View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15735_low_76 (Length: 240)

Name: NF15735_low_76
Description: NF15735
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15735_low_76
NF15735_low_76
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (19-229)||(6301594-6301804)
chr8 (19-229)||(23967508-23967718)
chr8 (19-229)||(37028626-37028836)
chr8 (19-229)||(42061782-42061992)
chr8 (19-229)||(44939231-44939441)
chr8 (19-229)||(12759162-12759372)
chr8 (21-229)||(41155301-41155508)
chr8 (19-223)||(44384066-44384270)
chr8 (19-229)||(14079950-14080160)
chr8 (19-229)||(39203299-39203509)
chr8 (19-229)||(42812070-42812280)
chr8 (19-229)||(44598433-44598644)
chr8 (19-229)||(41627560-41627770)
chr8 (19-229)||(45295172-45295382)
chr8 (19-229)||(36603188-36603398)
chr8 (20-229)||(41976127-41976335)
chr8 (19-229)||(22357565-22357775)
chr8 (19-189)||(30825113-30825283)
chr8 (19-183)||(20664094-20664258)
chr8 (19-183)||(30549460-30549624)
chr8 (19-229)||(27629339-27629549)
chr8 (19-229)||(41906516-41906726)
chr8 (58-229)||(19246809-19246980)
chr8 (58-229)||(19319993-19320164)
chr8 (20-229)||(33425377-33425584)
chr8 (19-183)||(44214210-44214374)
chr8 (63-229)||(6478611-6478776)
chr8 (19-153)||(19396543-19396676)
[»] chr3 (32 HSPs)
chr3 (19-223)||(39797468-39797672)
chr3 (19-229)||(5253374-5253584)
chr3 (19-229)||(36168584-36168794)
chr3 (19-229)||(11952409-11952619)
chr3 (19-229)||(16494794-16495004)
chr3 (19-229)||(2845879-2846089)
chr3 (19-229)||(22476621-22476830)
chr3 (19-229)||(8241619-8241829)
chr3 (19-229)||(54794086-54794296)
chr3 (19-229)||(35435889-35436099)
chr3 (19-216)||(52854586-52854783)
chr3 (19-229)||(16340584-16340794)
chr3 (19-229)||(52841654-52841864)
chr3 (19-223)||(17910889-17911093)
chr3 (19-229)||(12169066-12169276)
chr3 (19-229)||(23192445-23192655)
chr3 (19-189)||(35089007-35089177)
chr3 (19-229)||(51247284-51247494)
chr3 (19-209)||(55295931-55296121)
chr3 (19-223)||(40828065-40828269)
chr3 (19-218)||(11326785-11326984)
chr3 (19-229)||(31370150-31370359)
chr3 (19-183)||(917612-917776)
chr3 (19-183)||(44073888-44074052)
chr3 (19-190)||(54648681-54648852)
chr3 (19-229)||(6105247-6105456)
chr3 (19-229)||(21700690-21700900)
chr3 (19-229)||(48975596-48975806)
chr3 (40-223)||(50740297-50740481)
chr3 (19-229)||(49111986-49112198)
chr3 (40-223)||(50772373-50772557)
chr3 (96-222)||(28165218-28165351)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (19-229)||(47574457-47574667)
chr7 (19-229)||(6912479-6912689)
chr7 (19-229)||(3794425-3794634)
chr7 (19-220)||(33639832-33640031)
chr7 (19-229)||(9227357-9227567)
chr7 (19-229)||(17169977-17170186)
chr7 (19-229)||(47173407-47173614)
chr7 (19-229)||(14307848-14308057)
chr7 (19-229)||(19520090-19520300)
chr7 (19-229)||(48528887-48529096)
chr7 (19-229)||(31898913-31899125)
chr7 (19-229)||(39650074-39650285)
chr7 (19-229)||(5961616-5961826)
chr7 (19-229)||(42686486-42686696)
chr7 (19-217)||(42916767-42916965)
chr7 (19-219)||(47164702-47164903)
chr7 (19-229)||(23767574-23767782)
chr7 (40-229)||(17512481-17512670)
chr7 (40-229)||(17540544-17540733)
chr7 (19-183)||(33231128-33231292)
chr7 (36-223)||(4485790-4485977)
chr7 (19-190)||(11499549-11499720)
chr7 (19-189)||(8927067-8927237)
chr7 (40-229)||(17476838-17477028)
chr7 (40-229)||(17576186-17576376)
chr7 (19-229)||(19518942-19519152)
chr7 (19-229)||(19519516-19519726)
chr7 (19-183)||(19034828-19034992)
chr7 (19-183)||(20719644-20719808)
chr7 (19-183)||(20764314-20764478)
chr7 (19-183)||(34283271-34283435)
chr7 (40-229)||(17481284-17481474)
chr7 (40-229)||(17571740-17571930)
chr7 (19-183)||(29489892-29490056)
chr7 (19-229)||(27736191-27736394)
chr7 (100-229)||(9148359-9148488)
chr7 (19-79)||(9148309-9148369)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (19-229)||(13457852-13458062)
chr6 (19-229)||(34319988-34320198)
chr6 (19-229)||(1074403-1074613)
chr6 (19-229)||(7221641-7221851)
chr6 (19-229)||(18600126-18600336)
chr6 (19-229)||(33977867-33978077)
chr6 (19-229)||(1219475-1219684)
chr6 (19-229)||(24444878-24445087)
chr6 (19-229)||(9980188-9980396)
chr6 (19-229)||(22374986-22375196)
chr6 (18-229)||(2520060-2520270)
chr6 (19-229)||(7219933-7220143)
chr6 (19-218)||(14889090-14889288)
chr6 (19-217)||(11936938-11937136)
chr6 (19-229)||(15274500-15274710)
chr6 (19-229)||(25532166-25532376)
chr6 (19-229)||(3089172-3089380)
chr6 (20-229)||(17938420-17938630)
chr6 (19-229)||(34854853-34855062)
chr6 (19-183)||(248825-248989)
chr6 (19-183)||(12580964-12581128)
chr6 (19-229)||(1080731-1080939)
chr6 (46-229)||(4423308-4423491)
chr6 (140-229)||(11517558-11517647)
chr6 (152-219)||(33325611-33325678)
chr6 (152-219)||(35135274-35135341)
chr6 (20-84)||(11269627-11269691)
chr6 (20-84)||(11517659-11517723)
chr6 (140-177)||(11269703-11269740)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (19-229)||(31296662-31296872)
chr5 (19-229)||(19394368-19394578)
chr5 (19-229)||(12589409-12589618)
chr5 (19-229)||(289487-289697)
chr5 (19-229)||(34375531-34375741)
chr5 (19-229)||(35540990-35541200)
chr5 (19-229)||(3211327-3211537)
chr5 (19-229)||(25697647-25697856)
chr5 (19-229)||(34716539-34716747)
chr5 (19-189)||(7284556-7284726)
chr5 (19-229)||(30141454-30141665)
chr5 (19-229)||(3151734-3151944)
chr5 (19-229)||(3398463-3398672)
chr5 (19-229)||(27064781-27064991)
chr5 (19-229)||(41690226-41690434)
chr5 (19-229)||(30688195-30688404)
chr5 (21-223)||(4881166-4881368)
chr5 (19-229)||(26322205-26322413)
chr5 (21-229)||(1853048-1853256)
chr5 (19-189)||(33612309-33612479)
chr5 (19-217)||(3027338-3027537)
chr5 (19-190)||(20997108-20997278)
chr5 (19-183)||(37463279-37463443)
chr5 (42-229)||(20348847-20349029)
chr5 (19-229)||(19447023-19447220)
chr5 (74-229)||(2194100-2194254)
chr5 (117-229)||(21029083-21029195)
chr5 (19-78)||(2193666-2193725)
[»] chr4 (37 HSPs)
chr4 (19-229)||(15519780-15519990)
chr4 (19-229)||(741425-741635)
chr4 (19-229)||(40621078-40621288)
chr4 (19-229)||(575151-575361)
chr4 (19-229)||(35496661-35496871)
chr4 (19-229)||(35713259-35713468)
chr4 (19-223)||(16904207-16904411)
chr4 (19-229)||(17738974-17739183)
chr4 (19-229)||(52799977-52800185)
chr4 (19-229)||(15655958-15656168)
chr4 (19-229)||(28972025-28972235)
chr4 (20-218)||(53341342-53341540)
chr4 (19-229)||(55999846-56000056)
chr4 (19-229)||(5274893-5275102)
chr4 (19-229)||(19589779-19589989)
chr4 (19-229)||(39715644-39715854)
chr4 (19-229)||(47721211-47721421)
chr4 (19-218)||(13626984-13627183)
chr4 (19-229)||(7645258-7645468)
chr4 (19-229)||(23477836-23478045)
chr4 (19-229)||(14830658-14830867)
chr4 (19-229)||(19832533-19832743)
chr4 (19-229)||(28136202-28136412)
chr4 (19-229)||(33504134-33504344)
chr4 (19-229)||(34057712-34057921)
chr4 (19-223)||(1943431-1943635)
chr4 (19-183)||(10260500-10260664)
chr4 (19-183)||(21563791-21563955)
chr4 (19-183)||(24078570-24078734)
chr4 (19-183)||(26925442-26925606)
chr4 (19-183)||(43331312-43331476)
chr4 (19-183)||(51451378-51451542)
chr4 (19-229)||(39745992-39746202)
chr4 (19-185)||(36856062-36856228)
chr4 (88-229)||(54332788-54332929)
chr4 (140-209)||(16892158-16892227)
chr4 (20-84)||(16892082-16892146)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (19-229)||(1994057-1994267)
chr2 (19-229)||(6343845-6344055)
chr2 (19-229)||(14324329-14324539)
chr2 (19-229)||(28501230-28501440)
chr2 (20-229)||(9917825-9918034)
chr2 (19-229)||(10049116-10049326)
chr2 (19-229)||(18093845-18094055)
chr2 (19-229)||(16882881-16883091)
chr2 (19-229)||(17040571-17040781)
chr2 (19-229)||(28608172-28608382)
chr2 (19-229)||(19168749-19168959)
chr2 (37-229)||(14752136-14752328)
chr2 (19-229)||(26820568-26820778)
chr2 (19-229)||(26826476-26826686)
chr2 (19-229)||(30567987-30568197)
chr2 (19-229)||(4810497-4810707)
chr2 (19-229)||(21096649-21096858)
chr2 (19-217)||(9544756-9544956)
chr2 (19-229)||(4291769-4291978)
chr2 (19-229)||(33664896-33665106)
chr2 (19-229)||(36634209-36634418)
chr2 (19-183)||(3709859-3710023)
chr2 (19-183)||(11867393-11867557)
chr2 (19-183)||(35358786-35358950)
chr2 (19-229)||(42884341-42884550)
chr2 (19-229)||(45206088-45206298)
chr2 (54-218)||(33906255-33906419)
chr2 (140-229)||(7361057-7361146)
chr2 (20-84)||(7360981-7361045)
chr2 (153-190)||(11446729-11446766)
[»] chr1 (28 HSPs)
chr1 (19-229)||(18110639-18110849)
chr1 (19-229)||(43255672-43255882)
chr1 (19-229)||(50396086-50396296)
chr1 (19-223)||(51966856-51967060)
chr1 (19-229)||(13663534-13663744)
chr1 (19-229)||(29841805-29842014)
chr1 (19-229)||(42681313-42681522)
chr1 (19-229)||(50559972-50560183)
chr1 (19-229)||(10695309-10695518)
chr1 (19-229)||(28566836-28567046)
chr1 (19-229)||(4891051-4891260)
chr1 (19-229)||(18813140-18813350)
chr1 (19-229)||(29187227-29187436)
chr1 (19-229)||(31618611-31618820)
chr1 (19-229)||(34686509-34686718)
chr1 (19-229)||(38846342-38846552)
chr1 (19-229)||(33360653-33360863)
chr1 (19-217)||(52522699-52522897)
chr1 (19-189)||(34691047-34691217)
chr1 (19-217)||(41831186-41831383)
chr1 (19-229)||(41964049-41964258)
chr1 (19-229)||(48339315-48339525)
chr1 (19-229)||(52308757-52308966)
chr1 (19-229)||(15314175-15314384)
chr1 (19-156)||(18095734-18095870)
chr1 (134-229)||(21736710-21736805)
chr1 (19-113)||(49225199-49225293)
chr1 (154-207)||(18097673-18097726)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (19-229)||(153299-153509)
scaffold0006 (19-223)||(65765-65969)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (19-229)||(48981-49191)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (19-229)||(8842-9051)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (19-229)||(13601-13813)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (19-229)||(12721-12929)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (19-229)||(19507-19715)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (19-223)||(13984-14188)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (36-229)||(231552-231745)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (19-229)||(27492-27701)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (30-229)||(118966-119165)
scaffold0010 (17-94)||(118587-118664)
scaffold0010 (136-218)||(49896-49978)
scaffold0010 (136-218)||(57429-57511)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (19-229)||(11841-12044)
scaffold0032 (19-229)||(5392-5595)
[»] scaffold1884 (2 HSPs)
scaffold1884 (19-139)||(743-863)
scaffold1884 (158-229)||(862-933)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (19-114)||(16577-16672)
[»] scaffold2007 (1 HSPs)
scaffold2007 (119-214)||(109-204)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6301804 - 6301594
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6301804 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 6301705  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6301704 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 6301605  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  6301604 gcttcttctca 6301594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23967718 - 23967508
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23967718 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatctga 23967619  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23967618 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 23967519  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  23967518 gcttcttctca 23967508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 37028626 - 37028836
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37028626 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatctga 37028725  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37028726 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 37028825  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  37028826 gcttcttctca 37028836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42061992 - 42061782
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42061992 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatctga 42061893  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42061892 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 42061793  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  42061792 gcttcttctca 42061782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 44939231 - 44939441
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44939231 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatctga 44939330  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44939331 tttgattgtttattgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 44939430  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  44939431 gcttcttctca 44939441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 12759162 - 12759372
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  12759162 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacggtgttagagtaaattattatttcaaaatctga 12759261  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||    
T  12759262 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcaacagtcagaacttaagtaagagttcg 12759361  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  12759362 gcttcttctca 12759372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 41155301 - 41155508
Alignment:
Q  21 acctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  41155301 acctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacaatgttagagtaaattattatttcacaatctgatt 41155400  T
Q  121 tgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggc 220  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  41155401 tgattgtttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagcttaga-tcaaagcatcagtcaaaacttaagtcagagttcggc 41155499  T
Q  221 ttcatctca 229  Q
    ||| |||||    
T  41155500 ttcttctca 41155508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44384270 - 44384066
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  44384270 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatatagtgttagagtaaattattatttcacaatctga 44384171  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  44384170 tttgattgttttttgaccatgtttattgaattgttgtcgtgaccttaatacttttcaagctcaaagtcaaagcatcagtcagaacttaagtcacagttcg 44384071  T
Q  219 gcttc 223  Q
     ||||    
T  44384070 acttc 44384066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14080160 - 14079950
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  14080160 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 14080061  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  14080060 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgactttaacacttctcaagctcagagtcaaaacttcagttagaacttaagtcagagttcg 14079961  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  14079960 acttcttctca 14079950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 39203299 - 39203509
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39203299 caacctccattatccagttattgagaagtttaagatttagtaagtttgcattatgatttcacaatatagtattagagtaacttattatttcacaatctga 39203398  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  39203399 tttgattgtttattgaccatatttcttgaattcttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaaagtcaaagcttcagtcagaacttaagtcagagttcg 39203498  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  39203499 gcttcttctca 39203509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42812280 - 42812070
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  42812280 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattataatttcacaatacagtgttagaataacttattatttcacaattcga 42812181  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||    
T  42812180 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgactttaacacttctcaagctcatagtcaaagcttcagttagaacttaagttagagttcg 42812081  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  42812080 acttcttctca 42812070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 44598433 - 44598644
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  44598433 caacctacatcatccggttgttaagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 44598532  T
Q  119 tttga-ttgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttc 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||    
T  44598533 tttgatttgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttc 44598632  T
Q  218 ggcttcatctca 229  Q
    | |||| |||||    
T  44598633 gacttcttctca 44598644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 41627560 - 41627770
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  41627560 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctta 41627659  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  41627660 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgacattgacacttctcaagctcagattcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcg 41627759  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  41627760 acttcttctca 41627770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 45295382 - 45295172
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45295382 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacaatgttagagtaacttattatttcacaatctga 45295283  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  || ||||| ||||||||| |||||| |    
T  45295282 tttgattgttttttgaccatgttccttgaattgttgtcgtgaccttaaaacttctcaagcttagagtcaaaacattagtcagaacttaagtcagagtttg 45295183  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    | ||| |||||    
T  45295182 gtttcttctca 45295172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36603398 - 36603188
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  36603398 caacgtacatcatccggatgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcataatccga 36603299  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  36603298 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttatcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcg 36603199  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  36603198 acttcttctca 36603188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 41976127 - 41976335
Alignment:
Q  20 aacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgat 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| | ||||||||||||| | ||    
T  41976127 aacctacattttccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatgcagtgttagagtaaatcattatttcacaatctcat 41976226  T
