View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1574_high_20 (Length: 242)

Name: NF1574_high_20
Description: NF1574
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1574_high_20
NF1574_high_20
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (9-237)||(15388178-15388406)
chr4 (9-234)||(14760106-14760331)
chr4 (9-234)||(14668260-14668485)
chr4 (9-234)||(5009119-5009344)
chr4 (9-234)||(6573102-6573327)
chr4 (9-234)||(17016290-17016515)
chr4 (9-234)||(34185760-34185985)
chr4 (9-234)||(18313978-18314203)
chr4 (9-234)||(24589161-24589386)
chr4 (9-234)||(54836635-54836860)
chr4 (9-234)||(14101787-14102012)
chr4 (9-234)||(20335221-20335446)
chr4 (9-234)||(24115906-24116131)
chr4 (9-234)||(27160117-27160342)
chr4 (9-222)||(39853893-39854106)
chr4 (9-234)||(15231116-15231341)
chr4 (9-222)||(18797414-18797627)
chr4 (9-234)||(36341317-36341542)
chr4 (9-232)||(1903500-1903723)
chr4 (9-234)||(33670600-33670825)
chr4 (9-231)||(15281737-15281959)
chr4 (9-234)||(21972945-21973170)
chr4 (9-234)||(30757004-30757229)
chr4 (9-234)||(31123312-31123537)
chr4 (9-234)||(40102437-40102662)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (9-237)||(27394789-27395017)
chr2 (9-234)||(23125357-23125582)
chr2 (9-234)||(37948651-37948876)
chr2 (9-234)||(12658766-12658991)
chr2 (9-222)||(27806945-27807158)
chr2 (9-234)||(34294384-34294609)
chr2 (9-231)||(27431230-27431452)
chr2 (16-234)||(28885437-28885655)
chr2 (9-234)||(20841143-20841368)
chr2 (9-234)||(39048608-39048833)
chr2 (9-234)||(11631973-11632198)
chr2 (9-222)||(13933336-13933549)
chr2 (9-222)||(257442-257655)
chr2 (9-234)||(40236738-40236963)
chr2 (9-222)||(12590050-12590263)
chr2 (9-234)||(31879516-31879741)
chr2 (9-234)||(39893299-39893524)
chr2 (9-234)||(16826127-16826352)
chr2 (9-234)||(16895128-16895353)
chr2 (9-234)||(19413290-19413515)
chr2 (9-234)||(32053033-32053258)
chr2 (9-234)||(34864914-34865139)
chr2 (9-234)||(37380907-37381132)
chr2 (9-234)||(37682684-37682909)
chr2 (9-234)||(37697949-37698174)
chr2 (9-234)||(37928599-37928824)
chr2 (9-222)||(9346775-9346988)
chr2 (9-234)||(12713390-12713615)
chr2 (9-222)||(21673964-21674177)
chr2 (9-212)||(21699960-21700163)
chr2 (9-231)||(19453212-19453434)
chr2 (14-124)||(31890285-31890395)
chr2 (14-124)||(3785833-3785943)
chr2 (14-124)||(16164820-16164930)
chr2 (14-124)||(22924942-22925052)
chr2 (14-124)||(27779574-27779684)
chr2 (14-124)||(27819331-27819441)
chr2 (20-124)||(34158184-34158288)
chr2 (14-124)||(27119864-27119974)
chr2 (9-83)||(27827841-27827915)
chr2 (136-192)||(12383932-12383988)
chr2 (136-192)||(22949665-22949721)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (9-237)||(22077672-22077900)
chr8 (9-234)||(27605666-27605891)
chr8 (9-234)||(14560854-14561079)
chr8 (9-234)||(18793934-18794159)
chr8 (9-234)||(2134021-2134246)
chr8 (9-234)||(19691328-19691553)
chr8 (9-234)||(9357855-9358080)
chr8 (9-222)||(19205123-19205336)
chr8 (9-234)||(29832556-29832781)
chr8 (9-234)||(19677677-19677902)
chr8 (9-222)||(28358713-28358926)
chr8 (9-234)||(31357758-31357983)
chr8 (9-234)||(18712714-18712939)
chr8 (9-234)||(12089484-12089709)
chr8 (9-234)||(33261964-33262189)
chr8 (9-234)||(31486632-31486857)
chr8 (14-124)||(15770914-15771024)
chr8 (14-101)||(44564347-44564434)
chr8 (20-107)||(21344943-21345030)
chr8 (172-234)||(16286631-16286694)
chr8 (137-222)||(19844409-19844494)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (9-234)||(5593200-5593425)
chr3 (9-234)||(18054454-18054679)
chr3 (9-234)||(18273895-18274120)
chr3 (9-234)||(18289196-18289421)
chr3 (9-234)||(18304497-18304722)
chr3 (9-238)||(18333818-18334047)
chr3 (9-232)||(4793478-4793701)
chr3 (9-231)||(8286313-8286535)
chr3 (9-234)||(6205095-6205320)
chr3 (9-234)||(8299163-8299388)
chr3 (9-234)||(15889548-15889773)
chr3 (9-234)||(21677895-21678120)
chr3 (9-238)||(35883954-35884183)
chr3 (9-234)||(4686847-4687072)
chr3 (9-234)||(4724823-4725048)
chr3 (9-234)||(15737937-15738162)
chr3 (9-234)||(22384421-22384646)
chr3 (9-234)||(29145599-29145824)
chr3 (9-234)||(29661813-29662038)
chr3 (9-234)||(8214927-8215152)
chr3 (9-234)||(20069232-20069457)
chr3 (9-222)||(20573686-20573899)
chr3 (9-222)||(32442355-32442568)
chr3 (9-234)||(48469119-48469344)
chr3 (9-234)||(7076398-7076623)
chr3 (9-234)||(28112797-28113022)
chr3 (9-234)||(47026645-47026870)
chr3 (9-234)||(5016906-5017131)
chr3 (9-234)||(5606157-5606382)
chr3 (9-234)||(10399336-10399561)
chr3 (9-234)||(28342369-28342594)
chr3 (9-234)||(4343519-4343744)
chr3 (9-234)||(4420107-4420332)
chr3 (9-234)||(5470180-5470405)
chr3 (9-234)||(6539585-6539810)
chr3 (9-234)||(7999752-7999977)
chr3 (9-234)||(10646265-10646490)
chr3 (9-222)||(18245945-18246158)
chr3 (9-234)||(22867691-22867916)
chr3 (9-234)||(22882750-22882975)
chr3 (9-234)||(28024474-28024699)
chr3 (9-229)||(19697687-19697907)
chr3 (9-231)||(16621333-16621555)
chr3 (9-234)||(24331355-24331580)
chr3 (9-234)||(31961298-31961523)
chr3 (9-234)||(51785215-51785440)
chr3 (9-234)||(17981792-17982017)
chr3 (9-234)||(18228388-18228613)
chr3 (40-234)||(11107226-11107420)
chr3 (14-124)||(17992779-17992889)
chr3 (14-124)||(31033084-31033194)
chr3 (9-124)||(4627087-4627202)
chr3 (14-124)||(32293930-32294040)
chr3 (9-124)||(5714375-5714490)
chr3 (9-124)||(5725285-5725400)
chr3 (9-124)||(5766968-5767083)
chr3 (134-194)||(15592879-15592939)
chr3 (9-96)||(6963276-6963363)
chr3 (136-194)||(15918749-15918807)
chr3 (136-194)||(20443349-20443407)
chr3 (136-194)||(41440475-41440533)
chr3 (136-192)||(5950772-5950828)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (9-234)||(10913554-10913779)
chr7 (9-234)||(2157802-2158027)
chr7 (9-234)||(26438485-26438710)
chr7 (9-234)||(26534558-26534783)
chr7 (9-234)||(2106848-2107073)
chr7 (9-234)||(11421464-11421689)
chr7 (9-234)||(26271771-26271996)
chr7 (9-234)||(45390448-45390673)
chr7 (9-231)||(16515115-16515337)
chr7 (9-234)||(5131224-5131449)
chr7 (9-234)||(5144025-5144250)
chr7 (9-234)||(22145423-22145648)
chr7 (9-222)||(26516032-26516245)
chr7 (9-234)||(26316533-26316758)
chr7 (9-231)||(10844851-10845073)
chr7 (9-234)||(3448534-3448759)
chr7 (9-234)||(4141931-4142156)
chr7 (9-234)||(4202617-4202842)
chr7 (9-234)||(11444115-11444340)
chr7 (9-222)||(31561075-31561288)
chr7 (23-231)||(16044550-16044758)
chr7 (9-231)||(10842679-10842901)
chr7 (9-222)||(16748202-16748415)
chr7 (9-234)||(26666599-26666824)
chr7 (9-234)||(24589219-24589444)
chr7 (9-212)||(16446691-16446894)
chr7 (86-234)||(9621878-9622026)
chr7 (14-124)||(2776592-2776702)
chr7 (14-124)||(26512386-26512496)
chr7 (14-124)||(26681796-26681906)
chr7 (14-124)||(31127245-31127355)
chr7 (14-124)||(39209829-39209939)
chr7 (14-117)||(45734658-45734761)
chr7 (14-124)||(31087312-31087422)
chr7 (136-192)||(9469590-9469646)
chr7 (146-194)||(16287201-16287249)
chr7 (136-192)||(16393246-16393302)
chr7 (136-192)||(30369758-30369814)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (9-234)||(27022364-27022589)
chr6 (9-234)||(27287107-27287332)
chr6 (9-234)||(29552785-29553010)
chr6 (9-234)||(13295694-13295919)
chr6 (9-234)||(15421063-15421288)
chr6 (9-234)||(22931627-22931852)
chr6 (9-234)||(23854072-23854297)
chr6 (9-234)||(24866944-24867169)
chr6 (9-234)||(27626454-27626679)
chr6 (9-234)||(16677368-16677593)
chr6 (9-234)||(27179684-27179909)
chr6 (9-234)||(27269330-27269555)
chr6 (9-234)||(34461249-34461474)
chr6 (9-234)||(3699311-3699536)
chr6 (9-234)||(4760991-4761216)
chr6 (9-234)||(17089186-17089411)
chr6 (9-234)||(27010959-27011184)
chr6 (20-234)||(26921605-26921819)
chr6 (20-234)||(16753049-16753263)
chr6 (9-234)||(27060734-27060959)
chr6 (9-234)||(29504644-29504869)
chr6 (9-234)||(4528513-4528738)
chr6 (9-234)||(4542517-4542742)
chr6 (9-234)||(4720878-4721103)
chr6 (9-234)||(27488361-27488586)
chr6 (9-234)||(29576242-29576467)
chr6 (9-234)||(30554759-30554984)
chr6 (9-212)||(20171797-20172000)
chr6 (9-212)||(22163991-22164194)
chr6 (9-234)||(16940770-16940995)
chr6 (9-234)||(26113155-26113380)
chr6 (9-234)||(28210682-28210907)
chr6 (9-234)||(4776108-4776333)
chr6 (9-124)||(22455857-22455972)
chr6 (9-161)||(26992096-26992248)
chr6 (9-124)||(26775370-26775485)
chr6 (9-124)||(27358853-27358968)
chr6 (9-124)||(27449196-27449311)
chr6 (14-124)||(14142142-14142252)
chr6 (14-124)||(26789154-26789264)
chr6 (14-124)||(27197523-27197633)
chr6 (14-124)||(27251602-27251712)
chr6 (14-117)||(8902451-8902554)
chr6 (9-117)||(28163836-28163944)
chr6 (9-108)||(33373174-33373273)
chr6 (14-124)||(13520940-13521049)
chr6 (136-192)||(9136223-9136279)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (9-234)||(15655455-15655680)
chr5 (9-234)||(41677943-41678168)
chr5 (9-234)||(11552593-11552818)
chr5 (9-234)||(33295766-33295991)
chr5 (9-234)||(33780727-33780952)
chr5 (9-234)||(22995814-22996039)
chr5 (9-234)||(23629208-23629433)
chr5 (9-234)||(24684842-24685067)
chr5 (9-234)||(24973144-24973369)
chr5 (9-222)||(40470247-40470460)
chr5 (9-234)||(18372231-18372456)
chr5 (9-234)||(31434702-31434927)
chr5 (9-234)||(37355340-37355565)
chr5 (9-231)||(23895447-23895669)
chr5 (9-234)||(3792779-3793004)
chr5 (9-234)||(9320714-9320939)
chr5 (9-234)||(12135413-12135638)
chr5 (9-234)||(18497422-18497647)
chr5 (9-234)||(26483632-26483857)
chr5 (14-234)||(43081493-43081713)
chr5 (9-234)||(13321527-13321752)
chr5 (9-234)||(28652480-28652705)
chr5 (9-234)||(30032666-30032891)
chr5 (9-234)||(37767688-37767913)
chr5 (9-234)||(6877543-6877768)
chr5 (9-234)||(8662172-8662397)
chr5 (9-234)||(24586612-24586837)
chr5 (9-234)||(30155269-30155494)
chr5 (9-234)||(30171707-30171932)
chr5 (9-234)||(30937873-30938098)
chr5 (9-234)||(31823104-31823329)
chr5 (9-234)||(33519618-33519843)
chr5 (9-234)||(34619756-34619981)
chr5 (9-234)||(37668183-37668408)
chr5 (9-234)||(37758221-37758446)
chr5 (9-228)||(22891707-22891926)
chr5 (9-231)||(25203519-25203741)
chr5 (9-231)||(25267674-25267896)
chr5 (9-222)||(15755549-15755762)
chr5 (9-234)||(24727207-24727432)
chr5 (9-234)||(32592971-32593196)
chr5 (9-234)||(5641026-5641251)
chr5 (9-234)||(28956482-28956707)
chr5 (9-234)||(2514300-2514525)
chr5 (9-124)||(18125113-18125228)
chr5 (9-123)||(13439380-13439494)
chr5 (14-124)||(9547411-9547521)
chr5 (14-124)||(11326985-11327095)
chr5 (9-124)||(13183490-13183605)
chr5 (14-124)||(29887899-29888009)
chr5 (14-124)||(33878479-33878588)
chr5 (9-96)||(351912-351999)
chr5 (136-192)||(5440049-5440105)
chr5 (136-192)||(11944246-11944302)
chr5 (136-192)||(15784549-15784605)
chr5 (136-192)||(17957376-17957432)
chr5 (146-194)||(34468900-34468948)
chr5 (136-192)||(36375786-36375842)
chr5 (136-192)||(37000440-37000496)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (9-231)||(3301-3523)
scaffold0089 (95-234)||(43877-44016)
scaffold0089 (160-231)||(32096-32167)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (9-234)||(9267-9492)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (9-234)||(30524-30749)
scaffold0143 (9-231)||(19304-19526)
scaffold0143 (9-124)||(7301-7416)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (9-222)||(21894549-21894762)
chr1 (9-234)||(51641451-51641676)
chr1 (9-228)||(20339101-20339320)
chr1 (9-222)||(10965910-10966123)
chr1 (9-234)||(28588218-28588443)
chr1 (9-234)||(3644365-3644593)
chr1 (9-234)||(10948310-10948535)
chr1 (9-222)||(41790110-41790323)
chr1 (9-230)||(16204834-16205055)
chr1 (23-231)||(20464212-20464420)
chr1 (14-124)||(28153079-28153189)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (9-234)||(15812-16037)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (9-228)||(1424-1643)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (9-234)||(22991-23216)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (9-234)||(9253-9478)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (9-234)||(12802-13027)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (9-234)||(11728-11953)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (9-234)||(11180-11405)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (9-234)||(5979-6204)
scaffold0159 (161-234)||(23110-23183)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (9-231)||(9279-9501)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (9-231)||(5471-5693)
[»] scaffold1888 (1 HSPs)
scaffold1888 (137-234)||(1154-1251)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (20-223)||(43541-43754)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (134-194)||(35165-35225)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (158-219)||(33706-33770)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (136-192)||(29443-29499)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Original strand, 15388178 - 15388406
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15388178 acataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 15388277  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
    || ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15388278 cacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 15388377  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15388378 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgc 15388406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 14760106 - 14760331
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  14760106 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 14760205  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14760206 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 14760305  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  14760306 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 14760331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14668485 - 14668260
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  14668485 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 14668386  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668385 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 14668286  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||    
T  14668285 tctctgacttgcttctcggtctgtgg 14668260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5009344 - 5009119
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5009344 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5009245  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5009244 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 5009145  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  5009144 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 5009119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6573327 - 6573102
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  6573327 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 6573228  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6573227 tacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 6573128  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  6573127 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 6573102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17016515 - 17016290
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  17016515 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 17016416  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17016415 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 17016316  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  17016315 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 17016290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 34185760 - 34185985
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  34185760 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 34185859  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34185860 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 34185959  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  34185960 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 34185985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 18313978 - 18314203
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  18313978 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 18314077  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18314078 tacaataggctgattcttgctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18314177  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  18314178 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 18314203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 24589161 - 24589386
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  24589161 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 24589260  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589261 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 24589360  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  24589361 cctctgacttgcttctcagtctgtgg 24589386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 54836860 - 54836635
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  54836860 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 54836761  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  54836760 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgtccgaggaaa 54836661  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  54836660 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 54836635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14102012 - 14101787
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  14102012 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 14101913  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  14101912 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 14101813  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  14101812 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 14101787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 20335221 - 20335446
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  20335221 acataatcaaaggccttccttctacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 20335320  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20335321 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 20335420  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||    
T  20335421 cctctgacttgcttctcggtccgtgg 20335446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24116131 - 24115906
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  24116131 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24116032  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     |  | ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24116031 tacgacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 24115932  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  24115931 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 24115906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 27160117 - 27160342
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27160117 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27160216  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27160217 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27160316  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  27160317 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 27160342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 39854106 - 39853893
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  39854106 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 39854007  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| || ||| || | || |  ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854006 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaagataggcccgcaggttgtggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 39853907  T
Q  209 cctcggacttgctt 222  Q
    |||| |||||||||    
T  39853906 cctctgacttgctt 39853893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15231341 - 15231116
