View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15724_high_3 (Length: 344)

Name: NF15724_high_3
Description: NF15724
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15724_high_3
NF15724_high_3
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (1-320)||(2043-2362)
scaffold0234 (1-320)||(10934-11253)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (1-320)||(21940831-21941150)
chr8 (1-320)||(22171653-22171972)
chr8 (1-320)||(6094289-6094608)
chr8 (1-320)||(24642815-24643133)
chr8 (1-262)||(15326422-15326683)
chr8 (1-262)||(15506791-15507052)
chr8 (1-140)||(28548393-28548532)
chr8 (66-309)||(14983710-14983950)
chr8 (1-314)||(8371255-8371563)
chr8 (1-306)||(21969333-21969633)
chr8 (114-311)||(24797224-24797419)
chr8 (1-306)||(12562123-12562423)
chr8 (1-306)||(27007519-27007819)
chr8 (1-306)||(27014662-27014962)
chr8 (1-306)||(27880489-27880789)
chr8 (1-306)||(28020670-28020970)
chr8 (15-314)||(38232115-38232412)
chr8 (1-306)||(22130611-22130911)
chr8 (1-306)||(25611195-25611495)
chr8 (1-305)||(22659496-22659795)
chr8 (1-306)||(21916676-21916976)
chr8 (1-306)||(45534275-45534575)
chr8 (96-314)||(18835342-18835556)
chr8 (1-306)||(26240484-26240784)
chr8 (179-318)||(32872741-32872880)
chr8 (1-238)||(6430953-6431186)
chr8 (84-230)||(8781959-8782102)
chr8 (197-283)||(2375214-2375300)
chr8 (9-106)||(24796731-24796826)
chr8 (15-161)||(20535226-20535371)
chr8 (1-238)||(2962934-2963171)
chr8 (209-303)||(29645537-29645631)
chr8 (199-306)||(36970265-36970371)
chr8 (1-112)||(36970439-36970549)
chr8 (26-148)||(29645675-29645797)
chr8 (3-112)||(2375411-2375520)
chr8 (207-259)||(10920427-10920479)
chr8 (232-287)||(24535514-24535569)
chr8 (285-320)||(28555049-28555084)
chr8 (11-59)||(41368106-41368154)
chr8 (11-59)||(41375077-41375125)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (1-320)||(17684191-17684510)
chr6 (1-320)||(27380974-27381293)
chr6 (1-320)||(27471357-27471676)
chr6 (1-320)||(11651889-11652208)
chr6 (1-320)||(17691162-17691481)
chr6 (1-320)||(29309056-29309375)
chr6 (1-320)||(29316016-29316334)
chr6 (1-320)||(188699-189018)
chr6 (1-238)||(27296877-27297114)
chr6 (1-272)||(16394167-16394438)
chr6 (3-240)||(25536915-25537152)
chr6 (1-221)||(16559194-16559414)
chr6 (16-324)||(13359010-13359314)
chr6 (216-320)||(16566257-16566361)
chr6 (9-303)||(2669476-2669768)
chr6 (1-306)||(16789071-16789371)
chr6 (1-306)||(22859890-22860190)
chr6 (1-306)||(27508349-27508649)
chr6 (1-306)||(1586110-1586410)
chr6 (13-306)||(27527947-27528235)
chr6 (43-306)||(18019885-18020143)
chr6 (1-306)||(14074480-14074780)
chr6 (21-314)||(10359073-10359359)
chr6 (1-306)||(8612915-8613219)
chr6 (177-305)||(27925935-27926062)
chr6 (102-305)||(17850321-17850521)
chr6 (84-236)||(20736413-20736562)
chr6 (183-288)||(28172754-28172859)
chr6 (182-314)||(20553492-20553622)
chr6 (68-253)||(8510155-8510338)
chr6 (268-320)||(25537148-25537200)
chr6 (211-306)||(13995151-13995245)
chr6 (96-238)||(21994655-21994794)
chr6 (1-112)||(33317055-33317165)
chr6 (1-238)||(17120507-17120740)
chr6 (96-308)||(19218427-19218630)
chr6 (171-292)||(19347092-19347212)
chr6 (127-307)||(22560311-22560487)
chr6 (77-140)||(28172899-28172963)
chr6 (16-155)||(28756145-28756283)
chr6 (84-231)||(5758565-5758709)
chr6 (96-308)||(4073574-4073781)
chr6 (270-306)||(20736594-20736630)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (1-320)||(18262378-18262697)
chr4 (1-320)||(18269239-18269558)
chr4 (1-320)||(55612849-55613168)
chr4 (1-320)||(26963806-26964125)
chr4 (1-320)||(26970629-26970948)
chr4 (1-320)||(868763-869082)
chr4 (1-320)||(19926482-19926801)
chr4 (1-320)||(5707486-5707805)
chr4 (1-320)||(5714114-5714433)
chr4 (1-320)||(8858333-8858652)
chr4 (1-320)||(10621055-10621374)
chr4 (1-314)||(10628134-10628447)
chr4 (1-320)||(28392856-28393175)
chr4 (1-320)||(8845369-8845688)
chr4 (1-320)||(4426338-4426645)
chr4 (1-314)||(35223732-35224045)
chr4 (1-310)||(5667851-5668156)
chr4 (1-320)||(20311458-20311775)
chr4 (4-231)||(10677308-10677534)
chr4 (4-231)||(10890948-10891174)
chr4 (1-306)||(15461497-15461797)
chr4 (1-306)||(34975551-34975851)
chr4 (1-306)||(2677013-2677313)
chr4 (1-306)||(15815021-15815321)
chr4 (1-306)||(18111045-18111345)
chr4 (1-306)||(3369025-3369325)
chr4 (17-306)||(17299977-17300261)
chr4 (1-306)||(18163162-18163462)
chr4 (1-306)||(20243937-20244237)
chr4 (1-306)||(26531613-26531913)
chr4 (174-310)||(56516232-56516368)
chr4 (1-306)||(4675985-4676285)
chr4 (100-250)||(21453961-21454110)
chr4 (1-305)||(5870419-5870718)
chr4 (15-306)||(19365519-19365806)
chr4 (1-306)||(1941724-1942024)
chr4 (16-238)||(19362477-19362695)
chr4 (12-285)||(32646536-32646807)
chr4 (1-231)||(9487625-9487851)
chr4 (101-306)||(32636484-32636685)
chr4 (15-238)||(5528495-5528714)
chr4 (15-314)||(5616387-5616681)
chr4 (224-302)||(24700213-24700291)
chr4 (1-219)||(30040491-30040705)
chr4 (15-231)||(9538033-9538244)
chr4 (84-306)||(4546080-4546298)
chr4 (1-216)||(11421096-11421307)
chr4 (77-127)||(24701361-24701411)
chr4 (96-250)||(33888594-33888743)
chr4 (262-314)||(10677538-10677590)
chr4 (262-314)||(10891178-10891230)
chr4 (132-259)||(34777850-34777975)
chr4 (248-318)||(9937933-9938003)
chr4 (27-108)||(9937745-9937826)
chr4 (138-229)||(9937830-9937923)
chr4 (270-306)||(11421016-11421052)
chr4 (270-314)||(30040740-30040784)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (1-320)||(6110230-6110549)
chr3 (1-320)||(16482205-16482524)
chr3 (1-320)||(10579077-10579396)
chr3 (1-320)||(15600606-15600925)
chr3 (1-320)||(15607151-15607470)
chr3 (1-320)||(10572314-10572633)
chr3 (1-320)||(15341941-15342260)
chr3 (1-320)||(18520141-18520460)
chr3 (3-313)||(18522836-18523146)
chr3 (1-305)||(8490676-8490980)
chr3 (1-320)||(15357308-15357627)
chr3 (1-320)||(17780840-17781159)
chr3 (1-320)||(13211468-13211787)
chr3 (1-314)||(13248779-13249092)
chr3 (1-320)||(32056621-32056941)
chr3 (1-320)||(17199906-17200225)
chr3 (1-320)||(13516977-13517292)
chr3 (1-314)||(1647243-1647556)
chr3 (1-320)||(17136525-17136838)
chr3 (1-320)||(29925137-29925456)
chr3 (1-320)||(29974290-29974609)
chr3 (1-289)||(16200627-16200915)
chr3 (1-306)||(21034238-21034538)
chr3 (1-306)||(15846538-15846838)
chr3 (1-306)||(20147556-20147856)
chr3 (1-306)||(21398792-21399092)
chr3 (17-314)||(24253130-24253423)
chr3 (1-306)||(14890391-14890691)
chr3 (1-306)||(55427021-55427321)
chr3 (1-306)||(12299911-12300210)
chr3 (1-238)||(25978730-25978963)
chr3 (97-314)||(14147013-14147226)
chr3 (33-231)||(15526827-15527021)
chr3 (1-157)||(28088251-28088406)
chr3 (138-267)||(28953965-28954093)
chr3 (1-238)||(11787654-11787887)
chr3 (1-303)||(15317178-15317472)
chr3 (268-320)||(19089734-19089786)
chr3 (73-265)||(32280313-32280507)
chr3 (221-314)||(9504455-9504548)
chr3 (195-310)||(8251933-8252048)
chr3 (37-152)||(30464147-30464261)
chr3 (247-320)||(16200291-16200363)
chr3 (96-160)||(36138033-36138097)
chr3 (175-227)||(4189223-4189275)
chr3 (96-160)||(36142816-36142880)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (1-320)||(18252196-18252515)
chr1 (1-320)||(18532236-18532555)
chr1 (1-320)||(27131132-27131450)
chr1 (1-320)||(27310299-27310618)
chr1 (1-320)||(16358757-16359076)
chr1 (1-314)||(3855641-3855954)
chr1 (8-314)||(36816363-36816668)
chr1 (1-280)||(22641596-22641871)
chr1 (1-314)||(27277280-27277592)
chr1 (127-320)||(21171081-21171274)
chr1 (1-306)||(19706441-19706741)
chr1 (1-306)||(43802367-43802667)
chr1 (166-320)||(22657108-22657262)
chr1 (1-306)||(28134725-28135025)
chr1 (77-314)||(12014084-12014319)
chr1 (1-290)||(23507096-23507383)
chr1 (1-306)||(9456116-9456416)
chr1 (1-192)||(9916499-9916689)
chr1 (1-306)||(20391241-20391541)
chr1 (1-306)||(20779647-20779947)
chr1 (1-306)||(22670259-22670559)
chr1 (1-306)||(42816991-42817291)
chr1 (1-306)||(22612492-22612792)
chr1 (19-315)||(633925-634216)
chr1 (197-313)||(9917837-9917952)
chr1 (1-306)||(8727667-8727967)
chr1 (1-306)||(47667487-47667776)
chr1 (15-238)||(29096789-29097008)
chr1 (174-306)||(35930582-35930713)
chr1 (201-290)||(12006461-12006550)
chr1 (1-112)||(28145725-28145835)
chr1 (99-231)||(21881475-21881604)
chr1 (86-251)||(24301691-24301855)
chr1 (172-298)||(26923553-26923678)
chr1 (178-231)||(51997353-51997406)
chr1 (66-146)||(12006332-12006413)
chr1 (101-160)||(10852402-10852461)
chr1 (138-217)||(31236402-31236478)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (3-320)||(15152609-15152926)
chr7 (1-320)||(29327950-29328269)
chr7 (1-320)||(11535784-11536103)
chr7 (1-320)||(11542702-11543021)
chr7 (1-325)||(12750987-12751311)
chr7 (1-320)||(12738702-12739021)
chr7 (1-320)||(18561173-18561483)
chr7 (1-310)||(13392326-13392635)
chr7 (11-311)||(18257577-18257874)
chr7 (1-306)||(2204552-2204852)
chr7 (1-306)||(8464999-8465299)
chr7 (1-306)||(18400104-18400404)
chr7 (1-306)||(18407088-18407388)
chr7 (1-306)||(48808498-48808798)
chr7 (11-306)||(30254138-30254428)
chr7 (1-306)||(15729751-15730051)
chr7 (1-306)||(18139340-18139640)
chr7 (1-306)||(19230888-19231188)
chr7 (17-239)||(2365169-2365389)
chr7 (1-238)||(41680970-41681203)
chr7 (11-306)||(47166871-47167161)
chr7 (1-306)||(10668903-10669204)
chr7 (21-305)||(24443349-24443628)
chr7 (1-231)||(34128647-34128873)
chr7 (84-314)||(19388544-19388774)
chr7 (197-287)||(10235361-10235451)
chr7 (1-306)||(28130561-28130861)
chr7 (21-308)||(25845498-25845780)
chr7 (21-308)||(25845917-25846199)
chr7 (37-306)||(19393462-19393726)
chr7 (197-305)||(47833875-47833983)
chr7 (265-320)||(15148308-15148363)
chr7 (1-238)||(18259126-18259359)
chr7 (206-315)||(19859113-19859221)
chr7 (10-147)||(39112138-39112275)
chr7 (173-311)||(3132849-3132986)
chr7 (183-301)||(7662569-7662686)
chr7 (96-231)||(14591924-14592056)
chr7 (96-231)||(16011515-16011647)
chr7 (85-224)||(31190524-31190660)
chr7 (228-314)||(7396361-7396450)
chr7 (99-231)||(22969024-22969153)
chr7 (73-148)||(22948499-22948574)
chr7 (1-187)||(15169292-15169474)
chr7 (183-241)||(7396469-7396527)
chr7 (217-272)||(29983179-29983234)
chr7 (206-309)||(39111989-39112092)
chr7 (268-310)||(2365070-2365112)
chr7 (89-153)||(29984308-29984372)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (1-314)||(24695188-24695501)
chr5 (1-320)||(19714220-19714539)
chr5 (1-320)||(19706941-19707259)
chr5 (1-320)||(18569583-18569904)
chr5 (121-320)||(39538754-39538953)
chr5 (5-290)||(17298627-17298912)
chr5 (5-290)||(17285476-17285759)
chr5 (86-314)||(18806843-18807069)
chr5 (1-161)||(27347258-27347417)
chr5 (1-106)||(24701952-24702057)
chr5 (1-306)||(20941027-20941327)
chr5 (1-306)||(25805387-25805687)
chr5 (1-306)||(31899-32199)
chr5 (1-306)||(12789665-12789965)
chr5 (175-309)||(22546912-22547046)
chr5 (1-306)||(22941250-22941550)
chr5 (1-306)||(23545922-23546222)
chr5 (11-304)||(20100255-20100543)
chr5 (1-306)||(24933308-24933608)
chr5 (1-306)||(31096816-31097116)
chr5 (12-306)||(5097651-5097940)
chr5 (1-306)||(12764992-12765296)
chr5 (1-306)||(7865432-7865736)
chr5 (1-306)||(9811735-9812039)
chr5 (1-306)||(12703876-12704180)
chr5 (86-224)||(18806483-18806619)
chr5 (86-224)||(18806663-18806799)
chr5 (226-314)||(27347425-27347513)
chr5 (1-248)||(18829283-18829530)
chr5 (1-306)||(26245102-26245402)
chr5 (1-84)||(28719477-28719558)
chr5 (1-238)||(26129695-26129928)
chr5 (1-80)||(39538954-39539033)
chr5 (174-303)||(33477193-33477321)
chr5 (261-305)||(39535465-39535509)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (1-320)||(7273-7592)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (1-320)||(6656-6975)
scaffold0390 (1-320)||(13672-13991)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (1-320)||(18454-18772)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (1-320)||(25712-26031)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (1-320)||(21329970-21330289)
chr2 (1-320)||(18796672-18796991)
chr2 (8-314)||(18619976-18620281)
chr2 (1-314)||(36270338-36270648)
chr2 (13-314)||(22183220-22183518)
chr2 (13-311)||(6991847-6992146)
chr2 (8-270)||(20978091-20978351)
chr2 (11-320)||(18822249-18822556)
chr2 (1-306)||(30174377-30174677)
chr2 (1-306)||(24250034-24250334)
chr2 (1-306)||(24229217-24229517)
chr2 (174-314)||(19279460-19279600)
chr2 (197-305)||(18851977-18852085)
chr2 (11-238)||(15342014-15342237)
chr2 (15-305)||(29800468-29800757)
chr2 (28-162)||(17241034-17241167)
chr2 (197-300)||(36801899-36802003)
chr2 (84-306)||(19616435-19616653)
chr2 (66-146)||(36799745-36799826)
chr2 (97-231)||(40301034-40301164)
chr2 (197-304)||(28741220-28741326)
chr2 (24-229)||(41316305-41316506)
chr2 (4-66)||(41661694-41661756)
chr2 (96-231)||(21626824-21626955)
chr2 (84-160)||(28740910-28740986)
chr2 (172-235)||(28718943-28719006)
chr2 (197-314)||(24763751-24763867)
chr2 (270-310)||(12098609-12098649)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (18-320)||(1159-1461)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (1-320)||(5695-6007)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-255)||(230113-230367)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (1-306)||(183-483)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (1-306)||(3677-3977)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-306)||(119730-120030)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (11-306)||(12961-13251)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (37-306)||(130262-130526)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-306)||(67376-67676)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (96-306)||(8305-8511)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-306)||(39990-40290)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (1-238)||(26609-26842)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (197-314)||(90033-90151)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (27-314)||(8723-9005)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (1-189)||(102-286)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (1-231)||(11528-11758)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (96-231)||(83111-83243)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (1-305)||(53766-54064)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (176-267)||(45956-46051)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (270-314)||(15089-15133)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 2043 - 2362
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2043 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 2142  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2143 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 2242  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2243 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 2342  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  2343 agtctctatgctttaatgat 2362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 10934 - 11253
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10934 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 11033  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11034 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 11133  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11134 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 11233  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  11234 agtctctatgctttaatgat 11253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21941150 - 21940831
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941150 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 21941051  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21941050 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 21940951  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940950 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 21940851  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  21940850 agtctctatgctttaatgat 21940831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22171972 - 22171653
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171972 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 22171873  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22171872 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 22171773  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171772 tccaatataaatattactcataatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcagtctacctacataat 22171673  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  22171672 agtctctatgctttaatgat 22171653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 6094608 - 6094289
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094608 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacgaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 6094509  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  6094508 tggtttctggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggcggatcaa 6094409  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  6094408 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcactctacccatataat 6094309  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  6094308 agtctctatgctttaatgat 6094289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 24643133 - 24642815
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24643133 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagaccacgtttgaatggtgacaaaacacttgactccaacatctagggtacatag 24643034  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24643033 tggtttcagttcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataa-ttttactatgtagtattctcatggaggatcaa 24642935  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24642934 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataat 24642835  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    ||||||||| |||| |||||    
T  24642834 agtctctatactttaatgat 24642815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15326683 - 15326422
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326683 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 15326584  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15326583 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 15326484  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatcca 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15326483 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15326422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15507052 - 15506791
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15507052 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 15506953  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15506952 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 15506853  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatcca 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15506852 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15506791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 28548532 - 28548393
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548532 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcaccctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 28548433  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548432 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 28548393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 66 - 309
Target Start/End: Original strand, 14983710 - 14983950
Alignment:
Q  66 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttta 164  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  |    
T  14983710 acaaagtactcgactcttacatctagggtacatagtgatttcaggtcgaaggacggaatacaccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttaca 14983808  T
Q  165 taacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 264  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14983809 taacttt--ctatgtagtattctcatggcgggtcattctaatataa-tattactcctaatatctacatctatgtgaagacttgataacactttttccatg 14983905  T
Q  265 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 309  Q
    ||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  14983906 atccgtgagatatgatcattagtctacccacataatagtccctat 14983950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 8371255 - 8371563
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||||    
T  8371255 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgatcatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatag 8371353  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  8371354 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaa 8371450  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  8371451 tccaatataaatattactcttaatatttatacctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 8371549  T
Q  301 agtctctatgcttt 314  Q
    |||||| |||||||    
T  8371550 agtctcgatgcttt 8371563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21969633 - 21969333
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  21969633 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 21969535  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  21969534 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaa 21969438  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| ||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  21969437 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgatccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 21969339  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  21969338 agtctc 21969333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 114 - 311
Target Start/End: Original strand, 24797224 - 24797419
Alignment:
Q  114 aagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaata 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||     
T  24797224 aagggtggaatacaccac-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtcaatccagtataaatt 24797322  T
Q  214 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgc 311  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| | || ||||||||| |  ||||||||  |||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  24797323 ttactcataatatttatacctacgtgaagacatgatatc-ctatatccatgacccatgagatgtagtcatcaatatactcacataatagtctctatgc 24797419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12562423 - 12562123
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||||    
T  12562423 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatag 12562325  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  12562324 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaa 12562228  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  12562227 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 12562129  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  12562128 agtctc 12562123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 27007519 - 27007819
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  27007519 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 27007617  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  27007618 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 27007714  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  27007715 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 27007813  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  27007814 agtctc 27007819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 27014662 - 27014962
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  27014662 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 27014760  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  27014761 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 27014857  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  27014858 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 27014956  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  27014957 agtctc 27014962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 27880489 - 27880789
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  27880489 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 27880587  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  27880588 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 27880684  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  27880685 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 27880783  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  27880784 agtctc 27880789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 28020670 - 28020970
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  28020670 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 28020768  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  28020769 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 28020865  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  28020866 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 28020964  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  28020965 agtctc 28020970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 314
Target Start/End: Original strand, 38232115 - 38232412
Alignment:
Q  15 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 114  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||| | |   |||||| |||||||| | ||||| |||||||| |    ||||| |||      
T  38232115 cccatcaaccaactttataaccatcatgtcacggacaacgtttgtacgacaacaaagtactcgacttctacatcaagggtacacatcaatttcaagtctg 38232214  T
Q  115 agggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaata 213  Q
    ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||| | | ||||| |||  ||||||||  |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  38232215 aggatggaatacaccacttatcattatgcgaataacctgtgaca-tttacataacttt--ctatgtagcattctcacggcggatcaatccaatataaata 38232311  T
Q  214 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 313  Q
    |||| | |||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| | |||||||    
T  38232312 ttacccataatatgtgtatctatgtcaagactggatcactctttatccatgatccgtgagatgtgattatcagtctacccacaaaatagtttttatgctt 38232411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 22130611 - 22130911
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  22130611 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 22130709  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  22130710 tggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 22130806  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  22130807 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 22130905  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  22130906 agtctc 22130911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25611495 - 25611195
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||  |||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  25611495 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacactatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 25611397  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  25611396 tggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacagtttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaa 25611300  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |||||||   |||||||||||| ||||||||    
T  25611299 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcagtcatcagtctacatacataat 25611201  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  25611200 agtctc 25611195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 22659496 - 22659795
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||||    
T  22659496 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatag 22659594  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  22659595 tggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaa 22659691  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  |||||||   |||||||||||| ||||||||    
T  22659692 tccagtatacatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcagtcatcagtctacatacataat 22659790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21916976 - 21916676
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  21916976 tgattcatcaagtgcccatcaaccaaagttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 21916878  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  || ||||||||||||||    || ||||    
T  21916877 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--acaatgtagtattctcacagtgggtcaa 21916781  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  21916780 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgcatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 21916682  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  21916681 agtctc 21916676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 45534275 - 45534575
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  45534275 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 45534373  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  45534374 tggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 45534470  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  45534471 tccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 45534569  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  45534570 agtctc 45534575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18835556 - 18835342
Alignment:
Q  96 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 195  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||| |  ||    
T  18835556 cataatggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcactgtgtgaatatcttatgaca-tttttaaaacat--actatgtagtattctcacggtgg 18835460  T
Q  196 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 295  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||||| | |||||||||| |||    
