View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15757_low_3 (Length: 457)

Name: NF15757_low_3
Description: NF15757
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15757_low_3
NF15757_low_3
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (12-443)||(3413-3843)
scaffold0266 (10-449)||(1124-1563)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (10-449)||(20931345-20931783)
chr1 (10-449)||(20913037-20913468)
chr1 (10-422)||(20893476-20893889)
chr1 (10-403)||(37844319-37844714)
chr1 (10-348)||(41394222-41394559)
chr1 (10-403)||(20445679-20446074)
chr1 (10-403)||(20531444-20531838)
chr1 (10-262)||(5072388-5072640)
chr1 (10-262)||(18601118-18601370)
chr1 (10-347)||(22227809-22228146)
chr1 (10-347)||(22232506-22232843)
chr1 (14-262)||(2116258-2116506)
chr1 (76-393)||(45051489-45051803)
chr1 (127-393)||(51452608-51452886)
chr1 (317-393)||(7640806-7640882)
chr1 (316-347)||(15861327-15861358)
chr1 (316-385)||(2116558-2116627)
chr1 (217-257)||(16646118-16646158)
chr1 (316-348)||(21860334-21860366)
chr1 (317-393)||(22035755-22035831)
chr1 (316-348)||(44034871-44034903)
chr1 (14-54)||(45051446-45051486)
chr1 (316-360)||(46523695-46523739)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (10-449)||(8878-9316)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (9-449)||(16193542-16193980)
chr8 (10-449)||(43373291-43373731)
chr8 (21-449)||(24928615-24929043)
chr8 (10-262)||(30120722-30120974)
chr8 (10-200)||(222753-222943)
chr8 (10-200)||(736376-736566)
chr8 (10-200)||(860271-860461)
chr8 (10-262)||(16674392-16674644)
chr8 (10-258)||(21844576-21844824)
chr8 (10-258)||(21851969-21852217)
chr8 (10-348)||(16404900-16405235)
chr8 (316-449)||(24385551-24385684)
chr8 (14-262)||(6774258-6774505)
chr8 (14-262)||(24548986-24549233)
chr8 (10-393)||(22907083-22907476)
chr8 (21-274)||(17345581-17345832)
chr8 (127-393)||(5238203-5238481)
chr8 (127-393)||(24661117-24661395)
chr8 (127-393)||(43685662-43685940)
chr8 (138-200)||(691908-691970)
chr8 (316-422)||(41506634-41506741)
chr8 (316-390)||(21494314-21494388)
chr8 (317-422)||(7000445-7000551)
chr8 (316-390)||(22886654-22886728)
chr8 (316-390)||(3431134-3431208)
chr8 (316-390)||(2545265-2545339)
chr8 (316-348)||(24716762-24716794)
chr8 (176-258)||(26011658-26011741)
chr8 (316-390)||(16038744-16038818)
chr8 (316-402)||(17345887-17345973)
chr8 (316-393)||(16872923-16873000)
chr8 (316-348)||(274766-274798)
chr8 (316-348)||(641051-641083)
chr8 (316-348)||(826857-826889)
chr8 (316-360)||(13662170-13662214)
chr8 (316-360)||(13720833-13720877)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (21-449)||(171916-172343)
scaffold0001 (21-449)||(177619-178046)
scaffold0001 (316-390)||(164829-164903)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (10-449)||(2049810-2050248)
chr3 (10-449)||(12029971-12030410)
chr3 (10-402)||(14842433-14842824)
chr3 (21-403)||(13838905-13839287)
chr3 (10-262)||(55316219-55316471)
chr3 (10-262)||(41270075-41270327)
chr3 (10-396)||(45860805-45861202)
chr3 (228-449)||(19260648-19260869)
chr3 (10-237)||(16821139-16821366)
chr3 (10-274)||(13975722-13975985)
chr3 (10-311)||(15858986-15859287)
chr3 (10-396)||(13954756-13955153)
chr3 (10-449)||(17912297-17912744)
chr3 (9-284)||(51158008-51158282)
chr3 (10-267)||(15936634-15936890)
chr3 (10-348)||(16744041-16744377)
chr3 (13-267)||(15938476-15938729)
chr3 (14-393)||(15614838-15615214)
chr3 (316-444)||(30153265-30153393)
chr3 (316-449)||(38168237-38168371)
chr3 (211-348)||(19231981-19232121)
chr3 (316-420)||(53771365-53771468)
chr3 (316-420)||(16261777-16261880)
chr3 (345-449)||(5240528-5240632)
chr3 (127-393)||(2449107-2449385)
chr3 (316-403)||(33342204-33342291)
chr3 (316-420)||(11986009-11986112)
chr3 (316-390)||(14285289-14285363)
chr3 (316-377)||(28558494-28558555)
chr3 (316-403)||(54685146-54685233)
chr3 (316-382)||(51960997-51961063)
chr3 (178-420)||(54651625-54651867)
chr3 (316-382)||(19947026-19947092)
chr3 (316-382)||(11477061-11477127)
chr3 (316-393)||(23492696-23492773)
chr3 (316-390)||(16933827-16933901)
chr3 (10-123)||(47984650-47984763)
chr3 (10-123)||(47993937-47994050)
chr3 (10-123)||(48003224-48003337)
chr3 (10-123)||(48012510-48012623)
chr3 (316-393)||(8268605-8268682)
chr3 (316-393)||(8275705-8275782)
chr3 (178-271)||(11986169-11986262)
chr3 (217-258)||(14080715-14080756)
chr3 (10-51)||(15468555-15468596)
chr3 (174-258)||(4145814-4145898)
chr3 (316-348)||(17955884-17955916)
chr3 (313-348)||(15857163-15857198)
chr3 (176-257)||(30207380-30207462)
chr3 (411-449)||(54037921-54037959)
chr3 (174-258)||(6228625-6228710)
chr3 (10-51)||(22275209-22275250)
chr3 (317-382)||(44229293-44229358)
chr3 (316-348)||(2844514-2844546)
chr3 (316-348)||(3992873-3992905)
chr3 (217-257)||(14059214-14059254)
chr3 (316-360)||(18911300-18911344)
chr3 (316-348)||(54038024-54038056)
chr3 (316-348)||(55513193-55513225)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (12-449)||(16211768-16212204)
chr7 (10-449)||(36052667-36053104)
chr7 (10-422)||(13036863-13037277)
chr7 (15-422)||(11580586-11580997)
chr7 (10-262)||(10989410-10989661)
chr7 (10-263)||(2437457-2437710)
chr7 (10-347)||(3059966-3060302)
chr7 (10-262)||(13911024-13911277)
chr7 (10-258)||(13572676-13572924)
chr7 (10-382)||(47480910-47481294)
chr7 (16-393)||(25292207-25292595)
chr7 (10-267)||(18253842-18254098)
chr7 (10-420)||(13321014-13321437)
chr7 (10-237)||(16478987-16479213)
chr7 (10-393)||(7293017-7293410)
chr7 (316-449)||(25124450-25124583)
chr7 (316-449)||(3049905-3050039)
chr7 (316-420)||(42056117-42056220)
chr7 (127-393)||(30261998-30262276)
chr7 (127-393)||(11516343-11516621)
chr7 (127-393)||(15441433-15441711)
chr7 (345-449)||(17817259-17817363)
chr7 (345-449)||(19049638-19049742)
chr7 (316-420)||(2190014-2190117)
chr7 (316-402)||(2029244-2029330)
chr7 (242-416)||(36024372-36024554)
chr7 (279-416)||(15709428-15709570)
chr7 (316-393)||(14113858-14113935)
chr7 (316-449)||(15516660-15516793)
chr7 (153-390)||(295849-296087)
chr7 (316-393)||(14423509-14423585)
chr7 (317-390)||(10000245-10000318)
chr7 (316-390)||(371417-371491)
chr7 (317-390)||(48622541-48622614)
chr7 (176-257)||(13377693-13377775)
chr7 (316-393)||(13758677-13758754)
chr7 (176-258)||(16914928-16915011)
chr7 (317-390)||(16418805-16418878)
chr7 (316-348)||(126738-126770)
chr7 (242-274)||(14113989-14114021)
chr7 (242-274)||(14423639-14423671)
chr7 (316-360)||(15927875-15927919)
chr7 (316-360)||(18979926-18979970)
chr7 (316-348)||(32493946-32493978)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (10-449)||(48598-49036)
scaffold0023 (10-237)||(36093-36320)
scaffold0023 (316-349)||(61121-61154)
scaffold0023 (316-360)||(153912-153956)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (10-449)||(12115-12552)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (10-449)||(36733-37176)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (15-395)||(462743-463122)
chr2 (10-262)||(19886661-19886913)
chr2 (10-403)||(8891242-8891636)
chr2 (10-403)||(36982309-36982704)
chr2 (10-348)||(20627238-20627576)
chr2 (10-348)||(19794629-19794967)
chr2 (10-396)||(17396519-17396916)
chr2 (10-402)||(24341255-24341652)
chr2 (10-348)||(43642881-43643220)
chr2 (252-422)||(22863169-22863342)
chr2 (10-420)||(25265232-25265653)
chr2 (10-224)||(7507894-7508107)
chr2 (127-393)||(19689270-19689548)
chr2 (127-393)||(23820187-23820465)
chr2 (127-393)||(14906309-14906587)
chr2 (316-420)||(21273878-21273980)
chr2 (316-403)||(9652741-9652828)
chr2 (127-274)||(20015127-20015274)
chr2 (316-390)||(33128372-33128446)
chr2 (316-382)||(28031100-28031166)
chr2 (317-422)||(32466177-32466281)
chr2 (316-391)||(20015328-20015403)
chr2 (316-382)||(17204659-17204725)
chr2 (316-393)||(12641514-12641591)
chr2 (317-390)||(21142203-21142276)
chr2 (176-257)||(68156-68238)
chr2 (317-390)||(5888505-5888578)
chr2 (316-393)||(8944153-8944230)
chr2 (316-393)||(12635740-12635817)
chr2 (316-393)||(12728699-12728776)
chr2 (316-393)||(34824782-34824859)
chr2 (316-348)||(22284278-22284310)
chr2 (317-393)||(23774444-23774520)
chr2 (316-347)||(25213372-25213403)
chr2 (176-257)||(22775206-22775288)
chr2 (176-257)||(22780584-22780666)
chr2 (316-385)||(3798483-3798552)
chr2 (316-349)||(7507756-7507789)
chr2 (411-444)||(22275142-22275175)
chr2 (282-349)||(31146072-31146138)
chr2 (316-360)||(16935900-16935944)
chr2 (316-360)||(17006560-17006604)
chr2 (316-348)||(22275045-22275077)
chr2 (316-360)||(42177874-42177918)
chr2 (178-257)||(43646059-43646139)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (10-449)||(127994-128431)
scaffold0008 (10-237)||(31700-31928)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (16-449)||(272031-272463)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (10-422)||(13246430-13246844)
chr4 (110-449)||(121989-122327)
chr4 (10-262)||(47357654-47357906)
chr4 (10-416)||(15674940-15675352)
chr4 (10-348)||(54118168-54118507)
chr4 (10-258)||(10644219-10644467)
chr4 (18-274)||(13048221-13048477)
chr4 (78-416)||(10104101-10104445)
chr4 (211-416)||(33240900-33241112)
chr4 (10-393)||(26680201-26680594)
chr4 (10-247)||(31115629-31115865)
chr4 (316-420)||(15135836-15135939)
chr4 (316-420)||(15272140-15272243)
chr4 (242-402)||(31132545-31132711)
chr4 (127-274)||(10488678-10488825)
chr4 (127-274)||(16327926-16328073)
chr4 (316-390)||(32460561-32460635)
chr4 (10-107)||(111395-111492)
chr4 (317-422)||(55376420-55376525)
chr4 (316-385)||(14500075-14500144)
chr4 (316-393)||(16608968-16609045)
chr4 (316-385)||(40885422-40885491)
chr4 (316-393)||(16327795-16327872)
chr4 (78-258)||(40885570-40885749)
chr4 (316-390)||(8045272-8045346)
chr4 (317-390)||(22738577-22738650)
chr4 (316-393)||(10488879-10488956)
chr4 (316-360)||(14952085-14952129)
chr4 (318-382)||(18248527-18248591)
chr4 (323-393)||(13048090-13048160)
chr4 (176-257)||(15044992-15045074)
chr4 (316-385)||(16523146-16523215)
chr4 (316-393)||(20001030-20001107)
chr4 (316-368)||(7131962-7132014)
chr4 (10-54)||(10104450-10104494)
chr4 (317-393)||(26339327-26339403)
chr4 (316-382)||(8378493-8378559)
chr4 (176-257)||(15109350-15109432)
chr4 (316-382)||(19697244-19697310)
chr4 (316-382)||(19707829-19707895)
chr4 (283-360)||(17145562-17145639)
chr4 (316-360)||(15287150-15287194)
chr4 (316-360)||(15294259-15294303)
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (10-393)||(23506965-23507347)
chr5 (10-262)||(25426628-25426880)
chr5 (10-262)||(12374-12626)
chr5 (10-422)||(27182396-27182810)
chr5 (10-262)||(19499899-19500151)
chr5 (10-262)||(22366481-22366733)
chr5 (10-259)||(18777995-18778244)
chr5 (10-262)||(21073595-21073847)
chr5 (10-259)||(43443398-43443647)
chr5 (10-262)||(4199985-4200237)
chr5 (10-416)||(18530919-18531330)
chr5 (10-416)||(22053684-22054096)
chr5 (10-258)||(27009841-27010089)
chr5 (62-262)||(29188284-29188483)
chr5 (21-274)||(34939289-34939540)
chr5 (316-449)||(21205249-21205381)
chr5 (127-393)||(20623085-20623363)
chr5 (127-393)||(21233397-21233675)
chr5 (316-409)||(108668-108760)
chr5 (127-393)||(37052860-37053138)
chr5 (128-272)||(25900408-25900552)
chr5 (127-393)||(16536313-16536591)
chr5 (316-403)||(21651018-21651105)
chr5 (311-422)||(23981330-23981442)
chr5 (318-422)||(2032135-2032240)
chr5 (316-416)||(25005137-25005238)
chr5 (316-385)||(7529228-7529297)
chr5 (320-420)||(32951016-32951115)
chr5 (316-393)||(25900275-25900352)
chr5 (316-390)||(9730236-9730310)
chr5 (316-382)||(17909823-17909889)
chr5 (316-360)||(16105967-16106011)
chr5 (316-393)||(1219392-1219469)
chr5 (174-258)||(29918127-29918212)
chr5 (178-267)||(32950862-32950951)
chr5 (317-393)||(23328865-23328941)
chr5 (317-393)||(24616469-24616545)
chr5 (317-393)||(24712845-24712921)
chr5 (317-393)||(24745863-24745939)
chr5 (14-54)||(29190482-29190522)
chr5 (176-258)||(21310709-21310792)
chr5 (176-257)||(5450844-5450926)
chr5 (316-390)||(34939595-34939669)
chr5 (316-402)||(35790961-35791047)
chr5 (10-51)||(17471803-17471844)
chr5 (316-360)||(7425631-7425675)
chr5 (316-360)||(11343008-11343052)
chr5 (217-257)||(16595713-16595753)
[»] chr6 (34 HSPs)
chr6 (10-262)||(25175563-25175815)
chr6 (21-421)||(23153458-23153860)
chr6 (10-262)||(27653983-27654235)
chr6 (10-262)||(16825752-16826006)
chr6 (14-347)||(14626045-14626377)
chr6 (14-393)||(1649976-1650352)
chr6 (279-421)||(23148266-23148409)
chr6 (10-385)||(35009315-35009702)
chr6 (21-274)||(1657748-1657999)
chr6 (316-420)||(23995247-23995350)
chr6 (21-274)||(15862484-15862734)
chr6 (316-429)||(26090059-26090172)
chr6 (78-420)||(29665941-29666284)
chr6 (316-422)||(27751742-27751849)
chr6 (318-390)||(15742078-15742150)
chr6 (316-390)||(32276617-32276691)
chr6 (316-390)||(18839096-18839170)
chr6 (328-390)||(16299844-16299906)
chr6 (316-390)||(18002353-18002427)
chr6 (316-390)||(18823241-18823315)
chr6 (189-274)||(27751603-27751688)
chr6 (174-258)||(29605612-29605696)
chr6 (316-390)||(13620669-13620743)
chr6 (316-360)||(1657649-1657693)
chr6 (316-360)||(15862789-15862833)
chr6 (316-347)||(4991396-4991427)
chr6 (176-258)||(18629608-18629691)
chr6 (174-256)||(17083200-17083282)
chr6 (316-402)||(19610325-19610411)
chr6 (316-393)||(23978076-23978153)
chr6 (316-360)||(16232199-16232243)
chr6 (217-257)||(18399144-18399184)
chr6 (316-348)||(19983192-19983224)
chr6 (316-348)||(35015057-35015089)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (10-398)||(5940-6326)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (21-394)||(247320-247694)
scaffold0012 (316-402)||(34021-34107)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (10-403)||(26285-26678)
scaffold0162 (127-385)||(8055-8327)
scaffold0162 (316-420)||(12063-12166)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (10-416)||(123018-123427)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (10-368)||(862-1218)
scaffold0175 (357-403)||(15238-15284)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (14-449)||(41733-42165)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (128-449)||(51009-51328)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (10-237)||(42997-43224)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (10-345)||(19206-19543)
scaffold0195 (10-274)||(21290-21553)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (128-422)||(89303-89600)
scaffold0028 (223-422)||(107633-107835)
scaffold0028 (316-347)||(130880-130911)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (10-338)||(4996-5324)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (248-449)||(146838-147039)
scaffold0025 (10-416)||(8849-9261)
scaffold0025 (10-300)||(148721-149012)
scaffold0025 (374-449)||(149014-149090)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (34-267)||(5552-5785)
scaffold0772 (316-393)||(5846-5923)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (10-258)||(35-283)
scaffold0116 (316-422)||(338-442)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (10-267)||(48187-48443)
scaffold0049 (316-390)||(48504-48578)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (10-258)||(64527-64780)
scaffold0026 (10-267)||(107747-108003)
scaffold0026 (217-259)||(89863-89905)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (10-263)||(21115-21367)
scaffold0139 (10-237)||(14086-14312)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (10-224)||(5254-5466)
scaffold0022 (282-391)||(109872-109979)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (10-224)||(3722-3936)
[»] scaffold0215 (4 HSPs)
scaffold0215 (14-237)||(9374-9596)
scaffold0215 (14-237)||(16272-16494)
scaffold0215 (316-390)||(9223-9297)
scaffold0215 (316-390)||(16121-16195)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (116-262)||(1304-1450)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (316-449)||(193296-193429)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (10-274)||(534-797)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (10-390)||(41648-42039)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (316-444)||(6347-6475)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (10-389)||(13506-13897)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (316-449)||(12317-12450)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (10-274)||(34460-34724)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (10-393)||(36935-37328)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (316-420)||(13214-13317)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (316-420)||(57321-57424)
scaffold0058 (217-258)||(70307-70348)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (14-263)||(2966-3215)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (10-116)||(9-115)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (127-393)||(1451-1729)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (10-116)||(48514-48620)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (316-416)||(55904-56005)
scaffold0032 (316-402)||(108021-108107)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (106-262)||(13325-13480)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (316-403)||(823-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (316-403)||(9827-9914)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (127-393)||(22656-22934)
scaffold0141 (127-393)||(26911-27189)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (316-403)||(17249-17336)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (10-107)||(9382-9479)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (305-382)||(18015-18092)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (317-421)||(339-444)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (317-422)||(25532-25637)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (316-390)||(34266-34340)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (178-402)||(10202-10427)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (316-390)||(5434-5508)
[»] scaffold0066 (3 HSPs)
scaffold0066 (316-394)||(45338-45416)
scaffold0066 (316-394)||(54724-54802)
scaffold0066 (178-224)||(45198-45244)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (316-390)||(49710-49784)
[»] scaffold0361 (3 HSPs)
scaffold0361 (181-274)||(3360-3453)
scaffold0361 (316-390)||(3505-3578)
scaffold0361 (12-66)||(3210-3264)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (316-420)||(55942-56045)
scaffold0084 (178-271)||(56102-56195)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (316-390)||(4304-4378)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (316-390)||(5549-5623)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (316-390)||(95298-95372)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (317-390)||(12002-12075)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (176-258)||(8174-8257)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (316-390)||(6068-6142)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (316-390)||(9370-9444)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (176-257)||(2317-2399)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (317-390)||(54182-54255)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (316-348)||(80187-80219)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (316-390)||(7053-7127)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (316-350)||(17207-17241)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (283-360)||(1480-1557)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (217-258)||(1546-1587)
scaffold0456 (217-258)||(8691-8732)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (317-390)||(7517-7590)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (316-360)||(1419-1463)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (334-390)||(3743-3799)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (217-257)||(8011-8051)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (316-360)||(2700-2744)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (217-257)||(3525-3565)


Alignment Details
Target: scaffold0266 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 12 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3413
Alignment:
Q  12 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  3843 tcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 3744  T
Q  112 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 211  Q
    |||||||||||| | ||||| |||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  3743 acaacaacttagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 3645  T
Q  212 atcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3644 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatctataatcaaaattcatacaacttttgaaaatttacaaaat 3545  T
Q  312 gatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattat 411  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  3544 gaagatgattatgacaaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattct 3445  T
Q  412 tcaagctctccctcttctctccaacccttgtt 443  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3444 tcaagctctccctcttctctctaacccttgtt 3413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1563
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  1124 catcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 1223  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1224 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 1322  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaa 308  Q
      |||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1323 ttatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaa 1422  T
Q  309 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgat 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1423 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcacaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgat 1522  T
Q  409 tattcaagctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1523 tcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 1563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 20931345 - 20931783
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  20931345 catcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 20931444  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  20931445 taacaacaatttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 20931543  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20931544 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaacttcatacaacaattgaaaatttgcaaa 20931643  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgatt 409  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20931644 atgaggatgattatgataaaggctaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctgctaagctcactccaatcttgatt 20931743  T
Q  410 attcaagctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20931744 attcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 20931783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 20913037 - 20913468
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||       |||    
T  20913037 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca-------aat 20913129  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  20913130 taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 20913228  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20913229 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccgtaagcaaaattcatacaacaattgaaaatttgcaaa 20913328  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgatt 409  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20913329 atgaggatgattacgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgatt 20913428  T
Q  410 attcaagctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
     |||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20913429 cttcaatttctccctcttctctctaacccttgttcttctc 20913468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 10 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20893889 - 20893476
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||      
T  20893889 catcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatc 20893790  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  20893789 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaatta 20893691  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20893690 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt-aca 20893592  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaa-tcttg 406  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20893591 aaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaattcttg 20893492  T
Q  407 attattcaagctctcc 422  Q
    ||| |||||| |||||    
T  20893491 attcttcaagttctcc 20893476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 37844714 - 37844319
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  37844714 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 37844615  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttca-taacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    |||||||||||||| | |||||||    || |||||||| |||| ||  ||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  37844614 taacaacaacttagca-aaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 37844516  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttac 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37844515 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcac 37844416  T
Q  307 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatc 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  37844415 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaaaattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatc 37844319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Original strand, 41394222 - 41394559
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||      
T  41394222 catcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaca 41394321  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  41394322 taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaatta 41394420  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394421 tcatcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 41394520  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394521 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 41394559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 403
Target Start/End: Original strand, 20445679 - 20446074
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| |    
T  20445679 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20445778  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20445779 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20445877  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattt-ac 306  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20445878 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcac 20445977  T
Q  307 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatc 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  20445978 aaaatgatgatgattatgataaagactaactcccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttaactcctaagctcactccaatc 20446074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 403
Target Start/End: Original strand, 20531444 - 20531838
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| |    
T  20531444 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20531543  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20531544 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20531642  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     ||||||||||||||||||||||||  | || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20531643 tcatcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca 20531742  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  20531743 aaatgatgatgattatgataaagactaatttccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttatctcctaagctcactccaatc 20531838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5072640 - 5072388
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  5072640 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 5072541  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5072540 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 5072441  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  5072440 acatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 5072388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18601370 - 18601118
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  18601370 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 18601271  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18601270 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 18601171  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||| ||||||||||    
T  18601170 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagca 18601118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 22227809 - 22228146