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  15231341 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 15231242  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15231241 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 15231142  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| |||||| || |||||||||||    
T  15231141 cctctgacttgtttctcggtctgtgg 15231116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 18797414 - 18797627
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18797414 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtacttcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18797513  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797514 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18797613  T
Q  209 cctcggacttgctt 222  Q
    |||| |||||||||    
T  18797614 cctctgacttgctt 18797627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 36341317 - 36341542
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||    
T  36341317 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggctttcatcattcca 36341416  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     |  ||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36341417 tacgataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 36341516  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| |||||| || || ||||||||    
T  36341517 cctctgacttgtttctctgtctgtgg 36341542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1903723 - 1903500
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||   |||||    
T  1903723 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcaacgttcca 1903624  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  |||| || ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1903623 tacaataggctgattcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggctgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 1903524  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgt 232  Q
    |||| |||||| || |||||||||    
T  1903523 cctctgacttgtttctcggtctgt 1903500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 33670600 - 33670825
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33670600 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33670699  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  33670700 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 33670799  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  33670800 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 33670825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 15281737 - 15281959
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  15281737 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaaatcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 15281836  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15281837 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 15281936  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctg 231  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  15281937 cctctgacttgtttctcggtctg 15281959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21973170 - 21972945
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  21973170 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 21973071  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  21973070 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 21972971  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  21972970 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 21972945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30757229 - 30757004
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  30757229 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30757130  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  30757129 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 30757030  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  30757029 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 30757004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 31123312 - 31123537
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31123312 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31123411  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  31123412 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31123511  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  31123512 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 31123537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 40102437 - 40102662
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  40102437 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 40102536  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| |  | || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  40102537 tacaacaggctggttcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 40102636  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  40102637 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 40102662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27395017 - 27394789
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27395017 acataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 27394918  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
    || ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394917 cacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27394818  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394817 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgc 27394789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 23125357 - 23125582
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  23125357 acataatcaaaggccttccttccacgggtggcacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 23125456  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23125457 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 23125556  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  23125557 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 23125582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 37948651 - 37948876
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37948651 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37948750  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| || ||| || | || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37948751 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 37948850  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  37948851 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 37948876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12658991 - 12658766
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  12658991 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12658892  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12658891 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 12658792  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||    
T  12658791 cctctgacttgcttctcggtttgtgg 12658766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27807158 - 27806945
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27807158 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27807059  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| || ||| || | || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27807058 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27806959  T
Q  209 cctcggacttgctt 222  Q
    |||| |||||||||    
T  27806958 cctctgacttgctt 27806945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34294609 - 34294384
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  34294609 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 34294510  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34294509 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 34294410  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  34294409 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 34294384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 27431230 - 27431452
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27431230 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27431329  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| | |||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27431330 tacaataggctaattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 27431429  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctg 231  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  27431430 cctctgacttgcttctcggtctg 27431452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28885655 - 28885437
Alignment:
Q  16 caagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataata 115  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||| | ||||    
T  28885655 caagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaata 28885556  T
Q  116 ggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgga 215  Q
    ||||||||| || |||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  28885555 ggttgattctttctgagtagcttgaagaccggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctga 28885456  T
Q  216 cttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  28885455 cttgcttctcggtctgtgg 28885437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20841368 - 20841143
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  20841368 acataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 20841269  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20841268 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 20841169  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  20841168 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 20841143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 39048608 - 39048833
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  39048608 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 39048707  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39048708 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 39048807  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    ||||  |||||||| || ||||||||    
T  39048808 cctcttacttgcttctcagtctgtgg 39048833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 11631973 - 11632198
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  11631973 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11632072  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  11632073 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 11632172  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  11632173 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 11632198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 13933336 - 13933549
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13933336 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 13933435  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13933436 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 13933535  T
Q  209 cctcggacttgctt 222  Q
    |||| |||||||||    
T  13933536 cctctgacttgctt 13933549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 257442 - 257655
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  257442 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 257541  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  257542 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 257641  T
Q  209 cctcggacttgctt 222  Q
    |||| |||||||||    
T  257642 cctctgacttgctt 257655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40236963 - 40236738
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  40236963 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcgaaagcttcttggcattcattattcca 40236864  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40236863 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 40236764  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  40236763 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 40236738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12590263 - 12590050
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  12590263 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 12590164  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12590163 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 12590064  T
Q  209 cctcggacttgctt 222  Q
    |||| |||||||||    
T  12590063 cctctgacttgctt 12590050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31879741 - 31879516
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31879741 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31879642  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  31879641 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31879542  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  31879541 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 31879516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 39893524 - 39893299
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  39893524 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 39893425  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39893424 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 39893325  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  39893324 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 39893299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 16826127 - 16826352
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16826127 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16826226  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  16826227 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 16826326  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  16826327 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 16826352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16895353 - 16895128
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16895353 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16895254  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  16895253 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 16895154  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  16895153 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 16895128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 19413290 - 19413515
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19413290 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 19413389  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  19413390 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 19413489  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  19413490 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 19413515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 32053258 - 32053033
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  32053258 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 32053159  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  32053158 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 32053059  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  32053058 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 32053033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34865139 - 34864914
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  34865139 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 34865040  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  34865039 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 34864940  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  34864939 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 34864914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37381132 - 37380907
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37381132 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37381033  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||    
T  37381032 tacaacaggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaagtgtccgaggaaa 37380933  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| |||||| || |||||||||||    
T  37380932 cctctgacttgtttctcggtctgtgg 37380907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 37682684 - 37682909
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37682684 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37682783  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  37682784 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37682883  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  37682884 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 37682909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 37697949 - 37698174
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37697949 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37698048  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  37698049 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37698148  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  37698149 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 37698174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37928824 - 37928599
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37928824 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37928725  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  37928724 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37928625  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  37928624 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 37928599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 9346775 - 9346988
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  9346775 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 9346874  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  9346875 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 9346974  T
Q  209 cctcggacttgctt 222  Q
    |||| |||||||||    
T  9346975 cctctgacttgctt 9346988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 12713390 - 12713615
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  12713390 acatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12713489  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  12713490 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 12713589  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  12713590 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 12713615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 21673964 - 21674177
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  21673964 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 21674063  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  21674064 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 21674163  T
Q  209 cctcggacttgctt 222  Q
    |||| |||||||||    
T  21674164 cctctgacttgctt 21674177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 21699960 - 21700163
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  21699960 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggattggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 21700059  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21700060 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 21700159  T
Q  209 cctc 212  Q
    ||||    
T  21700160 cctc 21700163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 19453212 - 19453434
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||| |||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  19453212 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgccatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 19453311  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19453312 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 19453411  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctg 231  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  19453412 cctctgacttgtttctcggtctg 19453434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 31890285 - 31890395
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  31890285 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattgttccatacaa 31890384  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||| ||||||    
T  31890385 taggctgattc 31890395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 3785943 - 3785833
