View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1578-Insertion-4 (Length: 1068)

Name: NF1578-Insertion-4
Description: NF1578
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1578-Insertion-4
NF1578-Insertion-4
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (8-776)||(10340892-10341658)
chr8 (277-763)||(26981813-26982309)
chr8 (279-774)||(43956777-43957280)
chr8 (277-772)||(26986918-26987422)
chr8 (277-772)||(34108000-34108506)
chr8 (286-772)||(14318544-14319039)
chr8 (277-772)||(14314840-14315344)
chr8 (281-776)||(18608575-18609057)
chr8 (270-776)||(25953099-25953599)
chr8 (491-772)||(18494106-18494395)
chr8 (316-578)||(18884874-18885136)
chr8 (777-917)||(45483380-45483522)
chr8 (536-602)||(1781869-1781935)
chr8 (647-745)||(1781968-1782066)
chr8 (135-269)||(38201786-38201921)
chr8 (715-758)||(18608534-18608577)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (277-776)||(32429218-32429717)
chr4 (277-772)||(35095799-35096303)
chr4 (279-772)||(35090688-35091190)
chr4 (278-776)||(30019773-30020282)
chr4 (270-776)||(18670605-18671109)
chr4 (270-616)||(18716250-18716599)
chr4 (277-776)||(34279438-34279925)
chr4 (270-616)||(18736923-18737272)
chr4 (308-776)||(47071211-47071670)
chr4 (271-713)||(3424698-3425139)
chr4 (341-776)||(54859102-54859525)
chr4 (270-529)||(3415333-3415592)
chr4 (405-761)||(34128203-34128542)
chr4 (277-495)||(14646483-14646701)
chr4 (492-776)||(14643670-14643948)
chr4 (647-776)||(3409533-3409662)
chr4 (8-258)||(9789808-9790054)
chr4 (564-776)||(25618232-25618435)
chr4 (647-776)||(22118855-22118986)
chr4 (277-366)||(34128560-34128649)
chr4 (678-772)||(34601967-34602061)
chr4 (715-776)||(18671107-18671168)
chr4 (711-776)||(18716694-18716759)
chr4 (711-776)||(18737367-18737432)
chr4 (715-776)||(25618173-25618234)
chr4 (8-239)||(55236655-55236887)
chr4 (714-763)||(3424251-3424300)
chr4 (715-776)||(32429159-32429220)
chr4 (534-595)||(34602060-34602121)
chr4 (715-763)||(3409487-3409535)
chr4 (715-761)||(14643626-14643672)
chr4 (715-761)||(22118984-22119030)
chr4 (715-761)||(47071668-47071714)
chr4 (715-761)||(54859058-54859104)
chr4 (531-600)||(3409707-3409781)
chr4 (715-776)||(18716757-18716818)
chr4 (715-776)||(18737430-18737491)
chr4 (715-776)||(34279379-34279440)
chr4 (431-496)||(48779837-48779902)
chr4 (715-757)||(34279339-34279381)
chr4 (721-758)||(34601928-34601965)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (270-776)||(43358515-43359022)
chr1 (277-772)||(28598080-28598584)
chr1 (277-772)||(28574068-28574572)
chr1 (271-776)||(13654100-13654588)
chr1 (277-776)||(10186506-10187009)
chr1 (309-776)||(19310628-19311092)
chr1 (270-761)||(44523971-44524458)
chr1 (303-776)||(1187624-1188090)
chr1 (309-630)||(3465276-3465596)
chr1 (281-776)||(16050981-16051464)
chr1 (449-772)||(3468010-3468343)
chr1 (270-548)||(48366213-48366491)
chr1 (270-548)||(29681355-29681632)
chr1 (517-776)||(21431606-21431865)
chr1 (270-466)||(35624781-35624977)
chr1 (474-615)||(35626140-35626281)
chr1 (504-613)||(17414633-17414742)
chr1 (270-457)||(21431918-21432105)
chr1 (319-509)||(17415386-17415576)
chr1 (306-613)||(3696403-3696702)
chr1 (647-776)||(35653178-35653307)
chr1 (715-776)||(10185907-10185968)
chr1 (780-832)||(1014055-1014107)
chr1 (715-762)||(10186461-10186508)
chr1 (651-708)||(3701491-3701548)
chr1 (649-708)||(17414561-17414620)
chr1 (715-776)||(21431547-21431608)
chr1 (715-776)||(43359020-43359080)
chr1 (710-766)||(35626333-35626389)
chr1 (715-761)||(19311090-19311136)
chr1 (716-776)||(35626398-35626457)
chr1 (743-774)||(3701463-3701494)
chr1 (715-774)||(17414462-17414521)
chr1 (8-154)||(48377184-48377328)
chr1 (429-496)||(49053867-49053934)
chr1 (715-761)||(10185966-10186012)
chr1 (715-776)||(3701390-3701451)
chr1 (711-740)||(17414425-17414454)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (278-776)||(2022735-2023232)
chr5 (277-772)||(9877468-9877972)
chr5 (277-772)||(39908729-39909233)
chr5 (277-772)||(9872353-9872857)
chr5 (277-776)||(13556229-13556738)
chr5 (277-772)||(39903616-39904120)
chr5 (270-776)||(35368826-35369342)
chr5 (270-560)||(43378201-43378491)
chr5 (286-600)||(25183874-25184186)
chr5 (363-621)||(4555509-4555768)
chr5 (544-776)||(43540708-43540925)
chr5 (649-708)||(4555772-4555831)
chr5 (715-776)||(2023230-2023291)
chr5 (715-776)||(35368767-35368828)
chr5 (665-776)||(43379556-43379662)
chr5 (647-773)||(43402061-43402187)
chr5 (715-761)||(35368723-35368769)
chr5 (715-773)||(43379660-43379718)
chr5 (715-761)||(43540664-43540710)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (277-776)||(42779954-42780452)
chr2 (277-772)||(17720455-17720959)
chr2 (277-772)||(45120157-45120662)
chr2 (277-772)||(14917311-14917815)
chr2 (342-772)||(30283379-30283809)
chr2 (285-614)||(16284215-16284546)
chr2 (469-770)||(716230-716527)
chr2 (277-461)||(39196121-39196305)
chr2 (645-776)||(20892275-20892405)
chr2 (270-374)||(716125-716229)
chr2 (716-776)||(716532-716592)
chr2 (796-832)||(4076685-4076721)
chr2 (715-776)||(20892216-20892277)
chr2 (679-758)||(16286003-16286082)
[»] chr7 (21 HSPs)
chr7 (277-772)||(12856560-12857064)
chr7 (267-772)||(26050782-26051296)
chr7 (267-772)||(26060141-26060655)
chr7 (277-772)||(26055905-26056409)
chr7 (277-772)||(26065264-26065768)
chr7 (277-772)||(12851445-12851951)
chr7 (277-630)||(14610135-14610487)
chr7 (281-757)||(4181347-4181810)
chr7 (277-601)||(11056396-11056720)
chr7 (281-776)||(35352245-35352720)
chr7 (309-762)||(37459802-37460241)
chr7 (270-548)||(5436692-5436970)
chr7 (504-776)||(5440225-5440494)
chr7 (504-776)||(5449235-5449504)
chr7 (277-446)||(14615201-14615370)
chr7 (680-772)||(14610512-14610604)
chr7 (776-832)||(43264760-43264816)
chr7 (780-831)||(39780236-39780287)
chr7 (117-239)||(45715400-45715523)
chr7 (435-496)||(12239605-12239666)
chr7 (8-102)||(5462159-5462253)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (277-772)||(21275544-21276048)
chr6 (270-769)||(24509467-24509972)
chr6 (277-776)||(21936611-21937113)
chr6 (277-776)||(20752063-20752550)
chr6 (277-776)||(21937341-21937845)
chr6 (277-624)||(24508914-24509261)
chr6 (270-612)||(2887258-2887596)
chr6 (270-612)||(2888980-2889318)
chr6 (392-613)||(11183263-11183484)
chr6 (647-776)||(24508785-24508914)
chr6 (777-917)||(18819698-18819841)
chr6 (281-409)||(12909404-12909532)
chr6 (281-409)||(12934511-12934639)
chr6 (676-776)||(11183112-11183212)
chr6 (715-776)||(20752004-20752065)
chr6 (715-776)||(24508726-24508787)
chr6 (715-761)||(21936508-21936554)
chr6 (218-272)||(32209310-32209364)
chr6 (717-761)||(12909533-12909577)
chr6 (717-761)||(12934640-12934684)
chr6 (715-772)||(21936556-21936613)
chr6 (715-776)||(21937843-21937904)
[»] chr3 (34 HSPs)
chr3 (277-772)||(10672867-10673371)
chr3 (286-772)||(6852881-6853376)
chr3 (277-772)||(5481417-5481921)
chr3 (277-772)||(8464521-8465025)
chr3 (277-772)||(10591224-10591728)
chr3 (277-772)||(31076331-31076835)
chr3 (277-772)||(1302173-1302678)
chr3 (277-772)||(4049578-4050083)
chr3 (277-772)||(8458082-8458587)
chr3 (277-772)||(6857984-6858488)
chr3 (277-772)||(31081436-31081940)
chr3 (277-772)||(5457940-5458445)
chr3 (277-763)||(33702537-33703033)
chr3 (277-772)||(10677980-10678486)
chr3 (277-772)||(4054712-4055217)
chr3 (322-776)||(49784304-49784765)
chr3 (270-776)||(29827192-29827682)
chr3 (277-706)||(33703071-33703509)
chr3 (281-609)||(20890836-20891162)
chr3 (502-772)||(10584787-10585066)
chr3 (277-508)||(10586384-10586615)
chr3 (282-613)||(3187551-3187880)
chr3 (407-612)||(18024246-18024450)
chr3 (777-917)||(36614962-36615104)
chr3 (777-917)||(26905936-26906077)
chr3 (715-774)||(20891354-20891413)
chr3 (653-713)||(18024168-18024228)
chr3 (715-774)||(20891281-20891340)
chr3 (780-832)||(25069249-25069301)
chr3 (652-714)||(20891182-20891244)
chr3 (715-774)||(18024074-18024133)
chr3 (715-776)||(29827680-29827741)
chr3 (715-776)||(49784763-49784824)
chr3 (715-772)||(18023468-18023525)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (271-776)||(143861-144349)
[»] scaffold0223 (2 HSPs)
scaffold0223 (394-772)||(1948-2335)
scaffold0223 (277-441)||(7246-7410)
[»] scaffold0391 (2 HSPs)
scaffold0391 (277-469)||(16378-16570)
scaffold0391 (277-353)||(16283-16359)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (277-495)||(170589-170807)
scaffold0005 (492-776)||(173344-173622)
scaffold0005 (715-761)||(173620-173666)
[»] scaffold0756 (1 HSPs)
scaffold0756 (277-364)||(3916-4003)
[»] scaffold0592 (1 HSPs)
scaffold0592 (776-832)||(3616-3672)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 625; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 625; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 10341658 - 10340892
Alignment:
Q  8 gtcttaagaaacaatgcaagtttttatctttcaaggttttccggctatattcatatttcttctgatattcttcaaactgagttattagctatttatcaag 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10341658 gtcttaagaaacaatgcaggtttttaccttttaaggttttccggctatatttatatttcttctgatattcttcaagctgagttattagctatttatcaag 10341559  T
Q  108 gatcgttgttagcaaaaacgatagacattgatgaccttgtttgctactttgactccttacacaatgtagatctcataaaagtccatctatgaaatttcat 207  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10341558 gctcgttgttagcaaaaacgatggacattgatgaccttgtttgctactttgactccttacacaatgtagatctcataaaagtccatctatgaaatttcat 10341459  T
Q  208 gttgatgctattttgattcaaggcataaaagaattgatcgggcaaaacaatgtcactatttgttgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgca 307  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10341458 gttcatgctattttgattcaaggcataaaagaattgatcgggcaaaacaatgtcactatttgttgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgca 10341359  T
Q  308 tttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgt 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10341358 tttgaaacttgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcgcatgggattgccatactaacc-ttaggttcgattcgcccccaccaataactgt 10341260  T
Q  408 atattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagta 507  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  10341259 atattggatgcaataggagtgatcggcgaatccccttcatgatactatgagttccttgacgtgtattgcacaactacaccaagcgtatctcctaacaata 10341160  T
Q  508 ttttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaaca 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10341159 ttttacagatttatgattccagcaattcactcatgcattagagaatttatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaaca 10341060  T
Q  608 aaattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcac 707  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10341059 aaattctgtccaaaattgtatg-tttttatatgtccaactaatgcccaaatgccaagcatttatggtgcattatatgactcttcacatgagaaaaagcac 10340961  T
Q  708 ctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10340960 ctctttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacccttttgtcaaaggttatgatcatatacact 10340892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 26982309 - 26981813
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  26982309 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 26982210  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26982209 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 26982110  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  26982109 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 26982010  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaat-tgtgt---------gttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagca 666  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||         ||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||    
T  26982009 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaaaca 26981910  T
Q  667 tttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttat 763  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26981909 tttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 26981813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 279 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 43957280 - 43956777
Alignment:
Q  279 atcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaaccttt 378  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  43957280 atcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaattcaaagcgtatggggttgtcacactaaccttt 43957181  T
Q  379 aggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcac 478  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  43957180 aggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggattctatgagttctttgacgtgtattgcac 43957081  T
Q  479 aaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaa 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43957080 aaccacaccaagcgtatctcctaacagtgttttacaaatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaa 43956981  T
Q  579 tgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgt---------tttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcattt 669  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||         ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43956980 tgatgaagaattatgttgttaatgcaacaaaattatgt-ccaaattgtgtgtagttgtgtgtttttgtatgtccaactaatgcccaaatgtcaagcattt 43956882  T
Q  670 acagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcat 769  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  43956881 atagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcactcatttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacctttttgccaaaggttataatcat 43956782  T
Q  770 ataca 774  Q
    |||||    
T  43956781 ataca 43956777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 26987422 - 26986918
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||  ||| ||||| || ||||||||    
T  26987422 atatcttgtttgtagggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaacttaaagcgtatgtggttgccacactaacct 26987323  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26987322 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 26987223  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  26987222 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 26987123  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcat 667  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  26987122 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcat 26987023  T
Q  668 ttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatc 767  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  26987022 ttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataacc 26986923  T
Q  768 atata 772  Q
    |||||    
T  26986922 atata 26986918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Original strand, 34108000 - 34108506
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  34108000 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaaatcaaagcgtatggggttgccacactaacct 34108099  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34108100 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 34108199  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  34108200 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 34108299  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttg--tatgtccgactaatgcccaaatgtcaagc 665  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||  ||| | | |||||||||||||||||||||    
T  34108300 aatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatattcaactaatgcccaaatgtcaagc 34108399  T
Q  666 atttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34108400 atttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataa 34108499  T
Q  766 tcatata 772  Q
     ||||||    
T  34108500 ccatata 34108506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 286 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 14319039 - 14318544
Alignment:
Q  286 ttgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctttaggtttg 385  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  14319039 ttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcg 14318940  T
Q  386 attcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccaca 485  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14318939 attcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccaca 14318840  T
Q  486 ccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgaggga 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |    
T  14318839 ccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaa 14318740  T
Q  586 gaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtgc 676  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14318739 gaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtctcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgc 14318640  T
Q  677 attatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatata 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14318639 attatatgactcttcacatgagagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatata 14318544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 14315344 - 14314840
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  14315344 atattttgtttgttgggaagaagctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 14315245  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14315244 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaatagaaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 14315145  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  14315144 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 14315045  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcat 667  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  14315044 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtctcttcaactaatgcccaaatgtcaagcat 14314945  T
Q  668 ttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatc 767  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  14314944 ttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataacc 14314845  T
Q  768 atata 772  Q
    |||||    
T  14314844 atata 14314840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 281 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 18609057 - 18608575
Alignment:
Q  281 cttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctttag 380  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18609057 cttgattgttgggaagatgctgctgcacttgaaacctgaaaagtttgatggttatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgccacactaacctttag 18608958  T
Q  381 gtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaa 480  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18608957 gttcaattcgcccccaccaataattgtatattggatgaaataggaatgaccagtaaatccccttcaggataatatgagttccttgatgtgtattgcacaa 18608858  T
Q  481 ccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatg 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18608857 ccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatcgttccgtcaattaactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatg 18608758  T
Q  581 agggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtcc-gactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcatt 679  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||             ||||| |||| || ||  | ||||||| ||||| ||| |||||  ||||||||    
T  18608757 agggagaattatgttgttaatgtaacaaaattct-------------tgtttcttgtgtgcccaaattaatgcctaaatgccaaacatttgtagtgcatt 18608671  T
Q  680 atatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18608670 atatgac-cttcacatgagagaaaacacccctttaacttgaatcaatgttatggttcattaagcacccctttgccaaaggttatgaacatatacact 18608575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 270 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 25953599 - 25953099
Alignment:
Q  270 ttgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcata 369  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||| || |    
T  25953599 ttgttgtatatcttaattgttgggaagagactactgcacttgaaacctgaaaagtttgatggttaagcatgtaaaactcaaagtgcatggggttgccaca 25953500  T
Q  370 ctaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgt 469  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25953499 ctaacctttaagtacgattcgcccccaccaataactgtataatggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcagggtactatgagttccttgacgt 25953400  T
Q  470 gtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttaga 569  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25953399 gtattgcacaaccacacctagcgtatctcctaacagtattgtacatatttatggttcaagcaattcactcatgcattagacaattgatggatgatttaga 25953300  T
Q  570 gtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcattt 669  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||| | |        |||| ||| |||||    
T  25953299 gtatgagaatgatggagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaaattgtgttgttattgtttgtccaaat-------taatgccaaacattt 25953207  T
Q  670 acagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgcc-aaaggttatgatca 768  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  25953206 atagtgcattatatgaccattcacatgagagaaaacacccatttgacttaaatcaattttatggttcattaagcatccttttgccaaaatgttatgatca 25953107  T
Q  769 tatacact 776  Q
    ||||||||    
T  25953106 tatacact 25953099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 491 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 18494395 - 18494106
Alignment:
Q  491 cgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaatt 590  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||    
T  18494395 cgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaatt 18494296  T
Q  591 atgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaat---------tgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattat 681  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||| |         |||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18494295 atgttgttaatgtaacaaaattctatccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattat 18494196  T
Q  682 atgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatata 772  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18494195 atgactcttcacatgagagaaagcacct-tttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatata 18494106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 316 - 578
Target Start/End: Original strand, 18884874 - 18885136
Alignment:
Q  316 ctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattgga 415  Q
    |||||||||| || | |||||||  ||||||||||| |  ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  18884874 ctgaaaagtttaacggttatgcacataaaactcaaaacgtatggggttgccacactaacatttaggttcgattcgcccccaccaattactgtagattgga 18884973  T
Q  416 tgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacag 515  Q
    | ||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  18884974 ttcaatgggaatgaccagtgaacccccttcaggatactttaagttccttgatgtgtattgcacaatcacaccaagcatatctcttaacaggattttacag 18885073  T
