View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1573_low_5 (Length: 422)

Name: NF1573_low_5
Description: NF1573
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1573_low_5
NF1573_low_5
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (18-414)||(39848394-39848792)
chr8 (29-414)||(38632696-38633080)
chr8 (75-402)||(38453694-38454020)
chr8 (258-414)||(38632646-38632802)
chr8 (29-399)||(34916096-34916465)
chr8 (29-206)||(39848684-39848861)
chr8 (142-369)||(34533703-34533927)
chr8 (142-400)||(34916371-34916628)
chr8 (31-368)||(34533566-34533900)
chr8 (142-369)||(34533841-34534065)
chr8 (157-352)||(38453608-38453800)
chr8 (29-206)||(38453613-38453790)
chr8 (31-206)||(38632975-38633149)
chr8 (259-358)||(34539015-34539114)
chr8 (153-373)||(38632682-38632897)
chr8 (142-347)||(39848659-39848861)
chr8 (29-369)||(34916266-34916603)
chr8 (42-207)||(34544774-34544939)
chr8 (268-352)||(34549178-34549262)
chr8 (180-350)||(34544772-34544939)
chr8 (271-400)||(39848368-39848499)
chr8 (321-400)||(34544858-34544939)
chr8 (108-205)||(34539027-34539124)
chr8 (263-348)||(38632548-38632633)
chr8 (260-347)||(38633062-38633149)
chr8 (259-369)||(34916542-34916652)
chr8 (142-207)||(34549182-34549247)
chr8 (146-207)||(38632572-38632633)
chr8 (263-363)||(39848261-39848361)
chr8 (142-222)||(39848281-39848361)
chr8 (261-336)||(34548525-34548600)
chr8 (273-332)||(36951478-36951537)
chr8 (27-87)||(38632830-38632890)
chr8 (275-413)||(34533933-34534073)
chr8 (29-89)||(34533566-34533626)
chr8 (129-189)||(36951475-36951535)
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (143-399)||(44474388-44474643)
chr4 (29-206)||(44474550-44474727)
chr4 (260-352)||(44474640-44474732)
[»] chr3 (3 HSPs)
chr3 (75-400)||(7045895-7046219)
chr3 (293-352)||(7045817-7045876)
chr3 (149-206)||(7045822-7045879)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 414
Target Start/End: Original strand, 39848394 - 39848792
Alignment:
Q  18 attgcgctgatacatggatttggagtttatagatatgcaaatgtgggtgtctatatcggaatttggaaaaaacatgaaagggatggattagggattatga 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39848394 attgcgcttatacatggatttggagtttatagatatgcaaatgtgggtgtctatatcggaatttggaaaaaacatgaaagggatggattagggattatga 39848493  T
Q  118 gctgggatactggcgatgtcttctatggttgttggtcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatggggatgtctccactggaaa 217  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39848494 gttgggatactggagatgtcttctatggttgttggtcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatggggatgtctccattggaaa 39848593  T
Q  218 ttggaaaacatggaaaatggatgatgggacagcgattttcgattgggctaatggtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggattt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39848594 ttggaaaacatggaaaatggatgatgggagagcgattttcgattgggctaatggtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggattt 39848693  T
Q  318 agagtttatagatttgcaaatggggatgtctacatcggaaattggaaaaaagac--aatggatggaacagggattatgagttgggctgctgatgatgtc 414  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  39848694 ggagtttatagatttgcaaatggggatgtctacatcggaaattggaaaaaagacaaaatggatggaacagggattatgagttgggttgttggtgatgtc 39848792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 414
Target Start/End: Original strand, 38632696 - 38633080
Alignment:
Q  29 acatggatttggagtttatagatatgcaaatgtgggtgtctatatcggaatttggaaaaaacatgaaagggatggattagggattatgagctgggatact 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||| || |||| |||||||||| |   || |||||||  ||| |||||||| |||| ||||    
T  38632696 acatggatttggagtttatagatatgcagatgggcatgtctacatgggaaattggaaaaaagac--aatggatggaaaaggaattatgagttgggctact 38632793  T
Q  129 ggcgatgtcttctatggttgttggtcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatggggatgtctccactggaaattggaaaacat 228  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  38632794 ggtgatgtcttcgatggttgttggtcagatggacttatacatggatttggagtttatagatctgcaaatggggatgtctacactggaaattggaaaatag 38632893  T