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  3785943 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcagttaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 3785844  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||| ||||||    
T  3785843 taggctgattc 3785833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 16164930 - 16164820
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  16164930 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 16164831  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||| ||||||    
T  16164830 taggctgattc 16164820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 22924942 - 22925052
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  22924942 atcaaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 22925041  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||||||||||    
T  22925042 taggttgattc 22925052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27779684 - 27779574
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  27779684 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27779585  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||| ||||||    
T  27779584 taggctgattc 27779574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27819441 - 27819331
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  27819441 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27819342  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||| ||||||    
T  27819341 taggctgattc 27819331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 34158288 - 34158184
Alignment:
Q  20 ggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataataggtt 119  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | |||||| |    
T  34158288 ggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggct 34158189  T
Q  120 gattc 124  Q
    |||||    
T  34158188 gattc 34158184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27119974 - 27119864
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  27119974 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 27119875  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||| ||||||    
T  27119874 taggctgattc 27119864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 27827915 - 27827841
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaa 83  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||    
T  27827915 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaa 27827841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12383988 - 12383932
Alignment:
Q  136 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 192  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12383988 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 12383932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22949721 - 22949665
Alignment:
Q  136 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 192  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22949721 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 22949665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Original strand, 22077672 - 22077900
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22077672 acataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 22077771  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
    || ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077772 cacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatcagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 22077871  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077872 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgc 22077900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 27605666 - 27605891
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27605666 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27605765  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27605766 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27605865  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  27605866 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 27605891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14561079 - 14560854
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  14561079 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 14560980  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | ||||||||||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14560979 tacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 14560880  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  14560879 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 14560854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18794159 - 18793934
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18794159 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18794060  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18794059 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaaacgcccgaggaaa 18793960  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  18793959 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 18793934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 2134021 - 2134246
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2134021 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcattcatcattcca 2134120  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2134121 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 2134220  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  2134221 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 2134246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19691553 - 19691328
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19691553 acataatcaaaggccttccttccgcgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 19691454  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19691453 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 19691354  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||    
T  19691353 cctctgacttgcttctcggtttgtgg 19691328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9358080 - 9357855
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  9358080 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 9357981  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  9357980 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 9357881  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  9357880 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 9357855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 19205123 - 19205336
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19205123 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 19205222  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  19205223 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 19205322  T
Q  209 cctcggacttgctt 222  Q
    |||| |||||||||    
T  19205323 cctctgacttgctt 19205336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29832781 - 29832556
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  29832781 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29832682  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  29832681 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaa 29832582  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  29832581 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 29832556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19677902 - 19677677
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19677902 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 19677803  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  19677802 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 19677703  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  19677702 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 19677677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 28358713 - 28358926
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  28358713 acataatcaaaggccttccttccgcggatgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28358812  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  28358813 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 28358912  T
Q  209 cctcggacttgctt 222  Q
    |||| |||||||||    
T  28358913 cctctgacttgctt 28358926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31357983 - 31357758
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31357983 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31357884  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| |||| || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  31357883 tacaacagggtggttctttttaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31357784  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  31357783 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 31357758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18712939 - 18712714
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  18712939 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 18712840  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18712839 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaa 18712740  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| |||||| || |||||||||||    
T  18712739 cctctgacttgtttctcggtctgtgg 18712714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 12089484 - 12089709
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  12089484 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12089583  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  12089584 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 12089683  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  12089684 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 12089709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33262189 - 33261964
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33262189 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33262090  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  33262089 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 33261990  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  33261989 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 33261964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 31486632 - 31486857
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31486632 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31486731  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||  || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31486732 tacaacaggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgcccgaggaaa 31486831  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  31486832 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 31486857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 15771024 - 15770914
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  15771024 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 15770925  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||| ||||||    
T  15770924 taggctgattc 15770914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 44564434 - 44564347
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcat 101  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44564434 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcat 44564347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Original strand, 21344943 - 21345030
Alignment:
Q  20 ggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcc 107  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||    
T  21344943 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcc 21345030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16286694 - 16286631
Alignment:
Q  172 tatgaatcgggagatgtaattcaaacgcc-cgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16286694 tatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctcgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 16286631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19844494 - 19844409
Alignment:
Q  137 ttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 222  Q
    ||||||||||| || || || || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |  || || ||||||| |||||||||    
T  19844494 ttgaaaattggtccacatgtggcagtcatatgagatataaatctggagatgtagttcaatctaccaagaaaacctctgacttgctt 19844409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 5593200 - 5593425
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5593200 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 5593299  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5593300 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 5593399  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  5593400 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 5593425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18054679 - 18054454
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  18054679 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 18054580  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18054579 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18054480  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  18054479 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 18054454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 18273895 - 18274120
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18273895 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18273994  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18273995 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 18274094  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  18274095 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 18274120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 18289196 - 18289421
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18289196 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18289295  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18289296 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 18289395  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  18289396 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 18289421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 18304497 - 18304722
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18304497 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18304596  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18304597 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 18304696  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  18304697 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 18304722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18334047 - 18333818
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18334047 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18333948  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18333947 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18333848  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgct 238  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  18333847 cctctgacttgcttctcggtctgtggtgct 18333818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 232
Target Start/End: Original strand, 4793478 - 4793701
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4793478 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4793577  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4793578 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 4793677  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgt 232  Q
    |||| ||||||||| |||||||||    
T  4793678 cctctgacttgcttctcggtctgt 4793701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 8286313 - 8286535
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  8286313 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 8286412  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286413 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 8286512  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctg 231  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  8286513 cctctgacttgcttctcggtctg 8286535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6205320 - 6205095
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  6205320 acataatcaagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 6205221  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6205220 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 6205121  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  6205120 cctctgacttgcttctcagtctgtgg 6205095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8299388 - 8299163
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  8299388 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 8299289  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | ||||||||||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8299288 tacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 8299189  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  8299188 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 8299163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 15889548 - 15889773
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  15889548 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15889647  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15889648 tacaataggctgattctttctgaggagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 15889747  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  15889748 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 15889773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21678120 - 21677895
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  21678120 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 21678021  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678020 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 21677921  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  21677920 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 21677895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35884183 - 35883954
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  35884183 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 35884084  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35884083 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 35883984  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtggtgct 238  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  35883983 cctctgacttgcttctcggtctgtggtgct 35883954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4687072 - 4686847
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4687072 acataatcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4686973  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4686972 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 4686873  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  4686872 cctctgacttgcttctcagtctgtgg 4686847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4725048 - 4724823
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4725048 acataatcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4724949  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724948 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 4724849  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  4724848 cctctgacttgcttctcagtctgtgg 4724823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 15737937 - 15738162
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  15737937 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 15738036  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | | |||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15738037 tacagtaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 15738136  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  15738137 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 15738162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 22384421 - 22384646
