
Target Start/End: Original strand, 29440375 - 29440723
Alignment:
Q  173 tgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacc 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29440375 tgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatactagcttaacgttcttaaa-ccttcaaagattattagaccacc 29440473  T
Q  273 taaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----g 363  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    |    
T  29440474 taaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataag 29440573  T
Q  364 aatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtt 463  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||    
T  29440574 aataggtgcagtataccaattagggaaacatagatgactcgaaagacctgatctca--tctctctctttttc-tttccaaaactatctttatattctgtt 29440670  T
Q  464 tatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactagaataatttac 515  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||| || ||||||||||    
T  29440671 tatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcaggcattaaaataatttac 29440723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 37937596 - 37937181
Alignment:
Q  21 acatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgt 120  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |    
T  37937596 acatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattgaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacat 37937497  T
Q  121 gatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgttta 220  Q
    ||||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  37937496 gatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacataattgaattattctaataaacatggttagtttaggaatggataatccttta 37937397  T
Q  221 ttagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaaggga 320  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||     |||||| |||||||||||||||||    
T  37937396 ttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacgattattagaccacctaaggaattgggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaaggga 37937298  T
Q  321 ttgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagaca 411  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     |||||||    ||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  37937297 ttgattatgactattttgttaactatcgtagaactagtgaatcattcacaagaataggtgcggtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaagacc 37937198  T
Q  412 tgatctcagctctctct 428  Q
    | | |||| ||||||||    
T  37937197 taaactcatctctctct 37937181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 111 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 9966657 - 9966331
Alignment:
Q  111 atataaacgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatgga 210  Q
    |||||||| |||||| | ||||||  ||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  9966657 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagcttcctacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatgga 9966558  T
Q  211 taatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtccta 310  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||    
T  9966557 taatcatttatttgtgatgttaagttaacgttcataaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaagggctgtagtttgagaagagggtccta 9966458  T
Q  311 actcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta---------tcattcgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgat 401  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||         ||||  ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  9966457 actcaagggtttgattatgactattttgttaactatcgtgaaactagaaaataattcataagaataggtgcaatataccaattaggggaacatagatgat 9966358  T
Q  402 tcgaaagacatgatctcagctctctct 428  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||    
T  9966357 tcaaaagacttgatctcatctctctct 9966331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 16791138 - 16790719
Alignment:
Q  19 aaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaac 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||     
T  16791138 aaacatgttgttgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaat 16791039  T
Q  119 gtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtt 218  Q
     ||||||   |||||   ||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  16791038 atgatttaatgagaacgaatgactactgaccatagctttcggcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcatt 16790939  T
Q  219 tattagtgatattaagtta--acgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaa 316  Q
    | |||||||||||| ||||  |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    |||||| |||||||||||||    
T  16790938 tgttagtgatattaggttaacacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggctgtagccctagaagagggtcctaactcaa 16790840  T
Q  317 gggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaa 407  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||     || |||     |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16790839 gggattgattaggactattttgttaactatcgtaagactagtgactctttcacaataataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaa 16790740  T
Q  408 gacatgatctcagctctctct 428  Q
    ||| | | |||| ||||||||    
T  16790739 gacctaaactcatctctctct 16790719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 428
Target Start/End: Original strand, 12219520 - 12219939
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  12219520 gaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 12219619  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatga-ctattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcg 216  Q
      | |||| | |||||   |||| ||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  12219620 tatcatttagtgagaacgaatgaactactgaccctagctttcgacttaaacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcc 12219719  T
Q  217 tttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaa 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |   | ||     |||||| |||||||||||||    
T  12219720 tttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacataaggaattaagagatataaccctagaagagggtcctaactcaa 12219818  T
Q  317 gggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaa 407  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||     | |||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12219819 gggattgattatgactattttgctaactatcgtggaactagaaaaacattcacaagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaa 12219918  T
Q  408 gacatgatctcagctctctct 428  Q
    ||| | | |||| ||||||||    
T  12219919 gacctaaactcatctctctct 12219939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 428
Target Start/End: Original strand, 22630566 - 22630984
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  22630566 gaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaactgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 22630665  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | |||||   ||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |    
T  22630666 catgatttagtgagaacgaatgactactaaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacattgttagtctaagaatggataatatt 22630765  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    |||||| |||||||| |||||| | ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||     |||| | ||||||||||||||    
T  22630766 ttattattgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaaaatggtcctaactcaag 22630864  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22630865 ggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagggaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaagggaacataaatgattcgaaag 22630964  T
Q  409 acatgatctcagctctctct 428  Q
    || | | |||| ||||||||    
T  22630965 acctaaactcatctctctct 22630984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 410
Target Start/End: Original strand, 3875020 - 3875412
Alignment:
Q  27 tgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttc 126  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    |||||||| ||||||     
T  3875020 tgttgtgaaactgtgtttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaacatgattta 3875119  T
Q  127 gcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtg 226  Q
    | |||||   || ||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  3875120 gtgagaacgaattactaccgaccctagctttcgacttagacctaattgaatttttctaataaacatggttagtataggaatggataatcctttattagtg 3875219  T
Q  227 atattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgatt 326  Q
    |||||| ||||||||  || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||     ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3875220 atattaggttaacgtgatt-aaaccttcaatggttattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagtgtcctaactcaagggattgatt 3875318  T
Q  327 aagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt-----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagac 410  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||     || |||      ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3875319 aggactattttgttaactatcgtggaactagtgaattattaataaagaatatgtgcagtataccaattaggggaacataggtgattcgaaagac 3875412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 356
Target Start/End: Original strand, 17876835 - 17877168
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  ||     |||||||| ||    
T  17876835 catgttgctgtgaaactctatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaattctttttatatcctggtcaaatataaacatg 17876934  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   || |||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17876935 atttagtgagaacgaattactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttat 17877034  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| | |||||| ||| | || |||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||  | || |    |||||| |||||||||||||||||    
T  17877035 tagtgatattaggataacgtgctt-atacgttcaaagattgttagagcccctaagtaattaagggttgtaatcctcgaagaaagtcctaactcaagggat 17877133  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta 356  Q
    |||||  | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17877134 tgattttggctattttgttaactatcatggaacta 17877168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 356
Target Start/End: Original strand, 30926272 - 30926603
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  30926272 gaaacatgttgttgtgaaactctatctattgtgaatgtcaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaa 30926371  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | ||||||  ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||           |||||||||||    
T  30926372 catgattttgtgagaatgaatgactgctaaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggt-----------tggataatcgt 30926460  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacc----taaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaact 313  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||  | |  | |||||||| |||||||| |    
T  30926461 ttatttgtgatattaagttaacgttcataaaaccttcaaagagtattagaccacctaattaaggaattaggggttgtcatctgagaagagggtcctaagt 30926560  T
Q  314 caagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta 356  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||    
T  30926561 caatggattgattaggactattttgctaaccatcgtgaaacta 30926603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 111 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17874869 - 17874630
Alignment:
Q  111 atataaacgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatgga 210  Q
    |||||||| |||||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  17874869 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacttaattgaattgttctaatacacatggttagtctaggaatgga 17874770  T
Q  211 taatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaa-agattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcct 309  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||      ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | ||     |||||| ||||||    
T  17874769 taatcctttattagtgatattaggttaacgt------aaccttcaacaga-tattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccctagaagagggtcct 17874677  T
Q  310 aactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta 356  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  17874676 aacttaagggattgactaagactattttgttaatcatcgtagaacta 17874630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17876391 - 17876211
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  17876391 gaaacatgttgctgtgaaactctatttatcgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 17876292  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttag 198  Q
    | |||||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17876291 catgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacttaattgaattgttctaatacacatggttag 17876211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Original strand, 10600676 - 10600876
Alignment:
Q  23 atgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtga 122  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||    
T  10600676 atgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagattttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatga 10600775  T
Q  123 tttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttatt 222  Q
    ||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||      ||||||||||||| ||    
T  10600776 tttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacatgattagtc------tggataatcgtttgtt 10600869  T
Q  223 agtgata 229  Q
    |||||||    
T  10600870 agtgata 10600876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 35521740 - 35521423
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | ||  |  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| |  |||||| | ||    
T  35521740 catgttgttgtgaaactctatttcatgtgggtatcaatctagtttt-actcaattcaattgttcttaatgtattttatatactgataatatataa-catg 35521643  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaat----ggataatcgt 217  Q
    | |||| ||||||  | ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    ||||||| ||    
T  35521642 aattcgtgagaatgaaagactactgatcctagctttcaacttagacctaattgatttgttcaaataaacatggttagtctaggaatatatggataattgt 35521543  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||| ||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| | || | |||||||| |||||||| ||||     
T  35521542 ttatttgtgatataaggttagcgctcttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaagaaattagggattgtaatctgagaagagggtcctaagtcaat 35521443  T
Q  318 ggattgattaagactatttt 337  Q
    |  |||||||  ||||||||    
T  35521442 gagttgattagaactatttt 35521423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 255 - 406
Target Start/End: Original strand, 10600876 - 10601036
Alignment:
Q  255 aaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaac 354  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10600876 aaagattactagaccacctaaggaattaagggctgtagtttgagaagagggttctaactcaagggattgattaggattattttgttaactatcgtggaac 10600975  T
Q  355 t-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaa 406  Q
    |     |||||||     |||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10600976 tagagaatcattcataaaaataggtgcagtatatcaattaggggaacatcgatgattcgaa 10601036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 215 - 356
Target Start/End: Original strand, 34682622 - 34682762
Alignment:
Q  215 cgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactc 314  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||  ||||||| ||    
T  34682622 cgtttatttgtgatatcaggttaacgttcttaaaacc--caaagaatattagatcaccttaggaattagggactgtaatctgagaagagagtcctaagtc 34682719  T
Q  315 aagggattgattaagactatttt-gttaactatcgtggaacta 356  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  34682720 aagggattgattagggctattttggttaaccatcgtgaaacta 34682762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 363 - 426
Target Start/End: Original strand, 13137019 - 13137082
Alignment:
Q  363 gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13137019 gaataggtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctgatctcatctctct 13137082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 101
Target Start/End: Original strand, 29440252 - 29440331
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatat 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  29440252 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaatttaattgttcttaatgctttttatat 29440331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 373 - 426
Target Start/End: Original strand, 15470546 - 15470599
Alignment:
Q  373 agtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15470546 agtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctgatctcatctctct 15470599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 281
Target Start/End: Original strand, 11187929 - 11188073
Alignment:
Q  137 atgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagtt 236  Q
    ||||||| ||||  || |||| |||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||| | ||  ||    
T  11187929 atgactactgacattaactttcaacttatacctaattgaattgtttaattaaacatggttagtctaggaatggataaccgtttaattgtgagaatatatt 11188028  T
Q  237 aacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatt 281  Q
    ||| | || ||||||||| || | ||| ||| |||||||| ||||    
T  11188029 aacattctaaaaaccttcgaacaatatgagagcacctaagaaatt 11188073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 38427478 - 38427436
Alignment:
Q  140 actattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttc 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  38427478 actattgaccatagcttttaacttagatctaattaaattgttc 38427436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 75)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 22 - 504
Target Start/End: Original strand, 56195273 - 56195760
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  56195273 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 56195372  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  56195373 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 56195472  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  56195473 tagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 56195572  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||     ||||||    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  56195573 tgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaagacct 56195672  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcacta 504  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  56195673 gatctca--tctctctccttgtcttttccaaaactatc-ttattttctg-ttatttaaatttatgcaatcaaaactactgcctcgggcacta 56195760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 22 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 52531311 - 52530826
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  52531311 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttctgaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 52531212  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  52531211 atttagtgagaatgaatgactattgaccatagctttttacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 52531112  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52531111 tagtgatattaggttaacactcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggatgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 52531012  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52531011 tgattaggactattttgttaactatcgtggaattagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 52530912  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
    ||||||| ||||||   |||||  |||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  52530911 gatctcatctctct---cttattctttccaactctatctttatattctgtttatttaattttatgcaatcaaaactactgcctagggca 52530826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 22 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 34320293 - 34319805
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  34320293 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 34320194  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  34320193 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 34320094  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34320093 tagtgatattaggttaacgttcttaaaactttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctttagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 34319994  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |     ||||||    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  34319993 tgattagggctattttgttaactatcgtggaattagaaaatcattaatacgaataggtgcagtataccaattaagggaacatcgatgattcgaaagacct 34319894  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttattta-attttatgcaatcaaaactacttcctcgggcacta 504  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34319893 gatctca--tctctctccttgtcttttccaaaactatc-ttattttctg-ttatttactttttatgcaatcaaaactactgtctcgggcacta 34319805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 22 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 34018157 - 34017659
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  34018157 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacagtctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatg 34018058  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  34018057 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 34017958  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34017957 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaactcaagggat 34017858  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaac-----tatcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34017857 tgattaagactattttgttaactatcgtggaaccagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 34017758  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactagaataat 511  Q
    ||||||| ||||||   |||||  ||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  34017757 gatctcatctctct---cttattctttcc-aaactatctttatattctg-ttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcaggcattaaaataat 34017663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 22 - 514
Target Start/End: Original strand, 27014009 - 27014507
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  27014009 catgttgttgtgaaaatctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatattctgatcaaatataaacatg 27014108  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27014109 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatggataatcctttat 27014208  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  27014209 tagtgatattaggctaacgttcttaaaactttcaaagattattagaccacctaaggaatcaggggctgtagtttgagaagagggtcttaactcaaaggat 27014308  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27014309 tgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 27014408  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactagaataat 511  Q
    |||||||    |||||| |  ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  27014409 gatctca----tctctcttattcttttccaaaactatctttatattttgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcaggcactaaaataat 27014504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 22 - 501
Target Start/End: Original strand, 24150418 - 24150904
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  24150418 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 24150517  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |    
T  24150518 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtccaggaatggataatcgtttgt 24150617  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24150618 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 24150717  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  24150718 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacacagatgattcgaaagacct 24150817  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
    ||||||| |||||||||   ||  |||||||  |||||||||   ||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  24150818 gatctcatctctctctc---attctttccaactctatctttacattctatttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctagggca 24150904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 22 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 44809331 - 44808843
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  44809331 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaatttcattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 44809232  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  44809231 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggatgatcgtttgt 44809132  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44809131 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 44809032  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||     ||||||    |||||| ||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |    
T  44809031 tgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcaatataccaattaggagaacatcgatgattcgaaagatct 44808932  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttattta-attttatgcaatcaaaactacttcctcgggcacta 504  Q
    |||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44808931 gatctca--tctttctccttgtcttttccaaaactatc-ttattttctg-ttatttactttttatgcaatcaaaactactgcctcgggcacta 44808843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 429
Target Start/End: Original strand, 39501394 - 39501810
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  39501394 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 39501493  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  39501494 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 39501593  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  39501594 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgataagagggtcctaactcaaaggat 39501693  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39501694 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 39501793  T
Q  413 gatctcagctctctctc 429  Q
    ||||||| |||||||||    
T  39501794 gatctcatctctctctc 39501810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 23 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 19859895 - 19859379
Alignment:
Q  23 atgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtga 122  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19859895 atgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgaca-tctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgacaccatataaacatga 19859797  T
Q  123 tttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttatt 222  Q
    ||| | ||||||  || |||| |||||||||||||  ||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  19859796 tttagtgagaatgaataactactgaccatagctttctacttaaacttaattaagttgttttaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgtt 19859697  T
Q  223 agtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggatt 322  Q
    |||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19859696 agtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggatt 19859598  T
Q  323 gattaagactattttgttaactatcgtggaacta---------tcattcgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatg 413  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||         ||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  19859597 gattaagactattttattaattatcgtggaactagaaaataattcataagaatatgtgcagtataccaattaggggatcatagatgattcgaaagacctg 19859498  T
Q  414 atctcagctctctctc---------------ctta-tcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctc 496  Q
    |||||| |||||||||               |||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  19859497 atctcatctctctctctctctctctctctctcttattcttttccaaaactatttttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctc 19859398  T
Q  497 gggcactagaataatttac 515  Q
     | ||||| ||||||||||    
T  19859397 agacactaaaataatttac 19859379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 515
Target Start/End: Original strand, 53094249 - 53094755
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53094249 gaaacatgttgctgtgaaactctatctattgtgaatgacaatctaatttttattcaattaaattgttcttaatgctttttatatattgacaccatataaa 53094348  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||||| |||||   || |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  53094349 catgatttcgtgagaacgaattactactgaccatagttttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatggataatcgt 53094448  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    |||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||  | || | |||||||| |||||||| |||||    
T  53094449 ttatttctgatattaagttaacgttcataaaacattcaaagagtattagaccacctaaggagttaggggttgtactatgagaagagggtcctaagtcaag 53094548  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattcg-----aatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcg-aa 406  Q
    |||||||||| | ||||||||||||  |||||| ||||     ||||||||     |||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| | ||    
T  53094549 ggattgattaggcctattttgttaatcatcgtgaaactagagaatcattcgtaagaaataggtgcagtataccaattaggggaacttagaggatttgaaa 53094648  T
Q  407 agacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcactaga 506  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||| |    
T  53094649 agacctgatctca--tctctctccttatcttttccaaaaatatatttattttctgtttatttaattttatgcaataaaaactactgtctcagacactaaa 53094746  T
Q  507 ataatttac 515  Q
    |||||||||    
T  53094747 ataatttac 53094755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 22 - 501
Target Start/End: Original strand, 48637251 - 48637737
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  48637251 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 48637350  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  48637351 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 48637450  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaaga-ttattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaaggga 320  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48637451 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagatttattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaaggga 48637549  T
Q  321 ttgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagaca 411  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |     |||||||    | ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  48637550 ttgattaggactattttgttaactatcgtggaattagaaaatcattcataagcataggtgcagtataccaattagggaaacatagatgattcgaaagacc 48637649  T
Q  412 tgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
    |||||||| ||||||   |||||  | |||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  48637650 tgatctcatctctct---cttattctctccaactctatctttacattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctagggca 48637737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 22 - 504
Target Start/End: Original strand, 29324571 - 29325057
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  29324571 catgttgctgtgaaactcgatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 29324670  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  29324671 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 29324770  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  29324771 tagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaaaatggtcataactcaagggat 29324870  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||     ||||||     ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  29324871 tgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatatgaataggtgcaatataccaatta-gggaacatcgatgattcgaaagacct 29324969  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcacta 504  Q
    |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29324970 gatct--gatctctctccttgtcttttccaaaactatc-ttattttctg-ttatttaaatttatgcaatcaaaactactgcctcgggcacta 29325057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 515
Target Start/End: Original strand, 5672628 - 5673141
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaat--gacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    ||||||||     
T  5672628 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaaca 5672727  T
Q  120 -----------tgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatg 208  Q
               |||||| | ||||||  ||||||| ||||||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  5672728 agatttagtgatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagttttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatg 5672827  T
Q  209 gataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcc 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  5672828 gataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcc 5672927  T
Q  309 taactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatg 399  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     | |||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5672928 taactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaagcattcacaagaatatgtgcagtataccaattaggggaacatagatg 5673027  T
Q  400 attcgaaagacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgg 498  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||   |||||  |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |    
T  5673028 attcgaaagacctgatcgcatctctct---cttattctttccaactctatctttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcag 5673124  T
Q  499 gcactagaataatttac 515  Q
    ||| || ||||||||||    
