View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1578_low_6 (Length: 238)

Name: NF1578_low_6
Description: NF1578
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1578_low_6
NF1578_low_6
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (13-238)||(10296-10521)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (13-238)||(32090-32315)
[»] chr8 (55 HSPs)
chr8 (13-238)||(16199516-16199742)
chr8 (13-238)||(31971280-31971506)
chr8 (16-238)||(45130871-45131094)
chr8 (48-238)||(21389358-21389548)
chr8 (48-238)||(21395888-21396078)
chr8 (48-238)||(21790381-21790571)
chr8 (61-238)||(21778697-21778874)
chr8 (13-238)||(21918870-21919098)
chr8 (13-238)||(20536231-20536459)
chr8 (32-238)||(18879126-18879329)
chr8 (13-238)||(22626759-22626986)
chr8 (22-238)||(18818288-18818507)
chr8 (23-238)||(21923808-21924026)
chr8 (13-238)||(28648914-28649142)
chr8 (48-238)||(7372801-7372986)
chr8 (13-234)||(23648580-23648804)
chr8 (48-238)||(23406402-23406597)
chr8 (48-238)||(22875088-22875281)
chr8 (13-238)||(6759281-6759507)
chr8 (13-125)||(25363010-25363123)
chr8 (48-238)||(16092246-16092440)
chr8 (165-238)||(17140939-17141014)
chr8 (165-238)||(5866297-5866372)
chr8 (145-238)||(6520391-6520486)
chr8 (166-238)||(21491018-21491092)
chr8 (188-237)||(19154935-19154984)
chr8 (144-238)||(20498585-20498681)
chr8 (144-238)||(21285620-21285716)
chr8 (189-238)||(23760893-23760942)
chr8 (189-238)||(38855300-38855349)
chr8 (165-234)||(13508108-13508179)
chr8 (190-238)||(24353043-24353091)
chr8 (190-238)||(37116370-37116418)
chr8 (98-238)||(16413316-16413458)
chr8 (189-238)||(983455-983504)
chr8 (190-238)||(17267044-17267092)
chr8 (165-234)||(17612133-17612204)
chr8 (112-238)||(14409459-14409586)
chr8 (190-236)||(17439557-17439603)
chr8 (189-238)||(26355747-26355796)
chr8 (165-234)||(13597640-13597711)
chr8 (163-238)||(20046261-20046337)
chr8 (112-238)||(1484422-1484549)
chr8 (112-238)||(5853307-5853434)
chr8 (112-238)||(20403247-20403374)
chr8 (112-238)||(22001773-22001900)
chr8 (112-238)||(4483301-4483427)
chr8 (112-238)||(41598208-41598335)
chr8 (163-235)||(15203297-15203370)
chr8 (165-238)||(21249407-21249483)
chr8 (165-238)||(21255245-21255321)
chr8 (193-238)||(21673727-21673772)
chr8 (163-238)||(15070578-15070654)
chr8 (190-238)||(22525581-22525628)
chr8 (163-238)||(45290761-45290837)
[»] chr7 (66 HSPs)
chr7 (9-238)||(40443414-40443644)
chr7 (13-238)||(27847703-27847928)
chr7 (20-235)||(10589065-10589282)
chr7 (13-238)||(12698854-12699083)
chr7 (29-238)||(9509212-9509424)
chr7 (15-238)||(26212019-26212245)
chr7 (13-238)||(16386117-16386346)
chr7 (49-238)||(18456319-18456510)
chr7 (13-238)||(38227504-38227731)
chr7 (22-238)||(3564243-3564462)
chr7 (57-161)||(12187115-12187218)
chr7 (92-238)||(16213704-16213852)
chr7 (57-161)||(17137978-17138081)
chr7 (144-238)||(2280121-2280217)
chr7 (165-238)||(28505321-28505396)
chr7 (165-238)||(34200809-34200884)
chr7 (112-238)||(13647348-13647476)
chr7 (143-208)||(2530139-2530205)
chr7 (189-238)||(67768-67817)
chr7 (185-237)||(12901347-12901399)
chr7 (165-238)||(16495425-16495500)
chr7 (166-238)||(11996051-11996125)
chr7 (142-238)||(16219717-16219815)
chr7 (144-238)||(48273412-48273508)
chr7 (112-238)||(24704708-24704832)
chr7 (189-238)||(811180-811229)
chr7 (189-238)||(18005669-18005718)
chr7 (189-238)||(44014201-44014250)
chr7 (165-234)||(10063841-10063912)
chr7 (190-238)||(14044769-14044817)
chr7 (190-238)||(14354799-14354847)
chr7 (190-233)||(14036282-14036325)
chr7 (190-233)||(14346312-14346355)
chr7 (144-238)||(16056351-16056446)
chr7 (112-238)||(24275191-24275318)
chr7 (112-238)||(24702258-24702385)
chr7 (188-235)||(48991206-48991253)
chr7 (188-238)||(1868043-1868093)
chr7 (188-238)||(15008547-15008597)
chr7 (189-238)||(47831830-47831879)
chr7 (165-238)||(19486767-19486842)
chr7 (190-238)||(20220238-20220286)
chr7 (163-238)||(44116529-44116605)
chr7 (112-238)||(456341-456468)
chr7 (112-238)||(11393302-11393429)
chr7 (112-238)||(11972516-11972643)
chr7 (112-238)||(14949137-14949264)
chr7 (112-238)||(15376728-15376855)
chr7 (112-238)||(16232540-16232667)
chr7 (112-238)||(18430732-18430859)
chr7 (112-238)||(18640292-18640419)
chr7 (112-238)||(20385138-20385265)
chr7 (112-238)||(21189610-21189737)
chr7 (112-238)||(32125511-32125638)
chr7 (112-238)||(41522937-41523064)
chr7 (112-238)||(41525399-41525526)
chr7 (163-238)||(17061981-17062057)
chr7 (189-234)||(12255842-12255887)
chr7 (163-238)||(16410079-16410155)
chr7 (112-238)||(27216880-27217007)
chr7 (180-238)||(18154882-18154939)
chr7 (164-234)||(15211484-15211557)
chr7 (193-230)||(22072944-22072981)
chr7 (163-238)||(13869366-13869442)
chr7 (198-238)||(15144096-15144135)
chr7 (165-234)||(15754910-15754981)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (13-238)||(922-1147)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (20-234)||(15342-15557)
scaffold0114 (93-161)||(7391-7459)
[»] chr2 (57 HSPs)
chr2 (13-238)||(20309131-20309356)
chr2 (13-238)||(37986-38212)
chr2 (13-238)||(23285888-23286112)
chr2 (22-238)||(22731113-22731332)
chr2 (13-238)||(23654256-23654484)
chr2 (15-238)||(298686-298913)
chr2 (13-238)||(22738050-22738277)
chr2 (34-238)||(23060536-23060742)
chr2 (48-238)||(23076465-23076658)
chr2 (24-238)||(22337138-22337355)
chr2 (13-238)||(23660046-23660273)
chr2 (144-238)||(23103399-23103493)
chr2 (49-238)||(23708524-23708717)
chr2 (57-175)||(40622123-40622244)
chr2 (144-231)||(7735-7824)
chr2 (112-238)||(22105432-22105560)
chr2 (188-238)||(23207300-23207350)
chr2 (29-111)||(27753728-27753810)
chr2 (145-234)||(7679612-7679702)
chr2 (165-234)||(19671857-19671928)
chr2 (189-238)||(28405999-28406048)
chr2 (190-238)||(20520243-20520291)
chr2 (112-238)||(21155075-21155202)
chr2 (190-237)||(23004772-23004819)
chr2 (112-238)||(26505399-26505526)
chr2 (112-238)||(26507877-26508004)
chr2 (188-238)||(22413186-22413236)
chr2 (165-236)||(23071972-23072045)
chr2 (189-231)||(25175880-25175922)
chr2 (98-238)||(32214921-32215063)
chr2 (190-238)||(23287386-23287433)
chr2 (190-238)||(25108910-25108958)
chr2 (112-238)||(18808963-18809090)
chr2 (112-238)||(23130882-23131009)
chr2 (112-238)||(23133349-23133476)
chr2 (112-238)||(23135610-23135737)
chr2 (112-238)||(23709547-23709674)
chr2 (112-238)||(23712028-23712155)
chr2 (112-238)||(24367794-24367921)
chr2 (191-238)||(26392405-26392451)
chr2 (112-238)||(34402537-34402664)
chr2 (112-238)||(39682333-39682460)
chr2 (185-238)||(8946680-8946732)
chr2 (189-238)||(18786952-18787001)
chr2 (189-238)||(22134256-22134304)
chr2 (162-238)||(32451948-32452027)
chr2 (163-238)||(571417-571493)
chr2 (163-238)||(6726015-6726091)
chr2 (190-238)||(23791296-23791344)
chr2 (142-188)||(23019706-23019752)
chr2 (197-238)||(23040247-23040287)
chr2 (190-238)||(24697657-24697705)
chr2 (112-238)||(24898210-24898338)
chr2 (112-238)||(24900693-24900821)
chr2 (112-238)||(24903170-24903298)
chr2 (112-238)||(24905647-24905775)
chr2 (112-238)||(24908122-24908250)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (13-238)||(16305-16530)
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (24-238)||(17046510-17046724)
chr4 (13-235)||(14053172-14053396)
chr4 (13-238)||(12902780-12903008)
chr4 (13-238)||(7088900-7089128)
chr4 (29-236)||(44052854-44053064)
chr4 (13-238)||(22636458-22636685)
chr4 (15-235)||(23374231-23374454)
chr4 (13-238)||(16377393-16377619)
chr4 (52-238)||(16270145-16270333)
chr4 (29-238)||(7893726-7893935)
chr4 (22-238)||(16239849-16240067)
chr4 (13-135)||(3096772-3096894)
chr4 (80-238)||(7798797-7798958)
chr4 (13-234)||(14038675-14038899)
chr4 (92-238)||(13800-13949)
chr4 (92-238)||(6899914-6900062)
chr4 (89-175)||(15121749-15121834)
chr4 (89-208)||(43256106-43256227)
chr4 (13-125)||(17047942-17048055)
chr4 (142-238)||(52873367-52873465)
chr4 (165-238)||(15551840-15551915)
chr4 (189-238)||(12288259-12288308)
chr4 (189-238)||(12774030-12774079)
chr4 (189-238)||(52243245-52243294)
chr4 (144-238)||(14280336-14280431)
chr4 (180-238)||(3096316-3096373)
chr4 (112-238)||(22353856-22353984)
chr4 (188-238)||(46640504-46640554)
chr4 (189-238)||(39706337-39706386)
chr4 (190-238)||(53082202-53082250)
chr4 (112-238)||(18215289-18215416)
chr4 (112-238)||(44928894-44929022)
chr4 (144-238)||(54798756-54798852)
chr4 (98-238)||(19618172-19618314)
chr4 (98-238)||(23803265-23803407)
chr4 (196-238)||(43198611-43198653)
chr4 (162-238)||(6190485-6190564)
chr4 (144-238)||(8574871-8574965)
chr4 (189-238)||(8846379-8846428)
chr4 (112-238)||(12322-12449)
chr4 (112-238)||(15118367-15118494)
chr4 (112-238)||(44615308-44615435)
chr4 (112-238)||(52312530-52312657)
chr4 (98-238)||(3515027-3515169)
chr4 (98-238)||(19242719-19242861)
chr4 (98-238)||(51463868-51464010)
chr4 (92-238)||(1837503-1837651)
chr4 (163-238)||(15355391-15355467)
chr4 (163-238)||(44773153-44773229)
chr4 (112-238)||(18239434-18239561)
chr4 (165-223)||(16596686-16596746)
chr4 (190-234)||(17333304-17333347)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (13-238)||(13520-13746)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (16-238)||(1312-1534)
scaffold0106 (16-238)||(7289-7511)
scaffold0106 (192-238)||(15291-15336)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (13-238)||(47018-47237)
[»] chr6 (52 HSPs)
chr6 (13-238)||(16920503-16920728)
chr6 (13-238)||(22831526-22831753)
chr6 (89-238)||(35245609-35245758)
chr6 (16-238)||(11185528-11185750)
chr6 (13-235)||(20360830-20361055)
chr6 (29-238)||(20638169-20638381)
chr6 (13-238)||(29060563-29060791)
chr6 (13-238)||(17287666-17287894)
chr6 (13-234)||(22780097-22780321)
chr6 (48-238)||(19303446-19303638)
chr6 (13-238)||(18409697-18409925)
chr6 (13-238)||(20593796-20594024)
chr6 (111-238)||(16496267-16496396)
chr6 (13-238)||(25629225-25629453)
chr6 (116-238)||(20109161-20109285)
chr6 (97-238)||(20076723-20076863)
chr6 (89-208)||(27415887-27416008)
chr6 (144-238)||(23019429-23019525)
chr6 (189-238)||(27333267-27333316)
chr6 (189-238)||(27394007-27394056)
chr6 (144-238)||(25644343-25644440)
chr6 (196-238)||(19668394-19668436)
chr6 (189-238)||(9098563-9098612)
chr6 (190-238)||(23076753-23076801)
chr6 (163-238)||(25656649-25656725)
chr6 (165-238)||(28496494-28496569)
chr6 (165-238)||(29808905-29808980)
chr6 (190-238)||(35008171-35008219)
chr6 (116-234)||(1595573-1595692)
chr6 (112-238)||(2291195-2291322)
chr6 (98-238)||(25754829-25754971)
chr6 (98-238)||(30676710-30676852)
chr6 (188-238)||(33443070-33443119)
chr6 (148-238)||(4185827-4185919)
chr6 (189-238)||(19652218-19652267)
chr6 (163-238)||(22782247-22782323)
chr6 (112-238)||(12742337-12742464)
chr6 (112-238)||(18334607-18334734)
chr6 (112-238)||(19005066-19005193)
chr6 (112-238)||(19858934-19859061)
chr6 (112-238)||(24422567-24422694)
chr6 (112-238)||(33861814-33861941)
chr6 (112-238)||(33864298-33864425)
chr6 (98-238)||(34963393-34963535)
chr6 (163-235)||(25688525-25688598)
chr6 (112-235)||(1540926-1541050)
chr6 (165-238)||(8227534-8227609)
chr6 (163-237)||(16448593-16448668)
chr6 (148-238)||(4186390-4186482)
chr6 (180-237)||(22432269-22432325)
chr6 (180-237)||(22438819-22438875)
chr6 (165-234)||(1561330-1561401)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (16-238)||(51605-51827)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (13-238)||(5001-5226)
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (16-238)||(21292843-21293067)
chr5 (29-238)||(23390382-23390594)
chr5 (15-238)||(22075042-22075268)
chr5 (13-238)||(8286712-8286941)
chr5 (13-238)||(24493592-24493819)
chr5 (13-238)||(25421555-25421783)
chr5 (23-238)||(25431417-25431635)
chr5 (13-230)||(9077983-9078203)
chr5 (13-238)||(13025334-13025561)
chr5 (13-238)||(13095518-13095745)
chr5 (13-238)||(24529243-24529471)
chr5 (97-238)||(21808343-21808487)
chr5 (111-238)||(21729033-21729162)
chr5 (22-238)||(1096490-1096709)
chr5 (9-126)||(22107239-22107357)
chr5 (144-234)||(37723930-37724020)
chr5 (89-208)||(18356367-18356488)
chr5 (57-161)||(18769919-18770022)
chr5 (163-238)||(21997555-21997632)
chr5 (57-161)||(22032417-22032520)
chr5 (89-161)||(23572180-23572252)
chr5 (163-238)||(26012056-26012133)
chr5 (145-238)||(20026942-20027039)
chr5 (145-238)||(21329500-21329595)
chr5 (89-208)||(20910745-20910866)
chr5 (189-238)||(19660884-19660933)
chr5 (189-238)||(21502205-21502254)
chr5 (144-238)||(22144072-22144168)
chr5 (189-238)||(22959581-22959630)
chr5 (165-238)||(36314600-36314675)
chr5 (146-238)||(21565565-21565659)
chr5 (49-238)||(22412207-22412388)
chr5 (112-238)||(29329954-29330081)
chr5 (49-208)||(18418633-18418793)
chr5 (188-238)||(22178269-22178319)
chr5 (163-238)||(11581265-11581341)
chr5 (163-238)||(20902075-20902151)
chr5 (112-238)||(264783-264910)
chr5 (112-238)||(10732955-10733082)
chr5 (112-238)||(20909032-20909159)
chr5 (191-238)||(26732884-26732930)
chr5 (112-238)||(39363404-39363531)
chr5 (163-238)||(39245156-39245232)
chr5 (165-238)||(40725876-40725951)
chr5 (163-237)||(18319100-18319175)
chr5 (191-238)||(26740697-26740743)
chr5 (112-238)||(42245380-42245507)
chr5 (163-238)||(2154680-2154756)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (13-235)||(38801261-38801483)
chr1 (13-238)||(27250599-27250827)
chr1 (15-238)||(21026703-21026929)
chr1 (13-238)||(50210083-50210311)
chr1 (13-186)||(22354442-22354616)
chr1 (13-238)||(34509803-34510031)
chr1 (23-238)||(22532292-22532510)
chr1 (48-234)||(20135214-20135403)
chr1 (50-234)||(22468604-22468790)
chr1 (89-208)||(33797573-33797694)
chr1 (48-125)||(48603652-48603730)
chr1 (144-238)||(21896258-21896354)
chr1 (29-152)||(22356060-22356185)
chr1 (29-152)||(22357746-22357871)
chr1 (144-238)||(21861572-21861668)
chr1 (163-238)||(35261099-35261176)
chr1 (165-238)||(14295574-14295649)
chr1 (165-238)||(20918627-20918702)
chr1 (190-238)||(50614167-50614215)
chr1 (190-238)||(50621995-50622043)
chr1 (192-238)||(16368338-16368384)
chr1 (163-238)||(21754068-21754145)
chr1 (189-238)||(16758672-16758721)
chr1 (189-238)||(22921918-22921967)
chr1 (189-238)||(33681030-33681079)
chr1 (167-238)||(45574912-45574985)
chr1 (112-238)||(433032-433157)
chr1 (98-238)||(21840787-21840929)
chr1 (98-238)||(23593735-23593877)
chr1 (188-238)||(41050084-41050134)
chr1 (185-238)||(20847200-20847252)
chr1 (144-238)||(22237650-22237746)
chr1 (189-238)||(52928019-52928068)
chr1 (163-238)||(22123133-22123210)
chr1 (190-238)||(26064961-26065009)
chr1 (112-238)||(13988886-13989013)
chr1 (112-238)||(21923306-21923433)
chr1 (112-238)||(29776708-29776835)
chr1 (191-238)||(50686634-50686681)
chr1 (188-238)||(16093933-16093983)
chr1 (192-238)||(20454606-20454651)
chr1 (166-238)||(15860078-15860151)
chr1 (189-238)||(20248302-20248351)
chr1 (112-238)||(21475102-21475229)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (13-238)||(4735-4962)
scaffold0358 (13-186)||(13-186)
[»] chr3 (72 HSPs)
chr3 (13-238)||(20698306-20698533)
chr3 (29-238)||(13442297-13442509)
chr3 (29-238)||(17487879-17488091)
chr3 (29-238)||(17499361-17499573)
chr3 (20-238)||(12399232-12399453)
chr3 (13-238)||(14576703-14576930)
chr3 (13-238)||(14972877-14973105)
chr3 (23-238)||(23083241-23083459)
chr3 (48-238)||(26686910-26687103)
chr3 (48-237)||(43840956-43841148)
chr3 (13-238)||(18438557-18438785)
chr3 (13-238)||(14572612-14572839)
chr3 (49-238)||(24153115-24153306)
chr3 (23-238)||(25476265-25476483)
chr3 (22-238)||(40213600-40213818)
chr3 (22-234)||(11424642-11424853)
chr3 (48-238)||(42386433-42386627)
chr3 (48-125)||(14179570-14179648)
chr3 (13-125)||(16796685-16796798)
chr3 (189-238)||(12174308-12174357)
chr3 (144-238)||(15470947-15471043)
chr3 (189-238)||(32307700-32307749)
chr3 (189-238)||(49668125-49668174)
chr3 (93-235)||(856162-856304)
chr3 (165-238)||(13210350-13210425)
chr3 (190-238)||(22110402-22110450)
chr3 (165-234)||(24340746-24340817)
chr3 (190-238)||(43925981-43926029)
chr3 (188-238)||(37251216-37251266)
chr3 (98-238)||(50242842-50242984)
chr3 (192-237)||(606378-606423)
chr3 (189-238)||(9512943-9512992)
chr3 (189-238)||(9520918-9520967)
chr3 (144-238)||(27165270-27165366)
chr3 (189-238)||(52523778-52523827)
chr3 (165-234)||(23274714-23274785)
chr3 (112-238)||(9707622-9707749)
chr3 (112-238)||(29172598-29172725)
chr3 (112-238)||(53070668-53070795)
chr3 (188-238)||(12377944-12377994)
chr3 (98-238)||(12567580-12567722)
chr3 (98-238)||(13544045-13544187)
chr3 (98-238)||(17672646-17672788)
chr3 (196-238)||(28194713-28194755)
chr3 (163-238)||(53301572-53301649)
chr3 (145-231)||(14234517-14234605)
chr3 (193-238)||(16097351-16097396)
chr3 (189-238)||(16103803-16103852)
chr3 (144-238)||(36166618-36166712)
chr3 (13-188)||(30029915-30030090)
chr3 (165-238)||(37642288-37642363)
chr3 (163-238)||(43550544-43550621)
chr3 (112-238)||(7781362-7781489)
chr3 (112-238)||(8899114-8899241)
chr3 (112-238)||(17463198-17463325)
chr3 (112-238)||(28848626-28848753)
chr3 (112-238)||(34159346-34159473)
chr3 (112-238)||(38961906-38962033)
chr3 (112-238)||(45606922-45607049)
chr3 (112-238)||(55476511-55476638)
chr3 (144-238)||(21618469-21618563)
chr3 (146-238)||(55500962-55501055)
chr3 (163-238)||(6469200-6469276)
chr3 (163-238)||(8499538-8499614)
chr3 (190-238)||(13919352-13919399)
chr3 (112-235)||(17446670-17446794)
chr3 (112-238)||(16454296-16454423)
chr3 (166-238)||(16282880-16282953)
chr3 (163-238)||(12119791-12119867)
chr3 (112-238)||(13151805-13151933)
chr3 (112-238)||(13154270-13154398)
chr3 (163-238)||(15412449-15412525)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (13-238)||(919-1146)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (13-238)||(167849-168076)
scaffold0011 (13-238)||(51936-52164)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (13-238)||(1975-2203)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (29-234)||(13238-13446)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (13-238)||(20933-21162)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (29-238)||(1874-2086)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (22-238)||(3493-3712)
scaffold0292 (13-238)||(366-593)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (48-238)||(24206-24401)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (29-238)||(6007-6222)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (54-238)||(4872-5059)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (13-201)||(6669-6861)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (13-238)||(3021-3248)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (13-238)||(38784-39011)
scaffold0145 (52-238)||(32965-33153)
scaffold0145 (163-238)||(9769-9845)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (13-238)||(39500-39727)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (13-238)||(75085-75312)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (13-238)||(339820-340045)
scaffold0003 (89-208)||(71353-71474)
scaffold0003 (112-238)||(158465-158592)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (13-238)||(25935-26163)
scaffold0122 (144-234)||(44709-44801)
scaffold0122 (13-109)||(33365-33461)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (48-238)||(8438-8627)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (13-238)||(22906-23133)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (22-238)||(17094-17315)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (13-238)||(25919-26146)
scaffold0026 (18-238)||(39881-40103)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (29-173)||(124675-124820)
scaffold0021 (144-238)||(174789-174883)
scaffold0021 (185-238)||(136414-136467)
scaffold0021 (185-238)||(145122-145175)
scaffold0021 (191-238)||(121789-121835)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (48-211)||(13141-13308)
scaffold0175 (165-238)||(34146-34221)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (13-238)||(39936-40163)
scaffold0080 (188-238)||(19933-19983)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (13-238)||(4531-4758)
scaffold0228 (13-238)||(12113-12340)
scaffold0228 (13-238)||(22065-22292)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (13-238)||(16470-16698)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (60-238)||(3103-3284)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (57-235)||(26850-27027)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (125-238)||(28437-28552)
scaffold0046 (165-238)||(11315-11390)
scaffold0046 (165-238)||(2020-2095)
scaffold0046 (205-238)||(4575-4608)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (89-238)||(32904-33054)
scaffold0120 (89-238)||(45951-46101)
scaffold0120 (53-238)||(16136-16323)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (24-238)||(8502-8715)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (146-237)||(11447-11540)
scaffold0235 (13-70)||(11383-11440)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (20-125)||(1052-1158)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (13-181)||(27912-28081)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (13-105)||(3640-3732)
scaffold0165 (13-105)||(7704-7796)
scaffold0165 (163-238)||(27770-27847)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (93-161)||(1977-2045)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (57-161)||(21721-21824)
scaffold0210 (57-161)||(29613-29716)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (89-161)||(12859-12931)
scaffold0029 (98-238)||(11308-11450)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (92-231)||(53498-53640)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (89-208)||(15362-15483)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (163-238)||(32559-32636)
scaffold0034 (162-238)||(51903-51981)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (144-238)||(1055-1151)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (116-238)||(8489-8613)
scaffold0621 (189-238)||(6558-6607)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (144-238)||(12591-12687)
[»] scaffold0023 (6 HSPs)
scaffold0023 (144-238)||(100397-100493)
scaffold0023 (189-238)||(119898-119947)
scaffold0023 (98-238)||(17440-17582)
scaffold0023 (190-234)||(40224-40268)
scaffold0023 (112-238)||(94431-94558)
scaffold0023 (189-238)||(101522-101571)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (165-238)||(15684-15759)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (48-238)||(4547-4739)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (185-237)||(60761-60813)
scaffold0010 (144-238)||(129928-130024)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (13-104)||(10323-10414)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (98-238)||(4714-4856)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (188-238)||(38339-38389)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (188-238)||(25129-25179)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (144-238)||(2808-2904)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (144-238)||(10543-10639)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (144-238)||(13151-13247)
scaffold0357 (163-238)||(16121-16198)
scaffold0357 (190-238)||(2684-2732)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (185-238)||(8119-8172)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (189-238)||(19287-19336)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (165-234)||(11491-11562)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (48-186)||(3434-3574)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (165-238)||(1092-1167)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (165-234)||(38279-38350)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (190-238)||(14747-14795)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (192-238)||(573-619)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (98-238)||(4317-4459)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (188-238)||(6332-6382)
scaffold0420 (195-238)||(13793-13836)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (192-238)||(78345-78391)
scaffold0022 (190-238)||(129021-129068)
scaffold0022 (144-238)||(116450-116544)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (163-238)||(160707-160784)
scaffold0001 (98-238)||(501104-501246)
scaffold0001 (163-238)||(85646-85722)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (189-238)||(1105-1154)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (189-238)||(6835-6884)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (189-238)||(6634-6683)
scaffold0333 (189-238)||(14014-14063)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (189-238)||(5666-5715)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (189-238)||(6172-6221)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (189-238)||(2694-2743)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (189-238)||(23932-23981)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (144-238)||(38704-38800)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (144-238)||(22672-22768)
scaffold0037 (98-238)||(82092-82234)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (112-238)||(20394-20520)
scaffold0031 (97-186)||(128827-128917)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (189-238)||(15826-15875)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (165-234)||(18050-18121)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (189-237)||(62222-62270)
scaffold0028 (112-238)||(134231-134358)
scaffold0028 (112-238)||(136700-136827)
scaffold0028 (112-238)||(139169-139296)
scaffold0028 (112-238)||(144107-144234)
scaffold0028 (197-238)||(132681-132722)
scaffold0028 (112-238)||(141638-141765)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (13-84)||(17857-17928)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (98-238)||(10793-10935)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (188-238)||(2698-2748)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (189-238)||(1083-1132)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (61-201)||(881-1021)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (189-238)||(45841-45890)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (144-238)||(10550-10646)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (145-238)||(12789-12884)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (163-238)||(16804-16880)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (145-238)||(12962-13057)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (190-238)||(97028-97076)