T  18835459 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgtggtaatcagtctacatac 18835361  T
Q  296 ataatagtctctatgcttt 314  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  18835360 ataatagtctcgatgcttt 18835342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26240784 - 26240484
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||  |||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||||    
T  26240784 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacaaacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatag 26240686  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||| ||||| ||| | |  |||||  |  |||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  26240685 tggttttaggtctaagagcgatatacattataatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaa 26240589  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||| | ||||||||    
T  26240588 tccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatatacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtcttcatacataat 26240490  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  26240489 agtctc 26240484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 179 - 318
Target Start/End: Original strand, 32872741 - 32872880
Alignment:
Q  179 tagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtg 278  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||  | |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |    
T  32872741 tagtattctcatgacagatcaattcaatataaatattattactaatacttatgccgatgtaaagacttgatacctctttattcatgatctgtgagataag 32872840  T
Q  279 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatg 318  Q
    ||| | |||| | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  32872841 atcgtgagtccagccgcataatagtctctatgctttgatg 32872880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6431186 - 6430953
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||||    
T  6431186 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcatag 6431088  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    || |||||||||  || | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || || |    
T  6431087 tgatttcaggtcttagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtcta 6430991  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 238  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6430990 tctagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 6430953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 230
Target Start/End: Original strand, 8781959 - 8782102
Alignment:
Q  84 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 183  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    |||||||||||    
T  8781959 acatctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--agactatgtagta 8782055  T
Q  184 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttat 230  Q
    |||||| |  ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  8782056 ttctcacggtggatcaatcaagtataaatattagtcctaatatttat 8782102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2375300 - 2375214
Alignment:
Q  197 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 283  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  2375300 tcaatccaatatacatattactcataatatttatatttatgtgaaaatttgataactcattatccatgatacgtgtgatgtgatcat 2375214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 106
Target Start/End: Original strand, 24796731 - 24796826
Alignment:
Q  9 ggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  | |||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24796731 ggagtacccatcaaccaattttatagccattatattacaga--acgattgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtatatagtggttt 24796826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 161
Target Start/End: Original strand, 20535226 - 20535371
Alignment:
Q  15 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 114  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||| || ||||  || || ||  |||||||||| |||||| |    
T  20535226 cccattaaccaacattatggttatcctgttatagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtccat-atttaaggatcatagtggttccaggtcta 20535324  T
Q  115 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt 161  Q
    || |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20535325 agagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacacttt 20535371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 2962934 - 2963171
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||| |||| || ||||| || | ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| || |||||||  |||||    
T  2962934 tgattcatcaagtaaccatcaaccaacgttatggttatccttttgcagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acgtctagggatcatag 2963032  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---ttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 197  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||| | |||||||||||||||||| |   | | ||||  | |||||||||||||||||  |   | |    
T  2963033 tggtttcaggtctaagagggatatacgctattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataa--tgtactatgtagtattctcgcggtaggt 2963130  T
Q  198 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 238  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2963131 ctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 2963171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29645631 - 29645537
Alignment:
Q  209 aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagt 303  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||    
T  29645631 aaatattactcttaatgtttatatatatgtgaagagttgataaatctttatgcatgaaccatgagatgtggtcatcagtttacccacgtaatagt 29645537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36970371 - 36970265
Alignment:
Q  199 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||| ||||| |||||     
T  36970371 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcaatctacatacatg 36970273  T
Q  299 atagtctc 306  Q
    ||||||||    
T  36970272 atagtctc 36970265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 36970549 - 36970439
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||  | |||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||||    
T  36970549 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttacccttttacatataacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcatag 36970451  T
Q  101 tggtttcaggtc 112  Q
    ||||||||||||    
T  36970450 tggtttcaggtc 36970439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 29645797 - 29645675
Alignment:
Q  26 actttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaata 125  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| |   |||||| | | || ||| | ||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||| | ||    
T  29645797 actttatagtcatccttttacaaacaacatttgaacgtctacaaagaaattgaatcctatatctaggatacgtagaagtttcaggtcgaatggtgaagta 29645698  T
Q  126 caccactatcactatgagaatat 148  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  29645697 catcactatcactatgagaatat 29645675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 2375520 - 2375411
Alignment:
Q  3 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||  | ||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||| |||| ||| |     
T  2375520 attcatggagcacccatcaaccgactttatagttatccaattgcggatgatgtttgtatagcaacaaagtactcgactcctacatctatggtaaataata 2375421  T
Q  103 gtttcaggtc 112  Q
    ||||||||||    
T  2375420 gtttcaggtc 2375411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10920479 - 10920427
Alignment:
Q  207 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttat 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  10920479 ataaatattactcataatatttatacatatgtgaatatttgataactctttat 10920427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24535569 - 24535514
Alignment:
Q  232 tctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagt 287  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || |||| |||||||||||    
T  24535569 tctatgtgaaaacttgataactcattattcatgatccgtaagatatgatcatcagt 24535514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 285 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28555084 - 28555049
Alignment:
Q  285 agtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28555084 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 28555049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Original strand, 41368106 - 41368154
Alignment:
Q  11 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttga 59  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  41368106 agtacctattaaccaactttatagttatcatgttacagacaacgtttga 41368154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Original strand, 41375077 - 41375125
Alignment:
Q  11 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttga 59  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  41375077 agtacctattaaccaactttatagttatcatgttacagacaacgtttga 41375125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 17684191 - 17684510
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684191 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 17684290  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17684291 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 17684390  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684391 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 17684490  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  17684491 agtctctatgctttaatgat 17684510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 27380974 - 27381293
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27380974 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 27381073  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27381074 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 27381173  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381174 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 27381273  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  27381274 agtctctatgctttaatgat 27381293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 27471357 - 27471676
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471357 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 27471456  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27471457 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 27471556  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471557 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 27471656  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  27471657 agtctctatgctttaatgat 27471676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 11652208 - 11651889
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652208 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 11652109  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11652108 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 11652009  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11652008 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataat 11651909  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  11651908 agtctctatgctttaatgat 11651889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 17691162 - 17691481
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691162 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 17691261  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17691262 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 17691361  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691362 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 17691461  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  17691462 agtctttatgctttaatgat 17691481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 29309375 - 29309056
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29309375 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacctgactccaacatctagggtacatag 29309276  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29309275 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 29309176  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309175 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 29309076  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  29309075 agtctctatgctttaatgat 29309056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 29316334 - 29316016
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29316334 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcact-gactccaacatctagggtacatag 29316236  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29316235 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 29316136  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316135 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 29316036  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  29316035 agtctctatgctttaatgat 29316016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 188699 - 189018
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188699 tgatttatggagtatccatcaatcaactttatagtcattctgttacagacaatatttgaatgataacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 188798  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  188799 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 188898  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  188899 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacccacataat 188998  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  188999 agtctctatgctttaatgat 189018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27297114 - 27296877
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297114 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 27297015  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27297014 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 27296915  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27296914 tccaatataaatattactcctaatatttatatcaatgt 27296877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Original strand, 16394167 - 16394438
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16394167 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgattccaacatctagggtacatag 16394266  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||    
T  16394267 tggtttcaagtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactacgtagtattctcatggtgggtcaa 16394366  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16394367 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactgtttatccatgatatgtga 16394438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Original strand, 25536915 - 25537152
Alignment:
Q  3 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25536915 attcatggagtacccatcaaccaactttataatcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtaaatagtg 25537014  T
Q  103 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatc 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25537015 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactgtcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 25537114  T
Q  203 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtga 240  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25537115 caatataaatatgacacctaatatttatatctatgtga 25537152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 16559194 - 16559414
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16559194 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctacggtacatag 16559293  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16559294 cggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtggatcaa 16559393  T
Q  201 tccaatataaatattactcct 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16559394 tccaatataaatattactcct 16559414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 324
Target Start/End: Original strand, 13359010 - 13359314
Alignment:
Q  16 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||  |||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13359010 ccatcaaccgactttatagtcatcctgttacggacgatgtttgtacggcaacaaaatactcgactcctacatctaaggtacatagtggtttcaggtcgaa 13359109  T
Q  116 gggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||  ||||  ||| | |||||||||  |||||  |   |||| |||||||||||     
T  13359110 gggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataa--ttttcaatgtagtat--tcatggtgagacaattcaatataaatac 13359204  T
Q  215 tactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 314  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||    
T  13359205 tacttctaatacttatatctaagtgaagatttgataactttttatccatgatttgcgagatgtgatcatcagtctatccatataatagtctctacgcttt 13359304  T
Q  315 gatgatgtcc 324  Q
     ||| |||||    
T  13359305 aatgttgtcc 13359314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 216 - 320
Target Start/End: Original strand, 16566257 - 16566361
Alignment:
Q  216 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16566257 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 16566356  T
Q  316 atgat 320  Q
    |||||    
T  16566357 atgat 16566361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 2669768 - 2669476
Alignment:
Q  9 ggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttca 108  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  || ||| |||||| |   |||||| ||  |||||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  2669768 ggagtaccaatcaactgactttatagtcatcctgttatagataacatttgaacgacaacaaagtaccggactcctacatctagagtacataatgatttca 2669669  T
Q  109 ggtcgaagggtggaatacaccacta-tcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaata 207  Q
    |||| ||  ||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||   | ||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||| ||||    
T  2669668 ggtcaaatagtggaatacacaacttgtcactatgagaataacttatgatacttaa-acaacatt--ctatgtagtattttcatgatgtgtcaatcaaata 2669572  T
Q  208 taaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  2669571 taaatattactcctaatatttatatctatgtgaatacatgataactcttaatcaatgattcatgagatgtgatcatcaatctacccatataatagt 2669476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16789371 - 16789071
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  16789371 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 16789273  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  16789272 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 16789176  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  16789175 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 16789077  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  16789076 agtctc 16789071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 22859890 - 22860190
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  22859890 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcatag 22859988  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  22859989 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 22860085  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  22860086 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 22860184  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  22860185 agtctc 22860190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 27508349 - 27508649
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  27508349 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcatag 27508447  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  27508448 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 27508544  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||     
T  27508545 tccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataac 27508643  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  27508644 agtctc 27508649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 1586110 - 1586410
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  1586110 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 1586208  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  1586209 tggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 1586305  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  1586306 tccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 1586404  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  1586405 agtctc 1586410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 27527947 - 27528235
Alignment:
Q  13 tacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtc 112  Q
    ||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  27527947 tacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcatagtggtttcaggtc 27528045  T
Q  113 gaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaat 212  Q
     ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||    || ||||||||||| ||||    
T  27528046 taagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaat 27528142  T
Q  213 attactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27528143 attactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataacagtctc 27528235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 306
Target Start/End: Original strand, 18019885 - 18020143
Alignment:
Q  43 ttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatga 142  Q
    |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || || | ||||||| |  ||||||| ||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||    
T  18019885 ttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcga-catctagagatcatagtgatttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtga 18019983  T
Q  143 gaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaag 242  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18019984 gaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatag 18020080  T
Q  243 acttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 306  Q
    |||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18020081 acttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 18020143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14074780 - 14074480
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||| || || | |||||||||  |||||    
T  14074780 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaaaggcaacaaagcacttgagtcta-catctagggatcatag 14074682  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| |    ||||||   ||||| | ||| |||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  14074681 tggtttcaggtctaagagcaatatacacttttatcattgtgaaaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaa 14074585  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  14074584 tccattataaatattactcccaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 14074486  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  14074485 agtctc 14074480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 314
Target Start/End: Original strand, 10359073 - 10359359
Alignment:
Q  21 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 120  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||   | ||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||    
T  10359073 aaccaacttaatggttatcctgttacggacaatgtttgaatgacaataaagcacacgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtg 10359171  T
Q  121 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcc 220  Q
    | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  || |||||   |||||||||||||| ||| |  || || ||||| ||||||||||||       
T  10359172 gtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacac--ttcataac--atactatgtagtattttcacggtgggtcgatccagtataaatattaccta 10359267  T
Q  221 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 314  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||   || ||||| |  ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||| |||||    
T  10359268 taatatttatatctatgtatagacttaatatctc-acattcatga-ccatgagatgtggtcatcactctacatatataatagtctctacgcttt 10359359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8613219 - 8612915
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||  ||| || |||| |||||||||  |||||    
T  8613219 tgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcatag 8613121  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---ttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 197  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |   | | |||||   |||||||||||||||||| |  || |    
T  8613120 tggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgggt 8613023  T
Q  198 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacat 297  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||| |||||    
T  8613022 ctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctacatacat 8612924  T
Q  298 aatagtctc 306  Q
    |||||||||    
T  8612923 aatagtctc 8612915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 27926062 - 27925935
Alignment:
Q  177 tgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatg 276  Q
    ||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27926062 tgtagtattatcatggcgagtcaattcaatataaatattattcctaat-ttaatatctatgtgaaaacttcataaatctttatccatgatccgtgagatg 27925964  T
Q  277 tgatcatcagtctacctacataatagtct 305  Q
     |||||||||| || | ||||||||||||    
T  27925963 agatcatcagtttatccacataatagtct 27925935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 305
Target Start/End: Original strand, 17850321 - 17850521
Alignment:
Q  102 ggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttt-tataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||   || |||     | |||||||||||| | |  || ||||    
T  17850321 ggtttcaggtcaaagggtggtatacatcactatcactataagaataacttatgatacttacataaaacc----caatgtagtattcttaaggagggtcaa 17850416  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| || || ||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||    
T  17850417 tccaatatatatattactcataatatttatacctatgtgaatacacgataactcgttgtcaatgatctataagatatgatcatcagtctacccatataat 17850516  T
Q  301 agtct 305  Q
    |||||    
T  17850517 agtct 17850521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 236
Target Start/End: Original strand, 20736413 - 20736562
Alignment:
Q  84 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 183  Q
    ||||||||||  |||||| |||| ||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| | |  | |||||||||    
T  20736413 acatctagggatcatagtagttttaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcatagcat--aatatgtagta 20736509  T
Q  184 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 236  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20736510 ttctcacgatggatcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctat 20736562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28172859 - 28172754
Alignment:
Q  183 attctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 282  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||    
T  28172859 attctcatggagggtcaatccaatataaacactacccttaatatttatatctatgtaaagacttgataactttttaacaatgatctgtaagatgtgatca 28172760  T
Q  283 tcagtc 288  Q
    ||||||    
T  28172759 tcagtc 28172754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 182 - 314
Target Start/End: Original strand, 20553492 - 20553622
Alignment:
Q  182 tattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatc 281  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||   ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20553492 tattctcatgatgggtcaatc-aatataaatattattcttaatatt-atatctatgtgaatgtttgatatttctttatcgatgatatgtgagatgtgatc 20553589  T
Q  282 atcagtctacctacataatagtctctatgcttt 314  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| ||||||||    
T  20553590 atcagtctaccaacataaaaatctttatgcttt 20553622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8510338 - 8510155
Alignment:
Q  68 aaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataa 167  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||| |||||| |||||||||||| || || ||||||| ||  ||||    
T  8510338 aaagtactcgactcctacatctaaggtacatagtggttccaggccgaagcatgtaatgcaccaccatcactatgagagtaactaatgacac-ttacataa 8510240  T
Q  168 cttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaata-tttatatctatgtgaagacttgataact 253  Q
    | ||  |||||||||||| ||||    | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||    
T  8510239 catt--ctatgtagtattatcattgtaggtcaatcaaatataaatattacttctaatattttttatctatatgaagaaatgataact 8510155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Original strand, 25537148 - 25537200
Alignment:
Q  268 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  25537148 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgat 25537200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 306
Target Start/End: Original strand, 13995151 - 13995245
Alignment:
Q  211 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13995151 atattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 13995245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21994794 - 21994655
Alignment:
Q  96 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 195  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| |||||||||||||  ||    
T  21994794 catagtcgtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgaaaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatttagtattctcatggtgg 21994698  T
Q  196 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 238  Q
     ||| |||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  21994697 gtcattccagtataaatattactcgtaatgtttatagctatgt 21994655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 33317165 - 33317055
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||||    
T  33317165 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcatag 33317067  T
Q  101 tggtttcaggtc 112  Q
    ||||||||||||    