Q  516 atttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaa 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18885074 atttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagagtaagagaa 18885136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 777 - 917
Target Start/End: Original strand, 45483380 - 45483522
Alignment:
Q  777 catgggcggaggcagcatgaaacatggtgtggcatatgccacaccagtttctaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--aatatgcataattcataagggaa 874  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     |||||||||||||||||||||||    
T  45483380 catgggcggaggcagcatgaaacatggtgtggcatatgccacaccagtttctaatctttttttttttttttttttttaatatgcataattcataagggaa 45483479  T
Q  875 aggcttggcacgggggagatagaaattgaaaattgaaaaacat 917  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45483480 aggcctggcacggggaagatagaaattgaaaattgaaaaacat 45483522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 536 - 602
Target Start/End: Original strand, 1781869 - 1781935
Alignment:
Q  536 actcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatg 602  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1781869 actcatgaattagagaattggtggatgattttgagtaagagaatgagggataattatgttgttaatg 1781935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 647 - 745
Target Start/End: Original strand, 1781968 - 1782066
Alignment:
Q  647 taatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcac 745  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||| |||  |||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1781968 taatgtccaaatgtcaaacatttatagtgcagtatacgacctttcacatgagagaaaatactattttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcac 1782066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 38201921 - 38201786
Alignment:
Q  135 ttgatgaccttgtttgctactttgactccttacacaatgtagatctcataaaag-tccatctatgaaatttcatgttgatgctattttgattcaaggcat 233  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||| |||||| ||  | |||||||||||| | |||| || || ||||||||| | | | |||||||||||| |||    
T  38201921 ttgatgagcttgtttgctattctgactcattacacgatacaaatctcataaaaggttcatccataaagtttcatgttcacgatgttttgattcaagacat 38201822  T
Q  234 aaaagaattgatcgggcaaaacaatgtcactatttg 269  Q
    |||  ||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  38201821 aaagaaattgatcgagcaaaacaatatcaccatttg 38201786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 715 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 18608577 - 18608534
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaag 758  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18608577 acttgaatcactgctatggttcatcaagcacccctttgccaaag 18608534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 32429717 - 32429218
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  32429717 atatcttgattgttgggaagatgtggctgcacttgaaacctgaaaattttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccacactaacct 32429618  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatg-agtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattg 475  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32429617 ttaggttcgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataaggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattg 32429518  T
Q  476 cacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaaga 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32429517 cacaaccacacaaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttagagtaaga 32429418  T
Q  576 gaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtg 675  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  32429417 gaatgagggagaattatgttgttaatccaacaaaattctgtccaaaattgtgtg-ttgttgtgtgtccaactaatgcacaaatgccaagcatttatagtg 32429319  T
Q  676 cattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacac 775  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  32429318 cattatatgactcttcaaatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccctttgtcaaaggttatgatcatatacac 32429219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Original strand, 35095799 - 35096303
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  35095799 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 35095898  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35095899 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 35095998  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  35095999 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 35096098  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcat 667  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  35096099 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcat 35096198  T
Q  668 ttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatc 767  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  35096199 ttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataacc 35096298  T
Q  768 atata 772  Q
    |||||    
T  35096299 atata 35096303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 279 - 772
Target Start/End: Original strand, 35090688 - 35091190
Alignment:
Q  279 atcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaaccttt 378  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||||||||| || ||||||||||    
T  35090688 atcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaatttaaagtgtatggggttgccacactaaccttt 35090787  T
Q  379 aggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcac 478  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35090788 aggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcac 35090887  T
Q  479 aaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaa 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  35090888 aaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaa 35090987  T
Q  579 tgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgt----------tttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatt 668  Q
    |   |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||          ||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||    
T  35090988 ttttgatgaattatgttgttaatgtaacaaaattctgt-ccaaattgtgtgtagttgtatggtttttgtctcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatt 35091086  T
Q  669 tacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatca 768  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  35091087 tatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataacca 35091186  T
Q  769 tata 772  Q
    ||||    
T  35091187 tata 35091190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 278 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 30020282 - 30019773
Alignment:
Q  278 tatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctt 377  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||    
T  30020282 tatcttgattgttgagaagatgctgttgcacttgaaacctgaaaagttcaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttaccatattaacctt 30020183  T
Q  378 taggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatg-agtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30020182 t-ggttcgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataaggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 30020084  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30020083 ataaccacaccaaacgtatctcctaacagtatttcacatatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagag 30019984  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgtt------------ttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaag 664  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||            | || | ||||  ||||||||||||||| |||     
T  30019983 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaaattgtgtgttgttgtgttgttctgttctctgtcaaactaatgcccaaatgccaaa 30019884  T
Q  665 catttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatg 764  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30019883 catttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaagcacccatttgacttgaatc-atgttatggttcattaagcacctttttgccaaaggttatg 30019785  T
Q  765 atcatatacact 776  Q
    |||||| |||||    
T  30019784 atcatacacact 30019773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 270 - 776
Target Start/End: Original strand, 18670605 - 18671109
Alignment:
Q  270 ttgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcata 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| || |    
T  18670605 ttgttgtatatcttgattgttgggaagttgctgctgcacttgaaacctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaattcaaagcgcatggagttgccaca 18670704  T
Q  370 ctaacctttaggtttgattcgc-ccccaccaataactgtatattggatgcaatatg-agtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgac 467  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  18670705 ctaacctttaggttcgattcacaccccaccaataactatatattgaatgcaataaggaatgaccggcgaatccc-ttcaggatactatgagttccttca- 18670802  T
Q  468 gtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgattta 567  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18670803 -tgtattgcacaaccacaccaagtgtatctcctaacaatattttacagatttatggttccaacaagtcactcatgcattagagaattgatggatgattta 18670901  T
Q  568 gagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtcc-gactaatgcccaaatgtcaagca 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      ||  ||| ||| |||| |||||  | |||| |||||||| ||||||    
T  18670902 gagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacataattctggtttctat--tgtctttgttgtgtgtccaaattaattcccaaatgccaagca 18670999  T
Q  667 tttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgat 766  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |    
T  18671000 tttatagtccattatatgacccttcacatgagagaaagcacccatttgacttgaatcaatgctatggttcattaagccctcttttaccaaaggttatctt 18671099  T
Q  767 catatacact 776  Q
    ||||||||||    
T  18671100 catatacact 18671109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 270 - 616
Target Start/End: Original strand, 18716250 - 18716599
Alignment:
Q  270 ttgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcata 369  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  18716250 ttgttgtatatcttgattgttgggaagatgctgctgcacttgaaacctgaaaagtttaatggtaatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccaca 18716349  T
Q  370 ctaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatat-gagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacg 468  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  18716350 ctaacctttaggttcgattcgcccccaccaataactatatattggatgcaataaagaatgaccggcgaatccccttcaggatactaagagttctttgacg 18716449  T
Q  469 tgtattgcacaaccaca--ccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgattt 566  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18716450 tgtattgcacaaccacacaccaagcgtatcttctaatagtattttacagatttatggttccagcaattcactcttgtattagagaattgatggatgattt 18716549  T
Q  567 agagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgt 616  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18716550 agagtaagagaatgggggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgt 18716599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 277 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 34279925 - 34279438
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttc-aatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacc 375  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  34279925 atatcttgtttgtagggaagaggcggctgcacttgaaacctgaaacgttttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatgggattgtcacactaacc 34279826  T
Q  376 tttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattg 475  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||  || |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34279825 tttagcttcgattcgcccccaccaataactgtatattgaatgcaataggaatgaccgacgattccccttcaaaatactatgagtttcttgacgtgtattg 34279726  T
Q  476 cacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaaga 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34279725 cacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggtttcaggaattcactcatgcattagagaattgatggttgatttagagtaaga 34279626  T
Q  576 gaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtg 675  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||              |||| | ||| ||||  | |||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  34279625 gaacgaggaagaattatgttgttaatgtaacaaaattc-------------atgttctgtgtgtgtcaaattaatgctcaaatgtcgagcatttatagtg 34279539  T
Q  676 cattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacac 775  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34279538 cattatatgacccttcacatgagagaaaacactcatttgacttgaatcaatgttatggttaattgaacacccttttaccaaaggttatgatcatatacac 34279439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 270 - 616
Target Start/End: Original strand, 18736923 - 18737272
Alignment:
Q  270 ttgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcata 369  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| | || |    
T  18736923 ttgttgtatatcttgattgttgggaagatgctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatgaggtagccaaa 18737022  T
Q  370 ctaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatat-gagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacg 468  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18737023 ctaacctttaggttcaattcgcccccaccaataactatatattagatgcaataaagaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacg 18737122  T
Q  469 tgtattgcacaaccaca--ccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgattt 566  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18737123 tgtattgcacaaccacacaccaagcgaatcttctaaaagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgaattagagaattgatggatgattt 18737222  T
Q  567 agagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgt 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18737223 agagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgt 18737272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 308 - 776
Target Start/End: Original strand, 47071211 - 47071670
Alignment:
Q  308 tttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgt 407  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||| | |||||| |||    
T  47071211 tttgaaacctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccacactaacctttaggttcgattcacccc-atcaataattgt 47071309  T
Q  408 atattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagta 507  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||    
T  47071310 atatttgatgcaatatgaatgaccagcgaatccccttcatgatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacaccaatcatatctcatatcagta 47071409  T
Q  508 ttttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaaca 607  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47071410 ttttacaaatttatggttcaaacaattcactcattcattagagaattgatagataatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaaca 47071509  T
Q  608 aaattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtcc-gactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttc------acatgagag 700  Q
    ||||           || ||   || |||| |||||  | |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||      |||||||||    
T  47071510 aaat-----------ttctg---ttcttgt-tgtccaaattaatgcccaaatgttaaacatttatagtacattatatgacccttcacatgaacatgagag 47071594  T
Q  701 aaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47071595 aaaacacttttttgacttgaatcaatgcaatggttcattaagcatccatttgccaaaggttatgatcatatacact 47071670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 271 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 3425139 - 3424698
Alignment:
Q  271 tgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatac 370  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  3425139 tgttgtatatcttgattgttgggaagattgtgttgcacttgaaacctgaaaagtttaattattatgcatgcaaaactcaaagcgcatgggattgtcacac 3425040  T
Q  371 taacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 470  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| | | ||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  3425039 taacctttaggttcgattctcccccaccaataactgaatattggatgcaataggaatgaacagcgaatctcctttaggatactatgagttcattgatgtg 3424940  T
Q  471 tattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagag 570  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3424939 tattgcacaaccacaccaaccgtatctcctaacagtattttacagatttatgtttccagtaactcactcatgcattagagaattaatggatgatttagag 3424840  T
Q  571 taagagaatgagggaga-attatgttgttaatgcaac-aaaattctgtacaaaattgtgtgtt-ttttgtatgtc-cgactaatgcccaaatgtcaagca 666  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| | ||| |||||| ||| ||    ||| |||| || ||| ||||   | |||||||||||| ||||  |    
T  3424839 taagagaatgagggagatcttatgttgttaaagtaacaaaaattttgttca----tgt-tgttgttctgtttgtctaaattaatgcccaaatatcaaata 3424745  T
Q  667 tttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctcttt 713  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  3424744 tttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacaccccttt 3424698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 341 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 54859525 - 54859102
Alignment:
Q  341 taaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatcc 440  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||  ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| || | ||| | ||| ||    
T  54859525 taaaactcaaagcgcatggggttgccacactaacctttatgttcaattcgtccc-accaataattgtatattggatgcaataggaattaccagcgaaacc 54859427  T
Q  441 ccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactca 540  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  54859426 ccttcatgataatatgagttccttgatgtgtattacacaactacaccaaacgtatctcctaacagtattttacggatttatggttccagcaattcactcg 54859327  T
Q  541 tgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgttttttg-tat 639  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    ||          ||||| | | |    
T  54859326 tgcattagagaattgatggatgatttagagcaagagaatgagggagaatcatgttgttaatgtgacaaaattc----ca----------tttttggttgt 54859241  T
Q  640 gtcc-gactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagca-cctctttgacttgaatcaatgctatggttca 737  Q
    ||||  | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  54859240 gtccaaattaatgcccaaatatcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacaccccctttgacttgaatcaatgttatggttca 54859141  T
Q  738 ttaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54859140 ttaagcatccatttgccaaaggttatgatcatatacact 54859102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 270 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 3415592 - 3415333
Alignment:
Q  270 ttgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcata 369  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||| || |    
T  3415592 ttgttgtatatcttgattgttgggaagatgttgttgcacttgaaacctgaaaagtttaattatcatgcatgtaaaactcaaagcgcatgggattgccaca 3415493  T
Q  370 ctaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgt 469  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||   ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  3415492 ctaacctttaggttcaattcgcccccaccaataactgtatattggatgtaataggaatgaccaacgaatctccttcaggatactatgagttcattgatgt 3415393  T
Q  470 gtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccag 529  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3415392 gtattgcacaaccacaccaaccgtatctcctaatagtattttacagatttatggttccag 3415333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 405 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 34128542 - 34128203
Alignment:
Q  405 tgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaaca 504  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| |  |||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  34128542 tgtatattggatgcaaaaggaatgaccagcaaatctccttcaggatactatgagtttcatgaggtgtattgcacaaccacaccaaacatatctcctaacc 34128443  T
Q  505 gtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgca 604  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34128442 atattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagaaaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgca 34128343  T
Q  605 acaaaattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaag 704  Q
    ||||||||||             ||||| ||   ||||  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  34128342 acaaaattct-------------tgtttctt-agtgtcaaattaatggccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacattagagaaaa 34128257  T
Q  705 cacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggtt 761  Q
    |||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  34128256 cactcatttgacttgaatcaatgttatagttcattaag---ccttttgccaaaggtt 34128203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 277 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 14646701 - 14646483
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||  || ||| ||||    
T  14646701 atatcttgattgttaggatgaagctgctgcacttgaaatctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaacttaaagctcatggggtttccacactgacct 14646602  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14646601 ttaggttcgatttgcccccactaataactgtatattggatgcaataggaatgacccgcgaatcccctttaggatactatgagttccttaatgtgtattgc 14646502  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtat 495  Q
    | |||||||||||||||||    
T  14646501 agaaccacaccaagcgtat 14646483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 492 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 14643948 - 14643670
Alignment:
Q  492 gtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaatta 591  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14643948 gtatcccctaacagtattttagagatttatggttccagcaattcacctatacattagagaattgatggatgatttagagtaagagaattaggaagaatta 14643849  T
Q  592 tgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttc 691  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |      || ||| |||| | |||||   | |||||| ||||| |||| |||||| || |||||||||||| ||||    
T  14643848 tgttgttgatgtaacaaaattcttt-----tttctgtattttgt-tatgttaaattaatgcacaaatatcaaacatttatagcgcattatatgacccttc 14643755  T
Q  692 acatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14643754 acatgatagaaaacacccatttgacttgaatcaatgctaaggttcattaaacactcctttgtcaaatgttatgatcatatacact 14643670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 647 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 3409662 - 3409533
Alignment:
Q  647 taatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacc 746  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3409662 taatgcccaaatgtcaaatatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacactcctttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacc 3409563  T
Q  747 cttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409562 cctttgccaaaggttatgatcatatacact 3409533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Original strand, 9789808 - 9790054
Alignment:
Q  8 gtcttaagaaacaatgcaagtttttatctttcaaggttttccggctatattcatatttcttctgatattcttcaaactgagttattagctatttatcaag 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| | | |||||  |||||| ||||| |||||| |||||     ||  ||| |||  ||||||||| | ||    
T  9789808 gtcttaagaaacaatgcaggtttttaccttttaggattttctagctataatcataattcttcagatat-----aagttgaattaccagctatttaccgag 9789902  T
Q  108 gatcgttgttagcaaaaacgatagacattgatgaccttgtttgctactttgactccttacacaatgtagatctcataaaa-gtccatctatgaaatttca 206  Q
    |   | ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || || | |||||||||||    
T  9789903 gtatggtgttagctaaaactatagacattgatgagctggttcgctactttgactccttacacggtatagatctcataaaaggtacacccatgaaatttca 9790002  T
Q  207 tgttgatgctattttgattcaaggcataaaagaattgatcgggcaaaacaat 258  Q
    |||| ||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9790003 tgttcatgcagttttgattcaagacataaaagatttgatcgagcaaaacaat 9790054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 564 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 25618435 - 25618232
Alignment:
Q  564 tttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgttttttgta---tgtccgactaatgcccaaatgt 660  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||       || ||| ||| |||||   | ||  |||||||||||||||     
T  25618435 tttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaacaaaattttggt-----ttatgtttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgc 25618341  T
Q  661 caagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggt 760  Q
    |||||||||| |||||||||||||||       |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||| ||||||    
T  25618340 caagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacacctctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagcatccagttgcgaaaggt 25618248  T
Q  761 tatgatcatatacact 776  Q
    ||||||||||||||||    
T  25618247 tatgatcatatacact 25618232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 647 - 776
Target Start/End: Original strand, 22118855 - 22118986
Alignment:
Q  647 taatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaa--gcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagca 744  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  22118855 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtatattatatgacccttcacatgagagaaaatacacccctttgacttgaatgaataatatggttcattaagca 22118954  T
Q  745 cccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||| |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  22118955 cccctttgccgaaggttgcgatcatatacact 22118986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 277 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 34128649 - 34128560
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtc 366  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  34128649 atatcttgattgttgggaagagactgctgcacttgaaaccttaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagtgcatagggttgtc 34128560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 678 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 34602061 - 34601967
Alignment:
Q  678 ttatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatata 772  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||| |||   ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  34602061 ttatatgaccattcacatgagaaaaaacactcatttgacttgaatcaatgctatagttcattaaacatccatttgtcaaaggttatgatcatata 34601967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 715 - 776
Target Start/End: Original strand, 18671107 - 18671168
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18671107 acttgaatcaatgttatggttcattaagcaccattttgccaaaggttataaccatatacact 18671168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 711 - 776
Target Start/End: Original strand, 18716694 - 18716759
Alignment:
Q  711 tttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18716694 tttgacttgaatcaatgatatggttcattaagctctcttttaccaaaagttatgatcatatacact 18716759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 711 - 776
Target Start/End: Original strand, 18737367 - 18737432
Alignment:
Q  711 tttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18737367 tttgacttgaatcaatgatatggttcattaagctctcttttaccaaaagttatgatcatatacact 18737432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 715 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 25618234 - 25618173
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  25618234 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacact 25618173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 55236887 - 55236655
Alignment:
Q  8 gtcttaagaaacaatgcaagtttttatctttcaaggttttccggctatattcatatttcttctgatattcttcaaactgagttattagctatttatcaag 107  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||| |||||| | ||||| || |||||| | | ||| |||||||||||||||  ||||||| | || |||||||| |    
T  55236887 gtcttaaggaattatgctagtttttacctttcaggattttcaggttatatttacaattcctctgatattcttcaagttgagttacttgccatttatcagg 55236788  T
Q  108 gatcgttgttagcaaaaacgatagacattgatgaccttgtttgctactttgactccttacacaatgtagatctcataaaa-gtccatctatgaaatttca 206  Q
    |    ||| |||| ||| ||||  |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||   | || ||||||||||| ||||  |||||||||  ||    
T  55236787 gcctcttgctagccaaatcgatgaacattgatgcacttgtttgctactctgattccttacatggtataaatctcataaaaggtcctcctatgaaatacca 55236688  T
Q  207 tgttgatgctattttgattcaaggcataaaaga 239  Q
    |||| ||||| | |||||||||| |||||||||    
T  55236687 tgttcatgctgtgttgattcaagacataaaaga 55236655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 714 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 3424300 - 3424251
Alignment:
Q  714 gacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttat 763  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3424300 gacttaaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaaggttat 3424251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 715 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 32429220 - 32429159
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  32429220 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacact 32429159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 534 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 34602121 - 34602060
Alignment:
Q  534 tcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgtt 595  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  34602121 tcactcatgcataagaaaattgatggatgatttagagtaaaagaatgagggagaattgtgtt 34602060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 715 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 3409535 - 3409487
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttat 763  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3409535 acttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgccaaaggttat 3409487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 715 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 14643672 - 14643626
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggtt 761  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14643672 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcacccttttgccaaaggtt 14643626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 715 - 761
Target Start/End: Original strand, 22118984 - 22119030
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggtt 761  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22118984 acttgaatcaatgctaaggttcattaagcacccatttgccaaaggtt 22119030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 715 - 761
Target Start/End: Original strand, 47071668 - 47071714
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggtt 761  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47071668 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacccatttgccaaaggtt 47071714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 715 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 54859104 - 54859058
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggtt 761  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54859104 acttgaatcaatgttatgtttcattaagcacccttttgccaaaggtt 54859058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 531 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 3409781 - 3409707
Alignment:
Q  531 aattcactcatgtattagagaatt----gatggatgatttagagtaagagaatgagggaga-attatgttgttaa 600  Q
    |||||||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3409781 aattcactcatgcattagagaattaatatatggatgatttagagtaagagaatgagggagatcttatgttgttaa 3409707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 715 - 776
Target Start/End: Original strand, 18716757 - 18716818
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  18716757 acttgaatcaatgttatggttcattaagcactatttggccaaaggttataaccatatacact 18716818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 715 - 776
Target Start/End: Original strand, 18737430 - 18737491
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  18737430 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacaatttagccaaaggttataacaatatacact 18737491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 715 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 34279440 - 34279379
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    |||| |||||||| || |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34279440 acttaaatcaatgttaaggtttattaagcactcatttgccaaaggttataatcatatacact 34279379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 496
Target Start/End: Original strand, 48779837 - 48779902
Alignment:
Q  431 cggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatc 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||||||  |||||||||| ||||    
T  48779837 cggtgaatccccttcaggatactatgaaatcattgacgtgacttgcacattcacaccaagcatatc 48779902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 715 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 34279381 - 34279339
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaa 757  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  34279381 acttgaatcaatgctaaggttcattaagcacccatttgtcaaa 34279339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 721 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 34601965 - 34601928
Alignment:
Q  721 atcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaag 758  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34601965 atcaatgttatggttcattaagcacccctttgccaaag 34601928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 270 - 776
Target Start/End: Original strand, 43358515 - 43359022
Alignment:
Q  270 ttgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcata 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |    
T  43358515 ttgttgtatatcttgattgttgggaagatgctgttgcacttgaaacctgaaaagtttaatgattatgcatgtaaaactcaaagcgcatgaggttgccaca 43358614  T
Q  370 ctaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactat--gagttccttgac 467  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  43358615 ctaacatttaggttcgatttgcccccaccaataactgtatattggatgcaataggagtgaccggcgaatccccttcagaatactatatgagttccttgac 43358714  T
Q  468 gtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgattta 567  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  43358715 gtgtattgcacaaccacaccaaacatatctcctaacaattttttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggataattta 43358814  T
Q  568 gagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcat 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  43358815 gagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaacaaaattcagtccaaaattgtgtg-ttgtagtgtgtccaactaatgcccaaatgccaagcat 43358913  T
Q  668 ttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatc 767  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43358914 ttatagtgcattataggactcttcacatgagagaaagcactcatttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacccctttgccaaaggttatgatc 43359013  T
Q  768 atatacact 776  Q
    |||||||||    
T  43359014 atatacact 43359022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Original strand, 28598080 - 28598584
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  28598080 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 28598179  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28598180 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 28598279  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  28598280 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 28598379  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcat 667  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  28598380 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcat 28598479  T
Q  668 ttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatc 767  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  28598480 ttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataacc 28598579  T
Q  768 atata 772  Q
    |||||    
T  28598580 atata 28598584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Original strand, 28574068 - 28574572
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||| || ||||||||    
T  28574068 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaacttaaagcgtatggggttgccacactaacct 28574167  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28574168 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 28574267  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  28574268 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 28574367  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcat 667  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  28574368 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcat 28574467  T
Q  668 ttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatc 767  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  28574468 ttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataacc 28574567  T
Q  768 atata 772  Q
    |||||    
T  28574568 atata 28574572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 271 - 776
Target Start/End: Original strand, 13654100 - 13654588
Alignment:
Q  271 tgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatac 370  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||| || ||    
T  13654100 tgttagatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgcttacgcatgtaaaattcaaagcgcatggggttgccacac 13654199  T
Q  371 taacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13654200 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataggagttaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 13654299  T
Q  471 tattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgattt--ag 568  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||    
T  13654300 tattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattaatggatgatttagag 13654399  T
Q  569 agtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatt 668  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||               | |||     |||| |||| |||    
T  13654400 agcaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctatccaaaattgtgtgt---------------caaat----taatgccaagtatt 13654480  T
Q  669 tacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatca 768  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  13654481 tatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgccaagggttatgatca 13654580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 277 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 10187009 - 10186506
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  10187009 atatcttgatttttgagaagatgctgttgcacttgaaacctgaaaagtttaatgattatacatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccacactaacct 10186910  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10186909 ttaggttcgattcgcccccaccaataattgtatattggatgcaatagaaatgaccagtgaatcc-------gatactatgagttccttgacgtgtattgc 10186817  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaaca----gtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagta 572  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10186816 acaaccacaccaaacgtatctcctaacaatatttattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagta 10186717  T
Q  573 agagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtccg-------actaatgcccaaatgtcaagc 665  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||  || ||||   || |       | ||||||||||||||||| |    
T  10186716 agagaatgatggagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaaattatgttgttattgttcttctgtgttcaaattaatgcccaaatgtcaaac 10186617  T
Q  666 atttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatga 765  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10186616 atttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaagcacccatttgacttgaaccaatgctatggttcattaagcacccctttgtcaaaggttatga 10186517  T
Q  766 tcatatacact 776  Q
    |||||||||||    
T  10186516 tcatatacact 10186506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 309 - 776
Target Start/End: Original strand, 19310628 - 19311092
Alignment:
Q  309 ttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgta 408  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  19310628 ttgaaacctgaaaagtttaatggttatgcatgtgaaactcaaagcgcatggggttgcaacactaacctttaggttcgattcacccccaccaataactcta 19310727  T
Q  409 tattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtat 508  Q
    |||||||||||||| || ||||| | |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |    
T  19310728 tattggatgcaataggaatgaccagcgaatcccctt-agtatattatgagttccttgacgtgtattgcacaaccgcaccaagcatatctcctaatagtgt 19310826  T
Q  509 tttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaa 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19310827 tttacagatttatggttccagcaattcattcatgcattagagaattgatggatgatttatagtaagagaatgagggagaattatattgttaatgtaacaa 19310926  T
Q  609 aattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacc 708  Q
    || ||||| ||||||| |||   |||||  ||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19310927 aactctgtccaaaattatgttgcttttg--tgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattacatgacccttcacatgagagaaagcacc 19311024  T
Q  709 tctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
     |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19311025 cctttgacttgaatcaatgttatagttcattaagcacccttttaccaaaggttatgatcatatacact 19311092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 270 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 44524458 - 44523971
Alignment:
Q  270 ttgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcata 369  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  44524458 ttgttgtatatcttgattgttgggaagatgctgctgcacttgaaacctgaaaagtgtaatggttatgcatgcaaaactcaaagcgcatggggttgtcaca 44524359  T
Q  370 ctaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgt 469  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  44524358 ctaacatttag-ttcgattcgcccccatcaataactgtatattggatgcaataggaatgatcgacgaatccccttcggaatactatgagttccttgatgt 44524260  T
Q  470 gtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttaga 569  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  44524259 gtattgcacaaccaca---agcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttaaa 44524163  T
Q  570 gtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcattt 669  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| || ||||   ||  | ||||||||||||||||| |||||    
T  44524162 gtaagagaatgatggagaattatgttgttaatgcaacaatattctgttc-aaattgtgtg-ttgttgttgttcaaattaatgcccaaatgtcaaacattt 44524065  T
Q  670 acagtgcattatatgactcttcac--atgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggtt 761  Q
    | ||||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  44524064 atagtgcattatatgacccttcacatatgagggaaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcacccctttgacaaaggtt 44523971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 303 - 776
Target Start/End: Original strand, 1187624 - 1188090
Alignment:
Q  303 ctgcatttgaaacct-gaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctttaggtttgattcgcccccaccaat 401  Q
    ||||| ||||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1187624 ctgcacttgaaacctagaaaaatttaatagttatgcatgtaaaactcaaagtgcatggggttgccacactaacctttaggtttgattcgcccccaccaat 1187723  T
Q  402 aactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctccta 501  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1187724 aactgtatattggatgcaataggaaagaccagcgaatctccttcatgatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctccta 1187823  T
Q  502 acagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaat 601  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1187824 acaatattttacagatttatggttctaccaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttagagtaagagaatga-ggagatttatgttgttaat 1187922  T
Q  602 gcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagaga 701  Q
    | |||||||||||        || |||||||| | | ||||  | ||||||||||||| |||||| |||   || ||||||||||||| ||||||||||     
T  1187923 gtaacaaaattct------tgttctgtgttttgt-tgtgtcaaattaatgcccaaatggcaagcacttattatggattatatgactctacacatgagagt 1188015  T
Q  702 aagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1188016 aaacacccctttgacttgaattaatgttatggttcattaaacacccatttgccaaaggttatgatcatatacact 1188090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 309 - 630
Target Start/End: Original strand, 3465276 - 3465596
Alignment:
Q  309 ttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgta 408  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  3465276 ttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgtccccaccaataaatgta 3465375  T
Q  409 tattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtat 508  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3465376 tattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtat 3465475  T
Q  509 tttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaa 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||||| |||||    
T  3465476 tttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaa 3465575  T
Q  609 aattctgtacaaaattgtgtgt 630  Q
    |||||||| | |||||||||||    
T  3465576 aattctgt-ccaaattgtgtgt 3465596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 281 - 776
Target Start/End: Original strand, 16050981 - 16051464
Alignment:
Q  281 cttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctttag 380  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||| || ||||||||||||    
T  16050981 cttgattgttgggaagatgctgctgcacttgaaacctgaaaaatttaatggttatgcatgtaaaactcagagcgcacggggttgccacactaacctttag 16051080  T
Q  381 gtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaa 480  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  16051081 gttcgattcgcccccaccaataactgtatatttgatgcaaaatgaatgactagcgaatacccttcaagatactatgagttccttgatgtgtattgcacag 16051180  T