T  5673125 gcattaaaataatttac 5673141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 40903459 - 40903046
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  40903459 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatg 40903360  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  40903359 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaattgataatcctttat 40903260  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  40903259 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaagggctgtagtttgagaagagagtcctaagtcaagggat 40903160  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  40903159 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattctaaagacct 40903060  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  40903059 gatctcatctctct 40903046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 15812515 - 15812075
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatg--aatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacg 119  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    ||||||||     
T  15812515 catgttgctgtgaaactctatttattatattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaaca 15812416  T
Q  120 tgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgttt 219  Q
    |||||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15812415 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgttt 15812316  T
Q  220 attagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaaggg 319  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  15812315 tttagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagag 15812216  T
Q  320 attga-ttaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaaga 409  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||     ||||||    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  15812215 attgatttaggactattttgttaactattgtagaactagaaaatcattaatacgaataggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgtatcgaaaga 15812116  T
Q  410 catgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctt 452  Q
    | ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15812115 cctgatctca--tctctctccttgtcttttccaaaactatctt 15812075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 22 - 419
Target Start/End: Original strand, 44164529 - 44164934
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  44164529 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttatttatttcaattgttcttaatgttttttatattctgatcaaatataaacatg 44164628  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||| ||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  44164629 atttagtgagaatgaatgactactgactatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 44164728  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  44164729 tagtgatattaggttaacctgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggattgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggat 44164827  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44164828 tgattatgactattttgttaactatcgtggaactataaaatcattcataagaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagactt 44164927  T
Q  413 gatctca 419  Q
    |||||||    
T  44164928 gatctca 44164934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Original strand, 19820474 - 19820886
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  19820474 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 19820573  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||| ||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  19820574 atttagtgagaatgaatgactactgactatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 19820673  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19820674 tagtgatattaggttaagatgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggat 19820772  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  19820773 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacaaagatgattcgaaagacct 19820872  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  19820873 gatctcatctctct 19820886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 52006906 - 52006494
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||    |||||||| ||    
T  52006906 catgttgctgtgaaactctatctattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcgattgttcttaatgttttttatatcttgatcaaatataaacatg 52006807  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |    
T  52006806 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacaggtttagtctaggaatggataatcgtttgt 52006707  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  52006706 tagtgatattaggttgacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcttaagtcaagggat 52006608  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52006607 tgattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 52006508  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    | ||||| ||||||    
T  52006507 ggtctcatctctct 52006494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 30 - 452
Target Start/End: Original strand, 56198607 - 56199036
Alignment:
Q  30 tgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcg 129  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||||| | |    
T  56198607 tgtgaaactctatttattattaatgacaatctaatttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtg 56198706  T
Q  130 agaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgata 229  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  56198707 agaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtttgttagtgata 56198806  T
Q  230 ttaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaag 329  Q
    ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  56198807 ttaggttaacatgcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatcaggggttgtagttagagaagagggtcctaactcaagggattgattagg 56198906  T
Q  330 actattttgttaactatcgtggaacta---------tcattcgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcag 420  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||         | || | |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||     
T  56198907 actattttgttaactatcttagaactagaaaatgattaatacaaataggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaagacctgatttca- 56199005  T
Q  421 ctctctctccttatcttttccaaaactatctt 452  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  56199006 -tctctctccttgtcttttccaaaactatctt 56199036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 30 - 482
Target Start/End: Original strand, 5681182 - 5681637
Alignment:
Q  30 tgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcg 129  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||||| ||     
T  5681182 tgtgaaactcaatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagcc 5681281  T
Q  130 agaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgata 229  Q
    | ||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  5681282 ataacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataagcatggttagtgtaggaatggataatcgtttgttagtgata 5681381  T
Q  230 ttaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaag 329  Q
     || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  5681382 ctaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagg 5681480  T
Q  330 actattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcag 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||     |||||||    |||||  |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |  |||||     
T  5681481 actattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaatagtttcagtataccaattaagggaacatcgatgattcgaaagacctagtctca- 5681579  T
Q  421 ctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatc 482  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||    
T  5681580 ---tctctccttatcttttccaaaactatctttattttatg-ttatttaattttatgcaatc 5681637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 30 - 515
Target Start/End: Original strand, 5670318 - 5670823
Alignment:
Q  30 tgtgaaactttatttattatgaat--gacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcg 127  Q
    ||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    ||||||||  ||||| |    
T  5670318 tgtgaaactctatttattgtgaatatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacaagatttag 5670417  T
Q  128 cga-----------gaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcg 216  Q
     ||           ||||  ||||||| ||||||||| |||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  5670418 tgatgatttagaaagaatgaatgactactgaccatagttttctacttagacagaattaaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 5670517  T
Q  217 tttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaa 316  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5670518 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaa 5670617  T
Q  317 gggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaa 407  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     | |||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5670618 gggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaagcattcacaagaatatgtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaa 5670717  T
Q  408 gacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactaga 506  Q
    ||| ||||| || ||||||   |||||  |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||| || |    
T  5670718 gacctgatcgcatctctct---cttattctttccaactctatctttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcaggcattaaa 5670814  T
Q  507 ataatttac 515  Q
    |||||||||    
T  5670815 ataatttac 5670823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 22 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 15405460 - 15405020
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  15405460 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcgtgatcaaatataaacatg 15405361  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaat---ggataatcgtt 218  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  15405360 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagaccgaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaataatggataatcgtt 15405261  T
Q  219 tattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagg 318  Q
    | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  15405260 tgttagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaatg 15405161  T
Q  319 gattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaaga 409  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||     ||||||    | |||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15405160 gattgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacaaataggtgcagtatatcaattaggggaacttagatgattcgaaaga 15405061  T
Q  410 catgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctt 452  Q
    | ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15405060 cctgatctca--tctctctccttgtcttttccaaaactatctt 15405020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 485
Target Start/End: Original strand, 15431825 - 15432292
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  15431825 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatg 15431924  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| ||| |||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  15431925 atttagtgagaatgaatgactactgatcatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 15432024  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15432025 tagtgatattagattaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggatgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 15432123  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||| |||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  15432124 tgattagaactattttgttaactatcgtggtactagagaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgactcgaaagacct 15432223  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaa 485  Q
      |||||  |||||||  |||  |||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15432224 agtctca--tctctcttatta--ttttccaaacaaatctttattttctgtttatttaattttatgcaatcaaa 15432292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 48415905 - 48415488
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  48415905 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 48415806  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  48415805 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaatttttctaataataatggttagtctaggaatggataatcatttat 48415706  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  48415705 tattgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggagctgtagtttgagaagagagtcctgactcaagggat 48415606  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaac----atagatgattcgaaag 408  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||    
T  48415605 tgattaggactattttgttaactatcatggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatatatagataattcgaaag 48415506  T
Q  409 acatgatctcagctctct 426  Q
    || |||||||| ||||||    
T  48415505 acctgatctcatctctct 48415488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19864879 - 19864477
Alignment:
Q  30 tgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcg 129  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  19864879 tgtgaaactctatttattgtgaatgaca-tctaatttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgacaccatataaacatgatttagtg 19864781  T
Q  130 agaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgata 229  Q
    |||||  || |||| |||||||||||||  ||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  19864780 agaatgaataactactgaccatagctttctacttaaacttaattaagttgttttaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgata 19864681  T
Q  230 ttaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaag 329  Q
    ||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  19864680 ttaggttaacatgctt-aaaccttcaaagattattagaccatctaagaaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagg 19864582  T
Q  330 actattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcag 420  Q
    |||||||||||||||||    |||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  19864581 actattttgttaactat----gaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggatcatagatgattcgaaagacctgatctcat 19864486  T
Q  421 ctctctctc 429  Q
    |||||||||    
T  19864485 ctctctctc 19864477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 15430231 - 15429819
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  15430231 catgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgactatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 15430132  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    ||||   || |||  | ||||| |||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  15430131 atttaatgaaaatgaacgactactgaccataactttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgttttt 15430032  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||||| || |||||||||    
T  15430031 tagtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagataattagaccacctaaggaattaggggcagtagtttgagaagtgggtcccaagtcaagggat 15429933  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  15429932 ggattaagactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcaaaagacct 15429833  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  15429832 gatctcatctctct 15429819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 24044516 - 24044104
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  24044516 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 24044417  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  || |||| | |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  24044416 atttagtgagaatgaattactacttaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 24044317  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  24044316 tagtgatattaggttaacgtgtttaaa-cctttaaagattattagaccacctaagaaattaggggctgtagtttgagaagagtgtcctaagtcaagggat 24044218  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |    
T  24044217 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgtagtataccaattaggggaacatagataatttcaaagacct 24044118  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  24044117 gatctcatctctct 24044104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 30 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 33408685 - 33408223
Alignment:
Q  30 tgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcg 129  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||||| | |    
T  33408685 tgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaactcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcagatataaacatgatttagtg 33408586  T
Q  130 agaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgata 229  Q
    |||||  |||| || ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||    
T  33408585 agaatgaatgattactgaccatagctgtctacttagacctaattgagttgttcaaataaacattgttagtctaggaatagataatcagttatttgtgata 33408486  T
Q  230 ttaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaag 329  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  33408485 ttaagttaacgttcgtaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttatagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattagg 33408386  T
Q  330 actattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcag 420  Q
     ||||||| ||||| |||||| ||||     |||||||    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||     
T  33408385 gctattttattaaccatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccgattaggggaacttagaggattcgaaagacctaaactca- 33408287  T
Q  421 ctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaa 485  Q
     || |||||| ||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  33408286 -tcactctccatatattttccaaaactatctttattttatgtttatttaattttatgcaatcaaa 33408223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 38283864 - 38283452
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  38283864 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacctg 38283765  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||| | |    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  38283764 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctactgatagaatattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcctttgt 38283665  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  38283664 tagtgatattaggttaacgtgct-aaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagagtcctaactcaagggat 38283566  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||||     |||||||    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38283565 tgattatgactattttgtttactatcatggaactagaaaatcattcataagaatagatgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 38283466  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  38283465 gatctcatctctct 38283452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 137 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 40617069 - 40616698
Alignment:
Q  137 atgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagtt 236  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  40617069 atgactactgaccatagctttctacttagagagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgattttaggtt 40616970  T
Q  237 aacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattt 336  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40616969 aacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattt 40616870  T
Q  337 tgttaactatcgtggaacta---------tcattcgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctc 427  Q
    ||||||||||||||||||||         ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  40616869 tgttaactatcgtggaactagaaaagcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctgatctcatctctct- 40616771  T
Q  428 tccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
      |||||  |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  40616770 --cttattctttccaactctatctttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctagggca 40616698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 452
Target Start/End: Original strand, 33926713 - 33927155
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  33926713 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 33926812  T
Q  122 atttcgcgagaat---tga--tgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcg 216  Q
    |||| | |||||    |||  |||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33926813 atttagtgagaacgaatgacttgactactgaccctagctttcgacttagatctaattgaactgttctaataaacatgattagtctaggaatggataatcg 33926912  T
Q  217 tttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaa 316  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||  |  ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||    
T  33926913 tttgttagtgatattaggttaacgtgctttaaacctttgagaattattagaccacctgaggaattaggggctgtagttttagaagagggtcctaactcaa 33927012  T
Q  317 gggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaa 407  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||     ||||||    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33927013 gggattgattatggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaa 33927112  T
Q  408 gacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctt 452  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33927113 gacctgatctca--tctctctccttgtcttttccaaaactatctt 33927155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Original strand, 40794748 - 40795161
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||  ||    
T  40794748 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatatagtttttattcaattcgattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatg 40794847  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||| ||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  40794848 atttagtgagaatgaatgactactgaccataactttctacttaaacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 40794947  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||| ||    
T  40794948 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcttaagtcaaggaat 40795047  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||     |||||||    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  40795048 tgatcaggactattctgttaactatcgtgtaactagaaaatcattcataagaataggtgtagtataccaattagggaaacatagatgattcgaaagacct 40795147  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||| | ||||||    
T  40795148 gatcttatctctct 40795161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 30 - 485
Target Start/End: Original strand, 12238022 - 12238479
Alignment:
Q  30 tgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatat--tgacaccatataaacgtgatttcg 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||| ||||||||| |  |||    |||||||| |||||| |    
T  12238022 tgtgaaactttatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattg-----ttcttaatgctttttatatctcctgatcaaatataaacatgatttag 12238116  T
Q  128 cgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtga 227  Q
     |||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  12238117 tgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtga 12238216  T
Q  228 tattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgatta 327  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||| || | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12238217 tattaggttaacgtgtttaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattagagactgtaatctgagaagagggttctaactcaagggattgatta 12238316  T
Q  328 agactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctc 418  Q
     |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |  ||||    
T  12238317 tgactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacattgatgactcgaaagacctagtctc 12238416  T
Q  419 agctctctctcct-tatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaa 485  Q
    |    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||    
T  12238417 a----tctctcatatatattttccaaaactatctttattttatg-ttatttaattttatgcaatcaaa 12238479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 15436845 - 15436433
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  15436845 catgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgactatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 15436746  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    ||||   || |||  | ||||| |||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  15436745 atttaatgaaaatgaacgactactgaccataactttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgtataatcgttttt 15436646  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    || |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||||| || |||||||||    
T  15436645 tattgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagataattagaccacctaaggaattaggggcagtagtttgagaagtgggtcccaagtcaagggat 15436547  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  15436546 ggattaagactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcaaaagacct 15436447  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  15436446 gatctcatctctct 15436433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 46955854 - 46955441
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  46955854 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaatttaattgttcttaatgctttttatattatgatcaaatataaacatg 46955755  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  46955754 atttagtgagaacgaatgactactgaccataactttcgatttagacctaattgaattgttctaataaacatggttaatctaggaatggataatcgtttgt 46955655  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46955654 tagtgatattaggttaacgtttttaaaacattcaaagattattagtccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 46955555  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||| ||| |     ||||||    | |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  46955554 tgattagagctattttgttaactatcgttgaattagagaatcattaatacaaataggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcaaaagacct 46955455  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
     |||||| ||||||    
T  46955454 aatctcatctctct 46955441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 27677430 - 27677018
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  27677430 catgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttgttcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatg 27677331  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  27677330 atttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattaaattattctaataaacaaggttagtctaggaatggataatcgtttgt 27677231  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  27677230 tagcgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaagtcaagggat 27677132  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |    
T  27677131 tgattaggactattttgttaactatggtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattagaggaacataaatgattcgatagacct 27677032  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
     |||||| ||||||    
T  27677031 tatctcatctctct 27677018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 427
Target Start/End: Original strand, 15163938 - 15164353
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||| | ||    
T  15163938 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaattacaatctagtttttattcaattctattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataatcatg 15164037  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaa-tggataatcgttta 220  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  15164038 atttagtgagaacgaatgactactgaccttagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaaatggataatcgtttg 15164137  T
Q  221 ttagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaaggga 320  Q
    |||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15164138 ttagtgatattaggttaatctgcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttaagaagagggtcctaactcaaggga 15164237  T
Q  321 ttgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagaca 411  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||     |||||||    ||||| | | | |||||||||||| |||| || |||||||||||||||     
T  15164238 ttgattatgactattttgttaactatcatggaactagataatcattcataagaataggggcaatataccaattagaggaatatcgatgattcgaaagacc 15164337  T
Q  412 tgatctcagctctctc 427  Q
     ||||||| |||||||    
T  15164338 cgatctcatctctctc 15164353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 40493747 - 40493346
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  40493747 gaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 40493648  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  40493647 catgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgtataatcct 40493548  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaac-tcaa 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  | ||     |||||| |||| |||| ||||    
T  40493547 ttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccctagaagagggtcgtaacttcaa 40493449  T
Q  317 gggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaa 407  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||     |||||||    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40493448 gggattgattaggactatttttttaactatcgtagaactagtgaatcattcacaagaataggtgtggtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaa 40493349  T
Q  408 gac 410  Q
    |||    
T  40493348 gac 40493346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Original strand, 12782651 - 12783063
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||  |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  12782651 catgttgttgtgaaactctatttattgtgagtgacaatcttgtttttattcatttcagttgttcttaatactttttatattctgatcaaatataaacatg 12782750  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| |  | |||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12782751 atttagtaaaaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacggaattgaattgttctaataaacagggttagtctatgaatggataatcgtttgt 12782850  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  12782851 tagggatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaaaagggtcctaagtcaagggat 12782949  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  || ||||     ||||||     ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  12782950 tgattaggactattttgttaactctaatgaaactagaaaatcatttataagaataggtgcagtataccaattagaggaacatagatgattcgaaagacct 12783049  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  12783050 gatctcatctctct 12783063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 34 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 37103578 - 37103195
Alignment:
Q  34 aaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcgagaa 133  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||  ||     |||||||| |||||| | |||||    
T  37103578 aaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttattaatgctttatatatcctggtcaaatataaacatgatttagtgagaa 37103479  T
Q  134 ttgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaa 233  Q
    |  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||     
T  37103478 tgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaaca-ggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattag 37103380  T
Q  234 gttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagacta 333  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| |||||    
T  37103379 gttaacgtgcttaaa-ccttcgaagattattagaccaccaaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaagtcaaaggattgattaggacta 37103281  T
Q  334 ttttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagac 410  Q
    ||||||||||||||||| ||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37103280 ttttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattagggaaacatagatgattcgaaagac 37103195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Original strand, 11195421 - 11195836
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaa-ctttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgt 120  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |    
T  11195421 catgttgctgtgaaaactctatttattgtgagtgacaatctggtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcatgatcaaatataaacat 11195520  T
Q  121 gatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgttta 220  Q
    ||||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||    
T  11195521 gatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctacttgaattgttctaataaacatggttagtttaggaatgaataatcattta 11195620  T
Q  221 ttagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaaggga 320  Q
    ||||||||| || |||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||     |||||| |||||||||||||||||    
T  11195621 ttagtgataataggttaacgtgcct-aaaccttcaaaggttattagaccacctaagaaattaggggctttaaccctagaagagggtcctaactcaaggga 11195719  T
Q  321 ttgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagaca 411  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11195720 ttgattaggactgttttgttaactatcgtggaactagtgaatcattcataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacc 11195819  T
Q  412 tgatctcagctctctct 428  Q
    | | |||| ||||||||    
T  11195820 taaactcatctctctct 11195836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 428
Target Start/End: Original strand, 21419534 - 21419949
Alignment:
Q  21 acatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgt 120  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |    
T  21419534 acatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacat 21419633  T
Q  121 gatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgttta 220  Q