T  33317066 tggtttcaggtc 33317055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 17120507 - 17120740
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| | || ||||||||| |||||   |||||||||| || ||| |||| |||||  |||||    
T  17120507 tgattcatcaagcacccatcaaccaacgttatggttatcctttgacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcc-acatatagggatcatag 17120605  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||   |||||| ||| |||||||    || ||||    
T  17120606 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatttagcattctcacagtgggtcaa 17120702  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 238  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  17120703 tccagtataaatactactcctagtatttatacctatgt 17120740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19218630 - 19218427
Alignment:
Q  96 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 195  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||| | || ||||| | |||||||||||||||| | |||| ||||| |  ||||||||||||||||| |  ||    
T  19218630 catagtggtttcaggtctaagagtagtatatatcattatcattctgagaatatcttatgaaa-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgg 19218534  T
Q  196 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 295  Q
     |||||     |||||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| ||| | || ||||| |  |||| |||| |||||||||||| |||    
T  19218533 gtcaat-----ataaattttactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctcat-attcatgacccatgaggtgtggtcatcagtctacatac 19218440  T
Q  296 ataatagtctcta 308  Q
    |||||||||||||    
T  19218439 ataatagtctcta 19218427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 19347092 - 19347212
Alignment:
Q  171 ttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 270  Q
    ||||||||||||||||| ||| | | |||||||| || |||||||| || |||| ||||||  |||||||| || ||| ||||||||||| ||||| |||    
T  19347092 ttactatgtagtattctaatggcagttcaatccattacaaatattattc-taatgtttatacttatgtgaaaacatgacaactctttatcaatgatatgt 19347190  T
Q  271 gagatgtgatcatcagtctacc 292  Q
    ||||| || |||||| ||||||    
T  19347191 gagatatggtcatcaatctacc 19347212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 307
Target Start/End: Original strand, 22560311 - 22560487
Alignment:
Q  127 accactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatat 226  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||| |||||||    | ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22560311 accattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtgttctcatagtaggtcaatacagtataaatattactcctaatat 22560407  T
Q  227 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctct 307  Q
    ||| | ||||||  | |||| ||| |||  ||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  22560408 ttaaacctatgtataaacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggtcatcggtctacatgcataatagtctct 22560487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 28172963 - 28172899
Alignment:
Q  77 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactat 140  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28172963 gactcctatatctagggtacatactggtttccggtcgaagggtggaatacaccacttatcactat 28172899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Original strand, 28756145 - 28756283
Alignment:
Q  16 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 115  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||| |||||| |||| ||  |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||  |    
T  28756145 ccatcaaccgactttataggcatcttgttacatacaacatttga-tggtgataaagtacatgactcctacatatatggtacacagtggtttcaggtcata 28756243  T
Q  116 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatga 155  Q
    || ||  ||| | || ||||||||||||||||| ||||||    
T  28756244 ggatgagataaatcattatcactatgagaatattttatga 28756283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Original strand, 5758565 - 5758709
Alignment:
Q  84 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 183  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||| | | ||||||||||||||| || | |  ||||| |  |||||||||||    
T  5758565 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatggcaatctc-ataacgt--actatgtagta 5758661  T
Q  184 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 231  Q
    ||||||    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5758662 ttctcacagtggatctatccagtataaatattactcctaatatttata 5758709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4073781 - 4073574
Alignment:
Q  96 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 195  Q
    ||||||||||| ||||| |||  ||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||| | |  ||||||||||||||| |   |    
T  4073781 catagtggttttaggtctaagattggtatacatcgttatcattatgagaatatcttatgaa--ttttcataacatat--tatgtagtattctcacggtag 4073686  T
Q  196 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 295  Q
     |||||| ||||||||||||||  |||||||||| |  |||||  |||||| ||| |||  ||| ||||| || || ||||||||| ||| |||||  ||    
T  4073685 gtcaatcaaatataaatattacctctaatatttacacttatgtatagacttaatatctc-atattcatgacctatgggatgtgatcctcaatctacaaac 4073587  T
Q  296 ataatagtctcta 308  Q
    |||||||||||||    
T  4073586 ataatagtctcta 4073574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 306
Target Start/End: Original strand, 20736594 - 20736630
Alignment:
Q  270 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 306  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20736594 tgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtctc 20736630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18262697 - 18262378
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262697 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 18262598  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18262597 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 18262498  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262497 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 18262398  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  18262397 agtctctatgctttaatgat 18262378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18269558 - 18269239
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269558 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 18269459  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18269458 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 18269359  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269358 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 18269259  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  18269258 agtctctatgctttaatgat 18269239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 55613168 - 55612849
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613168 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 55613069  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55613068 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 55612969  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612968 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 55612869  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  55612868 agtctctatgctttaatgat 55612849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26964125 - 26963806
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964125 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 26964026  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26964025 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 26963926  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963925 tccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 26963826  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  26963825 agtctctatgctttaatgat 26963806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26970948 - 26970629
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970948 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 26970849  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26970848 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 26970749  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970748 tccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 26970649  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  26970648 agtctctatgctttaatgat 26970629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 869082 - 868763
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  869082 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 868983  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  868982 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 868883  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868882 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 868783  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  868782 agtctctatgctttaatgat 868763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 19926482 - 19926801
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926482 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 19926581  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19926582 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 19926681  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926682 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatttgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 19926781  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  19926782 agtctctatgctttaatgat 19926801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 5707805 - 5707486
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707805 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 5707706  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5707705 tggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 5707606  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707605 tccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 5707506  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  5707505 agtctctatgctttaatgat 5707486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 5714433 - 5714114
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714433 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 5714334  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5714333 tggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 5714234  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714233 tccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 5714134  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  5714133 agtctctatgctttaatgat 5714114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8858652 - 8858333
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858652 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 8858553  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8858552 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 8858453  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8858452 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatatgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagcctacccacataat 8858353  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  8858352 agtctctatgctttaatgat 8858333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 10621055 - 10621374
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621055 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 10621154  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10621155 tggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 10621254  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621255 tccaatataaatattactcctaaaatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 10621354  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  10621355 agtctctatgctttaatgat 10621374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 10628134 - 10628447
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628134 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 10628233  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10628234 tggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 10628333  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628334 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 10628433  T
Q  301 agtctctatgcttt 314  Q
    ||||||||||||||    
T  10628434 agtctctatgcttt 10628447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 28392856 - 28393175
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392856 tgattcatggagtactcatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 28392955  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28392956 tggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 28393055  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28393056 tccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacccacataat 28393155  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  28393156 agtctctatgctttaatgat 28393175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8845688 - 8845369
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845688 tgattcatggagtacccatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 8845589  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8845588 tggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 8845489  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8845488 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatataaagaattgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagcctacccacataat 8845389  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  8845388 agtctctatgctttaatgat 8845369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 4426338 - 4426645
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426338 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaatgtttgaatggtaacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 4426437  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4426438 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaa------------cttttcatagattttactatgtagtattctcatggcggatcaa 4426525  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4426526 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataat 4426625  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  4426626 agtctctatgctttaatgat 4426645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 35224045 - 35223732
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  35224045 tgattcgtggagtacacatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatgttgataaagcactcgactccaacatctaaggtacatcg 35223946  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || ||||    
T  35223945 tggtttcaggtcaaagggtggaatacaacactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggtggttcaa 35223846  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  35223845 tccagtataaatattactcctaatatttatacatatgtaaagacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatccgtctacccacataat 35223746  T
Q  301 agtctctatgcttt 314  Q
    ||||| ||||||||    
T  35223745 agtctatatgcttt 35223732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 5667851 - 5668156
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5667851 tgattcgtggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgac--caacatctagggtacatag 5667948  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||    
T  5667949 tggtttcaggtctaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgagtcaa 5668048  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||| | |||||||    
T  5668049 tccagtataaatattactcctaatatttatacctacgtgaagatatgataactctttatctatgatccgtgaga--tgatcatcggtctatccacataat 5668146  T
Q  301 agtctctatg 310  Q
    ||||||||||    
T  5668147 agtctctatg 5668156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20311775 - 20311458
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  20311775 tgattcgtggagtaccgattaaccgactttatagtcatcctgctacggacaacgtttgtacgggaacaaagtactcgaatcctacatctagggtaaatag 20311676  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatca 199  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| | ||   |||||| |  |||||||||||||||||||| | |||    
T  20311675 tggtttcaagtagaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatgtatgatagttac-ataactgt--ctatgtagtattctcatgacaggtca 20311579  T
Q  200 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataa 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| ||| ||    
T  20311578 atccaatataaaaattactcctaatatttacatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatccatgatatgtgatcatcaatctacccacaaaa 20311479  T
Q  300 tagtctctatgctttgatgat 320  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  20311478 tagtctctatgctttaatgat 20311458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 10677308 - 10677534
Alignment:
Q  4 ttcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtgg 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10677308 ttcatggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacatagtgg 10677406  T
Q  104 tttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatcc 203  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||    
T  10677407 tttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtcaatcc 10677506  T
Q  204 aatataaatattactcctaatatttata 231  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677507 agtataaatattactcctaatatttata 10677534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 10890948 - 10891174
Alignment:
Q  4 ttcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtgg 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10890948 ttcatggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacatagtgg 10891046  T
Q  104 tttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatcc 203  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||    
T  10891047 tttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtcaatcc 10891146  T
Q  204 aatataaatattactcctaatatttata 231  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891147 agtataaatattactcctaatatttata 10891174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15461797 - 15461497
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||||    
T  15461797 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatag 15461699  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  15461698 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaa 15461602  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  15461601 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 15461503  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  15461502 agtctc 15461497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34975851 - 34975551
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||||    
T  34975851 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatag 34975753  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  34975752 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 34975656  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  34975655 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 34975557  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  34975556 agtctc 34975551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2677313 - 2677013
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  2677313 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 2677215  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  2677214 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 2677118  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  2677117 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 2677019  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  2677018 agtctc 2677013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15815321 - 15815021
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  15815321 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 15815223  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  15815222 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 15815126  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  15815125 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 15815027  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  15815026 agtctc 15815021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 18111045 - 18111345
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  18111045 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 18111143  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  18111144 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 18111240  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  18111241 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 18111339  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  18111340 agtctc 18111345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 3369025 - 3369325
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||| || |  |||||    
T  3369025 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catcaagagatcatag 3369123  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  3369124 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 3369220  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  3369221 tccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 3369319  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  3369320 agtctc 3369325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 17299977 - 17300261
Alignment:
Q  17 catcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaag 116  Q
    ||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |||    
T  17299977 catcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaggtctaag 17300075  T
Q  117 ggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatta 216  Q
     | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||    
T  17300076 agcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatta 17300172  T
Q  217 ctcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  17300173 ctcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 17300261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18163462 - 18163162
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  18163462 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 18163364  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || | ||    
T  18163363 tggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtgaa 18163267  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18163266 tccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcgatcatcagtctacatacataat 18163168  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  18163167 agtctc 18163162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20244237 - 20243937
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  20244237 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 20244139  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  20244138 tggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 20244042  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  20244041 tccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 20243943  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  20243942 agtctc 20243937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26531913 - 26531613
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  26531913 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 26531815  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  26531814 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 26531718  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  26531717 tccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtatagccttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 26531619  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  26531618 agtctc 26531613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 174 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 56516368 - 56516232
Alignment:
Q  174 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 273  Q
    ||||||||| |||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  56516368 ctatgtagtgttctcatagcgagtcaatccaatataaatattactcatgatatttatacgtatgtgaagacttgataactctttatccattatctgtgag 56516269  T
Q  274 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 310  Q
    || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  56516268 atttgatcattaatctacctacataatagtctctatg 56516232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 4675985 - 4676285
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||  |||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  4675985 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttataatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 4676083  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  4676084 tggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 4676180  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  4676181 tccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 4676279  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  4676280 agtctc 4676285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 250
Target Start/End: Original strand, 21453961 - 21454110
Alignment:
Q  100 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatca 199  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||  ||||||  || |||||||||||||||||  || |||    
T  21453961 gtggtttcaggtcgaagggtgacatacaccactatcacaatgaaaatatcttatgatattttacataactcata-tatgtagtattctcatggtgggtca 21454059  T
Q  200 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 250  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21454060 attcaatataaatattactcctaatatttatatgtatgtgaaaacttgata 21454110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 5870718 - 5870419
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| |||||   ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  5870718 tgattcatcaagtactcatcaaccaacgttattgttatcctattatagacaacgttagaatgacaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcatag 5870620  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||| ||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  5870619 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcatatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 5870523  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  5870522 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 5870424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19365806 - 19365519
Alignment:
Q  15 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 114  Q
    ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| |    
T  19365806 cccattaactaacgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtcta 19365708  T
Q  115 agggtggaatacaccactatcacta-tgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaata 213  Q
    || |||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||| ||||| |  || |||||||| ||||||||    
T  19365707 agagtggtatacaccattatcattggtgagaatatcttatgacactttc-ataacat--actatgtagtactctcacggtgggtcaatccagtataaata 19365611  T
Q  214 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 306  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| || ||| |||  ||  ||||| |  ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  19365610 ttactcctaatatttatacctatgtatagatttaatatctc-atactcatgacccatgagatgtggtcatcagtctacgtatataatagtctc 19365519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1942024 - 1941724
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||||    
T  1942024 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacattagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcatag 1941926  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||| ||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || | ||    
T  1941925 tggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggttaa 1941829  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||  ||||||||    
T  1941828 tccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctatatacataat 1941730  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  1941729 agtctc 1941724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19362695 - 19362477
Alignment:
Q  16 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 115  Q
    |||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||| |  | |||| |||||| ||  ||||||||||||||||  ||    
T  19362695 ccattaaccaccgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcatttaagtcca-catctaaggatcatagtggtttcaggtttaa 19362597  T
Q  116 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 215  Q
    | |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  19362596 gagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacactttg-ataacat--actatgtagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatatt 19362500  T
Q  216 actcctaatatttatatctatgt 238  Q
    |||||||||||| ||| ||||||    
T  19362499 actcctaatattaatacctatgt 19362477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 285
Target Start/End: Original strand, 32646536 - 32646807
Alignment:
Q  12 gtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggt 111  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||  ||||||| | |   |||||| || ||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||    
T  32646536 gtacccatcaaccgacttcataatcatcctgttatggatgacgtttgtacgacaacaaagtacccgactcatacatccaggatacagagttgtttcaggt 32646635  T
Q  112 cgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 210  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||| | |||| || | ||||  | |  ||||| |||  ||||||| ||||| |||   | |||||||||| |||    
T  32646636 cgaagggtaaaatacaccacttatcactacgggaatgtcatgtgact-tatacataaccttt--tatgtagcattcttatggtaggtcaatccaatgtaa 32646732  T
