View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15712_low_21 (Length: 340)

Name: NF15712_low_21
Description: NF15712
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15712_low_21
NF15712_low_21
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (11-309)||(11497273-11497571)
chr4 (11-309)||(13822171-13822470)
chr4 (11-309)||(15253605-15253904)
chr4 (11-309)||(42710392-42710690)
chr4 (11-309)||(22110216-22110515)
chr4 (24-309)||(18291274-18291555)
chr4 (11-309)||(38426000-38426297)
chr4 (26-301)||(18082134-18082409)
chr4 (11-309)||(10630003-10630301)
chr4 (71-309)||(15348535-15348771)
chr4 (24-302)||(3353913-3354191)
chr4 (36-305)||(45234914-45235181)
chr4 (72-306)||(17485623-17485854)
chr4 (72-213)||(15260813-15260954)
chr4 (72-213)||(14686497-14686635)
chr4 (72-192)||(15864879-15864996)
chr4 (72-213)||(10649760-10649898)
chr4 (261-309)||(15864766-15864814)
[»] chr3 (48 HSPs)
chr3 (11-309)||(6814127-6814425)
chr3 (11-309)||(10603131-10603429)
chr3 (11-309)||(7599612-7599911)
chr3 (11-302)||(9361628-9361919)
chr3 (11-309)||(11946672-11946971)
chr3 (11-309)||(12187734-12188033)
chr3 (11-309)||(12194148-12194447)
chr3 (23-309)||(22164981-22165269)
chr3 (11-309)||(10146268-10146568)
chr3 (11-309)||(37941636-37941935)
chr3 (11-309)||(13188076-13188375)
chr3 (11-309)||(15644346-15644645)
chr3 (11-309)||(15557601-15557903)
chr3 (11-309)||(10160831-10161134)
chr3 (11-309)||(16374136-16374438)
chr3 (11-309)||(4369947-4370245)
chr3 (117-309)||(13505272-13505464)
chr3 (96-309)||(16449477-16449692)
chr3 (91-309)||(16654987-16655206)
chr3 (24-309)||(10547545-10547827)
chr3 (11-289)||(13096975-13097253)
chr3 (71-289)||(13089528-13089746)
chr3 (72-301)||(12777241-12777470)
chr3 (89-309)||(13689914-13690133)
chr3 (89-309)||(13694159-13694378)
chr3 (24-309)||(12160878-12161148)
chr3 (36-291)||(20157301-20157553)
chr3 (36-309)||(17387020-17387287)
chr3 (24-309)||(11866054-11866325)
chr3 (72-306)||(3246236-3246463)
chr3 (36-291)||(1991999-1992246)
chr3 (36-213)||(13600345-13600520)
chr3 (11-73)||(16449417-16449479)
chr3 (72-213)||(13136895-13137036)
chr3 (72-213)||(15945980-15946121)
chr3 (72-213)||(20560376-20560517)
chr3 (72-213)||(20562684-20562825)
chr3 (72-309)||(3339932-3340162)
chr3 (72-213)||(20564992-20565133)
chr3 (72-213)||(13064315-13064453)
chr3 (74-204)||(14349169-14349296)
chr3 (72-213)||(14446470-14446608)
chr3 (72-309)||(13196166-13196396)
chr3 (72-192)||(15629691-15629811)
chr3 (150-213)||(8687129-8687192)
chr3 (143-197)||(12390449-12390503)
chr3 (261-309)||(15629866-15629914)
chr3 (261-305)||(15945892-15945936)
[»] chr1 (10 HSPs)
chr1 (11-309)||(27046132-27046430)
chr1 (11-302)||(20236732-20237023)
chr1 (11-309)||(21799322-21799621)
chr1 (11-309)||(17095260-17095560)
chr1 (11-309)||(3989352-3989650)
chr1 (24-241)||(52939290-52939504)
chr1 (36-281)||(8652334-8652573)
chr1 (42-309)||(19876366-19876628)
chr1 (72-309)||(8948280-8948512)
chr1 (72-213)||(21785177-21785315)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (11-309)||(21955332-21955630)
chr8 (11-309)||(21381349-21381648)
chr8 (11-309)||(21099450-21099748)
chr8 (11-309)||(23910697-23910997)
chr8 (11-309)||(8313724-8314023)
chr8 (11-309)||(8323507-8323809)
chr8 (11-309)||(17619998-17620296)
chr8 (11-309)||(20039648-20039946)
chr8 (11-309)||(21854439-21854737)
chr8 (24-309)||(21942113-21942395)
chr8 (40-306)||(20711727-20711993)
chr8 (24-309)||(19365288-19365560)
chr8 (24-309)||(16419293-16419567)
chr8 (72-213)||(20001670-20001808)
chr8 (72-213)||(22101764-22101905)
chr8 (72-309)||(22369222-22369452)
chr8 (72-213)||(19766900-19767038)
chr8 (72-213)||(21830386-21830527)
chr8 (72-213)||(22034260-22034401)
chr8 (72-213)||(22100360-22100501)
chr8 (36-140)||(20375215-20375317)
chr8 (72-213)||(11347664-11347802)
chr8 (72-176)||(23674939-23675040)
chr8 (171-309)||(20375071-20375209)
chr8 (261-309)||(19766808-19766856)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (11-309)||(23711336-23711634)
chr5 (11-309)||(20596488-20596787)
chr5 (11-309)||(20602774-20603073)
chr5 (11-309)||(20609065-20609364)
chr5 (11-302)||(24939793-24940084)
chr5 (11-309)||(15734791-15735090)
chr5 (11-298)||(20791375-20791662)
chr5 (11-309)||(20621419-20621718)
chr5 (11-309)||(23747307-23747606)
chr5 (11-309)||(24953832-24954132)
chr5 (11-309)||(18072157-18072456)
chr5 (24-309)||(24219091-24219374)
chr5 (11-309)||(23601303-23601601)
chr5 (72-309)||(20445550-20445788)
chr5 (24-309)||(21281591-21281868)
chr5 (36-309)||(20574720-20574986)
chr5 (36-235)||(22947769-22947964)
chr5 (72-213)||(26847022-26847163)
chr5 (72-213)||(22854929-22855067)
chr5 (72-213)||(25007508-25007649)
chr5 (72-213)||(18484916-18485054)
chr5 (72-213)||(30760357-30760495)
chr5 (72-213)||(22318222-22318359)
chr5 (72-213)||(25116872-25117010)
chr5 (72-213)||(25175963-25176101)
chr5 (122-213)||(20439084-20439172)
chr5 (261-309)||(22854836-22854884)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (11-309)||(12275-12572)
chr2 (11-309)||(25356768-25357067)
chr2 (11-307)||(116803-117099)
chr2 (11-309)||(22045319-22045618)
chr2 (11-309)||(24795943-24796242)
chr2 (11-309)||(16774907-16775207)
chr2 (11-309)||(17589664-17589964)
chr2 (96-309)||(22664343-22664558)
chr2 (11-309)||(27626850-27627136)
chr2 (11-309)||(25145424-25145722)
chr2 (36-306)||(24517005-24517275)
chr2 (81-301)||(24820750-24820971)
chr2 (36-306)||(24501357-24501620)
chr2 (36-309)||(25371646-25371913)
chr2 (36-309)||(25366440-25366710)
chr2 (11-73)||(22664556-22664618)
chr2 (72-213)||(27630867-27631008)
chr2 (72-213)||(27769521-27769662)
chr2 (101-213)||(25368433-25368542)
chr2 (72-213)||(24170683-24170821)
chr2 (75-213)||(26192348-26192483)
chr2 (72-192)||(23160090-23160210)
chr2 (72-192)||(23571347-23571467)
chr2 (72-213)||(23647286-23647424)
chr2 (154-213)||(25338911-25338970)
chr2 (158-210)||(24320543-24320595)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (11-309)||(22166208-22166507)
chr6 (11-309)||(15698813-15699112)
chr6 (11-298)||(22062164-22062451)
chr6 (11-309)||(22243070-22243369)
chr6 (11-309)||(24855903-24856202)
chr6 (11-309)||(20016887-20017186)
chr6 (11-309)||(20169501-20169799)
chr6 (11-309)||(15850639-15850939)
chr6 (11-309)||(22767774-22768076)
chr6 (11-309)||(25625025-25625322)
chr6 (26-309)||(18011124-18011406)
chr6 (11-309)||(18853273-18853569)
chr6 (11-301)||(18447484-18447770)
chr6 (36-306)||(29594963-29595233)
chr6 (36-309)||(25632033-25632302)
chr6 (89-309)||(21561165-21561385)
chr6 (73-309)||(30672449-30672680)
chr6 (121-309)||(18188351-18188530)
chr6 (73-188)||(25962222-25962334)
chr6 (73-188)||(25966869-25966981)
chr6 (73-188)||(25962702-25962814)
chr6 (73-188)||(25967349-25967461)
chr6 (11-130)||(18185144-18185262)
chr6 (72-213)||(8724435-8724573)
chr6 (72-213)||(11218975-11219113)
chr6 (73-139)||(19586267-19586332)
chr6 (158-213)||(23518557-23518612)
chr6 (261-309)||(11218884-11218932)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (11-309)||(23514325-23514623)
chr7 (11-309)||(14550354-14550652)
chr7 (11-309)||(8717122-8717421)
chr7 (11-309)||(16150141-16150441)
chr7 (11-309)||(13673113-13673412)
chr7 (11-309)||(18593925-18594224)
chr7 (11-309)||(18617460-18617759)
chr7 (11-309)||(9582171-9582456)
chr7 (11-309)||(539424-539716)
chr7 (11-309)||(10432403-10432699)
chr7 (24-309)||(13355496-13355777)
chr7 (24-309)||(16466289-16466573)
chr7 (89-309)||(13657180-13657399)
chr7 (36-301)||(20107558-20107819)
chr7 (26-309)||(12566278-12566551)
chr7 (24-309)||(16531364-16531635)
chr7 (24-309)||(16634027-16634298)
chr7 (36-309)||(48802539-48802807)
chr7 (141-306)||(11927698-11927863)
chr7 (75-309)||(4311998-4312227)
chr7 (36-291)||(8782684-8782933)
chr7 (72-213)||(18286973-18287114)
chr7 (72-213)||(5396485-5396623)
chr7 (72-213)||(16326489-16326627)
chr7 (72-213)||(14222422-14222563)
chr7 (72-213)||(27290705-27290846)
chr7 (72-213)||(824995-825133)
chr7 (72-213)||(4792138-4792276)
chr7 (72-213)||(15065141-15065282)
chr7 (72-213)||(15917486-15917624)
chr7 (72-187)||(15207289-15207401)
chr7 (261-309)||(824903-824951)
chr7 (261-309)||(15207471-15207519)
chr7 (261-309)||(15917668-15917716)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (11-309)||(12744-13042)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (11-309)||(122627-122925)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (11-309)||(295-595)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (11-309)||(8981-9275)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (27-311)||(252545-252828)
scaffold0004 (89-309)||(355241-355453)
scaffold0004 (261-309)||(18872-18920)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (27-309)||(7269-7550)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (26-309)||(115904-116186)
scaffold0020 (26-309)||(120208-120490)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (129-302)||(24851-25024)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (11-309)||(17204-17502)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (11-306)||(4270-4565)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (36-306)||(35787-36058)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (24-309)||(101-383)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (72-309)||(51213-51450)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (72-309)||(10678-10911)
[»] scaffold1941 (1 HSPs)
scaffold1941 (36-306)||(923-1193)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (24-309)||(59303-59578)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (26-309)||(371-641)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (36-309)||(11651-11918)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (36-309)||(233480-233747)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (24-241)||(2956-3170)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (166-309)||(1-146)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (102-301)||(44715-44914)
scaffold0037 (102-301)||(52104-52303)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (36-309)||(928-1195)
[»] scaffold0374 (1 HSPs)
scaffold0374 (123-309)||(9449-9637)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (36-306)||(32238-32502)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (81-301)||(18916-19137)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (74-309)||(10416-10644)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (141-309)||(90533-90700)
scaffold0032 (24-91)||(90695-90762)
[»] scaffold0402 (1 HSPs)
scaffold0402 (87-309)||(7055-7272)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (227-302)||(7843-7918)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (124-307)||(13821-13999)
scaffold0278 (124-307)||(17155-17333)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (72-213)||(12165-12303)
[»] scaffold1225 (1 HSPs)
scaffold1225 (36-220)||(957-1141)
[»] scaffold0566 (2 HSPs)
scaffold0566 (72-213)||(1969-2107)
scaffold0566 (261-309)||(1874-1922)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (72-213)||(161197-161336)
scaffold0011 (111-210)||(171526-171621)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (72-309)||(11792-12025)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (72-213)||(29859-29997)
[»] scaffold0384 (2 HSPs)
scaffold0384 (72-213)||(9932-10070)
scaffold0384 (261-309)||(9841-9889)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (72-213)||(22862-23000)
[»] scaffold0656 (1 HSPs)
scaffold0656 (72-192)||(3241-3358)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (72-192)||(151-268)
[»] scaffold0577 (1 HSPs)
scaffold0577 (88-213)||(5954-6076)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (122-213)||(22228-22319)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (122-213)||(8097-8185)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 11497273 - 11497571
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11497273 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 11497372  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11497373 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 11497472  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11497473 gaatcaaccaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 11497571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13822470 - 13822171
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13822470 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 13822371  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13822370 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 13822271  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13822270 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 13822171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15253904 - 15253605
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15253904 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 15253805  T
Q  111 caactttgtgttttt-ctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtaca 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15253804 caactttgtgttttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtaca 15253705  T
Q  210 agaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15253704 agaatcaaccaaataagaggagacaattaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 15253605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 42710392 - 42710690
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42710392 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgtgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 42710491  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42710492 caactttgtgtttttcttattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaa 42710591  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42710592 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgccatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 42710690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22110515 - 22110216
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22110515 ttatactactggcgctttgagagtctttaaaggttaatgcaccactaagattagaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 22110416  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22110415 caactttgtgtttttctcattggagaatcttattcactttaaaacaagacgtggttatatcaagaaggcttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaa 22110316  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110315 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatgttttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 22110216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18291555 - 18291274
Alignment:
Q  24 actttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttt 123  Q
    ||||||||||| |||||| || || | |||| ||| |||| || || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18291555 actttgagaatttttaaatgtcaacgtaccagtaaaattagaatgcatttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaagcaactt-gtgttt 18291457  T
Q  124 ttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaat 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |    
T  18291456 ttctcattggagaattt-attcacgttaaaacaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacaaccaatt 18291358  T
Q  224 aagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
     |||||||| ||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18291357 tagaggagataat-aaaaatttatgtcatgat-ttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaa 18291274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 38426297 - 38426000
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||||| |  | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  38426297 ttatactacttttactttgagaatttttaaaggtcagcgtaccactaatattagaacgcatttccttaaaatacatatccatacatttactcaagggaag 38426198  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  38426197 caactt-gtgcatttctcattggagaattt-attcactttaaaacaagatgtgggtatatcagaaaaacttaaaacacaagagtttactttcatatacaa 38426100  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||  || ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  38426099 gaaataaccaattaagaggagacaataaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaaacaagctacttaaccatgcctttcacaataaaacagaacaa 38426000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 301
Target Start/End: Original strand, 18082134 - 18082409
Alignment:
Q  26 tttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttttt 125  Q
    ||||||||| ||||||||| || | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  18082134 tttgagaatttttaaaggtcaacgtaccactaatattagaacgcatttccttaaaatacctttccatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcattt 18082232  T
Q  126 ctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataa 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| || ||| |||    
T  18082233 ctcattggagaattt-attcactttaaaacaagatgtgggtatatcaggaaaacttaaagcacaagagtttactttcatgtacaggaattaaccaattaa 18082331  T
Q  226 gaggagacaatgaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaa-ttagctacttaaccatgccttttacaataaaa 301  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18082332 gaggagacaataaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaaacaaagctacttaaccatgccttttacaataaaa 18082409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10630301 - 10630003
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||   ||||||||| | ||||||||| || | |||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  10630301 ttatactacttttactttgagagtttttaaaggtcaacgtaccactaaaattaaaacatatttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaag 10630202  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  10630201 caactta-tgtttttctcattggagaattgtattcactttgaagcaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaatacaagagttcactttcatgtacaa 10630103  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgat-attttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||  || ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  10630102 gaaataaccaattaagaggagacaataaaaaatttatgtcatgatgtttttcaataaaaacaagctacttaaccatgtctttcacaataaaacagaacaa 10630003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 71 - 309
Target Start/End: Original strand, 15348535 - 15348771
Alignment:
Q  71 tttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatat 170  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15348535 tttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaagcaactt-gtgtttttctcattggagaattt-agtcactttaaaacaagatgtgggtatat 15348632  T
Q  171 caagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaa 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  15348633 caagaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaataaccaattaagaggagacaat-aaaaatttatgtcatgatatttttcaacaaaaa 15348731  T
Q  270 ttagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
      |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15348732 gaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaa 15348771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 3354191 - 3353913
Alignment:
Q  24 actttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttt 123  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| || || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  3354191 actttgagaatttttaaaggtcaatgtaccactaatattagaatgcatttccttaaaatacctatccatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcat 3354093  T
Q  124 ttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaat 223  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  || ||| |    
T  3354092 ttctcattggataattt-attcactttaaaacaagatgtgggtatatcaggaaaacttaaaacacaagagtttattttcatgtacaagaaataaccaatt 3353994  T
Q  224 aagaggagacaat-gaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaac 302  Q
    |||||||||| ||  |||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3353993 aagaggagacgataaaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaaacaagctacttaaccatgcctttcacaataaaac 3353913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 305
Target Start/End: Original strand, 45234914 - 45235181
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgttt-ccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattgga 134  Q
    ||||||||| || | |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  45234914 tttaaaggtcaacgtaccactaaaattagaacgcgttttccttaaaatacctattcatacacttacttaagggaaacaactt-gtgcttttctcattgga 45235012  T
Q  135 gaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaa-gacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagac 233  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  || | |||||||||    
T  45235013 gaattt-attcacattaaaacaaggtgtgggtatatcaagaaagacttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacaacaaatttagaggagac 45235111  T
Q  234 aatgaaaattttgtgtcatgatattttcaat-aaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaa 305  Q
    ||  |||| ||| ||||||   ||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||  |||| |||||||    
T  45235112 aa-caaaaatttatgtcat--aattttcaataaaaaataagatacttaatcatgcctttcgcaattaaacaaa 45235181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 306
Target Start/End: Original strand, 17485623 - 17485854
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  17485623 ttccttaaaatacttattcatacaattactcaagggatgcaactc-gtgcttttctcattggaaaattt-attcacaataaaacatgatgtgggtatatc 17485720  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgc-tttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaat 270  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||  || | |||||||||||  |||| ||| |||||| || |||||||||||||     
T  17485721 aagaaaacttaaaacacaagagttcacttttcatgtacaagaaacaactaatttagaggagacaa-caaaaatttatgtcataat-ttttcaataaaaac 17485818  T
Q  271 tagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaa 306  Q
     ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17485819 aagctatttaatcatgcctttcacaataaaacaaaa 17485854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 15260813 - 15260954
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||  ||||||| |||| |    
T  15260813 ttccttaaaataccccttcatacacttactcaaggattgcaactaggtgtttttctcattggagaattaatttcacaataaaacttgatgtggatatagc 15260912  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  15260913 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 15260954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 14686497 - 14686635
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||   ||||||  ||  ||||||||||||||||||||   |||  ||||||  |||||||||||| |    
T  14686497 ttccttaaaatacctattcatacacttacttaaggattgcaactaggttcttttctcattggagaatttt---cacaataaaacttgatgtgggtatagc 14686593  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  14686594 aagaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 14686635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15864996 - 15864879
