View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15782_low_1 (Length: 277)

Name: NF15782_low_1
Description: NF15782
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15782_low_1
NF15782_low_1
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (14-274)||(19268-19528)
[»] chr7 (79 HSPs)
chr7 (10-274)||(67745-68008)
chr7 (14-274)||(18005650-18005910)
chr7 (14-277)||(44014182-44014439)
chr7 (10-277)||(47831807-47832074)
chr7 (10-274)||(16219574-16219835)
chr7 (25-277)||(16056343-16056594)
chr7 (10-277)||(22072913-22073182)
chr7 (14-274)||(810988-811248)
chr7 (10-276)||(34200786-34201049)
chr7 (10-277)||(15754743-15755008)
chr7 (25-277)||(12901338-12901595)
chr7 (10-276)||(28505156-28505419)
chr7 (10-276)||(11995885-11996148)
chr7 (10-177)||(16495402-16495567)
chr7 (29-277)||(20220043-20220290)
chr7 (10-187)||(2280061-2280238)
chr7 (10-170)||(18430709-18430870)
chr7 (13-136)||(18456408-18456530)
chr7 (10-136)||(38227481-38227606)
chr7 (32-133)||(12255789-12255892)
chr7 (13-170)||(17061919-17062077)
chr7 (95-277)||(15113028-15113210)
chr7 (13-170)||(456321-456479)
chr7 (13-170)||(11972496-11972654)
chr7 (10-136)||(12698831-12698958)
chr7 (13-170)||(14949126-14949284)
chr7 (13-170)||(15376717-15376875)
chr7 (13-170)||(16232520-16232678)
chr7 (13-170)||(18640272-18640430)
chr7 (13-170)||(20385127-20385285)
chr7 (13-170)||(21189599-21189757)
chr7 (13-170)||(24702238-24702396)
chr7 (13-170)||(32125491-32125649)
chr7 (13-170)||(41522917-41523075)
chr7 (13-170)||(41525379-41525537)
chr7 (25-201)||(1867923-1868101)
chr7 (13-132)||(3564363-3564482)
chr7 (14-170)||(11393291-11393448)
chr7 (10-170)||(13647325-13647487)
chr7 (25-196)||(14044761-14044935)
chr7 (25-196)||(14354791-14354965)
chr7 (13-132)||(48273392-48273511)
chr7 (10-136)||(9509189-9509315)
chr7 (118-277)||(9389551-9389709)
chr7 (13-170)||(16410059-16410217)
chr7 (13-170)||(24704688-24704843)
chr7 (13-170)||(27216860-27217018)
chr7 (179-275)||(16324175-16324270)
chr7 (95-277)||(15116565-15116747)
chr7 (10-205)||(19486668-19486865)
chr7 (13-170)||(44116509-44116667)
chr7 (28-136)||(10063813-10063921)
chr7 (17-132)||(24275175-24275289)
chr7 (10-136)||(26211995-26212122)
chr7 (10-136)||(16386242-16386369)
chr7 (13-170)||(3386333-3386491)
chr7 (13-125)||(16213684-16213795)
chr7 (13-63)||(13869346-13869396)
chr7 (33-187)||(15008441-15008597)
chr7 (13-63)||(20110556-20110606)
chr7 (12-129)||(40443393-40443509)
chr7 (10-129)||(10589039-10589158)
chr7 (13-63)||(13831373-13831423)
chr7 (10-80)||(27847881-27847951)
chr7 (25-132)||(15144037-15144143)
chr7 (17-63)||(38898489-38898535)
chr7 (14-63)||(14932802-14932851)
chr7 (14-63)||(15356237-15356286)
chr7 (14-63)||(15360351-15360400)
chr7 (38-138)||(14036282-14036384)
chr7 (38-138)||(14346312-14346414)
chr7 (16-63)||(18154909-18154956)
chr7 (13-63)||(26356106-26356156)
chr7 (13-63)||(26358558-26358608)
chr7 (11-63)||(2832509-2832561)
chr7 (36-82)||(48991206-48991252)
chr7 (14-63)||(19649557-19649606)
chr7 (95-131)||(16324135-16324171)
chr7 (29-81)||(18203831-18203882)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (10-274)||(6535-6798)
scaffold0621 (25-277)||(8481-8736)
[»] chr1 (59 HSPs)
chr1 (14-277)||(22921723-22921986)
chr1 (10-277)||(33681010-33681274)
chr1 (10-277)||(22237630-22237895)
chr1 (25-277)||(52927836-52928076)
chr1 (29-277)||(21861423-21861672)
chr1 (24-277)||(21754059-21754302)
chr1 (29-277)||(21896112-21896358)
chr1 (14-274)||(20248283-20248539)
chr1 (29-277)||(16368140-16368388)
chr1 (26-272)||(20918620-20918863)
chr1 (29-277)||(50613970-50614219)
chr1 (29-277)||(50621798-50622047)
chr1 (29-277)||(50686630-50686880)
chr1 (10-177)||(14295507-14295672)
chr1 (29-275)||(41049891-41050138)
chr1 (118-277)||(35981542-35981700)
chr1 (118-277)||(49261448-49261606)
chr1 (25-199)||(16758664-16758841)
chr1 (14-229)||(21161720-21161932)
chr1 (11-132)||(50210212-50210333)
chr1 (29-123)||(35261086-35261180)
chr1 (13-170)||(13988866-13989024)
chr1 (118-275)||(20636957-20637113)
chr1 (13-170)||(21923295-21923453)
chr1 (10-170)||(45574846-45575008)
chr1 (13-170)||(21475091-21475249)
chr1 (12-132)||(21840766-21840885)
chr1 (13-170)||(23593739-23593897)
chr1 (13-170)||(29298137-29298294)
chr1 (13-170)||(29776688-29776846)
chr1 (13-170)||(31612313-31612471)
chr1 (13-129)||(34509783-34509899)
chr1 (13-170)||(433012-433168)
chr1 (10-136)||(22532269-22532395)
chr1 (10-136)||(27250724-27250850)
chr1 (13-170)||(22123071-22123230)
chr1 (10-136)||(21026680-21026806)
chr1 (207-277)||(12271744-12271814)
chr1 (10-63)||(13212974-13213027)
chr1 (29-188)||(16093825-16093987)
chr1 (11-75)||(20454610-20454673)
chr1 (7-63)||(21342090-21342146)
chr1 (11-170)||(16361915-16362075)
chr1 (10-81)||(20847205-20847275)
chr1 (13-63)||(21346961-21347011)
chr1 (13-63)||(21707167-21707217)
chr1 (13-63)||(21711709-21711759)
chr1 (7-63)||(15860121-15860177)
chr1 (10-86)||(38801433-38801508)
chr1 (63-177)||(22130863-22130975)
chr1 (11-129)||(22468698-22468816)
chr1 (13-63)||(16275476-16275526)
chr1 (78-177)||(51130632-51130729)
chr1 (14-63)||(21714546-21714595)
chr1 (11-129)||(20135188-20135306)
chr1 (31-170)||(26064959-26065100)
chr1 (11-63)||(24783160-24783212)
chr1 (16-63)||(40389157-40389204)
chr1 (95-215)||(22124370-22124491)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (14-277)||(40028-40291)
scaffold0023 (14-277)||(100378-100641)
scaffold0023 (13-170)||(94411-94569)
scaffold0023 (13-170)||(44454-44613)
scaffold0023 (10-83)||(119875-119948)
scaffold0023 (17-170)||(17444-17598)
scaffold0023 (14-87)||(101503-101576)
scaffold0023 (215-277)||(101599-101660)
scaffold0023 (14-63)||(38547-38596)
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (10-277)||(38855106-38855372)
chr8 (10-275)||(6520368-6520632)
chr8 (10-274)||(23760698-23760962)
chr8 (24-274)||(21673718-21673967)
chr8 (14-277)||(21285601-21285864)
chr8 (14-274)||(26355557-26355815)
chr8 (10-276)||(5866132-5866395)
chr8 (25-277)||(983256-983512)
chr8 (10-276)||(21490995-21491258)
chr8 (10-276)||(17140916-17141179)
chr8 (29-277)||(20498581-20498830)
chr8 (29-277)||(37116366-37116616)
chr8 (29-277)||(17266846-17267096)
chr8 (10-276)||(21255222-21255485)
chr8 (10-274)||(21249384-21249645)
chr8 (29-277)||(24353039-24353291)
chr8 (10-136)||(22626736-22626861)
chr8 (10-136)||(16092337-16092463)
chr8 (28-187)||(13508027-13508188)
chr8 (10-136)||(21918995-21919121)
chr8 (11-129)||(28649046-28649164)
chr8 (28-187)||(13597559-13597720)
chr8 (29-199)||(17439436-17439609)
chr8 (10-170)||(17612069-17612231)
chr8 (10-136)||(22875065-22875190)
chr8 (13-170)||(1484402-1484560)
chr8 (13-170)||(5853296-5853454)
chr8 (13-170)||(14409448-14409606)
chr8 (13-170)||(20046199-20046357)
chr8 (13-170)||(20403227-20403385)
chr8 (13-170)||(22001753-22001911)
chr8 (10-136)||(7372778-7372904)
chr8 (10-129)||(16199647-16199765)
chr8 (10-136)||(20536208-20536334)
chr8 (10-129)||(31971257-31971375)
chr8 (7-123)||(6759255-6759371)
chr8 (10-136)||(18818404-18818530)
chr8 (10-136)||(21923923-21924049)
chr8 (91-277)||(22364744-22364929)
chr8 (13-136)||(26219717-26219838)
chr8 (13-136)||(26225288-26225409)
chr8 (10-123)||(23406379-23406492)
chr8 (13-170)||(4483281-4483438)
chr8 (13-170)||(15203235-15203393)
chr8 (17-170)||(16413320-16413474)
chr8 (10-87)||(18879276-18879352)
chr8 (13-170)||(41598188-41598346)
chr8 (10-129)||(21395984-21396101)
chr8 (10-129)||(21790477-21790594)
chr8 (13-170)||(4542377-4542535)
chr8 (10-129)||(21389454-21389571)
chr8 (10-129)||(21778780-21778897)
chr8 (13-72)||(19896265-19896323)
chr8 (7-63)||(19937118-19937174)
chr8 (10-81)||(45131047-45131117)
chr8 (17-63)||(45290807-45290853)
chr8 (29-169)||(19801387-19801527)
chr8 (29-199)||(19154816-19154989)
chr8 (13-63)||(25484380-25484430)
chr8 (13-170)||(14823774-14823931)
chr8 (12-63)||(18678170-18678221)
chr8 (11-170)||(26223917-26224077)
chr8 (11-136)||(23648554-23648679)
chr8 (26-63)||(15070571-15070608)
chr8 (12-63)||(32121734-32121785)
chr8 (91-138)||(40492844-40492891)
chr8 (86-177)||(21383887-21383978)
chr8 (141-205)||(37515837-37515901)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (14-274)||(2502-2762)
[»] chr2 (63 HSPs)
chr2 (14-277)||(25175854-25176117)
chr2 (15-277)||(28405981-28406244)
chr2 (29-277)||(7586-7835)
chr2 (25-277)||(18786756-18787009)
chr2 (14-171)||(7679589-7679746)
chr2 (11-277)||(22134071-22134326)
chr2 (29-277)||(23207296-23207545)
chr2 (29-277)||(23791292-23791542)
chr2 (13-136)||(298809-298933)
chr2 (10-177)||(23071905-23072070)
chr2 (13-170)||(22105412-22105571)
chr2 (10-170)||(19671830-19671991)
chr2 (10-187)||(23708561-23708738)
chr2 (29-277)||(25108906-25109156)
chr2 (10-136)||(23060513-23060639)
chr2 (13-170)||(18808943-18809101)
chr2 (95-277)||(22459415-22459598)
chr2 (13-170)||(23130862-23131020)
chr2 (13-170)||(23133329-23133487)
chr2 (13-170)||(23709536-23709694)
chr2 (13-170)||(23712017-23712175)
chr2 (13-170)||(34402526-34402684)
chr2 (13-170)||(39682313-39682471)
chr2 (13-167)||(23135590-23135745)
chr2 (13-170)||(571397-571555)
chr2 (13-170)||(6725995-6726153)
chr2 (13-170)||(24367774-24367932)
chr2 (13-170)||(26505379-26505537)
chr2 (13-170)||(26507857-26508015)
chr2 (13-170)||(28577099-28577257)
chr2 (10-136)||(22337115-22337241)
chr2 (10-136)||(23076442-23076568)
chr2 (10-136)||(23285865-23285987)
chr2 (10-136)||(23654381-23654507)
chr2 (10-108)||(38138-38235)
chr2 (16-170)||(21155064-21155219)
chr2 (10-136)||(23660023-23660148)
chr2 (13-170)||(24898199-24898358)
chr2 (13-170)||(24900682-24900841)
chr2 (13-170)||(24903159-24903318)
chr2 (13-170)||(24905636-24905795)
chr2 (13-170)||(24908111-24908270)
chr2 (29-170)||(20520152-20520295)
chr2 (13-170)||(32039502-32039660)
chr2 (10-129)||(20309108-20309225)
chr2 (10-136)||(22731229-22731355)
chr2 (11-170)||(32214925-32215085)
chr2 (10-132)||(23103396-23103516)
chr2 (13-170)||(45029858-45030016)
chr2 (10-74)||(23040247-23040310)
chr2 (15-170)||(43137301-43137457)
chr2 (29-199)||(24697536-24697709)
chr2 (13-63)||(38967374-38967424)
chr2 (10-87)||(8946657-8946733)
chr2 (29-187)||(22413078-22413240)
chr2 (10-63)||(22738247-22738300)
chr2 (16-72)||(24643054-24643109)
chr2 (13-63)||(24529641-24529691)
chr2 (29-164)||(23004767-23004905)
chr2 (17-63)||(25616192-25616238)
chr2 (29-75)||(32451985-32452031)
chr2 (31-81)||(23287384-23287433)
chr2 (31-80)||(26392403-26392451)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (24-274)||(5657-5906)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (14-274)||(14554-14814)
[»] chr4 (66 HSPs)
chr4 (10-277)||(39706143-39706409)
chr4 (25-274)||(12288066-12288316)
chr4 (14-277)||(12774011-12774264)
chr4 (29-277)||(13704-13953)
chr4 (14-277)||(8846360-8846639)
chr4 (10-276)||(15551817-15552079)
chr4 (25-277)||(43198409-43198661)
chr4 (29-277)||(53082004-53082254)
chr4 (29-277)||(46640310-46640558)
chr4 (25-133)||(52243192-52243302)
chr4 (118-275)||(15099457-15099613)
chr4 (48-276)||(16596686-16596911)
chr4 (118-277)||(15190424-15190582)
chr4 (13-170)||(44615288-44615446)
chr4 (13-136)||(8574864-8574985)
chr4 (13-132)||(16377522-16377639)
chr4 (13-170)||(12311-12469)
chr4 (13-170)||(15118356-15118514)
chr4 (13-170)||(18215278-18215436)
chr4 (13-170)||(44773091-44773249)
chr4 (13-170)||(52312510-52312668)
chr4 (10-129)||(7088877-7088996)
chr4 (13-136)||(14280316-14280438)
chr4 (13-136)||(54798749-54798872)
chr4 (10-136)||(7798774-7798900)
chr4 (11-170)||(19618176-19618336)
chr4 (10-136)||(6899891-6900016)
chr4 (10-136)||(16270231-16270356)
chr4 (10-135)||(52873363-52873488)
chr4 (12-136)||(22636437-22636561)
chr4 (13-170)||(44928883-44929042)
chr4 (13-170)||(50222343-50222501)
chr4 (13-170)||(51463872-51464030)
chr4 (10-136)||(12902757-12902883)
chr4 (7-170)||(19242693-19242857)
chr4 (10-136)||(16239965-16240090)
chr4 (13-167)||(18239426-18239581)
chr4 (13-170)||(1837513-1837671)
chr4 (17-136)||(23374354-23374473)
chr4 (10-136)||(7893703-7893829)
chr4 (10-136)||(44052829-44052955)
chr4 (10-87)||(3096293-3096369)
chr4 (13-170)||(3515007-3515165)
chr4 (10-75)||(17046487-17046552)
chr4 (13-125)||(23803316-23803427)
chr4 (13-72)||(7641286-7641344)
chr4 (13-72)||(12610950-12611008)
chr4 (15-132)||(14038653-14038770)
chr4 (17-170)||(15355328-15355483)
chr4 (13-63)||(44102214-44102264)
chr4 (10-127)||(14053306-14053422)
chr4 (11-132)||(14970751-14970871)
chr4 (29-75)||(6190481-6190527)
chr4 (12-170)||(22353835-22353995)
chr4 (202-268)||(14164741-14164807)
chr4 (10-63)||(15367690-15367743)
chr4 (10-63)||(15370018-15370071)
chr4 (10-63)||(15371202-15371255)
chr4 (10-63)||(15373483-15373536)
chr4 (10-63)||(15402703-15402756)
chr4 (92-133)||(15464929-15464970)
chr4 (10-63)||(16223532-16223585)
chr4 (29-170)||(21815589-21815731)
chr4 (202-268)||(14158036-14158102)
chr4 (31-81)||(17333298-17333347)
chr4 (11-63)||(20157527-20157579)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (10-277)||(21329351-21329618)
chr5 (10-277)||(21502008-21502277)
chr5 (14-277)||(21565546-21565809)
chr5 (10-277)||(26011889-26012154)
chr5 (29-277)||(20026794-20027043)
chr5 (14-274)||(22959392-22959649)
chr5 (10-274)||(19668898-19669161)
chr5 (10-276)||(19660693-19660956)
chr5 (29-277)||(22178073-22178323)
chr5 (10-111)||(36314577-36314678)
chr5 (10-136)||(21729059-21729185)
chr5 (10-136)||(21808384-21808510)
chr5 (29-170)||(22144068-22144211)
chr5 (10-136)||(23390491-23390617)
chr5 (13-136)||(22412187-22412309)
chr5 (10-136)||(24493569-24493694)
chr5 (13-170)||(264772-264930)
chr5 (13-170)||(10732944-10733102)
chr5 (13-170)||(11581203-11581361)
chr5 (13-170)||(20909012-20909170)
chr5 (13-170)||(29329934-29330092)
chr5 (13-170)||(39363384-39363542)
chr5 (10-135)||(8286838-8286964)
chr5 (10-136)||(13025311-13025436)
chr5 (10-136)||(13095495-13095620)
chr5 (13-170)||(42245369-42245527)
chr5 (10-136)||(1096467-1096593)
chr5 (10-132)||(9077952-9078074)
chr5 (10-116)||(21997549-21997655)
chr5 (10-136)||(25421532-25421658)
chr5 (13-170)||(2154617-2154776)
chr5 (13-129)||(24529223-24529339)
chr5 (13-170)||(29345980-29346138)
chr5 (10-205)||(40725853-40726050)
chr5 (10-136)||(22075018-22075145)
chr5 (13-170)||(36154787-36154942)
chr5 (13-170)||(20902012-20902172)
chr5 (118-177)||(21741486-21741545)
chr5 (13-167)||(39245136-39245291)
chr5 (13-170)||(29348453-29348611)
chr5 (13-170)||(29350926-29351084)
chr5 (13-72)||(20918052-20918110)
chr5 (13-63)||(38619434-38619484)
chr5 (14-63)||(23064512-23064561)
chr5 (10-134)||(25431395-25431518)
chr5 (13-170)||(32027393-32027551)
chr5 (13-61)||(10775790-10775838)
chr5 (16-170)||(18319037-18319193)
chr5 (13-63)||(31061068-31061118)
chr5 (63-164)||(29448055-29448159)
chr5 (10-81)||(21293020-21293090)
chr5 (13-63)||(20806854-20806904)
chr5 (29-82)||(37723922-37723975)
chr5 (14-63)||(26704075-26704124)
chr5 (14-63)||(26973808-26973857)
chr5 (12-63)||(17517269-17517320)
chr5 (16-63)||(24067110-24067157)
chr5 (29-80)||(26740697-26740747)
chr5 (76-136)||(20766115-20766175)
chr5 (20-129)||(18418590-18418697)
chr5 (26-80)||(26732884-26732937)
chr5 (236-277)||(21741399-21741440)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (14-277)||(2658-2923)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (25-277)||(10542-10794)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (68-277)||(2072-2281)
[»] chr3 (91 HSPs)
chr3 (10-277)||(15470927-15471190)
chr3 (14-277)||(16097332-16097595)
chr3 (14-277)||(16103784-16104046)
chr3 (10-274)||(14234487-14234753)
chr3 (24-277)||(32307691-32307934)
chr3 (14-241)||(12174152-12174376)
chr3 (10-277)||(13210183-13210448)
chr3 (14-277)||(49667939-49668193)
chr3 (29-277)||(37251021-37251270)
chr3 (14-274)||(9512924-9513171)
chr3 (24-277)||(1644538-1644780)
chr3 (14-274)||(9520899-9521146)
chr3 (13-136)||(27165250-27165373)
chr3 (13-136)||(53301545-53301669)
chr3 (29-187)||(52523669-52523831)
chr3 (29-277)||(22110205-22110454)
chr3 (10-136)||(12399209-12399335)
chr3 (119-277)||(49389484-49389642)
chr3 (10-205)||(24340647-24340844)
chr3 (13-136)||(36166598-36166719)
chr3 (10-129)||(18438534-18438653)
chr3 (28-136)||(23274705-23274813)
chr3 (10-136)||(14972854-14972980)
chr3 (10-136)||(17487856-17487982)
chr3 (10-136)||(17499338-17499464)
chr3 (13-136)||(24153204-24153326)
chr3 (13-79)||(28194693-28194759)
chr3 (118-277)||(1465265-1465423)
chr3 (13-170)||(7781351-7781509)
chr3 (13-170)||(17463178-17463336)
chr3 (13-170)||(17672626-17672784)
chr3 (13-170)||(29172587-29172745)
chr3 (13-170)||(34159326-34159484)
chr3 (29-170)||(43925977-43926121)
chr3 (13-170)||(45606911-45607069)
chr3 (13-170)||(55476491-55476649)
chr3 (10-136)||(13442274-13442400)
chr3 (15-170)||(16282815-16282971)
chr3 (13-136)||(21618449-21618570)
chr3 (10-108)||(11424783-11424880)
chr3 (13-167)||(28848618-28848773)
chr3 (13-170)||(8899094-8899252)
chr3 (13-170)||(9707611-9707769)
chr3 (13-170)||(16454285-16454443)
chr3 (10-205)||(37642189-37642386)
chr3 (13-170)||(38961895-38962053)
chr3 (28-136)||(42386428-42386536)
chr3 (13-132)||(6469178-6469296)
chr3 (24-136)||(14572603-14572714)
chr3 (10-129)||(20698437-20698556)
chr3 (13-132)||(40213720-40213838)
chr3 (10-136)||(23083356-23083482)
chr3 (13-127)||(55500942-55501055)
chr3 (13-170)||(13151794-13151953)
chr3 (13-170)||(13154259-13154418)
chr3 (12-170)||(13544024-13544183)
chr3 (13-170)||(10247727-10247885)
chr3 (17-170)||(12567564-12567718)
chr3 (13-170)||(17446659-17446816)
chr3 (13-132)||(15977515-15977633)
chr3 (10-170)||(43550482-43550644)
chr3 (10-132)||(25476384-25476506)
chr3 (10-136)||(26686887-26687013)
chr3 (10-136)||(43840932-43841058)
chr3 (29-132)||(606324-606428)
chr3 (15-170)||(41123892-41124045)
chr3 (13-170)||(50242822-50242980)
chr3 (24-136)||(14576828-14576939)
chr3 (13-72)||(17737236-17737294)
chr3 (13-63)||(8499518-8499568)
chr3 (13-63)||(10556985-10557035)
chr3 (13-63)||(15412429-15412479)
chr3 (13-63)||(45577950-45578000)
chr3 (180-277)||(43927304-43927400)
chr3 (29-170)||(53070657-53070799)
chr3 (201-277)||(12934166-12934242)
chr3 (10-187)||(22147467-22147646)
chr3 (13-63)||(12119837-12119887)
chr3 (13-63)||(44494809-44494859)
chr3 (29-126)||(12377940-12378039)
chr3 (72-187)||(2051141-2051260)
chr3 (12-63)||(46822267-46822318)
chr3 (12-63)||(12511059-12511110)
chr3 (11-63)||(14665398-14665450)
chr3 (11-63)||(14668554-14668606)
chr3 (14-63)||(856140-856189)
chr3 (14-63)||(15878119-15878168)
chr3 (14-75)||(23077534-23077594)
chr3 (31-75)||(13919350-13919393)
chr3 (14-62)||(26196500-26196548)
chr3 (11-63)||(30029841-30029893)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (10-277)||(12766-13033)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (10-277)||(32538-32802)
scaffold0034 (29-69)||(51945-51985)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (28-270)||(62216-62455)
scaffold0028 (14-277)||(132662-132918)
scaffold0028 (13-170)||(136680-136838)
scaffold0028 (13-170)||(139149-139307)
scaffold0028 (13-170)||(144087-144245)
scaffold0028 (13-170)||(134211-134369)
scaffold0028 (13-170)||(141618-141776)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (25-277)||(10395-10647)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (10-274)||(5980-6244)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (14-277)||(1086-1349)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (10-277)||(6611-6878)
scaffold0333 (10-277)||(13991-14258)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (24-277)||(129919-130172)
scaffold0010 (29-133)||(60713-60818)
[»] chr6 (76 HSPs)
chr6 (10-277)||(23019408-23019673)
chr6 (14-277)||(19652199-19652460)
chr6 (25-277)||(19668386-19668639)
chr6 (10-277)||(22080593-22080846)
chr6 (10-277)||(28496328-28496592)
chr6 (10-277)||(29808739-29809003)
chr6 (10-277)||(1561303-1561568)
chr6 (25-277)||(9098379-9098620)
chr6 (10-277)||(20109140-20109408)
chr6 (10-111)||(27333238-27333339)
chr6 (10-111)||(27393978-27394079)
chr6 (24-125)||(4185827-4185928)
chr6 (24-125)||(4186381-4186482)
chr6 (10-136)||(16496244-16496370)
chr6 (13-170)||(1595549-1595707)
chr6 (13-170)||(22782227-22782385)
chr6 (10-132)||(29060540-29060662)
chr6 (29-275)||(23076749-23076997)
chr6 (13-170)||(2291184-2291342)
chr6 (13-170)||(12742317-12742475)
chr6 (13-170)||(18334596-18334754)
chr6 (13-170)||(19005046-19005204)
chr6 (13-170)||(19858923-19859081)
chr6 (10-123)||(20076700-20076812)
chr6 (13-170)||(24422547-24422705)
chr6 (25-133)||(25644335-25644444)
chr6 (13-170)||(33861794-33861952)
chr6 (13-170)||(33864278-33864436)
chr6 (29-277)||(35008167-35008417)
chr6 (10-136)||(17287791-17287917)
chr6 (11-170)||(30676714-30676874)
chr6 (11-132)||(18409826-18409947)
chr6 (10-132)||(19303540-19303661)
chr6 (13-170)||(8055029-8055187)
chr6 (10-205)||(8227435-8227632)
chr6 (13-170)||(26924644-26924802)
chr6 (14-183)||(31155346-31155514)
chr6 (10-132)||(25629354-25629476)
chr6 (13-170)||(25754809-25754967)
chr6 (13-116)||(25656629-25656731)
chr6 (10-136)||(20360955-20361081)
chr6 (13-170)||(20556898-20557054)
chr6 (10-132)||(20593773-20593895)
chr6 (11-170)||(34963371-34963531)
chr6 (13-167)||(1540918-1541073)
chr6 (10-72)||(25714417-25714478)
chr6 (10-129)||(16920634-16920751)
chr6 (10-129)||(20638285-20638404)
chr6 (13-132)||(25688502-25688620)
chr6 (177-277)||(27333139-27333238)
chr6 (177-277)||(27393879-27393978)
chr6 (10-129)||(35245586-35245703)
chr6 (13-170)||(3852021-3852179)
chr6 (65-125)||(4668217-4668277)
chr6 (65-125)||(4675064-4675124)
chr6 (16-170)||(16448530-16448686)
chr6 (29-170)||(18456735-18456877)
chr6 (10-63)||(22780295-22780348)
chr6 (10-75)||(22831503-22831568)
chr6 (29-277)||(18199269-18199519)
chr6 (29-73)||(11185524-11185568)
chr6 (29-132)||(18461895-18461997)
chr6 (12-63)||(19848063-19848114)
chr6 (29-277)||(18177525-18177775)
chr6 (29-277)||(18204096-18204346)
chr6 (141-230)||(28103799-28103887)
chr6 (91-197)||(18696569-18696675)
chr6 (29-72)||(18821904-18821946)
chr6 (12-63)||(23992429-23992480)
chr6 (91-199)||(18706387-18706495)
chr6 (7-51)||(19008799-19008843)
chr6 (31-108)||(33443068-33443146)
chr6 (14-63)||(18907111-18907160)
chr6 (14-63)||(19862978-19863027)
chr6 (14-63)||(19873120-19873169)
chr6 (141-189)||(18896256-18896304)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (25-277)||(22528-22776)
scaffold0037 (13-170)||(82072-82230)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (14-277)||(160688-160950)
scaffold0001 (17-170)||(501088-501242)
scaffold0001 (13-63)||(85692-85742)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (10-274)||(892-1155)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (24-274)||(6826-7073)
scaffold0556 (92-277)||(8097-8282)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (14-277)||(133-395)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (14-277)||(45646-45909)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (10-277)||(12942-13206)
scaffold0138 (91-277)||(18091-18277)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (25-277)||(7930-8180)
scaffold0218 (57-276)||(29135-29354)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (13-276)||(15664-15924)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (29-277)||(136221-136471)
scaffold0021 (29-277)||(144929-145179)
scaffold0021 (11-132)||(174767-174886)
scaffold0021 (10-80)||(121766-121835)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (29-277)||(53402-53651)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (29-277)||(12587-12835)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (10-276)||(11292-11555)
scaffold0046 (10-244)||(1997-2228)
scaffold0046 (10-129)||(28414-28533)
scaffold0046 (10-66)||(4552-4608)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (25-277)||(103492-103737)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (29-277)||(6136-6386)
scaffold0420 (29-75)||(13794-13840)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (33-277)||(38339-38585)
scaffold0139 (14-63)||(19980-20029)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (31-272)||(7917-8161)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (29-251)||(128849-129072)
scaffold0022 (33-275)||(78345-78587)
scaffold0022 (13-136)||(116430-116551)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (29-277)||(97024-97273)
scaffold0006 (29-277)||(106302-106551)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (10-274)||(34123-34384)
scaffold0175 (10-63)||(273-326)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (10-116)||(15792-15898)
scaffold0020 (202-277)||(15686-15761)
scaffold0020 (14-63)||(178898-178947)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (13-136)||(38697-38820)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (10-177)||(1025-1190)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (14-264)||(32102-32345)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (10-117)||(23897-24001)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (29-273)||(19742-19987)
scaffold0080 (10-136)||(39913-40038)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (10-136)||(3146-3271)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (29-136)||(1051-1158)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (60-274)||(54-270)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (11-132)||(3185-3306)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (25-170)||(25121-25268)
scaffold0123 (91-199)||(619-727)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (29-277)||(569-816)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (12-136)||(39479-39602)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (12-136)||(75210-75333)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (10-136)||(1851-1977)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (10-205)||(17951-18148)
scaffold0247 (13-63)||(2241-2291)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (10-136)||(32952-33077)
scaffold0120 (10-136)||(45928-46053)
scaffold0120 (10-132)||(16113-16235)
scaffold0120 (10-72)||(17389-17450)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (10-129)||(4849-4968)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (29-129)||(13147-13247)
scaffold0357 (25-133)||(16098-16206)
scaffold0357 (29-81)||(2680-2732)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (25-133)||(27747-27855)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (13-136)||(44702-44825)
scaffold0122 (17-132)||(26064-26179)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (10-187)||(11464-11643)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (10-187)||(38198-38377)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (11-132)||(17214-17337)
scaffold0056 (29-170)||(79288-79430)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (10-136)||(25896-26021)
scaffold0026 (10-136)||(39858-39983)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (13-170)||(20747-20905)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (13-170)||(37821-37979)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (13-170)||(158454-158612)
scaffold0003 (13-132)||(339949-340065)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (29-277)||(1651-1900)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (10-136)||(13211-13337)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (13-167)||(13392-13547)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (10-136)||(32942-33067)
scaffold0145 (10-136)||(38761-38886)
scaffold0145 (8-170)||(9744-9908)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (12-132)||(10772-10891)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (13-170)||(13947-14105)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (13-170)||(16784-16942)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (10-129)||(10427-10544)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (13-136)||(22886-23008)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (10-129)||(1289-1406)
scaffold0106 (10-129)||(7266-7383)
scaffold0106 (13-63)||(15306-15356)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (29-265)||(267679-267916)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (10-136)||(3470-3596)
scaffold0292 (10-136)||(343-468)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (10-136)||(51913-52039)
scaffold0011 (10-136)||(167973-168099)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (13-170)||(4694-4852)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (12-132)||(9241-9360)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (10-136)||(8528-8650)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (13-170)||(40400-40558)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (10-129)||(51582-51699)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (10-136)||(1043-1169)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (10-136)||(1952-2078)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (68-276)||(2300-2505)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (10-129)||(15466-15584)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (10-129)||(32067-32184)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (10-136)||(6116-6245)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (10-127)||(16282-16397)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (13-170)||(106-264)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (14-94)||(28806-28887)
scaffold0211 (201-277)||(28665-28741)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (29-170)||(20383-20524)
scaffold0031 (10-136)||(128751-128876)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (10-129)||(13497-13615)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (10-132)||(16599-16721)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (28-136)||(24297-24406)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (11-170)||(11286-11446)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (13-170)||(161093-161252)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (16-132)||(4300-4415)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (13-129)||(5132-5246)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (10-87)||(4712-4788)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (10-129)||(8479-8598)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (10-129)||(1053-1170)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (65-125)||(9133-9193)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (10-129)||(20910-21030)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (11-170)||(12253-12413)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (13-170)||(12064-12216)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (10-136)||(4508-4633)
scaffold0228 (10-136)||(12090-12215)
scaffold0228 (10-136)||(22042-22167)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (13-170)||(4214-4373)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (13-170)||(29931-30090)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (10-80)||(46995-47065)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (10-75)||(4890-4954)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (16-63)||(1393-1440)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (29-117)||(2694-2784)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (14-63)||(23843-23892)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (14-63)||(36454-36503)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (10-127)||(11447-11564)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (31-136)||(4545-4650)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (68-187)||(225465-225585)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (29-72)||(11982-12024)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (14-63)||(29558-29607)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (141-215)||(675-749)
[»] scaffold1137 (2 HSPs)
scaffold1137 (227-277)||(2157-2207)
scaffold1137 (122-164)||(2261-2303)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (14-64)||(289-339)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (14-63)||(159-208)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (14-63)||(21871-21920)
scaffold0210 (14-63)||(29763-29812)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (14-63)||(69794-69843)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (92-136)||(27912-27956)


Alignment Details
Target: scaffold0102 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Original strand, 19268 - 19528
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19268 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 19367  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19368 caaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcagggttactg 19467  T
Q  214 aaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaact 274  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19468 aaacaacaacatcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 19528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 79)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 67745 - 68008
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67745 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 67844  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggctt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  67845 aatgcaaatcaacaacatctcaa-tatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggctc 67943  T
Q  210 actgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaact 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  67944 actgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 68008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Original strand, 18005650 - 18005910
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005650 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtatggaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 18005749  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005750 caaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 18005849  T
Q  214 aaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaact 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  18005850 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcatatcaact 18005910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Original strand, 44014182 - 44014439
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014182 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 44014281  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 213  Q
    ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44014282 caaatcaac---atctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacagttatataccattaaaaacaacattagatcatattaattcaggcttactg 44014378  T
Q  214 aaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  44014379 aaacaacaacagcaaga-taacaacttagtttttaacctct--gatcaactcacatcaattcgt 44014439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Original strand, 47831807 - 47832074
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47831807 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcatatcatcatgatataacaatatcg 47831906  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||  || |||||||    
T  47831907 aatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatataatgtatatacaattatataacattagcgacaacattagattata-caattcaggct 47832005  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47832006 tactgaaacaacaacaacaagataaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgt 47832074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16219835 - 16219574
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16219835 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 16219739  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  16219738 aatgcaagtcatcaacatcttaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-taattcaggct 16219640  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaact 274  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||    
T  16219639 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctccaagatcaactaacatcaact 16219574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056594
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 124  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgcaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaa 16056441  T
Q  125 catctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaac 223  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  16056442 catctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatatcat-tcaggcttaccgaaacaacaac 16056540  T
Q  224 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16056541 atcaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 16056594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Original strand, 22072913 - 22073182
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | | |||||||||||||||||    
T  22072913 acatcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 22073012  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcagg 206  Q
     |||| || |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  22073013 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatgcaattatataacattaacaacaacattagattatat-aattcagg 22073111  T
Q  207 cttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22073112 cttactgaaacaacaacatcaagacaaacaacttagttccttacctgtaagatcaactcacatcaactcgt 22073182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 811248 - 810988
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811248 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 811149  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 212  Q
    ||| |||  ||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  811148 caagtcattaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttact 811050  T
Q  213 gaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaact 274  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || || || ||| ||||||||||||||||    
T  811049 gaaactacaacagcaagataaataacttagtttctaacttccaaggtcaactcacatcaact 810988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 276
Target Start/End: Original strand, 34200786 - 34201049
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  34200786 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 34200885  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    |||| || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||    ||||| ||    
T  34200886 aatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcata-agcatcagtct 34200981  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcg 276  Q
    |||||  |||  |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200982 tactgggacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 34201049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15755008 - 15754743
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15755008 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 15754909  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattaga-tcatattaaatcaggc 207  Q
    ||||||| |||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| | ||||| |  ||||| |    
T  15754908 aatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcata-tgcatcagtc 15754813  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||||| || |  |||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15754812 ttactggaatattaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaggatcaactcacatcaactcgt 15754743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901595
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| ||||  |  |||||||||||||||||| |||||||  || |    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacagc 12901437  T
Q  123 aacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaaca 221  Q
    |||||| |||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  12901438 aacatcacaac-atcatacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaatcata-taattcaagcttactgaaacaaca 12901535  T
Q  222 acagcaagacaaacaacttag-ttcct---tacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12901536 acaacaagataaacaacttagtttcctacgtacctccaagatcaactcacatcaactcgt 12901595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 28505419 - 28505156
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28505419 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 28505320  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
     ||  || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||    ||||| ||    
T  28505319 gatataaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcata-agcatcagtct 28505224  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcg 276  Q
    ||||| ||||   ||| ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28505223 tactggaacattgacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 28505156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 11996148 - 11995885
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  11996148 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattg 11996049  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    |||| || |||||||   |||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||    ||||| ||    
T  11996048 aatgtaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcata-agcatcagtct 11995953  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcg 276  Q
    |||||  |||  |||||||||  |||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11995952 tactgggacattaacagcaaggtaaacaaattagtttctaacctctaagataaactcacatcaactcg 11995885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 177
Target Start/End: Original strand, 16495402 - 16495567
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16495402 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 16495501  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 177  Q
    |||| || |||||||   ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16495502 aatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 16495567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20220290 - 20220043
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||       
T  20220290 cttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca--- 20220194  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20220193 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatcatct-aaatcaggcttactggaacaacaacag 20220095  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
     |||| || |||||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||||||||    
T  20220094 taagataagcaacttagtttcttacccctgtgatcacctcacatcaactcgt 20220043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2280238 - 2280061
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||     
T  2280238 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataataatatca 2280141  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||  ||||| ||||||||  |||||  ||||||||    
T  2280140 aatgcaaatcaacaacatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacat 2280061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 18430709 - 18430870
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||   ||| |||||||| |||| ||||||    
T  18430709 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatc 18430806  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
     ||||||| ||||||||||||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18430807 aaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18430870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18456530 - 18456408
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  18456530 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gatagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaat 18456432  T
Q  113 gcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  18456431 gcaagtcaacaacatcttaaatat 18456408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 38227481 - 38227606
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  38227481 acatcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 38227579  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  38227580 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 38227606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 12255892 - 12255789
Alignment:
Q  32 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  12255892 agacagactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatct 12255793  T
Q  130 caaa 133  Q
    ||||    
T  12255792 caaa 12255789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17062077 - 17061919
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||    
T  17062077 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaactcag-cagtatacaaaatagcatgacataataatatcaaat 17061979  T
Q  113 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    |||| ||| |||| |||||| ||| |||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17061978 gcaagtcagcaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17061919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 95 - 277
Target Start/End: Original strand, 15113028 - 15113210
Alignment:
Q  95 gatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc 193  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||   ||| | |||| |||  |||| |||||||||||||||  |||||  |  ||||| |  ||    
T  15113028 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaatattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataattaacatcaactc 15113127  T
Q  194 atattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15113128 atat-aaatcagtcttactgaaacaataacagcaggataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 15113210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 456321 - 456479
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  456321 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 456418  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  456419 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 456479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 11972496 - 11972654
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  11972496 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 11972593  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  11972594 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 11972654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 12698831 - 12698958
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaa--tcatcatgatataacaatat 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||   || ||||| |||| |||||    
T  12698831 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatat 12698929  T
Q  108 cgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    | | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  12698930 caattgcaattcatcaacatcttaaatat 12698958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14949284 - 14949126
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  14949284 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14949187  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14949186 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14949126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15376875 - 15376717
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  15376875 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15376778  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15376777 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 15376717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 16232520 - 16232678
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  16232520 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16232617  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16232618 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16232678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 18640272 - 18640430
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  18640272 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18640369  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18640370 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18640430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20385285 - 20385127
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  20385285 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20385188  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20385187 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20385127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21189757 - 21189599
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  21189757 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21189660  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21189659 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21189599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 24702238 - 24702396
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24702238 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 24702335  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24702336 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24702396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 32125491 - 32125649
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  32125491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32125588  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32125589 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 32125649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 41522917 - 41523075
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  41522917 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41523014  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41523015 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 41523075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 41525379 - 41525537
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  41525379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41525476  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41525477 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 41525537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867923
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaac 1868003  T
Q  123 aacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaa 201  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | ||||| |||||    
T  1868002 aacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttaaa 1867923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 3564482 - 3564363
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  3564482 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 3564384  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaa 132  Q
    || || |||||||||||||||    
T  3564383 tgtaagtcaacaacatctcaa 3564363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 11393448 - 11393291
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  11393448 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11393351  T
Q  113 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  11393350 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 11393291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 13647325 - 13647487
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||| ||||||    
T  13647325 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatc 13647423  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
     ||||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13647424 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13647487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 196
Target Start/End: Original strand, 14044761 - 14044935
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa- 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||   ||| ||  || ||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  14044761 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaat 14044859  T
Q  122 caacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcata 196  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  14044860 caacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcata 14044935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 196
Target Start/End: Original strand, 14354791 - 14354965
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa- 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||   ||| ||  || ||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  14354791 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaat 14354889  T
Q  122 caacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcata 196  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  14354890 caacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcata 14354965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Original strand, 48273392 - 48273511
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  48273392 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 48273490  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaa 132  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  48273491 tgcaagtcaacaacatctcaa 48273511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 9509189 - 9509315
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| | || ||||| |||| ||||||    
T  9509189 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatc 9509287  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  9509288 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 9509315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 118 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9389709 - 9389551
Alignment:
Q  118 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaat-caggcttactgaaa 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||    
T  9389709 tcaacaacatctcatatatcaacataattcatacaatgtatatacaattatataacattatcatcaatattaga--atatacaatccaggcttactggaa 9389612  T
Q  217 caacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
      |||||| ||||    | ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9389611 tgacaacatcaaggtcgataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgt 9389551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 16410059 - 16410217
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  16410059 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16410156  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  16410157 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatat 16410217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 24704688 - 24704843
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  | || || |||| |||||| |||    
T  24704688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaa--aacaagacataataatatcaaat 24704783  T
Q  113 gcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    |||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24704784 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24704843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 27216860 - 27217018
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  27216860 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 27216957  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  27216958 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 27217018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 179 - 275
Target Start/End: Original strand, 16324175 - 16324270
Alignment:
Q  179 caacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactc 275  Q
    |||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16324175 caacaacattagattatac-aattcaggcttactgaaacaacaacagcaagatcaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactc 16324270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 277
Target Start/End: Original strand, 15116565 - 15116747
Alignment:
Q  95 gatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc 193  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||   ||| | |||| |||  |||| |||||||||||||||  |||||  || ||||| |  ||    
T  15116565 gatataacaatatcaattgcaagtcatcaacatctcaatattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataaataacatcaactc 15116664  T
Q  194 atattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15116665 atat-acatcagtcttactgaaacaataacagtaggataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 15116747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19486865 - 19486668
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19486865 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 19486766  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcag 205  Q
     | | || | ||||||||||||||| |||| | ||||||||  | ||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||||||||    
T  19486765 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcag 19486668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 44116509 - 44116667
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  44116509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 44116606  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  44116607 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatat 44116667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10063921 - 10063813
Alignment:
Q  28 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 127  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||    
T  10063921 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaacatcatgatataataatatcgaacacaagtaaacaacat 10063822  T
Q  128 ctcaaatat 136  Q
    |||||||||    
T  10063821 ctcaaatat 10063813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 132
Target Start/End: Original strand, 24275175 - 24275289
Alignment:
Q  17 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  24275175 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 24275272  T
Q  116 attcaacaacatctcaa 132  Q
    | |||||||| ||||||    
T  24275273 agtcaacaacgtctcaa 24275289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 26211995 - 26212122
Alignment:
Q  10 acatcatcat-cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 107  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||    
T  26211995 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatat 26212093  T
Q  108 cgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||    
T  26212094 caattgcaattcaacaacatcttaaatat 26212122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16386369 - 16386242
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| | |||||| ||||| ||||  |||||    
T  16386369 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 16386270  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | || | |||| |||||||| ||||||    
T  16386269 aattgtatttcatcaacatcttaaatat 16386242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 3386333 - 3386491
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| || | |||||| ||    
T  3386333 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaa 3386430  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  3386431 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatat 3386491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Original strand, 16213684 - 16213795
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  16213684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 16213781  T
Q  112 tgcaattcaacaac 125  Q
    | ||| ||||||||    
T  16213782 tccaagtcaacaac 16213795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Original strand, 13869346 - 13869396
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869346 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 13869396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15008597 - 15008441
Alignment:
Q  33 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  15008597 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacacctc 15008499  T
Q  131 aaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 187  Q
    ||| |||| | ||||||||  ||||| |||||||| |||||  |||||  ||||||||    
T  15008498 aaacatcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacat 15008441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Original strand, 20110556 - 20110606
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110556 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 20110606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Original strand, 40443393 - 40443509
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| || ||||| |||| |||||| |     
T  40443393 atcatcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa-cagcatgacataataatatcaat 40443491  T
Q  112 tgcaattcaacaacatct 129  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  40443492 ttcaattcatcaacatct 40443509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 10589039 - 10589158
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||| || ||||| ||||  |||||    
T  10589039 acatcatcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatc 10589137  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatct 129  Q
     | ||||||||||||||||||    
T  10589138 aattgcaattcaacaacatct 10589158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Original strand, 13831373 - 13831423
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13831373 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 13831423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 27847951 - 27847881
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagt 80  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27847951 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagt 27847881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 15144143 - 15144037
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| | || || ||||| | |||||| |||||||  |||||    
T  15144143 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacat-ctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaaca 15144046  T
Q  124 acatctcaa 132  Q
    |||||||||    
T  15144045 acatctcaa 15144037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 38898535 - 38898489
Alignment:
Q  17 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38898535 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38898489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 14932851 - 14932802
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  14932851 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 14932802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15356286 - 15356237
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  15356286 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 15356237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15360400 - 15360351
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  15360400 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 15360351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 138
Target Start/End: Original strand, 14036282 - 14036384
Alignment:
Q  38 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa-caacatctcaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||     
T  14036282 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaac 14036380  T
Q  135 atca 138  Q
    ||||    
T  14036381 atca 14036384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 138
Target Start/End: Original strand, 14346312 - 14346414
Alignment:
Q  38 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa-caacatctcaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||     
T  14346312 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaac 14346410  T
Q  135 atca 138  Q
    ||||    
T  14346411 atca 14346414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 18154956 - 18154909
Alignment:
Q  16 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18154956 tcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 18154909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 26356156 - 26356106
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  26356156 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaa 26356106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 26358608 - 26358558
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  26358608 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaa 26358558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 2832561 - 2832509
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2832561 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 2832509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 82
Target Start/End: Original strand, 48991206 - 48991252
Alignment:
Q  36 cgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtat 82  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  48991206 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtat 48991252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 19649606 - 19649557
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19649606 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19649557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 131
Target Start/End: Original strand, 16324135 - 16324171
Alignment:
Q  95 gatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctca 131  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16324135 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctca 16324171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 81
Target Start/End: Original strand, 18203831 - 18203882
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagta 81  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||    
T  18203831 cttagatcgactcatgcagcttagtt-aataaacaacaacaacatagacagta 18203882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 6535 - 6798
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6535 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 6634  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggctt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6635 aatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggctt 6734  T
Q  210 actgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaact 274  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  6735 actgaaacaacaacagcaaga-taacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaact 6798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8736
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 8580  T
Q  125 catctcaaata-tca-acataattcatataatgtatataca--attatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaac 220  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||  |||||||  |||||  |||||||| |  ||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  8581 catctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattcata-tacatcagtcttactggaacaac 8679  T
Q  221 aacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8680 atcagcaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaattcacatcaactcgt 8736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 59)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22921986 - 22921723
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921986 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 22921887  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 213  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22921886 caaatcaacaacatctcaaatatcaacaaaattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactg 22921787  T
Q  214 aaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921786 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 22921723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Original strand, 33681010 - 33681274
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681010 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 33681106  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||    
T  33681107 aatgcaagtcgtcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtct 33681205  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681206 tactagaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 33681274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Original strand, 22237630 - 22237895
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22237630 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 22237726  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||    
T  22237727 aatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataactttagaaacaacatcaattcata-tgtatcagtct 22237825  T
Q  209 tactgaaacaacaa-cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
      ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22237826 cgctggaacaacaatcagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 22237895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 52928076 - 52927836
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
T  52928076 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat------------ 52927989  T
Q  125 catctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaac 223  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||| ||||||||     
T  52927988 catctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttactggaacaacaat 52927890  T
Q  224 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52927889 agcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 52927836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861423
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 21861573  T
Q  129 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagc 226  Q
    ||||| | ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||    
T  21861572 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcatatcataat-attcaggcttactgaaacaacaatagc 21861474  T
Q  227 aagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21861473 aagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 21861423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 277
Target Start/End: Original strand, 21754059 - 21754302
Alignment:
Q  24 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21754059 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaaca 21754157  T
Q  124 acatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaac 223  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||        |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||| |||||  ||    
T  21754158 acatctcaattatcaacataatccatttaatgtatatacaa--------cattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttactggaacaatgac 21754248  T
Q  224 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21754249 agcaagataaacaacttagtttctaacctctgagatcaactcacatcaactcgt 21754302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896112
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 21896259  T
Q  129 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagc 226  Q
    ||||| | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||| | | |||||||||||||||||||||   |    
T  21896258 tcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataat-attcaggcttactgaaacaacaa---c 21896163  T
Q  227 aagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21896162 aagataaacaacttagtttcttacatctaagatcaactcacatcaactcgt 21896112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Original strand, 20248283 - 20248539
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20248283 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 20248382  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 212  Q
    ||| |||||||   || ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    ||||| |  ||||| ||||||    
T  20248383 caaatcaacaa---cttaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatatatcattataaacaacatggattcata-tgcatcagtcttact 20248478  T
Q  213 gaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaact 274  Q
    |  ||||||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||    
T  20248479 g-gacaacaacatcaagataaataacttagtttctaacctctaagatcaatttacatcaact 20248539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16368388 - 16368140
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16368388 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 16368290  T
Q  127 tctcaaatatcaac-ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    ||||||  |||    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  16368289 tctcaac-atcgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacag 16368192  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
     |||| |||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16368191 taagataaacaacttaatttcttacccctatgatcaactcacatcaactcgt 16368140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 272
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918863
Alignment:
Q  26 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||     
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa- 20918718  T
Q  126 atctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
      ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||| |  |||||    || || ||||||| ||||  ||||    
T  20918719 --ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacatcaattcata-agcatgagtcttactggaacattaaca 20918815  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaa 272  Q
     ||||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  20918816 acaaggtaaacgacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaa 20918863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 50614219 - 50613970
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  50614219 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 50614120  T
Q  127 tctcaaatatcaac-ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    ||||||| |||    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| | |||||| | ||||||| || ||||||||||||||  |||||| |    
T  50614119 tctcaaacatcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaagtaacaacgg 50614021  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |   |||||| ||||||||||||||    
T  50614020 taagacaaacaacttagtttcttacc-ccctgatcaattcacatcaactcgt 50613970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 50622047 - 50621798
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  50622047 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 50621948  T
Q  127 tctcaaatatcaac-ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    ||||||| |||    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| | |||||| | ||||||| || ||||||||||||||  |||||| |    
T  50621947 tctcaaacatcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaagtaacaacgg 50621849  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |   |||||| ||||||||||||||    
T  50621848 taagacaaacaacttagtttcttacc-ccctgatcaattcacatcaactcgt 50621798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Original strand, 50686630 - 50686880
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||    |||  |  ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  50686630 cttagaccgactcatgcagtttagttaataaacaaacggcaacataggcagttcataaaatagttcatgatataacaatgtcaaatgcaaatcaacaaca 50686729  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  50686730 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcggatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacag 50686828  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
     |||| || |||||||||| |||||| | | ||||||||||| |||||||||    
T  50686829 taagataagcaacttagtttcttacccccatgatcaactcacgtcaactcgt 50686880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14295672 - 14295507
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14295672 acatcatcatcttcaacattttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 14295573  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 177  Q
    |||| || |||||||   ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14295572 aatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 14295507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41049891
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 41050039  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    ||||||  |||| | ||||||||  ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||| | | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  41050038 tctcaac-atcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacgtcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacag 41049941  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactc 275  Q
     |||| ||  ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41049940 taagataagaaacctagttccttacccctatgatcaactcacatcaactc 41049891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 118 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 35981700 - 35981542
Alignment:
Q  118 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaat-caggcttactgaaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||    
T  35981700 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatgcaattatataacattatcatcaacattaga--atatacaatccaggcttactggaa 35981603  T
Q  217 caacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
      |||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  35981602 tgacaacatcaagataaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaattcgt 35981542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 118 - 277
Target Start/End: Original strand, 49261448 - 49261606
Alignment:
Q  118 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||  || || ||||||||| ||     
T  49261448 tcaacaacatctcaaatatcaacataatttatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatata-caattccggcttactggaag 49261546  T
Q  218 aacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
     |||||| ||||  ||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49261547 gacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgt 49261606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 199
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758841
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 122  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaac 16758763  T
Q  123 aacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatta 199  Q
    |||||| |||   ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||  | |||||||||    
T  16758764 aacatcacaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaacaaatcatatta 16758841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 21161720 - 21161932
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21161720 catcatcatcatcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaacaaa-acagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcgaatg 21161818  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaat-atcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 212  Q
    ||||||| ||||   ||| || |||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||| |||| ||| | |  |||| ||||| |||    
T  21161819 caattcatcaac--ttcatatcatcaacataaatcatacaatgtttatacacttatataacatcaacgacatcattggatta-aacaaattaggctcact 21161915  T
Q  213 gaaacaacaacagcaag 229  Q
    | |||| ||||||||||    
T  21161916 ggaacatcaacagcaag 21161932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 50210333 - 50210212
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  50210333 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 50210235  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaa 132  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  50210234 aatgcaagtcaacaacatctcaa 50210212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35261086
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 35261086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 13988866 - 13989024
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  13988866 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13988963  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13988964 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13989024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 118 - 275
Target Start/End: Original strand, 20636957 - 20637113
Alignment:
Q  118 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaac 217  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |  |||  || |||||||||||| ||     
T  20636957 tcaacaacatcccaaatacaaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattaaaaaata-caattcaggcttactggaat 20637055  T
Q  218 aacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactc 275  Q
     |||||| ||||  ||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20637056 gacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactc 20637113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21923453 - 21923295
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  21923453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21923356  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21923355 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21923295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 45575008 - 45574846
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||| |    
T  45575008 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatacc 45574910  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
     ||||||| |||||||| |||||| ||| |||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  45574909 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 45574846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21475249 - 21475091
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  21475249 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21475152  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21475151 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21475091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 21840766 - 21840885
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |    
T  21840766 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 21840863  T
Q  111 atgcaattcaacaacatctcaa 132  Q
    |||||| |||||||| ||||||    
T  21840864 atgcaagtcaacaacgtctcaa 21840885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23593897 - 23593739
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23593897 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23593800  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  23593799 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 23593739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 29298137 - 29298294
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  29298137 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaa 29298233  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29298234 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29298294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 29776688 - 29776846
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||  | ||||| |||| |||||| ||    
T  29776688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaa 29776785  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29776786 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29776846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 31612313 - 31612471
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  31612313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 31612410  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  31612411 tgcaagtcaacaacatctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 31612471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Original strand, 34509783 - 34509899
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| ||    
T  34509783 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaa 34509881  T
Q  112 tgcaattcaacaacatct 129  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  34509882 tgcaagtcaacaacatct 34509899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 433012 - 433168
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||| || |||||| ||||  ||||| || |||| |||||| ||    
T  433012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacg----gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaa 433107  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  433108 tgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 433168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 22532269 - 22532395
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  22532269 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 22532367  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||    
T  22532368 cattgcaattcaacaacatcttaaatat 22532395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 27250850 - 27250724
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  27250850 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 27250752  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  27250751 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 27250724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22123230 - 22123071
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| | |||  | ||||| |||| |||||| ||    
T  22123230 tcatcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacaca-acagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 22123132  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaaca--taattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||  |||||| |||  |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22123131 tgcaagtcaacaatgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatacaattatat 22123071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 21026680 - 21026806
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | |||||| |||||  |||  |||||    
T  21026680 acatcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatc 21026778  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||    
T  21026779 aattgcaattcaacaacatcttaaatat 21026806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 277
Target Start/End: Original strand, 12271744 - 12271814
Alignment:
Q  207 cttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12271744 cttactgaaacaataacagcaggataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 12271814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 13213027 - 13212974