Q  120 ttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcgg 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  41976227 ttgattgtttttt-accatgtttcttgaattgttgttgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcatcagtcagaacttaagtcagagtttgg 41976325  T
Q  220 cttcatctca 229  Q
    |||| |||||    
T  41976326 cttcttctca 41976335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22357775 - 22357565
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  22357775 caacctacatcatccggttctttagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatctcacaatccga 22357676  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||| |||||| |    
T  22357675 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcatagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagtttg 22357576  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  22357575 acttcttctca 22357565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Original strand, 30825113 - 30825283
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  30825113 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 30825212  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaa 189  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30825213 tgtgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcatgactttaacacttctcaagctcagagtcaaa 30825283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20664258 - 20664094
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20664258 caacctacatcatccggttgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 20664159  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaga 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20664158 tttgattgtttattgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaacttaacacttctcaagctcaga 20664094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 30549624 - 30549460
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30549624 caacctacatcatccggttgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 30549525  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaga 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30549524 tttgattgtttattgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaacttaacacttctcaagctcaga 30549460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 27629339 - 27629549
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||   |    
T  27629339 caacctacatcatctggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattaagatttcacaatatagtgttagagtaacttattatttcacaatccaa 27629438  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||| |||||    
T  27629439 tttgattgttatttgaccatgtttcttgaatagttgtcgtgatcttaacatttctcaagctcagagtcaaagcttcaatcagaatttaagttagggttcg 27629538  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  27629539 acttcttctca 27629549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 41906516 - 41906726
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41906516 caacctatatcatccggttgttgagaagtttaagacttggtaagtttgcattatgatttcacaataaagtgttagagtaacttattatttcacaatttga 41906615  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | || |||||| | ||||||    
T  41906616 tttgattatttttttaccatgtttcttgaattgttatcgtgacattaacacttctcaaactcagagtcaaagcttcagttagaaattaagtcaaagttcg 41906715  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  41906716 acttcttctca 41906726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 58 - 229
Target Start/End: Original strand, 19246809 - 19246980
Alignment:
Q  58 gtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgatttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcg 157  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19246809 gtaagtttgcgttatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctgatttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcg 19246908  T
Q  158 tgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggcttcatctca 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  19246909 tgaccttaaaacttctcaagctcagagtcaaagcatcattcataacttaagtcagagttcggtttcttctca 19246980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 58 - 229
Target Start/End: Original strand, 19319993 - 19320164
Alignment:
Q  58 gtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgatttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcg 157  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19319993 gtaagtttgcgttatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctgatttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcg 19320092  T
Q  158 tgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggcttcatctca 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  19320093 tgaccttaaaacttctcaagctcagagtcaaagcatcattcataacttaagtcagagttcggtttcttctca 19320164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33425584 - 33425377
Alignment:
Q  20 aacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgat 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  33425584 aacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttggattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattattt-acaatccgat 33425486  T
Q  120 ttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcgg 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||     
T  33425485 ttgatttttttttgaccatgtttcttgaattgttgccgtgactttaacacttctcaagctcatagtcaaact-tcagttagaacttaagtcagagttcga 33425387  T
Q  220 cttcatctca 229  Q
    |||| |||||    
T  33425386 cttcttctca 33425377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 44214374 - 44214210
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44214374 caacctacatcatccggttgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatactgtgttagagtaacttattatttcacaatctga 44214275  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaga 183  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44214274 tttgattgtttattgacgatgtttcttgaattgttgtcgtgaacttaacacttctcaagctcaga 44214210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 63 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6478776 - 6478611
Alignment:
Q  63 tttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgatttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgacc 162  Q
    ||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6478776 tttgcattatgatttcatattacagtgttagagtaacttattatttcacaatctgatttgattgttttt-gaccatgcttcttgaattgttgtcgtgacc 6478678  T
Q  163 ttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggcttcatctca 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  6478677 ttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcgacttcttctca 6478611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19396676 - 19396543
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  19396676 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagactta-taagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 19396578  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgtt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19396577 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgtt 19396543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 32)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39797672 - 39797468
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39797672 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 39797573  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39797572 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 39797473  T
Q  219 gcttc 223  Q
    |||||    
T  39797472 gcttc 39797468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5253584 - 5253374
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5253584 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatctga 5253485  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5253484 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 5253385  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  5253384 gcttcttctca 5253374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36168794 - 36168584
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36168794 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttggtaagtttgcattatgatttcaaaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 36168695  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  36168694 tttgattgttgtttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagtcataacttaagttagagttcg 36168595  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  36168594 acttcttctca 36168584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11952619 - 11952409
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11952619 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatatagtgttagagtaaattattatttcacaatttga 11952520  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||||    
T  11952519 tttgattgttttttgactacgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcattagtctgaacttaagtcagagttcg 11952420  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  11952419 gcttcttctca 11952409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 16494794 - 16495004
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16494794 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 16494893  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||    
T  16494894 tttgattattttttgaccatgtttcttgaattgttatcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagctacagtcagaacttaagttagagttcg 16494993  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  16494994 gcttcttctca 16495004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2846089 - 2845879
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2846089 caacctacatcattcagttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 2845990  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||    
T  2845989 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttcttaagctcagagtcaaagattcagttagaacttaagttagagttcg 2845890  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  2845889 acttcttctca 2845879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 22476621 - 22476830
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22476621 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatttga 22476720  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  22476721 tttgattg-tttttaactatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtgaaagcatcagtctgaacttaagttagagttcg 22476819  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  22476820 gcttcttctca 22476830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 8241619 - 8241829
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8241619 caacccacatcatccggttgttaagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 8241718  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  8241719 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattattgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagtaagaacttaagtcagagttcg 8241818  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  8241819 gcttcttctca 8241829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 54794296 - 54794086
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54794296 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaaggcttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 54794197  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||| ||||||||    
T  54794196 tttgattgttttttgaccatgtttcttgagttgttgtcgtgaccttaacacttctcgagctcagagtcaaagctacagtcagaacttaagtgagagttcg 54794097  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  54794096 gcttcttctca 54794086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 35435889 - 35436099
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  35435889 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttggtaagtttgcattataatttcaaaatacagtgttggagtaacttattatttcacaatctga 35435988  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| ||||||||    
T  35435989 tttgattgttgtttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagctttagtcagaacttaagtcagagttcg 35436088  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    || || |||||    
T  35436089 gcctcttctca 35436099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 52854783 - 52854586
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52854783 caacctacatcatctggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacagtttga 52854684  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagtt 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  52854683 tttgattgttttttgacaatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcatagtcaaagtttcagttagaacttaagtcagagtt 52854586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 16340584 - 16340794
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16340584 caacctatatcatccggttgttaagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 16340683  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  16340684 tttgattgttttttgaccatgttttttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcg 16340783  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  16340784 acttcttctca 16340794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 52841864 - 52841654
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52841864 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 52841765  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  | ||||||||| ||||||||    
T  52841764 tttgattgttttttgaccaactttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcggctagaacttaagtcagagttcg 52841665  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  52841664 acttcttctca 52841654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17911093 - 17910889
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  17911093 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttcgtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 17910994  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||||||||| ||||||||    
T  17910993 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgactttaacacttctcaagctcagagtcaaagctttagttaaaacttaagtcagagttcg 17910894  T
Q  219 gcttc 223  Q
     ||||    
T  17910893 acttc 17910889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12169276 - 12169066
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12169276 caacctacatcatctggttgttgagaagtttaatacttagtaattttgcattatgatttcaaaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 12169177  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12169176 tttaattgttgtttgaccatctttcttgaattgtttttgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagtcagaacttaagtcagagttcg 12169077  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  12169076 gcttcttctca 12169066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 23192445 - 23192655
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  23192445 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcatagtacagtattagagtaacctattatttcacaatccga 23192544  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  23192545 tttgattgtttttagaccatgtttatttaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcg 23192644  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  23192645 acttcttctca 23192655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35089177 - 35089007
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  35089177 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgattttacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 35089078  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35089077 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgactttaacacttctcaagctcagagtcaaa 35089007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 51247284 - 51247494
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  51247284 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatgcagtgttagagtaacttattatttgacaatccga 51247383  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || |||||| ||||||||    
T  51247384 tttgattattttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagttagaaattaagtcagagttcg 51247483  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  51247484 acttcttctca 51247494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 55296121 - 55295931
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  55296121 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacactctga 55296022  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagt 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||    
T  55296021 attgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgttgtgaccttaacacttctcaagctcaaagtcaaagcatcagtcagaactaaagt 55295931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40828269 - 40828065
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  40828269 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttgataaatttgcattatgatttcacaaaacagtgttagagtaaattattattttacaatctga 40828170  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  40828169 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtaaccttaacacttcttaagctcagagttaaaacatcagtcagaacttaagttagagttcg 40828070  T
Q  219 gcttc 223  Q
    |||||    
T  40828069 gcttc 40828065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11326984 - 11326785
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||   |    
T  11326984 caacctacatcatccggttgttaaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttataatttcacaatccaa 11326885  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||    
T  11326884 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctgaagctcagagtcaaagattcagttagaacttaagttagagttcg 11326785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31370359 - 31370150
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  31370359 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 31370260  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  31370259 tttgattgttttttgaccatggttcttaaattgttgtcatgactttaacacttctcaagctcagagtcaaact-tcagttaaaacttaagtcagagttcg 31370161  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  31370160 acttcttctca 31370150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 917612 - 917776
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  917612 caacctacatcatccggttgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 917711  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaga 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  917712 tttgattgtttattgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaacttaacacttctcaagctcaga 917776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 44074052 - 44073888
