View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15736_low_5 (Length: 449)

Name: NF15736_low_5
Description: NF15736
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15736_low_5
NF15736_low_5
[»] chr2 (49 HSPs)
chr2 (153-423)||(14291493-14291763)
chr2 (153-423)||(9296224-9296493)
chr2 (153-426)||(11098746-11099019)
chr2 (153-419)||(3491755-3492018)
chr2 (153-365)||(25398500-25398711)
chr2 (153-365)||(25403638-25403849)
chr2 (179-365)||(25407653-25407838)
chr2 (153-419)||(40738848-40739098)
chr2 (153-419)||(28259010-28259270)
chr2 (154-419)||(23078304-23078562)
chr2 (161-329)||(39811894-39812060)
chr2 (153-291)||(44312567-44312704)
chr2 (170-419)||(36757595-36757837)
chr2 (164-328)||(32246804-32246966)
chr2 (153-403)||(8040064-8040314)
chr2 (153-327)||(10707172-10707345)
chr2 (170-327)||(42039588-42039744)
chr2 (153-349)||(8390049-8390243)
chr2 (153-419)||(13569332-13569593)
chr2 (170-419)||(34388880-34389115)
chr2 (170-293)||(10445397-10445519)
chr2 (153-419)||(21629948-21630209)
chr2 (153-245)||(19344426-19344518)
chr2 (153-245)||(19349284-19349376)
chr2 (170-293)||(39482953-39483075)
chr2 (18-78)||(9296568-9296628)
chr2 (153-293)||(14698961-14699100)
chr2 (153-246)||(20522224-20522319)
chr2 (153-293)||(34682287-34682427)
chr2 (153-276)||(17865207-17865330)
chr2 (170-236)||(27149303-27149369)
chr2 (170-293)||(33118158-33118280)
chr2 (171-293)||(31056067-31056188)
chr2 (153-246)||(33528619-33528714)
chr2 (153-246)||(2869691-2869786)
chr2 (376-419)||(25409854-25409897)
chr2 (382-429)||(39811847-39811894)
chr2 (18-70)||(14291358-14291410)
chr2 (383-427)||(32246968-32247012)
chr2 (170-233)||(16940221-16940284)
chr2 (170-233)||(17010886-17010949)
chr2 (37-78)||(3491644-3491684)
chr2 (18-78)||(11099094-11099153)
chr2 (153-246)||(2838028-2838123)
chr2 (37-78)||(25398386-25398426)
chr2 (37-78)||(25403524-25403564)
chr2 (18-78)||(32246653-32246713)
chr2 (376-419)||(17865428-17865469)
chr2 (31-59)||(44312798-44312826)
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (153-426)||(4759893-4760167)
chr8 (153-429)||(30655651-30655927)
chr8 (153-426)||(33037627-33037898)
chr8 (153-426)||(10688959-10689235)
chr8 (153-426)||(36979382-36979654)
chr8 (153-429)||(18870377-18870654)
chr8 (153-429)||(18852983-18853260)
chr8 (153-429)||(6311302-6311579)
chr8 (153-426)||(1261776-1262046)
chr8 (170-419)||(31071058-31071304)
chr8 (153-419)||(26287906-26288158)
chr8 (153-419)||(26301163-26301415)
chr8 (153-419)||(26313157-26313409)
chr8 (153-329)||(7289831-7290006)
chr8 (153-329)||(25328184-25328358)
chr8 (170-419)||(19175587-19175829)
chr8 (153-419)||(7412345-7412604)
chr8 (170-419)||(4456050-4456292)
chr8 (170-293)||(19752347-19752469)
chr8 (153-244)||(39784813-39784902)
chr8 (153-327)||(23799496-23799670)
chr8 (153-403)||(26403076-26403323)
chr8 (153-245)||(10684252-10684344)
chr8 (153-245)||(35745396-35745488)
chr8 (170-293)||(6127243-6127365)
chr8 (153-246)||(5702481-5702576)
chr8 (382-429)||(7289784-7289831)
chr8 (382-427)||(25328013-25328058)
chr8 (382-427)||(25328139-25328184)
chr8 (153-232)||(4696609-4696689)
chr8 (188-246)||(6813723-6813782)
chr8 (170-246)||(9054835-9054912)
chr8 (18-78)||(4760243-4760302)
chr8 (153-212)||(9765852-9765912)
chr8 (383-427)||(39784684-39784728)
chr8 (37-78)||(1262117-1262157)
chr8 (37-78)||(26287794-26287834)
chr8 (37-78)||(26313045-26313085)
chr8 (37-78)||(31071394-31071434)
chr8 (18-78)||(10689310-10689369)
chr8 (18-70)||(18853343-18853395)
chr8 (18-78)||(36979248-36979307)
chr8 (190-246)||(3051162-3051219)
chr8 (179-212)||(18813156-18813189)
chr8 (376-419)||(4696441-4696482)
chr8 (376-419)||(9054253-9054294)
[»] chr7 (59 HSPs)
chr7 (153-429)||(20357363-20357639)
chr7 (153-426)||(2057970-2058246)
chr7 (153-426)||(1533263-1533536)
chr7 (153-419)||(21639813-21640076)
chr7 (153-419)||(21646011-21646274)
chr7 (153-419)||(18408768-18409030)
chr7 (153-419)||(18413645-18413906)
chr7 (153-330)||(12406336-12406512)
chr7 (153-329)||(12396916-12397091)
chr7 (153-403)||(21983288-21983536)
chr7 (153-329)||(24024232-24024406)
chr7 (153-329)||(31109489-31109663)
chr7 (171-419)||(2479360-2479600)
chr7 (171-364)||(44848568-44848758)
chr7 (153-403)||(29159807-29160055)
chr7 (153-244)||(19992318-19992408)
chr7 (153-293)||(9189961-9190101)
chr7 (170-293)||(2580412-2580533)
chr7 (153-239)||(4866735-4866820)
chr7 (153-245)||(16880078-16880169)
chr7 (153-245)||(16884934-16885025)
chr7 (153-245)||(24261311-24261403)
chr7 (153-245)||(24266190-24266282)
chr7 (153-419)||(47263682-47263930)
chr7 (170-293)||(2647649-2647771)
chr7 (153-291)||(20284093-20284230)
chr7 (18-78)||(20357714-20357774)
chr7 (153-293)||(46516263-46516403)
chr7 (153-293)||(49091665-49091805)
chr7 (153-419)||(21988912-21989172)
chr7 (170-293)||(55970-56091)
chr7 (153-217)||(21812254-21812318)
chr7 (382-429)||(12397091-12397138)
chr7 (382-429)||(31109442-31109489)
chr7 (384-429)||(4873310-4873355)
chr7 (384-429)||(12406513-12406558)
chr7 (153-246)||(28617223-28617318)
chr7 (172-246)||(33332448-33332523)
chr7 (153-276)||(4796637-4796760)
chr7 (171-233)||(35960839-35960901)
chr7 (18-70)||(2057829-2057881)
chr7 (382-429)||(24024185-24024232)
chr7 (172-293)||(23402967-23403086)
chr7 (153-232)||(9185178-9185258)
chr7 (188-246)||(5817268-5817327)
chr7 (37-78)||(18413534-18413574)
chr7 (37-78)||(21639701-21639741)
chr7 (37-78)||(21645899-21645939)
chr7 (31-78)||(4866612-4866658)
chr7 (31-78)||(12396794-12396840)
chr7 (31-78)||(12406214-12406260)
chr7 (383-427)||(21812098-21812143)
chr7 (31-60)||(24024501-24024530)
chr7 (376-419)||(2580613-2580654)
chr7 (376-419)||(4796501-4796542)
chr7 (153-212)||(7351652-7351712)
chr7 (376-419)||(9185007-9185048)
chr7 (376-419)||(20284312-20284353)
chr7 (376-419)||(23402846-23402887)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (153-426)||(24741945-24742218)
chr4 (153-426)||(29760646-29760919)
chr4 (153-419)||(28468367-28468621)
chr4 (153-419)||(31985466-31985726)
chr4 (153-329)||(9229099-9229274)
chr4 (153-329)||(9224312-9224487)
chr4 (153-329)||(51520462-51520637)
chr4 (153-328)||(45347723-45347897)
chr4 (153-419)||(5396504-5396764)
chr4 (153-328)||(45357203-45357376)
chr4 (153-329)||(3814029-3814202)
chr4 (153-325)||(5732670-5732839)
chr4 (171-419)||(16623126-16623367)
chr4 (161-281)||(56146664-56146783)
chr4 (153-364)||(5147681-5147891)
chr4 (154-312)||(36315163-36315321)
chr4 (154-312)||(36329372-36329530)
chr4 (153-419)||(3777553-3777813)
chr4 (153-244)||(18855732-18855821)
chr4 (153-293)||(3796472-3796612)
chr4 (153-293)||(10047383-10047523)
chr4 (170-364)||(5143281-5143473)
chr4 (153-246)||(39245998-39246093)
chr4 (153-233)||(24333813-24333894)
chr4 (153-290)||(38152395-38152532)
chr4 (382-429)||(51520637-51520684)
chr4 (170-232)||(5269204-5269266)
chr4 (231-419)||(8689329-8689509)
chr4 (170-276)||(16630650-16630755)
chr4 (157-246)||(1983298-1983389)
chr4 (382-429)||(18712624-18712671)
chr4 (170-232)||(25862035-25862097)
chr4 (154-233)||(6743427-6743507)
chr4 (383-427)||(45347677-45347721)
chr4 (157-246)||(5112245-5112336)
chr4 (382-429)||(9224265-9224312)
chr4 (382-429)||(9229052-9229099)
chr4 (303-419)||(16628705-16628815)
chr4 (382-427)||(3814202-3814247)
chr4 (153-293)||(42599526-42599667)
chr4 (383-427)||(5732844-5732888)
chr4 (186-245)||(34495822-34495882)
chr4 (31-78)||(9224563-9224609)
chr4 (31-78)||(9229350-9229396)
chr4 (37-78)||(28468692-28468732)
chr4 (170-246)||(39774303-39774380)
chr4 (383-427)||(18855906-18855950)
chr4 (18-78)||(24741811-24741870)
chr4 (383-427)||(45357157-45357201)
chr4 (31-78)||(3813906-3813952)
chr4 (170-232)||(8689498-8689558)
chr4 (31-78)||(51520339-51520385)
chr4 (376-419)||(5112460-5112501)
chr4 (376-419)||(10047604-10047645)
[»] chr3 (66 HSPs)
chr3 (153-426)||(2671405-2671678)
chr3 (153-426)||(8738882-8739155)
chr3 (153-426)||(9091120-9091393)
chr3 (153-426)||(40372615-40372887)
chr3 (153-429)||(7167249-7167526)
chr3 (153-426)||(8477367-8477642)
chr3 (153-429)||(28503680-28503956)
chr3 (192-429)||(28501513-28501750)
chr3 (153-419)||(26928421-26928683)
chr3 (153-419)||(1305953-1306216)
chr3 (170-419)||(32143343-32143587)
chr3 (170-419)||(27452980-27453224)
chr3 (153-419)||(27974774-27975035)
chr3 (153-329)||(22173100-22173275)
chr3 (170-419)||(16264372-16264613)
chr3 (170-419)||(6794537-6794778)
chr3 (153-419)||(27986278-27986529)
chr3 (153-419)||(8370311-8370569)
chr3 (170-419)||(33386497-33386731)
chr3 (153-325)||(18656440-18656609)
chr3 (153-419)||(36029097-36029357)
chr3 (153-419)||(21711227-21711486)
chr3 (153-419)||(40592604-40592865)
chr3 (18-78)||(2671753-2671813)
chr3 (153-293)||(18552826-18552966)
chr3 (153-245)||(2672919-2673011)
chr3 (153-245)||(2677075-2677167)
chr3 (153-245)||(8512222-8512314)
chr3 (153-245)||(8517102-8517194)
chr3 (197-415)||(35925529-35925738)
chr3 (170-293)||(48438236-48438358)
chr3 (153-245)||(32475490-32475580)
chr3 (153-245)||(32480348-32480438)
chr3 (153-293)||(1736248-1736388)
chr3 (153-403)||(3715838-3716085)
chr3 (153-293)||(30709733-30709873)
chr3 (170-293)||(25795803-25795925)
chr3 (382-429)||(22173053-22173100)
chr3 (153-245)||(24968112-24968204)
chr3 (170-293)||(40844674-40844795)
chr3 (170-246)||(37466313-37466389)
chr3 (153-293)||(3328300-3328439)
chr3 (186-246)||(4386915-4386976)
chr3 (170-246)||(3323679-3323755)
chr3 (171-246)||(26299011-26299087)
chr3 (153-246)||(1417479-1417573)
chr3 (170-232)||(39039995-39040057)
chr3 (18-70)||(8739239-8739291)
chr3 (18-70)||(9091477-9091529)
chr3 (383-427)||(18656614-18656658)
chr3 (31-78)||(22173351-22173397)
chr3 (153-246)||(47923894-47923989)
chr3 (37-78)||(1305842-1305882)
chr3 (18-78)||(7167115-7167173)
chr3 (153-197)||(10207939-10207983)
chr3 (153-212)||(38210569-38210629)
chr3 (48-78)||(1309757-1309787)
chr3 (376-417)||(10274605-10274646)
chr3 (190-246)||(21353604-21353661)
chr3 (170-246)||(24695152-24695229)
chr3 (37-78)||(32143214-32143254)
chr3 (376-419)||(3323513-3323554)
chr3 (376-419)||(3328179-3328220)
chr3 (376-419)||(4386799-4386840)
chr3 (376-419)||(26299211-26299252)
chr3 (376-419)||(47923726-47923767)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (153-426)||(5674589-5674862)
chr6 (153-329)||(11856979-11857154)
chr6 (171-419)||(22709041-22709274)
chr6 (153-329)||(22010602-22010777)
chr6 (153-419)||(5757311-5757571)
chr6 (153-419)||(21356040-21356301)
chr6 (161-329)||(14737482-14737648)
chr6 (153-329)||(14742342-14742516)
chr6 (153-329)||(28184510-28184684)
chr6 (153-328)||(28155477-28155649)
chr6 (160-244)||(6438513-6438595)
chr6 (153-245)||(6005422-6005514)
chr6 (153-245)||(33330433-33330525)
chr6 (170-419)||(5572076-5572316)
chr6 (153-328)||(16838749-16838923)
chr6 (153-293)||(31086426-31086566)
chr6 (153-245)||(33335930-33336022)
chr6 (170-403)||(18232867-18233096)
chr6 (170-293)||(10077118-10077240)
chr6 (382-429)||(11857154-11857201)
chr6 (382-429)||(14737435-14737482)
chr6 (382-429)||(22010555-22010602)
chr6 (19-78)||(30125961-30126020)
chr6 (153-403)||(31979517-31979762)
chr6 (382-429)||(14742295-14742342)
chr6 (161-246)||(21801342-21801429)
chr6 (153-233)||(4629958-4630039)
chr6 (188-246)||(22963739-22963798)
chr6 (188-246)||(23824595-23824654)
chr6 (383-427)||(28155431-28155475)
chr6 (31-78)||(11856854-11856900)
chr6 (31-78)||(14737733-14737779)
chr6 (32-78)||(28184388-28184433)
chr6 (170-232)||(31936609-31936671)
chr6 (172-232)||(5017482-5017542)
chr6 (383-427)||(6438680-6438724)
chr6 (31-78)||(14742592-14742638)
chr6 (157-233)||(24435983-24436060)
chr6 (31-59)||(22010871-22010899)
chr6 (382-429)||(28184684-28184734)
chr6 (184-216)||(28955140-28955172)
[»] chr5 (61 HSPs)
chr5 (153-429)||(31180219-31180494)
chr5 (153-423)||(24135853-24136121)
chr5 (153-429)||(30631411-30631687)
chr5 (153-419)||(38219403-38219666)
chr5 (153-426)||(35387667-35387937)
chr5 (153-345)||(38192178-38192369)
chr5 (153-419)||(15464536-15464798)
chr5 (153-419)||(36932181-36932443)
chr5 (153-329)||(1457067-1457242)
chr5 (153-329)||(43592284-43592459)
chr5 (153-419)||(9353165-9353425)
chr5 (153-329)||(27449819-27449994)
chr5 (161-329)||(43598737-43598904)
chr5 (161-329)||(43604229-43604396)
chr5 (161-329)||(43609721-43609888)
chr5 (153-329)||(15044691-15044865)
chr5 (153-329)||(27444975-27445150)
chr5 (153-419)||(14520234-14520494)
chr5 (153-419)||(11916805-11917065)
chr5 (153-419)||(12084010-12084268)
chr5 (153-324)||(28807485-28807652)
chr5 (153-403)||(10281755-10282002)
chr5 (153-243)||(37556613-37556702)
chr5 (153-243)||(37561435-37561524)
chr5 (153-245)||(31401838-31401930)
chr5 (170-326)||(3880321-3880476)
chr5 (153-245)||(2785380-2785472)
chr5 (153-245)||(31396981-31397073)
chr5 (153-419)||(17003792-17004053)
chr5 (153-245)||(33768184-33768276)
chr5 (153-245)||(33791321-33791413)
chr5 (170-246)||(28832281-28832357)
chr5 (382-429)||(1457020-1457067)
chr5 (382-429)||(27445150-27445197)
chr5 (382-429)||(27449994-27450041)
chr5 (382-429)||(43592459-43592506)
chr5 (382-429)||(43598904-43598951)
chr5 (382-429)||(43604396-43604443)
chr5 (382-429)||(43609888-43609935)
chr5 (172-293)||(42127364-42127483)
chr5 (153-293)||(31300549-31300689)
chr5 (153-291)||(19588750-19588888)
chr5 (382-429)||(15044865-15044913)
chr5 (383-427)||(28807435-28807479)
chr5 (171-236)||(7160912-7160977)
chr5 (170-246)||(24553506-24553581)
chr5 (31-78)||(1457318-1457364)
chr5 (153-242)||(2630235-2630326)
chr5 (31-78)||(43592161-43592207)
chr5 (186-246)||(6741890-6741951)
chr5 (37-78)||(9353496-9353536)
chr5 (37-78)||(15464424-15464464)
chr5 (37-78)||(24135740-24135780)
chr5 (186-246)||(33030938-33030999)
chr5 (37-78)||(35387555-35387595)
chr5 (37-78)||(38192064-38192104)
chr5 (37-78)||(38219289-38219329)
chr5 (153-212)||(4410241-4410301)
chr5 (187-246)||(11181830-11181890)
chr5 (376-419)||(24553360-24553401)
chr5 (376-419)||(28832480-28832521)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (153-429)||(24787180-24787456)
chr1 (153-426)||(24202591-24202861)
chr1 (153-415)||(19358677-19358935)
chr1 (153-419)||(19361262-19361524)
chr1 (153-404)||(19379916-19380164)
chr1 (171-419)||(13604455-13604697)
chr1 (257-419)||(19366137-19366297)
chr1 (170-419)||(3281730-3281971)
chr1 (153-415)||(26644735-26644990)
chr1 (153-329)||(41390586-41390760)
chr1 (153-329)||(41398241-41398415)
chr1 (179-404)||(21536416-21536635)
chr1 (153-328)||(25444996-25445169)
chr1 (153-419)||(37069774-37070031)
chr1 (153-327)||(47703855-47704029)
chr1 (170-293)||(32889461-32889583)
chr1 (153-244)||(39445505-39445594)
chr1 (153-244)||(44023864-44023953)
chr1 (153-244)||(1055002-1055091)
chr1 (153-245)||(43988452-43988544)
chr1 (170-293)||(16124469-16124591)
chr1 (153-281)||(9476265-9476393)
chr1 (153-246)||(19072932-19073027)
chr1 (153-246)||(19120822-19120917)
chr1 (153-293)||(47098778-47098917)
chr1 (170-246)||(27104370-27104447)
chr1 (170-293)||(29651833-29651955)
chr1 (382-429)||(41390760-41390807)
chr1 (382-429)||(41398415-41398462)
chr1 (153-276)||(13598402-13598525)
chr1 (170-233)||(775694-775757)
chr1 (153-246)||(47102840-47102934)
chr1 (383-427)||(1054873-1054917)
chr1 (383-427)||(25439757-25439801)
chr1 (383-427)||(25444950-25444994)
chr1 (383-427)||(39445679-39445723)
chr1 (383-427)||(44023735-44023779)
chr1 (202-246)||(48382479-48382524)
chr1 (376-419)||(47102672-47102713)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (153-419)||(17781-18044)
scaffold0188 (153-419)||(23874-24137)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (153-419)||(8250-8512)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (171-419)||(133112-133354)
scaffold0006 (153-276)||(5687-5810)
scaffold0006 (170-233)||(2514-2577)
[»] scaffold0135 (3 HSPs)
scaffold0135 (153-329)||(34967-35142)
scaffold0135 (382-429)||(34920-34967)
scaffold0135 (31-78)||(35218-35264)
[»] scaffold0355 (4 HSPs)
scaffold0355 (153-329)||(9549-9722)
scaffold0355 (382-429)||(3707-3754)
scaffold0355 (250-329)||(3754-3833)
scaffold0355 (382-417)||(9514-9549)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (153-419)||(36665-36925)
scaffold0087 (153-415)||(43798-44054)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (153-419)||(85687-85947)
[»] scaffold0464 (2 HSPs)
scaffold0464 (153-244)||(368-457)
scaffold0464 (383-427)||(542-586)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (153-245)||(14297-14389)
scaffold0197 (153-245)||(19153-19245)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (153-245)||(2239-2331)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (170-281)||(10751-10861)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (153-245)||(148944-149036)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (153-217)||(181980-182044)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (171-290)||(17286-17404)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (171-232)||(45276-45337)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 153 - 423
Target Start/End: Original strand, 14291493 - 14291763
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291493 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 14291592  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14291593 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttt 14291692  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacact 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291693 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacact 14291763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 153 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 9296493 - 9296224
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9296493 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 9296394  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9296393 ccttcaagcttatacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttt 9296294  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacact 423  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9296293 agatccttccaa-tggtgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaatagacact 9296224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 153 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 11099019 - 11098746
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11099019 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 11098920  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11098919 cttgcaagcttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttt 11098820  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 426  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11098819 agatccttccaactaatgtactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 11098746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Original strand, 3491755 - 3492018
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3491755 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aatag 3491853  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  3491854 cttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctta 3491953  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||| |  || | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  3491954 agatccttccaa-tggtggaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgttttttccaacccaagaga 3492018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 153 - 365
Target Start/End: Original strand, 25398500 - 25398711
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25398500 ttgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aatag 25398598  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    | | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  25398599 cttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttt 25398698  T
Q  353 agatccttccaac 365  Q
    |||||||||||||    
T  25398699 agatccttccaac 25398711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 365
Target Start/End: Original strand, 25403638 - 25403849
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25403638 ttgttgactcagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aatag 25403736  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    | | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  25403737 cttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttt 25403836  T
Q  353 agatccttccaac 365  Q
    |||||||||||||    
T  25403837 agatccttccaac 25403849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 179 - 365
Target Start/End: Original strand, 25407653 - 25407838
Alignment:
Q  179 cctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagcc 278  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  25407653 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aatagcttgcaagcttacacaagaacaagtc 25407751  T
Q  279 ctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagatccttccaac 365  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  25407752 ctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaac 25407838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Original strand, 40738848 - 40739098
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          |||| |||||    
T  40738848 ttgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggggg-gagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaa-aatag 40738935  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    | | |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||    
T  40738936 cttgcaagcttacacaagaacaagtcttagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaatagtaagcttt 40739035  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
     ||||||||||| |  |||| | |||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  40739036 tgatccttccaa-tggtgaaat-ctcattacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 40739098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 28259270 - 28259010
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  28259270 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aata 28259173  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcc 350  Q
    || | ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| | |||||||     
T  28259172 gcttgcaagcttacacaagaacaagatctaatttctacccatttgtgttt-cccactctctcaataatgacccct-aaagagaagacacaaaaggaagct 28259075  T
Q  351 ttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    || ||||||||||| |  |||| | ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  28259074 tttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 28259010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 154 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 23078562 - 23078304
Alignment:
Q  154 tgttaacccagttc-agccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||    
T  23078562 tgttgacccagttcgatccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttagaaagagttacaagaa--aatag 23078465  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccc-cactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcct 351  Q
    | | |||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| |||||| ||| |||||||| |  |||||||||  |||||||||||| | ||||||| |    
T  23078464 cttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgttacccacactctca-atgatgaaccct--aagagaagacacaaaaggaagctt 23078368  T
Q  352 tagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    | ||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  23078367 ttgatccttccaa-tgatgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 23078304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 161 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 39812060 - 39811894
Alignment:
Q  161 ccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaag 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||    
T  39812060 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaag 39811964  T
Q  261 c-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    | ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  39811963 ctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 39811894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 153 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 44312704 - 44312567
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||    
T  44312704 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aactctag 44312607  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctaccc 291  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  44312606 ccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccc 44312567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 36757837 - 36757595
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 269  Q
    |||||||| |||||| |||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||  || ||| |||||||||||||||    
T  36757837 ccaatatgacctaatctgggggggataacagctctccaatccagtatgatgaaagtgtttcaaagagttataagaa--aaaagctttcaagcttacacaa 36757740  T
Q  270 gaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagatccttccaactaa 368  Q
    ||||||  ||||  |||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| |      
T  36757739 gaacaaaacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaatgatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tgg 36757643  T
Q  369 tgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  36757642 tgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 36757595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 164 - 328
Target Start/End: Original strand, 32246804 - 32246966
Alignment:
Q  164 gttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-t 262  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||| |    
T  32246804 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagctttcaagctt 32246900  T
Q  263 tacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 328  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||| |  || ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  32246901 tacacatgaacaaaccctagattataccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 32246966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 153 - 403