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13213027 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 13212974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16093987 - 16093825
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattc-aacaac 125  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||| |||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  16093987 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaatagcaacataggcagtatagaaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaaacaac 16093889  T
Q  126 atctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt 188  Q
    |||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| | |||||||    
T  16093888 atctcaaacatcataggtaattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattaaaatcaacatt 16093825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 20454673 - 20454610
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 75  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20454673 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatag 20454610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 63
Target Start/End: Original strand, 21342090 - 21342146
Alignment:
Q  7 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342090 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21342146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 16361915 - 16362075
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||   ||| || ||||| |||| ||||||     
T  16361915 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gacagcaacaca-acagtatataaaaacaacatgacataataatatca 16362012  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  16362013 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatat 16362075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 20847275 - 20847205
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagta 81  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20847275 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 20847205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Original strand, 21346961 - 21347011
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21346961 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21347011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Original strand, 21707167 - 21707217
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707167 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21707217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Original strand, 21711709 - 21711759
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711709 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21711759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15860177 - 15860121
Alignment:
Q  7 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15860177 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15860121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 38801508 - 38801433
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaa 86  Q
    ||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  38801508 acatcatcatcttcaacatcttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa 38801433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22130975 - 22130863
Alignment:
Q  63 aacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatata 161  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||    
T  22130975 aacagcaacataggcagtatccaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgcatata 22130879  T
Q  162 caattatataccatta 177  Q
    |||||||||| |||||    
T  22130878 caattatataacatta 22130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 22468816 - 22468698
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||  | ||| | || ||||| || | ||||||     
T  22468816 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatca 22468718  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatct 129  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  22468717 attgcaattcaacaacatct 22468698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 16275526 - 16275476
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16275526 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaa 16275476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 177
Target Start/End: Original strand, 51130632 - 51130729
Alignment:
Q  78 agtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccatt 176  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  51130632 agtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatt 51130728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 21714546 - 21714595
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21714546 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 21714595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Original strand, 20135188 - 20135306
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||| ||||| |||  | ||| | |||||||| |||| ||||||     
T  20135188 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaac-aatagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataataatatca 20135286  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatct 129  Q
      ||||||||||||||||||    
T  20135287 tgtgcaattcaacaacatct 20135306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 170
Target Start/End: Original strand, 26064959 - 26065100
Alignment:
Q  31 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 128  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||   |||  |  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  26064959 tagaccaactcatgcagcttagttgataaacaaacagcaacataggcagtacataaaataattcatgatataacaata-ccaatgcaaatcaacaacatc 26065057  T
Q  129 tcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||| | ||||||||  ||||  |||||||| |||||    
T  26065058 tcaaagatcatatataattcaagtaatacatatacaaatatat 26065100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 24783212 - 24783160
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24783212 catcatcatcttaatcatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacaa 24783160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 63
Target Start/End: Original strand, 40389157 - 40389204
Alignment:
Q  16 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  40389157 tcatcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataacaa 40389204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Original strand, 22124370 - 22124491
Alignment:
Q  95 gatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc 193  Q
    |||||||||||||| ||||  | ||||||||| || ||| |||  | |||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||    
T  22124370 gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaactatatcacattactaacaacatcaaatc 22124469  T
Q  194 atattaaatcaggcttactgaa 215  Q
    |||||| ||||| || ||||||    
T  22124470 atattatatcagactcactgaa 22124491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 40291 - 40028
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40291 catcatcatcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 40192  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 213  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  40191 caaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacataagatcatattaattcaggcttactg 40092  T
Q  214 aaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40091 aaacaacaacatcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 40028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Original strand, 100378 - 100641
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  100378 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataataatatcgaatg 100477  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  100478 caaatcaacaacatctcaaatattaacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaatttaggcttactg 100577  T
Q  214 aaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  100578 aaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctctaagagcaagtcacatcaactcgt 100641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 94411 - 94569
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  94411 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 94508  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  94509 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 94569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 44454 - 44613
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc--aaatcatcatgatataacaatatcga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |  ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  44454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaa 44551  T
Q  111 atgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  44552 atgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatagaattatat 44613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Original strand, 119875 - 119948
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatg 83  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  119875 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 119948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17444
Alignment:
Q  17 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  17598 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 17501  T
Q  116 attcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    | |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  17500 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 17444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 87
Target Start/End: Original strand, 101503 - 101576
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaa 87  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  101503 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 277
Target Start/End: Original strand, 101599 - 101660
Alignment:
Q  215 aacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  101599 aacaacaacaacaagagaa-caacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 101660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 38596 - 38547
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38596 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaa 38547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 38855372 - 38855106
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855372 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 38855273  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggctt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  || ||||||||    
T  38855272 aatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggctt 38855174  T
Q  210 actgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||    
T  38855173 actgaaacaacaacagcaagataaacaacttagttcctaatgtccaagatcaattcacatcaactcgt 38855106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 275
Target Start/End: Original strand, 6520368 - 6520632
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520368 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 6520467  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggctt 209  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  || ||||||||    
T  6520468 aatgcaagtcatcaacatcataaacatcaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggctt 6520566  T
Q  210 actgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactc 275  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6520567 actgaaacaacaacagcaagataaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactc 6520632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23760962 - 23760698
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  23760962 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcatcatgatataacaatattg 23760866  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggctt 209  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23760865 aattcaaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatttattcaggctt 23760766  T
Q  210 actgaaacaacaacagcaagac---aaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaact 274  Q
    ||||||||||||||| ||| |    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23760765 actgaaacaacaacaacaacaaggtaaacaacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaact 23760698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 274
Target Start/End: Original strand, 21673718 - 21673967
Alignment:
Q  24 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21673718 atcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaaca 21673817  T
Q  124 acatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaac 223  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21673818 acatctcaaatatcaatataatttatttaatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaagcttactgaaacaacaac 21673917  T
Q  224 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaact 274  Q
    | |||||  ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  21673918 aacaaga-taacaacttagtttttaacctctaatatcaactcacattaact 21673967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Original strand, 21285601 - 21285864
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  21285601 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatg 21285700  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 212  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21285701 caaatcaacaacatctcaaacatcaaacatagttcatgtaatgtatatacaattatatatcattaacaacaatattagattata-taattcaggcttact 21285799  T
Q  213 gaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21285800 gaaacaacaacaacaagataaagcacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 21285864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 26355815 - 26355557
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26355815 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcacgatataacaatatcgaatg 26355716  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 213  Q
    ||| ||||||||||||||   ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||     
T  26355715 caa-tcaacaacatctcagccatcaacatattccatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttacta 26355618  T
Q  214 aaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaact 274  Q
     ||||| ||||  |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26355617 gaacaataacaaaaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 26355557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 5866395 - 5866132
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5866395 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 5866296  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    |||| || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||    ||||| ||    
T  5866295 aatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcata-agcatcagtct 5866200  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcg 276  Q
    ||||| ||||  |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866199 tactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 5866132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983256
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 983413  T
Q  123 aacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaaca 221  Q
    |||||| | || ||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  983412 aacatcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatacagctatataacattatcaacaacattcaatcata-taattcagacttactgaaacaaca 983315  T
Q  222 acagcaa---gacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||| |||   || ||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  983314 acaacaacatgataaacaacttagtttcctacctccaagatcaactcatatcaactcgt 983256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 276
Target Start/End: Original strand, 21490995 - 21491258
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  21490995 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattg 21491094  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    |||| || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||    ||||| ||    
T  21491095 aatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcata-ggcatcagtct 21491190  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcg 276  Q
    ||||| ||||  |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21491191 tactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacattaactcg 21491258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 276
Target Start/End: Original strand, 17140916 - 17141179
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||||||    
T  17140916 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgacataataatatcg 17141015  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    |||| || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||    ||||| ||    
T  17141016 aatgtaaatcatcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcata-agcatcagtct 17141111  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcg 276  Q
    ||||| ||||  |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17141112 tactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 17141179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498830
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 20498680  T
Q  129 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagc 226  Q
    ||||| | ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||| || ||||| ||||| |||||| ||||| |    
T  20498681 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcata-tacatcagtcttaccgaaacatcaacatc 20498779  T
Q  227 aagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20498780 aagataaacaacttagtttcttacctccaagatcaactcacatcaactcgt 20498830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116616
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37116465  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37116466 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatct-aaatcaggcttactgaaacaacaacag 37116564  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
     |||| || |||||||||| |||||| | | ||||| |||||||||||||||    
T  37116565 taagataagcaacttagtttcttacccccatgatcatctcacatcaactcgt 37116616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17267096 - 17266846
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||   ||| |   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17267096 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17266997  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    ||||||| |||| | ||||||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  17266996 tctcaaacatcatatataattcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggctcactgaaacaacaacag 17266898  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
     |||| || |||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||||    
T  17266897 taagataagcaacttagtttcttacccccgtgatcaactcacatcaactcgt 17266846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 276
Target Start/End: Original strand, 21255222 - 21255485
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat-aacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21255222 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatc 21255321  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggc 207  Q
    ||||| || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||    ||||| |    
T  21255322 gaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcata-agcatcagtc 21255417  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcg 276  Q
    ||| ||| |||  |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21255418 ttagtgagacattaacagc-agggtaacaacttagttcctaacctctaagataaactcacatcaactcg 21255485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 21249384 - 21249645
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat-aacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21249384 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatc 21249483  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggc 207  Q
    ||||| || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||    ||||| |    
T  21249484 gaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcata-agcatcagtc 21249579  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaact 274  Q
    ||| ||| |||  |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21249580 ttagtgagacattaacagc-agggtaacaacttagttcctaacctctaagataaactcacatcaact 21249645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Original strand, 24353039 - 24353291
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24353039 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 24353137  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaaca---acaa 222  Q
    ||||||| |||  | | ||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||  |||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||   ||||    
T  24353138 tctcaaacatcgtatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacaa 24353236  T
Q  223 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||| |||| || |||||||||| |||| | | | |||||||||||||||||||||    
T  24353237 cagtaagataagcaacttagtttcttatccccatgatcaactcacatcaactcgt 24353291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 22626736 - 22626861
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  22626736 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatca 22626834  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  22626835 aatacaaatcaacaacatcttaaatat 22626861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16092463 - 16092337
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  16092463 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 16092365  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16092364 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 16092337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13508188 - 13508027
Alignment:
Q  28 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  13508188 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 13508089  T
Q  128 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 187  Q
    |||||||||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  13508088 ctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 13508027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 21919121 - 21918995
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  21919121 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 21919023  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||    
T  21919022 aattgcaattcaacaacatcttaaatat 21918995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 28649164 - 28649046
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  28649164 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 28649066  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatct 129  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  28649065 aatgcaagtcaacaacatct 28649046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13597720 - 13597559
Alignment:
Q  28 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  13597720 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 13597621  T
Q  128 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 187  Q
    | |||||||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  13597620 cccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 13597559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17439609 - 17439436
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17439609 cttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17439510  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatta 199  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  | |||||||| |||||||||    
T  17439509 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattatcaacattaaatcatatta 17439436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17612231 - 17612069
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17612231 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 17612132  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
     | | || | ||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17612131 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17612069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 22875065 - 22875190
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| || |||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  22875065 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagc-agcagcaacacaggcagtatacaaaacaacatgacataataatatca 22875163  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22875164 aatgcaagtcaacaacatctcaaatat 22875190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 1484402 - 1484560
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  1484402 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 1484499  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  1484500 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 1484560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 5853454 - 5853296
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  5853454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 5853357  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  5853356 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 5853296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14409606 - 14409448
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  14409606 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14409509  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14409508 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14409448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20046357 - 20046199
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  20046357 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 20046260  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20046259 tgcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20046199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 20403227 - 20403385
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  20403227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20403324  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20403325 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20403385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 22001753 - 22001911
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  22001753 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22001850  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22001851 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 22001911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 7372778 - 7372904
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  7372778 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7372876  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  7372877 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 7372904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16199765 - 16199647
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  16199765 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa-caacatgacataataatatca 16199667  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatct 129  Q
    | | ||||||| | ||||||    
T  16199666 atttcaattcatctacatct 16199647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 20536208 - 20536334
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  20536208 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 20536306  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  20536307 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 20536334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 31971257 - 31971375
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  31971257 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatca 31971355  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatct 129  Q
    | | ||||||| ||||||||    
T  31971356 attccaattcatcaacatct 31971375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 123
Target Start/End: Original strand, 6759255 - 6759371
Alignment:
Q  7 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaat 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||    
T  6759255 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataat 6759353  T
Q  106 atcgaatgcaattcaaca 123  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  6759354 atcaaatgcaagtcaaca 6759371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18818530 - 18818404
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  18818530 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 18818432  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | || || |||||| ||||| ||||||    
T  18818431 aattgtaagtcaacatcatcttaaatat 18818404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 21924049 - 21923923
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||| || ||||| || | ||||||    
T  21924049 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatc 21923951  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  21923950 aattgcaagtcaacaacatcttaaatat 21923923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 277
Target Start/End: Original strand, 22364744 - 22364929
Alignment:
Q  91 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 189  Q
    |||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  | |||  |||||||| |    
T  22364744 tcatgatataacaatatcaaa-gaaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcactttattaacaacatca 22364842  T
Q  190 gatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
     ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  ||| | |   |||||||||||||||||||||    
T  22364843 aatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttattatccccctgatcaactcacatcaactcgt 22364929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Original strand, 26219717 - 26219838
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||  |  |||| |||| |||||| |||    
T  26219717 tcatcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacacag-cagtatacaaaatagtatgacataataatatcaaat 26219814  T
Q  113 gcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  26219815 gcaagtcaacaacatctcaaatat 26219838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 26225409 - 26225288
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||| ||| |||| ||  |||| |||| |||||| |||    
T  26225409 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acaatatacaaaacagtatgacataataatatcaaat 26225312  T
Q  113 gcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     ||| |||||||||||||||||||    
T  26225311 acaagtcaacaacatctcaaatat 26225288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 23406379 - 23406492
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  23406379 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23406477  T
Q  109 gaatgcaattcaaca 123  Q
     | ||||| ||||||    
T  23406478 aattgcaagtcaaca 23406492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 4483281 - 4483438
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  4483281 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 4483377  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4483378 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 4483438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15203393 - 15203235
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  15203393 tcatcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15203296  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    || || |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15203295 tgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 15203235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16413474 - 16413320
Alignment:
Q  17 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  16413474 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16413377  T
Q  116 attcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    | |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  16413376 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 16413320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 18879352 - 18879276
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaa 87  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  18879352 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 18879276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 41598188 - 41598346
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  41598188 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataac-aacagcaacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41598285  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41598286 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 41598346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21396101 - 21395984
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  21396101 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--cagcatgagataattatatca 21396004  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatct 129  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  21396003 aattcaattcatcaacatct 21395984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21790594 - 21790477
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  21790594 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--cagcatgagataattatatca 21790497  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatct 129  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  21790496 aattcaattcatcaacatct 21790477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 4542535 - 4542377
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  || | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  4542535 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acaagatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 4542438  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4542437 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatagttcaagtaatgcatatacaattatat 4542377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21389571 - 21389454
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  21389571 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa--cagcatgacataattatatca 21389474  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatct 129  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  21389473 aattcaattcatcaacatct 21389454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21778897 - 21778780
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  21778897 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa--cagcatgacataattatatca 21778800  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatct 129  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  21778799 aattcaattcatcaacatct 21778780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 72
Target Start/End: Original strand, 19896265 - 19896323
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19896265 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 19896323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 19937174 - 19937118
Alignment:
Q  7 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19937174 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 19937118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 45131117 - 45131047
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagta 81  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  45131117 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 45131047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 45290853 - 45290807
Alignment:
Q  17 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290853 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45290807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801387
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || |||| |||||||| ||    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtc 19801430  T
Q  129 tcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattata 169  Q
    |||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  19801429 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattata 19801387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19154989 - 19154816
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatc--atcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||| |  |||  ||||||| |||||| | ||| | |||||||||    
T  19154989 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacatatccagatataataatatcaagtgctaatcaacaaca 19154890  T
Q  127 tctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatta 199  Q
     || ||| |||  | |||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||  | |||||||| |||||||||    
T  19154889 acttaaacatcttaaataattcagataatgcatatacaaatatattacattagtatcaacattaaatcatatta 19154816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 25484430 - 25484380
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  25484430 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataacaa 25484380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 14823774 - 14823931
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  14823774 tcatcatcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataac-aacaacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14823870  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14823871 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14823931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 18678221 - 18678170
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18678221 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaa 18678170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 26223917 - 26224077
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | || || ||| | |||  | ||||| |||| ||||||     
T  26223917 catcaacatcttaatcaacttagatcgacccatgcagcttaattaaataac-aacagcaataaag-caatatacaaaaatagcatgacataataatatca 26224014  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||  ||  |||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  26224015 aatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataatttaattaatgcatatacaattatat 26224077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 136
Target Start/End: Original strand, 23648554 - 23648679
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||| |||  | ||| | || ||||| |||| ||||||     
T  23648554 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaac-aatagcaacataggcagattacaacaacaacatgacataataatatca 23648652  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
      |||||| ||||||||||| ||||||    
T  23648653 tttgcaatacaacaacatcttaaatat 23648679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 63
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070608
Alignment:
Q  26 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15070608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 63
Target Start/End: Original strand, 32121734 - 32121785
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  32121734 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaa 32121785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 40492891 - 40492844
Alignment:
Q  91 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 138  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  40492891 tcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatca 40492844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 177
Target Start/End: Original strand, 21383887 - 21383978
Alignment:
Q  86 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 177  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||  ||||||||| |||||    
T  21383887 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21383978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 205
Target Start/End: Original strand, 37515837 - 37515901
Alignment:
Q  141 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcag 205  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||| |||| |||| |||||    
T  37515837 ataattcacataatgcatatacaattatatcacattactaacaacattaaatcacattatatcag 37515901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2502
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  2762 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtatgtaaatcatcatgttataacaatattgaatg 2663  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2662 caaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactg 2563  T
Q  214 aaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaact 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  2562 aaacaacatcagcaagataaacaacttaatttctaacctctaagatcaactcacatcaact 2502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 63)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Original strand, 25175854 - 25176117
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175854 catcatcatcatcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 25175953  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 213  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25175954 caaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataacgtatatataattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactg 25176053  T
Q  214 aaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25176054 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaacttacatcaattcgt 25176117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 277
Target Start/End: Original strand, 28405981 - 28406244
Alignment:
Q  15 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28405981 atcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 28406080  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  28406081 caaatcaacaacatctcaaatatcaacttaattcataaaatgtatatacaattatataccattaacaacaacaatagatcatattaaattaggcttacta 28406180  T
Q  214 aaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28406181 aaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 28406244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7835 - 7586
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 128  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  7835 cttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 7736  T
Q  129 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagc 226  Q
    ||||| | ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  7735 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattaacaacaacattaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacaac 7637  T
Q  227 aagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    | || ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7636 atgataaacaacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgt 7586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786756
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaaccagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 18786910  T
Q  123 aacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaaca 221  Q