scaffold0006 (190-238)||(106306-106354)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (112-238)||(13412-13539)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (112-238)||(20767-20894)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (112-238)||(37841-37968)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (98-238)||(126-268)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (188-238)||(103679-103729)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (188-238)||(267683-267733)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (189-238)||(152-201)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (190-235)||(206575-206619)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (163-238)||(29952-30028)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (112-238)||(13967-14094)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (142-238)||(8059-8159)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (98-238)||(9262-9404)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (189-238)||(28818-28868)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (197-238)||(32121-32162)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (164-234)||(192997-193070)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (163-238)||(40420-40496)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (163-238)||(161156-161232)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (57-126)||(69930-70000)


Alignment Details
Target: scaffold0456 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 10296 - 10521
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10296 tgaacccttgggtagaattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgatt 10395  T
Q  113 atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10396 atgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 10495  T
Q  213 aattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10496 aattaactatgctgcatgagtcggtc 10521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32315 - 32090
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  32315 tgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgttt 32216  T
Q  113 atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  32215 atgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgt 32117  T
Q  212 taattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  32116 tatttaactaagctgcatgagtcggtc 32090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 55)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 16199516 - 16199742
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  16199516 tgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttt 16199615  T
Q  113 atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16199616 atgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgaatactgtctatgttgctgtttgt 16199715  T
Q  212 taattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  16199716 tatttaactaagctgcatgagtcggtc 16199742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31971506 - 31971280
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  31971506 tgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt 31971407  T
Q  113 atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  31971406 atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttg 31971308  T
Q  211 ttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31971307 ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 31971280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 238
Target Start/End: Original strand, 45130871 - 45131094
Alignment:
Q  16 acccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45130871 acccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatg 45130970  T
Q  116 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa-ttgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgtta 213  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  45130971 cattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgtta 45131069  T
Q  214 attaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  45131070 tttaactaagctgcatgagtcggtc 45131094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 48 - 238
Target Start/End: Original strand, 21389358 - 21389548
Alignment:
Q  48 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 147  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21389358 gttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21389457  T
Q  148 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21389458 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21389548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 48 - 238
Target Start/End: Original strand, 21395888 - 21396078
Alignment:
Q  48 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21395888 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21395987  T
Q  148 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21395988 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21396078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 48 - 238
Target Start/End: Original strand, 21790381 - 21790571
Alignment:
Q  48 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21790381 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21790480  T
Q  148 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21790481 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21790571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 61 - 238
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778874
Alignment:
Q  61 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 160  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattga 21778796  T
Q  161 aattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21778797 atttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21778874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 21918870 - 21919098
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||    
T  21918870 tgaacccttgggtaagattaagacttaacgatgaggttaattacgatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgttt 21918969  T
Q  113 atgcattacttgaagaa-tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  21918970 atgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-t 21919068  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21919069 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21919098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20536459 - 20536231
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |     
T  20536459 tgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgtta 20536360  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  20536359 tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctg-t 20536261  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20536260 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20536231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 32 - 238
Target Start/End: Original strand, 18879126 - 18879329
Alignment:
Q  32 aagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaa 129  Q
    |||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| ||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  18879126 aagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctg-ataagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatgagcattacttgaagaa 18879223  T
Q  130 tatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcat 229  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18879224 tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt--tgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcat 18879320  T
Q  230 gagtcggtc 238  Q
    |||||||||    
T  18879321 gagtcggtc 18879329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22626986 - 22626759
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |     
T  22626986 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgtta 22626887  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgttt 209  Q
    ||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  22626886 tacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-tt 22626788  T
Q  210 gttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22626787 gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 22626759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 18818288 - 18818507
Alignment:
Q  22 gggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcatta 120  Q
    |||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||    
T  18818288 gggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcatta 18818387  T
Q  121 cttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaatta 217  Q
    ||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||  |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18818388 cttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttattta 18818486  T
Q  218 actaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18818487 actaagctgcatgagtcggtc 18818507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 238
Target Start/End: Original strand, 21923808 - 21924026
Alignment:
Q  23 ggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattac 121  Q
    ||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  | |||| | | | ||||||||    
T  21923808 ggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattac 21923907  T
Q  122 ttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaa 218  Q
    |||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21923908 ttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctg-ttgttatttaa 21924006  T
Q  219 ctaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21924007 ctaagctgcatgagtcggtc 21924026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 28648914 - 28649142
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  28648914 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 28649013  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    ||  |||||||||||  ||   ||||||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||    
T  28649014 tacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tt 28649112  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28649113 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 28649142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7372986 - 7372801
Alignment:
Q  48 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||||||       ||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  7372986 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa-------gcattacttgaagtataattgaatatttaagat 7372894  T
Q  148 gttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    | || ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7372893 gatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 7372801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23648804 - 23648580
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| |||||||| |||| || | |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  23648804 tgaaccttggggtagtattaagacctaatgatgatgttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttg 23648705  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 208  Q
    | ||||||||||||||  |  ||| |||  |||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| ||    
T  23648704 tgtgcattacttgaagttttattgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctatt 23648605  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
     |||||||||||||| ||||||||||    
T  23648604 -gttaattaactaagttgcatgagtc 23648580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23406597 - 23406402
Alignment:
Q  48 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 146  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  23406597 gttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 23406498  T
Q  147 tg--ttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||   || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23406497 tgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23406402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22875281 - 22875088
Alignment:
Q  48 gttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | ||    
T  22875281 gttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgag 22875182  T
Q  146 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||    
T  22875181 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctg-ctgctatttaactaagctgcatgagtcggtc 22875088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6759507 - 6759281
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  6759507 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt 6759408  T
Q  112 -tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgt 207  Q
     || |||||| |||||  ||   ||||||  | |||||||||    ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||    
T  6759407 atacgcattaattgaattatgagtgtataattgagatgttgac---ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgt 6759311  T
Q  208 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6759310 t-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 6759281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Original strand, 25363010 - 25363123
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-at 111  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||  |    
T  25363010 tgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttt 25363109  T
Q  112 tatgcattacttga 125  Q
    ||||||||||||||    
T  25363110 tatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 238
Target Start/End: Original strand, 16092246 - 16092440
Alignment:
Q  48 gttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 145  Q
    |||||||||||| || |||| ||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||  ||   ||||||  | ||    
T  16092246 gttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgag 16092345  T
Q  146 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16092346 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16092440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17141014 - 17140939
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17141014 gatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 17140939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Original strand, 5866297 - 5866372
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5866297 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 5866372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6520486 - 6520391
Alignment:
Q  145 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6520486 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 6520391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21491092 - 21491018
Alignment:
Q  166 atattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21491092 atattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21491018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 237
Target Start/End: Original strand, 19154935 - 19154984
Alignment:
Q  188 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19154935 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 19154984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20498681 - 20498585
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgta--tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| | || ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  20498681 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtc 20498585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285620
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtc 21285620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760942
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23760942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 38855300 - 38855349
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38855300 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 38855349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 234
Target Start/End: Original strand, 13508108 - 13508179
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13508108 gatattattatatcatgatgttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtc 13508179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353043
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 24353043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37116418 - 37116370
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37116418 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 37116370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413458
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16413416 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16413458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 983455 - 983504
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  983455 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 983504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Original strand, 17267044 - 17267092
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17267044 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 17267092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 234
Target Start/End: Original strand, 17612133 - 17612204
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  17612133 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtc 17612204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 14409459 - 14409586
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  14409459 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 14409557  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14409558 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 14409586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 236
Target Start/End: Original strand, 17439557 - 17439603
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcgg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17439557 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 17439603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 26355747 - 26355796
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26355747 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtc 26355796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 234
Target Start/End: Original strand, 13597640 - 13597711
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13597640 gatattattatatcatgatgttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtc 13597711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 20046261 - 20046337
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20046261 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20046337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1484549 - 1484422
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  1484549 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 1484451  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1484450 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 1484422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 5853307 - 5853434
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  5853307 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 5853405  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5853406 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 5853434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20403374 - 20403247
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  20403374 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20403276  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20403275 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20403247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22001900 - 22001773
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  22001900 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 22001802  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22001801 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 22001773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4483427 - 4483301
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  4483427 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 4483329  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4483328 -gtta-ttaactaagctgcatgagtcggtc 4483301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41598335 - 41598208
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||||||||||    
T  41598335 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 41598237  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41598236 -gttattcaactaagctgcatgagtcggtc 41598208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 235
Target Start/End: Original strand, 15203297 - 15203370
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcg 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15203297 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 15203370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21249483 - 21249407
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaatt-aactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21249483 gatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21249407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21255321 - 21255245
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaatt-aactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21255321 gatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21255245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21673772 - 21673727
Alignment:
Q  193 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  21673772 tgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtc 21673727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15070654 - 15070578
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15070654 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 15070578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525581
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtc 22525581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 45290761 - 45290837
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45290761 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 45290837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 66)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40443644 - 40443414
Alignment:
Q  9 gagatgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataat 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  40443644 gagatgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataat 40443545  T
Q  109 gattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgt 207  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||    
T  40443544 gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcgtatgttgctgt 40443445  T
Q  208 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40443444 ttgttatttaactaagctgcacgagtcggtc 40443414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 27847703 - 27847928
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||    
T  27847703 tgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgttt 27847802  T
Q  113 atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  27847803 atgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactgttgtacactgcctatgttgctgtttatt 27847902  T
Q  213 aattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||    
T  27847903 atttaactaagctgcatgaatcggtc 27847928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10589282 - 10589065
Alignment:
Q  20 ttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcatt 119  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10589282 ttgggtaggattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcatt 10589183  T
Q  120 acttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaatt 216  Q
     ||||||||||||||| | |   ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  10589182 gcttgaagaatatttgaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctg-ttgttattt 10589084  T
Q  217 aactaagctgcatgagtcg 235  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10589083 aactaagctgcatgagtcg 10589065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12699083 - 12698854
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||||||| ||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  12699083 tgaaccttggggtagtattaagagttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 12698984  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg----ttgtatactgcctatgttgctgt 207  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||     
T  12698983 tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctg- 12698885  T
Q  208 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12698884 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 12698854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9509424 - 9509212
Alignment:
Q  29 attaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 127  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||    
T  9509424 attaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaag 9509325  T
Q  128 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 224  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  9509324 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactg-ttgttatttaactaagc 9509226  T
Q  225 tgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||    
T  9509225 tgcatgagtcggtc 9509212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26212245 - 26212019
Alignment:
Q  15 aacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-atta 113  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||    
T  26212245 aacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgtttta 26212146  T
Q  114 tgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttg 210  Q
    ||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||    
T  26212145 tgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttg 26212047  T
Q  211 ttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||| ||||||||| || |||||||||||    
T  26212046 ttatttaactaagttgtatgagtcggtc 26212019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 16386117 - 16386346
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-at 111  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  |    
T  16386117 tgaacctttgggtaacattaagacttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttt 16386216  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    ||||||||||||||  | | |||| |||  ||||||||||||||| |  |||||||||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||    
T  16386217 tatgcattacttgagaattgtttgaatatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtt 16386316  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16386317 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16386346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 238