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  15864996 ttccttaaaatacctattcatacacttacttaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 15864900  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaaga 192  Q
    ||||| ||||| |||||||||    
T  15864899 aagaacacttacaacacaaga 15864879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10649898 - 10649760
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||  ||||||||| ||      
T  10649898 ttccttaaaatacctactcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtgtagt 10649802  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  10649801 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 10649760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15864814 - 15864766
Alignment:
Q  261 caataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15864814 caataaaaacaagctgcttattcatgccttttacaataaaacaaaacaa 15864766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 48)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 6814425 - 6814127
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6814425 ttatactactggcgctttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattagaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 6814326  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6814325 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 6814226  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6814225 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 6814127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 10603131 - 10603429
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10603131 ttatactacttgcactttgagaatctttaaaggttaatgtaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 10603230  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10603231 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 10603330  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10603331 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 10603429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 7599911 - 7599612
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7599911 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 7599812  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7599811 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 7599712  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7599711 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 7599612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 302
Target Start/End: Original strand, 9361628 - 9361919
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9361628 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 9361727  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9361728 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 9361827  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaac 302  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9361828 gaatcaaccaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgtcttttacaataaaac 9361919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 11946971 - 11946672
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11946971 ttatactactgacactttgagaatctttaaaggttaatgcaccgctaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 11946872  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgc-tttcatgtaca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  11946871 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttcatgtata 11946772  T
Q  210 agaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11946771 agaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 11946672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 12187734 - 12188033
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12187734 ttatactactggcgctttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgtgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 12187833  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12187834 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 12187933  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatg-aaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12187934 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaaattttgtgtcatgatatttttaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacagaacaa 12188033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 12194148 - 12194447
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12194148 ttatactactggcgctttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaatgtgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 12194247  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12194248 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 12194347  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12194348 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatatttttaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacagaacaa 12194447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 23 - 309
Target Start/End: Original strand, 22164981 - 22165269
Alignment:
Q  23 cactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaacttt-gtgt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22164981 cactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgtgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaacttttgtgt 22165080  T
Q  122 ttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22165081 ttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaaaacttagaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaa 22165180  T
Q  222 ataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165181 ataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 22165269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10146568 - 10146268
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10146568 ttatactactggcgctttgagaatttttaaaggttaatgcaccactaagattagaatgtgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 10146469  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10146468 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 10146369  T
Q  211 gaatcaatc-aaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaaca 308  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10146368 gaatcaatcaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcttgattttttcaataaaaattagctacttaactatgccttttacaataaaacagaaca 10146269  T
Q  309 a 309  Q
    |    
T  10146268 a 10146268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 37941935 - 37941636
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37941935 ttatactactggcgctttgagaatttttaaaggttaatgcaccactaagattagaacgcgttttcttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 37941836  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37941835 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 37941736  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaa-attttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37941735 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaattttttgtgtcatgatatttttaataaaaattagctacttaaacatgcctttcacaataaaacgaaacaa 37941636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 13188076 - 13188375
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13188076 ttatactactggcgctttgagaatttttaaaggttaatgcaccactaagattagaatgtgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 13188175  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13188176 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatatcaagaagacttaaaacacaagaatttgctttcatgtacaa 13188275  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  13188276 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgattttttcaataaaaattaactacttaactatgccttttacaataaaacagaacaa 13188375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15644645 - 15644346
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15644645 ttatactactggcgctttgagaatttttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgtgtttccttaaattacctattcatacacttactcaagggaag 15644546  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15644545 caactttgtgtttttctcattgaagaactttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaaggcttaaaacacaagagtttgctttcgtgtacaa 15644446  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15644445 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatgttttcaataaaaattagctacttaatcatgccttttacaataaaacaaaacaa 15644346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 15557601 - 15557903
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15557601 ttatactactggcgctttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgtgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 15557700  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagact---taaaacacaagagtttgctttcatgta 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15557701 caactttgtgtttttctcattgaagaactttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagactaaaaaaaacacaagagtttgctttcatgta 15557800  T
Q  208 caagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaa 306  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  15557801 caagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcacgatattttcaataaaaattagctacttaaacatgcctttcacaataaaacgaaa 15557900  T
Q  307 caa 309  Q
    |||    
T  15557901 caa 15557903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 10160831 - 10161134
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10160831 ttatactactggcgctttgagaatttttaaaggttaatgcaccactaagattagaatgtgtttccttaaaatacctattcattcatttactcaagggaag 10160930  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10160931 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 10161030  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatatt----ttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaa 305  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  10161031 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcttgatttttttcttcaataaaaattagctacttaactatgccttttacaataaaacaga 10161130  T
Q  306 acaa 309  Q
    ||||    
T  10161131 acaa 10161134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 16374136 - 16374438
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16374136 ttatactactggcgctttgagaatttttaaaggttaatgcaccactaagattagaatgtgtttccttaaaatacctattcatacattcactcaagggaag 16374235  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16374236 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatattaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 16374335  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa--ttttgtgtcatga--tattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaa 306  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16374336 gaataaacaaaataagaggagacaatgaagattttttttgtcatgatttttttttaataaaaattagctacttaactatgccttttacaataaaacaaaa 16374435  T
Q  307 caa 309  Q
    |||    
T  16374436 caa 16374438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4370245 - 4369947
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||||| || | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  4370245 ttatactacttttactttgagaatttttaaaggtcaacgtaccactaaaattagaacgcatttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaag 4370146  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4370145 caactttgtgtttttctcattggagaattt-attcacgttaaaacaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaa 4370047  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4370046 gaattaaccaattaagaggagacaataaaaattttgtgtcatgatatttttcaataaaaataagctacttaaccatgcctttcacaataaaacagaacaa 4369947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 117 - 309
Target Start/End: Original strand, 13505272 - 13505464
Alignment:
Q  117 tgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatca 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13505272 tgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaagaatca 13505371  T
Q  217 atcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13505372 atcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 13505464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 96 - 309
Target Start/End: Original strand, 16449477 - 16449692
Alignment:
Q  96 tttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagag-t 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16449477 tttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtt 16449576  T
Q  195 ttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgcctttta 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449577 ttgctttcatgtacaagaatcaatcgaataggaggagacaatgaaaatttttatgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgcctttta 16449676  T
Q  294 caataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||||||||||||    
T  16449677 caataaaacaaaacaa 16449692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 91 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16655206 - 16654987
Alignment:
Q  91 atacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16655206 atacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatatcaagaagacttaaaacacaa 16655107  T
Q  191 gagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatg-aaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgcct 289  Q
    || |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16655106 gaatttgcttttatgtacaagaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaaattttgtgtcatgatttttttaataaaaattagctacttaactatgcct 16655007  T
Q  290 tttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16655006 tttacaataaaacaaaacaa 16654987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 309
Target Start/End: Original strand, 10547545 - 10547827
Alignment:
Q  24 actttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttt 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | || ||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  10547545 actttgagaatttttaaaggttaacgtactactaaaattagaacgcatttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaac-ttgtgcat 10547643  T
Q  124 ttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagag-tttgctttcatgtacaagaatcaatcaaa 222  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | |     
T  10547644 ttctcattggag-gttttattcactttaaaacaagatgcgggtatatcaggagaacttaaaacacaagagctttactttcatgtacaagaaacaa-ctag 10547741  T
Q  223 taagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  10547742 taagaggagacaataaaaattttatgtcatgat-ttctcaataaaaacaagctacttaatcatgtctttcacaataaaacaaaacaa 10547827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 13097253 - 13096975
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||   ||||||||| | ||| ||||| || | |||||||| ||||||||   ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  13097253 ttatactacttttactttgagagtttttgaaggtcaacgtaccactaaaattaaaacatatttccttaaaatacttattcatacacttactcaagggaag 13097154  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  13097153 caactt-gtgtttttctcattggagaattgtattcactttgaagcaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaatacaagagttcactttcatgtacaa 13097055  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaattagctacttaaccatgcct 289  Q
    |||  || ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13097054 gaaataaccaattaagaggagacaataaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaaaaaagctacttaaccatgcct 13096975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 71 - 289
Target Start/End: Original strand, 13089528 - 13089746
Alignment:
Q  71 tttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatat 170  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13089528 tttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaagcaactt-gtgtttttctcattggagaattgtattcactttgaagcaagatgtgggtatat 13089626  T
Q  171 caagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaa 269  Q
    |||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  13089627 caagaaaacttaaaatacaagagttcactttcatgtacaagaaataaccaattaagaggagacaataaaaaatttatgtcatgatagttttcaataaaaa 13089726  T
Q  270 ttagctacttaaccatgcct 289  Q
      ||||||||||||||||||    
T  13089727 caagctacttaaccatgcct 13089746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 301
Target Start/End: Original strand, 12777241 - 12777470
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  12777241 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattt-attcactttaaaacaagatgtgggtatatt 12777339  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaat 270  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  12777340 aagaaaacttaaagcacaagagtttactttcatgtacaagaattaaccaattaagatgagacaataaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaaat 12777439  T
Q  271 tagctacttaaccatgccttttacaataaaa 301  Q
     |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12777440 aagctacttaaccatgcttttcacaataaaa 12777470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 89 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13690133 - 13689914
Alignment:
Q  89 tcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacac 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  13690133 tcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgtatttctcattggagaattt-attcattttgaaacaagatgtgggtatatcaagaaaactaaaaatac 13690036  T
Q  189 aagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatat-tttcaataaaaattagctacttaaccatgc 287  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||| | ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  13690035 aagagttcactttcatgtacaagaaacgaccaactaagaggagacaataaaaattatatgtcatgatttatttcattaaaaacaagctacttaaccatgc 13689936  T
Q  288 cttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13689935 cttttacaataaaacaaaacaa 13689914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 89 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13694378 - 13694159
Alignment:
Q  89 tcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacac 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |     
T  13694378 tcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgtatttctcattggagaattt-attcattttgaaacaagatgtgggtatatcaagaaaactaaaaatat 13694281  T
Q  189 aagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatat-tttcaataaaaattagctacttaaccatgc 287  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  13694280 aagagttcactttcatgtacaagaaacgaccaactaagaggagacaataaaaattttatgtcatgatttatttcattaaaaacaagctacttaaccatgc 13694181  T
Q  288 cttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13694180 cttttacaataaaacaaaacaa 13694159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 309
Target Start/End: Original strand, 12160878 - 12161148
Alignment:
Q  24 actttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttt 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  12160878 actttgagaatttttaaaggttaacataccactaaaattagaacgcatttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgaat 12160976  T
Q  124 ttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaat 223  Q
    ||            |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | | |||    
T  12160977 tt------------ttttattcactttaaaacaagaagtgggtatatcaggagaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacga-ccaat 12161063  T
Q  224 aagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12161064 aagaggagacaataaaaaatttatgtcatgat-ttttcaataaaaacaagctacttagtcatgcctttcacaataaaacaaaacaa 12161148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 291
Target Start/End: Original strand, 20157301 - 20157553
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 135  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| || | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20157301 tttaaacgttaacgtaccactaaaattagaatgtgtttccttaaagtacctattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcttttctcattggag 20157399  T
Q  136 aattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa 235  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||  || ||||||||| |||    
T  20157400 aattt-attcacattaaaacaagatgtaggtatatcaagaaaacttaaaacacaagagttcacttttatgtacaagaaacaactaattaagaggag-caa 20157497  T
Q  236 tgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttt 291  Q
      |||| ||| |||||| || |||| |  |||||  |||||||||| |||||||||    
T  20157498 ataaaaatttatgtcataattttttaataaaaaacaagctacttaatcatgccttt 20157553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 17387287 - 17387020
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 135  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| |||| | || ||||||||||| ||||||||| || || |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17387287 tttaaaggttaacgtaccactaaaattagaacgtgctttcttaaaatacctattcatacacttgcttaagggatgcaactt-gtgcttttctcattggag 17387189  T
Q  136 aattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa 235  Q
    ||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||    
T  17387188 aatt--attcacaataatacaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggatacaa 17387091  T
Q  236 tgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
      |||| ||| ||||||   ||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||    
T  17387090 -caaaaatttatgtcat--aattttcaataaaaacaagctacttaatcatgtctttctcaattaaacaaaacaa 17387020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 11866325 - 11866054
Alignment:
Q  24 actttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttt 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  11866325 actttgagaatttttaaaggttaacataccactaaaattagaacacatttccttaaaatgcctattcatacatttactcaagggaagcaac-ttgtgcat 11866227  T
Q  124 ttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaat 223  Q
    ||            ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| | | | |||    
T  11866226 tt------------ttttattcactttaaaacaagatgtgggtatataaggagaacttaaaacacaagaatttacgttcatgtacaagaaacga-ccaat 11866140  T
Q  224 aagaggagacaat-gaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    || ||||||||||  ||||  || | ||||||| |||||||||||||  || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11866139 aaaaggagacaataaaaaaaattatttcatgat-ttttcaataaaaaagaggtacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaa 11866054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 306
Target Start/End: Original strand, 3246236 - 3246463
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  ||||  ||||||||    
T  3246236 ttccttaaaatacctattcatacacttgctcaaggggtgcaacta-gtgcttttctcattggagaattt-attcacaataaaacttgatgcaggtatatc 3246333  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaatt 271  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||  ||||||   ||||||   ||||| ||||||||      
T  3246334 aagaaaacttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagacaacaaaaatt---tgtcat--aattttgaataaaaaca 3246428  T
Q  272 agctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaa 306  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  3246429 agctacttaatcatgcctttcgcaataaaacaaaa 3246463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1992246 - 1991999
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 135  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| |||| | | |||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1992246 tttaagggttaatgtaccactaaaattagaacgtgct-ccttaaaatacctattcatacaattgctcaaaggatgcaactt-gtgattttctcattggag 1992149  T