    ||| || |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||  ||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  18786909 aacgtcacaac-atcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaataacattcaatcatat-aatttaggcttactgaaacaaca 18786812  T
Q  222 acagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||||| || ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18786811 acagcatgataaacaacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgt 18786756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 7679589 - 7679746
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7679589 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc-aatg 7679687  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatata 171  Q
     || ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7679688 taagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatataattatata 7679746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22134326 - 22134071
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcga 110  Q
    |||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22134326 catcatcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaa-cagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcga 22134228  T
Q  111 atgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggctta 210  Q
    |||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||        |||||  |||||||  |  ||||| |  ||||| ||||    
T  22134227 atgcaa-tcaataacatctcatttatcaacataatccatttaatgtatatacaa--------cattataaacaacaccaattcata-tgcatcagtctta 22134138  T
Q  211 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||| || ||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134137 ctggaaaaatgacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 22134071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207545
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgaca 23207395  T
Q  127 tctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagc 226  Q
    ||||||   |  | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||| |||||||||||  |||||||||||     
T  23207396 tctcaacattataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcaggcttacttgaacaacaacagt 23207494  T
Q  227 aagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||| || |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23207495 aagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgt 23207545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Original strand, 23791292 - 23791542
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| |||||||| |||||   ||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  23791292 cttagaccgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaaca 23791391  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    ||||||| || | | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  23791392 tctcaaacattatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacaa 23791490  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||| ||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23791491 caagataaacaacttagtttccaacccccaagatcaactcacatcaactcgt 23791542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 298933 - 298809
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| |     
T  298933 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 298834  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  298833 tgcaattcaacaacatcttaaatat 298809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23072070 - 23071905
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23072070 acatcatcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 23071971  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 177  Q
    |||  || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23071970 aatataaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 23071905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 22105412 - 22105571
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  22105412 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22105510  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22105511 tgcaagtcaacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 22105571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 19671830 - 19671991
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19671830 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 19671929  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    || |||| | |||||||||||||   ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19671930 aacgcaagtaaacaacatctcaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 19671991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23708738 - 23708561
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  23708738 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatca 23708641  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatat--caacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 187  Q
    | ||||| ||| | |||||||||| ||   || ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  23708640 attgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 23708561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Original strand, 25108906 - 25109156
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| |||||   |||  |  |||||||||||||||||| ||   || ||||||| |    
T  25108906 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaatagttcatgatataacaatatcaaagcaaaatcaacaata 25109005  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||  |||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  25109006 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacag 25109104  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
     |||| || |||||||||| |||| | | | |||||||| ||||||||||||    
T  25109105 taagataagcaacttagtttcttatccccatgatcaacttacatcaactcgt 25109156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 23060513 - 23060639
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  23060513 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23060611  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  23060612 aattgcaagtcaacaacatcttaaatat 23060639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 18808943 - 18809101
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  18808943 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18809040  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18809041 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18809101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 95 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22459598 - 22459415
Alignment:
Q  95 gatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacata--attcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagat 192  Q
    |||||||||| ||| |||| || ||| |||||||||||||||  |||||  | |||  ||||||||||||||||||||  |||||  || ||||| |  |    
T  22459598 gatataacaacatcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattcacatataactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaataacatcaact 22459499  T
Q  193 catattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    | ||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22459498 cgtat-acatcagtcttactgaaacaataacagcaagataaacaacttagtttcttacctctaaggtcaactcacatcaactcgt 22459415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 23130862 - 23131020
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23130862 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23130959  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23130960 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23131020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 23133329 - 23133487
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23133329 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23133426  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23133427 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23133487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23709694 - 23709536
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23709694 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23709597  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23709596 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23709536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23712175 - 23712017
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23712175 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23712078  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23712077 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23712017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 34402684 - 34402526
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  34402684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 34402587  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  34402586 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 34402526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 39682313 - 39682471
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  39682313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39682410  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  39682411 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 39682471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 23135590 - 23135745
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23135590 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23135687  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaatta 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  23135688 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 23135745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 571397 - 571555
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  571397 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 571494  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| | |  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  571495 tgcaagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 571555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 6725995 - 6726153
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  6725995 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 6726092  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    || || |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  6726093 tgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 6726153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 24367774 - 24367932
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24367774 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24367871  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24367872 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24367932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 26505379 - 26505537
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| ||    
T  26505379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 26505476  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  26505477 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 26505537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 26507857 - 26508015
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| ||    
T  26507857 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 26507954  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  26507955 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 26508015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 28577099 - 28577257
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||| | ||| || |||||||||| |||||| ||    
T  28577099 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacgca-acagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaa 28577196  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    |||||  ||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  28577197 tgcaagccaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 28577257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 22337115 - 22337241
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||   ||| || ||||| |||| ||||||    
T  22337115 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatc 22337213  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||    
T  22337214 aaatgcaagacaacaacatctcaaatat 22337241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 23076442 - 23076568
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  23076442 acatcatcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 23076540  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  23076541 aattgcaagtcaacaatatcttaaatat 23076568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 23285865 - 23285987
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  | || || |||| ||||||     
T  23285865 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa--aaca-gacataataatatca 23285960  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  23285961 attgcaattcatcaacatcttaaatat 23285987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23654507 - 23654381
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||| || ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  23654507 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatc 23654409  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  23654408 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 23654381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 38235 - 38138
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  38235 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 38138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21155219 - 21155064
Alignment:
Q  16 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |||    
T  21155219 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 21155122  T
Q  115 aattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    || |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21155121 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21155064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 23660023 - 23660148
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| | || ||  |||| |||| ||||||     
T  23660023 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaac-aacagcaacataggcagtatacgaaacaggatgacataataatatca 23660121  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  23660122 aatgcaaatcaacaacatcttaaatat 23660148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24898358 - 24898199
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  24898358 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24898261  T
Q  111 atgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24898260 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24898199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24900841 - 24900682
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  24900841 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24900744  T
Q  111 atgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24900743 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24900682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24903318 - 24903159
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  24903318 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24903221  T
Q  111 atgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24903220 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24903159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24905795 - 24905636
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  24905795 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24905698  T
Q  111 atgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24905697 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24905636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24908270 - 24908111
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  24908270 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24908173  T
Q  111 atgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24908172 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24908111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520152
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 20520197  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||||| |||| | ||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  20520196 tctcaaacatcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatat 20520152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 32039660 - 32039502
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  32039660 tcatcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataac-aacagtaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32039563  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32039562 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 32039502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 20309108 - 20309225
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  20309108 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataattatatca 20309205  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatct 129  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  20309206 aattcaattcatcaacatct 20309225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22731355 - 22731229
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  22731355 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 22731257  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||||||| |||||| | ||||||    
T  22731256 aattgcaattcatcaacatattaaatat 22731229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 32215085 - 32214925
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  32215085 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 32214988  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  32214987 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 32214925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23103516 - 23103396
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| || |  |||||     
T  23103516 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-aaacagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacatgattatatca 23103419  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaa 132  Q
    ||| ||||||| |||||||||||    
T  23103418 aattcaattcatcaacatctcaa 23103396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 45030016 - 45029858
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  45030016 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-acaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 45029919  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  45029918 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacatttatat 45029858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 23040310 - 23040247
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacata 74  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23040310 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 170
Target Start/End: Original strand, 43137301 - 43137457
Alignment:
Q  15 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  | ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  43137301 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-taatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 43137398  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||| |||||||| |||||| | |  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  43137399 caagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 43137457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24697709 - 24697536
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |||| ||| |||||    || ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24697709 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaacaacaacgtaggcagtacatcaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaaca 24697610  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatta 199  Q
    |||||||  ||| | | ||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||||||    
T  24697609 tctcaaacttcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacataaaatcatatta 24697536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Original strand, 38967374 - 38967424
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967374 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38967424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 87
Target Start/End: Original strand, 8946657 - 8946733
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaa 87  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||    
T  8946657 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataac-aatagcaacataggcagtatacaaa 8946733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22413240 - 22413078
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataaca--atatcgaatgcaattcaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||    
T  22413240 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaacaa 22413141  T
Q  125 catctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 187  Q
    |||||| || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||    
T  22413140 catctc-aacatcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 22413078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 22738300 - 22738247
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738300 acatcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 22738247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 24643109 - 24643054
Alignment:
Q  16 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24643109 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 24643054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 24529691 - 24529641
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24529691 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaa 24529641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 164
Target Start/End: Original strand, 23004767 - 23004905
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||   |||  |  ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  23004767 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagtacataaaatagttcaggatataataatatcaaatgcaaatcaacaaca 23004866  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaa 164  Q
    ||||||| |||| | ||||| || |||||| ||||||||    
T  23004867 tctcaaacatcatatataatccacataatgcatatacaa 23004905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 63
Target Start/End: Original strand, 25616192 - 25616238
Alignment:
Q  17 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25616192 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaattacaa 25616238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451985
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 75  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacatag 32451985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 81
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287433
Alignment:
Q  31 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagta 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392451
Alignment:
Q  31 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagt 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 24 - 274
Target Start/End: Original strand, 5657 - 5906
Alignment:
Q  24 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5657 atcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtatgaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaaca 5756  T
Q  124 acatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaac 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5757 acatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaac 5856  T
Q  224 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaact 274  Q
    | ||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5857 aacaagataaa-aacttagtttttaacctctaagatcaactcacatcaact 5906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14814 - 14554
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14814 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagtaagaaaatcatcatgatatagtaatatcgaatg 14715  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14714 caaatcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatactattatataccattaacaaaaacattagatcatattaaatcaggcttactg 14615  T
Q  214 aaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaact 274  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14614 aaacaacaacagcaagatatacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 14554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 66)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39706409 - 39706143
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706409 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 39706310  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggctt 209  Q
    ||||||| |||  ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  39706309 aatgcaagtcatgaacatcataaacatcaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatcata-taattcaggctt 39706211  T
Q  210 actgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  39706210 actaaaacaacaacagcaagataaacaacttaattcctaatctccaagatcaactcacatcaactcgt 39706143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288066
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaac 12288217  T
Q  123 aacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaaca 221  Q
    |||||| | || ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12288216 aacatcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaccaacaacattaaatcata-taattcaggcttactgaaacaaca 12288119  T
Q  222 acagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaact 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12288118 acagcaagataaacaacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaact 12288066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Original strand, 12774011 - 12774264
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12774011 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaata 12774110  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 213  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||        |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| |||||||    
T  12774111 caa-tcaacaacatctcaattatcaacataatccatttaatgtatatacaa--------cattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttactg 12774200  T
Q  214 aaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774201 gaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 12774264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13704
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 13854  T
Q  129 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagc 226  Q
    ||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | ||||||  | ||||| ||||||| |||| |||||      
T  13853 tcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcata-aacatcagtcttactggaacatcaacata 13755  T
Q  227 aagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13754 aagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 13704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Original strand, 8846360 - 8846639
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8846360 catcatcatcatcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgagataacaatatcgaatg 8846459  T
Q  114 c----------------aattcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcata 196  Q
    |                || ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  |||||    
T  8846460 ctaacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata 8846559  T
Q  197 ttaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |  | |||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8846560 tgca-tcagtcttactggaacaacaactacaagataaacaacttagtttctaatctctaagttcaactcacatcaactcgt 8846639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 276
Target Start/End: Original strand, 15551817 - 15552079
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  15551817 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgatataataatatcg 15551916  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    || | || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||   |||||    ||||| ||    
T  15551917 aaggtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattgattcata-agcatcagtct 15552012  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcg 276  Q
    |||||  |||  |||||| ||   |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552013 tactgggacattaacagc-agggtaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 15552079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198409
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |    
T  43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatc 43198562  T
Q  123 aacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaac 220  Q
    || |||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| |  ||||| |  || || ||||||| |||| |    
T  43198561 aatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcata-tgcattagtcttactggaacatc 43198463  T
Q  221 aacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||||||||   | ||||||||||||||||||    
T  43198462 aacaacaagataaacaacttagttttttacctct---agcaactcacatcaactcgt 43198409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 53082254 - 53082004
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  53082254 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataaca 53082156  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  53082155 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacag 53082057  T
Q  226 caagacaaacaacttagttcctta-cctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
     |||| || |||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  53082056 taagataagcaacttagtttcttaccccccaagatcaactcacatcaactcgt 53082004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640310
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||| || |||| ||||    
T  46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataaca 46640459  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    |||| || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||| |  |||||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  46640458 tctc-aacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaaatcata-taattcaggtttactgaaacaataacag 46640361  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
     |||| || |||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  46640360 taagataagcaacttagtttcttacc-ccatgatcaactcacatcaactcgt 46640310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52243192
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaac 52243203  T
Q  123 aacatctcaaa 133  Q
    |||||||||||    
T  52243202 aacatctcaaa 52243192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 118 - 275
Target Start/End: Original strand, 15099457 - 15099613
Alignment:
Q  118 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaat-caggcttactgaaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||    
T  15099457 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattaga--atatacaatccaggcttactggaa 15099554  T
Q  217 caacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactc 275  Q
      |||||| ||||  ||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15099555 tgacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactc 15099613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 276
Target Start/End: Original strand, 16596686 - 16596911
Alignment:
Q  48 cttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataatt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |    
T  16596686 cttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcatcaa---ctcaattatcaaacttaagt 16596782  T
Q  147 catataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttcc 246  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  | |||    ||||| ||||||  ||||  |||||||||  ||||||||||||| |    
T  16596783 catgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaatttata-agcatcagtcttacttgaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttc 16596881  T
Q  247 ttacctctaagatcaactcacatcaactcg 276  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596882 taacctctaagatcaactcacatcaactcg 16596911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 118 - 277
Target Start/End: Original strand, 15190424 - 15190582
Alignment:
Q  118 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaat-caggcttactgaaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||    
T  15190424 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattaga--atatacaatccaggcttactggaa 15190521  T
Q  217 caacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
      |||||| ||||  ||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15190522 tgacaacatcaaggtaaataacttagtttctaacccccaagatcaactcacatcaactcgt 15190582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 44615288 - 44615446
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  44615288 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 44615385  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44615386 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 44615446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8574985 - 8574864
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  8574985 tcatcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaat 8574888  T
Q  113 gcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  8574887 gtaattcaacaacatctcaaatat 8574864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16377639 - 16377522
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  16377639 tcattatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacataataatatcaaat 16377542  T
Q  113 gcaattcaacaacatctcaa 132  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  16377541 gcaagtcaacaacatctcaa 16377522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 12469 - 12311
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  12469 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12372  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  12371 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 12311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15118514 - 15118356
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  15118514 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15118417  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15118416 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 15118356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18215436 - 18215278
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  18215436 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18215339  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18215338 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18215278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 44773249 - 44773091
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  44773249 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44773152  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44773151 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattatat 44773091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 52312510 - 52312668
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  52312510 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 52312607  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  52312608 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 52312668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 7088877 - 7088996
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  7088877 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7088975  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatct 129  Q
     | ||||||||| ||||||||    
T  7088976 aattgcaattcatcaacatct 7088996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Original strand, 14280316 - 14280438
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  14280316 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 14280413  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  14280414 tgcaagtcaacaacatctcaaatat 14280438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 54798872 - 54798749
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  54798872 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 54798774  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  54798773 tgcaagtcaacaacatctcaaatat 54798749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 7798774 - 7798900
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  7798774 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7798872  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  7798873 aattgcaagtcatcaacatcttaaatat 7798900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19618336 - 19618176
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||| ||||||     
T  19618336 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatca 19618239  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  19618238 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacctataattcaagtaatgcatatataattatat 19618176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 6899891 - 6900016
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| || |||   |||| ||||||     
T  6899891 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacaacatagcataataatatca 6899989  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  6899990 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 6900016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16270356 - 16270231
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  16270356 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 16270258  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  16270257 aatgcaagttaacaacatcttaaatat 16270231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 52873488 - 52873363
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  52873488 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 52873390  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaata 135  Q
     | ||||| |||||| ||||| |||||    
T  52873389 aattgcaagtcaacatcatcttaaata 52873363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Original strand, 22636437 - 22636561
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  22636437 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 22636535  T
Q  111 atgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||    
T  22636536 ttgcaattcatcaacatcttaaatat 22636561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 44929042 - 44928883
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| ||| || ||    
T  44929042 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaa 44928944  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44928943 tgcaagtcaataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 44928883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 50222501 - 50222343
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  50222501 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 50222404  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  50222403 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 50222343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 51464030 - 51463872
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  51464030 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 51463933  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  51463932 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatat 51463872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 12902757 - 12902883
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  12902757 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 12902855  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | || |||||| |||||||| ||||||    
T  12902856 aattgtaattcatcaacatcttaaatat 12902883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 19242693 - 19242857
Alignment:
Q  7 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaat 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||    
T  19242693 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataat 19242790  T
Q  106 atcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  19242791 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 19242857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16240090 - 16239965
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  16240090 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataac-aatagcaaaataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 16239992  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16239991 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 16239965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18239581 - 18239426
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  18239581 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18239484  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaatta 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  18239483 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 18239426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1837671 - 1837513
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||| | ||    
T  1837671 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaa 1837574  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||| |||||||    
T  1837573 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacgattatat 1837513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23374473 - 23374354
Alignment:
Q  17 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 115  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | ||||    
T  23374473 catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 23374375  T
Q  116 attcaacaacatctcaaatat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  23374374 attcaacaacatcttaaatat 23374354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 7893703 - 7893829
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  7893703 acatcatcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7893801  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  7893802 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 7893829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 44052829 - 44052955
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  44052829 acatcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataac-aacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 44052927  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  44052928 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 44052955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 87
Target Start/End: Original strand, 3096293 - 3096369