Q  481 ccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatg 580  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16051181 ccacaccaagcgtatttcctaacagtattttacagatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttaaagtaagaaaatg 16051280  T
Q  581 agggagaattatg-ttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtcc-gactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcat 678  Q
    ||  ||||  |||   ||||||| |||||||||||             |||| ||  | |||||  | ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16051281 agtaagaa-aatgagggttaatgtaacaaaattct-------------tgttcttgttgtgtccaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcat 16051366  T
Q  679 tatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16051367 tatatgaccattcacatgagtgaaaacacccttttgacttgaatcaatgatatggttcattaagcactcatttgccaaatgttatgatcatatacact 16051464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 449 - 772
Target Start/End: Original strand, 3468010 - 3468343
Alignment:
Q  449 atactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattag 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3468010 atactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattag 3468109  T
Q  549 agaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaat-tgtgt---------gttttttgta 638  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||         ||||||||||    
T  3468110 agaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgta 3468209  T
Q  639 tgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcat 738  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||    
T  3468210 tcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacatctttaacttgaatcaatgtcatgattcat 3468309  T
Q  739 taagcacccttttgccaaaggttatgatcatata 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3468310 taagcacccttttgccaaaggttataaccatata 3468343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 270 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 48366491 - 48366213
Alignment:
Q  270 ttgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcata 369  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |  |||| |||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  48366491 ttgttgtatatcttgatcgttgggaagatgttgttgcacttgaaacctgaaaaatctaatggttatgcatgtaaa-ctcaaagcgcatggggttgccata 48366393  T
Q  370 ctaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatg-agtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacg 468  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  48366392 ccaacctttaggttcgatttgcccccaccaataattgtatattggatgcaataaggaatgaccggcgaatccccttgaggatactatgaggtccttgacg 48366293  T
Q  469 tgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattag 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  48366292 tgtattgcacaaccacaccaagcgtatctccaaacaatattttacagatttatggttccagcaattcactaatgcattag 48366213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 270 - 548
Target Start/End: Original strand, 29681355 - 29681632
Alignment:
Q  270 ttgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcata 369  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  29681355 ttgttgtatatcttgatcgttgggaagatgctgttgcacttgaaacctgaaaaatctaatggttatgcatgtaaa-ctcaaagcgcatggggttgccata 29681453  T
Q  370 ctaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatg-agtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacg 468  Q
    | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||  |||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  29681454 ccaacctttaggttcgatttgcccc-accaataactgtatattggatgcaataaggaatgaccggcaaatccctttgaggatactatgaggtccttgacg 29681552  T
Q  469 tgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattag 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  29681553 tgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacaatattttacagatttatggttccagcaattcactaatgcattag 29681632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 517 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 21431865 - 21431606
Alignment:
Q  517 tttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct-g 615  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21431865 tttatggttccatcaattcactgatgcattagagaattgatggatgatttagattaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttg 21431766  T
Q  616 tacaaaattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagca-cctctttg 714  Q
    | |    || | |||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  21431765 ttcttgttt-tctgttgttc-tctgtccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaagcaccccctttg 21431668  T
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21431667 acttaaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatacacact 21431606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 270 - 466
Target Start/End: Original strand, 35624781 - 35624977
Alignment:
Q  270 ttgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcata 369  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  35624781 ttgttgtatattttgattgttcggaagatgctactgcacttgaaacatgaaaaatttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcgtggggttgtcata 35624880  T
Q  370 ctaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttga 466  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35624881 ctaacctttaggttcgattcgcccccaccaacaactgtatattggatgcaataggagtgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttga 35624977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 474 - 615
Target Start/End: Original strand, 35626140 - 35626281
Alignment:
Q  474 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaa 573  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35626140 tgcacaaccacatcgaacgtatctcctaatagtattttatagatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaa 35626239  T
Q  574 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctg 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35626240 gagaatgagggagaattatgttgttaatgtaacaaaattctg 35626281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 504 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 17414742 - 17414633
Alignment:
Q  504 agtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 603  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17414742 agtattttccagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgt 17414643  T
Q  604 aacaaaattc 613  Q
    ||||||||||    
T  17414642 aacaaaattc 17414633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 270 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 21432105 - 21431918
Alignment:
Q  270 ttgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcata 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||| || |    
T  21432105 ttgttgtatatcttgattgttgggaag-tgttactgcacttgaaacctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaatcgcatgaggttgccaca 21432007  T
Q  370 ctaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaat-atgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatga 457  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21432006 ctaacttttagattcgattcacccccaccaataactatatattgtttgcaataaggaatgaccggtgaatccccttctggatactatga 21431918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 319 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 17415576 - 17415386
Alignment:
Q  319 aaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgc 418  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||   |||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  17415576 aaaagtttaatggttatgcacgtaaaaatcaaagtgtatggggttgtcacactaacatttaggttcgatttgcccccaccaataattgtatattggatga 17415477  T
Q  419 aatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtatt 509  Q
    |||| || |||||    ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| || |||||||| | |||||| ||||| ||||    
T  17415476 aataggaatgaccatcaaatcctcttcaggatactattagtttcttgatgtgtattgcataatcacaccaatcatatctcttaacaatatt 17415386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 306 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 3696702 - 3696403
Alignment:
Q  306 catttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctttaggtttgattcgcccccaccaataact 405  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| |||| |    
T  3696702 catttgaaatcaaaaaagtttaataattatacatataaaactcaaa----at-gggttgtcatactaacctttaggtttgatgcttctccaccgataatt 3696608  T
Q  406 gtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacag 505  Q
    | ||||||||||||||| || ||| |  | |||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||| || ||||| |||| |||  ||||||| |||| |    
T  3696607 gaatattggatgcaata-gaatgatcaataaatctccttcaagatactatgaattccttga--tgtgtttcacaatcacagcaaaagtatctcttaaccg 3696511  T
Q  506 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag-aatgagggagaattatgttgttaatgca 604  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||||||||||||||| || | ||| ||||   ||||||| ||||||||||| |    
T  3696510 tattttaca-aattatggttccatcaattcattcattctgcagagaattgatggatgatttatagaatgagaaatggaagagaattgtgttgttaatgta 3696412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 647 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 35653307 - 35653178
Alignment:
Q  647 taatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacc 746  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |  ||  |||||||| |||||||||||||||| |||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  35653307 taatgcccaaatgtcaagtgtttataaggctatatatgacccttcacatgagagaaaacactcatttgaattgaatcaatgatatggttcattaagcact 35653208  T
Q  747 cttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35653207 cctttgtcaaaggttatgatcatatacact 35653178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 715 - 776
Target Start/End: Original strand, 10185907 - 10185968
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10185907 acttgaatcaatgatatggttcattaagcacctttttgccaaaggttataaccatatacact 10185968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 780 - 832
Target Start/End: Original strand, 1014055 - 1014107
Alignment:
Q  780 gggcggaggcagcatgaaacatggtgtggcatatgccacaccagtttctaatc 832  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1014055 gggcggaggcagtgtgaaacatggtgtggcatatgccacaccagtttctaatc 1014107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 715 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 10186508 - 10186461
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggtta 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10186508 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaagtta 10186461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 651 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 3701548 - 3701491
Alignment:
Q  651 gcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacc 708  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3701548 gcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatgtgactcttcacatgagagaaaacacc 3701491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 649 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 17414620 - 17414561
Alignment:
Q  649 atgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacc 708  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  17414620 atgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgaccattcacatgagagaaaccacc 17414561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 715 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 21431608 - 21431547
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  21431608 acttgaatcaatgttaaggttcatcaagcacccatttgccaaaggttataattatatacact 21431547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 715 - 776
Target Start/End: Original strand, 43359020 - 43359080
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  43359020 acttgaatcaatgttatggttcatta-gcacccttttgccaaatgttataaccatatacact 43359080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 710 - 766
Target Start/End: Original strand, 35626333 - 35626389
Alignment:
Q  710 ctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgat 766  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  35626333 ctttgacttgcatcaatgttatggttcatttaacacccttttgccaaaagttatgat 35626389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 715 - 761
Target Start/End: Original strand, 19311090 - 19311136
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggtt 761  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19311090 acttgaatcaatgctaaggttcattatgcacccctttgccaaaggtt 19311136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 716 - 776
Target Start/End: Original strand, 35626398 - 35626457
Alignment:
Q  716 cttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  35626398 cttgaatcaatgctaaggttcattaaatacc-ttttgtcaaaggttataatcatatacact 35626457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 3701494 - 3701463
Alignment:
Q  743 cacccttttgccaaaggttatgatcatataca 774  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3701494 cacccttttgccaaaggttatgatcatataca 3701463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 715 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 17414521 - 17414462
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatataca 774  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17414521 acttgaataaatgctatgaatcattaaacacctctttgccaaaggttatgatcatgtaca 17414462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 154
Target Start/End: Original strand, 48377184 - 48377328
Alignment:
Q  8 gtcttaagaaacaatgcaagtttttatctttcaaggttttccggctatattcatatttcttctgatattcttcaaactgagttattagctatttatcaag 107  Q
    ||||||||||| |||| | || |||| || ||||||||||| ||||||   |||| || || | ||||||||||| |||||||| | |||||||| |||     
T  48377184 gtcttaagaaataatgtaggtgtttacctctcaaggttttcaggctatc--cataattattttcatattcttcaagctgagttactcgctatttaccaat 48377281  T
Q  108 gatcgttgttagcaaaaacgatagacattgatgaccttgtttgctac 154  Q
    | | ||||||||| |||  ||| ||||||||||| ||  ||||||||    
T  48377282 gtttgttgttagctaaactgatggacattgatgaactcatttgctac 48377328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 49053934 - 49053867
Alignment:
Q  429 accggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatc 496  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| ||||    
T  49053934 accggcgaatccccttcaggatacaatgaaatccttgacgtgacttgcacattcacaccaagcatatc 49053867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 715 - 761
Target Start/End: Original strand, 10185966 - 10186012
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggtt 761  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10185966 acttgaatcaacgctaaggttcattaagcacccatttgctaaaggtt 10186012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 715 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 3701451 - 3701390
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  3701451 acttgaatcaatattatggttcattaagcatcaatttaccaaaggttgtgatcagatacact 3701390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 711 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 17414454 - 17414425
Alignment:
Q  711 tttgacttgaatcaatgctatggttcatta 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17414454 tttgacttgaatcaatgctatggttcatta 17414425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 340; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 278 - 776
Target Start/End: Original strand, 2022735 - 2023232
Alignment:
Q  278 tatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctt 377  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  2022735 tatcttgattgttgtaaagatgctgctgcacttgaaacctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatgaggttgccatactaacctt 2022834  T
Q  378 taggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatg-agtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2022835 taggttccattcgcccccaccaataactgtatatttgatgcaataaggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 2022934  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2022935 acaaccaaaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagag 2023034  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtgc 676  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| || |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  2023035 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaaattatgtg-ttgttgtgtgtccaactaatgcccatatgtcaagcatttatagtgc 2023133  T
Q  677 attatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2023134 attatatgactcttcacatgagagaaagcacc-ctttgacttgaatcaatgttatgattcattaaacacccatttgtcaaaggttatgatcatatacact 2023232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 9877972 - 9877468
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| || ||||||||    
T  9877972 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagtgtatggggttgccacactaacct 9877873  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9877872 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 9877773  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  9877772 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 9877673  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcat 667  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  9877672 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcat 9877573  T
Q  668 ttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatc 767  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  9877572 ttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataacc 9877473  T
Q  768 atata 772  Q
    |||||    
T  9877472 atata 9877468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Original strand, 39908729 - 39909233
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  39908729 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 39908828  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39908829 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 39908928  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  39908929 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 39909028  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcat 667  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  39909029 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtgatttttgttttttcaactaatgcccaaatgtcaagcat 39909128  T
Q  668 ttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatc 767  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  39909129 ttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataacc 39909228  T
Q  768 atata 772  Q
    |||||    
T  39909229 atata 39909233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 9872857 - 9872353
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| || ||||||||    
T  9872857 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagtgtatggggttgccacactaacct 9872758  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9872757 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 9872658  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  9872657 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 9872558  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcat 667  Q
    |||   | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  9872557 aattgtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcat 9872458  T
Q  668 ttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatc 767  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  9872457 ttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataacc 9872358  T
Q  768 atata 772  Q
    |||||    
T  9872357 atata 9872353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 277 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 13556738 - 13556229
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  13556738 atatcttgtttgttgggaagaggttactgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 13556639  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    || || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13556638 tttggctcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgatcgacgaatcccctttaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 13556539  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13556538 acaaccacaccaagcgtatctcctaaccgtattttacatatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagag 13556439  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtg-----------ttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagc 665  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||           |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13556438 aatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaacttctgt-ccaaattgtgtgtagttgtgtccttttctgtatgtccaactaatgcccaaatgtcaagc 13556340  T
Q  666 atttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatga 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  13556339 atttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacccatttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacctttttgccaaaggttataa 13556240  T
Q  766 tcatatacact 776  Q
    |||||||||||    
T  13556239 tcatatacact 13556229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Original strand, 39903616 - 39904120
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  39903616 atatcttgtttgttggaaagaggctgctgcacttgaaacccgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 39903715  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39903716 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 39903815  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  39903816 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 39903915  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcat 667  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||| | | | ||||||||| |||||||||||||    
T  39903916 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgttttttcaactaatgccaaaatgtcaagcat 39904015  T
Q  668 ttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatc 767  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||| | |    
T  39904016 ttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcactattttgccaaaggttataacc 39904115  T
Q  768 atata 772  Q
    |||||    
T  39904116 atata 39904120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 270 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 35369342 - 35368826
Alignment:
Q  270 ttgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacat---ggggttgtc 366  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||   ||||||| |    
T  35369342 ttgttgtatatcttgattgtt---aagagactgctgcacttgaaacctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatatgggggttgcc 35369246  T
Q  367 atactaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatg-----------caatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactat 455  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||           ||||| || ||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  35369245 acactaatctttaggttcgattcgcacccaccaataactgtatattggatgtatattggatgcaataggaatgaccagcgaatccccctcaggatactat 35369146  T
