View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1575_high_2 (Length: 388)

Name: NF1575_high_2
Description: NF1575
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1575_high_2
NF1575_high_2
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (16-262)||(39934897-39935142)
chr3 (83-244)||(22304560-22304719)
chr3 (83-235)||(32589704-32589853)
chr3 (83-224)||(43346799-43346940)
chr3 (84-223)||(12114571-12114710)
chr3 (83-224)||(37990647-37990788)
chr3 (83-224)||(37990985-37991126)
chr3 (83-224)||(42342396-42342537)
chr3 (84-243)||(39389062-39389219)
chr3 (84-224)||(54017825-54017965)
chr3 (83-223)||(29644910-29645050)
chr3 (83-224)||(15772863-15773004)
chr3 (83-224)||(33803260-33803401)
chr3 (83-224)||(35946531-35946672)
chr3 (84-224)||(54018207-54018347)
chr3 (81-224)||(29644587-29644730)
chr3 (98-243)||(50612470-50612618)
chr3 (84-210)||(41359774-41359900)
chr3 (81-224)||(25755403-25755546)
chr3 (86-224)||(52634685-52634822)
chr3 (83-224)||(25739433-25739574)
chr3 (82-224)||(22303962-22304097)
chr3 (83-203)||(45395661-45395781)
chr3 (81-224)||(53577373-53577516)
chr3 (83-224)||(15773201-15773344)
chr3 (85-224)||(32462910-32463050)
chr3 (83-210)||(42342098-42342225)
chr3 (119-244)||(4823646-4823769)
chr3 (83-224)||(21832353-21832492)
chr3 (86-224)||(39914261-39914399)
chr3 (84-224)||(33175668-33175813)
chr3 (101-224)||(3135099-3135222)
chr3 (85-243)||(51886553-51886703)
chr3 (82-224)||(49336693-49336836)
chr3 (86-175)||(22303670-22303759)
chr3 (83-223)||(42584832-42584970)
chr3 (83-224)||(31190026-31190159)
chr3 (83-243)||(37726496-37726646)
chr3 (83-193)||(1634323-1634432)
chr3 (83-204)||(44160555-44160673)
chr3 (83-193)||(45901754-45901864)
chr3 (83-224)||(3135462-3135610)
chr3 (115-224)||(8327913-8328022)
chr3 (85-204)||(11661980-11662099)
chr3 (85-224)||(53117985-53118123)
chr3 (101-191)||(47964544-47964634)
chr3 (131-204)||(33362349-33362422)
chr3 (86-193)||(32462569-32462676)
chr3 (83-224)||(9240158-9240299)
chr3 (86-191)||(12749211-12749316)
chr3 (126-244)||(3384317-3384433)
chr3 (141-224)||(7767380-7767463)
chr3 (178-244)||(22304237-22304301)
chr3 (84-163)||(54017557-54017636)
chr3 (121-191)||(46546371-46546441)
chr3 (125-183)||(52634990-52635048)
chr3 (105-191)||(39336000-39336086)
chr3 (83-148)||(41359499-41359564)
chr3 (166-224)||(11661544-11661602)
chr3 (101-191)||(25317200-25317290)
chr3 (333-381)||(39935213-39935258)
chr3 (126-191)||(39336280-39336345)
chr3 (83-224)||(47964923-47965064)
chr3 (177-224)||(43346659-43346706)
chr3 (115-166)||(53596027-53596078)
chr3 (115-166)||(53596342-53596393)
chr3 (115-166)||(53596542-53596593)
chr3 (127-165)||(17735043-17735081)
chr3 (127-165)||(19036312-19036350)
chr3 (115-148)||(11661605-11661638)
chr3 (125-178)||(17731954-17732007)
chr3 (125-178)||(19033185-19033238)
chr3 (83-153)||(43978873-43978947)
chr3 (81-148)||(7766789-7766854)
chr3 (83-123)||(22304303-22304343)
[»] chr8 (73 HSPs)
chr8 (81-244)||(3669678-3669839)
chr8 (81-243)||(1014251-1014411)
chr8 (85-224)||(45122067-45122206)
chr8 (83-243)||(3670052-3670210)
chr8 (79-224)||(34834885-34835030)
chr8 (86-224)||(34835218-34835356)
chr8 (83-209)||(45122648-45122774)
chr8 (83-224)||(3038298-3038439)
chr8 (83-244)||(30441072-30441235)
chr8 (96-243)||(20870594-20870741)
chr8 (83-224)||(25561823-25561965)
chr8 (83-204)||(9483195-9483316)
chr8 (95-224)||(33113387-33113516)
chr8 (83-224)||(40518591-40518732)
chr8 (81-244)||(1013877-1014038)
chr8 (86-204)||(34835504-34835622)
chr8 (86-204)||(34835770-34835888)
chr8 (83-224)||(37544498-37544639)
chr8 (83-210)||(6876870-6876997)
chr8 (81-224)||(30359280-30359423)
chr8 (83-221)||(5420663-5420801)
chr8 (83-224)||(30359618-30359759)
chr8 (96-224)||(70295-70423)
chr8 (83-201)||(40518103-40518221)
chr8 (95-224)||(147460-147589)
chr8 (83-224)||(1513923-1514064)
chr8 (83-224)||(8918772-8918913)
chr8 (83-224)||(9309364-9309504)
chr8 (83-224)||(9482612-9482753)
chr8 (83-204)||(40579514-40579635)
chr8 (83-224)||(45123015-45123156)
chr8 (83-210)||(45121664-45121791)
chr8 (85-203)||(18372004-18372122)
chr8 (83-224)||(9608754-9608895)
chr8 (83-224)||(45121918-45122059)
chr8 (83-172)||(5915928-5916017)
chr8 (79-244)||(6731895-6732049)
chr8 (96-210)||(9609108-9609222)
chr8 (83-224)||(9308986-9309131)
chr8 (83-224)||(18371669-18371805)
chr8 (120-224)||(43274824-43274928)
chr8 (83-196)||(9507819-9507932)
chr8 (84-224)||(4154290-4154429)
chr8 (81-224)||(6651512-6651646)
chr8 (84-223)||(12283883-12284021)
chr8 (161-224)||(18372785-18372848)
chr8 (85-224)||(32640542-32640676)
chr8 (98-224)||(41972167-41972296)
chr8 (156-243)||(41416252-41416335)
chr8 (83-204)||(32305506-32305627)
chr8 (83-154)||(41129067-41129138)
chr8 (115-224)||(8794120-8794229)
chr8 (85-165)||(147888-147968)
chr8 (101-224)||(9620704-9620825)
chr8 (143-210)||(3037776-3037843)
chr8 (161-224)||(18372342-18372405)
chr8 (125-224)||(18380067-18380166)
chr8 (129-221)||(18372988-18373077)
chr8 (116-248)||(4154707-4154836)
chr8 (125-204)||(18372656-18372731)
chr8 (160-223)||(25561729-25561792)
chr8 (83-154)||(40579277-40579348)
chr8 (83-148)||(8919152-8919217)
chr8 (95-147)||(16524451-16524503)
chr8 (141-197)||(18373236-18373292)
chr8 (121-162)||(12156704-12156745)
chr8 (101-154)||(20995442-20995495)
chr8 (84-196)||(43398077-43398192)
chr8 (117-224)||(5274784-5274891)
chr8 (136-189)||(33832022-33832075)
chr8 (128-220)||(20130462-20130553)
chr8 (83-139)||(43274643-43274699)
chr8 (79-191)||(40991795-40991907)
[»] chr6 (50 HSPs)
chr6 (85-243)||(3409251-3409407)
chr6 (83-244)||(29518911-29519070)
chr6 (83-243)||(29518495-29518653)
chr6 (83-243)||(32741171-32741329)
chr6 (83-244)||(2378117-2378276)
chr6 (83-243)||(35210196-35210354)
chr6 (83-244)||(3409651-3409810)
chr6 (83-245)||(3415448-3415610)
chr6 (82-210)||(10074370-10074498)
chr6 (85-243)||(26544041-26544197)
chr6 (83-224)||(2377763-2377904)
chr6 (83-243)||(3058218-3058376)
chr6 (83-224)||(16454916-16455057)
chr6 (83-243)||(14748350-14748504)
chr6 (83-224)||(2579880-2580021)
chr6 (84-243)||(1127352-1127509)
chr6 (83-242)||(1846741-1846898)
chr6 (84-224)||(16107687-16107827)
chr6 (83-224)||(2843563-2843705)
chr6 (83-224)||(10911574-10911716)
chr6 (83-204)||(2578451-2578572)
chr6 (83-224)||(6999804-6999945)
chr6 (83-224)||(16454584-16454725)
chr6 (83-196)||(10073624-10073737)
chr6 (81-224)||(2579498-2579641)
chr6 (90-224)||(1950200-1950334)
chr6 (86-223)||(5832038-5832174)
chr6 (83-224)||(10073999-10074140)
chr6 (108-224)||(9062383-9062498)
chr6 (124-224)||(32460629-32460729)
chr6 (86-224)||(593718-593858)
chr6 (83-224)||(5958615-5958752)
chr6 (83-209)||(2578843-2578968)
chr6 (142-224)||(16108072-16108154)
chr6 (85-223)||(2579119-2579253)
chr6 (87-224)||(12085046-12085182)
chr6 (113-224)||(8481936-8482046)
chr6 (85-148)||(12071701-12071764)
chr6 (84-191)||(12092491-12092598)
chr6 (117-210)||(2975575-2975668)
chr6 (101-191)||(6071174-6071264)
chr6 (101-187)||(30618643-30618727)
chr6 (160-210)||(35210501-35210551)
chr6 (113-165)||(11637759-11637811)
chr6 (156-196)||(14789285-14789325)
chr6 (97-141)||(10902452-10902496)
chr6 (83-170)||(31714732-31714818)
chr6 (98-224)||(17135092-17135218)
chr6 (101-191)||(34661635-34661725)
chr6 (125-165)||(22605305-22605345)
[»] chr1 (70 HSPs)
chr1 (107-241)||(32594748-32594880)
chr1 (83-244)||(44290832-44290992)
chr1 (83-248)||(41759470-41759633)
chr1 (83-244)||(44290466-44290625)
chr1 (83-244)||(48588496-48588655)
chr1 (83-223)||(3537607-3537747)
chr1 (84-224)||(41157384-41157524)
chr1 (84-204)||(41157020-41157140)
chr1 (83-243)||(3550712-3550867)
chr1 (81-224)||(34364516-34364659)
chr1 (82-224)||(40082416-40082557)
chr1 (83-224)||(41142381-41142523)
chr1 (83-224)||(26661530-26661671)
chr1 (83-223)||(3875339-3875479)
chr1 (83-210)||(31767169-31767296)
chr1 (81-224)||(34364934-34365077)
chr1 (85-224)||(9955916-9956057)
chr1 (83-224)||(14318876-14319017)
chr1 (84-224)||(37556120-37556260)
chr1 (96-224)||(29798208-29798336)
chr1 (83-224)||(17294586-17294728)
chr1 (98-208)||(26661921-26662031)
chr1 (85-210)||(39066210-39066335)
chr1 (83-224)||(50052032-50052172)
chr1 (83-244)||(45493982-45494146)
chr1 (83-224)||(11977289-11977430)
chr1 (86-224)||(5319976-5320114)
chr1 (98-224)||(22077518-22077644)
chr1 (83-224)||(24600322-24600463)
chr1 (83-224)||(34649447-34649588)
chr1 (83-224)||(37850608-37850749)
chr1 (80-223)||(5528759-5528902)
chr1 (83-204)||(32168706-32168821)
chr1 (90-224)||(38804370-38804504)
chr1 (87-224)||(45084391-45084522)
chr1 (156-244)||(3537228-3537314)
chr1 (83-196)||(22077118-22077231)
chr1 (114-199)||(44043811-44043896)
chr1 (84-224)||(37555739-37555878)
chr1 (83-224)||(66480-66621)
chr1 (139-224)||(41184489-41184574)
chr1 (74-224)||(22793287-22793438)
chr1 (86-224)||(24131999-24132134)
chr1 (85-221)||(30630648-30630784)
chr1 (86-210)||(66100-66223)
chr1 (83-221)||(5575116-5575252)
chr1 (83-224)||(22077837-22077977)
chr1 (85-186)||(45839678-45839779)
chr1 (110-160)||(9956208-9956258)
chr1 (108-210)||(10351183-10351285)
chr1 (101-196)||(30576609-30576704)
chr1 (84-224)||(19283464-19283604)
chr1 (86-218)||(44091909-44092041)
chr1 (119-224)||(44685465-44685570)
chr1 (119-196)||(4956228-4956305)
chr1 (83-148)||(11977029-11977094)
chr1 (118-178)||(35154046-35154106)
chr1 (83-163)||(50051697-50051776)
chr1 (84-134)||(4266807-4266855)
chr1 (156-223)||(21378122-21378189)
chr1 (101-179)||(1188614-1188692)
chr1 (84-162)||(47380176-47380254)
chr1 (174-224)||(50469180-50469230)
chr1 (168-224)||(4266875-4266931)
chr1 (165-224)||(30630912-30630972)
chr1 (98-189)||(24448321-24448412)
chr1 (110-179)||(1187399-1187468)
chr1 (95-188)||(5996892-5996984)
chr1 (115-148)||(31973375-31973408)
chr1 (139-184)||(41184152-41184197)
[»] chr2 (69 HSPs)
chr2 (83-244)||(36178613-36178772)
chr2 (83-224)||(15511503-15511644)
chr2 (83-244)||(37106179-37106338)
chr2 (83-243)||(14745675-14745833)
chr2 (83-244)||(5542633-5542792)
chr2 (83-224)||(962607-962748)
chr2 (83-224)||(6421394-6421535)
chr2 (83-243)||(41283483-41283641)
chr2 (83-224)||(42514658-42514799)
chr2 (83-244)||(5543006-5543165)
chr2 (83-248)||(37105911-37106074)
chr2 (83-224)||(15880272-15880413)
chr2 (83-210)||(6422133-6422260)
chr2 (83-224)||(40679637-40679778)
chr2 (86-210)||(36178182-36178306)
chr2 (86-233)||(33731648-33731795)
chr2 (81-224)||(40733526-40733669)
chr2 (83-224)||(6712985-6713127)
chr2 (83-196)||(36005888-36006001)
chr2 (95-221)||(28254259-28254383)
chr2 (126-243)||(36178320-36178435)
chr2 (83-244)||(7598600-7598751)
chr2 (83-224)||(37632605-37632746)
chr2 (85-243)||(1769884-1770040)
chr2 (83-244)||(14745301-14745461)
chr2 (81-222)||(40163378-40163520)
chr2 (83-224)||(35580732-35580872)
chr2 (86-224)||(38796629-38796769)
chr2 (81-224)||(28531320-28531463)
chr2 (83-196)||(23346274-23346386)
chr2 (83-179)||(3673122-3673218)
chr2 (85-221)||(7598240-7598376)
chr2 (110-224)||(33561486-33561600)
chr2 (83-171)||(6421793-6421881)
chr2 (89-204)||(5367484-5367599)
chr2 (83-224)||(16590897-16591033)
chr2 (83-161)||(3672773-3672851)
chr2 (122-224)||(31468797-31468895)
chr2 (96-224)||(12529049-12529177)
chr2 (81-224)||(29676912-29677060)
chr2 (86-210)||(29873548-29873672)
chr2 (83-224)||(40733892-40734032)
chr2 (126-224)||(16542458-16542556)
chr2 (101-222)||(30313189-30313309)
chr2 (83-171)||(6421688-6421776)
chr2 (145-224)||(31899496-31899575)
chr2 (125-209)||(31259666-31259750)
chr2 (88-180)||(36784273-36784365)
chr2 (128-210)||(28254165-28254247)
chr2 (83-224)||(29676544-29676679)
chr2 (125-222)||(29874073-29874170)
chr2 (102-191)||(31385779-31385868)
chr2 (156-224)||(38796299-38796367)
chr2 (103-235)||(41678396-41678527)
chr2 (116-191)||(30323506-30323581)
chr2 (101-224)||(33953797-33953920)
chr2 (125-224)||(37895111-37895210)
chr2 (85-191)||(3594188-3594294)
chr2 (115-166)||(28226404-28226455)
chr2 (83-224)||(9231258-9231399)
chr2 (176-224)||(36785664-36785712)
chr2 (126-224)||(12910237-12910335)
chr2 (115-191)||(30312831-30312907)
chr2 (129-169)||(35580494-35580534)
chr2 (120-179)||(25390313-25390372)
chr2 (134-191)||(2336666-2336723)
chr2 (117-154)||(13792536-13792573)
chr2 (103-160)||(15689427-15689484)
chr2 (115-196)||(37894732-37894813)
[»] chr7 (69 HSPs)
chr7 (83-224)||(1085624-1085765)
chr7 (83-223)||(6054570-6054710)
chr7 (84-224)||(7517589-7517729)
chr7 (83-244)||(14681501-14681658)
chr7 (85-224)||(19122741-19122879)
chr7 (81-224)||(30244279-30244422)
chr7 (83-244)||(37533019-37533177)
chr7 (85-223)||(45434646-45434784)
chr7 (83-241)||(29157559-29157715)
chr7 (83-224)||(37533372-37533513)
chr7 (84-224)||(40094783-40094923)
chr7 (86-224)||(11845200-11845338)
chr7 (83-224)||(23385-23526)
chr7 (81-210)||(22567045-22567174)
chr7 (83-224)||(34218042-34218183)
chr7 (81-224)||(30245086-30245225)
chr7 (86-224)||(45754725-45754862)
chr7 (104-224)||(7554034-7554154)
chr7 (81-224)||(36939739-36939882)
chr7 (98-223)||(24838724-24838850)
chr7 (84-210)||(45433264-45433390)
chr7 (86-224)||(47129104-47129242)
chr7 (83-224)||(9901654-9901793)
chr7 (125-224)||(22566712-22566811)
chr7 (86-224)||(41854644-41854781)
chr7 (83-224)||(24177444-24177585)
chr7 (95-223)||(118319-118449)
chr7 (114-224)||(16569205-16569315)
chr7 (114-224)||(16596347-16596457)
chr7 (83-229)||(30032571-30032717)
chr7 (81-191)||(30253534-30253640)
chr7 (97-224)||(36622969-36623096)
chr7 (84-221)||(36534795-36534930)
chr7 (107-204)||(1085280-1085377)
chr7 (114-223)||(40230330-40230439)
chr7 (83-210)||(37167810-37167931)
chr7 (85-224)||(8128451-8128590)
chr7 (114-224)||(43241504-43241614)
chr7 (83-187)||(28300261-28300366)
chr7 (99-224)||(20599323-20599450)
chr7 (160-224)||(30245503-30245567)
chr7 (83-224)||(41910594-41910743)
chr7 (108-235)||(37345916-37346043)
chr7 (83-148)||(47129454-47129519)
chr7 (145-224)||(28301613-28301692)
chr7 (83-148)||(28300576-28300642)
chr7 (160-222)||(30255350-30255412)
chr7 (116-164)||(23569043-23569091)
chr7 (165-224)||(36109007-36109066)
chr7 (86-165)||(40094424-40094503)
chr7 (83-145)||(37532759-37532821)
chr7 (101-166)||(21619071-21619136)
chr7 (163-224)||(30244710-30244771)
chr7 (101-184)||(4124114-4124197)
chr7 (115-166)||(21416181-21416232)
chr7 (97-191)||(15902342-15902436)
chr7 (83-132)||(30244453-30244502)
chr7 (83-132)||(30253671-30253720)
chr7 (88-141)||(45755019-45755072)
chr7 (128-220)||(44361517-44361608)
chr7 (102-161)||(2512575-2512634)
chr7 (108-162)||(37345652-37345706)
chr7 (88-125)||(7517765-7517802)
chr7 (88-125)||(7518031-7518068)
chr7 (83-132)||(30245256-30245305)
chr7 (183-224)||(40094502-40094543)
chr7 (121-162)||(48071457-48071498)
chr7 (101-161)||(7109754-7109814)
chr7 (126-166)||(27598052-27598092)
[»] chr4 (86 HSPs)
chr4 (84-244)||(50630762-50630920)
chr4 (83-243)||(55933130-55933288)
chr4 (83-224)||(25483345-25483486)
chr4 (83-224)||(54017601-54017742)
chr4 (84-238)||(50002423-50002575)
chr4 (83-224)||(36629246-36629387)
chr4 (83-243)||(41370349-41370507)
chr4 (83-210)||(54936219-54936345)
chr4 (83-224)||(1731653-1731794)
chr4 (83-224)||(36608667-36608808)
chr4 (83-224)||(39792866-39793007)
chr4 (85-224)||(39404407-39404546)
chr4 (85-211)||(18932757-18932883)
chr4 (83-221)||(22027967-22028105)
chr4 (83-224)||(3340816-3340957)
chr4 (83-224)||(32941129-32941270)
chr4 (85-210)||(54108936-54109060)
chr4 (81-223)||(54343012-54343147)
chr4 (83-226)||(44620360-44620503)
chr4 (83-210)||(44621025-44621152)
chr4 (104-210)||(45496828-45496934)
chr4 (95-224)||(4955335-4955464)
chr4 (83-221)||(22028375-22028515)
chr4 (83-224)||(39404027-39404168)
chr4 (84-224)||(3244458-3244598)
chr4 (85-224)||(52884704-52884844)
chr4 (85-224)||(50459730-50459869)
chr4 (85-224)||(52884896-52885038)
chr4 (86-224)||(16888825-16888963)
chr4 (114-243)||(49880152-49880279)
chr4 (83-224)||(10245929-10246069)
chr4 (83-224)||(49302913-49303056)
chr4 (87-210)||(4390111-4390234)
chr4 (83-224)||(20826226-20826367)
chr4 (95-224)||(34646667-34646796)
chr4 (84-204)||(54108565-54108686)
chr4 (83-224)||(22183270-22183411)
chr4 (83-224)||(44620669-44620809)
chr4 (83-224)||(51768066-51768207)
chr4 (125-224)||(2741080-2741179)
chr4 (85-224)||(36572028-36572167)
chr4 (83-202)||(49076837-49076955)
chr4 (102-224)||(41707490-41707611)
chr4 (83-224)||(20825845-20825986)
chr4 (81-224)||(2740709-2740850)
chr4 (95-191)||(15841386-15841482)
chr4 (83-179)||(23817687-23817783)
chr4 (85-224)||(34004593-34004730)
chr4 (126-221)||(54741227-54741322)
chr4 (102-224)||(3341137-3341259)
chr4 (114-224)||(6975493-6975603)
chr4 (83-224)||(16889542-16889683)
chr4 (125-210)||(54017750-54017835)
chr4 (81-221)||(45489336-45489475)
chr4 (83-193)||(43827480-43827589)
chr4 (83-224)||(3700374-3700507)
chr4 (83-187)||(18879852-18879956)
chr4 (83-182)||(31691203-31691304)
chr4 (83-224)||(43174515-43174657)
chr4 (83-210)||(3271807-3271939)
chr4 (96-224)||(40067052-40067181)
chr4 (139-224)||(49076510-49076595)
chr4 (101-224)||(23556890-23557013)
chr4 (81-191)||(28034271-28034381)
chr4 (87-224)||(19504714-19504842)
chr4 (101-231)||(760191-760320)
chr4 (167-224)||(44620305-44620362)
chr4 (115-204)||(48111736-48111825)
chr4 (108-191)||(34544148-34544232)
chr4 (84-147)||(45489721-45489784)
chr4 (156-222)||(10246358-10246424)
chr4 (83-153)||(41370738-41370808)
chr4 (83-141)||(43174233-43174291)
chr4 (159-224)||(11348410-11348475)
chr4 (119-179)||(2891864-2891924)
chr4 (83-196)||(39698950-39699065)
chr4 (115-166)||(11197293-11197344)
chr4 (85-144)||(11348272-11348330)
chr4 (132-191)||(41603246-41603305)
chr4 (181-243)||(50788087-50788147)
chr4 (167-224)||(44621435-44621492)
chr4 (114-166)||(922485-922537)
chr4 (167-210)||(44620968-44621011)
chr4 (115-166)||(53468038-53468089)
chr4 (99-191)||(6876123-6876212)
chr4 (108-221)||(15841016-15841128)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (81-243)||(32487386-32487545)
chr5 (83-243)||(6500443-6500600)
chr5 (83-224)||(18603128-18603269)
chr5 (83-244)||(6500814-6500972)
chr5 (83-224)||(40296323-40296464)
chr5 (83-238)||(36492225-36492378)
chr5 (83-210)||(3295353-3295479)
chr5 (83-244)||(624187-624346)
chr5 (90-224)||(41170643-41170777)
chr5 (83-243)||(27502044-27502202)
chr5 (114-245)||(9498693-9498822)
chr5 (81-224)||(11416983-11417126)
chr5 (83-235)||(3295023-3295172)
chr5 (83-224)||(25327944-25328085)
chr5 (79-224)||(26074150-26074295)
chr5 (79-224)||(26074621-26074766)
chr5 (83-223)||(41632792-41632932)
chr5 (89-224)||(13415774-13415909)
chr5 (83-224)||(15370108-15370249)
chr5 (83-221)||(26075169-26075308)
chr5 (83-224)||(35150016-35150156)
chr5 (83-223)||(34753033-34753173)
chr5 (79-229)||(38427552-38427701)
chr5 (83-224)||(42405606-42405745)
chr5 (83-224)||(299498-299639)
chr5 (98-238)||(29549278-29549416)
chr5 (84-224)||(12662661-12662801)
chr5 (86-243)||(623810-623965)
chr5 (83-221)||(33747783-33747921)
chr5 (83-224)||(1028525-1028666)
chr5 (83-196)||(15370439-15370552)
chr5 (84-224)||(24489215-24489353)
chr5 (81-196)||(26590916-26591031)
chr5 (83-210)||(35167846-35167973)
chr5 (94-243)||(5723810-5723957)
chr5 (83-224)||(36568577-36568716)
chr5 (95-224)||(6224205-6224334)
chr5 (101-224)||(26074807-26074931)
chr5 (96-209)||(41635212-41635325)
chr5 (89-222)||(300970-301095)
chr5 (158-248)||(7768837-7768925)
chr5 (107-189)||(36522269-36522351)
chr5 (101-224)||(36521922-36522045)
chr5 (83-224)||(2411016-2411157)
chr5 (156-224)||(26074327-26074395)
chr5 (115-190)||(13786041-13786116)
chr5 (125-219)||(19275543-19275636)
chr5 (83-147)||(26900025-26900089)
chr5 (157-224)||(35914858-35914925)
chr5 (138-210)||(42508635-42508707)
chr5 (97-148)||(795254-795305)
chr5 (115-166)||(13042606-13042657)
chr5 (119-166)||(13112604-13112651)
chr5 (86-146)||(38427306-38427366)
chr5 (173-224)||(6225053-6225104)
chr5 (108-175)||(32445943-32446010)
chr5 (138-224)||(31509632-31509718)
chr5 (163-224)||(39309693-39309754)
chr5 (83-148)||(42435512-42435577)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (84-224)||(5405-5546)
scaffold0734 (98-224)||(5786-5917)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (83-224)||(522-663)
scaffold0702 (83-244)||(155-309)
[»] scaffold0391 (2 HSPs)
scaffold0391 (83-224)||(1114-1255)
scaffold0391 (115-186)||(1731-1802)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (117-224)||(17496-17605)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (83-210)||(47383-47510)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (114-224)||(5366-5476)
scaffold0078 (83-221)||(4994-5132)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (155-224)||(10191-10260)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (101-191)||(39498-39588)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 262
Target Start/End: Original strand, 39934897 - 39935142
Alignment:
Q  16 aaatttaacctgtttaattcaaaacggttggtcatccgtttttatacgtctggttcaggggtcatcatccacatcgagactagaacaaccacacaagtaa 115  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  39934897 aaatttaacc-gattaatttaaaacggtcggtcatccatttctataagtctggttcaggggtcatcatccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaa 39934995  T
Q  116 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgac 215  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  39934996 gagagacatcacactcttactcaaaactttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtaggac 39935095  T
Q  216 atataactctcacacttgcaaaccaacacaaatccataaccacgtcc 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39935096 atataactctcacacttgcaaaccaacacaaatccataaccacgtcc 39935142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22304719 - 22304560
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304719 tccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 22304620  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  22304619 attcaacctttactattttatccgatgtgggacatata--gctcacacttgcaaaccaacac 22304560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 83 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32589853 - 32589704
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32589853 tccacatcgagcctagaacaaccacacaagcaagagagacatcgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 32589754  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgca 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||   ||||||||||||    
T  32589753 gttcaacctttattattttatcttatgtgggacatata---ctcacacttgca 32589704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 43346799 - 43346940
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  43346799 tccacatagaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttataaggt 43346898  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  43346899 gttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactc 43346940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 223
Target Start/End: Original strand, 12114571 - 12114710
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12114571 ccacatcgtggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 12114670  T
Q  184 ttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataact 223  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||  || ||||||||    
T  12114671 ttcaacctttacttttctatccgatgtgggatatataact 12114710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 37990647 - 37990788
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  37990647 tccacatcgaggctagaacaatcacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggt 37990746  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||   |||||||||||    
T  37990747 gttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactc 37990788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 37990985 - 37991126
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37990985 tccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgatgagtttataggtcctcttacttataaggt 37991084  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||    
T  37991085 gttcaacctttactattttatccaatgtgagacatataactc 37991126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 42342396 - 42342537
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  42342396 tccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttacttataaggt 42342495  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  42342496 gttgaacctttactcttttatcggatgtgggacatataactc 42342537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 39389219 - 39389062
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    ||||||| || |||||||||   |||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  39389219 ccacatcaaggctagaacaattgcacaggcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttagttttaaggtg 39389120  T
Q  184 ttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39389119 ttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 39389062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 224
Target Start/End: Original strand, 54017825 - 54017965
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54017825 ccacatcgaagctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgagtcctcttacttataaggtg 54017924  T
Q  184 ttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  54017925 ttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactc 54017965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 223
Target Start/End: Original strand, 29644910 - 29645050
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| || ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29644910 tccacatcgaggctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 29645009  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataact 223  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  29645010 gtttaacctttactcttttatccgatgtgggacatataact 29645050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15773004 - 15772863
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15773004 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggt 15772905  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  15772904 gttcaacatttactcttttatccgatatgggacatataactc 15772863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 33803260 - 33803401
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  33803260 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagagagggagacgccacactcttacccaataccttaatgcaatgggtttatgggtcctcttacttatatggt 33803359  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  33803360 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 33803401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35946672 - 35946531
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  35946672 tccacatcgaggctagaacaattgcacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttataaggt 35946573  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  35946572 gttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactc 35946531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 84 - 224
Target Start/End: Original strand, 54018207 - 54018347
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54018207 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcatgagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgggtcctcttacttataaggtg 54018306  T
Q  184 ttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||    
T  54018307 ttcaatctttactcttttatccgatgcaggacatataactc 54018347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Original strand, 29644587 - 29644730
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||| || ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  29644587 catccacatcgaagctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggttctcttacttataag 29644686  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||    
T  29644687 gtgttcaacctttactctttaatccgatgtgggacatataactc 29644730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 243
Target Start/End: Original strand, 50612470 - 50612618
Alignment:
Q  98 gaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtg-----tttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctt 192  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50612470 gaacaaccactcaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagataatatgttagatttatgagtcctcttacttataaggtgttcaatctt 50612569  T
Q  193 tactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  50612570 tactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 50612618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 210
Target Start/End: Original strand, 41359774 - 41359900
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  41359774 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcgagagagacgccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggta 41359873  T
Q  184 ttcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||    
T  41359874 ttcaacctttactattgtatccgatgt 41359900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25755546 - 25755403
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||| ||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  25755546 catccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacacttttacccacaactttaggacaatggatttatgagtcctcttacttataag 25755447  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  25755446 gtattcaacctttactcttttatctgatgtgagacatataactc 25755403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 52634822 - 52634685
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 185  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  52634822 acatcaaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt-ctcttacttataaggcgtt 52634724  T
Q  186 caacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  52634723 caacctttactgttttatccgatgtgggacatataactc 52634685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 25739433 - 25739574
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | |    
T  25739433 tccacatcgaggctagaactaccgcacaagctagagagacgtcacactcttacccaaaacctaaaagcaatgagtttatgggtcctcttacttatatgat 25739532  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  25739533 gttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactc 25739574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 224
Target Start/End: Original strand, 22303962 - 22304097
Alignment:
Q  82 atccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataagg 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||     
T  22303962 atccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataag- 22304060  T
Q  182 tgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
          |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22304061 ------acctttactattttatctgatgtgggacatataactc 22304097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 83 - 203
Target Start/End: Original strand, 45395661 - 45395781
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  45395661 tccacatcgaggctagagcaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgggtttatggatcctcttacttataacgt 45395760  T
Q  183 gttcaacctttactattttat 203  Q
    ||| |||||||||| ||||||    
T  45395761 gtttaacctttactcttttat 45395781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 53577516 - 53577373
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||| |||| || ||||    
T  53577516 catccacaccgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaagaccttaaggcaatatgtttatggatccacttatttttaag 53577417  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  53577416 atgttcaacctttactgttttatccgatgtgtgacatataactc 53577373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15773344 - 15773201
