View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15788_high_15 (Length: 358)

Name: NF15788_high_15
Description: NF15788
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15788_high_15
NF15788_high_15
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (3-348)||(9549303-9549648)
chr5 (1-348)||(24680492-24680839)
chr5 (1-348)||(24723019-24723366)
chr5 (1-348)||(11548409-11548756)
chr5 (1-348)||(22999874-23000221)
chr5 (1-348)||(31827179-31827526)
chr5 (1-346)||(33776542-33776887)
chr5 (1-348)||(30933691-30934038)
chr5 (1-348)||(23718745-23719092)
chr5 (1-348)||(9316506-9316853)
chr5 (1-348)||(12131210-12131557)
chr5 (1-348)||(15759617-15759964)
chr5 (1-348)||(26479447-26479794)
chr5 (1-348)||(30151073-30151420)
chr5 (1-348)||(30167524-30167871)
chr5 (1-348)||(8666235-8666582)
chr5 (1-348)||(2510106-2510453)
chr5 (1-348)||(5636965-5637312)
chr5 (1-348)||(18376172-18376519)
chr5 (1-348)||(29967826-29968173)
chr5 (1-348)||(30028470-30028817)
chr5 (1-348)||(6873357-6873704)
chr5 (1-348)||(24688917-24689264)
chr5 (1-348)||(33515411-33515758)
chr5 (1-348)||(24951165-24951512)
chr5 (1-348)||(23891261-23891608)
chr5 (10-348)||(25198096-25198434)
chr5 (111-328)||(18501528-18501745)
chr5 (33-328)||(15659540-15659835)
chr5 (33-328)||(37672272-37672567)
chr5 (33-328)||(37754055-37754350)
chr5 (33-328)||(37771779-37772074)
chr5 (111-328)||(3788691-3788908)
chr5 (111-328)||(40474332-40474549)
chr5 (33-328)||(28960578-28960874)
chr5 (33-348)||(13325604-13325919)
chr5 (33-328)||(41673796-41674091)
chr5 (33-328)||(31430515-31430810)
chr5 (144-328)||(32600249-32600433)
chr5 (33-328)||(28648313-28648608)
chr5 (33-328)||(33291615-33291910)
chr5 (33-328)||(43077336-43077631)
chr5 (51-328)||(34615626-34615903)
chr5 (144-328)||(37359435-37359619)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (3-348)||(18709634-18709979)
chr8 (1-348)||(27609727-27610074)
chr8 (1-348)||(2138081-2138428)
chr8 (1-348)||(16276600-16276947)
chr8 (7-348)||(14556679-14557020)
chr8 (1-348)||(19209182-19209529)
chr8 (1-348)||(28362777-28363124)
chr8 (1-348)||(19687144-19687491)
chr8 (1-348)||(31490572-31490919)
chr8 (1-348)||(33257769-33258116)
chr8 (1-348)||(31353569-31353917)
chr8 (7-328)||(16282504-16282825)
chr8 (33-328)||(3330361-3330656)
chr8 (33-328)||(19279329-19279624)
chr8 (33-328)||(19285543-19285838)
chr8 (33-328)||(19518985-19519280)
chr8 (33-328)||(12093575-12093870)
chr8 (8-316)||(22081726-22082034)
chr8 (144-328)||(29828502-29828686)
chr8 (111-328)||(19673594-19673811)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (1-348)||(24593174-24593521)
chr4 (1-348)||(30752803-30753150)
chr4 (1-348)||(33678207-33678554)
chr4 (1-348)||(17013061-17013408)
chr4 (1-348)||(14664079-14664426)
chr4 (1-348)||(14097602-14097949)
chr4 (1-348)||(40106501-40106848)
chr4 (1-348)||(31127381-31127728)
chr4 (1-348)||(21968762-21969109)
chr4 (1-348)||(27164180-27164527)
chr4 (1-348)||(1899321-1899668)
chr4 (33-328)||(39849716-39850011)
chr4 (34-327)||(14236409-14236702)
chr4 (33-328)||(54832483-54832778)
chr4 (8-301)||(15392244-15392537)
chr4 (33-328)||(34189840-34190135)
chr4 (33-328)||(36345395-36345690)
chr4 (144-328)||(6569057-6569241)
chr4 (144-328)||(19372465-19372649)
chr4 (144-328)||(24111869-24112053)
chr4 (9-328)||(15226942-15227261)
chr4 (144-328)||(14764187-14764371)
chr4 (33-328)||(5004963-5005258)
chr4 (31-328)||(15285808-15286105)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (1-348)||(11440607-11440954)
chr7 (1-346)||(5127039-5127384)
chr7 (1-348)||(11425525-11425872)
chr7 (1-348)||(3444341-3444688)
chr7 (1-348)||(26670663-26671010)
chr7 (7-348)||(2153626-2153967)
chr7 (1-348)||(9617698-9618045)
chr7 (1-348)||(4145872-4146219)
chr7 (1-348)||(10917614-10917961)
chr7 (1-348)||(16737209-16737556)
chr7 (1-348)||(16752263-16752610)
chr7 (1-348)||(17522579-17522926)
chr7 (1-348)||(17530289-17530636)
chr7 (1-348)||(26275843-26276190)
chr7 (1-348)||(26320618-26320965)
chr7 (1-348)||(24593290-24593637)
chr7 (1-348)||(45386390-45386737)
chr7 (1-348)||(16504128-16504475)
chr7 (1-348)||(16519164-16519511)
chr7 (33-328)||(26538642-26538937)
chr7 (6-348)||(16040378-16040720)
chr7 (33-328)||(26486513-26486808)
chr7 (6-326)||(16450766-16451086)
chr7 (144-328)||(22142850-22143034)
chr7 (33-328)||(31565168-31565463)
chr7 (111-328)||(31124068-31124285)
chr7 (144-328)||(5148109-5148293)
chr7 (144-328)||(26434447-26434631)
chr7 (33-320)||(5120539-5120826)
[»] chr3 (54 HSPs)
chr3 (1-348)||(51781018-51781365)
chr3 (1-348)||(51796105-51796452)
chr3 (1-346)||(18329681-18330026)
chr3 (1-346)||(4720638-4720983)
chr3 (1-348)||(29149659-29150006)
chr3 (1-346)||(6191323-6191668)
chr3 (1-348)||(36997993-36998340)
chr3 (1-348)||(4797557-4797904)
chr3 (7-348)||(14447821-14448162)
chr3 (7-348)||(8294988-8295329)
chr3 (1-348)||(35879773-35880120)
chr3 (1-348)||(15741983-15742330)
chr3 (1-348)||(31965377-31965724)
chr3 (1-348)||(5610226-5610573)
chr3 (1-348)||(28338310-28338657)
chr3 (1-348)||(8302165-8302512)
chr3 (1-348)||(24327166-24327513)
chr3 (1-348)||(50134975-50135322)
chr3 (1-346)||(18224198-18224543)
chr3 (1-348)||(7995569-7995916)
chr3 (1-348)||(10642077-10642424)
chr3 (1-348)||(5012719-5013066)
chr3 (1-348)||(17985860-17986207)
chr3 (1-348)||(18050269-18050616)
chr3 (1-348)||(4415923-4416270)
chr3 (1-348)||(15893610-15893957)
chr3 (33-328)||(21673732-21674027)
chr3 (111-328)||(8210858-8211075)
chr3 (111-328)||(20577786-20578003)
chr3 (111-328)||(48465032-48465249)
chr3 (33-328)||(5466024-5466319)
chr3 (33-328)||(22871798-22872093)
chr3 (33-328)||(22886857-22887152)
chr3 (6-328)||(15334891-15335213)
chr3 (33-348)||(4347588-4347903)
chr3 (33-328)||(6543398-6543693)
chr3 (33-328)||(29665909-29666204)
chr3 (33-328)||(4892252-4892547)
chr3 (33-328)||(7072251-7072546)
chr3 (33-328)||(10395175-10395470)
chr3 (33-348)||(28020317-28020632)
chr3 (33-328)||(47022492-47022787)
chr3 (111-328)||(5597290-5597507)
chr3 (111-328)||(11111285-11111502)
chr3 (144-328)||(18241877-18242061)
chr3 (144-328)||(18277976-18278160)
chr3 (144-328)||(18293277-18293461)
chr3 (33-328)||(28116881-28117176)
chr3 (33-328)||(32438196-32438491)
chr3 (6-328)||(18529404-18529731)
chr3 (144-328)||(18308578-18308762)
chr3 (8-298)||(16627456-16627746)
chr3 (111-320)||(22388507-22388716)
chr3 (6-72)||(15727995-15728061)
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (1-348)||(12717457-12717804)
chr2 (5-348)||(12654588-12654931)
chr2 (1-348)||(23129418-23129765)
chr2 (1-348)||(28881256-28881603)
chr2 (5-348)||(20836964-20837307)
chr2 (1-348)||(11636041-11636388)
chr2 (1-348)||(11642230-11642577)
chr2 (1-348)||(34860722-34861069)
chr2 (1-348)||(37686761-37687108)
chr2 (1-348)||(37702026-37702373)
chr2 (1-348)||(19417351-19417698)
chr2 (1-348)||(37924535-37924882)
chr2 (1-348)||(21678034-21678381)
chr2 (1-348)||(22926880-22927227)
chr2 (1-348)||(31875323-31875670)
chr2 (1-348)||(16830190-16830537)
chr2 (1-348)||(16890944-16891291)
chr2 (1-348)||(32048840-32049187)
chr2 (1-348)||(27435295-27435642)
chr2 (6-348)||(21704013-21704355)
chr2 (33-328)||(12585875-12586170)
chr2 (111-328)||(9350866-9351083)
chr2 (111-328)||(39052700-39052917)
chr2 (33-328)||(27776281-27776576)
chr2 (111-328)||(27816126-27816343)
chr2 (31-328)||(34278521-34278818)
chr2 (111-328)||(40232651-40232868)
chr2 (33-328)||(39889136-39889431)
chr2 (111-328)||(261637-261853)
chr2 (33-329)||(27802766-27803062)
chr2 (144-328)||(13937416-13937600)
chr2 (8-326)||(27392043-27392361)
chr2 (111-328)||(37374313-37374530)
chr2 (31-328)||(19457290-19457587)
chr2 (232-328)||(34285627-34285723)
chr2 (232-328)||(34290687-34290783)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (1-346)||(26917424-26917768)
chr6 (1-346)||(16748897-16749242)
chr6 (7-348)||(13299757-13300098)
chr6 (1-348)||(15425123-15425470)
chr6 (7-348)||(24305424-24305765)
chr6 (1-348)||(26999115-26999463)
chr6 (1-348)||(26988047-26988391)
chr6 (1-348)||(29572056-29572403)
chr6 (1-348)||(16944833-16945180)
chr6 (1-348)||(22935684-22936031)
chr6 (1-348)||(23858129-23858476)
chr6 (1-348)||(24862760-24863107)
chr6 (1-348)||(30558822-30559169)
chr6 (166-348)||(27630515-27630697)
chr6 (110-340)||(27273398-27273628)
chr6 (33-328)||(3695177-3695472)
chr6 (111-328)||(34464187-34464404)
chr6 (33-348)||(4524364-4524679)
chr6 (33-348)||(4756836-4757151)
chr6 (33-348)||(4772072-4772387)
chr6 (33-328)||(26778453-26778748)
chr6 (33-328)||(27360836-27361131)
chr6 (33-328)||(27451179-27451474)
chr6 (111-328)||(17024415-17024632)
chr6 (111-328)||(29500559-29500776)
chr6 (33-328)||(27043464-27043760)
chr6 (33-328)||(4546610-4546905)
chr6 (33-328)||(16673202-16673497)
chr6 (33-348)||(27006787-27007102)
chr6 (33-328)||(28206517-28206812)
chr6 (33-328)||(29548553-29548848)
chr6 (144-328)||(27484303-27484487)
chr6 (33-328)||(4724969-4725264)
chr6 (144-328)||(26117245-26117429)
chr6 (31-348)||(20159774-20160097)
chr6 (31-348)||(22172734-22173057)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-348)||(993-1340)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-348)||(29499-29846)
scaffold0124 (6-348)||(19462-19804)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-348)||(26338-26685)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (1-346)||(47850-48195)
scaffold0089 (1-348)||(40932-41279)
scaffold0089 (1-348)||(28809-29156)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (1-348)||(51637263-51637610)
chr1 (1-348)||(41794171-41794518)
chr1 (1-348)||(10961715-10962062)
chr1 (1-348)||(28584026-28584373)
chr1 (6-348)||(16208887-16209229)
chr1 (8-298)||(20460160-20460450)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-348)||(15793-16140)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (1-348)||(8102-8449)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (44-347)||(49036-49348)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (120-340)||(40826-41046)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (8-326)||(20620-20938)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (33-328)||(7310-7605)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (33-328)||(7015-7310)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (8-316)||(121076-121384)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (306-348)||(5339-5381)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (44-85)||(104-145)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 3 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9549648 - 9549303
Alignment:
Q  3 cagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9549648 cagcacggaagcatccccgtaaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcgg 9549549  T
Q  103 actctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcc 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9549548 actctttcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcc 9549449  T
Q  203 tcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9549448 tcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttgatggaagacgcc 9549349  T
Q  303 gctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9549348 gcagagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 9549303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 24680492 - 24680839
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  24680492 cacagcacggaagtatccccgtaaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaggccaatcgagggaatgc 24680591  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  24680592 ggactttttcaaaactcaagatctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaattccggatttcgaccggtacaacgggctaacttgc 24680691  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24680692 cctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttgatggaggatg 24680791  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24680792 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 24680839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 24723019 - 24723366
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  24723019 cacagcacggaagtatccccgtaaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaggccaatcgagggaatgc 24723118  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  24723119 ggactttttcaaaactcaagatctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaattccggatttcgaccggtacaacgggctaacttgc 24723218  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24723219 cctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttgatggaggatg 24723318  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24723319 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 24723366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 11548409 - 11548756
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  11548409 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgaggaaatgc 11548508  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11548509 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaaattcaaaatcccagatttcgaccggtacaacgggctaacttgt 11548608  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11548609 ccccaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 11548708  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11548709 ccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgatatccatacctttg 11548756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23000221 - 22999874
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23000221 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccatcatgagatcaaagccaatcgagggaatgc 23000122  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23000121 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcgaaagtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacttgt 23000022  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23000021 ccccataaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcacttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 22999922  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22999921 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 22999874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31827526 - 31827179
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31827526 cacagcatgaaagtatccccgtaaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaggccaatcgggggaatgc 31827427  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  31827426 ggactctttcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaattccggatttcgaccggtacaacggactaacttgc 31827327  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  31827326 cctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccattgttttcaggatagtttgatggaggatg 31827227  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31827226 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 31827179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 33776542 - 33776887
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  33776542 cacaccacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgaggaaatgc 33776641  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33776642 agactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaaattcaaaatcccagatttcgaccggtacaacgggctaacttgt 33776741  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33776742 ccccagaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatcctctgctttcaggatagtttgatggaagatg 33776841  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctt 346  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33776842 ccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgatatccatacctt 33776887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 30933691 - 30934038
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  30933691 cacagcacggaaacatccccgtgaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaattaaagccaatcgagggaatgc 30933790  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  30933791 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatctcggatttcgaccgatacaacgggctgacttgt 30933890  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  30933891 ccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaagatagtttgatggaagatg 30933990  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30933991 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 30934038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23719092 - 23718745
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  23719092 cacagcacggaagcatccccg-aaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgaggaaatgc 23718994  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  23718993 ggactctttcaaaactcaagatctctgtttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccggtacaacgggctgacttgt 23718894  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23718893 ccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaagatagtttgatggaagatg 23718794  T
Q  301 ccg-ctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23718793 ctgacagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 23718745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 9316506 - 9316853
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  9316506 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 9316605  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9316606 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 9316705  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  9316706 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 9316805  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9316806 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 9316853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 12131210 - 12131557
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  12131210 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 12131309  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12131310 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 12131409  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  12131410 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 12131509  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12131510 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 12131557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15759964 - 15759617
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  15759964 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 15759865  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15759864 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 15759765  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  15759764 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 15759665  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15759664 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 15759617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 26479447 - 26479794
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  26479447 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 26479546  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26479547 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 26479646  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  26479647 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 26479746  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26479747 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 26479794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 30151073 - 30151420
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  30151073 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 30151172  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  30151173 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 30151272  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  30151273 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 30151372  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30151373 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 30151420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 30167524 - 30167871
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  30167524 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 30167623  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  30167624 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 30167723  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  30167724 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 30167823  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30167824 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 30167871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8666582 - 8666235
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| || ||||||||    
T  8666582 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaaccgagggaatgc 8666483  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  8666482 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 8666383  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  8666382 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaagatg 8666283  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8666282 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 8666235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 2510106 - 2510453
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| || ||||||||    
T  2510106 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaaccgagggaatgc 2510205  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  2510206 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 2510305  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  2510306 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggtaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaagatg 2510405  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2510406 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 2510453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 5636965 - 5637312
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |  ||||||| |||| |||    
T  5636965 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccagaccaatcgagggagtgc 5637064  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5637065 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacctgt 5637164  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  5637165 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 5637264  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5637265 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 5637312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18376519 - 18376172
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  18376519 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 18376420  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  18376419 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgc 18376320  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  18376319 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 18376220  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18376219 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 18376172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29968173 - 29967826
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||| |||    
T  29968173 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggagtgc 29968074  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
      ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29968073 aaactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 29967974  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  29967973 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 29967874  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29967873 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 29967826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 30028470 - 30028817
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||| |||    
T  30028470 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggagtgc 30028569  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
      ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  30028570 aaactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 30028669  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  30028670 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 30028769  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30028770 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 30028817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 6873357 - 6873704