Q  211 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatca 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32646733 atattattcctaatatttatatctatgtgaagactcgatattcctttatcaatgatccgtgagatgtgatcatca 32646807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9487851 - 9487625
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| |||||||||  ||||   |||||  ||| || |||| |||||||||  |||||    
T  9487851 tgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatcctattacagacaacgttataatgacaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcatag 9487753  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | |  |||||||  ||||||||||||||||| || || || |    
T  9487752 tggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataactt--actatgtagtattctcacgatgggtcta 9487656  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttata 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9487655 tccagtataaatattactcctaatatttata 9487625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32636685 - 32636484
Alignment:
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||| |||| || |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  32636685 tggtttcacgtcggagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacattgggtcaa 32636589  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    ||||| ||| |||  ||| ||||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  32636588 tccaatataaatattactcataatatttatacctatgcatggacttaatatctc-gtattcatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 32636490  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  32636489 agtctc 32636484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Original strand, 5528495 - 5528714
Alignment:
Q  15 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 114  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||| || |||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||||  |||||||||  |    
T  5528495 cccattaaccaacattatggttatcctgttacagataacgtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagcagtttcaggtata 5528593  T
Q  115 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 214  Q
    || |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||  | ||||| || ||||||||| |  || | ||| ||||||||||||    
T  5528594 agagtgttatacaccattatcattatgagaatatcttatggca-ttttcataa--tatactacgtggtattctcacgttgggttaatacaatataaatat 5528690  T
Q  215 tactcctaatatttatatctatgt 238  Q
     |||||||||||||||| ||||||    
T  5528691 cactcctaatatttatacctatgt 5528714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 5616681 - 5616387
Alignment:
Q  15 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 114  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||  |||||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||| || |    
T  5616681 cccattaaccaacgttacagttatcttgttacaaacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagatcta 5616583  T
Q  115 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 214  Q
    ||  ||| |||||||| ||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||||  |  ||| ||||||||||||| |   | |||||||| |||||||||    
T  5616582 agattggtatacaccattatcattgtaagaatatcttatgacac-tttcataa--taaactctgtagtattctcacggttggtcaatccagtataaatat 5616486  T
Q  215 tactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 314  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||  | |||| | | |||  |||  |||| |  ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  5616485 tacttctaatatttatacctacgtatatacttaacatctc-atatttatgacccatgagatgtggtcatcaatctacatacataatagtctcaatgcttt 5616387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 224 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24700291 - 24700213
Alignment:
Q  224 tatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24700291 tatttatatctatgtgaagacttaatatctctttatccaagatctgtaagatgtgattatcagtctacccacataatag 24700213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 30040491 - 30040705
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| || ||||| ||||  ||||| || |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||||    
T  30040491 tgattcatcaagtactcattaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacattagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatag 30040589  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||| |||||||  || ||||    
T  30040590 tggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtactctcatggtgggtcaa 30040686  T
Q  201 tccaatataaatattactc 219  Q
    || | ||||||||||||||    
T  30040687 tctagtataaatattactc 30040705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9538244 - 9538033
Alignment:
Q  15 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 114  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| || |||| |||| | ||  ||| ||||||| ||||| |    
T  9538244 cccattaaccaacgttatggttatcctgttacggacaatgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catccaaggatcatggtggtttgaggtcta 9538146  T
Q  115 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 214  Q
    ||  ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| |   |||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||    
T  9538145 agactggac-acgccattatcattgtgagaatatcttatgacactttc-ataacatg--ctatgtagtattctcacgctgggtcaatccagtataaatat 9538050  T
Q  215 tactcctaatatttata 231  Q
    ||||||||| |||||||    
T  9538049 tactcctaacatttata 9538033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4546298 - 4546080
Alignment:
Q  84 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 183  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | |  |||||||  |||||||||||    
T  4546298 acatctagggatcatagtggttttaggtcaaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataactt--actatgtagta 4546202  T
Q  184 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 283  Q
    |||||| |  || ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| ||| ||    
T  4546201 ttctcacggtgggtctgtccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcgattat 4546103  T
Q  284 cagtctacctacataatagtctc 306  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  4546102 cagtcaacatacataatagtctc 4546080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11421307 - 11421096
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   | |||||||| || | || |||||| ||  |||||    
T  11421307 tgattcatcgagtacccattagccaacattatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaataaagcacttgagtaca-catctacggatcatag 11421209  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| | | |||  |||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||| | |  || ||||    
T  11421208 tggtttcaggtctatgagtgatatacattattatccctgtgataatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctaacggtgggtcaa 11421112  T
Q  201 tccaatataaatatta 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  11421111 tccaatataaatatta 11421096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 24701411 - 24701361
Alignment:
Q  77 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaataca 127  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24701411 gactcctacatctagggtacacagtggttttaggtcgaagggtggaataca 24701361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33888743 - 33888594
Alignment:
Q  96 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 195  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||||  |||| |  |  ||||| ||||| |||||  ||    
T  33888743 catagtgatttcaggtcgaaatgtggcatacaccactgtcaatatgatattatcttatcacactttacataaatcat--tatgtggtattatcatggtgg 33888646  T
Q  196 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 250  Q
     ||||| ||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33888645 gtcaattca---taaatattacacataatatttatatctatgtgaaaacttgata 33888594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 262 - 314
Target Start/End: Original strand, 10677538 - 10677590
Alignment:
Q  262 atgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 314  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  10677538 atgatccgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctatatacttt 10677590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 262 - 314
Target Start/End: Original strand, 10891178 - 10891230
Alignment:
Q  262 atgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 314  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  10891178 atgatccgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctatatacttt 10891230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 259
Target Start/End: Original strand, 34777850 - 34777975
Alignment:
Q  132 tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 231  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| |   | | |||||||||||||||  || |||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||    
T  34777850 tatcactatcaaaatatcttatgacactttacataagtc--aatgtgtagtattctcatggagggtcaatctaatacaaaaattactcattatatttata 34777947  T
Q  232 tctatgtgaagacttgataactctttat 259  Q
      ||| |||||||||||||||| |||||    
T  34777948 catatttgaagacttgataactttttat 34777975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 9937933 - 9938003
Alignment:
Q  248 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatg 318  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||    
T  9937933 ataactctttattcatgatttatgagatgtgatcatgactctacccacacaatagtctatatgcttcgatg 9938003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 108
Target Start/End: Original strand, 9937745 - 9937826
Alignment:
Q  27 ctttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttca 108  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  || |||| | |||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  9937745 ctttatagtcatccttttacgaacaatgtttgaacgacgataaagtattcgactcttacatctagggtacatagtgatttca 9937826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 229
Target Start/End: Original strand, 9937830 - 9937923
Alignment:
Q  138 tatgagaatatcttatgacactttttataacttttacta---tgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatattta 229  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||| |  |||||    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9937830 tatgagaatatcttatggcacatttcataattcatactaagtagtagtattctcatgacgg-tcactgcaatataaatattacttctattattta 9937923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11421052 - 11421016
Alignment:
Q  270 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 306  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11421052 tgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtctc 11421016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 314
Target Start/End: Original strand, 30040740 - 30040784
Alignment:
Q  270 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 314  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  30040740 tgagatgtggtcatcagtctatatacataatagtctcgatgcttt 30040784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 6110549 - 6110230
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110549 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 6110450  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6110449 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 6110350  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110349 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 6110250  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  6110249 agtctctatgctttaatgat 6110230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 16482205 - 16482524
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482205 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 16482304  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16482305 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 16482404  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482405 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 16482504  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  16482505 agtctctatgctttaatgat 16482524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 10579077 - 10579396
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579077 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 10579176  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10579177 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatcaa 10579276  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579277 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 10579376  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  10579377 agtctctatgctttaatgat 10579396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 15600606 - 15600925
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600606 tgattcatggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 15600705  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15600706 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 15600805  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600806 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 15600905  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  15600906 agtctctatgctttaatgat 15600925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 15607151 - 15607470
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607151 tgattcatggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 15607250  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15607251 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 15607350  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607351 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 15607450  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  15607451 agtctctatgctttaatgat 15607470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 10572314 - 10572633
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10572314 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacatag 10572413  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10572414 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacagttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 10572513  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572514 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 10572613  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  10572614 agtctctatgctttaatgat 10572633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 15341941 - 15342260
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15341941 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 15342040  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342041 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 15342140  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342141 tccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 15342240  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||| ||| |||||    
T  15342241 agtctctatgttttaatgat 15342260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18520460 - 18520141
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520460 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 18520361  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18520360 tggtttcagttcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 18520261  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520260 tcaaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 18520161  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  18520160 agtctctatgctttaatgat 18520141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 3 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18523146 - 18522836
Alignment:
Q  3 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523146 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 18523047  T
Q  103 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatc 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18523046 gtttcaggtcgaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggcggatcaatc 18522947  T
Q  203 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522946 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 18522847  T
Q  303 tctctatgctt 313  Q
    |||||||||||    
T  18522846 tctctatgctt 18522836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 8490980 - 8490676
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490980 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 8490881  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8490880 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 8490781  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490780 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 8490681  T
Q  301 agtct 305  Q
     ||||    
T  8490680 cgtct 8490676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 15357308 - 15357627
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357308 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 15357407  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15357408 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 15357507  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357508 cccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 15357607  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||| ||| |||||    
T  15357608 agtctctatgttttaatgat 15357627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 17780840 - 17781159
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780840 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 17780939  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17780940 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 17781039  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781040 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatctatgatttgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 17781139  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  17781140 agtctctatgctttaatgat 17781159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13211787 - 13211468
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  13211787 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacataa 13211688  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13211687 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcggatcaa 13211588  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13211587 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagttgtgatcatcagtctacctacataat 13211488  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  13211487 agtctctatgctttaatgat 13211468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13249092 - 13248779
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13249092 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacatag 13248993  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  13248992 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcgaatcaa 13248893  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13248892 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagttgtgatcatcagtctacctacataat 13248793  T
Q  301 agtctctatgcttt 314  Q
    ||||||||||||||    
T  13248792 agtctctatgcttt 13248779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 32056621 - 32056941
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056621 tgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 32056720  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32056721 tggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 32056820  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaata-tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataa 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  32056821 tccaatataaatattactcataatattttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcattagtctacccacataa 32056920  T
Q  300 tagtctctatgctttgatgat 320  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  32056921 tagtctctatgctttaatgat 32056941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 17199906 - 17200225
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17199906 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgatacgaacaacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctaaggtacatag 17200005  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  17200006 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagcgggtcaa 17200105  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17200106 tccaatacaaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccacgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataat 17200205  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  17200206 agtctctatgctttaatgat 17200225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13517292 - 13516977
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517292 tgattcatggagtacccatctaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtacatag 13517193  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  13517192 tggtttcaggtcgaagggtgggg----ccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatttagtattctcatggaggatcaa 13517097  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13517096 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataat 13516997  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    ||||||| |||||| |||||    
T  13516996 agtctctgtgctttaatgat 13516977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 1647243 - 1647556
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1647243 tgattcatggagtactcatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtatatag 1647342  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||    
T  1647343 tggttttaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgggaatatcgtatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcgagtcaa 1647442  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1647443 tcaaatataaacattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccacataat 1647542  T
Q  301 agtctctatgcttt 314  Q
    ||||||||||||||    
T  1647543 agtctctatgcttt 1647556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17136838 - 17136525
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136838 tgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatgtttactaagcactcgactccaacatctagggtacatag 17136739  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  17136738 tggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttcaataacttttactatgtagtattctcatggtgggtcaa 17136639  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  17136638 tccaatataaatattactccta------atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaaatgtgatcatcagtctacccacataat 17136545  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||| ||| |||||    
T  17136544 agtctctatgttttaatgat 17136525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 29925456 - 29925137
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  29925456 tgattcgtggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacataa 29925357  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  || ||||    
T  29925356 tggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtcaa 29925257  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | |||||||    
T  29925256 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcgatctatccacataat 29925157  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    || ||| ||||||| |||||    
T  29925156 agcctccatgctttaatgat 29925137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 29974609 - 29974290
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  29974609 tgattcgtggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacataa 29974510  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  || ||||    
T  29974509 tggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtcaa 29974410  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | |||||||    
T  29974409 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcgatctatccacataat 29974310  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    || ||| ||||||| |||||    
T  29974309 agcctccatgctttaatgat 29974290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16200915 - 16200627
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16200915 tgattcgtggagtatccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacatttgaatggtgacaaagcactcgacttcaacatctagggtacatag 16200816  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||||||  || ||||    
T  16200815 tggtttcaggtcaaagggttgaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatactttacataattttgactatgtagtattctcatggtgggtcaa 16200716  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtct 289  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16200715 tccaatatgaatattacacctaatatttgtatctatatgaatacttgataattctttatccatgatctgtaagatatgatcatcagtct 16200627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21034538 - 21034238
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  21034538 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 21034440  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  21034439 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaa 21034343  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  21034342 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 21034244  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  21034243 agtctc 21034238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 15846538 - 15846838
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||||    
T  15846538 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagggatcatag 15846636  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  15846637 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaa 15846733  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  15846734 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 15846832  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  15846833 agtctc 15846838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 20147556 - 20147856
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  20147556 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 20147654  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  20147655 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 20147751  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  20147752 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 20147850  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  20147851 agtctc 20147856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21399092 - 21398792
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||||    
T  21399092 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatag 21398994  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | | |||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  21398993 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtaagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaa 21398897  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  21398896 tccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgaggtcataagtctacatacataat 21398798  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  21398797 agtctc 21398792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 314
Target Start/End: Original strand, 24253130 - 24253423
Alignment:
Q  17 catcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaag 116  Q
    ||||||| |||||||| ||||  |||| |  ||||| ||||||| |   |||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  24253130 catcaactaactttatggtcactctgtaattgacaatgtttgaacgacaacaaagtactcgagtcatacatctaaggtacatagtggttttaggtcgaat 24253229  T
Q  117 ggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatta 216  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||   ||||| ||  ||||| | ||||||||||  || |||| ||||||||||||| |    
T  24253230 g-tggaatacaccgttatcactatgagaataacttatgatccttaa-ataacatt--ctatgcattattctcatggagggtcaaaccaatataaatataa 24253325  T
Q  217 ctcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 314  Q
    ||| |||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24253326 ctcttaatgtttataagtatgtgaaaacttgataactctttatccataattcgtgagatatgatcattagtctaccgacataatagtctctatgcttt 24253423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14890691 - 14890391
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| ||||||| |  || ||    
T  14890691 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttataattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcacag 14890593  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    || ||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  14890592 tgctttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaa 14890496  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  14890495 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 14890397  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  14890396 agtctc 14890391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 55427321 - 55427021
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  55427321 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 55427223  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  55427222 tggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 55427126  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  55427125 tccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 55427027  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  55427026 agtctc 55427021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12300210 - 12299911
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  12300210 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaatcacttgagtcca-catctagagatcatag 12300112  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  12300111 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 12300015  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  12300014 tccaatataaatattactcctaacatttatatctatg-atagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 12299917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 25978730 - 25978963