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456510
Alignment:
Q  49 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  148 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 18456510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38227731 - 38227504
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| | | |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||     
T  38227731 tgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgata 38227632  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgttt 209  Q
    | | ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||    
T  38227631 tgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-att 38227533  T
Q  210 gttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38227532 gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 38227504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 3564243 - 3564462
Alignment:
Q  22 gggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcatta 120  Q
    |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||| | || ||||||    
T  3564243 gggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcatta 3564342  T
Q  121 cttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaatta 217  Q
    ||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  3564343 cttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttattta 3564441  T
Q  218 actaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3564442 actaagctgcatgagtcggtc 3564462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12187218 - 12187115
Alignment:
Q  57 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 156  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||   | ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12187218 aatctgtgaagctg-ataagagatgtttgagttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 12187120  T
Q  157 ttgaa 161  Q
    |||||    
T  12187119 ttgaa 12187115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16213852 - 16213704
Alignment:
Q  92 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttg 187  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  ||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||   |||    
T  16213852 ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16213753  T
Q  188 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16213752 tatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16213704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 161
Target Start/End: Original strand, 17137978 - 17138081
Alignment:
Q  57 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 156  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17137978 aatctgtgaagctg-atatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 17138076  T
Q  157 ttgaa 161  Q
    |||||    
T  17138077 ttgaa 17138081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 2280121 - 2280217
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2280121 agatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 2280217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505396
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 28505396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34200884 - 34200809
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34200884 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 34200809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13647476 - 13647348
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||||||    
T  13647476 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 13647377  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13647376 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 13647348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 208
Target Start/End: Original strand, 2530139 - 2530205
Alignment:
Q  143 aagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  2530139 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtatgttgcctatgttgctgtt 2530205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 67817 - 67768
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  67817 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 67768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12901399 - 12901347
Alignment:
Q  185 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggt 237  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12901399 ttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 12901347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16495500 - 16495425
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16495500 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16495425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 238
Target Start/End: Original strand, 11996051 - 11996125
Alignment:
Q  166 atattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11996051 atattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtc 11996125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Original strand, 16219717 - 16219815
Alignment:
Q  142 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16219717 taagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtc 16219815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273412
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtc 48273412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24704832 - 24704708
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgt 211  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||||||||| ||    
T  24704832 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gt 24704735  T
Q  212 taattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  24704734 tatttaactaagctgcatgagtcggtc 24704708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 811180 - 811229
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  811180 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 811229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18005718 - 18005669
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18005718 atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 18005669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44014250 - 44014201
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44014250 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 44014201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 234
Target Start/End: Original strand, 10063841 - 10063912
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10063841 gatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtc 10063912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044769
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 14044769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354799
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 14354799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14036325 - 14036282
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14036325 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14346355 - 14346312
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14346355 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056351
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| | ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtc 16056351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24275318 - 24275191
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  24275318 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 24275220  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24275219 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 24275191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24702385 - 24702258
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24702385 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24702287  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24702286 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 24702258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 48991253 - 48991206
Alignment:
Q  188 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcg 235  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48991253 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 48991206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 1868043 - 1868093
Alignment:
Q  188 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1868043 tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtc 1868093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 15008547 - 15008597
Alignment:
Q  188 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15008547 tatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 15008597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 47831879 - 47831830
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47831879 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 47831830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Original strand, 19486767 - 19486842
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19486767 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtc 19486842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Original strand, 20220238 - 20220286
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20220238 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtc 20220286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44116605 - 44116529
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  44116605 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtc 44116529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 456468 - 456341
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  456468 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 456370  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  456369 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 456341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 11393302 - 11393429
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  11393302 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 11393400  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11393401 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 11393429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11972643 - 11972516
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  11972643 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 11972545  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11972544 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 11972516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 14949137 - 14949264
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  14949137 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 14949235  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14949236 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 14949264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 15376728 - 15376855
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  15376728 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 15376826  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15376827 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 15376855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16232667 - 16232540
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  16232667 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 16232569  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16232568 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16232540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18430859 - 18430732
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||  | ||||||||||    
T  18430859 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt 18430761  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18430760 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 18430732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18640419 - 18640292
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  18640419 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18640321  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18640320 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 18640292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 20385138 - 20385265
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  20385138 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20385236  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20385237 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20385265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 21189610 - 21189737
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21189610 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21189708  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21189709 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21189737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32125638 - 32125511
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  32125638 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 32125540  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32125539 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 32125511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41523064 - 41522937
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  41523064 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 41522966  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41522965 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 41522937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41525526 - 41525399
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  41525526 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 41525428  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41525427 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 41525399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 17061981 - 17062057
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||  | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17061981 ttgatattattatgtcatgctattttgtatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 17062057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 234
Target Start/End: Original strand, 12255842 - 12255887
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12255842 atactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 12255887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16410155 - 16410079
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16410155 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16410079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27217007 - 27216880
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  27217007 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 27216909  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27216908 -gttatttaactaagctgcatgagttggtc 27216880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 238
Target Start/End: Original strand, 18154882 - 18154939
Alignment:
Q  180 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18154882 tgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtc 18154939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15211557 - 15211484
Alignment:
Q  164 tgatattattatgtcatgttgttgt----atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||    || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15211557 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgtt-gttaattaactaagttgcatgagtc 15211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22072981 - 22072944
Alignment:
Q  193 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22072981 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatg 22072944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13869442 - 13869366
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13869442 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 13869366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 238
Target Start/End: Original strand, 15144096 - 15144135
Alignment:
Q  198 atgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15144096 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 15144135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 234
Target Start/End: Original strand, 15754910 - 15754981
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15754910 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtc 15754981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 922 - 1147
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  922 tgaacccttgggtaggattaagtcttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttt 1021  T
Q  113 atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  1022 atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgatgtttatt 1121  T
Q  213 aattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  1122 aattaactaagctgcatgagtcggtc 1147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Original strand, 15342 - 15557
Alignment:
Q  20 ttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcatt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15342 ttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatttatgcatt 15441  T
Q  120 acttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaatta 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  15442 acttgaagaatatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-cttgttattta 15540  T
Q  218 actaagctgcatgagtc 234  Q
    |||||||||||||||||    
T  15541 actaagctgcatgagtc 15557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7459 - 7391
Alignment:
Q  93 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaa 161  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7459 tatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa 7391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 57)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20309356 - 20309131
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  20309356 tgaacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttt 20309257  T
Q  113 atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20309256 atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctatttgtt 20309157  T
Q  213 aattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  20309156 atttaactaagctgcatgagtcggtc 20309131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 37986 - 38212
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  37986 tgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt 38085  T
Q  113 atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttg 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  38086 atgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctg-ttg 38184  T
Q  211 ttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38185 ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 38212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23286112 - 23285888
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-at 111  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  23286112 tgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt 23286013  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgt 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  23286012 tatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc-tgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgt 23285915  T
Q  212 taattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  23285914 tatttaactaagctgcatgagtcggtc 23285888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 22731113 - 22731332
Alignment:
Q  22 gggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcatta 120  Q
    |||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  22731113 gggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatta 22731212  T
Q  121 cttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaatta 217  Q
    ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  22731213 cttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttattta 22731311  T
Q  218 actaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22731312 actaagctgcatgagtcggtc 22731332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 23654256 - 23654484
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-at 111  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||  |    
T  23654256 tgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttt 23654355  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    ||||||||||||||  |||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||| || || |    
T  23654356 tatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttg-t 23654454  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23654455 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23654484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Original strand, 298686 - 298913
Alignment:
Q  15 aacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-atta 113  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||  |||    
T  298686 aacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgtttta 298785  T
Q  114 tgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttg 210  Q
    ||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  298786 tgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttg 298885  T
Q  211 ttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  298886 ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 22738050 - 22738277
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  22738050 tgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 22738149  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||| ||  || |    
T  22738150 tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatg-t 22738247  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22738248 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 22738277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23060742 - 23060536
Alignment:
Q  34 gacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatat 132  Q
    |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||     
T  23060742 gacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 23060644  T
Q  133 ttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcat 229  Q
    ||  |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23060643 tttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcat 23060545  T
Q  230 gagtcggtc 238  Q
    |||||||||    
T  23060544 gagtcggtc 23060536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23076658 - 23076465
Alignment:
Q  48 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  23076658 gttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 23076559  T
Q  147 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    | ||| ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23076558 tattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23076465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22337355 - 22337138
Alignment:
Q  24 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattact 122  Q
    |||| ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  22337355 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 22337256  T
Q  123 tgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaac 219  Q
    ||||  ||   ||||||  | |||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||   |||| || ||||| |||| |||||||| |||||| |||||    
T  22337255 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctg-ttgttatttaac 22337157  T
Q  220 taagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22337156 taagctgcatgagtcggtc 22337138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23660273 - 23660046
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||| | || | |||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  23660273 tgaaccttggggtagtattgagacttattgatgatgttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 23660174  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgttt 209  Q
    || |||||||||||   ||  ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  23660173 tacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctg-tt 23660075  T
Q  210 gttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||  ||||||||| | ||||||||||||    
T  23660074 gttgtttaactaagatacatgagtcggtc 23660046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 23103399 - 23103493
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23103399 agatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23103493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 238
Target Start/End: Original strand, 23708524 - 23708717
Alignment:
Q  49 ttaattataatctgtgaagctgt-ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 146  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||   ||| || || |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||  ||||||| ||   | |||    
T  23708524 ttaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgaga 23708623  T
Q  147 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||| ||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23708624 tgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtc 23708717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 175
Target Start/End: Original strand, 40622123 - 40622244
Alignment:
Q  57 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatt-----tgtatacataagatgttg 151  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  40622123 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtactgtatacataagatgttg 40622221  T
Q  152 atgaattgaaattgatattattat 175  Q
    |||||||| ||||||||| |||||    
T  40622222 atgaattg-aattgatataattat 40622244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 231
Target Start/End: Original strand, 7735 - 7824
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatga 231  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7735 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 7824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22105560 - 22105432
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||||||    
T  22105560 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 22105461  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22105460 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 22105432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23207350 - 23207300
Alignment:
Q  188 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23207350 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 23207300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 27753810 - 27753728
Alignment:
Q  29 attaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat 111  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27753810 attaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgat 27753728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7679702 - 7679612
Alignment:
Q  145 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7679702 gatgttgatgactt-acattgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 7679612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19671928 - 19671857
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19671928 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtc 19671857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28406048 - 28405999
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28406048 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 28405999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Original strand, 20520243 - 20520291
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20520243 tactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 20520291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 21155075 - 21155202
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||  | |||||||| |    
T  21155075 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-t 21155172  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21155173 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21155202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23004819 - 23004772
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggt 237  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23004819 tactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 23004772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26505526 - 26505399
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||    
T  26505526 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 26505428  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26505427 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 26505399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26508004 - 26507877
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||    
T  26508004 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 26507906  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26507905 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 26507877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 22413186 - 22413236
Alignment:
Q  188 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22413186 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtc 22413236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 236
Target Start/End: Original strand, 23071972 - 23072045
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcgg 236  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23071972 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcgg 23072045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25175922 - 25175880
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25175922 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 25175880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215063
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    || | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32215021 gc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 32215063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287386
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtc 23287386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108910
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtc 25108910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18809090 - 18808963
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  18809090 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18808992  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18808991 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 18808963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23131009 - 23130882
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23131009 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23130911  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23130910 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23130882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23133476 - 23133349
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23133476 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23133378  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23133377 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23133349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23135737 - 23135610
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23135737 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23135639  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23135638 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23135610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 23709547 - 23709674
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23709547 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23709645  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23709646 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23709674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 23712028 - 23712155
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  23712028 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23712126  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23712127 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23712155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24367921 - 24367794
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24367921 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24367823  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24367822 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 24367794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392405
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtc 26392405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 34402537 - 34402664
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  34402537 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 34402635  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34402636 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 34402664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39682460 - 39682333
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  39682460 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 39682362  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39682361 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 39682333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8946732 - 8946680
Alignment:
Q  185 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8946732 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtc 8946680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 18786952 - 18787001
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18786952 atactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 18787001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 22134256 - 22134304
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  22134256 atactgcctatgttgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtc 22134304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 238
Target Start/End: Original strand, 32451948 - 32452027
Alignment:
Q  162 attgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||| ||||||||||   || ||| || ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  32451948 attgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtc 32452027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 571493 - 571417
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  571493 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 571417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6726091 - 6726015
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6726091 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 6726015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23791344 - 23791296
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  23791344 tactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtc 23791296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 188
Target Start/End: Original strand, 23019706 - 23019752
Alignment:
Q  142 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 188  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23019706 taagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgttgttgt 23019752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 238
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040287
Alignment:
Q  197 tatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23040287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Original strand, 24697657 - 24697705
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  24697657 tactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtc 24697705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 24898210 - 24898338
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||  | |||||||| |    
T  24898210 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-t 24898307  T
Q  209 tgttaattaact-aagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24898308 tgttatttaactaaagctgcatgagtcggtc 24898338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 24900693 - 24900821
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||  | |||||||| |    
T  24900693 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-t 24900790  T
Q  209 tgttaattaact-aagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24900791 tgttatttaactaaagctgcatgagtcggtc 24900821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 24903170 - 24903298
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||  | |||||||| |    
T  24903170 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-t 24903267  T
Q  209 tgttaattaact-aagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24903268 tgttatttaactaaagctgcatgagtcggtc 24903298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 24905647 - 24905775
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||  | |||||||| |    
T  24905647 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-t 24905744  T
Q  209 tgttaattaact-aagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24905745 tgttatttaactaaagctgcatgagtcggtc 24905775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 24908122 - 24908250
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||  | |||||||| |    
T  24908122 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-t 24908219  T
Q  209 tgttaattaact-aagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24908220 tgttatttaactaaagctgcatgagtcggtc 24908250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16530 - 16305
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  16530 tgaacgcttgggtaggattaagacttaataatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttt 16431  T
Q  113 atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16430 atgcattacttgaagaatgtttgtatacataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttctt 16331  T
Q  213 aattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  16330 atttaactaagctgcatgagtcggtc 16305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 24 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17046724 - 17046510
Alignment:
Q  24 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattactt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  17046724 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattactt 17046625  T
Q  124 gaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17046624 gaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 17046525  T
Q  224 ctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||    
T  17046524 ctgcatgagtcggtc 17046510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 14053172 - 14053396
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  14053172 tgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt 14053271  T
Q  113 atgcattacttgaagaatatttgtatacataag-atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| || ||||||    
T  14053272 atgcattacttgaagaatatttgtatgcataagaatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatactgtctatgctgttgtttg 14053371  T
Q  211 ttaattaactaagctgcatgagtcg 235  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||    
T  14053372 ttatttaactaagttgcatgagtcg 14053396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12903008 - 12902780
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-at 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  12903008 tgaacctttgggtaggattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt 12902909  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  12902908 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-t 12902810  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12902809 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 12902780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7089128 - 7088900
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-at 111  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||  |    
T  7089128 tgaacctttgagtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttt 7089029  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  7089028 tatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-t 7088930  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7088929 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 7088900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 44053064 - 44052854
Alignment:
Q  29 attaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaa 126  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  44053064 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatgagcattacttgaa 44052966  T
Q  127 gaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaag 223  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||    
T  44052965 gaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatg-ttgttatttaactgag 44052867  T
Q  224 ctgcatgagtcgg 236  Q
    |||||||||||||    
T  44052866 ctgcatgagtcgg 44052854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22636685 - 22636458
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |     
T  22636685 tgaaccttggggtagtattaagacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgt-taagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgtta 22636587  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||| |||| |||||||| || |    
T  22636586 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttg-t 22636488  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22636487 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 22636458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Original strand, 23374231 - 23374454
Alignment:
Q  15 aacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-atta 113  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  23374231 aacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttta 23374330  T
Q  114 tgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttg 210  Q
    ||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||    
T  23374331 tgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttg 23374429  T
Q  211 ttaattaactaagctgcatgagtcg 235  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  23374430 ttatttaactaagctgcatgagtcg 23374454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 16377393 - 16377619
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  16377393 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 16377492  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttg 210  Q
    || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  16377493 tacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctg-ttg 16377591  T
Q  211 ttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16377592 ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16377619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Original strand, 16270145 - 16270333
Alignment:
Q  52 attataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgtt 150  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||    
T  16270145 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 16270244  T
Q  151 gatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    | | | ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16270245 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtcggtc 16270333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7893935 - 7893726
Alignment:
Q  29 attaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 127  Q
    ||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||   |||||||||| |||||| | | ||||||||||||||    
T  7893935 attaagacttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgat---tatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaag 7893839  T
Q  128 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 224  Q
     ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  7893838 tataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagc 7893740  T
Q  225 tgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||| ||||||    
T  7893739 tgcatgaatcggtc 7893726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 16239849 - 16240067
Alignment:
Q  22 gggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcatta 120  Q
    |||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| | | |||||||    
T  16239849 gggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcatta 16239948  T
Q  121 cttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaa 218  Q
    ||| ||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||  |||||| ||||    
T  16239949 cttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgct-attgttatttaa 16240047  T
Q  219 ctaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||| ||||    
T  16240048 ttaagttgcatgagttggtc 16240067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 3096894 - 3096772
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| ||    
T  3096894 tgaacctttgggtaggataaatacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgttt 3096795  T
Q  113 atgcattacttgaagaatatttg 135  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  3096794 atgcattacttgaagaatatttg 3096772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798797
Alignment:
Q  80 tgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtc 178  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| |||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  179 a---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 7798797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14038899 - 14038675
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  14038899 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 14038800  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||| |||||||   ||||||||||| | |||||||| |    
T  14038799 tgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctg-t 14038701  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14038700 tgttatttaactaagctgcatgagtc 14038675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 238
Target Start/End: Original strand, 13800 - 13949
Alignment:
Q  92 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt-- 188  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |      
T  13800 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgc 13899  T
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13900 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 13949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899914
Alignment:
Q  92 ttatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttg 187  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||  ||||||  |||    
T  6900062 ttatgatgtgatataatg-ttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttg 6899964  T
Q  188 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagatgcatgagtcggtc 6899914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 89 - 175
Target Start/End: Original strand, 15121749 - 15121834
Alignment:
Q  89 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattat 175  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15121749 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataattat 15121834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 89 - 208
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256227
Alignment:
Q  89 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 186  Q
    ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 43256204  T
Q  187 -gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
     |||| |||||||||||||||||    
T  43256205 ggtatgctgcctatgttgctgtt 43256227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Original strand, 17047942 - 17048055
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-at 111  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||  |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  17047942 tgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagagactaattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt 17048041  T
Q  112 tatgcattacttga 125  Q
    ||||||||||||||    
T  17048042 tatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Original strand, 52873367 - 52873465
Alignment:
Q  142 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52873367 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 52873465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15551915 - 15551840
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15551915 gatattattatatcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 15551840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 12288259 - 12288308
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12288259 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 12288308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12774079 - 12774030
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12774079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 12774030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 52243245 - 52243294
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52243245 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 52243294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14280431 - 14280336
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14280431 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 14280336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3096373 - 3096316
Alignment:
Q  180 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3096373 tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 3096316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22353984 - 22353856
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg-tata--ctgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||| |    
T  22353984 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatctgcctatgctgctg-t 22353886  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22353885 tgttatttacctaagctgcatgagtcggtc 22353856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 46640504 - 46640554
Alignment:
Q  188 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46640504 tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 46640554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 39706337 - 39706386
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39706337 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 39706386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082250
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 53082250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 18215289 - 18215416
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  18215289 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 18215387  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18215388 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 18215416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 44928894 - 44929022
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||  ||| ||| | |||| |||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  44928894 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt 44928993  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44928994 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 44929022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 54798756 - 54798852
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  54798756 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctg-ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtc 54798852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618314
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||  || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19618272 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 19618314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803407
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     | | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23803365 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23803407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 238
Target Start/End: Original strand, 43198611 - 43198653
Alignment:
Q  196 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43198611 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 43198653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6190564 - 6190485
Alignment:
Q  162 attgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||| ||||||||||   || ||| || ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  6190564 attgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtc 6190485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 8574871 - 8574965
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8574871 agatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 8574965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8846428 - 8846379
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  8846428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtc 8846379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 12322 - 12449
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  12322 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 12420  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12421 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 12449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 15118367 - 15118494
