View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15788_high_4 (Length: 500)

Name: NF15788_high_4
Description: NF15788
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15788_high_4
NF15788_high_4
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (3-500)||(16743990-16744489)
chr3 (127-415)||(17912483-17912771)
chr3 (54-421)||(2049777-2050147)
chr3 (54-421)||(14842487-14842856)
chr3 (54-431)||(13838852-13839232)
chr3 (54-421)||(12030073-12030443)
chr3 (101-432)||(15858996-15859331)
chr3 (117-432)||(51158008-51158325)
chr3 (127-292)||(2449238-2449404)
chr3 (134-421)||(15936634-15936922)
chr3 (6-189)||(19231982-19232169)
chr3 (134-421)||(15938476-15938764)
chr3 (139-414)||(15614808-15615085)
chr3 (54-173)||(19260749-19260869)
chr3 (127-259)||(13975722-13975853)
chr3 (127-259)||(45860937-45861068)
chr3 (347-477)||(15468555-15468686)
chr3 (127-421)||(13954890-13955185)
chr3 (347-477)||(22275119-22275250)
chr3 (279-414)||(47984624-47984759)
chr3 (279-414)||(48003198-48003333)
chr3 (279-414)||(47993911-47994046)
chr3 (279-414)||(48012484-48012619)
chr3 (161-429)||(16821099-16821369)
chr3 (139-421)||(55316187-55316471)
chr3 (6-85)||(3992873-3992953)
chr3 (6-85)||(55513193-55513273)
chr3 (11-88)||(15857120-15857198)
chr3 (139-421)||(41270043-41270327)
chr3 (6-85)||(2844514-2844594)
chr3 (447-492)||(2449391-2449436)
chr3 (369-421)||(19231945-19231997)
chr3 (6-85)||(54037976-54038056)
chr3 (31-85)||(17955861-17955916)
chr3 (6-85)||(7854305-7854385)
chr3 (25-85)||(45581954-45582016)
chr3 (347-421)||(13975944-13976017)
chr3 (359-421)||(45860773-45860834)
chr3 (143-184)||(14080715-14080756)
chr3 (400-432)||(22144532-22144564)
chr3 (271-389)||(12264932-12265050)
chr3 (13-65)||(17191884-17191936)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (127-500)||(22907214-22907588)
chr8 (54-414)||(16193643-16194005)
chr8 (6-421)||(16404852-16405268)
chr8 (54-421)||(43373392-43373761)
chr8 (54-431)||(24928716-24929096)
chr8 (127-292)||(5238184-5238350)
chr8 (127-292)||(24661248-24661414)
chr8 (127-292)||(43685643-43685809)
chr8 (127-418)||(17345540-17345832)
chr8 (139-414)||(24548956-24549233)
chr8 (139-414)||(6774258-6774535)
chr8 (161-421)||(21844594-21844856)
chr8 (161-421)||(21851987-21852249)
chr8 (139-421)||(30120690-30120974)
chr8 (447-500)||(5238144-5238197)
chr8 (447-500)||(24661401-24661454)
chr8 (447-500)||(43685603-43685656)
chr8 (6-85)||(274766-274846)
chr8 (6-85)||(641003-641083)
chr8 (6-85)||(826809-826889)
chr8 (6-85)||(24716714-24716794)
chr8 (202-421)||(222754-222975)
chr8 (202-421)||(736377-736598)
chr8 (202-421)||(860272-860493)
chr8 (277-431)||(23837154-23837308)
chr8 (139-259)||(16674392-16674512)
chr8 (348-429)||(13662481-13662561)
chr8 (368-417)||(16674624-16674672)
chr8 (143-184)||(23226076-23226117)
chr8 (395-432)||(41246613-41246650)
chr8 (6-85)||(39115598-39115678)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (127-500)||(26680089-26680463)
chr4 (6-432)||(54118120-54118551)
chr4 (54-432)||(13246386-13246769)
chr4 (54-417)||(15675009-15675381)
chr4 (54-259)||(122020-122226)
chr4 (154-414)||(31115603-31115865)
chr4 (127-292)||(10488659-10488825)
chr4 (127-292)||(16327926-16328092)
chr4 (54-417)||(10104170-10104523)
chr4 (161-421)||(10644187-10644449)
chr4 (127-259)||(13048221-13048353)
chr4 (290-421)||(111362-111493)
chr4 (54-189)||(33240901-33241043)
chr4 (139-421)||(47357622-47357906)
chr4 (6-85)||(25119059-25119139)
chr4 (447-492)||(10488627-10488672)
chr4 (447-492)||(16328079-16328124)
chr4 (343-418)||(7849970-7850044)
chr4 (6-85)||(5682380-5682460)
chr4 (143-324)||(40885570-40885753)
chr4 (277-371)||(41166083-41166177)
chr4 (277-421)||(15044794-15044938)
chr4 (400-432)||(44055870-44055902)
chr4 (277-392)||(8374504-8374619)
chr4 (277-421)||(15109486-15109630)
chr4 (271-392)||(17145796-17145917)
chr4 (277-341)||(13809647-13809711)
chr4 (277-388)||(52265645-52265757)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (127-500)||(7292905-7293279)
chr7 (54-433)||(13036938-13037322)
chr7 (54-421)||(16211733-16212103)
chr7 (13-421)||(3059933-3060344)
chr7 (54-421)||(36052634-36053003)
chr7 (54-421)||(11580661-11581035)
chr7 (127-414)||(47481031-47481320)
chr7 (127-292)||(11516324-11516490)
chr7 (127-292)||(15441564-15441730)
chr7 (127-292)||(30262129-30262295)
chr7 (134-421)||(18253842-18254130)
chr7 (128-414)||(13320988-13321278)
chr7 (162-418)||(16478985-16479244)
chr7 (127-259)||(25292338-25292470)
chr7 (161-421)||(13572644-13572906)
chr7 (161-421)||(2437425-2437687)
chr7 (139-421)||(10989378-10989661)
chr7 (62-418)||(295900-296257)
chr7 (161-403)||(13911046-13911292)
chr7 (447-500)||(15441717-15441770)
chr7 (447-500)||(30262282-30262335)
chr7 (6-85)||(126738-126818)
chr7 (6-85)||(32493898-32493978)
chr7 (447-500)||(11516284-11516337)
chr7 (6-85)||(1936869-1936949)
chr7 (127-169)||(14113989-14114031)
chr7 (127-169)||(14423639-14423681)
chr7 (6-85)||(111121-111201)
chr7 (400-432)||(15822691-15822723)
chr7 (347-421)||(25292560-25292633)
chr7 (277-432)||(17224075-17224230)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (127-500)||(37066-37440)
scaffold0078 (6-85)||(41632-41712)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (3-418)||(41394191-41394610)
chr1 (54-421)||(20445646-20446019)
chr1 (66-421)||(20531411-20531770)
chr1 (54-421)||(20931312-20931682)
chr1 (54-432)||(20893551-20893933)
chr1 (54-421)||(20913004-20913367)
chr1 (54-421)||(37844374-37844746)
chr1 (127-292)||(51452589-51452755)
chr1 (177-421)||(22227777-22228022)
chr1 (177-421)||(22232474-22232719)
chr1 (161-414)||(2116228-2116484)
chr1 (161-259)||(45051554-45051652)
chr1 (6-85)||(21860334-21860414)
chr1 (12-85)||(44034829-44034903)
chr1 (447-492)||(51452557-51452602)
chr1 (161-421)||(18601140-18601402)
chr1 (334-414)||(45051416-45051496)
chr1 (139-421)||(5072388-5072672)
chr1 (6-65)||(41218749-41218808)
chr1 (400-431)||(49967607-49967638)
chr1 (311-392)||(20254308-20254389)
chr1 (13-65)||(13376711-13376763)
chr1 (310-389)||(22143531-22143611)
chr1 (13-65)||(27675139-27675191)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (6-432)||(19794581-19795011)
chr2 (6-421)||(43642833-43643250)
chr2 (54-421)||(36982364-36982737)
chr2 (6-421)||(20627190-20627609)
chr2 (54-421)||(462706-463075)
chr2 (60-421)||(8891209-8891574)
chr2 (54-417)||(24341309-24341681)
chr2 (127-292)||(19689401-19689567)
chr2 (127-292)||(23820168-23820334)
chr2 (127-292)||(14906440-14906606)
chr2 (127-414)||(25265390-25265679)
chr2 (127-292)||(20015108-20015274)
chr2 (177-418)||(7507894-7508138)
chr2 (127-259)||(17396653-17396784)
chr2 (139-421)||(19886661-19886945)
chr2 (6-85)||(22284278-22284358)
chr2 (54-147)||(22863171-22863267)
chr2 (6-85)||(22275045-22275125)
chr2 (6-84)||(15633538-15633617)
chr2 (447-492)||(19689554-19689599)
chr2 (447-492)||(14906593-14906638)
chr2 (447-492)||(20015076-20015121)
chr2 (447-492)||(23820136-23820181)
chr2 (359-421)||(17396887-17396948)
chr2 (310-392)||(19669279-19669362)
chr2 (311-371)||(9636761-9636821)
chr2 (13-69)||(19660217-19660273)
chr2 (310-389)||(19666525-19666605)
chr2 (311-355)||(24884718-24884762)
chr2 (400-432)||(32465813-32465845)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (54-421)||(1091-1462)
scaffold0266 (54-421)||(3508-3877)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (54-421)||(48565-48935)
scaffold0023 (161-417)||(36065-36323)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (53-421)||(36836-37209)
scaffold0077 (6-65)||(15319-15378)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (62-421)||(19173-19537)
scaffold0195 (127-421)||(21257-21553)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (54-432)||(23153403-23153786)
chr6 (98-414)||(14626089-14626407)
chr6 (127-421)||(35009439-35009735)
chr6 (127-418)||(1657748-1658040)
chr6 (127-418)||(15862443-15862734)
chr6 (139-414)||(1650105-1650382)
chr6 (285-418)||(27740808-27740941)
chr6 (167-421)||(25175531-25175787)
chr6 (139-421)||(27653983-27654267)
chr6 (54-122)||(23148266-23148335)
chr6 (6-85)||(19983144-19983224)
chr6 (6-85)||(35015009-35015089)
chr6 (278-432)||(18381821-18381975)
chr6 (368-421)||(16825986-16826038)
chr6 (127-210)||(27751605-27751688)
chr6 (6-85)||(18583640-18583720)
chr6 (301-407)||(22361926-22362032)
chr6 (127-324)||(29665937-29666137)
chr6 (403-432)||(32898745-32898774)
chr6 (277-432)||(21623123-21623278)
chr6 (277-341)||(25367374-25367438)
chr6 (310-389)||(33324690-33324770)
chr6 (310-389)||(35136182-35136262)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (54-421)||(23506932-23507302)
chr5 (54-432)||(27182471-27182854)
chr5 (54-413)||(18530988-18531355)
chr5 (54-417)||(22053753-22054125)
chr5 (127-292)||(20623066-20623232)
chr5 (127-292)||(21233528-21233694)
chr5 (127-289)||(37052844-37053007)
chr5 (127-292)||(16536294-16536460)
chr5 (127-418)||(34939248-34939540)
chr5 (129-292)||(25900408-25900571)
chr5 (139-421)||(22366481-22366765)
chr5 (139-421)||(25426596-25426880)
chr5 (161-421)||(18778014-18778276)
chr5 (139-421)||(12342-12626)
chr5 (139-421)||(19499867-19500151)
chr5 (139-421)||(21073595-21073879)
chr5 (161-402)||(4200007-4200251)
chr5 (347-431)||(17471803-17471887)
chr5 (161-421)||(27009809-27010071)
chr5 (139-259)||(29188284-29188404)
chr5 (161-421)||(43443417-43443679)
chr5 (447-500)||(20623026-20623079)
chr5 (447-500)||(21233681-21233734)
chr5 (341-414)||(29190479-29190552)
chr5 (447-492)||(25900558-25900603)
chr5 (447-500)||(37052801-37052854)
chr5 (447-492)||(16536262-16536307)
chr5 (277-389)||(23493916-23494029)
chr5 (11-65)||(11584394-11584448)
chr5 (277-341)||(7728466-7728530)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (54-432)||(41686-42066)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (54-421)||(882-1250)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (54-421)||(128095-128464)
scaffold0008 (161-402)||(31697-31942)
scaffold0008 (400-428)||(22650-22678)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (54-421)||(5990-6358)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (54-421)||(247366-247738)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (54-421)||(123087-123460)
scaffold0011 (400-432)||(255074-255106)
scaffold0011 (400-432)||(261680-261712)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (54-431)||(171863-172242)
scaffold0001 (54-431)||(177566-177945)
scaffold0001 (400-432)||(70882-70914)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (54-421)||(12083-12450)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (63-421)||(4996-5356)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (65-417)||(8820-9180)
scaffold0025 (95-421)||(148688-149018)
scaffold0025 (54-147)||(146844-146938)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (54-421)||(8846-9215)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (54-421)||(26340-26710)
scaffold0162 (127-414)||(8180-8466)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (54-431)||(271983-272362)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (66-259)||(51121-51314)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (127-292)||(26892-27058)
scaffold0141 (134-292)||(22637-22796)
scaffold0141 (447-492)||(22605-22650)
scaffold0141 (447-492)||(26860-26905)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (127-292)||(1582-1748)
scaffold0124 (447-492)||(1735-1780)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (134-421)||(48155-48443)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (134-421)||(107715-108003)
scaffold0026 (196-421)||(64585-64812)
scaffold0026 (142-184)||(89863-89905)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (127-414)||(13480-13769)
scaffold0132 (6-85)||(42677-42754)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (127-414)||(41622-41911)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (127-419)||(534-828)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (127-418)||(34460-34755)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (54-259)||(89378-89586)
scaffold0028 (54-178)||(107708-107835)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (161-414)||(9371-9626)
scaffold0215 (161-414)||(16269-16524)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (138-414)||(2936-3215)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (290-432)||(9338-9480)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (177-421)||(5254-5498)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (134-259)||(5660-5785)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (177-421)||(3690-3936)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (162-421)||(42965-43226)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (161-421)||(14083-14344)
scaffold0139 (161-421)||(21138-21399)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (161-421)||(3-265)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (161-259)||(13347-13445)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (299-421)||(48482-48603)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (299-421)||(26-147)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (6-85)||(80187-80267)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (177-389)||(54415-54630)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (6-86)||(166116-166197)
scaffold0016 (12-86)||(162036-162111)
scaffold0016 (314-433)||(116687-116806)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (139-259)||(1304-1424)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (6-85)||(31132-31212)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (334-413)||(3183-3262)
scaffold0361 (127-210)||(3370-3453)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (12-85)||(5735-5809)
scaffold0686 (12-85)||(5941-6015)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (368-421)||(1815-1867)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (6-86)||(304-385)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (277-432)||(76984-77139)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (395-432)||(132505-132542)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (277-412)||(197390-197525)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (6-65)||(1721-1780)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (6-65)||(19802-19861)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (311-389)||(104793-104872)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (310-407)||(10642-10739)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (310-371)||(2471-2532)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (143-184)||(1546-1587)
scaffold0456 (143-184)||(8691-8732)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (403-432)||(7522-7551)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (143-184)||(8216-8257)
scaffold0123 (310-389)||(8007-8087)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (134-252)||(56106-56226)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (143-184)||(70307-70348)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (403-432)||(38253-38282)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (300-364)||(2548-2612)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 500
Target Start/End: Original strand, 16743990 - 16744489
Alignment:
Q  3 tggagaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaatt 101  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16743990 tggagaatcataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagtctttaccataatcatcatcattttgtaaatt 16744089  T
Q  102 ttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16744090 ttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgttaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatg 16744189  T
Q  202 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatg 300  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16744190 attgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttatagttgaattgagctatg 16744289  T
Q  301 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaatt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16744290 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataaatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaatt 16744389  T
Q  401 gttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16744390 gttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattgaggaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 16744489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 127 - 415
Target Start/End: Original strand, 17912483 - 17912771
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  17912483 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactt-gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17912581  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 325  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||     
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatttgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgt 17912681  T
Q  326 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttg 415  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17912682 tgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgtgggtgttttg 17912771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 2050147 - 2049777
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2050147 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 2050048  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| | |||| || || |||||    
T  2050047 tccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaa 2049948  T
Q  253 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 350  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | ||||| |||| ||||||||| | | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  2049947 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatga 2049848  T
Q  351 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2049847 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 2049777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Original strand, 14842487 - 14842856
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14842487 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 14842586  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||    
T  14842587 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaa 14842686  T
Q  253 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 350  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |  |||||||    
T  14842687 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatga 14842786  T
Q  351 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    || || | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14842787 ataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 14842856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13839232 - 13838852
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  13839232 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatgaataattgttgctaaattcgtg 13839133  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||    
T  13839132 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 13839033  T
Q  252 aattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 349  Q
    ||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||    
T  13839032 aattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatg 13838933  T
Q  350 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 431  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||  ||| || ||| ||  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  13838932 aatcattgtttgggtatgcatattcatgatttgttgttgagaa-atggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 13838852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Original strand, 12030073 - 12030443
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12030073 taaggtaagggggttaatcattatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgacttttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 12030172  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  12030173 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaa 12030272  T
Q  253 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 350  Q
     ||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||  | |||||||||| ||||||||| | | | || |||| |||||| | ||||||||    
T  12030273 gttgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttgatga 12030372  T
Q  351 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12030373 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 12030443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 101 - 432
Target Start/End: Original strand, 15858996 - 15859331
Alignment:
Q  101 tttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgt 198  Q
    |||||| |||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  15858996 tttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 15859095  T
Q  199 atgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagc 296  Q
    |||||||||||| | ||| |||||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||||||||||     
T  15859096 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagt 15859195  T
Q  297 tatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttg 396  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15859196 tatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttg 15859295  T
Q  397 aattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  15859296 aattgttgttgttgttttggtgaaaatggtgaattg 15859331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 117 - 432
Target Start/End: Original strand, 51158008 - 51158325
Alignment:
Q  117 aattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagatt 216  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||    
T  51158008 aattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 51158107  T
Q  217 ccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaatt 314  Q
     |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||    
T  51158108 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaatt 51158207  T
Q  315 gatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgtt-ggtgttt 413  Q
    |||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||  |||||||  |||||||  ||||||    
T  51158208 gatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgttaatttgagatgttgttaagtgttt 51158307  T
Q  414 tggtgaaatttgtgaattg 432  Q
    || | ||||||||||||||    
T  51158308 tgct-aaatttgtgaattg 51158325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 127 - 292
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449404
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 292  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 2449404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 421
Target Start/End: Original strand, 15936634 - 15936922
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 233  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  15936634 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15936733  T
Q  234 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 331  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  15936734 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 15936833  T