Target Start/End: Original strand, 8040064 - 8040314
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaa---agggttacaagaaaca 248  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   || ||||||||||  |    
T  8040064 ttgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagagttacaagaa--a 8040161  T
Q  249 atagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaa 347  Q
     |||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||  | |||||    
T  8040162 ttagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccactctcacaatatgaatcctaagaga-aaaacataaaaggaa 8040259  T
Q  348 gc-cttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttt 403  Q
    ||  || ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8040260 gctttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgttt 8040314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 153 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 10707345 - 10707172
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |    
T  10707345 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--att 10707248  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaa 327  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||||    
T  10707247 agcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatctgtg-tcacccactctcacaatatgaatcctaa 10707172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 42039744 - 42039588
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 269  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| | |||||||||||||    
T  42039744 ccaatatgacctaatctgtgggagagagcagctctctaatccactatgatgaaagtgttacgaagagttacaagaaa-attagcttgcaagcttacacaa 42039646  T
Q  270 gaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaa 327  Q
     |||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  42039645 aaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccactctcacaatatgaatcctaa 42039588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 8390243 - 8390049
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgtt-acaaagggttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||  | |    
T  8390243 ttgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaaagagttacaagaa--att 8390146  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc 349  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| |||||||||    
T  8390145 agcttacaagcttgcacaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccactctcacaatatgaatcct--aagagaaaacacaagaggaagc 8390049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Original strand, 13569332 - 13569593
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||   |    
T  13569332 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat--t 13569429  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc 349  Q
    ||| |  ||| ||||||||||||||| ||||  |||||||| | ||| | || ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| | |||||||    
T  13569430 agcttataagtttacacaagaacaagacctaatttctaccc-tttgtttgtcacccactctcacaatatgaatcct--aagagaaaacacaaaaggaagc 13569526  T
Q  350 -cttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
      || ||||||||||| |  |||| | ||||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  13569527 tttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactatccaaggtgtttataatg--tttcccaacccaagaga 13569593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 419
Target Start/End: Original strand, 34388880 - 34389115
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacaca 268  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||        ||  ||||||||||    
T  34388880 ccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa--------tt--agcttacaca 34388969  T
Q  269 agaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc-cttagatccttccaact 366  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| | |||||||  || ||||||||||| |    
T  34388970 agaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccactctcacaatatgaatcct--aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaa-t 34389065  T
Q  367 aatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
      |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  34389066 ggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 34389115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 170 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10445519 - 10445397
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacaca 268  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| | ||| ||||||||    
T  10445519 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactattatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaatcttacaca 10445422  T
Q  269 agaacaagccctagattctacccat 293  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||    
T  10445421 agaacaagacctaatttctacccat 10445397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Original strand, 21629948 - 21630209
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |    
T  21629948 ttgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--att 21630044  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 348  Q
    ||  |  ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| | ||| || ||||| ||| |||| ||||| |||  ||||||| |||| | ||||||    
T  21630045 agtttataagcttacacaagaacaagacttaatttctacccat-tttgtgtcacccacactctcaataatgaatcct--aagagaaaacacaaaaggaag 21630141  T
Q  349 c-cttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |  || ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  21630142 ctttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 21630209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Original strand, 19344426 - 19344518
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  19344426 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 19344518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Original strand, 19349284 - 19349376
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  19349284 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 19349376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 293
Target Start/End: Original strand, 39482953 - 39483075
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaatagccttcaagcttacaca 268  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||   |||| |  |||||||||||    
T  39482953 ccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatccactatgatgaaaatgttacaaaagagttacaagaaat--tagcttataagcttacaca 39483050  T
Q  269 agaacaagccctagattctacccat 293  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||    
T  39483051 agaacaagacctaatttctacccat 39483075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 9296628 - 9296568
Alignment:
Q  18 gtaatctatgagccaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9296628 gtaatctatgagcaaaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 9296568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14699100 - 14698961
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||   |    
T  14699100 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaag-gttacaaaagagttacaagaaat--t 14699004  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccat 293  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  14699003 agcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat 14698961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 246
Target Start/End: Original strand, 20522224 - 20522319
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 246  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20522224 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaa 20522319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 34682427 - 34682287
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  | |    
T  34682427 ttgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--att 34682330  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccat 293  Q
    ||| | || ||||||||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  34682329 agcttacaggcttacacaagaacaagacttaatttctacccat 34682287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 276
Target Start/End: Original strand, 17865207 - 17865330
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagcc-aatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||   |    
T  17865207 ttgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat--t 17865304  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaag 276  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||    
T  17865305 agcttataagcttacacaagaacaag 17865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27149369 - 27149303
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaaggg 236  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  27149369 ccaatatgacctactatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgatacaaaggg 27149303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 293
Target Start/End: Original strand, 33118158 - 33118280
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaatagccttcaagcttacaca 268  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||   |||| |  |||||||||||    
T  33118158 ccaatatgacctaatttgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaaaatagttacaagaaat--tagcttataagcttacaca 33118255  T
Q  269 agaacaagccctagattctacccat 293  Q
    |||||||| | ||  ||||||||||    
T  33118256 agaacaagacttaatttctacccat 33118280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 293
Target Start/End: Original strand, 31056067 - 31056188
Alignment:
Q  171 caatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 269  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| ||  | |||| |  ||||||||| ||    
T  31056067 caatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaataa--attagcttataagcttacaaaa 31056164  T
Q  270 gaacaagccctagattctacccat 293  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||    
T  31056165 gaacaagacctaatttctacccat 31056188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 33528714 - 33528619
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 246  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  33528714 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 33528619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2869786 - 2869691
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaa 246  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||| | | |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2869786 ttgtttacccagttcggtccaatatgacctactctaggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaaggagttacaagaaa 2869691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 419
Target Start/End: Original strand, 25409854 - 25409897
Alignment:
Q  376 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25409854 ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagaga 25409897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 39811894 - 39811847
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  39811894 acccaaggtgattacaatgtttttctcaacctaagagacactctcaac 39811847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 70
Target Start/End: Original strand, 14291358 - 14291410
Alignment:
Q  18 gtaatctatgagccaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctag 70  Q
    |||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291358 gtaatcaatgggcaaaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctag 14291410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 427
Target Start/End: Original strand, 32246968 - 32247012
Alignment:
Q  383 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  32246968 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctca 32247012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16940284 - 16940221
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa 233  Q
    |||||||| | |||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16940284 ccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 16940221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17010949 - 17010886
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa 233  Q
    |||||||| | |||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17010949 ccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 17010886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Original strand, 3491644 - 3491684
Alignment:
Q  37 gtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3491644 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagtctagtgt 3491684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 11099153 - 11099094
Alignment:
Q  18 gtaatctatgagccaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||| |||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11099153 gtaatcaatgaacaaaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgt 11099094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2838123 - 2838028
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaaa 246  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  2838123 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacatctccaatccactaaaatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaa 2838028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Original strand, 25398386 - 25398426
Alignment:
Q  37 gtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25398386 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgt 25398426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Original strand, 25403524 - 25403564
Alignment:
Q  37 gtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25403524 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgt 25403564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Original strand, 32246653 - 32246713
Alignment:
Q  18 gtaatctatgagc-caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  32246653 gtaatctatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaac-aaaacagtcctagactagtgt 32246713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 419
Target Start/End: Original strand, 17865428 - 17865469
Alignment:
Q  376 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  17865428 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 17865469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 44312826 - 44312798
Alignment:
Q  31 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaa 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312826 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaa 44312798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 153 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 4760167 - 4759893
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4760167 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 4760068  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4760067 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttt 4759968  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgt-ttttcccaacccaagagacactctc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4759967 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagactctctc 4759893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 153 - 429
Target Start/End: Original strand, 30655651 - 30655927
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655651 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 30655750  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30655751 ccttcaagcttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttt 30655850  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655851 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 30655927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 153 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 33037898 - 33037627
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037898 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 33037800  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  33037799 ccttcaagcttacacaagaacaaaccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccct-aaagagaagacactagaggaagcttt 33037701  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037700 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 33037627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 153 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 10689235 - 10688959
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10689235 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacagagggttacaagaaacaatag 10689136  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatg-tgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcct 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10689135 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctt 10689036  T
Q  352 tagatcct--tccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 426  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10689035 tagatcctcccccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 10688959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 153 - 426
Target Start/End: Original strand, 36979382 - 36979654
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36979382 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 36979481  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36979482 ccttcaagcttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttt 36979581  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  36979582 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatg-ttttcccaacctaagagacactctc 36979654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 153 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18870654 - 18870377
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18870654 ttgttgacccagttcatccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaata 18870555  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcct 351  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18870554 gcattcaagcttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctt 18870455  T
Q  352 tagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18870454 tagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 18870377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 153 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18853260 - 18852983
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18853260 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaata 18853161  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcct 351  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18853160 gcattcaagcttacacaagaacaaaccctagattttaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctt 18853061  T
Q  352 tagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18853060 tagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatatttttcccaacccaagagacactctcaac 18852983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 153 - 429
Target Start/End: Original strand, 6311302 - 6311579
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  6311302 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctag 6311400  T
Q  253 ccttcaagctt-acacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa--gagaagacactagaggaagc 349  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  6311401 ccttcaagctttacacaaga-caaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaaaagagaagtcactagaggaagc 6311499  T
Q  350 cttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311500 ttttgatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 6311579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 153 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 1262046 - 1261776
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1262046 ttgttgacccagttcaaccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aatag 1261948  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    | | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1261947 cttgcaagcttacacaagtacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttt 1261848  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 426  Q
    |||||||||||| |  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1261847 agatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagaccctctc 1261776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 170 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 31071304 - 31071058
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 269  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  31071304 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aatagcttgcaagcttacacaa 31071206  T
Q  270 gaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagatccttccaactaat 369  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |  |    
T  31071205 gaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttaagatccttccaa-tggt 31071107  T
Q  370 gaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31071106 gaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagaga 31071058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Original strand, 26287906 - 26288158
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          |||| |||||    
T  26287906 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaa-aatag 26287994  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    | | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  26287995 cttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtt-ccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttt 26288093  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26288094 agatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaactcaagaga 26288158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Original strand, 26301163 - 26301415
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          |||| |||||    
T  26301163 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaa-aatag 26301251  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    | | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  26301252 cttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtt-ccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttt 26301350  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26301351 agatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaactcaagaga 26301415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Original strand, 26313157 - 26313409
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          |||| |||||    
T  26313157 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaa-aatag 26313245  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    | | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  26313246 cttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtt-ccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttt 26313344  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26313345 agatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaactcaagaga 26313409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 7290006 - 7289831
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||    
T  7290006 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aactctag 7289909  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289908 ccttcaagctttacacatgaacaaaccctatattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 7289831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 25328358 - 25328184
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||    
T  25328358 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctag 25328262  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25328261 ccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaacatgaaccctaaaa 25328184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 170 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 19175829 - 19175587
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 269  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19175829 ccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa-aatagcctgcaagcttacacaa 19175731  T
Q  270 gaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagatccttccaactaa 368  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| | ||||| | || ||||||||||| ||     
T  19175730 gaacaagacctaacttctacacatttgtgttt-cccactctctcaatgatgaaccct--aagagaagacacaaaaggaaacttttgatccttccaa-tag 19175635  T
Q  369 tgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||    
T  19175634 tgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaatccaagaga 19175587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Original strand, 7412345 - 7412604
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  7412345 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aata 7412442  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcc 350  Q
     | | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||  | |||||||     
T  7412443 acttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttt-cccactctctcaataatgaaccct--aagagaagacataaaaggaagct 7412539  T
Q  351 ttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    || ||||||| ||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  7412540 tttgatcctttcaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 7412604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 170 - 419
Target Start/End: Original strand, 4456050 - 4456292
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 269  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||   |||||||||||||    
T  4456050 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aatagctggcaagcttacacaa 4456147  T
Q  270 gaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagatccttccaactaa 368  Q
    ||||||| | ||  |||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || |||||||| || |      
T  4456148 gaacaagacataatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaatgatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttctaa-tgg 4456244  T