Q  136 aattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa 235  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||  || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  1992148 aatt--attcacaataaaacaagatgtgggtatagaaagagtacataaa-cacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagacaa 1992052  T
Q  236 tgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttt 291  Q
      |||| ||| ||||||   ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  1992051 -caaaaatttatgtcat--aattttcaataaaaacaagctacttaatcatgccttt 1991999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13600520 - 13600345
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 135  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||| |||| | | |||||||||||| ||||||||| || || |||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  13600520 tttaagggttaatgtacctctaaaattataacgtgct-ccttaaaatacctattcatacacttgcttaagggatgcaactttgtgcttttctcattagag 13600422  T
Q  136 aattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |  |  ||||||||||||||||    
T  13600421 aa-tttattcacaataaaacaagatgtgggtatatcaagaacacttaaaacataaaaaatcactttcatgtacaagaa 13600345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 16449417 - 16449479
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgttt 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16449417 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgtaccactaagattaaaacgcgttt 16449479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 13136895 - 13137036
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  13136895 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgtttttctcattggagaattaatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 13136994  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  13136995 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 13137036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15946121 - 15945980
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  15946121 ttccttaaaatacctactcatacacttactcaaggattgcaactaggtgtttttctcattggagaatttatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 15946022  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  15946021 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 15945980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20560517 - 20560376
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  20560517 ttccttaaaatacctactcatacacttactcaaggattgcaactaggtgtttttctcattggagaatttatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 20560418  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  20560417 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 20560376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20562825 - 20562684
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  20562825 ttccttaaaatacctactcatacacttactcaaggattgcaactaggtgtttttctcattggagaatttatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 20562726  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  20562725 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 20562684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 309
Target Start/End: Original strand, 3339932 - 3340162
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  3339932 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 3340028  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaatt 271  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  |||||||||||||||| | | ||     || |||||||  |||| ||| |||||| |||    |||||||||      
T  3340029 aagaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgacca---ttgaagagacaacaaaaaatttatgtcataata-aaacaataaaaaca 3340124  T
Q  272 agctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3340125 agctgcttaatcatgccttttacaataaaacaaaacaa 3340162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20565133 - 20564992
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  20565133 ttccttaaaatacctactcatacacttactcaaggattgcaactaggtgtttttctcattggagaatttatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 20565034  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |   |||||||||||||||    
T  20565033 aagaatacttataacacaagaaatcattttcatgtacaagaa 20564992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13064453 - 13064315
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||| ||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  13064453 ttccttaaaatacctactcatacatttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggataatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 13064357  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  13064356 aagaaaacttaaaacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 13064315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 204
Target Start/End: Original strand, 14349169 - 14349296
Alignment:
Q  74 ccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaa 173  Q
    |||||||||||  || |||||| || ||||||||| ||||||   || |||| |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14349169 ccttaaaatacatatccatacaattgctcaagggatgcaactca-tgcttttttcattggagaatt--attcacaataaaacaagatgtgggtatatcaa 14349265  T
Q  174 gaagacttaaaacacaagagtttgctttcat 204  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  14349266 gaatacttaaaacacaagagttcactttcat 14349296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 14446470 - 14446608
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||| |||| |||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  14446470 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttgtcattggagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 14446566  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  14446567 aagaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 14446608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 309
Target Start/End: Original strand, 13196166 - 13196396
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||| |||||||||| |||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  13196166 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattagagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 13196262  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaatt 271  Q
    ||||| ||||  |||||||||  |  |||||||||||||||| | | ||     || |||||||  |||| ||| |||||| |||   | ||||||||      
T  13196263 aagaacacttgcaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgacca---ttgaagagacaacaaaaaatttatgtcataataaaat-aataaaaaga 13196358  T
Q  272 agctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13196359 agctacttattcatgccttttacaataaaacaaaacaa 13196396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 192
Target Start/End: Original strand, 15629691 - 15629811
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   |||||   ||||||||||||||||||||||   |||||  |||||   |||||||||||| |    
T  15629691 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaaccaggtgtttttctcattggagaattaatttcacaataaaaattgatgtgggtatagc 15629790  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaaga 192  Q
    ||||| ||||| |||||||||    
T  15629791 aagaatacttataacacaaga 15629811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 213
Target Start/End: Original strand, 8687129 - 8687192
Alignment:
Q  150 taaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |  |||| |||||||||||    
T  8687129 taaaacatgatgtgggtatatcaagaacactcaaaacacaagaaatcacttttatgtacaagaa 8687192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 197
Target Start/End: Original strand, 12390449 - 12390503
Alignment:
Q  143 ttcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttg 197  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12390449 ttcacattgaaacatgatgtgggtatagcaagaacacttaaaacacaagattttg 12390503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 309
Target Start/End: Original strand, 15629866 - 15629914
Alignment:
Q  261 caataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15629866 caataaaaacgagctgcttaatcatgccttttacaatgaaacaaaacaa 15629914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15945936 - 15945892
Alignment:
Q  261 caataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaa 305  Q
    |||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15945936 caataaaaataagctgcttattcatgccttttacaataaaacaaa 15945892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 10)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27046430 - 27046132
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27046430 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 27046331  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27046330 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaa 27046231  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27046230 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgccatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 27046132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20237023 - 20236732
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20237023 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctatttatacatttactcaagggaag 20236924  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20236923 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 20236824  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaac 302  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20236823 gaatcaaccaaataagaggagataatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataagaattagctacttgaccatgccttttacaataaaac 20236732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 21799322 - 21799621
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21799322 ttatactactggcgctttgagaatttttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgtgtttccttaaattacctattcatacacttactcaagggaag 21799421  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21799422 caactttgtgtttttctcattgaagaactttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaaggcttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 21799521  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21799522 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatgttttcaataaaaattagctacttaatcatgcctttttcaataaaacaaaacaa 21799621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 17095260 - 17095560
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17095260 ttatactactggcgctttgagaatctttgaaggttaatgcaccactaagattaaaacgtgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 17095359  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagact-taaaacacaagagtttgctttcatgtaca 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17095360 caactttgtgtttttctcattgaagaactttattcactttaaaacaagatatgggtatatcaagaagactaaaaaacacaagagtttgctttcatgtaca 17095459  T
Q  210 agaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaaca 308  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  17095460 agaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcacgatactttcaataaaaattagctacttaaacatgcctttcacaataaaacgaaaca 17095559  T
Q  309 a 309  Q
    |    
T  17095560 a 17095560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3989650 - 3989352
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3989650 ttatactacttttactttgagaatttttaaaggtcaatgtaccactaaaattagaacgcatttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaag 3989551  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  3989550 caactttgtatttttctcattggagaattt-attcacgttaaaacaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaacacaagagtttacttttatgtacaa 3989452  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||| || ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3989451 gaattaaccaattaagaggagacaataaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaaataagctacttaaccatgcctttcacaataaaacaaaacaa 3989352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Original strand, 52939290 - 52939504
Alignment:
Q  24 actttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttt 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |    
T  52939290 actttgagaatttttaaaggttaacgtaccattaaaattagaacgcatttccttaaaatacctattcatacatttactcaatggaagcaactt-gtgcat 52939388  T
Q  124 ttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaat 223  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | | |||    
T  52939389 ttctcattggagg-ttttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaggagaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacga-ccaat 52939486  T
Q  224 aagaggagacaatgaaaa 241  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  52939487 aagaggagacaataaaaa 52939504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 8652573 - 8652334
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 135  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| || | | |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8652573 tttaaaagttaacgtaccactaaaattagaatgtgcttccttaaaatacctattcatacacttgctcaagggatgcaactt-gtgcttttctcattggag 8652475  T
Q  136 aattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa 235  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||    
T  8652474 aatt--attcacgataaaacaagatgtgggtttatcaagaaaacttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggatacaa 8652377  T
Q  236 tgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaa 281  Q
      |||| ||| ||||||   ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8652376 -caaaaatttatgtcat--aattttcaataaaaacaagctacttaa 8652334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 309
Target Start/End: Original strand, 19876366 - 19876628
Alignment:
Q  42 ggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaatttt 141  Q
    |||||||  |||||||| |||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||  |||||  |||| |||||||||||||||||||     
T  19876366 ggttaatttaccactaaaattagaacgtgtt-ccttaaaatacctattcatacacttactcaaaggctgcaaccatgtgcttttctcattggagaattt- 19876463  T
Q  142 attcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa 241  Q
     |||||  |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||||| ||| ||  |  || |||||||  ||||    
T  19876464 -ttcacaataaaacaagatgcgggtatagcaagaacacttaaaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacaaccattttggaagagacaacaaaaa 19876562  T
Q  242 ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
     ||| ||||||   ||||||||||||||  |||  ||||| ||||||||| |||| |||||| |||||    
T  19876563 atttatgtcat--aattttcaataaaaacgagccgcttaatcatgcctttcacaacaaaacataacaa 19876628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 309
Target Start/End: Original strand, 8948280 - 8948512
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||||   |||  ||||||| |||||||||||| |    
T  8948280 ttccttaaaatacctattcatacacttgctcaaggattgcaactaagtgcttttctcattggagaatttt---cacaataaaacatgatgtgggtataac 8948376  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaatt 271  Q
    ||||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||||| | | ||  | ||| |||||||  |||| ||| ||||||   ||||||||||||||      
T  8948377 aagaacacttaaaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgaccattttagaagagacaacaaaaaatttatgtcat--aattttcaataaaaaca 8948474  T
Q  272 agctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||| ||||| |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  8948475 agctgcttaatcatgtctttcgcaataaaacaaaacaa 8948512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 21785177 - 21785315
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  21785177 ttccttaaaatacctactcatacatttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatatc 21785273  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  21785274 aagaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 21785315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21955630 - 21955332
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21955630 ttatactactggcactttgagaatcttaaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 21955531  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21955530 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 21955431  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21955430 gaatcaaccaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaatgaaacaaaacaa 21955332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21381648 - 21381349
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21381648 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 21381549  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21381548 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 21381449  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21381448 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 21381349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 21099450 - 21099748
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21099450 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 21099549  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21099550 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 21099649  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21099650 gaatcaaccaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcgtgatattttccataaaaattagctacttaaccatgccttttagaataaaacaaaacaa 21099748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23910997 - 23910697
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23910997 ttatactaccggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacttattcatacatttactcaagggaag 23910898  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaatttta-ttcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtaca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23910897 caactttgtgtttttctcattggagaattttattttactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtaca 23910798  T
Q  210 agaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaaca 308  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23910797 agaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaaca 23910698  T
Q  309 a 309  Q
    |    
T  23910697 a 23910697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8314023 - 8313724
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  8314023 ttatactactggcgctttgagaatttttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgtgtttccttaaattacctattcatacacttactcaagggaag 8313924  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8313923 caactttgtgtttttctcattgaagaactttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaaggcttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 8313824  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8313823 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatgttttcaataaaaattagctacttaatcatgccttttacaataaaacaaaacaa 8313724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 8323507 - 8323809
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8323507 ttatactactggcgctttgagaatttttaaaggttaatgtaccactaagattagaacgcgtttccttaaaatacccattcatacattcactcaagggaag 8323606  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8323607 caactttgtgtttttcttattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 8323706  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatg-aaaattttgtgtcatga---tattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaa 306  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8323707 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaaattttgtgtcatgatttttttttcaataaaaattagctgcttaactatgccttttacaataaaacaaaa 8323806  T
Q  307 caa 309  Q
    |||    
T  8323807 caa 8323809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 17620296 - 17619998
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||   ||||||||| | ||||||||| || | |||||||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  17620296 ttatactacttttactttgagagtttttaaaggtcaacgtaccactaaaattaaaacgtatttccttaaaatacttattcatacacttactcaagggaag 17620197  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  17620196 caactt-gtgtttttatcattggagaattgtattcactttgaagcaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaatacaagagttcactttcatgtacaa 17620098  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||  || ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17620097 gaaataaccaattaagaggagacaataaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaaacaagctacttaaccatgcctttcacaataaaacagaacaa 17619998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 20039648 - 20039946
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||   ||||||||| | ||||||||| || | |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20039648 ttatactacttttactttgagagtttttaaaggtcaacgtaccactaaaattaaaacgtctttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaag 20039747  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  20039748 cagctt-gtgtttttctcattggagaattgtaatcactttgaagcaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaatacaagagttcactttcatgtacaa 20039846  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||  || ||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20039847 gaaataaccaattaagaggagacaataagaaatttatgtcatgatatttttcaataaaaacaagctacttaaccatgcctttcacaataaaacagaacaa 20039946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 21854439 - 21854737
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||   ||||||||| | ||||||||| || | |||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||    
T  21854439 ttatactacttttactttgagagtttttaaaggtcaacgtaccactaaaattaaaacatatttccttaaaatacctattcatatacttaatcaagggaag 21854538  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  21854539 caactt-gtgtttttctcattggagaattgtattcactttgaagcatgatgtgggtatatcaagaaaacttaaaatacaagagttcactttcatgtacaa 21854637  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||  || ||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21854638 gaaataaccaattaagagtagacaataaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaaacaagctacttaaccatgcctttcacaataaaacagaacaa 21854737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 309
Target Start/End: Original strand, 21942113 - 21942395
Alignment:
Q  24 actttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttt 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  21942113 actttgagaatttttaaaggttaacgtaccactaaaattagaacgcatttccttagaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcat 21942211  T
Q  124 ttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaat 223  Q
     |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | | |    
T  21942212 atctcattggagg-ttttattcgctttaaaacaagatgtgggtatattaggagaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaattaacctatt 21942310  T
Q  224 aagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||| || |||||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||    
T  21942311 aagaggagacaataaaaaatttatgtcataat-ttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcgcaattaaacaaaacaa 21942395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20711993 - 20711727
Alignment:
Q  40 aaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaatt 139  Q