Q  332 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |  || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15936834 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 15936922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19232169 - 19231982
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtg-aatttt 103  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19232169 agaatcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatcatcatcattttgtgaaatttt 19232070  T
Q  104 caaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 189  Q
    |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19232069 caaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgat 19231982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 134 - 421
Target Start/End: Original strand, 15938476 - 15938764
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 233  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  15938476 attgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15938575  T
Q  234 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 331  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  15938576 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 15938675  T
Q  332 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15938676 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgctgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 15938764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 139 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 15615085 - 15614808
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || || ||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  15615085 tgctagatttgtgctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 15614986  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 336  Q
    || ||||| |||| || ||||  ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||    
T  15614985 gataagttgtgaatatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgat 15614886  T
Q  337 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 414  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15614885 gttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 15614808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 173
Target Start/End: Original strand, 19260749 - 19260869
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19260749 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaagttttcaaatgttgtatgaattttttttatggataattgttgctaaattcgtgc 19260848  T
Q  153 tccaactttgatgatatgttt 173  Q
    || || | |||||||||||||    
T  19260849 tctaattatgatgatatgttt 19260869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13975853
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||    
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 13975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 45861068 - 45860937
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||    
T  45861068 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 45860970  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  45860969 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 45860937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 347 - 477
Target Start/End: Original strand, 15468555 - 15468686
Alignment:
Q  347 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtg-aattgaagaaatatgata 445  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||| |    
T  15468555 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttgttgttttggtgaaatttgtgaaattggtgaattatgaca 15468654  T
Q  446 agttgttgttgaattatgatggagtgtatgat 477  Q
     ||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  15468655 tgttgttgttgaaacatgatggaatgtatgat 15468686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 127 - 421
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955185
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||    
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatg-ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 323  Q
    ||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||||  |  | |||||  || | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |     
T  13954989 ataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13955088  T
Q  324 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
     ||| || | |||  | |  || |||||| || | |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13955089 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgataatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 13955185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 347 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 22275250 - 22275119
Alignment:
Q  347 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtg-aattgaagaaatatgata 445  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| ||||| |    
T  22275250 atgaatcattgcttaggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaaattagtgaattatgaca 22275151  T
Q  446 agttgttgttgaattatgatggagtgtatgat 477  Q
     ||||||||||||  |||||||| || |||||    
T  22275150 tgttgttgttgaaacatgatggaatgcatgat 22275119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 279 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 47984759 - 47984624
Alignment:
Q  279 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 378  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  47984759 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47984660  T
Q  379 attgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 414  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  47984659 attgatgatgagaatttgaattgttgctgatgtttt 47984624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 279 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 48003333 - 48003198
Alignment:
Q  279 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 378  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  48003333 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48003234  T
Q  379 attgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 414  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  48003233 attgatgatgagaatttgaattgttgctgatgtttt 48003198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 279 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 47994046 - 47993911
Alignment:
Q  279 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 378  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  47994046 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47993947  T
Q  379 attgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 414  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  47993946 attgatgatgagaatttgaattgttgctgatgtttt 47993911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 279 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 48012619 - 48012484
Alignment:
Q  279 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 378  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  48012619 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48012520  T
Q  379 attgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 414  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  48012519 attgatgatgagaatttgaattgttgctgatgtttt 48012484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16821369 - 16821099
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 259  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||  ||| |||||  |||||||     
T  16821369 tgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgct 16821270  T
Q  260 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 357  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  16821269 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 16821170  T
Q  358 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaa 429  Q
     |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||  | ||| |||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  16821169 cttgggtttgcatattcatggattaatgatgataa-ataaatggttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 16821099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316187
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 335  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 55316272  T
Q  336 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    |  | |  || |||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  55316271 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 55316187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3992953 - 3992873
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  3992953 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3992873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 55513273 - 55513193
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  55513273 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 55513193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 88
Target Start/End: Original strand, 15857120 - 15857198
Alignment:
Q  11 cataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcat 88  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  15857120 cataggagctaaagtgaagctagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcat 15857198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270043
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||   ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 335  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 41270128  T
Q  336 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    |  | |  || |||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41270127 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 41270043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 2844594 - 2844514
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  2844594 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 2844514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 492
Target Start/End: Original strand, 2449391 - 2449436
Alignment:
Q  447 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 492  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2449391 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattg 2449436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 369 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 19231997 - 19231945
Alignment:
Q  369 atattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19231997 atattcatgaattgatgatgataatttggattgttgttggtgttttggtgaaa 19231945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 54037976 - 54038056
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  54037976 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 54038056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 85
Target Start/End: Original strand, 17955861 - 17955916
Alignment:
Q  31 tagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17955861 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17955916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 7854385 - 7854305
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  7854385 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 7854305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 45582016 - 45581954
Alignment:
Q  25 tgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa--ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  45582016 tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatcat 45581954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 421
Target Start/End: Original strand, 13975944 - 13976017
Alignment:
Q  347 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    |||||| || | |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13975944 atgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgataatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 13976017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 45860834 - 45860773
Alignment:
Q  359 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  45860834 ttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 45860773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080715
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 14080715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 432
Target Start/End: Original strand, 22144532 - 22144564
Alignment:
Q  400 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144532 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 22144564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 389
Target Start/End: Original strand, 12264932 - 12265050
Alignment:
Q  271 tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat 370  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| || | ||||| ||   ||||||||||||    
T  12264932 tttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacat 12265031  T
Q  371 attcatggattgatgatga 389  Q
    | | |||||||||||||||    
T  12265032 aattatggattgatgatga 12265050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 17191936 - 17191884
Alignment:
Q  13 taggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  17191936 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 17191884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 127 - 500
Target Start/End: Original strand, 22907214 - 22907588
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22907214 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 22907313  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 325  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907314 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 22907413  T
Q  326 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907414 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 22907513  T
Q  426 tgaattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 500  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22907514 tgaattgatgaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 22907588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 54 - 414
Target Start/End: Original strand, 16193643 - 16194005
Alignment:
Q  54 taaggtaaggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgct 153  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16193643 taaggtaaggggttagtctttatcataatcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaattttgcttatggatgattgttgctaaattcgtgct 16193742  T
Q  154 ccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaa 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  16193743 ccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 16193842  T
Q  254 ttgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaa 351  Q
    ||||||  ||| | |||| |||| ||  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||||    
T  16193843 ttgtgctcaattggtgaattttgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaa 16193942  T
Q  352 tcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 414  Q
    |||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||    
T  16193943 tcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgttaatttgagatgttgttggtgtttt 16194005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 421
Target Start/End: Original strand, 16404852 - 16405268
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttc 104  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| || |||||||    
T  16404852 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattt-gtaaattttc 16404950  T
Q  105 aaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16404951 aaatgttgtatgaatttttgcatgatggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatga 16405050  T
Q  203 ttgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatg 300  Q
    |||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | |||   ||| ||||||  ||||    
T  16405051 ttgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaaattgacatatg 16405147  T
Q  301 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaatt 400  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||  |    
T  16405148 attcttgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttttagttgatgaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatgataatttgagat 16405247  T
Q  401 gttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  16405248 gttgttggtgttttgatgaaa 16405268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Original strand, 43373392 - 43373761
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||  ||||||||| ||    
T  43373392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaattcgt 43373491  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  43373492 gctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 43373591  T
Q  251 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 348  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||| | | | || |||| |||||||| ||||||    
T  43373592 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgat 43373691  T
Q  349 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    |||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  43373692 gaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaa---ttgttggtgttttggtgaaa 43373761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 54 - 431
Target Start/End: Original strand, 24928716 - 24929096
Alignment:
Q  54 taaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtg 151  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  24928716 taaggtaatggggttagtctttatcataatcatcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 24928815  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 251  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||    
T  24928816 ctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 24928915  T
Q  252 aattgtgc-aaatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 349  Q
    ||||||||  ||| | ||||||| |  | ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||| ||| | | || |||| ||||||||  ||||||    
T  24928916 aattgtgctcaattggtgaatttcgctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgattgatg 24929015  T
Q  350 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 431  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||  ||| || ||| ||  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  24929016 aatcattgcttgggtatgcatattcatgatttgttgttgagaa-atggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 24929096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 127 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238184
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 292  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 5238184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 127 - 292
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661414
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 292  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 24661414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 127 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685643
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 292  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 43685643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 127 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345540
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 324  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||  | | ||| | || |||||||| |||||||||||| || ||||| || |||    
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattgt-gaattgagttatgattcttgttcagttgatattattg 17345634  T
Q  325 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 418  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17345633 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaataggtgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 17345540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 139 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24548956
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 336  Q
    || ||||| ||||||| ||||  ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgat 24549034  T
Q  337 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 414  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24549033 gttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 24548956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 139 - 414
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774535
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 336  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgat 6774457  T
Q  337 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 414  Q
    ||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6774458 gttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgatttgttgttggtgtttt 6774535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 421
Target Start/End: Original strand, 21844594 - 21844856
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||     
T  21844594 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgct 21844693  T
Q  260 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 357  Q
     ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | ||||| |||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  21844694 caattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 21844793  T
Q  358 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
     |||||| | ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21844794 cttgggtttgcatattcattgattgttgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 21844856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 421
Target Start/End: Original strand, 21851987 - 21852249
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||     
T  21851987 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgct 21852086  T
Q  260 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 357  Q
     ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  21852087 caattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 21852186  T
Q  358 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
     |||||| | ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21852187 cttgggtttgcatattcattgattgttgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 21852249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120690
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 335  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 30120775  T
Q  336 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30120774 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatcgattgatgatgataatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 30120690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 447 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 5238197 - 5238144
Alignment:
Q  447 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5238197 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 5238144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 447 - 500
Target Start/End: Original strand, 24661401 - 24661454
Alignment:
Q  447 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24661401 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 24661454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 447 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 43685656 - 43685603