    ||||| | |||||     ||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21419634 gatttagtgagaacgagcgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataagcatggttagtctaggaatggataatctttta 21419733  T
Q  221 ttagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaaggga 320  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||   | ||     |||||| ||| |||||||||||||    
T  21419734 ttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattaggtgatgtaaccctagaagagggttctaactcaaggga 21419832  T
Q  321 ttgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagaca 411  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     |||||||    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  21419833 ttgattaggactattttgttaactatcgtagaactagtgaatcattcacaagaataggtgtggtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaagacc 21419932  T
Q  412 tgatctcagctctctct 428  Q
    | | |||| ||||||||    
T  21419933 taaactcatctctctct 21419949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 30 - 404
Target Start/End: Original strand, 3718878 - 3719260
Alignment:
Q  30 tgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcg 129  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||    |||||||| |||||| | |    
T  3718878 tgtgaaactctatttattgtgaatgaaaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatactttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtg 3718977  T
Q  130 agaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgata 229  Q
    |||||  |||| || |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3718978 agaatgaatgattactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgata 3719077  T
Q  230 ttaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaag 329  Q
    ||| ||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |    
T  3719078 ttaggttaacgtgtttaaatc-ttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaagccaagggattgattagg 3719176  T
Q  330 actattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcg 404  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3719177 actattttgttaactattgtggaactagcaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattagggaaacatggatgattcg 3719260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 110 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 3798095 - 3797718
Alignment:
Q  110 catataaacgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatgg 209  Q
    ||||||||| ||||||   ||||||  ||||||| |||||||||||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||     
T  3798095 catataaacatgatttaatgagaatgaatgactactgaccatagctttctatttagacagaattgaattgttctaataaacagggttaatctaggaatga 3797996  T
Q  210 ataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcct 309  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||| |||| |    
T  3797995 ataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtgtgagaagagggtctt 3797897  T
Q  310 aactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatga 400  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||||     ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3797896 aactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagtgaatcattaataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatga 3797797  T
Q  401 ttcgaaagacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaa 485  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||    ||||||||||||||||||  ||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3797796 ttcgaaagacctgatctcatctctctc----tatcttttccaaaactat-gttattttctg-ttatttaattttatgcaatcaaa 3797718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 145 - 455
Target Start/End: Original strand, 18911368 - 18911683
Alignment:
Q  145 tgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtact 244  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||    
T  18911368 tgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgataataggttaacgtgct 18911467  T
Q  245 taaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaact 344  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18911468 taaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaact 18911566  T
Q  345 atcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctctcct-tat 434  Q
    |||||||||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||    |||||| | |||    
T  18911567 atcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcaaaagacctagtctca----tctctcatatat 18911662  T
Q  435 cttttccaaaactatctttat 455  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  18911663 attttccaaaactatctttat 18911683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 49 - 426
Target Start/End: Original strand, 49270456 - 49270837
Alignment:
Q  49 tgaatgacaatctagtttttattcaattcaattttt---cttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcgagaattgatgactatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  | | |   ||||||| |||||| | |||||   ||||||| |    
T  49270456 tgaatgacaatctagtttttattcaattcaattattgttcttaatgctttttatattctcaaa---tataaacatgatttagtgagaacgaatgactact 49270552  T
Q  146 gaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtactt 245  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| | |||    
T  49270553 gatcatagctttcgacttagacctaattgaattgttctcataaacatggttagtatatgaatgaataatcgtttgttagtgatattaggttaacattctt 49270652  T
Q  246 aaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaacta 345  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  49270653 aaaaccttca---attattagaccacctagggaattagggactgtagtttgagaagagggtcctaactcaa-ggattgattaggactattttgttaacta 49270748  T
Q  346 tcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
    |||| |||||     |||||||    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  49270749 tcgttgaactagataatcattcataagaatatgtgcagtataccaattaggagaatatagatgattcgaaagac-tgatctcatctctct 49270837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 354
Target Start/End: Original strand, 35509707 - 35510042
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  35509707 gaaacatgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgattaaatataaa 35509806  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| |  ||||   ||||||| ||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  35509807 catgatttagtaagaacgaatgactactgaccctagctttcgaattagacctaattgaattgttctaataaacatcgttagtctaggaatggataatcct 35509906  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||||||||||||    
T  35509907 ttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaacctttaatggttattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaag 35510005  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaac 354  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35510006 ggattgattatgactattttgttaactatcgtggaac 35510042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 18673450 - 18673043
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||||||  |||    |||||||    
T  18673450 gaaacatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaatt-----------aatgctttttatatcctgatcaaatataaa 18673362  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18673361 catgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacgtaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgt 18673262  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    || |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||| ||||||||||||||    
T  18673261 ttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggctttaaccctagaagagggtcctaactcaag 18673163  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||     || |||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18673162 ggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagtgactctttcacaagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 18673063  T
Q  409 acatgatctcagctctctct 428  Q
    || | | |||| ||||||||    
T  18673062 acctaaactcatctctctct 18673043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 29545253 - 29544853
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  29545253 gaaacatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 29545154  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | |||||   ||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  29545153 catgatttagtgagaacgaatgactactggccctaacttttgacttacacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcct 29545054  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  | ||     | ||||  ||| |||||||||    
T  29545053 ttattagtgatattaggttaatgtgctt-aaaccttcaaaggttattagacctcctaaggaattaggggttgtaaccctataagagagtcataactcaag 29544955  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||     |||||||     |||| ||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29544954 ggattgattagggctattttgttaactatcgtggaactagttaatcattcacaataataggtgcaatataccaattagaggaacatcgatgattcgaaag 29544855  T
Q  409 ac 410  Q
    ||    
T  29544854 ac 29544853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8875141 - 8874803
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   ||||    |||||||    
T  8875141 gaaaaatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatcacttgatcaaatataaa 8875042  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | | |||| | ||||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8875041 cataatttagtgagaatgaatgactaccgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatggatagtcgt 8874942  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  ||||||| ||| |||| ||||     
T  8874941 ttatttgttatattaagttaatgttcttaaaaccttcaaagaatattagaccacctaaggaattaggggctgtaatcggagaagagggttctaagtcaat 8874842  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta 356  Q
     ||||||||| | ||||||||||||| ||| || |||||    
T  8874841 cgattgattatggctattttgttaaccatcttgaaacta 8874803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 53009937 - 53009519
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||    |||||||    
T  53009937 gaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgataatctaggttttattcaattcaattgttcttaatactttttatatcctgatcaaatataaa 53009838  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | |    
T  53009837 catgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatttataaccat 53009738  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| || ||     |||||| ||||||||||||||    
T  53009737 ttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaagaaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaag 53009639  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
     |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  53009638 agattaattaggactattttgttaactatcgtggaactagtgaatcattcacaagaataggtgcagtatactaattaggggaacatagacgattcaaaag 53009539  T
Q  409 acatgatctcagctctctct 428  Q
    || | | |||| ||||||||    
T  53009538 acctaaactcatctctctct 53009519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 8877881 - 8877462
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    |||||||| || ||||||||| ||| |||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  | |    |||||||    
T  8877881 gaaacatgctgctgtgaaactctatctattgtagatgacaatcaagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaa 8877782  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | | ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8877781 catgatttagtgggaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagatttaattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatcgt 8877682  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  | |  |  |||||||  ||||||| |||||    
T  8877681 ttatttgtgatattaagttaacattcttaaaaccttcaaagaatattagaccacctaagaaattaggggttgtgatcggagaagagagtcctaagtcaag 8877582  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc-----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaa 407  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||     ||||||      |||| ||| ||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||    
T  8877581 ggattgattagggctattttgttaaccatcgtgaaactagagagtcattcataagaaataggtgcagtatactaaataggggaacttagatgatttgaaa 8877482  T
Q  408 gacatgatctcagctctctc 427  Q
    ||| |||||||| |||||||    
T  8877481 gacctgatctcatctctctc 8877462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 428
Target Start/End: Original strand, 25961800 - 25962219
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||  |||    |||||||    
T  25961800 gaaacatgttgctgtgaaactatattaattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaaagctttttatatcctgatcaaatataaa 25961899  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
      ||||||   |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  25961900 aatgatttaatgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcct 25961999  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagatta-ttagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaa 316  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||| | | ||| ||||||||||||||||||||||| || ||     |||||| |||||||||||||    
T  25962000 ttattagtgatattagcttaacgtgctt-aaacattcgacggttatttagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaa 25962098  T
Q  317 gggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaa 407  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||     |||||||    ||||| |||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25962099 gggattgattaggaatattttgttaactatcgtagaactagtgaatcattcacaagaataggtgcggtataccaattaggagaacatcgatgattcgaaa 25962198  T
Q  408 gacatgatctcagctctctct 428  Q
    ||| | | |||| ||||||||    
T  25962199 gacctaaactcatctctctct 25962219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 428
Target Start/End: Original strand, 30392315 - 30392729
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    |||| ||||||||| || |    |||||||    
T  30392315 gaaacatgttgctgtgaaactctatttattatgaatgacaatctagtttttattcatctcaattgt----aatgctttttatatcttaatcaaatataaa 30392410  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
      |||||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |    
T  30392411 tatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagcttttgaattagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatact 30392510  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||     |||||| |||||||| |||||    
T  30392511 ttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccaccttaggaattaggggttgtaaccctagaagagggtcctaattcaag 30392609  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     |||||||     |||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30392610 ggattgattaggattattttgttaactatcgtggaactagcgaatcattcataaaaataggtgcaatataccaattaggggaacatatatgattggaaag 30392709  T
Q  409 acatgatctcagctctctct 428  Q
    || | | |||| ||||||||    
T  30392710 acctaaactcatctctctct 30392729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22172751 - 22172422
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttattt-at-tatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacg 119  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||   ||||||| |     
T  22172751 catgttgttgtgaaactctgtttcatatatgaatatcaatatagttttgattcaattcaattgttattaatgatttttatatactgatcacatataa-ca 22172653  T
Q  120 tgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgttt 219  Q
    ||| |||| ||||||  |||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22172652 tgaattcgtgagaatgaatgattactgaccatagctttcaacttagaccttattgaattgttcaaataaacagggttagtctatgaatggataatcgttt 22172553  T
Q  220 attagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaaggg 319  Q
    ||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||| |||||||    
T  22172552 atttgcgatattaggttaacgttcttaaaaccttcgaagaatattagttcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagagggtcctaagtcaaggg 22172453  T
Q  320 attgattaagactatttt-gttaactatcgt 349  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  22172452 attgattatggctattttagttaactatcgt 22172422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 279
Target Start/End: Original strand, 19827236 - 19827492
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    ||| |||| ||    
T  19827236 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatacaaacatg 19827335  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| | |||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  19827336 atttagtgagaatgaatgactactaaccatagctttctacttagactgaatggaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 19827435  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaa 279  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19827436 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaa 19827492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15447022 - 15446792
Alignment:
Q  111 atataaacgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatgga 210  Q
    |||||||| |||||| | ||||||  || |||| |||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15447022 atataaacatgatttagtgagaatgaattactactgaccataactttctacttagactgaattgaattgttctaataaacagggttagtctatgaatgga 15446923  T
Q  211 taatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtccta 310  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  15446922 taatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttctaagattattggaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtccta 15446824  T
Q  311 actcaagggattgattaagactattttgttaa 342  Q
    | |||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  15446823 agtcaagggattgattataactatttggttaa 15446792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 37740136 - 37739820
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| |||||   ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||  | |    |||||||| ||    
T  37740136 catgttgttgtgaaactctatt-attgtgaatattaatctagtttt-attcaattcaattgttgttaatgctttttatattctaatcaaatataaacatg 37740039  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||||| ||||||  ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37740038 atttcgtgagaatgaatgactactaaccatagctttcaacttagacctaatcgaatttttcaaataaactgggttaatctatgaatggataatcgtttat 37739939  T
Q  222 tagtgatattaa---gttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagg 318  Q
    | |||||||||    ||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || | ||| |||| |||||||| ||||||    
T  37739938 ttgtgatattattaggttaatgtttgtaaaaccttcaaagattattagatcacctaaggaattagggacagtaatctgataagagggtcctaagtcaagg 37739839  T
Q  319 gattgattaagactatttt 337  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  37739838 gattgattagggctatttt 37739820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 111 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27679511 - 27679338
Alignment:
Q  111 atataaacgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatgga 210  Q
    |||||||| |||||| | ||||||  ||||||| ||| |||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27679511 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaacatagctttctacttatacagaattgaattgttctaataaacaaggttagtctaggaatgga 27679412  T
Q  211 taatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 285  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679411 taatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 27679338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 235 - 501
Target Start/End: Original strand, 5706347 - 5706625
Alignment:
Q  235 ttaacgta-cttaaaacctt-caaaga-ttattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagac 331  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  5706347 ttaacgtagcttaaaaccttacaaagaattattagctcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagagtgtcctaactcaagggattgattaggac 5706446  T
Q  332 -tattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagc 421  Q
     ||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |  |||||      
T  5706447 ttattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacattgatgactcgaaagacctagtctca-- 5706544  T
Q  422 tctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
    ||||||    ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||    
T  5706545 tctctccatatatattttccaaaactatctttattttctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcaggca 5706625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 137 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 33493956 - 33493756
Alignment:
Q  137 atgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagtt 236  Q
    ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| || |||    
T  33493956 atgactactgaccatagcttacaatttagacctaattgaattgttcaaataaacagagttagtctaggaatagataatcgtttatttgtgataatatgtt 33493857  T
Q  237 aacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattt 336  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||| | |||| ||| | || ||||||||    
T  33493856 aacgttctttaaacattcaaagaatattagatcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagatggtcctaagttaaggaattaaataggactattt 33493757  T
Q  337 t 337  Q
    |    
T  33493756 t 33493756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 48014424 - 48014167
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    |||    |||||||  ||    
T  48014424 catgttgctgtgaaactatatt-attgtcaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttaatgctttttatcc--tgatcaaatataaatatg 48014329  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    | |||| ||||||  || |||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  48014328 aattcgtgagaatgaataactactgaccataactttcaactttgacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtttaggaatggataatcgtttat 48014229  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattag 283  Q
    | |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  48014228 ttgtgacattaggttaacgttcttaaaaccttcaaataatattagatcacctaaggaattag 48014167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8448921 - 8448745
Alignment:
Q  19 aaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaac 118  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||    ||||||||    
T  8448921 aaacatgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattattgttaatgctttttatatcttgatcaaatataaac 8448822  T
Q  119 gtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacct-aattgaattgttctaataaacatgg 194  Q
     | ||||||  |||||  ||||||| ||  |||||||||  |||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  8448821 atcatttcgtaagaatgaatgactactggtcatagctttctacttagacctaaattgaattgctcaaataaacatgg 8448745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 213 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 5677594 - 5677470
Alignment:
Q  213 atcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaac 312  Q
    ||||| |||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||     
T  5677594 atcgtatatttgtgatacaaggttaacgtccttaaaaccttcaaagaatattagatcacttaaggaattagggactgtaatctgagaagatggtcctaag 5677495  T
Q  313 tcaagggattgattaagactatttt 337  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  5677494 tcaagggattgattaggactatttt 5677470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 313 - 429
Target Start/End: Original strand, 39498346 - 39498471
Alignment:
Q  313 tcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattc 403  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     ||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39498346 tcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacttagatgattc 39498445  T
Q  404 gaaagacatgatctcagctctctctc 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||    
T  39498446 gaaagacctgatctcatctctctctc 39498471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 27691519 - 27691442
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttat 99  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27691519 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttat 27691442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 101
Target Start/End: Original strand, 15438439 - 15438518
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatat 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  15438439 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 15438518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 363 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 15445391 - 15445328
Alignment:
Q  363 gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15445391 gaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctgatctcatctctct 15445328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 363 - 426
Target Start/End: Original strand, 19827511 - 19827574
Alignment:
Q  363 gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19827511 gaatatgtgcattataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctgatctcatctctct 19827574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 88
Target Start/End: Original strand, 18911300 - 18911366
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttctta 88  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18911300 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttctta 18911366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 421 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 19864367 - 19864272
Alignment:
Q  421 ctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactagaataatttac 515  Q
    |||||||||  | ||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  19864367 ctctctctctctctctcttccaaaactatttttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctctggcactaaaataatttac 19864272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 329 - 428
Target Start/End: Original strand, 35510044 - 35510152
Alignment:
Q  329 gactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctca 419  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||    
T  35510044 gactattttgttaactaacgtggaactagtgaatcattcataagaataggtgtagtataccaattaggggaatatagatgattcgaaagacctaaactca 35510143  T
Q  420 gctctctct 428  Q
     ||||||||    
T  35510144 tctctctct 35510152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24410246 - 24410206
Alignment:
Q  160 acttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24410246 acttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtc 24410206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 8871781 - 8871727
Alignment:
Q  373 agtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctc 427  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  8871781 agtataccaattaagggaacttagatgatttgaaagacctgatctcatctctctc 8871727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 5677783 - 5677700
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattga 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||  |||||||||||| | ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||    
T  5677783 catgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-actcaattcatctgttcttaatgctttttatatattga 5677700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 22 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 13450156 - 13449687
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  13450156 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 13450057  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| |||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  13450056 atttagtgagaacgaatgactactgaccc-agctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 13449958  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13449957 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaagggctttagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 13449858  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||     ||||||    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  13449857 tgattagagctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcagtataccaattaggggaccatcgatgattcgaaagacct 13449758  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaa 485  Q
    | |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13449757 gttctca--tctctctccttgtcttttccaaaactatctttattttctgtttatttaattttatgcaatcaaa 13449687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 22 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 23225286 - 23224800
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  23225286 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 23225187  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  23225186 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 23225087  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23225086 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 23224987  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23224986 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 23224887  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
    ||||||| |||||||||   ||  |||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  23224886 gatctcatctctctctc---attctttccaactctatctttacattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctagggca 23224800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 504
Target Start/End: Original strand, 6603192 - 6603679
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  6603192 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 6603291  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  6603292 atttagtgagaacgaatgactattgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 6603391  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6603392 tagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaagaaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 6603491  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||     ||||||    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  6603492 tgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaagactt 6603591  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcacta 504  Q
    |||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6603592 gatctca--tctttgtccttgtcttttccaaaactatc-ttattttctg-ttatttaaatttatgcaatcaaaactactgcctcggacacta 6603679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 22 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 45287449 - 45286964
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  45287449 catgttgctgtgaaactttatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 45287350  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  45287349 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttat 45287250  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  45287249 tagtgatactaggttaacgttcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaactcaagggat 45287151  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  45287150 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattagggaaacatagatgattcgaaagacct 45287051  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
     |||||| ||||||   |||||  |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  45287050 aatctcatctctct---cttattctttccaactctatctttattttctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcgggca 45286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 30 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 2441651 - 2441190
Alignment:
Q  30 tgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcg 129  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||||| | |    
T  2441651 tgtgaaactttatttattatcaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtg 2441552  T
Q  130 agaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgata 229  Q
    ||||   | ||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  2441551 agaacgaaagactactgaccctagctttcgacttagacataattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgata 2441452  T
Q  230 ttaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaag 329  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  2441451 ttaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattaaaccacctaaggaattagggactgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattagg 2441352  T
Q  330 actattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcag 420  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |     ||||||    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  2441351 gctattttgttaactatcgtagaattagaaaatcattaatacgaataggtgcagtataccaattaggagaacatcgatgattcgaaagacctgatctca- 2441253  T
Q  421 ctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaatttta-tgcaatcaaa 485  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  2441252 -tctctctccttat-ttttccaaaactatctttattttctg-ttatttacttttattgcaatcaaa 2441190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Original strand, 8276719 - 8277132
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  8276719 catgttgctgtgaaactctatttattgttaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 8276818  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  8276819 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaattgataatcgtttgt 8276918  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8276919 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctatagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 8277018  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  8277019 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcattataccaattaggggaacatagatgcttcgaaagacct 8277118  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  8277119 gatctcatctctct 8277132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 22 - 452
Target Start/End: Original strand, 16165482 - 16165919