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  22227809 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22227908  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  22227909 taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 22228007  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 308  Q
     |||||||||||||| |  || |||||| || ||   ||||||||||||||||| |||  | ||| || | |  ||||||||||||  ||||||  | ||    
T  22228008 tcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 22228107  T
Q  309 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 347  Q
    | ||   |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22228108 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 22228146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 22232506 - 22232843
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  22232506 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22232605  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  22232606 taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 22232704  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 308  Q
     |||||||||||||| |  || |||||| || ||   ||||||||||||||||| |||  | ||| || | |  ||||||||||||  ||||||  | ||    
T  22232705 tcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 22232804  T
Q  309 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 347  Q
    | ||   |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22232805 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 22232843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 262
Target Start/End: Original strand, 2116258 - 2116506
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaac-tcaaattaa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  2116258 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaa 2116357  T
Q  113 caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 212  Q
    ||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  2116358 caataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 2116456  T
Q  213 tcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||| |||||    
T  2116457 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaaaagcacgaatctagca 2116506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 393
Target Start/End: Original strand, 45051489 - 45051803
Alignment:
Q  76 ataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatata 175  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| | ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| |||||     
T  45051489 ataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatt 45051587  T
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat- 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| || |||  || ||||||| |||||  |||  | |||     
T  45051588 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagaacacgaatctagcatgaattgttcatc 45051687  T
Q  275 aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggct 374  Q
    || | |  ||||||||||||  |||||  | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||| ||||||    
T  45051688 aacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatca-catgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagattagaccaaacctaggct 45051784  T
Q  375 tcactttagcttctaagct 393  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  45051785 tcaatttagctcctaagct 45051803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 127 - 393
Target Start/End: Original strand, 51452608 - 51452886
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  51452608 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 51452707  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat--aatca--------aaattcatacaacatttgaaaatttacaa--aatgat 314  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | |||         | |||||||||    |||||| || |||  |||||     
T  51452708 caaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa 51452807  T
Q  315 gatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  51452808 catgattaagataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 51452886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 7640882 - 7640806
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||   |||||| ||||||| |||||||    
T  7640882 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagct 7640806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15861358 - 15861327
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861358 atgattatgataaagactaacccccttacctt 15861327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 385
Target Start/End: Original strand, 2116558 - 2116627
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagct 385  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||  || ||| ||||||||| |||||||    
T  2116558 atgattatgataatcactaacccctttaccttaaatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagct 2116627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 257
Target Start/End: Original strand, 16646118 - 16646158
Alignment:
Q  217 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 257  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16646118 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 16646158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 21860334 - 21860366
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21860334 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 21860366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 317 - 393
Target Start/End: Original strand, 22035755 - 22035831
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||   |||||| || |||| |||||||    
T  22035755 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagct 22035831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 44034903 - 44034871
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44034903 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 44034871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 54
Target Start/End: Original strand, 45051446 - 45051486
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 54  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  45051446 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaa 45051486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Original strand, 46523695 - 46523739
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 360  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  46523695 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaa 46523739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 8878 - 9316
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  8878 catcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 8977  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  8978 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 9076  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  9077 tcatcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattttccataagcaaaattcgtacaacttttgaaaatttgcaaa 9176  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgatt 409  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9177 atgaagatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgatt 9276  T
Q  410 attcaagctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
     |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  9277 cttcaagctctccctattctctctaacccttgttcttctc 9316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 9 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16193980 - 16193542
Alignment:
Q  9 acatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaa 108  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  16193980 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaa 16193881  T
Q  109 ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    |||||||||| || | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  16193880 ttaacaacaatttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaatt 16193782  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 308  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  16193781 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataagcaaaattcatacaatatttgaaaatttacca 16193682  T
Q  309 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgat 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16193681 aatgatgatgattatgataaagactaa-ccccttaccttagataaagatgaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatcttgat 16193583  T
Q  409 tattcaagctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    | || ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  16193582 tctttaagctctccctcttctctctaaccctagttcttctc 16193542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 43373731 - 43373291
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  43373731 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 43373632  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  43373631 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataatta 43373533  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     ||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  43373532 tcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaatttcaca 43373433  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttga 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43373432 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttga 43373333  T
Q  408 ttattcaagctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    || |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||    
T  43373332 ttcttcaagctctccttcttctctttaacccttgttcttctc 43373291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24929043 - 24928615
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||| ||| ||||||||||  || |||||||   ||| ||||||    
T  24929043 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaact 24928944  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    |||  ||||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  24928943 tagc-gaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 24928845  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatga 319  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24928844 tgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgacgatga 24928745  T
Q  320 ttatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaagctc 419  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  24928744 ttatgataaagactaaccccattaccttagataaagattaatcccaacttagacttcaatttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaagatc 24928645  T
Q  420 tccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24928644 tccctcttctctctaacccttgttcttctc 24928615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 30120722 - 30120974
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  30120722 catcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 30120821  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30120822 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 30120921  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  30120922 acataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 30120974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 222943 - 222753
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222943 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 222844  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222843 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 222753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 736566 - 736376
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736566 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 736467  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736466 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 736376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 860461 - 860271
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860461 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 860362  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860361 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 860271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16674644 - 16674392
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  16674644 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 16674545  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16674544 taacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 16674445  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 262  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  16674444 acataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagca 16674392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21844824 - 21844576
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21844824 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaat 21844725  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  21844724 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 21844625  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 258  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  21844624 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 21844576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21852217 - 21851969
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21852217 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctcaaat 21852118  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||  |    
T  21852117 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatca 21852018  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 258  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  21852017 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 21851969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16405235 - 16404900
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |  |||| |    
T  16405235 catcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatt 16405136  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||   |||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16405135 taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16405040  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16405039 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccatcatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttac- 16404941  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16404940 aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 16404900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 316 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24385684 - 24385551
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24385684 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 24385585  T
Q  416 gctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24385584 gctctccctcttctctccaacccttgttcttctc 24385551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6774505 - 6774258
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  6774505 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 6774406  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  6774405 aataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 6774307  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||| |||||    
T  6774306 caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 6774258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 262
Target Start/End: Original strand, 24548986 - 24549233
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||    
T  24548986 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 24549085  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  24549086 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 24549184  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||| |||||    
T  24549185 caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 24549233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 22907476 - 22907083
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  22907476 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 22907377  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  22907376 caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 22907279  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat--aatca--------aaattcatacaacatttgaa 299  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||         | |||||||||    ||||    
T  22907278 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaaatcatgaa 22907179  T
Q  300 aatttacaa--aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    || || |||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  22907178 aaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 22907083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Original strand, 17345581 - 17345832
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||| ||||  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  17345581 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 17345679  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  17345680 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 17345778  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||| |||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17345779 tgcatataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccat 17345832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 127 - 393
Target Start/End: Original strand, 5238203 - 5238481
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  5238203 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 5238302  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat--aatca--------aaattcatacaacatttgaaaatttacaa--aatgat 314  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||         | ||||| |||    |||||| || |||  |||||     
T  5238303 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa 5238402  T
Q  315 gatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  5238403 catgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 5238481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 127 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 24661395 - 24661117
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  24661395 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 24661296  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat--aatca--------aaattcatacaacatttgaaaatttacaa--aatgat 314  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||         | ||||| |||    |||||| || |||  |||||     
T  24661295 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa 24661196  T
Q  315 gatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  24661195 catgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 24661117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 127 - 393
Target Start/End: Original strand, 43685662 - 43685940
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  43685662 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 43685761  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat--aatca--------aaattcatacaacatttgaaaatttacaa--aatgat 314  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||         | ||||| |||    |||||| || |||  |||||     
T  43685762 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa 43685861  T
Q  315 gatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  43685862 catgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 43685940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 691970 - 691908
Alignment:
Q  138 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691970 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 691908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 316 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 41506741 - 41506634
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaa-tcttgattattca 414  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  41506741 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcttaagctcaccccaattcttgattcttca 41506642  T
Q  415 agctctcc 422  Q
    || |||||    
T  41506641 agttctcc 41506634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 21494388 - 21494314
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21494388 atgattatgaagaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaa 21494314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 317 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 7000551 - 7000445
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaa-tcttgattattcaa 415  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  7000551 tgattatgatgaaaactaacccccttactttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccccaattcttgattctacaa 7000452  T
Q  416 gctctcc 422  Q
    | |||||    
T  7000451 gttctcc 7000445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Original strand, 22886654 - 22886728
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  22886654 atgattatgattaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaagcttcactttagctcctaa 22886728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 3431208 - 3431134
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  3431208 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaatccaaacttgggcttcactttagctcctaa 3431134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Original strand, 2545265 - 2545339
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||| | || ||| |||||||||||||| ||||    
T  2545265 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaattcaaatttaagcttcactttagctcctaa 2545339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24716794 - 24716762
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716794 atgattatgataaagactaacccccttacctta 24716762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 258
Target Start/End: Original strand, 26011658 - 26011741
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  26011658 tgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 26011741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16038818 - 16038744
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||| ||||    
T  16038818 atgattatgatgaagacaaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 16038744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 402
Target Start/End: Original strand, 17345887 - 17345973
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaat 402  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||| || |||||    
T  17345887 atgattatgatgaagactaacccccttacctaagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaat 17345973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16873000 - 16872923
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||   |||||| ||||||| |||||||    
T  16873000 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaactcaaactcttgcttcaatttagctcctaagct 16872923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 274766 - 274798
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  274766 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 274798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 641083 - 641051
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  641083 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 641051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 826889 - 826857
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  826889 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 826857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 13662214 - 13662170
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 360  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13662214 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaa 13662170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 13720877 - 13720833
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 360  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13720877 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaa 13720833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Original strand, 171916 - 172343
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||    
T  171916 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 172015  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  172016 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 172114  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 320  Q
    | |||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172115 tccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 172214  T
Q  321 tatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaagctct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  172215 tatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaagctct 172314  T
Q  421 ccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  172315 cccttttctctctaacccttgttcttctc 172343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Original strand, 177619 - 178046
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||    
T  177619 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 177718  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  177719 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 177817  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 320  Q
    | |||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177818 tccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 177917  T
Q  321 tatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaagctct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  177918 tatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaagctct 178017  T
Q  421 ccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  178018 cccttttctctctaacccttgttcttctc 178046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 164903 - 164829
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| | | ||||||| | || ||| |||||||||||||| ||||    
T  164903 atgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcaaatttaagcttcactttagctcctaa 164829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 2049810 - 2050248
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||    
T  2049810 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaat 2049909  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  2049910 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 2050008  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  2050009 tcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattgatacaacatttgaaatttcacaaa 2050108  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgatt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2050109 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaaactcactccaatcttgatt 2050208  T
Q  410 attcaagctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2050209 cttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 2050248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 12030410 - 12029971
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||    
T  12030410 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaat 12030311  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||  || |||||||  |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  12030310 taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 12030212  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  12030211 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaagtcatacaacatttgaaatttcacaaa 12030112  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaat-cttgat 408  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  12030111 atgatgatgattatgataatgattaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatccttagt 12030012  T
Q  409 tattcaagctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12030011 tcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 12029971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 10 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 14842824 - 14842433
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  14842824 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 14842725  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  14842724 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaatta 14842626  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     | |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14842625 tcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgcaaa 14842526  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaat 402  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||| || |||||    
T  14842525 gtgaagatgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaat 14842433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 403
Target Start/End: Original strand, 13838905 - 13839287
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||| ||||||    
T  13838905 catgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 13839004  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  13839005 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 13839103  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatga 319  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13839104 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattattcataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatga 13839203  T