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  15118367 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 15118465  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15118466 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 15118494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44615435 - 44615308
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  44615435 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 44615337  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44615336 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 44615308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 52312657 - 52312530
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  52312657 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 52312559  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52312558 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 52312530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515027
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||| || ||||   |||||||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    || | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3515069 gc-tgtgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggtc 3515027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242719
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |  | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19242761 gt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 19242719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464010
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 193  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     | | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51463968 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 51464010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 238
Target Start/End: Original strand, 1837503 - 1837651
Alignment:
Q  92 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---g 187  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||   |    
T  1837503 ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 1837602  T
Q  188 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1837603 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 1837651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 15355391 - 15355467
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15355391 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 15355467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 44773153 - 44773229
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44773153 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 44773229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 18239434 - 18239561
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | || |||||||    
T  18239434 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt 18239532  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18239533 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 18239561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16596746 - 16596686
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaag 223  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16596746 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333304
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtc 17333304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13746 - 13520
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  13746 tgaacctttcggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgttt 13647  T
Q  113 atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttg 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  13646 atgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttg 13548  T
Q  211 ttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13547 ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 13520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1534 - 1312
Alignment:
Q  16 acccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  1534 acccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatg 1435  T
Q  116 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaat 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  1434 cattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgttgtacactgcctatgttgctgtttgttatt 1335  T
Q  216 taactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1334 taactaagctgcatgagtcggtc 1312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7511 - 7289
Alignment:
Q  16 acccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  7511 acccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatg 7412  T
Q  116 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaat 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  7411 cattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatt 7312  T
Q  216 taactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  7311 taactaagctgcatgagtcggtc 7289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 238
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15336
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 15336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 47237 - 47018
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  47237 tgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgag------tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgttt 47144  T
Q  113 atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  47143 atgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgctgtaaactgcctatgttgttgtttgtt 47044  T
Q  213 aattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  47043 atttaactaagctacatgagtcggtc 47018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 52)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 16920503 - 16920728
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  16920503 tgaacccttgggtagaattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgttt 16920602  T
Q  113 atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16920603 atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatgttgtatactgcctatgctgctgtttgtt 16920702  T
Q  213 aattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  16920703 atttaactaagctgcatgagtcggtc 16920728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22831753 - 22831526
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  22831753 tgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttt 22831654  T
Q  113 atgcattacttgaagaatatttgtataca--taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttg 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  22831653 atgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttg 22831554  T
Q  211 ttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22831553 ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 22831526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 89 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245609
Alignment:
Q  89 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 35245659  T
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245658 atactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 35245609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11185750 - 11185528
Alignment:
Q  16 acccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  11185750 acccttgggtaggattaagacttaatagtgaggttaaccgtaatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtttatg 11185651  T
Q  116 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaat 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| |    
T  11185650 cattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatt 11185551  T
Q  216 taactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11185550 taactaagctgcatgagtcggtc 11185528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 20360830 - 20361055
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  20360830 tgaacctttgggtagtattaagacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtta 20360929  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  20360930 tatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctg-t 20361028  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcg 235  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20361029 tgttatttaactaagctgcatgagtcg 20361055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 238
Target Start/End: Original strand, 20638169 - 20638381
Alignment:
Q  29 attaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaag 127  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  20638169 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaag 20638268  T
Q  128 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 224  Q
    ||| |||| |||   ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  20638269 aatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagc 20638367  T
Q  225 tgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||| ||||    
T  20638368 tgcatgagttggtc 20638381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29060791 - 29060563
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| |     
T  29060791 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgtta 29060692  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    | |||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |    
T  29060691 tgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-t 29060593  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29060592 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 29060563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 17287666 - 17287894
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| |  | ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||  | |||||||| | ||| |||||| |     
T  17287666 tgaaccttggggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgtta 17287765  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||| |    
T  17287766 tgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctg-t 17287864  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17287865 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 17287894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 22780097 - 22780321
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| || |||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| |     
T  22780097 tgaaccttggggtagtataaagacttaatgatgatgttaatcataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttg 22780196  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
      |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||  || |    
T  22780197 cgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttg-t 22780295  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22780296 tgttatttaactaagctgcatgagtc 22780321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 238
Target Start/End: Original strand, 19303446 - 19303638
Alignment:
Q  48 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataag 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||   ||||||  | ||    
T  19303446 gttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgag 19303544  T
Q  146 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19303545 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 19303638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 18409697 - 18409925
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  18409697 tgaaccttagggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 18409796  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||| |||| |||||  ||   || ||   | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| |    
T  18409797 tatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctg-t 18409895  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18409896 tgttatttaactgagctgcatgagtcggtc 18409925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20594024 - 20593796
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| || |     
T  20594024 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgataatgataattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgtta 20593925  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    || |||||||||||   ||  |||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  20593924 tacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtt 20593825  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    | ||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  20593824 t-ttatttaactgagctgcatgattcggtc 20593796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16496396 - 16496267
Alignment:
Q  111 ttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgt 207  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||     
T  16496396 ttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg- 16496298  T
Q  208 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16496297 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16496267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 25629225 - 25629453
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  25629225 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 25629324  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||| ||||   ||||||||| | |||| ||| |    
T  25629325 tacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctg-t 25629423  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25629424 tgtaatttaactaagctgcatgagtcggtc 25629453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20109285 - 20109161
Alignment:
Q  116 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgtta 213  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  20109285 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttt 20109186  T
Q  214 attaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20109185 attaactaagctgcatgagtcggtc 20109161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076723
Alignment:
Q  97 atgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatact 193  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||| ||| ||| ||   ||||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||| ||||  || ||||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttact 20076767  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20076766 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20076723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 208
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416008
Alignment:
Q  89 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 185  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtt 27415985  T
Q  186 tgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  27415986 tgtatgctgcctatgttgctgtt 27416008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019429
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtc 23019429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 27333267 - 27333316
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27333267 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 27333316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 27394007 - 27394056
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27394007 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 27394056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25644440 - 25644343
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| |||| |||   |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25644440 agatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 25644343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19668436 - 19668394
Alignment:
Q  196 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668436 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 19668394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 9098563 - 9098612
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9098563 atactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 9098612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076753
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 23076753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25656725 - 25656649
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25656725 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 25656649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Original strand, 28496494 - 28496569
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28496494 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 28496569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Original strand, 29808905 - 29808980
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29808905 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 29808980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008171
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 35008171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1595692 - 1595573
Alignment:
Q  116 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 212  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||| |||||    
T  1595692 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttatgttgctg-ttgtt 1595595  T
Q  213 aattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  1595594 atttaactaagctgcatgagtc 1595573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 2291195 - 2291322
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  2291195 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 2291293  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2291294 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 2291322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754829
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     | | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25754871 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 25754829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676852
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||   |||||||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30676810 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 30676852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33443119 - 33443070
Alignment:
Q  188 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33443119 tatactgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtc 33443070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 238
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4185919
Alignment:
Q  148 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4185919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19652267 - 19652218
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19652267 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtc 19652218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22782323 - 22782247
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22782323 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 22782247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12742464 - 12742337
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  12742464 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 12742366  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12742365 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 12742337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 18334607 - 18334734
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  18334607 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18334705  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18334706 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 18334734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19005193 - 19005066
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  19005193 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 19005095  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19005094 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 19005066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 19858934 - 19859061
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  19858934 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 19859032  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19859033 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 19859061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24422694 - 24422567
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  24422694 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24422596  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24422595 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 24422567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33861941 - 33861814
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  33861941 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 33861843  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33861842 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 33861814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33864425 - 33864298
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  33864425 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 33864327  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33864326 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 33864298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963393
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |  | |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  34963435 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 34963393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25688598 - 25688525
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcg 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  25688598 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 25688525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 235
Target Start/End: Original strand, 1540926 - 1541050
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||  | ||||||||||    
T  1540926 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 1541024  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcg 235  Q
     |||| |||||||||||||||||||||    
T  1541025 -gttatttaactaagctgcatgagtcg 1541050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Original strand, 8227534 - 8227609
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8227534 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtc 8227609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 237
Target Start/End: Original strand, 16448593 - 16448668
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggt 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16448593 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16448668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186390
Alignment:
Q  148 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4186390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22432325 - 22432269
Alignment:
Q  180 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggt 237  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22432325 tgttgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggt 22432269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22438875 - 22438819
Alignment:
Q  180 tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggt 237  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22438875 tgttgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggt 22438819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1561401 - 1561330
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1561401 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtc 1561330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 51827 - 51605
Alignment:
Q  16 acccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||    
T  51827 acccttgggtaggattaagacttaagagtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtttatg 51728  T
Q  116 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaat 215  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51727 catttcttgaaggatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatt 51628  T
Q  216 taactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  51627 taactaagctgcatgagtcggtc 51605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 5001 - 5226
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||    
T  5001 tgaacccttgggtaggattaagatttaataataaggttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgttt 5100  T
Q  113 atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 212  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  5101 atacattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgttgtataatacctatgttgatgtttgtt 5200  T
Q  213 aattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  5201 atttaactaagctgcatgagtcggtc 5226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 238
Target Start/End: Original strand, 21292843 - 21293067
Alignment:
Q  16 acccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21292843 acccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatg 21292942  T
Q  116 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa-ttgaa-attgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21292943 cattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgtt 21293041  T
Q  213 aattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||    
T  21293042 atttaactaagctgcatgaatcggtc 21293067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 238
Target Start/End: Original strand, 23390382 - 23390594
Alignment:
Q  29 attaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 127  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  23390382 attaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 23390481  T
Q  128 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 224  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23390482 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 23390580  T
Q  225 tgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||    
T  23390581 tgcatgagtcggtc 23390594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22075268 - 22075042
Alignment:
Q  15 aacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-atta 113  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  22075268 aacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttta 22075169  T
Q  114 tgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttg 210  Q
    ||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| |||    
T  22075168 tgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctg-ttg 22075070  T
Q  211 ttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22075069 ttatttaactaagctgaatgagtcggtc 22075042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 8286712 - 8286941
