View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15747_low_8 (Length: 226)

Name: NF15747_low_8
Description: NF15747
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15747_low_8
NF15747_low_8
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (9-219)||(33341812-33342022)
chr3 (9-219)||(7853913-7854123)
chr3 (9-219)||(54685415-54685625)
chr3 (10-184)||(17956099-17956274)
chr3 (10-197)||(30152893-30153082)
chr3 (10-188)||(45581591-45581771)
chr3 (10-176)||(54038239-54038406)
chr3 (20-164)||(16996176-16996321)
chr3 (20-172)||(19570805-19570957)
chr3 (80-219)||(19946629-19946768)
chr3 (20-160)||(50112168-50112309)
chr3 (23-172)||(317628-317778)
chr3 (10-176)||(3992522-3992690)
chr3 (20-172)||(22144389-22144542)
chr3 (23-166)||(16182065-16182209)
chr3 (10-167)||(53771022-53771181)
chr3 (10-176)||(23492346-23492513)
chr3 (10-140)||(16261463-16261593)
chr3 (20-144)||(12349847-12349970)
chr3 (20-172)||(13817492-13817642)
chr3 (10-167)||(2844172-2844331)
chr3 (20-172)||(35123674-35123826)
chr3 (20-172)||(6154448-6154600)
chr3 (20-172)||(14298399-14298551)
chr3 (20-172)||(14304026-14304178)
chr3 (20-167)||(53898572-53898719)
chr3 (20-188)||(17523006-17523176)
chr3 (10-167)||(38167896-38168054)
chr3 (20-172)||(6146863-6147015)
chr3 (80-219)||(47784924-47785064)
chr3 (20-172)||(14295415-14295569)
chr3 (20-166)||(17100636-17100783)
chr3 (20-166)||(17101321-17101468)
chr3 (23-176)||(11329081-11329235)
chr3 (42-183)||(17139474-17139616)
chr3 (42-176)||(14528151-14528286)
chr3 (138-219)||(9303343-9303425)
chr3 (75-167)||(28558188-28558282)
chr3 (29-176)||(12560362-12560510)
chr3 (20-176)||(54423986-54424142)
chr3 (20-167)||(19260956-19261104)
chr3 (50-176)||(55440996-55441123)
chr3 (20-172)||(14301042-14301196)
chr3 (20-167)||(12349656-12349809)
chr3 (42-192)||(12488865-12489017)
chr3 (104-167)||(14059414-14059478)
chr3 (43-182)||(17204667-17204807)
chr3 (65-191)||(38811170-38811297)
chr3 (80-192)||(1990759-1990873)
chr3 (110-191)||(17960520-17960602)
chr3 (11-73)||(34439451-34439513)
chr3 (28-139)||(8631801-8631912)
chr3 (67-183)||(9590918-9591035)
chr3 (80-197)||(12952915-12953034)
chr3 (23-142)||(17938582-17938701)
chr3 (42-183)||(15876034-15876176)
chr3 (80-167)||(3576615-3576703)
chr3 (42-142)||(16880131-16880231)
chr3 (10-50)||(28558271-28558311)
chr3 (80-191)||(34559857-34559969)
chr3 (108-182)||(17191511-17191583)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (20-218)||(11583982-11584184)
chr5 (10-176)||(2031783-2031950)
chr5 (10-197)||(11342635-11342825)
chr5 (20-197)||(1168321-1168500)
chr5 (20-172)||(28261498-28261651)
chr5 (10-176)||(21204898-21205066)
chr5 (20-165)||(21397073-21397222)
chr5 (21-172)||(21646857-21647009)
chr5 (20-172)||(11337303-11337455)
chr5 (20-172)||(24475560-24475708)
chr5 (20-172)||(4865239-4865393)
chr5 (20-188)||(20712036-20712206)
chr5 (10-176)||(21650668-21650835)
chr5 (137-219)||(16105573-16105656)
chr5 (21-141)||(21906729-21906846)
chr5 (137-219)||(109075-109158)
chr5 (20-144)||(24183249-24183370)
chr5 (29-183)||(19405503-19405658)
chr5 (23-191)||(7728378-7728547)
chr5 (50-172)||(23466434-23466557)
chr5 (23-192)||(3673818-3673989)
chr5 (42-191)||(21616974-21617124)
chr5 (29-192)||(23493875-23494040)
chr5 (108-183)||(16595474-16595550)
chr5 (108-191)||(32966352-32966436)
chr5 (23-175)||(19862183-19862336)
chr5 (180-218)||(24225596-24225634)
chr5 (80-192)||(6456580-6456694)
chr5 (80-191)||(37983325-37983434)
chr5 (80-183)||(29917931-29918035)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (10-219)||(18583264-18583457)
chr6 (10-184)||(35015272-35015447)
chr6 (20-184)||(19983416-19983581)
chr6 (10-167)||(26089718-26089875)
chr6 (21-172)||(25744331-25744483)
chr6 (80-219)||(18823573-18823712)
chr6 (10-176)||(18002611-18002777)
chr6 (20-160)||(32898779-32898920)
chr6 (10-167)||(23994904-23995063)
chr6 (80-219)||(18839428-18839567)
chr6 (20-172)||(22440911-22441064)
chr6 (23-172)||(31628245-31628395)
chr6 (14-176)||(15742339-15742505)
chr6 (21-176)||(18777119-18777275)
chr6 (20-172)||(13014826-13014979)
chr6 (137-219)||(4991002-4991085)
chr6 (23-166)||(16086001-16086144)
chr6 (23-166)||(18432626-18432770)
chr6 (23-197)||(18398890-18399065)
chr6 (23-184)||(18381803-18381965)
chr6 (20-157)||(18570271-18570409)
chr6 (108-219)||(17083383-17083496)
chr6 (23-191)||(22361885-22362054)
chr6 (42-167)||(25367376-25367502)
chr6 (23-172)||(16106499-16106643)
chr6 (68-176)||(28195259-28195367)
chr6 (110-167)||(15740211-15740269)
chr6 (78-183)||(18629786-18629892)
chr6 (42-188)||(25651197-25651345)
chr6 (108-191)||(25919571-25919655)
chr6 (108-167)||(33324675-33324735)
chr6 (108-167)||(35136217-35136277)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (20-219)||(75-274)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (10-176)||(41506924-41507091)
chr8 (10-184)||(24716977-24717152)
chr8 (10-157)||(39115267-39115415)
chr8 (23-172)||(41246635-41246785)
chr8 (20-172)||(19993171-19993324)
chr8 (20-167)||(22234920-22235068)
chr8 (20-172)||(20573309-20573461)
chr8 (10-188)||(16038996-16039176)
chr8 (20-144)||(37611675-37611798)
chr8 (10-176)||(274416-274583)
chr8 (10-176)||(641266-641433)
chr8 (10-176)||(827072-827239)
chr8 (20-188)||(20481565-20481735)
chr8 (23-160)||(20647949-20648087)
chr8 (23-160)||(20654025-20654163)
chr8 (29-183)||(39446892-39447046)
chr8 (104-172)||(20567200-20567268)
chr8 (80-172)||(20567335-20567427)
chr8 (80-172)||(20573528-20573620)
chr8 (68-172)||(25122513-25122618)
chr8 (29-191)||(38533607-38533770)
chr8 (87-197)||(29759893-29760005)
chr8 (42-191)||(5854572-5854722)
chr8 (31-167)||(21680984-21681121)
chr8 (111-191)||(22736046-22736127)
chr8 (23-184)||(23837163-23837325)
chr8 (108-172)||(15969796-15969860)
chr8 (10-140)||(24385867-24385988)
chr8 (42-191)||(26011452-26011602)
chr8 (113-184)||(21198362-21198434)
chr8 (42-192)||(33528383-33528533)
chr8 (42-191)||(15933256-15933406)
chr8 (23-76)||(20561751-20561804)
chr8 (67-192)||(23226240-23226368)
chr8 (66-192)||(23149736-23149865)
chr8 (115-184)||(24929018-24929087)
chr8 (67-184)||(31194488-31194606)
chr8 (108-184)||(17285232-17285309)
chr8 (78-192)||(22742717-22742833)
chr8 (80-183)||(27233244-27233348)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (42-219)||(3230-3407)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (20-219)||(21442-21642)
scaffold0120 (20-219)||(31141-31341)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (20-219)||(24890-25088)
scaffold0158 (20-150)||(25212-25341)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (10-176)||(111384-111550)
chr7 (10-197)||(126366-126555)
chr7 (10-188)||(32494161-32494341)
chr7 (23-219)||(7284180-7284376)
chr7 (20-172)||(39046740-39046893)
chr7 (20-176)||(11287390-11287547)
chr7 (13-167)||(42056407-42056563)
chr7 (20-172)||(35094794-35094946)
chr7 (10-167)||(2190301-2190460)
chr7 (20-172)||(12758965-12759117)
chr7 (10-167)||(3049565-3049723)
chr7 (10-176)||(2028893-2029061)
chr7 (20-172)||(15822548-15822701)
chr7 (10-184)||(1937127-1937290)
chr7 (42-172)||(45452305-45452435)
chr7 (20-176)||(3894998-3895155)
chr7 (20-183)||(16570122-16570287)
chr7 (20-183)||(16595375-16595540)
chr7 (23-167)||(26070384-26070529)
chr7 (23-167)||(26094171-26094316)
chr7 (20-172)||(47289758-47289911)
chr7 (20-176)||(12248237-12248395)
chr7 (20-172)||(44865204-44865360)
chr7 (42-183)||(49047813-49047955)
chr7 (20-183)||(13274753-13274918)
chr7 (66-219)||(14272049-14272203)
chr7 (20-172)||(143622-143769)
chr7 (13-184)||(17224047-17224220)
chr7 (20-188)||(12369957-12370127)
chr7 (42-191)||(16915067-16915217)
chr7 (42-191)||(48356602-48356752)
chr7 (13-192)||(13377485-13377667)
chr7 (80-192)||(4484683-4484797)
chr7 (113-192)||(4446168-4446249)
chr7 (113-192)||(14935319-14935400)
chr7 (113-192)||(15362912-15362993)
chr7 (108-191)||(34241393-34241477)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (10-184)||(6198-6373)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (10-184)||(31395-31570)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (10-184)||(41274-41449)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (10-197)||(14951713-14951902)
chr4 (10-184)||(25119322-25119498)
chr4 (20-172)||(53704850-53705003)
chr4 (10-184)||(5682642-5682817)
chr4 (16-197)||(55376710-55376893)
chr4 (20-184)||(34395222-34395387)
chr4 (16-172)||(23270047-23270204)
chr4 (20-172)||(44055892-44056045)
chr4 (20-172)||(16732146-16732299)
chr4 (20-160)||(44346816-44346957)
chr4 (22-172)||(53907818-53907966)
chr4 (10-167)||(15272427-15272586)
chr4 (20-172)||(30457880-30458033)
chr4 (20-157)||(21959580-21959718)
chr4 (20-166)||(820033-820177)
chr4 (20-128)||(8872588-8872699)
chr4 (117-219)||(16522748-16522851)
chr4 (20-167)||(12837317-12837464)
chr4 (20-167)||(30232613-30232761)
chr4 (42-176)||(18494467-18494602)
chr4 (117-219)||(9295624-9295727)
chr4 (29-167)||(13809636-13809775)
chr4 (21-144)||(45458973-45459096)
chr4 (43-183)||(27960938-27961078)
chr4 (108-191)||(37957230-37957314)
chr4 (42-219)||(7185983-7186159)
chr4 (82-191)||(7964890-7965000)
chr4 (23-144)||(52265628-52265749)
chr4 (108-191)||(19821981-19822065)
chr4 (23-192)||(15044784-15044955)
chr4 (13-192)||(15109458-15109640)
chr4 (108-184)||(14901197-14901274)
chr4 (108-184)||(47535251-47535328)
chr4 (66-184)||(41166109-41166228)
chr4 (80-192)||(41256546-41256660)
chr4 (43-191)||(18276392-18276541)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (10-176)||(12635-12802)
scaffold0039 (43-176)||(19049-19183)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (10-167)||(79846-80004)
scaffold0034 (20-144)||(46171-46295)
scaffold0034 (20-144)||(40664-40788)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (10-197)||(22366970-22367158)
chr1 (10-176)||(21859984-21860151)
chr1 (10-197)||(15861541-15861728)
chr1 (10-179)||(44035086-44035255)
chr1 (20-172)||(49967628-49967780)
chr1 (20-172)||(35522436-35522588)
chr1 (20-172)||(41212046-41212202)
chr1 (20-172)||(21718206-21718358)
chr1 (20-167)||(22403227-22403375)
chr1 (20-188)||(35054716-35054886)
chr1 (44-183)||(51627805-51627945)
chr1 (20-176)||(27329872-27330026)
chr1 (108-191)||(27674755-27674838)
chr1 (108-190)||(22829629-22829712)
chr1 (42-144)||(9784239-9784341)
chr1 (42-191)||(17608886-17609036)
chr1 (108-191)||(19603055-19603139)
chr1 (111-191)||(38033882-38033962)
chr1 (80-184)||(20177140-20177245)
chr1 (108-191)||(20955644-20955728)
chr1 (80-183)||(21194980-21195084)
chr1 (66-184)||(13377003-13377122)
chr1 (65-191)||(37234022-37234149)
chr1 (23-90)||(9784184-9784248)
chr1 (113-184)||(41229149-41229221)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (23-219)||(234-430)
scaffold0310 (143-219)||(6603-6679)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (10-184)||(162293-162469)
scaffold0016 (20-160)||(164204-164345)
scaffold0016 (10-184)||(166379-166547)
scaffold0016 (80-184)||(116690-116795)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (39-184)||(30056-30202)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (10-184)||(22274688-22274862)
chr2 (20-172)||(23836822-23836975)
chr2 (10-184)||(22283921-22284095)
chr2 (20-172)||(32465835-32465988)
chr2 (20-188)||(25876036-25876206)
chr2 (10-176)||(9653011-9653179)
chr2 (66-219)||(19433495-19433649)
chr2 (10-164)||(21274164-21274319)
chr2 (21-172)||(4448251-4448402)
chr2 (16-172)||(6879414-6879571)
chr2 (20-172)||(28974026-28974179)
chr2 (20-172)||(271148-271300)
chr2 (20-184)||(25601989-25602154)
chr2 (23-188)||(36890805-36890972)
chr2 (56-172)||(27261783-27261900)
chr2 (137-219)||(24826961-24827044)
chr2 (65-191)||(3403-3529)
chr2 (43-183)||(22579999-22580140)
chr2 (117-219)||(25212977-25213081)
chr2 (20-183)||(24571408-24571572)
chr2 (157-219)||(43645824-43645886)
chr2 (108-191)||(722353-722437)
chr2 (23-188)||(67952-68119)
chr2 (151-192)||(24884643-24884684)
chr2 (108-178)||(25305416-25305487)
chr2 (65-188)||(23821767-23821892)
chr2 (65-188)||(23830846-23830971)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (10-179)||(566-736)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (20-165)||(11825-11970)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (20-172)||(32180-32333)
scaffold0091 (20-172)||(41970-42123)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (20-172)||(132367-132520)
scaffold0021 (20-176)||(11660-11818)
scaffold0021 (21-136)||(88289-88404)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (20-172)||(70739-70892)
scaffold0001 (16-172)||(60784-60940)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (10-176)||(1093-1261)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (20-172)||(5363-5516)
scaffold0480 (20-176)||(8998-9156)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (10-176)||(13501-13669)
scaffold0251 (10-167)||(21475-21634)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (10-176)||(14921-15089)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (20-172)||(22668-22821)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (10-176)||(17519-17686)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (20-172)||(6962-7118)
scaffold0673 (20-172)||(939-1092)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (23-176)||(109582-109736)
scaffold0035 (21-176)||(118081-118237)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (20-172)||(254931-255084)
scaffold0011 (20-172)||(261537-261690)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (20-172)||(14854-15004)
scaffold0083 (79-172)||(14194-14288)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (20-165)||(7556-7699)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (23-160)||(85321-85459)
scaffold0014 (12-176)||(159275-159438)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (20-172)||(693-846)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (20-160)||(38287-38428)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (10-176)||(55553-55721)
scaffold0032 (104-191)||(93973-94061)
scaffold0032 (80-167)||(104799-104887)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (20-184)||(253106-253271)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (20-183)||(9903-10067)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (20-188)||(15588-15761)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (10-167)||(6658-6816)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (20-176)||(8960-9117)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (20-172)||(635-788)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (10-176)||(193603-193770)
scaffold0004 (10-167)||(186641-186799)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (23-166)||(1300-1444)
scaffold0359 (20-172)||(11771-11921)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (10-176)||(9622-9789)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (10-176)||(94948-95115)
scaffold0037 (20-176)||(24845-25002)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (23-176)||(10094-10248)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (113-219)||(28466-28573)
scaffold0150 (169-219)||(21637-21687)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (20-172)||(112662-112812)
scaffold0022 (42-183)||(109556-109698)
scaffold0022 (104-191)||(103123-103211)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (20-188)||(146561-146731)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (46-197)||(1332-1485)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (20-167)||(3-151)
scaffold0160 (80-176)||(3492-3589)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (23-184)||(4906-5068)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (23-172)||(11688-11837)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (11-172)||(48124-48286)
scaffold0068 (11-172)||(61572-61734)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (117-219)||(130486-130589)
scaffold0028 (42-167)||(79521-79647)
scaffold0028 (20-89)||(89586-89655)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (10-167)||(143-301)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (29-183)||(33854-34008)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (23-144)||(33668-33789)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (78-176)||(24372-24471)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (45-183)||(31010-31149)
scaffold0031 (29-87)||(70676-70734)
scaffold0031 (108-191)||(97403-97487)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (65-176)||(1889-2001)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (23-184)||(76967-77129)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (80-191)||(43975-44087)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (66-188)||(270-393)
[»] scaffold0740 (2 HSPs)
scaffold0740 (21-84)||(4351-4414)
scaffold0740 (104-172)||(4284-4353)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (106-176)||(7807-7878)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (50-160)||(3308-3419)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (103-188)||(6622-6708)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (42-191)||(69415-69565)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (29-191)||(2483-2646)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (159-216)||(12990-13048)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (108-184)||(35444-35520)
[»] scaffold1734 (1 HSPs)
scaffold1734 (127-184)||(1364-1422)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (179-219)||(12694-12734)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (106-176)||(22715-22786)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (23-192)||(2436-2607)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (184-219)||(3392-3427)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (80-192)||(107967-108080)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (137-188)||(5823-5875)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33342022 - 33341812
Alignment:
Q  9 ggtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgat 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33342022 ggtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattatgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgat 33341923  T
Q  109 gataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33341922 gataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgat 33341823  T
Q  209 tttgatgatgt 219  Q
    |||||| ||||    
T  33341822 tttgattatgt 33341812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7854123 - 7853913
Alignment:
Q  9 ggtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgat 108  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7854123 ggtaaattatgttcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgat 7854024  T
Q  109 gataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7854023 gataattcatggcttgggtttgcatgaatcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgat 7853924  T
Q  209 tttgatgatgt 219  Q
    |||||||||||    
T  7853923 tttgatgatgt 7853913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Original strand, 54685415 - 54685625
Alignment:
Q  9 ggtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgat 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54685415 ggtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgat 54685514  T
Q  109 gataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaa 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54685515 gataattcatggcttggatttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgctgttgctggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgat 54685614  T
Q  209 tttgatgatgt 219  Q
    |||||||||||    
T  54685615 tttgatgatgt 54685625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Original strand, 17956099 - 17956274
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  17956099 gtaaattatactcaattggtgtattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatg 17956198  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  17956199 atgatacatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 17956274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 30153082 - 30152893
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  30153082 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatg 30152983  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 197  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  30152982 atgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 30152893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 45581771 - 45581591
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45581771 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatg 45581672  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 188  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| | |||||| || |||||||||    
T  45581671 ataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 45581591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Original strand, 54038239 - 54038406
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  54038239 gtaaattatgctaaattggtgaattatgcatggttgttgatgaaatgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatagttgatg 54038338  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||| | ||||||    
T  54038339 ataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttaagaaataaattgttgttgttggttt 54038406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 164
Target Start/End: Original strand, 16996176 - 16996321
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  16996176 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 16996275  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgt 164  Q
    ||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  16996276 gcttgagtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagttgt 16996321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 19570805 - 19570957
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  19570805 ctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 19570904  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19570905 gcttgagtttgcataattcttggttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 19570957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 80 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19946768 - 19946629
Alignment:
Q  80 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 179  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19946768 tgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgt 19946669  T
Q  180 aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  19946668 aaaatgggttgataatatagaagtttgattttgatgatgt 19946629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 160
Target Start/End: Original strand, 50112168 - 50112309
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  50112168 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 50112267  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 160  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  50112268 gcttgagtttgcatgattcatggtttgtttttgagaaatgag 50112309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 172
Target Start/End: Original strand, 317628 - 317778
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  317628 aattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggct 317727  T
Q  123 tgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    || ||||| || |||| | | ||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  317728 tgagtttgtataattcttggtttgttgtggagaaatgagatgttgttggtg 317778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3992690 - 3992522
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | ||||    
T  3992690 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatg 3992591  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  3992590 ctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 3992522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 22144389 - 22144542