    ||||| |||| |||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  20711993 aaggtcaatgtaccactaaaattagaacgtttttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaagcaa-tttgtgtttatctcattggagaata 20711895  T
Q  140 ttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaa 239  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| | |||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||| ||    
T  20711894 ttattcattttgaaacaagttgtgggtatatcgagaaaacttaaaataaaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaactgagaggagacaataaa 20711795  T
Q  240 aattttgtgtcatgatat-tttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaa 306  Q
    | |||| || |||| | | ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20711794 atttttatgccatgctttatttcattaaaaacaagctacttaaccatgcctttcacaagaaaacaaaa 20711727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19365560 - 19365288
Alignment:
Q  24 actttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttt 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  19365560 actttgagaatttttaaaggttaaagtaccactaaaattagaacgcatttcgttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcat 19365462  T
Q  124 ttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaat 223  Q
    ||            ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| | | ||| |    
T  19365461 tt------------ttttattcactttaaaacaagatgtgggtatataaggagaacttgaaacacaatagtttattttcatgtacaagaaacgaccaa-t 19365375  T
Q  224 aagaggagacaatgaaaatt--ttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||||||||| ||||    || ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19365374 aagaggagacaataaaaaaaaattatgtcatgat-ttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaa 19365288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 309
Target Start/End: Original strand, 16419293 - 16419567
Alignment:
Q  24 actttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttt 123  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| | || ||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  16419293 actttgagaatttttaaagattaacgtacaactaaaattagaacgcatttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcat 16419391  T
Q  124 ttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaat 223  Q
    || |           |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | | |||    
T  16419392 tttt-----------tttattcactttaaaacaagatgtgggtatataaggagaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacga-ccaat 16419479  T
Q  224 aagaggagacaat---gaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||||||    ||||  || ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  16419480 aagaggagacaataaaaaaaaaattatgtcatgat-ttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcactatgaaacaaaacaa 16419567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20001808 - 20001670
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  20001808 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgtttttctcattggagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 20001712  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  20001711 aagaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 20001670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22101905 - 22101764
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   |||||   ||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  22101905 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaaccaggtgtttttctcattggagaattaatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 22101806  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  22101805 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 22101764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22369452 - 22369222
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  22369452 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 22369356  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaatt 271  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  |||||||||||||||| | | ||     || |||||||  |||| ||| |||||| |||    ||||||||||     
T  22369355 aagaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacgacca---ttgaagagacaacaaaaaatttatgtcataata-aaacaataaaaata 22369260  T
Q  272 agctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22369259 agctgcttattcatgccttttacaataaaacaaaacaa 22369222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19767038 - 19766900
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  19767038 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 19766942  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  19766941 aagaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 19766900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21830527 - 21830386
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  21830527 ttccttaaaatacctactcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattaatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 21830428  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  21830427 aagaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 21830386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 22034260 - 22034401
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  22034260 ttccttaaaatacctactcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattaatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 22034359  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  22034360 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 22034401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 22100360 - 22100501
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  22100360 ttccttaaaatacctactcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattaatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 22100459  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  22100460 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 22100501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20375317 - 20375215
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 135  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| |||| | | |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20375317 tttaaaggttaatttaccactaaaattagaacgtgct-ccttaaaatacctattcatacacttgctcaagggatgcaac-ttgtgcttttctcattggag 20375220  T
Q  136 aattt 140  Q
    |||||    
T  20375219 aattt 20375215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 11347664 - 11347802
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||| | ||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  11347664 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgctattctcattggagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 11347760  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  |||| |||||||||||    
T  11347761 aagaatacttacaacacaagaaatcactttaatgtacaagaa 11347802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23675040 - 23674939
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  23675040 ttccttaaaatacctattcatacactcactcaaggattgcaactaggtgtttttctcattggagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 23674944  T
Q  172 aagaa 176  Q
    |||||    
T  23674943 aagaa 23674939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 20375209 - 20375071
Alignment:
Q  171 caagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaat 270  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||  |||| ||| |||||| | ||||||||||||||     
T  20375209 caagaacactcaaaacacaagaattcaatttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggaaacaacaaaaaatttatgtcataaaattttcaataaaaac 20375110  T
Q  271 tagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
     |||  ||||| |||||||||  ||||||| || |||||    
T  20375109 aagccgcttaatcatgcctttcgcaataaatcataacaa 20375071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19766856 - 19766808
Alignment:
Q  261 caataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  19766856 caataaaaacaagctgcttattcatgccttttacaataaaacaaaacaa 19766808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 23711336 - 23711634
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23711336 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgtgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 23711435  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23711436 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaa 23711535  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711536 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgccatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 23711634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 20596488 - 20596787
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20596488 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 20596587  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20596588 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 20596687  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20596688 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttacccatgccttttacaataaaacaaaacaa 20596787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 20602774 - 20603073
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20602774 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 20602873  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602874 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 20602973  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602974 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttacccatgccttttacaataaaacaaaacaa 20603073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 20609065 - 20609364
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20609065 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 20609164  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20609165 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 20609264  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20609265 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttacccatgccttttacaataaaacaaaacaa 20609364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24940084 - 24939793
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24940084 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 24939985  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24939984 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 24939885  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaac 302  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24939884 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaagttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaac 24939793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15735090 - 15734791
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15735090 ttatactactggcattttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 15734991  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15734990 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 15734891  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
     ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15734890 taatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 15734791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 298
Target Start/End: Original strand, 20791375 - 20791662
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20791375 ttatactactggcgctttgagaatttttaaaggttaatgcaccactaagattagaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 20791474  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20791475 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 20791574  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaata 298  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20791575 gaatcaaccaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaata 20791662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 20621718 - 20621419
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20621718 ttatactactggcgctttgagagtctttaaaggttaatgcaccactaagattagaacgcgttttcttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 20621619  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20621618 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaa 20621519  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20621518 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatgttttcaatataaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 20621419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23747606 - 23747307
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23747606 ttatactactggcgctttgagagtctttaaaggttaatgcaccactaagattagaacacgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 23747507  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23747506 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgcacaa 23747407  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23747406 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatgttttcaataaaaattagctacttaactatgccttttaccataaaacaaaacaa 23747307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 24953832 - 24954132
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24953832 ttatactactggcgctttgagaatttttaaaggttaatgcaccactaagattagaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 24953931  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  24953932 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcattttaaaacaagatgtggttatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgcataa 24954031  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgcc-ttttacaataaaacaaaaca 308  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24954032 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgattttttcaataaaaattagctacttaactatgcctttttacaataaaacaaaaca 24954131  T
Q  309 a 309  Q
    |    
T  24954132 a 24954132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18072456 - 18072157
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18072456 ttatactacttgcgctttgagaatttttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgtgtttccttaaattacctattcatacacttactcaagggaag 18072357  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18072356 caactttgtgtttttctcattgaagaactttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaaggcttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 18072257  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaa-attttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18072256 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaattttttgtgtcatgatgttttcaataaaaattagctacttaatcatgccttttacaataaaacaaaacaa 18072157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 24 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24219374 - 24219091
Alignment:
Q  24 actttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttt 123  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||   |||||||| | || ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24219374 actttgagaatttttaaaggtcaacataccactaaaactagaacgcatttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaagcaactt-gtgttt 24219276  T
Q  124 ttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaat 223  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||| |    
T  24219275 ttctcattggagaattt-agtcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaataaccaatt 24219177  T
Q  224 aagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24219176 aagaggagacaat-aaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacgaaacaa 24219091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 23601303 - 23601601
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||   ||||||||| | ||||||||| || | |||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  23601303 ttatactacttttactttgagagtttttaaaggtcaacgtaccactaaaattaaaacatatttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaag 23601402  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  23601403 caactt-gtgtttttctcattggagaattgtattcactttgaagcaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaatacaagagttcactttcatgtacaa 23601501  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||  || ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  23601502 gaaataaccaattaagaggagacaataaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaatcaagctacttaaccatccctttcacaataaaacagaacaa 23601601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 309
Target Start/End: Original strand, 20445550 - 20445788
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20445550 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattgcagaattt-attcactttaaaacaagatgtgcgtatatc 20445648  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaat-gaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaa 269  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  ||||  || |||||||||| |||||||||||||    
T  20445649 aagaaaacttaaagcacaagagtttactttcatgtacaagaattaaccaattaagaggagacaataaaaaaaattatgtcatgatatttttcaataaaaa 20445748  T
Q  270 ttagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  20445749 taagctacttaaccatgcatttcacaataaaacagaacaa 20445788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 309
Target Start/End: Original strand, 21281591 - 21281868
Alignment:
Q  24 actttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttt 123  Q
    |||| |||||| ||||||||| || | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  21281591 acttagagaatttttaaaggtcaacgtaccactaaaattagaacgcatttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaagcaac-tagtgttt 21281689  T
Q  124 ttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaat 223  Q
    || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||    ||| ||| |    
T  21281690 ttttcattggataa-tttattcacttcaaaacaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaacacaagagtttaacatcatgtacaa----caaccaatt 21281784  T
Q  224 aagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
     |||||||||||  |||| ||| |||||| || |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21281785 tagaggagacaa-caaaaatttatgtcataat-ttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaa 21281868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 20574986 - 20574720
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 135  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | | |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20574986 tttaagggttaatgcaccactaaaattagaacgtgct-ccttaaaatacctattcatacagttgctcaagggatgcaactt-gtgcttttctcattggag 20574889  T
Q  136 aattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa 235  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  20574888 aatt--attcacaataaaacaagatgtgggtatatcaagaatacttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagacaa 20574791  T
Q  236 tgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
      |||| ||| ||||||   ||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||    
T  20574790 -caaaaatttatgtcat--aattttcaataaaaacaagctacttaatcatgtctttcgcaattaaacaaaacaa 20574720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22947964 - 22947769
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 135  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| |||| | | |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||    
T  22947964 tttaagggttaatgtaccactaaaattagaacgtgct-ccttaaaatacctattcatacacttgctcaagggatgaaactt-gtgcttttctcattggag 22947867  T
Q  136 aattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa 235  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  22947866 aatt--attcacaataaaacaagatgtaggtatagcaagaacacttaaaacacgagaattcactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagacaa 22947769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26847163 - 26847022
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| | | ||||| ||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  26847163 ttccttaaaatacctacttatacacttactcaaggattgcaactgggtgtttttctcattggagaatttatttcacaataaaacatgatgtgggtatatc 26847064  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| ||||||||   |  ||||||||||||||||    
T  26847063 aagaatacttacaacacaagcaatcactttcatgtacaagaa 26847022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22855067 - 22854929
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   ||||| |||||||  |||||||||||| |    
T  22855067 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatt---ttcacattaaaacttgatgtgggtatagc 22854971  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  22854970 aagaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 22854929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 25007508 - 25007649
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   |||||   ||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  25007508 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaaccaggtgtttttctcattggagaattaatttcacaataaaacttgatgtgggtataac 25007607  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  25007608 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 25007649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 18484916 - 18485054
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  18484916 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 18485012  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  18485013 aagaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 18485054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 30760357 - 30760495
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  30760357 ttccttaaaatacatattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 30760453  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  30760454 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 30760495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 22318222 - 22318359
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  22318222 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 22318318  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
     |||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  22318319 -agaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 22318359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 25116872 - 25117010
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||    ||||||  ||| ||||||||||||||||||||   |||  ||||||  |||||||||||| |    
T  25116872 ttccttaaaatacttattcatacacttactcaagaattgcaactaggtgcttttctcattggagaatttt---cacgataaaacttgatgtgggtatagc 25116968  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  25116969 aagaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 25117010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 25175963 - 25176101
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||    ||||||  ||| ||||||||||||||||||||   |||  ||||||  |||||||||||| |    
T  25175963 ttccttaaaatacttattcatacacttactcaagaattgcaactaggtgcttttctcattggagaatttt---cacgataaaacttgatgtgggtatagc 25176059  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  25176060 aagaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 25176101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 213