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| || ||||||||    
T  6873357 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaaccgagggaatgc 6873456  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6873457 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 6873556  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||    
T  6873557 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagcctgatggaggatg 6873656  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6873657 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 6873704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24689264 - 24688917
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  24689264 cacagcacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagctaatcgagggaatgc 24689165  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  24689164 ggactctttcaaaactcaggatctctgcttggtgccaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatgggctgacttgt 24689065  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  24689064 ccccagaaccacatcatcaggtatgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcacttatgattcactgcttccaagatagcttgatggaagatg 24688965  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24688964 ctgcagagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 24688917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 33515411 - 33515758
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| |||| |||    
T  33515411 cacagcgcagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcgagggagtgc 33515510  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  33515511 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 33515610  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  33515611 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 33515710  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33515711 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccacacctttg 33515758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 24951165 - 24951512
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  24951165 cacaccacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagctaatcgagggaatgc 24951264  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  24951265 ggactctttcaagactcaggatctctgcttggtgcctaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatgggctgacttgt 24951364  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  24951365 ccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaactacaaagacaatgattcactcatgattcactgcttccaagatagcttgatggaagatg 24951464  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24951465 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 24951512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 23891261 - 23891608
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||     
T  23891261 cacatcacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagctaaccgagggaatgg 23891360  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    ||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  23891361 ggactcttttaggactcatgatctctgcttggtaccaaaggtggatgtccccaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatgggctgacttgt 23891460  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||| || ||||| || ||||||||||    
T  23891461 ccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaactacaaagacaatgattcactcattattcactgcttccaagatagcttaatggaagatg 23891560  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || || ||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||    
T  23891561 ctgcagaatggtatactagcttgagcaaagatgacgttcatacctttg 23891608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Original strand, 25198096 - 25198434
Alignment:
Q  10 gaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactcttt 109  Q
    ||||||||||| | | |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || || |||||    ||||||||    
T  25198096 gaagcatccccttgatcaaaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatcaaagctaaccgagggaacagagactcttt 25198195  T
Q  110 caaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaac 209  Q
     || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||| || || || ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || |||    
T  25198196 taagactcatgatctctgcttggtaccaaaggtggacgtccccaagaagttcaaggtcccggagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaac 25198295  T
Q  210 cacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagt 309  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || || |    
T  25198296 cacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactacaaagacaatgattcactcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaagatgctgcagaat 25198395  T
Q  310 ggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||    
T  25198396 ggtatactagcttgagcaaagatgacgttcatacctttg 25198434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 111 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18501745 - 18501528
Alignment:
Q  111 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 210  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  18501745 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 18501646  T
Q  211 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 310  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| |||||||||| || || |||||    
T  18501645 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtg 18501546  T
Q  311 gtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||||| |||||||    
T  18501545 gtatactagtctgagcaa 18501528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15659835 - 15659540
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  15659835 atggaagagagaatggaagagcttgccaaagaactccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 15659736  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  15659735 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 15659636  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  15659635 gatgggcaactacaaagacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 15659540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37672567 - 37672272
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  37672567 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttgg 37672468  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  37672467 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 37672368  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  37672367 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 37672272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 37754055 - 37754350
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | |||||||| ||||| |||||||    
T  37754055 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaactcaggatctctgcttgg 37754154  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    |||| || || |||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  37754155 tgtcgaaggtagatgttccaaagaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 37754254  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  37754255 gatgggcaactacaaggacaatgatccccttatgatccatcacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 37754350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37772074 - 37771779
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  37772074 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 37771975  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  37771974 tatcgaaggtagatgttcctaaaaagttcaaaatcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 37771875  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  37771874 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 37771779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 111 - 328
Target Start/End: Original strand, 3788691 - 3788908
Alignment:
Q  111 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 210  Q
    ||||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  3788691 aaaacccaggatctctgcttggtatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 3788790  T
Q  211 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 310  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  3788791 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtg 3788890  T
Q  311 gtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||||| |||||||    
T  3788891 gtatactagtctgagcaa 3788908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 111 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 40474549 - 40474332
Alignment:
Q  111 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 210  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  40474549 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 40474450  T
Q  211 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 310  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || | ||| || || ||| ||||||| ||||| || |||||    
T  40474449 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgattcattacttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtg 40474350  T
Q  311 gtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||||| |||||||    
T  40474349 gtatactagtctgagcaa 40474332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28960874 - 28960578
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||| |||| ||||  |||||  | ||||| || |||||||||||||    
T  28960874 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaataggggaaatggagactccattaaaacccaggatctttgcttgg 28960775  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaa-gttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaa 231  Q
    | || || || |||||||| ||||| ||||||| | ||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| |    
T  28960774 tatcgaaggtagatgttccaaaaaaagttcaaagttccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccgga 28960675  T
Q  232 agatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  28960674 agatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgtagagtggtatactagtctgagcaa 28960578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13325919 - 13325604
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  13325919 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttgg 13325820  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  13325819 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 13325720  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaagaat 332  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||    
T  13325719 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 13325620  T
Q  333 gacatccatacctttg 348  Q
    ||  ||||||||||||    
T  13325619 gatgtccatacctttg 13325604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 41673796 - 41674091
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  41673796 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 41673895  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  41673896 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 41673995  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  41673996 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 41674091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 31430515 - 31430810
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  31430515 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttgg 31430614  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   || || ||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  31430615 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaaatataatgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 31430714  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  31430715 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaa 31430810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 32600433 - 32600249
Alignment:
Q  144 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 243  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  32600433 gatgctccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaact 32600334  T
Q  244 acaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  32600333 acaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 32600249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 28648313 - 28648608
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  28648313 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 28648412  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  28648413 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 28648512  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  28648513 gatgggtaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 28648608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 33291615 - 33291910
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    |||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  33291615 atggaagagaggatggaagagcttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 33291714  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  33291715 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagtttaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 33291814  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  33291815 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 33291910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 43077336 - 43077631
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  43077336 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 43077435  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  43077436 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaggtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 43077535  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  43077536 gatgggcaactacaaggacaatgattccctgatgatccattacttccaagacagtatgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaa 43077631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 51 - 328
Target Start/End: Original strand, 34615626 - 34615903
Alignment:
Q  51 gaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttc 150  Q
    |||||||||||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || | ||||||  | ||||| || || || ||||| || || || || |||||||    
T  34615626 gaacttgctaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggggactccattaaaacccaggacctctgcttagtatcgaaggtagatgttc 34615725  T
Q  151 ctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaaga 250  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  34615726 caaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaagtatgtccggaagatgggcaactacaagga 34615825  T
Q  251 caatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  34615826 caatgattcctttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 34615903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37359619 - 37359435
Alignment:
Q  144 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 243  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| || |||||||| |    
T  37359619 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaaaatgggcaact 37359520  T
Q  244 acaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  37359519 acaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 37359435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 3 - 348
Target Start/End: Original strand, 18709634 - 18709979
Alignment:
Q  3 cagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcgg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18709634 cagcacggaagcatccccgtaaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcgg 18709733  T
Q  103 actctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcc 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18709734 actctttcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtgcatgttcctaaaaatttcaaaatcccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcc 18709833  T
Q  203 tcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18709834 tcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttgatggaggatgcc 18709933  T
Q  303 gctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18709934 gcagagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 18709979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27610074 - 27609727
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  27610074 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgaggaaatgc 27609975  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  27609974 agactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaaaaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacgggctgacttgt 27609875  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27609874 ccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaagatagtttgatggaagatg 27609775  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27609774 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 27609727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2138428 - 2138081
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2138428 cacagcacggaagcatccccgtgatcaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgagggaatgc 2138329  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  2138328 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaacgggctgacttgt 2138229  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2138228 ccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttgatggaagatg 2138129  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
      || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2138128 ttgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 2138081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 16276600 - 16276947
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  16276600 cacagcacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccagtcgagggaatgc 16276699  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  16276700 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaacgggctgacttgt 16276799  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16276800 ccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaagatagtttgatggaagatg 16276899  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16276900 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 16276947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 7 - 348
Target Start/End: Original strand, 14556679 - 14557020
Alignment:
Q  7 acggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14556679 acggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgagggaatgcggactc 14556778  T
Q  107 tttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaa 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||     
T  14556779 tttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatataacgggctgacttgtccccag 14556878  T
Q  207 aaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctg 306  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  14556879 aaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaagatagtttgatggaagatgctgcag 14556978  T
Q  307 agtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14556979 agtggtatactagtttgagcaaaaatgacattcatacctttg 14557020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19209529 - 19209182
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  19209529 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 19209430  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19209429 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 19209330  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  19209329 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 19209230  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19209229 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 19209182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28363124 - 28362777
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  28363124 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 28363025  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  28363024 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 28362925  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  28362924 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 28362825  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28362824 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 28362777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 19687144 - 19687491
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  19687144 cacagcacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagctaatcgagggaatgc 19687243  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  19687244 ggactctttcaaaactcaagatctctccttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaacgggctgacttgt 19687343  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  19687344 ccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaagatagcttgatggaagatg 19687443  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19687444 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaacgacatccatacctttg 19687491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31490919 - 31490572
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  31490919 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 31490820  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  31490819 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgc 31490720  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  31490719 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 31490620  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31490619 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 31490572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 33257769 - 33258116
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| |||| |||    
T  33257769 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcgagggagtgc 33257868  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  33257869 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 33257968  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  33257969 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 33258068  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33258069 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 33258116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 31353569 - 31353917
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagcc-aatcgggggaatg 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||| ||| | |||||||    
T  31353569 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgttaaagaactccgtcacgagatccaggcccaatggagggaatg 31353668  T
Q  100 cggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctg 199  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  31353669 cagactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttg 31353768  T
Q  200 tcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagat 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  31353769 tcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattccctcatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggat 31353868  T
Q  300 gccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31353869 gccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 31353917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Original strand, 16282504 - 16282825
Alignment:
Q  7 acggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactc 106  Q
    |||||| ||||||||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| | ||||||    
T  16282504 acggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagctaaccgagggaacggggactc 16282603  T
Q  107 tttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaa 206  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||| ||     
T  16282604 ttttaagactcatgatctctgcttggtaccaaaggtggatgttcctaagaagttcaagatcccggattacgaccgatacaatgggctgacttgtccccag 16282703  T
Q  207 aaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctg 306  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || |    
T  16282704 aaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaactacaaagacaatgattcactcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaagatgctgcag 16282803  T
Q  307 agtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  16282804 aatggtatactagcttgagcaa 16282825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 3330656 - 3330361