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  16165482 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatg 16165581  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |    
T  16165582 atttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattattctaataaacatggttaatctaggaatgggtaatcgtttgt 16165681  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16165682 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtaatctgagaagagggtcctaactcaagggat 16165781  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||| |     ||||||    | |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  16165782 tgattagggctattttgttaactatcgttgaattagagaatcattaatacaaataggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaagacct 16165881  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctt 452  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16165882 gatctca--tctctctccttgtcttttccaaaactatctt 16165919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Original strand, 17730548 - 17730960
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  17730548 catgttgctgtgaaactctacttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgatttttatatcctgatcaaatataaacatg 17730647  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | || |||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  17730648 atttagtgaaaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 17730747  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    || |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  17730748 taatgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctatagtttgagaagagggtcctaagttaagggat 17730846  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17730847 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattagggaaacatagatgattcgaaagacat 17730946  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  17730947 gatctcatctctct 17730960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 22 - 409
Target Start/End: Original strand, 48645208 - 48645603
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  48645208 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaaatcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 48645307  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | || ||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  48645308 atttagtgataacgaatgactactgaccatagcttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 48645407  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    || |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48645408 tactgatattaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 48645506  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaaga 409  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||| ||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48645507 tgattagggctattttgttaaccatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaaga 48645603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 4596389 - 4595977
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  | |    |||||||| ||    
T  4596389 catgttgctctgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatg 4596290  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| |    
T  4596289 atttagtgagaatgaatgactattgaccatagttttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgaataattgtttgt 4596190  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  4596189 tagtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccaactaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcttaagtcaagggat 4596091  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||     |||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4596090 tgattatgactatttttttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaatatgtgaagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 4595991  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  4595990 gatctcatctctct 4595977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 9865107 - 9864694
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  9865107 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatgtagtttttattcaattcaattgttcttattgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 9865008  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  9865007 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 9864908  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9864907 tagtgatattaagttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattatgggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 9864808  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||     ||||||    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |    
T  9864807 tgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgtagtataccaattagggatacatagatgatttgaaagacct 9864708  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  9864707 gatctcatctctct 9864694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Original strand, 13842374 - 13842788
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  13842374 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 13842473  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  13842474 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctctcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatagataatcgtttgt 13842573  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  13842574 tagtgatattaggttaacgttcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgaggagagggtcctaattcaagggat 13842672  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |     ||||||    |||||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |    
T  13842673 tgattagggctattttgttaactatcgtggaattagaaaatcattaatacgaataggtgcagtataccaattacgggaatatcgatgattcgaaagacct 13842772  T
Q  413 gatctcagctctctct 428  Q
    ||||||| ||||||||    
T  13842773 gatctcatctctctct 13842788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 426
Target Start/End: Original strand, 20594007 - 20594409
Alignment:
Q  32 tgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcgag 131  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||  |||||| | |||    
T  20594007 tgaaactctatttattgtgaatgacattctagttcttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaatatgatttagtgag 20594106  T
Q  132 aattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatatt 231  Q
    |||  ||||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20594107 aatgaatgactactgaccataactttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtgtaagaatggataatcgttttttagtgatatt 20594206  T
Q  232 aagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagac 331  Q
    | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  20594207 aggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattaggac 20594305  T
Q  332 tattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagct 422  Q
    ||||||||||||||||||| ||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  20594306 tattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaatacgtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctgatctcatct 20594405  T
Q  423 ctct 426  Q
    ||||    
T  20594406 ctct 20594409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 9133140 - 9132744
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  |||    |||||||| ||    
T  9133140 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttctatatcctgatcaaatataaacatg 9133041  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  9133040 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaatggaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcatttat 9132941  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||||||||||||||||    
T  9132940 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggat 9132842  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagac 410  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9132841 tgattatgactattttgttaactatcgtggaactagtgaatcattcataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagac 9132744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 419
Target Start/End: Original strand, 4546603 - 4547008
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  4546603 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaattacaatctagttttcattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatg 4546702  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| ||||||| |||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  4546703 atttagtgagaatgaatgactactgaccattgctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataattgtttgt 4546802  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4546803 tagtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggat 4546901  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  4546902 tgattaggattattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtatatcaattagggaaacatagatgattcgaaagacct 4547001  T
Q  413 gatctca 419  Q
    |||||||    
T  4547002 gatctca 4547008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Original strand, 26557234 - 26557645
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  | |    |||||||| ||    
T  26557234 catgttgctgtgaaactctatttaatgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttt-atatcctaatcaaatataaacatg 26557332  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |    
T  26557333 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtttaggaatggataatcgtttgt 26557432  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |||||||||    
T  26557433 tagtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactgtagtttgagaagagggttctatgtcaagggat 26557531  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  26557532 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattagggaaacatagatgactcgaaagacct 26557631  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  26557632 gatctcatctctct 26557645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 38 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 37415789 - 37415340
Alignment:
Q  38 tttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcgagaattga 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  |||    |||||||| |||||| | |||||   |    
T  37415789 tttatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgtttttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaa 37415690  T
Q  138 tgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagtta 237  Q
    |||||| | ||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  37415689 tgactactaaccctaactttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatactaggtta 37415590  T
Q  238 acgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaa--ggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactatt 335  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  37415589 acgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaactcaagagattgattaggactatt 37415491  T
Q  336 ttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
    |||||||||||| |||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  37415490 ttgttaactatcatggaactagagaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctgatctcatctctct 37415391  T
Q  427 ctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaa 480  Q
       |||||  |||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  37415390 ---cttattctttccaactctatctttacattctgtttatttaattttatgcaa 37415340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 23 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 5242532 - 5242061
Alignment:
Q  23 atgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtga 122  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||| |  |||||||| |||    
T  5242532 atgttgttgtgaaactctatctattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatagaatataaacatga 5242433  T
Q  123 tttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttatt 222  Q
    ||||| || |||  ||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||    
T  5242432 tttcgtgataatgaatgactgctgaccctagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtccaagaatggatactcatttatt 5242333  T
Q  223 agtgatattaagttaacgtac-ttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
     |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| | |||||||| |||||||||    
T  5242332 tgtgatattaagttaacgttctttaaaatcttcaaagaatattagaccacctaaggaattaggggctgtagtctgagaatagggtcctaagtcaagggat 5242233  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattcg-----aatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagaca 411  Q
    || ||| |  |||||||||||| || ||| ||||     ||||||||     |||| ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||     
T  5242232 tggttatggatattttgttaaccatagtgaaactagagaatcattcgtaagaaataggtgcagtataccaattaagggaactcagaagattcgaaagacc 5242133  T
Q  412 tgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaa 485  Q
    ||||||||  |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5242132 tgatctca--tctctctctttatttttgccaaaactatctttattttatgtttatttaattttgtgcaatcaaa 5242061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 30 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 14683816 - 14683412
Alignment:
Q  30 tgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcg 129  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||||| | |    
T  14683816 tgtgaaactttatttactgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtg 14683717  T
Q  130 agaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgata 229  Q
    ||||   ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  14683716 agaacgaatgactagtgaccataacttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgcataatcatttattagtgata 14683617  T
Q  230 ttaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaag 329  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| || || |   |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  14683616 ttaggttaacgtgctt-aaaccttcaataactattagaccacctatggaattaggggctgtaatcctagaagagggtcctaactcaagggattgattatg 14683518  T
Q  330 actattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcag 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||     |||||||    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  14683517 actattttgttaactatcgtggaactagtgaatcattcataagaatagatgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctgatctcat 14683418  T
Q  421 ctctct 426  Q
    ||||||    
T  14683417 ctctct 14683412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 18 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 26136512 - 26136094
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  26136512 gaaacatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 26136413  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26136412 catgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacgtaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgt 26136313  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    || |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||| |||||||||| |||    
T  26136312 ttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggctttaaccctagaagagggtcctaactgaag 26136214  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||     || |||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26136213 ggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagtgactctttcacaagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 26136114  T
Q  409 acatgatctcagctctctct 428  Q
    || | | |||| ||||||||    
T  26136113 acctaaactcatctctctct 26136094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 26144892 - 26144474
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  26144892 gaaacatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 26144793  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26144792 catgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacgtaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgt 26144693  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    || |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||     |||||| |||||||||| |||    
T  26144692 ttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttactagaccacctaaggaattaggggctttaaccctagaagagggtcctaactgaag 26144594  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||     || |||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26144593 ggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagtgactctttcacaagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 26144494  T
Q  409 acatgatctcagctctctct 428  Q
    || | | |||| ||||||||    
T  26144493 acctaaactcatctctctct 26144474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 3068361 - 3067961
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    ||||||     
T  3068361 gaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaataacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataat 3068262  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  3068261 catgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaatatacatggttagtctaggaatggataatctt 3068162  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||     |||||| ||||||||||||||    
T  3068161 ttattagtgatattaggttaatgtgctt-aaaccttcaacgattattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaag 3068063  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||     ||||||    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3068062 ggattgattaggactattttgttaactatcatagaactagtgagtcattcacaagaataggtgcagtataacaattaggggaacatagatgattcgaaag 3067963  T
Q  409 ac 410  Q
    ||    
T  3067962 ac 3067961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 409
Target Start/End: Original strand, 10468874 - 10469273
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  10468874 gaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgtttttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 10468973  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||||| |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  10468974 catgatttcgtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatagataatcct 10469073  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||     |||||| ||||||||||||||    
T  10469074 ttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaag 10469172  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta---------tcattcgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||         |||   ||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10469173 ggattgattaggactatttttttaactatcatggaactagaaaagaattcacaagaataggtgcagtgtactaattaggggaacatagatgattcgaaag 10469272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 20081102 - 20080684
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  20081102 gaaacaagttgctgtgaaactctatttattgtgaatgataatctaatttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 20081003  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | |||||   ||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  20081002 catgatttagtgagaacgaatggctactgaccctagctttcgacttagacctaattgagttgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcct 20080903  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || ||     |||||  ||||||||||||||    
T  20080902 ttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcagcgattattagaccacctaagaaattagggtctataaccctagaagggggtcctaactcaag 20080804  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||     ||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20080803 ggattgattaggactattttgttaactatcgttgaactagtgactcattcagaagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 20080704  T
Q  409 acatgatctcagctctctct 428  Q
    || | | |||| ||||||||    
T  20080703 acttaaactcatctctctct 20080684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 37166527 - 37166131
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    |||||||  ||    
T  37166527 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaacgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaatatg 37166428  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   | ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  37166427 atttagtgagaacgaacgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcatttat 37166328  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||     ||||||  |||||||||||||||||    
T  37166327 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaacattcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccctagaagagagtcctaactcaagggat 37166229  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagac 410  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||     ||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37166228 tgattaggactactttgttaactatcgtaaaactagggactcattcacaagaataggtgcagtataccaattaggggaacataaatgattcgaaagac 37166131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 13809897 - 13809483
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  13809897 gaaacatgttgatgtgaaactctatctattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattatgatcaaatataaa 13809798  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||     ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13809797 catgatttcatgagaatgaatgactattggccatagctttcaactcagacctaattg-----ttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatcgt 13809703  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |  | || | |||||||| |||||||| |||||    
T  13809702 ttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaagagtattaggccacataaggaattagaggttgtaatatgagaagagggtcctaagtcaag 13809603  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattcg-----aatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaa 407  Q
    |||||||| | | ||||||||||||| |||||| ||||     ||||||||     |||| ||| ||||||||||||| |||||   ||| |||||||||    
T  13809602 ggattgatcagggctattttgttaaccatcgtgaaactagagaatcattcgtaataaataggtgcagtataccaattaagggaa-tcagaggattcgaaa 13809504  T
Q  408 gacatgatctcagctctctct 428  Q
    ||| |||||||| ||||||||    
T  13809503 gacttgatctcatctctctct 13809483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 356
Target Start/End: Original strand, 7227257 - 7227595
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  7227257 gaaacatgttgctatgaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 7227356  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  7227357 cattatttcgtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgagttgttcaaataaacatggctagcctagcaatggataatcgt 7227456  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| | || || || ||||| | |||||||| |||||    
T  7227457 ttatttgagatattaagttaacgttcgtaaaaccttcaaagaatattagatcatataaggaattagaggctgtaattggagaatagggtcctaagtcaag 7227556  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta 356  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| |||||| |||||    
T  7227557 ggattgattatggttattttgttaaccatcgtgaaacta 7227595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11398406 - 11398143
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  11398406 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttgttcagttcaattgttctgaatgttttttatattctgatcaaatataaacatg 11398307  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  11398306 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaagagtggataatcgtttgt 11398207  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 285  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11398206 tagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 11398143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 217 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 45290665 - 45290375
Alignment:
Q  217 tttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaa 316  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  45290665 tttattagtgatactaggttaacgttcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaactcaa 45290567  T
Q  317 gggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaa 407  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290566 gggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaa 45290467  T
Q  408 gacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
    ||| | |||||| ||||||   |||||  |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  45290466 gacctaatctcatctctct---cttattctttccaactctatctttattttctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcgggca 45290375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 285
Target Start/End: Original strand, 10344944 - 10345210
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| | ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  10344944 gaaacatgttgctttgaaactctacttattgtgaatgataatctagtttttattccattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaa 10345043  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | |||||    |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  10345044 catgatttagtgagaacgactgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaagaatggataatcct 10345143  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10345144 ttattagtgatattaagttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattagaccatctaaggaattaggg 10345210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 259
Target Start/End: Original strand, 4695258 - 4695494
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  4695258 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttattaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 4695357  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  4695358 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacacatttgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 4695457  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaaga 259  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  4695458 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaga 4695494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 5796287 - 5796590
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| |||||||||  || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  5796287 catgttgctgtgaaactc-atctattatgaataacaatctagtttt-attcaattcaattattcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatg 5796384  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5796385 attttgtgagaatgaatacctgctgaccatagctttcaacttagacctaattgagtttttcaaataaaaagggttagtctatgaatgaataatcgtttat 5796484  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    | ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | || | ||| |||| |||||||| |||||||||    
T  5796485 ttgtgatataatgttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaaggaattagagattgtaatatgataagagggtcctaagtcaagggat 5796584  T
Q  322 tgatta 327  Q
    ||||||    
T  5796585 tgatta 5796590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 160 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 9271700 - 9271433
Alignment:
Q  160 acttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaaga 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  9271700 acttagacctaattgaattgttctaataaacaa-------ctaggaatggataatcgtttgttagtgatatttggttaacgtgcttaaa-ccttcaaaga 9271609  T
Q  260 ttattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact---- 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||        
T  9271608 ttattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggacctaactcaagggattgattaggagtattttcttaactatcgtggaactagaa 9271509  T
Q  356 -atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||    
T  9271508 aatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattctaaatacctgttctcatctctct 9271433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 247 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 11920021 - 11919833
Alignment:
Q  247 aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactat 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11920021 aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttacctat 11919922  T
Q  347 cgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
    |||||||||     |||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11919921 cgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctgatctcatctctct 11919833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 37423321 - 37423083
Alignment:
Q  38 tttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcgagaattga 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  |||    |||||||| |||||| | |||||   |    
T  37423321 tttatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgtttttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaa 37423222  T
Q  138 tgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagtta 237  Q
    |||||| | ||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  37423221 tgactactaaccctaactttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatactaggtta 37423122  T
Q  238 acgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaagg 277  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37423121 acgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaagg 37423083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 65 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18562871 - 18562586
Alignment:
Q  65 ttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaactta 164  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  | | |  |||||||| || |||   ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18562871 ttttattcaattcagttgttcttaatgctttttatatccttataaaatataaacatgttttattgagaatgaatgactactgaccatagctttcaactta 18562772  T
Q  165 gacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattatt 264  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| || | ||||    
T  18562771 gacctaattgaattgttcaattaaacagggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcgaataatatt 18562672  T
Q  265 agaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactatttt-gttaactatcgt 349  Q
    ||  |||||||||||||||||||| || | ||||||||  ||||||| |||| ||||| || | | ||||||| ||||||||||||    
T  18562671 agctcacctaaggaattagggactgtaatatgagaagagagtcctaagtcaaaggattaatcagggctattttagttaactatcgt 18562586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22611991 - 22611771
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    |||||||    
T  22611991 gaaacatgttgttgcgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattttgatcaaatataaa 22611892  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  22611891 catgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttacacctaattgaattattctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcct 22611792  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaa 238  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  22611791 ttattagtgatattaggttaa 22611771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 225 - 426
Target Start/End: Original strand, 4542734 - 4542943
Alignment:
Q  225 tgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattga 324  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||    
T  4542734 tgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccaactaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaggtcaagggattga 4542832  T
Q  325 ttaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgat 415  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4542833 ttagaattattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcggaagacctgat 4542932  T
Q  416 ctcagctctct 426  Q
    |||| ||||||    
T  4542933 ctcatctctct 4542943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 274 - 408
Target Start/End: Original strand, 35961076 - 35961219
Alignment:
Q  274 aaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----ga 364  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||     |||||||    ||    
T  35961076 aaggaattaggggctatagtttgagaagagggtcctaaatcaagggattgattaggactattttgttgactatcgtggaactagaaaatcattcataaga 35961175  T
Q  365 atatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35961176 ataggtgcagtataccaattagaggaacatagatgattcgaaag 35961219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 299 - 424
Target Start/End: Original strand, 4695491 - 4695625
Alignment:
Q  299 aagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattagggg 389  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||||     ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4695491 aagagggtcctaagtcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattgataagaataggtgcagtataccaattagggg 4695590  T
Q  390 aacatagatgattcgaaagacatgatctcagctct 424  Q
    || |||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  4695591 aatatagatgattcgaaagacctggtctcatctct 4695625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 9273500 - 9273369
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  9273500 catgttgctgtgaaactatatttattgtgaatgactatctagtttttattcaattcaattgttcttaatattttttatatcctgatcaaatataaacatg 9273401  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatag 153  Q
    |||| | ||||||  |||||| ||||||||||    
T  9273400 atttagtgagaatgaatgactgttgaccatag 9273369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 137 - 286
Target Start/End: Original strand, 24918043 - 24918192
Alignment:
Q  137 atgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagtt 236  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||| | |||||| || | ||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||    
T  24918043 atgactactgaccaaagctttcaacttagacataattggattgttcaattaaacagggcttgtctatgaatggataatcgtttaattgtaatattaggtt 24918142  T