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||||    
T  25978730 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcatag 25978828  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || || |    
T  25978829 tggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtcta 25978925  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 238  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25978926 tccagtataaatattactcctaataattatacctatgt 25978963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14147226 - 14147013
Alignment:
Q  97 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgga 196  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||||||| ||||||| | | |     
T  14147226 atagtggtttcaggtctaagagtgatatacacctttatcaatgtgagaatatcttacgaca-ttttcataacat--actatgtagcattctcacggcagg 14147130  T
Q  197 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 296  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||| || |    
T  14147129 tcaatccagtataaatattcctcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggtcatcagtctacatata 14147031  T
Q  297 taatagtctctatgcttt 314  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  14147030 taatagtctctgtgcttt 14147013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15527021 - 15526827
Alignment:
Q  33 agtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact 132  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||| || ||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  15527021 agtcatgctgttacagacaacgtttgaatggttataaagcacttgagtcca-catgtatggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatacaccatt 15526923  T
Q  133 atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 231  Q
    | || | | |||||||||||||||| |||| ||| |   |||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15526922 aacattgtaagaatatcttatgaca-ttttcatagc--atactatttagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatattactcctaagatttata 15526827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 28088406 - 28088251
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||||| || || |||| |||||||||  |||||    
T  28088406 tgattcatcaagtatccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcccttgagtcca-catctagggatcatag 28088308  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgaca 157  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  28088307 tggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca 28088251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28954093 - 28953965
Alignment:
Q  138 tatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctat 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| || | ||||||| |  |||||||||||||||| | ||||  |||    
T  28954093 tatgagaatatcatatgacactttaaataacttat--tatgtagtattctcatgatgggttaatccaacaacaaatattactcctaatgtgtatacatat 28953996  T
Q  237 gtgaagacttgataactctttatccatgatc 267  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  28953995 gtgaagactttgtaactctttatcaatgatc 28953965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11787887 - 11787654
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |  |  ||||||||  ||||     
T  11787887 tgattcattaagtacccatcaaccaacgttatggttatccatttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgattatag-atctagggatcataa 11787789  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||| | | |  |||||||  ||||||||||||||||| |  || || |    
T  11787788 tggtttcaggtctaagagcgatatacaatattatcattgtgagaatatcttatgaaaatatc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcta 11787692  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 238  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11787691 tccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 11787654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 15317178 - 15317472
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||  | ||||  |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || |||| |||||||||  |||||    
T  15317178 tgattcatcaagtacccgtcaaccaacgttatgattatccgtttacagacaacgttagaatg---acaaagtacttgagtcca-catctagggatcatag 15317273  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |   ||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | |  ||||| |  ||||||||||||||||| |  || || |    
T  15317274 tggtttcaggtctaagagcgatttacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataacgt--actatgtagtattctcacggtgggtcta 15317370  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||| ||||| ||||||||    
T  15317371 tctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcaatctacatacataat 15317469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Original strand, 19089734 - 19089786
Alignment:
Q  268 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  19089734 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgatttaatgat 19089786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 32280507 - 32280313
Alignment:
Q  73 actcgactccaacatctagggtacata----gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataac 168  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||| ||  || |||  |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  32280507 actcgactcctacatctagggtacatatatagtggtttcaagtgaaaaggtaaaataaatcattatcactatgagaatatcttatgacactttacatgac 32280408  T
Q  169 ttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatga 265  Q
      | |||||||| |||||||||   || |||| | | | ||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  32280407 --tcactatgtattattctcattgtgggtcaaccgagtgtaaatattattcgtaatgattatacctatgtgaagattaaataactctttatccatga 32280313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9504548 - 9504455
Alignment:
Q  221 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 314  Q
    |||||||| ||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  9504548 taatatttttatgtatgttaatacttgataactccttatccatgacccgtgagataagattatcagtctacccacataatagtttctatccttt 9504455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 310
Target Start/End: Original strand, 8251933 - 8252048
Alignment:
Q  195 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||| |||||| | | |    
T  8251933 gatcaatcaaatataaatattactcgaaatatgtaaatttatgtaaagatttgataacattttattcatgatccgtaagatgtgatcttcagtccatcca 8252032  T
Q  295 cataatagtctctatg 310  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  8252033 catgatagtctatatg 8252048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 30464261 - 30464147
Alignment:
Q  37 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 136  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||   | ||| |||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| |||||    
T  30464261 atccttttacagacaacgtttgaatgtcaataaaacacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatagaccattatca 30464163  T
Q  137 ctatgagaatatctta 152  Q
     |||||||||||||||    
T  30464162 ttatgagaatatctta 30464147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16200363 - 16200291
Alignment:
Q  247 gataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | ||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  16200363 gataactctttatccatgatctgtaagatatgatcatcagtctctccaca-aatagtctccatgctttaatgat 16200291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 160
Target Start/End: Original strand, 36138033 - 36138097
Alignment:
Q  96 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 160  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  36138033 catagtgatttcaggttgaagggtggtatacaccattatcactttggaaatatcttatggcactt 36138097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4189275 - 4189223
Alignment:
Q  175 tatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatt 227  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  4189275 tatgtaatattctcatgacagatcaatatagtataaatattactcataatatt 4189223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 36142880 - 36142816
Alignment:
Q  96 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 160  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  36142880 catagtggtttcaggttgaagggtgacatacatcattatcactttggaaatatcttatggcactt 36142816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18252515 - 18252196
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252515 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 18252416  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18252415 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 18252316  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252315 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 18252216  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  18252215 agtctctatgctttaatgat 18252196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 18532236 - 18532555
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532236 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 18532335  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18532336 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 18532435  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18532436 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatctacataat 18532535  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  18532536 agtctctatgctttaatgat 18532555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 27131132 - 27131450
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27131132 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg-tacatag 27131230  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27131231 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 27131330  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131331 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 27131430  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  27131431 agtctttatgctttaatgat 27131450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 27310299 - 27310618
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310299 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 27310398  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27310399 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 27310498  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27310499 tccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccataatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataat 27310598  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  27310599 agtctctatgctttaatgat 27310618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 16358757 - 16359076
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16358757 tgattcatggagtacccatcaaccaactttaaagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatgg 16358856  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16358857 tggtttcaagacgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttctcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 16358956  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16358957 tccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaaggcttgataactctttatccattatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataat 16359056  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  16359057 agtctctatgctttaatgat 16359076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 3855641 - 3855954
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3855641 tgattcatggagtaccggtcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgcttgaatggtgacaaagcgctcaactccaacatctagggtacatag 3855740  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  3855741 tggtttcgggtcgaatggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacacttttcataacctttactatgtagtattctcattgcgggtcaa 3855840  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  3855841 tccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagactttataactctttatccatgatttgtgagatgtgatcatcagtctacccacgtaat 3855940  T
Q  301 agtctctatgcttt 314  Q
    |||||| |||||||    
T  3855941 agtctccatgcttt 3855954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 8 - 314
Target Start/End: Original strand, 36816363 - 36816668
Alignment:
Q  8 tggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttc 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816363 tggagtacctatcaaccaactttatagttatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaaacgctcgactccaacatctagggtacatagtggtttc 36816462  T
Q  108 aggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaata 207  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  36816463 agttcaaagggtggaatacaccaccatcactatgataattt-ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgggtcaatccaata 36816561  T
Q  208 taaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctct 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  36816562 taaatattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccacataatagtctct 36816661  T
Q  308 atgcttt 314  Q
    |||||||    
T  36816662 atgcttt 36816668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 22641596 - 22641871
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22641596 tgattcgtggagtacccatcgaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacatag 22641695  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||    
T  22641696 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagt-ttctcatggtgggtcaa 22641794  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgat 280  Q
    || | ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22641795 tctagtataaatattattcctaa---ttatatctatgtgaacacttaataactctttatccatgatctatgagatgtgat 22641871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 27277280 - 27277592
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27277280 tgatttatggagtacccttcaaccaactttatggtcatcttgttacaaacaatgtttgaattatgataaagcactcgactccaacatccagggtacatag 27277379  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||| | |||||| |||  || ||||    
T  27277380 tggtttcaggtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatggcac-tttcatgacttttactatgcaatattcttatggtgggtcaa 27277478  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27277479 tctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaaaacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcggtctacccacataat 27277578  T
Q  301 agtctctatgcttt 314  Q
    ||||||||||||||    
T  27277579 agtctctatgcttt 27277592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 127 - 320
Target Start/End: Original strand, 21171081 - 21171274
Alignment:
Q  127 accactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171081 accactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatat 21171180  T
Q  227 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  21171181 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgttatcatcagtctacccacataatagtctttatgctttaatgat 21171274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 19706441 - 19706741
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||||    
T  19706441 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatag 19706539  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  19706540 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaa 19706636  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  19706637 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 19706735  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  19706736 agtctc 19706741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 43802367 - 43802667
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||||    
T  43802367 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatag 43802465  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  43802466 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaa 43802562  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  43802563 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 43802661  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  43802662 agtctc 43802667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 166 - 320
Target Start/End: Original strand, 22657108 - 22657262
Alignment:
Q  166 aacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatga 265  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22657108 aacttttactatgtagtattcacatggtgggtcaatctaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttaataactctttatctatga 22657207  T
Q  266 tctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 320  Q
     || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||    
T  22657208 gctatgagatgtgatcatcagtctatccacatgatagtctctatgctttaatgat 22657262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 28134725 - 28135025
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  |||||    
T  28134725 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catttagggatcatag 28134823  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||    
T  28134824 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtggatcaa 28134920  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  28134921 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 28135019  T
Q  301 agtctc 306  Q
     |||||    
T  28135020 tgtctc 28135025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 77 - 314
Target Start/End: Original strand, 12014084 - 12014319
Alignment:
Q  77 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttact 175  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||   |||||| |  || | ||    
T  12014084 gactcctacatctagagtacacagtgattttaggttgaagggtgaaatacaccacttatcactatgagaatgacttgtga---tttttacatattgttct 12014180  T
Q  176 atgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagat 275  Q
    |||||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  12014181 atgtaacattctcatgccgggtcaatccaatattaatattactcttaatatttatatttatgtgaagacttgataactccttatcaatgatccgtgagat 12014280  T
Q  276 gtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 314  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||| || |||||    
T  12014281 gtgatcatcattctacccacataatggtctttacgcttt 12014319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23507383 - 23507096
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||| |||| |||    |||| ||| | |||||| |||| | ||  |||||||||||||| ||    
T  23507383 tgatttatggagtacccataaatcgaatttatagtcatcctattacagacggtatttgtatgataacaaagtactcaaatcttacatctagggtacacag 23507284  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatca 199  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||| |     | || ||||| ||||| |||  || | |    
T  23507283 tggtttcaggtcgaaggatgacatactccacttatcactatgagaataacttatg---ctttttacacaacgttctctgtagcattctaatggtgggtta 23507187  T
Q  200 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtcta 290  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23507186 atccaatataaatattactcctattatttatatctatgtgaaaacttgataactccttatccatgatccgtgagatgtgatcatcagtcta 23507096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9456416 - 9456116
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  9456416 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 9456318  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  9456317 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 9456221  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  9456220 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 9456122  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  9456121 agtctc 9456116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 9916499 - 9916689
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  9916499 tgattcgtggagaactcataaactaactttatagtcaccttgttacggacaacgtttggacggtaacaaagtactcgactcctacatctagggtacatag 9916598  T
Q  101 tgg-tttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatga 192  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9916599 tggttttcaggtcgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataacttt--ctatgtagtattctcatga 9916689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 20391241 - 20391541
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||||    
T  20391241 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcatag 20391339  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | || |||||  | ||||| | |||||||||||||||| |  ||| |||||  |||||||||||||||||||    || ||||    
T  20391340 tggtttcaggtctaagagcggtatacattattatcattgtgagaatatcttatga-aaatttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtcaa 20391436  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  20391437 tccaatataaatattactcctaacatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 20391535  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  20391536 agtctc 20391541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 20779647 - 20779947
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  20779647 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 20779745  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  20779746 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 20779842  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  20779843 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 20779941  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  20779942 agtctc 20779947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 22670259 - 22670559
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  22670259 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 22670357  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  22670358 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 22670454  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  22670455 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 22670553  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  22670554 agtctc 22670559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 42816991 - 42817291
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  42816991 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 42817089  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  42817090 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 42817186  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  42817187 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 42817285  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  42817286 agtctc 42817291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22612792 - 22612492
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||| ||||  | ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  22612792 tgattcatcaagtagccatcaaccaacgttatgattatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagtgatcatag 22612694  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  22612693 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaa 22612597  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  ||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  22612596 tccaataaaaatattactcccaatatttatatctatgtatagacttgatatatc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 22612498  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  22612497 agtctc 22612492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 634216 - 633925
Alignment:
Q  19 tcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaaggg 118  Q
    ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |    
T  634216 tcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagag 634118  T
Q  119 tggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattact 218  Q
     |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || | |||||| |||||||||||||    
T  634117 cgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggttaatccagtataaatattact 634021  T
Q  219 cctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttg 315  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  || | |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  634020 cctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atagctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttg 633925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 197 - 313
Target Start/End: Original strand, 9917837 - 9917952
Alignment:
Q  197 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||    
T  9917837 tcaatccaatataaatattactca-aatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatccacgagatgtgatcatcaacctaccgaca 9917935  T
Q  297 taatagtctctatgctt 313  Q
    || || |||||||||||    
T  9917936 tagtattctctatgctt 9917952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8727967 - 8727667
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||| | ||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||  |||||||||  |||||    
T  8727967 tgattcatcaagtacccattagccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtccg-catctagggatcatag 8727869  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    ||||| |||||| ||| |||  ||||||   |||||||| ||||||||||||||  | |||| ||||| |  ||||||||||||||||| |  |||||||    
T  8727868 tggttccaggtctaagagtgatatacactcttatcactaagagaatatcttatggta-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtggatcaa 8727772  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  8727771 tccagtataaatattacttctaatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatatatgacccatgagatgtagtcatcagtctacatagataat 8727673  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  8727672 agtctc 8727667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 47667487 - 47667776
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  47667487 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 47667585  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||           ||| |  || ||||    
T  47667586 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--act-----------tcacggtgggtcaa 47667671  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  47667672 tccaatataaatattactcataatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 47667770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29097008 - 29096789
Alignment:
Q  15 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 114  Q
    ||||| ||||||| |||| || ||||| |||| || ||||||||||| |  | ||| |||| || ||||  ||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  29097008 cccattaaccaacgttatggttatcctattacagataacgtttgaatcgaaataaaacacttgagtccat-atctagggatcatagtggtttcatgtcta 29096910  T
Q  115 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 214  Q
    || |||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||   | ||||||||||||| || |  ||||||||| | |||||||||    
T  29096909 agagtgtgaaacaccattatcattatgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atgctatgtagtattcacacggtggatcaatctagtataaatat 29096813  T
Q  215 tactcctaatatttatatctatgt 238  Q
    || ||||||||| |||| ||||||    
T  29096812 tattcctaatatgtatacctatgt 29096789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 174 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 35930713 - 35930582
Alignment:
Q  174 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 273  Q
    |||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||    
T  35930713 ctatgtagtattctcacggtaggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgag 35930615  T
Q  274 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 306  Q
    ||| | |||||||||||  ||||||||||||||    
T  35930614 atgcggtcatcagtctatatacataatagtctc 35930582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 201 - 290
Target Start/End: Original strand, 12006461 - 12006550
Alignment:
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtcta 290  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||| |||||  || || ||||||||||||||||    
T  12006461 tccagtataaatattactcttaatatttatatctgtgcgaacacttgataactccttatcaatgattcgtaagttgtgatcatcagtcta 12006550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 28145725 - 28145835
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||||    
T  28145725 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcatag 28145823  T
Q  101 tggtttcaggtc 112  Q
    ||||||||||||    
T  28145824 tggtttcaggtc 28145835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 231
Target Start/End: Original strand, 21881475 - 21881604
Alignment:
Q  99 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||||||||| |  || ||    
T  21881475 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtc 21881571  T
Q  199 aatccaatataaatattactcctaatatttata 231  Q
    ||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  21881572 aatcttgtataaacattactcctaatatttata 21881604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 251
Target Start/End: Original strand, 24301691 - 24301855
Alignment:
Q  86 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtatt 185  Q
    ||||||||  |||| || ||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||  | ||||||| |||||    
T  24301691 atctagggatcataatgattttaggtcaaagggttgtatacaccactatcactatgagaatgtcttatgatacttaacataac--tcactatgtggtatt 24301788  T
Q  186 ctcatgacggatcaatccaata-taaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataa 251  Q
    ||| ||| || |   || ||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||    
T  24301789 ctcgtgatgggtatttctaatagcaaatattactcctaatatgtatacctatgtgaaatcttgataa 24301855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 298
Target Start/End: Original strand, 26923553 - 26923678
Alignment:
Q  172 tactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 271  Q
    |||||||||||||||||| |  || ||||| || |||||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||    
T  26923553 tactatgtagtattctcacggtgggtcaattcagtataaatattactcctaatattcataccaatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatg 26923651  T