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  8286712 tgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 8286811  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg----ttgttgtatactgcctatgttgctgt 207  Q
    | ||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||     
T  8286812 tgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctg- 8286910  T
Q  208 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8286911 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 8286941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24493819 - 24493592
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  24493819 tgaaccttggggtagtattaagacttaataatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 24493720  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgttt 209  Q
    | ||||| |||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||    
T  24493719 tgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-att 24493621  T
Q  210 gttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24493620 gttacttaaccaagctgcatgagtcggtc 24493592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25421783 - 25421555
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  25421783 tgaaccttggggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 25421684  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |    
T  25421683 tgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-t 25421585  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25421584 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 25421555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25431635 - 25431417
Alignment:
Q  23 ggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattac 121  Q
    ||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  25431635 ggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattac 25431536  T
Q  122 ttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaa 218  Q
    |||||| ||| ||| | |  |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25431535 ttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaa 25431437  T
Q  219 ctaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  25431436 ctaagatgcatgagtcggtc 25431417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9078203 - 9077983
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  9078203 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 9078104  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    || |||||||||||   ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| |    
T  9078103 tacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctg-t 9078005  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatg 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  9078004 tgttatttaactaagctgcatg 9077983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13025561 - 13025334
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||    
T  13025561 tgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatg-tt 13025463  T
Q  113 atg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||  ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |    
T  13025462 atgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-at 13025364  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13025363 tgttatttaactatgctgcatgagtcggtc 13025334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13095745 - 13095518
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||    
T  13095745 tgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatg-tt 13095647  T
Q  113 atg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||  ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |    
T  13095646 atgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-at 13095548  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13095547 tgttatttaactatgctgcatgagtcggtc 13095518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24529471 - 24529243
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| | ||||||| || | ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| |     
T  24529471 tgaaccttggggtagtattgaaacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgtta 24529372  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    || |||||||||||   ||   ||||||  |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  24529371 taagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt 24529272  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24529271 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 24529243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 238
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808487
Alignment:
Q  97 atgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatac 192  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21808442  T
Q  193 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21808443 tgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21808487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 238
Target Start/End: Original strand, 21729033 - 21729162
Alignment:
Q  111 ttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgt 207  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||     
T  21729033 ttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg- 21729131  T
Q  208 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21729132 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21729162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1096709 - 1096490
Alignment:
Q  22 gggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcatta 120  Q
    |||||| ||| ||||||||| |  | ||||||||||| || ||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1096709 gggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcatta 1096610  T
Q  121 cttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaatta 217  Q
    ||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||   ||| ||||| ||| |||||||| |||||| |||    
T  1096609 cttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctg-ttgttattta 1096511  T
Q  218 actaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1096510 actaagctgcatgagtcggtc 1096490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 126
Target Start/End: Original strand, 22107239 - 22107357
Alignment:
Q  9 gagatgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataat 108  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22107239 gagatgaacctttgagtagtattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataat 22107338  T
Q  109 -gattatgcattacttgaa 126  Q
      |||||||||||||||||    
T  22107339 atattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37724020 - 37723930
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37724020 agatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtc 37723930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 89 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356367
Alignment:
Q  89 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tt 186  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgttt 18356389  T
Q  187 gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  18356388 gtatgctgcctatgttgctgtt 18356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 161
Target Start/End: Original strand, 18769919 - 18770022
Alignment:
Q  57 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 156  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18769919 aatctgtgaagctg-atatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 18770017  T
Q  157 ttgaa 161  Q
    |||||    
T  18770018 ttgaa 18770022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 21997555 - 21997632
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21997555 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21997632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22032520 - 22032417
Alignment:
Q  57 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 156  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22032520 aatctgtgaagctg-atacgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 22032422  T
Q  157 ttgaa 161  Q
    |||||    
T  22032421 ttgaa 22032417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 89 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23572252 - 23572180
Alignment:
Q  89 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaa 161  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23572252 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa 23572180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 26012056 - 26012133
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| |||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26012056 ttgatattgttatatcatgttgctttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 26012133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 238
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027039
Alignment:
Q  145 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt----tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||     | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20027039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 238
Target Start/End: Original strand, 21329500 - 21329595
Alignment:
Q  145 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| |||| | ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21329500 gatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21329595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 208
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910866
Alignment:
Q  89 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 185  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt 20910843  T
Q  186 tgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  20910844 tgtatgctgtctatgttgctgtt 20910866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 19660884 - 19660933
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19660884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 19660933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 21502205 - 21502254
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21502205 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 21502254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22144168 - 22144072
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| |  ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22144168 agatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 22144072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 22959581 - 22959630
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22959581 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 22959630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314600
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 36314600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21565659 - 21565565
Alignment:
Q  146 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21565659 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21565565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412207
Alignment:
Q  49 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |||      ||||    ||||||||  ||   ||||||  | |||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac-----ttat----tacttgaattatgaatgtatatttgagatg 22412298  T
Q  149 ttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22412297 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttg-ttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtc 22412207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29330081 - 29329954
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  29330081 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 29329983  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29329982 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 29329954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18418793 - 18418633
Alignment:
Q  49 ttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 146  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||| | |||    ||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||  |  ||| |||  |||||    
T  18418793 ttaattataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatat-taaga 18418695  T
Q  147 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  18418694 tgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgatgtt 18418633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 22178269 - 22178319
Alignment:
Q  188 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22178269 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtc 22178319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 11581265 - 11581341
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11581265 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 11581341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 20902075 - 20902151
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20902075 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20902151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 264783 - 264910
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  264783 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 264881  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  264882 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 264910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 10732955 - 10733082
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  10732955 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 10733053  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10733054 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 10733082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20909159 - 20909032
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||| ||    
T  20909159 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgct-tt 20909062  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20909061 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20909032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 238
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732930
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtc 26732930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39363531 - 39363404
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  39363531 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 39363433  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39363432 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 39363404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39245232 - 39245156
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39245232 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 39245156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40725951 - 40725876
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  40725951 gatattattatatcatgatgctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtc 40725876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 237
Target Start/End: Original strand, 18319100 - 18319175
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggt 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18319100 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 18319175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 238
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740743
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtc 26740743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 42245380 - 42245507
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  42245380 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 42245478  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  42245479 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 42245507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 2154680 - 2154756
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2154680 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 2154756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 38801261 - 38801483
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||    
T  38801261 tgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgttt 38801360  T
Q  113 atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgtt 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  38801361 atgcattacttgaagaataattgtatatataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcttgctgttgcacactgcctatgttgctgtttgtt 38801460  T
Q  213 aattaactaagctgcatgagtcg 235  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  38801461 atttaactaagctgcatgagtcg 38801483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 27250599 - 27250827
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-at 111  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  27250599 tgaacctttgggtagcattgatacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt 27250698  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||  |    
T  27250699 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-at 27250797  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27250798 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 27250827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21026929 - 21026703
Alignment:
Q  15 aacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-atta 113  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||  |||    
T  21026929 aacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgtttta 21026830  T
Q  114 tgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttg 210  Q
    ||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||    
T  21026829 tgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctg-ttg 21026731  T
Q  211 ttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21026730 ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21026703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 50210083 - 50210311
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  50210083 tgaacctttgggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 50210182  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
     | ||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |    
T  50210183 aacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-t 50210281  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50210282 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 50210311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 186
Target Start/End: Original strand, 22354442 - 22354616
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  22354442 tgaacctttaggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 22354541  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 186  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  22354542 tatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34510031 - 34509803
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| |     
T  34510031 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgtta 34509932  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    || |||||||||||   ||   ||||||  |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  34509931 taagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 34509832  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34509831 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 34509803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22532510 - 22532292
Alignment:
Q  23 ggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattac 121  Q
    ||||| ||| ||||||||| || | |||| |||| | |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  22532510 ggtagtattgagacttaatgatgatgttatttatgaactgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattac 22532411  T
Q  122 ttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaa 218  Q
    |||||  ||   || |||  |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22532410 ttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaa 22532312  T
Q  219 ctaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||  ||||||||| ||||    
T  22532311 ctaaattgcatgagttggtc 22532292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20135403 - 20135214
Alignment:
Q  48 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||  |  ||| |||| |||||    
T  20135403 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaaga 20135304  T
Q  147 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    ||||| ||||||| |  |||||||||||||||   |||||||||||  ||||||||| ||||  |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  20135303 tgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttgtttaactaagttgcatgagtc 20135214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 234
Target Start/End: Original strand, 22468604 - 22468790
Alignment:
Q  50 taattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || || || | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||   ||  ||| |||  |||||||    
T  22468604 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatg-taattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatg 22468702  T
Q  149 ttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22468703 ttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtc 22468790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 89 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797573
Alignment:
Q  89 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 185  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 33797596  T
Q  186 tgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    
T  33797595 tgtatgctgcatatgttgctgtt 33797573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 48603730 - 48603652
Alignment:
Q  48 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  48603730 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 21896258 - 21896354
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21896258 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtc 21896354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 152
Target Start/End: Original strand, 22356060 - 22356185
Alignment:
Q  29 attaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttga-tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaa 126  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  22356060 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 22356159  T
Q  127 gaatatttgtatacataagatgttga 152  Q
    |||| |||| |||  || ||||||||    
T  22356160 gaatgtttgaatatttatgatgttga 22356185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 152
Target Start/End: Original strand, 22357746 - 22357871
Alignment:
Q  29 attaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttga-tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaa 126  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  22357746 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 22357845  T
Q  127 gaatatttgtatacataagatgttga 152  Q
    |||| |||| |||  || ||||||||    
T  22357846 gaatgtttgaatatttatgatgttga 22357871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 21861572 - 21861668
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21861572 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtc 21861668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 35261099 - 35261176
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35261099 ttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 35261176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Original strand, 14295574 - 14295649
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14295574 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 14295649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20918702 - 20918627
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20918702 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20918627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Original strand, 50614167 - 50614215
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50614167 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 50614215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Original strand, 50621995 - 50622043
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50621995 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 50622043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 238
Target Start/End: Original strand, 16368338 - 16368384
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16368338 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 16368384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21754145 - 21754068
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21754145 ttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21754068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16758721 - 16758672
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16758721 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 16758672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 22921918 - 22921967
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22921918 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 22921967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33681079 - 33681030
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  33681079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 33681030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 238
Target Start/End: Original strand, 45574912 - 45574985
Alignment:
Q  167 tattattatgtcatgttgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||| |||| |   |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45574912 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 45574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 433157 - 433032
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||        
T  433157 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc---- 433062  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  433061 cgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 433032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840787
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21840829 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21840787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Original strand, 23593735 - 23593877
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  23593735 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23593834  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23593835 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23593877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 41050084 - 41050134
Alignment:
Q  188 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  41050084 tatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtc 41050134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 20847200 - 20847252
Alignment:
Q  185 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20847200 ttgtgtactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20847252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22237746 - 22237650
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22237746 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtc 22237650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 52928019 - 52928068
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52928019 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 52928068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 22123133 - 22123210
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||||  | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22123133 ttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtc 22123210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26065009 - 26064961
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtc 26064961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13989013 - 13988886
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13989013 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13988915  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13988914 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 13988886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 21923306 - 21923433
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21923306 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21923404  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21923405 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21923433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29776835 - 29776708
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||||||||    
T  29776835 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 29776737  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29776736 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 29776708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 50686681 - 50686634
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  50686681 actgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtc 50686634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 16093933 - 16093983
Alignment:
Q  188 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  16093933 tatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtc 16093983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 238
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454651
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20454651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 238
Target Start/End: Original strand, 15860078 - 15860151
Alignment:
Q  166 atattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15860078 atattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 15860151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20248351 - 20248302
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  20248351 atactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtc 20248302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 21475102 - 21475229
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21475102 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21475200  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21475201 -gttatttaactaagctgcatgagttggtc 21475229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4962 - 4735
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  4962 tgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt 4863  T
Q  113 atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgttt 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  4862 atgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-tt 4764  T
Q  210 gttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4763 gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 4735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 186 - 13
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  186 tgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttt 87  T
Q  113 atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 186  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||    
T  86 atgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtt 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 72)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 20698306 - 20698533
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||    
T  20698306 tgaacctttggatagaattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgttt 20698405  T
Q  113 atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgttt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  20698406 atgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-tt 20698504  T
Q  210 gttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20698505 gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20698533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13442509 - 13442297
Alignment:
Q  29 attaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 127  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  13442509 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 13442410  T
Q  128 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 224  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  13442409 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccg-ttgttatttaactaagc 13442311  T
Q  225 tgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||    
T  13442310 tgcatgagtcggtc 13442297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17488091 - 17487879
Alignment:
Q  29 attaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 127  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17488091 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaag 17487992  T
Q  128 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 224  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  17487991 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctg-ttgttatttaactaagc 17487893  T
Q  225 tgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||    
T  17487892 tgcatgagtcggtc 17487879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17499573 - 17499361
Alignment:
Q  29 attaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 127  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17499573 attaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaag 17499474  T
Q  128 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 224  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  17499473 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctg-ttgttatttaactaagc 17499375  T
Q  225 tgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||    
T  17499374 tgcatgagtcggtc 17499361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12399453 - 12399232
Alignment:
Q  20 ttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcat 118  Q
    |||||||| |||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12399453 ttgggtagcattaagacataatgaagaggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcat 12399354  T
Q  119 tacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaat 215  Q
    |||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  12399353 tacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatt 12399255  T
Q  216 taactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12399254 taactaagctgcatgagtcggtc 12399232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 14576703 - 14576930
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  14576703 tgaaccttggggtagtattaagatttaatgatgatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 14576802  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttg--tatactgcctatgttgctgttt 209  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||    
T  14576803 tatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctg-tt 14576901  T
Q  210 gttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||    
T  14576902 gttatttaactaagttgaatgagtcggtc 14576930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14973105 - 14972877
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  14973105 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 14973006  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  ||   |||||| || |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  14973005 tatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctg-t 14972907  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14972906 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 14972877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 238
Target Start/End: Original strand, 23083241 - 23083459
Alignment:
Q  23 ggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattac 121  Q
    ||||| ||||||||||| | || | |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  23083241 ggtagtattaagacttagtgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattac 23083340  T
Q  122 ttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaa 218  Q
    | |||| | | ||| |||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  23083341 tagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaa 23083439  T
Q  219 ctaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23083440 ctaagctgcatgagtcggtc 23083459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26687103 - 26686910
Alignment:
Q  48 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| | | |||  |||||    
T  26687103 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaaga 26687004  T
Q  147 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    || || ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26687003 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 26686910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 43841148 - 43840956
Alignment:
Q  48 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  43841148 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 43841049  T
Q  147 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggt 237  Q
    || || ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43841048 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 43840956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18438785 - 18438557
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| |     
T  18438785 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgtta 18438686  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    ||||||||||||||   ||   |||||| | ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  18438685 tatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-t 18438587  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18438586 tgttatttaactaagctacatgagtcggtc 18438557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14572839 - 14572612
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-at 111  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||  || || ||||||||||||||||||  |    
T  14572839 tgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgttt 14572740  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgttt 209  Q
    | | ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||    
T  14572739 ttttcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctg-tt 14572641  T
Q  210 gttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14572640 gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 14572612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 238
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153306
Alignment:
Q  49 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  148 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 24153306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 238
Target Start/End: Original strand, 25476265 - 25476483
Alignment:
Q  23 ggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattat--gcatta 120  Q
    ||||| ||| ||||||||| |  | |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  25476265 ggtagtattgagacttaatgaggatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatg-ttatgcgcatta 25476363  T
Q  121 cttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaatta 217  Q
    ||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| ||||||||| ||| |||||||| |||||  |||    
T  25476364 cttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctg-ttgtttttta 25476462  T
Q  218 actaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  25476463 actaagctacatgagtcggtc 25476483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 40213600 - 40213818
Alignment:
Q  22 gggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcatta 120  Q
    |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  40213600 gggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatta 40213699  T
Q  121 cttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttaatta 217  Q
    |||| |  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   ||||||||| || ||||| || |||||| |||    
T  40213700 cttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatg-ttgttattta 40213797  T
Q  218 actaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  40213798 actaagctacatgagtcggtc 40213818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 11424642 - 11424853
Alignment:
Q  22 gggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcatta 120  Q
    |||||| ||| |||||||||  | | ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | || ||||||    
T  11424642 gggtagtattgagacttaatgttgatgttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcatta 11424741  T
Q  121 cttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaa 218  Q
    ||||||  ||   || |||  | ||||||||||   |||  ||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11424742 cttgaattatgaatgcataattgagatgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaa 11424837  T
Q  219 ctaagctgcatgagtc 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  11424838 ctaagctgcatgagtc 11424853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 42386627 - 42386433
Alignment:
Q  48 gttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 145  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||  ||   || |||  | ||    
T  42386627 gttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgag 42386528  T
Q  146 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  42386527 atgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaaactgcatgagtcggtc 42386433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 14179648 - 14179570
Alignment:
Q  48 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14179648 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16796798 - 16796685
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-at 111  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  |    
T  16796798 tgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttt 16796699  T
Q  112 tatgcattacttga 125  Q
    ||||||||||||||    
T  16796698 tatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 12174308 - 12174357
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12174308 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 12174357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470947
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 15470947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32307749 - 32307700
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32307749 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 32307700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 49668125 - 49668174
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49668125 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 49668174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 856304 - 856162
Alignment:
Q  93 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtat 190  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||  | | ||||||||||     
T  856304 tatgatgtattataatgtttatgtattacttgaagattaattgtatacataagatgttgttgaattg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaa 856206  T
Q  191 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcg 235  Q
     ||||||||||||||  |||||| | ||||||| |||||||||||    
T  856205 tctgcctatgttgct-attgttattcaactaagttgcatgagtcg 856162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Original strand, 13210350 - 13210425
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13210350 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 13210425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110450
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 22110450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 234
Target Start/End: Original strand, 24340746 - 24340817
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24340746 gatattattatatcatgatgttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtc 24340817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 43926029 - 43925981
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43926029 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 43925981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 37251216 - 37251266
Alignment:
Q  188 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  37251216 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtc 37251266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242842
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     | | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50242884 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 50242842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 237
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606423
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggt 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 606423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9512992 - 9512943
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9512992 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtc 9512943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9520967 - 9520918
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9520967 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtc 9520918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27165366 - 27165270
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| ||||||| ||| | ||||||||  ||| |||||||||| |  |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27165366 agatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 27165270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 52523778 - 52523827
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52523778 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 52523827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23274785 - 23274714
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23274785 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtc 23274714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 9707622 - 9707749
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  9707622 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 9707720  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9707721 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 9707749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 29172598 - 29172725
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  29172598 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 29172696  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29172697 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 29172725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 53070668 - 53070795
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||   ||||||||  ||||||||||||    
T  53070668 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt 53070766  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53070767 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 53070795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12377994 - 12377944
Alignment:
Q  188 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  12377994 tatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtc 12377944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567580
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12567622 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 12567580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544045
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13544087 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 13544045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672646
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 193  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    || ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17672688 gc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 17672646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194713
Alignment:
Q  196 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 28194713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 53301572 - 53301649
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  53301572 ttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtc 53301649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14234605 - 14234517
Alignment:
Q  145 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatga 231  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14234605 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatga 14234517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16097396 - 16097351
Alignment:
Q  193 tgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16097396 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16097351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16103852 - 16103803
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16103852 atactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtc 16103803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 36166712 - 36166618
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36166712 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 36166618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 30030090 - 30029915
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||| || | ||| | |||||| ||||||||||| |||||| | |||    ||||||||||||||||||||| |     
T  30030090 tgaacctttgggtagctttaagacttaatgatgatgtttaatataatatgtgaagctgtttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttg 30029991  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 188  Q
    | | ||||||||||||  |  ||| |||  ||||| |||| ||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||    
T  30029990 tgtacattacttgaagttttattgaatatttaagacgttg-tgaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgt 30029915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Original strand, 37642288 - 37642363
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  37642288 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtc 37642363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 43550544 - 43550621
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43550544 ttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctg-tcattatttaactaagctgcatgagtcggtc 43550621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 7781362 - 7781489
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  7781362 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 7781460  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7781461 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 7781489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8899241 - 8899114
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  8899241 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 8899143  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8899142 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 8899114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17463325 - 17463198
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  17463325 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 17463227  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17463226 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 17463198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 28848626 - 28848753
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  28848626 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 28848724  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28848725 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 28848753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34159473 - 34159346
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  34159473 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 34159375  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34159374 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 34159346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 38961906 - 38962033
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  38961906 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 38962004  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38962005 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 38962033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 45606922 - 45607049
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  45606922 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 45607020  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45607021 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 45607049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 55476638 - 55476511
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  55476638 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 55476540  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55476539 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 55476511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21618563 - 21618469
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21618563 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21618469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500962
Alignment:
Q  146 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 55500962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 6469200 - 6469276
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6469200 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 6469276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8499614 - 8499538