Q  229 ggaaaatggatgatgggacagcgattttcgattgggctaatggtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatag 328  Q
      ||||||||| |||||| |  |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  38632894 acaaaatggattatgggagatggattttggattcagctaacggtgatgtttttgatggttatttgtcaaatggacttagatatggatttggagtttataa 38632993  T
Q  329 atttgcaaatggggatgtctacatcggaaattggaaaaa-agacaatggatggaacagggattatgagttgggctgctgatgatgtc 414  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  38632994 atttgcaaatggggatgtttacgtaggaaattggaaaaagacaaaatggatggaatagggattatgacttgggctactggtgatgtc 38633080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 75 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 38454020 - 38453694
Alignment:
Q  75 ggaatttggaaaaaacatgaaagggatggattagggattatgagctgggatactggcgatgtcttctatggttgttggtcaaatggacttgcacatggat 174  Q
    |||| |||||||||| || |||| ||||||  ||||| |||||| |||  |  ||| ||||| ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  38454020 ggaaattggaaaaaagataaaagagatggaagagggactatgagttggcctgatggtgatgtttttgatggttgttggtcaaatagacttgtacatggat 38453921  T
Q  175 atggagtttatagatccgcaaatggggatgtctccactggaaattggaaaacatggaaaatggatgatgggacagcgattttcgattgggctaatggtga 274  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||| || ||| | ||||||   | | || ||||||  ||||| |||| |||||    
T  38453920 atggagtttatagatctgtaaatggggatgttaacactggaaattggaaagcagggagattggatg---gaagagggattttgaattggactaacggtga 38453824  T
Q  275 tgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatagatttgcaaatggggatgtctacatcggaaattggaaaaaagac--a 372  Q
    |   |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |    
T  38453823 tcaatttgatggttgtctgtcgcatggacttagacatggacttggagtttatagatttgtaaatggggatgtctacaccggaaattggaaagaagacgaa 38453724  T
Q  373 atggatggaacagggattatgagttgggct 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38453723 atggatggaacagggatcatgagttgggct 38453694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 258 - 414
Target Start/End: Original strand, 38632646 - 38632802
Alignment:
Q  258 gattgggctaatggtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatagatttgcaaatggggatgtctacatcggaa 357  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||    
T  38632646 gattgggctgatggtgatgcttttgatggttgtctatcaaatggatttagacatggatttggagtttatagatatgcagatgggcatgtctacatgggaa 38632745  T
Q  358 attggaaaaaagacaatggatggaacagggattatgagttgggctgctgatgatgtc 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  38632746 attggaaaaaagacaatggatggaaaaggaattatgagttgggctactggtgatgtc 38632802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 34916465 - 34916096
Alignment:
Q  29 acatggatttggagtttatagatatgcaaatgtgggtgtctatatcggaatttggaaaaaacatgaaagggatggattagggattatgagctgggatact 128  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||   |||| |||| |||||   |||| |||||||  |||||||||||  |||| || |    
T  34916465 acatggatatggagtttatagatttgcaaatggggatgtctatgctggaaattgggaaaaaggagaaaaggatggaaaagggattatgaattggggtaat 34916366  T
Q  129 ggcgatgtcttctatggttgttggtcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatggggatgtctccactggaaattggaaaacat 228  Q
    || | | | ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |||| ||||||||||||| ||| |     
T  34916365 ggtgctattttcgatggttattggtcaaatggactttcacatggatatggagtttatagatctgctaatggaaacgtctacactggaaattgggaaaaag 34916266  T
Q  229 ggaaaatggatgatgggacagcgattttcgattgggctaatggtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatag 328  Q
    || ||| |   ||||| | || |||| |  | |||||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||||||  | |||||| | | ||||||||||    
T  34916265 gggaaagg---gatggaaaagggattatgaaatgggctaacggtgatgttttcgatggttattggtcaaatggacagaaacatggctatggagtttatag 34916169  T
Q  329 atttgcaaatggggatgtctacatcggaaattggaaaa--aagacaatggatggaacagggattatgagttgg 399  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||  || | ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  34916168 atttgcaaatggagatgtctacactggaaattggaaaaataataaaatggatggaagagggattatgaattgg 34916096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 39848684 - 39848861