Target Start/End: Original strand, 20439084 - 20439172
Alignment:
Q  122 ttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    |||||| |||||||||||||   |||  ||||||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  20439084 ttttctgattggagaatttt---cacaataaaacttgatgtgggtatagcaagaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 20439172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22854884 - 22854836
Alignment:
Q  261 caataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22854884 caataaaaacaagctgcttattcatgccttttacaataaaacaaaacaa 22854836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 12275 - 12572
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12275 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 12374  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12375 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaa-acaagagtttgctttcatgtacaa 12473  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12474 gaatcaaccaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 12572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 25357067 - 25356768
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25357067 ttatactactggcgctttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattagaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 25356968  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25356967 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 25356868  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25356867 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgattttttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 25356768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 117099 - 116803
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  117099 ttatactactgacactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgtgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaaa 117000  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  116999 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaataagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaa 116900  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaac 307  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116899 taatcaaccaaataagaggagacaatgaaaattttatgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaac 116803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 22045319 - 22045618
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22045319 ttatactactggcgctttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattagaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 22045418  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22045419 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 22045518  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  22045519 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgattttttcaataaaaattagctacttaactatgccttttacaataaaacagaacaa 22045618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 24795943 - 24796242
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24795943 ttatactactggcgctttgagaatttttaaaggttaatgcaccactaagattagaacacgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 24796042  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24796043 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttgaaacaagatgtggttatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 24796142  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24796143 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgattttttcaataaaagttagctacttaactatgccttttacaataaaacagaacaa 24796242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16775207 - 16774907
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16775207 ttatactactggcgctttgagagtccttaaaggttaatgcaccactaagattagaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 16775108  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16775107 caactttgtgtttttctcattggagaatcctattcactttaaaacaagatgtggttatatcaagaaggcttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaa 16775008  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattt-tgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgcc-ttttacaataaaacaaaaca 308  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16775007 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttgtgtgtcatgattttttcaataaaaattagctacttaactatgcctttttacaataaaacaaaaca 16774908  T
Q  309 a 309  Q
    |    
T  16774907 a 16774907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 17589964 - 17589664
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17589964 ttatactactggcgttttgagaatttttaaaggttaatgcaccactaagattagaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 17589865  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17589864 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttgaaacaagatgtggttatatcaagaaaacttaaaacacaagagtttgctttcatgcacaa 17589765  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatga-tattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaaca 308  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  17589764 gaatcaacaaattaagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatttttttcaataaaaattagctacttaactatgccttttacaataaaacagaaca 17589665  T
Q  309 a 309  Q
    |    
T  17589664 a 17589664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 96 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22664558 - 22664343
Alignment:
Q  96 tttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagag-t 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22664558 tttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtt 22664459  T
Q  195 ttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgcctttta 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22664458 ttgctttcatgtacaagaatcaatcgaataggaggagacaatgaaaatttttatgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgcctttta 22664359  T
Q  294 caataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||||||||||||    
T  22664358 caataaaacaaaacaa 22664343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27627136 - 27626850
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||      |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||    
T  27627136 ttatactactggcgctttgagaatttttaaaggttaatgcacca------ttaaaacgtgtttccttaaattacctattcatacacgtactcaagggaag 27627043  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27627042 caactttgtgtttttctcattgaaaaactttattcactttaaaacaagatgtaggtatatcaagaaggcttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaa 27626943  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27626942 ga-------aaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatgttttcaataaaaattagctacttaatcatgccttttacaataaaacaaaacaa 27626850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 25145424 - 25145722
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||   ||||||||| | ||||||||| || | |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  25145424 ttatactacttttactttgagagtttttaaaggtcaacgtaccactaaaattaaaacgtatttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaag 25145523  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  25145524 caactt-gtgtttttctcattggagaattgtattcactttgaagcaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaatacaagagttcactttcatgtacaa 25145622  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||  || ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25145623 gaaataaccaattaagaggagacaataaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaaacaagctacttaaccatgcctttcacaataaaacagaacaa 25145722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 306
Target Start/End: Original strand, 24517005 - 24517275
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 135  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24517005 tttaaaggtcaatgtaccattaaaattagaacgcttttccttaaaatacatattcatacacttactcaagggaagcaa-tttgtgtttttctcattggag 24517103  T
Q  136 aattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa 235  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| | |||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  24517104 aatattattcattttgaaacaaggtgtgggtatatcgagaaaacttaaaataaaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaactgagaggagacaa 24517203  T
Q  236 tgaaaattttgtgtcatgatat-tttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaa 306  Q
    | ||| |||| || |||| | | ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24517204 taaaatttttatgccatgctttatttcattaaaaacaagctacttaaccatgcctttcacaagaaaacaaaa 24517275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 81 - 301
Target Start/End: Original strand, 24820750 - 24820971
Alignment:
Q  81 atacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagact 180  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  24820750 atacctatccatacatttacttaagggaagcaactt-gtgtatttctcattggagaattt-attcagtttaaaacaagatgtgagtatatcaggaaaatt 24820847  T
Q  181 taaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaat--gaaaattttgtgtcatgatatttt-caataaaaattagctac 277  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||   ||||  || ||| || ||||||| |||||||||  ||||||    
T  24820848 taaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaataaccaattaagaggagacaataaaaaaaaattatgtaataatattttccaataaaaacaagctac 24820947  T
Q  278 ttaaccatgccttttacaataaaa 301  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  24820948 ttaaccatgcctttcacaataaaa 24820971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24501620 - 24501357
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 135  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| |||| | ||| ||||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||    
T  24501620 tttaagggttaatgtaccactaa-attagaacgtgcttc-ttaaactacctattcatacaattgctcaagggatgcaacttgg-gcttttctcattggag 24501524  T
Q  136 aattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa 235  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  24501523 aattt-attcacattaaaacaagatgtgagtatatcaagaatacttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagacaa 24501425  T
Q  236 tgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaa 306  Q
      |||| ||| ||||||   ||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  24501424 -caaaaatttatgtcat--aattctcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaacaaaacaaaa 24501357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 309
Target Start/End: Original strand, 25371646 - 25371913
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 135  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| |||| | ||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25371646 tttaaaggttaacgtaccactaaaattagaacgtgcttccttaaagtacctattcatacacttgctcaagggatgcaactt-gtgcttttctcattggag 25371744  T
Q  136 aattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa 235  Q
    ||||  || |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||    
T  25371745 aatt--atccacaataaaacaagatgtgggtttatcaagaaaacttaaaacacaagtgttcactttcatgtagaagaaacaaccagcttagaggagacaa 25371842  T
Q  236 tgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
      |||| ||| ||||||   |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25371843 -caaaaatttatgtcat--aattttcaataaaaataggctacttaatcatgcctttcacaattaaacaaaacaa 25371913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 309
Target Start/End: Original strand, 25366440 - 25366710
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 135  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| |||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||    
T  25366440 tttaaaggttaacgtaccactaaaattagaacgtgcttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgtttttctcattggag 25366539  T
Q  136 aattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa 235  Q
    ||||   |||||  |||||   |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||  |  |||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||    
T  25366540 aattagtttcacaataaaaattgatgtgggtatagcaagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaaacaaccgatttagaggagacaa 25366639  T
Q  236 tgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
      |||| ||| ||||||   ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  25366640 -caaaaatttatgtcat--aattttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcgcaacaaaacaaaacaa 25366710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 22664618 - 22664556
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgttt 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22664618 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgtaccactaagattaaaacgcgttt 22664556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27631008 - 27630867
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   |||||   ||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  27631008 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaaccaggtgtttttctcattggagaattaatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 27630909  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  27630908 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 27630867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 27769521 - 27769662
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  27769521 ttccttaaaatacctactcatacacttactcaaggattgcaactaggtgtttttctcattggagaatttatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 27769620  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| | ||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  27769621 aagaatatttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 27769662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 213
Target Start/End: Original strand, 25368433 - 25368542
Alignment:
Q  101 tcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctt 200  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||  |||    
T  25368433 tcaagggatgcaactt-gtgtttttctcattgaagaattt-attcacaataaaacaagatgtgggtatatcaagaatagtt-aaacacaagaattcactt 25368529  T
Q  201 tcatgtacaagaa 213  Q
    |||||||||||||    
T  25368530 tcatgtacaagaa 25368542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24170821 - 24170683
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  24170821 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 24170725  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  24170724 aagaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 24170683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 213
Target Start/End: Original strand, 26192348 - 26192483
Alignment:
Q  75 cttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaag 174  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| ||||    
T  26192348 cttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatagcaag 26192444  T
Q  175 aagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    || ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  26192445 aacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 26192483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 192
Target Start/End: Original strand, 23160090 - 23160210
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   |||||   |||||||||| |||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  23160090 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaaccaggtgtttttcttattggagaattaatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 23160189  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaaga 192  Q
    ||||| ||||| |||||||||    
T  23160190 aagaatacttataacacaaga 23160210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 192
Target Start/End: Original strand, 23571347 - 23571467
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   |||||   |||||||||| |||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  23571347 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaaccaggtgtttttcttattggagaattaatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 23571446  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaaga 192  Q
    ||||| ||||| |||||||||    
T  23571447 aagaatacttataacacaaga 23571467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23647424 - 23647286
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||   |||| |  ||| ||||||||||||||||||||   ||   ||||||  ||||||| |||| |    
T  23647424 ttccttaaaatacctactcatacacttactcagggattgcaagtaggtgcttttctcattggagaatttt---cagaataaaacttgatgtggttatagc 23647328  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23647327 aagaacacttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaa 23647286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Original strand, 25338911 - 25338970
Alignment:
Q  154 acaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |  |||| |||||||||||    
T  25338911 acaagatgtgggtatagcaagaacacttaaaacacaagaaatcactttaatgtacaagaa 25338970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24320595 - 24320543
Alignment:
Q  158 gatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  24320595 gatgtgggtatagcaagaacacttaaaacacaagaagtcactttcatgtacaa 24320543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 22166208 - 22166507
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22166208 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 22166307  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22166308 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 22166407  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22166408 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 22166507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15699112 - 15698813
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15699112 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 15699013  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15699012 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttgatgtacaa 15698913  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaa-ttagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15698912 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaatttagctacttgaccatgccttttacaataaaacacaacaa 15698813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 11 - 298
Target Start/End: Original strand, 22062164 - 22062451
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22062164 ttatactacttgcactttgagaatctttaaaggttaatgtaccactaagattaaaaagcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 22062263  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22062264 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaa 22062363  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaata 298  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22062364 gaatcaaccaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaata 22062451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22243369 - 22243070
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22243369 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 22243270  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22243269 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 22243170  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22243169 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcacgatattttcaataaaaattagctacttaaacatgcctttcacaataaaacgaaacaa 22243070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 24855903 - 24856202
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24855903 ttatactactggcgctttgagaatttttaaaggttaatgcaccactaagattagaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 24856002  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24856003 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaa 24856102  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatg-aaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  24856103 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaaattttgtgtcatgatgttttcaataaaaattagctacttaactatgccttttaccataaaacagaacaa 24856202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 20016887 - 20017186
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20016887 ttatactactggcgctttgagagtctttaaaggttaatgcaccactatgattagaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 20016986  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20016987 caactttgtgtttttctcattggaagattttattcactttaaaacaagatgtggttatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaa 20017086  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20017087 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatgttttcaataaaaagtagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 20017186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 20169799 - 20169501
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20169799 ttatactactggcgctttgagaatttttaaaggttaatgcaccactaagattagaatgtgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 20169700  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20169699 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 20169600  T
Q  211 gaatcaatc-aaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20169599 gaatcaatcaaaataagaggagacaatgaaaatttt-tgtcttgattttttcaataaaaattagctacttaactatgccttttacaataaaacagaacaa 20169501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 15850639 - 15850939
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15850639 ttatactactagcactttgagaatctttaaaggttaatgccccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacattcactcaagggaag 15850738  T
Q  111 caac-tttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagac-ttaaaacacaagagtttgctttcatgtac 208  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15850739 ccacttttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagactttaaaacacaagagtttgctttcatgtac 15850838  T
Q  209 aagaatcaatcaaataagaggagacaat-gaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaac 307  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15850839 aagaatcaa-caaataagaggagacaatggaaatttttgtatcatgatattttcaataaaaattagctatttaaccatgccttttgcaataaaacaaaac 15850937  T
Q  308 aa 309  Q
    ||    
T  15850938 aa 15850939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 22767774 - 22768076
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22767774 ttatactactggcgctttgagaatttttaaaggttaatgcaccattaagattagaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 22767873  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22767874 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttgaaacaagatgtggttatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 22767973  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatga---tattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaa 306  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  22767974 gagtcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatttttttttcaataaaaattagctacttaactatgccttttacaataaaacagaa 22768073  T
Q  307 caa 309  Q
    |||    
T  22768074 caa 22768076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 25625322 - 25625025