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |  ||||||||||| ||||    
T  22144389 ctcaattggtgaagtatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagccatgttgttgatgataatacatg 22144488  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  22144489 gcttgggtttgcatgattcatggtttgtggttgagaaatgagatgttgttggtg 22144542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 166
Target Start/End: Original strand, 16182065 - 16182209
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  16182065 aattggtgaattatgcattgtcgttgatgaattgtgataagtttaatgatcaattgttgttgttgttttttagtcatgttgttgatgataattcatggct 16182164  T
Q  123 tgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttg 166  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  16182165 tgggtttgcataattcttggattgttgttgagaaatgagatgttg 16182209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 53771181 - 53771022
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  |||    
T  53771181 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatg 53771082  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  53771081 ctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 53771022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23492513 - 23492346
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | ||||    
T  23492513 gtaaattatgctcaaatggtgaattatggatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatg 23492414  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  23492413 ctaattcatggcttgggtatgcatgattcatagtttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 23492346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 16261593 - 16261463
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | ||||    
T  16261593 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatg 16261494  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcat 140  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16261493 ctaattcatggcttgggtatgcatgattcat 16261463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 144
Target Start/End: Original strand, 12349847 - 12349970
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  12349847 ctcaattggtgaattatgcatcgtagttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 12349946  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgatt 144  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  12349947 gcttggg-ttgcatgattcatgatt 12349970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 13817642 - 13817492
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  13817642 ctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgt---tgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 13817546  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13817545 gcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 13817492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2844331 - 2844172
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | ||||    
T  2844331 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatg 2844232  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||| | |||||||||    
T  2844231 ctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaagtaagttgttgt 2844172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 35123826 - 35123674
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  35123826 ctcaattggtgaattatgctttgttgttattgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 35123727  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  35123726 gtttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 35123674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 6154448 - 6154600
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  6154448 ctcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 6154547  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgattgt-tgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | | | |||||||||| |||||| ||||    
T  6154548 gcttggg-ttgcatgattcataattttgtatggagaaatgagatgttgttggtg 6154600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 14298551 - 14298399
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||  |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  14298551 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtcatgttgttgatgataattcatg 14298452  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  14298451 gcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 14298399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 14304178 - 14304026
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||  |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  14304178 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtcatgttgttgatgataattcatg 14304079  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  14304078 gcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 14304026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 53898572 - 53898719
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||| |  ||| ||||||||||||    
T  53898572 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgcattgtgataagtttcatgatcaattaatgttgttgttgatatgtcatgttgttggtgataattcatg 53898671  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  53898672 gcttgggtttgcaagattcatgatttatgttgagaaatgagatgttgt 53898719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Original strand, 17523006 - 17523176
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgt-ttgatgataattcat 118  Q
    |||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| | |||||  | | |||||||||||||||    
T  17523006 ctcaattggtgaattatgctatgttattgatgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgctaagtcaattttgttgatgataattcat 17523105  T
Q  119 ggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 188  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||| ||| || |||||||||    
T  17523106 ggcttgggtttgcatgatttatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatgggt 17523176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 38168054 - 38167896
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | ||||    
T  38168054 gtaaattatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtaataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatg 38167955  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  38167954 ttaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 38167896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 6146863 - 6147015
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||    
T  6146863 ctcaattggtgaatcatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatggtcaattgttgctgttgttgttaagtcatgttgttgataataattcatg 6146962  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgattgt-tgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | | | |||||||||| |||||| ||||    
T  6146963 gcttgggttt-catgattcatgattttgtatggagaaatgagatgttgttggtg 6147015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 219
Target Start/End: Original strand, 47784924 - 47785064
Alignment:
Q  80 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 178  Q
    ||||||||||||| ||| || |  ||| | || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||    
T  47784924 tgttgttgttgttaagtgatgttgttgttaatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttggtgagaaatgagttgttgttggtgattctg 47785023  T
Q  179 taaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47785024 taaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 47785064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 14295569 - 14295415
Alignment:
Q  20 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 118  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||  | ||| || |  |||||||||||||||    
T  14295569 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgataattcat 14295470  T
Q  119 ggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14295469 ggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14295415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17100783 - 17100636
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  17100783 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatg 17100684  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 166  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  17100683 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttg 17100636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17101468 - 17101321
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  17101468 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatg 17101369  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 166  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  17101368 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttg 17101321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 176
Target Start/End: Original strand, 11329081 - 11329235
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||    
T  11329081 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggct 11329180  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  11329181 tgggtatgcatgattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggtagttt 11329235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 17139616 - 17139474
Alignment:
Q  42 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17139616 gttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatg 17139517  T
Q  142 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 183  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  17139516 atttgttgttgcgaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 17139474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 176
Target Start/End: Original strand, 14528151 - 14528286
Alignment:
Q  42 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14528151 gttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatggtaattcatggcttgggtatgaatgattcatg 14528250  T
Q  142 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14528251 atttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 14528286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 219
Target Start/End: Original strand, 9303343 - 9303425
Alignment:
Q  138 catgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9303343 catgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaacgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 9303425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28558282 - 28558188
Alignment:
Q  75 atggttgttg-ttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||    
T  28558282 atggttgttgattgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgt 28558188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 176
Target Start/End: Original strand, 12560362 - 12560510
Alignment:
Q  29 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 128  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| || |  | |||| |||||| ||||||||||     
T  12560362 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatatgattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgttaattcctggcttgggta 12560461  T
Q  129 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  12560462 tgcatgattcatgatttgatgttgagaaatgagatgttgttggtagttt 12560510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 54424142 - 54423986
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| | ||| |  |  | |||||| |||||||    
T  54424142 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattgctaagtgacgttgtggatgattattcatg 54424043  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  54424042 gcttgggtatgcatgattcatgatttgttatgagaaataagttgttgttgttggttt 54423986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 19260956 - 19261104
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | | || |  |  ||| |||||||||    
T  19260956 ctcaattggtgaattatactaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaaatgatgttatgaatgttaattcatg 19261055  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||||    
T  19261056 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttatgaaataagttgttgt 19261104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 176
Target Start/End: Original strand, 55440996 - 55441123
Alignment:
Q  50 tgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttg 148  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| || | ||| || |  |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || |||    
T  55440996 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgatgctaagtgatgttgttgatgataattcatgacttgggtatgcataattcatgattttttg 55441095  T
Q  149 ttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  55441096 ttgagaaatgagatgttgttggtggttt 55441123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 14301196 - 14301042
Alignment:
Q  20 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 118  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||  | ||| || |  |||||||| ||||||    
T  14301196 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgattattcat 14301097  T
Q  119 ggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    | ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14301096 gtctttggtttgcatgattcatgttttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14301042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 12349656 - 12349809
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  | |||||||| |||||    
T  12349656 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgtagatgataaatcatg 12349755  T
Q  120 gcttg-----ggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
    |||||     |||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||    
T  12349756 gcttggccatggtttgcatgattcataatttgatgatgagaaataagttgttgt 12349809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 192
Target Start/End: Original strand, 12488865 - 12489017
Alignment:
Q  42 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  12488865 gttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtgttcataattcatg 12488964  T
Q  142 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 192  Q
    | ||  || || ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  12488965 atttaatgatgggaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 12489017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 167
Target Start/End: Original strand, 14059414 - 14059478
Alignment:
Q  104 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgat-tgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  14059414 ttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcatgatctgttgatgagaaatgagatgttgt 14059478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 17204807 - 17204667
Alignment:
Q  43 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 142  Q
    |||||| |||||| ||||| |  ||||| | ||||| ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| |  || ||||||||    
T  17204807 ttgttgttgaattgtgataggaatcatgtttaatggatgttgttgttgctaagtaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgtttataattcatga 17204708  T
Q  143 tt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaa 182  Q
    || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17204707 tttgttgatgagaaatgagttgttgttagtggttttgtaaa 17204667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Original strand, 38811170 - 38811297
Alignment:
Q  65 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttg 163  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| || | ||||||||||||    
T  38811170 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgtgcataattcatgttttgatgatcagaaatgagttg 38811269  T
Q  164 ttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  38811270 ttgttggtgactttgtaaaatgggttga 38811297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 1990873 - 1990759
Alignment:
Q  80 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt-tgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggtttt 177  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||| || | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1990873 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttggtttgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttggtggtttt 1990774  T
Q  178 gtaaaatgggttgat 192  Q
    |||||||||||||||    
T  1990773 gtaaaatgggttgat 1990759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 191
Target Start/End: Original strand, 17960520 - 17960602
Alignment:
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  17960520 ataattcatgacttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgggaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 17960602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 34439451 - 34439513
Alignment:
Q  11 taaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatc 73  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34439451 taaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattatgataagtttcatgatc 34439513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 8631912 - 8631801
Alignment:
Q  28 gtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggt 127  Q
    ||||||||||| | ||||||| || ||| ||||| ||||||| |  ||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||||||||||||||    
T  8631912 gtgaattatgctttgttgttgttggattgtgataagtttcataacaaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggt 8631813  T
Q  128 ttgcatgattca 139  Q
    ||||||||||||    
T  8631812 ttgcatgattca 8631801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 183
Target Start/End: Original strand, 9590918 - 9591035
Alignment:
Q  67 catgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgtt 165  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| ||||||| ||||||| | |||  ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  9590918 catgttcaattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatgacttgggtgttcatagttcatgatttgatgatgagaaatgagttgtt 9591017  T
Q  166 gtcggtggttttgtaaaa 183  Q
    || | |||||||||||||    
T  9591018 gttgttggttttgtaaaa 9591035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12953034 - 12952915
Alignment:
Q  80 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 178  Q
    ||||||||||| | ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12953034 tgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttg 12952935  T
Q  179 t-aaaatgggttgataatga 197  Q
    | ||||||||||||| ||||    
T  12952934 taaaaatgggttgattatga 12952915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 17938701 - 17938582
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| || ||| || |   ||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||| || ||||||||||    
T  17938701 aattgatgaattatgctttgttgttgttggattgtggttattttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgataatcattcatggct 17938602  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatga 142  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  17938601 tgggtttacatgattcatga 17938582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15876176 - 15876034
Alignment:
Q  42 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  || ||||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  15876176 gttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttggtaagtgatgttgttaatgatgattcatggcttaggtattcataattcatg 15876077  T
Q  142 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 183  Q
    | |||| | |||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  15876076 atttgtggatgagaaatgagttggtgttggtagtttggtaaaa 15876034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 167
Target Start/End: Original strand, 3576615 - 3576703
Alignment:
Q  80 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  | | |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3576615 tgttgttgttgctaagtaatattgtggttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgt 3576703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 16880231 - 16880131
Alignment:
Q  42 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | |||| |||||| | ||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16880231 gttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttattgttgctaagtgatgttgtggatgataattcatggcttgggtgtgcataattcatg 16880132  T
Q  142 a 142  Q
    |    
T  16880131 a 16880131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 28558311 - 28558271
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgat 50  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28558311 gtaaatgatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat 28558271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 34559969 - 34559857
Alignment:
Q  80 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 178  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||||||||||| || | ||| | |||| ||| | || |||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  34559969 tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcataatttgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttg 34559870  T
Q  179 taaaatgggttga 191  Q
    |||||||||||||    
T  34559869 taaaatgggttga 34559857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 17191583 - 17191511
Alignment:
Q  108 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaa 182  Q
    |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  17191583 tgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgtt---ggtggttttgtaaa 17191511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11584184 - 11583982
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgc---atggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 116  Q
    |||||||||||||||||||    | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11584184 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgttgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattc 11584085  T
Q  117 atggcttggg-tttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatg 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  11584084 atggcttgggttttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttcgtggttttgtaaaatgggttgatgatgaagaagtttgtttttgatg 11583985  T
Q  216 atg 218  Q
    |||    
T  11583984 atg 11583982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2031950 - 2031783
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  2031950 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatg 2031851  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  2031850 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 2031783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11342825 - 11342635
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg-ttgtttagtcatatgtttgat 108  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  11342825 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgtttagtcatattgttgat 11342726  T
Q  109 gataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 197  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||    
T  11342725 gatgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgtcttggtgaaaatgggttgattatga 11342635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Original strand, 1168321 - 1168500
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  1168321 ctcaattggtgaattatgcaatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 1168420  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||  | ||||||||||||| ||||    
T  1168421 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatgggttgattatga 1168500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 28261651 - 28261498
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  28261651 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattgtgatatgttttatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgctgatgataattcatg 28261552  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28261551 gcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 28261498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21205066 - 21204898
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| || |  || ||     