Q  369 tgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  4456245 tgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 4456292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 170 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19752469 - 19752347
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 269  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  19752469 ccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaa-aatagcttgcaagcttacacaa 19752371  T
Q  270 gaacaagccctagattctacccat 293  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||    
T  19752370 gaacaagtcctaatttctacccat 19752347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 39784902 - 39784813
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  39784902 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 39784813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 153 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23799670 - 23799496
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |    
T  23799670 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--att 23799573  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaa 327  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||| |||||    
T  23799572 agcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccactgtcacaatatgaatcctaa 23799496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 26403323 - 26403076
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||  | |    
T  26403323 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttataggaa--att 26403226  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc 349  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || | ||||||||||||||||| |  | ||||||| |||| | |||||||    
T  26403225 agcttacaagcttgcacaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcactcactctcacaatatgaatc--ataagagaaaacacaaaaggaagc 26403129  T
Q  350 -cttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttt 403  Q
      || ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26403128 tttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgttt 26403076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10684344 - 10684252
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  10684344 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 10684252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Original strand, 35745396 - 35745488
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  35745396 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 35745488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 293
Target Start/End: Original strand, 6127243 - 6127365
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacaca 268  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| |  ||||||||| |    
T  6127243 ccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttataagcttacaaa 6127340  T
Q  269 agaacaagccctagattctacccat 293  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||    
T  6127341 agaacaagacctaatttctacccat 6127365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5702576 - 5702481
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 246  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5702576 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctccaatcccctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 5702481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 7289831 - 7289784
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289831 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 7289784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 382 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 25328058 - 25328013
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctca 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328058 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctca 25328013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 382 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 25328184 - 25328139
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctca 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328184 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctca 25328139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4696689 - 4696609
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttc-agccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaa 232  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4696689 ttgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaa 4696609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 246
Target Start/End: Original strand, 6813723 - 6813782
Alignment:
Q  188 ggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  6813723 ggggagagagcagctctccaatccaataagatgaaagtgacacaaaggggttacaagaaa 6813782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9054912 - 9054835
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaag-ggttacaagaaa 246  Q
    |||||||| |||| | ||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  9054912 ccaatatgacctactctggaggagagagcagctctctaatccactaagatgaaagtgatacaaagtggttacaagaaa 9054835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 4760302 - 4760243
Alignment:
Q  18 gtaatctatgagccaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4760302 gtaatcaatgagcaaaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgt 4760243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9765912 - 9765852
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatcca 212  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9765912 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 9765852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 39784728 - 39784684
Alignment:
Q  383 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  39784728 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagactctctca 39784684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 1262157 - 1262117
Alignment:
Q  37 gtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1262157 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagtctagtgt 1262117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Original strand, 26287794 - 26287834
Alignment:
Q  37 gtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26287794 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagtctagtgt 26287834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Original strand, 26313045 - 26313085
Alignment:
Q  37 gtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313045 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagtctagtgt 26313085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 31071434 - 31071394
Alignment:
Q  37 gtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31071434 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagtctagtgt 31071394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 10689369 - 10689310
Alignment:
Q  18 gtaatctatgagccaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  10689369 gtaatctatgagtctaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaacaaccctagtgtagtgt 10689310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 18853395 - 18853343
Alignment:
Q  18 gtaatctatgagccaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctag 70  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  18853395 gtaatctatgagtcaaatggtttccaagcaaacaacaaaaaaaaacgccctag 18853343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Original strand, 36979248 - 36979307
Alignment:
Q  18 gtaatctatgagccaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||| |||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36979248 gtaatcaatgaacaaaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgt 36979307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 246
Target Start/End: Original strand, 3051162 - 3051219
Alignment:
Q  190 ggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  3051162 ggagagagcacctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaa 3051219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18813189 - 18813156
Alignment:
Q  179 cctaatatgggggagagagcagctctccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18813189 cctaatatgggggagagagcagccctccaatcca 18813156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 4696482 - 4696441
Alignment:
Q  376 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  4696482 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 4696441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 9054294 - 9054253
Alignment:
Q  376 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  9054294 ctcactacccaaggtgattataatgtttt--ccaacccaagaga 9054253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 59)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 153 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 20357639 - 20357363
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20357639 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 20357541  T
Q  253 ccttcaagctt-acacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcct 351  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20357540 ccttcaagctttacacaagaacatgccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctt 20357441  T
Q  352 tagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20357440 tagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 20357363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 153 - 426
Target Start/End: Original strand, 2057970 - 2058246
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2057970 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 2058069  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatg-tgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcct 351  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2058070 cattcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctt 2058169  T
Q  352 tagatcct--tccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 426  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2058170 tagatcctcccccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 2058246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 153 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 1533536 - 1533263
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1533536 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcatctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 1533437  T
Q  253 ccttcaagcttacacaag-aacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcct 351  Q
    | | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1533436 cttgcaagcttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgttttcccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctt 1533337  T
Q  352 tagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 426  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1533336 tagatccttccaa-tggtgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 1533263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Original strand, 21639813 - 21640076
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21639813 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aatag 21639911  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21639912 cttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttt 21640011  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21640012 agatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagaga 21640076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Original strand, 21646011 - 21646274
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  21646011 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctagggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaagggttacaagaaa-aatag 21646109  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  21646110 cttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagattt 21646209  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21646210 agatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagaga 21646274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Original strand, 18408768 - 18409030
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  18408768 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccagtatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aataa 18408866  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    | | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |     
T  18408867 cttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaag-gaagacacaagaggaagctta 18408965  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    ||||||||  || |  |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18408966 agatccttttaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagaga 18409030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Original strand, 18413645 - 18413906
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18413645 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aatag 18413742  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
      | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |     
T  18413743 attgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaag-gaagacacaagaggaagctta 18413841  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18413842 agatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacattgtttttcccaacccaagaga 18413906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 330
Target Start/End: Original strand, 12406336 - 12406512
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||    
T  12406336 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaatagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aactctag 12406433  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaag 330  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406434 ccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaag 12406512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Original strand, 12396916 - 12397091
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||    
T  12396916 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aactctag 12397013  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    |||| || | ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12397014 cctttaatctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactatcacaatatgaaccctaaaa 12397091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 153 - 403
Target Start/End: Original strand, 21983288 - 21983536
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac--aaagggttacaagaaacaa 249  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||    
T  21983288 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaaagagttacaagaa--aa 21983385  T
Q  250 tagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 348  Q
    |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| | ||||||    
T  21983386 tagcttgcaagcttacacaagaacaagacctagtttctacccat-tttgtgtcacccactctcaaaatatgaaccct-aaagagaaaacacaaaaggaag 21983483  T
Q  349 ccttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttt 403  Q
    | |  ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21983484 cttatgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgttt 21983536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24024406 - 24024232
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||  |||    
T  24024406 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaatgttacaag--actctag 24024310  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  24024309 ccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacgatgaaccctaaaa 24024232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 31109663 - 31109489
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||    
T  31109663 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctag 31109567  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    ||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||| |   | ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31109566 ccttcaagctttgcacatgaacaaaccctagattctaccctttgatattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 31109489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 171 - 419
Target Start/End: Original strand, 2479360 - 2479600
Alignment:
Q  171 caatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaag 270  Q
    ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  2479360 caatatgacctaatctagggg-gagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttataagaa--aatagcttgcaagcttacacaag 2479456  T
Q  271 aacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagatccttccaactaat 369  Q
    |||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |  | ||||||| || ||||||||||| |  |    
T  2479457 aacaagacctaatttctacccatgtgtgttt-cccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagatataaaaggaagcttttgatccttccaa-tggt 2479553  T
Q  370 gaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  2479554 gaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 2479600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 171 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 44848758 - 44848568
Alignment:
Q  171 caatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaag 270  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| | ||||||||||||||    
T  44848758 caatatgacctaacctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aaaagcttgcaagcttacacaag 44848661  T
Q  271 aacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagatccttccaa 364  Q
    || ||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||    
T  44848660 aataagacctaatttctacccatttgtgttt-cccactctctcaataatgaactct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa 44848568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 153 - 403
Target Start/End: Original strand, 29159807 - 29160055
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |    
T  29159807 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--att 29159904  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc 349  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| | |||||||    
T  29159905 agcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttttgtgtcacccactctcacaatatgaatcct--aagagaaaacacaaaaggaagc 29160002  T
Q  350 -cttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttt 403  Q
      || ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29160003 tttttgatccttccaa-tgttgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgttt 29160055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 244
Target Start/End: Original strand, 19992318 - 19992408
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19992318 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 19992408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 9190101 - 9189961
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  9190101 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaa-aata 9190003  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccat 293  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  9190002 gcttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccat 9189961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 170 - 293
Target Start/End: Original strand, 2580412 - 2580533
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 269  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  2580412 ccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa--aatagcttgcaagcttacacaa 2580509  T
Q  270 gaacaagccctagattctacccat 293  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||    
T  2580510 gaacaagtcctagtttctacccat 2580533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 239
Target Start/End: Original strand, 4866735 - 4866820
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggtta 239  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4866735 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggtta 4866820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Original strand, 16880078 - 16880169
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  16880078 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgttttacaaagagttacaagaa 16880169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Original strand, 16884934 - 16885025
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  16884934 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgttttacaaagagttacaagaa 16885025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24261403 - 24261311
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  24261403 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 24261311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24266282 - 24266190
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  24266282 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 24266190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Original strand, 47263682 - 47263930
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||          |||| |||||  ||||    
T  47263682 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggaga--gcagctctccaatccactatgatgaaagt----------gttataagaa--aata 47263767  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcc 350  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| | |||||||     
T  47263768 gcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctatccatttgtgttt-cccactctctcaataatgaaccct-aaatagaagacacaaaaggaagct 47263865  T
Q  351 ttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    || ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||    
T  47263866 tttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtatttacaatg--tttcccaaccgaagaga 47263930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 2647771 - 2647649
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaatagccttcaagcttacaca 268  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||   |||| |  |||||||||||    
T  2647771 ccaatatgacctattctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat--tagcttataagcttacaca 2647674  T
Q  269 agaacaagccctagattctacccat 293  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||    
T  2647673 agaacaagacctaatttctacccat 2647649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 291
Target Start/End: Original strand, 20284093 - 20284230
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||  | ||    
T  20284093 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgcgttacaagaa--atta 20284190  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctaccc 291  Q
    || |  ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||    
T  20284191 gcttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctaccc 20284230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 20357774 - 20357714
Alignment:
Q  18 gtaatctatgagccaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20357774 gtaatctatgagccaaatggtctccaagctaacaacaacaaaaacagccctagactagtgt 20357714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 46516403 - 46516263
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||   |    
T  46516403 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat--t 46516306  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccat 293  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  46516305 agcttaaaagcttacacaagaacaagacataatttctacccat 46516263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Original strand, 49091665 - 49091805
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |    
T  49091665 ttgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--att 49091762  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccat 293  Q
    | | |  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  49091763 accttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat 49091805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Original strand, 21988912 - 21989172
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac--aaagggttacaagaaacaa 249  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||| ||||||  || |||||||||||| | |||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||    
T  21988912 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagag--caactctccaatccactttgatgaaagtgttacaaaaagagttacaagaa--aa 21989007  T
Q  250 tagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 348  Q
    |||  | |||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||||| | ||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| || ||||||    
T  21989008 tagattgcaagcttatacaagaataaaacctagtttctacccat-tttgtgtcacccactctaaaaatatgaaccct-aaagagaaaacaataaaggaag 21989105  T
Q  349 ccttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    | |  ||||||||||| |  | || | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  21989106 cttatgatccttccaa-tggtaaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 21989172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 293
Target Start/End: Original strand, 55970 - 56091
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaatagccttcaagcttacaca 268  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||   |||| |  |||||||||||    
T  55970 ccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat--tagcttataagcttacaca 56066  T
Q  269 agaacaagccctagattctacccat 293  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||    
T  56067 agaacaagacctaatttctacccat 56091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21812318 - 21812254
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatg 217  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21812318 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctttccaatccaatatg 21812254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Original strand, 12397091 - 12397138
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12397091 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 12397138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 31109489 - 31109442