Q  320 ttatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatc 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  13839204 ttatgatgaagactaacccccttaccttagatgaagagtaatccctacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatc 13839287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 55316219 - 55316471
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  55316219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 55316318  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55316319 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 55316418  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  55316419 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 55316471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 41270075 - 41270327
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  41270075 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 41270174  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41270175 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaacta 41270274  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  41270275 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 41270327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 396
Target Start/End: Original strand, 45860805 - 45861202
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  45860805 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 45860904  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  45860905 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 45861004  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-------aatcaa---aattcatacaacatttgaa 299  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||||   | |||||||||    ||||    
T  45861005 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcctttcaacccatttcatacaattcatgaa 45861103  T
Q  300 aatttacaa--aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcac 396  Q
    || || |||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  45861104 aaattgcaaagaatgaatatgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctcac 45861202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 228 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19260869 - 19260648
Alignment:
Q  228 aaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 327  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19260869 aaacatatcatcataattagagcacgaatttagcaacaattatccataaaaaaaattcatacaacatttgaaaacttacaaaatgatgatgattatgata 19260770  T
Q  328 aagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaagctctccctctt 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19260769 aagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttagacttcaatttagctcttaatctcactccaatcttgattcttcaagctctccctctt 19260670  T
Q  428 ctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    
T  19260669 ctctctaacccttgttcttctc 19260648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 16821139 - 16821366
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  16821139 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 16821238  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16821239 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16821338  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16821339 tcatcaatttatgcatacaaacataaca 16821366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13975985 - 13975722
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13975985 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13975886  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  13975885 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 13975786  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13975785 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13975722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15859287 - 15858986
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  15859287 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 15859188  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15859187 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15859089  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15859088 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattg-aaatttaca 15858990  T
Q  308 aaat 311  Q
    ||||    
T  15858989 aaat 15858986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 13955153 - 13954756
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13955153 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13955054  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  13955053 taatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 13954954  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-------aatcaa---aattcatacaacatttgaa 299  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||||   | |||||||||    ||||    
T  13954953 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcctttcaacccatttcatacaattcatgaa 13954855  T
Q  300 aatttacaa--aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcac 396  Q
    || || |||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13954854 aaattgcaaagaatgaacatgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctcac 13954756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17912744 - 17912297
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||  ||||||| |||||| | ||||| |    
T  17912744 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaatt 17912645  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||| ||  |  |||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17912644 caactacaacatatca--aattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 17912547  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataa-------tcaa---aattcatacaacatttgaa 299  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||||   | |||||||||    ||||    
T  17912546 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca-agttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaaataatgaa 17912448  T
Q  300 aatttaca-aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactc 398  Q
    ||||   | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  17912447 aattgcaataaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccacctcaggcttcaatttagctcctaagctcactc 17912348  T
Q  399 caatcttgattattcaagctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  17912347 caaccttgattcttcaagctctccctcttctctttaacccttgttcttctc 17912297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 51158282 - 51158008
Alignment:
Q  9 acatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaa 108  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  51158282 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 51158183  T
Q  109 ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
     |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  51158182 ctaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 51158084  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaatt 284  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  51158083 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaatt 51158008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15936890 - 15936634
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  15936890 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 15936791  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15936790 taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15936692  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 267  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15936691 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 15936634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16744377 - 16744041
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||  | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  16744377 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 16744278  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| | ||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||| |||||  ||    
T  16744277 caactataacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacactta 16744180  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
      ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744179 ttatcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttaacaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 16744080  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  16744079 atgatgatgattatggtaaagactaacctcgttacctta 16744041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15938729 - 15938476
Alignment:
Q  13 catcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  15938729 catcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaa 15938630  T
Q  113 caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 212  Q
    ||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  15938629 caacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 15938531  T
Q  213 tcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 267  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||  | |||||||||||| |||||| ||||||    
T  15938530 tcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaat 15938476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 393
Target Start/End: Original strand, 15614838 - 15615214
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||    
T  15614838 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 15614937  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||    
T  15614938 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcat 15615036  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatg 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||  |||||| ||| |||||  |||  | ||| || | |  ||||||||||||  |||||  | ||||||     
T  15615037 caattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatt 15615134  T
Q  313 atgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  15615135 a-catgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 15615214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 316 - 444
Target Start/End: Original strand, 30153265 - 30153393
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaa 415  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  30153265 atgattatgataaaaactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttagacttctctttagctcctaagctcaccccaatcttgattcttcaa 30153364  T
Q  416 gctctccctcttctctccaacccttgttc 444  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30153365 gctctccctcttctctctaacccttgttc 30153393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 316 - 449
Target Start/End: Original strand, 38168237 - 38168371
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaat-cttgattattca 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| ||||    
T  38168237 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagttcactccaatccttaattcttca 38168336  T
Q  415 agctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38168337 agctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 38168371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 211 - 348
Target Start/End: Original strand, 19231981 - 19232121
Alignment:
Q  211 catcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattt-aca 307  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19231981 catcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcaca 19232080  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19232081 aaatgatgatgattaagataaagactaacccccttacctta 19232121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 316 - 420
Target Start/End: Original strand, 53771365 - 53771468
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  53771365 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcac-ccaatcttgattcctcaa 53771463  T
Q  416 gctct 420  Q
    |||||    
T  53771464 gctct 53771468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 316 - 420
Target Start/End: Original strand, 16261777 - 16261880
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  16261777 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaattccaacttaggcttcactttagctcctaagctcac-ccaatcttgattcctcaa 16261875  T
Q  416 gctct 420  Q
    |||||    
T  16261876 gctct 16261880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 345 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 5240632 - 5240528
Alignment:
Q  345 cttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaagctctccctcttctctccaacccttgttc 444  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5240632 cttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcgtaagctcactccaatcttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttc 5240533  T
Q  445 atctc 449  Q
     ||||    
T  5240532 ttctc 5240528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 127 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 2449385 - 2449107
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  2449385 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 2449286  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat--aatca--------aaattcatacaacatttgaaaatttacaa--aatgat 314  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||         | ||||| |||    |||||| || |||  |||||     
T  2449285 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa 2449186  T
Q  315 gatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  2449185 catgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 2449107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 316 - 403
Target Start/End: Original strand, 33342204 - 33342291
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  33342204 atgattatgataaagactaaccctcttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagttcactccaatc 33342291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 316 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 11986112 - 11986009
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaa 415  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  11986112 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccccaat-ttgattcttcaa 11986014  T
Q  416 gctct 420  Q
     ||||    
T  11986013 actct 11986009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Original strand, 14285289 - 14285363
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  14285289 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaagcttcactttagctcctaa 14285363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 316 - 377
Target Start/End: Original strand, 28558494 - 28558555
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttca 377  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28558494 atgattatgataaaaactaaccctcttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttca 28558555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 316 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 54685233 - 54685146
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatc 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||  |||||||||||    
T  54685233 atgattatcataaagactaacccacttaccttggatgaagattaatcccaacttagacttcaatttagctcctaatttcactccaatc 54685146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 316 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 51961063 - 51960997
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcacttta 382  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  51961063 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttagacttcacttta 51960997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 420
Target Start/End: Original strand, 54651625 - 54651867
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aa 276  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || || ||   ||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  54651625 aacatgcaatttcactcacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaa 54651724  T
Q  277 tcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttc 376  Q
     | |  ||||||||||||  |||| |  | ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| || |||||  |||||    
T  54651725 cccattttcatacaacatgagaaattgcaaaaattgaacatgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgattaacccaaacttttgcttc 54651824  T
Q  377 actttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaagctct 420  Q
    | || |||| |||||||||| ||||| ||||||  |||||||||    
T  54651825 aattaagctcctaagctcaccccaat-ttgattcatcaagctct 54651867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 382
Target Start/End: Original strand, 19947026 - 19947092
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcacttta 382  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19947026 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaggcttcacttta 19947092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 11477127 - 11477061
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcacttta 382  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11477127 atgattatgaagaagactaacccccttaccttaggtaatgattaattcaaacttaggcttcacttta 11477061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 393
Target Start/End: Original strand, 23492696 - 23492773
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| |||||||    
T  23492696 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagct 23492773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16933901 - 16933827
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||| ||||    
T  16933901 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 16933827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 47984650 - 47984763
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
T  47984650 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47984749  T
Q  110 taacaacaacttag 123  Q
     |||||||||||||    
T  47984750 caacaacaacttag 47984763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 47993937 - 47994050
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
T  47993937 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47994036  T
Q  110 taacaacaacttag 123  Q
     |||||||||||||    
T  47994037 caacaacaacttag 47994050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 48003224 - 48003337
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
T  48003224 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48003323  T
Q  110 taacaacaacttag 123  Q
     |||||||||||||    
T  48003324 caacaacaacttag 48003337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 48012510 - 48012623
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
T  48012510 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48012609  T
Q  110 taacaacaacttag 123  Q
     |||||||||||||    
T  48012610 caacaacaacttag 48012623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 8268682 - 8268605
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||   |||||| ||||||| |||||||    
T  8268682 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagct 8268605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 8275782 - 8275705
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||   |||||| ||||||| |||||||    
T  8275782 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagct 8275705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 178 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11986262 - 11986169
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatc 271  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || ||| || ||||||| || || |||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||    
T  11986262 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatc 11986169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 258
Target Start/End: Original strand, 14080715 - 14080756
Alignment:
Q  217 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 258  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14080715 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 14080756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 15468596 - 15468555
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 51  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15468596 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcat 15468555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4145898 - 4145814
Alignment:
Q  174 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 258  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||| || || ||||||||| || |||||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  4145898 tatgaacatgtaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaattcatgtattcaaacatatcaccataattggagtacgaattt 4145814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17955916 - 17955884
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955916 atgattatgataaagactaacccccttacctta 17955884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15857198 - 15857163
Alignment:
Q  313 atgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15857198 atgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 15857163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 257
Target Start/End: Original strand, 30207380 - 30207462
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 257  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  30207380 tgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 30207462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 411 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 54037959 - 54037921
Alignment:
Q  411 ttcaagctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  54037959 ttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 54037921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6228710 - 6228625
Alignment:
Q  174 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||| |||||| || |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  6228710 tatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt 6228625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Original strand, 22275209 - 22275250
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 51  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22275209 catcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcat 22275250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 382
Target Start/End: Original strand, 44229293 - 44229358
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcacttta 382  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||| | | ||||||  |||||||| |||||||||    
T  44229293 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggtttcacttta 44229358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 2844514 - 2844546
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2844514 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 2844546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 3992873 - 3992905
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3992873 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 3992905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14059254 - 14059214
Alignment:
Q  217 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 257  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14059254 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 14059214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Original strand, 18911300 - 18911344
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 360  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18911300 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaa 18911344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 54038056 - 54038024
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54038056 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 54038024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 55513193 - 55513225
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55513193 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 55513225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 449
Target Start/End: Original strand, 16211768 - 16212204
Alignment:
Q  12 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 111  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||| | |||||||||    
T  16211768 tcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaatta 16211867  T
Q  112 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 211  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||| || |    
T  16211868 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatc 16211966  T
Q  212 atcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16211967 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattgtccataagcaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaat 16212066  T
Q  312 gatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattat 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  16212067 gatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatcttgattct 16212166  T
Q  412 tcaagctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16212167 tcaaactctccctcttctctctaacccttgttcttctc 16212204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 36052667 - 36053104
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  || ||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  36052667 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 36052766  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||   |||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||    
T  36052767 taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataatta 36052862  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     ||||||||||||||||||||| || || || |||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  36052863 tcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagtataaatttagcaacaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaatttcaca 36052962  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttga 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36052963 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttga 36053062  T
Q  408 ttattcaagctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  36053063 ttcttcaagctctccctcttctctctaaccattgttcttctc 36053104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 13037277 - 13036863
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||      
T  13037277 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatc 13037178  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||    
T  13037177 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaatta 13037079  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13037078 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 13036979  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaat-cttg 406  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  13036978 aaatgatgatgattatggtgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagcttactccaatccttg 13036879  T
Q  407 attattcaagctctcc 422  Q
    ||| |||||| |||||    
T  13036878 attcttcaagttctcc 13036863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 11580997 - 11580586
Alignment:
Q  15 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 114  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||    
T  11580997 tcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 11580898  T
Q  115 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 214  Q
    ||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  11580897 acaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 11580799  T
Q  215 aattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc---aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaa- 310  Q
    ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11580798 aattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccattatgcaaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaa 11580699  T
Q  311 tgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaat-cttgatt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11580698 tgatgatgattatgataaagactaatccccttaccttagattaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatccttgatt 11580599  T
Q  410 attcaagctctcc 422  Q
     |||||| |||||    
T  11580598 cttcaagttctcc 11580586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 10989410 - 10989661
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989410 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 10989509  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10989510 ta-caacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 10989608  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  10989609 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 10989661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 2437457 - 2437710
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  2437457 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatat 2437556  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2437557 taacaacaacttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 2437656  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |    |||||||||||||||||    
T  2437657 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaa 2437710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 3059966 - 3060302