Q  237 aacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggga 286  Q
    |||    | ||||| ||||  || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24918143 aacactttgaaaactttcagggaatattagaccacataaggaattaggga 24918192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 11398070 - 11397993
Alignment:
Q  373 agtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctt 452  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  11398070 agtataccaattaggggaacatcgatgaatcgaaagacctaatctca--tctctctcattgtcttttccaaaactatctt 11397993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 45290787 - 45290715
Alignment:
Q  29 ttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatat 101  Q
    |||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  45290787 ttgtaaaactctctttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 45290715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 428
Target Start/End: Original strand, 10345278 - 10345343
Alignment:
Q  363 gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctct 428  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  10345278 gaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctaaactcatctctctct 10345343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 81
Target Start/End: Original strand, 9080907 - 9080970
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatt 81  Q
    |||| ||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9080907 gaaagatgttgccgtgaaactctatttattgtcaatgacaatctagtttttattcaattcaatt 9080970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 22 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 26753077 - 26752589
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  26753077 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 26752978  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  || |||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  26752977 atttagtgagaatgaattactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 26752878  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26752877 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 26752778  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  26752777 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaaaaggtgcagtataccaattaggggaacataaatgattcgaaagacct 26752678  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcacta 504  Q
    ||||||| ||||||   |||||  |||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26752677 gatctcatctctct---cttattctttccaactctatctttatattctgtttatttaattttatgcaatcaaaaccactacctcgggcacta 26752589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 491
Target Start/End: Original strand, 43491498 - 43491978
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  43491498 gaaacatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaattgttattaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 43491597  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
      |||||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43491598 tatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgt 43491697  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    || |||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  43491698 ttgttagtgatattaggttaacgtgcataaaatcttcaaagattattaaaccacctaaggaattagggggtctagtttgagaagagggttctaactcaag 43491797  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     |||||||     ||||  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43491798 ggattgattagaactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataaaaatagatgcaatataccgattaggggaacatagatgattcgaaag 43491897  T
Q  409 acatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactact 491  Q
    || ||||||||  |||||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43491898 acctgatctca--tctctctcttattcttttccaaaactatctttattttctatttatttaattttatgcaatcaaaactact 43491978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 504
Target Start/End: Original strand, 7624849 - 7625337
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  7624849 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 7624948  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  7624949 atttagtgagaacaaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtttgt 7625048  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7625049 tagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattagaggctgtagtttgagaagagagtcctaactcaagggat 7625148  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||     ||||||    | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  7625149 tgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacaaataggtgtagtataccaattaggggaacatcgatgatttgaaagacct 7625248  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttattta-attttatgcaatcaaaactacttcctcgggcacta 504  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7625249 gatctca--tctctctccttgtcttttccaaaactatc-ttattttctg-ttatttactttttatgcaatcaaaactactgcctcgggcacta 7625337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 14016514 - 14016027
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  14016514 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 14016415  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  14016414 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 14016315  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| |||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14016314 tagtgatattaggttaaagtgctttaaaccttcgagaattattaaaccacctaagaaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 14016215  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||||||     ||||||    |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  14016214 tgattagggctattttgttaactaccgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcactataccaattaggggaacatcgatgattcgaaagacct 14016115  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcacta 504  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14016114 gatctca--tctctctccttgtcttttccaaaactatc-ttattttctg-ttatttaaatttatgcaatcaaaactactgcctcgggcacta 14016027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 41877140 - 41876727
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  41877140 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgtttttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 41877041  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  41877040 atttagtgagaaagaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 41876941  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41876940 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 41876841  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta---------tcattcgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||         ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41876840 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaattattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 41876741  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  41876740 gatctcatctctct 41876727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 22 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 41306902 - 41306438
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  41306902 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctaatttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 41306803  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    ||||    |||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |    
T  41306802 atttaataagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggtatggataatcgtttgt 41306703  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  41306702 tagtgatattaggttaacatgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgaaaagagggtcctaactcaagggat 41306604  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||     |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  41306603 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataaaaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagaccc 41306504  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaa 480  Q
    ||||| |  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41306503 gatctta--tctctctctttatcttttccaaaattatctttattttctgtttatttaattttatgcaa 41306438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Original strand, 18952440 - 18952854
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  18952440 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgtttttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatg 18952539  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |    
T  18952540 atttagtgagaacgaatgactaatgaccatagctttcgacttagatctaattgaattgttctaataaacatggttagtttaggaatggataattgtttgt 18952639  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18952640 tagtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 18952738  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  18952739 tgattatgactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacatagatgatttgaaagattt 18952838  T
Q  413 gatctcagctctctct 428  Q
    ||||||| ||||||||    
T  18952839 gatctcatctctctct 18952854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 25 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 22937310 - 22936842
Alignment:
Q  25 gttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatt 124  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    |||||||| |||||    
T  22937310 gttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcattttatatcctgatcaaatataaacatgatt 22937211  T
Q  125 tcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattag 224  Q
    | | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22937210 tagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttag 22937111  T
Q  225 tgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattga 324  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22937110 tgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagagggtcctaactaaagggattga 22937011  T
Q  325 ttaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgat 415  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |  |    
T  22937010 ttaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacattgatgactcgaaagacctagt 22936911  T
Q  416 ctcagctctctctccttatcttttccaaaactatcttta-tcatctgtttatttaattttatgcaatcaaa 485  Q
    ||||  ||||||    ||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22936910 ctca--tctctccatatatattttccaaaactatctttatttttctgtttatttaattttatgcaatcaaa 22936842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 419
Target Start/End: Original strand, 7270763 - 7271168
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||     |||||||| ||    
T  7270763 catgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttctattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctggtcaaatataaacatg 7270862  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7270863 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattgaattgttctaacaaacatggttagtctatgaatggataatcgtttgt 7270962  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||  | ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7270963 tagtgatattgggctaacgtgtttaaa-ccttcaaagattatcagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 7271061  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| |||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7271062 tgattagaactattttgttaactatcatggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 7271161  T
Q  413 gatctca 419  Q
    |||||||    
T  7271162 gatctca 7271168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Original strand, 17664299 - 17664710
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  17664299 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 17664398  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  17664399 atttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagatctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatcgataatcctttat 17664498  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || | | |||||| ||||||||||||||||||    
T  17664499 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtaatcttagaagagggtcctaactcaagggat 17664597  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcat---tcgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatg 413  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||   | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  17664598 tgattatgactattttgttaactatcgtggaactagtgaatcatacatagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagataattcaaaagacctg 17664697  T
Q  414 atctcagctctct 426  Q
    |||||| ||||||    
T  17664698 atctcatctctct 17664710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 428
Target Start/End: Original strand, 20055522 - 20055935
Alignment:
Q  23 atgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtga 122  Q
    |||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||    
T  20055522 atgttgctgtgaaactctatttatcgtgaatgacaatcaagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatga 20055621  T
Q  123 tttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttatt 222  Q
    ||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  20055622 tttagtgagaaagaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgtt 20055721  T
Q  223 agtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggatt 322  Q
    |||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20055722 agtgatattaggttaacgtgctttaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagacggtcctaactcacgggatt 20055820  T
Q  323 gattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatg 413  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  20055821 gattaggattattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctc 20055920  T
Q  414 atctcagctctctct 428  Q
    ||||||  |||||||    
T  20055921 atctcatatctctct 20055935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 21333057 - 21332586
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacg-- 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||  |||    |||||||        
T  21333057 catgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgctcttaatgctttttatatcatgatcaaatataaaaaga 21332958  T
Q  120 tgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgttt 219  Q
    |||||| | ||||||  ||||||| |||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21332957 tgatttagtgagaataaatgactactgactatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctatgaatggataatcgttt 21332858  T
Q  220 attagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaaggg 319  Q
     |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||| |     
T  21332857 gttagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagatcatctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaagtcaatga 21332759  T
Q  320 attgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagac 410  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21332758 attgattaggactattttattaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagac 21332659  T
Q  411 atgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaatttta-tgcaatcaaa 485  Q
     ||||||||  |||||||| |  || |||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  21332658 ctgatctca--tctctctcttattcctttccaaaactatctttattttctg-ttatttacttttattgcaatcaaa 21332586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 480
Target Start/End: Original strand, 31863442 - 31863925
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaa-tggtttttatatattgacaccatataa 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||  |||    ||||||    
T  31863442 gaaacatgttgctgtgaaactttatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaaatgctttttatatcctgatcaaatataa 31863541  T
Q  117 acgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatc- 215  Q
    || |||||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  31863542 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattattctaataaacatggttagtctaggaatggataatca 31863641  T
Q  216 -------------gtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaaga 302  Q
                 |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  31863642 tttgttagtgatcgtttgttagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctatagtttgagaaga 31863741  T
Q  303 aggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaaca 393  Q
     | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  31863742 ggatcctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtatatcaattaggggaaca 31863841  T
Q  394 tagatgattcgaaagacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaa 480  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||   |||||  |||||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  31863842 tagatgattcgaaagacctagtctcatctctct---cttattctttccaactctatctttatattatgtttatttaattttatgcaa 31863925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 31 - 485
Target Start/End: Original strand, 42062677 - 42063137
Alignment:
Q  31 gtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcga 130  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  | |    |||||||| |||||| | ||    
T  42062677 gtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtga 42062776  T
Q  131 gaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatat 230  Q
    |||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  42062777 gaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatat 42062876  T
Q  231 taagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaaga 330  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  42062877 taggttaacgtgcttaaaaccttcaaagaatattagttcacctaaggaattagggactgtaatatgagaagagggtcctaactcaagagattgattagga 42062976  T
Q  331 ctattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |  |||||      
T  42062977 ctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattagggaaacatagatgattcaaaagacctagtctca-- 42063074  T
Q  422 tctctctcct-tatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaatttta-tgcaatcaaa 485  Q
      |||||| | ||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  42063075 --tctctcatatatattttccaaaactatctttattttctg-ttatttacttttattgcaatcaaa 42063137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 26895979 - 26895565
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||||||| ||||    |||||||| ||    
T  26895979 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttctatttaattcagttgttcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaacatg 26895880  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||    |||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  26895879 atttagtgagaacgattgactactgaccatagctttcgacttagacataattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 26895780  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  26895779 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagaggctgtagtttgagaagagagtcttaactcaagggat 26895681  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||     |||||||    ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26895680 tgattaggactattttgttaattatcgttgaactaaaaaatcattcataagaataggtgcaacataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 26895581  T
Q  413 gatctcagctctctct 428  Q
    ||||||| ||||||||    
T  26895580 gatctcatctctctct 26895565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 419
Target Start/End: Original strand, 33551868 - 33552273
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattga-caccatataaacgt 120  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||| ||  |||||||| |    
T  33551868 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaaatataaacat 33551967  T
Q  121 gatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgttta 220  Q
    ||||| | || |||  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  33551968 gatttagtgataatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattgaattgttctaacaaatatggtcagtctaggaatggataatcgtttg 33552067  T
Q  221 ttagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaaggga 320  Q
    |||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33552068 ttagtgatattaggttaatgtgctt-aaaccttcaaagatta-tagaccacttaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaaggga 33552165  T
Q  321 ttgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagaca 411  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33552166 ttgattatgactattttgttaactatcgtggaattagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacc 33552265  T
Q  412 tgatctca 419  Q
    ||||||||    
T  33552266 tgatctca 33552273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Original strand, 34831510 - 34831923
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggttttt-atatattgacaccatataaacgt 120  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |  |||    |||||||| |    
T  34831510 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttttatttcctgatcaaatataaacat 34831609  T
Q  121 gatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgttta 220  Q
    ||||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||     
T  34831610 gatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttg 34831709  T
Q  221 ttagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaaggga 320  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34831710 ttagtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaactcaaggga 34831808  T
Q  321 ttgattaagactattttgttaactatcgtggaacta---------tcattcgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagaca 411  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||         ||||  ||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||     
T  34831809 ttgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaattattcataagaataggtgcattataccaattaggggaactcagaagattcgaaagacc 34831908  T
Q  412 tgatctcagctctct 426  Q
    | |||||| ||||||    
T  34831909 taatctcatctctct 34831923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 21336073 - 21335634
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  21336073 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaataacaatatagttttaattcaattcaattgctcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 21335974  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||| ||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  21335973 atttagtgagaatgaatgactactgactataactttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctataaatggataatcgtttgt 21335874  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||| ||||    
T  21335873 tagtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagatcacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagacggttctaagtcaaaggat 21335775  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21335774 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgcagtatacaaattaggggaacatagatgattcgaaagactt 21335675  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttat 455  Q
    | |||||  |||||| | |  || |||||||||||||||||||    
T  21335674 ggtctca--tctctcgcttattcctttccaaaactatctttat 21335634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 18 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 34133362 - 34132944
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  34133362 gaaacatgttgctgtgaaactttattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 34133263  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
      |||||| | |||||   ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  34133262 tatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcct 34133163  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||||||||||||    
T  34133162 ttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaag 34133064  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||     || |||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34133063 ggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagtgactctttcacaagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 34132964  T
Q  409 acatgatctcagctctctct 428  Q
    || | | |||| ||||||||    
T  34132963 acctaaactcatctctctct 34132944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 18 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 34143593 - 34143175
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  34143593 gaaacatgttgctgtgaaactttattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 34143494  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
      |||||| | |||||   ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  34143493 tatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcct 34143394  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||||||||||||    
T  34143393 ttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaag 34143295  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||     || |||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34143294 ggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagtgactctttcacaagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 34143195  T
Q  409 acatgatctcagctctctct 428  Q
    || | | |||| ||||||||    
T  34143194 acctaaactcatctctctct 34143175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 26907834 - 26907415
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    |||||||    
T  26907834 gaaacatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagttttaattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaa 26907735  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  26907734 catgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacttaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcct 26907635  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |  | ||     |||||| ||||||||||||||    
T  26907634 ttattggtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattagaccacctaaggaattacaggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaag 26907536  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26907535 ggattgattatgactattttgttaactatcgtagaactaatgaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 26907436  T
Q  409 acatgatctcagctctctctc 429  Q
    || | | |||| |||||||||    
T  26907435 acctaaactcatctctctctc 26907415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 428
Target Start/End: Original strand, 12087701 - 12088119
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  12087701 gaaacatgttgctgtgaaactttattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 12087800  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
      |||||| | |||||   ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12087801 tatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcct 12087900  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||     |||||| ||||||||||||||    
T  12087901 ttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaag 12087999  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||     || |||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12088000 ggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagtgactctttcacaagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 12088099  T
Q  409 acatgatctcagctctctct 428  Q
    || | | |||| ||||||||    
T  12088100 acctaaactcatctctctct 12088119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 410
Target Start/End: Original strand, 40582996 - 40583392
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||  ||    
T  40582996 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatg 40583095  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  40583096 atttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattaaattgttctaataaagatggttagtctaggaatagataatcgtttct 40583195  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  40583196 tagtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcgaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttaagaagagggtcataactcaagggat 40583294  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagac 410  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  40583295 tgattaggactattttgttaactatcgtggaattatagaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggagaacatcgaggattcgaaagac 40583392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 14376189 - 14375715
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtga--aactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatata 115  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  |||    |||||    
T  14376189 gaaacatgttgctgtgagaaactttatttattgcgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttgttatattctgatcaaatata 14376090  T
Q  116 aacgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatc 215  Q
    ||| |||||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14376089 aacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 14375990  T
Q  216 gtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaag-------------a 302  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||             |    
T  14375989 gtttgctagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggtctgtagtttgagtagagggtcctaactca 14375891  T
Q  303 aggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaaca 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||     |||||||     |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14375890 aggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcatggaactagaaaatcattcataaaaataggtgcagtataccaattaggggaaca 14375791  T
Q  394 tagatgattcgaaagacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaat 471  Q
    | ||||| ||||||||| |  |||||  ||||||    ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14375790 ttgatgactcgaaagacctagtctca--tctctccatatatattttccaaaactatctttattttctgtttatttaat 14375715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 4099897 - 4099496
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaattt-----ttcttaatggtttttatatattgacaccatataa 116  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||| |||||||||  |||    ||||||    
T  4099897 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataa 4099798  T
Q  117 acgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcg 216  Q
    || |||||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4099797 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttatacataattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 4099698  T
Q  217 tttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaa 316  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  4099697 tttgttagtgatattaggttaacgtgctt-aaatcttcaaatattattagaccacctaaagaattaggggctgtagtttgagaagagggtcttaagtcaa 4099599  T
Q  317 gggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaa 407  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4099598 gggattgattatgactattttgctaactatcgtgcaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaa 4099499  T
Q  408 gac 410  Q
    |||    
T  4099498 gac 4099496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 12058867 - 12058453
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||     |||||||  ||    
T  12058867 catgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacattctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctggtcaaatataaatatg 12058768  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12058767 atttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttaaacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttat 12058668  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||||||||||||||||    
T  12058667 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggat 12058569  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||     || |||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12058568 tgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagggactctttcacaagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 12058469  T
Q  413 gatctcagctctctct 428  Q
     | |||| ||||||||    
T  12058468 aaactcatctctctct 12058453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 43 - 327
Target Start/End: Original strand, 2837071 - 2837355
Alignment:
Q  43 ttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcgagaattgatgact 142  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   ||    |||||||| |||||| |  |||||  ||||||    
T  2837071 ttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcccgatcaaatataaacatgatttagtcagaatgaatgact 2837170  T
Q  143 attgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgta 242  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  2837171 actgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtttatgaatggataatcgtttattagtgataataggttaacgtt 2837270  T
Q  243 cttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgatta 327  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2837271 cataaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgagaagagggtcctaaatcaagggattgatta 2837355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 18239874 - 18239383
Alignment:
Q  19 aaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaac 118  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||  |  ||  ||||||||    
T  18239874 aaacatgttattgtgaaactctatctattgtgaatgaaaatctactttttattaaattcaattgttcttcatgctttttatatcctatcaa-atataaac 18239776  T
Q  119 gtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtt 218  Q