Alignment:
Q  447 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43685656 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 43685603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 274846 - 274766
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  274846 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 274766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 641003 - 641083
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  641003 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 641083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 826809 - 826889
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  826809 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 826889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 24716714 - 24716794
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24716714 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24716794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 421
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222975
Alignment:
Q  202 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 298  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 222853  T
Q  299 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 398  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  222854 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgag 222953  T
Q  399 ttgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  222954 ttg-tgttggtgttttggtgaaa 222975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 421
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736598
Alignment:
Q  202 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 298  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 736476  T
Q  299 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 398  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  736477 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgag 736576  T
Q  399 ttgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  736577 ttg-tgttggtgttttggtgaaa 736598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 421
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860493
Alignment:
Q  202 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 298  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 860371  T
Q  299 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 398  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  860372 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgag 860471  T
Q  399 ttgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  860472 ttg-tgttggtgttttggtgaaa 860493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23837308 - 23837154
Alignment:
Q  277 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 375  Q
    ||||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||| |||||    
T  23837308 atgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattca 23837209  T
Q  376 tggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 431  Q
    ||  ||| |||||| ||  ||| |||||| ||||| ||| |||||||| |||||||    
T  23837208 tgatttgttgatgagaa-atgagttgttggtggtggttttgtgaaattggtgaatt 23837154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674512
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgc 16674512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 348 - 429
Target Start/End: Original strand, 13662481 - 13662561
Alignment:
Q  348 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaa 429  Q
    ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  13662481 tgaatcatgatttgggtatacataattatggattgatgatgagaa-ctaaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 13662561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 417
Target Start/End: Original strand, 16674624 - 16674672
Alignment:
Q  368 catattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 417  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16674624 catattcatggattgatgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggt 16674672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 23226076 - 23226117
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23226076 aaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 23226117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 41246650 - 41246613
Alignment:
Q  395 tgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41246650 tgaaatgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 41246613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 39115678 - 39115598
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaaggg-gttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  39115678 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtaataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatcat 39115598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 127 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680089
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 325  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 26680264  T
Q  326 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680263 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 26680164  T
Q  426 tgaattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 500  Q
     |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26680163 ggaatcgatgaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 26680089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 432
Target Start/End: Original strand, 54118120 - 54118551
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttc 104  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  54118120 agaatcataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttc 54118219  T
Q  105 aaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  54118220 aaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatga 54118319  T
Q  203 ttgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatg 300  Q
    |||||||| | ||| |||||| ||||| | | || ||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  ||| || ||||    
T  54118320 ttgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagatttagttatg 54118419  T
Q  301 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaatt 400  Q
    |||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  54118420 attcttgttcaattgatgttatagttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaatt 54118519  T
Q  401 gttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  54118520 gttgttggtgttttggtgaaaatggtgaattg 54118551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13246769 - 13246386
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||| ||    
T  13246769 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgt 13246670  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  13246669 gctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13246570  T
Q  251 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 348  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||    
T  13246569 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 13246470  T
Q  349 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246469 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 13246386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 54 - 417
Target Start/End: Original strand, 15675009 - 15675381
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  15675009 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 15675108  T
Q  147 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 246  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  15675109 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 15675208  T
Q  247 atgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagt 344  Q
     ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||    
T  15675209 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgt 15675308  T
Q  345 tgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 417  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15675309 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 15675381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 122226 - 122020
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  122226 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaatttgtgc 122127  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  122126 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 122027  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  122026 attgtgc 122020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 154 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115603
Alignment:
Q  154 ccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaa 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||  | |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  254 ttgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaa 351  Q
    || |||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaa 31115666  T
Q  352 tcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 414  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31115665 tcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 31115603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 127 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488659
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 292  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 10488659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 127 - 292
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328092
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 292  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16328092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 54 - 417
Target Start/End: Original strand, 10104170 - 10104523
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    |||   | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  10104170 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 10104269  T
Q  147 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 246  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  10104270 ccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 10104369  T
Q  247 atgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagt 344  Q
     ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||                   ||    
T  10104370 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgtt-------------------gt 10104450  T
Q  345 tgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 417  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10104451 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 10104523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 10644449 - 10644187
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||  |||||||     
T  10644449 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 10644350  T
Q  260 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 357  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  10644349 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 10644250  T
Q  358 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10644249 cttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 10644187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048353
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||||| ||| || |||||||||| |||||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgc 13048353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 290 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 111493 - 111362
Alignment:
Q  290 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatga 389  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  111493 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatga 111394  T
Q  390 aaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
     |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  111393 taatttgagatgttgttggtgttttgatgaaa 111362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33241043 - 33240901
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  33241043 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 33240944  T
Q  147 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 189  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33240943 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 33240901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357622
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 335  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 47357707  T
Q  336 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    | || |  ||||||||| || | ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  47357706 tattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatgagaatttgagctg-tgttggtgttttggtgaaa 47357622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 25119059 - 25119139
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaaggg-gttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  25119059 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagtttttatcataatcat 25119139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 10488672 - 10488627
Alignment:
Q  447 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 492  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10488672 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattg 10488627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 492
Target Start/End: Original strand, 16328079 - 16328124
Alignment:
Q  447 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 492  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16328079 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattg 16328124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 7850044 - 7849970
Alignment:
Q  343 gttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 418  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7850044 gttgatgaatcatgacttgagtatacataatcatgaattggtgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtg 7849970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 5682380 - 5682460
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaag-gggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| |||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  5682380 agaatcataggagcaaaagtgaagcatgagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatcat 5682460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 324
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885753
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa-tatgtagaaatgag 241  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||| | ||| |||||| ||| |||||| |||||      
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtc 40885669  T
Q  242 aagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 324  Q
    |||||||| ||||| |||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40885670 aagttatg-aaattatgctcaattggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttg 40885753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 371
Target Start/End: Original strand, 41166083 - 41166177
Alignment:
Q  277 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 371  Q
    ||||||| ||||||||| |  | || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  41166083 atgttgttgttgaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggcttgggtattcata 41166177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 15044938 - 15044794
Alignment:
Q  277 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 375  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| | |||||| | ||| | |||    
T  15044938 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatca 15044839  T
Q  376 tggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||  |||||||||| ||  | ||||||||||| || ||||||||||    
T  15044838 tgatttgatgatgagaa-ataaattgttgttgttgctttggtgaaa 15044794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 44055902 - 44055870
Alignment:
Q  400 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44055902 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 44055870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8374619 - 8374504
Alignment:
Q  277 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcat 376  Q
    ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| || | ||||| || | ||||||||||||| | ||    
T  8374619 atgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatggcttgggtatacataattat 8374520  T
Q  377 ggattgatgatgaaaa 392  Q
     |||||||||||||||    
T  8374519 cgattgatgatgaaaa 8374504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 421
Target Start/End: Original strand, 15109486 - 15109630
Alignment:
Q  277 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 375  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||| | |||||| |||| | |||||| | ||| | |||    
T  15109486 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatca 15109585  T
Q  376 tggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||  |||||||||| ||  | ||||||||||| || ||||||||||    
T  15109586 tgatttgatgatgagaa-ataaattgttgttgttgctttggtgaaa 15109630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 17145796 - 17145917
Alignment:
Q  271 tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat 370  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| || | ||||| ||   ||||||||||||    
T  17145796 tttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacat 17145895  T
Q  371 attcatggattgatgatgaaaa 392  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  17145896 aattacggattgatgatgaaaa 17145917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 341
Target Start/End: Original strand, 13809647 - 13809711
Alignment:
Q  277 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 341  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13809647 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgt 13809711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 388
Target Start/End: Original strand, 52265645 - 52265757
Alignment:
Q  277 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 375  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||  |||||||| |||| | |||||| | ||| |||||    
T  52265645 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatgattcatggcttgggtgttcataattca 52265744  T
Q  376 tggattgatgatg 388  Q
    ||  |||||||||    
T  52265745 tgatttgatgatg 52265757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 127 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 7293279 - 7292905
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7293279 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 7293180  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 325  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293179 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 7293080  T
Q  326 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293079 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 7292980  T
Q  426 tgaattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 500  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  7292979 tgaattgatgaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttgtgattgtggttgat 7292905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 433
Target Start/End: Original strand, 13036938 - 13037322
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||    
T  13036938 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 13037037  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  13037038 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13037137  T
Q  251 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 348  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |  ||  |||| |||||||| ||||||    
T  13037138 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggttgat 13037237  T
Q  349 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattga 433  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13037238 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattga 13037322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16212103 - 16211733
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  16212103 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggacaattgttgctaaattcgtgc 16212004  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  16212003 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16211904  T
Q  253 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 350  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | ||||||||||  |||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  16211903 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 16211804  T
Q  351 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
     |||| | |||||||| |||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16211803 ttcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatgaagagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 16211733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 3060344 - 3059933
Alignment:
Q  13 taggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaaggggtta-gtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgtt 111  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3060344 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgtt 3060245  T
Q  112 gtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggtt 211  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||  | |||||||     
T  3060244 atatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtg 3060145  T
Q  212 agattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgt 308  Q
    | ||| |||||| ||||||||| |||||| || || |||||||| ||  ||||||| |||| ||||  | ||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  3060144 aaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaatgg-tgaattttgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgt 3060046  T
Q  309 gcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttgg 408  Q
     ||||||||||| |   || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||| ||    
T  3060045 tcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgataatttgagatgttgtggg 3059946  T
Q  409 tgttttggtgaaa 421  Q
    ||||||| |||||    
T  3059945 tgttttgatgaaa 3059933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 36053003 - 36052634
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  36053003 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaatttat 36052904  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  36052903 actccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 36052804  T
Q  251 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 348  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | |||   ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||||| ||||||    
T  36052803 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgat 36052707  T
Q  349 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    |||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36052706 gaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 36052634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Original strand, 11580661 - 11581035