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 31109442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 384 - 429
Target Start/End: Original strand, 4873310 - 4873355
Alignment:
Q  384 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4873310 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 4873355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 384 - 429
Target Start/End: Original strand, 12406513 - 12406558
Alignment:
Q  384 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406513 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 12406558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28617318 - 28617223
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaa-agggttacaagaaa 246  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  28617318 ttgtttacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgatacaatggggttacaagaaa 28617223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 33332523 - 33332448
Alignment:
Q  172 aatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 246  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  33332523 aatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 33332448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4796760 - 4796637
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaat 250  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||| ||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||   |    
T  4796760 ttgttaacccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggagaaagcagccctcaaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaagaaat--t 4796663  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaag 276  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||    
T  4796662 agcttataagcttacacaagaacaag 4796637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 233
Target Start/End: Original strand, 35960839 - 35960901
Alignment:
Q  171 caatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa 233  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  35960839 caatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaaaccactatgatgaaagtgttacaaa 35960901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 70
Target Start/End: Original strand, 2057829 - 2057881
Alignment:
Q  18 gtaatctatgagccaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctag 70  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2057829 gtaatctatgagtcaaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaaccgccctag 2057881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24024232 - 24024185
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24024232 acccacggtgattacaatgtttttccaaacccaagagacactctcaac 24024185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23403086 - 23402967
Alignment:
Q  172 aatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaaga 271  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||| |||||||| | || |||||||||||||||| | ||||||||||  | |||| |  ||||||||| ||||    
T  23403086 aatatgacctaatctgagggagtgagcagccctccaatctactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa--attagcttataagcttacaaaaga 23402989  T
Q  272 acaagccctagattctacccat 293  Q
    ||||| ||||  ||||||||||    
T  23402988 acaagtcctaatttctacccat 23402967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9185258 - 9185178
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaa 232  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||  |||| | |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9185258 ttgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9185178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5817327 - 5817268
Alignment:
Q  188 ggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaaa 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  5817327 ggggagagagcagctctccaatccactaatatgaaagtgatacaaaggggttacaagaaa 5817268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Original strand, 18413534 - 18413574
Alignment:
Q  37 gtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18413534 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagtctagtgt 18413574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Original strand, 21639701 - 21639741
Alignment:
Q  37 gtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21639701 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagtctagtgt 21639741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Original strand, 21645899 - 21645939
Alignment:
Q  37 gtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21645899 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagtctagtgt 21645939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Original strand, 4866612 - 4866658
Alignment:
Q  31 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  4866612 caaatggtctccaagcaaacaacaac-aaaacagtcctagactagtgt 4866658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Original strand, 12396794 - 12396840
Alignment:
Q  31 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  12396794 caaatggtctccaagcaaacaacaac-aaagcagccctagactagtgt 12396840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Original strand, 12406214 - 12406260
Alignment:
Q  31 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  12406214 caaatggtctccaagcaaacaacaac-aaagcagccctagactagtgt 12406260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 21812143 - 21812098
Alignment:
Q  383 cccaaggtgattacaatgttttt-cccaacccaagagacactctca 427  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  21812143 cccaaggtgattacaatgtttttccccaacctaagaaacactctca 21812098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 24024530 - 24024501
Alignment:
Q  31 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024530 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa 24024501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 419
Target Start/End: Original strand, 2580613 - 2580654
Alignment:
Q  376 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  2580613 ctcactacccaaggtgtttacaatgtttt--ccaacccaagaga 2580654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 4796542 - 4796501
Alignment:
Q  376 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  4796542 ctcactacccaaggtgtttacaatgtttt--ccaacccaagaga 4796501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 212
Target Start/End: Original strand, 7351652 - 7351712
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatcca 212  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7351652 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatcca 7351712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 9185048 - 9185007
Alignment:
Q  376 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  9185048 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 9185007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 419
Target Start/End: Original strand, 20284312 - 20284353
Alignment:
Q  376 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  20284312 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 20284353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 23402887 - 23402846
Alignment:
Q  376 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  23402887 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 23402846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 153 - 426
Target Start/End: Original strand, 24741945 - 24742218
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24741945 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 24742044  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24742045 ccttcaagcttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttt 24742144  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24742145 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 24742218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 153 - 426
Target Start/End: Original strand, 29760646 - 29760919
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29760646 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 29760745  T
Q  253 ccttcaagcttacacaag-aacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcct 351  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  29760746 cctgcaagcttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccct--aagagaagacactagaggaagctt 29760843  T
Q  352 tagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatg-tttttcccaacccaagagacactctc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29760844 tagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagacactctc 29760919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 28468621 - 28468367
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          |||| |||||    
T  28468621 ttgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaaatag 28468532  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
      | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  28468531 tttgcaagcttacacaataacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttt 28468432  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28468431 agatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatatttttcccaacccaagaga 28468367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 31985726 - 31985466
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31985726 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aata 31985629  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcct 351  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  31985628 gcttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttgtgttt-cccactctcacaatgtgaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagctt 31985530  T
Q  352 tagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    | ||||||||| | |  |||| |  ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  31985529 ttgatccttccca-tggtgaaat-ttcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 31985466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 9229274 - 9229099
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||  |||    
T  9229274 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttagaag-aactctag 9229177  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9229176 ccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaa 9229099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 9224487 - 9224312
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||  |||    
T  9224487 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttagaag-aactctag 9224390  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9224389 ccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaa 9224312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Original strand, 51520462 - 51520637
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||    
T  51520462 ttgttgacccagttctgccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aactctag 51520559  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  51520560 ccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 51520637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 153 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 45347897 - 45347723
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |  |||    
T  45347897 ttgttgacccagttcagccaatatggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-acctctag 45347800  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  45347799 ccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 45347723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 5396764 - 5396504
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||    
T  5396764 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttgcaaagagttacaagaa--aata 5396667  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcc 350  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| || | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | || ||||     
T  5396666 gcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttactcactctctcaatgatgaaccct-aaagagaagacacaaaagaaagct 5396569  T
Q  351 ttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    || ||| ||||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  5396568 tttgattcttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 5396504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 153 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 45357376 - 45357203
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||    
T  45357376 ttgttgacccagttcagccaatatggcataatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctag 45357280  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 328  Q
    | ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  45357279 ctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 45357203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Original strand, 3814029 - 3814202
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||  |||    
T  3814029 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaag--actctag 3814125  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    | ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3814126 ctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 3814202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 153 - 325
Target Start/End: Original strand, 5732670 - 5732839
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||    
T  5732670 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctag 5732766  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccct 325  Q
    | ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  5732767 ctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactataaaccct 5732839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 171 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 16623367 - 16623126
Alignment:
Q  171 caatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 269  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | ||||    ||||||||| ||    
T  16623367 caatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagctaataagcttacagaa 16623270  T
Q  270 gaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagatccttccaactaa 368  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| | ||||||| || ||||||||||| |      
T  16623269 gaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccactctcacaatatgaatcctaaa--agaaaacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tgg 16623174  T
Q  369 tgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  16623173 tgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 16623126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 56146783 - 56146664
Alignment:
Q  161 ccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaag 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||    
T  56146783 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aactctagccttcaag 56146686  T
Q  261 c-ttacacaagaacaagcccta 281  Q
    | ||||||| |||||| |||||    
T  56146685 ctttacacatgaacaaacccta 56146664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 364
Target Start/End: Original strand, 5147681 - 5147891
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||  |||    
T  5147681 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctccagtccattatgatgaaagtgttacaaaatagttacaagaa--aat 5147778  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc 349  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||    
T  5147779 agcttgcaagcttacacaagaacaaggcctaatttctacccat-tttgtgtcacccattctcacaatatgaaccct-aaagagaaaacacaaaaggaagc 5147876  T
Q  350 cttagatccttccaa 364  Q
     |  |||||||||||    
T  5147877 ttatgatccttccaa 5147891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36315321 - 36315163
Alignment:
Q  154 tgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||    
T  36315321 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaat--tag 36315224  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccc-cactctca 312  Q
    | |  |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  36315223 cttagaagcttacacaagagcaagacctaatttctacccatttgtgttacccacactctca 36315163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36329530 - 36329372
Alignment:
Q  154 tgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||    
T  36329530 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaat--tag 36329433  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccc-cactctca 312  Q
    | |  |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  36329432 cttagaagcttacacaagagcaagacctaatttctacccatttgtgttacccacactctca 36329372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Original strand, 3777553 - 3777813
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||  |||||| | | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  3777553 ttgttgacccagttcggtccaatataacctaatctagaggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aata 3777650  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc- 349  Q
    || | ||| ||||||||||||||||  |||  |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||  ||||||| | || | |||||||     
T  3777651 gcttgcaaacttacacaagaacaagatctaatttctacccat-tttgtgtcacccactctcacaatatgaatcct--aagagaaaatacaaaaggaagct 3777747  T
Q  350 cttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
     || |||| |||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  3777748 ttttgatcattccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 3777813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 244
Target Start/End: Original strand, 18855732 - 18855821
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  18855732 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 18855821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 3796612 - 3796472
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |    
T  3796612 ttgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagagagcaactctctaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--att 3796515  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccat 293  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  3796514 agcttacaagcttgcacaagaacaagacctaatttctacccat 3796472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Original strand, 10047383 - 10047523
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||   |    
T  10047383 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat--t 10047480  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccat 293  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  10047481 agcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat 10047523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 170 - 364
Target Start/End: Original strand, 5143281 - 5143473
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacaca 268  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||   |||||||||  |||||| | ||||| ||||||    
T  5143281 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaacccactatgatgaaagtgttacaaaaaatttacaagaa--aatagcttgcaagcatacaca 5143378  T
Q  269 agaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagatccttccaa 364  Q
    |||||||| ||||  |||||| ||| | ||| ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| |  |||||||||||    
T  5143379 agaacaagacctaatttctactcat-tttgtgtcagccactctcagaatatgaaccct-aaagagaaaacacaaaaggaagcttatgatccttccaa 5143473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 246
Target Start/End: Original strand, 39245998 - 39246093
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 246  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  39245998 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 39246093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 233
Target Start/End: Original strand, 24333813 - 24333894
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa 233  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24333813 ttgttaactcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaacgtgttacaaa 24333894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 38152532 - 38152395
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||| ||||||   |    
T  38152532 ttgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactatggtgaaagtgttacaaaagagttataagaaat--t 38152435  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacc 290  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  38152434 agcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacc 38152395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Original strand, 51520637 - 51520684
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520637 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 51520684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5269266 - 5269204
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaa 232  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5269266 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 5269204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 8689509 - 8689329
Alignment:
Q  231 aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaa 329  Q
    |||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| || ||||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||    
T  8689509 aaagtgttacaagaaa--atagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccaatttgtgttt-cccactctctcaatgatgaaccct--aa 8689415  T
Q  330 gagaagacactagaggaagccttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||| | ||||| | || ||||||||||| |  |||| | ||||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  8689414 gagaagacacaaaaggaaacttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactatccaaggtgtttaaaatg--tttcccaacccaagaga 8689329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16630755 - 16630650
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaatagccttcaagcttacaca 268  Q
    |||||||| | |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||   |||| |  |||||||||||    
T  16630755 ccaatatgacataatctggaggagagaacagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat--tagcttataagcttacaca 16630658  T
Q  269 agaacaag 276  Q
    ||||||||    
T  16630657 agaacaag 16630650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1983389 - 1983298
Alignment:
Q  157 taacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaaa 246  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  1983389 taacccagttcggtccaatatgacctactatgggggagatagcagctctccaatccactaggatcaaagtgatacaaaggggttacaagaaa 1983298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18712671 - 18712624
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18712671 acccaaggtgataacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 18712624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25862097 - 25862035
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaa 232  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25862097 ccaatatgacctaatatggggaagagagcggccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 25862035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6743507 - 6743427
Alignment:
Q  154 tgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa 233  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||| |  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6743507 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 6743427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 383 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 45347721 - 45347677
Alignment:
Q  383 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45347721 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctca 45347677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Original strand, 5112245 - 5112336
Alignment:
Q  157 taacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaaa 246  Q
    ||||||||||| | ||||||||  ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5112245 taacccagttcggtccaatatgatctactttgggggtgagagcagctctccaatccactaatatgaaagtgttacaaatgggttacaagaaa 5112336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 9224312 - 9224265
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9224312 acccaaggtgattacaatgttttcccaaacccaagagacactctcaac 9224265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 9229099 - 9229052
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9229099 acccaaggtgattacaatgttttcccaaacccaagagacactctcaac 9229052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 303 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 16628815 - 16628705
Alignment:
Q  303 cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtt 402  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||  | ||||||| || ||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||| ||||||||      
T  16628815 cccactctcacaatatgaatcctaaaagaaaacaca--aaaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatg-- 16628722  T
Q  403 tttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||||||||    
T  16628721 tttcccaacccaagaga 16628705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 427
Target Start/End: Original strand, 3814202 - 3814247
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctca 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3814202 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctca 3814247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 42599667 - 42599526
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagag--cagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaa 249  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  || | |||||||||| || ||||||| |||||||| | ||||||||||  |     
T  42599667 ttgttgacccaattcagtccaatatgacataatatgggggagagagagcaaccctccaatccactaagatgaaaatgttacaatgagttacaagaa--at 42599570  T
Q  250 tagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccat 293  Q
    |||| |  ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||    
T  42599569 tagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccat 42599526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 427