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44074052 caacctacatcatccggttgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 44073953  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaga 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44073952 tttgattgtttattgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaacttaacacttctcaagctcaga 44073888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 54648852 - 54648681
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||   |    
T  54648852 caacctacatcatccggttgttgagaagtttgagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacaatgttagagtaacttattatttcacaatccaa 54648753  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaag 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54648752 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcatgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaag 54648681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6105456 - 6105247
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  6105456 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagcaacttattatttcacaatccga 6105357  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  6105356 tttgattgtttttttaacatgtttcttgaattcttgtcatgactttaacacttctcaagctcagagtcaaact-tcagttaaaacttaagtcagagttcg 6105258  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  6105257 acttcttctca 6105247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21700900 - 21700690
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  21700900 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagactgagtaaatttgcattatgatttcacaatatagtgttagagtaacttattagttcacaatccga 21700801  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  21700800 tttggttgttttttgacaatgtttcttgaattgttgtcataaccttaacacttctcaagctcagagttaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcg 21700701  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  21700700 acttcttctca 21700690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 48975596 - 48975806
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  48975596 caacctacatcagccggttgttgagaagtttaagacttaataagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 48975695  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  48975696 ttcgattgttttttgaccatgttccttgaattgtcgtcgtaaccttagcacttctcaagttcggagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcg 48975795  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  48975796 acttcttctca 48975806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 223
Target Start/End: Original strand, 50740297 - 50740481
Alignment:
Q  40 tgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgatttgattgtttt-ttgaccat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  50740297 tgagaagtttaagacttagtaagtttacattatgagttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccgatttgattgtttttttgaccat 50740396  T
Q  139 gtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggcttc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||| ||||    
T  50740397 gtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttttcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcgacttc 50740481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 49111986 - 49112198
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||   |    
T  49111986 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaaatttgcattatgatttcacaatacaatgttagagtaacttattatttcacaatccaa 49112085  T
Q  119 tttgattg--ttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagtt 216  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||| | ||||||||| | ||||    
T  49112086 tttgattgtttttttttaccatgtttcttgaattgttgttgtgaccttaacacttctcaagctcaaagtcaaagctacagttagaacttaagtcatagtt 49112185  T
Q  217 cggcttcatctca 229  Q
    || |||| |||||    
T  49112186 cgacttcttctca 49112198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 50772557 - 50772373
Alignment:
Q  40 tgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgatttgatt-gttttttgaccat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||    
T  50772557 tgagaagtttaagacttagtaagtttacattatgagttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccgatttgatttgtttttttaccat 50772458  T
Q  139 gtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggcttc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||| ||||    
T  50772457 gtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttttcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcgacttc 50772373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 96 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28165351 - 28165218
Alignment:
Q  96 taacttattatttcacaatttgatttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttg-------tcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaa 188  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28165351 taacttattatttcacaatctgatttgattgttttttgaccatgtttcttaaattgttgtcatgactcatgaccttcacacttctcaagctcagagtcaa 28165252  T
Q  189 agtatcagtcataacttaagttagagttcggctt 222  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28165251 agcatcagtcagaacttaagtcagagttcggctt 28165218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 47574667 - 47574457
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47574667 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatctga 47574568  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47574567 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 47574468  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  47574467 gcttcttctca 47574457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6912689 - 6912479
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  6912689 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttatcatttcacaatctga 6912590  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6912589 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 6912490  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  6912489 gcttcttctca 6912479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 3794425 - 3794634
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3794425 caacctacattatctggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatttga 3794524  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||    
T  3794525 tttgattg-tttttgactatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctccagctcagagtcaaagcatcagtctgaacttaagtcagagttcg 3794623  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  3794624 gcttcttctca 3794634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33640031 - 33639832
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  33640031 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaa-ttattatttcacaatctga 33639933  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  33639932 tttgattgttttt-gaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcatcagtaagaacttaagtcagagttcg 33639834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9227567 - 9227357
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9227567 caacctagatcatccagttgttgaaaagtttaagacttgataagtttgcattatgatttcaaaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 9227468  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||    
T  9227467 tttgattgttgtttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcatagtcaaagtttcagtcagaacttaagtcaaagttcg 9227368  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    |||||||||||    
T  9227367 gcttcatctca 9227357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 17169977 - 17170186
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  17169977 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatctaa 17170076  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17170077 tttgatt-tttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagcttagagtcaaagcatcagtcagaacttaagtcagagttcg 17170175  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  17170176 acttcttctca 17170186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 47173407 - 47173614
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47173407 caacctacaccatccggttgttgagaagtttaagacttagtaaatttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 47173506  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  47173507 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgtt---gtgaccttaacacttctcaagctcatagtcaaagcttcagtcagaacttaagttagagttcg 47173603  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  47173604 gcttcttctca 47173614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 14307848 - 14308057
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  14307848 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 14307947  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  14307948 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcatgactttaacacttctcaagctcagagtcaaact-tcagttaaaacttaagtcagagttcg 14308046  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  14308047 acttcttctca 14308057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 19520090 - 19520300
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  19520090 caacctacatcatccgattgttgagaagtttaagacttagtaagtttccattatgatttcacaatatagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 19520189  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  19520190 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcatgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagattcagttagaacttaagtcagaattcg 19520289  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  19520290 acttcttctca 19520300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 48529096 - 48528887
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  48529096 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatatattgttagagtaaattattatttcacaatctaa 48528997  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  48528996 tttgatt-tttttttaccatatttcttgaattgttgtcgcgaccttaacacttctcaagcttagagtcaaagtatcagtcagaacttaagtcagagttca 48528898  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  48528897 gcttcttctca 48528887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31899125 - 31898913
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  31899125 caacctacattattcggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacaatgttagagtaaattattatttcacaatctaa 31899026  T
Q  119 tttgattgttttttg--accatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagtt 216  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  31899025 tttgattttttttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagcttagagtcaaagcatcagtcataacttaagtcagagtt 31898926  T
Q  217 cggcttcatctca 229  Q
    ||||||| |||||    
T  31898925 cggcttcttctca 31898913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39650285 - 39650074
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  39650285 caacctacattattcggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttacattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatctga 39650186  T
Q  119 tttgattg-ttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttc 217  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  39650185 tttaattgttttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagcttagagtcaaagcatcaatcagaacttaagtcagagttc 39650086  T
Q  218 ggcttcatctca 229  Q
    |||||| |||||    
T  39650085 ggcttcttctca 39650074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 5961616 - 5961826
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||  ||    
T  5961616 caacctacatcatgcggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgtttgagtaacttattatttcacaatccga 5961715  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  5961716 tttgattgttttttgtccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagttaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcg 5961815  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  5961816 acttcttctca 5961826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 42686486 - 42686696
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  42686486 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaataaaatgttagagtaacttattatttcacaatccga 42686585  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || | ||||||||| ||||||||    
T  42686586 tttgattatttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttctgttagaacttaagtcagagttcg 42686685  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  42686686 acttcttctca 42686696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 217
Target Start/End: Original strand, 42916767 - 42916965
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42916767 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtcagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 42916866  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttc 217  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  42916867 tttggttgttttttgaccaagtttcttgaattgttgtcgtgaacttaaaacttctcaagctcatagtcaaagcatcagtcagaacttatgtcagagttc 42916965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 47164903 - 47164702
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47164903 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacaatgttagagtaacttattatttcacaatctga 47164804  T
Q  119 tttgattgtt-ttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttc 217  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||  ||||||    
T  47164803 tttgattgttttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagcttagagtcaaagcttcagtcagaacttaagtcggagttc 47164704  T
Q  218 gg 219  Q
    ||    
T  47164703 gg 47164702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23767782 - 23767574
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  23767782 caacctacatcatccggttgt-gagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 23767684  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  23767683 tttgattgatttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgactttaacacttctcaagctcagagtcaaact-tcagttagaacttaagtcagagttcg 23767585  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  23767584 acttcttctca 23767574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Original strand, 17512481 - 17512670
Alignment:
Q  40 tgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgatttgattgttttttgaccatg 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17512481 tgagaagtttaagacttagtaagtttgcattaagatttcacaatatagtgttagagtaacttattatttcacaatccgatttgattgttttttgaccatg 17512580  T
Q  140 tttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggcttcatctca 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  17512581 tttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttttcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcgacttcttctca 17512670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17540733 - 17540544
Alignment:
Q  40 tgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgatttgattgttttttgaccatg 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17540733 tgagaagtttaagacttagtaagtttgcattaagatttcacaatatagtgttagagtaacttattatttcacaatccgatttgattgttttttgaccatg 17540634  T
Q  140 tttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggcttcatctca 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  17540633 tttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttttcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcgacttcttctca 17540544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 33231292 - 33231128
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33231292 caacctacatcatccggttgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 33231193  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaga 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33231192 tttgattgtttattgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaacttaacacttctcaagctcaga 33231128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 36 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4485977 - 4485790
Alignment:
Q  36 ttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgatttgattgttttttgac 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4485977 ttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatatagtgttagagtaacttattatttcataatctgatttgattgttttttgac 4485878  T
Q  136 catgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggcttc 223  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  4485877 cacatttcttgaattattgtcgtgaccataacacttctcaagctcagagtcaaagcttcaatcagaacttaagtcagagttcagcttc 4485790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 190
Target Start/End: Original strand, 11499549 - 11499720
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | | |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  11499549 caacctacatcattcggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgattttacaatacaatgttagagtaacttattatttcacaatccga 11499648  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaag 190  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11499649 tttaattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaag 11499720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8927237 - 8927067
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  8927237 caacctacatcatccgtttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 8927138  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8927137 tttgattgttttttgaccatgtttcttaaattgttgtcatgactttaacacttctcaagctcagagtcaaa 8927067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Original strand, 17476838 - 17477028
Alignment:
Q  40 tgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgatttgattg-ttttttgaccat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  17476838 tgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccgatttgattgtttttttgaccat 17476937  T
Q  139 gtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggcttcatctca 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  17476938 gtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttttcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcgacttcttctca 17477028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17576376 - 17576186
Alignment:
Q  40 tgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgatttgattgtt-ttttgaccat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  17576376 tgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccgatttgattgtttttttgaccat 17576277  T