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaag--agagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  15773344 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagcaagagacatcacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgagtcctcttacttataag 15773245  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
     |||||||| |||||| ||||||  |||||  ||||||||||||    
T  15773244 atgttcaacttttactcttttattcgatgtgggacatataactc 15773201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Original strand, 32462910 - 32463050
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  32462910 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcttcttacttataaggtat 32463009  T
Q  185 tcaacc-tttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||| |||||| || |||| |||||  ||||||||||||    
T  32463010 tcaaccttttactcttctatccgatgtgggacatataactc 32463050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 210
Target Start/End: Original strand, 42342098 - 42342225
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  42342098 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggc 42342197  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
     || ||| |||||| ||||||| |||||    
T  42342198 attgaacatttactcttttatccgatgt 42342225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4823769 - 4823646
Alignment:
Q  119 agacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacata 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||  ||| ||    
T  4823769 agacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcctacttataaggtgtttaacttttactattttatccgatgtgagactta 4823670  T
Q  219 taactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
    |||  |||||||||||||||||||||    
T  4823669 taa--ctcacacttgcaaaccaacac 4823646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 21832353 - 21832492
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21832353 tccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagagagacgccac--tcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgagtcctcttacttataaggt 21832450  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| || ||||  ||||  ||||||||||||    
T  21832451 gttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactc 21832492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39914399 - 39914261
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 185  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||| || |  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39914399 acatcgaggctagaacaaccgcataagtgagagagacaccacactcttatccaaaatattaaggcattaggtttatgggtcctcttatttataaggtgtt 39914300  T
Q  186 caacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  39914299 caacctctactgttttatctgatgtgagacatataactc 39914261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 224
Target Start/End: Original strand, 33175668 - 33175813
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacac--tcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttat---gggtcctcttacttata 178  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||||   |||| ||||||||||||    
T  33175668 ccacaccgaggctagaacaatcacacaagtgagagagacgtcacacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttattatgggttctcttacttata 33175767  T
Q  179 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||    
T  33175768 aggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgagacatataactc 33175813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 101 - 224
Target Start/End: Original strand, 3135099 - 3135222
Alignment:
Q  101 caaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| | || || |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3135099 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttatggcagtgggtttatgggttcttttacttataaggtgttcaacatttactattt 3135198  T
Q  201 tatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||| |||||  ||||||||||||    
T  3135199 tatccgatgtgggacatataactc 3135222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 51886703 - 51886553
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| |||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  51886703 cacatcgagattagaacaatcacacttgcaaaagagacatcacactcttatccaaaacg------caatgagtttatgggtcctcttacttatatgatgt 51886610  T
Q  185 tcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    |||||||||||||||||||  |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  51886609 tcaacctttactattttattcgatgtgagacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 51886553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 224
Target Start/End: Original strand, 49336693 - 49336836
Alignment:
Q  82 atccacatcgagactagaacaaccacacaagtaa-gagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    |||||||| |||  |||||||||| |||||  || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49336693 atccacattgaggatagaacaaccgcacaaaaaaagagagacaccacactcttacccagaactttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataag 49336792  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||| |||||||||||| || |||| |||||  ||||| ||||||    
T  49336793 gtggtcaacctttacttttctatccgatgtgagacatgtaactc 49336836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 175
Target Start/End: Original strand, 22303670 - 22303759
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttactt 175  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22303670 acatcgaggctagaacaatcgcacaagtaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 22303759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 223
Target Start/End: Original strand, 42584832 - 42584970
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||| || |||||||||||| || |||||||||| ||  ||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  42584832 tccacattgaaactagaacaaccgcataagtaagagacac--cacactctttctcaaaatcttaagacaattggtttatggatcctcttacttataaggt 42584929  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataact 223  Q
    |||||| ||||||| || |||| |||||  |||||||||||    
T  42584930 gttcaatctttactcttctatccgatgtgggacatataact 42584970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31190159 - 31190026
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |        |||||||||||| |||||||||||    
T  31190159 tccaaatcgaggctagaacaacccgacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc--------tatgggtcctctaacttataaggt 31190068  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||    
T  31190067 gttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatatcactc 31190026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37726646 - 37726496
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| ||| |||||        | ||||||||||||||||||    
T  37726646 tccacatcgaggctagaacaactatacaagtaagataaacgtcacactcttatccaaaacctaaaggcaatg--------gatcctcttacttataaggt 37726555  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
     |||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37726554 attcaacatttactattttatccgatgtgagacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 37726496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 1634323 - 1634432
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | | || ||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  1634323 tccacatcgaggctagaacaaccatata-gtgagagagataccgcactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttatgggtcctcttacttataatgt 1634421  T
Q  183 gttcaaccttt 193  Q
    ||| |||||||    
T  1634422 gtttaaccttt 1634432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Original strand, 44160555 - 44160673
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||  ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  44160555 tccacatcgaggctagaacaatcgca--agtaagagagacgccacattcttacc-aaaaccttaagacaatgggtttatggatcctcttatttataaggt 44160651  T
Q  183 gttcaacctttactattttatc 204  Q
    |||||||||||| | |||||||    
T  44160652 gttcaacctttattgttttatc 44160673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 45901864 - 45901754
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  45901864 tccacatcgaagttagaacaaccctataagtaagagagacaccacactcttaccaaaaactttaaggccatgagtttatgcgtcctcttacttataaggt 45901765  T
Q  183 gttcaaccttt 193  Q
    |||||||||||    
T  45901764 gttcaaccttt 45901754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 3135462 - 3135610
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttat--gggtcctcttac-----tt 175  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||     |     
T  3135462 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggggtcctcttactaatata 3135561  T
Q  176 ataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  3135562 ataaggtgttcaacttttactcttttatctgaggtgggacatataactc 3135610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8328022 - 8327913
Alignment:
Q  115 agagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatga 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||| |||||  ||    
T  8328022 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattacgtttatgggttctcttacttataagatattcatcctttactcttttatccgatgtggga 8327923  T
Q  215 catataactc 224  Q
    ||||||||||    
T  8327922 catataactc 8327913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11662099 - 11661980
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaa-ccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| | ||||| |||| |||||||    
T  11662099 cacatcgaggctagaacaaccacacaa-tgagagagacacctcactcttacccaaaaaccttaaggcaattggtttatgaggcctctcacttttaaggtg 11662001  T
Q  184 ttcaacctttactattttatc 204  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  11662000 ttcaacctttactcttttatc 11661980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Original strand, 53117985 - 53118123
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    ||||||||  |||||||||||||||  || |||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||  |||||| |||||||||||||    
T  53117985 cacatcgatgctagaacaaccacacttgtgagagagacactacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggttt-tgaatcctctcacttataaggtgt 53118083  T
Q  185 tcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |   |||||||||||    
T  53118084 tcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactc 53118123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Original strand, 47964544 - 47964634
Alignment:
Q  101 caaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||  | |||||||||    
T  47964544 caaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctcacttatatagcgttcaacct 47964634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 204
Target Start/End: Original strand, 33362349 - 33362422
Alignment:
Q  131 cttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatc 204  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  33362349 cttacccaaaatcttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttattattttatc 33362422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 193
Target Start/End: Original strand, 32462569 - 32462676
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 185  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||  |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  ||||  |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  32462569 acatcgaggctaaaacaatcccacaaacaagagagaccccacactcttatccaaaaccttaaagcaataggtttatggatcatcttacttataaggtgtt 32462668  T
Q  186 caaccttt 193  Q
    ||||||||    
T  32462669 caaccttt 32462676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9240299 - 9240158
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||| | | ||||||||| |||| ||||| || ||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9240299 tccacatcgaggctagaataaccgcactattgagagagacaccacattcttatccgaaatcttaaggtaatggatttatgggtcctcttacttataaggt 9240200  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||| | ||||||  | |||| |||||   |||||||||||    
T  9240199 gttcagcttttacttctctatccgatgtggaacatataactc 9240158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12749316 - 12749211
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||| | ||||||||||  ||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  12749316 acatccagactagaacaaccacataagtaagagtgagtccacactcttatcaaaaaccttaatgcaattggtttatgggtcctcacacttataaagtgtt 12749217  T
Q  186 caacct 191  Q
    ||||||    
T  12749216 caacct 12749211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 244
Target Start/End: Original strand, 3384317 - 3384433
Alignment:
Q  126 acactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactct 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||  ||||  |||||||||  ||    
T  3384317 acactcttacccaaaactttaaggcattaagtttatgggtcctcttccttataaagtgtttaacctatactgttttatcatatgtgggacatataa--ct 3384414  T
Q  226 cacacttgcaaaccaacac 244  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  3384415 cacgcttgcacaccaacac 3384433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 224
Target Start/End: Original strand, 7767380 - 7767463
Alignment:
Q  141 accttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||    
T  7767380 accttaagacaatgggtttatgagtcctcttagttataaagtgtccaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactc 7767463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22304301 - 22304237
Alignment:
Q  178 aaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22304301 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaacac 22304237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 163
Target Start/End: Original strand, 54017557 - 54017636
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgg 163  Q
    |||||||||| | | ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  54017557 ccacatcgaggccaaaacaatcacataagtaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 54017636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 191
Target Start/End: Original strand, 46546371 - 46546441
Alignment:
Q  121 acatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 191  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||||||    
T  46546371 acatcacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggattctctaacttataaagtgttcaacct 46546441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 52635048 - 52634990
Alignment:
Q  125 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52635048 cacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttatttataaggtg 52634990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 191
Target Start/End: Original strand, 39336000 - 39336086
Alignment:
Q  105 cacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 191  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| | | | |||||| |||||||||||    
T  39336000 cacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgattttatgagtcttatcatttataaagtgttcaacct 39336086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 148
Target Start/End: Original strand, 41359499 - 41359564
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaag 148  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41359499 tccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacgccacactcttacccaaaaccttaag 41359564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11661602 - 11661544
Alignment:
Q  166 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  11661602 cctcttacttataagatgtttaaccgttactattttatccgatgtgggacatataactc 11661544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25317290 - 25317200
Alignment:
Q  101 caaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 191  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||    
T  25317290 caaccacacaagtgagagacacactacacttttacccaaaaccttaaggcaacaagtttatgggtcctctcagttacaaagtgctcaacct 25317200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 381
Target Start/End: Original strand, 39935213 - 39935258
Alignment:
Q  333 ctgaatcatatcttcccctctctcattaataaagttgcgagaataatct 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  39935213 ctgaatcatatcttcccctctctcat---taaagttgcgagaataatct 39935258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 191
Target Start/End: Original strand, 39336280 - 39336345
Alignment:
Q  126 acactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 191  Q
    ||||| ||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  39336280 acactattatccaaaaccttaaagcaatgagtttatggatcctctcacttataaagtgttcaacct 39336345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 47964923 - 47965064
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||| || | ||||||| || | |||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||| | ||||| |||||||   |    
T  47964923 tccacatctaggccagaacaatcatataagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggcttatgagccctctcacttatataat 47965022  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||| |||||  ||| || |||| ||||||  |||||||||||    
T  47965023 gtttaacctccacttttctatccgatgtaaaacatataactc 47965064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43346706 - 43346659
Alignment:
Q  177 taaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||    
T  43346706 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatacaactc 43346659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 53596078 - 53596027
Alignment:
Q  115 agagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtc 166  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||    
T  53596078 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggtc 53596027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 53596393 - 53596342
Alignment:
Q  115 agagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtc 166  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||    
T  53596393 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggtc 53596342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 53596593 - 53596542
Alignment:
Q  115 agagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtc 166  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  53596593 agagagacaccacactcttacctaaaatcttaagtcaatgggtttatgggtc 53596542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 165
Target Start/End: Original strand, 17735043 - 17735081
Alignment:
Q  127 cactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggt 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17735043 cactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatgggt 17735081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 165
Target Start/End: Original strand, 19036312 - 19036350
Alignment:
Q  127 cactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggt 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19036312 cactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatgggt 19036350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11661638 - 11661605
Alignment:
Q  115 agagagacatcacactcttacccaaaaccttaag 148  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11661638 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 11661605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 178
Target Start/End: Original strand, 17731954 - 17732007
Alignment:
Q  125 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttata 178  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  17731954 cacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttccctttcttata 17732007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 178
Target Start/End: Original strand, 19033185 - 19033238
Alignment:
Q  125 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttata 178  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  19033185 cacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttccctttcttata 19033238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 153
Target Start/End: Original strand, 43978873 - 43978947
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacact----cttacccaaaaccttaagacaat 153  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||    |||||||||||||||||| ||||    
T  43978873 tccacatcgaggttagaacaaacacacaagtgagagagacgccacactctagcttacccaaaaccttaaggcaat 43978947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 7766789 - 7766854
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaag 148  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||  |||| ||||||| |||||||||||    
T  7766789 catctacatcgaggctagaacaaccatacaagt--gagagacgccacaatcttacctaaaaccttaag 7766854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22304343 - 22304303
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagaca 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22304343 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagaca 22304303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 73)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 81 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3669839 - 3669678
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  3669839 catccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataag 3669740  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3669739 gtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaacac 3669678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 81 - 243
Target Start/End: Original strand, 1014251 - 1014411
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||  || | ||||| |||||||||||||||||||    
T  1014251 catccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaggagagacaccacactcttacccaaaactttaaggtaacgagtttacgggtcctcttacttataag 1014350  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1014351 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 1014411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Original strand, 45122067 - 45122206
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45122067 cacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgt 45122166  T
Q  185 tcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  45122167 tcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactc 45122206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3670210 - 3670052
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  3670210 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttatgggtcctcatacttataaggt 3670111  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3670110 gttaaacctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 3670052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34835030 - 34834885
Alignment:
Q  79 atcatccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttata 178  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  34835030 atcatccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcatcttacttata 34834931  T
Q  179 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||    
T  34834930 aggtgtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactc 34834885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34835356 - 34835218
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 185  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34835356 acatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 34835257  T
Q  186 caacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  34835256 caacctttactattttatcggatgtgggacatataactc 34835218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 45122774 - 45122648
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45122774 tccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggt 45122675  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  45122674 gttcaacctttactattttatccgatg 45122648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 3038298 - 3038439
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  3038298 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttacttataaagt 3038397  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  3038398 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 3038439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30441235 - 30441072
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttactta----ta 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    ||    
T  30441235 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataatta 30441136  T
Q  179 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30441135 aggtgttcaacctttactattttagccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaacac 30441072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 243
Target Start/End: Original strand, 20870594 - 20870741
Alignment:
Q  96 tagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 195  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20870594 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttac 20870693  T
Q  196 tattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    |||||||||||||||   |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  20870694 tattttatctgatgtggaacatatataactcacacttgcaaaccaaca 20870741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 25561823 - 25561965
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttaccc-aaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataagg 181  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25561823 tccacatcgaggctagagcaaccacacaagcaagagagatgtcacactcttaccccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataagg 25561922  T
Q  182 tgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  25561923 tgttcaacgtttactcttttatccgatgtgggacatataactc 25561965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Original strand, 9483195 - 9483316
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9483195 tccacatcgaggctagaacaaccgcacgagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 9483294  T
Q  183 gttcaacctttactattttatc 204  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  9483295 gttcaacctttactcttttatc 9483316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 224
Target Start/End: Original strand, 33113387 - 33113516
Alignment:
Q  95 ctagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 194  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  33113387 ctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagacgttcaaccttta 33113486  T
Q  195 ctattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  33113487 ctattttatccgatgtaggacatataactc 33113516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40518732 - 40518591
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  40518732 tccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcattgggtttatgggtcctcttatttataaggt 40518633  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||    
T  40518632 gttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataactc 40518591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 81 - 244
Target Start/End: Original strand, 1013877 - 1014038
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  1013877 catccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaaaagagacaacacactcttactcaaaactctaaggcaatgggtttattggtcctcttacttatagg 1013976  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1013977 gtgttcaacttttactattttatccgatgtggaacatataa--ctcacacttgcaaaccaacac 1014038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34835622 - 34835504
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 185  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34835622 acatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 34835523  T
Q  186 caacctttactattttatc 204  Q
     ||||||||||||||||||    
T  34835522 aaacctttactattttatc 34835504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34835888 - 34835770
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 185  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34835888 acatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 34835789  T
Q  186 caacctttactattttatc 204  Q
     ||||||||||||||||||    
T  34835788 aaacctttactattttatc 34835770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 37544498 - 37544639
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  37544498 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaagtaatggatttatgggtcctctttcttataatgt 37544597  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  37544598 gttcaacctttactattttatccgatgtgcgacttataactc 37544639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 210
Target Start/End: Original strand, 6876870 - 6876997
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  6876870 tccacatcgaggctagaacaaccacacaaacaagagaaacaccacactcttacccaaaaccctaagacaatgagtgtatgggtcatcttatttataaggt 6876969  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  6876970 gttcaacctttacttttttatccgatgt 6876997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30359423 - 30359280
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  30359423 catccacattgaggctaaaacaacatcacaagaaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttgcttataag 30359324  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  30359323 gtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactc 30359280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5420801 - 5420663
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  5420801 tccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagggagacgtcacactcttacaaaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataagat 5420702  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataa 221  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||    
T  5420701 gttcaacctttactattctatccgatgtgggacatataa 5420663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30359759 - 30359618
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||   |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  30359759 tccacatcgaagttagaacaaccgcataagtaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggttatgggtttatgagtcctcttacttataaggt 30359660  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  30359659 gttcaacttttactcttttatctgatgtgagacatataactc 30359618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 224
Target Start/End: Original strand, 70295 - 70423
Alignment:
Q  96 tagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 195  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  70295 tagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacctaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacatttac 70394  T
Q  196 tattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    | ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  70395 tcttttatccgatgtgggacatataactc 70423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40518221 - 40518103
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||    
T  40518221 tccacatcaaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcattgggtttatgggtccatttacttataaggt 40518122  T
Q  183 gttcaacctttactatttt 201  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  40518121 gttcaacctttactttttt 40518103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 147589 - 147460
Alignment:
Q  95 ctagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 194  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  147589 ctagaactaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaataggtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaaccttta 147490  T
Q  195 ctattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    || ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  147489 ctcttttatccgatgtgggacatataactc 147460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 1513923 - 1514064
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1513923 tccacatcgaggctagaataaccccacatgtaagagagataccacacttttacccaaaaccttaaggttatgggtttaagggtcctcttacttataaggt 1514022  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||||    
T  1514023 gttcaacctttactcttttatccgatgtgggatatataactc 1514064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 8918772 - 8918913