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  3059966 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 3060065  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||    
T  3060066 taacaacaacttaaca-aaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaatta 3060164  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||||||| ||||||||||| |||  | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3060165 tcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatataacatttgaaaatttacaaa 3060264  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3060265 atgatgatgattatgataaagacttacccccttacctt 3060302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13911277 - 13911024
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  13911277 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 13911178  T
Q  110 taacaacaactt-aggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  13911177 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 13911078  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |    ||||||||||||||||    
T  13911077 aacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca 13911024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 13572676 - 13572924
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13572676 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13572775  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||  |    
T  13572776 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatca 13572875  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 258  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  13572876 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 13572924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 47481294 - 47480910
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  47481294 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 47481195  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  47481194 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 47481096  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-----------aatcaaaattcatacaacatttga 298  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||           || | | ||||||||||||  |||    
T  47481095 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatga 47480996  T
Q  299 aaatttaca--aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcacttta 382  Q
     || || ||  ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47480995 gaaattgcaataaatgaatatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcacttta 47480910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 25292595 - 25292207
Alignment:
Q  16 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  25292595 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacga 25292496  T
Q  116 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 215  Q
    |||| |||||| ||||||||  || |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||    
T  25292495 caacctaggag-aattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaaca 25292397  T
Q  216 attcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat--aatca--------aaattcatacaacatttgaaaattta 305  Q
    |||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||  | |||         | |||||||||   ||||||| ||     
T  25292396 attcatacatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaaatcttgaaaaattg 25292297  T
Q  306 caa--aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    |||  |||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  25292296 caaagaatgaacttgattatgataaagactaacccccttatcttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 25292207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18254098 - 18253842
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  18254098 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 18253999  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18253998 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18253900  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 267  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18253899 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 18253842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 420
Target Start/End: Original strand, 13321014 - 13321437
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  13321014 catcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 13321113  T
Q  110 taacaa-caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaattatacaa 206  Q
     ||||| |||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||||||||  ||||| | |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13321114 caacaatcaacttagca-aaattcaccaattgagcacaat-ttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa 13321211  T
Q  207 ctaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatca---------aaattcatacaacatt 295  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||  || |||         | ||||||||||||      
T  13321212 ttatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccacttattcaattcaacccatattcatacaacaaa 13321311  T
Q  296 tgaaaatttaca--aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    ||| || || ||  ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  13321312 tgagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacctaggcttcactttagctcctaagct 13321411  T
Q  394 cactccaatcttgattattcaagctct 420  Q
     || ||||| |||||| ||||||||||    
T  13321412 taccccaat-ttgattcttcaagctct 13321437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16479213 - 16478987
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||    
T  16479213 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaat 16479114  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||| || ||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16479113 taaaaataacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16479015  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  16479014 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 16478987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 393
Target Start/End: Original strand, 7293017 - 7293410
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  7293017 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 7293116  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  7293117 caacaacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 7293214  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat--aatca--------aaattcatacaacatttgaa 299  Q
      || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||         | |||||||||    ||||    
T  7293215 ttattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaaatcatgaa 7293314  T
Q  300 aatttacaa--aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    || || |||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  7293315 aaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 7293410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 316 - 449
Target Start/End: Original strand, 25124450 - 25124583
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaa 415  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25124450 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 25124549  T
Q  416 gctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  25124550 gctctccctcttctctctaatccttgttcttctc 25124583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 316 - 449
Target Start/End: Original strand, 3049905 - 3050039
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaat-cttgattattca 414  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||| ||| ||| ||||    
T  3049905 atgattatgataaaaactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcttaagttcactccaatccttaattcttca 3050004  T
Q  415 agctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3050005 agctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 3050039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 316 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 42056220 - 42056117
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  42056220 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcac-ccaatcttgattactcaa 42056122  T
Q  416 gctct 420  Q
    |||||    
T  42056121 gctct 42056117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 127 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 30262276 - 30261998
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  30262276 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 30262177  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat--aatca--------aaattcatacaacatttgaaaatttacaa--aatgat 314  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||         | |||||||||    |||||| || |||  |||||     
T  30262176 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa 30262077  T
Q  315 gatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  30262076 catgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 30261998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 127 - 393
Target Start/End: Original strand, 11516343 - 11516621
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  11516343 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 11516442  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat--aatca--------aaattcatacaacatttgaaaatttacaa--aatgat 314  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||         | ||||| |||    |||||| || |||  |||||     
T  11516443 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa 11516542  T
Q  315 gatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  11516543 catgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 11516621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 127 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15441711 - 15441433
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  15441711 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 15441612  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat--aatca--------aaattcatacaacatttgaaaatttacaa--aatgat 314  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||         | ||||| |||    |||||| || |||  |||||     
T  15441611 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa 15441512  T
Q  315 gatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  15441511 catgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 15441433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 345 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17817363 - 17817259
Alignment:
Q  345 cttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaagctctccctcttctctccaacccttgttc 444  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17817363 cttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcgtaagctcactccaatcttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttc 17817264  T
Q  445 atctc 449  Q
     ||||    
T  17817263 ttctc 17817259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 345 - 449
Target Start/End: Original strand, 19049638 - 19049742
Alignment:
Q  345 cttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaagctctccctcttctctccaacccttgttc 444  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19049638 cttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcgtaagctcactccaatcttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttc 19049737  T
Q  445 atctc 449  Q
     ||||    
T  19049738 ttctc 19049742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 316 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 2190117 - 2190014
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaa 415  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  2190117 atgattatgataaaaactaaccgccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttaactcctaagctcac-ccaatcttgattcctcaa 2190019  T
Q  416 gctct 420  Q
    |||||    
T  2190018 gctct 2190014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 316 - 402
Target Start/End: Original strand, 2029244 - 2029330
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaat 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  2029244 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaattccaacttaggcttcaatttagctcctaagttcactccaat 2029330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 242 - 416
Target Start/End: Original strand, 36024372 - 36024554
Alignment:
Q  242 agttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaa 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| ||  |||    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36024372 agttggagcacgaatttagaaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaa 36024471  T
Q  336 -cccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaa-tcttgattattcaag 416  Q
     |||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  36024472 ccccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcataagctcactccaattcttgattcttcaag 36024554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 279 - 416
Target Start/End: Original strand, 15709428 - 15709570
Alignment:
Q  279 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat----gatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggct 374  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | |||||| | |||||||||||    
T  15709428 aaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaattgatgatgatgattatgatgaagactaatcctcttaccttagattatgattaacctcaacttaggct 15709527  T
Q  375 tcactttagcttctaagctcactccaa-tcttgattattcaag 416  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15709528 tcactttagctcctaagctcactccaattcttgattcttcaag 15709570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 316 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 14113935 - 14113858
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  14113935 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagcttctaagct 14113858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 316 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15516793 - 15516660
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaa 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||| || ||||   |||||| || |||| |||  || || |||||||||||| |||||    
T  15516793 atgattatgataaagactaacccccttacatttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctagacttaccccaatcttgattcttcaa 15516694  T
Q  416 gctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15516693 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 15516660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 296087 - 295849
Alignment:
Q  153 ataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcac 252  Q
    ||||||| |||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||| |||  | || |||| ||||||||| |||||||||||| |  | || || |||    
T  296087 ataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaattagaacac 295988  T
Q  253 gaatttagcaacaatcatccataat-caaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacct-tag 349  Q
    ||||||||||||||| || ||| || ||||| |||||||||  |||||||||  | ||||||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||    
T  295987 gaatttagcaacaattattcattatgcaaaatttcatacaaagtttgaaaatgca-aaaatgatgagaattatgttgaagacaaacccccttacctctag 295889  T
Q  350 ataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
      ||||||||||||||||||   ||||| ||||||| ||||    
T  295888 -caaagattaatcccaacttgtacttcaatttagctcctaa 295849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 14423585 - 14423509
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  14423585 atgattatgataa-gactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagcttctaagct 14423509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 10000318 - 10000245
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10000318 tgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaa 10000245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Original strand, 371417 - 371491
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  371417 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 371491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 48622614 - 48622541
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  48622614 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaa 48622541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 257
Target Start/End: Original strand, 13377693 - 13377775
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 257  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13377693 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 13377775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 393
Target Start/End: Original strand, 13758677 - 13758754
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||   |||||| ||||||| |||||||    
T  13758677 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagct 13758754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16915011 - 16914928
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 258  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || |||||||| ||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  16915011 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 16914928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 390
Target Start/End: Original strand, 16418805 - 16418878
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||| | | ||||||  |||| | |||||||||||||| ||||    
T  16418805 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaactaaagcttcactttagctcctaa 16418878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 126738 - 126770
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  126738 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 126770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 242 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14114021 - 14113989
Alignment:
Q  242 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14114021 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14113989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 242 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14423671 - 14423639
Alignment:
Q  242 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14423671 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14423639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Original strand, 15927875 - 15927919
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 360  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15927875 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaa 15927919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18979970 - 18979926
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 360  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18979970 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaa 18979926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32493978 - 32493946
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32493978 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 32493946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 48598 - 49036
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  48598 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 48697  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    || ||||||||||| | |||||||||   | |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  48698 tagcaacaacttagca-aaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 48796  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48797 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 48896  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgatt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48897 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggctttactttagctcctaagctcactccaatcttgatt 48996  T
Q  410 attcaagctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
     ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  48997 cttcaatctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 49036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 36093 - 36320
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  36093 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctcaaat 36192  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36193 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 36292  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  36293 acatcaattcatacatacaaacataaca 36320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 61154 - 61121
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 349  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  61154 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 61121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 153956 - 153912
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 360  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  153956 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaa 153912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 12115 - 12552
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |    
T  12115 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt 12214  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
      |||||||||||  | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  12215 --acaacaacttaaca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaatta 12311  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaa 308  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||    
T  12312 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaatttcatacagcatttg-aaagttacaa 12410  T
Q  309 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaa-tcttga 407  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  12411 aattaagatgattatgataaagactaacccccttaccttagatagagattaatcctaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatttttga 12510  T
Q  408 ttattcaagctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12511 ttcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 12552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 37176 - 36733
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||| ||| |||||||||| ||| |||||||      
T  37176 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatc 37077  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  37076 caaccacaacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaatta 36978  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  36977 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaatttcaca 36878  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttca---ctttagcttctaagctcactccaatct 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||    
T  36877 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaaataaagattaatcccaacttaggcttcacttctttagctcctaagctcactccaatct 36778  T
Q  405 tgattattcaagctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36777 tgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 36733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 395
Target Start/End: Original strand, 462743 - 463122
Alignment:
Q  15 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||    
T  462743 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 462842  T
Q  115 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 214  Q
    ||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||    
T  462843 acaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatc 462941  T
Q  215 aattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgat 314  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  462942 aattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgat 463041  T
Q  315 gatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctca 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  463042 gatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctca 463122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19886913 - 19886661
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886913 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19886814  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886813 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19886714  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  19886713 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19886661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 403
Target Start/End: Original strand, 8891242 - 8891636
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  8891242 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 8891341  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  8891342 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaatta 8891440  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8891441 tcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 8891540  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatc 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  8891541 aaatgatgatgattatgataaagactaacccctttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagttcctaagctcactccaatc 8891636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 36982704 - 36982309
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |    
T  36982704 catcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 36982605  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||    
T  36982604 caacaacaacttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaatta 36982506  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac- 306  Q
     |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||     
T  36982505 tcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 36982406  T
Q  307 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatc 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  36982405 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagactaataccaacttaggcttcaatttagctcctcagctcactccaatc 36982309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20627576 - 20627238
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || | ||| |||||  ||||| |||| |||||||||||| | | |||||||    
T  20627576 catcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaat 20627477  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20627476 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20627378  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaa-tttacaa 308  Q
     ||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20627377 tcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccataatcataattcatacaatatttgaaaattttacaa 20627278  T
Q  309 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20627277 aatgatgatgattatgataaagactaaccccgttacctta 20627238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19794967 - 19794629
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  19794967 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 19794868  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19794867 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 19794769  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19794768 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttg-aaatttaca 19794670  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19794669 aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 19794629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 17396916 - 17396519
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17396916 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 17396817  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  17396816 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 17396717  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat--aatca--------aaattcatacaacatttgaa 299  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||         | |||||||||    ||||    
T  17396716 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatgtcaacccatttcatacaaatcatgaa 17396618  T
Q  300 aatttacaa--aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcac 396  Q
    || || |||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  17396617 aaattgcaaagaatgaacatgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggctttaatttagctcctaagctcac 17396519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 24341652 - 24341255
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  24341652 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 24341553  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  24341552 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaatta 24341454  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  24341453 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgca 24341354  T
Q  308 aa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaat 402  Q
    ||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24341353 aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcattttagctcctaagctcactccaat 24341255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 43643220 - 43642881