Q  139 gtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggcttcatctca 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  17576276 gtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttttcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcgacttcttctca 17576186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 19518942 - 19519152
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||  ||    
T  19518942 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagaataagttattatttcacaatccga 19519041  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  19519042 tttgattggtttttgaccatgtttatagaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaaagtcaaagattcagttagaacttaagtcagaattcg 19519141  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  19519142 acttcttctca 19519152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 19519516 - 19519726
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||  ||    
T  19519516 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagaataagttattatttcacaatccga 19519615  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  19519616 tttgattggtttttgaccatgtttatagaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaaagtcaaagattcagttagaacttaagtcagaattcg 19519715  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  19519716 acttcttctca 19519726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19034992 - 19034828
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19034992 caacctacatcatccgattgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatatga 19034893  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaga 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19034892 tttgattgtttattgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaacttaacacttctcaagctcaga 19034828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 20719644 - 20719808
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20719644 caacctacatcatccgattgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatatga 20719743  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaga 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20719744 tttgattgtttattgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaacttaacacttctcaagctcaga 20719808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 20764314 - 20764478
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20764314 caacctacatcatccggttgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatactgtgttagagtaacttattatttcacaatctga 20764413  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaga 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20764414 tttgattgtttattgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaacttaacacttctcaagctcaga 20764478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 34283435 - 34283271
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34283435 caacctacatcatccggttgttgaaaagtttaagacttggtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 34283336  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaga 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34283335 tttgattgtttattgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaacttaacacttctcaagctcaga 34283271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Original strand, 17481284 - 17481474
Alignment:
Q  40 tgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgatttgattgtttt-ttgaccat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  17481284 tgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccaatttgattgtttttttgaccat 17481383  T
Q  139 gtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggcttcatctca 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  17481384 gtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttttcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcgacttcttctca 17481474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17571930 - 17571740
Alignment:
Q  40 tgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgatttgattgtttttt-gaccat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  17571930 tgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccaatttgattgtttttttgaccat 17571831  T
Q  139 gtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggcttcatctca 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  17571830 gtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttttcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcgacttcttctca 17571740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 29489892 - 29490056
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29489892 caacctacatcatccgattgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgtattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatatga 29489991  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaga 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29489992 tttgattgtttattgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaacttaacacttctcaagctcaga 29490056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27736394 - 27736191
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||  |||||||||||||| |||    
T  27736394 caacctacattattcggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacactgttagagtaaactattatttcacaatctga 27736295  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||       |||||||| |||||||| |||| |||| | ||||||    
T  27736294 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgttgtgaccttaacaattctca-------agtcaaagcatcagtcagaactaaagtcacagttcg 27736202  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  27736201 gcttcttctca 27736191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 100 - 229
Target Start/End: Original strand, 9148359 - 9148488
Alignment:
Q  100 ttattatttcacaatttgatttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtca 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9148359 ttattatttcacaatctgatttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaaactcagagtcaaagcatcagtca 9148458  T
Q  200 taacttaagttagagttcggcttcatctca 229  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  9148459 gaacttaagtcagagttcggcttcttctca 9148488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Original strand, 9148309 - 9148369
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttca 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9148309 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattattatttca 9148369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13458062 - 13457852
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13458062 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatctga 13457963  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13457962 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 13457863  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  13457862 gcttcttctca 13457852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 34319988 - 34320198
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  34319988 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatagagtgttagagtaacttactatttcacaatctga 34320087  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34320088 tttgattgttttttgaccaagtttcttgaattgttgtcgtgaccttaaaacttctcaagctcagagtcaaagcatcagtcagaacttaagtcagagttcg 34320187  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    | ||| |||||    
T  34320188 gtttcttctca 34320198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1074613 - 1074403
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  1074613 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 1074514  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  1074513 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcg 1074414  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  1074413 acttcttctca 1074403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 7221641 - 7221851
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  7221641 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 7221740  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  7221741 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcg 7221840  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  7221841 acttcttctca 7221851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18600336 - 18600126
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18600336 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 18600237  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  18600236 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaaacttcagttagaacttaagtcagagttcg 18600137  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  18600136 acttcttctca 18600126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 33977867 - 33978077
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33977867 caacctacatcatccggttgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 33977966  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||    
T  33977967 tttgattgtttattgaccatgtttcttgaattgttttcgtgaacttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttccgtcataacttaagtgagagttcg 33978066  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  33978067 gcttcttctca 33978077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 1219475 - 1219684
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  1219475 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatctaa 1219574  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1219575 tttgatt-tttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagcttagagtcaaagcatcagtcagaacttaagtcagagttcg 1219673  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  1219674 acttcttctca 1219684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 24444878 - 24445087
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  24444878 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatctaa 24444977  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  24444978 tttgatt-tttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagcttagagtcaaagcatcagtcagaacttaagtcagagttcg 24445076  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  24445077 acttcttctca 24445087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9980396 - 9980188
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  9980396 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatctaa 9980297  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  9980296 tttgat--tttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagcttagagtcaaagcatcagtcagaacttaagtcagagttcg 9980199  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  9980198 acttcttctca 9980188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22375196 - 22374986
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22375196 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 22375097  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  22375096 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgacactaacacttctcaagctcagagtcaaaacttcagttagaacttaagtcagagttcg 22374997  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  22374996 acttcttctca 22374986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Original strand, 2520060 - 2520270
Alignment:
Q  18 acaacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttg 117  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  2520060 acaatctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccg 2520159  T
Q  118 atttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| |||||||    
T  2520160 atttgattgttttttgaccatgtttcttaaattgttgtcatgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaact-tcagttaaaacttaagtcagagttc 2520258  T
Q  218 ggcttcatctca 229  Q
    | |||| |||||    
T  2520259 gacttcttctca 2520270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7220143 - 7219933
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  7220143 caacctacataatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 7220044  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  7220043 tttgattgttttttgaccatgtttatttaattgttgtcgtgaccttaacgcttctcaagctcagagccaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcg 7219944  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  7219943 acttcttctca 7219933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14889288 - 14889090
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  14889288 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 14889189  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  14889188 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaactgttttcgtgactttaacacttctcaagctcagagtcaaact-tcagttagaacttaagtcagagttcg 14889090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11937136 - 11936938
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  11937136 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaattttgcattattatttcataatatagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 11937037  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||   ||||| | ||||||||| |||||||    
T  11937036 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgactttaacacttttcaagctcagagtcaaaacttcagttagaacttaagtcagagttc 11936938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 15274500 - 15274710
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  15274500 caacctacatcatcaggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttctcaatccga 15274599  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15274600 tttgattgctttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacatttctcaagttcaaagtcaaagtttcagttagaacttaagtcagagttcg 15274699  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  15274700 acttcttctca 15274710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 25532166 - 25532376
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  25532166 caacctaaattatccagttgttgagaagtttaaaacttagtaagtttgcataatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatctga 25532265  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||     
T  25532266 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtggccttaatatttctcaagctcagaatcaaagcatcagtcagaacttaagtcagagttca 25532365  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  25532366 gcttcttctca 25532376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3089380 - 3089172
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  3089380 caacctaaataatcaggttattgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaata--gtgttagagtaacttattatttcataatctga 3089283  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3089282 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaggctcatagtcaaaacttcagtcagaacttaagtcagagttcg 3089183  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  3089182 gcttcttctca 3089172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 17938420 - 17938630
Alignment:
Q  20 aacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgat 119  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  17938420 aacctacatcatccgattgttgagaagtttaagacttagtaagtttacattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccgat 17938519  T
Q  120 ttgattg-ttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  17938520 ttgattgttttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaaacttcagttagaacttaagtcagagttcg 17938619  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  17938620 acttcttctca 17938630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 34854853 - 34855062
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  34854853 caacctccatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 34854952  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  34854953 tttgattgttttttgaccatgtttcttaaattgttgtcgtgactttaacacttctcaagcttagagtcaaact-tcagttagaacttaagtcagaattcg 34855051  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  34855052 acttcttctca 34855062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 248825 - 248989
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  248825 caacctacatcatccggttgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 248924  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaga 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  248925 tttgattgtttattgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaacttaacacttctcaagctcaga 248989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 12581128 - 12580964
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12581128 caacctacatcatccggttgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 12581029  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaga 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12581028 tttgattgtttattgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaacttaacacttctcaagctcaga 12580964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1080939 - 1080731
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  1080939 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacattgttagagtaacttattatttcacagtccga 1080840  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  1080839 tttgattgttttttgaccatgtttctt-aattgttgtcatgactttaacacttctcaagctcagagtcaaa-tttcagttaaaacttaagtcagagttcg 1080742  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  1080741 acttcttctca 1080731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 229
Target Start/End: Original strand, 4423308 - 4423491
Alignment:
Q  46 gtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgatttgattgttttttgaccatgtttctt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423308 gtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatagaatgttagagtaacttattatttcacaacctgatttgattgttttttgaccatgtttctt 4423407  T
Q  146 gaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggcttcatctca 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  4423408 gaattgttgtcgtgactttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcaaagttcgacttcttctca 4423491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11517647 - 11517558
Alignment:
Q  140 tttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggcttcatctca 229  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||    
T  11517647 tttcttgaatagttttcgtgaccttaacacttttcaagctcagagtcaaagcttcagtcataacttaagtcagggttcgacttcttctca 11517558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33325678 - 33325611