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  22384421 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 22384520  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | ||||||||||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22384521 tacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgttcgaggaaa 22384620  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  22384621 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 22384646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 29145599 - 29145824
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  29145599 acataatcaaaggccttccctccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29145698  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29145699 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 29145798  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||    
T  29145799 cctctaacttgcttctcggtctgtgg 29145824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 29661813 - 29662038
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  29661813 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29661912  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  | || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29661913 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 29662012  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  29662013 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 29662038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8215152 - 8214927
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  8215152 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 8215053  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
    || || ||| |||||  || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  8215052 cacaacaggctgattttttctgagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 8214953  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  8214952 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 8214927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20069457 - 20069232
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  20069457 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 20069358  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     |  ||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20069357 tacgataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 20069258  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  20069257 cctctgacttgcttctcagtctgtgg 20069232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 20573686 - 20573899
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||    
T  20573686 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcctcattcca 20573785  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| || ||| || | || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20573786 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 20573885  T
Q  209 cctcggacttgctt 222  Q
    |||| |||||||||    
T  20573886 cctctgacttgctt 20573899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32442568 - 32442355
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  32442568 acataatcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 32442469  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||  |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32442468 tacaacagactgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 32442369  T
Q  209 cctcggacttgctt 222  Q
    |||| |||||||||    
T  32442368 cctctgacttgctt 32442355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 48469344 - 48469119
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  48469344 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcattattcca 48469245  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48469244 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 48469145  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||  |||||| || || ||||||||    
T  48469144 cctatgacttgtttctctgtctgtgg 48469119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7076623 - 7076398
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  7076623 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 7076524  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| || ||| || |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  7076523 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgcgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 7076424  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  7076423 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 7076398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 28112797 - 28113022
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  28112797 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattcca 28112896  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  28112897 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgctgtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 28112996  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  28112997 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 28113022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 47026870 - 47026645
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  47026870 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 47026771  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  47026770 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 47026671  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  47026670 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 47026645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5017131 - 5016906
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5017131 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5017032  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  5017031 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 5016932  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  5016931 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 5016906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 5606157 - 5606382
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5606157 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5606256  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  5606257 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 5606356  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  5606357 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 5606382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10399561 - 10399336
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  10399561 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 10399462  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10399461 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 10399362  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| |||||| || || ||||||||    
T  10399361 cctctgacttgtttctctgtctgtgg 10399336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28342594 - 28342369
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  28342594 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28342495  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  28342494 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 28342395  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  28342394 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 28342369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 4343519 - 4343744
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4343519 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4343618  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4343619 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4343718  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  4343719 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 4343744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4420332 - 4420107
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4420332 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4420233  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4420232 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4420133  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  4420132 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 4420107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5470405 - 5470180
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5470405 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5470306  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  5470305 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 5470206  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  5470205 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 5470180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 6539585 - 6539810
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  6539585 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 6539684  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  6539685 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 6539784  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  6539785 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 6539810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7999977 - 7999752
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  7999977 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 7999878  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  7999877 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 7999778  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  7999777 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 7999752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10646490 - 10646265
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  10646490 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 10646391  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  10646390 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 10646291  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  10646290 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 10646265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18246158 - 18245945
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18246158 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18246059  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  18246058 tacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 18245959  T
Q  209 cctcggacttgctt 222  Q
    |||| |||||||||    
T  18245958 cctctgacttgctt 18245945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 22867691 - 22867916
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  22867691 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 22867790  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  22867791 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 22867890  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  22867891 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 22867916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 22882750 - 22882975
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  22882750 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 22882849  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  22882850 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 22882949  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  22882950 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 22882975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28024699 - 28024474
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  28024699 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 28024600  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28024599 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 28024500  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  28024499 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 28024474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19697907 - 19697687
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  19697907 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgacgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 19697808  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| | ||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  19697807 tacaataggctgattcttcttgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaattgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 19697708  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtc 229  Q
    |||| |||||| || ||||||    
T  19697707 cctctgacttgtttctcggtc 19697687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 16621333 - 16621555
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  16621333 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 16621432  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16621433 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 16621532  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctg 231  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  16621533 cctctgacttgtttctcggtctg 16621555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24331580 - 24331355
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  24331580 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctttttggcattcatcattcca 24331481  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  24331480 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 24331381  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  24331380 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 24331355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 31961298 - 31961523
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31961298 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31961397  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  31961398 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31961497  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  31961498 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 31961523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 51785440 - 51785215
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  51785440 acatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 51785341  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  51785340 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 51785241  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  51785240 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 51785215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 17981792 - 17982017
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  17981792 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 17981891  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  17981892 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 17981991  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  17981992 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 17982017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18228613 - 18228388
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18228613 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18228514  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  18228513 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 18228414  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  18228413 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 18228388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 234
Target Start/End: Original strand, 11107226 - 11107420
Alignment:
Q  40 gacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataataggttgattcattttgagaaatttg 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| | |||||| ||| || || |||| |  |||    
T  11107226 gacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcttcattccatacaataggctgactctttctgagtagcttg 11107325  T
Q  140 aaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11107326 aagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 11107420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 17992779 - 17992889
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  17992779 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 17992878  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||||||||||    
T  17992879 taggttgattc 17992889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 31033084 - 31033194
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  31033084 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatataa 31033183  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||| ||||||    
T  31033184 taggctgattc 31033194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4627202 - 4627087
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4627202 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4627103  T
Q  109 cataataggttgattc 124  Q
     | |||||| ||||||    
T  4627102 tacaataggctgattc 4627087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 32294040 - 32293930
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  32294040 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 32293941  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||| ||||||    
T  32293940 taggctgattc 32293930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 5714490 - 5714375
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  5714490 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 5714391  T
Q  109 cataataggttgattc 124  Q
     | |||||| ||||||    
T  5714390 tacaataggctgattc 5714375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 5725400 - 5725285
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  5725400 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 5725301  T
Q  109 cataataggttgattc 124  Q
     | |||||| ||||||    
T  5725300 tacaataggctgattc 5725285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 5766968 - 5767083
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  5766968 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 5767067  T
Q  109 cataataggttgattc 124  Q
     | |||||| ||||||    
T  5767068 tacaataggctgattc 5767083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 194
Target Start/End: Original strand, 15592879 - 15592939
Alignment:
Q  134 aatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 194  Q
    |||||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15592879 aatttgaatatcggcctgcacgttgctgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 15592939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 96
Target Start/End: Original strand, 6963276 - 6963363
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggca 96  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| | || |||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  6963276 acatgatcaaaggccttccttcaactggagggacaagaatcggaggttctaacaaataccctttgatgctatcaaaagctttctggca 6963363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15918807 - 15918749
Alignment:
Q  136 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 194  Q
    |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15918807 tttgaatatcggtccgcacgttgctgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 15918749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20443407 - 20443349
Alignment:
Q  136 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 194  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20443407 tttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaattca 20443349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 41440533 - 41440475
Alignment:
Q  136 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 194  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41440533 tttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaattca 41440475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Original strand, 5950772 - 5950828
Alignment:
Q  136 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 192  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5950772 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 5950828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 10913554 - 10913779
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  10913554 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 10913653  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10913654 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 10913753  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  10913754 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 10913779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2158027 - 2157802
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  2158027 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 2157928  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2157927 tacaataggctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 2157828  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  2157827 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 2157802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26438710 - 26438485
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  26438710 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26438611  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| || ||| || | || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26438610 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 26438511  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| |||||| || |||||||||||    
T  26438510 cctctgacttgtttctcggtctgtgg 26438485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 26534558 - 26534783
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  26534558 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26534657  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26534658 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggaaatgtaattcaaacgcccgaggaaa 26534757  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||    
T  26534758 cctctgacttgcttctcggtttgtgg 26534783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 2106848 - 2107073
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  2106848 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 2106947  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | ||||||||||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2106948 tacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 2107047  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||    
T  2107048 cctctgacttgcttctcggtatgtgg 2107073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 11421464 - 11421689
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  11421464 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 11421563  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11421564 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaac 11421663  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  11421664 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 11421689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 26271771 - 26271996
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26271771 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcattcatcattcca 26271870  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26271871 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 26271970  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  26271971 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 26271996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45390673 - 45390448
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  45390673 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 45390574  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| || |||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  45390573 tacaacaggctgattctttctgagtagtttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 45390474  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  45390473 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 45390448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 16515115 - 16515337
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||    
T  16515115 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagattcttggcattcatcattcca 16515214  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16515215 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcagcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 16515314  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctg 231  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  16515315 cctctgacttgcttctcggtctg 16515337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5131449 - 5131224
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5131449 acataatcaaaggcctcccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5131350  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5131349 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 5131250  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  5131249 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 5131224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 5144025 - 5144250
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  5144025 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 5144124  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5144125 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcaaacgtccgaggaaa 5144224  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  5144225 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 5144250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22145648 - 22145423
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  22145648 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 22145549  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22145548 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaa 22145449  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    ||||  ||||| || |||||||||||    
T  22145448 cctctaacttgtttctcggtctgtgg 22145423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26516245 - 26516032
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  26516245 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26516146  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26516145 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 26516046  T
Q  209 cctcggacttgctt 222  Q
    |||| |||||||||    
T  26516045 cctctgacttgctt 26516032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 26316533 - 26316758
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  26316533 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26316632  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  26316633 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 26316732  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  26316733 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 26316758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10845073 - 10844851
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  10845073 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttacagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 10844974  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10844973 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 10844874  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctg 231  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  10844873 cctctgacttgtttctcggtctg 10844851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3448759 - 3448534
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  3448759 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 3448660  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  3448659 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 3448560  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  3448559 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 3448534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 4141931 - 4142156
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4141931 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4142030  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4142031 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4142130  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  4142131 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 4142156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4202842 - 4202617
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4202842 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4202743  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| ||  || || |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  4202742 tacaataggctggctctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 4202643  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    ||||  |||||||| || ||||||||    
T  4202642 cctctaacttgcttctctgtctgtgg 4202617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11444340 - 11444115
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  11444340 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11444241  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  11444240 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 11444141  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  11444140 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 11444115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 31561075 - 31561288
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31561075 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31561174  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  31561175 tacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31561274  T
Q  209 cctcggacttgctt 222  Q
    |||| |||||||||    
T  31561275 cctctgacttgctt 31561288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16044758 - 16044550
Alignment:
Q  23 cttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataataggttgat 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| ||| || || ||||||||||  ||||| | |||||| ||||    
T  16044758 cttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctattaaaagcctcttggcattcatcgttccatacaataggctgat 16044659  T
Q  123 tcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 222  Q
    || |  |||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  16044658 tcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgttt 16044559  T
Q  223 ttcggtctg 231  Q
     ||||||||    
T  16044558 ctcggtctg 16044550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 10842679 - 10842901
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  10842679 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 10842778  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10842779 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatataaatcgggagatgtaatgcaatcgcccgaggaaa 10842878  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctg 231  Q
    ||||  ||||| || ||||||||    
T  10842879 cctctaacttgtttctcggtctg 10842901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 16748202 - 16748415
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16748202 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16748301  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || |||||||||| |  |||| |  ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  16748302 tacaacaggttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 16748401  T
Q  209 cctcggacttgctt 222  Q
    |||| |||||||||    
T  16748402 cctctgacttgctt 16748415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 26666599 - 26666824
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  26666599 acataatcaaaggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26666698  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     |  | ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  26666699 tacgacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 26666798  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  26666799 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 26666824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 24589219 - 24589444
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  24589219 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgattccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24589318  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  24589319 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 24589418  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  24589419 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 24589444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 16446691 - 16446894
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||  | ||||||||||  |||||    
T  16446691 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagccccttggcattcatcgttcca 16446790  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||  |||||| |  |||| |  ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16446791 tacaatagtctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcctgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcacccgaggaaa 16446890  T
Q  209 cctc 212  Q
    ||||    
T  16446891 cctc 16446894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9622026 - 9621878
Alignment:
Q  86 gcttcctggcattcattattccacataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggaga 185  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9622026 gcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagaga 9621927  T
Q  186 tgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||    
T  9621926 tgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtgg 9621878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 2776702 - 2776592
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  2776702 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 2776603  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||| ||||||    
T  2776602 taggctgattc 2776592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 26512386 - 26512496
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  26512386 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 26512485  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||| ||||||    
T  26512486 taggctgattc 26512496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 26681796 - 26681906
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  26681796 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 26681895  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||| ||||||    
T  26681896 taggctgattc 26681906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 31127355 - 31127245
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  31127355 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 31127256  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||| ||||||    
T  31127255 taggctgattc 31127245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 39209829 - 39209939
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  39209829 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 39209928  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||||||||||    
T  39209929 taggttgattc 39209939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 45734761 - 45734658
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  45734761 atcaaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 45734662  T
Q  114 tagg 117  Q
    ||||    
T  45734661 tagg 45734658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 31087312 - 31087422
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| | ||    
T  31087312 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaa 31087411  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||| ||||||    
T  31087412 taggctgattc 31087422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9469646 - 9469590
Alignment:
Q  136 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 192  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9469646 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 9469590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 194
Target Start/End: Original strand, 16287201 - 16287249
Alignment:
Q  146 ggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 194  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16287201 ggcccacatgttgcagtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 16287249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Original strand, 16393246 - 16393302
Alignment:
Q  136 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 192  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16393246 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 16393302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Original strand, 30369758 - 30369814
Alignment:
Q  136 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 192  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30369758 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 30369814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27022589 - 27022364
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27022589 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27022490  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27022489 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatataaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27022390  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  27022389 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 27022364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 27287107 - 27287332
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27287107 acataatcaaaggccttccttccacaggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27287206  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||  || |||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27287207 tacaataggctgattatttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27287306  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  27287307 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 27287332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29553010 - 29552785
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  29553010 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29552911  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29552910 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 29552811  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  29552810 cctctgacttgcttctcagtctgtgg 29552785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 13295694 - 13295919
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||    
T  13295694 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttagcattcatcattcca 13295793  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13295794 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 13295893  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  13295894 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 13295919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 15421063 - 15421288
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  15421063 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15421162  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15421163 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 15421262  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  15421263 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 15421288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 22931627 - 22931852
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  22931627 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 22931726  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22931727 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 22931826  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  22931827 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 22931852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 23854072 - 23854297