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||||| || | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  25625322 ttatactacttttactttgagaatttttaaaggtcaacgtaccactaatattagaacgcatttccttaaaatacctatccatacatttactcaagggaag 25625223  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
     ||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25625222 aaactt-gtgcatttctcattggagaattt-attcactttaaaacaagatgtgggtatatgaggaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaa 25625125  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||  || ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25625124 gaaataaccaattaagaggagacaataaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaaataagctacttaaccatgcctttcacaataaaacaaaacaa 25625025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18011406 - 18011124
Alignment:
Q  26 tttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttttt 125  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||    
T  18011406 tttgagaatttttaaaggtcaatgtaccactaatattagaacgcatttccttaaaatacctatccatacatttactcaagggaag-aactt-gtgcattt 18011309  T
Q  126 ctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataa 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| |||    
T  18011308 ctcattggagaattt-attcactttaaaacaagatgtgggtatatcaggaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaactaa 18011210  T
Q  226 gaggagacaat-gaaaattttgtgtcatgatat-tttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18011209 gaggagacaataaaaaattttatgtcatgatttatttcattaaaaacaagatagttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 18011124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18853569 - 18853273
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||   |||||||| || ||||||||| ||   |||||||| | || ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18853569 ttatactacttttactttgaggatttttaaaggtcaacataccactaaaactagaacgcatttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaag 18853470  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  18853469 caactt-gtgtttttctcattggagaattt-agtcactttaaaacaagatgtgggtatgtcaagaaaacttaagacacaagagtttactttcatgtacaa 18853372  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||  || ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  18853371 gaaataaccaattaagaggagacaat-aaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaaacaagctacttaatcatgtctttcacaataaaacaaaacaa 18853273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18447770 - 18447484
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||   ||||||| ||| ||||||||| || | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18447770 ttatactacttttactttgaaaatttttaaaggtcaacgtaccactaaaattagaacgcatttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaag 18447671  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18447670 caactt-gtgtttttctcattggagaattt-attcacgttaaaacaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaa 18447573  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaa 301  Q
    ||| ||| | ||||| | || | ||  |||| ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18447572 gaaacaa-ccaataaaaagaaaaaaataaaaatttatgtcatgat-ttttcaataaaaacaagctacttaatcatgccttttacaataaaa 18447484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 36 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29595233 - 29594963
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 135  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29595233 tttaaaggtcaatgtaccactaaaattagaacgcatttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaagcaactt-gtgtttttctcattggag 29595135  T
Q  136 aattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa 235  Q
    ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  29595134 aatttcattcatttggaaacaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaatacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaactaagaggagacaa 29595035  T
Q  236 tgaaaattttgtgtcatgatat-tttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaa 306  Q
      |||||||| || |||| | | ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29595034 aaaaaattttatgccatgctttatttcattaaaaacaagctacttaaccatgcctttcacaagaaaacaaaa 29594963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 309
Target Start/End: Original strand, 25632033 - 25632302
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 135  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||  ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  25632033 tttaaaagttaacgtaccactaaaattagaacgtatttccttaaaatacatattcatacacttactcaagggaagcaactt-gtgcttatctcattggag 25632131  T
Q  136 aattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa 235  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  25632132 aattt-attcacattaaaacaaaatgtgggtatatcaagaaaacttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagacaa 25632230  T
Q  236 tgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
      |||| ||| |||||| || ||| |||||||||  || ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  25632231 -caaaaatttatgtcataat-tttacaataaaaacaagttacttaatcatgcctttcacaataaaataaaacaa 25632302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 309
Target Start/End: Original strand, 21561165 - 21561385
Alignment:
Q  89 tcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacac 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21561165 tcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagaattt-attcattttgaaataagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaacac 21561262  T
Q  189 aagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagac-aatgaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaattagctacttaaccatg 286  Q
    ||||||||  |||||||||||||||  || ||| ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  21561263 aagagtttattttcatgtacaagaaataaccaattaagaggagacaaataaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaaacaagctacttaatcatg 21561362  T
Q  287 ccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
     |||| |||||||||||||||||    
T  21561363 tctttcacaataaaacaaaacaa 21561385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 309
Target Start/End: Original strand, 30672449 - 30672680
Alignment:
Q  73 tccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatca 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||| || ||||||||    
T  30672449 tccttaaaatacctattcatacaatttctcaagggatgcaactt-gtgtttttctcattggagaatt--attcacaataaaacaagatatgtgtatatca 30672545  T
Q  173 agaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaatta 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||  |||| ||| ||||||   ||| ||||||||||  |    
T  30672546 agaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagacaactaaaaatttatgtcat--aattctcaataaaaacaa 30672643  T
Q  273 gctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||    
T  30672644 gctacttaatcatgtctttcgcaattaaacaaaacaa 30672680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 121 - 309
Target Start/End: Original strand, 18188351 - 18188530
Alignment:
Q  121 tttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatca 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  ||||||||||||    ||| ||    
T  18188351 tttttctcattggagaattt-attcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaacac--gagtttaatttcatgtacaa----caacca 18188443  T
Q  221 aataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    | | |||||||||||  |||| ||| |||||| || |||||||||||||  |||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||    
T  18188444 atttagaggagacaa-caaaaatttatgtcataat-ttttcaataaaaacaagctacttaatcatgtctttcacaataaaacaacacaa 18188530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25962334 - 25962222
Alignment:
Q  73 tccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatca 172  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25962334 tccttaaaatacctattcatacatttgctcaagggatgcaactc-gtgcttttctcattggagaatt--attcacaataaaacaagatgtgggtatatca 25962238  T
Q  173 agaagacttaaaacac 188  Q
    |||| |||||||||||    
T  25962237 agaatacttaaaacac 25962222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25966981 - 25966869
Alignment:
Q  73 tccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatca 172  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25966981 tccttaaaatacctattcatacatttgctcaagggatgcaactc-gtgcttttctcattggagaatt--attcacaataaaacaagatgtgggtatatca 25966885  T
Q  173 agaagacttaaaacac 188  Q
    |||| |||||||||||    
T  25966884 agaatacttaaaacac 25966869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25962814 - 25962702
Alignment:
Q  73 tccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatca 172  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25962814 tccttaaaatacatattcatacatttgctcaagggatgcaactc-gtgcttttctcattggagaatt--attcacaataaaacaagatgtgggtatatca 25962718  T
Q  173 agaagacttaaaacac 188  Q
    |||| |||||||||||    
T  25962717 agaatacttaaaacac 25962702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25967461 - 25967349
Alignment:
Q  73 tccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatca 172  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25967461 tccttaaaatacatattcatacatttgctcaagggatgcaactc-gtgcttttctcattggagaatt--attcacaataaaacaagatgtgggtatatca 25967365  T
Q  173 agaagacttaaaacac 188  Q
    |||| |||||||||||    
T  25967364 agaatacttaaaacac 25967349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Original strand, 18185144 - 18185262
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||||| || | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  18185144 ttatactacttttactttgagaatttttaaaggtcaacgtaccactaaaattagaacgcatttccttaaaatacctatttatacacttactcaagggaag 18185243  T
Q  111 caactttgtgtttttctcat 130  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  18185244 caac-ttgtgtttttctcat 18185262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 8724435 - 8724573
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  8724435 ttccttaaaatacctattcatacacttactaaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 8724531  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  8724532 aagaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 8724573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11219113 - 11218975
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||   ||||||  |||||| ||||||||||| |||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  11219113 ttccttaaaatatctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgtttatctcattggaggatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 11219017  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| ||||| |||  || |||| |||||||||||    
T  11219016 aagaacacttacaacacgagaaattactttaatgtacaagaa 11218975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 139
Target Start/End: Original strand, 19586267 - 19586332
Alignment:
Q  73 tccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaatt 139  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19586267 tccttaaaatacctattcatacaattgctcaagggatgcaac-ttgtgcttttctcattggagaatt 19586332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 213
Target Start/End: Original strand, 23518557 - 23518612
Alignment:
Q  158 gatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  23518557 gatgtgggtatagcaagaacacttaaaacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 23518612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 11218932 - 11218884
Alignment:
Q  261 caataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  11218932 caataaaaacaagctatttattcatgccttttacaataaaacaaaacaa 11218884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23514623 - 23514325
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23514623 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 23514524  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23514523 caactttttgtttttctcattggagaattgtattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 23514424  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23514423 gaatcaaccaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgtcttttacaataaaacaaaacaa 23514325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 14550652 - 14550354
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14550652 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccgctaggattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 14550553  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14550552 caactttgtgtttttctcattggagagttttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 14550453  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14550452 gaatcaacaaaataaaaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 14550354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8717421 - 8717122
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8717421 ttatactactggcattttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 8717322  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8717321 caactttgtgtttttctcattggagatttttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 8717222  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
     ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8717221 taatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 8717122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 16150141 - 16150441
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16150141 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgtgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 16150240  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16150241 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaa 16150340  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgata-ttttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaaca 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16150341 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatatttttcaataaaaacaagctacttaaccatgcctttcacaataaaacaaaaca 16150440  T
Q  309 a 309  Q
    |    
T  16150441 a 16150441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13673412 - 13673113
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13673412 ttatactactggcgctttgagagtctttaaaggttaatgcaccactaagattagaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 13673313  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13673312 caactttgtgtatttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaa 13673213  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13673212 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatgttttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 13673113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 18593925 - 18594224
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18593925 ttatactactggcgctttgagagtctttaaaggttaatgcaccactaagattagaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 18594024  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18594025 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatatcaagaagacctaaaacacaagagtttgcttttatgtacaa 18594124  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594125 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatgttttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 18594224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18617759 - 18617460
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18617759 ttatactactggcgctttgagagtctttaaaggttaatgcaccactaagattagaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 18617660  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18617659 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatatcaagaagacctaaaacacaagagtttgcttttatgtacaa 18617560  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18617559 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgatgttttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 18617460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9582456 - 9582171
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9582456 ttatactactggcactttgagaatctttaaatgttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 9582357  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||| |||||||||||||             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9582356 caaatttgtgtttttct-------------tattcactttaaaacaagatgtggatatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcttgtacaa 9582270  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9582269 gaatcaatcaaataaaaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaaatagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 9582171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 539424 - 539716
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  539424 ttatactaccggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctaatcatacatttactcaagggaag 539523  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  539524 caactttgtgtttttctcattg------tttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 539617  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatga-tattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
     || | | | |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  539618 aaaacga-ccaataagaggagacaataaaaattttatgtcatgattgatttcattaaaaacaagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 539716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 10432403 - 10432699
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||||| || | |||||||| | || ||| | |||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  10432403 ttatactacttttactttgagaatttttaaaggtcaacgtaccactaaaactagaacacatttcgttaaaatacttattcatacacttactcaagggaag 10432502  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10432503 caactt-gtgtttttctcattggagaattt-agtcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaacacaagagtatactttcatgtacaa 10432600  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||  || ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  10432601 gaaataaccaattaagaggagacaat-aaaaatttatgtcatgatacttttcaataaaaataagctacttaactatgcctttcacaataaaacaaaacaa 10432699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13355777 - 13355496
Alignment:
Q  24 actttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttt 123  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | |||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13355777 actttgagaatttttaaaggtcaacgtaccactaaaattagaacgcattttcttaaaatacctatttatacacttactcaagggaagcaactt-gtgttt 13355679  T
Q  124 ttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaat 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| ||| |    
T  13355678 ttctcattggagaattt-attcactttaaaaaaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaacacaagtgtttaatttcatgtacaagaaacaaccaatt 13355580  T
Q  224 aagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
     |||||||||||  |||| ||| |||||| || |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  13355579 tagaggagacaa-caaaaatttatgtcataat-ttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaa 13355496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 309
Target Start/End: Original strand, 16466289 - 16466573
Alignment:
Q  24 actttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttt 123  Q
    |||||||||||  || |||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  16466289 actttgagaattctttaaggttaatgtaccactaaaattagaacgcatttccttaaaatacctatttatacatttactcaagggaagcaactttttgcat 16466388  T
Q  124 ttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaat 223  Q
     |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | | |||    
T  16466389 atctcattggag-gttctattcactttaaaacaagatgtgggtatattaggagaacttaaaacacaagagtttaatttcatgtacaagaaacga-ccaat 16466486  T
Q  224 aagaggagacaatgaaaattttgtgtcatga-tattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16466487 aagaggagacaataaaaattttatgtcatgattgatttcattaaaaacaagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 16466573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 89 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13657399 - 13657180
Alignment:
Q  89 tcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacac 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  13657399 tcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgtatttctcattggagaattt-attcattttgaaacaagatgtgggtatatcaagaaaactaaaaatac 13657302  T
Q  189 aagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatat-tttcaataaaaattagctacttaaccatgc 287  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||| | ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  13657301 aagagttcactttcatgtacaagaaacgaccaactaagaggagacaataaaaattatatgtcatgatttatttcattaaaaacaagctacttaaccatgc 13657202  T
Q  288 cttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13657201 cttttacaataaaacaaaacaa 13657180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 36 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20107819 - 20107558
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 135  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20107819 tttaaaggttaacgtaccactaaaattagaacgtgtttccttaaaatacttattcatacacttactcaagggaagcaactt-gtgcttttctcattggag 20107721  T
Q  136 aattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa 235  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  20107720 aattt-attcacattaaaacaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaatacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaacttagaggagacaa 20107622  T
Q  236 tgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaa 301  Q
      |||| ||| |||||| || ||||||||| |||  |||||||||| |||| ||||  ||||||||    
T  20107621 -caaaaatttatgtcataat-ttttcaatagaaacaagctacttaatcatgtctttcgcaataaaa 20107558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 12566551 - 12566278
Alignment:
Q  26 tttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttttt 125  Q
    ||||||||| | ||||||| || | ||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12566551 tttgagaatttctaaaggtcaacgtaccgctaagattagaacgcattttcttaaaatacatattcatacacttactcaagggaagcaactt-gtgttttt 12566453  T
Q  126 ctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataa 225  Q
    |||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||| | |    
T  12566452 ctcattggagaattta-------tgaaaacaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaacataagagtttactttcatgtacaagaaacaaccaattta 12566360  T
Q  226 gaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||||||| |||  ||| ||||||||| |||||||||||||  || || |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12566359 gaggagacaat-aaacatttatgtcatgat-ttttcaataaaaacaagttatttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaa 12566278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16531635 - 16531364
Alignment:
Q  24 actttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttt 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  16531635 actttgagaatttttaaaggttaacgtaccactaaaattagaacgcatttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcat 16531537  T