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaa 87  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  3096293 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 3096369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 3515007 - 3515165
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||| | ||| || || || |||| |||||| ||    
T  3515007 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaa 3515104  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  3515105 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 3515165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 75
Target Start/End: Original strand, 17046487 - 17046552
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 75  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046487 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 17046552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23803427 - 23803316
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  23803427 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23803330  T
Q  112 tgcaattcaacaac 125  Q
    ||||| ||||||||    
T  23803329 tgcaaatcaacaac 23803316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 7641344 - 7641286
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7641344 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 7641286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 72
Target Start/End: Original strand, 12610950 - 12611008
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12610950 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 12611008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 132
Target Start/End: Original strand, 14038653 - 14038770
Alignment:
Q  15 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||  |||| |||||| ||||    
T  14038653 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatg 14038751  T
Q  114 caattcaacaacatctcaa 132  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  14038752 caagtcaacaacatctcaa 14038770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15355483 - 15355328
Alignment:
Q  17 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  15355483 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15355386  T
Q  116 attcaa-caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    | |||| |||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15355385 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatat 15355328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Original strand, 44102214 - 44102264
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 44102264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14053422 - 14053306
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  14053422 acatcatcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa-cagcatgacataataatatca 14053324  T
Q  110 aatgcaattcaacaacat 127  Q
    | | ||||||| ||||||    
T  14053323 atttcaattcatcaacat 14053306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 14970871 - 14970751
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | || || ||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  14970871 catcaacattttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaacag-caatatacaaaaacagcatgacataataatatca 14970774  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaa 132  Q
    ||||||| |||||||| ||||||    
T  14970773 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 14970751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 75
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190527
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacatag 6190527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 170
Target Start/End: Original strand, 22353835 - 22353995
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgca-aatcatcatgatataacaatatcga 110  Q
    |||||||| || | || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||  || |  | || ||||| ||||||||||| |    
T  22353835 atcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttaggtaaataac-aacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaa 22353933  T
Q  111 atgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
     | |||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22353934 ttacaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 22353995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 268
Target Start/End: Original strand, 14164741 - 14164807
Alignment:
Q  202 tcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcaca 268  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||    
T  14164741 tcaggcttactagaacaacaacagcaagataaacaacttagttcccaacccctaggatcatctcaca 14164807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 63
Target Start/End: Original strand, 15367690 - 15367743
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15367690 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15367743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 63
Target Start/End: Original strand, 15370018 - 15370071
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15370018 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15370071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 63
Target Start/End: Original strand, 15371202 - 15371255
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15371202 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15371255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 63
Target Start/End: Original strand, 15373483 - 15373536
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15373483 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15373536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 63
Target Start/End: Original strand, 15402703 - 15402756
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15402703 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15402756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15464970 - 15464929
Alignment:
Q  92 catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaa 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15464970 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 15464929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 63
Target Start/End: Original strand, 16223532 - 16223585
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16223532 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 16223585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815589
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| | || |||| | ||| || ||||| |||| |||||  ||||||| |||||||| |    
T  21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataac-gacagcaacaca-actgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgt 21815634  T
Q  128 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21815633 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21815589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 268
Target Start/End: Original strand, 14158036 - 14158102
Alignment:
Q  202 tcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcaca 268  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||    
T  14158036 tcaggcttactagaacaacaacagcaagataaaaaacttagttcccaacccctaggatcatctcaca 14158102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 81
Target Start/End: Original strand, 17333298 - 17333347
Alignment:
Q  31 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagta 81  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  17333298 tagactgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatagacagta 17333347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 20157579 - 20157527
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  20157579 catcatcgtcttaatcaacttatatagactcatgcaaattagttaaataacaa 20157527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21329618 - 21329351
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21329618 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcg 21329519  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    ||| ||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  || |||||||    
T  21329518 aattcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggct 21329420  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329419 tactgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 21329351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21502277 - 21502008
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21502277 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcagcatgatataacaatatcg 21502178  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    ||||||| ||| || ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21502177 aatgcaagtcatcatcatcttaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggct 21502078  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttag-ttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || || |||||||||| ||||||||||||    
T  21502077 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagttttctaacttccaagatcaactaacatcaactcgt 21502008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Original strand, 21565546 - 21565809
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565546 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatccaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 21565645  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 212  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||    
T  21565646 caagtcatcaacatttcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttact 21565744  T
Q  213 gaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
      |||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565745 agaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 21565809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26012154 - 26011889
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  26012154 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaagcaacatgatataacaatatca 26012057  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    ||||  | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||  |||||||    
T  26012056 aatgtgaatcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacatcaacaacaacatcagattata-tagttcaggct 26011958  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26011957 tactgaaacaacaataacaagataaacaacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgt 26011889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026794
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaaca 20026944  T
Q  127 tctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    || |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| |||     
T  20026943 tcacaac-atcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatatagcattatcaacaacattaaaacatat-aattcaggcttactgaaacaactacaa 20026846  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20026845 caagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcgactcgt 20026794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22959649 - 22959392
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22959649 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatg 22959550  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 212  Q
    ||| |||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||   ||||| |  ||||| ||||||    
T  22959549 caaatcaacaa---ctcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattttaaccaacattgattcata-tgcatcagtcttact 22959454  T
Q  213 gaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaact 274  Q
    | ||||| |||| ||||| ||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22959453 ggaacaaaaacaacaagataaacaacttggtttttaacctctaagatcaactcacatcaact 22959392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 19668898 - 19669161
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19668898 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcg 19668997  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta--gatcatattaaatcagg 206  Q
    ||||||| |||||||   |||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |    ||||| |  |||||     
T  19668998 aatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacataagtcctgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaatattcata-tgcatcagt 19669093  T
Q  207 cttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaact 274  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19669094 cttactggaacaacaacaacaagataaacgacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 19669161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19660956 - 19660693
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  ||||||    
T  19660956 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcttgatataatgatatcg 19660857  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    |||  || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||    ||||| ||    
T  19660856 aatataaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcata-agcatcagtct 19660761  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcg 276  Q
    ||||| ||||  |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19660760 tactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 19660693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178073
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| ||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 22178224  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||   ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||    
T  22178223 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatccaatcatat-aatttaggtttactgaaacaacaacag 22178125  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
     |||| || |||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  22178124 taagataagcaacttagtttcttacccccatgatcaactcacatcaactcgt 22178073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Original strand, 36314577 - 36314678
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  36314577 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 36314676  T
Q  110 aa 111  Q
    ||    
T  36314677 aa 36314678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 21729185 - 21729059
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  21729185 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 21729087  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||    
T  21729086 aattgcaattcaacaacatcttaaatat 21729059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 21808510 - 21808384
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  21808510 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 21808412  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||    
T  21808411 aattgcaattcaacaacatcttaaatat 21808384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 170
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144211
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacatc 22144167  T
Q  129 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| | ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22144168 tcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatat 22144211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23390617 - 23390491
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  23390617 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23390519  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  23390518 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 23390491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Original strand, 22412187 - 22412309
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  22412187 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-gataacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 22412285  T
Q  113 gcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  22412286 gcaagtcaacaacatctcaaatat 22412309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 24493569 - 24493694
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  24493569 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 24493667  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24493668 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 24493694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 264930 - 264772
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  264930 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 264833  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  264832 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 264772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 10733102 - 10732944
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  10733102 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 10733005  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  10733004 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 10732944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 11581361 - 11581203
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  11581361 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 11581264  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||| ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11581263 tgcaagtcaataacgtctcaattattcacgtataattcaagtaatgtatatacaattatat 11581203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 20909012 - 20909170
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  20909012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20909109  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20909110 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20909170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 29329934 - 29330092
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  29329934 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 29330031  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29330032 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29330092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 39363384 - 39363542
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  39363384 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39363481  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  39363482 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 39363542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 8286964 - 8286838
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc--aaatcatcatgatataacaatat 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  ||| || ||||| |||| |||||    
T  8286964 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatat 8286866  T
Q  108 cgaatgcaattcaacaacatctcaaata 135  Q
    | | ||||||||| |||||||| |||||    
T  8286865 caattgcaattcatcaacatcttaaata 8286838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 13025311 - 13025436
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||   |||||     
T  13025311 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatca 13025409  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13025410 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 13025436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 13095495 - 13095620
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||   |||||     
T  13095495 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatca 13095593  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13095594 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 13095620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 42245527 - 42245369
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  42245527 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 42245430  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  42245429 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 42245369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 1096467 - 1096593
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||| || ||| | |||| ||||||    
T  1096467 acatcaacatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatc 1096565  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1096566 aaatgcaaatcaacaacatctcacatat 1096593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Original strand, 9077952 - 9078074
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  9077952 acatcatcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 9078050  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaa 132  Q
     | ||||| |||||||||||||||    
T  9078051 aagtgcaagtcaacaacatctcaa 9078074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 21997655 - 21997549
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  21997655 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 21997557  T
Q  109 gaatgcaa 116  Q
     |||||||    
T  21997556 aaatgcaa 21997549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 25421532 - 25421658
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  25421532 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 25421630  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  25421631 aattgcaagtcaacagcatcttaaatat 25421658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2154776 - 2154617
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |     
T  2154776 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaac 2154679  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaa--atatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| ||||||  || ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2154678 tgcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatat 2154617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Original strand, 24529223 - 24529339
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| ||    
T  24529223 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaa 24529321  T
Q  112 tgcaattcaacaacatct 129  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  24529322 tgcaagtcaacaacatct 24529339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 29345980 - 29346138
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  29345980 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataac-aacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29346077  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29346078 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29346138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Original strand, 40725853 - 40726050
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  40725853 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaagcatcatgatataataatatcg 40725952  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcag 205  Q
     | | || | ||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||||||||    
T  40725953 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcag 40726050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 22075018 - 22075145
Alignment:
Q  10 acatcatcat-cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 107  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| ||||| |||| |||||    
T  22075018 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataac-aacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatat 22075116  T
Q  108 cgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||    
T  22075117 caattgcaattcaacaacatcttaaatat 22075145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 36154942 - 36154787
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  36154942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa----caacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 36154848  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  36154847 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 36154787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20902172 - 20902012
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  20902172 tcatcatcttaattcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 20902075  T
Q  111 atgcaattcaacaacatctcaa--atatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
     ||||| |||||||| ||||||  || ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20902074 gtgcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatat 20902012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21741545 - 21741486
Alignment:
Q  118 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21741545 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacatta 21741486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 39245136 - 39245291
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  39245136 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39245233  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaatta 167  Q
    ||||| |||| ||| || ||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  39245234 tgcaagtcaataacgtcccaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 39245291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 29348453 - 29348611
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  29348453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-gaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29348550  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29348551 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29348611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 29350926 - 29351084
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  29350926 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-gaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29351023  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29351024 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29351084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 20918110 - 20918052
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20918110 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 20918052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Original strand, 38619434 - 38619484
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619434 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38619484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 23064512 - 23064561
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064512 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 23064561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 134
Target Start/End: Original strand, 25431395 - 25431518
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  25431395 acatcatcatcttcataaa-ttagaccgactcatgcatcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 25431492  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaat 134  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||    
T  25431493 aattgcaagtcaacaacatcttaaat 25431518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 32027393 - 32027551
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  32027393 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacaacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32027490  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    | ||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32027491 tccaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 32027551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 10775838 - 10775790
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 10775790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18319193 - 18319037
Alignment:
Q  16 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||    
T  18319193 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 18319096  T
Q  115 aattcaa-caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    || |||| |||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18319095 aagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatat 18319037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Original strand, 31061068 - 31061118
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31061068 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 31061118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 164
Target Start/End: Original strand, 29448055 - 29448159
Alignment:
Q  63 aacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtata 159  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||    
T  29448055 aacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatacgtaattcatgtaatgcata 29448154  T
Q  160 tacaa 164  Q
    |||||    
T  29448155 tacaa 29448159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 21293090 - 21293020
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagta 81  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  21293090 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 21293020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 20806904 - 20806854
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20806904 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaa 20806854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 82
Target Start/End: Original strand, 37723922 - 37723975
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtat 82  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  37723922 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtat 37723975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 26704075 - 26704124
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26704075 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26704124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 26973808 - 26973857
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26973808 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26973857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 17517320 - 17517269
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17517320 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaa 17517269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 63
Target Start/End: Original strand, 24067110 - 24067157
Alignment:
Q  16 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  24067110 tcatcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataacaa 24067157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 26740747 - 26740697
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagt 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  26740747 cttagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20766175 - 20766115
Alignment:
Q  76 acagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20766175 acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 20766115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 129
Target Start/End: Original strand, 18418590 - 18418697
Alignment:
Q  20 cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaatt 118  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||   |||||||    
T  18418590 cttaatcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataac-aacatcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacataataatatcatttgcaatt 18418687  T
Q  119 caacaacatct 129  Q
    | |||||||||    
T  18418688 c-acaacatct 18418697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732884
Alignment:
Q  26 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagt 80  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 236 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21741440 - 21741399
Alignment:
Q  236 aacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21741440 aacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgt 21741399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2923 - 2658
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2923 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatg 2824  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatg----tatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggctt 209  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2823 caaatcaacaacatctcaaatatcagcttaattcataaaatgtatatatatacaat--tataccattaacaacaacaatagatcatattaaatcaggctt 2726  T
Q  210 actgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2725 actgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 2658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10794
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 10641  T
Q  125 catctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaac 223  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10642 catctcaaacatcgaacataattcatgtaatgtatatacaattatatgacattaacaacaacattagattata-taattcaggcttactgaaacaacaac 10740  T
Q  224 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10741 agcaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 10794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 68 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2072
Alignment:
Q  68 caacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaatta 167  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2281 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcagcataattcatataatgtatatacaatta 2182  T
Q  168 tataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcac 267  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  2181 tataccattaacaacaacattggatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttattttctaacctctaagatcaactcac 2082  T
Q  268 atcaactcgt 277  Q
    ||||||||||    
T  2081 atcaactcgt 2072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 91)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Original strand, 15470927 - 15471190
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470927 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 15471023  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  15471024 aatgcaagtcatcaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaac-ttagatcata-taattcaggct 15471121  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  15471122 tactgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctccaagatcatctaacatcaactcgt 15471190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Original strand, 16097332 - 16097595
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16097332 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatcatataacaatatcgaatg 16097431  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 212  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||    
T  16097432 caagtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttact 16097530  T
Q  213 gaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16097531 ggaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaatctctaagatcaactcacatcaactcgt 16097595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Original strand, 16103784 - 16104046
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103784 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 16103883  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  || || ||||||    
T  16103884 caa-tcaacaacatctcaaatatcaaacataattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaattcata-tggattagtcttact 16103981  T
Q  213 gaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16103982 ggaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagattaactcacatcaactcgt 16104046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 14234487 - 14234753
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14234487 acatcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 14234586  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |  || |||||||    
T  14234587 aatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatta-aacaattcaggct 14234685  T
Q  209 tactga--aacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaact 274  Q
    ||||||  |||||||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||    
T  14234686 tactgaacaacaacaacaacaagataaataacttagtttctaacctccaagatcaactaacatcaact 14234753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 277
Target Start/End: Original strand, 32307691 - 32307934
Alignment:
Q  24 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32307691 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaaca 32307789  T
Q  124 acatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaac 223  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||        |||||  ||||||||||  |||||    ||||| ||||||  |||||  ||    
T  32307790 acatctcaattatcaacataatccatttaatgtatatacaa--------cattataaacaacattaattcata-agcatcagtcttactagaacaatgac 32307880  T
Q  224 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307881 agcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 32307934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12174376 - 12174152
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174376 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 12174277  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 212  Q
    |||   ||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||   ||||| |  ||||| ||||||    
T  12174276 caa---aacaacaactcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattgattcata-tgcatcagtcttact 12174181  T
Q  213 gaaacaacaacagcaagacaaacaactta 241  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||    
T  12174180 ggaacaacaacagcaagctaaacaactta 12174152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13210448 - 13210183
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  13210448 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 13210349  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt-agatcatattaaatcaggc 207  Q
    ||||||| |||||||   || ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| |  ||||| |  ||||| |    
T  13210348 aatgcaaatcaacaa---cttaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattgaattcata-tgcatcagcc 13210253  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||||| ||    |||| ||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13210252 ttactggaatgttaacaacaagataaacaacttagtttctaacctctaggatcaactcacatcaactcgt 13210183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 49668193 - 49667939
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49668193 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 49668094  T
Q  114 caattcaacaa-catctcaaatatcaacataattcatataatgtatataca--attatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggctta 210  Q
    |||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||| ||| |||||||||  |||||||||    |||| ||||      ||||| |  ||||| ||||    
T  49668093 caat-caacaaacatctcatttatcaacataatccatttaaagtatatacagcattatatac----aacatcaac------tcata-tgcatcagtctta 49668006  T
Q  211 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49668005 ctggaacaatgacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 49667939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37251021
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37251171  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    ||||||  |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| || |||| ||||||| |||||||||||    
T  37251170 tctcaac-atcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcagacttactggaacaacaacag 37251073  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
     |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  37251072 taagataaacaacttagtttcttacccccaagatcaactcacatcaactcgt 37251021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Original strand, 9512924 - 9513171
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9512924 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 9513023  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 213  Q
    ||||    ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||        |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| |||||||    
T  9513024 caat----caacatctcatttatcaacataatccatttaatgtatataaaa--------cattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttactg 9513110  T
Q  214 aaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaact 274  Q
     ||||| |||| ||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9513111 gaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagattaactcacataaact 9513171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1644780 - 1644538
Alignment:
Q  24 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 123  Q
    ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  1644780 atcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatgcaaatcatcattatataacaatatcgaatacaa-tcaaca 1644683  T
Q  124 acatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaac 223  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||        |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||| ||||| |||    
T  1644682 atatctcaattatcaacataatccatttaatgtatatacaa--------cattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttactggaacaataac 1644592  T
Q  224 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    | ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644591 aacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 1644538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Original strand, 9520899 - 9521146
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9520899 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 9520998  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 213  Q
    ||||    ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||  |        |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| |||||||    
T  9520999 caat----caacatctcatttatcaacataatccatttaatgtatataaca--------cattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactg 9521085  T
Q  214 aaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaact 274  Q
     ||||| |||| ||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9521086 gaacaataacaacaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagattaactcacataaact 9521146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Original strand, 27165250 - 27165373
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||    
T  27165250 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaacaacatgatataccaatatcaaat 27165349  T
Q  113 gcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||    
T  27165350 gcaagtcatcaatatctcaaatat 27165373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 53301669 - 53301545
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  53301669 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaat 53301570  T
Q  113 gcaattca-acaacatctcaaatat 136  Q
    |||| |||  ||| |||||||||||    
T  53301569 gcaagtcattcaatatctcaaatat 53301545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523669
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaaca 52523732  T
Q  127 tctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 187  Q
    ||||||| | ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  52523731 tctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 52523669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22110454 - 22110205
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  22110454 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagca 22110355  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    |||| || |||| | | ||||||| |||||  |||||| ||||||  |||||  |||||| | | ||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  22110354 tctc-aacatcatatagaattcatgtaatgcgtatacatttatatcacattattaacaacttcaaatcata-caattcaggcttactgaaacaacaacag 22110257  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