T  21205066 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatatttgttgttgttgttaagtgatgttatttatt 21204967  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  21204966 ctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 21204898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 21397222 - 21397073
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttg---ttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| |  |||||||||||||    
T  21397222 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattgttgttaagtcatgttgttgatgataattc 21397123  T
Q  117 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgtt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||    
T  21397122 atggcttgggtttgcatgattcatggtttgttattgagaaatgagatgtt 21397073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 172
Target Start/End: Original strand, 21646857 - 21647009
Alignment:
Q  21 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcat-atgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21646857 tcaattggtgaattatgtatcgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgctgttgttgtttagtcatgatg-ttgatgataattcatg 21646955  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||||| || |||  | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21646956 gcttgggtttgtataattattggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 21647009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 11337303 - 11337455
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||| |||||||||||||    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  11337303 ctcatttggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgtcgttgatgataattcatg 11337402  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11337403 gcttgagtttacatgattcatgattgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 11337455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 24475708 - 24475560
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  24475708 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgt--tatgtttcatgatcaat---tgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 24475614  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24475613 gcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 24475560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 4865393 - 4865239
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa-ttcat 118  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |  |||||||||| |||||    
T  4865393 ctcaattggtgaattatgcattgtggttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttatggttgtttattcatgttgttgatgataatttcat 4865294  T
Q  119 ggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  4865293 ggcttgggtttgcataattcttgaattgttgttgagagatgaggtgttgttggtg 4865239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20712206 - 20712036
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||    
T  20712206 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgttaattcatg 20712107  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 188  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  20712106 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 20712036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21650835 - 21650668
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  |||    
T  21650835 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatg 21650736  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
     |||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||| | ||||||    
T  21650735 ctaattcatggtttgggtatgcatgattcataatttgttgtggtgaaataagttgttgttgttggttt 21650668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 137 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16105656 - 16105573
Alignment:
Q  137 tcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 219  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16105656 tcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 16105573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21906846 - 21906729
Alignment:
Q  21 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 120  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   || |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||    
T  21906846 tcaattgatgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat---tgatgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatgg 21906750  T
Q  121 cttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21906749 cttgggtttgcatgattcatg 21906729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 219
Target Start/End: Original strand, 109075 - 109158
Alignment:
Q  137 tcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 219  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  109075 tcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgatagagaagaagtttgattttgatgatgt 109158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 144
Target Start/End: Original strand, 24183249 - 24183370
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| | || |||||||| |  ||||| |   ||||||||||| |||    
T  24183249 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatgagtttcatgatcaattgatggtgttgttgatatgtcatgt---tgatgataattaatg 24183345  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgatt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24183346 gcttgggtttgcatgattcatgatt 24183370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19405658 - 19405503
Alignment:
Q  29 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 128  Q
    |||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||  || |  || || |  ||||||||||||||||||||||||     
T  19405658 tgaattatgattcgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatattgttactggtatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggta 19405559  T
Q  129 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 183  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  19405558 tgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 19405503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7728547 - 7728378
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||| || |||    
T  7728547 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataatttatcgct 7728448  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||    
T  7728447 tgggtgtgcataattcatgaattgttggtgagagatgaggtgttgttggtgactttgaaaaatgggttga 7728378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23466557 - 23466434
Alignment:
Q  50 tgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcat-atgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgtt 147  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23466557 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgtt-gatgatagttcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgtt 23466459  T
Q  148 gttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||| |||||  |||||| ||||    
T  23466458 gttgaggaatgatatgttgttggtg 23466434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3673989 - 3673818
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||  |  || |||||||| ||||||||||    
T  3673989 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagcgaggtggttgatgatgattcatggct 3673890  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 192  Q
    ||||| | ||| | ||| || ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  3673889 tgggtgttcataaatcacgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 3673818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21617124 - 21616974
Alignment:
Q  42 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  21617124 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgttgattcatggcttgggtgttcataattcatg 21617025  T
Q  142 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    | ||| || |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21617024 atttgatgatgagaagtgagctgttgtggttggttttgtaaaatgggttga 21616974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23494040 - 23493875
Alignment:
Q  29 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 128  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| |||||||||||||||     
T  23494040 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtg 23493941  T
Q  129 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 192  Q
    | ||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||| ||||||    
T  23493940 ttcataattcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgagttgat 23493875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16595550 - 16595474
Alignment:
Q  108 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 183  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  16595550 tgataattcatgacttgggtgtgcatgattcatgaattgttgatgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 16595474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 191
Target Start/End: Original strand, 32966352 - 32966436
Alignment:
Q  108 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattg-ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  32966352 tgataattcatggcttgagcgtgcataattcataattggttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 32966436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19862336 - 19862183
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |  |||||  |||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||| ||    
T  19862336 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtgcaattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgatgattcatgact 19862237  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggtt 175  Q
    ||||| | ||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  19862236 tgggtgttcataattcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttggtggtt 19862183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 218
Target Start/End: Original strand, 24225596 - 24225634
Alignment:
Q  180 aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24225596 aaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatg 24225634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6456694 - 6456580
Alignment:
Q  80 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 178  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| || |||||||| ||||||||| | || |||||    
T  6456694 tgttgttgttgttaagagatatcgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatgaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttgtttttg 6456595  T
Q  179 ta-aaatgggttgat 192  Q
    || ||| ||||||||    
T  6456594 tacaaacgggttgat 6456580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37983434 - 37983325
Alignment:
Q  80 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 178  Q
    ||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| |||||| |||||||| | ||| | ||| |||| | || ||| ||||||||||||||   ||||||||    
T  37983434 tgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcaggatttgatgatgaaaaatgagttgttgt---tggttttg 37983338  T
Q  179 taaaatgggttga 191  Q
    |||||||||||||    
T  37983337 taaaatgggttga 37983325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29918035 - 29917931
Alignment:
Q  80 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 178  Q
    ||||||||||| | ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||    
T  29918035 tgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgttgagaaataaattattgtcgttggttttg 29917936  T
Q  179 taaaa 183  Q
    |||||    
T  29917935 taaaa 29917931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18583457 - 18583264
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||                |||    
T  18583457 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgttg----------------atg 18583374  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18583373 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgatt 18583274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Original strand, 35015272 - 35015447
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  35015272 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatg 35015371  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  35015372 atgatacatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 35015447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Original strand, 19983416 - 19983581
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||    
T  19983416 ctcaattagtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatggttagtggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatg 19983515  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  19983516 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 19983581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26089875 - 26089718
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | ||||    
T  26089875 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatg 26089776  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
     |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  26089775 ctaattcatggtttgggtatgcatgattcataattgttgttgtgaaataagttgttgt 26089718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 172
Target Start/End: Original strand, 25744331 - 25744483
Alignment:
Q  21 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 120  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  25744331 tcaagtggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatgg 25744430  T
Q  121 cttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||||||| |||| | | ||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  25744431 cttgggtttgcataattcttggtttgttgtagagaaatgagatgttgttggtg 25744483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 219
Target Start/End: Original strand, 18823573 - 18823712
Alignment:
Q  80 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 179  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18823573 tgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgtggagaaatgagttgttggtggtggttttgt 18823672  T
Q  180 aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 219  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18823673 aaaatggcttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 18823712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Original strand, 18002611 - 18002777
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |  |  | ||||    
T  18002611 gtaaattatgctcaattgatgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgacgttatggatg 18002710  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  18002711 ctaattcatggcttgggtatgcatgattcatacttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 18002777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 32898920 - 32898779
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||    
T  32898920 ctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgaagttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattaatg 32898821  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 160  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  32898820 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgag 32898779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23995063 - 23994904
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  |||    
T  23995063 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatg 23994964  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  23994963 ctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 23994904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 219
Target Start/End: Original strand, 18839428 - 18839567
Alignment:
Q  80 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 179  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18839428 tgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgtggagaaatgagttgttggtggtggttttgt 18839527  T
Q  180 aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 219  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  18839528 aaaatgagttgaaaaagaagaagtttgattttgatgatgt 18839567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22441064 - 22440911
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  22441064 ctcaattggtgaattatgcattgttgttcatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 22440965  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  22440964 gcttggg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 22440911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 31628395 - 31628245
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  31628395 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 31628296  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  31628295 tgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgttgttggtg 31628245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Original strand, 15742339 - 15742505
Alignment:
Q  14 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatgg---ttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatga 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||| || |  |  |||     
T  15742339 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgc 15742438  T
Q  111 taattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  15742439 taattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgctggttt 15742505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18777275 - 18777119
Alignment:
Q  21 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 120  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || |  | |||| ||||||||||    
T  18777275 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatgaatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatgg 18777176  T
Q  121 cttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  18777175 cttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 18777119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 13014826 - 13014979
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| || |||| |||||| |  ||||||||||||| ||    
T  13014826 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcaagatcaattgttgttgctgatgttaagtcatgttgttgatgataattcgtg 13014925  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  13014926 gcttggg-ttgcatgattcttgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 13014979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 137 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4991085 - 4991002
Alignment:
Q  137 tcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 219  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4991085 tcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 4991002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 16086144 - 16086001
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| |  ||||| |  || ||||||||||||| ||    
T  16086144 aattggtgaattataccttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtcatgttgttaatgataattcatgact 16086045  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttg 166  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  16086044 tgggtttgcatgattcatgatttatgtggagaaatgagatgttg 16086001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18432770 - 18432626
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||||| |  || || |  |||||||||||||||||||    
T  18432770 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgatgttgttgatatgttatgttgttgatgataattcatggct 18432671  T
Q  123 tgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttg 166  Q
    ||||||||||||||| || | || ||||||| ||||||| |||||    
T  18432670 tgggtttgcatgattaatggtttattgttgaaaaatgagatgttg 18432626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18399065 - 18398890
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||    
T  18399065 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggct 18398966  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 197  Q
    ||||| ||||| |||||||| |  || | |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18398965 tgggtgtgcataattcatgaattgtgataagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgattatga 18398890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 184
Target Start/End: Original strand, 18381803 - 18381965
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |  ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||| |||| ||||||||||    
T  18381803 aattgttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggct 18381902  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    ||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18381903 tgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtgaaat 18381965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18570409 - 18570271
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  18570409 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagaagtagttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatg 18570310  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaat 157  Q
    || ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  18570309 gcctgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaat 18570271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 219
Target Start/End: Original strand, 17083383 - 17083496
Alignment:
Q  108 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatgaagaagttt 205  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || | |||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17083383 tgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgattagaaatgagttgttgttgttgtttttgtgaaaatgggttgataatgaagaagttt 17083482  T
Q  206 gaatttgatgatgt 219  Q
    || |||||||||||    
T  17083483 gattttgatgatgt 17083496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 191
Target Start/End: Original strand, 22361885 - 22362054
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||    
T  22361885 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgaaattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 22361984  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    ||||| | ||| ||||||| |||| || |||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  22361985 tgggtgttcataattcatgaattgatgatgagaattgagttgttgttgttagttttgtaaaatgggttga 22362054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 167
Target Start/End: Original strand, 25367376 - 25367502
Alignment:
Q  42 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25367376 gttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttatcgataattcatggcttgggtgtgcatgattcatg 25367475  T
Q  142 -attgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25367476 aattgttgatgagaaatgagatgttgt 25367502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16106643 - 16106499
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| |  ||||| |  || ||||||||||||| |     
T  16106643 aattggtgaattataccttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtcatgttgttaatgataattcatgac- 16106545  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
        ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  16106544 ----tttgcatgattcatgatttatgtggagaaatgagatgttgttggtg 16106499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 176
Target Start/End: Original strand, 28195259 - 28195367
Alignment:
Q  68 atgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| |||||    
T  28195259 atgatcaattgttgtggttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcataatt-atgatttattgttgagaaatgagatgttg 28195357  T
Q  167 tcggtggttt 176  Q
    | ||| ||||    
T  28195358 ttggtagttt 28195367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15740269 - 15740211
Alignment:
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15740269 ataattcatggtttgggtgtgcatgattcatgaattgttgatgagaaatgagatgttgt 15740211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 78 - 183
Target Start/End: Original strand, 18629786 - 18629892
Alignment:
Q  78 gttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| |||||||| |||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  18629786 gttgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttt 18629885  T
Q  177 tgtaaaa 183  Q
    |||||||    