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  23854072 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 23854171  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854172 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 23854271  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  23854272 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 23854297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24867169 - 24866944
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  24867169 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24867070  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24867069 tacaataggctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 24866970  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  24866969 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 24866944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 27626454 - 27626679
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27626454 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27626553  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
    || |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27626554 cacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 27626653  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||    
T  27626654 cctctgacttgcttctcggtccgtgg 27626679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16677593 - 16677368
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16677593 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16677494  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16677493 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcagattgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 16677394  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| |||||| || || ||||||||    
T  16677393 cctctgacttgtttctctgtctgtgg 16677368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27179909 - 27179684
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||    
T  27179909 acataatcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcattcatcattcca 27179810  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27179809 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27179710  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  27179709 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 27179684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 27269330 - 27269555
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||    
T  27269330 acataatcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcattcatcattcca 27269429  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27269430 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27269529  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  27269530 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 27269555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 34461249 - 34461474
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  34461249 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 34461348  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34461349 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 34461448  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  34461449 cctctgacttgcttctcagtctgtgg 34461474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3699536 - 3699311
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3699536 acatgatcaaaggccttccttccacacgtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 3699437  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3699436 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 3699337  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| |||||| || || ||||||||    
T  3699336 cctctgacttgtttctctgtctgtgg 3699311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4761216 - 4760991
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4761216 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4761117  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| || ||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4761116 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4761017  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  4761016 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 4760991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 17089186 - 17089411
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  17089186 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 17089285  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
    || |||||| |||||| |  |||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17089286 cacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggtagcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 17089385  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||    
T  17089386 cctctgacttgcttctcggtccgtgg 17089411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27011184 - 27010959
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27011184 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27011085  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| || ||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  27011084 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 27010985  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  27010984 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 27010959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26921819 - 26921605
Alignment:
Q  20 ggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataataggtt 119  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| | || ||| |    
T  26921819 ggccttccttccacgggtgggacaaagataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcattattccaaacaacaggct 26921720  T
Q  120 gattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttg 219  Q
    ||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26921719 gattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttg 26921620  T
Q  220 cttttcggtctgtgg 234  Q
    ||| |||||||||||    
T  26921619 cttctcggtctgtgg 26921605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16753263 - 16753049
Alignment:
Q  20 ggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataataggtt 119  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| | |||||| |    
T  16753263 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggct 16753164  T
Q  120 gattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttg 219  Q
    ||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  16753163 gattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttg 16753064  T
Q  220 cttttcggtctgtgg 234  Q
     || |||||||||||    
T  16753063 tttctcggtctgtgg 16753049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27060959 - 27060734
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  27060959 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 27060860  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27060859 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgtccgaggaaa 27060760  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  27060759 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 27060734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29504869 - 29504644
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  29504869 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29504770  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  29504769 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaa 29504670  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  29504669 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 29504644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4528738 - 4528513
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||    
T  4528738 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatccca 4528639  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4528638 tacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4528539  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  4528538 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 4528513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 4542517 - 4542742
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4542517 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4542616  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4542617 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4542716  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  4542717 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 4542742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 4720878 - 4721103
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4720878 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4720977  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4720978 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4721077  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  4721078 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 4721103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27488586 - 27488361
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27488586 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27488487  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  27488486 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 27488387  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  27488386 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 27488361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29576467 - 29576242
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  29576467 acatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29576368  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  29576367 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaa 29576268  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  29576267 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 29576242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 30554759 - 30554984
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  30554759 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30554858  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  30554859 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 30554958  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  30554959 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 30554984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20172000 - 20171797
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  20172000 acataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 20171901  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
    || ||| ||||||||| |  |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20171900 cacaatgggttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 20171801  T
Q  209 cctc 212  Q
    ||||    
T  20171800 cctc 20171797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 22163991 - 22164194
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  22163991 acataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 22164090  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
    || ||| ||||||||| |  |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22164091 cacaatgggttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 22164190  T
Q  209 cctc 212  Q
    ||||    
T  22164191 cctc 22164194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 16940770 - 16940995
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16940770 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16940869  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  16940870 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 16940969  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  16940970 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 16940995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 26113155 - 26113380
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  26113155 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26113254  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  26113255 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 26113354  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  26113355 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 26113380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28210907 - 28210682
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  28210907 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28210808  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  28210807 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 28210708  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  28210707 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 28210682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4776333 - 4776108
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4776333 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4776234  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4776233 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4776134  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  4776133 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 4776108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 22455857 - 22455972
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22455857 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 22455956  T
Q  109 cataataggttgattc 124  Q
    || |||||||||||||    
T  22455957 cacaataggttgattc 22455972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 26992248 - 26992096
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  26992248 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 26992149  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcgg 161  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || ||||||||||||||||    
T  26992148 tagaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcgg 26992096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 26775370 - 26775485
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  26775370 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 26775469  T
Q  109 cataataggttgattc 124  Q
     | |||||| ||||||    
T  26775470 tacaataggctgattc 26775485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 27358853 - 27358968
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  27358853 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 27358952  T
Q  109 cataataggttgattc 124  Q
     | |||||| ||||||    
T  27358953 tacaataggctgattc 27358968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 27449196 - 27449311
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  27449196 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 27449295  T
Q  109 cataataggttgattc 124  Q
     | |||||| ||||||    
T  27449296 tacaataggctgattc 27449311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 14142142 - 14142252
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  14142142 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 14142241  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||| ||||||    
T  14142242 taggctgattc 14142252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 26789264 - 26789154
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  26789264 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 26789165  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||| ||||||    
T  26789164 taggctgattc 26789154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27197633 - 27197523
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  27197633 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27197534  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||| ||||||    
T  27197533 taggctgattc 27197523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 27251602 - 27251712
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  27251602 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27251701  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||| ||||||    
T  27251702 taggctgattc 27251712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Original strand, 8902451 - 8902554
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||    
T  8902451 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcatgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaa 8902550  T
Q  114 tagg 117  Q
    ||||    
T  8902551 tagg 8902554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 28163944 - 28163836
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  28163944 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28163845  T
Q  109 cataatagg 117  Q
     | ||||||    
T  28163844 tacaatagg 28163836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Original strand, 33373174 - 33373273
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33373174 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33373273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 13520940 - 13521049
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||| | ||    
T  13520940 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcc-ggcattcatcgttccatacaa 13521038  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||| ||||||    
T  13521039 taggctgattc 13521049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Original strand, 9136223 - 9136279
Alignment:
Q  136 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 192  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9136223 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 9136279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 15655455 - 15655680
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  15655455 acataatcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15655554  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | ||| || |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15655555 tacaatgggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 15655654  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  15655655 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 15655680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41678168 - 41677943
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  41678168 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 41678069  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41678068 tacaataggctgattctttctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 41677969  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||    
T  41677968 cctctaacttgcttctcggtctgtgg 41677943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11552818 - 11552593
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  11552818 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11552719  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552718 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 11552619  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  11552618 cctctgacttgcttctcagtctgtgg 11552593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33295991 - 33295766
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33295991 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33295892  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33295891 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 33295792  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  33295791 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 33295766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33780952 - 33780727
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33780952 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33780853  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33780852 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 33780753  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  33780752 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 33780727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 22995814 - 22996039