Q  272 agatgtgatcatcagtctacctacata 298  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26923652 agatgtggtcatcagtctacatacata 26923678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 51997406 - 51997353
Alignment:
Q  178 gtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 231  Q
    ||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51997406 gtagtattctcatggtgggtcaatctaatataaatattactcctaatatttata 51997353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Original strand, 12006332 - 12006413
Alignment:
Q  66 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaat 146  Q
    |||||| ||| |||| | |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  12006332 acaaagtacttgacttctacatctagagtacacaatgatttcaggtcgaagggtggaaaacaccacttatcagtatgagaat 12006413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 160
Target Start/End: Original strand, 10852402 - 10852461
Alignment:
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 160  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||    
T  10852402 tggtttcaggttgaagggtgacatacaccattatcactttaaaaatatcttatgacactt 10852461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 217
Target Start/End: Original strand, 31236402 - 31236478
Alignment:
Q  138 tatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattac 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||  | |||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||    
T  31236402 tatgagaatatcttacgacactttc-ataa--tatactatgtagtattctcatgatagatcaattcagtataagtattac 31236478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 3 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15152926 - 15152609
Alignment:
Q  3 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152926 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 15152827  T
Q  103 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatc 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15152826 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 15152727  T
Q  203 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152726 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 15152627  T
Q  303 tctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||| |||||    
T  15152626 tctctatgctttaatgat 15152609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 29328269 - 29327950
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328269 tgattcatggagtacccatcaagcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 29328170  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29328169 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 29328070  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328069 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 29327970  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  29327969 agtctctatgctttaatgat 29327950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 11535784 - 11536103
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535784 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 11535883  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11535884 tggtttcaggtcgaatgttggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 11535983  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535984 tccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagactggataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 11536083  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  11536084 agtctctatgctttaatgat 11536103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 11542702 - 11543021
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11542702 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaatcactcgactccagcatctagggtacatag 11542801  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11542802 tggtttcaggtcgaagggtggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacatttactatgtagtattctcatggcggatcaa 11542901  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542902 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 11543001  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  11543002 agtctctatgctttaatgat 11543021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12751311 - 12750987
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12751311 tgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacctag 12751212  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12751211 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 12751112  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12751111 tccaatataaatattactcataatatttatatctatgagaagaattgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccacataat 12751012  T
Q  301 agtctctatgctttgatgatgtcca 325  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12751011 agtctctatgctttaatgatatcca 12750987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 12739021 - 12738702
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12739021 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactacaacatctagggtacatag 12738922  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12738921 tagtttcaggtcgaacggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 12738822  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12738821 tccaatataaatattatgagtaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcttcagtctacccacataat 12738722  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  12738721 agtctctatgctttaatgat 12738702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18561483 - 18561173
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18561483 tgattcgtgcagtacctatcaatcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaatcactcaactccaacatctagggtacatag 18561384  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  18561383 tggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactat---------ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagagggtcaa 18561293  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18561292 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataat 18561193  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  18561192 agtctctatgctttaatgat 18561173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13392635 - 13392326
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  13392635 tgattcatggagtacccatcaaccaattttatagtcatcttgttacaaacaacgtttgtatggtgacaaagcacctgactccaacatctatggtacatag 13392536  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||  || ||||    
T  13392535 tgattttaggtcaaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataaattttactatgtaatattcgcatggtgggtcaa 13392436  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| | | |||    
T  13392435 tccagtataaatatttctcctaatatttattcctatgtgaagacaggataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcgatctaccaatacaat 13392336  T
Q  301 agtctctatg 310  Q
    ||||||||||    
T  13392335 agtctctatg 13392326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 311
Target Start/End: Original strand, 18257577 - 18257874
Alignment:
Q  11 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  18257577 agtacccatcaaccaactttatagttatcttgttacacacaacgtttgaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 18257675  T
Q  111 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 210  Q
    || ||| |||  |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| || || |  |||||||| |||||| | |  || | ||||||||||||    
T  18257676 tctaagagtgatatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacatttttcatgacat--actatgtaatattctgacggtgggttaatccaatataa 18257773  T
Q  211 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  18257774 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcaatctatccacataatagtctttatg 18257873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2204852 - 2204552
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  2204852 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 2204754  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  2204753 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 2204657  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  2204656 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 2204558  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  2204557 agtctc 2204552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8465299 - 8464999
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||| ||  |||||    
T  8465299 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctaaggatcatag 8465201  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  8465200 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaa 8465104  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  8465103 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 8465005  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  8465004 agtctc 8464999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18400404 - 18400104
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  18400404 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 18400306  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  18400305 tggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 18400209  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  18400208 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 18400110  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  18400109 agtctc 18400104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18407388 - 18407088
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  18407388 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 18407290  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  18407289 tggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 18407193  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  18407192 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 18407094  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  18407093 agtctc 18407088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 48808498 - 48808798
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  48808498 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 48808596  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  48808597 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 48808693  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  48808694 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 48808792  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  48808793 agtctc 48808798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30254428 - 30254138
Alignment:
Q  11 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||| |    
T  30254428 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaag 30254330  T
Q  111 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 210  Q
    || ||| ||   |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||    
T  30254329 tctaagagtaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatacaa 30254233  T
Q  211 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30254232 atattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 30254138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15730051 - 15729751
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  15730051 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 15729953  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  15729952 tggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 15729856  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  15729855 tccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 15729757  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  15729756 agtctc 15729751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 18139340 - 18139640
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  18139340 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcatag 18139438  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  18139439 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 18139535  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  18139536 tccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacctgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 18139634  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  18139635 agtctc 18139640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19231188 - 19230888
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||| |||||  |||||    
T  19231188 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catttagggatcatag 19231090  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  ||||||| |  ||||||||||||||| |  || ||||    
T  19231089 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataacttat--tatgtagtattctcacggtgggtcaa 19230993  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  19230992 tccagtataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 19230894  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  19230893 agtctc 19230888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2365389 - 2365169
Alignment:
Q  17 catcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaag 116  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |   |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||     
T  2365389 catcaaccgactttatagtcaatctgttacggacgacgtttgtacgacaacaaagtacttgactccaaggtctagggtacatagtggctttaggtcgaat 2365290  T
Q  117 ggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 215  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||||   |||||||| ||| |||||  || |||||||||| ||||||||    
T  2365289 ggtgaaatacaccacttatcacaatgagaataacttatgaca-tttacataacttc--ctatgtagcattttcatggtgggtcaatccaatgtaaatatt 2365193  T
Q  216 actcctaatatttatatctatgtg 239  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  2365192 actcctaatattgatatctatgtg 2365169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 41680970 - 41681203
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||||    
T  41680970 tgattcatcaagtaccaatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatag 41681068  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  41681069 tggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaa 41681165  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 238  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41681166 tccagtataaatattactcataatatttatacctatgt 41681203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 306
Target Start/End: Original strand, 47166871 - 47167161
Alignment:
Q  11 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 110  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  47166871 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 47166969  T
Q  111 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 210  Q
    || ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || || ||| | |||||    
T  47166970 tctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtctatctagtataa 47167066  T
Q  211 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 306  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47167067 atattactcataatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 47167161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 10668903 - 10669204
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||| | || |||| ||| || ||  |||||    
T  10668903 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcatttgagtcca-catttacggatcatag 10669001  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat-gagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatca 199  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| |   ||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||    
T  10669002 tggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcaattgcgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtca 10669098  T
Q  200 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataa 299  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  10669099 atctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataa 10669197  T
Q  300 tagtctc 306  Q
    |||||||    
T  10669198 tagtctc 10669204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 305
Target Start/End: Original strand, 24443349 - 24443628
Alignment:
Q  21 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 120  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    | |||||||| || ||| ||||||||||  |||| |||||||| ||| ||| |||    
T  24443349 aaccaacgttatggtcatcctgttacacacaacgtttgaataacaataaagcacttgagtcc-acatctagggatcataatggtttcaagtctaagagtg 24443447  T
Q  121 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcc 220  Q
      |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||   |||||||||||| ||||| |  || | |||| | |||||||||||||||    
T  24443448 ttatacaccattatcactgtgagaataacttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtactctcacggtgggttaatctagtataaatattactcc 24443544  T
Q  221 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 305  Q
    ||||||| ||| ||||||  | |||| ||| || | ||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24443545 taatattcatacctatgtataaacttaatatct-tatattcatgacccatgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtct 24443628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34128873 - 34128647
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||||    
T  34128873 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcatag 34128775  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||| | ||| | | ||||||||||||||||||  | | |||||   ||||||||||||||||||  | ||||| |    
T  34128774 tggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--gtactatgtagtattctcacaatggatcta 34128678  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttata 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34128677 tccagtataaatattactcctaatatttata 34128647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19388774 - 19388544
Alignment:
Q  84 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactt--ttactatgtag 181  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  |   |||||||    
T  19388774 acatctagggctcataatggtttcaggtctaagagtggtatacactattaccactatgagaatatcttatgacactttc-ataacatactatatatgtag 19388676  T
Q  182 tattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatc 281  Q
    |||||||||||  |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||  | |||| ||| |||  ||| ||||| | ||||||| || ||    
T  19388675 tattctcatgattgggcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctttgtacaaacttaatatctc-atattcatgacccgtgagatatggtc 19388577  T
Q  282 atcagtctacctacataatagtctctatgcttt 314  Q
    |||| ||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  19388576 atcaatctatatacataataatctctatgcttt 19388544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 197 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10235451 - 10235361
Alignment:
Q  197 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagt 287  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10235451 tcaatccgatataaatattattcctaatatttatacatatgggaacacctgataactctttatcaatgatctgtgagatgtgatcatcagt 10235361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28130861 - 28130561
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || ||| ||||||| ||  |||||    
T  28130861 tgattcattaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcc-acatctacggatcatag 28130763  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    || ||||||||| |||  ||  |||||| | ||| | | ||||||||||||||||||  ||| |||||   ||||||||| ||||||||    || ||||    
T  28130762 tgatttcaggtctaagaatgatatacactattattattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtaatattctcacagtgggtcaa 28130666  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||||||| | |||||||||||| | ||||||    
T  28130665 tccagtataaatattactcctgatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatttatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatgcataat 28130567  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  28130566 agtctc 28130561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 308
Target Start/End: Original strand, 25845498 - 25845780
Alignment:
Q  21 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 120  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  25845498 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25845596  T
Q  121 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcc 220  Q
    | ||||| || ||| | | |||||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||||||||||| |  |  |||||||| |||||||||||||||    
T  25845597 gtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcc 25845693  T
Q  221 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctcta 308  Q
    ||||||| | |  || ||  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25845694 taatattgacacatacgtatagacttaatatctc-atattcatgagcaatgagatgtggtcatcagtctacatgcataatagtctcta 25845780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 308
Target Start/End: Original strand, 25845917 - 25846199
Alignment:
Q  21 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 120  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  25845917 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25846015  T
Q  121 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcc 220  Q
    | ||||| || ||| | | |||||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||||||||||| |  |  |||||||| |||||||||||||||    
T  25846016 gtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcc 25846112  T
Q  221 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctcta 308  Q
    ||||||| | |  || ||  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25846113 taatattgacacatacgtatagacttaatatctc-atattcatgagcaatgagatgtggtcatcagtctacatgcataatagtctcta 25846199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Original strand, 19393462 - 19393726
Alignment:
Q  37 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 136  Q
    ||||| |||| |||||| || ||| ||| |||||||||| || || |||||||||||  |||| ||| |||||||| ||| |||  |||||| | |||||    
T  19393462 atccttttacagacaacattagaaaggtaacaaagcacttgagtc-aacatctagggatcatactggattcaggtctaagagtgatatacactattatca 19393560  T
Q  137 ctatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 236  Q
     | |||||||||||||||| | |||| ||||| |  ||||||||||||||||| |   | |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19393561 ttgtgagaatatcttatgaga-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtcggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctat 19393657  T
Q  237 gtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 306  Q
    ||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19393658 gtatagacttaatatctc-atatttatgacccatgaaatgtggtcattagtctacatacataatagtctc 19393726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 197 - 305
Target Start/End: Original strand, 47833875 - 47833983
Alignment:
Q  197 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 296  Q
    |||||| |||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||     
T  47833875 tcaatcaaatataaatattatgagtaatatttatacctatgtgaaaacttggtaactctttattcatgatcggtgagatctgatcaccagcctacctacg 47833974  T
Q  297 taatagtct 305  Q
    |||||||||    
T  47833975 taatagtct 47833983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 265 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15148363 - 15148308
Alignment:
Q  265 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15148363 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 15148308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 18259126 - 18259359
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  ||||     
T  18259126 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcataa 18259224  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
     ||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  |||||||| |||||||||| |  || || |    
T  18259225 gggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgcagtattctcacggtgggtcta 18259321  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 238  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  18259322 tccagtataaatattactttcaatatttatacctatgt 18259359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19859221 - 19859113
Alignment:
Q  206 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  19859221 tataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtct 19859123  T
Q  306 ctatgctttg 315  Q
    | | ||||||    
T  19859122 cgacgctttg 19859113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 39112275 - 39112138
Alignment:
Q  10 gagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcag 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||| |   |||||  ||| || ||| |||||||| |||||||||| |||||     
T  39112275 gagtacctatcaaccaactttatagtcaccttattacagacaacgtttgaacgacaacaaaatacttgattcctacatctagagtacatagtgatttcat 39112176  T
Q  110 gtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 147  Q
    || |||   ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112175 gttgaataatggaatacaccactatcactaagagaata 39112138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3132986 - 3132849
Alignment:
Q  173 actatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 272  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |  ||  | |||| |||    
T  3132986 actatgtagtattcttatgacaggtcaatccaatataaatatta-acataataattatacatatgtgaagacttgatatctcatattcatttatctatga 3132888  T
Q  273 gatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgc 311  Q
    ||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||    
T  3132887 gatgtgatcatcagtctaatcacattgtagtctctatgc 3132849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 301
Target Start/End: Original strand, 7662569 - 7662686
Alignment:
Q  183 attctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 282  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||  || |||| ||||||    
T  7662569 attctcatggcgggtcaatctaataaaaatattacttataat-tttatatctatgtgaagacttgataagtttttatacatgattcgtaagatatgatca 7662667  T
Q  283 tcagtctacctacataata 301  Q
    ||||| || | ||||||||    
T  7662668 tcagtgtatccacataata 7662686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14592056 - 14591924
Alignment:
Q  96 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    ||| ||||||||||||| |  ||    
T  14592056 catagtggtttcaagtctaagagtgatatacactattatcaatctgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtgtagtattctcacggtgg 14591960  T
Q  196 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 231  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14591959 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 14591924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16011647 - 16011515
Alignment:
Q  96 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 195  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    ||| | |||||||||||||  ||    
T  16011647 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcaatgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtatagtattctcatggtgg 16011551  T
Q  196 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 231  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16011550 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 16011515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Original strand, 31190524 - 31190660
Alignment:
Q  85 catctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 184  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||   ||| |||||||||    
T  31190524 catctagggatcttagtggtttcaggtctaacagtgatatacaccattatcactatgagaatatcttaagaca-tattcataac--atacaatgtagtat 31190620  T
Q  185 tctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaat 224  Q
    |||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31190621 tctcatggtgggtcaatccagtataaatattgctcctaat 31190660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 7396450 - 7396361
Alignment:
Q  228 tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc---tacataatagtctctatgcttt 314  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||    |||||||||||||||||||||    
T  7396450 tatatttatgtgaatacttgataattctttattcatgatatgtgagatgtgatcatcagttcaccctgcacataatagtctctatgcttt 7396361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22969153 - 22969024
Alignment:
Q  99 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 198  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||||||||| |  || ||    
T  22969153 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtc 22969057  T
Q  199 aatccaatataaatattactcctaatatttata 231  Q
    ||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  22969056 aatcttgtataaacattactcctaatatttata 22969024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 148
Target Start/End: Original strand, 22948499 - 22948574
Alignment:
Q  73 actcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 148  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22948499 actcaactcctacatctaaggtacatagcggtttcatgtcgaagggtggcatacacgactattactacgagaatat 22948574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 15169292 - 15169474
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| || |||||||||| |||| || |||||||||  || |||||||||||||  | |||||| |  | |||| ||||| |||  |||||    
T  15169292 tgattcatcaagtgcctatcaaccaacgttatggttatcctgttatagataacgtttgaatggcaataaagcatttaagtcca-catcttgggatcatag 15169390  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattct 187  Q
    |||||| ||| | ||| || | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||||    
T  15169391 tggttttaggactaagagtagcatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattct 15169474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7396527 - 7396469
Alignment:
Q  183 attctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaa 241  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  7396527 attcttatgacgggttaatccaatataaatattacccataatatttatatttatgtgaa 7396469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 217 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29983234 - 29983179
Alignment:
Q  217 ctcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 272  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29983234 ctcctaatatttatacatatgtgaaaatttgttaactctttatccatgatccgtga 29983179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 206 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 39112092 - 39111989
Alignment:
Q  206 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||  |  ||||||||||||||||| || || ||| | | ||| ||||||||   ||||||||||    
T  39112092 tataaataatactcctaatatttatgtatatatgaagaaattgtaactctttatccatgacctatgtgatattaccattagtctacccttataatagtct 39111993  T
Q  306 ctat 309  Q
    ||||    
T  39111992 ctat 39111989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2365112 - 2365070
Alignment:
Q  268 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  2365112 tgtgagatgtgatcatcagtcgacccacatgatagtctctatg 2365070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 29984372 - 29984308
Alignment:
Q  89 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttat 153  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||  || || ||||  |||||||||||||||||||    
T  29984372 tagggtacatggtggtttcaagttgaagggtgatatgcatcacttccactatgagaatatcttat 29984308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 24695188 - 24695501
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695188 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 24695287  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24695288 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 24695387  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695388 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 24695487  T
Q  301 agtctctatgcttt 314  Q
    ||||||||||||||    
T  24695488 agtctctatgcttt 24695501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 19714220 - 19714539
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714220 tgattcatgtagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 19714319  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19714320 tggtttcaggtcgaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 19714419  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19714420 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataat 19714519  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  19714520 agtctctatgctttaatgat 19714539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 19706941 - 19707259
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19706941 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacggacaacgtttgaatggtgacagagcactcgactccaatatctagggtacatag 19707040  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |  || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19707041 ttatt-caggtcgaagggtggaatacacaattatcactatgagaaaatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 19707139  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19707140 tccaatataaatattactcctagtatttatatctatgtgaagatttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataat 19707239  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  19707240 agtctctatgctttaatgat 19707259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 18569583 - 18569904
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18569583 tgattcatgaagtacccatcaaccaattttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgataaagcactcgactccaacatgtagggtacatag 18569682  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18569683 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgataatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtcaa 18569782  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctt--tatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18569783 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgatatctctttatatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctaccaacata 18569882  T
Q  299 atagtctctatgctttgatgat 320  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  18569883 atagtctttatgctttaatgat 18569904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 39538953 - 39538754
Alignment:
Q  121 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcc 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  39538953 gaatataccactatcactatgagaatattttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggtgggtcaatccaatataaatattactcc 39538854  T
Q  221 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  39538853 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaaatatgaccatcagtctacccacataatagtcttcatgctttaatgat 39538754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 290
Target Start/End: Original strand, 17298627 - 17298912
Alignment:
Q  5 tcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggt 104  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  17298627 tcatggagcacccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaacgtttgtacggaaacaaagtactcgactcctaaacctagggtacatattggt 17298726  T
Q  105 ttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatcc 203  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||  ||| ||||||||||||||  || |||||||    
T  17298727 ttcaggttgaagggtggaatacgccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttacataacttt--ctacgtagtattctcatggtgggtcaatcc 17298823  T
Q  204 aatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaga--tgtgatcatcagtcta 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||| |  ||||||||||||||||    
T  17298824 aatataaatattactcttaatatttatatctatgtgaagatttaataactctttatccatgacccgtgatatgtgtgatcatcagtcta 17298912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 290
Target Start/End: Original strand, 17285476 - 17285759
Alignment:
Q  5 tcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggt 104  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||  |||||| |||||| ||| | | |||||||||||| || |    
T  17285476 tcatggagcacccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaaagtttgtacggaaacaaagtactcgaatcctaaacctagggtacatattgat 17285575  T
Q  105 ttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatcc 203  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| | | |  ||||||||  |||||||||||||||||   || |||||||    
T  17285576 ttcaggtcgaagagtggaatataccacttatcactatgataataacttatgata-tatacataacttt--ctatgtagtattctcattgtgggtcaatcc 17285672  T
Q  204 aatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtcta 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17285673 aatataaatattactcttaatatttatatctatgtaaagacttgataactctttatccatgacctgtgatatgtgatcatcagtcta 17285759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 314
Target Start/End: Original strand, 18806843 - 18807069
Alignment:
Q  86 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 184  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||   | ||||||  |||||||  ||    
T  18806843 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgacagttacaa-aacttt--ctatgtatcat 18806939  T
Q  185 tctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatc 284  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  18806940 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatatgaaatgtgatcatc 18807039  T
Q  285 agtctacctacataatagtctctatgcttt 314  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18807040 agtctacccgcataatagtctctatgcttt 18807069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 27347258 - 27347417
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27347258 tgattcgtggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttaaagataacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatag 27347356  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt 161  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27347357 tggtttcgtgtcaaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacacttt 27347417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 24701952 - 24702057
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24701952 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 24702051  T
Q  101 tggttt 106  Q
    ||||||    
T  24702052 tggttt 24702057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20941327 - 20941027
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||||    
T  20941327 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatag 20941229  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  20941228 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaa 20941132  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  20941131 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 20941033  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  20941032 agtctc 20941027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 25805387 - 25805687
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||||    
T  25805387 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatag 25805485  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||  ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  25805486 tggtttcaggtgtaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaa 25805582  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  25805583 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 25805681  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  25805682 agtctc 25805687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32199 - 31899
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  32199 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 32101  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  32100 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 32004  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  32003 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 31905  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  31904 agtctc 31899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 12789665 - 12789965
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  12789665 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 12789763  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| |  | |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  12789764 tggtttcaggtctaagagcagtatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 12789860  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  12789861 tccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 12789959  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  12789960 agtctc 12789965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 175 - 309
Target Start/End: Original strand, 22546912 - 22547046
Alignment:
Q  175 tatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaga 274  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22546912 tatgtagtattctcatggctggtcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatatgaaaacttgataactctttatccatgatttgtgaga 22547011  T
Q  275 tgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 309  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  22547012 tgtgatcatcggtctatccacataatagtctctat 22547046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22941550 - 22941250
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||||    
T  22941550 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatag 22941452  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  22941451 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaa 22941355  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||  |||| |||| |  ||||||  | |||||||||||| ||||||||    
T  22941354 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtataaacttgatatctc-atatctatgacccatgagatacggtcatcagtctacatacataat 22941256  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  22941255 agtctc 22941250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23546222 - 23545922
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  23546222 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 23546124  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  23546123 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 23546027  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  23546026 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 23545928  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  23545927 agtctc 23545922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 304
Target Start/End: Original strand, 20100255 - 20100543
Alignment:
Q  11 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 110  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||  | |||||||| || |||| ||||| |||  ||||||||||||| |    
T  20100255 agtacccatcaaccaacattatggttatccttttacagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catcttgggatcatagtggtttcatg 20100353  T
Q  111 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 210  Q
    || ||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||| |||||| |  || |||| ||| |||||    
T  20100354 tctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagttttctcacgttgggtcaagccagtataa 20100450  T
Q  211 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtc 304  Q
     |||||||||||||||| ||| |||| |  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20100451 gtattactcctaatattgatacctatctatagacttaatatctc-atattcatgacccatgagatgtgatcatcagtctacatacataatagtc 20100543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 24933308 - 24933608
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  24933308 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 24933406  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  24933407 tggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 24933503  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  24933504 tccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 24933602  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  24933603 agtctc 24933608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31097116 - 31096816
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||     
T  31097116 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgattcca-catctagggatcataa 31097018  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  31097017 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaa 31096921  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  31096920 tccaatataaatattactcctataatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 31096822  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  31096821 agtctc 31096816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5097940 - 5097651
Alignment:
Q  12 gtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggt 111  Q
    |||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||| |||  ||||||||||||||||    
T  5097940 gtacccatcaacaaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctcgggatcatagtggtttcaggt 5097842  T
Q  112 cgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaa 211  Q
    | ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||| ||||||||| |||  ||||| |  ||||||||||||||||| |  || | |||||||||||||    
T  5097841 ctaagagcgatatacactattatcattgtgagaataacttatgacaatttc-ataacat--actatgtagtattctcacggtgggttaatccaatataaa 5097745  T
Q  212 tattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 306  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5097744 tattactcataatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgtagtcatcagtctacatacataatagtctc 5097651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 12764992 - 12765296
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||| || |  |||||    
T  12764992 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcatag 12765090  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgtagtattctcatgacggat 197  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||| |||||||||| ||  |   |||||||  ||||||||||||||||| |  || |    
T  12765091 tggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatgtcttatgacaattaatctcataactt--actatgtagtattctcacggtgggt 12765188  T
Q  198 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacat 297  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12765189 ctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctacatacat 12765287  T
Q  298 aatagtctc 306  Q
    |||||||||    
T  12765288 aatagtctc 12765296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 7865432 - 7865736
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||  ||| || |||| |||||||||  |||||    
T  7865432 tgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcatag 7865530  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---ttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 197  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |   | | |||||   |||||||||||||||||| |  || |    
T  7865531 tggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgggt 7865628  T
Q  198 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacat 297  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||| |||||    
T  7865629 ctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctacatacat 7865727  T
Q  298 aatagtctc 306  Q
    |||||||||    
T  7865728 aatagtctc 7865736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 9811735 - 9812039
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||| || |  |||||    
T  9811735 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcatag 9811833  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgtagtattctcatgacggat 197  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||| ||  |   ||||| |  ||||||||||||||||| |  || |    
T  9811834 tggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgggt 9811931  T
Q  198 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacat 297  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  9811932 ctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctacatacat 9812030  T
Q  298 aatagtctc 306  Q
    | |||||||    
T  9812031 agtagtctc 9812039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 12703876 - 12704180
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||| || |  |||||    
T  12703876 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcatag 12703974  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgtagtattctcatgacggat 197  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||| ||  |   ||||| |  ||||||||||||||||| |  || |    
T  12703975 tggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgggt 12704072  T
Q  198 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacat 297  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12704073 ctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctacatacat 12704171  T
Q  298 aatagtctc 306  Q
    | |||||||    
T  12704172 agtagtctc 12704180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 18806483 - 18806619
Alignment:
Q  86 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 184  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||  | ||||||  |||||||  ||    
T  18806483 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806579  T
Q  185 tctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaat 224  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18806580 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 18806663 - 18806799
Alignment:
Q  86 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 184  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||  | ||||||  |||||||  ||    
T  18806663 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806759  T
Q  185 tctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaat 224  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18806760 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 226 - 314
Target Start/End: Original strand, 27347425 - 27347513
Alignment:
Q  226 tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 314  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  27347425 tttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatctgtgagatgtgatcatcggcctatccacaaaatagtctctatgcttt 27347513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 18829283 - 18829530
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaa---ccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtaca 97  Q
    |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||  ||  || |||| | |   |||||| || ||||||  ||||| || |||||    
T  18829283 tgatccatggagtacccatcaataaccaactttatagtcatcattttatagatgacatttgtacgacaacaaagtacacgactctcacatc-agtgtaca 18829381  T
Q  98 tagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgga 196  Q
    ||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||   ||||||||  |||||||  |||||||||  ||     
T  18829382 tagtggttttaggtcaaatgatggaatacaccacttatcattatgagaataacttatggaacttac-ataacttt--ctatgtatcattctcatggtggg 18829478  T
Q  197 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 248  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  18829479 tcaatccaatataaatattggtcctaatatttatatatatgagaacacttga 18829530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26245402 - 26245102
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||  ||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   ||||||||||  | ||||  |||||| |  ||||     
T  26245402 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgctatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttaagtccat-atctagagatcataa 26245304  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||| | || || | |||||||||||||||||| |||  ||||| |  |||||| |||||||| |    |||||||    
T  26245303 tggtttcaggtctaagagcgatatacactattaacattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataacat--actatgcagtattctgacagtggatcaa 26245207  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||| |||  |||| |||| |  |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  26245206 tcaagtataaatattactcctaatatttatacctatgtataaacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcaatcatcagtctacatacataat 26245108  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  26245107 agtctc 26245102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 28719477 - 28719558
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaa 84  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  28719477 tgattcgtggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttacagacaacgtttg-acggtgataaagcactcgactccaa 28719558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 26129695 - 26129928
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||| | ||||| |||| || ||| | |||  ||||| ||| ||||||  | |||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  26129695 tgattcattaagtacccattagccaacgttatggttatctttttatagacaatgttagaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagtgatcatag 26129793  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||| ||| ||| |||  |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| |||| ||||| |  ||||||| ||||| ||| |  || ||||    
T  26129794 tggtttcatgtctaagagtgatatacaccattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtggtattttcacggtgggtcaa 26129890  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 238  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  26129891 tccagtataaatattactcataatatttgtatatatgt 26129928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 39539033 - 39538954
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgact 80  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| || |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39539033 tgattcgtggagtacctaccaaccaactttataatcatcctattccaaacaacatttgaatggtgataaagcactcgact 39538954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 303
Target Start/End: Original strand, 33477193 - 33477321
Alignment:
Q  174 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 273  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||| ||||||  ||  ||||||||| || |||     
T  33477193 ctatgtagtattcttatggcagatcaattatgtataaatattactcttaatattaatatttatttgtagatttgatatttc-atatccatgacctttgat 33477291  T
Q  274 atgtgatcatcagtctacctacataatagt 303  Q
    ||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  33477292 atgtgattatcagtttactcacataatagt 33477321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 39535509 - 39535465
Alignment:
Q  261 catgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 305  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39535509 catgacctatgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtct 39535465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 7592 - 7273
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7592 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 7493  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7492 ttgtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 7393  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7392 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 7293  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  7292 agtctctatgctttaatgat 7273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 6656 - 6975
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6656 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 6755  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6756 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 6855  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6856 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 6955  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  6956 agtctctatgctttaatgat 6975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 13672 - 13991
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13672 tgattcatggagtaaccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 13771  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13772 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatcaa 13871  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13872 tccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 13971  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  13972 agtctttatgctttaatgat 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18772 - 18454
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18772 tgattcatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 18674  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18673 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 18574  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18573 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 18474  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  18473 agtctctatgctttaatgat 18454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 25712 - 26031
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25712 tgatttatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 25811  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25812 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 25911  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25912 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagtcttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 26011  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||| ||||||||| |||||    
T  26012 agtcgctatgctttaatgat 26031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 21329970 - 21330289
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329970 tgattcatggagtccccatcaacctactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 21330069  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21330070 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 21330169  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21330170 tccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtccacctacataat 21330269  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  21330270 agtctctatgctttaatgat 21330289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18796991 - 18796672
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18796991 tgattcatggtgtacccatcaacaaactttatagtcatcctgttacgtacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacatag 18796892  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  18796891 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccaccatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagaggatcaa 18796792  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18796791 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataat 18796692  T
Q  301 agtctctatgctttgatgat 320  Q
    |||||| ||||||| |||||    
T  18796691 agtctcaatgctttaatgat 18796672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18620281 - 18619976
Alignment:
Q  8 tggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18620281 tggagtacccatcaaccaactttatggtcatcttgttacatacataatgtgaatggtgataaagcactcgactccaacatttagggtacatagtggtttc 18620182  T
Q  108 aggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaata 207  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| | ||    
T  18620181 aggtcaaagggtgggatacaccaatatcaccatgagaatatcttatgacactttc-ataacttttactatgtagtattctcatggtgggtcaatctagta 18620083  T
Q  208 taaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctct 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |    
T  18620082 taaatattactcctaatatttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcggcctacccacataatagtctat 18619983  T
Q  308 atgcttt 314  Q
    |||||||    
T  18619982 atgcttt 18619976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 36270648 - 36270338