T  18629886 tgtaaaa 18629892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25651345 - 25651197
Alignment:
Q  42 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  25651345 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 25651246  T
Q  142 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 188  Q
    ||| | || |||||| | ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  25651245 attggatgatgagaattaagttgttgttgttggttttgtgaaaatgggt 25651197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25919655 - 25919571
Alignment:
Q  108 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  25919655 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgaaaaatgagttattgttggtgactttgtaaaatgagttga 25919571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 33324735 - 33324675
Alignment:
Q  108 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  33324735 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgt 33324675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 167
Target Start/End: Original strand, 35136217 - 35136277
Alignment:
Q  108 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  35136217 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgt 35136277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 274 - 75
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  274 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 175  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  174 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgctgagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 75  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Original strand, 41506924 - 41507091
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  41506924 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatg 41507023  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  41507024 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 41507091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Original strand, 24716977 - 24717152
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  24716977 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatttgtttcatgttcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatg 24717076  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  24717077 atgatacatggcttgggtttgcatgattcataatttgttgttgataaatggattgttgttggtggttttgtaaaat 24717152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 39115415 - 39115267
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39115415 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatagttgttgatgaatcgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatg 39115316  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaat 157  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||| | || ||||||||||||    
T  39115315 ataattcatgacttgtgtatgcatgattcataatttattgttgagaaat 39115267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 41246785 - 41246635
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  41246785 aattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggct 41246686  T
Q  123 tgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  41246685 tgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgaaatgttgttggtg 41246635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 19993171 - 19993324
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  19993171 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataaatttcatcatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 19993270  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19993271 gctagggtttgcataattcttggattgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 19993324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 22234920 - 22235068
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  22234920 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 22235019  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
    | |||||||||||| |||| | | ||||||||||| | |||| ||||||    
T  22235020 gattgggtttgcataattcttggtttgttgttgaggattgagatgttgt 22235068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 20573309 - 20573461
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  20573309 ctcaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 20573408  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20573409 gcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20573461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 16038996 - 16039176
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | ||||    
T  16038996 gtaaattatgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatg 16039095  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 188  Q
     ||||| ||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  16039096 ctaatttatggcttggatatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 16039176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 37611798 - 37611675
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  37611798 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgtggttgatgataattcatg 37611699  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgatt 144  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||    
T  37611698 gcttggg-ttgcataattcatgatt 37611675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 274583 - 274416
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| || |  | ||||    
T  274583 gtaaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatg 274484  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  274483 ctaattcatggcttgggtatgcatgaatcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 274416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Original strand, 641266 - 641433
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| || |  | ||||    
T  641266 gtaaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatg 641365  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  641366 ctaattcatggcttgggtatgcatgaatcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 641433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Original strand, 827072 - 827239
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| || |  | ||||    
T  827072 gtaaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatg 827171  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  827172 ctaattcatggcttgggtatgcatgaatcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 827239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20481735 - 20481565
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||    
T  20481735 ctcaattggtgaattatactttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgttaattcatg 20481636  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 188  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  20481635 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 20481565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 160
Target Start/End: Original strand, 20647949 - 20648087
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| |  ||||| |  |||||| |||| |||||||    
T  20647949 aattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatgttaatccatggct 20648048  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgag 160  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  20648049 tgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaagtgag 20648087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 160
Target Start/End: Original strand, 20654025 - 20654163
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| |  ||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  20654025 aattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatgttaattcattgct 20654124  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgag 160  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  20654125 tgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaagtgag 20654163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 183
Target Start/End: Original strand, 39446892 - 39447046
Alignment:
Q  29 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 128  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||||| ||||||||||||||||||     
T  39446892 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataattcatggcttgggta 39446991  T
Q  129 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 183  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  39446992 tgcatgatt-atgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 39447046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 172
Target Start/End: Original strand, 20567200 - 20567268
Alignment:
Q  104 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20567200 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20567268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 172
Target Start/End: Original strand, 20567335 - 20567427
Alignment:
Q  80 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20567335 tgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20567427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 172
Target Start/End: Original strand, 20573528 - 20573620
Alignment:
Q  80 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20573528 tgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20573620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 25122618 - 25122513
Alignment:
Q  68 atgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgtt 165  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||    
T  25122618 atgatcaatagatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgtt 25122520  T
Q  166 gtcggtg 172  Q
    || ||||    
T  25122519 gttggtg 25122513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38533770 - 38533607
Alignment:
Q  29 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 128  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| |  || || |  ||||||||||||||||||||||||     
T  38533770 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaggtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtg 38533671  T
Q  129 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||||    
T  38533670 tgcataattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggagactttgtaaaatgggttga 38533607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 29760005 - 29759893
Alignment:
Q  87 gttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaat 184  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| ||  ||||    
T  29760005 gttgtttagtcatattgttgatgatgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggtttgttgttggtgttttggtgtaaat 29759906  T
Q  185 gggttgataatga 197  Q
    |||||||| ||||    
T  29759905 gggttgattatga 29759893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5854722 - 5854572
Alignment:
Q  42 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  5854722 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 5854623  T
Q  142 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    ||| | || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5854622 atttgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 5854572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21681121 - 21680984
Alignment:
Q  31 aattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttg 130  Q
    |||||||| | ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| | |||||||  || |  || || |  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  21681121 aattatgctttgttgttgttgaattgtgattagtttcatgatcaattgatgttgttactggtatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatg 21681022  T
Q  131 catgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  21681021 catgattcatgatttgttgtggagaaataagatgttgt 21680984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 191
Target Start/End: Original strand, 22736046 - 22736127
Alignment:
Q  111 taattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  22736046 taattcatggcttgggtgtgcataattcatgaattgttgatgaaaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 22736127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23837325 - 23837163
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| || || |  ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||| |||| ||||||||||    
T  23837325 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggct 23837226  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    ||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  23837225 tgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttggtggtggttttgtgaaat 23837163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15969860 - 15969796
Alignment:
Q  108 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||    
T  15969860 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgattgtagaggagaaatgagttgttgttggtg 15969796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Original strand, 24385867 - 24385988
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||         | | ||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | ||||    
T  24385867 gtaaattatgctcaattggtgaattaagcattgttgttgatgaat---------tgtaatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgattttatggatg 24385957  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcat 140  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24385958 ctaattcatggcttgggtatgcatgattcat 24385988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26011602 - 26011452
Alignment:
Q  42 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| | ||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  26011602 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttgaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 26011503  T
Q  142 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    ||| | || |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26011502 atttgatgatgagaattaagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 26011452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 184
Target Start/End: Original strand, 21198362 - 21198434
Alignment:
Q  113 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21198362 attcatggcttgggtgttcataattcatgatttgtggatgagaaatgagttgttgttggtggtttggtaaaat 21198434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33528533 - 33528383
Alignment:
Q  42 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| | ||| | ||||||||||| | ||  |||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  33528533 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatat-tttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 33528435  T
Q  142 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgat 192  Q
    ||| | || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  33528434 atttgatgatgagaaatgggttgttgttgttgattttgtaaaatgggttgat 33528383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15933406 - 15933256
Alignment:
Q  42 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| |   | | |||||    
T  15933406 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgtttgtaaatcatg 15933307  T
Q  142 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    ||| |  | |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15933306 atttgaagatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 15933256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 76
Target Start/End: Original strand, 20561751 - 20561804
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaat 76  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20561751 aattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 20561804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 192
Target Start/End: Original strand, 23226240 - 23226368
Alignment:
Q  67 catgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgtt 165  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| |  |||||||||  |||||    
T  23226240 catgttcaattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgattatgagaaatggattgtt 23226339  T
Q  166 gtcggtggttttgta--aaatgggttgat 192  Q
    || | ||||||||||  ||||||||||||    
T  23226340 gttgttggttttgtaagaaatgggttgat 23226368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23149865 - 23149736
Alignment:
Q  66 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 164  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| | ||| || |  ||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| | || ||| |||||||||||    
T  23149865 tcatgttcaatagttgtttttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgagtattcataattcatgatttgatgatgaaaaatgagttgt 23149766  T
Q  165 tgtcggtggttttgta--aaatgggttgat 192  Q
    ||| | ||||||||||  ||||||||||||    
T  23149765 tgttgttggttttgtaagaaatgggttgat 23149736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 184
Target Start/End: Original strand, 24929018 - 24929087
Alignment:
Q  115 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24929018 tcattgcttgggtatgcat-attcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 24929087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 184
Target Start/End: Original strand, 31194488 - 31194606
Alignment:
Q  67 catgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgtt 165  Q
    |||| ||||| | ||||||||||| | | | ||||  ||| |||| |||||| ||||||||   |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  31194488 catgttcaattgatgttgttgttgctaaatgatattgttgttgatgattcatagcttgggtgcacatgattcatgatttgttggtgaaaaatgagttgtt 31194587  T
Q  166 gtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    || ||||  ||||||||||    
T  31194588 gttggtgactttgtaaaat 31194606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17285309 - 17285232
Alignment:
Q  108 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||  | |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  17285309 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgacttgaggatgagaaatgagttgttgttggtagttttgcaaaat 17285232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22742833 - 22742717
Alignment:
Q  78 gttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||| |||||||||| | ||| | || | | |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  22742833 gttgttgttgttgttgaggaatattgttgttgatgattcgtggcttgggtgttcataaatcttggtttgttgatgagaaataagttgttgttgttggttt 22742734  T
Q  177 tgt-aaaatgggttgat 192  Q
    ||| |||||||||||||    
T  22742733 tgtaaaaatgggttgat 22742717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 183
Target Start/End: Original strand, 27233244 - 27233348
Alignment:
Q  80 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 178  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | |  |||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  27233244 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgataatgagaaataagttgttgttgttggttttg 27233343  T
Q  179 taaaa 183  Q
    |||||    
T  27233344 taaaa 27233348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3407 - 3230
Alignment:
Q  42 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3407 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 3308  T
Q  142 attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3307 attgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 3230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21642 - 21442
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||| | | | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  21642 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattatttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 21543  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21542 gcttgggtttgcatgattcatgaattgttgttaagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatg 21443  T
Q  219 t 219  Q
    |    
T  21442 t 21442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31341 - 31141
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||| |||||| |   |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| | |||| |||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  31341 ctcaattggtaaattatactatgttgttgatgaattgtgataagtttcattatcaattgatgtttttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 31242  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  31241 gcttgggtttgcatgattcatgaattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaaaaagtttgattttgatgatg 31142  T
Q  219 t 219  Q
    |    
T  31141 t 31141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25088 - 24890
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |  | ||| |  ||||||||||||||||    
T  25088 ctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggcatgttgttgatgataattcatg 24989  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24988 gcttgggtt-gcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 24890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 25341 - 25212
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |  | ||| |  ||||||||||||||||    
T  25341 ctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggcatgttgttgatgataattcatg 25242  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgtt 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25241 gcttggg-ttgcatgattcatgattgttgtt 25212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Original strand, 111384 - 111550
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  111384 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatg 111483  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  111484 ataattcatggcttgggtatgcatgattcaaatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 111550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 126555 - 126366
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  126555 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatactgttgatg 126456  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg-taaaatgggttgataatga 197  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |  ||||||||||||| ||||    
T  126455 atgatacatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggagaaaatgggttgattatga 126366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 32494161 - 32494341
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32494161 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatgattgatg 32494260  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 188  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| | |||||| || |||||||||    
T  32494261 ataattcatggcttgtgtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 32494341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 219
Target Start/End: Original strand, 7284180 - 7284376
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||| |||||||||||||    
T  7284180 aattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgataataattcatggct 7284279  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  7284280 tgagtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgttaaatgggttgataatggagaagtttgattttgacgatgt 7284376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 39046740 - 39046893
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  39046740 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 39046839  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgat-tgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  39046840 gcttgggtttgcataattcttgatctgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 39046893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11287547 - 11287390
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  11287547 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 11287448  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11287447 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 11287390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 42056407 - 42056563
Alignment:
Q  13 aattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||  |  ||| ||    
T  42056407 aattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatattatgaatgcta 42056506  T
Q  113 attcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  42056507 attcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 42056563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 35094946 - 35094794