     |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  18239775 atgatttcgtgagaatgaatgactactgaccatagctttgaacttagacctaattgaattgttcaaataaacaaggctagtctaggaatggataatcgtt 18239676  T
Q  219 tattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagg 318  Q
    |||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||| | ||| |||  |||||||| ||||||    
T  18239675 tatatgtaatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaagagtattagaccacctaagaaattaggggttttactctgacaagggggtcctaagtcaagg 18239576  T
Q  319 gattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattcg-----aatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||     |||| ||| |||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  18239575 gattgattagggctattttgttaattatcgtgaaactagagaatcattcgaaagaaataggtgcagtacaccaattaggggaactcagaggattcgaaag 18239476  T
Q  409 acatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcactagaat 508  Q
    || || ||||              |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  ||||| | |||    
T  18239475 acctgttctc--------------atcttttccaaaactatctttattttctgtttatttcattttatgcaatcaaatctactgccttaggcaccaaaat 18239390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 426
Target Start/End: Original strand, 39192095 - 39192489
Alignment:
Q  42 tttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcgagaattgatgac 141  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||  ||||||   |||||   |||||    
T  39192095 tttattgtgaatgataatctaatttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttaatgagaacaaatgac 39192194  T
Q  142 tattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgt 241  Q
    ||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  39192195 tattgaccatagctttcgacctagatctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatagataatcgtttgttagtgatattaggttaatgt 39192294  T
Q  242 acttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgtta 341  Q
     ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39192295 gctt-aaaccttgaaagattattataccacctaaggaattaggggttgtagtttaagaagagggtcttaactcaagggattgattatgactattttgtta 39192393  T
Q  342 actatcgtggaact-------atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
    ||||||||| ||||       |||||||    ||||| ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  39192394 actatcgtgcaactagagagaatcattcataagaatacgtgcattatatcaattaggggaacattgatgattcgaaagatctgatctcatctctct 39192489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 409
Target Start/End: Original strand, 17748187 - 17748582
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  17748187 catgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 17748286  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17748287 atttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagaactaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttat 17748386  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| | | |||||||| ||| |||| |||||||| || ||     |||||| ||||||||||||||||||    
T  17748387 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcgacggttattagatcacttaagaaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggat 17748485  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaaga 409  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||     ||||||     |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17748486 tgattaggactattttgttaactatcgttaaactagggactcattcacaaaaataggtgcggtataccaattaggggaacatagatgattcggaaga 17748582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 406
Target Start/End: Original strand, 26292538 - 26292930
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||  |||    |||||||| ||    
T  26292538 catgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatactatttatatcctgatcaaatataaacatg 26292637  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   |||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  26292638 atttagtgagaacgaatgactaccgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgtataatcctttat 26292737  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||     | |||| |||| |||||||||||||    
T  26292738 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccctataagagggtcgtaactcaagggat 26292836  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaa 406  Q
    || ||  |||||||| |||||||||| |||||||     ||||||     ||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26292837 tggttcggactatttggttaactatcatggaactagcgaatcattgataagaataggtgcagtataccaattagaggagcatagatgattcgaa 26292930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Original strand, 30066089 - 30066348
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    |||||||| ||    
T  30066089 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattattcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaacatg 30066188  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    ||||   ||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  30066189 atttaatgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaaatgaattgttctaacaaacatggttagtctaggagtggataatcgtttgt 30066288  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 282  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30066289 tagagatattaggttaacgttctt-aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaatta 30066348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 56 - 350
Target Start/End: Original strand, 21914903 - 21915197
Alignment:
Q  56 caatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagct 155  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||    |||||||| |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||    
T  21914903 caatctagtttt-attcaattcaattgttcttaatgatttttatagcctgatcaaatataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactgaccatagct 21915001  T
Q  156 tttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttca 255  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  21915002 ttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatgaataatcgtttatttgtgatattaggttaacgttcttcaaaccttca 21915101  T
Q  256 aagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactatttt-gttaactatcgtg 350  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||    
T  21915102 aagaatattagatcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagagggtcataagtcaagggattgattagggctattttagttaaccatcgtg 21915197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 265
Target Start/End: Original strand, 32837775 - 32838007
Alignment:
Q  30 tgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcg 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||  |||    |||||||| |||||| | |    
T  32837775 tgtgaaactctatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttc--aatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgattt-gtg 32837871  T
Q  130 agaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgata 229  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  32837872 agaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgata 32837971  T
Q  230 ttaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattatta 265  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32837972 ttaggttaacgtgcttaaaaccttcaaagattatta 32838007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 205 - 427
Target Start/End: Original strand, 22131159 - 22131390
Alignment:
Q  205 aatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaag 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||| |    
T  22131159 aatggataatcgtttattagtgatattaggttaacgtgcttaaaaccttcaaggattattaaaccacctaaggaattaggtgttgtagtttgagaagagg 22131258  T
Q  305 gtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta---------tcattcgaatatgtgtagtataccaattaggggaacata 395  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||         |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||     
T  22131259 gtcctaactcaagagattgattaggaatattttgttaactatcgtagaactagagaatcattcatacgaataggtgcagtataccaattaggggaacatc 22131358  T
Q  396 gatgattcgaaagacatgatctcagctctctc 427  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22131359 gatgattcgaaagacctgatctcatctctctc 22131390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 28787698 - 28787374
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacg-t 120  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  | |    ||||||||  |    
T  28787698 catgttgctgtgaaagtctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaactat 28787599  T
Q  121 gatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgttta 220  Q
    ||||| | ||||||  ||||||| ||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||     
T  28787598 gatttagtgagaatgaatgactactgaccatagttttctacttggacataattgaattgttctaataaacaaggttagtctaggaatggataatcgtttg 28787499  T
Q  221 ttagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaaggga 320  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |         ||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  28787498 ttagtgatattaggttaacgtgcttaaacc---------ttattagaccagctaaggaattatgggttgtagtttgagaagagggt-ctaagtcaaggga 28787409  T
Q  321 ttg--attaagactattttgttaactatcgtggaa 353  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28787408 ttgaaattaagactattttgttaactattgtggaa 28787374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 11959546 - 11959157
Alignment:
Q  21 acatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgt 120  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |    
T  11959546 acatgttgctgttaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat-ctgatcaaatataaacat 11959448  T
Q  121 gatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacc-taattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgttt 219  Q
    ||||| | |||||   ||||||| | |||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| |||    
T  11959447 gatttagtgagaacgaatgactactaaccatagcgttcgacttagaccttaattgaattgttctaataaacatggttagtcta--aa--gataatccttt 11959352  T
Q  220 attagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaaggg 319  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||| ||||||||| ||    
T  11959351 attagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaacggttattacaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggttctaactcaaagg 11959253  T
Q  320 attgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagac 410  Q
    ||||||||  ||||    |||||||||| | ||||||     ||||||    ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11959252 attgattataacta----gttaactatcatagaactagggactcattcacaagaataggtgcggtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagac 11959157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 250 - 501
Target Start/End: Original strand, 37215019 - 37215276
Alignment:
Q  250 ccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgt 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37215019 ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattatgactattttgttaactatcgt 37215118  T
Q  350 ggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctctccttatcttttc 440  Q
    ||||||     |||||||    ||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||||||   |||||  ||||    
T  37215119 ggaactagaaaatcattcataagaataggtgcaatataccaatta-gggaacttagatgattcgaaagacctaatttcatctctct---cttattctttc 37215214  T
Q  441 caaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
    |||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  37215215 caactctatctttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctagggca 37215276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 232
Target Start/End: Original strand, 23043912 - 23044121
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  23043912 catgttgttatgaaa-tctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 23044010  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| || || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  23044011 atttagtgagaacgaatgactactggccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcctttat 23044110  T
Q  222 tagtgatatta 232  Q
    |||||||||||    
T  23044111 tagtgatatta 23044121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 22130020 - 22130198
Alignment:
Q  30 tgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcg 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||||| | |    
T  22130020 tgtgaaactctatttattatgaatgacaatctagtttttat-caattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgattttgtg 22130118  T
Q  130 agaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatgg 209  Q
    ||| |  |||||||  |||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22130119 agattgaatgactacggaccctagcgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtttaggaatgg 22130198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18766019 - 18765756
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||  || || ||   ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  18766019 gaaacatgtggctgtgaaactttattgcttgtgcatattaatctagtttt-attcaattcaattgtttttaatgctttttatatattgacactatataat 18765921  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
      ||| || |  ||| |  ||||||| | | | ||||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  |||||| |    
T  18765920 t-tgaattggtaaga-tgaatgactactaatcctagcttacgacttagacctatttgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaataaataatcat 18765823  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagg 284  Q
    ||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  18765822 ttatttgtgatattaggttaacgctcttaaaaccttcgaagaatgttagaccacttaaggaattagg 18765756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 28441514 - 28441431
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatat 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  28441514 gaaacatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatattttttatat 28441431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 356
Target Start/End: Original strand, 31575165 - 31575497
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||   ||||||| | |     
T  31575165 catgttgttgtgaaactctatttcatgtgaatatcaatctagtttt-atttaattcaattgttcataatgctttttatatactgatcacatataa-cata 31575262  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagac--ctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgttt 219  Q
    | |||| ||||||  || |||| | |   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||    
T  31575263 aattcgagagaatgaattactaatta---tagctttcaacttagacacctaattgaattgttcaaataaacagggttattctgagaatggatattcgttt 31575359  T
Q  220 attagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactc-aagg 318  Q
    ||| ||||||||| |||||| | |||   | ||||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||| || ||||||||||  |||| || || ||||    
T  31575360 atttgtgatattaggttaactttcttttta-cttcaaagaatattagattacctagggaattagagactgtaatttgagaagagagtcccaagtcaaagg 31575458  T
Q  319 gattgattaagactatttt-gttaactatcgtggaacta 356  Q
    |||||||||   ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  31575459 gattgattagagctattttagttaaccatcgtgaaacta 31575497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 297 - 428
Target Start/End: Original strand, 23044163 - 23044303
Alignment:
Q  297 agaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattagg 387  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||    
T  23044163 agaagagggtcctaactcaaggcattgattaagattattttgttaactatcgtgaaactactgaatcattcataagaataggtgcagtataccaattagg 23044262  T
Q  388 ggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctct 428  Q
    |||||||||||||||| |||||| | | |||| ||||||||    
T  23044263 ggaacatagatgattcaaaagacctaaactcatctctctct 23044303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 563498 - 563372
Alignment:
Q  159 aacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaag 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| |   | ||||||||  |||    
T  563498 aacttagacctaattgaattgttcaactaaacaaggttagtctaggaatgaataatcgtttaattgtgatattatgttaatgctttgaaaacctttgaag 563399  T
Q  259 attattagaccacctaaggaattaggg 285  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  563398 aatattagatcacctaaagaattaggg 563372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 315 - 424
Target Start/End: Original strand, 30066348 - 30066466
Alignment:
Q  315 aagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcga 405  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||     ||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30066348 aagggattgattagcactattttgttaactatcgcggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcga 30066447  T
Q  406 aagacatgatctcagctct 424  Q
    ||||| |||||||| ||||    
T  30066448 aagacctgatctcatctct 30066466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 393 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 40916155 - 40916069
Alignment:
Q  393 atagatgattcgaaagacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaa 480  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  40916155 atagatgacttgaaagacctgatctcatctctctctctttatcttttccaaaattatctttattttc-gtttatttaattttatgcaa 40916069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 511
Target Start/End: Original strand, 32838007 - 32838118
Alignment:
Q  397 atgattcgaaagacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcct 495  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||    |  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |    
T  32838007 atgattcgaaagacctgatctcatctctct----tattcttttccaaaactatatttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgctt 32838102  T
Q  496 cgggcactagaataat 511  Q
    | ||||||| ||||||    
T  32838103 caggcactaaaataat 32838118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 28441410 - 28441342
Alignment:
Q  434 tcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||    
T  28441410 tcttttccaaaactatatttatattctgtttatttaattttatgcaaatcaaatcaactccctcgggca 28441342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 463 - 515
Target Start/End: Original strand, 10629407 - 10629459
Alignment:
Q  463 ttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcactagaataatttac 515  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| || ||||||||||    
T  10629407 ttatttaattttatgcaatcaaatctactgccttaggcattaaaataatttac 10629459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 18 - 485
Target Start/End: Original strand, 292766 - 293239
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  292766 gaaacatgttgctgtgaaattctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 292865  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | |||||   ||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  292866 catgatttagtgagaacgaatgactactgacgatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtataggaatggataatcct 292965  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  292966 ttattagtgatactaggttaacgttcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaactcaag 293064  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  293065 ggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 293164  T
Q  409 acatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaa 485  Q
    || ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  293165 acttgatctca--tctctctctttatcttttccaaaattatctttattttctgtttatttaattatatacaatcaaa 293239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 42)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 504
Target Start/End: Original strand, 31204586 - 31205073
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  31204586 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 31204685  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  31204686 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 31204785  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31204786 tagtgatattaggttaacgtgttttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggatgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 31204885  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||| |     ||||||    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  31204886 tgattagggatattttgttaactatcgtggaattagaaaatcattaatacgaataggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaagacct 31204985  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcacta 504  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31204986 gatctca--tctctctccttgtcttttccaaaactatc-ttattttctg-ttatttaaatttatgcaatcaaaactactgcctcgggcacta 31205073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 22 - 515
Target Start/End: Original strand, 28110805 - 28111304
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  28110805 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatg-tttttatatcctgatcaaatataaacatg 28110903  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    ||||   ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||| |    
T  28110904 atttaatgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaatagggttagtataggaatggataatcgtttgt 28111003  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28111004 tagtgatattaggttaatgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 28111103  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  28111104 tgattaggactgttttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagatct 28111203  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactagaataat 511  Q
    ||||||| ||||||   |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| | ||||| ||||||    
T  28111204 gatctcatctctct---cttattctttccaaaactatctttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcagacactaaaataat 28111300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 22 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 37184239 - 37183752
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  37184239 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 37184140  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  37184139 atttagtgagaacgaatgactactgatcctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatagttagtctaggaatggataaccgtttgt 37184040  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37184039 tagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 37183940  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||     ||||||    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  37183939 tgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaataggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaagacct 37183840  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcacta 504  Q
    |||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37183839 gatctca--tctctctcattgtcttttccaaaactatc-ttattttctg-ttatttaaatttatgcaatcaaaactactgcctcgggcacta 37183752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 22 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 45961120 - 45960633
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  45961120 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 45961021  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  45961020 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 45960921  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45960920 tagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 45960821  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||| ||||     ||||||    | |||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  45960820 tgattagagctattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattaatacaaataggtgcattataccaattaggggaacatcgatgattcgaaagacct 45960721  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcacta 504  Q
    |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45960720 gatctca--tctctcttcttgtcttttccaaaactatc-ttattttctg-ttatttaaatttatgcaatcaaaactactgcctcgggcacta 45960633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 515
Target Start/End: Original strand, 2793976 - 2794475
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  2793976 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 2794075  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  2794076 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttat 2794175  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    |||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2794176 tagtgatactagcttaacgttcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaactcaagggat 2794274  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  2794275 tgattatgactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgcagtataccaattagggaaacatagatgactcgaaagacct 2794374  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactagaataat 511  Q
    |||||||  |||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| | || || ||||||    
T  2794375 gatctca--tctctctctttttc-tttccaaaactatctttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcagacattaaaataat 2794471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 22 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 6071329 - 6070860
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||    |||||||| ||    
T  6071329 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgccttttatatactgatcaaatataaacatg 6071230  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  6071229 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 6071130  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6071129 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaagaaattaggggatgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 6071030  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |     ||||||    |||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  6071029 tgattaggactattttgttaactatcgtggaaatagaaaatcattaatacgaataggtgcaatataccaattaggggaacatcgatgattcgaaaaacct 6070930  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaa-ttttatgcaatcaaa 485  Q
    |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6070929 gatctca--tctcgctccttgtcttttccaaaactatc-ttattttctg-ttatttaatttttatgcaatcaaa 6070860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Original strand, 45941164 - 45941577
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  45941164 catgttgctgtgaaaccctatttattgtaaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 45941263  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  45941264 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 45941363  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  45941364 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaaaagggtcctaactcaagggat 45941463  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45941464 tgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 45941563  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  45941564 gatctcatctctct 45941577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 673448 - 673031
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||| |  |||||||| ||    
T  673448 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgataaaatataaacatg 673349  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  673348 atttagtgagaatgaatgactattgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtttat 673249  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  673248 tagtgatattatgttaacgtacttaaacccttcaaagattattagaccacctaaaaaattaggggttgtagtttgagaagagggtattaactcaagggat 673149  T
Q  322 tgattaagacta--ttttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagac 410  Q
    ||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||     ||||||     ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  673148 tgattgagactatttttttttaactatcgtggaactagaaaatcatttacaagaataggtgcagtataccaattagggaaacatagatgattcgaaatac 673049  T
Q  411 atgatctcagctctctct 428  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  673048 atgatctcatctctctct 673031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 22 - 504
Target Start/End: Original strand, 20398601 - 20399089
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  20398601 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 20398700  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  || |||| |||||||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  20398701 atttagtgagaatgaatcactactgaccatagctttctactttgacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 20398800  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20398801 tagtgatattaggttaacgtgctttaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtctgagaagagggttctaactcaagggat 20398900  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  20398901 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgactcgaaagacct 20399000  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcacta 504  Q
    ||||||| ||||||   |||||  |||||||  ||||||||||  | || |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||    
T  20399001 gatctcatctctct---cttattctttccaactctatctttattttatg-ttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcaggcacta 20399089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 49498877 - 49498393
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  49498877 gaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 49498778  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaactta-gacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcg 216  Q
    | |||||| | || |||  ||||||| |||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  49498777 catgatttagtgataatgaatgactactgaccatagctttctacttaagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcg 49498678  T
Q  217 tttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaa 316  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  49498677 tttgttagtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaa 49498579  T
Q  317 gggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaa 407  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49498578 gggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactataaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacttagatgattcgaaa 49498479  T
Q  408 gacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
    ||| | |||||| |||||||         |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  49498478 gacctaatctcatctctctc---------tttccaactctatctttatattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctagggca 49498393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 22 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 23022299 - 23021835
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  | |    |||||||| ||    
T  23022299 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatactttttatatcctaatcaaatataaacatg 23022200  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  23022199 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 23022100  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || | || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  23022099 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattatttgatcacctaaggaattaggggctgtggtctaagaagagggtcctaactcaagggat 23022000  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaac-----tatcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  23021999 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaatatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacttagatgattcgaaagacct 23021900  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaa 480  Q
     |||||| |||| |   |||||  |||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23021899 aatctcatctctat---cttattctttccaactctatctttatattctgtttatttaattttatgcaa 23021835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 34732739 - 34732236
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||    
T  34732739 gaaatatgttgctgtgaaactctatctattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatt-tttttatttattgacacgatataaa 34732641  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||||  ||||||  ||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  34732640 catgatttcctgagaatgaatgactactgaccataactttcaacttaaacctaattgaattgttcaaataaacatagttagtctaggaatgaataatcgt 34732541  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||  | || |||||||||| |||||||| |||||    
T  34732540 ttatttgtgatattaagttaacgttcttaaaaccttcaaagagtattagaccacctaacaaattaggggatgtactttgagaagagggtcctaagtcaag 34732441  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattcg-----aatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaa 407  Q
    ||||||| || | ||||||||||||| |||||| ||||     ||||||||     ||||  || ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  34732440 ggattga-tagggctattttgttaaccatcgtgaaactagagaatcattcgtaagaaataattgcagtataccaattaggggaactcagaggattcgaaa 34732342  T
Q  408 gacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcactagaa 507  Q
    ||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| |||||||||||| |   ||| |||||| ||    
T  34732341 gaactgatctca--tatctctccttatcttttccaaaactatctttattttcttcttatttaattttattcaatcaaaactagtgtttcgagcactaaaa 34732244  T
Q  508 taatttac 515  Q
    ||||||||    
T  34732243 taatttac 34732236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 21107666 - 21107254