Alignment:
Q  152 ttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcgg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||    
T  33325678 ttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcatgagtcagaacttaagtcagagttcgg 33325611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 219
Target Start/End: Original strand, 35135274 - 35135341
Alignment:
Q  152 ttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcgg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| | |||||||||    
T  35135274 ttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcatgagtcagaacttaaatcagagttcgg 35135341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 84
Target Start/End: Original strand, 11269627 - 11269691
Alignment:
Q  20 aacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaata 84  Q
    ||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  11269627 aacctacatcacccgattgtttaaaagtttaagacttggtaagtttgcattatgatttcagaata 11269691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 11517723 - 11517659
Alignment:
Q  20 aacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaata 84  Q
    ||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11517723 aacctacatcacccgattgtttagaagtttaagacttgataagtttgcattatgatttcacaata 11517659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 177
Target Start/End: Original strand, 11269703 - 11269740
Alignment:
Q  140 tttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaag 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11269703 tttcttgaatagttgtcgtgaccttaacacttttcaag 11269740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31296872 - 31296662
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31296872 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatctga 31296773  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31296772 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 31296673  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  31296672 gcttcttctca 31296662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 19394368 - 19394578
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19394368 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatctga 19394467  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19394468 tttgattattttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 19394567  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  19394568 gcttcttctca 19394578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12589618 - 12589409
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12589618 caacctgcattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatttga 12589519  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||    
T  12589518 tttgattgt-ttttgactatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcatcagtctgaacttaagtcagagttcg 12589420  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  12589419 gcttcttctca 12589409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 289487 - 289697
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||    
T  289487 caacctacatcatccgattgttgagaagtttaaaacttggtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtgttagaggaacttattatttcacaatctga 289586  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  289587 tttgattgttgtttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagtcagaacttaagtcagagttcg 289686  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    | ||| |||||    
T  289687 gtttcttctca 289697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34375741 - 34375531
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  34375741 caacctacatcatccggttgttaagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 34375642  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  34375641 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcg 34375542  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  34375541 acttcttctca 34375531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35541200 - 35540990
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  35541200 caacctacatcatccggttgttaagaagtttaagacttggtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 35541101  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  35541100 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagttaaaacttaagtcagagttcg 35541001  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  35541000 gcttcttctca 35540990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3211537 - 3211327
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3211537 caacctacattatccagttattgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgattttacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 3211438  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| | ||||||    
T  3211437 tatgattgttttttgaccatatttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagtcagaacttaagtcatagttcg 3211338  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  3211337 gcttcttctca 3211327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25697856 - 25697647
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  25697856 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacaatgttagagtaaattattatttcacaatctaa 25697757  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25697756 tttgatt-tttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagcttagagtcaaagcatcagtcagaacttaagtcagagttcg 25697658  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  25697657 gcttcttctca 25697647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 34716539 - 34716747
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  34716539 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatctaa 34716638  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34716639 tttgat--tttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagcttagagtcaaagcatcagtcagaacttaagtcagagttcg 34716736  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  34716737 acttcttctca 34716747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Original strand, 7284556 - 7284726
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7284556 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacaatgttagagtaacttattatttcacaatttga 7284655  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7284656 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgactttaacacttctcaagctcagagtcaaa 7284726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 30141454 - 30141665
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  30141454 caacctacattattcggttgttgagaagtttaaaacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatctga 30141553  T
Q  119 tttgattg-ttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttc 217  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  30141554 tttaattgttttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagcttagagtcaaagcatcaatcagaacttaagtcagagttc 30141653  T
Q  218 ggcttcatctca 229  Q
    |||||| |||||    
T  30141654 ggcttcttctca 30141665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3151944 - 3151734
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  3151944 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagcaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 3151845  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||||||||| ||||||||    
T  3151844 tttgattgtttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtggccttaacacttctcaagctcagagtcaaagctttagttagaacttaagtcagagttcg 3151745  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  3151744 acttcttctca 3151734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3398672 - 3398463
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  3398672 caacctacatcatccgattgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatacagtgttagaataacttattatttcacaatccga 3398573  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   ||||||||| ||||||||    
T  3398572 tttgatt-ttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagttggaacttaagtcagagttcg 3398474  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  3398473 acttcttctca 3398463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 27064781 - 27064991
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  27064781 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaatttattatttcacaatccga 27064880  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| ||| ||||||||    
T  27064881 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaacttaatacttctcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttcagtcagagttcg 27064980  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  27064981 acttcttctca 27064991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 41690226 - 41690434
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||||||| | |    
T  41690226 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaaatattatttcacaatctaa 41690325  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  41690326 tttgat--tttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagcttagagtcaaagcatcagtaagaacttaagtcagagttcg 41690423  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  41690424 acttcttctca 41690434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 30688195 - 30688404
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  30688195 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 30688294  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  30688295 tttgattgatttttgaccatgtttcttgaattgttgtcatgactttaacacttctcaagctcatagtcaaact-tcagttaaaacttaagtcagagttcg 30688393  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  30688394 acttcttctca 30688404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 223
Target Start/End: Original strand, 4881166 - 4881368
Alignment:
Q  21 acctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgatt 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4881166 acctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattttgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctgatt 4881265  T
Q  121 tgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggc 220  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||   |||| | ||||||||| |||||||| |    
T  4881266 taattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcatgaccttaacaactctcaagctcagagtcaaagctccagttagaacttaagtcagagttcgac 4881365  T
Q  221 ttc 223  Q
    |||    
T  4881366 ttc 4881368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26322413 - 26322205
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  26322413 caacctacatcatccggttgt-gagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacaatgttagagtaacttattatttcacaatccga 26322315  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  26322314 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgacttcaacacttctcaagctcagagtcaaaat-tcagttagaacttaagtcagagttcg 26322216  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  26322215 acttcttctca 26322205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1853256 - 1853048
Alignment:
Q  21 acctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgatt 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| | | |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  1853256 acctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattattttttcaccatacaatgttagagtaacttattatttcacaatccgatt 1853157  T
Q  121 tgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| | ||||||||| |||||||| |    
T  1853156 tgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcatagtcaaaacttcagttaaaacttaagtcagagttcgac 1853057  T
Q  221 ttcatctca 229  Q
    ||| |||||    
T  1853056 ttcttctca 1853048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33612479 - 33612309
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  33612479 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaaaacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 33612380  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  33612379 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgacttttacacttctcaagctaagagtcaaa 33612309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 217
Target Start/End: Original strand, 3027338 - 3027537
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3027338 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagactcagtaagtttgcattatgatttcacaatacgatgttagagtaacttattatttcacaatctga 3027437  T
Q  119 tttgattg-ttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttc 217  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||||||||    
T  3027438 tttgattgttttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgacattaacacttctccagctcaaagtcaaagcttcagttagaacttaagttagagttc 3027537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20997278 - 20997108
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||||||||   |    
T  20997278 caacttacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacctatt-tttcacaatccaa 20997180  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaag 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20997179 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaag 20997108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 37463279 - 37463443
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37463279 caacctacatcatccggttgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 37463378  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaga 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  37463379 tttgattgtttattgaccatgtttcttgaattgttctcatgaacttaacacttctcaagctcaga 37463443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 229
Target Start/End: Original strand, 20348847 - 20349029
Alignment:
Q  42 agaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgatttgattgttttttgaccatgtt 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||    
T  20348847 agaagtttaagacttagtaagtttgcattatcatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccgatt-----gttttttgaccatgtt 20348941  T
Q  142 tcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggcttcatctca 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  20348942 tcttgaattgttgtcgtgatcttaacacttttcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcgacttcttctca 20349029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 19447023 - 19447220
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||| ||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  19447023 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattac-------------agtgttagaataacttattatttcacaatccga 19447109  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19447110 tttgattattttttgaccatgtttctagaattgttgtcgtgaccttaacacttctccagctcagagtcaaagattcagttagaacttaagtcagagttcg 19447209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 2194100 - 2194254
Alignment:
Q  74 atttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgatttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttct 173  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  2194100 atttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccgatttgattgtttttttaccatgtttcttaaattgttgtcatgactttaacacttct 2194199  T
Q  174 caagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggcttcatctca 229  Q
    |||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  2194200 caagctcagagtcaaact-tcagttaaaacttaagtcaaagttcgacttcttctca 2194254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 117 - 229
Target Start/End: Original strand, 21029083 - 21029195
Alignment:
Q  117 gatttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagtt 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||    
T  21029083 gatttgattgtttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagtt 21029182  T
Q  217 cggcttcatctca 229  Q
     | |||| |||||    
T  21029183 tgacttcttctca 21029195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Original strand, 2193666 - 2193725
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttc 78  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2193666 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttc 2193725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 37)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 15519780 - 15519990
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15519780 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatctga 15519879  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15519880 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 15519979  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  15519980 gcttcttctca 15519990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 741635 - 741425
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  741635 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatctga 741536  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  741535 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagaggcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 741436  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  741435 gcttcttctca 741425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 40621078 - 40621288
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  40621078 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatctaa 40621177  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||    
T  40621178 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcataagtcagaacttaagtcagagttcg 40621277  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  40621278 gcttcttctca 40621288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 575361 - 575151
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  575361 caacctacattatccagttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatttga 575262  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||    
T  575261 tttgattgttttttgactatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacactactcaagctcagagtcaaagcatcagtctgaacttaagtcagagttcg 575162  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  575161 gcttcttctca 575151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35496871 - 35496661
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  35496871 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacaatgttagagtaaattattatttcacaatctga 35496772  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  35496771 tttgattggttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcatcagtcagaacttaagtcagagttcg 35496672  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  35496671 gcttcttctca 35496661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35713468 - 35713259