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  3330656 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 3330557  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  3330556 tatcgaaggtagatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 3330457  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  3330456 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaa 3330361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19279624 - 19279329
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  19279624 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 19279525  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  19279524 tatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 19279425  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| |||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||    
T  19279424 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtggtatactagtctgagcaa 19279329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 19285543 - 19285838
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||| | |||||||| ||||| ||||| |    
T  19285543 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactctattaaaactcaggatctctgcttag 19285642  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  19285643 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 19285742  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||    
T  19285743 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgccgcaaaatggtatactagtctgagcaa 19285838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19519280 - 19518985
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  19519280 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 19519181  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  19519180 tatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 19519081  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| |||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||    
T  19519080 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtggtatactagtctgagcaa 19518985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 12093870 - 12093575
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  ||||||| || || || |||||||    
T  12093870 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccatcaaaacccaggacctctgcttgg 12093771  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  12093770 tatcgaaggtggatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 12093671  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  12093670 aatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaa 12093575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22082034 - 22081726
Alignment:
Q  8 cggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactct 107  Q
    ||||||||||| ||| |  ||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| |||||||| | |   ||  ||    
T  22082034 cggaagcatcctcgtgattaaaacaatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcgggaaatcaaagctaatcggggaagtagcgatact 22081935  T
Q  108 ttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaa 207  Q
     | || ||||| ||||| ||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |    
T  22081934 gttaagactcatgatctctgcttggtaccgaaggtggatgtccctaagaagttcaaggttccggatttcgaccgatacaatgggctaacttgtccacaga 22081835  T
Q  208 accacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctga 307  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||  || |||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||    
T  22081834 atcccatcatcaaatatgtccggaagatggctaactacttagacaatgattcactcatgatccactgctttcaggatagtctaatggaagatgctgcaga 22081735  T
Q  308 gtggtatac 316  Q
     ||||||||    
T  22081734 atggtatac 22081726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Original strand, 29828502 - 29828686
Alignment:
Q  144 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 243  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  29828502 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaact 29828601  T
Q  244 acaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| |||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||    
T  29828602 acaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtggtatactagtctgagcaa 29828686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 111 - 328
Target Start/End: Original strand, 19673594 - 19673811
Alignment:
Q  111 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 210  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  19673594 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaggtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 19673693  T
Q  211 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 310  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || || || ||| ||||||| ||||| || |||||    
T  19673694 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaacgattcccttatgatccattatttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtg 19673793  T
Q  311 gtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||||| |||||||    
T  19673794 gtatactagtctgagcaa 19673811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24593521 - 24593174
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24593521 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgagggaatgc 24593422  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24593421 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaagtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccggtacaacgggctaacttgt 24593322  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24593321 ccccaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttgatggaagatg 24593222  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24593221 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 24593174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 30752803 - 30753150
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  30752803 cacagcacggaagtatccccgtaaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaggccaatcgagggaatgc 30752902  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  30752903 ggactttttcaaaactcaagatctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaattccggatttcgaccggtacaacgggctaacttgc 30753002  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  30753003 cctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttgatggaggatg 30753102  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30753103 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 30753150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 33678554 - 33678207
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  33678554 cacagcacggaagtatccccgtaaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaggccaatcgagggaatgc 33678455  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  33678454 ggactttttcaaaactcaagatctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaattccggatttcgaccggtacaacgggctaacttgc 33678355  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  33678354 cctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttgatggaggatg 33678255  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33678254 ccgctgagtggtatactagtttaagcaagaatgacatccatacctttg 33678207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 17013061 - 17013408
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17013061 cacagcacggaagcatccccgtgaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgagggaatgc 17013160  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  17013161 ggactctttcaaaacccaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacgggctgacttgt 17013260  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17013261 ccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaagatagtttgatggaagatg 17013360  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17013361 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 17013408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 14664079 - 14664426
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  14664079 cacagcacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagccaatcgagggaatgc 14664178  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  14664179 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacgggctgacttgt 14664278  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  14664279 ccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaagatagcttgatggaagatg 14664378  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14664379 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 14664426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 14097602 - 14097949
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  14097602 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 14097701  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14097702 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 14097801  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  14097802 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 14097901  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14097902 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 14097949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 40106848 - 40106501
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  40106848 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 40106749  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  40106748 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctgacttgt 40106649  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  40106648 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 40106549  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40106548 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 40106501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31127728 - 31127381
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| |||| |||    
T  31127728 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcgagggagtgc 31127629  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  31127628 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 31127529  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  31127528 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 31127429  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31127428 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccacacctttg 31127381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 21968762 - 21969109
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| |||| |||    
T  21968762 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcgagggagtgc 21968861  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21968862 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 21968961  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  21968962 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaagatagtctgatggaggatg 21969061  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21969062 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 21969109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27164527 - 27164180
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||| |    
T  27164527 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatagaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatac 27164428  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  27164427 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgacaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgc 27164328  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |    
T  27164327 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggacg 27164228  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27164227 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 27164180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 1899321 - 1899668
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || || ||||| |     
T  1899321 cacatcacggaagcatccccgtgattaaaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaaccgagggaacgg 1899420  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    ||||||| | || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||    
T  1899421 ggactctgttaagactcatgatctctgcttggtaccaaaggtggacgtccctaagaagttcaagatcccagagtttgaccgatacaatgggctaacttgt 1899520  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  1899521 ccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaagacg 1899620  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || || ||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||    
T  1899621 ctgcagaatggtatactagcttgagcaaagatgacgttcatacctttg 1899668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 39849716 - 39850011
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||  ||||||||  |||| ||||| |  || ||||| |||||| |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  39849716 atggaagagagaatggcagaacttgccgaagagctccgacgggaaattaaggccaataggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 39849815  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  39849816 tatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 39849915  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  39849916 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattactttcaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaa 39850011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 14236702 - 14236409
Alignment:
Q  34 tggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttggt 133  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || || || || |  ||  || | || ||||| ||||| ||||||||    
T  14236702 tggaggagaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaaccgaggaaacggtgatcctgttaagactcatgatctctgcttggt 14236603  T
Q  134 gtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaag 233  Q
      |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  14236602 accaaaggtggacgtccctaaaaagttcaaagtcccggatttcgaccgatacaacgggctgacttgtcctcaaaaccacattatcaagtatgtccggaag 14236503  T
Q  234 atgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagca 327  Q
    ||||  || |||  |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || || || |||||||| || |||||||    
T  14236502 atggctaactactcagacaatgattcactcatgattcactgcttccaggatagcttaatggaagacgctgcagaatggtataccagcttgagca 14236409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 54832483 - 54832778
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||| | |||||||| ||||| ||||| |    
T  54832483 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactctattaaaactcaggatctctgcttag 54832582  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  54832583 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 54832682  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||    
T  54832683 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgccgcaaaatggtatactagtctgagcaa 54832778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15392537 - 15392244
Alignment:
Q  8 cggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactct 107  Q
    ||||||||||||| | |  ||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| |||||||| | |   ||  ||    
T  15392537 cggaagcatccccttgattaaaacaatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcgggaaatcaaagctaatcggggaagtagcgatact 15392438  T
Q  108 ttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaa 207  Q
     | || ||||| ||||| ||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||  | | |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |    
T  15392437 gttaagactcatgatctctgcttggtaccgaaggtggatgtccctaagaagttcaaggttctggatttcgaccgatacaatgggctaacttgtccacaga 15392338  T
Q  208 accacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgc 301  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15392337 atcacatcatcaaatatgtccggaagatggctaattacgcagacaatgattcactcatgatccactgctttcaggatagtctaatggaagatgc 15392244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 34190135 - 34189840
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    |||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  34190135 atggaagagaggatggaagagcttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 34190036  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  34190035 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 34189936  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  34189935 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 34189840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 36345690 - 36345395
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  36345690 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 36345591  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || |||||| |||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  36345590 tatcgaaagtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtccttaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 36345491  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  36345490 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 36345395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Original strand, 6569057 - 6569241
Alignment:
Q  144 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 243  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6569057 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaact 6569156  T
Q  244 acaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  6569157 acaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 6569241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Original strand, 19372465 - 19372649
Alignment:
Q  144 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 243  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19372465 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaact 19372564  T
Q  244 acaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  19372565 acaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 19372649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Original strand, 24111869 - 24112053
Alignment:
Q  144 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 243  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  24111869 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaact 24111968  T
Q  244 acaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  24111969 acaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 24112053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 328
Target Start/End: Original strand, 15226942 - 15227261
Alignment:
Q  9 ggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctt 108  Q
    |||||||||||||| |  | | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| || || ||||| | |||| ||     
T  15226942 ggaagcatccccgtgattagaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccatcgtgaaatcaaagctaaccgagggaacggggaccctg 15227041  T
Q  109 tcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaa 208  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||| || || || ||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  15227042 ttaagactcatgatctctgcttggtaccaaaggtggacgtccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaa 15227141  T
Q  209 ccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgag 308  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || |||||||| || || ||     
T  15227142 ccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcattgcttccaagatagcttaatggaagacgctgcagaa 15227241  T
Q  309 tggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  15227242 tggtatactagcttgagcaa 15227261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14764371 - 14764187
Alignment:
Q  144 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 243  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  14764371 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaact 14764272  T
Q  244 acaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |  || || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  14764271 acaaggacaatgattcccttatgatccattatttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 14764187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 5004963 - 5005258
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  5004963 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 5005062  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  5005063 tatcgaaggtagatgttccaaagaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 5005162  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  || || || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  5005163 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattatttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 5005258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15286105 - 15285808
Alignment:
Q  31 ccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgctt 130  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||  |||| | |   ||  || | || ||||| |||||||||||    
T  15286105 ccatggaagaaaggatagaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaacaggggaagtagtgatactattaagactcatgatctttgctt 15286006  T
Q  131 ggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccga 230  Q
    |||  |||| |||||  | || || ||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  15286005 ggtaccaaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccga 15285906  T
Q  231 aagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||    
T  15285905 aagatgggtaattactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaagatgctgcagaatggtacaccagcttgagcaa 15285808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 11440607 - 11440954
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  11440607 cacagcacggaagtatccccgtaaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaggccaatcgagggaatgc 11440706  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  11440707 ggactttttcaaaactcaagatctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaattccggatttcgaccggtacaacgggctaacttgc 11440806  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11440807 cctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttgatggaggatg 11440906  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11440907 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 11440954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 5127039 - 5127384
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5127039 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgagggaatgc 5127138  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5127139 ggactctttcaaaactcaagacctctgcttggtgtcaaaagtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacttgt 5127238  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5127239 ccccagaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 5127338  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctt 346  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5127339 ccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgatatccatacctt 5127384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 11425872 - 11425525
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  11425872 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgaggaaatgc 11425773  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11425772 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaatagtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacttgt 11425673  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11425672 ccccagaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattctcttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 11425573  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11425572 ccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 11425525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 3444341 - 3444688
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  3444341 cacagcacggaagtacccccgtaaccaagaccatggaagagatgatgggggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaggccaatcgggggaatgc 3444440  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  3444441 ggactctttcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaattccggatttcgaccggtacaacgggctaacttgc 3444540  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3444541 cctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttgatggaggatg 3444640  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3444641 ctgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 3444688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26671010 - 26670663