Q  456 gagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattg 555  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  35369145 gagttccttgatgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaatagtattttacagatttatggttacaacaattcactcatgcattagagaattg 35369046  T
Q  556 atggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgccca 655  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||        ||||||| || |||| ||||  | |||||||||    
T  35369045 atggatgatttagagtaagagaatgaggaagaattatgtttttgatgcaacaaaattcttgtttttgttgtgtg-ttgttgtgtgtcaaattaatgccca 35368947  T
Q  656 aatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgcca 755  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||  ||    
T  35368946 aatgtcaagcatttatagtgcattatatgacttttcacatgagagaaaacactcatttgacttgaatcaatgttatgattcattaaacacctttttatca 35368847  T
Q  756 aaggttatgatcatatacact 776  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  35368846 aatgttatgatcatatacact 35368826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 270 - 560
Target Start/End: Original strand, 43378201 - 43378491
Alignment:
Q  270 ttgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcata 369  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  43378201 ttgttgtatatcttgattgttgggaagaagttgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgtcaca 43378300  T
Q  370 ctaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgt 469  Q
    ||||| |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  43378301 ctaacatttaggttcgatttacccccaccaataattgtatatttgatgcaattggaatgacaagtgaatccccttcaggatattattagttccttgacgt 43378400  T
Q  470 gtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatgga 560  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  43378401 gtattgcacaatcacattaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactaatgcattaaagaattgatgga 43378491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 286 - 600
Target Start/End: Original strand, 25183874 - 25184186
Alignment:
Q  286 ttgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggg----gttgtcatactaacctttagg 381  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    |||| || |||| ||||||||    
T  25183874 ttgttcggaagaggcttctgcacttgaaacctgaaatctttaatgattatgcatgtaaaactgaaagcgcatgggccgggttgccacactatcctttagg 25183973  T
Q  382 tttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaac 481  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25183974 ttcgattctcccccaccaataactgtatattggatgcaataggagttaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtttattgcacaac 25184073  T
Q  482 cacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatga 581  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||      ||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25184074 cataccaagcgtatctccaaacaatattttacagat------ttctagcaattcactaatacattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgg 25184167  T
Q  582 gggagaattatgttgttaa 600  Q
     | |||| |||||||||||    
T  25184168 tgaagaaatatgttgttaa 25184186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 363 - 621
Target Start/End: Original strand, 4555509 - 4555768
Alignment:
Q  363 tgtcatactaacctttaggtttgattcgccccc-accaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttc 461  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    ||| || |||| |||| || ||||||    
T  4555509 tgtcacactaacttttaggtttgattcgtcccttaccaataactgtatattggatgcaataggaatgaccaacaaattcctttcaagatattacgagttc 4555608  T
Q  462 cttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggat 561  Q
     |||| |||||||||| || |||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4555609 attgatgtgtattgcaaaatcacaccaaacatatttcttaacattattttacagatttatggtaccaataattcactcatgcattagagaattaatggat 4555708  T
Q  562 gatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaa 621  Q
    |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  4555709 gatttagagtaatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattgtgtccaaa 4555768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 544 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 43540925 - 43540708
Alignment:
Q  544 attagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaatt-ctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtc 642  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| || | ||        ||||      |||||    
T  43540925 attagagaattgatagatgatttagagtaagagaatgatggagaactatgttgttaatgtaacaaaatttctattca--------tgtt------atgtc 43540840  T
Q  643 cgact-aatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaa 741  Q
    | | | |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||   |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  43540839 caaattaatgcccagatgccaagtatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaa--cactcatttgacttgagtcaatgttatggttcattaa 43540742  T
Q  742 gcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43540741 gca-ccttttgtcaaaggttatgatcatatacact 43540708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 649 - 708
Target Start/End: Original strand, 4555772 - 4555831
Alignment:
Q  649 atgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacc 708  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  4555772 atgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactattaacatgagagaaaacacc 4555831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 715 - 776
Target Start/End: Original strand, 2023230 - 2023291
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  2023230 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatacacact 2023291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 715 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 35368828 - 35368767
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  35368828 acttgaatcaatgctaaggttcattaagcacctctttgtcaaaggttataatcatatacact 35368767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 665 - 776
Target Start/End: Original strand, 43379556 - 43379662
Alignment:
Q  665 catttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatg 764  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||     ||| |||   ||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||| |||||    
T  43379556 catttatagtgcattatatgacccttcacat-----aaaacactcattttacttgaatcaatgttatgattcactaagcactcttttaccaaagtttatg 43379650  T
Q  765 atcatatacact 776  Q
    ||||||||||||    
T  43379651 atcatatacact 43379662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 647 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 43402187 - 43402061
Alignment:
Q  647 taatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacc 746  Q
    |||||||  |||| ||| |||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||| || |  ||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |    
T  43402187 taatgcctcaatgacaaacatttatagtgcattatatgatccttcatatgaaagaaaacatcaatttgattcgaatcaatgttatggttcattaagtatc 43402088  T
Q  747 cttttgccaaaggttatgatcatatac 773  Q
      |||| |||| ||||| |||||||||    
T  43402087 aatttgtcaaaagttataatcatatac 43402061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 715 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 35368769 - 35368723
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggtt 761  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  35368769 acttaaatcaatgctaaggttcattaagcactcatttgccaaaggtt 35368723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 715 - 773
Target Start/End: Original strand, 43379660 - 43379718
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatac 773  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |  ||| ||||| |||||||||||||||    
T  43379660 acttgaatcaatgctacggttcattaaacatcactttaccaaaagttatgatcatatac 43379718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 715 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 43540710 - 43540664
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggtt 761  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  43540710 acttgaatcaatactaagattcattaagcacccctttgccaaaggtt 43540664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 776
Target Start/End: Original strand, 42779954 - 42780452
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  42779954 atatcttgtttgttgggaagatgctgctgcacttgaaacctgaaaagtttaatgattatgcatgtaaaactcaaagcatatggggttaccacactaacct 42780053  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatat-gagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattg 475  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42780054 ttaggttcgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataacgaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattg 42780153  T
Q  476 cacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaaga 575  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42780154 cacaaccacaccaaatgtatctcctaacagtattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaga 42780253  T
Q  576 gaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtg 675  Q
    |||||  | |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  42780254 gaatggtgaagaattatgtag-taatgtaacaaaattctgtccaaaattgtgtg-ttgttgtgtgtccaactaatgcccaactgtcaatcatttatagtg 42780351  T
Q  676 cattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacac 775  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  42780352 cattatatgactcttcacatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagccaccatttgccaaaggttatgatcatatacac 42780451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 17720959 - 17720455
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || | ||||||    
T  17720959 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacattaacct 17720860  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17720859 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 17720760  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  17720759 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 17720660  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcat 667  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  17720659 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcat 17720560  T
Q  668 ttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatc 767  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  17720559 ttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataacc 17720460  T
Q  768 atata 772  Q
    |||||    
T  17720459 atata 17720455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Original strand, 45120157 - 45120662
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  45120157 atatattgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 45120256  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45120257 ttaggttcgactcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 45120356  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  45120357 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattggagaattgatggatgatttagaataatag 45120456  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaat-tgtgt---------gttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagca 666  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||         ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  45120457 aatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagca 45120556  T
Q  667 tttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgat 766  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  45120557 tttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataac 45120656  T
Q  767 catata 772  Q
    ||||||    
T  45120657 catata 45120662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 14917815 - 14917311
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  14917815 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 14917716  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14917715 ttaggttcgattcgcctccaccaataaatgtatattggatgcaatagaaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 14917616  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  14917615 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 14917516  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcat 667  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  14917515 aatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggtttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcat 14917416  T
Q  668 ttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatc 767  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  14917415 ttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacagctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataacc 14917316  T
Q  768 atata 772  Q
    |||||    
T  14917315 atata 14917311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 342 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 30283809 - 30283379
Alignment:
Q  342 aaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccc 441  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  30283809 aaaactcaaagcgtatgtggttgccacactaacctttaagttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccc 30283710  T
Q  442 cttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcat 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30283709 cttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaatagtattttacagatttatggttctagcaattcactcat 30283610  T
Q  542 gtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgt-tttttgtatg 640  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |  || ||| |     
T  30283609 gcattagagaattgattgatgatttagagtaagagaaggatggagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgt-ccaaattgtgtttagttgtgtgtt 30283511  T
Q  641 tccgactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcatta 740  Q
    | | ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  30283510 ttcaactaatgcccaaatgccaaacatttatagtgcattatatgactcttcacatgaaagaaaacacccctttaacttgaatcaatattatggttcatta 30283411  T
Q  741 agcacccttttgccaaaggttatgatcatata 772  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  30283410 agcacccttttgccaaagattataaccatata 30283379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 285 - 614
Target Start/End: Original strand, 16284215 - 16284546
Alignment:
Q  285 attgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctttaggttt 384  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| | ||||||||     
T  16284215 attgttgggaagatgctgctgcacttgaaacctgaaaagtttaatgattatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccacactaccttttaggttc 16284314  T
Q  385 gattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatcccc-ttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaacca 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16284315 gattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataggaatgaccagcgaatcccctttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgtacaacca 16284414  T
Q  484 caccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatga-tttagagtaagagaatgag 582  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16284415 caccaagcgtatctcctaatggtattttactgatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagagttgatgaatgattttagagtaagagaatgag 16284514  T
Q  583 ggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 614  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16284515 ggagaattatattgttaatgcaacaaaattct 16284546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 469 - 770
Target Start/End: Original strand, 716230 - 716527
Alignment:
Q  469 tgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttag 568  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  716230 tgtattgtacaaccacaccaaacgtatctcctaactgtattttacagatttagggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttag 716329  T
Q  569 agtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattc-tgtacaaaattgtgtgtt-ttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagca 666  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||| |||      || ||| || | ||||  |||  ||||||||||||||| ||| ||    
T  716330 agtaagagaatgaaggagaattatgttgttaaagaagcaaaattcttgt------ttatgttttctgttgtcagtcacactaatgcccaaatgccaaaca 716423  T
Q  667 tttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgat 766  Q
    |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  716424 tttatagtgcattatatgacctttcatatgagagaaaacatccctttgacttgaatcaatgttacggtccattaaacacctttttgccaaaggttatgat 716523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 277 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 39196305 - 39196121
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  39196305 atatcttgtttgttgggaagaggatgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 39196206  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttc 461  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39196205 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttc 39196121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 645 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 20892405 - 20892275
Alignment:
Q  645 actaatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagca 744  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  20892405 actaatgcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatatgactcttcacacgagagaaaacactcatttgatttgaatcaatg-tttggttcattaagca 20892307  T
Q  745 cccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    || ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20892306 cctttttggcaaatgttatgatcatatacact 20892275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 270 - 374
Target Start/End: Original strand, 716125 - 716229
Alignment:
Q  270 ttgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcata 369  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  716125 ttgttgtatatcttgattgttgggaagatgttgttgcacttgaaacctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccaca 716224  T
Q  370 ctaac 374  Q
    |||||    
T  716225 ctaac 716229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 716 - 776
Target Start/End: Original strand, 716532 - 716592
Alignment:
Q  716 cttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  716532 cttgaatcaatgctaagcttcattaagcacccctttaccaaaggttataatcatatacact 716592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 796 - 832
Target Start/End: Complemental strand, 4076721 - 4076685
Alignment:
Q  796 aaacatggtgtggcatatgccacaccagtttctaatc 832  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4076721 aaacatggtgtggcatatgccacaccagtttctaatc 4076685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 715 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 20892277 - 20892216
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||| || |||||||||||||||    
T  20892277 acttgaatcaatgttatggttcattaatcactcacttgccaaatgtcatgatcatatacact 20892216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 679 - 758
Target Start/End: Original strand, 16286003 - 16286082
Alignment:
Q  679 tatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaag 758  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||| |||||| | ||| ||||||||| |||| |||| ||||||    
T  16286003 tatatgacccttcacatgagagaaaacacccatttaacttcaatcaacgttatagttcattaaacaccattttaccaaag 16286082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Original strand, 12856560 - 12857064
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  12856560 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 12856659  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12856660 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 12856759  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  12856760 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 12856859  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcat 667  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  12856860 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcat 12856959  T
Q  668 ttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatc 767  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  12856960 ttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataacc 12857059  T
Q  768 atata 772  Q
    |||||    
T  12857060 atata 12857064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 267 - 772
Target Start/End: Original strand, 26050782 - 26051296
Alignment:
Q  267 ttgttgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtc 366  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  26050782 ttgttgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgcc 26050881  T
Q  367 atactaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttga 466  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26050882 acactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttga 26050981  T
Q  467 cgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgattt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26050982 cgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgattt 26051081  T
Q  567 agagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaa 657  Q
    ||| ||| ||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||||| | | ||||||||| |||    
T  26051082 agaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcctaaa 26051181  T
Q  658 tgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaa 757  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26051182 tgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaa 26051281  T
Q  758 ggttatgatcatata 772  Q
    |||||| | ||||||    
T  26051282 ggttataaccatata 26051296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 267 - 772
Target Start/End: Original strand, 26060141 - 26060655
Alignment:
Q  267 ttgttgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtc 366  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  26060141 ttgttgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgcc 26060240  T
Q  367 atactaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttga 466  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26060241 acactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttga 26060340  T
Q  467 cgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgattt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26060341 cgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgattt 26060440  T
Q  567 agagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaa 657  Q
    ||| ||| ||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||||| | | ||||||||| |||    
T  26060441 agaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcctaaa 26060540  T
Q  658 tgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaa 757  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26060541 tgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaa 26060640  T
Q  758 ggttatgatcatata 772  Q
    |||||| | ||||||    