Q  124 ttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaaga-cttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaa 222  Q
    || |           |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||| | | |||     
T  16531536 tttt-----------tttattcattttaaaacaagatgtgggtata-caaggagaacttaaaacactatagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa- 16531450  T
Q  223 taagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16531449 taaaaggagacaataaaaaatttatgtcatgat-ttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaa 16531364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 309
Target Start/End: Original strand, 16634027 - 16634298
Alignment:
Q  24 actttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttt 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  16634027 actttgagaatttttaaaggttaacgtaccactaaaattagaacgcatttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcat 16634125  T
Q  124 ttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaaga-cttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaa 222  Q
    || |           |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||| | | |||     
T  16634126 tttt-----------tttattcattttaaaacaagatgtgggtata-caaggagaacttaaaacactatagtttactttcatgtacaagaaacgaccaa- 16634212  T
Q  223 taagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16634213 taaaaggagacaataaaaaatttatgtcatgat-ttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaa 16634298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 309
Target Start/End: Original strand, 48802539 - 48802807
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 135  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| |||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | ||||  ||| ||||||||||||||    
T  48802539 tttaaaggttaacgtaccactaaaattagaacgtgcttccttaaaatacctattcatacacttgctcaagggatgtaacta-gtgcttttctcattggag 48802637  T
Q  136 aattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa 235  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  48802638 aattt-attcacattaaaacatgatgcgggtttatcaagaaaacttaaaacacaagatttcactttcatgtacaagaaacaatcaatttagaggagacaa 48802736  T
Q  236 tgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
      |||| ||| ||||||   ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||    
T  48802737 -caaaaatttatgtcat--aattttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcgcaattaaacaaaacaa 48802807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 141 - 306
Target Start/End: Original strand, 11927698 - 11927863
Alignment:
Q  141 tattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | | |||||||||||| ||| |||    
T  11927698 tattcactttaaaacaagatgtgggtatattaggagaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacga-ccaataagaggagataataaaa 11927796  T
Q  241 attttgtgtcatga-tattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaa 306  Q
    ||||| |||||||| |  ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11927797 attttatgtcatgattgatttcattaaaaacaagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaa 11927863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4312227 - 4311998
Alignment:
Q  75 cttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaag 174  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||||   |||||||||||||||||| ||||||    
T  4312227 cttaaaatacctattcatacaattactcaagggatgcaactc-gtgcttttctcattggagaatt--attcataataaaacaagatgtgggtacatcaag 4312131  T
Q  175 aagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagc 274  Q
    |  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||  |||| ||| ||||||   ||||||||||||||  |||    
T  4312130 agaacttaaaacaaaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagacaa-caaaaatttatgtcat--aattttcaataaaaacaagc 4312034  T
Q  275 tacttaaccatgccttttacaa-taaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||    
T  4312033 tacttaatcatgcctttcacaatttaaacaaaacaa 4311998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 291
Target Start/End: Original strand, 8782684 - 8782933
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 135  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| |||| | | | |||||||||  ||||||||| || ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8782684 tttaagggttaatgtaccactaaaattagaacgtgctac-ttaaaatacttattcatacacttgctcaaggggtgcaactt-gtgcttttctcattggag 8782781  T
Q  136 aattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa 235  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||    
T  8782782 aattt-attcacaataaaacaagatgtgggtatagcaagatcacttaaaacacaagaattcactttcatgtacaagaaacaaccgatttagaggagacaa 8782880  T
Q  236 tgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttt 291  Q
      |||| ||| ||||||   ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  8782881 -caaaaatttatgtcat--aattttcaataaaaacaagctacttaatcatgccttt 8782933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18287114 - 18286973
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   |||||   ||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  18287114 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaaccaggtgtttttctcattggagaattaatttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 18287015  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  18287014 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 18286973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5396623 - 5396485
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||   || ||||||||||||||||||||   |||  ||||||  |||||||||||| |    
T  5396623 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactagatgcttttctcattggagaatttt---cacaataaaacttgatgtgggtatagc 5396527  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  5396526 aagaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 5396485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 16326489 - 16326627
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  16326489 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 16326585  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| ||||||| |  |  ||||||||||||||||    
T  16326586 aagaacacttacaacacaaaaaatcactttcatgtacaagaa 16326627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 14222422 - 14222563
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||  || ||||||||| |    
T  14222422 ttccttaaaatacctactcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattaatttcacaataaaacttgacgtgggtatagc 14222521  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  14222522 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 14222563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27290846 - 27290705
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||   ||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||  ||||||  | |||||||||| |    
T  27290846 ttccttaaaatacctactcatacacttactcaaggattgcaactcggtgcttttctcattggagaatttatttcacaataaaacttggtgtgggtatagc 27290747  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    || || ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  27290746 aaaaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 27290705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 825133 - 824995
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  825133 ttccttaaaatacctattcataaacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 825037  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| | ||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  825036 aagaacaattacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 824995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 4792138 - 4792276
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| || |||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||||  | |   ||||||| |||||||||||| |    
T  4792138 ttccgtaaaatacctactcatacacttgctcaaggattgcaactaagtgcttttctcattggagaattttcataa---taaaacatgatgtgggtatagc 4792234  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  4792235 aagaacacttaaaacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 4792276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15065282 - 15065141
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||   ||||||  ||| |||| |||||||||||||   |||||  |||||   |||||||||||| |    
T  15065282 ttccttaaaatacctactcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttttcattggagaattaatttcacaataaaatttgatgtgggtatagc 15065183  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  15065182 aagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 15065141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 15917486 - 15917624
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||| |   |||||||||||| |    
T  15917486 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatt---ttcacaataacaattgatgtgggtatagc 15917582  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| ||||| |||  |  ||||||||||||||||    
T  15917583 aagaacacttacaacacgagaaatcactttcatgtacaagaa 15917624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Original strand, 15207289 - 15207401
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  15207289 ttccttaaaatacctatttatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 15207385  T
Q  172 aagaagacttaaaaca 187  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  15207386 aagaacacttacaaca 15207401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 824951 - 824903
Alignment:
Q  261 caataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  824951 caataaaaacaagctgcttattcatgccttttacaataaaacaaaacaa 824903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 309
Target Start/End: Original strand, 15207471 - 15207519
Alignment:
Q  261 caataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15207471 caataaaaacaagctgcttattcatgccttttacaataaaacaaaacaa 15207519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 309
Target Start/End: Original strand, 15917668 - 15917716
Alignment:
Q  261 caataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15917668 caataaaaacaagctgcttattcatgccttttacaataaaacaaaacaa 15917716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13042 - 12744
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13042 ttatactactgacactttgagaatctttaaaggttaatgtaccactaagattaaaacgtgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 12943  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12942 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 12843  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12842 gaatcaaccaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttccataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 12744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 122925 - 122627
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  122925 ttatactactggcactttgagaatctttcaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaag 122826  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  122825 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagacgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacat 122726  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  122725 gaatcaatcaaataagtggagacaatgaaaattttgtgccatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 122627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 595 - 295
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  595 ttatactactggcgctttgagaatttttaaaggttaatgcaccactaagattagaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactctagggaag 496  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  495 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtggttatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgcacaa 396  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgcc-ttttacaataaaacaaaaca 308  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  395 gaatcaacaaaataagaggagacaatgaaaatttttgtgtcatgattttttcaataaaaattagctacttaactatgcctttttacaataaaacaaaaca 296  T
Q  309 a 309  Q
    |    
T  295 a 295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 8981 - 9275
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||||| || | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  8981 ttatactacttttactttgagaatttttaaaggtcaacgtaccactaaaattagaacgcatttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaag 9080  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9081 caactt-gtgtttttctcattggagaattt-attcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaacacaagagtttaatttcatgtacaa 9178  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||| ||| ||| | |||||||||||  |||| ||| |||||| || |||||||||||||  |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  9179 gaaacaaccaatttagaggagacaa-caaaaatttatgtcataat-ttttcaataaaaagaagctacttaatcatgtctttcacaataaaacaaaacaa 9275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 311
Target Start/End: Original strand, 252545 - 252828
Alignment:
Q  27 ttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttc 126  Q
    |||| ||| ||||||||| || | |||||||| |||| || || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  252545 ttgaaaatttttaaaggtcaacgtaccactaatattagaatgcattttcttaaaatacctatccatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcatttc 252643  T
Q  127 tcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataag 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| ||||    
T  252644 tcattggagaattt-attcactttaaaacaagatgtgggtatatcaggaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaacaactaag 252742  T
Q  227 aggagacaatgaaaattttgtgtcatgatat-tttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaatg 311  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  252743 aggagacaataaaaattttatgtcatgatttatttcattaaaaacaagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaatg 252828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 89 - 309
Target Start/End: Original strand, 355241 - 355453
Alignment:
Q  89 tcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacac 188  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||    
T  355241 tcatacatttactcaagggaaacaactt-gtgcatttctcattggagaattttg---------aaacaagatgtgggtatatcgagaaaactaaaaatac 355330  T
Q  189 aagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaat-gaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaattagctacttaaccatg 286  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  355331 aagagttcactttcatgtacaagaaataaccaattaagaggagacaataaaaaaatttatgtcacgatatttttcaataaaaataagctacttaaccatg 355430  T
Q  287 ccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||| ||||||||||| |||||    
T  355431 cctttcacaataaaacagaacaa 355453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 309
Target Start/End: Original strand, 18872 - 18920
Alignment:
Q  261 caataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18872 caataaaaacaagctgcttattcatgccttttacaataaaacaaaacaa 18920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 7550 - 7269
Alignment:
Q  27 ttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttc 126  Q
    |||||| | ||||||||| |||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7550 ttgagagtttttaaaggtcaatataccactaaaattagaacgcgtttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgtttttc 7452  T
Q  127 tcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataag 226  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  7451 tcattggagaatttcattcattttgaatcaagatgtgggtatatcaagaaaacttaagatacaagagttcactttcatgtacaagaaacaatcaactaag 7352  T
Q  227 aggagacaatgaaaattttgtgtcatgatat-tttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  7351 aggagacaat-aaaattttatgtcatgatttatttcattaaaaacaagctacttaatcatgcctttcgcaataaaacaaaacaa 7269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 116186 - 115904
Alignment:
Q  26 tttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttttt 125  Q
    ||||||||| ||||||||| || | |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  116186 tttgagaatttttaaaggtcaacgtaccactaatattagaacgcatttcctaaaaatacctatccacacatttactcaagggaagcaactt-gtgcattt 116088  T
Q  126 ctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataa 225  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| |||    
T  116087 ctcattggagaactt-attcactttaaaacaagatgtgggtatatcaggaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaactaa 115989  T
Q  226 gaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatat-tttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  115988 gaggagacaataaaaattttatgtcatgatttatttctttaaaaacaagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 115904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 120490 - 120208
Alignment:
Q  26 tttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttttt 125  Q
    ||||||||| ||||||||| || | |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  120490 tttgagaatttttaaaggtcaacgtaccactaatattagaacgcatttcctaaaaatacctatccacacatttactcaagggaagcaactt-gtgcattt 120392  T
Q  126 ctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataa 225  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| |||    
T  120391 ctcattggagaactt-attcactttaaaacaagatgtgggtatatcaggaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacgaccaactaa 120293  T
Q  226 gaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatat-tttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  120292 gaggagacaataaaaattttatgtcatgatttatttctttaaaaacaagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 120208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 129 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 25024 - 24851
Alignment:
Q  129 attggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagag 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25024 attggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatgtcaagaagacttaaaacacaagagtttgcttttatgtacaagaatcaa-caaataagag 24926  T
Q  229 gagacaatgaaaa-ttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaac 302  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24925 gagacaatgaaaatttttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgcctttcacaataaaac 24851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 17204 - 17502
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||   ||||||||| | ||||||||| || | |||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17204 ttatactacttttactttgagagtttttaaaggtcaacgtaccactaaaattaaaacatatttccttaaaatacctattcatacacttactcaagggaag 17303  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  17304 cagctt-gtgtttttctcattggagaattgtaatcactttgaagcaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaatacaagagttcactttcatgtacaa 17402  T
Q  211 gaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||  || ||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17403 gaaataaccaattaagagcagacaataaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaaacaagctacttaaccatgcctttcacaataaaacagaacaa 17502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 306
Target Start/End: Original strand, 4270 - 4565
Alignment:
Q  11 ttatactactggcactttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaag 110  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||||| || | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||    
T  4270 ttatactacttttactttgagaatttttaaaggtcaacgtaccactaaaattagaacgcatttccttaaaatacctatt-atacacttacttaagggaag 4368  T
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagac-ttaaaacacaagagtttgctttcatgtaca 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4369 caactt-gtgtttttctcattggagaatttcattcattttgaaacaagatgtgggtatatcaagaaaactttaaaatacaagagtttactttcatgtaca 4467  T
Q  210 agaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatat-tttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaa 306  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4468 agaaacaaccaactaagaggagacaataaaaaatttatgtcatgatttatttcattaaaaacaagctacttaaccatgcctttcacaacaaaacaaaa 4565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 36 - 306
Target Start/End: Original strand, 35787 - 36058
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 135  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35787 tttaaaggtcaatgtaccactaaaattagaacgcattttcttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 35886  T
Q  136 aattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa 235  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||  ||||||||||||||||  |  ||| |||||||||||||    
T  35887 aatttcattcattttgaaacaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaatgaaagagttcactttcatgtacaagaaatacccaactaagaggagacaa 35986  T
Q  236 tgaaaattttgtgtcatgatat-tttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaa 306  Q
    | |||||||| || |||| | | ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  35987 taaaaattttatgccatgctttatttcattaaaaacaagctacttaaccatgcctttcacaagaaaacaaaa 36058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 383 - 101
Alignment:
Q  24 actttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttt 123  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  383 actttgagaatttttaatggttaacgtaccactaaaattagaacgcatttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaac-ttgtgcat 285  T
Q  124 ttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaat 223  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   | | |||    
T  284 ttctcattggag-gttttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaggagaacttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaatga-ccaat 187  T
Q  224 aagaggagacaat-gaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||||||  ||||  || ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  186 aagaggagacaataaaaaaaattatgtcatgat-ttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaa 101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 72 - 309
Target Start/End: Original strand, 51213 - 51450
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  51213 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaattt-attcactttaaaacaagatgtgggtatata 51311  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaat 270  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  51312 aagaaaacttaaagcacaagagtttactttcatgtacaagaattaactaattaagaggagacaataagaattttatgtcatgatatttttcaataaaaat 51411  T
Q  271 tagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
     ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  51412 aagctacttaaccatgtctttcacaataaaacaaaacaa 51450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10911 - 10678
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10911 ttccttaaaatatctattcatacatttactcaagggaagcaactt-gtgcttttctcattggagaattt-attcactttgaaaaaagatgtgggtatatc 10814  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaatt 271  Q
    ||||| |||||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||| |||||||||      
T  10813 aagaaaacttaaattacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagacaat-aaaaatttatgtcatgat-tttccaataaaaaca 10716  T
Q  272 agctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10715 agctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaa 10678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1941 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold1941