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  26671010 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 26670911  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  26670910 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaattccggatttcgaccggtacaacgggctaacttgc 26670811  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26670810 cctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttgatggaggatg 26670711  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26670710 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 26670663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 348
Target Start/End: Original strand, 2153626 - 2153967
Alignment:
Q  7 acggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||    
T  2153626 acggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagcccatcgagggaatgcgaactc 2153725  T
Q  107 tttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaa 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||     
T  2153726 tttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaacgggctgacttgtccccag 2153825  T
Q  207 aaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctg 306  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  2153826 aaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttgatggaagatgctgcag 2153925  T
Q  307 agtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2153926 agtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 2153967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 9617698 - 9618045
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  9617698 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 9617797  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9617798 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 9617897  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  9617898 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 9617997  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9617998 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 9618045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4146219 - 4145872
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  4146219 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 4146120  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  4146119 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaatttgt 4146020  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  4146019 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 4145920  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4145919 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 4145872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10917961 - 10917614
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  10917961 cacagcacggaagcatccccgtgatcaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactctgtcatgaaatcaaagccaatcgagggaatgc 10917862  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  10917861 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacgggctgacttgt 10917762  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10917761 ccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggaaattacaaacacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagcttgatggaagatg 10917662  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10917661 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 10917614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16737556 - 16737209
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| || ||||||||    
T  16737556 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaaccgagggaatgc 16737457  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16737456 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 16737357  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16737356 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaagatg 16737257  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16737256 ccgcagagtggtataccagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 16737209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16752610 - 16752263
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| || ||||||||    
T  16752610 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaaccgagggaatgc 16752511  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16752510 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 16752411  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16752410 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaagatg 16752311  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16752310 ccgcagagtggtataccagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 16752263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 17522579 - 17522926
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| || ||||||||    
T  17522579 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaaccgagggaatgc 17522678  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17522679 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 17522778  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17522779 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaagatg 17522878  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17522879 ccgcagagtggtataccagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 17522926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17530636 - 17530289
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| || ||||||||    
T  17530636 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaaccgagggaatgc 17530537  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17530536 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 17530437  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17530436 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaagatg 17530337  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17530336 ccgcagagtggtataccagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 17530289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26276190 - 26275843
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  26276190 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 26276091  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
      ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26276090 aaactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 26275991  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  26275990 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 26275891  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26275890 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 26275843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26320965 - 26320618
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  26320965 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 26320866  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
      ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26320865 aaactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 26320766  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  26320765 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 26320666  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26320665 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 26320618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24593637 - 24593290
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| |||| |||    
T  24593637 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcgagggagtgc 24593538  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24593537 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 24593438  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  24593437 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 24593338  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24593337 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 24593290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 45386390 - 45386737
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  45386390 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 45386489  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  45386490 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgc 45386589  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  45386590 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 45386689  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45386690 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 45386737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16504475 - 16504128
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  16504475 cacagcacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagctaatcgagggaatgc 16504376  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  16504375 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtaccaaaggtggatgtccctaagaagttcaagatctcggatttcgaccgatacaatgggctgacttgt 16504276  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  16504275 ccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcactcatgattcactgcttccaagatagcttgatggaagatg 16504176  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16504175 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 16504128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16519511 - 16519164
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  16519511 cacagcacggaaacatccccgtgatcaaaactatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagctaatcgagggaatgc 16519412  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  16519411 agactctttcaaaactcaagatctctgcttggtaccaaaggtggatgtccctaagaagttcaagatcccggatttcgaccgatacaatgggctgacttgt 16519312  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  16519311 ccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcactcatgattcactgcttccaagatagcttgatggaagatg 16519212  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16519211 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 16519164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26538937 - 26538642
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  26538937 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 26538838  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| || ||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  26538837 tatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataatgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 26538738  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  26538737 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 26538642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 348
Target Start/End: Original strand, 16040378 - 16040720
Alignment:
Q  6 cacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggact 105  Q
    ||||||||||| | ||| |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || || ||||| | |||||    
T  16040378 cacggaagcatgcacgtgattaaaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaaccgagggaacggggact 16040477  T
Q  106 ctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctca 205  Q
    || | || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||| || || || ||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  16040478 ctgttaagactcatgatctctgcttggtaccaaaggtggacgtccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtcccca 16040577  T
Q  206 aaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgct 305  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||  | ||||||||  | ||     
T  16040578 taaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcacttatgattcactgcttccaagatagcctaatggaagacactgca 16040677  T
Q  306 gagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    || ||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||    
T  16040678 gaatggtatactagcttgagcaaagatgacgttcatacctttg 16040720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26486808 - 26486513
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  26486808 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 26486709  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  26486708 tatcgaaagtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 26486609  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||    
T  26486608 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagcctgagcaa 26486513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16451086 - 16450766
Alignment:
Q  6 cacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggact 105  Q
    ||||||||||||||||| |  | | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || || ||||| |  |||     
T  16451086 cacggaagcatccccgtgattagaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaaccgagggaacggagacc 16450987  T
Q  106 ctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctca 205  Q
    || | || ||||| ||||| |||||| |  |||| ||||| || ||||| ||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  16450986 ctgttaagactcatgatctctgcttgataccaaaggtggacgtccctaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtcccca 16450887  T
Q  206 aaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgct 305  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||   ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||     
T  16450886 gaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactccgacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagattaatggaagacgctgca 16450787  T
Q  306 gagtggtatactagtttgagc 326  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  16450786 gaatggtatactagcttgagc 16450766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Original strand, 22142850 - 22143034
Alignment:
Q  144 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 243  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22142850 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaact 22142949  T
Q  244 acaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  22142950 acaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 22143034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31565463 - 31565168
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  31565463 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttgg 31565364  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || ||| |||| |||||||||||| ||||| | ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  31565363 tatcgaaggtagatattccaaaaaagttcaaagtcccgtagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 31565264  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  31565263 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 31565168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 111 - 328
Target Start/End: Original strand, 31124068 - 31124285
Alignment:
Q  111 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 210  Q
    ||||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || || |||||||| |    
T  31124068 aaaacccaggatctctgcttggtatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgccctcaaaatc 31124167  T
Q  211 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 310  Q
    | ||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  31124168 atattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtg 31124267  T
Q  311 gtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||||| |||||||    
T  31124268 gtatactagtctgagcaa 31124285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5148293 - 5148109
Alignment:
Q  144 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 243  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5148293 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaact 5148194  T
Q  244 acaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| |||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  5148193 acaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaaaatgctgcggagtggtatactagtctgagcaa 5148109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Original strand, 26434447 - 26434631
Alignment:
Q  144 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 243  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26434447 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaact 26434546  T
Q  244 acaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || | ||| || || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  26434547 acaaggacaatgattcccttatgattcattacttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 26434631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 320
Target Start/End: Original strand, 5120539 - 5120826
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    |||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  5120539 atggaagagaggatggaagagcttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttgg 5120638  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  |||| |||||||| ||    
T  5120639 tatcgaaggtagatgttcccaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaagtatgtccggaa 5120738  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagt 320  Q
    |||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5120739 gatgagcaactacaaggataatgattcccttatgattcattgcttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagt 5120826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 54)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 51781018 - 51781365
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  51781018 cacagcacggaagtatccccgtaaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaggccaatcgagggaatgc 51781117  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  51781118 ggactttttcaaaactcaagatctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaattccggatttcgaccggtacaacgggctaacttgc 51781217  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  51781218 cctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttgatggaggatg 51781317  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51781318 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 51781365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 51796105 - 51796452
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  51796105 cacagcacggaagtatccccgtaaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaggccaatcgagggaatgc 51796204  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  51796205 ggactttttcaaaactcaagatctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaattccggatttcgaccggtacaacgggctaacttgc 51796304  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  51796305 cctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttgatggaggatg 51796404  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51796405 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 51796452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 18329681 - 18330026
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18329681 cacagcacggaagcatccccgtgaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgagggaatgc 18329780  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18329781 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacttgt 18329880  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18329881 ccccaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 18329980  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctt 346  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18329981 ccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgatatccatacctt 18330026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 4720638 - 4720983
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4720638 cacagcacggaaacatccccgtgaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgagggaatgc 4720737  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4720738 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaagtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacttgt 4720837  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4720838 ccacaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 4720937  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctt 346  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4720938 ccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgatatccatacctt 4720983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29150006 - 29149659
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||    
T  29150006 cacagcacagaagtatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcagagccaatcgaggaaatgc 29149907  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29149906 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaagtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccggtacaacgggctaacttgt 29149807  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29149806 ccccaaaaccacatcattaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 29149707  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29149706 ccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 29149659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 6191323 - 6191668
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6191323 cacagcacggaaacatccccgtgaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgagggaatgc 6191422  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6191423 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaagtggatgtccctaagaagttcaaaatcctagatttcgaccggtacaacgggctaacttgt 6191522  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6191523 ccccaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 6191622  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctt 346  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  6191623 ccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgatatccatacctt 6191668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 36998340 - 36997993
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  36998340 cacagcatggaagtatccccgtaaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactgcgtcatgagatcaaggccaatcgagggaatgc 36998241  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  36998240 ggactttttcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaattccggatttcgaccggtacaacgggctaacttgc 36998141  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  36998140 cctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattataaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttgatggaggatg 36998041  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36998040 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 36997993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4797904 - 4797557
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4797904 cacagcacggaagcatccccgtgaccgaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgagggaatgc 4797805  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  4797804 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggacttcgaccgatacaacgggctaacttgt 4797705  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4797704 ccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 4797605  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4797604 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 4797557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 14448162 - 14447821
Alignment:
Q  7 acggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactc 106  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14448162 acggaagcatccccgtgaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgagggaatgcggactc 14448063  T
Q  107 tttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaa 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  14448062 tttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccatatttcgaccgatacaacgggctaacttgtccccag 14447963  T
Q  207 aaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctg 306  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  14447962 aaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgctgcag 14447863  T
Q  307 agtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14447862 agtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 14447821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 348
Target Start/End: Original strand, 8294988 - 8295329
Alignment:
Q  7 acggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactc 106  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8294988 acggaagcatccccgtgaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgagggaatgcggactc 8295087  T
Q  107 tttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaa 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||     