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg---attatggatgattgttgctaaattt 148  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||| ||||||||||     
T  11580661 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaattc 11580760  T
Q  149 gtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttat 248  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |    
T  11580761 gtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgt 11580860  T
Q  249 gaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttg 346  Q
    |||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||    
T  11580861 gaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttg 11580960  T
Q  347 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11580961 atgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgaggacgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 11581035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 127 - 414
Target Start/End: Original strand, 47481031 - 47481320
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||    
T  47481031 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaa 47481130  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 323  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |     
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattgg-tgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatc 47481229  T
Q  324 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 414  Q
    | |  |||| |||||| | ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47481230 gctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgataatttgaattgttgttggtgtttt 47481320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 127 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516324
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 292  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 11516324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 127 - 292
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441730
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 292  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 15441730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 127 - 292
Target Start/End: Original strand, 30262129 - 30262295
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30262129 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 30262228  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 292  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30262229 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 30262295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 134 - 421
Target Start/End: Original strand, 18253842 - 18254130
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 233  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  18253842 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 18253941  T
Q  234 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 331  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  18253942 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 18254041  T
Q  332 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |  || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18254042 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 18254130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 128 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 13321278 - 13320988
Alignment:
Q  128 tggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa 227  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||    
T  13321278 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaa 13321179  T
Q  228 --tatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttg-tagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 322  Q
      |||||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||| | |||||||  | | |||| | ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |    
T  13321178 agtatgtataaatgtcaagttatgaaa-ttgtgctcaattggtgaattttgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 13321080  T
Q  323 tgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 414  Q
    || || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13321079 tgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatgagaatttggattgttgttggtgtttt 13320988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 162 - 418
Target Start/End: Original strand, 16478985 - 16479244
Alignment:
Q  162 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca- 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||      
T  16478985 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 16479084  T
Q  261 aatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtt 359  Q
    ||| | ||||||| |  | ||| |  || | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | |    
T  16479085 aattggtgaattttgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgct 16479184  T
Q  360 tgggtatacatattcatggattgatgatgaaaa-tttgaattgttgttggtgttttggtg 418  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16479185 tgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaattttgaattgttgttggtgttttggtg 16479244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292470
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||||| ||| || ||| |||||| |||||||    
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgc 25292470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 13572906 - 13572644
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||     
T  13572906 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgct 13572807  T
Q  260 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 357  Q
     ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  || |||||| || |    
T  13572806 caattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattg 13572707  T
Q  358 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
     |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13572706 cttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 13572644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 2437687 - 2437425
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg-- 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||      
T  2437687 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgtt 2437588  T
Q  259 caaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatc 356  Q
    ||| ||| |||||||  | |  ||||| ||| |  |||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| ||     
T  2437587 caattgg-tgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 2437489  T
Q  357 gtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    | ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2437488 gcttgagtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 2437425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989378
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 335  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  | |  ||||| ||  | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgta-atttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 10989463  T
Q  336 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10989462 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 10989378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 418
Target Start/End: Original strand, 295900 - 296257
Alignment:
Q  62 ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaa-ttttg-attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaact 159  Q
    |||||| ||||| | ||||||  |||||||||| || |||||||||  ||||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||| ||| || || |    
T  295900 ggggtttgtcttcaacataattctcatcatttt-tgcattttcaaactttgtatgaaattttgcataatgaataattgttgctaaattcgtgttctaatt 295998  T
Q  160 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaat--tgt 257  Q
      | || ||||||||| ||||||||| ||| ||||   ||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| |||||||||||||| |||||  | |    
T  295999 gaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttataaaaattatat 296098  T
Q  258 gcaaatggatgaa-tttgacatgttg-tagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcat 355  Q
     ||||||| |||| ||||  |  ||| |  |||||||| | | |||||| ||| ||||||||||||||| |  |||| ||||||   |||||||||| |     
T  296099 ccaaatgg-tgaattttgctaaattgatgtttgaattgtgttgtgattcatgttcaattgatgttgttgctattaattgatgtt---gttgatgaattac 296194  T
Q  356 cgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 418  Q
     | |||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  296195 tgattgggtatgcttattcatggattgatgttgaaaaattgaatttgtgttggtgttttggtg 296257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 403
Target Start/End: Original strand, 13911046 - 13911292
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 259  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||| |||     
T  13911046 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 13911145  T
Q  260 aaatggatgaatttgac---atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatc 356  Q
     ||| | |||||||  |   | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| ||     
T  13911146 caattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 13911245  T
Q  357 gtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgtt 403  Q
      |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13911246 tcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattgtt 13911292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 447 - 500
Target Start/End: Original strand, 15441717 - 15441770
Alignment:
Q  447 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15441717 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 15441770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 447 - 500
Target Start/End: Original strand, 30262282 - 30262335
Alignment:
Q  447 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30262282 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 30262335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 126818 - 126738
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  126818 agaatcataggagcaaaaatgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 126738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 32493898 - 32493978
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  32493898 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 32493978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 447 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 11516337 - 11516284
Alignment:
Q  447 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11516337 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgagtatatgttatgattgtggttgat 11516284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 1936869 - 1936949
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  1936869 agaatcatagaagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatcat 1936949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 169
Target Start/End: Original strand, 14113989 - 14114031
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatat 169  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14113989 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14114031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 169
Target Start/End: Original strand, 14423639 - 14423681
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatat 169  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14423639 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 111121 - 111201
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  111121 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaaaagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 111201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 432
Target Start/End: Original strand, 15822691 - 15822723
Alignment:
Q  400 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15822691 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 15822723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 347 - 421
Target Start/End: Original strand, 25292560 - 25292633
Alignment:
Q  347 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    |||||| || | |||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25292560 atgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttaatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 25292633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 432
Target Start/End: Original strand, 17224075 - 17224230
Alignment:
Q  277 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 375  Q
    ||||||| |||||||||   || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||   |||||| |||| | |||||||| ||| |||||    
T  17224075 atgttgttgttgaattgttgtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttaatgatgattcatggcttgggtattcataattca 17224174  T
Q  376 tggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
    ||  ||| |||||| ||  ||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  17224175 tgatttgttgatgagaa-atgagttgttgttggtggttttgtaaaattggtgaattg 17224230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 127 - 500
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37440
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 325  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 37265  T
Q  326 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37266 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 37365  T
Q  426 tgaattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 500  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  37366 tgaattgatgaaatatgataagtttttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttgtgattgtggttgat 37440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 41712 - 41632
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  41712 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 41632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 3 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 41394610 - 41394191
Alignment:
Q  3 tggagaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaatt 101  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  41394610 tggagaatcataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaatt 41394511  T
Q  102 ttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  41394510 ttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatg 41394411  T
Q  202 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctat 299  Q
    ||||||||| |  || |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | |||   ||||| | |    
T  41394410 attgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttatgttgagattt 41394311  T
Q  300 gattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaa-tttgaa 398  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41394310 gattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaattttgaa 41394211  T
Q  399 ttgttgttggtgttttggtg 418  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  41394210 ttgttgttggtgttttggtg 41394191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 20446019 - 20445646
Alignment:
Q  54 taaggtaaggg-gttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttg 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| |    
T  20446019 taaggtaagggagttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 20445920  T
Q  150 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 249  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || || | | |||||| ||||  ||    
T  20445919 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtg 20445820  T
Q  250 aaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 347  Q
    ||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | || |||| ||||||||||||||    
T  20445819 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttga 20445720  T
Q  348 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20445719 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 20445646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 66 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 20531770 - 20531411
Alignment:
Q  66 ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttga 163  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  20531770 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaaatgtga 20531671  T
Q  164 tgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaa 262  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || || | | |||||| ||||  ||||||||||||  ||    
T  20531670 taatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaa 20531571  T
Q  263 tggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttg 361  Q
    | | |||| ||||  | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  20531570 ttggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttg 20531471  T
Q  362 ggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20531470 ggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 20531411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 20931682 - 20931312
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20931682 taaggtaagggggttagcctttatcataatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaagtttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 20931583  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  20931582 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20931483  T
Q  253 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 350  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  |  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  20931482 attgtgctaaattggtgaattttgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 20931383  T
Q  351 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    || ||   |||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20931382 ataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 20931312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 54 - 432
Target Start/End: Original strand, 20893551 - 20893933
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  20893551 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgt-aattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattctt 20893649  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  20893650 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 20893749  T
Q  251 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 348  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||  |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||||| ||||||    
T  20893750 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgat 20893849  T
Q  349 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20893850 gaatcattgtttgggtatgcatattcataaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttgaagaaatttgtgaattg 20893933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 20913367 - 20913004
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  20913367 taaggtaagggggttagtctttatcgtaatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaattttgcttacggataattgttgctaaattcgtgc 20913268  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  20913267 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20913168  T
Q  253 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 350  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||      |||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||| |||| ||||||||    
T  20913167 attgtgctcaattggtgaattttgcaaagttgttgtt-aatt------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttgatga 20913075  T
Q  351 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    || || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20913074 ataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 20913004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Original strand, 37844374 - 37844746
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  37844374 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 37844473  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtta-tg 249  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || || | | |||||| ||  || ||    
T  37844474 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtg 37844573  T
Q  250 aaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 347  Q
    ||||||||||  |||  ||||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||    
T  37844574 aaaattgtgctcaattaatgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttga 37844673  T
Q  348 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||| |||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  37844674 tgagtcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaa-tgttgttggtgttttgatgaaa 37844746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 127 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452589
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 292  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 51452589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 177 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 22228022 - 22227777
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg-caaatggatgaatttga 275  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||| | |||||||      
T  22228022 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttg 22227923  T
Q  276 c-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattc 374  Q
    | | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||    
T  22227922 ctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 22227823  T
Q  375 atggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22227822 atggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 22227777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 177 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 22232719 - 22232474
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg-caaatggatgaatttga 275  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||| | |||||||      
T  22232719 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttg 22232620  T
Q  276 c-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattc 374  Q
    | | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||    
T  22232619 ctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 22232520  T
Q  375 atggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22232519 atggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 22232474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 2116484 - 2116228
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  2116484 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 2116385  T
Q  261 -aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctat-gattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 357  Q
     ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||||  | | ||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  2116384 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattg 2116285  T
Q  358 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 414  Q
     |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2116284 cttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 2116228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 45051652 - 45051554