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35713468 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatttga 35713369  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  35713368 tttgattgt-ttttaactatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtgaaagcatcagtctgaacttaagttagagttcg 35713270  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  35713269 gcttcttctca 35713259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 223
Target Start/End: Original strand, 16904207 - 16904411
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  16904207 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatctga 16904306  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16904307 tttgattgttttttgaccatatttcttgaattgttctcgtgacgttaacacttctaaagctcagagtcaaaacatcagtcagaacttaagttagagttcg 16904406  T
Q  219 gcttc 223  Q
    |||||    
T  16904407 gcttc 16904411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 17738974 - 17739183
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  17738974 caacctacattatccggtagttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaca-tacagtgttagagtaaattattatttcacaatctga 17739072  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||| ||||||||    
T  17739073 tttgattgtttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcatcagtatgaacttaagtcagagttcg 17739172  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  17739173 gcttcttctca 17739183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 52799977 - 52800185
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  52799977 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatctaa 52800076  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  52800077 tttgat--tttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagcttagagtcaaagcatcagtcagaacttaagtcagagttcg 52800174  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  52800175 acttcttctca 52800185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15656168 - 15655958
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15656168 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 15656069  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15656068 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgactttaacacttctcaagttcagagtcaaaacttcagttagaacttaagtcagagttcg 15655969  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  15655968 acttcttctca 15655958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 28972025 - 28972235
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  28972025 caacctacatcatccggttgttaagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttatagtaacttattatttcacaatccga 28972124  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  28972125 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattattgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcg 28972224  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  28972225 acttcttctca 28972235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Original strand, 53341342 - 53341540
Alignment:
Q  20 aacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgat 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  53341342 aacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgattttacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccgat 53341441  T
Q  120 ttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  53341442 ttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaaactcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcg 53341540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 56000056 - 55999846
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  56000056 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacagtacagtgttagagtaacttataatttcacaatccga 55999957  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  55999956 tttgattgtttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcg 55999857  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  55999856 acttcttctca 55999846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5275102 - 5274893
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5275102 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 5275003  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  5275002 tttgattgttttttgaccatgtttcttaaattgttgtcatgactttaacacttctcaagctcagagtcaaact-tcagttaaaacttaagtcagagttcg 5274904  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  5274903 acttcttctca 5274893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 19589779 - 19589989
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  19589779 caacctacatcattcggttgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttgacaatctga 19589878  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||    
T  19589879 tttgattgtttattgatcatgtttcttgaattgttgtcgtgaacttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttccgtcataacttaagtcatagttcg 19589978  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  19589979 gcttcttctca 19589989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39715854 - 39715644
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||| | |    
T  39715854 caacctacattatccgattgttgagaagtttaagacttaataagtttgcattatgatttcacaatacagtgttaaagtaaattattatttcacaatctaa 39715755  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  39715754 tttgattttttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaaacttagagtcaaagcatcagtcagaacttaagtcagagttcg 39715655  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  39715654 gcttcttctca 39715644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 47721421 - 47721211
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47721421 caacctaaatcatctggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 47721322  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||     
T  47721321 tttgattgttgtttgaccatgtttattgaattgttgttgtgaccttaacacttctcaaacttagagtcaaagcttcagtcagaacttaagtcagagttca 47721222  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  47721221 gcttcttctca 47721211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Original strand, 13626984 - 13627183
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  13626984 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacattgttagagtaacttattatttcacaatccga 13627083  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | | ||||||||| ||||||||    
T  13627084 tttgattgtttttttaccatgtttcttgaattgttgtcatgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcatttagaacttaagtcagagttcg 13627183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7645468 - 7645258
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  7645468 caacctacatcatccggttgttgagaactttaatacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagaataacttattatttcacaatctaa 7645369  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||||| ||||||||    
T  7645368 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcatagtcaaagctttagttagaacttaagtcagagttcg 7645269  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  7645268 acttcttctca 7645258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 23477836 - 23478045
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  23477836 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 23477935  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  23477936 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgtcgtcatgactttaacacttctcaagctcaaagtcaaact-tcagttaaaacttaagtcagagttcg 23478034  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  23478035 acttcttctca 23478045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14830867 - 14830658
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  14830867 caacctacatcatctggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacaatgttagagtaacttattatttcacaatccga 14830768  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  14830767 tttgattgtttttggaccatgtttcttgaattgttgtcgtgactttaacacttctcaagctcagagtcaaact-tcagttagaacgtaagtcagagttcg 14830669  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  14830668 acttcttctca 14830658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19832743 - 19832533
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||   |    
T  19832743 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttacagtaacttattattttacaatccaa 19832644  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19832643 tttgattgtttttttaccaggtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaatgcttcagttagaacttaagtcagagttcg 19832544  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  19832543 acttcttctca 19832533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28136412 - 28136202
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  28136412 caacctacatcatccggatgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacaatgttagagtaacttattatttcacaatccga 28136313  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| |||| ||||||||    
T  28136312 tttgattgttttttgaacatgtttcttgaattgttgtcgtgactttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagttagaactaaagtcagagttcg 28136213  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  28136212 acttcttctca 28136202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33504344 - 33504134
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||| | |||||||||||||||||||||||  ||    
T  33504344 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttggtaagtttgcattatgattttacaatacagtgtgagagtaacttattatttcacaatccga 33504245  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||||||||| |||| |||    
T  33504244 tttgattgttttttgaccatatttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagctttagttagaacttaagtcagagctcg 33504145  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  33504144 acttcttctca 33504134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34057921 - 34057712
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  34057921 caacctacatcatctggttgttgagaagtttaagaattagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 34057822  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  34057821 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcatgagtttaacacttctcaagctcagagtcaaact-tcagttaaaacttaagtcagagttcg 34057723  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  34057722 acttcttctca 34057712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 223
Target Start/End: Original strand, 1943431 - 1943635
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | | ||||||||||||||||||||||| | | |    
T  1943431 caacctacatcaaccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttaacaatacaatgttagagtaacttattatttcacagtctaa 1943530  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||    
T  1943531 tttgattgttttttgaccatttttcttgaattgttgtcgtaaccttaacacttctgaagctcagagtcaaagcttcagtcagaacttaagtcggagttcg 1943630  T
Q  219 gcttc 223  Q
    |||||    
T  1943631 gcttc 1943635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 10260664 - 10260500
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10260664 caacctacatcatccggttgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 10260565  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaga 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10260564 tttgattgtttattgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaacttaacacttctcaagctcaga 10260500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 21563791 - 21563955
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21563791 caacctacatcatccggttgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 21563890  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaga 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21563891 tttgattgtttattgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaacttaacacttctcaagctcaga 21563955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 24078734 - 24078570
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24078734 caacctacatcatccggttgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 24078635  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaga 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24078634 tttgattgtttattgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaacttaacacttctcaagctcaga 24078570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 26925606 - 26925442
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26925606 caacctacatcatccggttgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 26925507  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaga 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26925506 tttgattgtttattgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaacttaacacttctcaagctcaga 26925442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 43331312 - 43331476
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43331312 caacctacatcatccggttgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 43331411  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaga 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43331412 tttgattgtttattgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaacttaacacttctcaagctcaga 43331476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 51451378 - 51451542
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51451378 caacctacatcatccggttgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 51451477  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaga 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51451478 tttgattgtttattgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaacttaacacttctcaagctcaga 51451542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39746202 - 39745992
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||   |    
T  39746202 caacctacatcatctggttgttgaaaagtttaagacttagtaattttgtattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattaattcacaatccaa 39746103  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | | ||||||||| |||| |||    
T  39746102 tttgatagttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcaattagaacttaagtcagagctcg 39746003  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  39746002 acttcttctca 39745992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 36856062 - 36856228
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||||||||||||||  ||    
T  36856062 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttggagtatcttattatttcacaatccga 36856161  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagt 185  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36856162 tttgattatcttttgaccatgttttttgcattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagt 36856228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 88 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 54332929 - 54332788
Alignment:
Q  88 tattagagtaacttattatttcacaatttgatttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtca 187  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  54332929 tattagagtaacttattattttacaatccgatttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgactttaacacttctcaagctcggagtca 54332830  T
Q  188 aagtatcagtcataacttaagttagagttcggcttcatctca 229  Q
    ||   ||||| | ||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  54332829 aaacttcagttagaacttaagtcatagttcgacttcttctca 54332788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 209
Target Start/End: Original strand, 16892158 - 16892227
Alignment:
Q  140 tttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  16892158 tttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttttcaagctcagagtcaaagtttcaatcataacgtaagt 16892227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 84
Target Start/End: Original strand, 16892082 - 16892146
Alignment:
Q  20 aacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaata 84  Q
    ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16892082 aacctacatcacccgattgtttagaagtttaagacttggtaagtttgcattatgatttcacaata 16892146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1994267 - 1994057
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1994267 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatctga 1994168  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1994167 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 1994068  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  1994067 gcttcttctca 1994057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6344055 - 6343845
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6344055 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatctga 6343956  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6343955 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 6343856  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  6343855 gcttcttctca 6343845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14324539 - 14324329
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14324539 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatctga 14324440  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14324439 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 14324340  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  14324339 gcttcttctca 14324329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 28501230 - 28501440
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28501230 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatctga 28501329  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28501330 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgttgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 28501429  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  28501430 gcttcttctca 28501440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9918034 - 9917825
Alignment:
Q  20 aacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9918034 aacctacattatccggttgttgataagtttaaatcttagtaagtttgcattatgatttcacaatagagtgttagagtaaattattatttcacaatttgat 9917935  T
Q  120 ttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcgg 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  9917934 ttgattgttttttgactatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtctgaacttaagtcagagttcgg 9917835  T