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| | ||  |||||| | |||||||  ||||||||||| ||| |    
T  36270648 tgattcattgagtacccaacaaccgactttatagtcatcctgttacgaacgacttttgtacggcaacaaagtattcgactcatacatctagggtgcatgg 36270549  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatca 199  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||  |||| |||  |||||||  ||||||||| ||  |||    
T  36270548 tggttttaggtcgaagggtg-aatacaccacttatcactatgagaatgacttgtgac-ctttacataatttt--ctatgtaacattctcatggcgagtca 36270453  T
Q  200 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  36270452 atccaatataaatattactcctaatatttaaatcgaagtgaaaacttgataactctttctctatgactcgtgagatgtgatcatcagtctacccacacaa 36270353  T
Q  300 tagtctctatgcttt 314  Q
    |||||| ||| ||||    
T  36270352 tagtctttatacttt 36270338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 314
Target Start/End: Original strand, 22183220 - 22183518
Alignment:
Q  13 tacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtc 112  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||| |     |||||| |||||||||| ||||| || |||||   ||||||||||||    
T  22183220 tacccatcaatcgactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgtacaacaacaaagtactcgactcctacatcaagagtacacgttggtttcaggtc 22183319  T
Q  113 gaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaa 211  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||||  |||  ||||| ||   ||||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||     
T  22183320 aaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatgacctgtgact-tttacataacatta--tatgtaacattgtcatggcgggtcaatccaatataa- 22183415  T
Q  212 tattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgc 311  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||| |    
T  22183416 tattactcttaatatttatatctatgtgaagacttgataactccttatcaaagatctgtgagatttgatcatcaatctacccacgtaatagtctctatac 22183515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 6991847 - 6992146
Alignment:
Q  13 tacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaa-gcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggt 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||  |  ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||     
T  6991847 tacccatcaaccgactttatagtcatcgtgtcatagacaacgtttaaacagaaacaaaagtactcgactcctacatctagggaacatagtgatttcaggc 6991946  T
Q  112 cgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||   |||| |||  ||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||    
T  6991947 cgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatagtttatgtcacttac-ataatttt--ctatgtagcgttcttatggaggatcaatccaatataa 6992043  T
Q  211 atattactcctaatatttatatctatgtgaag--acttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctcta 308  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||| ||| ||    
T  6992044 atattactcctgagatttatacctatgtgaagatacttgataaatctttatttataatctgtgagatatgatcattagtctacccatataataatcttta 6992143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20978351 - 20978091
Alignment:
Q  8 tggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttc 107  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| || ||    
T  20978351 tggagtatccatcaatcgactttatagttatcatgttacggactacgtttatatgacatcaaagtactcgaatcctacatctagggtacatagtagtgtc 20978252  T
Q  108 aggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaat 206  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||  | || ||  ||||||||| ||| ||||||||||    
T  20978251 atgtcaaagagtggaatacaccacttatcactacgagaataacttatgaca-ttttcataatttt--ccatataaaattctcatggcgggtcaatccaat 20978155  T
Q  207 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 270  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20978154 ataaatattactcataataattatatctcggtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 20978091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18822556 - 18822249
Alignment:
Q  11 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||  |||   | |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18822556 agtacccattaaccaactttatagtcattgtgttacggatgacgtttatatgacaaaaaagtacttgactcctacatctagggtacacagtggtttcagg 18822457  T
Q  111 tcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatata 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  |||  ||  ||||  ||||| |||  ||||||  | ||||||| | |||||||||||||||    
T  18822456 tcgaagggtggaatacaccacttatctatatgagaatgacttgagat-ctttacataacgttt--tatgtaacaatctcatggcagatcaatccaatata 18822360  T
Q  210 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 309  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| | |    
T  18822359 aatattaccattaatatttatatctatgtgaaaagttgataactccttatcaatgatccgtgatatgtgatcatcagtctattgacataataatctatct 18822260  T
Q  310 gctttgatgat 320  Q
    ||||| |||||    
T  18822259 gctttaatgat 18822249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30174677 - 30174377
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  30174677 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 30174579  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  30174578 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 30174482  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  30174481 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 30174383  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  30174382 agtctc 30174377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 24250034 - 24250334
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  24250034 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcatag 24250132  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  24250133 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 24250229  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  24250230 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 24250328  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  24250329 agtctc 24250334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 24229217 - 24229517
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || || | |||||||||  |||||    
T  24229217 tgattcatcaagtacccttcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcta-catctagggatcatag 24229315  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||| | | ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  24229316 tggtttcaaggctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaa 24229412  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  24229413 tccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgaaccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 24229511  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  24229512 agtctc 24229517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 174 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19279600 - 19279460
Alignment:
Q  174 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 273  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  19279600 ctatgtggtattctcatgacgtgtcaatccaatataaatattactccaaatatctatatctatctgaaaacttgataactttttatccatgatacgtgag 19279501  T
Q  274 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 314  Q
    |||||||||| |||| ||   ||||||||||| ||||||||    
T  19279500 atgtgatcattagtcaactcgcataatagtctttatgcttt 19279460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 197 - 305
Target Start/End: Original strand, 18851977 - 18852085
Alignment:
Q  197 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||    
T  18851977 tcaatccaatataaatattactcttaatatttatacatatttgaagacttgataactctttattcatgatccgtgagatgggatcattagtctaccgaca 18852076  T
Q  297 taatagtct 305  Q
    |||||||||    
T  18852077 taatagtct 18852085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 15342014 - 15342237
Alignment:
Q  11 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 110  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  ||||  ||||||| |  | |||||| | || | || |||||||||  |||||||||||||||    
T  15342014 agtacccattaaccaacgttatggtcatcctgttacaaacaatttttgaattgcaataaagcatttgagttca-catctagggatcatagtggtttcagg 15342112  T
Q  111 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 210  Q
    || ||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||||| ||| |  || | |||||| |||||    
T  15342113 tctaagagtggcatacaccactatcattgtgagactatcttatgacactttc-ataacat--actatgtagtattttcacggtgggttaatccagtataa 15342209  T
Q  211 atattactcctaatatttatatctatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15342210 atattactcctaatatttatacctatgt 15342237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 29800757 - 29800468
Alignment:
Q  15 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 114  Q
    ||||| ||||||| ||||  | |||||||||| ||||| |||||||||   | |||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  29800757 cccattaaccaacattatgattatcctgttacagacaatgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaagtcta 29800659  T
Q  115 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 214  Q
    || |||| |||||||| ||||  | |||||||||| | | |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||    
T  29800658 agagtggtatacaccattatccttgtgagaatatcatgttacactttt-ataacat--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtataaatat 29800562  T
Q  215 tactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactcttt---atccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 305  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  | |||| || | | | |   |||||||| |  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29800561 tactcctaatatttatacccatgtatatacttaattaatatctcacatccatgacccatgggatgtgatcatcagtctacatacataatagtct 29800468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17241167 - 17241034
Alignment:
Q  28 tttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaataca 127  Q
    ||||||| | || ||||||  |||||||||||  ||||| |||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  17241167 tttataggcttcatgttacacacaacgtttgagcggtgataaagtacttgactcctacatctacagtacatagtggttttaggtcgaagg-tgaaataca 17241069  T
Q  128 ccactatcactatgagaatatcttatgacactttt 162  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17241068 ccattatcactatgagaatatcttattacactttt 17241034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 197 - 300
Target Start/End: Original strand, 36801899 - 36802003
Alignment:
Q  197 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatct-atgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 295  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||    
T  36801899 tcaattcaatataaatattacccttaatatttatattttatgcgaagacttgataactcattatcaatgatttgtgaggtgtgatcatcagtctactcac 36801998  T
Q  296 ataat 300  Q
    |||||    
T  36801999 ataat 36802003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19616653 - 19616435
Alignment:
Q  84 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 183  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||    ||||||||||||    
T  19616653 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcatatgaca-ttttcataa--aatactatgtagta 19616557  T
Q  184 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 283  Q
    |||||| |  || ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| ||   |||  ||||    ||||||||| ||||    
T  19616556 ttctcacggtgggtcaattcagaataaatgttactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatct-aatatttatgactcatgagatgtggtcat 19616458  T
Q  284 cagtctacctacataatagtctc 306  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  19616457 cagtctacatacataatagtctc 19616435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Original strand, 36799745 - 36799826
Alignment:
Q  66 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaat 146  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36799745 acaaagtacttgactcctacatctagggcgcatagtggtttcaggtcaaacggtagaatacaccacttatcactatgagaat 36799826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 231
Target Start/End: Original strand, 40301034 - 40301164
Alignment:
Q  97 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgga 196  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| | |  |||||||||||||||||  ||     
T  40301034 atagtggtttcatgtctaagagtggtatacatcattatcactatgagactatcttatgacac--ttcataacatgt--tatgtagtattctcatggtggg 40301129  T
Q  197 tcaatccaatataaatattactcctaatatttata 231  Q
    ||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  40301130 tcaatctggtataaatattacttctaatatgtata 40301164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 304
Target Start/End: Original strand, 28741220 - 28741326
Alignment:
Q  197 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 296  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||| ||| | || |||||    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28741220 tcaatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtacatacttaatatctcat-attcatgacgcatgagatgtgatcatcagtctacataca 28741318  T
Q  297 taatagtc 304  Q
    ||||||||    
T  28741319 taatagtc 28741326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 229
Target Start/End: Original strand, 41316305 - 41316506
Alignment:
Q  24 caactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaa 123  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||   | ||||| ||  | |||| |||||||||  |||||||| |||||||| |||  ||| |    
T  41316305 caactttatagttatcctgttacagataacgtttgaatgacaataaagcccttaagtcca-catctagggatcatagtggattcaggtctaagaatggta 41316403  T
Q  124 tacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaa 223  Q
    | | ||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||| || ||||||||||  || || ||  | |||||||||||||| |||    
T  41316404 ttctccgttatcagtatgagaatatcttatgacac-tttcataac--atactatataatattctcatggtgggtcgattaagtataaatattactcataa 41316500  T
Q  224 tattta 229  Q
    ||||||    
T  41316501 tattta 41316506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 41661756 - 41661694
Alignment:
Q  4 ttcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtga 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||  |||||||||||||||||||    
T  41661756 ttcatggagtacccatcaaccaactttatgatcatcttattatagacaacgtttgaatggtga 41661694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21626955 - 21626824
Alignment:
Q  96 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 195  Q
    ||||||| ||||||||| ||  |||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   ||   |||||||||||||||  ||    
T  21626955 catagtgatttcaggtctaacagtggtagacactattatcactatgagaatatcttatgacac-tttcataac--atagcgtgtagtattctcatggtgg 21626859  T
Q  196 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 231  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21626858 -tcaattcaatataaatattactcatattatttata 21626824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 160
Target Start/End: Original strand, 28740910 - 28740986
Alignment:
Q  84 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 160  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||  ||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28740910 acatctagggatcatagtggtttcagatctaagaatggtatacaccattatcattatgagaatgtcttatgacactt 28740986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 28718943 - 28719006
Alignment:
Q  172 tactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatcta 235  Q
    |||| ||||||||||||| || |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28718943 tactgtgtagtattctcacgatgagtcaatcaagtataaatattactcctaatatttatatcta 28719006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 314
Target Start/End: Original strand, 24763751 - 24763867
Alignment:
Q  197 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 296  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| | ||| |||  | || |||| |  ||||| ||| |||||||||||| || |    
T  24763751 tcaatccagtataaatattactcataatatttatacctatgtatagacgtaatatctc-atgtctatgacccatgagacgtggtcatcagtctacataaa 24763849  T
Q  297 taatagtctctatgcttt 314  Q
    |||||||||| |||||||    
T  24763850 taatagtctcgatgcttt 24763867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 310
Target Start/End: Original strand, 12098609 - 12098649
Alignment:
Q  270 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 310  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12098609 tgagatctgatcatcagtctacatacataatagtctctatg 12098649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 18 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 1461 - 1159
Alignment:
Q  18 atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 117  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1461 atcaaccaactttatatttatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 1362  T
Q  118 gtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattac 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1361 gtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatcaatccaatataaatattac 1262  T
Q  218 tcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgat 317  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1261 tcttaatatttatatctatggcaagacttgataactttttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaat 1162  T
Q  318 gat 320  Q
    |||    
T  1161 gat 1159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 6007 - 5695
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6007 tgattgatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacttgactccaacatctagggtacatag 5908  T
Q  101 tggtttcaggtcgaaggg-tggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt-ataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 198  Q
    |||||||| |||||| || |||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5907 tggtttcatgtcgaaaggatggaatgcac---------tatgagaatatcttatgacactttttcataacttttactatgtagtattcacatggcggatc 5817  T
Q  199 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5816 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgacctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 5717  T
Q  299 atagtctctatgctttgatgat 320  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  5716 atagtctttatgctttaatgat 5695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 230113 - 230367
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  230113 tgattcatggtgtatccaccaaccaactttattgtcatcttgttacagacaacgtttgaatagtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacataa 230212  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  230213 tggtttcaggtcgaagggtagaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatcaa 230312  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactct 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230313 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactct 230367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 483 - 183
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  483 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 385  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  384 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaa 288  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  287 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgtggtcatcagtcgacatacataat 189  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  188 agtctc 183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 3677 - 3977
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  3677 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 3775  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  3776 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 3872  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  3873 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 3971  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  3972 agtctc 3977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 120030 - 119730
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||    
T  120030 tgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatag 119932  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  119931 tggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaa 119835  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  119834 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacgtacataat 119736  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  119735 agtctc 119730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 306
Target Start/End: Original strand, 12961 - 13251
Alignment:
Q  11 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||||| | || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  12961 agtacccatcaaccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaagcaattgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 13059  T
Q  111 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 210  Q
    || ||| |||  |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||   |||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||    
T  13060 tctaagagtgatatacactattatcattatgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtcaatccggtataa 13156  T
Q  211 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 306  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13157 atattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatatatgacccatgagatgtggtcatcggtctacatacataatagtctc 13251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Original strand, 130262 - 130526
Alignment:
Q  37 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 136  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | |||||    
T  130262 atccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatca 130360  T
Q  137 ctatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 236  Q
     | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130361 ttgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 130457  T
Q  237 gtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 306  Q
    ||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  130458 gtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 130526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 67376 - 67676
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||||    
T  67376 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcatag 67474  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||| ||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || ||||    
T  67475 tggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtcaa 67571  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||  ||||||||    
T  67572 tccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctatatacataat 67670  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  67671 agtctc 67676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8511 - 8305
Alignment:
Q  96 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 195  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  ||    
T  8511 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgg 8415  T
Q  196 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 295  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  8414 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 8316  T
Q  296 ataatagtctc 306  Q
    |||||||||||    
T  8315 ataatagtctc 8305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 39990 - 40290
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  |||| |||| | |||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  | |||||||| || ||||  || |||||  |||||    
T  39990 tgattcatcaagtaaccattagccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggaaataaagcacttgagtccat-atttagggatcatag 40088  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||| ||| ||| ||   |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||||||    || ||||    
T  40089 tggtttcaagtctaagagttatatacaccattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacagtgggtcaa 40185  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  ||||||||| |  |||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  40186 tccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggccatcagtctacatacataat 40284  T
Q  301 agtctc 306  Q
    ||||||    
T  40285 agtctc 40290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26842 - 26609
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||  ||||   | ||||||||||| |||| ||| |||||  |||||    
T  26842 tgattcatcgagtacccattatccaacgttatggttatccttttacagacaacattaaaatgacaataaagcactcgagtcca-catatagggatcatag 26744  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||| |  || ||||    
T  26743 tggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatatagtattctcaaggtgggtcaa 26647  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 238  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26646 tccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 26609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 197 - 314
Target Start/End: Original strand, 90033 - 90151
Alignment:
Q  197 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactc-tttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 295  Q
    |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  90033 tcaatccaatataaatgttatacgtaatatttatatctatgtgaagtgttgataactcttttacccatgatccgtgagatgtgattatcagtctatctac 90132  T
Q  296 ataatagtctctatgcttt 314  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  90133 atagtagtctttatgcttt 90151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9005 - 8723
Alignment:
Q  27 ctttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatac 126  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||   | ||| |||| ||||||| ||| || ||  ||| ||||||||||||| | | |||| ||||    
T  9005 ctttatagttatcatgttacagagaacgtttgaatgacaataaaacacttgactcca-catttaaggatcattgtggtttcaggtctaggagtggtatac 8907  T
Q  127 accactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatat 226  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||   ||||| |||||||||||||   || |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  8906 accattatcactatgagaatatcttatgaca-tcttcataac--atactaagtagtattctcattgggggtcaatctagtataaatattactcctaatat 8810  T
Q  227 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 314  Q
    ||| |  ||||   |  ||| ||| |||  |||| ||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  8809 ttacacatatgcatatccttaatatctc-atatctatgacatgtgagacgtgatcatcaatctacatacatattagtctctacgcttt 8723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 286 - 102
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||||||||  || ||    
T  286 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcagag 188  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctca 189  Q
    |||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  187 tggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctca 102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 11528 - 11758
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  || ||    
T  11528 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcaaag 11626  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgtagtattctcatgacggat 197  Q
    |||||||||||| ||| | |   |||||   ||||| | |||||||||||||||||| ||  |   |||||   ||||||||||||||||||    || |    
T  11627 tggtttcaggtctaagagcgatgtacactgttatcattgtgagaatatcttatgacaattaatcacataac--gtactatgtagtattctcacagtgggt 11724  T
Q  198 caatccaatataaatattactcctaatatttata 231  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11725 ctatccagtataaatattactcctaatatttata 11758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 231
Target Start/End: Original strand, 83111 - 83243
Alignment:
Q  96 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 195  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  ||  ||||   |||||||||||||||||||   ||    
T  83111 catactggtttcaggtctaagagtggagtacaccaatatgactatgataatatcttatgacac-cttcgtaac--atactatgtagtattctcattgtgg 83207  T
Q  196 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 231  Q
     |||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  83208 gtcaatccagtataaatattacttctgatatttata 83243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 54064 - 53766
Alignment:
Q  1 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  | |||||||| || ||| ||| ||||||  |||||    
T  54064 tgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatgg-cataaagcacttgagtcc-acacctagggatcatag 53967  T
Q  101 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 200  Q
    |||||||||||| ||| |    ||| || | || ||   ||||||||||||||||||  ||| |||||   |||||||||||||||||| |  || ||||    
T  53966 tggtttcaggtctaagagcaatataaactattaacatgttgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtcaa 53870  T
Q  201 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 300  Q
     ||| | | |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| || ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||| ||||| ||||||||    
T  53869 cccagtgtgaatattactcttaatatttatacctatgtatagaattaatacctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcaatctacatacataat 53771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 46051 - 45956
Alignment:
Q  176 atgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatat----ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 267  Q
    |||||| ||||| |||  || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    |||||||||| |||| | |||| |||| |||||||||||||    
T  46051 atgtagcattctaatggtgggtcaattcaatataaatattactcataatatatatttatatctatatgaatatttgacaactttttatccatgatc 45956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 314
Target Start/End: Original strand, 15089 - 15133
Alignment:
Q  270 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 314  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15089 tgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgatgcttt 15133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University