T  8295088 tttcaaaactcaagatctctgcttagtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccag 8295187  T
Q  207 aaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctg 306  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  8295188 aaccacatcatcaagtatgttcgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttgatggaagatgccgcag 8295287  T
Q  307 agtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8295288 agtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 8295329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 35879773 - 35880120
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  35879773 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctgcagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgaggaaatgc 35879872  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  35879873 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatttccctaagaaattcaaaatcccagatttcgaccggtacaacgggctgacttgt 35879972  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35879973 ccccagaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttgatggaagatg 35880072  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35880073 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 35880120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15742330 - 15741983
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  15742330 cacaacacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgaggaaatgc 15742231  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  15742230 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaagtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacgggctgacttgt 15742131  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15742130 ccccagaatcacatcatcaagtatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttgatggaagatg 15742031  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15742030 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 15741983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31965724 - 31965377
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  31965724 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 31965625  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  31965624 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 31965525  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  31965524 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 31965425  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31965424 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 31965377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5610573 - 5610226
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  5610573 cacagcacaggagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 5610474  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  5610473 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 5610374  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  5610373 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 5610274  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5610273 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 5610226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 28338310 - 28338657
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  28338310 cacagcacaggagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 28338409  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  28338410 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 28338509  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  28338510 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 28338609  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28338610 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 28338657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8302512 - 8302165
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  8302512 cacagcacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccatcatgaaatcaaagccaatcgagggaatgc 8302413  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  8302412 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatgggctgacttgt 8302313  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  8302312 ccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcacttatgatccactgcttccaagatagcttgatggaagatg 8302213  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8302212 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 8302165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 24327166 - 24327513
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||| |||    
T  24327166 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggagtgc 24327265  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24327266 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 24327365  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  24327366 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaagatagtctgatggaggatg 24327465  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24327466 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 24327513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 50135322 - 50134975
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||    
T  50135322 cacagcacaggagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagattcaggccaatcgagggaatgc 50135223  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||    
T  50135222 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtataacgggctgacttgt 50135123  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  50135122 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 50135023  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50135022 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 50134975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 18224198 - 18224543
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| |||| |||    
T  18224198 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcgagggagtgc 18224297  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18224298 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 18224397  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  18224398 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 18224497  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctt 346  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18224498 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctt 18224543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 7995569 - 7995916
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||| |    
T  7995569 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatac 7995668  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  7995669 cgactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgc 7995768  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  7995769 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 7995868  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7995869 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 7995916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 10642077 - 10642424
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||| |    
T  10642077 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatac 10642176  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  10642177 cgactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgc 10642276  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  10642277 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 10642376  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10642377 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 10642424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 5012719 - 5013066
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| |||| |||    
T  5012719 cacagcacaaaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcgagggagtgc 5012818  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  5012819 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccagtacaacgggctaacttgt 5012918  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  5012919 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 5013018  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5013019 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 5013066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17986207 - 17985860
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| |||| |||    
T  17986207 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcgagggagtgc 17986108  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17986107 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 17986008  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  17986007 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 17985908  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  17985907 ccgcagaatggtatactagtttgagtaagaatgacatccacacctttg 17985860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 18050269 - 18050616
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  18050269 cacagcacggaagcatccccgtgatcaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagccaatcgagggaatgc 18050368  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||    
T  18050369 agactctttcaaatctcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatgggctgccttgt 18050468  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  18050469 ccccagaaccacatcatcaagtatgtctggaagatgggcaattacaaagacaatgattcacttatgatccactgcttccaagatagcttgatggaagatg 18050568  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18050569 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 18050616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 4415923 - 4416270
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  4415923 cacagcacaggagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 4416022  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||    
T  4416023 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggacgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtataacgggctgacttgt 4416122  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  4416123 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 4416222  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4416223 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 4416270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15893957 - 15893610
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  15893957 cacagcacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagctaatcgagggaatgc 15893858  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  15893857 agactctttcaaaactcatgatctttgcttggtaccaaaggtggatgtccctaagaagttcaagatcccgaatttcgaccgatacaatgggctgacttgt 15893758  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||||| |||||||||||||    
T  15893757 ccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaactacaaagacaatgattcactcatgattcactacttccaagatagcttgatggaagatg 15893658  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15893657 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 15893610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 21673732 - 21674027
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  21673732 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 21673831  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  21673832 tatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 21673931  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  21673932 gatgggcaactacaaggataatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaa 21674027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 111 - 328
Target Start/End: Original strand, 8210858 - 8211075
Alignment:
Q  111 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 210  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  8210858 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 8210957  T
Q  211 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 310  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||| ||||| || |||||    
T  8210958 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaagacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtg 8211057  T
Q  311 gtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||||| |||||||    
T  8211058 gtatactagtctgagcaa 8211075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 111 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20578003 - 20577786
Alignment:
Q  111 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 210  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  20578003 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 20577904  T
Q  211 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 310  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| |||||||||| || || |||||    
T  20577903 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtg 20577804  T
Q  311 gtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||||| |||||||    
T  20577803 gtatactagtctgagcaa 20577786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 111 - 328
Target Start/End: Original strand, 48465032 - 48465249
Alignment:
Q  111 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 210  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  48465032 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 48465131  T
Q  211 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 310  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| |||||||||| || || |||||    
T  48465132 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtg 48465231  T
Q  311 gtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||||| |||||||    
T  48465232 gtatactagtctgagcaa 48465249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 5466024 - 5466319
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  5466024 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttgg 5466123  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  5466124 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 5466223  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  5466224 gatgggcaactacaaagacaatgatccccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaa 5466319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22872093 - 22871798
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || | ||||||  | ||||| || || || |||||||    
T  22872093 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggggactccattaaaacccaggacctctgcttgg 22871994  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  22871993 tatcgaaggtagatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 22871894  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  22871893 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaa 22871798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22887152 - 22886857
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || | ||||||  | ||||| || || || |||||||    
T  22887152 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggggactccattaaaacccaggacctctgcttgg 22887053  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  22887052 tatcgaaggtagatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 22886953  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  22886952 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaa 22886857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15335213 - 15334891
Alignment:
Q  6 cacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggact 105  Q
    ||||||||||||||||| |  | | | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || || ||||| | ||||     
T  15335213 cacggaagcatccccgtgattagaactatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaaccgagggaacggggacc 15335114  T
Q  106 ctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctca 205  Q
    || | || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||| || || || ||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  15335113 ctgttaagactcatgatctctgcttggtaccaaaggtggacgtccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtcccca 15335014  T
Q  206 aaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgct 305  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||     
T  15335013 gaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaagacgctgca 15334914  T
Q  306 gagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    || ||||||||||| ||||||||    
T  15334913 gaatggtatactagcttgagcaa 15334891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4347903 - 4347588
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  4347903 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 4347804  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  4347803 tatcgaaggtagatgttcccaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 4347704  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaagaat 332  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||    
T  4347703 gatgggcaactacaaggacaatgattcgtttatgatccattacttccaagatagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 4347604  T
Q  333 gacatccatacctttg 348  Q
    ||  ||||||||||||    
T  4347603 gatgtccatacctttg 4347588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 6543693 - 6543398
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  6543693 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttgg 6543594  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  6543593 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccgaaa 6543494  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  6543493 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 6543398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 29666204 - 29665909
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  29666204 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 29666105  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  29666104 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 29666005  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  29666004 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaa 29665909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 4892252 - 4892547
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    |||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  4892252 atggaagagaggatggaagagcttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 4892351  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  |||| |||||||| ||    
T  4892352 tatcgaaggtagatgttcccaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaagtatgtccggaa 4892451  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  4892452 gatgagcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattgcttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttaagcaa 4892547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 7072251 - 7072546
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  7072251 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 7072350  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| || ||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  7072351 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataatgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 7072450  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  7072451 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 7072546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 10395175 - 10395470
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  10395175 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccatgatctctgcttag 10395274  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  |||||||||| || ||    
T  10395275 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgttcggaa 10395374  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  10395375 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 10395470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 348
Target Start/End: Original strand, 28020317 - 28020632
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  28020317 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 28020416  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   || |||| ||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  28020417 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgagctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 28020516  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaagaat 332  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||    
T  28020517 gatgggcaactacaaggacaacgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 28020616  T
Q  333 gacatccatacctttg 348  Q
    ||  ||||||||||||    
T  28020617 gatgtccatacctttg 28020632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 47022492 - 47022787
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| || ||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  47022492 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggctaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttgg 47022591  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  47022592 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaggtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 47022691  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  47022692 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 47022787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 111 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5597507 - 5597290
Alignment:
Q  111 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 210  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||| || || ||||||||||| |    
T  5597507 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacggactgacttgtcctcaaaatc 5597408  T
Q  211 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 310  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  5597407 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtg 5597308  T
Q  311 gtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||| |||| |||||||    
T  5597307 gtatagtagtctgagcaa 5597290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 111 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11111502 - 11111285
Alignment:
Q  111 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 210  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  11111502 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 11111403  T
Q  211 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 310  Q
    | ||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| |||||||||| || || |||||    
T  11111402 atattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtg 11111303  T
Q  311 gtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||||| |||||||    
T  11111302 gtatactagtctgagcaa 11111285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Original strand, 18241877 - 18242061
Alignment:
Q  144 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 243  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  18241877 gatgttccaaaaaagttcaaggtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaact 18241976  T
Q  244 acaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  18241977 acaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 18242061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18278160 - 18277976
Alignment:
Q  144 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 243  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || |||||||| || || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18278160 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcagaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaact 18278061  T
Q  244 acaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  18278060 ataaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 18277976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18293461 - 18293277
Alignment:
Q  144 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 243  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || |||||||| || || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18293461 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcagaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaact 18293362  T
Q  244 acaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  18293361 ataaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 18293277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28117176 - 28116881
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| | ||  |||||| | ||||| || || || ||||| |    