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||||||  || |||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  8918772 tccacatcgaggttaaaacaaccacacacgcaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcaataggtttatgggtcctcttacttataaagt 8918871  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||  ||||| ||||||    
T  8918872 gttcaacctttactctgctatctgatgtgggacatgtaactc 8918913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9309504 - 9309364
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9309504 tccacatcgaggctagaacaaccacatac-tgagagagacaccacactcttacccgacaccttaaggcaatgagtttaagggtcctcttacttataaggt 9309406  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  9309405 gttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactc 9309364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 9482612 - 9482753
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||  ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9482612 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagataccacactcttatacaaaatctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 9482711  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||   |||||||||||    
T  9482712 gttcaacctttactcttttatcccatgtggaacatataactc 9482753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Original strand, 40579514 - 40579635
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||||||  ||||||||||  ||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  40579514 tccacatcgaggatagaacaaccgtacaagcaatagagacaccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggtcctcttacttataaggt 40579613  T
Q  183 gttcaacctttactattttatc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  40579614 gttcaacctttactattttatc 40579635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45123156 - 45123015
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcaca--ctcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||  ||||    
T  45123156 tccacatcgagattagaacaaccccacaaataagagagacaccacactctcttacccaaaaccttaagaaaataggtttatgggtcatcttact--taag 45123059  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  45123058 gtgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 45123015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 210
Target Start/End: Original strand, 45121664 - 45121791
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  |  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  45121664 tccacatcgaggctagaacaaccccataagtaagagagatatcacactcttactcaaaaccttaaggctgtaggtttatggatcctcttacttataaggt 45121763  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||    
T  45121764 gatcaacctttactcttttatccgatgt 45121791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Original strand, 18372004 - 18372122
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18372004 cacattgaggctagagcaaccgcacaagcgagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatggatcctcttacttataaggtgt 18372103  T
Q  185 tcaacctttactattttat 203  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18372104 tcaacctttactattttat 18372122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9608895 - 9608754
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9608895 tccacatcgaggctagaacaacctcactagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaaggtgatgggtttatgggtcatcttacttataaggt 9608796  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| |  ||||||||||||    
T  9608795 gttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactc 9608754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 45121918 - 45122059
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||| || || ||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  45121918 tccacatcgaggcttgaataaccacacgagcaaaagagacgccacactgttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaagt 45122017  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||    
T  45122018 gttcaacctttactattttatgcgatgtgggacatataactc 45122059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 5916017 - 5915928
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctctta 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5916017 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctta 5915928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6732049 - 6731895
Alignment:
Q  79 atcatccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttata 178  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||        
T  6732049 atcatccacatcgaggttagaacaaccgcataagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctcttact---- 6731954  T
Q  179 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
         ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  6731953 -----ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaacaacac 6731895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9609222 - 9609108
Alignment:
Q  96 tagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 195  Q
    |||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9609222 tagaacaaccacactagcaagagagacgccacactcttaccgaaaacattaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagatgttcaacctttac 9609123  T
Q  196 tattttatctgatgt 210  Q
    | || ||||||||||    
T  9609122 ttttctatctgatgt 9609108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9309131 - 9308986
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacact---cttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataa 179  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||| ||||||   ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9309131 tccacatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactactcttgcccaaaacctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 9309033  T
Q  180 ggtgttcaacctttactattttatctga--tgtatgacatataactc 224  Q
      |||||||| |||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  9309032 catgttcaacttttactcttttatctgatgtgtaggacatataactc 9308986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 18371669 - 18371805
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||     |    
T  18371669 tccacatcgaagctagagcaaccgcacaaatgagagacacaccacactcttacccaaaaccttaaggca-tgggtttatgggtcttcttacttaa----t 18371763  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18371764 gttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactc 18371805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 224
Target Start/End: Original strand, 43274824 - 43274928
Alignment:
Q  120 gacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatat 219  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||   ||||||    
T  43274824 gacaccacactcttactcaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcttacttataatatattcaacctttactcttttatctgatgtgaaacatat 43274923  T
Q  220 aactc 224  Q
    |||||    
T  43274924 aactc 43274928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 9507932 - 9507819
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  9507932 tccacatcgaggcttgaacaaccatataagagatagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataaggt 9507833  T
Q  183 gttcaacctttact 196  Q
     |||||||||||||    
T  9507832 attcaacctttact 9507819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 224
Target Start/End: Original strand, 4154290 - 4154429
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    ||||||| || | ||| |||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||| |||    
T  4154290 ccacatctaggccagagcaaccaaacaattgagagagacatcacacacttacccaaaatattaaggcaatgagtttatgggt-ctctcacttataaagtg 4154388  T
Q  184 ttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||  ||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  4154389 ttcaacctccacttttctatctgatgtaggacatataactc 4154429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6651646 - 6651512
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    |||||||||||||  |||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||            
T  6651646 catccacatcgaggttagaacaatcgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctctta-------- 6651555  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  6651554 -ttttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactc 6651512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12284021 - 12283883
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  || ||||||| ||| | |||||| |||| |     
T  12284021 ccacatagaggctagaacaaccacacaagtgagagagacactacactcttatccaaaaccttaagac-ttgagtttatgtgtcattttacttttaagata 12283923  T
Q  184 ttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataact 223  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||  |||||||||||    
T  12283922 ttcaacatttacttttttatctgacgtgggacatataact 12283883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 224
Target Start/End: Original strand, 18372785 - 18372848
Alignment:
Q  161 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18372785 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactc 18372848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Original strand, 32640542 - 32640676
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||     |||    
T  32640542 cacatcgaggctagaacaatcacaaaagcaagagagacgcaacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatcggtcctcttaccta-----tgt 32640636  T
Q  185 tcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||    
T  32640637 tcaacctttactcttttatccgatgtgagacagataactc 32640676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41972296 - 41972167
Alignment:
Q  98 gaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaa---aaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 194  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||   ||| ||| | ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  41972296 gaacaaccacacaagcaagagtgacgccacactcttacccaacaaaactttatggcaatgggtttatgggtcctatcacttataaggtgttcaaccttta 41972197  T
Q  195 ctattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    || || |||| |||||  ||||||||||||    
T  41972196 cttttctatccgatgtgggacatataactc 41972167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 243
Target Start/End: Original strand, 41416252 - 41416335
Alignment:
Q  156 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    ||||||||||||||||    
T  41416252 gtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact----cacttgcaaaccaaca 41416335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32305627 - 32305506
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||| ||  |||||||||  || |||||| | ||||  |||||||||| |||||| ||||||  |||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  32305627 tccacatcaaggttagaacaactgcataagtaataaagacgccacactcttatccaaaatcttaaggtaatgggtttataggtcttcttacttataaggt 32305528  T
Q  183 gttcaacctttactattttatc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32305527 gttcaacctttactattttatc 32305506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 41129138 - 41129067
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatg 154  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41129138 tccacatcgaggtttgaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcatacccaaaaccttaagacaatg 41129067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8794229 - 8794120
Alignment:
Q  115 agagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatga 214  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| |||||  ||    
T  8794229 agagagacaccgcactctcacccaaaaccttaagatattaggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacatttattcttttatccgatgtgaga 8794130  T
Q  215 catataactc 224  Q
    ||||||||||    
T  8794129 catataactc 8794120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 147968 - 147888
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggt 165  Q
    ||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  147968 cacattgaggctagaacaactgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggt 147888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 224
Target Start/End: Original strand, 9620704 - 9620825
Alignment:
Q  101 caaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||   |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | |||| ||     
T  9620704 caaccacacaagtgagagagacatcaaactcttat--aaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgatcaacttctacttttc 9620801  T
Q  201 tatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||| |||  ||||||||||||    
T  9620802 tatctgttgtgagacatataactc 9620825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 210
Target Start/End: Original strand, 3037776 - 3037843
Alignment:
Q  143 cttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  3037776 cttaagacaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactatttcatccgatgt 3037843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 224
Target Start/End: Original strand, 18372342 - 18372405
Alignment:
Q  161 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  18372342 tgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactc 18372405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 224
Target Start/End: Original strand, 18380067 - 18380166
Alignment:
Q  125 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  | || |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  || |||||||||    
T  18380067 cacactcttactcaaaaccttaaggtagtgggtttataggcccccttacttataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggatatataactc 18380166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 129 - 221
Target Start/End: Original strand, 18372988 - 18373077
Alignment:
Q  129 ctcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataa 221  Q
    ||||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  18372988 ctcttacccaaaacct---ggcaatgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgaagtgggacatataa 18373077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 248
Target Start/End: Original strand, 4154707 - 4154836
Alignment:
Q  116 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgac 215  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||| || |||| |||||  |||    
T  4154707 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctttcacttataaagtgttcaacctccacttttctatcagatgtgggac 4154806  T
Q  216 atataactctcacacttgcaaaccaacacaaat 248  Q
    ||||||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  4154807 atataa--ctcacacttgcaca-caacacaaat 4154836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 204
Target Start/End: Original strand, 18372656 - 18372731
Alignment:
Q  125 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatc 204  Q
    ||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18372656 cacactcttacccaaaacct---ggcaatgggtttatgagtcctcttacttataag-tgttcaacctttactattttatc 18372731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Original strand, 25561729 - 25561792
Alignment:
Q  160 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataact 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  25561729 atgggtactcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataact 25561792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 154
Target Start/End: Original strand, 40579277 - 40579348
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatg 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  40579277 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcctaaggcaatg 40579348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 148
Target Start/End: Original strand, 8919152 - 8919217
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaag 148  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8919152 tccacatcgaagctagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaag 8919217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16524503 - 16524451
Alignment:
Q  95 ctagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaa 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16524503 ctagagcaaccacacaagtaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaa 16524451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 197
Target Start/End: Original strand, 18373236 - 18373292
Alignment:
Q  141 accttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 197  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18373236 accttaagacaatgggttaatggatcctcttatttataaggtgttcaacctttacta 18373292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 162
Target Start/End: Original strand, 12156704 - 12156745
Alignment:
Q  121 acatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatg 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12156704 acatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 12156745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 154
Target Start/End: Original strand, 20995442 - 20995495
Alignment:
Q  101 caaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatg 154  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  20995442 caaccacacaagtgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatg 20995495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 196
Target Start/End: Original strand, 43398077 - 43398192
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctc---ttacttataag 180  Q
    ||||||||||  |||| ||||| ||| ||||| ||| ||  |||| ||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||||||||   ||| |||||||    
T  43398077 ccacatcgaggttagagcaaccgcactagtaaaagaaacgccacattcttatccaaaactttaaggcaatgaatttatgggtcctcctcttatttataag 43398176  T
Q  181 gtgttcaacctttact 196  Q
    ||||||||||||||||    
T  43398177 gtgttcaacctttact 43398192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5274891 - 5274784
Alignment:
Q  117 agagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgaca 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||  |||||||||| ||  | |||||| ||||||||||| | || ||||||   |||||  |||    
T  5274891 agagacatcacactcttactcaaaatcttaaggcaatgattttatgggtcttcccatttataaagtgttcaacctctccttttttattcaatgtagaaca 5274792  T
Q  217 tataactc 224  Q
    ||||||||    
T  5274791 tataactc 5274784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33832075 - 33832022
Alignment:
Q  136 ccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 189  Q
    |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  33832075 ccaaaaccttaaaaaaaagtgtttataggtcctcttacttataaagtgttcaac 33832022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20130553 - 20130462
Alignment:
Q  128 actcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatata 220  Q
    ||||||||| |||||| ||||   ||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  20130553 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatata 20130462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 43274643 - 43274699
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaa 139  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  43274643 tccacatcgaggctggaacaaccccataagtaagagagacaccacactcatacccaa 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40991907 - 40991795
Alignment:
Q  79 atcatccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactctt-acccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttat 177  Q
    ||||||||||| | | ||||| |||||||||| || ||   |||| |||| |||| |||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||    
T  40991907 atcatccacattgggcctagagcaaccacacaggtgagttggacaccaca-tcttaacccaaaaccttgaggcattgggtttatgggtcctctcacttat 40991809  T
Q  178 aaggtgttcaacct 191  Q
     | |||||||||||    
T  40991808 gaagtgttcaacct 40991795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 50)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3409407 - 3409251
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409407 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 3409308  T
Q  185 tcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3409307 tcaacctttactattttatctgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 3409251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29519070 - 29518911
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29519070 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 29518971  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  29518970 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaacac 29518911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29518653 - 29518495
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29518653 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 29518554  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29518553 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 29518495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 32741329 - 32741171
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32741329 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 32741230  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  32741229 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 32741171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2378276 - 2378117
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2378276 tccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 2378177  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2378176 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaacac 2378117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 35210354 - 35210196
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  35210354 tccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaaaagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggttttatgggtcctcttacttataaggt 35210255  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  35210254 gttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 35210196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3409810 - 3409651
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  3409810 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaaataaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagat 3409711  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3409710 gttcaacttttactattttatctgatgtggtacatataa--ctcacacttgcaaaccaacac 3409651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3415610 - 3415448
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactaga--acaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    ||||||||||| |||||  |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  3415610 tccacatcgaggctagagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttatatg 3415511  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacaca 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  3415510 gtgttcaacctttactattttatgtgatgtgggacatataa--ctcacactcgcaaaccaacaca 3415448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 210
Target Start/End: Original strand, 10074370 - 10074498
Alignment:
Q  82 atccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataagg 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10074370 atccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagg 10074469  T
Q  182 tgttcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||    
T  10074470 tgttcaacctttacttttctatccgatgt 10074498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26544197 - 26544041
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    ||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26544197 cacattgaggctagaacaatcgcacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaaccttaaggcggtgggtttatgggtcctcttacttataacgtgt 26544098  T
Q  185 tcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26544097 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 26544041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2377904 - 2377763
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2377904 tccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 2377805  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||||    
T  2377804 gttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactc 2377763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3058376 - 3058218
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||||||  |||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3058376 tccacatcgaggttagaaccaccctacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcatacttataaggt 3058277  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  3058276 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctaacacttgcaaaccaaca 3058218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16455057 - 16454916
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16455057 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctattacttataaggt 16454958  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||    
T  16454957 gttcaacctttactcttttatctgatgtgggacacataactc 16454916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Original strand, 14748350 - 14748504
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14748350 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagac----cacactcttacccaaaaccttaacgcaatgagtttatgggtcctcttatttataaggt 14748445  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  14748446 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaatcaaca 14748504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 2579880 - 2580021
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  2579880 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggctgtgggtttatgggtcctcttacttataatgt 2579979  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  2579980 gttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactc 2580021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 84 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1127509 - 1127352
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1127509 ccacatcgaggttagagcaaccacataagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtg 1127410  T
Q  184 ttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||  || ||||||  |||||| |||||||||||||    
T  1127409 ttcaacctttactattttacccgatgtgggatatataa--ctcacagttgcaaaccaaca 1127352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 83 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1846898 - 1846741
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1846898 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtgctcttacttataaggt 1846799  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaac 242  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||   |||||||||||| |||||    
T  1846798 gttcaacctttactattttatccgatgtgagacatagaa--ttcacacttgcaacccaac 1846741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 84 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16107827 - 16107687
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16107827 ccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtg 16107728  T
Q  184 ttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    || |||||||||| ||||||| |||||   |||||||||||    
T  16107727 tttaacctttacttttttatccgatgtgacacatataactc 16107687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2843705 - 2843563
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttat-gggtcctcttacttataagg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2843705 tccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggggtcctcttacttataagg 2843606  T
Q  182 tgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||||    
T  2843605 tgttcaacttttattattttatccgatgtgaaacatataactc 2843563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10911716 - 10911574
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  10911716 tccacatcgaggcttgaacaacaacattagtaagagagacatcacactcttattcaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggt 10911617  T
Q  183 gttcaacctttac-tattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  10911616 gttcaacctttactttttttatctgatgtaggacatataactc 10911574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Original strand, 2578451 - 2578572
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  2578451 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaagt 2578550  T
Q  183 gttcaacctttactattttatc 204  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  2578551 gttcaacctttactcttttatc 2578572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 6999804 - 6999945
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6999804 tccacatcgagactagaacaaccacattagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcagtgagtttatggatcctcttacatataaggt 6999903  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6999904 gttcaacttttacttttttatccgatgtaggacatataactc 6999945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16454725 - 16454584
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16454725 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 16454626  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||  |||| |||||||    
T  16454625 gttcaacttttattcttttatctgatgtgggacacataactc 16454584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Original strand, 10073624 - 10073737
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  10073624 tccacatcgatgctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagccaatgagtttatggatcctcttacttataaggt 10073723  T
Q  183 gttcaacctttact 196  Q
    ||||||||||||||    
T  10073724 gttcaacctttact 10073737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Original strand, 2579498 - 2579641
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2579498 catccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccatacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggccctcttacttataag 2579597  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    || | | ||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||    
T  2579598 gtatccgacctttacttttttgtccgatgtgggacatataactc 2579641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 224
Target Start/End: Original strand, 1950200 - 1950334
Alignment:
Q  90 cgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 189  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |   ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1950200 cgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcattagatttatggctcctcttacttgtaaggtgttcaac 1950299  T
Q  190 ctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  1950300 ctttactcttttatccgatgtgggacatataactc 1950334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 223
Target Start/End: Original strand, 5832038 - 5832174
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5832038 acatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacacttttacccaaaatcttaag-gggtggctttatgggtcctcttacttataaggtgtt 5832136  T
Q  186 caacctttactattttatctgatgtatgacatataact 223  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||  |||||||||||    
T  5832137 caacctttactcttttatccaatgtgggacatataact 5832174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 10073999 - 10074140
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| | |||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10073999 tccacgtcgaggctagaacaaccaaataagcgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 10074098  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| |||||| || |||| |||||  || |||||||||    
T  10074099 gttcaacgtttacttttctatccgatgtgggatatataactc 10074140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 224
Target Start/End: Original strand, 9062383 - 9062498
Alignment:
Q  108 acaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctga 207  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  9062383 acaagtaagagagataccacacttttacccaaaac-ttaagacaatgagtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccga 9062481  T
Q  208 tgtatgacatataactc 224  Q
    |||  ||||||||||||    