T  26060641 ggttataaccatata 26060655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Original strand, 26055905 - 26056409
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||    
T  26055905 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatgaggttgccacactaacct 26056004  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26056005 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 26056104  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  26056105 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 26056204  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcat 667  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||    
T  26056205 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcctaaatgtcaagcat 26056304  T
Q  668 ttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatc 767  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  26056305 ttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataacc 26056404  T
Q  768 atata 772  Q
    |||||    
T  26056405 atata 26056409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Original strand, 26065264 - 26065768
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||    
T  26065264 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatgaggttgccacactaacct 26065363  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065364 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 26065463  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  26065464 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 26065563  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcat 667  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||    
T  26065564 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcctaaatgtcaagcat 26065663  T
Q  668 ttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatc 767  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  26065664 ttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataacc 26065763  T
Q  768 atata 772  Q
    |||||    
T  26065764 atata 26065768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 294; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Original strand, 12851445 - 12851951
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  12851445 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaaactgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 12851544  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12851545 ttaggttcgattcgaacacaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccgacgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 12851644  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  12851645 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 12851744  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgt----------tttttgtatgtc--cgactaatgcccaaatgtcaag 664  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||          ||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  12851745 aatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattttgt-ccaaattgtgtgtagttgtatggtttttgtatatcttcaactaatgcccaaatgtcaag 12851843  T
Q  665 catttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatg 764  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12851844 tatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttata 12851943  T
Q  765 atcatata 772  Q
    | ||||||    
T  12851944 accatata 12851951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 277 - 630
Target Start/End: Original strand, 14610135 - 14610487
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  14610135 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 14610234  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14610235 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccagcgaatccccttcaggatactatgagtttcttgacgtgtattgc 14610334  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14610335 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagag 14610434  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgt 630  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  14610435 aatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgt-ccaaattgtgtgt 14610487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 281 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 4181810 - 4181347
Alignment:
Q  281 cttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctttag 380  Q
    |||||||||| | |||| | | ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  4181810 cttgattgttagaaagaggttgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcgtatggggttgtcacactaacctttag 4181711  T
Q  381 gtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaa 480  Q
    ||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4181710 gttcgattcttccccaccaataactctatattggatgcaattggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaa 4181611  T
Q  481 ccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatg 580  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4181610 ccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggtttatggttcgagcaa-tcactcatgcattagagaattgatggatgatttagattaagagaatg 4181512  T
Q  581 agggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcatta 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||         | ||   || | ||| ||||  | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4181511 agggagaattatgttgttaatgcaacaaaattc---------tcgt---ttatgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcatta 4181424  T
Q  681 tatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaa 757  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  4181423 tatgactcttcatatgagagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacccctttgccaaa 4181347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 277 - 601
Target Start/End: Original strand, 11056396 - 11056720
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  11056396 atatcttgtttgttgggaagaggttgctgcacttgaaacatgaaatgtttaatgattatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccacactaacct 11056495  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11056496 ttatgtgtgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgaatgaccgacgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtgttgc 11056595  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11056596 acaatcacaccaaacgtatctcctaatagtattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttaaagtaagag 11056695  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaat 601  Q
    |||||   |||||||||||||||||    
T  11056696 aatgataaagaattatgttgttaat 11056720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 281 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 35352720 - 35352245
Alignment:
Q  281 cttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctttag 380  Q
    |||||||| |||||||| | | ||||| ||||||| || |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||    
T  35352720 cttgattgatgggaagaggttcctgcacttgaaacatggaaagtttaatggttaagcatgtaaaactcaaagcgcatggggttaccacactaacctttag 35352621  T
Q  381 gtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaa 480  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  35352620 gttcaattcgcccccaccaataattgtatattggatgcaataggaatgaccagcgaatcctcttcaggatactatgagttccatgatgtgtattgcacaa 35352521  T
Q  481 ccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatg 580  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||         
T  35352520 ccacatcaagagtaactcctaacagtattttatagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatggtttatagtaaga----- 35352426  T
Q  581 agggagaattatgttgttaatgcaacaaaattc-tgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtccgact-aatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcat 678  Q
         |||||||||||||||||  ||||||||| |||     |||||||        | ||||| | | |||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  35352425 -----gaattatgttgttaatgtgacaaaattcttgt-----attgtgt--------tgtgtccaaattaatgcccaaatgtcaagcatatatggtgcat 35352344  T
Q  679 tatatgactcttc-acatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||    ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||    
T  35352343 tatatgacccttcaaaatgagagaaaatgtctctttgacttgattcaacgatttggttcattaagcacccatttatcaaaggttatgattatatacact 35352245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 309 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 37460241 - 37459802
Alignment:
Q  309 ttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgta 408  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||  ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||    
T  37460241 ttgaaacctgaaatttttaatgattatgcatgtaaaacttaaagcgcacggg-ttcccatactaacctatagcttcaattcacccccaccaataactgta 37460143  T
Q  409 tattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtat 508  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  37460142 tattggatgcaataagaatgaccgatgaatccacttcatgatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcttaacaatat 37460043  T
Q  509 tttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaa 608  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||     
T  37460042 tttacagatatatggtttcagcaattcgctaatgcatcagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgtgggagaattatgttgttcatgtaacat 37459943  T
Q  609 aattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtcc-gactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcac 707  Q
    |||||  ||             | |||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||    
T  37459942 aattc-cta-------------tatttgtatgtccatattaatgcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatatgtccattcacatgagagaaaacac 37459857  T
Q  708 ctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggtta 762  Q
       ||||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  37459856 gcatttgatttgaattgatgttatggttcattaaacactcatttgccaaaggtta 37459802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 270 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 5436970 - 5436692
Alignment:
Q  270 ttgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcata 369  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  5436970 ttgttgtatatcttgatcgttgggaagatgctgctgcacttgaaacttgaaaaatctaatggttatgcatgtaaa-ctcaaagcgcatggggttgccata 5436872  T
Q  370 ctaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatg-agtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacg 468  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5436871 ccaacctttaggttcgatttgcccccaccaataactgtatattggatgcaataaggaatgaccggcgaattcccttgaggatactatgaggtccttgacg 5436772  T
Q  469 tgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattag 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  5436771 tgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacaatattttacagatttatggttcaagcaattcactaatgcattag 5436692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 504 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 5440494 - 5440225
Alignment:
Q  504 agtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 603  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  5440494 agtattttacagatgtatggttccagcaatttactcaagctttagagaattgatcgatgatttagagtaagggaatgagggagaattatgttgttaatgt 5440395  T
Q  604 aacaaaa-ttct-gtacaaaattgtgtgttttttgtatgtccgact-aatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagag 700  Q
    || |||| |||| || |    |||| ||||||| || ||||| | | || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5440394 aataaaaattcttgttc----ttgt-tgttttt-gtgtgtccaaattaaagcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagag 5440301  T
Q  701 aaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  5440300 aaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaatcacccctttcccaaaagttatgaccatatacact 5440225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 504 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 5449504 - 5449235
Alignment:
Q  504 agtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 603  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  5449504 agtattttacagatgtatggttccagcaatttactcaagctttagagaattgatcgatgatttagagtaagggaatgagggagaattatgttgttaatgt 5449405  T
Q  604 aacaaaa-ttct-gtacaaaattgtgtgttttttgtatgtccgact-aatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagag 700  Q
    || |||| |||| || |    |||| ||||||| || ||||| | | || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5449404 aataaaaattcttgttc----ttgt-tgttttt-gtgtgtccaaattaaagcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagag 5449311  T
Q  701 aaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  5449310 aaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaatcacccctttcccaaaagttatgaccatatacact 5449235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 277 - 446
Target Start/End: Original strand, 14615201 - 14615370
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||    
T  14615201 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggtttccacactaacct 14615300  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttca 446  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  14615301 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttca 14615370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 680 - 772
Target Start/End: Original strand, 14610512 - 14610604
Alignment:
Q  680 atatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatata 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14610512 atatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatata 14610604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 776 - 832
Target Start/End: Original strand, 43264760 - 43264816
Alignment:
Q  776 tcatgggcggaggcagcatgaaacatggtgtggcatatgccacaccagtttctaatc 832  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43264760 tcatgggcggaggcagcgtgaaacatggtgtggcatatgccacaccagtttctaatc 43264816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 780 - 831
Target Start/End: Original strand, 39780236 - 39780287
Alignment:
Q  780 gggcggaggcagcatgaaacatggtgtggcatatgccacaccagtttctaat 831  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39780236 gggcggaggcagcgtgaaacaaggtgtggcatatgccacaccagtttctaat 39780287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 45715523 - 45715400
Alignment:
Q  117 tagcaaaaacgatagacattgatgaccttgtttgctactttgactccttacacaatgtagatctcataaaa-gtccatctatgaaatttcatgttgatgc 215  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   | || ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| |||     
T  45715523 tagcaaaatcgatgaacattgatgagcttgtttgctactttgattccttacatggtataaatctcataaaaggtcctcctatgaaatatcatgttcatga 45715424  T
Q  216 tattttgattcaaggcataaaaga 239  Q
    | | |||||||||| |||||||||    
T  45715423 tgtattgattcaagacataaaaga 45715400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 496
Target Start/End: Original strand, 12239605 - 12239666
Alignment:
Q  435 gaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatc 496  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||    
T  12239605 gaatccccttcaggatacgatgaaatccttgacgtgacttgcacattcacaccaagcgtatc 12239666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 102
Target Start/End: Original strand, 5462159 - 5462253
Alignment:
Q  8 gtcttaagaaacaatgcaagtttttatctttcaaggttttccggctatattcatatttcttctgatattcttcaaactgagttattagctattta 102  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| | ||| | |||| ||||||||||||   ||||||||| |||||||| |  || ||||| ||||||||    
T  5462159 gtcttaagaaacaatgtaggtttttatttatcaggctttttcggctatattcaagattcttctgacattcttcatatcgaattatttgctattta 5462253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Original strand, 21275544 - 21276048
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  21275544 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 21275643  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21275644 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 21275743  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21275744 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 21275843  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcat 667  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  21275844 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcat 21275943  T
Q  668 ttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatc 767  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  21275944 ttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataacc 21276043  T
Q  768 atata 772  Q
    |||||    
T  21276044 atata 21276048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 270 - 769
Target Start/End: Original strand, 24509467 - 24509972
Alignment:
Q  270 ttgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcata 369  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  24509467 ttgttgtatatcttgattgttgggaagaggttgttgcacttgaaaccttaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaatcgcatggggttgccata 24509566  T
Q  370 ctaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgt 469  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  24509567 ctaacctttaggttcgattcgcccccaccaataactatatattggatgcaataggaatgatcggcgaatccccttcataatactatgagttccttgatgt 24509666  T
Q  470 gtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttaga 569  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  24509667 gtattgcacaaccacaccatgcgtatctcctaacagtattttacaaatttatggttccaacaattcactaatgcattagagaattgatggatgatttaaa 24509766  T
Q  570 gtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgt--tttttgt----atgtccgactaatgcccaaatgtcaa 663  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||| |  || ||||     |||   |||||||||||||||||||    
T  24509767 gtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaacataattttgtacaaaattatgtataattgttgttgtcgtgttaaactaatgcccaaatgtcaa 24509866  T
Q  664 gcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttat 763  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||    
T  24509867 gcatttatagtgcattatatgaaccttcacatgagagaaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaaacacacttttgtcaaatgttat 24509966  T
Q  764 gatcat 769  Q
    ||||||    
T  24509967 gatcat 24509972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 277 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 21937113 - 21936611
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||||||    
T  21937113 atatcttgattgttgggaacaggttgctgcacttgaaactcgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagtgcatagggtttccatactaacct 21937014  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  21937013 ttaggctcgattcgtccccaccaataattgtatattagatgcaataggaatggtcggagaatccccttcagaatactatgagttccttgatgtgtattgc 21936914  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  21936913 acaaccacatcgagtgtatctcctaataatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatagatgatttagagtatgag 21936814  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgt--tttttg-tatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatttacag 673  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||  || ||| | |||   |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  21936813 aatgatggagaattatgttgttaatgtaacaaagttcagtccaaaattgtgtgttgttgttgttgtgttaaactaatgcccaaatgttaagcatttatag 21936714  T
Q  674 tgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatac 773  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21936713 tgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggtttattaagcacctttttgccaaaggttatgatcatatac 21936614  T
Q  774 act 776  Q
    |||    
T  21936613 act 21936611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 277 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 20752550 - 20752063
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| ||||||||| || |||  |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20752550 atatcttgtttgttggga-gaggctgttgcacttgaaacctgaaatgtttaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgccatactaacct 20752452  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20752451 ttaggttcgattcgcccccacaaataactgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactacgagttccttgacgtgtattgc 20752352  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  20752351 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcatcagagaattgatggatgacttatagtaagag 20752252  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtgc 676  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||       | ||     ||||||| ||||| |||| ||||| |||||    
T  20752251 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctttccaaaactgtgtgt------caagt-----taatgcctaaatgccaagtatttatagtgc 20752163  T
Q  677 attatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  20752162 attagatgacctttcacatgagagaaaacactcatttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcaccattttgtcaaaggttatggccatatacact 20752063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 277 - 776
Target Start/End: Original strand, 21937341 - 21937845
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  21937341 atatcttgattgttgggaagagactgttgcacttgaaacctgaaaagtttaatggtaatgcatataaaactcaaagcgcatggggtttccatactaacct 21937440  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21937441 ttaggctcgattcgcccccaccaataaccatatattggatgcaataggaatgaccggcgaatcccctttaggatactatgagttccttgttgtgtattgc 21937540  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21937541 acaaccacaccaagcgtatctcgtaacaatattatacaaatttatggttccagcaattcactcatgcatttgagaattgatggatgttttagaataagag 21937640  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgt--tttttg----tatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcattta 670  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||  || |||    | |||   ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21937641 agtgatggaaaattatgttgttaatg-tacaaaattatgtccaaaattgtgtgttgttgttgttgttgtgttaaactaatgcccaaatgccaaacattta 21937739  T
Q  671 cagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcata 770  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21937740 tagtgcgttatatgacccttcacatgagagaaaatacccctttgacttgaatcaatgtgatggttcattaaacacccttttgccaaaggttatgatcata 21937839  T
Q  771 tacact 776  Q
    ||||||    
T  21937840 tacact 21937845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 277 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 24509261 - 24508914
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  24509261 atatcttgattgttgggaagaggctgctgcacttgaaacttcaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaaacgcatggggttgccatactaacct 24509162  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24509161 ttaggttcgattcgcccccaccaataactatatattggatgcaataggaatgatcggcgaatccccttcataatactatgagttccttgacgtgtattgc 24509062  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24509061 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaaatttatgattccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaag 24508962  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaatt 624  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  24508961 aatgatggagaattatgttgttaatgtaacataattttgtacaaaatt 24508914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 270 - 612