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  22995814 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 22995913  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22995914 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 22996013  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  22996014 cctctgacttgcttctcagtctgtgg 22996039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23629433 - 23629208
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  23629433 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 23629334  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23629333 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 23629234  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  23629233 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 23629208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 24684842 - 24685067
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  24684842 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24684941  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24684942 tacaataggctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 24685041  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  24685042 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 24685067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24973369 - 24973144
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24973369 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcattattcca 24973270  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  24973269 tacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaagcgtccgaggaaa 24973170  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  24973169 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 24973144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 40470247 - 40470460
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40470247 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 40470346  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| || ||| || | || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470347 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 40470446  T
Q  209 cctcggacttgctt 222  Q
    |||| |||||||||    
T  40470447 cctctgacttgctt 40470460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 18372231 - 18372456
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18372231 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 18372330  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  18372331 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 18372430  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  18372431 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 18372456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31434927 - 31434702
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31434927 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31434828  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| || ||| || |||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  31434827 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31434728  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  31434727 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 31434702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 37355340 - 37355565
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37355340 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37355439  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  37355440 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37355539  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  37355540 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 37355565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23895669 - 23895447
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||  |||||    
T  23895669 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcataagcttcttggcattcatcgttcca 23895570  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23895569 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 23895470  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctg 231  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  23895469 cctctgacttgtttctcggtctg 23895447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3793004 - 3792779
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3793004 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 3792905  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3792904 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 3792805  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  3792804 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 3792779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9320939 - 9320714
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  9320939 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 9320840  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  9320839 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 9320740  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  9320739 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 9320714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12135638 - 12135413
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  12135638 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12135539  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  12135538 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 12135439  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  12135438 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 12135413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 18497422 - 18497647
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18497422 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18497521  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18497522 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18497621  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| |||||| || || ||||||||    
T  18497622 cctctgacttgtttctctgtctgtgg 18497647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26483857 - 26483632
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  26483857 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26483758  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  26483757 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 26483658  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  26483657 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 26483632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43081713 - 43081493
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||    
T  43081713 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 43081614  T
Q  114 taggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcg 213  Q
     ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  43081613 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctct 43081514  T
Q  214 gacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  43081513 gacttgcttctcggtctgtgg 43081493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 13321527 - 13321752
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13321527 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 13321626  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  13321627 tacaacaggctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 13321726  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  13321727 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 13321752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28652705 - 28652480
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  28652705 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28652606  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  28652605 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 28652506  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  28652505 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 28652480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30032891 - 30032666
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  30032891 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30032792  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| || ||| || | || |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  30032791 tacaataggctggttctttctaagcagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 30032692  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  30032691 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 30032666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 37767688 - 37767913
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37767688 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37767787  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  37767788 tacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37767887  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  37767888 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 37767913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6877768 - 6877543
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||    
T  6877768 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatccca 6877669  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  6877668 tacaacaggctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 6877569  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  6877568 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 6877543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 8662172 - 8662397
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  8662172 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 8662271  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  8662272 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 8662371  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  8662372 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 8662397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24586837 - 24586612
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  24586837 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24586738  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  24586737 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 24586638  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  24586637 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 24586612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30155494 - 30155269
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  30155494 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30155395  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  30155394 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 30155295  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  30155294 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 30155269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30171932 - 30171707
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  30171932 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcactcatcattcca 30171833  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| || ||  || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30171832 tacaataggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 30171733  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  30171732 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 30171707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30938098 - 30937873
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||   ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  30938098 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatatgtggttccagcaggtaactcttggtgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 30937999  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30937998 tacaataggctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 30937899  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  30937898 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 30937873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 31823104 - 31823329
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31823104 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31823203  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  31823204 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31823303  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  31823304 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 31823329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33519843 - 33519618
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33519843 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33519744  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  33519743 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 33519644  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  33519643 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 33519618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34619981 - 34619756
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  34619981 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 34619882  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34619881 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 34619782  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  34619781 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 34619756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 37668183 - 37668408
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37668183 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37668282  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  37668283 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37668382  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  37668383 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 37668408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37758446 - 37758221
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37758446 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37758347  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  37758346 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37758247  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  37758246 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 37758221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22891926 - 22891707
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  22891926 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 22891827  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22891826 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcgggccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 22891727  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggt 228  Q
    |||| |||||| || |||||    
T  22891726 cctctgacttgtttctcggt 22891707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25203741 - 25203519
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||| ||||  |||||    
T  25203741 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagtcatcgttcca 25203642  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25203641 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 25203542  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctg 231  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  25203541 cctctgacttgtttctcggtctg 25203519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25267896 - 25267674
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||| ||||  |||||    
T  25267896 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagtcatcgttcca 25267797  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25267796 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 25267697  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctg 231  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  25267696 cctctgacttgtttctcggtctg 25267674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 15755549 - 15755762
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  15755549 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15755648  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  15755649 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 15755748  T
Q  209 cctcggacttgctt 222  Q
    |||| |||||||||    
T  15755749 cctctgacttgctt 15755762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24727432 - 24727207
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  24727432 acatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24727333  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  24727332 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 24727233  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  24727232 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 24727207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 32592971 - 32593196
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  32592971 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 32593070  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  32593071 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgagagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 32593170  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  32593171 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 32593196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5641251 - 5641026
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5641251 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5641152  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  5641151 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 5641052  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  5641051 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 5641026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 28956482 - 28956707
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  28956482 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 28956581  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| || ||  || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28956582 tacaataggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 28956681  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  28956682 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 28956707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2514525 - 2514300
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||   |||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  2514525 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaactcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 2514426  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  2514425 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 2514326  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  2514325 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 2514300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 18125113 - 18125228
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  18125113 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 18125212  T
Q  109 cataataggttgattc 124  Q
     | |||||| ||||||    
T  18125213 tacaataggctgattc 18125228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Original strand, 13439380 - 13439494
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  13439380 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 13439479  T
Q  109 cataataggttgatt 123  Q
     | |||||| |||||    
T  13439480 tacaataggctgatt 13439494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 9547411 - 9547521
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  9547411 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 9547510  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||| ||||||    
T  9547511 taggctgattc 9547521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11327095 - 11326985
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  11327095 atcaaaggccttccttccatgggagggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 11326996  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||||||||||    