     |||| || |||||||||| ||||||   | |||||||||||||||| ||||    
T  22110256 taagataagcaacttagtttcttaccctcatgatcaactcacatcaattcgt 22110205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 12399209 - 12399335
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  12399209 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 12399307  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12399308 aaatgcaattcaacaacatcttaaatat 12399335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 49389642 - 49389484
Alignment:
Q  119 caacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaac 217  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| |||    
T  49389642 caacaacatctcaactatcaaacataattcatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaac 49389544  T
Q  218 aacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49389543 aacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaacacacatcaactcgt 49389484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24340844 - 24340647
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  24340844 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaacatcatgatataataatatcg 24340745  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcag 205  Q
    || |||| | |||||||||||||||||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||||||||    
T  24340744 aacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcag 24340647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Original strand, 36166598 - 36166719
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  36166598 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacacag-cagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 36166695  T
Q  113 gcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  36166696 gcaagtcaacaacatctcaaatat 36166719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 18438534 - 18438653
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||||| ||||||    
T  18438534 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatc 18438632  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatct 129  Q
     ||||||| ||||||||||||    
T  18438633 aaatgcaagtcaacaacatct 18438653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 136
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274813
Alignment:
Q  28 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 127  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 23274804  T
Q  128 ctcaaatat 136  Q
    |||||||||    
T  23274805 ctcaaatat 23274813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 14972854 - 14972980
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  14972854 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 14972952  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14972953 aaatgcaaatcaacaacatctcatatat 14972980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 17487856 - 17487982
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  17487856 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17487954  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  17487955 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 17487982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 17499338 - 17499464
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  17499338 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17499436  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  17499437 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 17499464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24153326 - 24153204
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  ||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  24153326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gatagcaacataggtagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 24153228  T
Q  113 gcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  24153227 gcaagtcaacaacatcttaaatat 24153204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 79
Target Start/End: Original strand, 28194693 - 28194759
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacag 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194693 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacag 28194759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 118 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1465423 - 1465265
Alignment:
Q  118 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaat-caggcttactgaaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||  |||   ||| ||||||||||| ||    
T  1465423 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatgtaatgtatatacaattgtataacattatcatcaacattaga--ataaacaatccaggcttactggaa 1465326  T
Q  217 caacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
      ||| || ||||  ||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1465325 tgacagcatcaaggtaaataacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgt 1465265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 7781509 - 7781351
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  7781509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 7781412  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  7781411 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 7781351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 17463178 - 17463336
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  17463178 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17463275  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17463276 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17463336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 17672626 - 17672784
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  17672626 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17672723  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  17672724 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatat 17672784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 29172745 - 29172587
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  29172745 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29172648  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29172647 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29172587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 34159326 - 34159484
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  34159326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 34159423  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  34159424 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 34159484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 170
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926121
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 43926076  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||||| |||| | | ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  43926077 tctcaaacatcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatat 43926121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 45607069 - 45606911
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  45607069 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 45606972  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  45606971 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 45606911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 55476491 - 55476649
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  55476491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 55476588  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  55476589 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 55476649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 13442274 - 13442400
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  13442274 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 13442372  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  13442373 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 13442400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16282971 - 16282815
Alignment:
Q  15 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||| |||||    
T  16282971 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatg 16282874  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16282873 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16282815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Original strand, 21618449 - 21618570
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 112  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  21618449 tcatcttctcaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 21618546  T
Q  113 gcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  21618547 gcaagtcaacaacatctcaaatat 21618570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 11424880 - 11424783
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  11424880 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataacaatatc 11424783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28848773 - 28848618
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  28848773 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 28848676  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaatta 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  28848675 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 28848618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 8899094 - 8899252
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  8899094 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 8899191  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  8899192 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 8899252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9707769 - 9707611
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  9707769 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 9707672  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    | ||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  9707671 tacaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 9707611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16454443 - 16454285
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  16454443 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16454346  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16454345 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16454285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 37642386 - 37642189
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  37642386 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 37642287  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcag 205  Q
     | | || | ||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||||||||    
T  37642286 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcag 37642189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 38962053 - 38961895
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  38962053 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 38961956  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  38961955 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 38961895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 136
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386536
Alignment:
Q  28 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||  || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaaca 42386526  T
Q  127 tctcaaatat 136  Q
    ||||||||||    
T  42386527 tctcaaatat 42386536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 6469296 - 6469178
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  6469296 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 6469199  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaa 132  Q
    ||||| |||||||| ||||||    
T  6469198 tgcaagtcaacaacgtctcaa 6469178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 136
Target Start/End: Original strand, 14572603 - 14572714
Alignment:
Q  24 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||  | ||||||    
T  14572603 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgagagtcaaca 14572701  T
Q  124 acatctcaaatat 136  Q
    |||||| ||||||    
T  14572702 acatcttaaatat 14572714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20698556 - 20698437
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || |||||  ||| ||||||    
T  20698556 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatc 20698458  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatct 129  Q
     | ||||||||| ||||||||    
T  20698457 aattgcaattcatcaacatct 20698437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 40213838 - 40213720
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgca-aatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| || || |||||||| |||| |||||| ||    
T  40213838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacatcaacacag-cagtatacataaacatcatgacataataatatcaaa 40213741  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaa 132  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  40213740 tgcaagtcaacaacatctcaa 40213720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23083482 - 23083356
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||| ||  |||| |||| ||||||    
T  23083482 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatc 23083384  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  23083383 aattgcaagtcaacaacatcttaaatat 23083356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Original strand, 55500942 - 55501055
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  55500942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 55501039  T
Q  112 tgcaattcaacaacat 127  Q
    ||||| ||||||||||    
T  55501040 tgcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13151953 - 13151794
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  13151953 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 13151856  T
Q  111 atgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13151855 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13151794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13154418 - 13154259
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  13154418 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 13154321  T
Q  111 atgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13154320 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13154259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 170
Target Start/End: Original strand, 13544024 - 13544183
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||| | ||| |||||||| |||| |||||| |    
T  13544024 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 13544121  T
Q  111 atgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  13544122 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 13544183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 10247885 - 10247727
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  10247885 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataac-aacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 10247788  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  10247787 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 10247727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Original strand, 12567564 - 12567718
Alignment:
Q  17 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||    
T  12567564 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 12567661  T
Q  116 attcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    | |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  12567662 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 12567718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17446816 - 17446659
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  17446816 tcatcatcttaatcaacttagac-gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17446720  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaacata--attcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17446719 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattatat 17446659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Original strand, 15977515 - 15977633
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  15977515 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 15977612  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaa 132  Q
    ||||| |||||||| ||||||    
T  15977613 tgcaagtcaacaacgtctcaa 15977633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 43550644 - 43550482
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  |||||||| ||| || ||||| |||| ||||||    
T  43550644 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-tgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatc 43550546  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
     ||||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  43550545 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgtatatacaattatat 43550482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25476506 - 25476384
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  25476506 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaac-aacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 25476408  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaa 132  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  25476407 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 25476384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 26686887 - 26687013
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  26686887 acatcatcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 26686985  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  26686986 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 26687013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 43840932 - 43841058
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  43840932 acatcattatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 43841030  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  43841031 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 43841058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 606428 - 606324
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |   ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  606428 cttataccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcacataaatcagttcatgatataacaatatc-aatgcaattcaacaaca 606330  T
Q  127 tctcaa 132  Q
    ||||||    
T  606329 tctcaa 606324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 170
Target Start/End: Original strand, 41123892 - 41124045
Alignment:
Q  15 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  41123892 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa----caacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 41123986  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41123987 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 41124045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 50242822 - 50242980
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  50242822 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-tagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 50242919  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  50242920 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 50242980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14576939 - 14576828
Alignment:
Q  24 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 123  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | | || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||    
T  14576939 atcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataac-aacagcaacatagacagtataaacaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 14576841  T
Q  124 acatctcaaatat 136  Q
    |||||| ||||||    
T  14576840 acatcttaaatat 14576828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 72
Target Start/End: Original strand, 17737236 - 17737294
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17737236 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 17737294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Original strand, 8499518 - 8499568
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499518 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 8499568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Original strand, 10556985 - 10557035
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10556985 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 10557035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Original strand, 15412429 - 15412479
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412429 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15412479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 45578000 - 45577950
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45578000 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45577950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 277
Target Start/End: Original strand, 43927304 - 43927400
Alignment:
Q  180 aacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  43927304 aacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtttcttacccccatgatcaactcacatcaactcgt 43927400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070657
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||| || || || |||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 53070702  T
Q  128 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  53070701 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 53070657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 201 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12934242 - 12934166
Alignment:
Q  201 atcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||| ||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12934242 atcagtcttactggaacaatgacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 12934166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22147646 - 22147467
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||| ||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22147646 acatcaacatcttcaacgacttggaccgagtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 22147547  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 187  Q
     | | || | ||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  22147546 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 22147467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 12119887 - 12119837
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12119887 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaa 12119837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Original strand, 44494809 - 44494859
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44494809 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaa 44494859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 126
Target Start/End: Original strand, 12377940 - 12378039
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  12377940 cttagaccgactcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaatagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 12378039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2051260 - 2051141
Alignment:
Q  72 atagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaatta 167  Q
    |||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  2051260 ataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaatta 2051161  T
Q  168 tataccattaacaacaacat 187  Q
    |||  |||||  ||||||||    
T  2051160 tatcacattataaacaacat 2051141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 63
Target Start/End: Original strand, 46822267 - 46822318
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  46822267 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaa 46822318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 63
Target Start/End: Original strand, 12511059 - 12511110
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12511059 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaa 12511110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Original strand, 14665398 - 14665450
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14665398 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 14665450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Original strand, 14668554 - 14668606
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14668554 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 14668606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 856140 - 856189
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  856140 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataacaa 856189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15878168 - 15878119
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15878168 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 15878119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 23077594 - 23077534
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 75  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  23077594 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataac-aacagcaacatag 23077534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 75
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919393
Alignment:
Q  31 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 75  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatag 13919393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 26196548 - 26196500
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 62  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  26196548 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataaca 26196500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Original strand, 30029841 - 30029893
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  30029841 catcaacatctcattcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaa 30029893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Original strand, 12766 - 13033
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12766 acatcatcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 12865  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  12866 aatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaataacaacattagatcata-taattcaggct 12964  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12965 tactggaacaacaacagcaagataaaccacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 13033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Original strand, 32538 - 32802
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  32538 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatca 32635  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||    
T  32636 aatgcaa-tcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaaaaacattagattata-taattcaggct 32733  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32734 tactgaaacaataacaacaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 32802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51945
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagca 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagca 51945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 270
Target Start/End: Original strand, 62216 - 62455
Alignment:
Q  28 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||    
T  62216 acttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgaaaaacatcatggtataataatatcgaatgca---caacaacat 62312  T
Q  128 ctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagca 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  62313 ctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacatcattagttcataacaattcaggcttactgaaacaacaacagca 62412  T
Q  228 agacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatc 270  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  62413 agataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatc 62455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Original strand, 132662 - 132918
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 112  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  132662 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatatcgaat 132761  T
Q  113 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 212  Q
    | || ||| |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||      |||| | |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||    
T  132762 gtaa-tcatcaacgtctcaattatcaacataatccatttaatgtata------tatacaacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttact 132853  T
Q  213 gaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  132854 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 132918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 136680 - 136838
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  136680 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 136777  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  136778 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 136838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 139149 - 139307
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  139149 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 139246  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  139247 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 139307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 144087 - 144245
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  144087 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 144184  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  144185 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 144245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 134211 - 134369
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  134211 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 134308  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  134309 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 134369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 141618 - 141776
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  141618 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 141715  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  141716 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 141776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10395
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10647 tcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 10548  T
Q  125 catctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaac 223  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||| |||||||||    
T  10547 catctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttactggaacaacaac 10449  T
Q  224 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    | ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10448 aacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 10395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6244 - 5980
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6244 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 6145  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    ||||||| |||  ||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  || |||||||    
T  6144 aatgcaagtcattaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggct 6046  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaact 274  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  6045 tactgaaacaataacagcaagataaataacttagtttttaacctccaagatcaactaacatcaact 5980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Original strand, 1086 - 1349
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1086 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaata 1185  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 212  Q
    ||  ||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||||    
T  1186 caggtcatcaacatttcaaacatcaaacataattcatggaatgtatatacaactatataacattaacaacaacatcaaatcata-tacatcagtcttact 1284  T
Q  213 gaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    | |||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1285 ggaacaacaacaacaagataaaaaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 1349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Original strand, 6611 - 6878
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6611 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcg 6710  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    ||||||| | | || |||   ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  6711 aatgcaagttatcatcattataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcata-taattcaagct 6809  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | || | ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  6810 tactaaaacaacaacagcaagataaacaacttagattctaatctccaagttcaactcacatcaactcgt 6878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Original strand, 13991 - 14258
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13991 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcg 14090  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    ||||||| | | || |||   ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  14091 aatgcaagttatcatcattataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcata-taattcaagct 14189  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | || | ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14190 tactaaaacaacaacagcaagataaacaacttagattctaatctccaagttcaactcacatcaactcgt 14258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 277
Target Start/End: Original strand, 129919 - 130172
Alignment:
Q  24 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  129919 atcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 130018  T
Q  124 acatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaa 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||| ||||||||    
T  130019 acatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattgtaaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttactggaacaacaa 130117  T
Q  223 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  130118 cagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 130172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 60818 - 60713
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  60818 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagctcatgatataccaatatc-aatgcaaatcaacaaca 60720  T
Q  127 tctcaaa 133  Q
    |||||||    
T  60719 tctcaaa 60713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 76)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Original strand, 23019408 - 23019673
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  23019408 acatcatcatctt--tcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatca 23019505  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||    
T  23019506 aatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacgacattagattata-tagttcaggct 23019604  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23019605 tactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaacctccaagatcaactcacatcaactcgt 23019673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Original strand, 19652199 - 19652460
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652199 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 19652298  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactg 213  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| |||||||    
T  19652299 caa-tcaacaacatctcaaacatcaacataatccatttaaagtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttactg 19652396  T
Q  214 aaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652397 gaacaataacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 19652460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668639
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaac 19668485  T
Q  123 aacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaaca 221  Q
    |||||| |||  |||| || |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  19668486 aacatcacaac-atcatacgtaattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacactacatcatat-acatcagacttactgaaacaaca 19668583  T
Q  222 acagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19668584 acagcaagataaacaacttagtttcttacctccaagatcaactcacatcaactcgt 19668639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22080846 - 22080593
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||             ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22080846 acatcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaa-------------cataggcagtatgcaaaacatcatgatataacaatatcg 22080760  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggctt 209  Q
    ||||||    |||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| || | ||||||    
T  22080759 aatgcacag-aacaacatctcaaacatcgtcataattaatataatgtatatacatttatataacattaacaacatcattaggtcatatcaatttaggctt 22080661  T
Q  210 actgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080660 actgaaacaacaagagcaagataagcaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 22080593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28496592 - 28496328
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28496592 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 28496493  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    |||| || |||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  ||||| |  ||||| ||    
T  28496492 aatgtaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcata-tgcatcagtct 28496397  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||| ||||  |||||||||  ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  28496396 tactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaaactctaagatcaactcacatcaactcgt 28496328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29809003 - 29808739
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  29809003 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 29808904  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    |||| || |||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  ||||| |  ||||| ||    
T  29808903 aatgtaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcata-tgcatcagtct 29808808  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||| ||||  |||||||||  ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  29808807 tactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaaactctaagatcaactcacatcaactcgt 29808739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Original strand, 1561303 - 1561568
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1561303 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 1561402  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattaga-tcatattaaatcaggc 207  Q
    ||||||| |||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| | ||||| |  ||||| |    
T  1561403 aatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcata-tgcatcagtc 1561498  T
Q  208 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||||| || |  |||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1561499 ttactggaatattaacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaggatcaactcacatcaactcgt 1561568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098379
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaac 9098521  T
Q  123 aacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaaca 221  Q
    ||| || | || ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||            ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  9098520 aacttcac-aacatcaaacataattcatgtaatgtatatataattatat------------aacattaaatcata-taattcaggcttactgaaacaata 9098435  T
Q  222 acagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    || |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098434 actgcaagataaacaaattagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 9098379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Original strand, 20109140 - 20109408
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||     
T  20109140 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacataatataacaatatca 20109237  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatataca--attatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcag 205  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||  |||||||  |||||  |||||||| |  | ||| || |||||    
T  20109238 aatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattgata-tacatcag 20109336  T
Q  206 gcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
     ||||||  ||  ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109337 tcttactagaaagacatcagcaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 20109408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 27333339 - 27333238
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333339 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 27333240  T
Q  110 aa 111  Q
    ||    
T  27333239 aa 27333238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 27394079 - 27393978
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394079 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 27393980  T
Q  110 aa 111  Q
    ||    
T  27393979 aa 27393978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 4185928 - 4185827
Alignment:
Q  24 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4185928 atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatca 4185829  T
Q  124 ac 125  Q
    ||    
T  4185828 ac 4185827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 125
Target Start/End: Original strand, 4186381 - 4186482
Alignment:
Q  24 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4186381 atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatca 4186480  T
Q  124 ac 125  Q
    ||    
T  4186481 ac 4186482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 16496244 - 16496370
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  16496244 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 16496342  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||    
T  16496343 aattgcaattcaacaacatcttaaatat 16496370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 1595549 - 1595707
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  1595549 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 1595646  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    |||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  1595647 tgcaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatggatatacaattatat 1595707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 22782227 - 22782385