T  9062482 tgtgggacatataactc 9062498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 224
Target Start/End: Original strand, 32460629 - 32460729
Alignment:
Q  124 tcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataact 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||    
T  32460629 tcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatacgatgtgggacatataact 32460728  T
Q  224 c 224  Q
    |    
T  32460729 c 32460729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 593718 - 593858
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacat--cacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| || |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  593718 acatcgagcctagaacaaccgtacaagtaagagagagataccacactattacccaaaaccttaaggcagtcggtttatgagtcctcttacttataaggtg 593817  T
Q  184 ttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||    
T  593818 ttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatacaactc 593858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 5958615 - 5958752
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||    
T  5958615 tccacatcgaggttagaacaatcacacaag----agagacatcacactctatcccaaaactttaagacaatgagtttatgagttctcttatttataaggt 5958710  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  5958711 gttcaacctttactgttttatccgatgtaacacatataactc 5958752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Original strand, 2578843 - 2578968
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  2578843 tccacatcgaggtcagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgagtttatggatcctcttatttataaggt 2578942  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatg 209  Q
     |||||| |||||| ||||||| ||||    
T  2578943 attcaacatttact-ttttatccgatg 2578968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16108154 - 16108072
Alignment:
Q  142 ccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   |||||||||||    
T  16108154 ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgtggaacatataactc 16108072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 223
Target Start/End: Original strand, 2579119 - 2579253
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    ||| |||||||| ||||    ||||||||||||    
T  2579119 cacatcgaggctagaacaaccacacgagcaagagagacaccacactcttagccaaagccttaaagttatgggtttatggttcct----cttataaggtgt 2579214  T
Q  185 tcaacctttactattttatctgatgtatgacatataact 223  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  2579215 tcaacttttactcttttatccgatgtgggacatataact 2579253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 224
Target Start/End: Original strand, 12085046 - 12085182
Alignment:
Q  87 catcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 186  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| ||||| |   |||||| ||||||    
T  12085046 catcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggccatggttttatgagtcctttctattataaagtgttc 12085145  T
Q  187 aacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    || ||  ||| || ||||||||| | ||||||||||||    
T  12085146 aaactccact-ttctatctgatgcaggacatataactc 12085182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8482046 - 8481936
Alignment:
Q  113 taagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtat 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||      
T  8482046 taagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcatctcatttataaagtgttcaacctccacttttatatctgatgt-g 8481948  T
Q  213 gacatataactc 224  Q
    ||||||||||||    
T  8481947 gacatataactc 8481936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 148
Target Start/End: Original strand, 12071701 - 12071764
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaag 148  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12071701 cacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaag 12071764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 191
Target Start/End: Original strand, 12092491 - 12092598
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||    
T  12092491 ccacatccaggccagagcaacctcacaagtgagagagacaccacagtcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatggatcctctcacttataaagtg 12092590  T
Q  184 ttcaacct 191  Q
     |||||||    
T  12092591 ctcaacct 12092598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2975668 - 2975575
Alignment:
Q  117 agagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||    
T  2975668 agagacatcacactcttattcaaaactttaagacaaaggatttatgggtcatcttgcttataaggtgttcaacatttacttttctatttgatgt 2975575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6071264 - 6071174
Alignment:
Q  101 caaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 191  Q
    |||||| |||||  ||||||||  |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||    
T  6071264 caaccatacaagcgagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcatctcacttataaagtgttcaacct 6071174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 187
Target Start/End: Original strand, 30618643 - 30618727
Alignment:
Q  101 caaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttca 187  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  30618643 caaccacataagtaagagagacaccacatttttacccataaccttaagacaacg-gtttat-ggtcatcttacttataaagtgttca 30618727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35210551 - 35210501
Alignment:
Q  160 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  35210551 atgggtcctcttacttacaaggtattcaacctttactattttatccgatgt 35210501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 165
Target Start/End: Original strand, 11637759 - 11637811
Alignment:
Q  113 taagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggt 165  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11637759 taagagagacaccacactcttatccaaaatcttaagacaatgggtttatgggt 11637811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 196
Target Start/End: Original strand, 14789285 - 14789325
Alignment:
Q  156 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14789285 gtttatgggtcctcttacttgtaaggtgttcaacctttact 14789325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 141
Target Start/End: Original strand, 10902452 - 10902496
Alignment:
Q  97 agaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaa 141  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10902452 agaacaaccatacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 10902496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 31714818 - 31714732
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctct 170  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||  | | | ||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  31714818 tccacatcgaggctagagcaaccacacaagcgaaaaa-acgccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagttaatgggtcctct 31714732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 224
Target Start/End: Original strand, 17135092 - 17135218
Alignment:
Q  98 gaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 197  Q
    |||||||| ||||||  | |||| | ||||||||||| ||||||| ||   |||||| |||||||  ||||||| |||||||||| || ||| ||||||     
T  17135092 gaacaaccgcacaagcgaaagagccgtcacactcttatccaaaactttctaacaatgagtttatgaatcctcttgcttataaggtattaaacatttactt 17135191  T
Q  198 ttttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
     | |||| |||||  ||||||||||||    
T  17135192 ctctatccgatgtgagacatataactc 17135218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Original strand, 34661635 - 34661725
Alignment:
Q  101 caaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 191  Q
    |||||| |||||| ||| || || |||||| | ||  |||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  34661635 caaccatacaagtgagacagccaccacactttaacgtaaaaccttaagacaatatatgtatgggttctcttacttataaagtgatcaacct 34661725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Original strand, 22605305 - 22605345
Alignment:
Q  125 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggt 165  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22605305 cacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 22605345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 70)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 107 - 241
Target Start/End: Original strand, 32594748 - 32594880
Alignment:
Q  107 cacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctg 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32594748 cacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctg 32594847  T
Q  207 atgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaa 241  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  32594848 atgtaggacatataa--ctcacacttgcaaaccaa 32594880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Original strand, 44290832 - 44290992
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactctt-acccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataagg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44290832 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagatacaccacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 44290931  T
Q  182 tgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44290932 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaacac 44290992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41759633 - 41759470
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||||    
T  41759633 tccacatcaaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcatcttacttataaggt 41759534  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacacaaat 248  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  41759533 gttcaacttttactattttatccgatgtgtgacatataa--ctcacacttgcaaaccaacaaaaat 41759470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Original strand, 44290466 - 44290625
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  44290466 tccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagaaagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagat 44290565  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44290566 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaacac 44290625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Original strand, 48588496 - 48588655
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  48588496 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttacgggtcttcttacttataaggt 48588595  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  48588596 gttcaacctttactattttatccgatgtcggacatagaa--ctcacacttgcaaaccaacac 48588655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 223
Target Start/End: Original strand, 3537607 - 3537747
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  3537607 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttataggtcctcttactcataaggt 3537706  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataact 223  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  3537707 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 3537747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41157524 - 41157384
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41157524 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagacagacaccacactcttactcaaaacctaaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 41157425  T
Q  184 ttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  41157424 ttcaacttttactcttttatctgatgtgggacatataactc 41157384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41157140 - 41157020
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41157140 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtg 41157041  T
Q  184 ttcaacctttactattttatc 204  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  41157040 ttcaacctttactcttttatc 41157020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3550867 - 3550712
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |   | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3550867 tccacatcgaggctagaacaaccgta---gcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggt 3550771  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  3550770 gttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataa--ctcacacttgccaaccaaca 3550712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34364659 - 34364516
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  34364659 catccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttacggatcctcttacttataag 34364560  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  34364559 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactc 34364516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 82 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40082557 - 40082416
Alignment:
Q  82 atccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataagg 181  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||    
T  40082557 atccacatcgaggctagaacaaacgcacaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatga-tcctcttacttataagg 40082459  T
Q  182 tgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  40082458 tgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactc 40082416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41142523 - 41142381
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactctt-acccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataagg 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  41142523 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactctttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttacttataagg 41142424  T
Q  182 tgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  41142423 tgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactc 41142381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 26661530 - 26661671
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  26661530 tccatatcgaggcttgaacaaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaggt 26661629  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||||    
T  26661630 gttcaacctttactcttttacccgatgtgggacatataactc 26661671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 83 - 223
Target Start/End: Original strand, 3875339 - 3875479
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3875339 tccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagactccacattcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggt 3875438  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataact 223  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3875439 gtacaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataact 3875479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 83 - 210
Target Start/End: Original strand, 31767169 - 31767296
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31767169 tccacatcgagtctagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggttaatgggtcctcttacttataaggt 31767268  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  31767269 gttcaacctttactgttttatccgatgt 31767296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34365077 - 34364934
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    |||||||||||||  |||| ||||  || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34365077 catccacatcgaggttagagcaactgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataag 34364978  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  34364977 gtgttcaacctttattattttatccgatgtgtgacatataactc 34364934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9956057 - 9955916
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgttt-atgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9956057 cacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttaatgggtcctcttacttataatgtg 9955958  T
Q  184 ttcaacctttac-tattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||    
T  9955957 ttcaacctttactttttttatctgatgtgggacatataactc 9955916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14319017 - 14318876
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  14319017 tccacattgaggctagaacaaccgcacaaataagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatagatttatgggtcttcttacttataaggt 14318918  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||    
T  14318917 gttcaacctttactattttatccgacgtggaacatataactc 14318876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 37556260 - 37556120
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  37556260 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttat-ggtcctcttacttataagatg 37556162  T
Q  184 ttcaacctttacta-ttttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  37556161 ttcaacctttactatttttatccgatgtgggacatataactc 37556120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29798336 - 29798208
Alignment:
Q  96 tagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 195  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29798336 tagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttatccaagaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 29798237  T
Q  196 tattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  29798236 tattttatccaatgtaggacatataactc 29798208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17294728 - 17294586
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaacca-cacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataagg 181  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  17294728 tccacatcgaggctagagcaacctgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaag 17294629  T
Q  182 tgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  17294628 tgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactc 17294586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 208
Target Start/End: Original strand, 26661921 - 26662031
Alignment:
Q  98 gaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  26661921 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttctcacttataaggtgttcaacctttactc 26662020  T
Q  198 ttttatctgat 208  Q
    |||||||||||    
T  26662021 ttttatctgat 26662031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 85 - 210
Target Start/End: Original strand, 39066210 - 39066335
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39066210 cacatcaaggctagaacaaccacataagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgattttatgggtcatcttagttataaggtgt 39066309  T
Q  185 tcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
    |||||||||||| || |||| |||||    
T  39066310 tcaacctttacttttctatccgatgt 39066335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 50052032 - 50052172
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  50052032 tccacatcgaggttagaacaac-acataaacaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagaaaataggtttatgggtcctcttacttataagat 50052130  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  50052131 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 50052172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Original strand, 45493982 - 45494146
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataa--- 179  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||        
T  45493982 tccacatcgaggcttgaacaaccacataaggaagagagacaccacactcttatccaaaactttaaggcaatgggtttatggatcatcttacttatatata 45494081  T
Q  180 -ggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  45494082 tggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa-actcacacttgcaaaccaacac 45494146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11977430 - 11977289
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  11977430 tccacatcgaggctagaacaaccgcacttgcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtgctcttacttataaggt 11977331  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||  ||||||||||||    
T  11977330 gttcaacatttactgttttacccgatgtgggacatataactc 11977289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 5319976 - 5320114
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 185  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5319976 acattgaggctagaacaaccacataagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctctcacttataaggtgtt 5320075  T
Q  186 caacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||| |||||| || |||| |||||   |||||||||||    
T  5320076 caacttttacttttctatccgatgtggaacatataactc 5320114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 224
Target Start/End: Original strand, 22077518 - 22077644
Alignment:
Q  98 gaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 197  Q
    |||||||| || |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22077518 gaacaaccgcataagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggctacgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactt 22077617  T
Q  198 ttttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    || |||| |||||  ||||||||||||    
T  22077618 ttctatccgatgtgagacatataactc 22077644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 24600322 - 24600463
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||  |    
T  24600322 tccacatcgaggctagaacaaccatactagcgagagagacaccacactcttacacaaaaccttaagacaatgagtttatgagttctcttacttataatat 24600421  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| |  ||||||||||||    
T  24600422 gttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactc 24600463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34649588 - 34649447
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||   |||||||||||    
T  34649588 tccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacgcctcactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggttcttgcacttataaggt 34649489  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  34649488 gttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactc 34649447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 37850608 - 37850749
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  37850608 tccacatcgaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacaccacactcttatccgaaaccttaaaacattaggtttatgggttctcttacttataaggt 37850707  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||| |||| ||||||  |||||  ||||||||||||    
T  37850708 gttcaacctctactgttttatgcgatgtgggacatataactc 37850749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 223
Target Start/End: Original strand, 5528759 - 5528902
Alignment:
Q  80 tcatccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataa 179  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| || ||  |||||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  5528759 tcatccacatcgaggatagaacaaccgcataaagaagagagacgccacacatttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgagtcctcttatttataa 5528858  T
Q  180 ggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataact 223  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  5528859 gatgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 5528902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 204
Target Start/End: Original strand, 32168706 - 32168821
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||      ||||||    
T  32168706 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctct------taaggt 32168799  T
Q  183 gttcaacctttactattttatc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32168800 gttcaacctttactattttatc 32168821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 224
Target Start/End: Original strand, 38804370 - 38804504
Alignment:
Q  90 cgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 189  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  38804370 cgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggttatgggtttatggatcctcttacttataatgtgttcaac 38804469  T
Q  190 ctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| ||||||  |||||  ||| ||||||||    
T  38804470 ctttactcttttattcgatgtgggacgtataactc 38804504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45084522 - 45084391
Alignment:
Q  87 catcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 186  Q
    |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45084522 catcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacaccactctcttacccaaaaccttaagacg------ttatgggtcctcttacttataaggtgttc 45084429  T
Q  187 aacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  || |||||||||    
T  45084428 aacctttactgttttatccgatgtgggagatataactc 45084391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 244
Target Start/End: Original strand, 3537228 - 3537314
Alignment:
Q  156 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3537228 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaacac 3537314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Original strand, 22077118 - 22077231
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22077118 tccacatcgaggcttgaacaaccgcataagtgagggagacgtcacactcttatccaaaaccttagggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggt 22077217  T
Q  183 gttcaacctttact 196  Q
     |||||||||||||    
T  22077218 attcaacctttact 22077231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 199
Target Start/End: Original strand, 44043811 - 44043896
Alignment:
Q  114 aagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatt 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44043811 aagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacatttactatt 44043896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 37555878 - 37555739
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |  ||||  ||||||||||||||||| ||     
T  37555878 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaggattta-aggtcctcttacttataatgta 37555780  T
Q  184 ttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  37555779 ttcaaccttcactattttatccgatgtgggacttataactc 37555739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 66480 - 66621
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||  ||||||||   | ||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  66480 tccacattgaggctagaacaaccgcacaagcgagagagacgctatactcttacccaaaaccttaaggccatatgtttatggatcctcttacttataaggt 66579  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| |   |||||||||||    
T  66580 gttcaacctttacttttctatccgatatggaacatataactc 66621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Original strand, 41184489 - 41184574
Alignment:
Q  139 aaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  41184489 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactc 41184574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22793438 - 22793287
Alignment:
Q  74 gggtcatcatccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagac-aatgtgtttatgggtcctctta 172  Q
    |||||||| |||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||| |||||||| |||||| |    
T  22793438 gggtcatcgtccatattgaggccagaacaaccacacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccgtaaggcaaatgggtttatggatcctctca 22793339  T
Q  173 cttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| || |||||||| |||| || |||  |||||  ||||||||||||    
T  22793338 cttataaagttttcaacctctacttttctatacgatgtgggacatataactc 22793287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 24131999 - 24132134
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  24131999 acatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacact--tacccaaa-ccttaaggcaatgagtttatggatccccttatttataaggtgtt 24132095  T
Q  186 caacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||| || |||| ||||   ||||||||||||    
T  24132096 caacctttacttttctatccgatgagggacatataactc 24132134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 221
Target Start/End: Original strand, 30630648 - 30630784
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||| | || |||  | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30630648 cacatcgaggccagaacaaccacataagtgatagggacgccccactcttacccaaaactttaaggcaatgtgtttatgggttctcttacttataaagtgt 30630747  T
Q  185 tcaacctttactattttatctgatgtatgacatataa 221  Q
      |||||||| | ||||||| |||||  |||||||||    
T  30630748 caaacctttaattttttatccgatgtgagacatataa 30630784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 66100 - 66223
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 185  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||  ||||| |  |||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66100 acatcgaggccagaacaaccatacaagt--gagaggcgccacactcttacccaaaaccttaaggccataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 66197  T
Q  186 c-aacctttactattttatctgatgt 210  Q
    | |||||||||| || |||| |||||    
T  66198 caaacctttacttttctatccgatgt 66223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5575252 - 5575116
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| || |||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||||  | |||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5575252 tccacatcgaggctagaactacctcataag--agagagacgccacactcttatccaaaaccttaaagctatggatttataggtcctcttacttataaggt 5575155  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataa 221  Q
    |||||||||||||| || |||| || ||  |||||||||    
T  5575154 gttcaacctttactcttctatccgacgtgggacatataa 5575116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 22077837 - 22077977
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||  || |||||||| || |||| | ||||||  ||||||||||||| |||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  22077837 tccacatcgatgcttgaacaaccgcataagtgaaagagacgccacactcttaccccaaaccttagg-ctatgagtttatgggtcctcttacttataagat 22077935  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||| | || |||| ||| ||  |||||||||||    
T  22077936 gttcaacctttatttttctatccgatttaaaacatataactc 22077977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 45839779 - 45839678
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    ||||||||| | ||||||| | |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  45839779 cacatcgaggccagaacaatcccacaagcaagagagacaccacaatcttacccaaaaccttaaggcattacatttatgggtcttcttacttataaggtgt 45839680  T
Q  185 tc 186  Q
    ||    
T  45839679 tc 45839678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 160
Target Start/End: Original strand, 9956208 - 9956258
Alignment:
Q  110 aagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgttta 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9956208 aagtaagagagacatcacactcttacccaaaacattaagacaatgtgttta 9956258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10351285 - 10351183
Alignment:
Q  108 acaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctga 207  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || | || |||||||    
T  10351285 acaagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaagtaatgtgtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacctctatttttctatctga 10351186  T
Q  208 tgt 210  Q
    |||    
T  10351185 tgt 10351183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 196
Target Start/End: Original strand, 30576609 - 30576704
Alignment:
Q  101 caaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 196  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||    
T  30576609 caacaacacaagtgagagagacattacatttttacccaaaacattaagacattatgtctatgggtcctctcactcataaagtgttcaacctctact 30576704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 224
Target Start/End: Original strand, 19283464 - 19283604
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||| | ||| || |||    
T  19283464 ccacatccaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcgatgagtttatgtgtcctctcatttacaaagtg 19283563  T
Q  184 ttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
     |||||||  ||| || |||| | |||  ||||||||||||    
T  19283564 ctcaacctccacttttctatccggtgtgggacatataactc 19283604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44092041 - 44091909
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 185  Q