Alignment:
Q  29 acatggatttggagtttatagatatgcaaatgtgggtgtctatatcggaatttggaaaaaacatgaaagggatggattagggattatgagctgggatact 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||| |||| |  |    
T  39848684 acatggatttggagtttatagatttgcaaatggggatgtctacatcggaaattggaaaaaagacaaaatggatggaacagggattatgagttgggttgtt 39848783  T
Q  129 ggcgatgtcttctatggttgttggtcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatggggatgtc 206  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  39848784 ggtgatgtcttcgatggttgttggtcaaatggacttatacatggatatggagtttatagatatgctaacggggatgtc 39848861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 142 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34533927 - 34533703
Alignment:
Q  142 atggttgttggtcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatggggatgtctccactggaaattggaaaacatggaaaatggatga 241  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||||| | ||  ||   ||||    
T  34533927 atggttgttggtcaaatagacttaaagatggatatggagtttatagatatgcaaatggggatgtccacactggacattggaaaaaagggggaa---atga 34533831  T
Q  242 tgggacagcgattttcgattgggctaatggtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatagatttgcaaatggg 341  Q
    ||| | || |||| |    ||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||    
T  34533830 tggaaaagggattatgagatgggctaatggtgttgttttcgatggttgttggtcaaatggacttagacatggatatggagtttgtagatttacaaatggg 34533731  T
Q  342 gatgtctacatcggaaattggaaaaaag 369  Q
    |||||| |||  ||| ||||||||||||    
T  34533730 gatgtccacagtggacattggaaaaaag 34533703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 34916628 - 34916371
Alignment:
Q  142 atggttgttggtcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatggggatgtctccactggaaattggaaaacatggaaaatggatga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| ||| | || ||| |    |    
T  34916628 atggttgttggtcaaatggactttcacatggatatggagtttatagatctgcaaatggaaacgtctacactggaaattgggaaaaaggggaaagg---ca 34916532  T
Q  242 tgggacagcgattttcgattgggctaatggtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatagatttgcaaatggg 341  Q
    ||| | || |||| |  | |||||||| | ||||||||| ||||||| |  ||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  34916531 tggaaaagggattatgaaatgggctaacgatgatgttttcgatggttattggtcaaatggacataaacatggatatggagtttatagatttgcaaatggg 34916432  T
Q  342 gatgtctacatcggaaattggaaaaaag--acaatggatggaacagggattatgagttggg 400  Q
    ||||||||    ||||||||| ||||||    || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  34916431 gatgtctatgctggaaattgggaaaaaggagaaaaggatggaaaagggattatgaattggg 34916371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 34533900 - 34533566
Alignment:
Q  31 atggatttggagtttatagatatgcaaatgtgggtgtctatatcggaatttggaaaaaacatgaaagggatggattagggattatgagctgggatactgg 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| | |  |||  ||||||||||   | ||  ||||||  |||||||||||| |||| || |||    
T  34533900 atggatatggagtttatagatatgcaaatggggatgtccacactggacattggaaaaaagggggaaatgatggaaaagggattatgagatgggctaatgg 34533801  T
Q  131 cgatgtcttctatggttgttggtcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatggggatgtctccactggaaattggaaaacatgg 230  Q
     | ||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||  || |||| ||||||||| | ||    
T  34533800 tgttgttttcgatggttgttggtcaaatggacttagacatggatatggagtttgtagatttacaaatggggatgtccacagtggacattggaaaaaaggg 34533701  T
Q  231 aaaatggatgatgggacagcgattttcgattgggctaatggtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatagat 330  Q
     |||   | ||||| | || ||||      |||||    ||||||||||| |||||||||  || ||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||    
T  34533700 gaaa---aggatggaaaagggattaagagatgggcaggcggtgatgttttcgatggttgttggtaaaatggacttaaacatggatctggagtttatacat 34533604  T
Q  331 ttgcaaatggggatgtctacatcggaaattggaaaaaa 368  Q
     ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  34533603 atgctaatggggatgtctatattggaaaatggaaaaaa 34533566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34534065 - 34533841
Alignment:
Q  142 atggttgttggtcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatggggatgtctccactggaaattggaaaacatggaaaatggatga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||  | |||||| ||||| |  |  ||||||||| |||   ||||||| ||||     
T  34534065 atggttgttggtcaaatggacttaaacatggacatggggtttatagatatgtaaatggagatgtttatagaggaaattgggaaaatgggaaaatagatg- 34533967  T
Q  242 tgggacagcgattttcgattgggctaatggtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatagatttgcaaatggg 341  Q
      ||| || |||| |  |||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  34533966 --ggaaagggattatgaattgggttgatggtgatgtttttgatggttgttggtcaaatagacttaaagatggatatggagtttatagatatgcaaatggg 34533869  T
Q  342 gatgtctacatcggaaattggaaaaaag 369  Q
    |||||| |||  ||| ||||||||||||    
T  34533868 gatgtccacactggacattggaaaaaag 34533841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 38453800 - 38453608
Alignment:
Q  157 atggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatggggatgtctccactggaaattggaaaacatggaaaatggatgatgggacagcgatttt 256  Q
    ||||||||  |||||||  ||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||||||||||  |    |||||||||   | |||| |||  |    
T  38453800 atggacttagacatggacttggagtttatagatttgtaaatggggatgtctacaccggaaattggaaagaagacgaaatggatg---gaacagggatcat 38453704  T
Q  257 cgattgggctaatggtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatagatttgcaaatggggatgtctacat 352  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  38453703 gagttgggctaatggtgatgtttttgatggttgttggtcaaatggacttatacatggatctggagtttttagatttgcaaatggggatgtcgacat 38453608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 38453790 - 38453613
Alignment:
Q  29 acatggatttggagtttatagatatgcaaatgtgggtgtctatatcggaatttggaaaaaacatgaaagggatggattagggattatgagctgggatact 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||| || |||||| | ||||| ||||||| || | |||| |||||||  |||||| ||||| |||| || |    
T  38453790 acatggacttggagtttatagatttgtaaatggggatgtctacaccggaaattggaaagaagacgaaatggatggaacagggatcatgagttgggctaat 38453691  T
Q  129 ggcgatgtcttctatggttgttggtcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatggggatgtc 206  Q
    || ||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  38453690 ggtgatgtttttgatggttgttggtcaaatggacttatacatggatctggagtttttagatttgcaaatggggatgtc 38453613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 206
Target Start/End: Original strand, 38632975 - 38633149
Alignment:
Q  31 atggatttggagtttatagatatgcaaatgtgggtgtctatatcggaatttggaaaaa-acatgaaagggatggattagggattatgagctgggatactg 129  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| || ||| ||  | |||| ||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||  |||| |||||    
T  38632975 atggatttggagtttataaatttgcaaatggggatgtttacgtaggaaattggaaaaagaca--aaatggatggaatagggattatgacttgggctactg 38633072  T
Q  130 gcgatgtcttctatggttgttggtcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatggggatgtc 206  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  38633073 gtgatgtcttcgatggttgttggtcaaatgggcttatacatggatctggagtttatagatatgctaatggggatgtc 38633149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 34539114 - 34539015
Alignment:
Q  259 attgggctaatggtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatagatttgcaaatggggatgtctacatcggaaa 358  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  34539114 attgggctaatggcgatgtttttaatggttgttggtcaaatggacttagacatggttctggagtttatagatttgcaaatggggatgtgtacttcggaaa 34539015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 373
Target Start/End: Original strand, 38632682 - 38632897
Alignment:
Q  153 tcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatggggatgtctccactggaaattggaaaacatggaaaatggatgatgggacagcga 252  Q
    ||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||  ||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||| |  || ||||   ||||| | ||  |    