T  28117176 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaagtggagactctattaaaacccaggacctctgcttag 28117077  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  28117076 tatcgaaggtagatgttccaaagaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 28116977  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  || || || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  28116976 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattatttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 28116881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 32438196 - 32438491
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  32438196 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 32438295  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  32438296 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 32438395  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || |  ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  32438396 aatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaaggcagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 32438491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 328
Target Start/End: Original strand, 18529404 - 18529731
Alignment:
Q  6 cacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcgg--- 102  Q
    |||||||| |||||||| |  | | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || || ||||| | ||       
T  18529404 cacggaagtatccccgtgattagaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaaccgagggaacgggggaa 18529503  T
Q  103 actct-ttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaag-tggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    || || || || ||||| ||||| ||||||||  |||||| ||||||| || || ||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||  || |||    
T  18529504 accctatttaagactcatgatctctgcttggtaccaaaaggtggatgtccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggcggacttgt 18529603  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  18529604 ccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaagacg 18529703  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    | || || ||||||||||| ||||||||    
T  18529704 ctgcggaatggtatactagcttgagcaa 18529731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18308762 - 18308578
Alignment:
Q  144 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 243  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||| |||| || |||||||| || || ||  ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18308762 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacaggctgacttgtcctcagaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaact 18308663  T
Q  244 acaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  18308662 ataaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 18308578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16627746 - 16627456
Alignment:
Q  8 cggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactct 107  Q
    ||||||||||||||| |  | | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||  | ||||| | |||| ||    
T  16627746 cggaagcatccccgtgattagaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaactgagggaacggggaccct 16627647  T
Q  108 ttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaa 207  Q
     | || ||||| ||||| ||||||||  |||| |||||  | || || ||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||  | |    
T  16627646 gttaagactcatgatctctgcttggtaccaaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccctaga 16627547  T
Q  208 accacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaaga 298  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  16627546 accacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaaga 16627456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22388716 - 22388507
Alignment:
Q  111 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 210  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  22388716 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaggtagatgttcccaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 22388617  T
Q  211 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 310  Q
    | ||  |||| |||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||| |||||| || ||||| || || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  22388616 atattgtcaagtatgtccggaagatgagcaactacaaggataatgattcccctatgattcattgcttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtg 22388517  T
Q  311 gtatactagt 320  Q
    ||||||||||    
T  22388516 gtatactagt 22388507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15728061 - 15727995
Alignment:
Q  6 cacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtc 72  Q
    ||||||||||||||||| |  | | |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15728061 cacggaagcatccccgtgattagaaccatggaagaaaggattgaggaacttgctaaagaactccgtc 15727995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12717804 - 12717457
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  12717804 cacagcacggaagtatccccgtaaccaagaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaggccaatcgagggaatgc 12717705  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  12717704 ggactttttcaaaactcaagatctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaattccggatttcgaccggtacaacgggctaacttgc 12717605  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12717604 cctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtttgatggaggatg 12717505  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12717504 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 12717457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 348
Target Start/End: Original strand, 12654588 - 12654931
Alignment:
Q  5 gcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12654588 gcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgagggaatgcggac 12654687  T
Q  105 tctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctc 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  12654688 tctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacgggctgacttgtcccc 12654787  T
Q  205 aaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgc 304  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  12654788 agaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaagatagtttgatggaagatgctgc 12654887  T
Q  305 tgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12654888 agagtggtatactagtttgagcaaaaatgacattcatacctttg 12654931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23129765 - 23129418
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23129765 cacagcacggaagcacccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctagagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgagggaatgc 23129666  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  23129665 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccaatacaacgggctgacctgt 23129566  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23129565 ccccagaaccacatcatcaagtacatccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttgatggaagatg 23129466  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23129465 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 23129418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 28881256 - 28881603
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  28881256 cacaacacggaaacatccccgtgaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgaggaaatgc 28881355  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  28881356 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacgggctgacttgt 28881455  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  28881456 ccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaagatagtttgatggaagatg 28881555  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28881556 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 28881603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 5 - 348
Target Start/End: Original strand, 20836964 - 20837307
Alignment:
Q  5 gcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  20836964 gcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactctgtcatgagatcaaagccaatcgagggaatgcagac 20837063  T
Q  105 tctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctc 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  20837064 tctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacgggctgacttgtcccc 20837163  T
Q  205 aaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgc 304  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  20837164 agaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaagatagtttgatggaagatgctgc 20837263  T
Q  305 tgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
     ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20837264 agagtggtatactagtttgagcaaaaaagacatccatacctttg 20837307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 11636388 - 11636041
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  11636388 cacagcacggaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 11636289  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11636288 agactctgtcaaaactcgagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 11636189  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  11636188 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 11636089  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11636088 ctgcagagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 11636041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 11642577 - 11642230
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  11642577 cacagcacggaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 11642478  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11642477 agactctgtcaaaactcgagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 11642378  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  11642377 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 11642278  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11642277 ctgcagagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 11642230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 34860722 - 34861069
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  34860722 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 34860821  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34860822 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 34860921  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  34860922 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 34861021  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34861022 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 34861069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37687108 - 37686761
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  37687108 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 37687009  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  37687008 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 37686909  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  37686908 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 37686809  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37686808 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 37686761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37702373 - 37702026
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  37702373 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 37702274  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  37702273 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 37702174  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  37702173 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 37702074  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37702073 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 37702026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19417698 - 19417351
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||| |||    
T  19417698 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggagtgc 19417599  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19417598 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 19417499  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  19417498 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 19417399  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19417398 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 19417351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 37924535 - 37924882
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| |||| |||    
T  37924535 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcgagggagtgc 37924634  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  37924635 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 37924734  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  37924735 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 37924834  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37924835 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 37924882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21678381 - 21678034
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||| || || |||||    
T  21678381 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaaccgaggaaatgc 21678282  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21678281 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 21678182  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21678181 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaagatg 21678082  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21678081 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 21678034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22927227 - 22926880
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  22927227 cacagcacaggagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 22927128  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||    
T  22927127 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtataacgggctgacttgt 22927028  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  22927027 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 22926928  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22926927 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 22926880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 31875323 - 31875670
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||| |    
T  31875323 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatac 31875422  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  31875423 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgc 31875522  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  31875523 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 31875622  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31875623 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 31875670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16830537 - 16830190
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| |||| |||    
T  16830537 cacagcgcagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcgagggagtgc 16830438  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16830437 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 16830338  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  16830337 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 16830238  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16830237 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccacacctttg 16830190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 16890944 - 16891291
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| |||| |||    
T  16890944 cacagcgcagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcgagggagtgc 16891043  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16891044 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 16891143  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  16891144 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 16891243  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16891244 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccacacctttg 16891291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 32048840 - 32049187
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| |||| |||    
T  32048840 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcgagggagtgc 32048939  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  32048940 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 32049039  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  32049040 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaagatagtctgatggaggatg 32049139  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32049140 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 32049187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27435642 - 27435295
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  27435642 cacagcatggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagctaatcgagggaatgc 27435543  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||    
T  27435542 agactctttcaaaactcaggatctctgcttggtaccaaaggtggatgtccctaagaagttcaagatcccggacttcgaccgatacaatgggctgacttgt 27435443  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  27435442 ccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcactcatgattcactgcttccaagatagcttgatggaagatg 27435343  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27435342 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacattcatacctttg 27435295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21704355 - 21704013
Alignment:
Q  6 cacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggact 105  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || || ||||| | |||||    
T  21704355 cacggaagcatccccgtgattaaaaccatggaagaaaggatggaagaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaaccgagggaacggggact 21704256  T
Q  106 ctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctca 205  Q
    || | || ||||| || || ||||||||  |||| ||||| || || || ||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  21704255 ctgttaagactcatgacctctgcttggtaccaaaggtggacgtccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtcccca 21704156  T
Q  206 aaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgct 305  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||     
T  21704155 taaccatatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaagacgctgca 21704056  T
Q  306 gagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    || ||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||    
T  21704055 gaatggtatactagcttgagcaaagatgacgttcatacctttg 21704013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 12585875 - 12586170
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  12585875 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 12585974  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| || ||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  12585975 tatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataatgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 12586074  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  12586075 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 12586170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 111 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 9351083 - 9350866
Alignment:
Q  111 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 210  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  9351083 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 9350984  T
Q  211 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 310  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||  ||||||||||||| || |||||    
T  9350983 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagcctgatggaagatgctgcggagtg 9350884  T
Q  311 gtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||||| |||||||    
T  9350883 gtatactagtctgagcaa 9350866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 111 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 39052917 - 39052700
Alignment:
Q  111 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 210  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  39052917 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 39052818  T
Q  211 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 310  Q
    | ||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  39052817 atattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtg 39052718  T
Q  311 gtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||||| |||||||    
T  39052717 gtatactagtctgagcaa 39052700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 27776281 - 27776576
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||  ||||||||  |||| |||||||  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  27776281 atggaagagagaatggcagaacttgccgaagagctccgtcgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 27776380  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  27776381 tatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccagagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 27776480  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| |||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||    
T  27776481 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtggtatactagtctgagcaa 27776576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 111 - 328
Target Start/End: Original strand, 27816126 - 27816343
Alignment:
Q  111 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 210  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  27816126 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccagagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 27816225  T
Q  211 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 310  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| |||||||||| || || |||||    
T  27816226 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtg 27816325  T
Q  311 gtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||||| |||||||    
T  27816326 gtatactagtctgagcaa 27816343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 328
Target Start/End: Original strand, 34278521 - 34278818
Alignment:
Q  31 ccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgctt 130  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| |||||    
T  34278521 ccatggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgctt 34278620  T
Q  131 ggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccga 230  Q
     || || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  |||||||||||||     
T  34278621 agtatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccgg 34278720  T
Q  231 aagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  34278721 aagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 34278818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 111 - 328
Target Start/End: Original strand, 40232651 - 40232868
Alignment:
Q  111 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 210  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  40232651 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 40232750  T
Q  211 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 310  Q
    | ||  |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| |||||||||| || || |||||    
T  40232751 atattgtcaaatatgtacggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtg 40232850  T
Q  311 gtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||||| |||||||    
T  40232851 gtatactagtctgagcaa 40232868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 39889136 - 39889431
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || | ||||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  39889136 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggggactccgttaaaacccaggatctctgcttgg 39889235  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  39889236 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 39889335  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  39889336 gatgggcaactacaaggataatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 39889431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 111 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 261853 - 261637