Target Start/End: Original strand, 5732844 - 5732888
Alignment:
Q  383 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  5732844 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctca 5732888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34495882 - 34495822
Alignment:
Q  186 tgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaa 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  34495882 tgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgggttacaagaa 34495822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 9224609 - 9224563
Alignment:
Q  31 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9224609 caaatggtctccaagcaaacaacaac-aaaacagccctagactagtgt 9224563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 9229396 - 9229350
Alignment:
Q  31 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9229396 caaatggtctccaagcaaacaacaac-aaaacagccctagactagtgt 9229350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 28468732 - 28468692
Alignment:
Q  37 gtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28468732 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagtctagtgt 28468692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39774380 - 39774303
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaaa 246  Q
    |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  39774380 ccaatatgacctactctgggggatagagcagctctccaatccactaaaatgaaagtgatacaaataggttacaagaaa 39774303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 383 - 427
Target Start/End: Original strand, 18855906 - 18855950
Alignment:
Q  383 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  18855906 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctca 18855950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Original strand, 24741811 - 24741870
Alignment:
Q  18 gtaatctatgagccaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||| |||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24741811 gtaatcaatgaacaaaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgt 24741870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 383 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 45357201 - 45357157
Alignment:
Q  383 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  45357201 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctca 45357157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Original strand, 3813906 - 3813952
Alignment:
Q  31 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  3813906 caaatggtctccaagcaaacaacaac-aaaacagtcctagactagtgt 3813952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8689558 - 8689498
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaa 232  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8689558 ccaatatgatctaatatgggggagagg--agctctcctatccactatgatgaaagtgttacaa 8689498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Original strand, 51520339 - 51520385
Alignment:
Q  31 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  51520339 caaatggtctccaagcaaacaacaac-aaagcagccctagactagtgt 51520385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 419
Target Start/End: Original strand, 5112460 - 5112501
Alignment:
Q  376 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  5112460 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 5112501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 419
Target Start/End: Original strand, 10047604 - 10047645
Alignment:
Q  376 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  10047604 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 10047645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 66)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 153 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 2671678 - 2671405
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671678 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 2671579  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
      | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2671578 attgcaagcttacacaagaccaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttt 2671479  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671478 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 2671405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 153 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 8739155 - 8738882
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8739155 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 8739056  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  8739055 ccttcaagcttacacaagaacaatccctagattctacccatatgtatttccccactctcacaatatgaaccctagaagagaagacactagaggaagcttt 8738956  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 426  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8738955 agatcctttcaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatactctc 8738882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 153 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 9091393 - 9091120
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9091393 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 9091294  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  9091293 ccttcaagcttacacaagaacaatccctagattctacccatatgtatttccccactctcacaatatgaaccctagaagagaagacactagaggaagcttt 9091194  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 426  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9091193 agatcctttcaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatactctc 9091120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 153 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 40372887 - 40372615
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40372887 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aatag 40372789  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40372788 cttgcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcataatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttt 40372689  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40372688 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 40372615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 153 - 429
Target Start/End: Original strand, 7167249 - 7167526
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7167249 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 7167348  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7167349 ccttcaagcttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttt 7167448  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatg-tttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7167449 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagacactctcaac 7167526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 153 - 426
Target Start/End: Original strand, 8477367 - 8477642
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8477367 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 8477466  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaa-caagccctagattctacccatatgtgtttcccc-actctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcc 350  Q
    | | ||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8477467 cttgcaagcttacacaataaacaagacctagattctaccctttggtgtttcccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagct 8477566  T
Q  351 ttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8477567 ttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 8477642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 153 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 28503956 - 28503680
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  28503956 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggaagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctag 28503858  T
Q  253 ccttcaagctt-acacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcct 351  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  28503857 ccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctt 28503758  T
Q  352 tagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28503757 tagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatatttttcccaacccaagagacactctcaac 28503680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 192 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 28501750 - 28501513
Alignment:
Q  192 agagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-acacaagaacaagccctagattctacc 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  28501750 agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctacc 28501652  T
Q  291 catatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggt 390  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28501651 ctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggt 28501552  T
Q  391 gattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28501551 gattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 28501513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 26928683 - 26928421
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26928683 ttgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaaatag 26928584  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  26928583 cttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttt 26928484  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
     ||||||||||| |  |||| | |||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  26928483 tgatccttccaa-tggtgaaat-ctcattacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 26928421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Original strand, 1305953 - 1306216
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1305953 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagatagcagctctccaatccactacgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aatag 1306051  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
      | |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  1306052 tttgcaagcttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctta 1306151  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1306152 agatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagaga 1306216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 170 - 419
Target Start/End: Original strand, 32143343 - 32143587
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 269  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  32143343 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aatagcttgcaagcttacacaa 32143441  T
Q  270 gaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagatccttccaactaat 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |  |    
T  32143442 gaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttttgatccttccaa-tggt 32143540  T
Q  370 gaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  32143541 gaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttt--ccaacccaagaga 32143587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 170 - 419
Target Start/End: Original strand, 27452980 - 27453224
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 269  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  27452980 ccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aatagcttgcaagcttacacaa 27453078  T
Q  270 gaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagatccttccaactaat 369  Q
    ||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| |  |    
T  27453079 gaacaattcctattttctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tggt 27453177  T
Q  370 gaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||    
T  27453178 gaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttgccaacccaagaga 27453224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 27975035 - 27974774
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27975035 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa-aata 27974937  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcc 350  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||     
T  27974936 gcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttt-cccattctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagct 27974839  T
Q  351 ttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    || ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||    
T  27974838 tttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccgacccaagaga 27974774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22173275 - 22173100
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||    
T  22173275 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aactctag 22173178  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22173177 ccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcctaatatgaaccctaaaa 22173100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 170 - 419
Target Start/End: Original strand, 16264372 - 16264613
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 269  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||||||| |||||    
T  16264372 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aatagcttgcaagcttccacaa 16264469  T
Q  270 gaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagatccttccaactaa 368  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| |      
T  16264470 gaacaagacctaatttctacacatttgtg-ttacccactctctcaatgatgaaccct--aagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tgg 16264565  T
Q  369 tgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  16264566 tgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 16264613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 170 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 6794778 - 6794537
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 269  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||||||||||||    
T  6794778 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa-attagcttgcaagcttacacaa 6794680  T
Q  270 gaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagatccttccaactaat 369  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||  ||||||| | || | ||||||| || | || |||||| |  |    
T  6794679 gaacaagtcctaatttctacccatttgtg-tcacccactctcacaatatgaaccct--aagagaaaatacaaaaggaagcttttgttcattccaa-tggt 6794584  T
Q  370 gaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||    
T  6794583 gaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaactcaagaga 6794537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 27986529 - 27986278
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          |||| || |    
T  27986529 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaaa-a 27986441  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcct 351  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  27986440 gcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtttccc-actctctcaatatcaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagctt 27986342  T
Q  352 tagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    | ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  27986341 ttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 27986278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 8370569 - 8370311
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||    
T  8370569 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaat--ta 8370472  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcct 351  Q
    || |  ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| | ||||| | |    
T  8370471 gcttaaaagcttacacaagaacaagacataatttctacccatttgtg-tcacccactctcacaatatgaatcct--aagagaaaacacaaaaggaaactt 8370375  T
Q  352 tagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    | ||||||||||| |  |||| | ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  8370374 ttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 8370311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 33386731 - 33386497
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 269  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          |||| |||||  | |||||||||||||    
T  33386731 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaa-aatagtttgcaagcttacacaa 33386643  T
Q  270 gaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaata-tgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagatccttccaactaa 368  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| |      
T  33386642 gaacaagtcctaatttctacccatttgtgtttccc-actctctcaataatgaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tgg 33386545  T
Q  369 tgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||    
T  33386544 tgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttctcaacccaagaga 33386497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 153 - 325
Target Start/End: Original strand, 18656440 - 18656609
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||    
T  18656440 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctag 18656536  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccct 325  Q
    | ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  18656537 cattcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactataaaccct 18656609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Original strand, 36029097 - 36029357
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |    
T  36029097 ttgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--att 36029194  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc 349  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || | |||||||| |||||||| |||  ||||||| |||| | |||||||    
T  36029195 agcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcactcactctcaaaatatgaatcct--aagagaaaacacaaaaggaagc 36029291  T
Q  350 cttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
     || ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  36029292 ttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 36029357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Original strand, 21711227 - 21711486
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||    
T  21711227 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaat--ta 21711324  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccc-cactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcc 350  Q
    || |  |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||| ||| |||||||| |  ||||| |||  ||||||| |||| | |||||||     
T  21711325 gcttaaaagcttacacaagagcaagacctaatttctacccatttgtgttacccacactctca-ataatgaatcct--aagagaaaacacaaaaggaagct 21711421  T
Q  351 ttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    || ||||||||||| |  |||| | |||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  21711422 tttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactactcaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 21711486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 40592865 - 40592604
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |    
T  40592865 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctccaatcgactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--att 40592768  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc 349  Q
    ||| | |||||||||||||||||||   |||  |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| | |||||||    
T  40592767 agcttacaagcttacacaagaacaaaatctaatttctacccat-tttgtgtcacccactctcacaatatgaatcct--aagagaaaacacaaaaggaagc 40592671  T
Q  350 -cttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
      || ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  40592670 tttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 40592604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 2671813 - 2671753
Alignment:
Q  18 gtaatctatgagccaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671813 gtaatctatgagccaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 2671753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18552966 - 18552826
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||   |    
T  18552966 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat--t 18552869  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccat 293  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  18552868 agcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat 18552826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2673011 - 2672919
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  2673011 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 2672919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2677167 - 2677075
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  2677167 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 2677075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Original strand, 8512222 - 8512314
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  8512222 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 8512314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Original strand, 8517102 - 8517194
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  8517102 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 8517194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 197 - 415
Target Start/End: Original strand, 35925529 - 35925738
Alignment:
Q  197 gcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatg 296  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||  |  |||||||||| |||||||  ||||  |||||||||| ||    
T  35925529 gcagttctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--attagtttataagcttacactagaacaaaacctaatttctacccatttg 35925626  T
Q  297 tgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattac 396  Q
    || |  ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||    
T  35925627 tg-tcacccactctcacaatatgaatcct--aagagaaaacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttac 35925721  T
Q  397 aatgtttttcccaacccaa 415  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  35925722 aatg--tttcccaacccaa 35925738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 170 - 293
Target Start/End: Original strand, 48438236 - 48438358
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaatagccttcaagcttacaca 268  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||   |||| |  |||||||||||    
T  48438236 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat--tagcatataagcttacaca 48438333  T
Q  269 agaacaagccctagattctacccat 293  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||    
T  48438334 agaacaagacctaatttctacccat 48438358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Original strand, 32475490 - 32475580
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  32475490 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgt-ttacaaagagttacaagaa 32475580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Original strand, 32480348 - 32480438
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  32480348 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgt-ttacaaagagttacaagaa 32480438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 1736388 - 1736248
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |    
T  1736388 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--att 1736291  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccat 293  Q
    | | |  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  1736290 aacttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat 1736248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 3716085 - 3715838
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |    
T  3716085 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--att 3715988  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc 349  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||| |||  ||||||| |||| | || ||||    
T  3715987 agcttacaaacttacacaagaacaagacttaatttctacccat-tttgtgtcacccactttcacaatatgaatcct--aagagaaaacacaaaagaaagc 3715891  T
Q  350 -cttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttt 403  Q
      || ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3715890 tttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgttt 3715838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 30709873 - 30709733
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||   |    
T  30709873 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaagaaat--t 30709776  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccat 293  Q
    ||| |  |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||    
T  30709775 agcttataagcttacacaagagcaagacctaatttctacccat 30709733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 293
Target Start/End: Original strand, 25795803 - 25795925
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacaca 268  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| |  ||||||||| |    
T  25795803 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatctactaagatgaaagtgttacgaaagagttacaagaa--attagcttataagcttacaaa 25795900  T
Q  269 agaacaagccctagattctacccat 293  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||    
T  25795901 agaacaagacctaatttctacccat 25795925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22173100 - 22173053
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173100 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 22173053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Original strand, 24968112 - 24968204
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  24968112 ttgttgacccagttcagccaatgtggcttaattttggggagagagtagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 24968204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 293
Target Start/End: Original strand, 40844674 - 40844795
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaatagccttcaagcttacaca 268  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||   |||| |  |||||||||||    
T  40844674 ccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat--tagcttataagcttacaca 40844770  T