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  43643220 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaat 43643121  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||| ||||||| || | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43643120 taataacaactaagaa-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43643022  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43643021 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaacaattatccactatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca 43642922  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43642921 aaatgatgatgattatgataaagactaacctccttccctta 43642881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 252 - 422
Target Start/End: Original strand, 22863169 - 22863342
Alignment:
Q  252 cgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttag 349  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22863169 cgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttag 22863268  T
Q  350 ataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaat-cttgattattcaagctctcc 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||    
T  22863269 ataaagattaatcccaacttaggctgcaatttagctcctaagctcaccccaatccttgattcttcaagttctcc 22863342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 25265653 - 25265232
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
T  25265653 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 25265554  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25265553 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 25265455  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-----------aatcaaaattcatacaacatttga 298  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||           || | | ||||||||||||  |||    
T  25265454 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatga 25265355  T
Q  299 aaatttaca--aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcac 396  Q
     || || ||  ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  25265354 gaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttacattagataatgattaatccaaacctaggcttcactttagctcctaagcttac 25265255  T
Q  397 tccaatcttgattattcaagctct 420  Q
     ||||| |||||| ||||||||||    
T  25265254 cccaat-ttgattcttcaagctct 25265232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7508107 - 7507894
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | |||||     
T  7508107 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaa- 7508009  T
Q  109 ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    |||||||||||||||   |||||||||  || | |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  7508008 ttaacaacaacttagcc-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 7507910  T
Q  209 aacatcaattcatgca 224  Q
    | ||||||||||||||    
T  7507909 atcatcaattcatgca 7507894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 127 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 19689548 - 19689270
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  19689548 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 19689449  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat--aatca--------aaattcatacaacatttgaaaatttacaa--aatgat 314  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||         | |||||||||    |||||| || |||  |||||     
T  19689448 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa 19689349  T
Q  315 gatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  19689348 catgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 19689270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 127 - 393
Target Start/End: Original strand, 23820187 - 23820465
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  23820187 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 23820286  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat--aatca--------aaattcatacaacatttgaaaatttacaa--aatgat 314  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||         | ||||| |||    |||||| || |||  |||||     
T  23820287 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa 23820386  T
Q  315 gatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  23820387 catgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 23820465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 127 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 14906587 - 14906309
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  14906587 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 14906488  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat--aatca--------aaattcatacaacatttgaaaatttacaa--aatgat 314  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||         | ||||| |||    |||||| || |||  |||||     
T  14906487 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa 14906388  T
Q  315 gatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  14906387 catgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 14906309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 316 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 21273980 - 21273878
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  21273980 atgattatgataaagactaacccc-ttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcataagctcac-ccaatcttgattcctcaa 21273883  T
Q  416 gctct 420  Q
    |||||    
T  21273882 gctct 21273878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 316 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 9652828 - 9652741
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatc 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  9652828 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggtttcaatttagctcctaagttcactccaatc 9652741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 20015127 - 20015274
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| | |||| ||  ||||||||||||||     
T  20015127 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatg 20015226  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20015227 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20015274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Original strand, 33128372 - 33128446
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33128372 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaa 33128446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28031166 - 28031100
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcacttta 382  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  28031166 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaattcaaacttaggcttcacttta 28031100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 317 - 422
Target Start/End: Original strand, 32466177 - 32466281
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaag 416  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | | ||||| || ||||||    
T  32466177 tgattatgatgaagactaacccc-ttaccttagataaggatcaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcacccaattcttggttcttcaag 32466275  T
Q  417 ctctcc 422  Q
     |||||    
T  32466276 ttctcc 32466281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 316 - 391
Target Start/End: Original strand, 20015328 - 20015403
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaag 391  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  20015328 atgatcatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaag 20015403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 382
Target Start/End: Original strand, 17204659 - 17204725
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcacttta 382  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17204659 atgattatgatgaagactaacccccttactttaggttatgattaatccaaacttagacttcacttta 17204725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 12641591 - 12641514
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| ||||||| |||||||    
T  12641591 atgattatgataataactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagct 12641514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 390
Target Start/End: Original strand, 21142203 - 21142276
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21142203 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaa 21142276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 257
Target Start/End: Original strand, 68156 - 68238
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 257  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  68156 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 68238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5888578 - 5888505
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||| | | ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||    
T  5888578 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaagcttcactttagctcctaa 5888505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 393
Target Start/End: Original strand, 8944153 - 8944230
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||   |||||| ||||||| |||||||    
T  8944153 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagct 8944230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 12635817 - 12635740
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||   |||||| ||||||| |||||||    
T  12635817 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagct 12635740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 393
Target Start/End: Original strand, 12728699 - 12728776
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||   |||||| ||||||| |||||||    
T  12728699 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagct 12728776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 393
Target Start/End: Original strand, 34824782 - 34824859
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||   |||||| ||||||| |||||||    
T  34824782 atgattatgataatcactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagct 34824859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 22284278 - 22284310
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284278 atgattatgataaagactaacccccttacctta 22284310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 393
Target Start/End: Original strand, 23774444 - 23774520
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||   |||||| ||||||| |||||||    
T  23774444 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagct 23774520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 347
Target Start/End: Original strand, 25213372 - 25213403
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213372 atgattatgataaagactaacccccttacctt 25213403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22775288 - 22775206
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 257  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22775288 tgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 22775206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22780666 - 22780584
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 257  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22780666 tgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 22780584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 3798552 - 3798483
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagct 385  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||   |||||| |||||||    
T  3798552 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagct 3798483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 7507789 - 7507756
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 349  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7507789 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 7507756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 411 - 444
Target Start/End: Original strand, 22275142 - 22275175
Alignment:
Q  411 ttcaagctctccctcttctctccaacccttgttc 444  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22275142 ttcaagctctccctcttctctctaacccttgttc 22275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 31146138 - 31146072
Alignment:
Q  282 attcatacaaca-tttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttag 349  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  31146138 attcatacaacaatttgaaaatttacacaa--aagatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 31146072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Original strand, 16935900 - 16935944
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 360  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16935900 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaa 16935944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Original strand, 17006560 - 17006604
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 360  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17006560 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaa 17006604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 22275045 - 22275077
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22275045 atgattatgataaaggctaacccccttacctta 22275077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 42177918 - 42177874
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 360  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  42177918 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaa 42177874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 257
Target Start/End: Original strand, 43646059 - 43646139
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 257  Q
    |||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  43646059 aacatgaaatttcaccaacaacaatccaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcaacataattagagcacgaatt 43646139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 128431 - 127994
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| |    
T  128431 catcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaa-t 128333  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||| ||  | |||||| ||  || |||||||| |||| |||||| ||  ||| || || ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  128332 taacaacaacctaaca-aaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 128234  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  128233 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacttttgaaaatttgcaaa 128134  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgatt 409  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  128133 atgaagatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcattttatctcctaatctcactccaatcttgatt 128034  T
Q  410 attcaagctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
     |||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||    
T  128033 cttcaagctctccctcttctctctaactgttgttcttctc 127994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31928 - 31700
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  31928 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 31829  T
Q  110 taacaacaactt-aggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31828 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaact 31729  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31728 aacatcaattcatgcattcaaacataaca 31700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 449
Target Start/End: Original strand, 272031 - 272463
Alignment:
Q  16 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   |||||| || |||||||||||||| |||||||   ||| |    
T  272031 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaacca 272130  T
Q  116 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 215  Q
    |||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||    
T  272131 caacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatca 272229  T
Q  216 attcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatg 315  Q
    |||||| |||||||||||| ||  | |||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  272230 attcattcatacaaacatatcattacagttggagtacgtatttagcaatatttatccataatcaaaatttatacaatatttgaaaatttacaaaatgatg 272329  T
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||    
T  272330 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctgagctcactccaatcttgattctttaa 272429  T
Q  416 gctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  272430 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 10 - 422
Target Start/End: Original strand, 13246430 - 13246844
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  13246430 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 13246529  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13246530 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 13246628  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246629 tcattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 13246728  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaa-tcttg 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13246729 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaattcttg 13246828  T
Q  407 attattcaagctctcc 422  Q
    ||| |||||| |||||    
T  13246829 attcttcaagttctcc 13246844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 110 - 449
Target Start/End: Original strand, 121989 - 122327
Alignment:
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  121989 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 122087  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  122088 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 122187  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgatt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  122188 atgatgatgattatgataaagactaatccccttaccttagataaagattaatcccaacttagacttcaatttagctcttaagctcactccaatcttgatt 122287  T
Q  410 attcaagctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  122288 cttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 122327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 47357654 - 47357906
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357654 catcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 47357753  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357754 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 47357853  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  47357854 acatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 47357906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 15675352 - 15674940
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  15675352 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 15675253  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15675252 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15675154  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  15675153 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgca 15675054  T
Q  308 aa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaa-t 402  Q
    ||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  15675053 aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatt 15674954  T
Q  403 cttgattattcaag 416  Q
    ||||||| ||||||    
T  15674953 cttgattcttcaag 15674940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 54118507 - 54118168
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |||| ||      
T  54118507 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatc 54118408  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||| || | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  54118407 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 54118309  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54118308 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca 54118209  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54118208 aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 54118168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 10644219 - 10644467
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  10644219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 10644318  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  10644319 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 10644418  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 258  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  10644419 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 10644467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13048477 - 13048221
Alignment:
Q  18 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  13048477 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaaca 13048378  T
Q  118 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 217  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||     
T  13048377 acttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaa 13048278  T
Q  218 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    ||||||||||||||||| ||    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13048277 tcatgcatacaaacatatcattgaagttggagcatgaatttagcaacaattatccat 13048221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 78 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 10104445 - 10104101
Alignment:
Q  78 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatg 177  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||    
T  10104445 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg 10104347  T
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--ta 275  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||    
T  10104346 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatccaatta 10104247  T
Q  276 atcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttag 371  Q
       ||||||||||| ||||||||||| ||  |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||    
T  10104246 tgaaaaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttag 10104147  T
Q  372 gcttcactttagcttctaagctcactccaa-tcttgattattcaag 416  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10104146 gctttactttagctcctaagctcactccaattcttgattcttcaag 10104101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 211 - 416
Target Start/End: Original strand, 33240900 - 33241112
Alignment:
Q  211 catcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  33240900 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaa 33240999  T
Q  309 a----atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaa-tc 403  Q
    |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||    
T  33241000 aaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcgctttaactcctaagctcactccaattc 33241099  T
Q  404 ttgattattcaag 416  Q
    |||||| ||||||    
T  33241100 ttgattcttcaag 33241112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 393
Target Start/End: Original strand, 26680201 - 26680594
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  26680201 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 26680300  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  26680301 caactacaacat--gtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 26680398  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat--aatca----aa---att-catacaacatttgaa 299  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||    ||   ||| |||||||    ||||    
T  26680399 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccattccatacaaatcatgaa 26680498  T
Q  300 aatttacaa--aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    || || |||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  26680499 aaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 26680594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 247
Target Start/End: Original strand, 31115629 - 31115865
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  31115629 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 31115728  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||||| |||||||||  || |||| ||| |||| |||||  ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  31115729 caacaacaacttagga-aaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 31115827  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttgg 247  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  31115828 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 31115865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 316 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 15135939 - 15135836
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  15135939 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcac-ccaatcttgattcctcaa 15135841  T
Q  416 gctct 420  Q
    |||||    
T  15135840 gctct 15135836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 316 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 15272243 - 15272140
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  15272243 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcac-ccaatcttgattcctcaa 15272145  T
Q  416 gctct 420  Q
    |||||    
T  15272144 gctct 15272140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 402
Target Start/End: Original strand, 31132545 - 31132711
Alignment:
Q  242 agttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  31132545 agttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgataattatgatgaagactaa 31132644  T
Q  336 cccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaat 402  Q
    |||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31132645 cccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggctccactttagctcctaagctcactccaat 31132711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 10488678 - 10488825
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  10488678 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 10488777  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10488778 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 10488825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16328073 - 16327926
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  16328073 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 16327974  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16327973 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16327926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 32460635 - 32460561
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32460635 atgattatgaagaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaa 32460561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 107
Target Start/End: Original strand, 111395 - 111492
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaa 107  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  111395 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaa 111492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 55376525 - 55376420
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaag 416  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | | ||||| || ||||||    
T  55376525 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggatcaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcacccaattcttggttcttcaag 55376426  T
Q  417 ctctcc 422  Q
     |||||    
T  55376425 ttctcc 55376420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 316 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 14500144 - 14500075
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagct 385  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  14500144 atgattatgatgaagcctaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaagcttcactttagct 14500075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 316 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16609045 - 16608968
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  16609045 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 16608968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 316 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 40885491 - 40885422
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagct 385  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40885491 atgattatgatgaattctaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttagct 40885422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16327872 - 16327795
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  16327872 atgattatgataaagactaacccccttaccttatatgaagattaggccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 16327795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 40885749 - 40885570
Alignment:
Q  78 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat 176  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||| ||||||| | || ||||||  || |||| ||| ||||||||||  ||||| | |||| | |    
T  40885749 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagca-aagttcaccaattgagcataat-ttcataacttgacatttatacatacttt 40885652  T
Q  177 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  40885651 gaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattt 40885570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Original strand, 8045272 - 8045346
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8045272 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaattcaaacttagacttcactttagctcctaa 8045346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 390
Target Start/End: Original strand, 22738577 - 22738650
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22738577 tgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaa 22738650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 393
Target Start/End: Original strand, 10488879 - 10488956