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  45051652 tgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 45051554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 21860414 - 21860334
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  21860414 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 21860334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 44034829 - 44034903
Alignment:
Q  12 ataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  44034829 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 44034903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 447 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 51452602 - 51452557
Alignment:
Q  447 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51452602 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 51452557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 421
Target Start/End: Original strand, 18601140 - 18601402
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 259  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||     
T  18601140 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgct 18601239  T
Q  260 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 357  Q
     ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | |||  | |  || |||||| || |    
T  18601240 caattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattg 18601339  T
Q  358 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  18601340 cttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaattagagttg-tgttggtgttttggtgaaa 18601402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 45051496 - 45051416
Alignment:
Q  334 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 414  Q
    |||||| | ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45051496 gatgttattgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 45051416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 421
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072672
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 335  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 5072587  T
Q  336 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    |  | |  || |||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  5072588 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaattagagttg-tgttggtgttttggtgaaa 5072672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 41218808 - 41218749
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41218808 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggg 41218749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 49967638 - 49967607
Alignment:
Q  400 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49967638 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 49967607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20254389 - 20254308
Alignment:
Q  311 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaa 392  Q
    |||||||||||||| |||| | | ||||||| || | ||||| ||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  20254389 aattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaa 20254308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 13376711 - 13376763
Alignment:
Q  13 taggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  13376711 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 13376763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 310 - 389
Target Start/End: Original strand, 22143531 - 22143611
Alignment:
Q  310 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatga 389  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  22143531 caattgatgttgttgctgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgatgatga 22143611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 27675191 - 27675139
Alignment:
Q  13 taggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27675191 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggagataattaaggtaagggg 27675139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 432
Target Start/End: Original strand, 19794581 - 19795011
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttc 104  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  19794581 agaatcataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtaaattt-c 19794679  T
Q  105 aaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19794680 aaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtcgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatga 19794779  T
Q  203 ttgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatg 300  Q
    |||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||    
T  19794780 ttgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatg 19794879  T
Q  301 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaatt 400  Q
    |||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19794880 attcttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaatt 19794979  T
Q  401 gttgttggtg-ttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19794980 tttgttggtgtttttggtgaaa-ttgtgaattg 19795011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 421
Target Start/End: Original strand, 43642833 - 43643250
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttc 104  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43642833 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttc 43642932  T
Q  105 aaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  43642933 aaatgttgtatgaatttttgcatagtggataattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatga 43643032  T
Q  203 ttgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat-gttgtagttgaattgagctatg 300  Q
    |||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | |||||  || | ||||| ||||    
T  43643033 ttgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttttcttagttgttattaatttgagatatg 43643132  T
Q  301 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaatt 400  Q
    |||||||| ||||||||| | ||| || |||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||       
T  43643133 attcttgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgataatttga--- 43643229  T
Q  401 gttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    | ||||||||||||| |||||    
T  43643230 gatgttggtgttttgatgaaa 43643250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Original strand, 36982364 - 36982737
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttg 149  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| |    
T  36982364 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 36982463  T
Q  150 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| |||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||    
T  36982464 tgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 36982563  T
Q  250 aaaattgtgca-aatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 347  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||    
T  36982564 aaaattgtgctcaattggtgaattttgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttga 36982663  T
Q  348 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  36982664 tgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattattgttggtgttttagtgaaa 36982737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 421
Target Start/End: Original strand, 20627190 - 20627609
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-tttt 103  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  20627190 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaaatttt 20627289  T
Q  104 caaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgat 203  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  20627290 caaatattgtatgaattatgattatggataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgat 20627389  T
Q  204 tgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatga 301  Q
    ||||||| | ||| |||||  ||||||||| |||||| || || ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | | |    
T  20627390 tgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttaa 20627489  T
Q  302 ttcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg 401  Q
    ||||||| |||||||| || | | || |||| | |||||| ||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||    
T  20627490 ttcttgttcaattgattttatggttgttaattggtgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatgataatttgagatg 20627589  T
Q  402 ttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  20627590 ttgttggtgttttgatgaaa 20627609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 463075 - 462706
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  463075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 462976  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  462975 tccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 462876  T
Q  253 attgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 349  Q
    ||||||  ||| ||| |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||| ||  ||||||    
T  462875 attgtgttcaattgg-tgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattgatg 462777  T
Q  350 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  462776 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggataagaatttgaa-tgttgttggtgttttgatgaaa 462706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 8891574 - 8891209
Alignment:
Q  60 aaggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaa 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8891574 aaggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaa 8891475  T
Q  158 ctttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgt 257  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||    
T  8891474 ctgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 8891375  T
Q  258 gc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcat 355  Q
    ||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  8891374 gctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatgaatcat 8891275  T
Q  356 cgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
     | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8891274 tgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaatggttgttggtgttttggtgaaa 8891209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 54 - 417
Target Start/End: Original strand, 24341309 - 24341681
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  24341309 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 24341408  T
Q  147 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 246  Q
    |  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||  ||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  24341409 tcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 24341508  T
Q  247 atgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagt 344  Q
     ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||   ||    
T  24341509 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgt 24341608  T
Q  345 tgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 417  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24341609 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattattgttggtgttttggt 24341681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 127 - 292
Target Start/End: Original strand, 19689401 - 19689567
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19689401 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 19689500  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 292  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19689501 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 19689567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 127 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820168
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 292  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 23820168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 127 - 292
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906606
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 292  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 14906606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 127 - 414
Target Start/End: Original strand, 25265390 - 25265679
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  25265390 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 25265489  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 324  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  25265490 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 25265589  T
Q  325 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 414  Q
     || |||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25265590 ttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 25265679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 127 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015108
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 292  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20015108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 177 - 418
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508138
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaatttg 274  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattgg-tgaatttg 7507992  T
Q  275 ac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgc-aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatat 372  Q
     | | ||||| ||| ||||||| |||||||| |||   |||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  7507993 gctaagttgttgtt-aattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatat 7508091  T
Q  373 tcatggattgatgatgaaaa-tttgaattgttgttggtgttttggtg 418  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7508092 tcatggattgatgatgaaaattttgaattgttgttggtgttttggtg 7508138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396784
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 17396784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 421
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886945
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | || |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaatg-gatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 335  Q
    || |||||||||| ||||||| || | | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19886860  T
Q  336 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19886861 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 19886945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22284358 - 22284278
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22284358 agaatcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22284278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22863267 - 22863171
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatt 147  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||    
T  22863267 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaatt 22863171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22275125 - 22275045
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  22275125 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatcat 22275045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 15633617 - 15633538
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatca 84  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15633617 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatca 15633538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 447 - 492
Target Start/End: Original strand, 19689554 - 19689599
Alignment:
Q  447 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689554 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 19689599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 492
Target Start/End: Original strand, 14906593 - 14906638
Alignment:
Q  447 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 492  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14906593 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattg 14906638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20015121 - 20015076
Alignment:
Q  447 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 492  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20015121 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattg 20015076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 23820181 - 23820136
Alignment:
Q  447 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 492  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23820181 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattg 23820136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 421
Target Start/End: Original strand, 17396887 - 17396948
Alignment:
Q  359 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17396887 ttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 17396948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 392
Target Start/End: Original strand, 19669279 - 19669362
Alignment:
Q  310 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatgaaaa 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||    
T  19669279 caattgatgttgttgttgctaagtgatgttattgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaactgatgatgaaaa 19669362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 9636821 - 9636761
Alignment:
Q  311 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 371  Q
    |||||||||||||| || ||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  9636821 aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagtttgggtattcata 9636761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19660273 - 19660217
Alignment:
Q  13 taggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaaggggttag 69  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19660273 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaaggggttag 19660217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 310 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 19666605 - 19666525
Alignment:
Q  310 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatga 389  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  19666605 caattgatgttgttgttgctaagtgatattgtcgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgttttgatgatga 19666525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24884762 - 24884718
Alignment:
Q  311 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcat 355  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  24884762 aattgatgttgttgttgctaatagatattgttgttgatgattcat 24884718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 400 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 32465845 - 32465813
Alignment:
Q  400 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32465845 tgttgttggtgttttggtgaaatttatgaattg 32465813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1091
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||    
T  1462 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttcttatggataattgttgctaaattcgtg 1363  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 251  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  1362 ctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 1263  T
Q  252 aattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 349  Q
    ||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||| |||| |||||||    
T  1262 aattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggttgatg 1163  T
Q  350 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||| || | |||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1162 aataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Original strand, 3508 - 3877
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  3508 taaggtaagggggttagtctttgtcataatcatcttcattttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttgattatagataattgttgctaaattcgtgc 3607  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  3608 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 3707  T
Q  253 attgtg--caaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 350  Q
    ||||||  ||| |||   | ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  |||| ||    
T  3708 attgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgagga 3807  T
Q  351 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    || || | |||||||| |||||| |||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3808 ataattgcttgggtatgcatattgatggattgatgaggagagtttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 3877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 48935 - 48565
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  48935 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 48836  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  48835 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaa 48736  T
Q  253 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 350  Q
    |||||||  | | | |||| ||||  | ||||| | |  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||||||| ||||||||    
T  48735 attgtgctcagttggtgaattttgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatga 48636  T
Q  351 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48635 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 48565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 36323 - 36065
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 259  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| ||| || | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||     
T  36323 tgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 36224  T
Q  260 aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 357  Q
    |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| |||| |||||| |  ||| || | |||  | |  ||||||||| || |    
T  36223 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattg 36124  T
Q  358 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 417  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  36123 cttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttatggt 36065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 53 - 421
Target Start/End: Original strand, 36836 - 37209
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttg 149  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||| |    
T  36836 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcg 36935  T
Q  150 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||    
T  36936 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 37035  T
Q  250 aaaattgtgc-aaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 347  Q
    |||||||||| |||| | |||||||  | | ||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||| | | || |||| |||||||| |||||    
T  37036 aaaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttga 37135  T
Q  348 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37136 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 37209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Original strand, 15319 - 15378
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15319 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgggctaatagttggagataattaaggtaagggg 15378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 62 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 19537 - 19173
Alignment:
Q  62 ggggttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaac 158  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19537 ggggttagtcttcatcataatcatcataatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaac 19438  T
Q  159 tttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg 258  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  19437 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 19338  T
Q  259 c-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatc 356  Q
    |  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||     
T  19337 ctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcatt 19238  T
Q  357 gtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19237 gcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattattgttggtgttttggtgaaa 19173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 127 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21257
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||    
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 324  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattg 21354  T
Q  325 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21353 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattattgttggtgttttggtgaaa 21257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23153786 - 23153403
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| ||||||| ||    
T  23153786 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcgt 23153687  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  23153686 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 23153587  T
Q  251 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 348  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||||| || | | || |||| |||||||| ||||||    
T  23153586 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttgat 23153487  T
Q  349 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23153486 gaatcattacttgggtatacatattcatgaattaaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 23153403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 98 - 414
Target Start/End: Original strand, 14626089 - 14626407
Alignment:
Q  98 aattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtg 197  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  14626089 aattctcaaatgttgtttgaattgtgattatggataattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 14626188  T
Q  198 tatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaat--tgtgcaaatggatgaatt-tgacatgttgtagttgaattga 294  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||  | ||||| ||| | ||||    
T  14626189 tatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtgcaattgg-tgaattatgctaagttgttgttaacttga 14626287  T
Q  295 gctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatt 394  Q
    | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  14626288 gatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatt 14626387  T
Q  395 tgaattgttgttggtgtttt 414  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14626388 tgaattgttgttggtgtttt 14626407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 127 - 421
Target Start/End: Original strand, 35009439 - 35009735
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  35009439 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 35009538  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 324  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  35009539 ttatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 35009638  T
Q  325 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35009639 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattattgttggtgttttggtgaaa 35009735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 418
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1658040
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 324  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||  | | ||| | || |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattgt-gaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattg 1657946  T
Q  325 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 418  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1657947 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaataggtgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 1658040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 127 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862443
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 324  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||    
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttc-atttatgttattg 15862537  T
Q  325 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 418  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862536 ctgataattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaataggtgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 15862443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 139 - 414
Target Start/End: Original strand, 1650105 - 1650382
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||  |||    
T  1650105 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaat 1650204  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 336  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||    
T  1650205 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgat 1650304  T
Q  337 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 414  Q
    ||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1650305 gttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 1650382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 285 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 27740941 - 27740808
Alignment:
Q  285 gttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 384  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |  ||   |||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27740941 gttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtggttgctattatctgatgttgttgtggatgaatcatggtttgggtatgcatattcatgaattgat 27740842  T
Q  385 gatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 418  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27740841 gatgaaaatttgaattggtgttggtgttttggtg 27740808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 167 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 25175787 - 25175531
Alignment:
Q  167 tatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatgg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| |    
T  25175787 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 25175688  T
Q  266 atgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttggg 363  Q
     |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||    
T  25175687 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 25175588  T
Q  364 tatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25175587 tatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 25175531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 421
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654267
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 335  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| | | ||||||| |  ||| || | ||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttga 27654182  T
Q  336 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27654183 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatgagaatttgaattg-tgtcggtgttttggtgaaa 27654267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23148335 - 23148266
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt 122  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23148335 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 23148266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 19983144 - 19983224
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  19983144 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 19983224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 35015009 - 35015089
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  35015009 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 35015089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 432
Target Start/End: Original strand, 18381821 - 18381975
Alignment:
Q  278 tgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcat 376  Q
    |||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||    
T  18381821 tgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcat 18381920  T
Q  377 ggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
    |  ||| |||||| ||  ||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  18381921 gatttgttgatgagaa-atgagttgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattg 18381975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 421
Target Start/End: Original strand, 16825986 - 16826038
Alignment:
Q  368 catattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16825986 catattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 16826038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27751688 - 27751605
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggt 210  Q
    |||||| | ||| |||||||| |||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  27751688 atggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggt 27751605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18583720 - 18583640
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  18583720 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 18583640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 407
Target Start/End: Original strand, 22361926 - 22362032
Alignment:
Q  301 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatgaaaatttgaat 399  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||| | ||| ||||||| ||||||||||| || |||| |    
T  22361926 attcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatgagaa-ttgagt 22362024  T
Q  400 tgttgttg 407  Q
    ||||||||    
T  22362025 tgttgttg 22362032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 29666137 - 29665937
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt-- 224  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||| | || ||||| ||| ||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||      
T  29666137 atggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttca 29666038  T
Q  225 aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 322  Q
    || |||| | |||||  |||||||| ||||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| |||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  29666037 aagtatgcataaatgtcaagttatg-aaattgtactcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgttgt 29665939  T
Q  323 tg 324  Q
    ||    
T  29665938 tg 29665937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 32898774 - 32898745
Alignment:
Q  403 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32898774 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 32898745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21623278 - 21623123
Alignment:
Q  277 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 375  Q
    ||||||| ||||||||| | || || || ||| | ||||||||||||| ||||||  |||||||  ||| |||| |||| | |||||||| ||| |||||    
T  21623278 atgttgttgttgaattgtggtaagaatcatgttctattgatgttgttgttgctaagtgatgttgatgttaatgagtcatggcttgggtattcataattca 21623179  T
Q  376 tggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
    ||  |||  ||||||||  ||| |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||    
T  21623178 tgatttgtggatgaaaa-atgagttgttgttggtagtttggtaaaattggtgaattg 21623123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 341
Target Start/End: Original strand, 25367374 - 25367438
Alignment:
Q  277 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 341  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  25367374 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 25367438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 310 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 33324770 - 33324690
Alignment:
Q  310 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatga 389  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||    
T  33324770 caattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatga 33324690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 310 - 389
Target Start/End: Original strand, 35136182 - 35136262
Alignment:
Q  310 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatga 389  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||    
T  35136182 caattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatga 35136262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 23507302 - 23506932
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23507302 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatctccattttgtaagatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 23507203  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  23507202 tccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 23507103  T
Q  253 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 350  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  23507102 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 23507003  T
Q  351 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    || || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507002 ataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 23506932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 432
Target Start/End: Original strand, 27182471 - 27182854
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  27182471 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 27182570  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  27182571 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 27182670  T
Q  251 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 348  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||    
T  27182671 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 27182770  T
Q  349 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
    ||||||| | ||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27182771 gaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttttgaattg 27182854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 413
Target Start/End: Original strand, 18530988 - 18531355
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatc---atcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaat-tttgattat-ggatgattgttgctaaatt 147  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||    
T  18530988 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcgtcatcatcattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaaatt 18531087  T
Q  148 tgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtta 247  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| ||||||     
T  18531088 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 18531187  T
Q  248 tgaaaattgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagt 344  Q
    |||||||||||  ||| ||| |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||    
T  18531188 tgaaaattgtgttcaattgg-tgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 18531286  T
Q  345 tgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttt 413  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18531287 tgatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttt 18531355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 417
Target Start/End: Original strand, 22053753 - 22054125
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat--tttgtgaa--ttttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  22053753 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgaaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 22053852  T
Q  147 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 246  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  22053853 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 22053952  T
Q  247 atgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagt 344  Q
     ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||    
T  22053953 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 22054052  T
Q  345 tgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 417  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22054053 tgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 22054125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 127 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623066
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 292  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20623066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 127 - 292
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233694
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 292  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 21233694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 127 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052844
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttga 289  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 37052844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 127 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536294
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 292  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16536294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 127 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939248
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 324  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||  | | ||  | || |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagtcattgt-gaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattg 34939342  T
Q  325 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 418  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34939341 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaataggtgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 34939248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 129 - 292
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900571
Alignment:
Q  129 ggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaat 228  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  229 atgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 292  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-ttgacatgttgttgttgaatt 25900571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 139 - 421
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366765
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 335  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 22366680  T
Q  336 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22366681 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 22366765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 139 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426596
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaatg-gatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 335  Q
    || |||||||||| ||||||| || | | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25426681  T
Q  336 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25426680 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 25426596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 421
Target Start/End: Original strand, 18778014 - 18778276
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 259  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||     
T  18778014 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 18778113  T
Q  260 aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 357  Q
    |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||  || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  18778114 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatattatgattgatgaataattg 18778213  T
Q  358 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18778214 cttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 18778276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12342
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | || |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaatg-gatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 335  Q
    || |||||||||| ||||||| || | | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 12427  T
Q  336 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12426 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 12342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19499867
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaatg-gatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 335  Q
    || |||||||||| ||||||| || | | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19499952  T
Q  336 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    | || |  ||||| ||| || | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19499951 tattatgattgattaataattgctttggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 19499867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 421
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073879
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgcaaatg-gatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 335  Q
    || |||||||||| ||||||| || | | |||||||    |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttga 21073794  T
Q  336 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21073795 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 21073879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 402
Target Start/End: Original strand, 4200007 - 4200251
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 259  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||| |||     
T  4200007 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 4200106  T
Q  260 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 357  Q
    |||| | |||||||  |  ||||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  4200107 aaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaatgattg 4200206  T
Q  358 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgt 402  Q
     |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4200207 cttgggtttgcatattcatgggttgatgatgagaatttgaattgt 4200251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 347 - 431
Target Start/End: Original strand, 17471803 - 17471887
Alignment:
Q  347 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 431  Q
    ||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17471803 atgaatcattgcttgggtacgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaattggtgaatt 17471887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 27010071 - 27009809
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |     
T  27010071 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtact 27009972  T
Q  260 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 357  Q
     ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  || |||||| || |    
T  27009971 caattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattg 27009872  T
Q  358 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