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  22782227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22782324  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22782325 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattatat 22782385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Original strand, 29060540 - 29060662
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  29060540 acatcatcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 29060638  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaa 132  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  29060639 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 29060662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 275
Target Start/End: Original strand, 23076749 - 23076997
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcat--catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||   ||| |||  |  ||||||| |||||| | ||  | |||||||||    
T  23076749 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaaca 23076848  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
     || ||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  23076849 acttaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatct-atatcaggcttactgaaacaacaacag 23076947  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactc 275  Q
     |||| || ||| |||||| |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  23076948 taagataagcaaattagtttcttacccccatgatcaactcacatcaactc 23076997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2291342 - 2291184
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  2291342 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 2291245  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  2291244 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 2291184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 12742317 - 12742475
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  12742317 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12742414  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  12742415 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 12742475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18334754 - 18334596
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  18334754 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18334657  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18334656 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18334596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 19005046 - 19005204
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  19005046 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 19005143  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19005144 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 19005204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19859081 - 19858923
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  19859081 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 19858984  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19858983 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 19858923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 20076700 - 20076812
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||| ||||||     
T  20076700 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaaacagcatgacataataatatca 20076798  T
Q  110 aatgcaattcaaca 123  Q
    ||||||| ||||||    
T  20076799 aatgcaaatcaaca 20076812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 24422547 - 24422705
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  24422547 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24422644  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24422645 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24422705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644444
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||| || ||| ||    
T  25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
Q  124 acatctcaaa 133  Q
    ||||||||||    
T  25644435 acatctcaaa 25644444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 33861794 - 33861952
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  33861794 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 33861891  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  33861892 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 33861952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 33864278 - 33864436
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  33864278 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 33864375  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  33864376 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 33864436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Original strand, 35008167 - 35008417
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcat--catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||   ||| |||  |  ||||||| |||||| | ||  | |||| ||||    
T  35008167 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaaaaaca 35008266  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
     || ||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | ||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  35008267 acttaaacatcatatataattcatgtaatgaatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatct-atatcaggcttactgaaacaataacag 35008365  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
     |||| || |||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  35008366 taagataagcaacttagtttcttacccccatgatcaactcacatcaactcgt 35008417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 17287917 - 17287791
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||  || ||||| |||| ||||||    
T  17287917 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatc 17287819  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  17287818 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 17287791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 30676874 - 30676714
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| || |||||||||| ||||||     
T  30676874 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 30676777  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  30676776 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 30676714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18409947 - 18409826
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  18409947 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatca 18409849  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaa 132  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  18409848 aatgcaagtcaacaacatctcaa 18409826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19303661 - 19303540
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  19303661 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacacaggaagtatacaaaacaacatgacataataatatca 19303563  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaa 132  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  19303562 aatgcaagtcaacaacatctcaa 19303540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 8055029 - 8055187
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  8055029 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-aaagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 8055126  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  8055127 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 8055187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8227632 - 8227435
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8227632 acatcaacatcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 8227533  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcag 205  Q
     | | || | ||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||||||||    
T  8227532 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcag 8227435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 26924802 - 26924644
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  26924802 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 26924705  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  26924704 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 26924644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 31155514 - 31155346
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 112  Q
    ||||||| | |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31155514 catcatcatcatcaacttggattgactcatgcaacttagttaaataacaaaacagcaac-taaacagtatgcaagtcatcgtgatataacaatatcgaat 31155416  T
Q  113 gcaattcaacaacatctcaaat-atcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaaca 183  Q
    |||||||| ||||   ||| || |||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||| ||| |||||||    
T  31155415 gcaattcatcaac--ttcatatcatcaacataaatcatgcaatgtttatacatttatataacatcaacaaca 31155346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25629476 - 25629354
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |  |||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  25629476 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattac-aacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatc 25629378  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaa 132  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  25629377 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 25629354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 25754809 - 25754967
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  25754809 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25754906  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  25754907 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 25754967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Original strand, 25656629 - 25656731
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  25656629 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25656726  T
Q  112 tgcaa 116  Q
    |||||    
T  25656727 tgcaa 25656731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20361081 - 20360955
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  20361081 acatcatcattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatc 20360983  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  20360982 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 20360955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20557054 - 20556898
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||  |||| |||||| ||    
T  20557054 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaa 20556957  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20556956 tgcaagtcaacaacgtctc-aatttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20556898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Original strand, 20593773 - 20593895
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  20593773 acatcatcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataa-aaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 20593871  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaa 132  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  20593872 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 20593895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 34963371 - 34963531
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  34963371 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 34963468  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  34963469 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 34963531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1541073 - 1540918
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||    
T  1541073 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaa 1540976  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaatta 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  1540975 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 1540918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 25714417 - 25714478
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25714417 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16920751 - 16920634
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||| ||||  |||||     
T  16920751 acatcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtatacaa--catcatgacataagtatatca 16920654  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatct 129  Q
    ||| | ||||| ||||||||    
T  16920653 aattccattcatcaacatct 16920634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20638404 - 20638285
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  20638404 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 20638306  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatct 129  Q
     | ||||||| | ||||||||    
T  20638305 aattgcaatttatcaacatct 20638285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Original strand, 25688502 - 25688620
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |     
T  25688502 tcattatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaac 25688599  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaa 132  Q
    ||||| |||||||| ||||||    
T  25688600 tgcaagtcaacaacgtctcaa 25688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27333238 - 27333139
Alignment:
Q  177 aacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcg 276  Q
    |||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333238 aacaacaacattggattatac-aattcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaatttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 27333140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27393978 - 27393879
Alignment:
Q  177 aacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcg 276  Q
    |||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27393978 aacaacaacattggattatac-aattcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaatttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 27393880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 35245586 - 35245703
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||  || ||||| |||| ||||||     
T  35245586 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatacaa--caacatgacataataatatca 35245683  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatct 129  Q
    | | ||||||| ||||||||    
T  35245684 atttcaattcatcaacatct 35245703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3852179 - 3852021
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| || | |||||  ||    
T  3852179 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaa 3852082  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  3852081 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 3852021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 4668277 - 4668217
Alignment:
Q  65 cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 125  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4668277 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4668217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 4675124 - 4675064
Alignment:
Q  65 cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 125  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4675124 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4675064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16448686 - 16448530
Alignment:
Q  16 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||    
T  16448686 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 16448589  T
Q  115 aattcaa-caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    || |||| |||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16448588 aagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatat 16448530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 170
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456877
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18456832  T
Q  128 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18456833 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18456877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 22780348 - 22780295
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22780348 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 22780295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 75
Target Start/End: Original strand, 22831503 - 22831568
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 75  Q
    ||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831503 acatcatcatcttcaacatagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 22831568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18199519 - 18199269
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||  || |   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||  | |||||| ||    
T  18199519 cttagaccgactcatgcagcttaatcaa-taataaacagcaacataggaagcacataaaacaactcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatca 18199421  T
Q  127 -tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
     ||| ||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18199420 atcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcat-ttatatcagacttactgaaacaacaaca 18199322  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||  | || ||||||  || | |||| | | |||||||||||| ||||||||    
T  18199321 gcagtataagcaacttcatttcctaccccaaggatcaactcacaacaactcgt 18199269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 73
Target Start/End: Original strand, 11185524 - 11185568
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacat 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11185524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacat 11185568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 132
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18461997
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18461992  T
Q  128 ctcaa 132  Q
    |||||    
T  18461993 ctcaa 18461997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 19848114 - 19848063
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19848114 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaa 19848063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18177775 - 18177525
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| ||||||||  || |   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||  | |||||| ||    
T  18177775 cttagaccgactcatgcagcttaatcaa-taataaacaacaacataggaagcacataaaacaactcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatca 18177677  T
Q  127 -tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
     ||| ||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18177676 atcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcat-ttatatcagacttactgaaacaacaaca 18177578  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||  | || ||||||  || | |||| | | |||||||||||| ||||||||    
T  18177577 gcagtataagcaacttcatttcctaccccaaggatcaactcacaacaactcgt 18177525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Original strand, 18204096 - 18204346
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| ||||||||  || |   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||  | |||||| ||    
T  18204096 cttagaccgactcatgcagcttaatcaa-taataaacaacaacataggaagcacataaaacaactcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatca 18204194  T
Q  127 -tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
     ||| ||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18204195 atcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcat-ttacatcagacttactgaaacaacaaca 18204293  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||  | || ||||||  || | |||| | | |||||||||||| ||||||||    
T  18204294 gcagtataagcaacttcatttcctaccccaaggatcaactcacaacaactcgt 18204346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28103887 - 28103799
Alignment:
Q  141 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaaga 230  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28103887 ataattcacataatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaaga 28103799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 197
Target Start/End: Original strand, 18696569 - 18696675
Alignment:
Q  91 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 189  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||||    
T  18696569 tcatgatataacaatatc-aaagcaaatcaataacatctccaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatta 18696667  T
Q  190 gatcatat 197  Q
     |||||||    
T  18696668 aatcatat 18696675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821904
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 18821904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 63
Target Start/End: Original strand, 23992429 - 23992480
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23992429 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagctaaataacaa 23992480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 199
Target Start/End: Original strand, 18706387 - 18706495
Alignment:
Q  91 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 189  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| |    
T  18706387 tcatgatataacaatatc-aaagcaaatcaataacatcttaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatgacattattaacaacatca 18706485  T
Q  190 gatcatatta 199  Q
     |||||||||    
T  18706486 aatcatatta 18706495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 51
Target Start/End: Original strand, 19008799 - 19008843
Alignment:
Q  7 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctta 51  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19008799 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccaactcatgcagctta 19008843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 108
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443146
Alignment:
Q  31 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||| ||||||||||||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagtatataaaacatctcaagatataacaatatc 33443146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 18907111 - 18907160
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18907111 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcagcttagttaaataacaa 18907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 19862978 - 19863027
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19862978 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19863027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 19873120 - 19873169
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19873120 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19873169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18896304 - 18896256
Alignment:
Q  141 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 189  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  18896304 ataattcacataatgcatatacaattatatcccattactaacaacatta 18896256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22776 - 22528
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22776 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 22677  T
Q  125 catctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaac 223  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |    ||| |  ||||| ||||||| |||| ||||    
T  22676 catctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatca----ata-tgcatcagtcttactggaacagcaac 22582  T
Q  224 agcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22581 atcaagacaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 22528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 82072 - 82230
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  82072 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataac-aacagcaacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 82169  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  82170 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 82230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Original strand, 160688 - 160950
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  160688 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatg 160787  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 212  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| |||||     
T  160788 caa-tcaacaacatgtcaaatatcaaacataagtcatgtaatatatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttacc 160885  T
Q  213 gaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  160886 gaaacaacaacaacaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 160950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Original strand, 501088 - 501242
Alignment:
Q  17 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  501088 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 501185  T
Q  116 attcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    | |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  501186 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 501242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 85742 - 85692
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85742 tcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 85692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1155 - 892
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1155 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgcagatcatcatgatataacaacatcg 1056  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |   || |||||||    
T  1055 aatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagat--ttacaattcaggct 958  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaact 274  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| || || || |||||||||| |||||||||    
T  957 tactgaaacaacaacaacaagataaataacttagtttctaacttccaagatcaactaacatcaact 892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 24 - 274
Target Start/End: Original strand, 6826 - 7073
Alignment:
Q  24 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 123  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6826 atcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaaca 6925  T
Q  124 acatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaa 222  Q
    |   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||| |  ||||| ||||||| ||||||||    
T  6926 a---ctcaaatatcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattaattcata-tgcatcagtcttactggaacaacaa 7021  T
Q  223 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaact 274  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7022 cagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 7073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 92 - 277
Target Start/End: Original strand, 8097 - 8282
Alignment:
Q  92 catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattag 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8097 catgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattag 8196  T
Q  191 atcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    || |||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8197 attatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagcaggataaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 8282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Original strand, 133 - 395
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  133 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 232  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| || |||    
T  233 caaatcaacaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacatcaattcata-tgtatcagtctcact 331  T
Q  213 gaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
      ||||||||||||||||  ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  332 agaacaacaacagcaaga-taacaactcagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 45909 - 45646
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45909 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 45810  T
Q  114 caattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 212  Q
     || ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||    
T  45809 taagtcatcaacatctcaattatcaaacataattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttact 45711  T
Q  213 gaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    | |||||  ||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45710 ggaacaattacagcaatataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 45646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Original strand, 12942 - 13206
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12942 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcagcatgatataacaatatcg 13038  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||   || |||||||    
T  13039 aatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcgtgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattat-ccaattcaggct 13137  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || | ||| | |||||||||||||||||||||    
T  13138 tactgaaacaacaacagcaagataaataacttagtttctaatctccatgatcaactcacatcaactcgt 13206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 91 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18277 - 18091
Alignment:
Q  91 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 189  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||| |    
T  18277 tcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatca 18178  T
Q  190 gatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
     | ||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||| | | ||||| |||||||||||||||    
T  18177 aaacatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtgagataagcaacttagtttcttacccccatgatcatctcacatcaactcgt 18091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 7930
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  8180 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaac 8081  T
Q  123 aacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaaca 221  Q
    |||||| |||  |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8080 aacatcacaac-atcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacattaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaaca 7983  T
Q  222 acagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
       |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7982 ---gcaagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 7930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 29354 - 29135
Alignment:
Q  57 ataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatg 155  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||   |||| |||||| | ||| |||| || ||    
T  29354 ataacaaacagcaacataggtagtattcaaactatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaac---tcaattatcaaacttaagtcatgtactg 29258  T
Q  156 tatatacaattatataccat---taacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacct 252  Q
    |||||||||||||||| |||   ||  | ||||||||  |||||   | |||| ||||||| ||||  |||||||||  ||||||||||||| || ||||    
T  29257 tatatacaattatataacataattataagcaacattaattcataagca-tcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacct 29159  T
Q  253 ctaagatcaactcacatcaactcg 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29158 ctaagatcaactcacatcaactcg 29135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 276
Target Start/End: Original strand, 15664 - 15924
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15664 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaccatcatgatataataatatcgaat 15763  T
Q  113 gcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttac 211  Q
    | || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||   |||||| |||||    
T  15764 gtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattatttcata-agaatcagtcttac 15859  T
Q  212 tgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcg 276  Q
    || | ||  |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15860 tggatcattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcg 15924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136221
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 136372  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattaga-tcatattaaatcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    || ||   |||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  136371 tcacatc-atcgtacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaaca 136274  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  136273 gcaagataaacaacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgt 136221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 144929
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||| |||||  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 145080  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattaga-tcatattaaatcaggcttactgaaacaacaaca 224  Q
    || ||   |||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  145079 tcacatc-atcgtacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaaca 144982  T
Q  225 gcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  144981 gcaagataaacaacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgt 144929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Original strand, 174767 - 174886
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcga 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  || ||||| || |  ||||| |    
T  174767 catcatcaacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacatgattatatcaa 174864  T
Q  111 atgcaattcaacaacatctcaa 132  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  174865 attcaattcaacaacatctcaa 174886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 80
Target Start/End: Original strand, 121766 - 121835
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagt 80  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  121766 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 53651 - 53402
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 128  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  53651 cttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 53552  T
Q  129 tcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagc 226  Q
    ||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | ||||||  | ||||| ||||||| |||| |||||      
T  53551 tcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcata-aacatcagtcttactggaacatcaacata 53453  T
Q  227 aagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53452 aagataaacaacttagtttcttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 53402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12835
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 128  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 12686  T
Q  129 tcaaata--tcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagc 226  Q
    |||||||  |  | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | || |||  | || || ||||||||||||||||||||    
T  12687 tcaaatacttatatataattca-gtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaataata-cacattagacttactgaaacaacaacagc 12784  T
Q  227 aagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12785 aagataaacaacttagtttattacctctaagatcaactcacatccactcgt 12835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 276
Target Start/End: Original strand, 11292 - 11555
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11292 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 11391  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    |||| || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||  |||||    ||||| ||    
T  11392 aatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatactattatataacattataagcaacattaattcata-agcatcagtct 11487  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcg 276  Q
    ||||  ||||  |||| ||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11488 tacttgaacattaacaccaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagattaactcacatcaactcg 11555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Original strand, 1997 - 2228
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1997 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 2096  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    |||| || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||    ||||| ||    
T  2097 aatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcata-agcatcagact 2192  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 244  Q
    ||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||    
T  2193 tactggaacattaacagcaaggtaaacaacttagtt 2228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 28414 - 28533
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  28414 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 28512  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatct 129  Q
     | ||||||||||||||||||    
T  28513 aattgcaattcaacaacatct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 66
Target Start/End: Original strand, 4552 - 4608
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 66  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4552 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 4608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 103737 - 103492
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||  |||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  103737 tcaacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataaaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacaac 103638  T
Q  123 aacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaa 222  Q
    ||||||      ||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  103637 aacatc------at--acataattcatgtaatgtatatacaactacataacattaacaacaacattaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaa 103547  T
Q  223 cagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||| |||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  103546 caggaagataaagaacttagtttcctacctccaagatcaactcacatcaactcgt 103492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6136
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 6287  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  6286 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacag 6188  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
      ||| || |||||||||| |||||| | | ||||| |||||||||||||||    
T  6187 tgagataagcaacttagtttcttacccccatgatcatctcacatcaactcgt 6136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 13840 - 13794
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  13840 cttagaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacaacaacatag 13794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 277
Target Start/End: Original strand, 38339 - 38585
Alignment:
Q  33 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38339 gaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatctc 38438  T
Q  131 aaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaag 229  Q
    ||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||  |||||  ||||||   |||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  38439 aaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatatatatcacattaatctcaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaag 38537  T
Q  230 acaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    | || |||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||||    
T  38538 ataagcaacttagtttcttacccccgtgatcaactcacatcaactcgt 38585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 19980 - 20029
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19980 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcagcttgattaaataacaa 20029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7917
Alignment:
Q  31 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatcagctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacatc 8062  T
Q  129 tcaaatat-ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagc 226  Q
    | ||| || || | ||||||||  ||||||||||| ||||||||  |||||  |||||||| | ||||||| | ||||| || |||| ||||||| ||||    
T  8061 ttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatat-acatcagtctcactggaacaacatcagc 7963  T
Q  227 aagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaa 272  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  7962 aagataaacaacttagtttcatacctctaagatcaactcacatcaa 7917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128849
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 128974  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  128973 tctcaaacatcatatataattcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatct-aaatcaggcttactgaaacaacaacag 128875  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacc 251  Q
     |||| || |||||||||| ||||||    
T  128874 taagataagcaacttagtttcttacc 128849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 275
Target Start/End: Original strand, 78345 - 78587
Alignment:
Q  33 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  78345 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctc 78443  T
Q  131 aaatatcaac-ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaag 229  Q
    ||  |||    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  78444 aac-atcgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaag 78541  T
Q  230 acaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactc 275  Q
    | || |||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  78542 ataagcaacttagttgcttacccccatgatcaactcacatcaactc 78587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Original strand, 116430 - 116551
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||| || ||||| ||||  ||||| |||    
T  116430 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataatcatatcaaat 116527  T
Q  113 gcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  116528 gcaagtcaacaacatctcaaatat 116551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97273
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 97123  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  97124 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctatatcaggcttactgaaacaacaacag 97222  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
     |||| || |||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  97223 taagaaaagcaacttagtttcttacc-ccatgatcaactcacatcaactcgt 97273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106551
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 106401  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  106402 tctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctatatcaggcttactgaaacaacaacag 106500  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
     |||| || |||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  106501 taagaaaagcaacttagtttcttacc-ccatgatcaactcacatcaactcgt 106551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 34123 - 34384