    |||||||| | |||||||| | |||||| ||| ||||  |||||||||||||| || ||||| | | |   ||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  44092041 acatcgaggccagaacaacaaaacaagtgagaaagacgccacactcttacccacaatcttaaaatattagatttatgggttctctcacttataaagtgtt 44091942  T
Q  186 caacctttactattttatctgatgtatgacata 218  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  44091941 caacctttacttttacatctgatgtgtgacata 44091909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 44685570 - 44685465
Alignment:
Q  119 agacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttc-aacctttactattttatctgatgtatgacat 217  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||| ||| |  |||||    
T  44685570 agacgtcacactgttacccaaa-cattaaggcaatgagtttattggtcctcttacttataaggttttcaaacctttacttttctatccgatatgggacat 44685472  T
Q  218 ataactc 224  Q
    |||||||    
T  44685471 ataactc 44685465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 4956305 - 4956228
Alignment:
Q  119 agacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 196  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| |||   ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4956305 agacgtcacacttttacctaaaactttagagcaatgagtttatggatcctcttacttataagatgttcaacctttact 4956228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11977094 - 11977029
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaag 148  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11977094 tccacatcgaggctagaactaccgcacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 11977029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Original strand, 35154046 - 35154106
Alignment:
Q  118 gagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttata 178  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  35154046 gagacaccacactcttgccaaaaaccttaagacaatcagtttatgggccctcttacttata 35154106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 163
Target Start/End: Original strand, 50051697 - 50051776
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgg 163  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  50051697 tccacatcgatgctagaacaac-acataaacaagagagacaccacactcttacgcaaaaccttaagataatgggtttatgg 50051776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 134
Target Start/End: Original strand, 4266807 - 4266855
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactctta 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4266807 ccacatcgaggctagaacaaccaca--agtaagagagacatcacactctta 4266855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 223
Target Start/End: Original strand, 21378122 - 21378189
Alignment:
Q  156 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataact 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||| ||| |  |||||||||||    
T  21378122 gtttatgggtcctcttacttataagatattcaacctttactgttctatccgatctgggacatataact 21378189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 179
Target Start/End: Original strand, 1188614 - 1188692
Alignment:
Q  101 caaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataa 179  Q
    |||||||| |||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  1188614 caaccacataagtgagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgagtcttctcacttataa 1188692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 162
Target Start/End: Original strand, 47380176 - 47380254
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatg 162  Q
    ||||||| || || || |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  47380176 ccacatctaggcttgagcaaccagacaagtgagagagatgtcacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatg 47380254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 224
Target Start/End: Original strand, 50469180 - 50469230
Alignment:
Q  174 ttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  50469180 ttataaagtgttcaacctttactttattatctgatgtaggacatataactc 50469230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 4266875 - 4266931
Alignment:
Q  168 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4266875 tcttacttctaatgtgttcaacatttactcttttatctaatgtaggacatataactc 4266931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 224
Target Start/End: Original strand, 30630912 - 30630972
Alignment:
Q  165 tcctcttacttataaggtgttcaaccttt-actattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30630912 tcctcttacttataaggtgttcagcctttaatttttttatccgatgtaagacatataactc 30630972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 98 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24448412 - 24448321
Alignment:
Q  98 gaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 189  Q
    |||||||| || |||| ||||| ||  |||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||    
T  24448412 gaacaacctcataagtgagagacacgccacacttttatccaaaatcttaagacaatgagtttatgagccctctcacttataaaatgttcaac 24448321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 179
Target Start/End: Original strand, 1187399 - 1187468
Alignment:
Q  110 aagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataa 179  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  1187399 aagtgagagagacgtcacacttttactcaaaatcttaaggtaatgagtttatgggtcttctcacttataa 1187468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Original strand, 5996892 - 5996984
Alignment:
Q  95 ctagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 188  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||  | ||||| |||||| | ||||||  |||||||    
T  5996892 ctagagcaaccacacaaatgagagagacaccacactctcactcaaaaccttaa-acaatggatatatggatcctctcatttataaaatgttcaa 5996984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 148
Target Start/End: Original strand, 31973375 - 31973408
Alignment:
Q  115 agagagacatcacactcttacccaaaaccttaag 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31973375 agagagacatcacactcttacccaaaatcttaag 31973408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 184
Target Start/End: Original strand, 41184152 - 41184197
Alignment:
Q  139 aaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41184152 aaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaagtgt 41184197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 69)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Original strand, 36178613 - 36178772
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36178613 tccacatagaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 36178712  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  36178713 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaactaacac 36178772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 15511503 - 15511644
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  15511503 tccacatcgagactagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataacgt 15511602  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||    
T  15511603 gttcaacctttactcttttatccgttgtgtgacatataactc 15511644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37106338 - 37106179
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37106338 tccacatcgaggctagaacaatcgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 37106239  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37106238 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaacac 37106179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Original strand, 14745675 - 14745833
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14745675 tccacatcgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 14745774  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14745775 gttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 14745833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Original strand, 5542633 - 5542792
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  5542633 tccacatcgagacttgaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttacttataaggt 5542732  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5542733 gttcaacctttactattttattcgatatgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaacac 5542792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 962748 - 962607
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  962748 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacaacacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctctcacttataaggt 962649  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||    
T  962648 gttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactc 962607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6421535 - 6421394
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6421535 tccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggt 6421436  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  6421435 gttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactc 6421394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Original strand, 41283483 - 41283641
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41283483 tccacatcaaggctagaacaaccacacaaacaagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggt 41283582  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41283583 gttcaacctttactattttatccgatatgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 41283641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 42514799 - 42514658
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42514799 tccacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 42514700  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  42514699 gttcaacctttacttttctatctgatgtaggacatataactc 42514658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Original strand, 5543006 - 5543165
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5543006 tccacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatggatcctcttacttataaggt 5543105  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5543106 gttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaacac 5543165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37106074 - 37105911
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  37106074 tccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtccccttacttataaggt 37105975  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacacaaat 248  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||    
T  37105974 gttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaacccacaaaaat 37105911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15880413 - 15880272
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15880413 tccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 15880314  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||   |||||||||||    
T  15880313 gttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactc 15880272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 83 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6422260 - 6422133
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6422260 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttaattataatgt 6422161  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  6422160 gttcaacctttacttttttatctgatgt 6422133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 40679637 - 40679778
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  40679637 tccacatcgagactagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggttctcttacttataaggt 40679736  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||| ||||| || |||| ||| |  ||||||||||||    
T  40679737 gttcaacccttacttttctatccgatatgggacatataactc 40679778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 36178182 - 36178306
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 185  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  36178182 acatcgaggctataacaaccacacaagcaagagaggcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggttcccttacttataaggtgtt 36178281  T
Q  186 caacctttactattttatctgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  36178282 caacctttactattttatccgatgt 36178306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33731795 - 33731648
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 185  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  33731795 acatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggatcctcttacttataaggtgct 33731696  T
Q  186 caacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttg 233  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||    
T  33731695 caacctttactcttttatccgatgtgagatatataactcacacacttg 33731648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40733669 - 40733526
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  40733669 catccacatcgagacttgaactaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggttgtaggtttatgggtcctcttacttataag 40733570  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  40733569 gtgttcaacatttacttttttatctgatgtgggacatataactc 40733526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6713127 - 6712985
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaa-ccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataagg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6713127 tccacatcgaggctagaacaatcccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaaccttaaagcaataggtttatgggtcctcttacttataagg 6713028  T
Q  182 tgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  6713027 tgttcaacatttactgttttatccgatgtgagacatataactc 6712985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Original strand, 36005888 - 36006001
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36005888 tccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggt 36005987  T
Q  183 gttcaacctttact 196  Q
    ||||||| ||||||    
T  36005988 gttcaacttttact 36006001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 95 - 221
Target Start/End: Original strand, 28254259 - 28254383
Alignment:
Q  95 ctagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 194  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28254259 ctagaacaaccccacaag--agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaaccttta 28254356  T
Q  195 ctattttatctgatgtatgacatataa 221  Q
    || || |||| |||||  |||||||||    
T  28254357 cttttctatccgatgtgggacatataa 28254383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 126 - 243
Target Start/End: Original strand, 36178320 - 36178435
Alignment:
Q  126 acactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactct 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||||||||  ||    
T  36178320 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtccccttacttataaggtgttccacctttactattttatccgaagtgggacatataa--ct 36178417  T
Q  226 cacacttgcaaaccaaca 243  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36178418 cacacttgcaaaccaaca 36178435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7598751 - 7598600
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  7598751 tccacatcgatgcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttaccaaaaacgttaagg--------ttatgggtcctcttacttataaggt 7598660  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  7598659 gttcaacctttacttttttatctgatgtgggacatataa--ctcacacttgcacaccaacac 7598600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 37632605 - 37632746
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  37632605 tccacatcgaggctagaacaatcacacttgtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaagttatgggtttatgggtcctcttacttataaaat 37632704  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37632705 gtcaaacctttactattttatccgatgtaggacatataactc 37632746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1770040 - 1769884
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||  |||| | | ||  | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1770040 cacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttattcaaagcttcaaagctatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgt 1769941  T
Q  185 tcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  1769940 tcaacttttactcttttatccgatgtgtgacatataa--ctcacacttgcacaccaaca 1769884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Original strand, 14745301 - 14745461
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccac-acaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataagg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||     
T  14745301 tccacatcgaggctagaacaaccaccacttacaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcatacttacaaga 14745400  T
Q  182 tgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||  |||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  14745401 tgttcaaccattactattttattcgatgtgggacatataa--ctcacagttgcaaaccaacac 14745461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 81 - 222
Target Start/End: Original strand, 40163378 - 40163520
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaacctt-aagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataa 179  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||    
T  40163378 catctacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaagacactaggttaatgggtcatcttacttataa 40163477  T
Q  180 ggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataac 222  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||    
T  40163478 ggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataac 40163520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 35580732 - 35580872
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  35580732 tccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-ggtcctctcacttataaggt 35580830  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  35580831 gttcaacatttattgttttatccgatgtgggacatataactc 35580872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 38796629 - 38796769
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcaca--ctcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| || ||||||  ||||  |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38796629 acatcgaggcttgaacaaccacacaagcaatagagacgccacatactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttacttataaggtg 38796728  T
Q  184 ttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  38796729 ttcaacctttattgttttatcagatgtgggacatataactc 38796769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Original strand, 28531320 - 28531463
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||  || || | |||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  28531320 catccacatcgaggctagagcaactgcataactgagagagtcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggacctcttacttataag 28531419  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||| || || |||| |||||  ||||||||||||    
T  28531420 gtgttcaacctttgcttttctatccgatgtgggacatataactc 28531463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23346386 - 23346274
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23346386 tccacatctaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttaccgaaaaccttaaggctatgggtttatgggccctctta-ttataaggt 23346288  T
Q  183 gttcaacctttact 196  Q
    ||| ||||||||||    
T  23346287 gtttaacctttact 23346274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3673218 - 3673122
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataa 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3673218 tccacatcgaggctagaacaaccacactagtaagagagacatcacactcttagccaaaatcttaaagcaatgagtttatggatcctcttacttataa 3673122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7598376 - 7598240
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7598376 cacatcgaggcttgaacaaccgcacaagtgagagagacaccatattcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctcttatttataaggtgt 7598277  T
Q  185 tcaacctttactattttatctgatgtatgacatataa 221  Q
    | |||||||||| || |||  ||||||  ||||||||    
T  7598276 tgaacctttacttttctattcgatgtagaacatataa 7598240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 224
Target Start/End: Original strand, 33561486 - 33561600
Alignment:
Q  110 aagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatg 209  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||| || |||||||||    
T  33561486 aagtgagagagatatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccacttttctatctgatg 33561585  T
Q  210 tatgacatataactc 224  Q
    |   |||||||||||    
T  33561586 tggaacatataactc 33561600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 6421881 - 6421793
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctctt 171  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  6421881 tccacatcgaggccagaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctt 6421793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5367599 - 5367484
Alignment:
Q  89 tcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 188  Q
    ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  5367599 tcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgtgttcatggatcatcttacttataaggtgttcaa 5367500  T
Q  189 cctttactattttatc 204  Q
    ||||| || |||||||    
T  5367499 cctttgctcttttatc 5367484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16591033 - 16590897
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |    
T  16591033 tccacattgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacattagattcttacttaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttactt------t 16590940  T
Q  183 gttcaacctttac-tattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||||    
T  16590939 gttcaacctttactttttttatttgatgtgggacatataactc 16590897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 3672851 - 3672773
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttat 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  3672851 tccacatcgagactagaacaaccacacaattaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttat 3672773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 224
Target Start/End: Original strand, 31468797 - 31468895
Alignment:
Q  122 catcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  31468797 catcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcct----cttataagatattcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 31468892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 224
Target Start/End: Original strand, 12529049 - 12529177
Alignment:
Q  96 tagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 195  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||  ||  ||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  12529049 tagaacaaccgcacaaacaagagagacactacgttcttatctaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttatacggtgttcaatctttac 12529148  T
Q  196 tattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12529149 tgttttatttgatgtaggacatataactc 12529177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29677060 - 29676912
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatggg-----tcctcttactt 175  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||     |||||| || |    
T  29677060 catccacatcgaggttggaacaaccccacaattaagagagacaccacactcttacttaaagccttaaggcaatgggtttatgggtcttctcctctcacct 29676961  T
Q  176 ataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  29676960 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactc 29676912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 29873548 - 29873672
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 185  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||||  ||||    
T  29873548 acatccagaccagagcaaccacacaagtgagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcccacttataaaatgtt 29873647  T
Q  186 caacctttactattttatctgatgt 210  Q
    ||||||  ||| || ||||||||||    
T  29873648 caacctccacttttctatctgatgt 29873672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40734032 - 40733892
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgt-gtttatgggtcctcttacttataagg 181  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  40734032 tccacatcgagacttgaacaaccacacaagcgagacagacaccacactcttacccaaaactttaaggc--tgtaggttatgagccctcttacttataagg 40733935  T
Q  182 tgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||| || ||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||    
T  40733934 tgttaaatctttactcttttattcgatgtgggacatataactc 40733892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16542556 - 16542458
Alignment:
Q  126 acactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  16542556 acactcttactcaaaatcttaaggcaatgagtttataagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacttataactc 16542458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30313309 - 30313189
Alignment:
Q  101 caaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| ||     
T  30313309 caaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttttgggtcctctcacttataa-gtgttcaacctccacttttc 30313211  T
Q  201 tatctgatgtatgacatataac 222  Q
    |||| |||||  ||||||||||    
T  30313210 tatccgatgtgagacatataac 30313189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 6421776 - 6421688
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctctt 171  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  6421776 tccacatcgaggccggaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaacctttagtcaataggtttatgggtcctctt 6421688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 224
Target Start/End: Original strand, 31899496 - 31899575
Alignment:
Q  145 taagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||||||||    
T  31899496 taaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactc 31899575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 209
Target Start/End: Original strand, 31259666 - 31259750
Alignment:
Q  125 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  31259666 cacactcttacccaaaaccttaaggtgataggtttatgggtcatcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatccgatg 31259750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 180
Target Start/End: Original strand, 36784273 - 36784365
Alignment:
Q  88 atcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    |||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  36784273 atcgaggcttgaataaccacacaagcaagagagacacaacacttttatccaaaaccttaagacaaagggtttatgggtcatcttacttataag 36784365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 210
Target Start/End: Original strand, 28254165 - 28254247
Alignment:
Q  128 actcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||    
T  28254165 actcttaccctaaactttaaggcaaagtgtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttacttttctatccgatgt 28254247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29676679 - 29676544
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||      | ||||| |||||||||| |||| |||||||| ||    
T  29676679 tccacatcgaggtttgaataaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa------ggcaatgagtttatgggttctctcacttataatgt 29676586  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||    
T  29676585 gttcaatctttactcttttatccaatgtgagacatataactc 29676544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 222
Target Start/End: Original strand, 29874073 - 29874170
Alignment:
Q  125 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataac 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||  ||||||||||    
T  29874073 cacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcccaattataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacatataac 29874170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31385868 - 31385779
Alignment:
Q  102 aaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 191  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  31385868 aaccacacaagtgaaagagacaccacacttattcccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctttcacttataaggtgctcaacct 31385779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 224
Target Start/End: Original strand, 38796299 - 38796367
Alignment:
Q  156 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  38796299 gtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactc 38796367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 235
Target Start/End: Original strand, 41678396 - 41678527
Alignment:
Q  103 accacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatttta 202  Q
    |||| |||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||   || || ||    
T  41678396 accatacaagtgagagagacgttacactcttactcaaaaccttaaggcaaag-gtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccccttttcta 41678494  T
Q  203 tctgatgtatgacatataactctcacacttgca 235  Q
    ||||||||  ||||||||   ||||||||||||    
T  41678495 tctgatgtgagacatatataactcacacttgca 41678527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30323581 - 30323506
Alignment:
Q  116 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 191  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  30323581 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttataggtcctctcacttctaaagtgttcaacct 30323506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 224
Target Start/End: Original strand, 33953797 - 33953920
Alignment:
Q  101 caaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 200  Q
    |||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||| |||   ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||| ||     
T  33953797 caaccataaaagtaagagggacgtcacactcttacccaaaattttaaggcaacaggtttatgggtcctctcacttatatagtgttcaacctccacttttc 33953896  T
Q  201 tatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||    
T  33953897 tatctgatgtgggacttataactc 33953920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 224
Target Start/End: Original strand, 37895111 - 37895210
Alignment:
Q  125 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || || |||||| |||||| |||||| |||| | || |||| |||||  ||||||||||||    
T  37895111 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgtgttcttttacttttaaggttttcaacttttatttttctatccgatgtgggacatataactc 37895210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 191
Target Start/End: Original strand, 3594188 - 3594294
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    |||||||||  ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  3594188 cacatcgaggttagaataaacacactagtatgagagatatcacactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctatcacttataaagtgt 3594287  T
Q  185 tcaacct 191  Q
    || ||||    
T  3594288 tcgacct 3594294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 28226455 - 28226404
Alignment:
Q  115 agagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtc 166  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226455 agagagacaccacactcttacctaaaaccctaagacaatgtgtttatgggtc 28226404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9231399 - 9231258
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||| ||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  ||||||||| ||||||| ||||| |  || ||| |||| |||||||| ||||||  |    
T  9231399 tccacatcaaggttagaataaccgcataagttagagagatactacactcttaaccaaaactttaaggcggtgggttgatggatcctcttatttataatat 9231300  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |  ||||||||||||    
T  9231299 gttcaacctttacttttctatctgatatgagacatataactc 9231258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 224
Target Start/End: Original strand, 36785664 - 36785712
Alignment:
Q  176 ataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  36785664 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 36785712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12910335 - 12910237
Alignment:
Q  126 acactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| | | |||||||||| ||||||||| |||| ||  ||| |||||   |||||||||||    
T  12910335 acactcttacccaaaaccttaagacaatgaatttataagtcatttcacttataaggggttcaacctgtacttttccatccgatgtggaacatataactc 12910237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30312907 - 30312831
Alignment:
Q  115 agagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 191  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||  |||  ||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||    
T  30312907 agagagactacacacttttacccaaaaccttaaggaaataagtttatgggtcatctaagttataaagtgttcaacct 30312831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 169
Target Start/End: Original strand, 35580494 - 35580534
Alignment:
Q  129 ctcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctc 169  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35580494 ctcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctc 35580534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 179
Target Start/End: Original strand, 25390313 - 25390372
Alignment:
Q  120 gacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataa 179  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  25390313 gacaccacacttctacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcttcttagttataa 25390372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2336723 - 2336666
Alignment:
Q  134 acccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 191  Q
    |||||||| |||||| || ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2336723 acccaaaatcttaaggcattgaatttatgggtcctctcacttataaagtgttcaacct 2336666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 154
Target Start/End: Original strand, 13792536 - 13792573
Alignment:
Q  117 agagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatg 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  13792536 agagacatcacactcttacccaaaacctcaagtcaatg 13792573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 160
Target Start/End: Original strand, 15689427 - 15689484
Alignment:
Q  103 accacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgttta 160  Q
    ||||||| ||| | ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15689427 accacactagtgatagagacaccacatttttacccaaaaccttaagacaatgagttta 15689484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 196
Target Start/End: Original strand, 37894732 - 37894813
Alignment:
Q  115 agagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 196  Q
    ||||| ||| |||||| ||| |||||| |||||| |||||  |||||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||||    
T  37894732 agagacacaccacacttttaaccaaaatcttaaggcaatggatttatgagtcttcttacttataaggtttttagcctttact 37894813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 69)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 1085624 - 1085765
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  1085624 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagt 1085723  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  1085724 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 1085765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6054710 - 6054570
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6054710 tccacatcaaggctagaacaaccatacaagtaggagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 6054611  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataact 223  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  6054610 gttcaacatttactattttatccgatgtgagacatataact 6054570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 84 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7517729 - 7517589
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517729 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagacagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 7517630  T
Q  184 ttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  7517629 ttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactc 7517589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14681658 - 14681501
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14681658 tccacatcaaggctagaacaaccacacttgt--gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggccctcttacttacaaggt 14681561  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  14681560 gttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataa--cttacacttgcaaaccaacac 14681501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19122879 - 19122741
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19122879 cacatcgagactagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgagtcctcttacttataaggtgt 19122780  T
Q  185 tcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  19122779 tcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactc 19122741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30244422 - 30244279
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  30244422 catccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataag 30244323  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  30244322 gtcttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactc 30244279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Original strand, 37533019 - 37533177
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||||||  |||||||| | |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37533019 tccacatcgaggttagaacaagcgcacaagcaagagagacaccacact-ttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggt 37533117  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37533118 gttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaacac 37533177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45434784 - 45434646
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45434784 cacatcgaggctagaacaactccacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcagtaagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 45434685  T
Q  185 tcaacctttactattttatctgatgtatgacatataact 223  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  45434684 tcaacctttacttttttatccgatgtgggacatataact 45434646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29157715 - 29157559
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  29157715 tccacatcaagactagagcaactacacgagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcgtcttacttataaggt 29157616  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29157615 gttcaacctttactattttatccggtgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaa 29157559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 37533372 - 37533513
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  37533372 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggt 37533471  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||  |||||||||||    
T  37533472 gttcaacctttactattttattcaatgtagaacatataactc 37533513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 224
Target Start/End: Original strand, 40094783 - 40094923
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40094783 ccacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacgatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 40094882  T
Q  184 ttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    || |||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||    
T  40094883 ttgaacctttactcttttattcgatgtgagacatataactc 40094923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11845338 - 11845200
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 185  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11845338 acatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgtt 11845239  T
Q  186 caacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||    
T  11845238 caacctttactattttatccgatgtggaacatataactc 11845200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 23385 - 23526
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23385 tccaaatcgaggctagaacaaccgcacatgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttacttataaggt 23484  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||    
T  23485 gttcaacctttactattgtatccgatgtggaacatataactc 23526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 81 - 210
Target Start/End: Original strand, 22567045 - 22567174
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    ||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22567045 catccacatcgaggcccgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataag 22567144  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22567145 gtgttcaacctttactcttttatccgatgt 22567174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 34218042 - 34218183
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34218042 tccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttataaggt 34218141  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  34218142 gttcaacatttacttttttatccgatgtgagacatataactc 34218183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30245225 - 30245086
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  30245225 catccacatcgaggcttgaacaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcgtcttacttataag 30245130  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||||||||    
T  30245129 gtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactc 30245086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45754862 - 45754725
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 185  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  45754862 acatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgagtcatcttacttataaggtgtt 45754763  T
Q  186 caacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  45754762 caacatttactattttatccgatgt-ggacatataactc 45754725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7554154 - 7554034
Alignment:
Q  104 ccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 203  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554154 ccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 7554055  T
Q  204 ctgatgtatgacatataactc 224  Q
    | |||||  ||||||||||||    
T  7554054 ccgatgtgggacatataactc 7554034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Original strand, 36939739 - 36939882
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  36939739 catccacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagaaacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataag 36939838  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| |  ||||||||||||    
T  36939839 gtgttcaacttttactattttatacgatttgggacatataactc 36939882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 223
Target Start/End: Original strand, 24838724 - 24838850
Alignment:
Q  98 gaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcc-tcttacttataaggtgttcaacctttact 196  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24838724 gaacaaccacacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaacgggtttatggatccttcttacttataaggtgttcaacctttact 24838823  T
Q  197 attttatctgatgtatgacatataact 223  Q
     ||||||  |||||  |||||||||||    
T  24838824 cttttattcgatgtgagacatataact 24838850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 84 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 45433390 - 45433264
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| || |||||||||||||||||    
T  45433390 ccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatgagttctcttacttataaggtg 45433291  T
Q  184 ttcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  45433290 ttcaacctttactcttttatccgatgt 45433264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 47129242 - 47129104
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 185  Q
    |||| ||| |||||||||||||||  || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  47129242 acattgaggctagaacaaccacacttgtgagagagacaccacactcctacccaaaaccttaaagcgatgggtttatgggtcctcttacttataagaggtt 47129143  T
Q  186 caacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  47129142 caacctttactattttatccgatgtgagacatataactc 47129104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9901793 - 9901654
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| |    
T  9901793 tccacaccgaggctagaacaaccgcactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatggatcctc-tacgtataagat 9901695  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  9901694 gttcaacctttactgttttatccgatgt-ggacatataactc 9901654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 125 - 224
Target Start/End: Original strand, 22566712 - 22566811
Alignment:
Q  125 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||    
T  22566712 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatattactc 22566811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41854781 - 41854644
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 185  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || | | ||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  41854781 acattgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattatatttataggtcatcttgcttataaggtgtt 41854682  T
Q  186 caacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||    
T  41854681 caacctttactctttta-ctgatgtgggacatataactc 41854644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24177585 - 24177444
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||| ||||| |||  |||||| |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24177585 tccacgtcgaggctaagacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttaccaaaaactttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataaggt 24177486  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  24177485 gttcagcctttactcttttatccgatgtgggacatataactc 24177444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 95 - 223
Target Start/End: Original strand, 118319 - 118449
Alignment:
Q  95 ctagaacaaccacacaagtaagaga--gacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctt 192  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||  |||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  118319 ctagaacaaccacacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttacggtaatgggtttatggatcctcttacttattaggtgttcaacctt 118418  T
Q  193 tactattttatctgatgtatgacatataact 223  Q
    |||| || ||||||||||  |||||||||||    
T  118419 tacttttctatctgatgtgggacatataact 118449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16569315 - 16569205
Alignment:
Q  114 aagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatg 213  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||  |    
T  16569315 aagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtgag 16569216  T
Q  214 acatataactc 224  Q
    |||||||||||    
T  16569215 acatataactc 16569205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 224
Target Start/End: Original strand, 16596347 - 16596457
Alignment:
Q  114 aagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatg 213  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||  |    
T  16596347 aagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtgag 16596446  T
Q  214 acatataactc 224  Q
    |||||||||||    
T  16596447 acatataactc 16596457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30032717 - 30032571
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||| | ||||||||||||||||    
T  30032717 tccacatcgaggatagaacaaccgcacaagcaagagagatgtcacactcttacccaaaaccttaaggctataggtttatggatactcttacttataaggt 30032618  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcaca 229  Q
    |||||||  ||||| ||||||  |||||  |||||||||||| ||||    
T  30032617 gttcaacacttactcttttattcgatgtgggacatataactcacaca 30032571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 81 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30253640 - 30253534
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  30253640 catccacatcgaggcttgaacaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttataag 30253545  T
Q  181 gtgttcaacct 191  Q
    || ||||||||    
T  30253544 gtcttcaacct 30253534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36623096 - 36622969
Alignment:
Q  97 agaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 196  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  36623096 agaacaatcacacaagtaagagaggcaccatactcctacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcctcctacttataaaatgtttaacctttact 36622997  T
Q  197 attttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  36622996 attttatccgatgtgggacatataactc 36622969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 221
Target Start/End: Original strand, 36534795 - 36534930
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36534795 ccacatcgaggctggaacaaccacacttgt--gagagacgccacactcttacccaaaaccttaagactttaggtttatgggtcctcttacttataaggtg 36534892  T
Q  184 ttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataa 221  Q
    |||||||| |||| ||||||| || ||  |||||||||    
T  36534893 ttcaacctctactgttttatccgaggtgggacatataa 36534930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 1085280 - 1085377
Alignment:
Q  107 cacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatc 204  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  1085280 cacaaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttatgagttgttcaacttttactattttatc 1085377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 223
Target Start/End: Original strand, 40230330 - 40230439
Alignment:
Q  114 aagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatg 213  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||  |||||  |    
T  40230330 aagagagacaccagacttttacccaaaaccttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacttttacttttttattcgatgtggg 40230429  T
Q  214 acatataact 223  Q
    ||||||||||    
T  40230430 acatataact 40230439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37167931 - 37167810
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||       |    
T  37167931 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagtcaatggatttatggatcctcttact------ct 37167838  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37167837 gttcaacatttactattttatctgatgt 37167810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Original strand, 8128451 - 8128590
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8128451 cacatcgatgctagaacaaccacataagcgagagtgacaccacactcttaaccaaaaccttaaggttatgggtttatgggtcctcttacatataaggtgt 8128550  T
Q  185 tcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||| | || |||| ||| |  ||||||||||||    
T  8128551 tcaacctttatttttctatccgatatgggacatataactc 8128590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43241614 - 43241504
Alignment:
Q  114 aagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatg 213  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||       
T  43241614 aagagagacatcatacttttacctaaaaccttaagtcaataagtttatgagtccttttacttataaggtgttcaacctttatttttttatccgatgtgga 43241515  T
Q  214 acatataactc 224  Q
    |||||||||||    
T  43241514 acatataactc 43241504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 187
Target Start/End: Original strand, 28300261 - 28300366
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttat-gggtcctcttacttataagg 181  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  28300261 tccacatcgaggcccgaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatggggttctcttacttataagg 28300360  T
Q  182 tgttca 187  Q
    ||||||    
T  28300361 tgttca 28300366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20599450 - 20599323
Alignment:
Q  99 aacaaccacacaagtaagagagacatcacactct--tacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 196  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  20599450 aacaaccatacaagcaagagagacaccacactctcttacccaaaacgttaaggcaatgagtttatatgtcctcttatttataaagtgtttatcctttact 20599351  T
Q  197 attttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
     ||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  20599350 tttttatccgatatgggacatataactc 20599323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30245567 - 30245503
Alignment:
Q  160 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  30245567 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacatataactc 30245503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 41910594 - 41910743
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaacc--------ttaagacaatgtgtttatgggtcctcttact 174  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||| |||| |        ||||| ||||| ||||||||||||||| | |    
T  41910594 tccacatcgaggttagaacaaccacacttgtgagagaaacaccacactcttaccaaaaatccaaaaatcttaagccaatgggtttatgggtcctctcagt 41910693  T
Q  175 tataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  41910694 tataaggtattcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactc 41910743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37346043 - 37345916
Alignment:
Q  108 acaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctga 207  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||||  ||| || |||| ||    
T  37346043 acaagtgagagagacgtcacactcttactcaaaactttaaggcaatatgtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttctatcaga 37345944  T
Q  208 tgtatgacatataactctcacacttgca 235  Q
    | |||||||||||   ||||||||||||    
T  37345943 tatatgacatatataactcacacttgca 37345916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 47129519 - 47129454
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaag 148  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47129519 tccacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 47129454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 224
Target Start/End: Original strand, 28301613 - 28301692
Alignment:
Q  145 taagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||| |||||  ||||||||||||    
T  28301613 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttttctatccgatgtgagacatataactc 28301692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 148
Target Start/End: Original strand, 28300576 - 28300642
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactctta-cccaaaaccttaag 148  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28300576 tccacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaag 28300642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30255412 - 30255350
Alignment:
Q  160 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataac 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||    
T  30255412 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataac 30255350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 164
Target Start/End: Original strand, 23569043 - 23569091
Alignment:
Q  116 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatggg 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23569043 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 23569091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 224
Target Start/End: Original strand, 36109007 - 36109066
Alignment:
Q  165 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||||    
T  36109007 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagaaatataactc 36109066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 165
Target Start/End: Original strand, 40094424 - 40094503
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggt 165  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||    
T  40094424 acatcggggctagaacaaccacataagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaactttaaagtaatgagtttatgggt 40094503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Original strand, 37532759 - 37532821
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaacctt 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37532759 tccacatcgaggctagaacaacagcacaagctagagagacaccacactcttacccaaaacctt 37532821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 166
Target Start/End: Original strand, 21619071 - 21619136
Alignment:
Q  101 caaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtc 166  Q
    |||||| |||||| | ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21619071 caaccatacaagtgaaagatacaccacacttttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtc 21619136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30244771 - 30244710
Alignment:
Q  163 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||    
T  30244771 ggtcctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactc 30244710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 184
Target Start/End: Original strand, 4124114 - 4124197
Alignment:
Q  101 caaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    |||||| | |||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||  ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  4124114 caaccaaaaaagtgagagagacaccacacttttatccaaaaccttaatgcaatgagtttattggtcctctcacttataaagtgt 4124197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 166
Target Start/End: Original strand, 21416181 - 21416232
Alignment:
Q  115 agagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtc 166  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  21416181 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 21416232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15902436 - 15902342
Alignment:
Q  97 agaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 191  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||| ||  | | |||||||| |||||||||||    
T  15902436 agaacaatcacacaagtgagagcgacaccacacttttatccaaaaccttaagacaacgagcttatgtgtgatttcacttataaagtgttcaacct 15902342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 30244502 - 30244453
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactct 132  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30244502 tccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30244453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 30253720 - 30253671
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactct 132  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30253720 tccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30253671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 45755072 - 45755019
Alignment:
Q  88 atcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaa 141  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  45755072 atcgaggcttgaacaaccacacaagtaagggagacaccacacttttacccaaaa 45755019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 220
Target Start/End: Original strand, 44361517 - 44361608
Alignment:
Q  128 actcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatata 220  Q
    ||||||||| |||||| ||||   ||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  44361517 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatata 44361608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 2512634 - 2512575
Alignment:
Q  102 aaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttat 161  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||    
T  2512634 aaccacacaagtgagagatatatcacactcttacacaaaatattaagacaatgagtttat 2512575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 37345706 - 37345652
Alignment:
Q  108 acaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatg 162  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  37345706 acaagtgagagagacgtcagactcttaccaaaaaccttaaggcaatatgtttatg 37345652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 7517802 - 7517765
Alignment:
Q  88 atcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatc 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7517802 atcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacatc 7517765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 7518068 - 7518031
Alignment:
Q  88 atcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatc 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7518068 atcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacatc 7518031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 30245305 - 30245256
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactct 132  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30245305 tccacattgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30245256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 224
Target Start/End: Original strand, 40094502 - 40094543
Alignment:
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  40094502 gttcaacctttactcttttatctgatgttggacatataactc 40094543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 48071498 - 48071457
Alignment:
Q  121 acatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatg 162  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  48071498 acatcacactcttatccaaaaccttaagacaataggtttatg 48071457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 161
Target Start/End: Original strand, 7109754 - 7109814
Alignment:
Q  101 caaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttat 161  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | | || |||||||||||   |||||||||||    
T  7109754 caaccacacatgtaagagagacatcacaatttaactcaaaaccttaatgtaatgtgtttat 7109814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 27598092 - 27598052
Alignment:
Q  126 acactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtc 166  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27598092 acactcttacgcaaaaccctaagacaatgggtttatgggtc 27598052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 86)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 84 - 244
Target Start/End: Original strand, 50630762 - 50630920
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  50630762 ccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataatgtg 50630861  T
Q  184 ttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  50630862 ttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataa--ctcacgcttgcaaaccaacac 50630920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Original strand, 55933130 - 55933288
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55933130 tccacatcgaggctagaacaactgtacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 55933229  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  55933230 gttcaacccttactattttatccgatgtaggacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 55933288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25483486 - 25483345
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  25483486 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataagat 25483387  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  25483386 gttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactc 25483345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 54017601 - 54017742
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  54017601 tccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacatcacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagat 54017700  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  54017701 gttcaacctttactattttatctgacgtgggacatataactc 54017742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 84 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 50002575 - 50002423
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||    
T  50002575 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttacttaaaaagtg 50002476  T
Q  184 ttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaac 238  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||    
T  50002475 ttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataa--ctcacacttgcaaac 50002423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36629387 - 36629246
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36629387 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggt 36629288  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||| ||| |||||| || |||| |||||  ||||||||||||    
T  36629287 gtttaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactc 36629246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41370507 - 41370349