     |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27009871 cttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 27009809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188404
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || ||||| ||||||| ||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgc 29188404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 421
Target Start/End: Original strand, 43443417 - 43443679
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 259  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||     
T  43443417 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgct 43443516  T
Q  260 aaatggatgaatt--tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 357  Q
     ||| | ||||||  |   | ||||| ||||| ||||| | ||| |||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  43443517 caattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 43443616  T
Q  358 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
     |||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43443617 cttgggtttgcatattcatggattgatgatgaggatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 43443679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 447 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20623079 - 20623026
Alignment:
Q  447 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20623079 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 20623026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 447 - 500
Target Start/End: Original strand, 21233681 - 21233734
Alignment:
Q  447 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21233681 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 21233734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 341 - 414
Target Start/End: Original strand, 29190479 - 29190552
Alignment:
Q  341 tagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 414  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29190479 tagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 29190552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 492
Target Start/End: Original strand, 25900558 - 25900603
Alignment:
Q  447 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 492  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25900558 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattg 25900603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 37052854 - 37052801
Alignment:
Q  447 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgat 500  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37052854 gttgttgttgagttatgatggagggtatgattatatgttatgattgtggttgat 37052801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 447 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16536307 - 16536262
Alignment:
Q  447 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 492  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16536307 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattgtatgttatgattg 16536262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 23494029 - 23493916
Alignment:
Q  277 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 375  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| | |||||| | ||| |||||    
T  23494029 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattca 23493930  T
Q  376 tggattgatgatga 389  Q
    ||  ||||||||||    
T  23493929 tgatttgatgatga 23493916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 11584448 - 11584394
Alignment:
Q  11 cataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11584448 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 11584394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7728530 - 7728466
Alignment:
Q  277 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 341  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  7728530 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 7728466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 42066 - 41686
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  42066 taaggtaagggggttggtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 41967  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||||||||| | ||| |||| | ||||||||| |||||| || || |||||    
T  41966 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaa 41867  T
Q  253 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 350  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||| | | | || |||| | |||||||| ||||||    
T  41866 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatgatga 41767  T
Q  351 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41766 atcattggttgggtatgcatattcatgaattgattattagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa-ttgtgaattg 41686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Original strand, 882 - 1250
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 981  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||    
T  982 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 1081  T
Q  253 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 350  Q
    |||||||  ||| |||||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | | |||||||| ||| ||||||| | |||| ||||  ||||| |  |||||||    
T  1082 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 1180  T
Q  351 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    || || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1181 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgtt-ttggtgttttggtgaaa 1250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Original strand, 128095 - 128464
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  128095 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 128194  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |  ||  ||||| |||||    
T  128195 ttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaa 128294  T
Q  253 attgtg--caaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 350  Q
    ||||||  ||| |||   | ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  |||||||    
T  128295 attgtgctcaattggcgaattttgttaggttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatga 128393  T
Q  351 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    || || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  128394 ataattgattgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 128464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 402
Target Start/End: Original strand, 31697 - 31942
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 259  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| ||| || | ||||| | |||||| |||||||||| ||| |||     
T  31697 tgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 31796  T
Q  260 aaatggatgaatttgac---atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatc 356  Q
     ||| | |||||||  |   | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || |  || || |  ||||||||| ||     
T  31797 caattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataatt 31896  T
Q  357 gtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgt 402  Q
    | |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  31897 gcttgggtttgcatattcatggattaatgatgagaatttgaattgt 31942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 400 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22678 - 22650
Alignment:
Q  400 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtga 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22678 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtga 22650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6358
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5990 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 6089  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| | ||||| | |||    
T  6090 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaa 6189  T
Q  253 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 350  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| | |||| ||||   |||| |  |||||||    
T  6190 attgtgctgaattggtgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattgatga 6288  T
Q  351 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    || || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6289 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 6358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Original strand, 247366 - 247738
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||    
T  247366 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 247465  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  247466 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 247565  T
Q  251 aaattgtg--caaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 348  Q
    ||||||||  ||| |||   | ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||||| ||||||    
T  247566 aaattgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgat 247665  T
Q  349 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  247666 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaactgaggatgagaatttgaatggttgttggtgttttggtgaaa 247738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Original strand, 123087 - 123460
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttg 149  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| |    
T  123087 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcataatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 123186  T
Q  150 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 249  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||    
T  123187 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 123286  T
Q  250 aaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 347  Q
    ||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  ||| || |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||    
T  123287 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttga 123386  T
Q  348 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||||| || | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123387 tgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 123460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 400 - 432
Target Start/End: Original strand, 255074 - 255106
Alignment:
Q  400 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  255074 tgttgttggtgttttcgtgaaatttgtgaattg 255106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 400 - 432
Target Start/End: Original strand, 261680 - 261712
Alignment:
Q  400 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  261680 tgttgttggtgttttcgtgaaatttgtgaattg 261712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 54 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 172242 - 171863
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||  ||||    
T  172242 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 172143  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  172142 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 172043  T
Q  253 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 350  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  172042 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 171943  T
Q  351 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 431  Q
    ||||| | || ||||| ||||||||||  ||| || | || |  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  171942 atcattgcttaggtatgcatattcatgatttgttg-ttaagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 171863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 54 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 177945 - 177566
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||  ||||    
T  177945 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 177846  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  177845 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 177746  T
Q  253 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 350  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  177745 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 177646  T
Q  351 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 431  Q
    ||||| | || ||||| ||||||||||  ||| || | || |  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  177645 atcattgcttaggtatgcatattcatgatttgttg-ttaagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 177566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 432
Target Start/End: Original strand, 70882 - 70914
Alignment:
Q  400 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70882 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 70914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12083
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaatttgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  12450 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttaattttgt-aactttcaaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 12352  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 251  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | | | ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||    
T  12351 ctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaa 12252  T
Q  252 aattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 349  Q
    |||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||  ||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  || |||    
T  12251 aattgtgctaaattggtgaattttgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattcatg 12154  T
Q  350 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12153 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttagtgaaa 12083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 63 - 421
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5356
Alignment:
Q  63 gggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaacttt 161  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  4996 gggttagtctttatcataatcattatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatggataattgttgctaaattcgtactccaactgt 5095  T
Q  162 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-a 260  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| | | | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||      
T  5096 gacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 5195  T
Q  261 aatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtt 359  Q
    ||| | |||| ||||  | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||||||  |||||||||||| | |    
T  5196 aattggtgaattttgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgct 5295  T
Q  360 tgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  5296 tgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaa-tgttgttggtgttttgatgaaa 5356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 9180 - 8820
Alignment:
Q  65 gttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaatttgtgctccaac 158  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| ||||| |||||   ||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  9180 gttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccatc 9081  T
Q  159 tttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg 258  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  9080 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtg 8981  T
Q  259 ca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatc 356  Q
    |  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||| |  |||| |||||||| |||||||||||||     
T  8980 ctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttgttgatgaatcatt 8881  T
Q  357 gtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 417  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8880 gcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaatttttgttggtgttttggt 8820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 95 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 149018 - 148688
Alignment:
Q  95 gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataat 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||   || || ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  149018 gtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataattgataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgat 148919  T
Q  193 aagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaa 290  Q
    || |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| |     
T  148918 aattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaat 148819  T
Q  291 ttgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaa 390  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| || ||||| ||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  148818 ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatgag 148719  T
Q  391 aatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148718 aatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 148688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 146938 - 146844
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatt 147  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  146938 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttcctaaatt 146844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 9215 - 8846
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  9215 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtacgaattttgcttatggaaaattgttgctaaattcgtgc 9116  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||  | ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| || |||||| |||||  ||||| |||||    
T  9115 tccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaa 9016  T
Q  253 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 350  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  |||||||    
T  9015 attgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatga 8916  T
Q  351 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    || || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8915 ataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 8846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Original strand, 26340 - 26710
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaatttgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| || |||||||||||||| |||    
T  26340 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatgtataattgttgctaaattcgtg 26439  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||| | | | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  26440 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 26539  T
Q  252 aattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 349  Q
    |||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||||||  ||||||    
T  26540 aattgttctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatg 26639  T
Q  350 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    |||||| | |||||||| |||||| ||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  26640 aatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatgagaatttg-agtgttgttggtgttttgatgaaa 26710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 127 - 414
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8466
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | ||| || ||| ||    
T  8180 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaa 8279  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 324  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  |||||   ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  8280 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgtt---gttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 8376  T
Q  325 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 414  Q
     || |||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8377 ttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatatacatgaattgatgatgagaatttgaattgttgctggtgtttt 8466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 272362 - 271983
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | |||||||||  || |    
T  272362 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatattgtataaattttgattatggataaatattgctaaatacgtac 272263  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||  | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  272262 tccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 272163  T
Q  253 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 350  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  272162 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatga 272063  T
Q  351 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 431  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| |||| | ||  | |  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  272062 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattg-ttatagagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattagtgaatt 271983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 66 - 259
Target Start/End: Original strand, 51121 - 51314
Alignment:
Q  66 ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatg 165  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  51121 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatg 51220  T
Q  166 atatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  51221 atatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 51314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 127 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26892
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 292  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 26892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 134 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22796 - 22637
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||     
T  22796 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtg 22697  T
Q  234 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 292  Q
     |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22696 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 22637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22650 - 22605
Alignment:
Q  447 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 492  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22650 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattg 22605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 26905 - 26860
Alignment:
Q  447 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 492  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26905 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattg 26860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 127 - 292
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1748
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 292  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 1748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 492
Target Start/End: Original strand, 1735 - 1780
Alignment:
Q  447 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 492  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1735 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattg 1780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 134 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 48443 - 48155