Alignment:
Q  111 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 210  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  261853 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 261754  T
Q  211 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 310  Q
    | ||  ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| |||||||||| || || |||||    
T  261753 atattgtcaaatatgtccggaa-atgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtg 261655  T
Q  311 gtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||||| |||||||    
T  261654 gtatactagtctgagcaa 261637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 329
Target Start/End: Original strand, 27802766 - 27803062
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  27802766 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 27802865  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  27802866 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 27802965  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaag 329  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  27802966 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaag 27803062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13937600 - 13937416
Alignment:
Q  144 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 243  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  13937600 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaact 13937501  T
Q  244 acaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  13937500 acaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaa 13937416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 326
Target Start/End: Original strand, 27392043 - 27392361
Alignment:
Q  8 cggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactct 107  Q
    ||||||||||||||| |  | | |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  || || ||||| |||||||| | |   ||  ||    
T  27392043 cggaagcatccccgtgattagaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaggaactccgtcgggaaatcaaagctaatcggggaagtagtgatact 27392142  T
Q  108 ttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaa 207  Q
     | || ||||| ||||| ||||||||  | || |||||| | ||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |    
T  27392143 gttaagactcatgatctctgcttggtaccgaaggtggatatccctaagaagttcaaggttccggatttcgaccgatacaatgggctaacttgtccacaga 27392242  T
Q  208 accacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctga 307  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||  || |||  |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||| |  ||    
T  27392243 atcacatcatcaaatatgtccggaagatggctaactactcagacaatgattcactcatgatccactactttcaagatagtctaatggaagatgctggaga 27392342  T
Q  308 gtggtatactagtttgagc 326  Q
     |||||||| || ||||||    
T  27392343 atggtataccagcttgagc 27392361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 111 - 328
Target Start/End: Original strand, 37374313 - 37374530
Alignment:
Q  111 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 210  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||| |||| || || |||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  37374313 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccagagtttgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 37374412  T
Q  211 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 310  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  37374413 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtg 37374512  T
Q  311 gtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||||| |||||||    
T  37374513 gtatactagtctgagcaa 37374530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19457587 - 19457290
Alignment:
Q  31 ccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgctt 130  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| | |   ||  || | || ||||| |||||||||||    
T  19457587 ccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaaccggggaagtagtgatactgttaagactcatgatctttgctt 19457488  T
Q  131 ggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccga 230  Q
    |||  |||| |||||  | || || ||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  19457487 ggtaccaaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagaattcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccga 19457388  T
Q  231 aagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||| || |||  |||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||    
T  19457387 aagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttgatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaa 19457290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 232 - 328
Target Start/End: Original strand, 34285627 - 34285723
Alignment:
Q  232 agatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  34285627 agatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 34285723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 232 - 328
Target Start/End: Original strand, 34290687 - 34290783
Alignment:
Q  232 agatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  34290687 agatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 34290783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 26917424 - 26917768
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  26917424 cacaacacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactc-gtcatgagatcaaagccaatcgaggaaatgc 26917522  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26917523 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacttgt 26917622  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26917623 ccccagaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 26917722  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctt 346  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26917723 ccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgatatccatacctt 26917768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 16748897 - 16749242
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  16748897 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgaggaaatgc 16748996  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16748997 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaaattcaaaatcccagatttcgaccggtacaacgggctaacttgt 16749096  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16749097 ccccaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttgatggaagatg 16749196  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctt 346  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16749197 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgatatccatacctt 16749242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 7 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13300098 - 13299757
Alignment:
Q  7 acggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactc 106  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13300098 acggaagcatccccgtgaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagccaatcgagggaatgcggactc 13299999  T
Q  107 tttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaa 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||     
T  13299998 tttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccatatttcgaccgatacaacgggctgacttgtccccag 13299899  T
Q  207 aaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctg 306  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  13299898 aaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaagatagtttgatggaagatgctgcag 13299799  T
Q  307 agtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13299798 agtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 13299757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15425470 - 15425123
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15425470 cacagcacggaaacatccccgtgaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaaatccgtcatgaaattaaagccaatcgagggaatgc 15425371  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  15425370 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacgggctgacttgt 15425271  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15425270 ccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagcttgatggaagatg 15425171  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15425170 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 15425123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24305765 - 24305424
Alignment:
Q  7 acggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactc 106  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24305765 acggaagcatccccgtgaccaaaaccatggaggagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaattaaagccaatcgagggaatgcggactc 24305666  T
Q  107 tttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaa 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||     
T  24305665 tttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaagtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacgggctgacttgtccccag 24305566  T
Q  207 aaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctg 306  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  24305565 aaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttgatggaagatgctgcag 24305466  T
Q  307 agtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24305465 agtggtatactagtttgagcaaaaatgacattcatacctttg 24305424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 26999115 - 26999463
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26999115 cacagcacggaagcatccccgtgaccaaaaccatggaagagatgatgaaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgagggaatgc 26999214  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  26999215 ggactctttcaaaactcaagatctctgtttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggacttcgaccgatacaacgggctaacttgt 26999314  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcagga-tagtttgatggaagat 299  Q
    || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26999315 ccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggattagtttgatggaagat 26999414  T
Q  300 gccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26999415 gttgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 26999463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 26988047 - 26988391
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  26988047 cacagcatggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgaggaaatgc 26988146  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||    
T  26988147 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggacttcgaccgatacaac-ggctaa-ctgt 26988244  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26988245 cc-cagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttgatggaagatg 26988343  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
      || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26988344 ttgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 26988391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 29572056 - 29572403
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  29572056 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 29572155  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29572156 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 29572255  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  29572256 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 29572355  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29572356 ccgcagagtggtacactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 29572403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16945180 - 16944833
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| |||| |||    
T  16945180 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcgagggagtgc 16945081  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16945080 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 16944981  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  16944980 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 16944881  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16944880 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 16944833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22936031 - 22935684
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  22936031 cacagcgcggaagcatccccgtgatcaaaacaatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagccaatcgagggaatgc 22935932  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  22935931 agactctttcaaaactcaagatctctgtttggtgtcaaaggtggatgtccctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatgggctgacttgt 22935832  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  22935831 ccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcacttatgatccactgcttccaagatagcttgatggaagatg 22935732  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22935731 ctgcagagtggtatactaatttgagcaaaaatgacatccatacctttg 22935684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23858476 - 23858129
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  23858476 cacagcgcggaagcatccccgtgatcaaaacaatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagccaatcgagggaatgc 23858377  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  23858376 agactctttcaaaactcaagatctctgtttggtgtcaaaggtggatgtccctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatgggctgacttgt 23858277  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  23858276 ccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcacttatgatccactgcttccaagatagcttgatggaagatg 23858177  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23858176 ctgcagagtggtatactaatttgagcaaaaatgacatccatacctttg 23858129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 24862760 - 24863107
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  24862760 cacagcacggaaacatccccgtgatcaaaacaatggaggagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagctaatcgagggaatgc 24862859  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  24862860 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttagtgtcaaaggtggatatccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatgggctgacttgt 24862959  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24862960 ccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcacttatgatccactgctttcaagatagtttgatggaagatg 24863059  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
      || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24863060 ttgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 24863107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30559169 - 30558822
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| |||| |||    
T  30559169 cacagcgcagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcgagggagtgc 30559070  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  30559069 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 30558970  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  30558969 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 30558870  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30558869 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccacacctttg 30558822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 166 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27630697 - 27630515
Alignment:
Q  166 tcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttat 265  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  27630697 tcccggagttcgacaagtacaacgggctgacttgtcctcaaaatcatatcatcaaatatgtccgcaagatgggaaattacaaagacaatgactcacttat 27630598  T
Q  266 gatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27630597 gatccactgcttccaggatagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactggtttgagcaaggatgacatccatacttttg 27630515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 110 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27273628 - 27273398
Alignment:
Q  110 caaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaac 209  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | || || || |||||  |||| || ||||||  |||||||||||| || |||||||||||     
T  27273628 caaaactcatgatctttgtttggtatccaaagtggacatcccgaagaaattcaagctcccagagttcgacaagtacaacgggctgacttgtcctcaaaat 27273529  T
Q  210 cacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagt 309  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  27273528 catatcatcaagtatgtccgcaagatgggaaattacaaagacaatgattcgcttatgatacactgcttccaagatagcttgatggaagatgctgcagagt 27273429  T
Q  310 ggtatactagtttgagcaagaatgacatcca 340  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27273428 ggtatactggtttgagcaaggatgacatcca 27273398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 3695177 - 3695472
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  3695177 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 3695276  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  3695277 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 3695376  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  3695377 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattactttcaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaa 3695472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 111 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 34464404 - 34464187
Alignment:
Q  111 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 210  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  34464404 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaagtggatgttcctaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 34464305  T
Q  211 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 310  Q
    | ||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  34464304 atattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtg 34464205  T
Q  311 gtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||||| |||||||    
T  34464204 gtatactagtctgagcaa 34464187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 348
Target Start/End: Original strand, 4524364 - 4524679
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || | ||||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  4524364 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggggactccattaaaacccaggatctctgcttgg 4524463  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  4524464 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 4524563  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaagaat 332  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||    
T  4524564 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 4524663  T
Q  333 gacatccatacctttg 348  Q
    ||  ||||||||||||    
T  4524664 gatgtccatacctttg 4524679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 348
Target Start/End: Original strand, 4756836 - 4757151
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  4756836 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 4756935  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  4756936 tatcgaaagtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 4757035  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaagaat 332  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||    
T  4757036 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 4757135  T
Q  333 gacatccatacctttg 348  Q
    ||  ||||||||||||    
T  4757136 gatgtccatacctttg 4757151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 348
Target Start/End: Original strand, 4772072 - 4772387
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  4772072 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 4772171  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  4772172 tatcgaaagtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 4772271  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaagaat 332  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||    
T  4772272 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 4772371  T
Q  333 gacatccatacctttg 348  Q
    ||  ||||||||||||    
T  4772372 gatgtccatacctttg 4772387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26778748 - 26778453
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  26778748 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttgg 26778649  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  26778648 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 26778549  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  26778548 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 26778453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27361131 - 27360836
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||| |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  27361131 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaataggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 27361032  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  27361031 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 27360932  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  27360931 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 27360836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27451474 - 27451179
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||| |||| ||||  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  27451474 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaataggggaaatggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 27451375  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  27451374 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 27451275  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  27451274 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 27451179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 111 - 328
Target Start/End: Original strand, 17024415 - 17024632
Alignment:
Q  111 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 210  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  17024415 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaggtagatgttcccaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 17024514  T
Q  211 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 310  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  17024515 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtg 17024614  T
Q  311 gtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||||| |||||||    
T  17024615 gtatactagtctgagcaa 17024632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 111 - 328
Target Start/End: Original strand, 29500559 - 29500776
Alignment:
Q  111 aaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaacc 210  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  29500559 aaaacccaggatctctgcttagtatcgaaagtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatc 29500658  T
Q  211 acatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtg 310  Q
    | ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||| || || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  29500659 atattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccatcacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtg 29500758  T
Q  311 gtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||||| |||||||    
T  29500759 gtatactagtctgagcaa 29500776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 27043464 - 27043760
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||| | ||||| || ||||| ||||| |    
T  27043464 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactctattaaaacccaggatctctgcttag 27043563  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgtt-cctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaa 231  Q
    | || || || |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| |    
T  27043564 tatcgaaggtagatgttaccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccgga 27043663  T
Q  232 agatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  27043664 agatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 27043760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4546905 - 4546610
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || || || |||||||    
T  4546905 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggacctctgcttgg 4546806  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  4546805 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 4546706  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  4546705 aatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaa 4546610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 16673202 - 16673497