Q  269 agaacaagccctagattctacccat 293  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||    
T  40844771 agaacaagacctaatttctacccat 40844795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 246
Target Start/End: Original strand, 37466313 - 37466389
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 246  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  37466313 ccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaa 37466389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 3328439 - 3328300
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||| |||||| | | |||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||  | ||    
T  3328439 ttgttgacccagttcattccaatatgacctaatctagaggagagagcagcccttcaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa--atta 3328342  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccat 293  Q
    || |  ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||    
T  3328341 gcttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccat 3328300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4386976 - 4386915
Alignment:
Q  186 tgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  4386976 tgggggagagagcagctctccaatccaataagataaaagtgatacaaatgggttacaagaaa 4386915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3323755 - 3323679
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 246  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3323755 ccaatatgacctaatctgggagagagaacagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaa 3323679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 246
Target Start/End: Original strand, 26299011 - 26299087
Alignment:
Q  171 caatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 246  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26299011 caatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 26299087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1417573 - 1417479
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 246  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||| || || ||||||||||||| | |||| ||||||    
T  1417573 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatccactaagaagaaagtgttacaatgagttataagaaa 1417479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 170 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39040057 - 39039995
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaa 232  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39040057 ccaatatgacctaatctggggaagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 39039995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 8739291 - 8739239
Alignment:
Q  18 gtaatctatgagccaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctag 70  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  8739291 gtaatctatgagtcaaatggtttccaagcaaataacaacaaaaaccgccctag 8739239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 9091529 - 9091477
Alignment:
Q  18 gtaatctatgagccaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctag 70  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  9091529 gtaatctatgagtcaaatggtttccaagcaaataacaacaaaaaccgccctag 9091477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 427
Target Start/End: Original strand, 18656614 - 18656658
Alignment:
Q  383 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  18656614 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctca 18656658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 22173397 - 22173351
Alignment:
Q  31 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22173397 caaatggtctccaagcaaacaacaac-aaaacagccctagactagtgt 22173351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 47923989 - 47923894
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttc-agccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 246  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  47923989 ttgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagcccttcaatctactatgatgaaagtgctacaaaagagttacaagaaa 47923894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Original strand, 1305842 - 1305882
Alignment:
Q  37 gtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1305842 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagtctagtgt 1305882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Original strand, 7167115 - 7167173
Alignment:
Q  18 gtaatctatgagccaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7167115 gtaatctatgagcaaaatggtttccaagc-aacaacaac-aaaacagccctagactagtgt 7167173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 197
Target Start/End: Original strand, 10207939 - 10207983
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagag 197  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10207939 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagag 10207983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38210629 - 38210569
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatcca 212  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210629 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatcca 38210569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 78
Target Start/End: Original strand, 1309757 - 1309787
Alignment:
Q  48 aacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1309757 aacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 1309787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 417
Target Start/End: Original strand, 10274605 - 10274646
Alignment:
Q  376 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaaga 417  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  10274605 ctcactacccaaggtgaatataatgtgtttcccaacccaaga 10274646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 246
Target Start/End: Original strand, 21353604 - 21353661
Alignment:
Q  190 ggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  21353604 ggagagagcacctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaa 21353661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24695229 - 24695152
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 246  Q
    |||||||| |||||| |  ||||||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  24695229 ccaatatgacctaatctacgggagagagcaaccctctaatccgctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 24695152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Original strand, 32143214 - 32143254
Alignment:
Q  37 gtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32143214 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagacctagtctagtgt 32143254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 3323554 - 3323513
Alignment:
Q  376 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  3323554 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 3323513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 3328220 - 3328179
Alignment:
Q  376 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  3328220 ctcactacccaaggtgtttacaatgtttt--ccaacccaagaga 3328179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 4386840 - 4386799
Alignment:
Q  376 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4386840 ctcactactcaaggtgattacaatg--tttcccaacccaagaga 4386799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 419
Target Start/End: Original strand, 26299211 - 26299252
Alignment:
Q  376 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  26299211 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 26299252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 47923767 - 47923726
Alignment:
Q  376 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  47923767 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 47923726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 153 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 5674862 - 5674589
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5674862 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 5674763  T
Q  253 ccttcaagcttacacaag-aacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcct 351  Q
    | | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5674762 cttgcaagcttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctt 5674663  T
Q  352 tagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 426  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5674662 tagatccttccaa-tggtgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 5674589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Original strand, 11856979 - 11857154
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||    
T  11856979 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aactctag 11857076  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11857077 ccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 11857154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 171 - 419
Target Start/End: Original strand, 22709041 - 22709274
Alignment:
Q  171 caatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaag 270  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  22709041 caatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaa-aatagcttgcaagcttacacaag 22709129  T
Q  271 aacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagatccttccaactaatg 370  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||| |  ||    
T  22709130 aacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagtttttgatccttccaa-tggtg 22709228  T
Q  371 aactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    || | ||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  22709229 aaat-ctcactatccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 22709274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22010777 - 22010602
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||    
T  22010777 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aactctag 22010680  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010679 ccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttgatatttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 22010602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 5757571 - 5757311
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  5757571 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aata 5757474  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcc 350  Q
    || | |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||| | ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||     
T  5757473 gcttgcaagcttatacaagaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttccactctctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacggaaggaagct 5757376  T
Q  351 ttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    || ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  5757375 tttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 5757311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Original strand, 21356040 - 21356301
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21356040 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttactaagagttacaagaaa-aata 21356138  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcc 350  Q
     | | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| | |||||||     
T  21356139 acttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttt-ctcactctctcaataatgaaccct-aaagaaaagacacaaaaggaagct 21356236  T
Q  351 ttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    || ||| ||||||| | ||||| | |||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  21356237 tttgattcttccaa-tgatgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcctaacccaagaga 21356301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 14737648 - 14737482
Alignment:
Q  161 ccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaag 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||    
T  14737648 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaag 14737552  T
Q  261 c-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    | ||||| | |||||| ||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14737551 ctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 14737482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 14742516 - 14742342
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||    
T  14742516 ttgttgacccagttcagccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctag 14742420  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    ||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14742419 ccttcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 14742342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Original strand, 28184510 - 28184684
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |  |||    
T  28184510 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaacactc--tag 28184606  T
Q  253 ccttcaagctt-acacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28184607 ccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 28184684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 153 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28155649 - 28155477
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    |||    
T  28155649 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa--tttag 28155553  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 328  Q
    | ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28155552 ctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 28155477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 244
Target Start/End: Original strand, 6438513 - 6438595
Alignment:
Q  160 cccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  6438513 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 6438595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Original strand, 6005422 - 6005514
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  6005422 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 6005514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33330525 - 33330433
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  33330525 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 33330433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 5572316 - 5572076
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaatagccttcaagcttacaca 268  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||   |||| |  |||||||||||    
T  5572316 ccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat--tagcttataagcttacaca 5572219  T
Q  269 agaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagatccttccaacta 367  Q
    |||||||| ||||  |||||| ||| | ||| || ||||| ||| ||  ||||| |||  ||||||| |||| | ||||||| || |||| |||||| ||    
T  5572218 agaacaagacctaatttctacgcat-tttgtgtcacccacactctca--atgaatcct--aagagaaaacacaaaaggaagcttttgatcattccaa-ta 5572125  T
Q  368 atgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
     |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  5572124 gtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 5572076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 328
Target Start/End: Original strand, 16838749 - 16838923
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |  ||    
T  16838749 ttgttgacccagttcagccaatgtggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatc--ta 16838845  T
Q  252 gc-cttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 328  Q
    ||  ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  || ||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  16838846 gctattcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaa 16838923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 31086566 - 31086426
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||   |    
T  31086566 ttgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaggagttacaagaaat--t 31086469  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccat 293  Q
    ||| |  |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||    
T  31086468 agcttataagcttacacaagagcaagacctaatttctacccat 31086426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33336022 - 33335930
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  33336022 ttgttgacccagttcagccaatgtgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 33335930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 403
Target Start/End: Original strand, 18232867 - 18233096
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacaca 268  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||| |  |||||||||||    
T  18232867 ccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaattcactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--atcagcttataagcttacaca 18232964  T
Q  269 agaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagatccttccaact 366  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||| ||| |||| ||||| |||  ||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| |    
T  18232965 agaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccacactctcaataatgaatcct--aagagaaaacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-t 18233060  T
Q  367 aatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttt 403  Q
      |||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18233061 ggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgttt 18233096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10077240 - 10077118
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacaca 268  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||  | |||| |  ||||||||| |    
T  10077240 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaaaagttacaagaa--attagcttataagcttacaaa 10077143  T
Q  269 agaacaagccctagattctacccat 293  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||    
T  10077142 agaacaagacctaatttctacccat 10077118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Original strand, 11857154 - 11857201
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11857154 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 11857201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 14737482 - 14737435
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737482 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 14737435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22010602 - 22010555
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010602 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 22010555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 30126020 - 30125961
Alignment:
Q  19 taatctatgagccaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  30126020 taatctatgagccaaatggtctccaagctaactacaacaaaaacagccctagactagtgt 30125961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 403
Target Start/End: Original strand, 31979517 - 31979762
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||| ||||||||||  | |    
T  31979517 ttgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttgcaaaagagttacaagaa--att 31979614  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc 349  Q
    | | |  ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||| ||| ||  ||||| |||  ||||||| |||| | |||||||    
T  31979615 aacttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccatttttgtgtcacccacactctca--atgaatcct--aagagaaaacacaaaaggaagc 31979710  T
Q  350 cttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttt 403  Q
     || ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  31979711 ttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgttt 31979762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 14742342 - 14742295
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742342 acccaaagtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 14742295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21801429 - 21801342
Alignment:
Q  161 ccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 246  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  21801429 ccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagcgagcagctctccaatccactaagataaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 21801342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 233
Target Start/End: Original strand, 4629958 - 4630039
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa 233  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4629958 ttgttgactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaa 4630039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 246
Target Start/End: Original strand, 22963739 - 22963798
Alignment:
Q  188 ggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22963739 ggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 22963798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23824654 - 23824595
Alignment:
Q  188 ggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  23824654 ggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 23824595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 28155475 - 28155431
Alignment:
Q  383 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  28155475 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctca 28155431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Original strand, 11856854 - 11856900
Alignment:
Q  31 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11856854 caaatggtctccaagcaaacaacaac-aaaacagccctagactagtgt 11856900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 14737779 - 14737733
Alignment:
Q  31 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14737779 caaatggtctccaagcaaacaacaac-aaaacagccctagactagtgt 14737733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 78
Target Start/End: Original strand, 28184388 - 28184433
Alignment:
Q  32 aaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28184388 aaatggtctccaagcaaacaacaac-aaaacagccctagactagtgt 28184433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 232
Target Start/End: Original strand, 31936609 - 31936671
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaa 232  Q
    |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  31936609 ccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaatccactaatatgaaagtgttacaa 31936671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5017542 - 5017482
Alignment:
Q  172 aatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaa 232  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5017542 aatatgacctaatctaggggagagagcaaccctccaatctactatgatgaaagtgttacaa 5017482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 383 - 427
Target Start/End: Original strand, 6438680 - 6438724
Alignment:
Q  383 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  6438680 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctca 6438724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 14742638 - 14742592
Alignment:
Q  31 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14742638 caaatggtctccaagcatacaacaac-aaaacagccctagactagtgt 14742592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24436060 - 24435983
Alignment:
Q  157 taacccagttc-agccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa 233  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| | | |||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| |||||||||    
T  24436060 taacccagttcgatccaatatgacctactctaggggagagagcagccctccgatccactaggatgaaaatgttacaaa 24435983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 22010899 - 22010871
Alignment:
Q  31 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaa 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010899 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaa 22010871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Original strand, 28184684 - 28184734
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgttttt---cccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||    
T  28184684 acccaaggtgattactatgtttttttcccaaacccaagagacactctcaac 28184734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 216
Target Start/End: Original strand, 28955140 - 28955172
Alignment:
Q  184 tatgggggagagagcagctctccaatccaatat 216  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28955140 tatgggggagagatcagctctccaatccaatat 28955172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 153 - 429
Target Start/End: Original strand, 31180219 - 31180494
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  31180219 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaagggttacaagaaactctag 31180317  T
Q  253 ccttcaagctt-acacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcct 351  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  31180318 ccttcaagctttacacaaga-caaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccataaaagagaagacactagaggaagctt 31180416  T
Q  352 tagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31180417 tagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 31180494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 153 - 423
Target Start/End: Original strand, 24135853 - 24136121
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24135853 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctatccaatgcactaagatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aatag 24135951  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24135952 cttgcaagcttacacaagaacaagtcctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatgtgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttt 24136051  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacact 423  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24136052 agatccttccaa-tggtgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacact 24136121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 153 - 429
Target Start/End: Original strand, 30631411 - 30631687
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  30631411 ttgttgactcagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaagggttacaagaaactctag 30631509  T