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  10488879 atgattaagataaagaccaaccaccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 10488956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Original strand, 14952085 - 14952129
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14952085 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaa 14952129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 382
Target Start/End: Original strand, 18248527 - 18248591
Alignment:
Q  318 gattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcacttta 382  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  18248527 gattatgataataactaacccccttaccttagatgatgattaatcttaacttaagcttcacttta 18248591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 13048160 - 13048090
Alignment:
Q  323 tgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || ||| ||||||||| |||| || |||||||    
T  13048160 tgataaagactaacccccttaacttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttaactcctaagct 13048090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 257
Target Start/End: Original strand, 15044992 - 15045074
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 257  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15044992 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 15045074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 385
Target Start/End: Original strand, 16523146 - 16523215
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagct 385  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  ||||||||||||||    
T  16523146 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagct 16523215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 393
Target Start/End: Original strand, 20001030 - 20001107
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||   |||||| ||||||| |||||||    
T  20001030 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagct 20001107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 7132014 - 7131962
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaact 368  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  7132014 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaatccaaact 7131962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 10104494 - 10104450
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 54  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10104494 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaa 10104450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 393
Target Start/End: Original strand, 26339327 - 26339403
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||   |||||| ||||||| |||||||    
T  26339327 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagct 26339403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 382
Target Start/End: Original strand, 8378493 - 8378559
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcacttta 382  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| | | ||||||  |||||| |||||||||||    
T  8378493 atgattatgataataactaatccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaagcttcacttta 8378559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15109432 - 15109350
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 257  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  15109432 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaatt 15109350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 19697310 - 19697244
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcacttta 382  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| | | ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  19697310 atgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcacacttaggcttcacttta 19697244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 19707895 - 19707829
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcacttta 382  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| | | ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  19707895 atgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcacacttaggcttcacttta 19707829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 17145639 - 17145562
Alignment:
Q  283 ttcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 360  Q
    ||||||||||||  ||||||  | ||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17145639 ttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaa 17145562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15287194 - 15287150
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 360  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15287194 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaa 15287150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15294303 - 15294259
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 360  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15294303 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaa 15294259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 10 - 393
Target Start/End: Original strand, 23506965 - 23507347
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  23506965 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 23507064  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23507065 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 23507163  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23507164 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaatcttacaaa 23507263  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  23507264 atggagatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaattccaacttatgcttcactttaactcctaagct 23507347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 25426628 - 25426880
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426628 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25426727  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426728 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25426827  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  25426828 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 25426880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 12374 - 12626
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12374 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 12473  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12474 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 12573  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  12574 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 12626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 27182810 - 27182396
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  27182810 catcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 27182711  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  27182710 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaatta 27182612  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     ||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27182611 tcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 27182512  T
Q  308 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaa-tcttg 406  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27182511 aaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaattcttg 27182412  T
Q  407 attattcaagctctcc 422  Q
    ||| |||||| |||||    
T  27182411 attcttcaagttctcc 27182396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 19499899 - 19500151
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19499899 catcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19499998  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19499999 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19500098  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  19500099 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19500151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22366733 - 22366481
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22366733 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactcaaat 22366634  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366633 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 22366534  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  22366533 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 22366481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 10 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18778244 - 18777995
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778244 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 18778145  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778144 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 18778045  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattta 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||    
T  18778044 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 18777995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21073847 - 21073595
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073847 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 21073748  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073747 taacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 21073648  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 262  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  21073647 acatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 21073595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 43443647 - 43443398
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  43443647 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagactcacatctcaaat 43443548  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43443547 caacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 43443448  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattta 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||    
T  43443447 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 43443398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 4200237 - 4199985
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  4200237 catcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 4200138  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4200137 caacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 4200038  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |    ||||||||||||||||    
T  4200037 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca 4199985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 18531330 - 18530919
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  18531330 catcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 18531231  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18531230 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18531132  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc-ataatcaaa-attcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||| |||||||| ||||||||||| || ||    
T  18531131 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaacattcataccacatttgaaaaattgca 18531032  T
Q  308 aaatgatgat---gattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaa-tc 403  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18531031 aaatgatgatgacgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaattc 18530932  T
Q  404 ttgattattcaag 416  Q
    |||||| ||||||    
T  18530931 ttgattcttcaag 18530919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 22054096 - 22053684
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  22054096 catcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 22053997  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22053996 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 22053898  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  22053897 tcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaatttca 22053798  T
Q  308 aa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaa-t 402  Q
    ||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  22053797 aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttagacttcactttagctcctaagctcacttcaatt 22053698  T
Q  403 cttgattattcaag 416  Q
    ||||||| ||||||    
T  22053697 cttgattcttcaag 22053684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 27009841 - 27010089
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27009841 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 27009940  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||  |    
T  27009941 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatca 27010040  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 258  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  27010041 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 27010089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 29188483 - 29188284
Alignment:
Q  62 atcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttat 161  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||    
T  29188483 atcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttat 29188385  T
Q  162 catttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagc 261  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||| ||||    
T  29188384 catttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagc 29188285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Original strand, 34939289 - 34939540
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||  |||    
T  34939289 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaatgact 34939387  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  34939388 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 34939486  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34939487 tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacagttatccat 34939540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 316 - 449
Target Start/End: Original strand, 21205249 - 21205381
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaa 415  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21205249 atgattatgataaagactaatccc-ttatcttagatgaagattaattccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 21205347  T
Q  416 gctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  21205348 gctctcccacttctctctaacccttgttcttctc 21205381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 127 - 393
Target Start/End: Original strand, 20623085 - 20623363
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  20623085 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 20623184  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat--aatca--------aaattcatacaacatttgaaaatttacaa--aatgat 314  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||         | ||||| |||    |||||| || |||  |||||     
T  20623185 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa 20623284  T
Q  315 gatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  20623285 catgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 20623363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 127 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21233675 - 21233397
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  21233675 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 21233576  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat--aatca--------aaattcatacaacatttgaaaatttacaa--aatgat 314  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||         | ||||| |||    |||||| || |||  |||||     
T  21233575 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa 21233476  T
Q  315 gatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  21233475 catgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 21233397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 316 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 108760 - 108668
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgatt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||    
T  108760 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttacctcctaagctcac-caaatcttgatt 108668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 393
Target Start/End: Original strand, 37052860 - 37053138
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||   |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  37052860 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 37052959  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat--aatca----aa---at-tcatacaacatttgaaaatttacaa--aatgat 314  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||    ||   || |||| |||    |||||| || |||  |||||     
T  37052960 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatctcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa 37053059  T
Q  315 gatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  37053060 catgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 37053138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 128 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25900552 - 25900408
Alignment:
Q  128 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 227  Q
    |||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   ||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  25900552 aattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 25900453  T
Q  228 aaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc 272  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25900452 aaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcc 25900408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 393
Target Start/End: Original strand, 16536313 - 16536591
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  || ||||||||||||    
T  16536313 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcata 16536412  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataa-------tcaa---aattcatacaacatttgaaaatttacaaa--atgat 314  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||||   | ||||| |||    |||||| || ||||  ||||     
T  16536413 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa 16536512  T
Q  315 gatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  16536513 catgattatgataaagactaacccccttatcttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 16536591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 316 - 403
Target Start/End: Original strand, 21651018 - 21651105
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatc 403  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21651018 atgattatgataaatattaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttagacttcaatttagctcctaagctcactccaatc 21651105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 311 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 23981442 - 23981330
Alignment:
Q  311 tgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaa-tcttgatt 409  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  23981442 tgattatgattttgatgaagactaacccccttacctaagatgaagattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccccaattcttgatt 23981343  T
Q  410 attcaagctctcc 422  Q
     |||||| |||||    
T  23981342 cttcaagatctcc 23981330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 318 - 422
Target Start/End: Original strand, 2032135 - 2032240
Alignment:
Q  318 gattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaa-tcttgattattcaag 416  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  2032135 gattatgatgaaaactaacccccttaccttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccccaattcttgattcttcaag 2032234  T
Q  417 ctctcc 422  Q
     |||||    
T  2032235 ttctcc 2032240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 316 - 416
Target Start/End: Original strand, 25005137 - 25005238
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaa-tcttgattattca 414  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||| ||||    
T  25005137 atgattatgatgaagactaacccccttactttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctagattcactccaattcttgattcttca 25005236  T
Q  415 ag 416  Q
    ||    
T  25005237 ag 25005238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 316 - 385
Target Start/End: Original strand, 7529228 - 7529297
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagct 385  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7529228 atgattatgaagaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttagct 7529297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 420
Target Start/End: Original strand, 32951016 - 32951115
Alignment:
Q  320 ttatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaagctc 419  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||    
T  32951016 ttatgatgaagactaacccccttaccttaaataatgattaattcaaacttagacttcaatttagctcctaagcttaccccaat-ttgattcttcaagctc 32951114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 25900352 - 25900275
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||| | ||||||| |||||||    
T  25900352 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggctttaatttagctcctaagct 25900275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9730310 - 9730236
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9730310 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 9730236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 382
Target Start/End: Original strand, 17909823 - 17909889
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcacttta 382  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17909823 atgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaggcttcacttta 17909889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Original strand, 16105967 - 16106011
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16105967 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaa 16106011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 1219469 - 1219392
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||   |||||| ||||||| |||||||    
T  1219469 atgattatgataatcactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagct 1219392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 174 - 258
Target Start/End: Original strand, 29918127 - 29918212
Alignment:
Q  174 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| || |||||||| |||| || |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  29918127 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtattcaaacatatcatcataattggagcacgaattt 29918212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 178 - 267
Target Start/End: Original strand, 32950862 - 32950951
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 267  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||| |||| || || || |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||    
T  32950862 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 32950951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 393
Target Start/End: Original strand, 23328865 - 23328941
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||   |||||| ||||||| |||||||    
T  23328865 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagct 23328941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 393
Target Start/End: Original strand, 24616469 - 24616545
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||   |||||| ||||||| |||||||    
T  24616469 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagct 24616545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 393
Target Start/End: Original strand, 24712845 - 24712921
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||   |||||| ||||||| |||||||    
T  24712845 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagct 24712921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 393
Target Start/End: Original strand, 24745863 - 24745939
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||   |||||| ||||||| |||||||    
T  24745863 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagct 24745939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 29190522 - 29190482
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 54  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29190522 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaa 29190482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21310792 - 21310709
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 258  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  21310792 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 21310709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 5450926 - 5450844
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 257  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  5450926 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaatt 5450844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Original strand, 34939595 - 34939669
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| | | ||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||    
T  34939595 atgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcacacttagacttcactttagctcctaa 34939669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 35791047 - 35790961
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaat 402  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||| || |||||    
T  35791047 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaat 35790961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 17471844 - 17471803
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 51  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17471844 catcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcat 17471803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Original strand, 7425631 - 7425675
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 360  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7425631 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaa 7425675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Original strand, 11343008 - 11343052
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 360  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  11343008 atgattatgataaaaactaacccccttacctttgaagaagattaa 11343052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 257
Target Start/End: Original strand, 16595713 - 16595753
Alignment:
Q  217 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 257  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16595713 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 16595753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 34)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 25175563 - 25175815
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175563 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25175662  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175663 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25175762  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  25175763 acatcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagca 25175815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 421
Target Start/End: Original strand, 23153458 - 23153860
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || || ||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  23153458 catgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 23153557  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  23153558 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 23153656  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 318  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23153657 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 23153756  T
Q  319 attatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaa-tcttgattattcaagc 417  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  23153757 attatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaattcttgattcttcaagt 23153856  T
Q  418 tctc 421  Q
    ||||    
T  23153857 tctc 23153860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27654235 - 27653983
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27654235 catcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaat 27654136  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654135 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 27654036  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  27654035 acatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagca 27653983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16826006 - 16825752
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16826006 catcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 16825907  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatta--tacaac 207  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16825906 taacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaac 16825807  T
Q  208 taacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  16825806 taacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 16825752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14626377 - 14626045
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||||    