T  11326995 taggttgattc 11326985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 13183490 - 13183605
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||    
T  13183490 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggaattcatcgttcca 13183589  T
Q  109 cataataggttgattc 124  Q
     | |||||| ||||||    
T  13183590 tacaataggctgattc 13183605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 29887899 - 29888009
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  29887899 atcaaaggccttccttccacggatgagacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 29887998  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||| ||||||    
T  29887999 taggctgattc 29888009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 33878588 - 33878479
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||| | ||    
T  33878588 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcc-ggcattcatcgttccatacaa 33878490  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||| ||||||    
T  33878489 taggctgattc 33878479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 96
Target Start/End: Original strand, 351912 - 351999
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggca 96  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| | || |||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  351912 acatgatcaaaggccttccttcaactggagggacaagaatcggaggttctaacaaataccctttgatgctatcaaaagctttctggca 351999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Original strand, 5440049 - 5440105
Alignment:
Q  136 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 192  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5440049 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 5440105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Original strand, 11944246 - 11944302
Alignment:
Q  136 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 192  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11944246 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 11944302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Original strand, 15784549 - 15784605
Alignment:
Q  136 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 192  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15784549 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 15784605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17957432 - 17957376
Alignment:
Q  136 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 192  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17957432 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 17957376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 34468948 - 34468900
Alignment:
Q  146 ggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 194  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34468948 ggcccacatgttgcagtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 34468900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Original strand, 36375786 - 36375842
Alignment:
Q  136 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 192  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36375786 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 36375842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Original strand, 37000440 - 37000496
Alignment:
Q  136 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 192  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37000440 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 37000496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3523 - 3301
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  3523 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 3424  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3423 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 3324  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctg 231  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  3323 cctctgacttgcttctcggtctg 3301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 95 - 234
Target Start/End: Original strand, 43877 - 44016
Alignment:
Q  95 cattcattattccacataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 194  Q
    ||||||| |||||| | |||||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43877 cattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 43976  T
Q  195 aacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  43977 aacgcccgaggaaacctctgacttgcttctgggtctgtgg 44016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 231
Target Start/End: Original strand, 32096 - 32167
Alignment:
Q  160 ggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctg 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32096 ggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 32167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9492 - 9267
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  9492 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 9393  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9392 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 9293  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  9292 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 9267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30749 - 30524
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  30749 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30650  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30649 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 30550  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  30549 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 30524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19526 - 19304
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  19526 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 19427  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19426 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 19327  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctg 231  Q
    ||||  ||||| || ||||||||    
T  19326 cctctaacttgtttctcggtctg 19304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 7416 - 7301
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  7416 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 7317  T
Q  109 cataataggttgattc 124  Q
     | |||||| ||||||    
T  7316 tacaataggctgattc 7301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 21894549 - 21894762
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  21894549 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 21894648  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| || | || |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21894649 tacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 21894748  T
Q  209 cctcggacttgctt 222  Q
    |||| |||||||||    
T  21894749 cctctgacttgctt 21894762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 51641676 - 51641451
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  51641676 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 51641577  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| || |||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  51641576 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 51641477  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  51641476 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 51641451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 20339101 - 20339320
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  20339101 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattcca 20339200  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20339201 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 20339300  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggt 228  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  20339301 cctctgacttgcttttcggt 20339320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10966123 - 10965910
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  10966123 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 10966024  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| |||||| |  |||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10966023 tacaacaggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 10965924  T
Q  209 cctcggacttgctt 222  Q
    |||| |||||||||    
T  10965923 cctctgacttgctt 10965910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28588443 - 28588218
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  28588443 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28588344  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28588343 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgcccgaggaaa 28588244  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  28588243 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 28588218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3644593 - 3644365
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataat-ctttgatgctatcaaaggcttcct-ggcattcattattc 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  3644593 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattctttgatgctatcaaaagcttctttggcattcatcattc 3644494  T
Q  107 cacataataggttgattcattt-tgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 205  Q
    || | |||||| |||||| ||| | || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3644493 catacaataggctgattcttttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 3644394  T
Q  206 aaacctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  3644393 aaacctctgacttgcttctctgtctgtgg 3644365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10948535 - 10948310
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  10948535 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 10948436  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  10948435 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 10948336  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  10948335 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 10948310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 41790110 - 41790323
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  41790110 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 41790209  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  41790210 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 41790309  T
Q  209 cctcggacttgctt 222  Q
    |||| |||||||||    
T  41790310 cctctgacttgctt 41790323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 16204834 - 16205055
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||   ||||| ||||  |||||    
T  16204834 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctctttggcagtcatcgttcca 16204933  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  16204934 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctgaggaaa 16205033  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtct 230  Q
    |||| ||||||||| |||||||    
T  16205034 cctctgacttgcttctcggtct 16205055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20464420 - 20464212
Alignment:
Q  23 cttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataataggttgat 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| | |||||| ||||    
T  20464420 cttccttccacgggtgggacaaggataggtgtttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctgat 20464321  T
Q  123 tcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 222  Q
    || |  |||| |  ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  20464320 tcttcctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctcagacttgttt 20464221  T
Q  223 ttcggtctg 231  Q
     ||||||||    
T  20464220 ctcggtctg 20464212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 28153189 - 28153079
Alignment:
Q  14 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacataa 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  28153189 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 28153090  T
Q  114 taggttgattc 124  Q
    |||| ||||||    
T  28153089 taggctgattc 28153079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16037 - 15812
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16037 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15938  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15937 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 15838  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  15837 cctctgacttgcttctcggtctgtgg 15812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 1424 - 1643
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  1424 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattcca 1523  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1524 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 1623  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggt 228  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  1624 cctctgacttgcttttcggt 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 22991 - 23216
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  22991 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 23090  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |  |||| |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||    
T  23091 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 23190  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  23191 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 23216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9478 - 9253
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  9478 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 9379  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  9378 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 9279  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  9278 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 9253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13027 - 12802
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13027 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12928  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||  || |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  12927 tacaacaggctggttttttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 12828  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  12827 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 12802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 11728 - 11953
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  11728 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11827  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  11828 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 11927  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  11928 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 11953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11405 - 11180
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  11405 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11306  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || | || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  11305 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 11206  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  11205 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 11180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 5979 - 6204
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||| |||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  5979 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatactatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 6078  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | || ||| || ||| || |||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  6079 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 6178  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||    
T  6179 cctctgacttgcttctctgtctgtgg 6204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23183 - 23110
Alignment:
Q  161 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  23183 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtgg 23110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9501 - 9279
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||| ||  | || |||||||  |||||    
T  9501 acataatcaaaggccttccttccacaagtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgttatcaaaagccccttgacattcatcgttcca 9402  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     | |||||| |||||| |   ||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  9401 tacaataggctgattcttccagagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaag 9302  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctg 231  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  9301 cctctgacttgtttctcggtctg 9279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 5471 - 5693
Alignment:
Q  9 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 108  Q
    |||| ||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||    
T  5471 acatgatcaacgaccttccttccacaggtgggacaaggataggtggctctaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcatttca 5570  T
Q  109 cataataggttgattcattttgagaaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 208  Q
     |  | |||||||||  |  |||| |  ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  5571 taccacaggttgatttttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggtggcagtcatgtgagatatgaaccttgagatataattcaaacgcccgagaaaa 5670  T
Q  209 cctcggacttgcttttcggtctg 231  Q
    |||| ||||||||| || |||||    
T  5671 cctctgacttgcttctcagtctg 5693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1888 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1888
Description:

Target: scaffold1888; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 137 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1251 - 1154
Alignment:
Q  137 ttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtgg 234  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1251 ttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcattcgttcgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 1154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 223
Target Start/End: Original strand, 43541 - 43754
Alignment:
Q  20 ggccttccttccactggcgggacaaggata-ggtggttccagcagataatct-ttgatgctatc--aaaggcttcctggcattcatt--attccacataa 113  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||   ||| ||||| ||||||||| |  |||||| | ||    
T  43541 ggccttccttccacgggtgggacaaggataaggtggttccagcaggtaatttcttgatgctatacaaaaagcttcttggcattcaattaattccatacaa 43640  T
Q  114 taggt-tgattcattttga-gaaatttgaaaattggcccgcaggtt-gcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaa-ttcaaacgcccgaggaaac 209  Q
    ||||  |||||| || | | | |  ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||    
T  43641 taggactgattctttctaaagtagcttgaagatcggcccgcaggtttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattttaagcgtccgaggaaac 43740  T
Q  210 ctcggacttgcttt 223  Q
    ||| ||||||||||    
T  43741 ctctgacttgcttt 43754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 194
Target Start/End: Original strand, 35165 - 35225
Alignment:
Q  134 aatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 194  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35165 aatttgaatatcggcccgcacgttgccgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 35225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33770 - 33706
Alignment:
Q  158 gcggtcatatgagatat-gaa-tcgggagatgtaattcaaacg-cccgaggaaacctcggacttg 219  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33770 gcggtcatgtgagatatagaagtcgggagatgtaattcaaacgccccgaggaaacctctgacttg 33706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 29499 - 29443
Alignment:
Q  136 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 192  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29499 tttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 29443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University