Target Start/End: Original strand, 2887258 - 2887596
Alignment:
Q  270 ttgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcata 369  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||| | | ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  2887258 ttgttgtatatcttgattgttgaaaagaagttgctgcacttgaaacctgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaactcaaagcgcatggggttgtcaca 2887357  T
Q  370 ctaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatg-agtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacg 468  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||     | |||||||||||||| | | ||||||  |||||| ||||| |||||||||| |||||| |||    
T  2887358 ctaacatttaggttcgattcgcccccaccaat-----tttattggatgcaataaggaatgaccgacgaatcctcttcacgatactatgaattccttcacg 2887452  T
Q  469 tgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttag 568  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  2887453 tgtattgcacaaccacaccaaatatatctcttaacactattttacagatttatgattccagcaattcactcatgcattagagagttgatggatgatttag 2887552  T
Q  569 agtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaatt 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2887553 agtaagagaatgagggagaattatgttggtaatggaacaaaatt 2887596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 270 - 612
Target Start/End: Original strand, 2888980 - 2889318
Alignment:
Q  270 ttgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcata 369  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||| | | ||||| |||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  2888980 ttgttgtatatcttgattgttgaaaagaagttgctgcacttgaaatctggaaagtttaatggttatgaatgtaaaactcaaagcgcatggggttgtcaca 2889079  T
Q  370 ctaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatg-agtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacg 468  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||     | |||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| |||    
T  2889080 ctaacatttaggttcgattcgcccccaccaat-----tttattggatgcaataaggaatgaccggcgaatcctcttcacgatactatgaattccttcacg 2889174  T
Q  469 tgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttag 568  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  2889175 tgtattgcacaaccacaccaaatatatctcttaacactattttacagatttatgattccagcaattcactcatgcattagagagttgatgaatgatttag 2889274  T
Q  569 agtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaatt 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2889275 agtaagagaatgagggagaattatgttggtaatggaacaaaatt 2889318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 392 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 11183484 - 11183263
Alignment:
Q  392 ccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagc 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  || ||| | ||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||      
T  11183484 ccccaccaataactgtatattggatgtgatgggaatgatcagtgaatcccattcaagatattatgagttccttgatgtgtattacacaaccacaccaaat 11183385  T
Q  492 gtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaatta 591  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11183384 gtatctcctaacagtattttacaggtttatggtttcagcaatttactcatgcattagagaattgattgatgatttagagtaagagaatgagagagaatta 11183285  T
Q  592 tgttgttaatgcaacaaaattc 613  Q
    |||| ||| || ||||||||||    
T  11183284 tgttattattgtaacaaaattc 11183263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 647 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 24508914 - 24508785
Alignment:
Q  647 taatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacc 746  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24508914 taatgcccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcacc 24508815  T
Q  747 cttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24508814 cttttgccaaaggttatgatcttatacact 24508785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 777 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 18819841 - 18819698
Alignment:
Q  777 catgggcggaggcagcatgaaacatggtgtggcatatgccacaccagtttctaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---aatatgcataattcataaggga 873  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      ||||||||||||||||||||||    
T  18819841 catgggcggaggcagcatgaaacatggtgtggcatatgccacaccagtttctaatcttttttttttttttttttttttaatatgcataattcataaggga 18819742  T
Q  874 aaggcttggcacgggggagatagaaattgaaaattgaaaaacat 917  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18819741 aaggcctggcacggggaagatagaaattgaaaattgaaaaacat 18819698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 281 - 409
Target Start/End: Original strand, 12909404 - 12909532
Alignment:
Q  281 cttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctttag 380  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||  | |||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  12909404 cttgattgttgggaagaggcggctgcacttaaaacctgaaaaaattaatcgttatgcatgtaaacttcaaagcgcatggggttgccacactaacctttag 12909503  T
Q  381 gtttgattcgcccccaccaataactgtat 409  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12909504 gttcgattcgcccccaccaataacggtat 12909532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 281 - 409
Target Start/End: Original strand, 12934511 - 12934639
Alignment:
Q  281 cttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctttag 380  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||  | ||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||     
T  12934511 cttgattgttgggaagaggcggctgcacttaaaacctgaaaaaattaatcattatgcatgtaaacttcaaagcgcatggggttgccacactaacctttat 12934610  T
Q  381 gtttgattcgcccccaccaataactgtat 409  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12934611 gttcgattcgcccccaccaataacggtat 12934639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 676 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 11183212 - 11183112
Alignment:
Q  676 cattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacac 775  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||  ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11183212 cattatatgagccttcacatgggagaacacacccatttgacttgaatcagtgttatggttcattaaacatccctttgtcaaaggttatgatcatatacac 11183113  T
Q  776 t 776  Q
    |    
T  11183112 t 11183112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 715 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 20752065 - 20752004
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||| || |||||||||    
T  20752065 acttgaatcaatgctaaggttcattaaacacccctttgtcaaaggttataataatatacact 20752004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 715 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 24508787 - 24508726
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24508787 acttgaattaatgctaaggttcattaaacacccctttaccaaaggtcatgatcatatacact 24508726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 715 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 21936554 - 21936508
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggtt 761  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21936554 acttgaatcaatgcaaaggttcattaagcacccatttgccaaaggtt 21936508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 32209364 - 32209310
Alignment:
Q  218 ttttgattcaaggcataaaagaattgatcgggcaaaacaatgtcactatttgttg 272  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  32209364 ttttgattcaagacataaaagatatgatcgagcaaaacaatatcactatttgttg 32209310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 717 - 761
Target Start/End: Original strand, 12909533 - 12909577
Alignment:
Q  717 ttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggtt 761  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12909533 ttgaatcaatgctaaggttcattaaacacctttttgccaaaggtt 12909577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 717 - 761
Target Start/End: Original strand, 12934640 - 12934684
Alignment:
Q  717 ttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggtt 761  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12934640 ttgaatcaatgctaaggttcattaaacacctttttgccaaaggtt 12934684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 715 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 21936613 - 21936556
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatata 772  Q
    |||||||| ||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21936613 acttgaataaattctaaggttcactaaacacccctttgccaaaggtcatgatcatata 21936556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 715 - 776
Target Start/End: Original strand, 21937843 - 21937904
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21937843 acttgaatcaatgataaagttaattaaacaccccttttccaaaggtcatgatcatatacact 21937904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 10673371 - 10672867
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  10673371 atattttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 10673272  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10673271 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 10673172  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  10673171 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 10673072  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcat 667  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  10673071 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcat 10672972  T
Q  668 ttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatc 767  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  10672971 ttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataacc 10672872  T
Q  768 atata 772  Q
    |||||    
T  10672871 atata 10672867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 286 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 6853376 - 6852881
Alignment:
Q  286 ttgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctttaggtttg 385  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  6853376 ttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcg 6853277  T
Q  386 attcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccaca 485  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6853276 attcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccaca 6853177  T
Q  486 ccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgaggga 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |    
T  6853176 ccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaa 6853077  T
Q  586 gaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtgc 676  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6853076 gaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgc 6852977  T
Q  677 attatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatata 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6852976 attatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcatcaagcacccttttgccaaaggttataaccatata 6852881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 5481921 - 5481417
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  5481921 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 5481822  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5481821 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 5481722  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  5481721 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 5481622  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcat 667  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  5481621 aatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggtttttttatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcat 5481522  T
Q  668 ttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatc 767  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  5481521 ttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataacc 5481422  T
Q  768 atata 772  Q
    |||||    
T  5481421 atata 5481417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Original strand, 8464521 - 8465025
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  8464521 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 8464620  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464621 ttaggttcgattcgccccaaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 8464720  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8464721 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 8464820  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcat 667  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  8464821 aatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcat 8464920  T
Q  668 ttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatc 767  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  8464921 ttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcaccattttgccaaaggttataacc 8465020  T
Q  768 atata 772  Q
    |||||    
T  8465021 atata 8465025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 10591728 - 10591224
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  10591728 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 10591629  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10591628 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttcattgacgtgtattgc 10591529  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  10591528 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 10591429  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcat 667  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  10591428 aatgatgaggaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcat 10591329  T
Q  668 ttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatc 767  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  10591328 ttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttaccaaaggttataacc 10591229  T
Q  768 atata 772  Q
    |||||    
T  10591228 atata 10591224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 31076835 - 31076331
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  31076835 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 31076736  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31076735 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccgacgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 31076636  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  31076635 acaaccacaccaaacgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 31076536  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcat 667  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  31076535 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatgttcaactaatgcccaaatgtcaagcat 31076436  T
Q  668 ttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatc 767  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  31076435 ttataatgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataacc 31076336  T
Q  768 atata 772  Q
    |||||    
T  31076335 atata 31076331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 1302678 - 1302173
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  1302678 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 1302579  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1302578 ttaggttcgatacgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 1302479  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  1302478 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 1302379  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaat-tgtgt---------gttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagca 666  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| | |||||         ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  1302378 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattttgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagca 1302279  T
Q  667 tttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgat 766  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  1302278 tttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataac 1302179  T
Q  767 catata 772  Q
    ||||||    
T  1302178 catata 1302173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Original strand, 4049578 - 4050083
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  4049578 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatatttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 4049677  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4049678 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 4049777  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  4049778 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 4049877  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaat-tgtgt---------gttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagca 666  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||         ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  4049878 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagca 4049977  T
Q  667 tttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgat 766  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  4049978 tttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataac 4050077  T
Q  767 catata 772  Q
    ||||||    
T  4050078 catata 4050083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Original strand, 8458082 - 8458587
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  8458082 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 8458181  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8458182 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 8458281  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8458282 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 8458381  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgccc-aaatgtcaagca 666  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||    
T  8458382 aatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaaatgtcaagca 8458481  T
Q  667 tttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgat 766  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  8458482 tttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaccacccttttgccaaaggttataac 8458581  T
Q  767 catata 772  Q
    ||||||    
T  8458582 catata 8458587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 6858488 - 6857984
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  6858488 atatcttgtttgttgggaagaggatgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 6858389  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6858388 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcaaatccccttcaagatactatgagttccttgacgtgtattgc 6858289  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  6858288 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 6858189  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcat 667  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  6858188 aatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcat 6858089  T
Q  668 ttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatc 767  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |    
T  6858088 ttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaatcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcatcaagcacccttttgccaaaggttataacc 6857989  T
Q  768 atata 772  Q
    |||||    
T  6857988 atata 6857984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 31081940 - 31081436
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  31081940 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctaaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 31081841  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31081840 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 31081741  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  31081740 acaaccacaccaaacgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 31081641  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcat 667  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  31081640 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatgttcaactaatgcccaaatgtcaagcat 31081541  T
Q  668 ttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatc 767  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  31081540 ttataatgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataacc 31081441  T
Q  768 atata 772  Q
    |||||    
T  31081440 atata 31081436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 5458445 - 5457940
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  5458445 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 5458346  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5458345 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 5458246  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  5458245 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 5458146  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgt-gttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagca 666  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | |||||| ||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  5458145 aatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggttttttttatcttcaactaatgcccaaatgtcaagca 5458046  T
Q  667 tttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgat 766  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  5458045 tttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaagggttataac 5457946  T
Q  767 catata 772  Q
    ||||||    
T  5457945 catata 5457940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 277 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 33703033 - 33702537
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  33703033 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 33702934  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33702933 ttaggttcgattcgctcccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgactggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 33702834  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  33702833 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacatatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 33702734  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaat-tgtgt---------gttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagca 666  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||         ||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||    
T  33702733 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtctattcaactaatgcccaaatgtcaagca 33702634  T