T  38632682 tcaaatggatttagacatggatttggagtttatagatatgcagatgggcatgtctacatgggaaattggaaaaaa--gacaatg---gatggaaaaggaa 38632776  T
Q  253 ttttcgattgggctaatggtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatagatttgcaaatggggatgtctacat 352  Q
    || |   |||||||| ||||||||| || |||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  38632777 ttatgagttgggctactggtgatgtcttcgatggttgttggtcagatggacttatacatggatttggagtttatagatctgcaaatggggatgtctacac 38632876  T
Q  353 cggaaattggaaaaaagacaa 373  Q
     ||||||||||||| ||||||    
T  38632877 tggaaattggaaaatagacaa 38632897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 347
Target Start/End: Original strand, 39848659 - 39848861
Alignment:
Q  142 atggttgttggtcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatggggatgtctccactggaaattggaaaacatggaaaatggatga 241  Q
    ||||||||  |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |   ||||||||||     
T  39848659 atggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttggagtttatagatttgcaaatggggatgtctacatcggaaattggaaaaaagacaaaatggatg- 39848757  T
Q  242 tgggacagcgattttcgattgggctaatggtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatagatttgcaaatggg 341  Q
      | |||| |||| |   ||||| |  ||||||||| || |||||||||  |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| || |||    
T  39848758 --gaacagggattatgagttgggttgttggtgatgtcttcgatggttgttggtcaaatggacttatacatggatatggagtttatagatatgctaacggg 39848855  T
Q  342 gatgtc 347  Q
    ||||||    
T  39848856 gatgtc 39848861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34916603 - 34916266
Alignment:
Q  29 acatggatttggagtttatagatatgcaaatgtgggtgtctatatcggaatttggaaaaaacatgaaagggatggattagggattatgagctgggatact 128  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||     ||||| |  |||| |||| |||||   |||||| |||||  |||||||||||  |||| ||      
T  34916603 acatggatatggagtttatagatctgcaaatggaaacgtctacactggaaattgggaaaaaggggaaaggcatggaaaagggattatgaaatgggctaac 34916504  T
Q  129 ggcgatgtcttctatggttgttggtcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatggggatgtctccactggaaattggaaaacat 228  Q
    |  ||||| ||| |||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||| ||| |     
T  34916503 gatgatgttttcgatggttattggtcaaatggacataaacatggatatggagtttatagatttgcaaatggggatgtctatgctggaaattgggaaaaag 34916404  T
Q  229 ggaaaatggatgatgggacagcgattttcgattgggctaatggtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatag 328  Q
    |  |||   | ||||| | || |||| |  |||||| |||||||| | |||| ||||||| |  |||||||||||||  |||||||| | ||||||||||    
T  34916403 gagaaa---aggatggaaaagggattatgaattggggtaatggtgctattttcgatggttattggtcaaatggactttcacatggatatggagtttatag 34916307  T
Q  329 atttgcaaatggggatgtctacatcggaaattggaaaaaag 369  Q
    || ||| |||||  | |||||||  ||||||||| ||||||    
T  34916306 atctgctaatggaaacgtctacactggaaattgggaaaaag 34916266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34544939 - 34544774
Alignment:
Q  42 gtttatagatatgcaaatgtgggtgtctatatcggaatttggaaaaaacatgaaagggatggattagggattatgagctgggatactggcgatgtcttct 141  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||| || || | |||||||||  || ||| |||||||  |||||||||||  |||| || ||| ||||| |||     
T  34544939 gtttatagatttgcaaatggggatgtctacattggtaattggaaaaatgataaaatggatggaagagggattatgaattgggttaatggtgatgttttca 34544840  T
Q  142 atggttgttggtcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatggggatgtct 207  Q
    |||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  34544839 atggatgttggtcaaatggacatagacatggatatggagtttatagattttcaaatgggaatgtct 34544774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 268 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 34549262 - 34549178
Alignment:
Q  268 atggtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatagatttgcaaatggggatgtctacat 352  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  34549262 atggtgatgtttttgatggttgttggtctaatggacttacacatggatatggagtttatagattttcaaatgggaatgtctacat 34549178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34544939 - 34544772