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  21107666 catgttgctgtcaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattaaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatg 21107567  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| ||||||| |||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  21107566 atttagtgagaatgaatgactactgaccattgctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 21107467  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21107466 tagtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccatctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggat 21107368  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  21107367 tgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggtgaacatagatgattcgaaagacct 21107268  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||||| ||||||    
T  21107267 gatctcatctctct 21107254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 41058677 - 41058281
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  41058677 catgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 41058578  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  41058577 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaatagggttagtctaggaatggataattgtttgt 41058478  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  41058477 tagtgataataggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagactacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaaatcaagggat 41058379  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagac 410  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41058378 tgattatgactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagcataccaattagaggaacatagatgattcgaaagac 41058281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 1950830 - 1950434
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||  ||    
T  1950830 catgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcatatataaatatg 1950731  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  1950730 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgtattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 1950631  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  1950630 tagtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcgaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggttctaagtcaagggat 1950532  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagac 410  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1950531 tgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagac 1950434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 23 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 21018840 - 21018430
Alignment:
Q  23 atgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtga 122  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||    |||||||| |||    
T  21018840 atgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaactgttcttaacgcttttt-tatcttgatcaaatataaacatga 21018742  T
Q  123 tttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttatt 222  Q
    ||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  21018741 tttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttttaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgtt 21018642  T
Q  223 agtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggatt 322  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  21018641 agtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcataagtcaagggatt 21018543  T
Q  323 gattaagactattttgttaactatcgtggaacta---------tcattcgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatg 413  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||         ||||  ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21018542 gattaggactattttgttaactatcgtggaactaaaaaaccattcataagaataggttcagtatacaaattaggggaacatagatgattcgaaagacctg 21018443  T
Q  414 atctcagctctct 426  Q
    |||||| ||||||    
T  21018442 atctcatctctct 21018430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 18 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 49853457 - 49853120
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  49853457 gaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 49853358  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | ||||||  ||||||| | |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  49853357 catgatttagtgagaatgaatgactactaaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgt 49853258  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    || ||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  49853257 ttgttattgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaag 49853159  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta 356  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  49853158 tgattgattaggactattttgttaactgtcgtggaacta 49853120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 906064 - 905664
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  906064 catgttattgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 905965  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  905964 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttat 905865  T
Q  222 tagtg----atattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    |||||    |||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||     |||||| ||||||||||||||    
T  905864 tagtgatatatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggttgtaaccatagaagagggtcctaactcaag 905766  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  905765 ggattgattaaaactattttgttaactatcgtggaactagtgaatcattcataagaataagtgcagtataccaattagggaaacatagatgattcgaaag 905666  T
Q  409 ac 410  Q
    ||    
T  905665 ac 905664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 3797205 - 3796787
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  3797205 gaaacatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 3797106  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
      |||||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  3797105 tatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtttaggaatggataatcct 3797006  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||||||||||||    
T  3797005 ttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaag 3796907  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||     || |||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3796906 ggattgattatgactattttgttaactatcgtaaaactagtgactctttcgcaagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 3796807  T
Q  409 acatgatctcagctctctct 428  Q
    || | | |||| ||||||||    
T  3796806 acctaaactcatctctctct 3796787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 30 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 29643588 - 29643182
Alignment:
Q  30 tgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcg 129  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||||| | |    
T  29643588 tgtgaaactctatttattttgaatgacaatttagtttttattcaattaaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtg 29643489  T
Q  130 agaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgata 229  Q
     |||   ||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  29643488 tgaacgaatgactactgaccctaactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttaatctaggaatggataatcctttattagtgata 29643389  T
Q  230 ttaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaag 329  Q
    ||| |||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  | || |   |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  29643388 ttaggttaacatgctt-aaaccttcgaagattattagaccacctaaggaattagaggttgtaatcctagaagagggtcctaactcaagggattgattagg 29643290  T
Q  330 actattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcag 420  Q
     |||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||     
T  29643289 gctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtatactagttaggggaacatcgatgattcgaaagacctaaactcat 29643190  T
Q  421 ctctctct 428  Q
    ||||||||    
T  29643189 ctctctct 29643182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Original strand, 2405258 - 2405670
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||    |||||||| ||    
T  2405258 catgttgttgtgaaactcaatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgattttcatatcctgatcaaatataaacatg 2405357  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| |||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  2405358 atttagtgagaacgaatgactactgaccataacgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttat 2405457  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttc-aaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaaggga 320  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||  | ||     || ||| |||||||||||||  ||    
T  2405458 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcgacaga-tattagaccacctaaggaattaagggatgtaaccctaggagagggtcctaactcaattga 2405555  T
Q  321 ttgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagaca 411  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  2405556 ttgattaggactattttgttaactatcgtagaactagggaatcattcacaagaataggtgcagtataccaattaggaaaacatagatgattcgaaagacc 2405655  T
Q  412 tgatctcagctctct 426  Q
    |||||||| ||||||    
T  2405656 tgatctcatctctct 2405670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 327
Target Start/End: Original strand, 7635391 - 7635698
Alignment:
Q  19 aaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaac 118  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||  |||   |||||| ||    
T  7635391 aaacatgttgatgtgaaactctatttcttatgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttagtgctttttatatgctgatcacatatatac 7635489  T
Q  119 gtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtt 218  Q
     ||| |||| ||||||  ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  7635490 atgaattcgtgagaatgaatgactattgatcataactttcaacttagacctgattgaattgttcaaataaacagggtcagtctaggaatagataatcgtt 7635589  T
Q  219 tattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagg 318  Q
    |||| || |||  | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||| ||||||    
T  7635590 tatttgtaataagaggttaacgttcttaaaaccttcaaagaatattagatcacctaaggaattatggactgtaatctgagaagagggtcctaagtcaagg 7635689  T
Q  319 gattgatta 327  Q
     ||||||||    
T  7635690 tattgatta 7635698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27355941 - 27355729
Alignment:
Q  145 tgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtact 244  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  27355941 tgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttatttgtgatattaggttaacgttct 27355842  T
Q  245 taaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactatttt-gttaac 343  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  27355841 taaaaccttcaaaaaatattagatcacctaatgaattagggactgtaatatgagaagagggtcctaagtcaagggattgattaggcctattttagttaac 27355742  T
Q  344 tatcgtggaacta 356  Q
     |||||| |||||    
T  27355741 catcgtgaaacta 27355729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11668404 - 11668171
Alignment:
Q  19 aaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaac 118  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   ||    ||||||||    
T  11668404 aaacatgttgctgtgaaactctatctattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcccgatcaaatataaac 11668305  T
Q  119 gtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtt 218  Q
     |||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11668304 atgattttgtgagaattaatgactactgaccatagctttcaacttagaccgaattgaatttttcaaataaatatggttactctaggaatggataatcgtt 11668205  T
Q  219 tattagtgatattaagttaacgtacttaaaacct 252  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11668204 tatttgtgatattaagttaacgttcttaaaacct 11668171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27332148 - 27331883
Alignment:
Q  19 aaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaac 118  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||   |||||||||    
T  27332148 aaacatgttgctatgaaactttatttcttgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttattaatgctttttatatactgatcacatataaac 27332050  T
Q  119 gtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaa-tggataatcgt 217  Q
     ||| |||  ||||||  ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  27332049 atgaattcatgagaatgaatgactactgaccataactttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaattgaataatcgt 27331950  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagg 284  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||    
T  27331949 ttatttgtgatattaggttaacgttgttaaaaccttcaaaaaatattagatcacctaatgaattagg 27331883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 111 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21434763 - 21434523
Alignment:
Q  111 atataaacgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatgga 210  Q
    |||||||| || ||| | ||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |    
T  21434763 atataaacatgttttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttatacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatgaa 21434664  T
Q  211 taatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtccta 310  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||  ||| ||    
T  21434663 taatcgtttatttgttatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaataatattagatcacctaaggaattagggactgtaatctgagaagagtgtctta 21434564  T
Q  311 actcaagggattgattaagactatttt-gttaactatcgtg 350  Q
    | |||| |||||||||| | ||||||| ||||||| |||||    
T  21434563 agtcaatggattgattatggctattttagttaactgtcgtg 21434523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 247 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 21111309 - 21111121
Alignment:
Q  247 aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactat 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21111309 aaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaagttaagggattgattaagactattttgttaactat 21111210  T
Q  347 cgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
    |||| ||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21111209 cgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggagaacatagatgattcgaaagacctgatctcatctctct 21111121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 175 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27355165 - 27354986
Alignment:
Q  175 aattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccaccta 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  27355165 aattgttctaataaacatggttagtgtaggaatagataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgtttaaa-ccttcgaagattaatagaccaccta 27355067  T
Q  275 aggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta 356  Q
    |||||||||||  | |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27355066 aggaattagggt-tgtagtttaagaagagggtcctaactcaagggattggttatgactattttgttaactatcgtggaacta 27354986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 212 - 485
Target Start/End: Original strand, 42022578 - 42022860
Alignment:
Q  212 aatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaa 311  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||     ||||||  | ||||||||||||| ||||||||    
T  42022578 aatcgtttat-agtgatattaggataacgtaattaaaaccttcaaaaattattagatcaccta-----ttaggggttatagtttgagaagagggtcctaa 42022671  T
Q  312 ctcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----------tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatag 396  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||           ||||||    ||||| ||| || ||||  ||||| |||||  ||    
T  42022672 ctcaagggattgattaaaactattttgttaactatagtggaactagaaattcttattcattcataagaataggtgcagcatactgattagaggaactcag 42022771  T
Q  397 atgattcgaaagacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaa 485  Q
    | |||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  42022772 aggattcgaaagatctagtctcatctctctctccttatcttttccaaaactatatttattttatgtttatttaattttatgcaatcaaa 42022860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34066818 - 34066599
Alignment:
Q  19 aaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaac 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  34066818 aaacatgttgttgtgaaactctatttcttgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatatattaacaccatataatc 34066720  T
Q  119 gtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtt 218  Q
     ||| |  || ||| |  ||||||| | ||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  | |    
T  34066719 -tgaatcggcaagattgaatgactactaaccatagcttacaacttatacctaatttgattgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataactgct 34066621  T
Q  219 tattagtgatattaagttaacg 240  Q
    |||| ||||||| |||||||||    
T  34066620 tatttgtgatatcaagttaacg 34066599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 362 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 27536558 - 27536419
Alignment:
Q  362 cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctg 461  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  27536558 cgaataggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaagacctgatctca--tctctctccttgtcttttccaaaactatc-ttattttctg 27536462  T
Q  462 tttattta-attttatgcaatcaaaactacttcctcgggcacta 504  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27536461 -ttatttactttttatgcaatcaaaactactgcctcgggcacta 27536419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 313 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 21114583 - 21114461
Alignment:
Q  313 tcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattc 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||||    ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21114583 tcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggagaacatagatgattc 21114484  T
Q  404 gaaagacatgatctcagctctct 426  Q
    ||||||| |||||||| ||||||    
T  21114483 gaaagacctgatctcatctctct 21114461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 216 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13431141 - 13431021
Alignment:
Q  216 gtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactca 315  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||| || | ||||||||  ||||||| |||    
T  13431141 gtttatttgtgatattaagttaacgttcgtaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattagagactgtaatatgagaagagagtcctaagtca 13431042  T
Q  316 agggattgattaagactattt 336  Q
    |||||||||||| | ||||||    
T  13431041 agggattgattagggctattt 13431021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 101
Target Start/End: Original strand, 42022420 - 42022502
Alignment:
Q  19 aaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatat 101  Q
    |||||| ||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  42022420 aaacatattgctgtgaaattctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 42022502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11667153 - 11667056
Alignment:
Q  246 aaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaac 343  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||| | |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11667153 aaaaccttcaaataatattagaccacctaaggaattaggggctgtaatctgagaagaggatcctaagtcaagggattgattagggctattttgttaac 11667056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16055747 - 16055629
Alignment:
Q  219 tattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagg 318  Q
    |||| ||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||  | || | |||||||| |||||||| ||||||    
T  16055747 tatttgtgatattaggttaacattcttcaaaccttcaaagaatattagatcacctaaggatttaggggttgtaatctgagaagagggtcctaagtcaagg 16055648  T
Q  319 gattgattaagactatttt 337  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  16055647 gattgattagggctatttt 16055629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 27536661 - 27536583
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagt-ttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatat 101  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27536661 catgttgttgtgaaact--atttattattaatgacaatctagttttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatat 27536583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 243 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 34065317 - 34065204
Alignment:
Q  243 cttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaa 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||| || | ||||| || |||||||| | ||| ||||||||| | |||||| |||||    
T  34065317 cttaaaaccttcaaagattattagatcaccaaaggtattagagactgtaatatgagaggagggtcctaagttaagagattgattagggctatttggttaa 34065218  T
Q  343 ctatcgtggaacta 356  Q
    | |||||| |||||    
T  34065217 ccatcgtgaaacta 34065204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16056982 - 16056874
Alignment:
Q  219 tattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagg 318  Q
    |||| ||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||   || | |||||||| |||||||| ||||||    
T  16056982 tatttgtgatattaggttaacgttattcaaacctttaaagtatattagatcacctaaggaattagggatcgtaatctgagaagagggtcctaagtcaagg 16056883  T
Q  319 gattgatta 327  Q
    |||||||||    
T  16056882 gattgatta 16056874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16061148 - 16061030
Alignment:
Q  219 tattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagg 318  Q
    |||| ||||||||| ||||| || ||| ||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||| | || | ||||||||   |||||| |||| |    
T  16061148 tatttgtgatattaggttaatgttcttcaaacctataaagtatattagatcacctaaggaattagggattgtaatatgagaagagaatcctaagtcaatg 16061049  T
Q  319 gattgattaagactatttt 337  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  16061048 gattgattagggctatttt 16061030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 37907624 - 37907562
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatt 81  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  37907624 gaaacatgtggttgtgaaactatattgcttatgaatatcaatctag-ttttattcaattcaatt 37907562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 377 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 13430969 - 13430917
Alignment:
Q  377 taccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctctc 429  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  13430969 taccaattaggggaactcagaggattcgaaagccctgatctcatctctctctc 13430917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 22 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 4164 - 3678
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  4164 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgaaaatctagtttttattcaattcaactgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 4065  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  4064 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 3965  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3964 tagtgatattaggttaatgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 3865  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  3864 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattagggtaacatagatgattcgaaagacct 3765  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
    ||||||| ||||||   |||||  |||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  3764 gatctcatctctct---cttattctttccaactctatctttacattctgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctagggca 3678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 485
Target Start/End: Original strand, 62264 - 62729
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  62264 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 62363  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  62364 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 62463  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  62464 tagtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 62562  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  62563 tgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 62662  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaatttta-tgcaatcaaa 485  Q
    |||     ||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  62663 gat-----ctctctctctttttc-tttccaaaactatctttattttctg-ttatttacttttattgcaatcaaa 62729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 428
Target Start/End: Original strand, 63611 - 64020
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  | ||  |        |||||||    
T  63611 gaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacattctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctcctgatcaa--------atataaa 63702  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  63703 catgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcga-ttagacctaattgtattgttttaataaacatggttagtctaggaatggataatcct 63801  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||     | |||| ||||||||||||||    
T  63802 ttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcgaaggttattataccacctaaggaattaggggctataaccctataagagggtcctaactcaag 63900  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     | |||||    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  63901 ggattgattcagactattttgttaactattgtggaactagaaaagcattcacaagaataggtgcagtataccgattaggggaacatagatgattcgaaag 64000  T
Q  409 acatgatctcagctctctct 428  Q
    || | | |||| ||||||||    
T  64001 acctaaactcatctctctct 64020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 452
Target Start/End: Original strand, 89516 - 89953
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  89516 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 89615  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  89616 atttagtgagaacgaatgactactgaccctaacttttgacttagacctaattgaattgttttaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 89715  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  89716 tagtgatattaagttaacgtgcttcaaaccttcgagaattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagagtcctaactcaagggat 89815  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||     ||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  89816 tgattagggctattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattaatacgaatatgtgcagtataccaattaggggaacttagatgattcgaaagacct 89915  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctt 452  Q
    |||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  89916 gatctca--tctctctccttgtgttttccaaaactatctt 89953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 22 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 5775 - 5276
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagttttt-attcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgt 120  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |    
T  5775 catgttgctgtgaaaccctatttattgtaaatgacaatctagttttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacat 5676  T
Q  121 gatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgttta 220  Q
    ||||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5675 gatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatggataatccttta 5576  T
Q  221 ttagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaaggga 320  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  5575 ttagtgatattaggctaacgttcttaaaactttcaaagattattagaccacctaaggaatcaggggctgtagtttgagaagagggtcttaactcaaagga 5476  T
Q  321 ttgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagaca 411  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||     |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5475 ttgattaggactattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacc 5376  T
Q  412 tgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgc-aatcaaaactacttcctcgggcactagaataa 510  Q
    ||||||||    |||||| |  ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  5375 tgatctca----tctctcttattcttttccaaaactatctttatattttgtttatttaattttatgcaaaccaaaactactgcctcaggcactaaaataa 5280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 22 - 429
Target Start/End: Original strand, 19142 - 19558
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| ||    
T  19142 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 19241  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  19242 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgt 19341  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  19342 tagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagtttattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagagttctaactcaagggat 19441  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  19442 tgattatgactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataagaataggtgcagtataccaattagaggaacatagatgattcgaaagacct 19541  T
Q  413 gatctcagctctctctc 429  Q
    ||||||| |||||||||    
T  19542 gatctcatctctctctc 19558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0520
Description:

Target: scaffold0520; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 8594 - 8182
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |    |||||||| ||    
T  8594 catgttgatgtgaaacactatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatg 8495  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  8494 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacttggttagtctaggaatggataatcgtttgt 8395  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8394 ttgtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaagggat 8296  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||| |     |||||||    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  8295 cgattaggactattttgttaactatcgtggaaatagaaaatcattcataagaataggtgtagtataccaattagggaaacataaatgattcgaaagacct 8196  T
Q  413 gatctcagctctct 426  Q
    ||||| | ||||||    
T  8195 gatcttatctctct 8182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 170 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1775 - 1590
Alignment:
Q  170 aattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagacc 269  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||||||    
T  1775 aattgaattattctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgtgcttaaa-cttttaaagattattagacc 1677  T
Q  270 acctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta 356  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  1676 acctaaggaattaggggttgtagtttgagaagacggtcctaagtcaagggattgattatgactattttgttaactattgtgtaacta 1590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4355 - 4187
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||  | |    |||||||| ||    
T  4355 catgttgatgtgaaacactatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattattcttaaagctttttatatcctaatcaaatataaacatg 4256  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaac 190  Q
    |||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4255 atttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaac 4187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 3661 - 3189
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  3661 gaaacaagttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaa-ctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 3563  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  3562 catgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttaacctaggaatggataatcgt 3463  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    || |||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||    
T  3462 ttgttagtgatattaggtaaacatgcttaaaaccttcaaagaatattagctcacctaaggaattagggactgtaatatgagaagagggttctaactcaag 3363  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaag 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  3362 ggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcattataccaattatgggaacattgatgactcgaaag 3263  T
Q  409 acatgatctcagctctctctcct-tatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaa 485  Q
    || |  |||||    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3262 acctagtctca----tctctcatatatattttccaaaactatctttattttctgtttatttaattttatgcaatcaaa 3189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 57957 - 57550
Alignment:
Q  30 tgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcg 129  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  |||    |||||||| |||||| | |    
T  57957 tgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgtttttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtg 57858  T
Q  130 agaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgata 229  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  57857 agaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaaaatggttagtctagaaatggataatcgtttattagtgata 57758  T
Q  230 ttaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaag 329  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||  | ||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||| |    
T  57757 ttaagttaacgttcgtaaaaccttcaaagagtattagaccacctaagcaatcaggggatgtagtttgagaagagggccctaactcaatggatagattagg 57658  T
Q  330 actattttgttaactatcgtggaacta---------tcattcgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcag 420  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||         ||||  ||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  57657 actattttgttaactatcgtgaaactagaaaatcgttcataagaataggtgcaatataccaattatgtgaacatagatgattcgaaagacctgatctcat 57558  T
Q  421 ctctctct 428  Q
    ||||||||    
T  57557 ctctctct 57550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 42 - 426
Target Start/End: Original strand, 197914 - 198306
Alignment:
Q  42 tttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcgagaattgatgac 141  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||||| | ||||||  |||||    
T  197914 tttattatgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgac 198013  T