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41370507 tccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacactacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 41370408  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
     |||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41370407 tttcaacatttactattttatccgatttgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 41370349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 54936345 - 54936219
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  54936345 tccacatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttacaaggt 54936247  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54936246 gttcaacctttactattttatctgatgt 54936219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 1731653 - 1731794
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  1731653 tccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttatttataagat 1731752  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  1731753 gttcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataactc 1731794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 36608667 - 36608808
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  36608667 tccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatggatcctcttacttatgaggt 36608766  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  36608767 gttcaacttttactcttttatccgatgttggacatataactc 36608808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 39792866 - 39793007
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  39792866 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttacggttcctctttcttataaggt 39792965  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||    
T  39792966 gttcaacatttacttttctatctgatgtgggacatataactc 39793007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39404546 - 39404407
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39404546 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacattcttgcccaaaaccttaaggctataggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 39404447  T
Q  185 tcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    || ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  39404446 tccacctttactcttttatctgatgtgggacatataactc 39404407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 211
Target Start/End: Original strand, 18932757 - 18932883
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  18932757 cacatcgaggctataacaaccactcaagtaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttatttataaggtat 18932856  T
Q  185 tcaacctttactattttatctgatgta 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18932857 tcaacctttactattttatccgatgta 18932883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 221
Target Start/End: Original strand, 22027967 - 22028105
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22027967 tccacatcgagactaaaacaaccacataagcgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatatgtttatgggtcctcttacttataaggt 22028066  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataa 221  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||    
T  22028067 gttcaacctttcgtattttatccgatgtgggacatataa 22028105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3340957 - 3340816
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  3340957 tccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggt 3340858  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||||   ||||||||||||    
T  3340857 gctcaacctttactctttcatctgatgcgggacatataactc 3340816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 32941129 - 32941270
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||    
T  32941129 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagccctcttatttataaggt 32941228  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| || | || |||||| ||||||||||||    
T  32941229 gttcaacctttactgttctttccgatgtaagacatataactc 32941270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 54109060 - 54108936
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54109060 cacatcgaagctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaac-ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 54108962  T
Q  185 tcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  54108961 tcaacctttactattttatccgatgt 54108936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 81 - 223
Target Start/End: Original strand, 54343012 - 54343147
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||||||||||||||    
T  54343012 catccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-------gggtcctcttacttataag 54343104  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataact 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  54343105 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 54343147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 83 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44620503 - 44620360
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||||    
T  44620503 tccacatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagaaacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggctctcttatttataaggt 44620404  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctc 226  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||   |||||||||||||    
T  44620403 gttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataactctc 44620360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 83 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 44621152 - 44621025
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  44621152 tccacatcgaggctagaataaccgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgtgccctcttacttataaggt 44621053  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  44621052 gttcaacctttactgttttatccgatgt 44621025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 45496934 - 45496828
Alignment:
Q  104 ccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 203  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45496934 ccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacgattttat 45496835  T
Q  204 ctgatgt 210  Q
    | |||||    
T  45496834 ccgatgt 45496828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 95 - 224
Target Start/End: Original strand, 4955335 - 4955464
Alignment:
Q  95 ctagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 194  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4955335 ctagagcaaccgcacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaaccttaa 4955434  T
Q  195 ctattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  4955435 ctattttatccgatatgagacatataactc 4955464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 221
Target Start/End: Original strand, 22028375 - 22028515
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22028375 tccacattgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgagtttatgggtcctcttactaataaggt 22028474  T
Q  183 gttcaaccttta--ctattttatctgatgtatgacatataa 221  Q
    ||||||||||||   | ||||||| |||||| |||||||||    
T  22028475 gttcaacctttatttttttttatccgatgtaggacatataa 22028515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39404168 - 39404027
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  39404168 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaatgctatgagtttatgagtcctcttacttataaagt 39404069  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||    
T  39404068 gttcaacctttactcttttattcaatgtaggacatataactc 39404027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 224
Target Start/End: Original strand, 3244458 - 3244598
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3244458 ccacatcgaggctggaacaaccatacaagtgagagagacgacacattcttacccaaaactttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataagatg 3244557  T
Q  184 ttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||    
T  3244558 ttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactc 3244598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 52884844 - 52884704
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttaccc-aaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||||||||    
T  52884844 cacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatcgatcatcttacttataaggtg 52884745  T
Q  184 ttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  52884744 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 52884704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 50459869 - 50459730
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  50459869 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacgctcttacctaaaaccttaagataatgggtttatgagtcctcttacttataagatgt 50459770  T
Q  185 tcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||   |||||||||||    
T  50459769 tcaacctttactcttttaaccgatgtggaacatataactc 50459730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 52885038 - 52884896
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagaga--catcacactcttaccc-aaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataagg 181  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||  || |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  52885038 cacatcgaggctagatcaaccacacaaataagagagagacaccacattcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataagg 52884939  T
Q  182 tgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  52884938 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 52884896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 16888825 - 16888963
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 185  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  16888825 acatcgaaactagaacaatcgcacaaacaagagagacatcacactcttacccaaaaccgtaagacaatgagtttataggttctcttacttataaggtatt 16888924  T
Q  186 caacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||    
T  16888925 caacctttacttttctatccgatgtgggacatataactc 16888963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 49880279 - 49880152
Alignment:
Q  114 aagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatg 213  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  |    
T  49880279 aagagagacaccacgctcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtggg 49880180  T
Q  214 acatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  49880179 acatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 49880152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10246069 - 10245929
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10246069 tccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagggagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctttgggtttat-ggtcctcttacttataaggt 10245971  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||    
T  10245970 gttcaacctttactcttttatccgatgtggggcatataactc 10245929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 49303056 - 49302913
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttac--ttataag 180  Q
    |||||||||||  |||||||| | || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  49303056 tccacatcgaggatagaacaatcgcataagtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttttataag 49302957  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
     ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||    
T  49302956 atgttcaacctttacttttttatttgatgtgggacatataactc 49302913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 87 - 210
Target Start/End: Original strand, 4390111 - 4390234
Alignment:
Q  87 catcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 186  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| | | || ||||||||||||||||||||||    
T  4390111 catcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaacgcaatgtgctaaaggatcctcttacttataaggtgttc 4390210  T
Q  187 aacctttactattttatctgatgt 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  4390211 aacctttactcttttatctgatgt 4390234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20826367 - 20826226
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  20826367 tccacatcgaggctagaacaatcgcataaggaagagagacatcacactcttacctaaaatgttaaggctatgggtttatgggttctcttacttataacgt 20826268  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  20826267 gttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactc 20826226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 224
Target Start/End: Original strand, 34646667 - 34646796
Alignment:
Q  95 ctagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 194  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  34646667 ctagaacaaccacacagaccagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttagttataaggtgttcaacattta 34646766  T
Q  195 ctattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    || ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  34646767 ctgttttatccgatgtgggacatataactc 34646796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 54108686 - 54108565
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgttt-atgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  54108686 ccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttagccaaaaccttaaggcaatgaattttatgggtccttttacttataaggt 54108587  T
Q  183 gttcaacctttactattttatc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  54108586 gttcaacctttactattttatc 54108565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 22183270 - 22183411
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||  |    
T  22183270 tccacatcgaggctagaacaaccgtacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttacttataaatt 22183369  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||  || |||||||||    
T  22183370 gttcaacatttactcttttatccgatgtgggatatataactc 22183411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 44620809 - 44620669
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||||||  || ||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  44620809 tccacatcgaggatataacaaccgcacaagcaagagagaaaccacactcttacccaaaaccttaaggttatg-gtttatgggtcctcttacttataaagt 44620711  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||    
T  44620710 gttcaacctctactatttcatccgatgtgggacatataactc 44620669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 51768066 - 51768207
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  51768066 tccacatcgaggttagaacaatcccataagtaagagagacatcgtacttttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgagtcctcttatttataaggt 51768165  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| |||||| || |||  ||| || ||||||||||||    
T  51768166 gttcaacatttactcttatattcgatataggacatataactc 51768207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 125 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2741179 - 2741080
Alignment:
Q  125 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  2741179 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatggagttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattctatctgatgtgggacatataactc 2741080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36572167 - 36572028
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||  ||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36572167 cacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcgagagagacaccatactctaacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcttcttacttataaggtgt 36572068  T
Q  185 tcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||  ||||||||||||    
T  36572067 tcaacatttactcttttattcgatgtgggacatataactc 36572028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 202
Target Start/End: Original strand, 49076837 - 49076955
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  49076837 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaaagacaccacactctaacccaaaaccttaaggttatgggtttatgggttctcttac-tataaggt 49076935  T
Q  183 gttcaacctttactatttta 202  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  49076936 gttcaacctttactatttta 49076955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Original strand, 41707490 - 41707611
Alignment:
Q  102 aaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatttt 201  Q
    |||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  41707490 aaccacgctagtgagagagacaccacactcttacc-aaaaccttaagacaatgagtttatgggttcttttacttatatggtgttcaacctttactctttt 41707588  T
Q  202 atctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||| |||||  ||||||||||||    
T  41707589 atccgatgtgggacatataactc 41707611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20825986 - 20825845
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |   |||||||||| |||||| |||||||||    
T  20825986 tccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaaggtttatgggtgctcttatttataaggt 20825887  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||   |||||||||||    
T  20825886 gttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactc 20825845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2740850 - 2740709
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||  ||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||||||||    
T  2740850 catccatatcgaggctagaacaaccaca--agtgagagagacgccacactcttacgtaaaaccttaaggctctgggtttataggtcctcttacttataag 2740753  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||    
T  2740752 gtgttcaacctttactgttctatccgatgtgggacatataactc 2740709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 191
Target Start/End: Original strand, 15841386 - 15841482
Alignment:
Q  95 ctagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 191  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| || |||||||||||    
T  15841386 ctagagcaaccacacaagtgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgaatcctctcacttacaaagtgttcaacct 15841482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 179
Target Start/End: Original strand, 23817687 - 23817783
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataa 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  23817687 tccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgaatcctcttacttataa 23817783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Original strand, 34004593 - 34004730
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgt 184  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||  |||||||||| | |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34004593 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagggagagagacggcacactcttatcgaaaaccttaagg-aatgagtttatgggtcctcttacttataagttgt 34004691  T
Q  185 tcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||||    
T  34004692 tcaacctttagt-ttttatcatatgtgtgacatataactc 34004730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 221
Target Start/End: Original strand, 54741227 - 54741322
Alignment:
Q  126 acactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataa 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||  |||||||||    
T  54741227 acactcttatccaaaaccttaagacaatctgtgtatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataa 54741322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3341259 - 3341137
Alignment:
Q  102 aaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatttt 201  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  3341259 aaccacataattaagaaagacatcacactcttacccaaaatcttaaaacaatgatgttatgggtcctcttacttataaagtgtttaacctttactctttt 3341160  T
Q  202 atctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||  ||||  ||||||||||||    
T  3341159 atccaatgtgggacatataactc 3341137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 114 - 224
Target Start/End: Original strand, 6975493 - 6975603
Alignment:
Q  114 aagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatg 213  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  6975493 aagagagacgccacactcttacccaaaatcttaagataatggatttatgagtcctcttacttataagatattcaacctttactattttatcggatgtgag 6975592  T
Q  214 acatataactc 224  Q
    |||||||||||    
T  6975593 acatataactc 6975603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 16889542 - 16889683
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| || |  |||||||  ||||||||||||||||||    
T  16889542 tccacatcgaggttagaacaatcacacaaggaagagagacaccatactcttacccaaaactttaaggcagtaggtttatgaatcctcttacttataaggt 16889641  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
     ||||||||||||| || |||| ||| |  ||||||||||||    
T  16889642 attcaacctttacttttctatccgatttgagacatataactc 16889683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 210
Target Start/End: Original strand, 54017750 - 54017835
Alignment:
Q  125 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  54017750 cacactcttacctaaaaccttaagacaatgggaatatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgt 54017835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 221
Target Start/End: Original strand, 45489336 - 45489475
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |  ||||| | || |||||||||||| |    
T  45489336 catccacatcgaggctagaacaatcacactagcaaaagagacatcacactcttaccaaaaatcttaa-acagtaggtttaagagttctcttacttatatg 45489434  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataa 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||    
T  45489435 gtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataa 45489475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 43827589 - 43827480
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||     
T  43827589 tccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatcc-aaaccttaaggcaatgaatttatgggtcctcttatttataagga 43827491  T
Q  183 gttcaaccttt 193  Q
    |||||| ||||    
T  43827490 gttcaatcttt 43827480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3700507 - 3700374
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||        ||| |||||||||||||    
T  3700507 tccacatcgaggcttgaataaccacacaaatgagagagacatcatactcttatccaaaaccttaaggcaatgagt--------ccttttacttataaggt 3700416  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3700415 gttcaacatttactcttttatccgatgtaggacatataactc 3700374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18879956 - 18879852
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  |||||| |||| |||||||||||||||    
T  18879956 tccacatcgaagctagaacaaccacacaaccaaaagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttataggtcatcttacttataaggt 18879857  T
Q  183 gttca 187  Q
    |||||    
T  18879856 gttca 18879852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 31691304 - 31691203
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagaga--gacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  ||||| ||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31691304 tccacatcgaggctagaacaatcgtacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataag 31691205  T
Q  181 gt 182  Q
    ||    
T  31691204 gt 31691203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43174657 - 43174515
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||| || ||| |||||||| | ||  |||||||||  ||||||||||||||| || |||||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  43174657 tccacatcaaggctacaacaaccatataaacaagagagacgccacactcttacccaacactttaaggtcataggtttatgtgtcctcttacttataaggt 43174558  T
Q  183 gttcaacctttact-attttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||    
T  43174557 gttcaacctttactctttttatctgatgtgtggcatataactc 43174515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3271939 - 3271807
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaa---gagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttactt---a 176  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||  ||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||   |    
T  3271939 tccacatcgaggctagaacaaccacataataaacgagagagaca-cacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggttctcttacttataa 3271841  T
Q  177 taaggtgttcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||    
T  3271840 taaggtgtttaacttttacttttctatctgatgt 3271807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40067181 - 40067052
Alignment:
Q  96 tagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac-cttta 194  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  | ||  | |||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  40067181 tagaacaaccacataagcaagagagacatcacacttttacccaaaatcttaaggtagtggatctatgtgtcctcttacttataatgtgttcaacttttta 40067082  T
Q  195 ctattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |  ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  40067081 cacttttatccgatgtagaacatataactc 40067052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Original strand, 49076510 - 49076595
Alignment:
Q  139 aaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |   |||||||||||    
T  49076510 aaactttaagacaatgggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatatggtacatataactc 49076595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 224
Target Start/End: Original strand, 23556890 - 23557013
Alignment:
Q  101 caaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||  ||| ||     
T  23556890 caaccacacaagtaagagagacgtcacactcttatccaaaactttaaggcaatgattttatggattctcttatttataaaatgttcaacctccacttttc 23556989  T
Q  201 tatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||| ||||||  |||| ||||||    
T  23556990 tatccgatgtaaaacatttaactc 23557013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28034381 - 28034271
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||| || |||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||| |||| ||||||||     
T  28034381 catccacatccagaccagagcaaccgcataagtgagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggttctctcacttataaa 28034282  T
Q  181 gtgttcaacct 191  Q
    |||||||||||    
T  28034281 gtgttcaacct 28034271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19504842 - 19504714
Alignment:
Q  87 catcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 186  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||         ||||||    
T  19504842 catcgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaatagatttatgggtcctctt---------gtgttc 19504752  T
Q  187 aacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  19504751 aacttttactattttatccgatatgggacatataactc 19504714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 760320 - 760191
Alignment:
Q  101 caaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 200  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| | | ||     
T  760320 caaccacacaaatgagagagacaccacacttttacc-aaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagttctcaaccttcatttttc 760222  T
Q  201 tatctgatgtatgacatataactctcacact 231  Q
    |||  |||||  |||||||||||| ||||||    
T  760221 tattcgatgtgggacatataactcacacact 760191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 44620362 - 44620305
Alignment:
Q  167 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||    
T  44620362 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcccatgtgggacatataactc 44620305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 204
Target Start/End: Original strand, 48111736 - 48111825
Alignment:
Q  115 agagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatc 204  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  ||||  |||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  48111736 agagagacaccacactcatacctaaaaccttaaggtaatggatttataagtccttttacttataatgtgttcaacctttactcttttatc 48111825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 34544232 - 34544148
Alignment:
Q  108 acaagtaagagagacatcacactcttacccaaaa-ccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 191  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  34544232 acaagtgagagagataccacactcttacccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcatttataaagtgatcaacct 34544148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 147
Target Start/End: Original strand, 45489721 - 45489784
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  45489721 ccacatcgagactagaacaaccatgcaagcgagagagacaccacactattacccaaaaccttaa 45489784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10246424 - 10246358
Alignment:
Q  156 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataac 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||    
T  10246424 gtttatgggtcctctaacttataagatgttcaacctttactcttttatccgatttgagacatataac 10246358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 41370808 - 41370738
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaat 153  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||    
T  41370808 tccacatcgaggttagaacaaccactcaagtaagagagacatcacatttttacctaaaatcttaaggcaat 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 43174291 - 43174233
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaa 141  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  43174291 tccacatcaaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 43174233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 224
Target Start/End: Original strand, 11348410 - 11348475
Alignment:
Q  159 tatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11348410 tatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccactattttatctgatgtagaacatataactc 11348475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 179
Target Start/End: Original strand, 2891864 - 2891924
Alignment:
Q  119 agacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataa 179  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||    
T  2891864 agacatcacactttaacccaaaaccttaagacattaggtttatggatcctcttacttataa 2891924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Original strand, 39698950 - 39699065
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagac--aatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    |||||||||| ||||||||||| ||   | |  ||||||| |||||||||||| ||     
T  39698950 tccacatcgagactagaataaccgcacaagcaagagagatgctacactcttactcaaaaccttaaaacgacacggatttatggatcctcttacttagaat 39699049  T
Q  181 gtgttcaacctttact 196  Q
     |||||||||||||||    
T  39699050 atgttcaacctttact 39699065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11197344 - 11197293
Alignment:
Q  115 agagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtc 166  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  11197344 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 11197293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 11348272 - 11348330
Alignment:
Q  85 cacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaacct 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11348272 cacatcgagacttgaacaaccacataagtgagagagaca-cacactcttaccaaaaacct 11348330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Original strand, 41603246 - 41603305
Alignment:
Q  132 ttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 191  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||    
T  41603246 ttacccaaaaccttaagacactatgtttatgggtcttctcacttataaagtgctcaacct 41603305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 243
Target Start/End: Original strand, 50788087 - 50788147
Alignment:
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  50788087 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa--cttacacttgcaaaccaaca 50788147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 44621492 - 44621435
Alignment:
Q  167 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||    
T  44621492 ctcttacttataaggtgtttaacctttactgttttatcccatgttggacatataactc 44621435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 922537 - 922485
Alignment:
Q  114 aagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtc 166  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  922537 aagagagacaccacactcttatccaaacccctaagacaatgggtttatgggtc 922485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 44621011 - 44620968