Q  253 ccttcaagctt-acacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcct 351  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  30631510 ccttcaagctttacacatgaacaaaccatagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa-gagaagtcactagaggaagctt 30631608  T
Q  352 tagatccttccaactaatgaactcctc-actacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30631609 tagatccttccaactaatgaactcctccactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 30631687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Original strand, 38219403 - 38219666
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38219403 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aatag 38219501  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    | | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  38219502 cttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttt 38219601  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38219602 agatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagaga 38219666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 153 - 426
Target Start/End: Original strand, 35387667 - 35387937
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35387667 ttgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aatag 35387765  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    | | |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  35387766 cttgcaagcttacacaagaataagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagtttt 35387865  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 426  Q
    |||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  35387866 agatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgattacaatgttttttccaacccaagagaccctctc 35387937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 38192178 - 38192369
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38192178 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aatag 38192276  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagagg 345  Q
    | | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38192277 cttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagagg 38192369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Original strand, 15464536 - 15464798
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15464536 ttgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa-aata 15464634  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcc 350  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||     
T  15464635 gcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttt-cccactctcacaataatgaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagct 15464733  T
Q  351 ttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    || ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||    
T  15464734 tttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacgatg--tttcccaacccaagaga 15464798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 36932443 - 36932181
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36932443 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa-aata 36932345  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcc 350  Q
    || | |||| ||||| ||||||||| | ||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  36932344 gcttgcaagtttacataagaacaagacttaatttctacccatttgtgttt-cccactctctcaataatgaaccctaaaacagaagacacaagaggaagct 36932246  T
Q  351 ttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    || ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  36932245 tttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 36932181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 1457242 - 1457067
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||    
T  1457242 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aactctag 1457145  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457144 ccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 1457067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Original strand, 43592284 - 43592459
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||    
T  43592284 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aactctag 43592381  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43592382 ccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 43592459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 9353425 - 9353165
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |    
T  9353425 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aaaa 9353328  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcc 350  Q
    || | ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| | |||||||     
T  9353327 gcttgcaagcttacacaagaacaagatctaatttctacccatttgtgttt-cccactctctcaataatgaa-ccttaaagagaagacacaaaaggaagct 9353230  T
Q  351 ttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    || ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  9353229 tttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 9353165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Original strand, 27449819 - 27449994
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||    
T  27449819 ttgttgacccagttcagccaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aactctag 27449916  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27449917 ccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 27449994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 161 - 329
Target Start/End: Original strand, 43598737 - 43598904
Alignment:
Q  161 ccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaag 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||    
T  43598737 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aactctagccttcaag 43598834  T
Q  261 c-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    | ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43598835 ctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 43598904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 161 - 329
Target Start/End: Original strand, 43604229 - 43604396
Alignment:
Q  161 ccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaag 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||    
T  43604229 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aactctagccttcaag 43604326  T
Q  261 c-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    | ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43604327 ctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 43604396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 161 - 329
Target Start/End: Original strand, 43609721 - 43609888
Alignment:
Q  161 ccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaag 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||    
T  43609721 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aactctagccttcaag 43609818  T
Q  261 c-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    | ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43609819 ctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 43609888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Original strand, 15044691 - 15044865
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||    
T  15044691 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctag 15044787  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    | ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15044788 ctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 15044865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Original strand, 27444975 - 27445150
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||    
T  27444975 ttgttgacccagttcaggcaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aactctag 27445072  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27445073 ccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 27445150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Original strand, 14520234 - 14520494
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  14520234 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aata 14520331  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaa-tatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcc 350  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| || ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||     
T  14520332 gcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaattatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagct 14520429  T
Q  351 ttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    || ||||||||||| |  |||| | ||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  14520430 tttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactatccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 14520494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 11917065 - 11916805
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  |||    
T  11917065 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--aat 11916968  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc 349  Q
    ||  | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || |||||||||| |  |||||||||  ||||||| |||| | ||||||     
T  11916967 agtttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccactctcaaacgatgaaccct--aagagaaaacacaaaaggaagt 11916871  T
Q  350 cttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
     || ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  11916870 ttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 11916805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 12084268 - 12084010
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||    
T  12084268 ttgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--atta 12084171  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcct 351  Q
     | |  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||  |||| || |||| | |||||| ||    
T  12084170 acttaaaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtg-tcacccactctcacaatatgaatcct--aagaaaaaacacaaaaggaag-ct 12084075  T
Q  352 tagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |  |||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||    
T  12084074 tttatccttccaaatggtgaa-ttctcactacccaaggtgtttaaaatg--tttaccaacccaagaga 12084010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 153 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 28807652 - 28807485
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |  |||    
T  28807652 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaagaatc--tag 28807557  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccc 324  Q
    | ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||| |||||||||    
T  28807556 ctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 28807485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 153 - 403
Target Start/End: Original strand, 10281755 - 10282002
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |    
T  10281755 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--att 10281852  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc 349  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||| |||  ||||||| |||| | || ||||    
T  10281853 agcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccacactcacaatatgaatcct--aagagaaaacacaaaagaaagc 10281949  T
Q  350 -cttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttt 403  Q
      || ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10281950 tttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgttt 10282002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37556702 - 37556613
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaag 243  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  37556702 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaag 37556613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37561524 - 37561435
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaag 243  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  37561524 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaag 37561435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31401930 - 31401838
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  31401930 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 31401838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 170 - 326
Target Start/End: Original strand, 3880321 - 3880476
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacaca 268  Q
    |||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||  | ||||||||||||    
T  3880321 ccaatatgacctaatctgaggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagtttacaagcttacaca 3880418  T
Q  269 agaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaacccta 326  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  3880419 agaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccactctcacaatatgaatccta 3880476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Original strand, 2785380 - 2785472
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  2785380 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 2785472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31397073 - 31396981
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  31397073 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 31396981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 17004053 - 17003792
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||||  ||| | |    
T  17004053 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtatttcaaaagagttaca--aaaaatt 17003956  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc- 349  Q
    | | | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |   ||  | ||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| | |||||||     
T  17003955 aacttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttaatttcactcactctcacaatatgaatcct--aagagaaaacacaaaaggaagct 17003858  T
Q  350 cttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
     || ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  17003857 ttttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttccaaacccaagaga 17003792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Original strand, 33768184 - 33768276
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  33768184 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 33768276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Original strand, 33791321 - 33791413
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  33791321 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggaaagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 33791413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 246
Target Start/End: Original strand, 28832281 - 28832357
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 246  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  28832281 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaa 28832357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 1457067 - 1457020
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457067 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 1457020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Original strand, 27445150 - 27445197
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27445150 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 27445197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Original strand, 27449994 - 27450041
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449994 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 27450041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Original strand, 43592459 - 43592506
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592459 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 43592506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Original strand, 43598904 - 43598951
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598904 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 43598951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Original strand, 43604396 - 43604443
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604396 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 43604443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Original strand, 43609888 - 43609935
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609888 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 43609935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 42127483 - 42127364
Alignment:
Q  172 aatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaaga 271  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||  | |||| |  ||||||||| ||||    
T  42127483 aatatgacctaatctgggggagagagcagccccccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa--attagcttataagcttacaaaaga 42127386  T
Q  272 acaagccctagattctacccat 293  Q
    ||||| ||||  ||||||||||    
T  42127385 acaagtcctactttctacccat 42127364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 31300689 - 31300549
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||| | || ||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||    
T  31300689 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagagaaactctccaatccactaagatgaaagtgttataatgagttgcaagaaa-aata 31300591  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccat 293  Q
    |  | |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  31300590 gtttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccat 31300549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 291
Target Start/End: Original strand, 19588750 - 19588888
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||  ||||| |  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |    
T  19588750 ttgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--att 19588847  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctaccc 291  Q
    | | |  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  19588848 accttataagcttacacaagaacaagacctaatttctaccc 19588888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Original strand, 15044865 - 15044913
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15044865 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaac 15044913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 28807479 - 28807435
Alignment:
Q  383 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  28807479 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctca 28807435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7160977 - 7160912
Alignment:
Q  171 caatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaaggg 236  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  7160977 caatatgacctactataggggagagatcagctctccaatccactcagatgaaagtgatacaaaggg 7160912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24553581 - 24553506
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 246  Q
    |||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  24553581 ccaatatgacctaatctatgggagagagcagc-ctccactccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaa 24553506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 1457364 - 1457318
Alignment:
Q  31 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  1457364 caaatggtctccaagcaaacaacaac-aaagcagccctagactagtgt 1457318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 242
Target Start/End: Original strand, 2630235 - 2630326
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaa 242  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||| |||  | || |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2630235 ttgttaacctagttcggtccaatatgacctgctttgagggagatagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgatacaaaagggttacaa 2630326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Original strand, 43592161 - 43592207
Alignment:
Q  31 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  43592161 caaatggtctccaagcaaacaacaac-aaagcagccctagactagtgt 43592207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Original strand, 6741890 - 6741951
Alignment:
Q  186 tgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaag-ggttacaagaaa 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  6741890 tgggggatagagcagctctccaatccattaagatggaagtgatacaaagaagttacaagaaa 6741951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 9353536 - 9353496
Alignment:
Q  37 gtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9353536 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagacctagtctagtgt 9353496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Original strand, 15464424 - 15464464
Alignment:
Q  37 gtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15464424 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagacctagtctagtgt 15464464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Original strand, 24135740 - 24135780
Alignment:
Q  37 gtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24135740 gtctccaagcaaacaacaac-aaaacagccctagactagtgt 24135780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 33030999 - 33030938
Alignment:
Q  186 tgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaa-agggttacaagaaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| | |||  |||||||||||||    
T  33030999 tgggggagagagcagctctccaattcactaagatgaaagtgatgcaatggggttacaagaaa 33030938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Original strand, 35387555 - 35387595
Alignment:
Q  37 gtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35387555 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacaaccctagtctagtgt 35387595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Original strand, 38192064 - 38192104
Alignment:
Q  37 gtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38192064 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgt 38192104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Original strand, 38219289 - 38219329
Alignment:
Q  37 gtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38219289 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgt 38219329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4410301 - 4410241
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatcca 212  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  4410301 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 4410241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11181890 - 11181830
Alignment:
Q  187 gggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaaa 246  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  11181890 gggggagagagcaaccctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaa 11181830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 24553401 - 24553360
Alignment:
Q  376 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  24553401 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 24553360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 419
Target Start/End: Original strand, 28832480 - 28832521
Alignment:
Q  376 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  28832480 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 28832521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 153 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24787456 - 24787180
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24787456 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 24787358  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcct 351  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24787357 ccttcaagcattacacaagaacaaatcctagattctaccctttggtgtttcccaactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctt 24787258  T
Q  352 tagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24787257 tagatccttccaactaatgaactcctcactgcccaaggtgattataatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 24787180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 153 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 24202861 - 24202591
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24202861 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aatag 24202763  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24202762 cttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttt 24202663  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 426  Q
    |||||||||||| |  |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24202662 agatccttccaa-tggtgagat-ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 24202591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 153 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 19358935 - 19358677
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19358935 ttgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aatag 19358837  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  19358836 cttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttt 19358737  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaa 415  Q
    |||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19358736 agatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg-ttttcccaacccaa 19358677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 19361524 - 19361262
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19361524 ttgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aatag 19361426  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
      | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  19361425 tttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttt 19361326  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19361325 agatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg-ttttcccaacccaagaga 19361262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 153 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19380164 - 19379916
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19380164 ttgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aatag 19380066  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
      | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  19380065 tttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttt 19379966  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttt 404  Q
    |||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19379965 agatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttt 19379916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 171 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 13604697 - 13604455
Alignment:
Q  171 caatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaag 270  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  13604697 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaagaaa-aatagcttgcaaacttacacaag 13604599  T
Q  271 aacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagatccttccaactaat 369  Q
    |||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| |  |    
T  13604598 aacaagacctaatttctacccatttgtgttt-cccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tggt 13604502  T
Q  370 gaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  13604501 gaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 13604455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 257 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 19366297 - 19366137
Alignment:
Q  257 caagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagat 356  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19366297 caagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagat 19366198  T
Q  357 ccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19366197 ccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatatttttcccaacccaagaga 19366137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 170 - 419
Target Start/End: Original strand, 3281730 - 3281971
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 269  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  3281730 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacgatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aatagcttgcaagcttacacaa 3281827  T
Q  270 gaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagatccttccaactaa 368  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| |      
T  3281828 gaacaagacctaatttctacccatttgtgttt-cccactctctcaatgatgaaccct--aagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tgg 3281923  T
Q  369 tgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  3281924 tgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 3281971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 153 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 26644990 - 26644735
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  26644990 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccattatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aata 26644893  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcc 350  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| | |||||||     
T  26644892 gcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttt-ctcactctctcaatgatgaaccct--aagagaagacacaaaaggaagct 26644796  T
Q  351 ttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaa 415  Q
    || ||||||||||| |  |||| | |||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  26644795 tttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactactcaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaa 26644735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Original strand, 41390586 - 41390760
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||    
T  41390586 ttgttgacccagatcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctag 41390682  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  41390683 ccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 41390760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Original strand, 41398241 - 41398415
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||    
T  41398241 ttgttgacccaggtcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctag 41398337  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  41398338 ccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 41398415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 21536635 - 21536416
Alignment:
Q  179 cctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagcc 278  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||  |    
T  21536635 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aatagcttgcaagcttacacaagaacaatac 21536538  T
Q  279 ctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagatccttccaactaatgaactcct 377  Q
     ||  |||||||| | |||| || ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| |  |||| | ||    
T  21536537 ttaatttctacccgtttgtg-ttacccactctctcaatgatgaaccct--aagagaagacacaaaaggaagctttcgatccttccaa-tggtgaaat-ct 21536443  T
Q  378 cactacccaaggtgattacaatgtttt 404  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||    
T  21536442 tactacccaaggtgtttacaatgtttt 21536416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 153 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 25445169 - 25444996
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||    
T  25445169 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctag 25445073  T
Q  253 cct-tcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 328  Q
    | | |||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||| |  || ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25445072 cttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-gctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 25444996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Original strand, 37069774 - 37070031
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||     ||||    
T  37069774 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaa-----aata 37069868  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcc 350  Q
    |  | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| || ||||||| | |||| ||||||| | ||||||||||||| | |||||||     
T  37069869 gtttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactcactcaataatgaaccat-aaagagaagacacaaaaggaagct 37069966  T
Q  351 ttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    || ||||||||||| |  |||| | |||| || |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  37069967 tttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcattatccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 37070031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 47704029 - 47703855
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||  | |    
T  47704029 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaa--att 47703932  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaa 327  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  47703931 agcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccactctcacaatatgaatcctaa 47703855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 170 - 293
Target Start/End: Original strand, 32889461 - 32889583
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 269  Q
    |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  32889461 ccaatatgacctagtctgggggatagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaa-aatagcttgcaagcttacacaa 32889559  T
Q  270 gaacaagccctagattctacccat 293  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||    
T  32889560 gaacaagtcctaatttctacccat 32889583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 244
Target Start/End: Original strand, 39445505 - 39445594
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  39445505 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 39445594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 44023953 - 44023864
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  44023953 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 44023864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1055091 - 1055002
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  1055091 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcaactctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 1055002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43988544 - 43988452
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  43988544 ttgtttacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 43988452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16124591 - 16124469
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacaca 268  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| |  ||||||||| |    
T  16124591 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttataagcttacata 16124494  T
Q  269 agaacaagccctagattctacccat 293  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||    
T  16124493 agaacaagacctaatttctacccat 16124469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 281
Target Start/End: Original strand, 9476265 - 9476393
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||| |||||  | |    
T  9476265 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtattacaaaagagttataagaa--att 9476362  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaagcccta 281  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  9476363 agcttacaagcttacacaagaacaagaccta 9476393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 246
Target Start/End: Original strand, 19072932 - 19073027
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 246  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19072932 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 19073027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 246
Target Start/End: Original strand, 19120822 - 19120917
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 246  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19120822 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 19120917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 47098917 - 47098778
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||  | ||    
T  47098917 ttgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa--atta 47098820  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccat 293  Q
    || |  ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||    
T  47098819 gcttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccat 47098778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27104447 - 27104370
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 246  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27104447 ccaatataacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 27104370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 293
Target Start/End: Original strand, 29651833 - 29651955
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacaca 268  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||  | || | |  |||||||||||    
T  29651833 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaa--attaacttataagcttacaca 29651930  T
Q  269 agaacaagccctagattctacccat 293  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||    
T  29651931 agaacaagacctaatttctacccat 29651955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Original strand, 41390760 - 41390807
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390760 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 41390807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Original strand, 41398415 - 41398462
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398415 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 41398462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 276
Target Start/End: Original strand, 13598402 - 13598525
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||   |    
T  13598402 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagatacaagaaat--t 13598499  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaag 276  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||    
T  13598500 agcttataagcttacacaagaacaag 13598525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 233
Target Start/End: Original strand, 775694 - 775757
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa 233  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  775694 ccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaa 775757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 47102934 - 47102840
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 246  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||  ||||||||| || ||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  47102934 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccatccaatccactaagatgaaaatgttacaatgagttacaagaaa 47102840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 383 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 1054917 - 1054873
Alignment:
Q  383 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  1054917 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctca 1054873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 383 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 25439801 - 25439757
Alignment:
Q  383 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  25439801 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctca 25439757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 383 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 25444994 - 25444950
Alignment:
Q  383 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  25444994 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctca 25444950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 383 - 427
Target Start/End: Original strand, 39445679 - 39445723
Alignment:
Q  383 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  39445679 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctca 39445723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 383 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 44023779 - 44023735
Alignment:
Q  383 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  44023779 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctca 44023735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 48382524 - 48382479
Alignment:
Q  202 tctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaaa 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  48382524 tctccaatccaatatgatgaaagtgatacaaataggttacaagaaa 48382479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 47102713 - 47102672
Alignment:
Q  376 ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  47102713 ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 47102672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 18044 - 17781
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18044 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aatag 17946  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    | | |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  17945 cttgcaagcttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttt 17846  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||| |  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17845 agatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 17781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 24137 - 23874
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24137 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aatag 24039  T
Q  253 ccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcctt 352  Q
    | | |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  24038 cttgcaagcttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttt 23939  T
Q  353 agatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    |||||||||||| |  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23938 agatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 23874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 8512 - 8250
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8512 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa-aata 8414  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcc 350  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||  ||||||  || ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||     
T  8413 gcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacgtatttgtgttt-cccactctctcaataatgaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagct 8315  T
Q  351 ttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    ||  |||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  8314 tttaatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 8250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 171 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 133354 - 133112
Alignment:
Q  171 caatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaag 270  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  133354 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaagaaa-aatagcttgcaaacttacacaag 133256  T
Q  271 aacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagccttagatccttccaactaat 369  Q
    |||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| |  |    
T  133255 aacaagacctaatttctacccatttgtgttt-cccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaa-tggt 133159  T
Q  370 gaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  133158 gaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 133112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 276
Target Start/End: Original strand, 5687 - 5810
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaat 250  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||   |    
T  5687 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagatacaagaaat--t 5784  T
Q  251 agccttcaagcttacacaagaacaag 276  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||    
T  5785 agcttataagcttacacaagaacaag 5810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 233
Target Start/End: Original strand, 2514 - 2577
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa 233  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2514 ccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 2577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 35142 - 34967
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||  |||    
T  35142 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttagaag-aactctag 35045  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35044 ccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaa 34967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 34967 - 34920
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  34967 acccaaggtgattacaatgttttcccaaacccaagagacactctcaac 34920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 35264 - 35218
Alignment:
Q  31 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgt 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  35264 caaatggtctccaagcaaacaacaac-aaaacagccctagactagtgt 35218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 9722 - 9549
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatag 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||    
T  9722 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctag 9626  T
Q  253 ccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9625 ccttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 9549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 3754 - 3707
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaac 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3754 acccaaggtgattacaatgtttttcctaacctaagagacactctcaac 3707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 3833 - 3754
Alignment:
Q  250 tagccttcaagctt-acacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 329  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3833 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagat-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 3754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 382 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 9549 - 9514
Alignment:
Q  382 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaaga 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9549 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 9514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 36925 - 36665
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| | ||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  36925 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctcgccaacccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aata 36828  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcc 350  Q
    || | |||||||||||||||||||| | |   |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||     
T  36827 gcttgcaagcttacacaagaacaagacatgatttctacccatttgtgttt-cccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagct 36730  T
Q  351 ttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    || ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  36729 tttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttt--ccaacccaagaga 36665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 44054 - 43798
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  44054 ttgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aata 43957  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcc 350  Q
    || | |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||| | ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||     
T  43956 gcttgcaagcttatacaagaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttccactctctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaaggaagct 43859  T
Q  351 ttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaa 415  Q
    || ||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  43858 tttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaa 43798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 419
Target Start/End: Original strand, 85687 - 85947
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcag-ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaata 251  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||    
T  85687 ttgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctccaatccaccatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaat--ta 85784  T
Q  252 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctaccca-tatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcc 350  Q
    || |  |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| | ||||| | ||||||| |||||||||||  |||| ||| || |||| | ||||||      
T  85785 gcttaaaagcttacacaagagcaagacctaatttctacccattttgtgtct-cccactcccacaatatgaattctaagaga-aaaacacaaaaggaagtt 85882  T
Q  351 ttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 419  Q
    || ||||||||||| |  |||| | |||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  85883 tttgatccttccaa-tggtgaaat-ctcactacccaaagtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga 85947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 244
Target Start/End: Original strand, 368 - 457
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  368 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 383 - 427
Target Start/End: Original strand, 542 - 586
Alignment:
Q  383 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  542 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctca 586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14389 - 14297
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  14389 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 14297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19245 - 19153
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||||    
T  19245 ttgttgacccagttcagccattgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatacaatatg-tgagtgtgttacaaaagagttacaagaa 19153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2331 - 2239
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  2331 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 2239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 281
Target Start/End: Original strand, 10751 - 10861
Alignment:
Q  170 ccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacaca 268  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||  | ||||||||||||    
T  10751 ccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagtttacaagcttacaca 10848  T
Q  269 agaacaagcccta 281  Q
    |||||||| ||||    
T  10849 agaacaagaccta 10861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 149036 - 148944
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 245  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  149036 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 148944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 182044 - 181980
Alignment:
Q  153 ttgttaacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatg 217  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  182044 ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 181980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Original strand, 17286 - 17404
Alignment:
Q  171 caatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 269  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||   |||| |  ||||||||||||    
T  17286 caatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccattatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat--tagcttataagcttacacaa 17383  T
Q  270 gaacaagccctagattctacc 290  Q
    ||||||| ||||  |||||||    
T  17384 gaacaagacctaatttctacc 17404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 232
Target Start/End: Original strand, 45276 - 45337
Alignment:
Q  171 caatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaa 232  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  45276 caatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagcgttacaa 45337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University