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  34123 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaacccatcatgatataataatatcg 34222  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggct 208  Q
    |||| || ||||||||   |||| |||||| | ||| |||  |||| |||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||    ||||| ||    
T  34223 aatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaagtcaagtaatatatatacaattatataacattataagcaacattaattcata-agcatcagtct 34318  T
Q  209 tactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaact 274  Q
    ||||| || |  |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  34319 tactggaaaattaacagcaaggtaaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaact 34384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 63
Target Start/End: Original strand, 273 - 326
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  273 acatcattatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaa 326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 15898 - 15792
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15898 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcg 15799  T
Q  110 aatgcaa 116  Q
    |||||||    
T  15798 aatgcaa 15792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15761 - 15686
Alignment:
Q  202 tcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15761 tcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtttctaatctccaagatcaactcacatcaactcgt 15686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 178898 - 178947
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  178898 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 178947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 38820 - 38697
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  38820 tcatcatcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaat 38721  T
Q  113 gcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||    
T  38720 gcaagtcatcaatatctcaaatat 38697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1190 - 1025
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1190 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 1091  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 177  Q
    |||| || |||||||   ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1090 aatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 264
Target Start/End: Original strand, 32102 - 32345
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 112  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32102 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaat 32201  T
Q  113 gcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttact 212  Q
    | || ||| |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||      |||| | |||||  |||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||    
T  32202 gtaa-tcatcaacgtctcaattatcaacataatccatttaatgtata------tatacaacattataaacaacatcaattcata-tgcatcagtcttact 32293  T
Q  213 gaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaact 264  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32294 ggaacaacaacagtaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaact 32345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 24001 - 23897
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24001 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 23905  T
Q  110 aatgcaat 117  Q
    ||||||||    
T  23904 aatgcaat 23897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19742
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaaca 19888  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    |||| |  |||| | |||| |||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  || ||||| | |||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  19887 tctc-agcatcataaataactcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaataacatcaaatcata-taattcatgcttactggaacaacaacag 19790  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaac 273  Q
     |||| || |||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||    
T  19789 taagataagcaacttagtttcttacccccaagatcaactcatatcaac 19742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 39913 - 40038
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  39913 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatca 40011  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  40012 aatgcatgtcaataacatcttaaatat 40038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 3271 - 3146
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  3271 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatca 3173  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3172 aatgcaagtcaacaacatctcaaatat 3146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 136
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1158
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacatc 1150  T
Q  129 tcaaatat 136  Q
    ||||||||    
T  1151 tcaaatat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 274
Target Start/End: Original strand, 54 - 270
Alignment:
Q  60 acaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgt 156  Q
    |||||||||||||||| |||||   ||| ||  ||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||| | ||||||||| |||||     
T  54 acaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcagatgcaaatcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgc 153  T
Q  157 atatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaa 256  Q
    ||||||| ||||||| |||||  |||||||| | ||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||| | |     
T  154 atatacatttatataacattattaacaacatcaaatcat-ttaatttaggcttactgaaacaacaacagtaagatatgcaacttagtttcttacccccat 252  T
Q  257 gatcaactcacatcaact 274  Q
    ||||||||||||||||||    
T  253 gatcaactcacatcaact 270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 3306 - 3185
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||||| ||||||     
T  3306 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 3208  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaa 132  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  3207 aatgtaattcaacaacatctcaa 3185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 170
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25268
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaac 25219  T
Q  123 aacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25220 aacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaaatatat 25268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 199
Target Start/End: Original strand, 619 - 727
Alignment:
Q  91 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 189  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| |    
T  619 tcatgatataacaatatc-aaagcaaatcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatca 717  T
Q  190 gatcatatta 199  Q
     |||||||||    
T  718 aatcatatta 727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Original strand, 569 - 816
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  569 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 667  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    || | || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| | ||||   ||||   | || || | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  668 tc-ccaacatcatatataattcatgtaatgcatatacattaatatcatattatttaaaagatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacag 765  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
      ||| ||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  766 ttagataaacaacttagtttcttacc-atatgatcaactcacatcaactcgt 816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Original strand, 39479 - 39602
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  39479 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaa 39577  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  39578 tgcaagtcaacaacatctcaaatat 39602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 75333 - 75210
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  75333 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaa 75235  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  75234 tgcaagtcaacaacatctcaaatat 75210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 1851 - 1977
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  1851 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 1949  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  1950 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 1977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18148 - 17951
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  || |||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  18148 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaacatcatgatataataatatcg 18049  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcag 205  Q
    || |||| | |||||||||||||||||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||||||||    
T  18048 aacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcag 17951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 2291 - 2241
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2291 tcatcattttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataacaa 2241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 33077 - 32952
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  33077 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 32979  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||    
T  32978 attgcaattcaacaacatcttaaatat 32952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 45928 - 46053
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  45928 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 46026  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||    
T  46027 attgcaattcaacaacatcttaaatat 46053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Original strand, 16113 - 16235
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||| || || ||||| | ||||||    
T  16113 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatc 16211  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaa 132  Q
     |||||||  ||||| ||||||||    
T  16212 aaatgcaagccaacatcatctcaa 16235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 17450 - 17389
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17450 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaaca 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 4849 - 4968
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  4849 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 4947  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatct 129  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  4948 aaatgcaattcaacaacatct 4968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 129
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13247
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatc 13246  T
Q  129 t 129  Q
    |    
T  13247 t 13247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 16098
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaa 16107  T
Q  125 catctcaaa 133  Q
    |||||||||    
T  16106 catctcaaa 16098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 81
Target Start/End: Original strand, 2680 - 2732
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagta 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| |||||    
T  2680 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaagcaacaacataggcagta 2732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27747
Alignment:
Q  25 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaa 27756  T
Q  125 catctcaaa 133  Q
    |||||||||    
T  27755 catctcaaa 27747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 44825 - 44702
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  44825 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44727  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  44726 tgcaagtcaacaacatctcaaatat 44702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 26064
Alignment:
Q  17 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| |    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgta 26081  T
Q  116 attcaacaacatctcaa 132  Q
    |||||||||| ||||||    
T  26080 attcaacaacgtctcaa 26064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 187
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11643
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||| |||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11464 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 11563  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 187  Q
     | | || | ||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  11564 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 11643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 38377 - 38198
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||| |||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38377 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 38278  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaat-atca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 187  Q
     | | || | ||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  38277 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 38198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17337 - 17214
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc---aaatcatcatgatataacaatat 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |   ||| || ||||| |||| |||||    
T  17337 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatat 17239  T
Q  108 cgaatgcaattcaacaacatctcaa 132  Q
    | ||||||| |||||||||||||||    
T  17238 caaatgcaagtcaacaacatctcaa 17214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79288
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||   ||| || ||||| |||| ||| || ||||||| |||||||| |    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cgacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgt 79333  T
Q  128 ctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  79332 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaagtatat 79288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 25896 - 26021
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||| ||||||     
T  25896 acatcattatcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatca 25994  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||    
T  25995 aatgcaagtaaacaacatctcaaatat 26021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 39858 - 39983
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||| ||||||     
T  39858 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatca 39956  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||    
T  39957 aatgcaagtaaacaacatctcaaatat 39983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 20747 - 20905
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  20747 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20844  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20845 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 37821 - 37979
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  37821 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 37918  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  37919 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 37979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 158612 - 158454
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  158612 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 158515  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  158514 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 158454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 340065 - 339949
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 112  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  340065 tcatcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac--acaacaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaat 339968  T
Q  113 gcaattcaacaacatctcaa 132  Q
     ||| |||||||||||||||    
T  339967 -caagtcaacaacatctcaa 339949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1900 - 1651
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||  |||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1900 cttagaccgactcatgcagcttagttattaaactaacattaacataggtagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 1801  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    ||||||  |||| | |||||| || ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||| | | ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||    
T  1800 tctcaac-atcatatataatttatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacgtcaaatcatat-aattcaggcttactggaacaacaatag 1703  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
     |||| |  |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  1702 taagataggcaacttagtttcttaccctcaagatcaactcacatcaactcgt 1651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 13211 - 13337
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  13211 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 13309  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  13310 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 13337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 13392 - 13547
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  13392 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13489  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaatta 167  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  13490 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 13547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 32942 - 33067
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  32942 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 33040  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  33041 aatgcaagttaacaacatcttaaatat 33067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 38761 - 38886
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  38761 acatcatcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 38859  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  38860 aatgcaaataaacaacatcttaaatat 38886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 170
Target Start/End: Original strand, 9744 - 9908
Alignment:
Q  8 ggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| ||||    
T  9744 ggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagaatgacataataata 9841  T
Q  107 tcgaatgcaattcaacaacatctcaa--atatca-acataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    || | ||||| |||||||| ||||||  || ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  9842 tcaagtgcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatat 9908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 10772 - 10891
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |    
T  10772 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 10869  T
Q  111 atgcaattcaacaacatctcaa 132  Q
    |||||| |||||||| ||||||    
T  10870 atgcaagtcaacaacgtctcaa 10891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 13947 - 14105
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  13947 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14044  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14045 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 16784 - 16942
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  16784 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-tagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 16881  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16882 tgcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 10544 - 10427
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  || ||||| |||| ||||||     
T  10544 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataataatatca 10447  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatct 129  Q
    | | ||||||||||||||||    
T  10446 atttcaattcaacaacatct 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Original strand, 22886 - 23008
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  22886 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-ccagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22983  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||    
T  22984 tgcaagtcaacaacatcttaaatat 23008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 1289 - 1406
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||  |||||||| ||||  |||||     
T  1289 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtacaa--catcatgacataattatatca 1386  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatct 129  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  1387 aattcaattcatcaacatct 1406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 7266 - 7383
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  7266 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--caacatgaaataattatatca 7363  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatct 129  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  7364 aattcaattcatcaacatct 7383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15356 - 15306
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15356 tcatcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Original strand, 267679 - 267916
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaaca 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||  ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  267679 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaata 267778  T
Q  127 tctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacag 225  Q
    |||| || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||| ||| | |||||| | |  ||||||||||||||||||| |||    
T  267779 tctc-aacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaccatcaaatcata-tcatccaggcttactgaaacaacagcag 267876  T
Q  226 caagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactc 265  Q
     |||  || |||||||||| ||||||  || |||||||||    
T  267877 taagctaagcaacttagtttcttacccttatgatcaactc 267916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 3470 - 3596
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  3470 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaa-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 3568  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  3569 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 3596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 343 - 468
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||  | |||||  ||| ||||||     
T  343 acatcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaataacataggcagtatacaaaatagcatgacgtaataatatca 441  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    | || || |||||||||||| ||||||    
T  442 attggaagtcaacaacatcttaaatat 468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 51913 - 52039
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  51913 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatc 52011  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  52012 aattgcaagtcaacatcatcttaaatat 52039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 168099 - 167973
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | |||  | ||||| |||| ||||||    
T  168099 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 168001  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  168000 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 167973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 4694 - 4852
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  4694 tcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 4791  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  4792 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 4852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 9241 - 9360
Alignment:
Q  12 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcga 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||   ||| |||||||| |||| |||||| |    
T  9241 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaa 9338  T
Q  111 atgcaattcaacaacatctcaa 132  Q
    |||||| |||||||| ||||||    
T  9339 atgcaagtcaacaacgtctcaa 9360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8528
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||  ||| || ||||| |||| ||||||     
T  8650 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat----aacagcaacataggcagtatcaaaaacagcatgacataataatatca 8555  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  8554 attgcaagtcaacatcatcttaaatat 8528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 40400 - 40558
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||    
T  40400 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaa 40497  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaacat--aattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  40498 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatat 40558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 51582 - 51699
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||  ||| |     
T  51582 acatcatcattttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa--catcatgacataattataaca 51679  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatct 129  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  51680 aattcaattcatcaacatct 51699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 1043
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | |||  | ||||| |||| ||||||    
T  1169 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 1071  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  1070 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 1043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 1952 - 2078
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||| | |||||| ||||| ||||  |||||    
T  1952 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatc 2050  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||    
T  2051 aattgcaattcaacaacatcttaaatat 2078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2505 - 2300
Alignment:
Q  68 caacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaatt 166  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  2505 caacttagaccgtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatttaatgtatatacaatt 2409  T
Q  167 atataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactca 266  Q
    ||||| |||||  | ||||||||  |||||    ||||| ||||||| ||||  || ||||||  ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  2408 atataacattataagcaacattaattcata-agcatcagtcttactggaacattaatagcaaggtaaaaaacttagtttctaacctctaagatcaactca 2310  T
Q  267 catcaactcg 276  Q
    ||| ||||||    
T  2309 cataaactcg 2300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 15584 - 15466
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  15584 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aagagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatca 15486  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatct 129  Q
    | | ||||||| ||||||||    
T  15485 atttcaattcatcaacatct 15466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 32067 - 32184
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||| ||||||     
T  32067 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaa-caacatgacataataatatca 32164  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatct 129  Q
    | | ||||||| ||||||||    
T  32165 atttcaattcatcaacatct 32184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 6245 - 6116
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca--aacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||  ||||| | ||| || ||||| || | ||||    
T  6245 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataata 6146  T
Q  107 tcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    || | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  6145 tcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 6116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 127
Target Start/End: Original strand, 16282 - 16397
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  |||||     
T  16282 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataattatatca 16379  T
Q  110 aatgcaattcaacaacat 127  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  16380 aattcaattcatcaacat 16397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 106 - 264
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  106 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 203  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  204 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 28887 - 28806
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-aacagcaacatagacagtatgcaaatcatcat 94  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28887 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaatcatcat 28806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 201 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28741 - 28665
Alignment:
Q  201 atcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    ||||| ||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28741 atcagtcttactggaacaatgacagcaagataaacaacttagtttctaacctctaagatcaactcacatcaactcgt 28665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20383
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-tcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 20427  T
Q  129 tcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    |||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20426 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 128751 - 128876
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | | |  |   ||| || ||||| |||| ||||||     
T  128751 acatcatcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaa-agcaacaaaaaaaaaaaaaaaaacagcatgacataataatatca 128849  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  128850 aatgcaagtcaacaacatcttaaatat 128876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 13497 - 13615
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| || | ||||||     
T  13497 acatcatcaacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacatgataatatca 13595  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatct 129  Q
    | | | ||||| ||||||||    
T  13596 atttcgattcatcaacatct 13615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16721 - 16599
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  16721 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 16623  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaa 132  Q
     |||| || |||||| ||||||||    
T  16622 aaatggaagtcaacagcatctcaa 16599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24297
Alignment:
Q  28 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaa--tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||   || ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaac 24308  T
Q  126 atctcaaatat 136  Q
    |||| ||||||    
T  24307 atcttaaatat 24297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 11286 - 11446
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  11286 catcaacatcttaatcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 11383  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacata--attcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||  |||||  |||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  11384 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatat 11446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 161252 - 161093
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| || |||||| | ||| ||| |||| |||| |||||| ||    
T  161252 tcatcatcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatc-aacagcgacacag-cagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaa 161155  T
Q  112 tgcaattcaa-caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  161154 tgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatat 161093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 132
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4415
Alignment:
Q  16 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |||    
T  4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-tagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgc 4397  T
Q  115 aattcaacaacatctcaa 132  Q
    || |||||||| ||||||    
T  4398 aaatcaacaacgtctcaa 4415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 5246 - 5132
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 112  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||  |||||||| ||||  ||||| |||    
T  5246 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggtattatacaa--catcatgacataattatatcaaat 5149  T
Q  113 gcaattcaacaacatct 129  Q
     ||||||| ||||||||    
T  5148 tcaattcatcaacatct 5132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 87
Target Start/End: Original strand, 4712 - 4788
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaa 87  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||    
T  4712 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaa 4788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 8479 - 8598
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||  ||||| | ||| ||  |||| |||| ||||||    
T  8479 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatc 8577  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatct 129  Q
     | ||||| ||||||||||||    
T  8578 aattgcaagtcaacaacatct 8598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 1170 - 1053
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||  |||||||| ||||  |||||     
T  1170 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtatacaa--catcatgacataattatatca 1073  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatct 129  Q
    | | ||||||| ||||||||    
T  1072 atttcaattcatcaacatct 1053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 125
Target Start/End: Original strand, 9133 - 9193
Alignment:
Q  65 cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 125  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9133 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 9193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 20910 - 21030
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||| |||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| ||| || ||||| |||| ||||||    
T  20910 acatcaacatcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatc 21009  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatct 129  Q
     | ||||||||||||||||||    
T  21010 aattgcaattcaacaacatct 21030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 12413 - 12253
Alignment:
Q  11 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| || | ||| || ||||| | || ||||||     
T  12413 catcaacatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatca 12316  T
Q  110 aatgcaattcaacaacatctcaaatatcaaca--taattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||  |||  |||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  12315 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatataattatat 12253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 12064 - 12216
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  12064 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-------aaacagcaacacag-cagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaa 12155  T
Q  112 tgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  12156 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 12216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 4508 - 4633
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||   ||| || ||||| |||| ||||||    
T  4508 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 4605  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||    
T  4606 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 4633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 12090 - 12215
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||   ||| || ||||| |||| ||||||    
T  12090 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 12187  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12188 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 12215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 22042 - 22167
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||   ||| || ||||| |||| ||||||    
T  22042 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 22139  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22140 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 22167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 4214 - 4373
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  4214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-gacagcgacacag-cagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaa 4311  T
Q  112 tgcaattcaa-caacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
    ||||| |||| |||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4312 tgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatat 4373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 29931 - 30090
Alignment:
Q  13 tcatcatcttaatc-aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 110  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  29931 tcatcatcttaattgaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 30028  T
Q  111 atgcaattcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 170  Q
     || || |||||||| |||||| |||  ||  |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  30029 gtgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataattcatatacaattatat 30090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 80
Target Start/End: Original strand, 46995 - 47065
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagt 80  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  46995 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 47065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 4954 - 4890
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 75  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4954 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacatag 4890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1393
Alignment:
Q  16 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1440 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 1393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 117
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2784
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  2694 cttagaccgactcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaat 2784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 23843 - 23892
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23843 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 23892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 36454 - 36503
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36454 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 36503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 11564 - 11447
Alignment:
Q  10 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  11564 acatcttcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 11466  T
Q  109 gaatgcaattcaacaacat 127  Q
     | | ||||||| ||||||    
T  11465 aatttcaattcatcaacat 11447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 136
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4650
Alignment:
Q  31 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||| | || || ||||| | |||||| |||  |||||||||||||||    
T  4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatct 4643  T
Q  130 caaatat 136  Q
     ||||||    
T  4644 taaatat 4650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 187
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225585
Alignment:
Q  68 caacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaat 165  Q
    |||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||||| |||||||||    
T  225465 caacatagtcagtatgcaaaacagcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaat 225563  T
Q  166 tatataccattaacaacaacat 187  Q
    |||||  |||||  ||||||||    
T  225564 tatatcacattataaacaacat 225585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 72
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12024
Alignment:
Q  29 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 12024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 29558 - 29607
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  29558 catcatcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaa 29607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 749 - 675
Alignment:
Q  141 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaa 215  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||  | |||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  749 ataattcacataatgcatatacaaatatatcacattactatcaacatcagatcacattatatcaggcttactgaa 675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2207 - 2157
Alignment:
Q  227 aagacaaacaacttagttccttacctctaagatcaactcacatcaactcgt 277  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2207 aagataaacaacttagtttctaacctctaagattaactcacatccactcgt 2157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 2303 - 2261
Alignment:
Q  122 caacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaa 164  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2303 caacatctcgaatatcaacataatccatttaatgtatatacaa 2261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 64
Target Start/End: Original strand, 289 - 339
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa 64  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  289 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaaa 339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 159 - 208
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  159 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 21920 - 21871
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21920 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaa 21871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 29812 - 29763
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  29812 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaa 29763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 69794 - 69843
Alignment:
Q  14 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 63  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  69794 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 69843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 136
Target Start/End: Original strand, 27912 - 27956
Alignment:
Q  92 catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 136  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27912 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 27956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University