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||    
T  35094946 ctcaattggtgaattatgcactgttgttgatgaattgttaaatgtttcatgatcaatg-ttgctgttgttgtttagtcatgttgttgatgataaatcatg 35094848  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  35094847 gcttgggtttgcataattcttgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 35094794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 2190301 - 2190460
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  | ||||    
T  2190301 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgatgttgttaagtgatgttatggatg 2190400  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||| | |||||||||    
T  2190401 ctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaagtaagttgttgt 2190460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 12759117 - 12758965
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||| ||||||||||||    
T  12759117 ctcaattggtgaattatgctatgttgttggtgaattatgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttggtgataattcatg 12759018  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  12759017 gcttgggtttgcaggatttatgatttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 12758965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3049723 - 3049565
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | ||||    
T  3049723 gtaaattatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatg 3049624  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  3049623 ttaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 3049565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2029061 - 2028893
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||| ||| || |  | ||||    
T  2029061 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtcgttgttaagtgatgttatggatg 2028962  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
     ||||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  2028961 ctaattcatgacttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 2028893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 15822548 - 15822701
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||||||    
T  15822548 ctcaaatggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatg 15822647  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  15822648 gcttgggtttgcatgattcatggtttgtggttgagaaatgagatgttgttggtg 15822701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Original strand, 1937127 - 1937290
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||            |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  1937127 gtaaattatgctcaattggtgaattatgtatggttgttgatgaatt------------atgatcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatg 1937214  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||    
T  1937215 atgatacatgacttgggtttgcatgattcataattttttgttgagaaatggattattgttggtggttttgtgaaat 1937290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 172
Target Start/End: Original strand, 45452305 - 45452435
Alignment:
Q  42 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45452305 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgtcgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttggcatgattcatg 45452404  T
Q  142 attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  45452405 atttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 45452435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3895155 - 3894998
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  3895155 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatg 3895056  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||  |||| ||||||||| | ||||||    
T  3895055 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtaaaataagttgttgttgttggttt 3894998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 183
Target Start/End: Original strand, 16570122 - 16570287
Alignment:
Q  20 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 118  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||  |||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||||||||||||    
T  16570122 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtcgtggatgataattcat 16570221  T
Q  119 ggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  16570222 ggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgtgggtgttttggtaaaa 16570287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16595540 - 16595375
Alignment:
Q  20 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 118  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||  |||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||||||||||||    
T  16595540 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtcgtggatgataattcat 16595441  T
Q  119 ggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  16595440 ggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgtgggtgttttggtaaaa 16595375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 167
Target Start/End: Original strand, 26070384 - 26070529
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||||| ||||||||||    
T  26070384 aattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattcatggct 26070483  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26070484 tgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaataagttgttgt 26070529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 167
Target Start/End: Original strand, 26094171 - 26094316
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||||| ||||||||||    
T  26094171 aattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattcatggct 26094270  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26094271 tgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaataagttgttgt 26094316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 47289911 - 47289758
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||| |   |||||||||||||||    
T  47289911 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgctgttgctgttaagtcatgttgatgatgataattcatg 47289812  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||| | |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  47289811 gcttgtg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 47289758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Original strand, 12248237 - 12248395
Alignment:
Q  20 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 118  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | ||| || |  | ||||||||| |||    
T  12248237 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgataatgcat 12248336  T
Q  119 ggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12248337 gacttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 12248395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 44865360 - 44865204
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt---agtcatatgtttgatgataattc 116  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    |||||| |  || ||||||||||    
T  44865360 ctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaattgttgttgttgttgttgttaagtcatgtagtttatgataattc 44865261  T
Q  117 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  44865260 atggcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 44865204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 183
Target Start/End: Original strand, 49047813 - 49047955
Alignment:
Q  42 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49047813 gttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgctgataattcatggcttgggtatgcatgattcatg 49047912  T
Q  142 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 183  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  49047913 atttgttgttgagaaacgagatgttgttggtagtttggtaaaa 49047955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13274918 - 13274753
Alignment:
Q  20 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 118  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||    
T  13274918 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcat 13274819  T
Q  119 ggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  13274818 ggctttggtatgcatgattcatgttttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 13274753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 219
Target Start/End: Original strand, 14272049 - 14272203
Alignment:
Q  66 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 164  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | | | ||||  ||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  14272049 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaaatgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgattagatgatgagaaatgagttgt 14272148  T
Q  165 tgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 219  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||    
T  14272149 tggtggtggttttgtaaaatgggttgatgatgaagaagttttattttaatgatgt 14272203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 143769 - 143622
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||      ||||||||||| |||||| |  || |||||||||||||    
T  143769 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaa------ttgttgttgttaagtcatgttgttaatgataattcatg 143676  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  143675 gcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 143622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 184
Target Start/End: Original strand, 17224047 - 17224220
Alignment:
Q  13 aattatactcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 111  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||| |||||| |  || |  ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  || |||||    
T  17224047 aattatactcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgttgtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttaatgat 17224146  T
Q  112 aattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
     ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17224147 gattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaat 17224220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Original strand, 12369957 - 12370127
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||| | ||||||||||| | ||| || |  |  || || |||||||    
T  12369957 ctcaattggtgaattatgccttgttgttgttgaattgtgataactttcatgattaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtgcataattattcatg 12370056  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 188  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| || | |||||| || |||||||||    
T  12370057 gcttaggtatgcatgattcatgatttgttattgagaaataagttgtagttgttggtttggtgaaaatgggt 12370127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Original strand, 16915067 - 16915217
Alignment:
Q  42 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  16915067 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtcatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 16915166  T
Q  142 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    | ||| ||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16915167 atttgatgaagagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 16915217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 48356752 - 48356602
Alignment:
Q  42 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  48356752 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 48356653  T
Q  142 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    ||| | || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  48356652 atttgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 48356602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13377667 - 13377485
Alignment:
Q  13 aattatactcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 111  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||||||||    
T  13377667 aattatactcaaattgattaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgat 13377568  T
Q  112 aattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 192  Q
     ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  13377567 gattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 13377485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4484797 - 4484683
Alignment:
Q  80 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 178  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||||| |||||||| | ||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||   ||||||||    
T  4484797 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtattcatgaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgtgcttggttttg 4484698  T
Q  179 t-aaaatgggttgat 192  Q
    | |||||||||||||    
T  4484697 taaaaatgggttgat 4484683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4446249 - 4446168
Alignment:
Q  113 attcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 192  Q
    ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  4446249 attcatggcttgggtgttcataaatcatgaattgatgatgtgaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 4446168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14935400 - 14935319
Alignment:
Q  113 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 192  Q
    |||||||| |||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  14935400 attcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgttgatgagaaatcagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 14935319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15362993 - 15362912
Alignment:
Q  113 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 192  Q
    |||||||| |||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  15362993 attcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgttgatgagaaatcagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 15362912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 191
Target Start/End: Original strand, 34241393 - 34241477
Alignment:
Q  108 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    |||| |||||||||||| || | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  34241393 tgatgattcatggcttgagtgttcataaatcatgatttgatgatgaaaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaagggttga 34241477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Original strand, 6198 - 6373
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  6198 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtaatattgttgatg 6297  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  6298 atgatacatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 6373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Original strand, 31395 - 31570
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  31395 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatg 31494  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    || || |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  31495 atgatacatggcttaggtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 31570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 41449 - 41274
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  41449 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatg 41350  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    || || |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  41349 atgatacatggcttaggtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 41274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14951902 - 14951713
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  14951902 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttatttagtcatattgttgatg 14951803  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 197  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  14951802 atgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 14951713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Original strand, 25119322 - 25119498
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  25119322 gtaaattatgatcaattggtgaattatgcatggtttttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgata 25119421  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  25119422 atgatacatggcttgggtttgcatgattcataattttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 25119498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 53704850 - 53705003
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  53704850 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 53704949  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53704950 gcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 53705003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Original strand, 5682642 - 5682817
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||    
T  5682642 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattattggttgttgttgttttttattcatattgttgatg 5682741  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    || ||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  5682742 atgatatatgtcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 5682817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Original strand, 55376710 - 55376893
Alignment:
Q  16 tatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | | || |  ||||||||||||    
T  55376710 tatactcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaaattatgttgttgatgataatt 55376809  T
Q  116 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||  | ||||||||||||| ||||    
T  55376810 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgatgttggtgttttgatgaaaatgggttgattatga 55376893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 34395387 - 34395222
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  34395387 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatg 34395288  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  34395287 gcttgagtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 34395222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Original strand, 23270047 - 23270204
Alignment:
Q  16 tatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  23270047 tatactcaattgatgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtatcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 23270146  T
Q  116 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  23270147 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgtggttgagaaatgagatgttgttggtg 23270204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 44056045 - 44055892
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  44056045 ctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtggtttagccatgttgttgatgataattcatg 44055946  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  44055945 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 44055892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16732299 - 16732146
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  16732299 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 16732200  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16732199 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 16732146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 44346957 - 44346816
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||    
T  44346957 ctcaattggtgaattatacattgttgttcatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtgatgtcgttgatgataattcatg 44346858  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 160  Q
    |||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  44346857 gcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgag 44346816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 172
Target Start/End: Original strand, 53907818 - 53907966
Alignment:
Q  22 caattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggc 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  53907818 caattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaatgtttcatgatcaa---ttgttgttgttgattagtcatgttgttgatgataattcatggc 53907914  T
Q  122 ttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53907915 ttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 53907966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 15272427 - 15272586
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  |||    
T  15272427 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttccatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatg 15272526  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  15272527 ctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 15272586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 30458033 - 30457880
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  30458033 ctcaattggtgaattacgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgtggttgatgataattcatg 30457934  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||| |||||| |||||| |  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  30457933 gcttggg-ttgcataattcattattttgttatagagaaatgagatgttgttggtg 30457880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Original strand, 21959580 - 21959718
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  21959580 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 21959679  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaat 157  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  21959680 gcttgggcttgcatgattcatagtttgtggttgagaaat 21959718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Original strand, 820033 - 820177
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  820033 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaa---ttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 820129  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttg 166  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||    
T  820130 gcttggg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttg 820177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 128
Target Start/End: Original strand, 8872588 - 8872699
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaa---tggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 116  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  8872588 ctcaattggtgaattatgcgttgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataactc 8872687  T
Q  117 atggcttgggtt 128  Q
    ||||||||||||    
T  8872688 atggcttgggtt 8872699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16522851 - 16522748
Alignment:
Q  117 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatg 215  Q
    ||||||||||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16522851 atggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatg 16522752  T
Q  216 atgt 219  Q
    ||||    
T  16522751 atgt 16522748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 12837317 - 12837464
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  12837317 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatggtcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatg 12837416  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  12837417 gcttgggtatgcatgattcatgatttgttg-tgagaaataagttgttgt 12837464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 30232613 - 30232761
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  30232613 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatg 30232712  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
    |||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  30232713 gcttgggtatgcattattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 30232761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 176
Target Start/End: Original strand, 18494467 - 18494602
Alignment:
Q  42 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    ||||||| |||||| || || | |||||||||||| |||| |||||||||| ||| || |  |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18494467 gttgttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgttgctgttgttgttaagtgatgttgttgatggtaactcatggcttgggtatgcatgattcatg 18494566  T