Description:

Target: scaffold1941; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 306
Target Start/End: Original strand, 923 - 1193
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 135  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  923 tttaaaggtcaatgtaccattaaaattagaacgcttttccttaaaatacatattcatacacttactcaagggaagcaa-tttgtgtttttctcattggag 1021  T
Q  136 aattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa 235  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| | |||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  1022 aatattattcattttgaaacaaggtgtgggtatatcgagaaaacttaaaataaaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaactgagaggagacaa 1121  T
Q  236 tgaaaattttgtgtcatgatat-tttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaa 306  Q
    | ||| |||| || |||| | | ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1122 taaaatttttatgccatgctttatttcattaaaaacaagctacttaaccatgcctttcacaagaaaacaaaa 1193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 309
Target Start/End: Original strand, 59303 - 59578
Alignment:
Q  24 actttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttt 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  59303 actttgagaatttttaaaggttaacgtaccactaaaattaaaacgcatttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaac-ttgtgcat 59401  T
Q  124 ttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaat 223  Q
    || |          ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||    
T  59402 tttt----------ttttattcactttaaaacaagatgtgggtatataaggagaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacaa-ccaat 59490  T
Q  224 aagaggagacaat---gaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||||||    ||||  || ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  59491 aagaggagacaataaaaaaaaaattatgtcatgat-ttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaa 59578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 641 - 371
Alignment:
Q  26 tttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttttt 125  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| || || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||    
T  641 tttgagaatttttaaaggttaacgtaccactaaaattagaatgcatttccttaaaatatctattcatacatttactcaagggaaggaactt-gtgcattt 543  T
Q  126 ctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataa 225  Q
                ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | | |||||    
T  542 ------------ttttattcactttaaaacaagatgtgggtatataaggaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaacga-ccaataa 456  T
Q  226 gaggagacaatgaaaattttgtgtcatga-tattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||| | |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  455 gaggagacaataaaaaatttatgtcatgatttttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaa 371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 11918 - 11651
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 135  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| |||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  11918 tttaaaggttaacgtaccactaaaattagaacgtgcttccttaaaatacctattcatacacttgctcaagggatgcaacttt-tgcttttctcattggag 11820  T
Q  136 aattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa 235  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||    
T  11819 aatt--attcacaataaaacaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccgatttagaggagacaa 11722  T
Q  236 tgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
      |||| ||| ||||||   ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  11721 -caaaaatttatgtcat--aattttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcgcaacaaaacaaaacaa 11651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 309
Target Start/End: Original strand, 233480 - 233747
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 135  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| |||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  233480 tttaaaggttaacgtaccactaaaattagaacgtgcttccttaaaatacctattcatacacttgctcaagggatgcaacttt-tgcttttctcattggag 233578  T
Q  136 aattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa 235  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||    
T  233579 aatt--attcacaataaaacaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccgatttagaggagacaa 233676  T
Q  236 tgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
      |||| ||| ||||||   ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  233677 -caaaaatttatgtcat--aattttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcgcaacaaaacaaaacaa 233747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Original strand, 2956 - 3170
Alignment:
Q  24 actttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgttt 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  2956 actttgagaatttttaaaggttaacgtaccactaaaattagaacgcatttccttaaaatacctattcatacatttactcaagggaagcaac-ttgtgcat 3054  T
Q  124 ttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaat 223  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | | | |||    
T  3055 atctcattggag-gttttattcactttaaaacaagatgtgggtatattatgagaacttaaaacacaagattttactttcatgtacaagaaacga-ccaat 3152  T
Q  224 aagaggagacaatgaaaa 241  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  3153 aagaggagacaataaaaa 3170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 166 - 309
Target Start/End: Original strand, 1 - 146
Alignment:
Q  166 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaa-ttttgtgtcatga-tattttcaa 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  1 tatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaacaaaataagaggcgacaatgaaaatttttgtgtcatgatttttttcaa 100  T
Q  264 taaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101 tagaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 44914 - 44715
Alignment:
Q  102 caagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagactt-aaaacacaagagtttgctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  44914 caagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagaattt-attcactttaaaacaagatgtgggtatatcaggaaaactttaaaacacaagagtttactt 44817  T
Q  201 tcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataa 299  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  44816 tcatgtacaagaattaaccaattaagaggagacgataaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaaacaagctacctaaccatgcctttcacaataa 44717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 52303 - 52104
Alignment:
Q  102 caagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagactt-aaaacacaagagtttgctt 200  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  52303 caagggaagcaactt-gtgcatttctcattggagaattt-attcactttaaaacaagatgtgggtatatcaggaaaactttaaaacacaagagtttactt 52206  T
Q  201 tcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgata-ttttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataa 299  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  52205 tcatgtacaagaattaaccaattaagaggagacgataaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaaacaagctacctaaccatgcctttcacaataa 52106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 309
Target Start/End: Original strand, 928 - 1195
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 135  Q
    ||||| |||||||  |||||||| |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  928 tttaagggttaatataccactaaaattagaacgcgct-ccttaaaatacctattcatacgcttgctcaagggatgcaactt-gtgcttttctcattggag 1025  T
Q  136 aattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa 235  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||| |    
T  1026 aatt--attcacaataaaacaagatgtgggtatatcacgaaaacttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagacca 1123  T
Q  236 tgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
      |||| ||| |||||| || |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  1124 -caaaaatttatgtcataat-ttttcaataaaaacaagctacttaatcatgccttttgcaattaaacaaaacaa 1195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0374 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0374
Description:

Target: scaffold0374; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 123 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9637 - 9449
Alignment:
Q  123 tttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaa 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||     
T  9637 tttctcattggagaattt-attcattttgaaacaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaataaccaat 9539  T
Q  223 taagaggagac-aatgaaaattttgtgtcatgata-ttttcaat-aaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  9538 taagagaagacaaataaaaaatttatgtcatgatatttttcaataaaaaataagctacttaaccatgcctttcacaataaaacagaacaa 9449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 306
Target Start/End: Original strand, 32238 - 32502
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 135  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| |||| | || ||||||||||| |||||||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32238 tttaaaggttaacgtaccactaaaattagaacgtgctttcttaaaatacctattcatacacatgctcaagggatgcaactt-gtgcttttctcattggag 32336  T
Q  136 aattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaa 235  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| ||| | ||||||||| |    
T  32337 aatt--attcacaataaaacaagatgtgggtatatcaagaaaacttaaaacacaagagttcactttcgtgtacaagaaacaaccaatttagaggagac-a 32433  T
Q  236 tgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaa 306  Q
      |||| ||| ||||||   ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  32434 gcaaaaatttatgtcat--aattttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcgcaattaaacaaaa 32502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 81 - 301
Target Start/End: Original strand, 18916 - 19137
Alignment:
Q  81 atacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagact 180  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  18916 atacctatccatacatttacttaagggaagcaactt-gtgtatttctcattggagaattt-attcagtttaaaacaagatgtgagtatatcaggaaaatt 19013  T
Q  181 taaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaat--gaaaattttgtgtcatgatatttt-caataaaaattagctac 277  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||   ||||  || ||| || ||||||| |||||||||  ||||||    
T  19014 taaaacacaagagtttactttcatgtacaagaaataaccaattaagaggagacaataaaaaaaaattatgtaataatattttccaataaaaacaagctac 19113  T
Q  278 ttaaccatgccttttacaataaaa 301  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  19114 ttaaccatgcctttcacaataaaa 19137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 74 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10644 - 10416
Alignment:
Q  74 ccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaa 173  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||  ||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10644 ccttgaaatacctattcatacacttactcaagggaagcaacttgtttttttttacattgtagaatta-attcactttaaaataagatgtgggtatatcaa 10546  T
Q  174 gaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattag 273  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||| ||| | |||||||||||  |||| ||| |||||| || |||||||||||||  ||    
T  10545 gaaaacttaaaacacaagagtttactttcatgtacaa----caaccaatttagaggagacaa-caaaaatttatgtcataat-ttttcaataaaaacaag 10452  T
Q  274 ctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10451 ctacttaatcatgcctttcacaaaaaaacaaaacaa 10416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 141 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 90700 - 90533
Alignment:
Q  141 tattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttg-ctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaa 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||| ||    
T  90700 tattcactttaaaataagatgtggttatatcaggagaacttaaaacacaagagttttactttcatgtacaagaaacgaccaa-taagaggagacaattaa 90602  T
Q  240 aattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    || ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  90601 aaatttatgtcatgat-ttttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcacaataaaacaaaacaa 90533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 90762 - 90695
Alignment:
Q  24 actttgagaatctttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattca 91  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  90762 actttgagaatttttaaaggttaacgtaccactaaaattagaacgcattttcttaaaatacctattca 90695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0402 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0402
Description:

Target: scaffold0402; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 87 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 7272 - 7055
Alignment:
Q  87 attcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaac 186  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  7272 attcatacaattcctcaagggatgcaactt-gtgctttcctcattgcagaatt--attcacaataaaacaagatgtgtgtatatcaaggaaacttaaaac 7176  T
Q  187 acaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatg 286  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||| |||| ||| ||||||   ||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  7175 acaagaattctctttcatgtacaagaaacaaccaatttagaggagacaataaaaaatttatgtcat--aattttcaataaaaacaagctacttaatcatg 7078  T
Q  287 ccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||  ||| |||||| |||||    
T  7077 cctttcgcaacaaaacataacaa 7055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 302
Target Start/End: Original strand, 7843 - 7918
Alignment:
Q  227 aggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaac 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7843 aggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaac 7918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 307
Target Start/End: Original strand, 13821 - 13999
Alignment:
Q  124 ttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaat 223  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  || |    
T  13821 ttctcattggagaatt--attcacaataaaacaagatgtgggtatatcaagaatccttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacaactaatt 13918  T
Q  224 aagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaac 307  Q
     |||||||||||  |||| ||| ||||||   ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||| |||||||||    
T  13919 tagaggagacaa-caaaaatttatgtcat--aattttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcgcaattaaacaaaac 13999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 307
Target Start/End: Original strand, 17155 - 17333
Alignment:
Q  124 ttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaat 223  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  || |    
T  17155 ttctcattggagaatt--attcacaataaaacaagatgtgggtatatcaagaatccttaaaacacaagagttcactttcatgtacaagaaacaactaatt 17252  T
Q  224 aagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaac 307  Q
     |||||||||||  |||||||  |||||  | ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||| |||||||||    
T  17253 tagaggagacaacaaaaattta-tgtca--aaattttcaataaaaacaagctacttaatcatgcctttcgcaattaaacaaaac 17333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 12165 - 12303
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||| |||||||||||| |    
T  12165 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatt---ttcacaataaaacatgatgtgggtatagc 12261  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  12262 aagaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 12303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1225 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1225
Description:

Target: scaffold1225; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1141 - 957
Alignment:
Q  36 tttaaaggttaatgcaccactaagattaaaacgcgtttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggag 135  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| |||  | | |||||||||||| | ||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||| || |     
T  1141 tttaagggttaatgtaccactaaaattagaacatgct-ccttaaaatacctactcatacacttgctcaagggatgcaactttgtgcttttctcagtgaat 1043  T
Q  136 aattttatt-cactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatca 220  Q
    | |||| || |||  |||||||||||||  ||| | |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  1042 atttttttttcacaataaaacaagatgtcagtacaacaagaacacttaaaacacaagaattcactttcatgtacaagaaacaatca 957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2107 - 1969
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  2107 ttccttaaaatacttattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatatc 2011  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  2010 aagaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 1969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 1922 - 1874
Alignment:
Q  261 caataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1922 caataaaaataagctccttattcatgccttttacaataaaacaaaacaa 1874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 161336 - 161197
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtg-tttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatat 170  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||   ||||||  ||| |||||||||||||||||||||   |||  ||||||  ||||||||||||     
T  161336 ttccttaaaatacctactcatacacttactcaaggattgcaactaagtgctttttctcattggagaatttt---cacaataaaacttgatgtgggtatag 161240  T
Q  171 caagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    |||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  161239 caagaacacttaaaacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 161197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 171621 - 171526
Alignment:
Q  111 caactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaa 210  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||   ||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  |  |||||||||||||    
T  171621 caactttgtgcttttctcatag-agaatttt---cacattaaaaaaagatgtgggtatagcaagaacacttaaaatacaagaaatcactttcatgtacaa 171526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 12025 - 11792
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| | ||||||| || |||||||   || |||  ||| ||||||||||||||||||||   |||  ||||||  |||||||||||| |    
T  12025 ttccttaaaatacctactcatacacttgctcaaggattgcgactaagtgcttttctcattggagaatttt---cacaataaaacttgatgtgggtatagc 11929  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaatcaatcaaataagaggagacaatgaaaattttgtgtcatgatattttcaataaaaatt 271  Q
     |||| |||||||||||||||  |   ||||||||||||||| | | ||  | ||| |||||||  |||| ||| |||||| |||    |||||||||      
T  11928 cagaacacttaaaacacaagaaatcattttcatgtacaagaaacgaccattttagaagagacaacaaaaaatttatgtcataata-aaacaataaaaaca 11830  T
Q  272 agctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11829 agctgcttaatcatgccttttacaataaaacaaaacaa 11792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29997 - 29859
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  29997 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 29901  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |   |||||||||||||||    
T  29900 aagaacacttacaacacaagaaatcattttcatgtacaagaa 29859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10070 - 9932
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||| ||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  10070 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctctttggagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 9974  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||| | ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  9973 aagcatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 9932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9889 - 9841
Alignment:
Q  261 caataaaaattagctacttaaccatgccttttacaataaaacaaaacaa 309  Q
    |||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9889 caataaaaacaagctgcttattcatgccttttacaataaaacaaaacaa 9841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 22862 - 23000
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||| ||||||| |    
T  22862 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatt---ttcacaataaaacttgatgagggtatagc 22958  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    || || ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  22959 aaaaacacttacaacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 23000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0656 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0656
Description:

Target: scaffold0656; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 192
Target Start/End: Original strand, 3241 - 3358
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  3241 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcttttctcattggagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtatagc 3337  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaaga 192  Q
    ||||| ||| | |||||||||    
T  3338 aagaacactcacaacacaaga 3358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 151
Alignment:
Q  72 ttccttaaaatacccattcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||  |||  |||||||||||||||||   |||||  ||||||  ||||||||||||      
T  268 ttccttaaaatacctattcatacacttactcaaggattgcaactaggtgcctttctcattggagaatt---ttcacaataaaacttgatgtgggtataga 172  T
Q  172 aagaagacttaaaacacaaga 192  Q
    ||||| ||||| |||||||||    
T  171 aagaacacttacaacacaaga 151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0577
Description:

Target: scaffold0577; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6076 - 5954
Alignment:
Q  88 ttcatacatttactcaagggaagcaactttgtgtttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaaca 187  Q
    |||||||| ||||||||||   ||||||  ||| | ||||||||||||||||||   |||  ||||||  |||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  6076 ttcatacacttactcaaggattgcaactaggtgctattctcattggagaatttt---cacaataaaacttgatgtgggtatagcaagaatacttacaaca 5980  T
Q  188 caagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    |||||  |  ||||||||||||||||    
T  5979 caagaaatcactttcatgtacaagaa 5954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22319 - 22228
Alignment:
Q  122 ttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    |||||||||||||||||||  |||||  ||||||  | |||||||||| |||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  22319 ttttctcattggagaatttatttcacaataaaacttgttgtgggtatagcaagaatacttataacacaagaaatcactttcatgtacaagaa 22228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8185 - 8097
Alignment:
Q  122 ttttctcattggagaattttattcactttaaaacaagatgtgggtatatcaagaagacttaaaacacaagagtttgctttcatgtacaagaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||   |||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||  |  ||||||||||||||||    
T  8185 ttttctcattggagaatttt---cacaataaaacttgatgtgggtatatcaagaacacttacaacacgagaaatcactttcatgtacaagaa 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University