T  14626377 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaac 14626278  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    |||||||||| | || ||||||  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  14626277 aacaacttagcataa-ttcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 14626179  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatga 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  ||| |||    
T  14626178 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaattcaaacaacatttgagaatttgtaaagtga 14626079  T
Q  314 tgatgattatgataaagactaacccccttacctt 347  Q
     ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  14626078 agatgattgtgataataactaacccccttacctt 14626045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 1650352 - 1649976
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  1650352 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 1650253  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
     | ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  1650252 cataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 1650154  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatg 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||  |||||||||| |||||  |||  | ||| || | |  ||||||||||||  |||||  | ||||||     
T  1650153 caattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatt 1650056  T
Q  313 atgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  1650055 a-catgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 1649976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 279 - 421
Target Start/End: Original strand, 23148266 - 23148409
Alignment:
Q  279 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  23148266 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaa 23148365  T
Q  379 tttagcttctaagctcactccaa-tcttgattattcaagctctc 421  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  23148366 tttagctcctaagctcactccaattcttgattcttcaagttctc 23148409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 35009702 - 35009315
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
T  35009702 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 35009603  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  35009602 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 35009504  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-----------aatcaaaattcatacaacatttga 298  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||           || | | ||||||||||||  |||    
T  35009503 tcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccatttcttcaattcaacccatattcatacaacaaatga 35009404  T
Q  299 aaatttaca--aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagct 385  Q
     || || ||  ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  35009403 gaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttactttagataatgattaatccaaactttggcttcactttagct 35009315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1657999 - 1657748
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  1657999 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 1657901  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  1657900 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 1657802  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1657801 tgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 1657748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 316 - 420
Target Start/End: Original strand, 23995247 - 23995350
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  23995247 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcac-ccaatcttgattcctcaa 23995345  T
Q  416 gctct 420  Q
    |||||    
T  23995346 gctct 23995350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Original strand, 15862484 - 15862734
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| || ||   ||||||| | | |||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  15862484 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataacataaat-gaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 15862581  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  15862582 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 15862680  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15862681 tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccat 15862734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 316 - 429
Target Start/End: Original strand, 26090059 - 26090172
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26090059 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaacctcactccaatcttgattcttcaa 26090158  T
Q  416 gctctccctcttct 429  Q
    ||||||||||||||    
T  26090159 gctctccctcttct 26090172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 420
Target Start/End: Original strand, 29665941 - 29666284
Alignment:
Q  78 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat 176  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||  | ||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||| | |    
T  29665941 aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagtacaat-ttcataacttgacatttatgcatacttt 29666038  T
Q  177 gaa-catgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccata 275  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||  || |||||| || || | ||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  29666039 gaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccatc 29666138  T
Q  276 atcaaaatt-catacaacatttgaaaatttacaaaa--tgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttagg 372  Q
    | |  | || ||||||||| | || || || ||| |  |||  ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  29666139 accccattttcatacaacaat-gagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccacttatgttagataatgattaatccaaacttagg 29666237  T
Q  373 cttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaagctct 420  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  29666238 cttcaatttagctcctaagctcaccccaat-ttgattcttcaagctct 29666284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 316 - 422
Target Start/End: Original strand, 27751742 - 27751849
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaa-tcttgattattca 414  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  27751742 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccccaattcttgattcttca 27751841  T
Q  415 agctctcc 422  Q
    || |||||    
T  27751842 agttctcc 27751849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 318 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 15742150 - 15742078
Alignment:
Q  318 gattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15742150 gattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaa 15742078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 32276691 - 32276617
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  32276691 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaagcttcactttagctcctaa 32276617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18839170 - 18839096
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18839170 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaagcttcactttagcttctaa 18839096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 328 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16299906 - 16299844
Alignment:
Q  328 aagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16299906 aagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaa 16299844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18002427 - 18002353
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18002427 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggttatgattaatctaaacttagccttcactttagctcctaa 18002353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18823315 - 18823241
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  18823315 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaaacttcactttagctcctaa 18823241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 274
Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751688
Alignment:
Q  189 tcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  27751603 tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccat 27751688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 258
Target Start/End: Original strand, 29605612 - 29605696
Alignment:
Q  174 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||  ||||||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  29605612 tatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaattcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt 29605696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13620743 - 13620669
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||| |||||||||||||||| ||||    
T  13620743 atgattatgaagaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaactcaggcttcactttagctcctaa 13620669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 1657693 - 1657649
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 360  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1657693 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagaagattaa 1657649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Original strand, 15862789 - 15862833
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 360  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15862789 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagaagattaa 15862833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 347
Target Start/End: Original strand, 4991396 - 4991427
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991396 atgattatgataaagactaacccccttacctt 4991427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18629691 - 18629608
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 258  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || |||||||| ||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  18629691 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 18629608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 17083282 - 17083200
Alignment:
Q  174 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaat 256  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  || ||| || || |||||||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||    
T  17083282 tatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat 17083200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 402
Target Start/End: Original strand, 19610325 - 19610411
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaat 402  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||| || |||||    
T  19610325 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaat 19610411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 393
Target Start/End: Original strand, 23978076 - 23978153
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||  |||||||| || ||||   |||||| ||||||| |||||||    
T  23978076 atgattatgataataactaacgcccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagct 23978153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Original strand, 16232199 - 16232243
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 360  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16232199 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaa 16232243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 257
Target Start/End: Original strand, 18399144 - 18399184
Alignment:
Q  217 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 257  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18399144 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 18399184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19983224 - 19983192
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19983224 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 19983192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 35015089 - 35015057
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35015089 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 35015057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 10 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 6326 - 5940
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| |    
T  6326 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t 6228  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| || | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6227 taacaacaacttagca-aaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 6129  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6128 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgcaaa 6029  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactc 398  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||| || |||| ||||||| ||||    
T  6028 gtgaaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatagagattaatcctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttactc 5940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 247694 - 247320
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  247694 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 247595  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | ||||| |||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||||  |||| |||||| || ||||||||||    
T  247594 tagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattca 247496  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 318  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247495 tgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 247396  T
Q  319 attatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  247395 attatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctc 247320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 34107 - 34021
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaat 402  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| ||||||| ||||||| || |||||    
T  34107 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacgccaat 34021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 26678 - 26285
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  26678 catcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 26579  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||| ||    
T  26578 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaatta 26480  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaa 308  Q
     |||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26479 tcatcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatacattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 26380  T
Q  309 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatc 403  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  26379 aatgatcatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccatcttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatc 26285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 127 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 8327 - 8055
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  8327 aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcata 8228  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-----------aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca--aaatga 313  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||           || | | ||||||||||||  ||| || || ||  ||||||    
T  8227 caaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatga 8128  T
Q  314 tgatgattatgataaagactaa-cccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagct 385  Q
      ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8127 acatgattatgatgaagactaaccccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcattttagct 8055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 316 - 420
Target Start/End: Original strand, 12063 - 12166
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaa 415  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||||| |||||| ||||     
T  12063 atgattatgatgaagactaacccccttatcttagataatgattaatccaaactttggcttcaatttagctcctaagcttaccccaat-ttgattcttcac 12161  T
Q  416 gctct 420  Q
    |||||    
T  12162 gctct 12166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 10 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 123427 - 123018
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| ||      
T  123427 catcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatc 123328  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  123327 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 123229  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac- 306  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  123228 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgcaaatttaca 123129  T
Q  307 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaa-tctt 405  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  123128 aaaattatgatgattatggtgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaattctt 123029  T
Q  406 gattattcaag 416  Q
    |||| ||||||    
T  123028 gattcttcaag 123018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 10 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 862
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||| | | ||||| |    
T  1218 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctcaa-t 1120  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  || |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1119 taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 1021  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 309  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||    
T  1020 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgtaaa 921  T
Q  310 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaact 368  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  920 gtgaagatgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaaccccaact 862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 403
Target Start/End: Original strand, 15238 - 15284
Alignment:
Q  357 ttaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  15238 ttaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagttcactccaatc 15284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 449
Target Start/End: Original strand, 41733 - 42165
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | || | ||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||  ||||    
T  41733 atcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaac 41832  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    |||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||   |||| || |||    
T  41833 aacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcat 41931  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatga 313  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41932 caattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatga 42031  T
Q  314 tgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaat-cttgattatt 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||| |||||| |||  || ||    
T  42032 tgatgattatgataaagaccaacccccttaccttagataaatattaatcccaacttagacttcaatttacctcctaagctcagtccaatccttagttctt 42131  T
Q  413 caagctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    |||| ||||   |||||||| ||||||||||| ||||    
T  42132 caagttctc---cttctctctaacccttgttcttctc 42165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 128 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 51328 - 51009
Alignment:
Q  128 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 227  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  51328 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatac 51229  T
Q  228 aaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 327  Q
    ||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51228 aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 51129  T
Q  328 aagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaat-cttgattattcaagctctccctct 426  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  || |||||| ||||   ||    
T  51128 aagactaatctccttacctaagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatccttagttcttcaagttctc---ct 51032  T
Q  427 tctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    |||||| ||||||||||| ||||    
T  51031 tctctctaacccttgttcttctc 51009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 42997 - 43224
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  42997 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaat 43096  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43097 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43196  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43197 tcatcaattcatgcatagaaacataaca 43224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Original strand, 19206 - 19543
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |    
T  19206 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 19305  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  19306 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 19404  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac- 306  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19405 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 19504  T
Q  307 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacc 345  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19505 aaaattatgatgattatgatgaagactaacccccttacc 19543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 21290 - 21553
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |    
T  21290 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 21389  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  21390 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 21488  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21489 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 128 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 89600 - 89303
Alignment:
Q  128 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 227  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| ||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  89600 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 89501  T
Q  228 aaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatga 325  Q
    ||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  89500 aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatagaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatcatga 89401  T
Q  326 taaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaa-tcttgattattcaagctctcc 422  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  89400 tgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttaactcctaagctcactccaattcttgattcttcaagttctcc 89303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 223 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 107835 - 107633
Alignment:
Q  223 catacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 320  Q
    |||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107835 catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 107736  T
Q  321 tatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaa-tcttgattattcaagctc 419  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  107735 catgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttaactcctaagctcactccaattcttgattcttcaagttc 107636  T
Q  420 tcc 422  Q
    |||    
T  107635 tcc 107633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 347
Target Start/End: Original strand, 130880 - 130911
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130880 atgattatgataaagactaacccccttacctt 130911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5324 - 4996
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  5324 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 5225  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||    
T  5224 taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaacaatcttacaatta 5126  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat-caaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 308  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5125 tcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaacaattatccattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 5026  T
Q  309 aatgatgatgattatgataaagactaaccc 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5025 aatgataatgattatgataaagactaaccc 4996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 248 - 449
Target Start/End: Original strand, 146838 - 147039
Alignment:
Q  248 agcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 347  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146838 agcatgaatttaggaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 146937  T
Q  348 agataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaagctctccctcttctctccaacccttgttcatc 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  146938 agataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttc 147037  T
Q  448 tc 449  Q
    ||    
T  147038 tc 147039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 416
Target Start/End: Original strand, 8849 - 9261
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||  ||||| | ||||| |    
T  8849 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaatt 8948  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8949 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 9047  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||| ||||| ||||||||||| || ||    
T  9048 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaatacataccacatttgaaaaattgca 9147  T
Q  308 aa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaa-t 402  Q
    ||    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  9148 aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacacacttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatt 9247  T
Q  403 cttgattattcaag 416  Q
    ||||||| ||||||    
T  9248 cttgattcttcaag 9261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 148721 - 149012
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||  |||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  148721 catcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 148820  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  148821 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 148919  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| ||| || ||   ||||||||||||||||||||||    
T  148920 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatcaattatgcaaaaattcatacaacatttgaaa 149012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Original strand, 149014 - 149090
Alignment:
Q  374 ttcactttagcttctaagctcactccaatcttga-ttattcaagctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  149014 ttcactttagctcctaagctcactccaatctttagttcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 149090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 5552 - 5785
Alignment:
Q  34 acccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattca 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5552 acccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattca 5651  T
Q  134 cccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||  || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  5652 ccaattgagcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacat 5751  T
Q  234 aacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 267  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5752 aacatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 5785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 393
Target Start/End: Original strand, 5846 - 5923
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  5846 atgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 5923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 35 - 283
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  35 catcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 134  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  135 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 234  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 258  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  235 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 422
Target Start/End: Original strand, 338 - 442
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaa 415  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||  ||||||  ||||    
T  338 atgattttgataataactaacccccttaccttagaagaagattaatccaaactctcgcttcaattcagctcctaagcttaccccaa--ttgattcctcaa 435  T
Q  416 gctctcc 422  Q
    |||||||    
T  436 gctctcc 442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 267
Target Start/End: Original strand, 48187 - 48443
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  48187 catcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 48286  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  48287 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 48385  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 267  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  48386 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaat 48443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Original strand, 48504 - 48578