Alignment:
Q  180 gtttatagatccgcaaatggggatgtctccactggaaattggaaaacatgg-aaaatggatgatgggacagcgattttcgattgggctaatggtgatgtt 278  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||  ||||||||||   | | || |||| |  |||||| |||||||||||||    
T  34544939 gtttatagatttgcaaatggggatgtctacattggtaattggaaaa-atgataaaatggatg---gaagagggattatgaattgggttaatggtgatgtt 34544844  T
Q  279 tttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatagatttgcaaatggggatgtctac 350  Q
    ||  |||| |||  ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  34544843 ttcaatggatgttggtcaaatggacatagacatggatatggagtttatagattttcaaatgggaatgtctac 34544772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 271 - 400
Target Start/End: Original strand, 39848368 - 39848499
Alignment:
Q  271 gtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatagatttgcaaatggggatgtctacatcggaaattggaaaaaaga 370  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  39848368 gtgatgtttttgatggttgtcgatcaattgcgcttatacatggatttggagtttatagatatgcaaatgtgggtgtctatatcggaatttggaaaaaaca 39848467  T
Q  371 --caatggatggaacagggattatgagttggg 400  Q
       || |||||||  |||||||||||||||||    
T  39848468 tgaaagggatggattagggattatgagttggg 39848499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 321 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 34544939 - 34544858
Alignment:
Q  321 gtttatagatttgcaaatggggatgtctacatcggaaattggaaaaa--agacaatggatggaacagggattatgagttggg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  | | ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  34544939 gtttatagatttgcaaatggggatgtctacattggtaattggaaaaatgataaaatggatggaagagggattatgaattggg 34544858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34539124 - 34539027
Alignment:
Q  108 gggattatgagctgggatactggcgatgtcttctatggttgttggtcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatggggatgt 205  Q
    ||||||||||  |||| || ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34539124 gggattatgaattgggctaatggcgatgtttttaatggttgttggtcaaatggacttagacatggttctggagtttatagatttgcaaatggggatgt 34539027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 263 - 348
Target Start/End: Original strand, 38632548 - 38632633
Alignment:
Q  263 ggctaatggtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatagatttgcaaatggggatgtct 348  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  38632548 ggctaatggtgatgttttggatgcttgttggtcaaatggacttctacatggatttggagtttttagagctgcaaatggggatgtct 38632633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Original strand, 38633062 - 38633149
Alignment:
Q  260 ttgggctaatggtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatagatttgcaaatggggatgtc 347  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||  ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  38633062 ttgggctactggtgatgtcttcgatggttgttggtcaaatgggcttatacatggatctggagtttatagatatgctaatggggatgtc 38633149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34916652 - 34916542
Alignment:
Q  259 attgggctaatggtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatagatttgcaaatggggatgtctacatcggaaa 358  Q
    |||||| |||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||| |||||||||  | |||||||  |||||    
T  34916652 attggggtaatggtgctattttcgatggttgttggtcaaatggactttcacatggatatggagtttatagatctgcaaatggaaacgtctacactggaaa 34916553  T
Q  359 ttggaaaaaag 369  Q
    |||| ||||||    
T  34916552 ttgggaaaaag 34916542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34549247 - 34549182
Alignment:
Q  142 atggttgttggtcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatggggatgtct 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  34549247 atggttgttggtctaatggacttacacatggatatggagtttatagattttcaaatgggaatgtct 34549182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 207
Target Start/End: Original strand, 38632572 - 38632633
Alignment:
Q  146 ttgttggtcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatggggatgtct 207  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  38632572 ttgttggtcaaatggacttctacatggatttggagtttttagagctgcaaatggggatgtct 38632633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 363
Target Start/End: Original strand, 39848261 - 39848361
Alignment:
Q  263 ggctaatggtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttag-acatggatttagagtttatagatttgcaaatggggatgtctacatcggaaattg 361  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| | | |||||| | |||||| ||||||||||||||| || |||||||  ||||||||    
T  39848261 ggctaatggtgatgtttttaatggttgttggtcaaat-gactttgtatatggatatggagtttttagatttgcaaatggtgacgtctacactggaaattg 39848359  T
Q  362 ga 363  Q
    ||    
T  39848360 ga 39848361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 222
Target Start/End: Original strand, 39848281 - 39848361
Alignment:
Q  142 atggttgttggtcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatggggatgtctccactggaaattgga 222  Q
    ||||||||||||||||||   ||| | ||||||||||||||| |||||  |||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  39848281 atggttgttggtcaaatgactttgtatatggatatggagtttttagatttgcaaatggtgacgtctacactggaaattgga 39848361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 34548600 - 34548525
Alignment:
Q  261 tgggctaatggtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatagatttgcaa 336  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |   |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  34548600 tgggctaatggtgatattttcgatggtggctggtcaaatggagttagacatggatttgaagtttatatatttgcaa 34548525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 273 - 332
Target Start/End: Original strand, 36951478 - 36951537
Alignment:
Q  273 gatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatagattt 332  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  36951478 gatgtttttgatggttgttggttaaatggacttagacaaggatctggagtttatagattt 36951537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 87
Target Start/End: Original strand, 38632830 - 38632890
Alignment:
Q  27 atacatggatttggagtttatagatatgcaaatgtgggtgtctatatcggaatttggaaaa 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |  |||| ||||||||    
T  38632830 atacatggatttggagtttatagatctgcaaatggggatgtctacactggaaattggaaaa 38632890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 34534073 - 34533933
Alignment:
Q  275 tgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatagatttgcaaatggggatgtctacatcggaaattggaaaaa--agaca 372  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||  | | |||||||||| || |||||| ||||| || |  ||||||||| ||||   || |    
T  34534073 tgttttcgatggttgttggtcaaatggacttaaacatggacatggggtttatagatatgtaaatggagatgtttatagaggaaattgggaaaatgggaaa 34533974  T
Q  373 atggatggaacagggattatgagttgggctgctgatgatgt 413  Q
    || ||||| | ||||||||||| ||||| || || ||||||    
T  34533973 atagatgggaaagggattatgaattgggttgatggtgatgt 34533933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 34533626 - 34533566
Alignment:
Q  29 acatggatttggagtttatagatatgcaaatgtgggtgtctatatcggaatttggaaaaaa 89  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||||||| ||||  |||||||||    
T  34533626 acatggatctggagtttatacatatgctaatggggatgtctatattggaaaatggaaaaaa 34533566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 129 - 189
Target Start/End: Original strand, 36951475 - 36951535
Alignment:
Q  129 ggcgatgtcttctatggttgttggtcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagat 189  Q
    |||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||    
T  36951475 ggcgatgtttttgatggttgttggttaaatggacttagacaaggatctggagtttatagat 36951535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 143 - 399
Target Start/End: Original strand, 44474388 - 44474643
Alignment:
Q  143 tggttgttggtcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatggggatgtctccactggaaattggaaaacatggaaaatggatgat 242  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||| || |||   | |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||      