Q  667 tttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttat 763  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33702633 tttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttat 33702537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 10678486 - 10677980
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  10678486 atattttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 10678387  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10678386 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 10678287  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  10678286 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 10678187  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcat 667  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||         | ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  10678186 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcat 10678087  T
Q  668 ttacagtgcattata--tgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatga 765  Q
    ||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10678086 ttatagtgcattatatgtgactcttcacatgaaagaaagcacctttttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataa 10677987  T
Q  766 tcatata 772  Q
     ||||||    
T  10677986 ccatata 10677980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 277 - 772
Target Start/End: Original strand, 4054712 - 4055217
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  4054712 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctggaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 4054811  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4054812 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccgacgaatccccttcaggatactatgagttccttaacgtgtattgc 4054911  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  4054912 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttagaataatag 4055011  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaat-tgtgt---------gttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagca 666  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||||         ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  4055012 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctatccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagca 4055111  T
Q  667 tttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgat 766  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  4055112 tttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataac 4055211  T
Q  767 catata 772  Q
    ||||||    
T  4055212 catata 4055217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 322 - 776
Target Start/End: Original strand, 49784304 - 49784765
Alignment:
Q  322 agttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctttaggtttgattcgccccc-------accaataactgtatattgg 414  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||       |||||||||||||||||||    
T  49784304 agtttaatgattatgcatgtaa--ctcaaagcgcatggggttgtcaaactaacatttaggttcgattcgccccccccccccaccaataactgtatattgg 49784401  T
Q  415 atgcaatatg-agtgaccggtgaatccccttcaggatac--tatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtatttt 511  Q
    |||||||| | | |||| || |||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||    
T  49784402 atgcaataaggaatgactggcgaatccccttcaagatacactatgagttctttgacgtgtattgcacaaccataccaaacatatctcctaacaatatttt 49784501  T
Q  512 acagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaat 611  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49784502 ccagatttatggttccagcaattcactcatgaattagagaattgatagatgatttaaagtaaaagaatgagggggaattatgttgttaatgcaacaaaat 49784601  T
Q  612 tctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctct 711  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  49784602 tctgtccaaaattgtgtg-ttgttgtatgtccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacactcat 49784700  T
Q  712 ttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  49784701 ttgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccatttgccaaagcttatgatcatatacact 49784765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 270 - 776
Target Start/End: Original strand, 29827192 - 29827682
Alignment:
Q  270 ttgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcata 369  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  || |    
T  29827192 ttgttgtatatcttgattgttggaaagatactgctgcacttaaaacctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttaccaca 29827291  T
Q  370 ctaa-cctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacg 468  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29827292 ctaaacctttaggttcgattcgcctccaccaataattgtatattggatgcaataggagcgaccggcgaatccccttcaagatactatgagttccttgacg 29827391  T
Q  469 tgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttag 568  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  29827392 tgtattgcacaaccacaccaagggtatctcctaacagtattttacagatttat-----cagcaattcactcatgcattagagaattgatgaatgatttag 29827486  T
Q  569 agtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatt 668  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||           ||| | | || | ||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  29827487 agtaagagaatgagggagaattaggttattaatgcaacaaaattct-----------tgtttatgttttttgtcaaactaatgcccaaatgccaagcatt 29827575  T
Q  669 tacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatca 768  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  29827576 tataatgcattatatgact-ttcacatgatagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatgattcattaagcaccattttgccaaagattatgacca 29827674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 277 - 706
Target Start/End: Original strand, 33703071 - 33703509
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  33703071 atatcttgtttgttggaaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 33703170  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703171 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccg-ttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 33703269  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagag 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  33703270 acaaccacaccaagcgtatctcctaatagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatag 33703369  T
Q  577 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaat-tgtgt---------gttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagca 666  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| | |||||         ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  33703370 aatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattatgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagca 33703469  T
Q  667 tttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagca 706  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703470 tttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagca 33703509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 281 - 609
Target Start/End: Original strand, 20890836 - 20891162
Alignment:
Q  281 cttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctttag 380  Q
    |||||||||||||||||  || ||||| || ||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||     
T  20890836 cttgattgttgggaagagactgctgcactttaaatctaaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaa 20890935  T
Q  381 gtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaa 480  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20890936 gtttgattcgcgcc-accaataactgtatattggatgcaatatgaatgactagtgaatccccttcag-atactatgagttccttgatgtgtattacacaa 20891033  T
Q  481 ccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatg 580  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20891034 tcacacaaagcgtatctcttaacagtattttatagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagcgaatg 20891133  T
Q  581 agggagaattatgttgttaatgcaacaaa 609  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20891134 agggagaattatgttgtttatgtaacaaa 20891162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 502 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 10585066 - 10584787
Alignment:
Q  502 acagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaat 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||||||    
T  10585066 acagtattttacagatttatggttctagctattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaggaattatgttgttaat 10584967  T
Q  602 gcaacaaaattctgtacaaaat---------tgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttca 692  Q
    | ||||||||||||| |||| |         |||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10584966 gtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttca 10584867  T
Q  693 catgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatata 772  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10584866 catgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatata 10584787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 277 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 10586615 - 10586384
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||    
T  10586615 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatgaggttgccacactaacct 10586516  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10586515 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 10586416  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtatctcctaacagtat 508  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10586415 acaaccacgccaagcgtatctcctaacagtat 10586384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 282 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 3187880 - 3187551
Alignment:
Q  282 ttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacctttagg 381  Q
    |||||| |||||| || |||| |||| ||||||  |||||| || ||| || ||||| |||||| ||||||   |||||||||||||||||||||| |||    
T  3187880 ttgattcttgggaggaggctaatgcacttgaaatttgaaaaatttaataataatgcacgtaaaagtcaaagtgtatggggttgtcatactaaccttaagg 3187781  T
Q  382 tttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaac 481  Q
    || ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| || |||| || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  3187780 ttcgattcgctccg-ccaataactatatattggatgcaataggaatgactggcgaatccccttaaggatac-atgagtttcttgatgtgtattgcacaat 3187683  T
Q  482 cacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatga 581  Q
     |||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3187682 tacacaaagtgtatctcttaacaatattttacagatttatggttcgagcaattcactcatgcattaaagaattgatagatgatttagagtaagagaatga 3187583  T
Q  582 gggagaattatgttgttaatgcaacaaaattc 613  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3187582 gggagaattatgttgttaatgtcacaaaattc 3187551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 407 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 18024450 - 18024246
Alignment:
Q  407 tatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagt 506  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| | ||||  ||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |    
T  18024450 tatatttgatgcaataggaatgaccagcgaatatccttcaggatactatgagtttttt-atgtgtattgcacaatcacaccaagcgtatctgttaacaat 18024352  T
Q  507 attttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaac 606  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18024351 attttacagatttattgttctaacaattcattcatgcattagagaattgatgaatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaac 18024252  T
Q  607 aaaatt 612  Q
    ||||||    
T  18024251 aaaatt 18024246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 777 - 917
Target Start/End: Original strand, 36614962 - 36615104
Alignment:
Q  777 catgggcggaggcagcatgaaacatggtgtggcatatgccacaccagtttctaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--aatatgcataattcataagggaa 874  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     |||||||||||||||||||||||    
T  36614962 catgggcggaggcagcatgaaacatggtgtggcatatgccacaccagtttctaatctttttttttttttttttttttaatatgcataattcataagggaa 36615061  T
Q  875 aggcttggcacgggggagatagaaattgaaaattgaaaaacat 917  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36615062 aggcctggcacggggaagatagaaattgaaaattgaaaaacat 36615104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 777 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 26906077 - 26905936
Alignment:
Q  777 catgggcggaggcagcatgaaacatggtgtggcatatgccacaccagtttctaatc-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatatgcataattcataagggaaa 875  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    ||||||||||||||||||||||||    
T  26906077 catgggcggaggcagcatgaaacatggtgtggcatatgccacaccagtttctaatcttttttttttttttttttttaatatgcataattcataagggaaa 26905978  T
Q  876 ggcttggcacgggggagatagaaattgaaaattgaaaaacat 917  Q
    ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26905977 ggcctggcactgggaagatagaaattgaaaattgaaaaacat 26905936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 715 - 774
Target Start/End: Original strand, 20891354 - 20891413
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatataca 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20891354 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatggtcatataca 20891413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 653 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 18024228 - 18024168
Alignment:
Q  653 ccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctcttt 713  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18024228 ccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacctcttt 18024168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 715 - 774
Target Start/End: Original strand, 20891281 - 20891340
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatataca 774  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20891281 acttgaatcaatgatatggttcattaagcaaccatttgccaaaggttatgatcatataca 20891340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 780 - 832
Target Start/End: Original strand, 25069249 - 25069301
Alignment:
Q  780 gggcggaggcagcatgaaacatggtgtggcatatgccacaccagtttctaatc 832  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25069249 gggcggaggcagtgtgaaacatggtgtggcatatgccacaccagtttctaatc 25069301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 652 - 714
Target Start/End: Original strand, 20891182 - 20891244
Alignment:
Q  652 cccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttg 714  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  20891182 cccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacccctttg 20891244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 715 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 18024133 - 18024074
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatataca 774  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18024133 acttgaatcaatgttatggtttattaaacacccttttgccaaagattatgattatataca 18024074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 715 - 776
Target Start/End: Original strand, 29827680 - 29827741
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  29827680 acttgaatcaatgctaaggttcattaagcaccaatttgtcaaatgttataatcatatacact 29827741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 715 - 776
Target Start/End: Original strand, 49784763 - 49784824
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  49784763 acttgaatcaatgatatggtttattatgcacccttttgccaaatgttataaccatatacact 49784824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 715 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 18023525 - 18023468
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatata 772  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||    
T  18023525 acttgaatcaatgatatgattcattaagcacccctttaccaacggttatgaccatata 18023468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 271 - 776
Target Start/End: Original strand, 143861 - 144349
Alignment:
Q  271 tgttggatatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatac 370  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||| || ||    
T  143861 tgttagatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgcttacgcatgtaaaattcaaagcgcatggggttgccacac 143960  T
Q  371 taacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  143961 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataggagttaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 144060  T
Q  471 tattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgattt--ag 568  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||    
T  144061 tattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattaatggatgatttagag 144160  T
Q  569 agtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatt 668  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||               | |||     |||| |||| |||    
T  144161 agcaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctatccaaaattgtgtgt---------------caaat----taatgccaagtatt 144241  T
Q  669 tacagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatca 768  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  144242 tatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgccaagggttatgatca 144341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 2)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 394 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 2335 - 1948
Alignment:
Q  394 ccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgt 493  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2335 ccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgt 2236  T
Q  494 atctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatg 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||    
T  2235 atctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatg 2136  T
Q  594 ttgttaatgcaacaaaattctgtacaa---------aattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatg 684  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||         | ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2135 ttgttaatgtaataaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg 2036  T
Q  685 actcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatata 772  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2035 actcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatata 1948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 7410 - 7246
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||| ||  ||  || |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  7410 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaatctttaatttttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 7311  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccc 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  7310 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccc 7246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 129; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 277 - 469
Target Start/End: Original strand, 16378 - 16570
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  16378 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacct 16477  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgt 469  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16478 ttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgt 16570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 277 - 353
Target Start/End: Original strand, 16283 - 16359
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagc 353  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16283 atatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagc 16359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 119; Significance: 3e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 277 - 495
Target Start/End: Original strand, 170589 - 170807
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgtcatactaacct 376  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||  || ||| ||||    
T  170589 atatcttgattgttaggatgaagctgctgcacttgaaatctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaacttaaagctcatggggtttccacactgacct 170688  T
Q  377 ttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgagtgaccggtgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 476  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  170689 ttaggttcgatttgcccccactaataactgtatattggatgcaataggaatgacccgcgaatcccctttaggatactatgagttccttaatgtgtattgc 170788  T
Q  477 acaaccacaccaagcgtat 495  Q
    | |||||||||||||||||    
T  170789 agaaccacaccaagcgtat 170807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 492 - 776
Target Start/End: Original strand, 173344 - 173622
Alignment:
Q  492 gtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaatta 591  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  173344 gtatcccctaacagtattttagagatttatggttccagcaattcacctatacattagagaattgatggatgatttagagtaagagaattaggaagaatta 173443  T
Q  592 tgttgttaatgcaacaaaattctgtacaaaattgtgtgttttttgtatgtccgactaatgcccaaatgtcaagcatttacagtgcattatatgactcttc 691  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |      || ||| |||| | |||||   | |||||| ||||| |||| |||||| || |||||||||||| ||||    
T  173444 tgttgttgatgtaacaaaattcttt-----tttctgtattttgt-tatgttaaattaatgcacaaatatcaaacatttatagcgcattatatgacccttc 173537  T
Q  692 acatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatatacact 776  Q
    |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  173538 acatgatagaaaacacccatttgacttgaatcaatgctaaggttcattaaacactcctttgtcaaatgttatgatcatatacact 173622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 715 - 761
Target Start/End: Original strand, 173620 - 173666
Alignment:
Q  715 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggtt 761  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  173620 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcacccttttgccaaaggtt 173666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0756 (Bit Score: 48; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0756
Description:

Target: scaffold0756; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 277 - 364
Target Start/End: Original strand, 3916 - 4003
Alignment:
Q  277 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacctgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttg 364  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3916 atatcttgtttgttgagaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttg 4003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0592 (Bit Score: 45; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0592
Description:

Target: scaffold0592; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 776 - 832
Target Start/End: Original strand, 3616 - 3672
Alignment:
Q  776 tcatgggcggaggcagcatgaaacatggtgtggcatatgccacaccagtttctaatc 832  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3616 tcatgggcagaggcagtgtgaaacatggtgtggcatatgccacaccagtttctaatc 3672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University