Q  142 tattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgt 241  Q
    || |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  198014 tactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacaggaatagtctaggaatggataatcatttgttagtgatattaggttaacgt 198113  T
Q  242 acttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgtta 341  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  198114 gcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattagaggctatagtttgagaagagggtcctaagtcaagggattgattaggactattttgtta 198212  T
Q  342 actatcgtggaacta---------tcattcgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
    |||||||||||||||         ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  198213 actatcgtggaactagaaaattattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctgatctcatctctct 198306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0757 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0757
Description:

Target: scaffold0757; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 426
Target Start/End: Original strand, 5094 - 5511
Alignment:
Q  17 agaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataa 116  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||  | |    ||||||    
T  5094 agaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaactgtttttaatgctttttatatccttatcaaatataa 5193  T
Q  117 acgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcg 216  Q
    || |||||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||    
T  5194 acatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattaaattgttctaataaatagggttagtctaggaatggatgatcg 5293  T
Q  217 tttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaa 316  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5294 tttgttagtgatattaggttaacgttcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaagtcaa 5392  T
Q  317 gggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaa 407  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||||| ||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5393 gggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactaaaaaatcattcataagaataggtgcactatatcaattaggggaatatagatgattcgaaa 5492  T
Q  408 gacatgatctcagctctct 426  Q
    ||| |||||||| ||||||    
T  5493 gacctgatctcatctctct 5511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 439 - 3
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||  |||    |||||||| ||    
T  439 catgttgctgtgaaactatatttattattaattacaatttagtttttattcaattcaattgttcttattgctctttatatcctgatcaaatataaacatg 340  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    | || | |||||   ||||||| ||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  339 aattagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagatataattgaattgttctgataaacatggttagtctaggaatggataatcgtttgt 240  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  239 tagtgatattaggttaacgttctaaaaaccttgaaagattattagaccgcctaagaaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggat 140  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcatt----cgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    | |||| | ||||||||||||||||||||||| |     ||||||    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  139 ttattagggctattttgttaactatcgtggaattagaaaatcattaatacgaataggtgcagtataccaattaagggaacatcgatgattcgaaagacct 40  T
Q  413 gatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctt 452  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39 gatctca--tctctctccttat-ttttccaaaactatctt 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 3799 - 3733
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttctta 88  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3799 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttctta 3733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 10929 - 10863
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttctta 88  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10929 catgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttctta 10863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 67900 - 67567
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||  ||    
T  67900 catgttgctgtgaaactctatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatg 67801  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |    
T  67800 atttagtgagaacgaatgactaccgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatatataatcgtttgt 67701  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  67700 tagtgatattaagttaacatgctt-aaaccttcgaagattattagaccacctaaggaattaggagttgtagtttaagaagagggtcctaactcaagggat 67602  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta 356  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  67601 tgattaggactattttgttaactatcgtggtacta 67567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 146 - 429
Target Start/End: Original strand, 1 - 293
Alignment:
Q  146 gaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtactt 245  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  1 gaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatcgtttgttagtgatattaggttaacgttctt 100  T
Q  246 aaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaacta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  101 aaaaccttcaaagattattagaccacctaagaaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaacta 200  T
Q  346 tcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctctc 429  Q
    ||||||||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  201 tcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacttgatctcatctctctctc 293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 178; Significance: 9e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 410
Target Start/End: Original strand, 30841 - 31238
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    |||||||  ||    
T  30841 catgttgttgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatg 30940  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  30941 atttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgatttgttctaataaacatggttagtctaggaatgtataatcctttat 31040  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||||||||||||||||    
T  31041 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccacctaaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggat 31139  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattagggg-aacatagatgattcgaaagac 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||     || |||    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  31140 tgattaagactattttgttaactatcgtaaaactagtgactctttcacaagaataggtgcagtataccaattaggggtaacataaatgattcgaaagac 31238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 3391 - 2965
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  | |    |||||||    
T  3391 gaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaa 3292  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaat---tga----tgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatgga 210  Q
    | |||||| | |||||    |||    |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3291 catgatttagtgagaacgaatgactactgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctacgaatgga 3192  T
Q  211 taatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtccta 310  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||     |||||| |||||||    
T  3191 taatcctttattagtgatattaggttaacatgctt-aaaccttcaacgattattagaccacctaaggaattaggggttgtaacactagaagagggtccta 3093  T
Q  311 actcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgat 401  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3092 actcaatggattgattaggactattttggtaactatcgtagaactagtgaatcattcacaagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgat 2993  T
Q  402 tcgaaagacatgatctcagctctctctc 429  Q
    ||||||||| | | |||| |||||||||    
T  2992 tcgaaagacctaaactcatctctctctc 2965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 59062 - 58661
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||    
T  59062 gaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaa 58963  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaa--ttgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatc 215  Q
    | |||||| | |||||   ||||||| | ||| || ||||  |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  58962 catgatttagtgagaacgaatgactactaaccctaactttcgacttagacctaattgaatttttttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 58863  T
Q  216 gtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactca 315  Q
     |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||| || ||     |||||| ||||||||||||    
T  58862 ctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagactgcataaggaattaggggctgtaaccctagaagagggtcctaactca 58764  T
Q  316 agggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaa 406  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     | |||||    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  58763 agggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaagcattcacaagaataggtgcagtatacaaattaggggaacatagatgattcgaa 58664  T
Q  407 aga 409  Q
    |||    
T  58663 aga 58661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1755 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold1755
Description:

Target: scaffold1755; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 160 - 426
Target Start/End: Original strand, 6 - 280
Alignment:
Q  160 acttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaaga 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  6 acttagacctaattgaattgttctaataaatagggttagtctaggaatggataatcctttgttagtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaaga 104  T
Q  260 ttattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact---- 355  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||        
T  105 ttattagaccacctaagcaattagggactgaagtttgagaagagggtcctaactcaagggattgattaggactatgttgttaactatcgtggaactagaa 204  T
Q  356 -atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
     |||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  205 aatcattcataagaatatgtgcagtataccaattaggggaacatatatgattcgaaagacctgatctcatctctct 280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 180 - 501
Target Start/End: Original strand, 89 - 416
Alignment:
Q  180 ttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaa 279  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  89 ttctactaatcatggttagtctaggaatgaataatcctttattagtgatattaggttaacgttcttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaa 188  T
Q  280 ttagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgt 370  Q
    |||||| || |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||||||    ||||| ||    
T  189 ttaggggctgtagtttgagaagagagtcttaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtaaaactagaaaatcattcataagaataggt 288  T
Q  371 gtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttatttaa 470  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     |||||| |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  289 gcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagatctgatctc----gtctctcttattcttttccaaaactatctttatattctgtttatttaa 384  T
Q  471 ttttatgc-aatcaaaactacttcctcgggca 501  Q
    |||||||| ||||||| | ||| |||||||||    
T  385 ttttatgcaaatcaaatcaactgcctcgggca 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 157
Target Start/End: Original strand, 1 - 90
Alignment:
Q  68 tattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttt 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||| |||||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  1 tattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagcttt 90  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 356
Target Start/End: Original strand, 19098 - 19429
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagttttt-attcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataa 116  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||    ||||||    
T  19098 gaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagttttttattcaattcaattgttcataatgcttgttatatcttgatcaaatataa 19197  T
Q  117 acgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcg 216  Q
     | |||||| | |||||   ||||||| |||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||    
T  19198 -catgatttagtgagaacgaatgactactgaccataactttcgactgagacctaattgaattgttcta-------tggttagtctaggaatggataatcg 19289  T
Q  217 tttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaa 316  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19290 tttgttagtgatattaggttaacgtgcataaaaccttcaaagattattagatcacctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcctaactcaa 19389  T
Q  317 gggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta 356  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  19390 gggattgattagaactattttgttaactatcgtggaacta 19429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 118824 - 118487
Alignment:
Q  19 aaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaac 118  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    ||||||||    
T  118824 aaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaac 118725  T
Q  119 gtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtt 218  Q
     ||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  118724 atgaattcgtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatcgtt 118625  T
Q  219 tattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagg 318  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||| ||    | ||||| |||||||| ||||||    
T  118624 tatttgtgatattaggttaacgcatgtaaaaccttcaaagaatattagatcatctaaggaattatagactgtaacccgcgaagagggtcctaagtcaagg 118525  T
Q  319 gattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta 356  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||| || |||||    
T  118524 gattgattagtgctattttgttaactatcctgaaacta 118487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Original strand, 29112 - 29526
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||  ||    
T  29112 catgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatg 29211  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   | ||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  29212 atttagtgagaacgaaagactactgaccataactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttat 29311  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||  | ||     |||||| ||||||||||||||||||    
T  29312 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaagttattagaccacgtgaggaattaggggttgtaaccctagaagagggtcctaactcaagggat 29410  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||     ||||||    ||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29411 tgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagggactcattcacaagaataggtgcagtataaaaattaggggaacatagatgattcgaaagacct 29510  T
Q  413 gatctcagctctctct 428  Q
     | |||| ||||||||    
T  29511 aaactcatctctctct 29526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 428
Target Start/End: Original strand, 19042 - 19441
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    |||||||  ||    
T  19042 catgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatg 19141  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    |||| | |||||   | ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |               ||| | |||||    
T  19142 atttagtgagaacgaacgactactgaccatagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatgct---------------taaacctttat 19226  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | ||  |  |||||| ||||||||||||||||||    
T  19227 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcaaaggttattagaccatctaaggaattaggggttgtaactctagaagagggtcctaactcaagggat 19325  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacat 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||     ||||||    ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  19326 tgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagggagtcattcacaagaataggtgcagtataccaatgaggtgaacatagatgattcgaaagacct 19425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 51 - 407
Target Start/End: Original strand, 10185 - 10549
Alignment:
Q  51 aatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcgagaattgatgactattgacca 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||    ||||||||  ||||| | |||||   ||||||| |||||     
T  10185 aatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacaggatttagtgagaacgaatgactactgaccc 10284  T
Q  151 tagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaac 250  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  10285 tagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtcaaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaac 10383  T
Q  251 cttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtg 350  Q
    |||||| | ||||||| || |||||| ||||||||  | ||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10384 cttcaacggttattagtccgcctaagaaattaggggttgtaaccctagaagatggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgta 10483  T
Q  351 gaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaa 407  Q
    |||||     |||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10484 gaactagtgaatcattcacaagaataggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaa 10549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2073 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold2073
Description:

Target: scaffold2073; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 258 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 1007 - 741
Alignment:
Q  258 gattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta- 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  1007 gattattagaccacctaaggaattaggggttgtagtttgaaaagagggtcctaacccaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactag 908  T
Q  357 ----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaacta 448  Q
        ||||||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  907 ataatcattcataagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctgatatcatctatctctccttatcttttccaaaacta 808  T
Q  449 tctttatcatctgtttatttaattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcactagaataatttac 515  Q
     ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  807 cctttattttctatttatttaattttatgcaatcaaaactactgcctcgagcactaaaataatttac 741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 170 - 426
Target Start/End: Original strand, 248413 - 248677
Alignment:
Q  170 aattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagacc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  248413 aattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgattaaa-ccttcaaagattattagacc 248511  T
Q  270 acctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta---------tcat 360  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||         ||||    
T  248512 acctaaggaattaggggttgtagtttgtgaagagggtcctaagtcaagggattgattatgactattttgttaactgtcgtggaactagaaaatcactcat 248611  T
Q  361 tcgaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
      ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  248612 aagaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctgatctcatctctct 248677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 171 - 426
Target Start/End: Original strand, 27005 - 27268
Alignment:
Q  171 attgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagacca 270  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27005 attgaattgttctaataaatagggttagtctaggaatggataatcgtttgttcgtgatattaggttaacgtgcttaaa-ccttcaaagattattacacca 27103  T
Q  271 cctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc--- 362  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||     |||||||       
T  27104 cctaaggaattaggggctgtagtttgagaagagggtcttaagtcaatggattgattaggactattttgttaactatcatggaactagagaatcattcata 27203  T
Q  363 -gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
     |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27204 agaatagatgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctgatctcatctctct 27268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Original strand, 26935 - 27004
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatg 91  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  26935 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttgtttaattcaattgttcttaatg 27004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1063 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1063
Description:

Target: scaffold1063; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 168 - 481
Target Start/End: Original strand, 2385 - 2713
Alignment:
Q  168 ctaattgaattgttctaataaacatggtta--gtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattatta 265  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  2385 ctaactgaattgttctaataaacatggttatagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggttaacgtgcttaaaacgttcaaagaatatta 2484  T
Q  266 gaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcat 360  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||    
T  2485 gctcacctaaggaattagggactgtagtatgagaagagggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcat 2584  T
Q  361 tc----------gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatc 450  Q
    ||          ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |  |||||  ||||||    ||| ||||| || |||||     
T  2585 tcataagaataagaataggtgcagtataccaattaggggaacattgatgactcgaaagacctagtctca--tctctccatatatattttctaatactatt 2682  T
Q  451 tttatcatctgtttatttaattttatgcaat 481  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  2683 tttattttctgtttatttaattttgtgcaat 2713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 350
Target Start/End: Original strand, 9682 - 10014
Alignment:
Q  19 aaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaac 118  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||    
T  9682 aaacatgttgctgtgaaactctatttcttatgaatatcaatatagtttt-attcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgatcacataaaaac 9780  T
Q  119 gtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtt 218  Q
     ||| |||| ||||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||| |||| | |||| |||    
T  9781 atgaattcgtgagaatgaatgattattgaccataactttcaacttagacctaattgaattgatcgaataaacagagttagtctaggaattggtaattgtt 9880  T
Q  219 tattagtgatattaa-gttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    |||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||| | ||||| | ||| |||||||||||||||| || | |||||||| |||||||| |||||    
T  9881 tatttgtgatattaaggttaactttcttaaaaccttcaaataatattataacacataaggaattagggactctaatctgagaagagggtcctaagtcaag 9980  T
Q  318 ggattgattaagactatttt-gttaactatcgtg 350  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| ||||||    
T  9981 ggattgattagggctattttggttaaccatcgtg 10014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1785 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold1785
Description:

Target: scaffold1785; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 356
Target Start/End: Original strand, 1001 - 1329
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  | ||  |        |||||||    
T  1001 gaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacattctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctcctgatcaa--------atataaa 1092  T
Q  118 cgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgt 217  Q
    | |||||| | |||||   ||||||| ||||| |||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  1093 catgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcga-ttagacctaattgtattgttttaataaacatggttagtctaggaatggataatcct 1191  T
Q  218 ttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaag 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||     | |||| ||||||||||||||    
T  1192 ttattagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcgaaggttattataccacctaaggaattaggggctataaccctataagagggtcctaactcaag 1290  T
Q  318 ggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1291 ggattgattcagactattttgttaactattgtggaacta 1329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1785; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 363 - 485
Target Start/End: Original strand, 3 - 119
Alignment:
Q  363 gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgt 462  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||     
T  3 gaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacctgat-----ctctctctctttttc-tttccaaaactatctttattttctg- 95  T
Q  463 ttatttaatttta-tgcaatcaaa 485  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||    
T  96 ttatttacttttattgcaatcaaa 119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 2448 - 2052
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtg 121  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||  |||    |||||||  ||    
T  2448 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctaatgtttattcaattcaattgttcttaatgctttttgcatcctgatcaaatataaatatg 2349  T
Q  122 atttcgcgagaattgatgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttat 221  Q
    ||||   |||||   || |||| || || ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  2348 atttattgagaacgaattactactggccctagatttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttaatctaggaatggataatcctttat 2249  T
Q  222 tagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggat 321  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || || |   ||||||  |||| ||||||||||||    
T  2248 tagtgatattaggttaacgtgctt-aaaccttcgaagattattagaccacctaagaaattacgggctgtaatcctagaagagagtcccaactcaagggat 2150  T
Q  322 tgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagac 410  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||| |     |||||||    ||||| ||| | |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  2149 tgattagggctattttgttaagtatcgtggaattagaaaatcattcataagaataggtgcaatataccaattcggagaacatagatgattctaaagac 2052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 209 - 428
Target Start/End: Original strand, 241434 - 241661
Alignment:
Q  209 gataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcc 308  Q
    ||||||| ||| ||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||    
T  241434 gataatcatttgttagtgatactaggttaatgtgcttaaa-ccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggcctgcagtttgagaagagggtcc 241532  T
Q  309 taactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatg 399  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||     |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  241533 taactcaagggattgattacgactattttgttaactatcgtggaactagagaatcattcataaaaataggtgcagtataccaattaggggaacatagatg 241632  T
Q  400 attcgaaagacatgatctcagctctctct 428  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||||    
T  241633 attcgaaagatctgatctcatatctctct 241661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 56 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 48743 - 48464
Alignment:
Q  56 caatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgcgagaattgatgactattgaccatagct 155  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  | | | |  |  ||| |  ||||||| ||||| |||||    
T  48743 caatctagtttt-attcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgacaccatatagtc-taaatcggtaagattgaatgactactgaccctagct 48646  T
Q  156 tttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttca 255  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||    
T  48645 tacaactttgacctaattgaattgttcaagtaaacaaggttagcctaggaatggataatcgtttatttgtgatattatgttaacattcataaaaccttca 48546  T
Q  256 aagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactatttt 337  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||  || | |||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  48545 aagaatattggatcacctaaggaattagggaccgtaatctgagaagagggtcctacgtcaagggattgattatgactatttt 48464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1809 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1809
Description:

Target: scaffold1809; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 210 - 426
Target Start/End: Original strand, 1 - 224
Alignment:
Q  210 ataatcgtttattagtgatattaagttaacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattagggactttagtttgagaagaaggtcct 309  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| | ||||||    
T  1 ataatcgtttgttagtgatattaggttaacatgcttaaa-ctttcaaagattatttgaccacctaagaaattaggggttgtagtttgagaatagggtcct 99  T
Q  310 aactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaact-----atcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatga 400  Q
    || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  100 aagtcaagggactgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaaca-gtgtagtataccaattaggggaacatatatga 198  T
Q  401 ttcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||    
T  199 ttcgaaagacctgatctcatctctct 224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 137 - 285
Target Start/End: Original strand, 14101 - 14248
Alignment:
Q  137 atgactattgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatcgtttattagtgatattaagtt 236  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  14101 atgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatcctttattagtgatattaggtt 14200  T
Q  237 aacgtacttaaaaccttcaaagattattagaccacctaaggaattaggg 285  Q
    ||||| ||| |||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||    
T  14201 aacgtgctt-aaaccttcgacggttattagatcacctaaggaattaggg 14248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 309 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 7801 - 7599
Alignment:
Q  309 taactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatg 399  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     ||||||    ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  7801 taactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtggaactagaaaatcattcataagaataggtgcaatataccaattaggggaacatagatg 7702  T
Q  400 attcgaaagacatgatctcagctctctctccttatcttttccaaaactatctttatcatctgtttattta-attttatgcaatcaaaactacttcctcgg 498  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||  | || ||||| ||||||    
T  7701 attcgaaagacctgatctca--tctctctcctattctttttcaaaactatctttattttctg-ttatttactttttatgcacaccaacctactgcctcgg 7605  T
Q  499 gcacta 504  Q
    ||||||    
T  7604 gcacta 7599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 101
Target Start/End: Original strand, 1489 - 1572
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatat 101  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  1489 gaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgtatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 1572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 410
Target Start/End: Original strand, 4012 - 4059
Alignment:
Q  363 gaatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagac 410  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4012 gaataggtgcagtataccaattagagaaacatagatgattcgaaagac 4059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 297 - 428
Target Start/End: Original strand, 15433 - 15573
Alignment:
Q  297 agaagaaggtcctaactcaagggattgattaagactattttgttaactatcgtggaacta-----tcattc----gaatatgtgtagtataccaattagg 387  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||     ||||||    ||||| ||| ||||| |||||||||    
T  15433 agaagagggtcctaactcaagggattgattaggactattttgttaactatcgtaaaactagcgactcattcacaagaataggtgcagtatcccaattagg 15532  T
Q  388 ggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctctct 428  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  15533 ggaacatagatgattcgaaagacctaaactcatctctctct 15573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 101
Target Start/End: Original strand, 24568 - 24647
Alignment:
Q  22 catgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatggtttttatat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24568 catgttgttgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 24647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 14344 - 14282
Alignment:
Q  364 aatatgtgtagtataccaattaggggaacatagatgattcgaaagacatgatctcagctctct 426  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14344 aataggtgcagtataccaattaggggaacatcgatgattcgaaagacctgatctcatctctct 14282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 49 - 1
Alignment:
Q  23 atgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttatt 71  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49 atgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 81
Target Start/End: Original strand, 31453 - 31515
Alignment:
Q  18 gaaacatgttgttgtgaaactttatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaatt 81  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  31453 gaaacatgtggttgtgaaactatattgcttatgaatatcaatctag-ttttattcaattcaatt 31515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0996 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0996
Description:

Target: scaffold0996; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 469 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 1842 - 1796
Alignment:
Q  469 aattttatgcaatcaaaactacttcctcgggcactagaataatttac 515  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  1842 aattttatgccatcaaaactactggctcgggcactaaaataatttac 1796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University