Q  142 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18494567 acttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 18494602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9295727 - 9295624
Alignment:
Q  117 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatg 215  Q
    ||||||||||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  9295727 atggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttatgtaaaatgagttgataaagaagaagtttgattttgatg 9295628  T
Q  216 atgt 219  Q
    ||||    
T  9295627 atgt 9295624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 167
Target Start/End: Original strand, 13809636 - 13809775
Alignment:
Q  29 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 128  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | | | || |  |||||||||||||||||||||| |     
T  13809636 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgttgatgataattcatggcttggata 13809735  T
Q  129 tgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13809736 tgcatgattcatgattggttgttgagaaatgagatgttgt 13809775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 144
Target Start/End: Original strand, 45458973 - 45459096
Alignment:
Q  21 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 120  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||| |||||| |||||    
T  45458973 tcaattggtgaattatgctttgctgttgttgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgaagataatccatgg 45459072  T
Q  121 cttgggtttgcatgattcatgatt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  45459073 cttgggtttgcatgattcatgatt 45459096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 27961078 - 27960938
Alignment:
Q  43 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 142  Q
    |||||| |||||| | ||| | |||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  27961078 ttgttgttgaattgttataagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgataattcatggtttgggtatgcatgatt-atga 27960980  T
Q  143 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 183  Q
     || ||||||||||||||| | |||| ||| |||| ||||||    
T  27960979 tttattgttgagaaatgagatattgttggtagtttggtaaaa 27960938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 191
Target Start/End: Original strand, 37957230 - 37957314
Alignment:
Q  108 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  37957230 tgataattcacggcttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgataaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 37957314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Original strand, 7185983 - 7186159
Alignment:
Q  42 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| | ||| | ||||||||||| | ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| |  || | |||||    
T  7185983 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatattattgttgatgattcatggcttgggtgtttataaatcatg 7186082  T
Q  142 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 219  Q
    ||| | || ||||| ||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7186083 atttgatgatgagatatgagttgttgt---tgtttttgtgaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 7186159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 191
Target Start/End: Original strand, 7964890 - 7965000
Alignment:
Q  82 ttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgta 180  Q
    ||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||||||||||| || | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7964890 ttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttgta 7964989  T
Q  181 aaatgggttga 191  Q
    |||||||||||    
T  7964990 aaatgggttga 7965000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Original strand, 52265628 - 52265749
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||   || |||| ||||||||||    
T  52265628 aattgttgaattatgcaatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatgattcatggct 52265727  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatgatt 144  Q
    ||||| | ||| ||||||||||    
T  52265728 tgggtgttcataattcatgatt 52265749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 191
Target Start/End: Original strand, 19821981 - 19822065
Alignment:
Q  108 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| |||||    
T  19821981 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgtttttggtgactttgtaaaatgagttga 19822065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15044955 - 15044784
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||    
T  15044955 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggct 15044856  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 192  Q
    ||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||| | ||||||| | || ||| || |||||||||||||    
T  15044855 tgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataaattgttgttgttgctttggtgaaaatgggttgat 15044784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 15109458 - 15109640
Alignment:
Q  13 aattatactcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 111  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||||||||    
T  15109458 aattatactcaaattgataaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgat 15109557  T
Q  112 aattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 192  Q
     ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||| | ||||||| | || ||| || |||||||||||||    
T  15109558 gattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataaattgttgttgttgctttggtgaaaatgggttgat 15109640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14901274 - 14901197
Alignment:
Q  108 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14901274 tgatgattcatgacatgggtgtgcataattcatgaattgatgatgagaaatgggttgttgttggtggttttgtaaaat 14901197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 184
Target Start/End: Original strand, 47535251 - 47535328
Alignment:
Q  108 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  47535251 tgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgatttgttaatgagaaatgagttgttgttgatggttttgtaaaat 47535328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 184
Target Start/End: Original strand, 41166109 - 41166228
Alignment:
Q  66 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 164  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||| |||| | ||||||||||||| | ||| | | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  41166109 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggcttgggtattcataacttatgatttgttgatgagaaatgagttgt 41166208  T
Q  165 tgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    ||| ||||||||||| ||||    
T  41166209 tgtgggtggttttgtgaaat 41166228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 192
Target Start/End: Original strand, 41256546 - 41256660
Alignment:
Q  80 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 178  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||||||| |||||| | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||||     
T  41256546 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggtttta 41256645  T
Q  179 t-aaaatgggttgat 192  Q
    | |||||||||||||    
T  41256646 taaaaatgggttgat 41256660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18276541 - 18276392
Alignment:
Q  43 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 142  Q
    |||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | |||||||||||   ||| ||||  ||| |||| ||| ||||||||||| | ||| | ||||||    
T  18276541 ttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgcaaagtgatattgttgttgatgattgatggcttgggtgttcataaatcatga 18276442  T
Q  143 tt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    || |  | |||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18276441 tttgacgatgagtattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 18276392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Original strand, 12635 - 12802
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12635 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatg 12734  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  12735 ataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 12802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 43 - 176
Target Start/End: Original strand, 19049 - 19183
Alignment:
Q  43 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 142  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19049 ttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataa 19148  T
Q  143 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
     ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  19149 tttgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 19183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 80004 - 79846
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  80004 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatg 79905  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  79904 ataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 79846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 46295 - 46171
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||  ||| |||| |||||||    
T  46295 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgtttctaagtgatattgttgttgatgattcatg 46196  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgatt 144  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||    
T  46195 gcttgggtgttcataattcatgatt 46171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 40788 - 40664
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||    |||||| |  ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||||||    
T  40788 ctcaattggtgaattatgctatattgttgttacattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatg 40689  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgatt 144  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||    
T  40688 gcttgggtgttcataattcatgatt 40664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22367158 - 22366970
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22367158 gtaaattatgctcaattggtgaat-atgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatg 22367060  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 197  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  22367059 atgatacatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 22366970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21860151 - 21859984
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  21860151 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatg 21860052  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    || || ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  21860051 atgatacatggctcgggtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatgaattgttgttgttggttt 21859984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 197
Target Start/End: Original strand, 15861541 - 15861728
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||    
T  15861541 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgt--ttgtttagtcatattgttgatg 15861638  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 197  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  15861639 atgatgcatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 15861728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 44035086 - 44035255
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  44035086 gtaaattatgctcatttggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatagttgatg 44035185  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 179  Q
    || | | |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  44035186 atga-taatggcttgagtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 44035255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 49967780 - 49967628
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||     
T  49967780 ctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgatacgtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatt 49967681  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  49967680 gcttcggtttgcatgattcatggttgttgttgaggaatgagatgttgttggtg 49967628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 35522436 - 35522588
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  35522436 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatacgtcatgttgttgatgataattcatg 35522535  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  35522536 gcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 35522588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 41212202 - 41212046
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt---tgtttagtcatatgtttgatgataattc 116  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  41212202 ctcaattagtgaattatgcactgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattc 41212103  T
Q  117 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41212102 atggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 41212046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21718358 - 21718206
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  21718358 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 21718259  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  21718258 gcttgggtttgcatgattcatggttgttcttgagaaatgagatgttgttggtg 21718206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 22403227 - 22403375
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  22403227 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaactgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 22403326  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||    
T  22403327 gcttgggttt-catgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgt 22403375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 35054886 - 35054716
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  35054886 ctcaattggtgaattatgctatgtagttgatgaactgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatg 35054787  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 188  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||| | ||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  35054786 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtggaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 35054716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 183
Target Start/End: Original strand, 51627805 - 51627945
Alignment:
Q  44 tgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcat-atgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 142  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51627805 tgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgtt-gatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatga 51627903  T
Q  143 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 183  Q
     ||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  51627904 tttgctgttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtaaaa 51627945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Original strand, 27329872 - 27330026
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  27329872 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatg 27329971  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||| ||  ||||||  |||| ||||||||| | ||||||    
T  27329972 gcttgggtatgcatgattcataat--ttgttgtcaaataagttgttgttgttggttt 27330026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27674838 - 27674755
Alignment:
Q  108 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  27674838 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 27674755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 190
Target Start/End: Original strand, 22829629 - 22829712
Alignment:
Q  108 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttg 190  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  22829629 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttg 22829712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 144
Target Start/End: Original strand, 9784239 - 9784341
Alignment:
Q  42 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9784239 gttgttgttgaattgtgataagtttcaagatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggcttgcatgattcatg 9784338  T
Q  142 att 144  Q
    |||    
T  9784339 att 9784341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17609036 - 17608886
Alignment:
Q  42 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  17609036 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgttgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 17608937  T
Q  142 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    | ||| |  |||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  17608936 atttgattatgagaattgagttgttgttgttggttttggaaaatgggttga 17608886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19603139 - 19603055
Alignment:
Q  108 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    |||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  19603139 tgataattcatgacttgggtgtgaataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 19603055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 191
Target Start/End: Original strand, 38033882 - 38033962
Alignment:
Q  111 taattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  38033882 taattcatggcttgggtgtgcatagttcacgattgttgatgagaaataagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 38033962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20177245 - 20177140
Alignment:
Q  80 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 178  Q
    ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20177245 tgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttggatattcataattcatgatttgttgaagagaaatgagttgttgttggtggttttg 20177146  T
Q  179 taaaat 184  Q
    | ||||    
T  20177145 tgaaat 20177140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 191
Target Start/End: Original strand, 20955644 - 20955728
Alignment:
Q  108 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||| ||| |||||| || ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||    
T  20955644 tgataattcatggcttcggtgtgaataattcgtgaattgttggtgtgaaatgagttgttgtgggtgactttgtaaaaggggttga 20955728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21195084 - 21194980
Alignment:
Q  80 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 178  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||||     
T  21195084 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggtttta 21194985  T
Q  179 taaaa 183  Q
    |||||    
T  21194984 taaaa 21194980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 184
Target Start/End: Original strand, 13377003 - 13377122
Alignment:
Q  66 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgt 164  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||| | |||||||||||| || | ||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  13377003 tcatgctcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgttgattcatggcttgagtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgaattgt 13377102  T
Q  165 tgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    ||| || |||||||| ||||    
T  13377103 tgttggcggttttgtgaaat 13377122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Original strand, 37234022 - 37234149
Alignment:
Q  65 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttg 163  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||| ||||||| | ||| | |||||||| | || ||| || ||||||     
T  37234022 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatgacttgggtgtccataaatcatgatttgatgatgaaaattgagttt 37234121  T
Q  164 ttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||    
T  37234122 ttgtggttggttttgtaaaatgggttga 37234149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 90
Target Start/End: Original strand, 9784184 - 9784248
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttg 90  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||   ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  9784184 aattggtgaattatgctttgttgttga---attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 9784248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 184
Target Start/End: Original strand, 41229149 - 41229221
Alignment:
Q  113 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    |||||||||||| || | ||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  41229149 attcatggcttgagtgttcataattcatgatttgtggatgagaaatgagttgttgttggtagtttggtaaaat 41229221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 219
Target Start/End: Original strand, 234 - 430
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    |||| ||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||| |||    
T  234 aattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatagct 333  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  334 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagcttttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 143 - 219
Target Start/End: Original strand, 6603 - 6679
Alignment:
Q  143 ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6603 ttgttgttgagaattgagttgttcttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 6679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Original strand, 162293 - 162469
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg-ttgtttagtcatatgtttgat 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  162293 gtaaattatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgtttagtcatattgttgat 162392  T
Q  109 gataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  162393 gatgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 162469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 164345 - 164204
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||    
T  164345 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatggtaattcatg 164246  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 160  Q
    |||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  164245 gcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgag 164204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Original strand, 166379 - 166547
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||||  ||||||    
T  166379 gtaaattatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt-------taatattgttgatg 166471  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  166472 atgatacatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgaaaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 166547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 184
Target Start/End: Original strand, 116690 - 116795
Alignment:
Q  80 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 178  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  116690 tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgaaaaatggattgttgttggtggttttg 116789  T
Q  179 taaaat 184  Q
    ||||||    
T  116790 taaaat 116795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 30202 - 30056
Alignment:
Q  39 atggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattc 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30202 atggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattc 30103  T
Q  139 atga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  30102 atgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 30056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22274862 - 22274688
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  22274862 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatg 22274763  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    || ||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  22274762 atgatagatggcttggg-ttgcatgattcatgaattgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 22274688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 23836822 - 23836975
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  23836822 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcattttgttgatgataattcatg 23836921  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
     ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23836922 acttgggtttgcataattcttgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 23836975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22284095 - 22283921
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||  ||||||    
T  22284095 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatcgttgtttttgatgtttagtcttattgttgatg 22283996  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  22283995 atgatacatggcttggg-ttgcatgattcatgaattgctgttgagaaatgaattgttgttggtggttttgtgaaat 22283921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 32465988 - 32465835
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  32465988 ctcaattggtgaattatgcattgttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 32465889  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32465888 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 32465835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Original strand, 25876036 - 25876206
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  25876036 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgcttcatgatcaaatgttgttgttattgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 25876135  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 188  Q
    |||||||||||||| |||| | | ||||| ||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  25876136 gcttgggtttgcataattcttggcttgttattgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 25876206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Original strand, 9653011 - 9653179
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  | ||||    
T  9653011 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgcgatatttttcatgatcaatagatgttgatgttgttaagtgatgttatggatg 9653110  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  9653111 ctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 9653179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 219
Target Start/End: Original strand, 19433495 - 19433649
Alignment:
Q  66 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 164  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19433495 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgt 19433594  T
Q  165 tgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 219  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19433595 tgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 19433649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 164
Target Start/End: Original strand, 21274164 - 21274319
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | ||||    
T  21274164 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtaatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatg 21274263  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgt 164  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||    
T  21274264 ctaattcatggcttggg-tagcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgt 21274319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 172
Target Start/End: Original strand, 4448251 - 4448402
Alignment:
Q  21 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 120  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||||    
T  4448251 tcaattggtgaatgatgctttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgg 4448350  T
Q  121 cttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  4448351 cttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgaaaaatgagatgttgttggtg 4448402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 6879571 - 6879414
Alignment:
Q  16 tatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||     
T  6879571 tatactcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgatatgtttaatgatcaattgttgttgttgttatttagtcatgttgttgatgataata 6879472  T
Q  116 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||| |||||||||  || |||| | | ||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  6879471 catgtcttgggtttaaataattcttggtttgttgttgagaattgagatgttgttggtg 6879414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 28974179 - 28974026
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||| |||| |||||||||   |||||||||||||| || || |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  28974179 ctcatttggcgaattatgctatgttgttgatgaattgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 28974080  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  28974079 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggtg 28974026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 271300 - 271148
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||     
T  271300 ctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcata 271201  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| ||||    
T  271200 gcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgaggaatgagatgttgttggtg 271148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 25602154 - 25601989
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||| ||||||   || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  || ||||||| |||||    
T  25602154 ctcaattggtgagttatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgtttatgataaatcatg 25602055  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  25602054 gcttaggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 25601989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 188
Target Start/End: Original strand, 36890805 - 36890972
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| || |  | |||||| ||||||||||    
T  36890805 aattggtgaattatgctatgttgttgataaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattcatggct 36890904  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 188  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  36890905 tgggtatgcatgattcttgatttgttgttgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 36890972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 27261900 - 27261783
Alignment:
Q  56 ttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgaga 154  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27261900 ttgataagtttcatgatcaattgatattgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttaaga 27261801  T
Q  155 aatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  27261800 aatgagatgttgttggtg 27261783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 219
Target Start/End: Original strand, 24826961 - 24827044
Alignment:
Q  137 tcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 219  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  24826961 tcatgattgttgttgagaaaatgagctgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgatattgatgatgt 24827044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Original strand, 3403 - 3529
Alignment:
Q  65 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgt 164  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3403 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgattgtagatgagaaatgagttgt 3502  T
Q  165 tgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  3503 tgttggtgactttgtaaaatgggttga 3529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 183
Target Start/End: Original strand, 22579999 - 22580140
Alignment:
Q  43 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 142  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| || || |  || || |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22579999 ttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgctgctgatatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatga 22580098  T
Q  143 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 183  Q
     ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  22580099 tttgttgtggagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 22580140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25213081 - 25212977
Alignment:
Q  117 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag--aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgat 214  Q
    ||||||||||| | |||   |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  25213081 atggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaaatgagttgttggtggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaaatttgattttgat 25212982  T
Q  215 gatgt 219  Q
    |||||    
T  25212981 gatgt 25212977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 183
Target Start/End: Original strand, 24571408 - 24571572
Alignment:
Q  20 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 118  Q
    |||||||||| |||||||||   ||| ||| |||||| || || | |||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |||||||||| ||||    
T  24571408 ctcaattggttgaattatgctatgtttttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgataactcat 24571507  T
Q  119 ggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 183  Q
    | ||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  24571508 g-cttggctatgtatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtaaaa 24571572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 43645886 - 43645824
Alignment:
Q  157 tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 219  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  43645886 tgagttgttggtggtggttttgtaaaatgggttggtaatgaaaaagtttgattttgatgatgt 43645824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 722437 - 722353
Alignment:
Q  108 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  722437 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttattgatgagatatgagttgttgttggtgactttgtaaaattggttga 722353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 68119 - 67952
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| || || | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| || | ||||||||||    
T  68119 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttggtgattcatggct 68020  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 188  Q
    || || | ||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  68019 tgcgtgttcataattcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttgtgaaaatgggt 67952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24884684 - 24884643
Alignment:
Q  151 gagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgat 192  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24884684 gagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttgat 24884643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25305487 - 25305416
Alignment:
Q  108 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 178  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25305487 tgatgattcatggcctgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtagttttg 25305416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 188
Target Start/End: Original strand, 23821767 - 23821892
Alignment:
Q  65 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttg 163  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||| || || ||||| |||||    
T  23821767 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcatgggtgttcataattcatgatttgatgatgtgaaataagttg 23821866  T
Q  164 ttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 188  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||    
T  23821867 ttgttgttggttttgtgaaaatgggt 23821892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 188
Target Start/End: Original strand, 23830846 - 23830971
Alignment:
Q  65 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttg 163  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||| || || ||||| |||||    
T  23830846 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcatgggtgttcataattcatgatttgatgatgtgaaataagttg 23830945  T
Q  164 ttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 188  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||    
T  23830946 ttgttgttggttttgtgaaaatgggt 23830971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 566 - 736
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||||    
T  566 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgatatttactcatattgttgatg 665  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 179  Q
    || || |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||  || |||| |||||||||||    
T  666 atgatacatggcttgggtttgcatgattaataatttgttgttgagaaatggattattgttggtggttttgt 736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 165
Target Start/End: Original strand, 11825 - 11970
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  11825 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 11924  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgtt 165  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11925 gcttgagtttgcatggttcatgattggtgttgagaaatgagatgtt 11970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 32333 - 32180
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  32333 ctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 32234  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32233 gcttgggtttgcataatccttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 32180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 41970 - 42123
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  41970 ctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 42069  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  42070 gcttgggtttgcataatccttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 42123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 132367 - 132520
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  132367 ctcaattggtgaattatgcatcgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 132466  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  132467 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgaaatgttgttggtg 132520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11818 - 11660
Alignment:
Q  20 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 118  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| |  |  |||||||||||||||    
T  11818 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgtagaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgacgttgttgatgataattcat 11719  T
Q  119 ggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11718 ggcttggttatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 11660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 88404 - 88289
Alignment:
Q  21 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 120  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  | |||| |||||| |||    
T  88404 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgctgttgttaagtgatgttatggatgctaattcttgg 88305  T
Q  121 cttgggtttgcatgat 136  Q
    ||||||| ||||||||    
T  88304 cttgggtatgcatgat 88289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 70739 - 70892
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  70739 ctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcattggatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 70838  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
     |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  70839 acttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 70892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 60940 - 60784
Alignment:
Q  16 tatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 115  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  60940 tatacttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 60841  T
Q  116 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  60840 catgacttgggtttgcatgattcatgatttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 60784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Original strand, 1093 - 1261
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  |||    
T  1093 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatg 1192  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  1193 ctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgagaaataagttgttgttgttggttt 1261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 5363 - 5516
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  5363 ctcaattggtgaattaggcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 5462  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5463 gtttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 5516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Original strand, 8998 - 9156
Alignment:
Q  20 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 118  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||    
T  8998 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcat 9097  T
Q  119 ggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9098 ggcttaggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgtcggtggttt 9156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Original strand, 13501 - 13669
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | ||||    
T  13501 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatg 13600  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  13601 ctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 13669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 21475 - 21634
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  |||    
T  21475 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatg 21574  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  21575 ctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 21634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15089 - 14921
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | ||||    
T  15089 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatg 14990  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  14989 ctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 14921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22821 - 22668
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||    
T  22821 ctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttttgtcatgttgttgatgataattcatg 22722  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  22721 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttattgagaaatgagatgttgttggtg 22668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Original strand, 17519 - 17686
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | ||||    
T  17519 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatg 17618  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatgat-tgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  17619 ctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatatgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 17686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 6962 - 7118
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaa---tggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  6962 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattc 7061  T
Q  117 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7062 atggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 7118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 939 - 1092
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  939 ctcaattggtgaattatgcattgttattgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 1038  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1039 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 1092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 176
Target Start/End: Original strand, 109582 - 109736
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  109582 aattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggct 109681  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  109682 tgggattgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 109736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Original strand, 118081 - 118237
Alignment:
Q  21 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 120  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||    
T  118081 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatgg 118180  T
Q  121 cttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  118181 cttggggttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 118237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 254931 - 255084
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  254931 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 255030  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  255031 gcttgagtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 255084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 261537 - 261690
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  261537 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 261636  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  261637 gcttgagtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 261690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15004 - 14854
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  15004 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgt---tgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 14908  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattc-atgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14907 gcttgggtttgcataattctcggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 14288 - 14194
Alignment:
Q  79 ttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattc-atgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14288 ttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattctcggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 7699 - 7556
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  7699 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 7600  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgtt 165  Q
    |||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||| ||||    
T  7599 gcttgggtttgcatgattc--gttggttgttgagaaatgagatgtt 7556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 85459 - 85321
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  85459 aattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggtt 85360  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgag 160  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  85359 tgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgag 85321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 159438 - 159275
Alignment:
Q  12 aaattatactcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatga 110  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||   |||| || |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |   ||||||    
T  159438 aaattatgctcaattggttgaattatgctatgttgatgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgt---tgatga 159342  T
Q  111 taattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  159341 taatttttggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 159275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 693 - 846
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||| ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  693 ctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 792  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  793 gcttgggttggcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 38428 - 38287
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||     
T  38428 ctcaattggcgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgacgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcata 38329  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 160  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38328 acttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgag 38287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 55721 - 55553
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | ||||    
T  55721 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatg 55622  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||  |||| ||||||||| | ||||||    
T  55621 ctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtaaaataagttgttgttgttggttt 55553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 93973 - 94061