T  44474388 tggttcttggtcaaatggccttgtacatggatttggagtttttacatctctagatggggatgtctacgctggaaattggaaaacagggaaattggatg-- 44474485  T
Q  243 gggacagcgattttcgattgggctaatggtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatagatttgcaaatgggg 342  Q
     | | || || |||  |||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  44474486 -gaagagggaatttgaattgggctaatgatgatcattttaatggttgtctgtcaaatgggcttagacatggatttggagtttatacatttgtaaatgggg 44474584  T
Q  343 atgtctacatcggaaattggaaaaaagac--aatggatggaacagggattatgagttgg 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||  |||||||||    
T  44474585 atgtctatatcggaaattggaaaaatgacaaaatggatggaagagggaccatgagttgg 44474643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 44474550 - 44474727
Alignment:
Q  29 acatggatttggagtttatagatatgcaaatgtgggtgtctatatcggaatttggaaaaaacatgaaagggatggattagggattatgagctgggatact 128  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||||||  |  ||| |||||||  |||||  ||||| |||  || |    
T  44474550 acatggatttggagtttatacatttgtaaatggggatgtctatatcggaaattggaaaaatgacaaaatggatggaagagggaccatgagttggactaat 44474649  T
Q  129 ggcgatgtcttctatggttgttggtcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatggggatgtc 206  Q
    || ||||| ||  | ||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||||    
T  44474650 ggtgatgtttttgaaggttgctggtcaaatggacttatacatggatctggagtttttaaatttgcaaatggggatgtc 44474727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 352
Target Start/End: Original strand, 44474640 - 44474732
Alignment:
Q  260 ttgggctaatggtgatgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatagatttgcaaatggggatgtctacat 352  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||| |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  44474640 ttggactaatggtgatgtttttgaaggttgctggtcaaatggacttatacatggatctggagtttttaaatttgcaaatggggatgtcgacat 44474732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 3)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7046219 - 7045895
Alignment:
Q  75 ggaatttggaaaaaacatgaaagggatggattagggattatgagctgggatactggcgatgtcttctatggttgttggtcaaatggacttgcacatggat 174  Q
    |||| |||||||||| || ||| |||||||  ||||||| |||| |||| || ||| ||| | || ||| ||  || || ||||||| ||| ||||| ||    
T  7046219 ggaaattggaaaaaagataaaatggatggaaaagggattgtgagttgggctaatggtgattttttttatagtccttagttaaatggagttgtacatgaat 7046120  T
Q  175 atggagtttatagatccgcaaatggggatgtctccactggaaattggaaaacatg-gaaaatggatgatgggacagcgattttcgattgggctaatggtg 273  Q
     ||||  ||||| ||  | ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||  | || || ||||||  |||||| ||||||||    
T  7046119 ttggaagttatatatgtggaaacggggatgtctacactggatattggaaaa-atgagaaaatggatg--gaga-agggattttatattgggttaatggtg 7046024  T
Q  274 atgtttttgatggttgtatgtcaaatggacttagacatggatttagagtttatagatttgcaaatggggatgtctacatcggaaattggaa--aaaagac 371  Q
    ||  ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||||||   |||||||||||  || |||     
T  7046023 atagttttgatggttgcctgtcaaatggactcagagatggatttggagtttataaatttagaaatggtgatgtctacggaggaaattggaaagaagagaa 7045924  T
Q  372 aatggatggaacagggattatgagttggg 400  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  7045923 aatggatggaagagggatcatgagttggg 7045895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 293 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 7045876 - 7045817
Alignment:
Q  293 gtcaaatggacttagacatggatttagagtttatagatttgcaaatggggatgtctacat 352  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||| || |||||||||||| |||||| ||||    
T  7045876 gtcaaatggacttatacatggatatggagtttttacatttgcaaatggagatgtcaacat 7045817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7045879 - 7045822
Alignment:
Q  149 ttggtcaaatggacttgcacatggatatggagtttatagatccgcaaatggggatgtc 206  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||  |||||||| ||||||    
T  7045879 ttggtcaaatggacttatacatggatatggagtttttacatttgcaaatggagatgtc 7045822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University