Alignment:
Q  167 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  44621011 ctcttacttataaggtgttcaacctttacagttttatccgatgt 44620968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 166
Target Start/End: Original strand, 53468038 - 53468089
Alignment:
Q  115 agagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtc 166  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  53468038 agagagacatcacacacttatccaaaagcttaaaacaatgagtttatgggtc 53468089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 191
Target Start/End: Original strand, 6876123 - 6876212
Alignment:
Q  99 aacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 191  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||  ||||||| |||||| ||||    
T  6876123 aacaacca-acaagtgagagagacgtcacacttttatccaaaaccttaagtcgatgcgtttattggttctct--cttataaagtgttcgacct 6876212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 221
Target Start/End: Original strand, 15841016 - 15841128
Alignment:
Q  108 acaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctga 207  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||| |||||| | |||||| ||||||||  |||||| |||  ||| || |||||||    
T  15841016 acaagtgagagagacaatacactcttacccaaaa-cttaaagcaatgggtttatagatcctctcacttataaaatgttcagcctccacttttctatctga 15841114  T
Q  208 tgtatgacatataa 221  Q
    | |  |||||||||    
T  15841115 tatgggacatataa 15841128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 81 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 32487545 - 32487386
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  32487545 catccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagatacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat-ag 32487447  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  32487446 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 32487386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6500600 - 6500443
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  6500600 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttaaaggtcctcttacttataaggt 6500501  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6500500 gttcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 6500443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 18603128 - 18603269
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18603128 tccacatcgaggctagaactaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 18603227  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18603228 gttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactc 18603269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6500972 - 6500814
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6500972 tccacatcgaggctagaataaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtccttttatttataaggt 6500873  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6500872 gttcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataa--ctcacacttgcaaaccaacac 6500814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 40296323 - 40296464
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40296323 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 40296422  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  40296423 gttcaaccttttctattttatccgatgtgggacatataactc 40296464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 83 - 238
Target Start/End: Original strand, 36492225 - 36492378
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36492225 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaacctaaaggtaatgtgtttattggtcctcttacttataaggt 36492324  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaac 238  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||    
T  36492325 gttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaac 36492378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 210
Target Start/End: Original strand, 3295353 - 3295479
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3295353 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaacacactcttacc-aaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttacttataaggt 3295451  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  3295452 gttcaacctttactattttatccgatgt 3295479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 624346 - 624187
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  624346 tccacatcgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggctatgggtttatgggtcatcttacttataacgt 624247  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  624246 gttcaacctttactattttatacaatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaacac 624187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 90 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41170777 - 41170643
Alignment:
Q  90 cgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 189  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41170777 cgaggctagaacaaccacacaagcaagaaaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaac 41170678  T
Q  190 ctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  41170677 ctttactattttatccgatgtgggacatataactc 41170643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Original strand, 27502044 - 27502202
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  27502044 tccacatcgaggatagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttaccaaaaatcttaaggcaataggtttatgggtcctcttacttataaggt 27502143  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27502144 gtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 27502202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 245
Target Start/End: Original strand, 9498693 - 9498822
Alignment:
Q  114 aagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatg 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  9498693 aagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattctatctgatgtgag 9498792  T
Q  214 acatataactctcacacttgcaaaccaacaca 245  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  9498793 acatataa--ctcacatttgcaaaccaacaca 9498822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Original strand, 11416983 - 11417126
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  11416983 catccacatcgaagctagaacaatcccacaagcaagagagagatcacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataag 11417082  T
Q  181 gtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||    
T  11417083 gtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactc 11417126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 235
Target Start/End: Original strand, 3295023 - 3295172
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3295023 tccacatcgaggctacaacaaccacacaaccaagagagacaccacactcatacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcttcttacttataaggt 3295122  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgca 235  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||   ||||||||||||    
T  3295123 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata---ctcacacttgca 3295172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25328085 - 25327944
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  25328085 tccacattgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttacttataaggt 25327986  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25327985 gttcaacttttactgttttatccgatgtaggacatataactc 25327944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Original strand, 26074150 - 26074295
Alignment:
Q  79 atcatccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttata 178  Q
    |||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||     
T  26074150 atcacccacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttcatgggtcctcttacatatg 26074249  T
Q  179 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26074250 aggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactc 26074295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26074766 - 26074621
Alignment:
Q  79 atcatccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttata 178  Q
    |||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26074766 atcacccacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 26074667  T
Q  179 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |   |||||||||||    
T  26074666 aggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactc 26074621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 83 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41632932 - 41632792
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  41632932 tccacatcgagactaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaagcattgggtttatgggtcctcttacttataaggt 41632833  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataact 223  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||  |||||||||||    
T  41632832 gttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataact 41632792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 224
Target Start/End: Original strand, 13415774 - 13415909
Alignment:
Q  89 tcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 188  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13415774 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 13415873  T
Q  189 cctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||    
T  13415874 cctttactaatttatccgatgtgggacatataactc 13415909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15370249 - 15370108
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  15370249 tccacatcgaggctagaacaatcccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctgtggatttatgggtcctcttacttataagat 15370150  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||    
T  15370149 gttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactc 15370108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 221
Target Start/End: Original strand, 26075169 - 26075308
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactctt-acccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataagg 181  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26075169 tccacatcgaggctaaaacaaccacacttgcaagagagacgacacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 26075268  T
Q  182 tgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataa 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||    
T  26075269 tgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataa 26075308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35150156 - 35150016
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  35150156 tccacattgaggttagaacaaccacactagtgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggt-ctcttacttataaggt 35150058  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  35150057 gttcaaccttgactcttttatccgatgtgggacatataactc 35150016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 83 - 223
Target Start/End: Original strand, 34753033 - 34753173
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  34753033 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttcttacttataaggt 34753132  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataact 223  Q
    ||||||| |||||| || ||||  ||||  |||||||||||    
T  34753133 gttcaacttttacttttctatccaatgtgggacatataact 34753173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38427701 - 38427552
Alignment:
Q  79 atcatccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttata 178  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||    
T  38427701 atcatccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtgagagagacgtcacactcttacacaaaaccttaagacaatggattaatgggtcctc-tacttata 38427603  T
Q  179 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcaca 229  Q
    || ||||||||||||||| || ||||  ||||  |||||||||||| ||||    
T  38427602 agatgttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacaca 38427552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 42405606 - 42405745
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  42405606 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagacac--cacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtccttttacttgtaaggt 42405703  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  42405704 gttcaacctttactattttatccgatgttggacatataactc 42405745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 299639 - 299498
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||  |||||||||||  ||||| || ||||||  ||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  299639 tccacatcgatgctagaacaaccgtacaagcaatagagacgccacactcttacacaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcatcttacttataaggt 299540  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  299539 gttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactc 299498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Original strand, 29549278 - 29549416
Alignment:
Q  98 gaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 197  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  29549278 gaacaaccacataagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggtaatgtgtttatgggtcttcttacttatatggtgttcatcctttacta 29549377  T
Q  198 ttttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaac 238  Q
    ||||||||||| |   ||||||||  |||||||||||||||    
T  29549378 ttttatctgatatggaacatataa--ctcacacttgcaaac 29549416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 224
Target Start/End: Original strand, 12662661 - 12662801
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||  ||    
T  12662661 ccacatcgaggctagaagaaccccacaagcaagaaaggcaccacactcttacccaaaaacttaagacaatggatttatgggttttcttacttataaaatg 12662760  T
Q  184 ttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  12662761 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 12662801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 623965 - 623810
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 185  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||  |||||||| ||  ||||||| ||| |||||    
T  623965 acattgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggctataagtttatggctcaacttacttgtaaagtgtt 623866  T
Q  186 caacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    |||||||||||||| |||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  623865 caacctttactattatatccgatgtgagacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 623810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33747921 - 33747783
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  33747921 tccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcctcttacttataaagt 33747822  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataa 221  Q
     || |||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  33747821 atttaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 33747783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 1028525 - 1028666
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  1028525 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggttataggtttatgggtcctcttacttataaagt 1028624  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||| |||||||| || |||| |||||  ||||||||||||    
T  1028625 gttcatcctttacttttctatccgatgtgggacatataactc 1028666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 15370552 - 15370439
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15370552 tccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccacactcttacgcaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 15370453  T
Q  183 gttcaacctttact 196  Q
    ||||||| ||||||    
T  15370452 gttcaacatttact 15370439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 224
Target Start/End: Original strand, 24489215 - 24489353
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtg 183  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  24489215 ccacatcgagactagaacaaccgcacaagtaaaagagacgccacactcttacgcaaaatcttaaggcaatgggtttatgggt--tcttactaataaggtg 24489312  T
Q  184 ttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    || ||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||    
T  24489313 tttaaccttttcttttctatctgatgtgggacatataactc 24489353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 196
Target Start/End: Original strand, 26590916 - 26591031
Alignment:
Q  81 catccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataag 180  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  26590916 catccacatcgaggttagaacaaccacactagtgagagagacgccacactcttactcaaaaccttaaggcattgaatttatggatcctcttacttataag 26591015  T
Q  181 gtgttcaacctttact 196  Q
    ||||||||||||||||    
T  26591016 gtgttcaacctttact 26591031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 210
Target Start/End: Original strand, 35167846 - 35167973
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||   |||||||||| || ||||||||||||    
T  35167846 tccacatcgatgctagaacaaccacactagtgtgagagacatcacactcttaccaaaaacatcaaggcaatagatttatgggtcatcctacttataaggt 35167945  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  35167946 gttcaacctttactcttttatctgatgt 35167973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 243
Target Start/End: Original strand, 5723810 - 5723957
Alignment:
Q  94 actagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttt 193  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  5723810 actagaacaaccgcacaagcaagagagacactatactctttcccaaaaccttaagacaataaattaatgggttctcttacatataatgtgttcaactttt 5723909  T
Q  194 actattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaaca 243  Q
    | ||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5723910 attattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 5723957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 36568577 - 36568716
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  36568577 tccacatcgaggatagaacaaccacacaag--agagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttacgggtcatctcacttataaggt 36568674  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| |||||| || |||| |||||  ||||||||||||    
T  36568675 gttcaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactc 36568716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 95 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6224334 - 6224205
Alignment:
Q  95 ctagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 194  Q
    ||||| ||||| |||||| ||  ||| || |||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6224334 ctagaccaaccgcacaagcaactgaggcaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 6224235  T
Q  195 ctattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    || ||||||| || ||  ||||||||||||    
T  6224234 ctcttttatccgaagtgggacatataactc 6224205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 224
Target Start/End: Original strand, 26074807 - 26074931
Alignment:
Q  101 caaccacacaagtaagagagacatcacactctt-acccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatt 199  Q
    |||||||||  | |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  26074807 caaccacacttgcaagagagacgccacactctttacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcctacttatattgtgttcaacctttactctt 26074906  T
Q  200 ttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||    
T  26074907 ttatccgatgtgggacatataactc 26074931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 209
Target Start/End: Original strand, 41635212 - 41635325
Alignment:
Q  96 tagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 195  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  41635212 tagagcaaccatacaagtaaaagagatactacactcttacctaaaattttaagacaatggatttatggatcctcttatttataaggtgttcaacatttac 41635311  T
Q  196 tattttatctgatg 209  Q
    | ||||||||||||    
T  41635312 tcttttatctgatg 41635325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 89 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 301095 - 300970
Alignment:
Q  89 tcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 188  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||  ||        |||||||||||||||| |||||    
T  301095 tcgagacttgaacagccacacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaatcttaaggcaatggatt--------ctcttacttataaggtattcaa 301004  T
Q  189 cctttactattttatctgatgtatgacatataac 222  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  301003 cctttactgttttatctgatgtgggacatataac 300970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7768925 - 7768837
Alignment:
Q  158 ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacacaaat 248  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  7768925 ttatgggtccttttacttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtaggatatataa--ctcacacttgaaaaccaacaaaaat 7768837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 189
Target Start/End: Original strand, 36522269 - 36522351
Alignment:
Q  107 cacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 189  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||  ||||||||    
T  36522269 cacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagataatgggtttattggtcctctcacttataaaatgttcaac 36522351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 224
Target Start/End: Original strand, 36521922 - 36522045
Alignment:
Q  101 caaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 200  Q
    ||||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | ||| |  |||||||||||  ||| ||     
T  36521922 caaccacacaaatgagagagatgacacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctctcatttaaagagtgttcaacctcaacttttc 36522021  T
Q  201 tatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||  ||||||||||||    
T  36522022 tatctgatgtgggacatataactc 36522045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2411157 - 2411016
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||  ||||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||| ||| |    
T  2411157 tccatatcgaggttagaacaatcattcaagtaatagagaaactacactcttactcaaaaccttaaggcaataagtttatgggttctcttacttacaagat 2411058  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| ||||||  | ||||  ||||| ||||||||||||    
T  2411057 gttcaacttttacttctctatccaatgtaggacatataactc 2411016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26074395 - 26074327
Alignment:
Q  156 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||  ||||||||||||    
T  26074395 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaatctttagttttctatctgatgtgggacatataactc 26074327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Original strand, 13786041 - 13786116
Alignment:
Q  115 agagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 190  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13786041 agagagacatcacactcttatccaaaatcttaagacaatagatttacgggtcatcttacttataaagtgttcaacc 13786116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19275636 - 19275543
Alignment:
Q  125 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatat 219  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| || |||||||    
T  19275636 cacaatcttacccaaaatcttaagacaatgaatttatgggtcttcttccttataa-gtgttcaacctctacttttctatctgatttaagacatat 19275543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 147
Target Start/End: Original strand, 26900025 - 26900089
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaa 147  Q
    |||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26900025 tccacatcaaggctagaacaaacccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 26900089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35914925 - 35914858
Alignment:
Q  157 tttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35914925 tttacgggtcttcttacttataaaatgttcaacctttactcttttatccgatgtgtgacatataactc 35914858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 42508707 - 42508635
Alignment:
Q  138 aaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||| || |||| |||||    
T  42508707 aaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttattagatgtttaacctttacttttctatccgatgt 42508635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 148
Target Start/End: Original strand, 795254 - 795305
Alignment:
Q  97 agaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaag 148  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  795254 agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaag 795305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 13042657 - 13042606
Alignment:
Q  115 agagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtc 166  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13042657 agagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 13042606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 13112651 - 13112604
Alignment:
Q  119 agacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtc 166  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13112651 agacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtc 13112604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 38427366 - 38427306
Alignment:
Q  86 acatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaacctta 146  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  38427366 acatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaatctta 38427306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6225104 - 6225053
Alignment:
Q  173 cttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  || |||||||||    
T  6225104 cttataaggtgttcaacctttattcttttatctgatgtgggatatataactc 6225053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 32446010 - 32445943
Alignment:
Q  108 acaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttactt 175  Q
    |||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||    
T  32446010 acaagtgagagagacaccacactttaacccaaaaccttaaggcgttgggtttatgggtcctctcactt 32445943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31509718 - 31509632
Alignment:
Q  138 aaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||  ||||||||||||    
T  31509718 aaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgagacatataactc 31509632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39309754 - 39309693
Alignment:
Q  163 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||  ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  39309754 ggtcctcttatttataatgtgttcaacatttacccttttatccgatgtgggacatataactc 39309693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 42435577 - 42435512
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaag 148  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||   | |||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  42435577 tccacatcgatgctagaacaaccacacttatgagagagacatcacactctgattcaaaaccttaag 42435512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 84 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5546 - 5405
Alignment:
Q  84 ccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaacctt-aagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5546 ccacatcgaggcttgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaactttaagacaatatgtttatgggccctcttacttataaggt 5447  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5446 gttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactc 5405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5917 - 5786
Alignment:
Q  98 gaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaac-----cttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctt 192  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||      |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5917 gaacaaccccacaagtaaaagagacaccacactcttactcaaaatttaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctt 5818  T
Q  193 tactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  5817 tactattttatccgatgtgcgacatataactc 5786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 522 - 663
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  522 tccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 621  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||||    
T  622 gttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactc 663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Original strand, 155 - 309
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||| ||| ||| |||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  155 tccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaa-cctaaagt--atg-gtttatgg-tcctcttacttataaggt 249  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactctcacacttgcaaaccaacac 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  250 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaacac 309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Original strand, 1114 - 1255
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||||    
T  1114 tccacatcgaggctagaacaaccacataaacaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctttttcttataaggt 1213  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||    
T  1214 gttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactc 1255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 186
Target Start/End: Original strand, 1731 - 1802
Alignment:
Q  115 agagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 186  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1731 agagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgttc 1802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 117 - 224
Target Start/End: Original strand, 17496 - 17605
Alignment:
Q  117 agagacatcacactcttacccaaaa--ccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatga 214  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17496 agagacaccatactcttacccaaaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgtga 17595  T
Q  215 catataactc 224  Q
    ||||||||||    
T  17596 catataactc 17605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 47510 - 47383
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  47510 tccacatcgaggttagaacaaccgcgcaagcaagagagacaccacatttttacccaaaactttaaggcaatgggtttatggattctcttacttataaggt 47411  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  47410 gttcaaactttactattttatcggatgt 47383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5476 - 5366
Alignment:
Q  114 aagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatg 213  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||       
T  5476 aagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgga 5377  T
Q  214 acatataactc 224  Q
    |||||||||||    
T  5376 acatataactc 5366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5132 - 4994
Alignment:
Q  83 tccacatcgagactagaacaaccacacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggt 182  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||| |    
T  5132 tccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccataaggcaatgagtttatgggtctttttacttataagat 5033  T
Q  183 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataa 221  Q
     || |||||||||| || | || |||||  |||||||||    
T  5032 attaaacctttactgttctctccgatgtgagacatataa 4994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 224
Target Start/End: Original strand, 10191 - 10260
Alignment:
Q  155 tgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  10191 tgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttaccattttatccgatgtgagacatataactc 10260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 39588 - 39498
Alignment:
Q  101 caaccacacaagtaagagagacatc-acactcttacccaaaaccttaagacaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 191  Q
    |||||||||||| |||||||||  | ||||| |||||||||| |||||| |||  ||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||    
T  39588 caaccacacaagcaagagagacgccaacacttttacccaaaa-cttaaggcaacatgtttatagttcctctcacttataaggagttcaacct 39498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University