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  16673202 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 16673301  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  16673302 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 16673401  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| |||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||    
T  16673402 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtggtatactagtctgagcaa 16673497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 348
Target Start/End: Original strand, 27006787 - 27007102
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| ||||| |    
T  27006787 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttag 27006886  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   || |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  27006887 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 27006986  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaagaat 332  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||    
T  27006987 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagat 27007086  T
Q  333 gacatccatacctttg 348  Q
    ||  ||||||||||||    
T  27007087 gatgtccatacctttg 27007102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 28206517 - 28206812
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || || || |||||||    
T  28206517 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggacctctgcttgg 28206616  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  28206617 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 28206716  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  28206717 aatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaa 28206812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 29548553 - 29548848
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| || |  |||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  29548553 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaacggagactccattaaaacccaggatctctgcttgg 29548652  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || |||||||| || || ||  |||||||||| || ||    
T  29548653 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcagaatcatattgtcaaatatgttcggaa 29548752  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  29548753 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 29548848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Original strand, 27484303 - 27484487
Alignment:
Q  144 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 243  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  27484303 gatgttccaaaaaagttcaaggtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaact 27484402  T
Q  244 acaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  27484403 acaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaa 27484487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4725264 - 4724969
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || || || ||||| |    
T  4725264 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggacctctgcttag 4725165  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  4725164 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 4725065  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  4725064 aatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 4724969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26117429 - 26117245
Alignment:
Q  144 gatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaatt 243  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| || |||||||| |    
T  26117429 gatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaaaatgggcaact 26117330  T
Q  244 acaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  26117329 acaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 26117245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 348
Target Start/End: Original strand, 20159774 - 20160097
Alignment:
Q  31 ccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaa------aactcaagatct 124  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || || |||||    ||| || | ||      || ||| |||||    
T  20159774 ccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaaccgagggaacagtgaccctgttaatgttaaaaatcatgatct 20159873  T
Q  125 ttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatat 224  Q
     ||||||||  |||  |||||  | ||||| ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || |||||||| ||     
T  20159874 atgcttggtaccaagggtggacatccctaagaagttcaaggtcccggagttcgaccgatacaatgggctgacttgtcctcagaatcatatcatcaagtac 20159973  T
Q  225 gtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttga 324  Q
    ||||| |||||| | || ||    ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||    
T  20159974 gtccgcaagatgagtaactatttggacaatgattcactcatgattcattgcttccaagatagcttaatggaagatgctgcagaatggtacactagcttga 20160073  T
Q  325 gcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||    
T  20160074 gcaaggatgacatctatacttttg 20160097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22173057 - 22172734
Alignment:
Q  31 ccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaa------aactcaagatct 124  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || || |||||    ||| || | ||      || ||| |||||    
T  22173057 ccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaaccgagggaacagtgaccctgttaatgttaaaaatcatgatct 22172958  T
Q  125 ttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatat 224  Q
     ||||||||  |||  |||||  | ||||| ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || |||||||| ||     
T  22172957 atgcttggtaccaagggtggacatccctaagaagttcaaggtcccggagttcgaccgatacaatgggctgacttgtcctcagaatcatatcatcaagtac 22172858  T
Q  225 gtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttga 324  Q
    ||||| |||||| | || ||    ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||    
T  22172857 gtccgcaagatgagtaactatttggacaatgattcactcatgattcattgcttccaagatagcttaatggaagatgctgcagaatggtacactagcttga 22172758  T
Q  325 gcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||    
T  22172757 gcaaggatgacatctatacttttg 22172734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1340 - 993
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1340 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaagaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgagggaatgc 1241  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  1240 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaagtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccggtacaacgggctgacttgt 1141  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1140 ccccagaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttgatggaagatg 1041  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1040 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 29499 - 29846
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29499 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgagggaatgc 29598  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  29599 ggactctttctaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggacttcgaccgatacaacgggctaacttgt 29698  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29699 ccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 29798  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29799 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 29846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 348
Target Start/End: Original strand, 19462 - 19804
Alignment:
Q  6 cacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggact 105  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| | |||||    
T  19462 cacggaagcatccccgtgattaaaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagctaaccgagggaacggggact 19561  T
Q  106 ctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctca 205  Q
    || | || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||| || || || ||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  19562 ctgttaagactcatgatctctgcttggtaccaaaggtggacgtccccaagaagttcaaagtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtcccca 19661  T
Q  206 aaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgct 305  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||     
T  19662 gaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactacaaagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaagacgctgca 19761  T
Q  306 gagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    || ||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||    
T  19762 gaatggtatactagcttgagcaaagatgacgttcatacctttg 19804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 26338 - 26685
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  26338 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagatcaaagccaatcgaggaaatgc 26437  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  26438 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaaattcaaaatcccagatttcgaccgatacaacgggctaacttgt 26537  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26538 cctcagaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcacttatgatccactgctttcaagatagtttgatggaagatg 26637  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26638 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 26685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 48195 - 47850
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  48195 cacagcacggaagcatccccgtgaccaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaattaaagccaatcgaggaaatgc 48096  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  48095 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaagtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacgggctgacttgt 47996  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47995 ccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggaaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttgatggaagatg 47896  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctt 346  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47895 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctt 47850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 41279 - 40932
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  41279 cacagcacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagctaatcgagggaatgc 41180  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  41179 ggactctttcaaaactcaagatctctgcttggtgtcaaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatgggctgacttgt 41080  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  41079 ccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgggtaattacaaagacaatgattcacttatgattcactgcttccaagatagcttgatggaagatg 40980  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40979 ctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 40932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 28809 - 29156
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||    
T  28809 cacaccacggaaacatccccgtgatcaaaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagctaatcaagggaatgc 28908  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  28909 ggactctttcaagactcaggatctctgcttggtaccaaaggtggatgtccctaagaagttcaagatcccggatttcgaccgatacaatgggctgacttgt 29008  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  29009 ccccagaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggtaactacaaagacaatgattcactcatgattcactgcttccaagatagcttgatggaagatg 29108  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29109 ctacagagtggtatactagtttgagcaaaaatgacatccatacctttg 29156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 51637263 - 51637610
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  51637263 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 51637362  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  51637363 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 51637462  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  51637463 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 51637562  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51637563 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 51637610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 41794518 - 41794171
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  41794518 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 41794419  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  41794418 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 41794319  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  41794318 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 41794219  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41794218 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 41794171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 10961715 - 10962062
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  10961715 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatgggggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 10961814  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10961815 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtatcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 10961914  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  10961915 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 10962014  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10962015 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 10962062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 28584026 - 28584373
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| |||| |||    
T  28584026 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagaaatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgaaatccaggccaatcgagggagtgc 28584125  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  28584126 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 28584225  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  28584226 ccccaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 28584325  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28584326 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 28584373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16209229 - 16208887
Alignment:
Q  6 cacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggact 105  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| | | |||    
T  16209229 cacggaagcatccccgtgatcaaaaccatgaaagaaaggatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgaaatcaaagctaaccgagggaacgggaact 16209130  T
Q  106 ctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctca 205  Q
    || | || ||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||| || || ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  16209129 ctattaagactcatgatctctgcttggtaccaaaggtggatgtccccaagaagttcaaggtcccggagttcgaccgatacaatgggctgacttgtcccca 16209030  T
Q  206 aaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgct 305  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||     
T  16209029 gaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactataaagacaatgattcactcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaagacgctgca 16208930  T
Q  306 gagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    || ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||    
T  16208929 gaatggtatactagcttgagcaaaaatgacgttcatacctttg 16208887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 298
Target Start/End: Original strand, 20460160 - 20460450
Alignment:
Q  8 cggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactct 107  Q
    ||||||||||||||| |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || || ||||| | |||| ||    
T  20460160 cggaagcatccccgtgattaaaaccatggaagaaaagatggaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagctaaccgagggaacggggaccct 20460259  T
Q  108 ttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaa 207  Q
     | || ||||| ||||| ||||||||  |||| |||||  |||| || ||||||||  |||| || ||| |||| ||||| ||||| || ||||| || |    
T  20460260 gttaagactcatgatctctgcttggtaccaaaggtggacattcccaagaagttcaaggtcccagagttcaaccgatacaatgggctgacttgtccccaga 20460359  T
Q  208 accacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaaga 298  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  20460360 accacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaaga 20460450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16140 - 15793
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  16140 cacagcacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgagggaatgc 16041  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||     
T  16040 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccgatacaacgggctaacttgc 15941  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  15940 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 15841  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15840 ccgcagagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 15793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8449 - 8102
Alignment:
Q  1 cacagcacggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgc 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||||    
T  8449 cacagtacagaagcatccccgtaaccaagactatggaagaaatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcacgagatccaggccaatcgatggaatgc 8350  T
Q  101 ggactctttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgt 200  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  8349 agactctgtcaaaactcaagacctttgcttagtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgt 8250  T
Q  201 cctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatg 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  8249 cctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatg 8150  T
Q  301 ccgctgagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8149 ccgcaaagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 8102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 44 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 49348 - 49036
Alignment:
Q  44 gatggaggaacttg-ctaaagaactccgtcat-gagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaag-atctttgcttggtgtcaaaa 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |  ||    
T  49348 gatggaggaacttgactaaagaactccgtcatagaaatcaaagctaatcgagggaatgcggactctttcaagactcagggatctctgcttggtgccgtaa 49249  T
Q  141 g-tggatgttcc-taaaaagttcaaaa-tcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatat-gtccgaaagatg 236  Q
    | ||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  49248 ggtggatgtaccctaagaagttcaaaaatcccggatttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatagtccgaaagatg 49149  T
Q  237 ggcaattacaaagacaatgattcccttatgatc-cactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgct-gagtggtatactagtttgagcaagaatga 334  Q
    || || ||||||||||||||||| || |||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49148 ggtaactacaaagacaatgattcactcatgatttcactgcttccaagatagcttgatggaagatgctgctagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 49049  T
Q  335 catccataccttt 347  Q
    |||||||||||||    
T  49048 catccataccttt 49036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 120 - 340
Target Start/End: Original strand, 40826 - 41046
Alignment:
Q  120 gatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatca 219  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||  |||| || || |||||  |||| || ||||||  |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  40826 gatctatgtttggtatccaaagtggacattccgaagaaattcaagctcccagaattcgacaagtacaacgggctgacttgtcctcaaaatcatatcatca 40925  T
Q  220 aatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactag 319  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  40926 agtatgtccgcaagatgggaaattacaaagacaatgattcgcttatgatacactgcttccaagatagcttgatggaagatgccgcagagtggtatactgg 41025  T
Q  320 tttgagcaagaatgacatcca 340  Q
    |||||||||| |||| |||||    
T  41026 tttgagcaaggatgatatcca 41046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 326
Target Start/End: Original strand, 20620 - 20938
Alignment:
Q  8 cggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactct 107  Q
    ||||||||||||||| |  | | |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  || || ||||| |||||||| | |   ||  ||    
T  20620 cggaagcatccccgtgattagaaccatggaagaaaggatggaggaacttgctaaggaactccgtcgggaaatcaaagctaatcggggaagtagtgatact 20719  T
Q  108 ttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaa 207  Q
     | || ||||| ||||| ||||||||  | || |||||| | ||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |    
T  20720 gttaagactcatgatctctgcttggtaccgaaggtggatatccctaagaagttcaaggttccggatttcgaccgatacaatgggctaacttgtccacaga 20819  T
Q  208 accacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctga 307  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||  || |||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||    
T  20820 atcacatcatcaaatatgtccggaagatggctaactactcagacaatgattcactcatgatccactgctttcaggatagtctaatggaagatgctgcaga 20919  T
Q  308 gtggtatactagtttgagc 326  Q
     |||||||| || ||||||    
T  20920 atggtataccagcttgagc 20938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 7310 - 7605
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  ||||||| || ||||| ||||| |    
T  7310 atggaagagagaatggcagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccatcaaaacccaggatctctgcttag 7409  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  7410 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa 7509  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  7510 gatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaa 7605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Original strand, 7015 - 7310
Alignment:
Q  33 atggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactctttcaaaactcaagatctttgcttgg 132  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||  |||| ||||  |||||  | ||||| || || || |||||||    
T  7015 atggaagagagaatggaagaacttgccaaagagctccgacgggaaattaaggccaacaggggaaatggagactccattaaaacccaggacctctgcttgg 7114  T
Q  133 tgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaaccacatcatcaaatatgtccgaaa 232  Q
    | || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||    
T  7115 tatcgaaggtagatgttccaaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaa 7214  T
Q  233 gatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 328  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  7215 aatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaa 7310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 121384 - 121076
Alignment:
Q  8 cggaagcatccccgtaaccaaagccatggaagagatgatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagccaatcgggggaatgcggactct 107  Q
    ||||||||||||||| |  | | |||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||   | |||||||| ||||||||   |   ||  ||    
T  121384 cggaagcatccccgtgattagaaccatggaagaaaggatggaggaacttgttaaggaactccgtcggtaaattaaagctaatcggggatgtagtgatact 121285  T
Q  108 ttcaaaactcaagatctttgcttggtgtcaaaagtggatgttcctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaa 207  Q
     | || ||||| ||||| ||||||||  | || |||||| | ||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |    
T  121284 gttaagactcatgatctctgcttggtaccgaaggtggatatccctaagaagttcaaggttccggatttcgaccgatacaatgggctaacttgtccacaga 121185  T
Q  208 accacatcatcaaatatgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgctga 307  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||  || |||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||    
T  121184 atcacatcatcaaatatgtccggaagatggctaactactcagacaatgattcactcatgatccactgctttcaggatagtctaatggaagatgctgcaga 121085  T
Q  308 gtggtatac 316  Q
     ||||||||    
T  121084 atggtatac 121076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 348
Target Start/End: Original strand, 5339 - 5381
Alignment:
Q  306 gagtggtatactagtttgagcaagaatgacatccatacctttg 348  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5339 gagtggtatactagtttgagtaagaatgacatccatacctttg 5381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 145 - 104
Alignment:
Q  44 gatggaggaacttgctaaagaactccgtcatgagattaaagc 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  145 gatggaggaacttgctaaagaactccgtcgtgaaatcaaagc 104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University