Alignment:
Q  104 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    ||||||||||||||||  ||||||   ||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  93973 ttgatgataattcatgatttgggtgaacataattcatgatttgttggtgagaaatgagatgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 94061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 167
Target Start/End: Original strand, 104799 - 104887
Alignment:
Q  80 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||    
T  104799 tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatgataaatgagttgttgt 104887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Original strand, 253106 - 253271
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |  |||||||||||||| |    
T  253106 ctcaattggtgaatcatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtttttgttaagtcatgttgttgatgataattcaag 253205  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  253206 gcttgggtttgcatgattcatgatttcttgatgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 253271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 10067 - 9903
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||||||    
T  10067 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgattattcatg 9968  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  9967 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 9903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Original strand, 15588 - 15761
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaa---tggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||    
T  15588 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttatagatgctaattc 15687  T
Q  117 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 188  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||| | ||||||| | |||||| || |||||||||    
T  15688 atggcttgggtatgcatgattcataattttttgttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 15761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 6658 - 6816
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||| ||| || |  | ||||    
T  6658 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttgatgatcaatagatcttgttgttgttaagtgatgttatggatg 6757  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  6758 ctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 6816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9117 - 8960
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||| |||||| ||||| | | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  9117 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcaagatcacttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 9018  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9017 gcttgggtttgcttgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 8960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 635 - 788
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||| ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||  | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  635 ctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttactaagtcatgttgttgatgataattcatg 734  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  735 gcttgggttggcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Original strand, 193603 - 193770
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | ||||    
T  193603 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatta-ttgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatg 193701  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  193702 ctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgcgaaataagttgttgttgttggttt 193770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 186641 - 186799
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | ||||    
T  186641 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatta-ttgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatg 186739  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  186740 ctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 186799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 1444 - 1300
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  1444 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggct 1345  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1344 tgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttg 1300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 11771 - 11921
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  11771 ctcaattagtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaa---ttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 11867  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||| |||||| | ||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  11868 gcttggg-ttgcataactcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 11921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Original strand, 9622 - 9789
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |  |  | ||||    
T  9622 gtaaattatgctcaattagtgacttatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgacgttatggatg 9721  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  9722 ctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 9789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 95115 - 94948
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | ||||    
T  95115 gtaaattatgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgataagtgatgttatggatg 95016  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
     |||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  95015 ctaattcatggtttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 94948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Original strand, 24845 - 25002
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||| ||    
T  24845 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcttg 24944  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  24945 gcttgggtattcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 25002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 176
Target Start/End: Original strand, 10094 - 10248
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| ||||||||||||    
T  10094 aattggcgaattatgcttggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggct 10193  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  10194 tgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgatggttt 10248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28573 - 28466
Alignment:
Q  113 attcatggcttgggtttgcatgattcatgattg-ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaattt 211  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28573 attcatggcttgggtgttcataattcatgatttattggtgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgatttt 28474  T
Q  212 gatgatgt 219  Q
    ||||||||    
T  28473 gatgatgt 28466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21687 - 21637
Alignment:
Q  169 ggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21687 ggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 21637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 112662 - 112812
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||   || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |   || ||||||||||||    
T  112662 ctcaattagtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatttatgttgttgttgttaagtcatgt---tgttgataattcatg 112758  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  112759 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 112812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 109698 - 109556
Alignment:
Q  42 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  109698 gttgttgttgaattgtgataagattcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcacgattcatg 109599  T
Q  142 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 183  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  109598 atttgttgatgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 109556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Original strand, 103123 - 103211
Alignment:
Q  104 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  103123 ttgatgataattcatggtttgggtgtgcataattcatgaattgttggtgataaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 103211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 146731 - 146561
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| |||||||||    
T  146731 ctcaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgcatgttaattcatg 146632  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 188  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  146631 gcttgggtatgcatgattcataatttgtttttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 146561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1332
Alignment:
Q  46 ttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tt 144  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||| ||||| |  ||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1485 ttgatgaattgtgataagtttcatgatcaataaatgttgctgttgctatgtcatgttgttgatgataaatcatggcttgggtttgcatgattcatgattt 1386  T
Q  145 gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 197  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  1385 gttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 1332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 151 - 3
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||   || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  151 ctcaattcgtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatcttgttgatgataattcatg 52  T
Q  120 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||||||    
T  51 gcttgggtttgcatgtttcattatttgttgttgagaaatggattgttgt 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3589 - 3492
Alignment:
Q  80 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||| ||||||||    
T  3589 tgttgttgttgctatgtcatcttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgtttcattatttgttgttgagaaatggaatgttgttggtggttt 3492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 5068 - 4906
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    |||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  5068 aattggtgaattatgatttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggct 4969  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    ||| | | ||| |||||||| ||| || |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  4968 tggttgttcataattcatgatttgctgatgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 4906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 172
Target Start/End: Original strand, 11688 - 11837
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||| ||    
T  11688 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatcagtttcatgatcaatttatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgact 11787  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  11788 tgggtttgcataattcatgatttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 11837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 48286 - 48124
Alignment:
Q  11 taaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatga 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| || |||||||| || ||| |  |||||||    
T  48286 taaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgttaagccatgttgttgatga 48187  T
Q  111 taattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  48186 taattcatggcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 48124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 61734 - 61572
Alignment:
Q  11 taaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatga 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| || |||||||| || ||| |  |||||||    
T  61734 taaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgttaagccatgttgttgatga 61635  T
Q  111 taattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  61634 taattcatggcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 61572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 130589 - 130486
Alignment:
Q  117 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatg 215  Q
    ||||||||||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  130589 atggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttaataaagaagaagtttgattttgatg 130490  T
Q  216 atgt 219  Q
    ||||    
T  130489 atgt 130486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 79647 - 79521
Alignment:
Q  42 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    ||||||| |||||| |||| ||   |||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  79647 gttgttgttgaattatgatgtgaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatg 79548  T
Q  142 -attgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
     |||| || ||||||||||||||||||    
T  79547 aattggtgatgagaaatgagttgttgt 79521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 89586 - 89655
Alignment:
Q  20 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtt 89  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  89586 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttaaattgtgataagtttcatgaacaattgatgttgttgtt 89655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 143 - 301
Alignment:
Q  10 gtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||| || |  | ||||    
T  143 gtaaattatgctcaattggtgaattatgcataataattgatgaattatgataagtttcatgatcaataaatgttgttgttgttaagtgatgttatggatg 242  T
Q  110 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 167  Q
     |||||||||||||| || |||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||    
T  243 ctaattcatggcttgagtatgcatgattcataatttattgttgtgaaataagttgttgt 301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 183
Target Start/End: Original strand, 33854 - 34008
Alignment:
Q  29 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 128  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||||| ||||||||||||||||||     
T  33854 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataattcatggcttgggta 33953  T
Q  129 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 183  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  33954 tgcatgatt-atgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 34008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 33789 - 33668
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||    
T  33789 aattggtgaattatgctatgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 33690  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatgatt 144  Q
     |||| | ||| ||||||||||    
T  33689 agggtgttcataattcatgatt 33668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 176
Target Start/End: Original strand, 24372 - 24471
Alignment:
Q  78 gttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    ||||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  24372 gttgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatgtcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 24471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 31149 - 31010
Alignment:
Q  45 gttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-t 143  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||| ||| | |||||||| || |  || |  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  31149 gttgttgaattgtgataagtttcatgattaattgatgttgttgctgatatgtgaggtttttgatgataatttatggcttgggtatgcatgattcatgact 31050  T
Q  144 tgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 183  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  31049 tgttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 31010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 70734 - 70676
Alignment:
Q  29 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 87  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  70734 tgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 70676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 191
Target Start/End: Original strand, 97403 - 97487
Alignment:
Q  108 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||| | |||||||| | || | |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  97403 tgatgattcatgccttgggttttcataaatcatgatttgatgataagaattgagttgttgttattggttttgtaaaatgggttga 97487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2001 - 1889
Alignment:
Q  65 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttg 163  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |   |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  2001 ttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgatgatgataattcttggcttgagtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatg 1902  T
Q  164 ttgtcggtggttt 176  Q
    ||||  |||||||    
T  1901 ttgttagtggttt 1889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 184
Target Start/End: Original strand, 76967 - 77129
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| || |  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||  |||| ||||||||||    
T  76967 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttattgatgattcatggct 77066  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    ||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  77067 tgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtgaaat 77129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 191
Target Start/End: Original strand, 43975 - 44087
Alignment:
Q  80 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 178  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  43975 tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttg 44074  T
Q  179 taaaatgggttga 191  Q
    |||||||||||||    
T  44075 taaaatgggttga 44087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 393 - 270
Alignment:
Q  66 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 164  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || | |||| |||| ||||||| |||||||   ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  393 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtttttgttgattattcatgccttgggtgctcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgt 294  T
Q  165 tgtcggtggttttgtaaaatgggt 188  Q
    ||| |||||||||||||| |||||    
T  293 tgttggtggttttgtaaactgggt 270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 4414 - 4351
Alignment:
Q  21 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttg 84  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  4414 tcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagttttatgatcaattgttgttg 4351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 4353 - 4284
Alignment:
Q  104 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 172  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4353 ttgatgataattcatggtttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 4284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7878 - 7807
Alignment:
Q  106 gatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  7878 gatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagttt 7807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3419 - 3308
Alignment:
Q  50 tgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttg 148  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||| ||||| | ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3419 tgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgatgttgctaagtgatgttgtggatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttg 3320  T
Q  149 ttgagaaatgag 160  Q
    ||||||||||||    
T  3319 ttgagaaatgag 3308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6708 - 6622
Alignment:
Q  103 tttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggt 188  Q
    |||| |||| |||||||||||||||   ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6708 tttgttgatgattcatggcttgggtggtcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaactgggt 6622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 69565 - 69415
Alignment:
Q  42 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 141  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  69565 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 69466  T
Q  142 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    | ||| || |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  69465 atttgatgatgagaattgaggtgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 69415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2646 - 2483
Alignment:
Q  29 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 128  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||||||| ||||||     
T  2646 tgaattatgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtg 2547  T
Q  129 tgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 191  Q
    | ||| | |||||||| | || |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  2546 ttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgacttgttgttgttggttttctaaaatgggttga 2483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 216
Target Start/End: Original strand, 12990 - 13048
Alignment:
Q  159 agttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatga 216  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12990 agttgttgttgatggttttgtgaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatga 13048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 35520 - 35444
Alignment:
Q  108 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35520 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttg-tgttggtggttttgtaaaat 35444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1422 - 1364
Alignment:
Q  127 tttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  1422 tttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12734 - 12694
Alignment:
Q  179 taaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 219  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12734 taaaatgggttgatagtgaagaagtttgattttgatgatgt 12694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 176
Target Start/End: Original strand, 22715 - 22786
Alignment:
Q  106 gatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 176  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  22715 gatgctaattcatggtttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 22786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Original strand, 2436 - 2607
Alignment:
Q  23 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 122  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |  ||||| ||||| | ||||||||||  | ||| || |  |||||||| ||||||||||    
T  2436 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattatgataagactcatgttcaattgatgttgttgttcctaagtgatgttgttgatgatgattcatggct 2535  T
Q  123 tgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 192  Q
    ||||  | ||| |||||||  ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  2536 tgggcgttcataattcatgttttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 2607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 219
Target Start/End: Original strand, 3392 - 3427
Alignment:
Q  184 tgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3392 tgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 3427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 108080 - 107967
Alignment:
Q  80 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 179  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||||| |||||||| | ||| | |||||| | ||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |    
T  108080 tgttgttgttgttaagatatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgaattttgatgagaaataagttgttgttgttggtttttt 107981  T
Q  180 -aaaatgggttgat 192  Q
     |||||||||||||    
T  107980 aaaaatgggttgat 107967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 188
Target Start/End: Original strand, 5823 - 5875
Alignment:
Q  137 tcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgta-aaatgggt 188  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  5823 tcatgattgttggtgagaaatgagatgttgttggttgttttgtataaatgggt 5875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University