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | | ||||||| | || || ||||||||||||||| ||||    
T  48504 atgattatgaagaagactaacccccttacattaggttatgattaattcaaatttgggcttcactttagctcctaa 48578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 64780 - 64527
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  64780 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 64681  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  64680 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 64581  T
Q  210 acatc-----aattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 258  Q
     ||||     |||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  64580 tcatcaatataattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaattt 64527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 267
Target Start/End: Original strand, 107747 - 108003
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  107747 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 107846  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  107847 taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 107945  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 267  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  107946 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 108003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 89905 - 89863
Alignment:
Q  217 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattta 259  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  89905 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 89863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21367 - 21115
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||    
T  21367 catcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaat 21268  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  21267 taacaacaacttagga-aaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataatta 21169  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaa 263  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||| || |    |||||||||||||||||    
T  21168 tcatcaattaatggatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaa 21115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14312 - 14086
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||  | |||||||    
T  14312 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaat 14213  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    || ||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  14212 tatcaacaacttagga-aaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataatta 14114  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14113 tcatcaattcatgcatacagacataaca 14086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5466 - 5254
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  5466 catcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 5368  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||| || | |||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5367 taacaacaactcagca-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 5269  T
Q  210 acatcaattcatgca 224  Q
     ||||||||||||||    
T  5268 tcatcaattcatgca 5254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 282 - 391
Target Start/End: Original strand, 109872 - 109979
Alignment:
Q  282 attcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatccc--aacttaggcttcact 379  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||  | |||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||  | |||||||||||||    
T  109872 attcatacaacaattgataatttacacaa--aagatgattatgatgaattctaaccaccttaccttagtta--gattaattccctagcttaggcttcact 109967  T
Q  380 ttagcttctaag 391  Q
    |||||| |||||    
T  109968 ttagctcctaag 109979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Original strand, 3722 - 3936
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  3722 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 3821  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatca-tttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||   |||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3822 taacaacaacttagca-aaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 3920  T
Q  209 aacatcaattcatgca 224  Q
    | ||||||||||||||    
T  3921 atcatcaattcatgca 3936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 116; Significance: 8e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9596 - 9374
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  9596 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 9497  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  9496 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 9398  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataaca 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  9397 caattcatgcatacaaacataaca 9374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16494 - 16272
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  16494 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 16395  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  16394 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 16296  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataaca 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16295 caattcatgcatacaaacataaca 16272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9297 - 9223
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  9297 atgattgtgataataactaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaa 9223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16195 - 16121
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16195 atgattgtgataataactaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaa 16121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 116 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 1450 - 1304
Alignment:
Q  116 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1450 caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatca 1351  T
Q  216 attcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  1350 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 1304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 316 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 193429 - 193296
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaa 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  193429 atgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttaattcttcaa 193330  T
Q  416 gctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  193329 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 193296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 797 - 534
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| || ||  |||||||||| || ||||||||||| |||| ||      
T  797 catcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatc 698  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||  ||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  697 taacagtaacttagca-aaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 599  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  598 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 390
Target Start/End: Original strand, 41648 - 42039
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||  |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
T  41648 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 41747  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  41748 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 41846  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-----------aatcaaaattcatacaacatttga 298  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||           || | | |||||||||||| |       
T  41847 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaatgag 41946  T
Q  299 aaatttaca-aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||| | | ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  41947 aaattgaaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaa 42039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 316 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 6475 - 6347
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6475 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaggaataatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 6376  T
Q  416 gctctccctcttctctccaacccttgttc 444  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6375 gctctccctcttctctctaactcttgttc 6347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 389
Target Start/End: Original strand, 13506 - 13897
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
T  13506 catcgtcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 13605  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| ||| | ||||||| |  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13606 caacaacaacatagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 13704  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-----------aatcaaaattcatacaacatttga 298  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||           || | | ||||||||||||  |||    
T  13705 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatga 13804  T
Q  299 aaatttaca--aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttcta 389  Q
     || || ||  |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  13805 gaaattgcaataaataaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttatcttcta 13897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 316 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12317
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaa 415  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12450 atgattatgataaaaactaacccccttaccttagataaagattcatcccaacttagacttcaatttagctcctaagctcaatccaatcttgattcttcaa 12351  T
Q  416 gctctccctcttctctccaacccttgttcatctc 449  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12350 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 12317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34724 - 34460
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | |||||     
T  34724 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat 34625  T
Q  109 ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||||   |||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  34624 tcaacaacaacttagca-aaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 34526  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34525 atcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccat 34460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 37328 - 36935
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | |||||      
T  37328 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatc 37229  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  37228 caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 37131  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat--aatca--------aaattcatacaacatttgaa 299  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||         | |||||||||    ||||    
T  37130 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaaatcatgaa 37031  T
Q  300 aatttacaa--aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
    || ||  ||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  37030 aaattgtaaggaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 36935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 316 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 13317 - 13214
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  13317 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcac-ccaatcttgattcctcaa 13219  T
Q  416 gctct 420  Q
    |||||    
T  13218 gctct 13214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 316 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 57424 - 57321
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  57424 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctactaagctcac-ccaatcttgattcctcaa 57326  T
Q  416 gctct 420  Q
    |||||    
T  57325 gctct 57321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 70348 - 70307
Alignment:
Q  217 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 258  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  70348 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaattt 70307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 2966 - 3215
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaattaa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | ||||| | ||    
T  2966 atcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaa 3065  T
Q  113 caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 212  Q
    ||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  3066 caacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 3164  T
Q  213 tcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaa 263  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||   |||||||||||||||||    
T  3165 tcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa 3215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 115 - 9
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  115 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatcaaatatcaaat 16  T
Q  110 taacaac 116  Q
    |||||||    
T  15 taacaac 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 127 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 1729 - 1451
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  1729 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 1630  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat--aatca--------aaattcatacaacatttgaaaatttacaa--aatgat 314  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||         | ||||| |||    |||||| || |||  |||||     
T  1629 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa 1530  T
Q  315 gatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  1529 catgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 1451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 116
Target Start/End: Original strand, 48514 - 48620
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  48514 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatcaaatctcaaat 48613  T
Q  110 taacaac 116  Q
    |||||||    
T  48614 taacaac 48620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 316 - 416
Target Start/End: Original strand, 55904 - 56005
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaa-tcttgattattca 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  55904 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaatttaggcttcaatttagctcctaagctctctccaattcttgattcttca 56003  T
Q  415 ag 416  Q
    ||    
T  56004 ag 56005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 316 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 108107 - 108021
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaat 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||| || |||||    
T  108107 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaattccaacttaggcttcaattcagctcctaagcttaccccaat 108021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13480 - 13325
Alignment:
Q  106 aaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca 205  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13480 aaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcataca 13382  T
Q  206 actaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 262  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| || | |  |||||||||| |||||    
T  13381 attatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaagagcacgaatctagca 13325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 316 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 910 - 823
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatc 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  910 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagttcactccaatc 823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 316 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 9914 - 9827
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatc 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  9914 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagttcactccaatc 9827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 127 - 393
Target Start/End: Original strand, 22656 - 22934
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  22656 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 22755  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat--aatca--------aaattcatacaacatttgaaaatttacaa--aatgat 314  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || |||  | |||         | ||||| |||    |||||| || |||  |||||     
T  22756 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattattcattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaa 22855  T
Q  315 gatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  22856 catgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 22934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 127 - 393
Target Start/End: Original strand, 26911 - 27189
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  26911 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 27010  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataa-------tcaa---aattcatacaacatttgaaaatttacaaa--atgat 314  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||||   | ||||| |||    |||||| || ||||  | ||     
T  27011 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaaggaa 27110  T
Q  315 gatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagct 393  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  27111 catgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 27189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 316 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 17336 - 17249
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  17336 atgattatgataaagactaacccgcttaccttagatggagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagttcactccaatc 17249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 107
Target Start/End: Original strand, 9382 - 9479
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaa 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9382 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaa 9479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 305 - 382
Target Start/End: Original strand, 18015 - 18092
Alignment:
Q  305 acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcacttta 382  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18015 acaaaataattatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcacttta 18092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 339 - 444
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaa-tcttgattattcaa 415  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||| |||| |||||||| |||||    
T  339 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaagaccaccccaattcttgattcttcaa 438  T
Q  416 gctctc 421  Q
    | ||||    
T  439 gttctc 444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 317 - 422
Target Start/End: Original strand, 25532 - 25637
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaag 416  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||   | |||||||| ||||||    
T  25532 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcacctaattcttgattcttcaag 25631  T
Q  417 ctctcc 422  Q
     |||||    
T  25632 ttctcc 25637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 34340 - 34266
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  34340 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcattttagctcctaa 34266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 10427 - 10202
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aa 276  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| || || ||   ||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  10427 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaa 10328  T
Q  277 tcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttc 376  Q
     | |  ||||||||||||  ||||||  | ||| |||  ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  10327 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgaagaagacaaacccccttaccttagatgatgattaaccccaacttaggcttc 10228  T
Q  377 actttagcttctaagctcactccaat 402  Q
    |||||||||  |||||| || |||||    
T  10227 actttagctcataagcttaccccaat 10202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5508 - 5434
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  5508 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaatcttaggcttcactttagctcctaa 5434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 316 - 394
Target Start/End: Original strand, 45338 - 45416
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctc 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  45338 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatggttaatccaaacttaggcttcaattaagctcctaagctc 45416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 394
Target Start/End: Original strand, 54724 - 54802
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctc 394  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||    
T  54724 atgattatgatgaagactaaccaccttaccttagataatggttaatccaaacttaagcttcaattaagctcctaagctc 54802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 45198 - 45244
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  45198 aacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgca 45244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 49784 - 49710
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  49784 atgattatgaagaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaa 49710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 274
Target Start/End: Original strand, 3360 - 3453
Alignment:
Q  181 atgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3360 atgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccat 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Original strand, 3505 - 3578
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3505 atgattatgaggaagaataacccc-ttaccttagatgatgattaattcaaacttaggcttcactttagctcctaa 3578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 66
Target Start/End: Original strand, 3210 - 3264
Alignment:
Q  12 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaa 66  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  3210 tcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaatcacaacatcaa 3264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 316 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 56045 - 55942
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaagctcactccaatcttgattattcaa 415  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| || ||||| |||| ||||| |||||| |||||    
T  56045 atgattatgatgaagactaaccccctgaccgtagataatgattaatccaaacttaggctttaatttatctcctaagttcaccccaat-ttgattcttcaa 55947  T
Q  416 gctct 420  Q
    |||||    
T  55946 gctct 55942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 56195 - 56102
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatc 271  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||| ||||||| || || |||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||    
T  56195 aacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatc 56102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4378 - 4304
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||    
T  4378 atgattatgataaagtctaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttttgcttcactttagctcctaa 4304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Original strand, 5549 - 5623
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  5549 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttgggcttcattttagctcctaa 5623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Original strand, 95298 - 95372
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  95298 atgattatgaagaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacctaggcttcactttagctcctaa 95372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 12075 - 12002
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | | |||||   ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12075 tgattatgataataactaacccccttaccttagatgatgtttaattttaacttaggcttcactttagctcctaa 12002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 258
Target Start/End: Original strand, 8174 - 8257
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 258  Q
    |||||||| || |||||||||||  || ||| || |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  8174 tgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 6142 - 6068
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6142 atgattatgtttaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 6068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9444 - 9370
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9444 atgattatgaagaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 9370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2399 - 2317
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 257  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2399 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 2317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 390
Target Start/End: Original strand, 54182 - 54255
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  54182 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactatagctcctaa 54255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 348
Target Start/End: Original strand, 80187 - 80219
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttacctta 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80187 atgattatgataaagactaacccccttacctta 80219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 7127 - 7053
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| | | ||||||| | || ||| |||||||||||||| ||||    
T  7127 atgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcaaatttaagcttcactttagctcctaa 7053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17241 - 17207
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttaga 350  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17241 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaga 17207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 1557 - 1480
Alignment:
Q  283 ttcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 360  Q
    ||||||||||||  ||||||  | ||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1557 ttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaa 1480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1546
Alignment:
Q  217 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 258  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  1587 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 1546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8732 - 8691
Alignment:
Q  217 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 258  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  8732 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 390
Target Start/End: Original strand, 7517 - 7590
Alignment:
Q  317 tgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||| | | ||||||  |||| | |||||||||||||| ||||    
T  7517 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaactaaagcttcactttagctcctaa 7590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 1463 - 1419
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 360  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1463 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaa 1419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 390
Target Start/End: Original strand, 3743 - 3799
Alignment:
Q  334 aacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagcttctaa 390  Q
    |||||| ||||||||||| | | ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3743 aaccccattaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaa 3799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 257
Target Start/End: Original strand, 8011 - 8051
Alignment:
Q  217 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 257  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8011 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 8051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Original strand, 2700 - 2744
Alignment:
Q  316 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 360  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2700 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaa 2744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 257
Target Start/End: Original strand, 3525 - 3565
Alignment:
Q  217 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 257  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3525 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 3565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University