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  48443 attgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 48344  T
Q  234 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 331  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  48343 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaa 48244  T
Q  332 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48243 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 48155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 108003 - 107715
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 233  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| || |    
T  108003 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgca 107904  T
Q  234 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 331  Q
     |||||| ||||| | ||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  107903 aaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 107804  T
Q  332 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    | ||||||||  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  107803 ttgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 107715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 196 - 421
Target Start/End: Original strand, 64585 - 64812
Alignment:
Q  196 tgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaatt 292  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||    
T  64585 tgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaattt 64684  T
Q  293 gagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaa 392  Q
    ||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  || |||||| || | |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||    
T  64685 gagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaa 64784  T
Q  393 tttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  64785 tttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 64812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 184
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  142 taaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 127 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 13769 - 13480
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  13769 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13670  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 324  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  13669 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 13570  T
Q  325 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 414  Q
     || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  13569 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatgaattgacgatgagaatttgaatttttgtaggtgtttt 13480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 42754 - 42677
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  42754 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagata---aaggtaagggggttagtttttatcataatcat 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 127 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 41911 - 41622
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  41911 atggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 323  Q
     |||||| ||||| |||||| |||||||||||  ||| ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||    
T  41811 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattgg-tgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 41713  T
Q  324 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 414  Q
    | || |||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41712 gttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 41622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 127 - 419
Target Start/End: Original strand, 534 - 828
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 324  Q
    ||| | | ||||||  |||| |||||||||| |  ||| | |||| ||||  | |||   |||  ||| || ||||||||||||  |||||||||| | |    
T  634 ataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattttgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatgg 733  T
Q  325 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtga 419  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  734 ctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatgagaatttgaatggttgttggtgttttggtga 828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 127 - 418
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34755
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgc-aattgatgttgtt 323  Q
     | |||| ||||  |||||| |||||||||| |  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| |||   |||||||||| ||    
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttatt 34659  T
Q  324 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaa-tttgaattgttgttggtgttttggtg 418  Q
    | || || | |||||||| ||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34660 gttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaattttgaattgttgttggtgttttggtg 34755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 89378 - 89586
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||    
T  89378 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 89477  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||| | ||||| |||    
T  89478 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtga 89577  T
Q  251 aaattgtgc 259  Q
    |||||||||    
T  89578 aaattgtgc 89586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 178
Target Start/End: Original strand, 107708 - 107835
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatttgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||| ||    
T  107708 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataatttttgctaaattcgt 107807  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatg 178  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  107808 gctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 414
Target Start/End: Original strand, 9371 - 9626
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  9371 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 9470  T
Q  261 -aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 358  Q
     ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |     
T  9471 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 9570  T
Q  359 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 414  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9571 ttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 9626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 414
Target Start/End: Original strand, 16269 - 16524
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  16269 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 16368  T
Q  261 -aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 358  Q
     ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |     
T  16369 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 16468  T
Q  359 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 414  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16469 ttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 16524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 138 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 2936
Alignment:
Q  138 ttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 237  Q
    |||||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| |||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  238 tgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgttgatgctaatag 334  Q
    || |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||| || || | |    
T  3115 tgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttg 3016  T
Q  335 atgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 414  Q
    ||||||| ||||||||||||  | ||| |||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3015 atgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 2936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 290 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9480 - 9338
Alignment:
Q  290 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatga 389  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9480 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatga 9381  T
Q  390 aaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9380 gaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaaatggtgaattg 9338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 177 - 421
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5498
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaatttg 274  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||     
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattgg-tgaatttt 5352  T
Q  275 acat-gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatatt 373  Q
     |   ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||||||||  || |||||| || | |||||| | ||||||    
T  5353 gctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatatt 5451  T
Q  374 catggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5452 catggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 5498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5785 - 5660
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  5785 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgta 5686  T
Q  234 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
     |||||| |||| ||||| |||||||    
T  5685 aaaatgataagtcatgaatattgtgc 5660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 177 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3690
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa-tgagaagttatgaaaattgtg-caaatggatgaatttg 274  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||| | ||| | |||||||     
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaatttt 3837  T
Q  275 ac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatatt 373  Q
     | | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| ||   |||||| | ||||||    
T  3836 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatatt 3737  T
Q  374 catggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3736 catggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttgatgttttggtgaaa 3690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 162 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 43226 - 42965
Alignment:
Q  162 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-a 260  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  43226 gatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgcta 43127  T
Q  261 aatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 358  Q
    ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |     
T  43126 aattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 43027  T
Q  359 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43026 ttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttaaattg-tgttggtgttttggtgaaa 42965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 421
Target Start/End: Original strand, 14083 - 14344
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 259  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||     
T  14083 tgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgct 14182  T
Q  260 aaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 358  Q
     ||| | |||||||  | | ||||| | | | ||||| |  ||||||||| ||||| ||||| |  ||| |  | |||||| |  ||||||||| || |     
T  14183 caattggtgaattttcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataattgc 14282  T
Q  359 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14283 ttgagtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 14344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 421
Target Start/End: Original strand, 21138 - 21399
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 260  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||     
T  21138 tgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgagct 21237  T
Q  261 -aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 358  Q
     ||| | |||||||  | | ||||| ||| | ||||| |  ||||||||| ||||||||||| |  ||| || | |||||| |  ||||||||| || |     
T  21238 caattggtgaattttcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttgatgttatgattgatgaataattgc 21337  T
Q  359 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21338 ttgagtttgcatattcatggattaatgatgaaaatttgaactg-tgttggtgttttggtgaaa 21399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 265 - 3
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||     
T  265 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgtgct 166  T
Q  260 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 357  Q
     ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  || |||||| || |    
T  165 caattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattg 66  T
Q  358 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
     |||||| | |||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  65 cttgggtttgcatattcatgaattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 259
Target Start/End: Original strand, 13347 - 13445
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  13347 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 13445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 299 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 48603 - 48482
Alignment:
Q  299 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 398  Q
    |||||||||| || |||||||| | |||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48603 tgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 48504  T
Q  399 ttgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||| ||||||||||||| |||||    
T  48503 ttg-tgttggtgttttgatgaaa 48482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 299 - 421
Target Start/End: Original strand, 26 - 147
Alignment:
Q  299 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 398  Q
    |||||||||| ||| |||| || |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26 tgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 125  T
Q  399 ttgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  126 ttgtt-ttggtgttttggtgaaa 147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 80267 - 80187
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  80267 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 177 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 54630 - 54415
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa--tatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaattt 273  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| ||||||| ||  |||||| |||||  ||||||||||| |||| |  ||| | |||||||    
T  54630 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaa-ttgtactcaattggtgaattt 54532  T
Q  274 -gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatat 372  Q
     || ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| || | ||||||||   ||||||||||||||    
T  54531 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaatcatgagttgggtatacatat 54432  T
Q  373 tcatggattgatgatga 389  Q
    | |||||||||||||||    
T  54431 ttatggattgatgatga 54415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Original strand, 166116 - 166197
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 86  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  166116 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 166197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 86
Target Start/End: Original strand, 162036 - 162111
Alignment:
Q  12 ataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 86  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  162036 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 162111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 314 - 433
Target Start/End: Original strand, 116687 - 116806
Alignment:
Q  314 tgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata-ttcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtt 412  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||| | |||| ||||||  ||| ||||||||| | || |||||||||||| |    
T  116687 tgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgaaaaatgga-ttgttgttggtggt 116785  T
Q  413 ttggtgaaatttgtgaattga 433  Q
    || || ||||| |||||||||    
T  116786 tttgtaaaattggtgaattga 116806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1424
Alignment:
Q  139 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgc 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 31132 - 31212
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  31132 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 31212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 3262 - 3183
Alignment:
Q  334 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttt 413  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  3262 gatgttgtgattgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatgaagagaattggaattgttgttggtgttt 3183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3370
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggt 210  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggt 3370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 5735 - 5809
Alignment:
Q  12 ataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  5735 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 5809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 5941 - 6015
Alignment:
Q  12 ataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  5941 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 6015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 1867 - 1815
Alignment:
Q  368 catattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 421  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1867 catattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 1815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Original strand, 304 - 385
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 86  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  304 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatcatc 385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 432
Target Start/End: Original strand, 76984 - 77139
Alignment:
Q  277 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 375  Q
    ||||||| ||||||||| | |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| ||||  ||||||| |||| | |||||||| ||| |||||    
T  76984 atgttgttgttgaattgtggtgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttattgatgattcatggcttgggtattcataattca 77083  T
Q  376 tggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
    ||  ||| |||||| ||  ||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  77084 tgatttgttgatgagaa-atgagttgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattg 77139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 432
Target Start/End: Original strand, 132505 - 132542
Alignment:
Q  395 tgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132505 tgaaatgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 132542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 412
Target Start/End: Original strand, 197390 - 197525
Alignment:
Q  277 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 375  Q
    ||||||| ||||||||| | |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| |||||||| | ||| | |||    
T  197390 atgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtcttcataaatca 197489  T
Q  376 tggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtt 412  Q
    ||  |||||||||| || |||| ||||||||| ||||    
T  197490 tgctttgatgatgagaa-ttgagttgttgttgttgtt 197525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 1780 - 1721
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1780 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 1721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Original strand, 19802 - 19861
Alignment:
Q  6 agaagcataggagccaaagtgaagttagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19802 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 19861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 389
Target Start/End: Original strand, 104793 - 104872
Alignment:
Q  311 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatga 389  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  104793 aattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatga 104872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 10739 - 10642
Alignment:
Q  310 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttg 407  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||| | |||| | |||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10739 caattgatgttgtttttgctaagtgatgttgttgttgatcattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatgaaaa-atgaattgttgttg 10642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2532 - 2471
Alignment:
Q  310 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 371  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  2532 caattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 2471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 1546 - 1587
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1546 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 8691 - 8732
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8691 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7551 - 7522
Alignment:
Q  403 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7551 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 7522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8216
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 310 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 8087 - 8007
Alignment:
Q  310 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatga 389  Q
    ||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||    
T  8087 caattgatgttgttgttgctatgtgatgttgttgttgatgattcatagcttgggtattcataattcatgaattggtgatga 8007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Original strand, 56106 - 56226
Alignment:
Q  134 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt--aaatatg 231  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||| || || ||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | | ||| |||||||  || ||||    
T  56106 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatg 56205  T
Q  232 tagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    || |||||  |||||||||||    
T  56206 tataaatgtcaagttatgaaa 56226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70348
Alignment:
Q  143 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 70348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 38282 - 38253
Alignment:
Q  403 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38282 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 38253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 300 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 2612 - 2548
Alignment:
Q  300 gattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggt 364  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  2612 gattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggt 2548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University