Q  220 cttcatctca 229  Q
    |||| |||||    
T  9917834 cttcttctca 9917825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10049326 - 10049116
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  10049326 caacctatattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgtattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatctga 10049227  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10049226 tttgattgtttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagcttagagtcaaagcatcagtcagaacttaagtcagagttcg 10049127  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  10049126 gcttcttctca 10049116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18094055 - 18093845
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  18094055 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatctga 18093956  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||    
T  18093955 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttatcaagctcagagtcaaaacatcagtcagaacttaagtcagggttcg 18093856  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  18093855 acttcttctca 18093845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 16882881 - 16883091
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16882881 caacctacatcatccggttgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgccttatgatttcacaatatagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 16882980  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16882981 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtggccttaaaacttctcaagctcagagtcaaagcttcagtcagaacttaagtcagagttcg 16883080  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    | ||| |||||    
T  16883081 gtttcttctca 16883091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 17040571 - 17040781
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17040571 caacctacatcatccggttgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgccttatgatttcacaatatagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 17040670  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17040671 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtggccttaaaacttctcaagctcagagtcaaagcttcagtcagaacttaagtcagagttcg 17040770  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    | ||| |||||    
T  17040771 gtttcttctca 17040781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 28608172 - 28608382
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  28608172 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttgacaatctga 28608271  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||     
T  28608272 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttttcgtgaccttaacacttctcaaacttagagtcaaagcatcagtcagaacttaagtcagagttca 28608371  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  28608372 gcttcttctca 28608382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19168959 - 19168749
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  19168959 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaataaagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 19168860  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||||||||| ||||||||    
T  19168859 tttgattgatttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttaagttagaacttaagtcagagttcg 19168760  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  19168759 acttcttctca 19168749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Original strand, 14752136 - 14752328
Alignment:
Q  37 tgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgatttgattgttttttgacc 136  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  14752136 tgttgagaagtttaagacttggtaagtttgcattatgatttcaaaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctaatttgattgttgtttgacc 14752235  T
Q  137 atgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggcttcatctca 229  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14752236 atgtttcttgaattattgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagtcagaacttaagttagagttcggcttcttctca 14752328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 26820568 - 26820778
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  26820568 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 26820667  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||| | ||||||    
T  26820668 tttgattgttttttgaccatatttcttgaattgttgtcgtgactttaacacttctcaagctcagagtcaaaacttcagttagaacttaagtcatagttcg 26820767  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  26820768 acttcttctca 26820778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 26826476 - 26826686
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  26826476 caacctacatcatccggttgttaagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttatagtaacttattatttcacaatccga 26826575  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  26826576 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattattgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcg 26826675  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  26826676 acttcttctca 26826686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30568197 - 30567987
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  30568197 caacctacatcatccggatgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacaatgttagagtaacttattatttcacaatccga 30568098  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  30568097 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttctcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcg 30567998  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  30567997 acttcttctca 30567987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 4810497 - 4810707
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  4810497 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttattaagtttgcattatgatttcacaatacaatgttagagtaacttattatttcacaatctta 4810596  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| ||||||||| ||||||||    
T  4810597 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattattatcgtgaccttaacacttctcaagatcagagtcaaagctacagtcagaacttaagtcagagttcg 4810696  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  4810697 gcttcttctca 4810707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 21096649 - 21096858
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  21096649 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 21096748  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  21096749 tttgattgttttttgaccatgtttcttaaattgttgtcatgactttaacacttctcaagctcagagtcaaact-tcagttaaaacttaagtcagagttcg 21096847  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  21096848 acttcttctca 21096858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9544956 - 9544756
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  9544956 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatatagtgttagagtaaattattatttcacaatctaa 9544857  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcg---tgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagt 215  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9544856 tttgatt-tttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgcgacgaccttaacacttctcaagcttagagtcaaagtatcagtcagaacttaagtcagagt 9544758  T
Q  216 tc 217  Q
    ||    
T  9544757 tc 9544756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4291978 - 4291769
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||| ||||| | |    
T  4291978 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacattgttagagtaaattattattttacaatctaa 4291879  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4291878 tttgatt-tctttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagcttagagtcaaagcatcagtcagaacttaagtcagagttcg 4291780  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  4291779 acttcttctca 4291769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33665106 - 33664896
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  33665106 caacctacatcatccgattgttgataagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaaaacagtgctagagtaacttattatttcacaatccga 33665007  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  33665006 ttttattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacatttctcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcg 33664907  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  33664906 acttcttctca 33664896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36634418 - 36634209
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||| ||||||| || ||    
T  36634418 caacctacatcatcctgttgttgataagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacctatt-tttcacatttcga 36634320  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  36634319 tttaattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcg 36634220  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  36634219 acttcttctca 36634209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 3709859 - 3710023
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3709859 caacctacatcatccggttgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 3709958  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaga 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3709959 tttgattgtttattgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaacttaacacttctcaagctcaga 3710023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 11867557 - 11867393
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11867557 caacctacatcatccggttgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 11867458  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaga 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11867457 tttgattgtttattgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaacttaacacttctcaagctcaga 11867393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 35358950 - 35358786
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35358950 caacctacatcatccggttgttgaaaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 35358851  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaga 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35358850 tttgattgtttattgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaacttaacacttctcaagctcaga 35358786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 42884341 - 42884550
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  42884341 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaaaacttagtaagtttgcattatgatttcacgatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 42884440  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  42884441 tttgattgtttttt-accatgtttcttgaattgttgttgtgaccgtaacacttcttaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcg 42884539  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  42884540 acttcttctca 42884550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 45206298 - 45206088
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||   |    
T  45206298 caacctacatcatccagttgttgataagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccaa 45206199  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  | ||||||||| ||||||||    
T  45206198 tttgattgttttttgaccatgtttatttaactgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaaacttcagatagaacttaagtcagagttcg 45206099  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  45206098 acttcttctca 45206088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Original strand, 33906255 - 33906419
Alignment:
Q  54 cttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgatttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgtt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906255 cttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccgatttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgtt 33906354  T
Q  154 gtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  33906355 gtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcg 33906419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 229
Target Start/End: Original strand, 7361057 - 7361146
Alignment:
Q  140 tttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggcttcatctca 229  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||    
T  7361057 tttcttgaatagttttcgtgaccttaacacttttcaagctcagagtcaaagcttcagtcataacttaagtcagggttcgacttcttctca 7361146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 84
Target Start/End: Original strand, 7360981 - 7361045
Alignment:
Q  20 aacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaata 84  Q
    ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  7360981 aacctacatcacccgattgtttagaagtttaagacttggtaagtttgcattatgatttcacaata 7361045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 190
Target Start/End: Original strand, 11446729 - 11446766
Alignment:
Q  153 tgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaag 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11446729 tgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaag 11446766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 28)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 18110639 - 18110849
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18110639 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatctga 18110738  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18110739 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 18110838  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  18110839 gcttcttctca 18110849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43255882 - 43255672
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43255882 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatctga 43255783  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43255782 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 43255683  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  43255682 gcttcttctca 43255672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 50396296 - 50396086
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50396296 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatctga 50396197  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50396196 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 50396097  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  50396096 gcttcttctca 50396086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 51967060 - 51966856
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  51967060 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatctga 51966961  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  51966960 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcatcagtcagaacttaagtcagagttcg 51966861  T
Q  219 gcttc 223  Q
     ||||    
T  51966860 acttc 51966856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13663744 - 13663534
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13663744 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 13663645  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||    
T  13663644 tttgattattttttgaccatgtttcttgaattgttatcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagctacagtcagaacttaagttagagttcg 13663545  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  13663544 gcttcttctca 13663534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29842014 - 29841805
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29842014 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatttga 29841915  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||    
T  29841914 tttgattgt-ttttgactatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcatcagtctgaacttaagtcagagttcg 29841816  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  29841815 gcttcttctca 29841805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 42681313 - 42681522
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42681313 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatttga 42681412  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||    
T  42681413 tttgattg-tttttgactatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcatcagtctgaacttaagtcagagttcg 42681511  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  42681512 gcttcttctca 42681522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 50559972 - 50560183
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  50559972 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatctga 50560071  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctc-agagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttc 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  50560072 tttgattggtttttgaccatgtttcttgaattgttatcgtgaccttaacacttctcaagctcaagagtcaaagcatcagtcagaacttaagtcagagttc 50560171  T
Q  218 ggcttcatctca 229  Q
    |||||| |||||    
T  50560172 ggcttcttctca 50560183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10695518 - 10695309
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||    
T  10695518 caacctacattatccggttgttgggaagtttaagacttagtaagtttgcgttatgatttcacaatacagtgttagag-aacttattatttcacaatctga 10695420  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10695419 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcatagtcaaagcatcagtcaaaacttaagtcagagttcg 10695320  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  10695319 gcttcttctca 10695309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28567046 - 28566836
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28567046 caacctacatcatccggttggtgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 28566947  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||| ||||||||    
T  28566946 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttatcgtgacattaacacttctcaagctcagagtcaaagctacagtcagaacttaagtcagagttcg 28566847  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  28566846 gcttcttctca 28566836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 4891051 - 4891260
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  4891051 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatctaa 4891150  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4891151 tttgatt-tttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagcttagagtcaaagcatcagtcagaacttaagtcagagttcg 4891249  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  4891250 acttcttctca 4891260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 18813140 - 18813350
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18813140 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 18813239  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  18813240 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgactttaacacttctcaagctcagagtcaaaacttcagttagaacttaagtcagagttcg 18813339  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  18813340 acttcttctca 18813350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29187436 - 29187227
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  29187436 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatctaa 29187337  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  29187336 tttgatt-tttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagcttagagtcaaagcatcagtcagaacttaagtcagagttcg 29187238  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  29187237 acttcttctca 29187227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 31618611 - 31618820
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  31618611 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 31618710  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  31618711 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgactttaacacttctcaagctcagagtcaaact-tcagttagaacttaagtcagagttcg 31618809  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  31618810 acttcttctca 31618820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 34686509 - 34686718
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  34686509 caacctacatcatctggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 34686608  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  34686609 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgactttaacacttctcaagctcagagtcaaact-tcagttagaacttaagtcagagttcg 34686707  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  34686708 acttcttctca 34686718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38846552 - 38846342
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  38846552 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 38846453  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||| |    
T  38846452 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgttgtgaccttaacacttcttaagctcagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagtttg 38846353  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  38846352 acttcttctca 38846342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 33360653 - 33360863
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  33360653 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatctaa 33360752  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtc-aaagtatcagtcataacttaagttagagttc 217  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  33360753 tttgatt-tttttttaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagcttagagtcaaaagcatcagtcagaacttaagtcagagttc 33360851  T
Q  218 ggcttcatctca 229  Q
    | |||| |||||    
T  33360852 gacttcttctca 33360863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 52522897 - 52522699
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52522897 caacctacatcatctggttgttgagaaatttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 52522798  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttc 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||| |||||||    
T  52522797 tttgattgttttttgaccatatttcttgaattgttgtcgtgactttaacacttctcaagctcagagtcaaaacttcagttagaacttaagtcagagttc 52522699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Original strand, 34691047 - 34691217
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  34691047 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaaaacttagtaagtttgcattatgatttcacaatatagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 34691146  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34691147 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgtagtcgtgactttaacacttctcaagctaagagtcaaa 34691217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 41831383 - 41831186
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  41831383 caacctacatcatccagtgtttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 41831284  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| |||||||    
T  41831283 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgactttaacacttctcaagctcagagtcaaact-tcagttagaacttaagtcagagttc 41831186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41964258 - 41964049
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  41964258 caacctacatcatctggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 41964159  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  41964158 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcatgattttaacacttctcaaactcagagtcaaact-tcagttaaaacttaagtcagagttcg 41964060  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  41964059 acttcttctca 41964049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 48339315 - 48339525
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  48339315 caacctacaacatccggttgttgataagtttaagacttagtaaatttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatcaga 48339414  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  48339415 tttgattgttttttgaccatgtttattaaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagcttagagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagagttcg 48339514  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  48339515 acttcttctca 48339525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 52308757 - 52308966
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  52308757 caacctacattatccgattgttgagaaatttaagacttagtaagtttgaattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattattttccaatctga 52308856  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||| |    
T  52308857 tttgattgttttttgaccatgtttcttgta-tgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcatcagttagaacttaagtcagagtttg 52308955  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  52308956 gcttcttctca 52308966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 15314175 - 15314384
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15314175 caacctacatcattcggttgttaagaagtttaagacttaataagtttgcattatgatttcacaatacaatgttagagtaacttattatttcacaatctga 15314274  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15314275 tttgattttttttttaccatg-ttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagttcaaggtcaaagcatcagtcaaaacttaagtcagagttcg 15314373  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  15314374 gcttcttctca 15314384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Original strand, 18095734 - 18095870
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18095734 caacctacatcatctggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgattttacaatacag--ttagagtaacttattatttcacaatctga 18095831  T
Q  119 tttgattg-ttttttgaccatgtttcttgaattgttgtc 156  Q
    || ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18095832 ttcgattgttttttttaccatgtttcttgaatagttgtc 18095870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 229
Target Start/End: Original strand, 21736710 - 21736805
Alignment:
Q  134 accatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggcttcatctca 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  21736710 accatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctaaagctcacagtcaaagcttcagtcagaacttaagttagagttatgcttcttctca 21736805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 113
Target Start/End: Original strand, 49225199 - 49225293
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaa 113  Q
    ||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  49225199 caacctaaataatcagattgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacattgttagagtaacttattatttcacaa 49225293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 207
Target Start/End: Original strand, 18097673 - 18097726
Alignment:
Q  154 gtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18097673 gtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtttcagtcagaacttaa 18097726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 153509 - 153299
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  153509 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagaattagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatctga 153410  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||    
T  153409 tttgattattttttgaccatgtttcttgaattgttatcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagctacagtcagaacttaagttagagttcg 153310  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  153309 gcttcttctca 153299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 65969 - 65765
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | | ||||||||||||||||||||||| | | |    
T  65969 caacctacatcaaccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttaacaatacaatgttagagtaacttattatttcacagtctaa 65870  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||    
T  65869 tttgattgttttttgaccatttttcttgaattgttgtcgtaaccttaacacttctgaagctcagagtcaaagcttcagtcagaacttaagtcggagttcg 65770  T
Q  219 gcttc 223  Q
    |||||    
T  65769 gcttc 65765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 48981 - 49191
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  48981 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaaatttgcattatgatttcaaaatacagtgttagagtaacttataatttcacaatcaga 49080  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  49081 tttgattgttatttaaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagcttcagtcaaaacttaagtcagagttcg 49180  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  49181 gcttcttctca 49191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 8842 - 9051
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  8842 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaatccga 8941  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  8942 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgactttaacacttctcaagctcagagtcaaact-tcagttagaacttaagtcagagttcg 9040  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  9041 acttcttctca 9051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13813 - 13601
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||| ||||||||||||||| |||    
T  13813 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaaatttgcattatgatttcacaatacagtgtttgagtaaattattatttcacaatctga 13714  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaa--gtatcagtcataacttaagttagagtt 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||| ||||||    
T  13713 tttgattgttttttgaacatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaaacatatcagtcggaacttaagtcagagtt 13614  T
Q  217 cggcttcatctca 229  Q
    ||||||| |||||    
T  13613 cggcttcttctca 13601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 12721 - 12929
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  12721 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatctaa 12820  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12821 tttgat--tttttttaccatgtttattgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagcttagagtcaaagcatcagtcagaacttaagtcagagttcg 12918  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
    ||||| |||||    
T  12919 gcttcttctca 12929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19715 - 19507
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  19715 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatctaa 19616  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19615 tttgattttttttt--ccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagcttagagtcaaagcatcagtcagaacttaagtcagagttcg 19518  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  19517 acttcttctca 19507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14188 - 13984
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  ||||||||  |||||||||||||| |||    
T  14188 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacaatgatagagtaaaatattatttcacaatctga 14089  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14088 tttgattgttttttgatcatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacaattctcaagctcatagtcaaagcatcagtcaaaacttaagtcagagttcg 13989  T
Q  219 gcttc 223  Q
     ||||    
T  13988 acttc 13984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 36 - 229
Target Start/End: Original strand, 231552 - 231745
Alignment:
Q  36 ttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgatttgattgttttttgac 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  231552 ttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaaattattatttcacaatctgatttgattgttttttgac 231651  T
Q  136 catgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggcttcatctca 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  231652 catttttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttttcaagcttagagtcaaaacatcagtcagaacttaagtcagagttcggcttcttctca 231745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27701 - 27492
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27701 caacctacatcatctggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacaatgttagagtaacttattatttcacaatccga 27602  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  27601 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgactttaacacttctcaagctcagagtcaaact-tcagttagaacgtaagtcagagttcg 27503  T
Q  219 gcttcatctca 229  Q
     |||| |||||    
T  27502 acttcttctca 27492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 229
Target Start/End: Original strand, 118966 - 119165
Alignment:
Q  30 atccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttgatttgattgttt 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  118966 atccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattattttacaatctgatttgattgttt 119065  T
Q  130 tttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggcttcatctca 229  Q
    || ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  119066 ttcgaccatgtttcttcaattgttgccatgaccttaacacttctcaagctcatagtcaaagcttcagtcagaacttaagtcagagttcgacttcttctca 119165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 94
Target Start/End: Original strand, 118587 - 118664
Alignment:
Q  17 cacaacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattaga 94  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  118587 cacatcctacatgatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacagtgttaga 118664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Original strand, 49896 - 49978
Alignment:
Q  136 catgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| | | ||||| ||||||||    
T  49896 catgtttcttcaattgttgccgtgaccttaacacttctcaagctcatagtcaaagcttcagtcagagcataagtcagagttcg 49978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Original strand, 57429 - 57511
Alignment:
Q  136 catgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcg 218  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| | | ||||| ||||||||    
T  57429 catgtttcttcaattgttgccgtgaccttaacacttctcaagctcatagtcaaagcttcagtcagagcataagtcagagttcg 57511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12044 - 11841
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  12044 caacctaaattatctggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaataaagtattagagtaaattattatttcacaatctga 11945  T
Q  119 tttgattgttttttgac----catgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagag 214  Q
    |||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||           ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  11944 tttgattgttttttgaccatgcatgttccttgaattgttg-----------acacttctcaagcacagagtcaaagcatcagtcagaacttaagtcagag 11856  T
Q  215 ttcggcttcatctca 229  Q
    |||| |||| |||||    
T  11855 ttcgacttcttctca 11841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5595 - 5392
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  5595 caacctaaattatctggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacggtgttagagtaaattattatttcacaatctga 5496  T
Q  119 tttgattgttttttgac----catgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagag 214  Q
    |||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||           ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  5495 tttgattgttttttgaccatgcatgttccttgaattgttg-----------acacttctcaagcacagagtcaaagcatcagtcagaacttaagtcagag 5407  T
Q  215 ttcggcttcatctca 229  Q
    |||| |||| |||||    
T  5406 ttcgacttcttctca 5392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1884 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold1884
Description:

Target: scaffold1884; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Original strand, 743 - 863
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaatttga 118  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  743 caacctacattatccgggtgttaagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcacaatacaatgttaaagtaacttattatttcacaatccga 842  T
Q  119 tttgattgttttttgaccatg 139  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  843 tttgattgttttttgaccatg 863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1884; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 229
Target Start/End: Original strand, 862 - 933
Alignment:
Q  158 tgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagagttcggcttcatctca 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | || |||||| |||||||| |||| |||||    
T  862 tgaccttaacacttctcaagctcagattcaaagcttcagttagaatttaagtcagagttcgacttcttctca 933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 16672 - 16577
Alignment:
Q  19 caacctacattatccggttgttgagaagtttaagacttagtaagtttgcattatgatttcaaaatatagtattagagtaacttattatttcacaat 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16672 caacctacatcatccggttgttgagaagtttaagacttaataagtttgcattatgatttcacaatacagtgttagagtaacttattatttcacaat 16577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2007 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold2007
Description:

Target: scaffold2007; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 204 - 109
Alignment:
Q  119 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcagagtcaaagtatcagtcataacttaagttagag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||| ||||    
T  204 tttgattgttttttgaccatgtttcttgaattgttgtcgtgaccttaacacttctcaagctcaaagtcaaagcttcagttagaacttaagtcagag 109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University