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||| | | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8499614 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 8499538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919352
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcggtc 13919352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 235
Target Start/End: Original strand, 17446670 - 17446794
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  17446670 tatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 17446768  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcg 235  Q
     |||| |||||||||||||||||||||    
T  17446769 -gttatttaactaagctgcatgagtcg 17446794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 16454296 - 16454423
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  16454296 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 16454394  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16454395 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 16454423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 166 - 238
Target Start/End: Original strand, 16282880 - 16282953
Alignment:
Q  166 atattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16282880 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16282953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 12119791 - 12119867
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12119791 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaacaaagctgcatgagtcggtc 12119867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 13151805 - 13151933
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||  | |||||||| |    
T  13151805 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-t 13151902  T
Q  209 tgttaattaact-aagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13151903 tgttatttaactaaagctgcatgagtcggtc 13151933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 13154270 - 13154398
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||  | |||||||| |    
T  13154270 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-t 13154367  T
Q  209 tgttaattaact-aagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13154368 tgttatttaactaaagctgcatgagtcggtc 13154398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15412525 - 15412449
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15412525 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 15412449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 919 - 1146
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| ||    
T  919 tgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgttt 1018  T
Q  113 atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgttt 209  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| || ||    
T  1019 atgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-tt 1117  T
Q  210 gttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1118 gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 1146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 167849 - 168076
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt 112  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| ||    
T  167849 tgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgttt 167948  T
Q  113 atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgttt 209  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| || ||    
T  167949 atgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-tt 168047  T
Q  210 gttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  168048 gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 168076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 52164 - 51936
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||| |     
T  52164 tgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgtta 52065  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  52064 tgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctg-t 51966  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51965 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 51936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2203 - 1975
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-at 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |    
T  2203 tgaacctttgggtaggattaagacttaatgataaggttattaataatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttt 2104  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |    
T  2103 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctg-t 2005  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2004 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 1975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13446 - 13238
Alignment:
Q  29 attaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 127  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13446 attaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaag 13347  T
Q  128 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 224  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13346 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 13248  T
Q  225 tgcatgagtc 234  Q
    ||||||||||    
T  13247 tgcatgagtc 13238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21162 - 20933
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-at 111  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |  | ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||  |    
T  21162 tgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttt 21063  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||| |    
T  21062 tatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgat 20963  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20962 tgttaattaactaagctttatgagtcggtc 20933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2086 - 1874
Alignment:
Q  29 attaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 127  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  2086 attaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 1987  T
Q  128 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagc 224  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1986 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 1888  T
Q  225 tgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||    
T  1887 tgcatgagtcggtc 1874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3712 - 3493
Alignment:
Q  22 gggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcatta 120  Q
    |||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  3712 gggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcatta 3613  T
Q  121 cttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaatta 217  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  3612 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttattta 3514  T
Q  218 actaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  3513 actaagctacatgagtcggtc 3493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 593 - 366
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| |  | |||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  593 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 494  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg--ttgttgtatactgcctatgttgctgttt 209  Q
    | |||||||||||||| ||| | | |||  |||||||||| ||| ||  |||||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||  || ||    
T  493 tgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattg-tt 395  T
Q  210 gttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  394 gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 238
Target Start/End: Original strand, 24206 - 24401
Alignment:
Q  48 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga-ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  24206 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaag 24305  T
Q  146 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg----ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24306 atgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 24401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 238
Target Start/End: Original strand, 6007 - 6222
Alignment:
Q  29 attaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 127  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  6007 attaagacttaatgatgatgttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 6106  T
Q  128 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgt--ttgttaattaactaa 222  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||   |||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||| ||||||||    
T  6107 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaa 6206  T
Q  223 gctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||    
T  6207 gctgcatgagtcggtc 6222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5059 - 4872
Alignment:
Q  54 tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttga 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||| ||||||||||     
T  5059 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgt 4960  T
Q  153 tgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4959 tgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaatctgcatgagtcggtc 4872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6861 - 6669
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-at 111  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |    
T  6861 tgaacctttgggtaggattaagatttaatgataaggttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttt 6762  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgt 201  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  6761 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 3021 - 3248
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  3021 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 3120  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgttt 209  Q
    |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  3121 tatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-tt 3219  T
Q  210 gttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3220 gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 3248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39011 - 38784
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  39011 tgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 38912  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgttt 209  Q
    | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||    
T  38911 tgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-att 38813  T
Q  210 gttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  38812 gttatttaattaagctgcatgactcggtc 38784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33153 - 32965
Alignment:
Q  52 attataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgtt 150  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||    
T  33153 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 33054  T
Q  151 gatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    | | | ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  33053 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtcggtc 32965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9845 - 9769
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9845 ttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 9769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39727 - 39500
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  39727 tgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 39628  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgttt 209  Q
    | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||    
T  39627 tgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-tt 39529  T
Q  210 gttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39528 gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 39500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 75085 - 75312
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  75085 tgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 75184  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgttt 209  Q
    | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||    
T  75185 tgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-tt 75283  T
Q  210 gttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  75284 gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 75312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 339820 - 340045
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  339820 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgacgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 339919  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgttt 209  Q
    ||  |||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |    
T  339920 tacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttg--t 340016  T
Q  210 gttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  340017 gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 340045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71353
Alignment:
Q  89 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 185  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtt 71376  T
Q  186 tgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  71375 tgtatgctgcctatgttgctgtt 71353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 158465 - 158592
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  158465 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 158563  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  158564 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 158592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 25935 - 26163
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  25935 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 26034  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
     | ||||||||||||  ||   ||||||| | ||| |||| ||||||  | |||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  26035 aacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-t 26133  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26134 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 26163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 234
Target Start/End: Original strand, 44709 - 44801
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  44709 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 44801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 109
Target Start/End: Original strand, 33365 - 33461
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg 109  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||| || ||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||||||||||    
T  33365 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatg 33461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 238
Target Start/End: Original strand, 8438 - 8627
Alignment:
Q  48 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  8438 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 8537  T
Q  147 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    || || ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8538 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgc----tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 8627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23133 - 22906
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| |     
T  23133 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgtta 23034  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||  | |||||||| |    
T  23033 tgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctg-t 22936  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22935 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 22906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 17094 - 17315
Alignment:
Q  22 gggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcatta 120  Q
    |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| || ||||||||||||||||||||| |  | ||||||    
T  17094 gggtagtattgagacttaatcatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcatta 17193  T
Q  121 cttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg-----ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaat 215  Q
    ||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  17194 cttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatt 17292  T
Q  216 taactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17293 taactaagctgcatgagtcggtc 17315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26146 - 25919
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  26146 tgaaccttggggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 26047  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg--ttgttgtatactgcctatgttgctgttt 209  Q
     ||||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||  ||    
T  26046 aatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgct-att 25948  T
Q  210 gttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25947 gttatttaactaagcttcatgagtcggtc 25919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40103 - 39881
Alignment:
Q  18 ccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgc 116  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  40103 ccttgggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgc 40004  T
Q  117 attacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg--ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaa 214  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||  | |||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||  ||||||     
T  40003 attacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgct-attgttat 39905  T
Q  215 ttaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||    
T  39904 ttaactaagcttcatgagttggtc 39881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 124820 - 124675
Alignment:
Q  29 attaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaag 127  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  124820 attaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaag 124721  T
Q  128 aatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattatt 173  Q
    |||||||| |||  ||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  124720 aatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 174883 - 174789
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  174883 agatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 174789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 136414 - 136467
Alignment:
Q  185 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  136414 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtc 136467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 145122 - 145175
Alignment:
Q  185 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  145122 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtc 145175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121789
Alignment:
Q  191 actgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 121789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13308 - 13141
Alignment:
Q  48 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 146  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  13308 gttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 13209  T
Q  147 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgt 211  Q
    || || ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13208 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtttgt 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34221 - 34146
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34221 gatattattatatcatgatgggttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtc 34146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40163 - 39936
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  40163 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 40064  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgttt 209  Q
    | |||||||||||||| ||| |   |||  |||||||||  |||  || | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||    
T  40063 tgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-att 39965  T
Q  210 gttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  39964 gttatttaattaagctgcatgagttggtc 39936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 19933 - 19983
Alignment:
Q  188 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19933 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtc 19983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4758 - 4531
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  4758 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 4659  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| || |||||||| | |||||||| |    
T  4658 tacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-t 4560  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4559 tgttatttaactaagc-gcatgagtcggtc 4531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12340 - 12113
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  12340 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 12241  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| || |||||||| | |||||||| |    
T  12240 tacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-t 12142  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  12141 tgttatttaactaagc-gcatgagtcggtc 12113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22292 - 22065
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  22292 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 22193  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||   |||| || |||||||| | |||||||| |    
T  22192 tacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-t 22094  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22093 tgttatttaactaagc-gcatgagtcggtc 22065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 16470 - 16698
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |     
T  16470 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgtta 16569  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    || ||||||||||||  ||   ||||||| | ||||| || ||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||| |    
T  16570 tacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctg-t 16668  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16669 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 238
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3284
Alignment:
Q  60 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 158  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  159 gaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
      | ||||||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 3284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27027 - 26850
Alignment:
Q  57 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 156  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27027 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 26929  T
Q  157 ttgaaattgatattattat-gtca-tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcg 235  Q
    ||| ||||||||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  26928 ttg-aattgatataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagatgcatgagtcg 26850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 125 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28552 - 28437
Alignment:
Q  125 aagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaacta 221  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  28552 aagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaacta 28454  T
Q  222 agctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||    
T  28453 agctgcatgagtcggtc 28437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11390 - 11315
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11390 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 11315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2095 - 2020
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2095 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 2020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 205 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4575
Alignment:
Q  205 tgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 4575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 238
Target Start/End: Original strand, 32904 - 33054
Alignment:
Q  89 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--t 185  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||| | | |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |    
T  32904 tgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttt 33002  T
Q  186 tgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33003 tgtatactgcctgtgttgctg-ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 33054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 46101 - 45951
Alignment:
Q  89 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--t 185  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||| | | |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |    
T  46101 tgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttt 46003  T
Q  186 tgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46002 tgtatactgcctgtgttgctg-ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 45951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16323 - 16136
Alignment:
Q  53 ttataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttg 151  Q
    ||||||||||||||||||| | | | |||||| || |||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||   ||   ||||||| | ||||| ||    
T  16323 ttataatctgtgaagctgtttta-agatgttgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatg 16225  T
Q  152 atgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     ||  ||| | |||||||||| || || || ||||   ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16224 ttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8715 - 8502
Alignment:
Q  24 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattact 122  Q
    |||| ||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||    ||||| | | |||||||||    
T  8715 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattact 8620  T
Q  123 tgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaac 219  Q
    ||||| | | ||| ||   |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||||||||||  |||||| |||||    
T  8619 tgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgct-attgttatttaac 8521  T
Q  220 taagctgcatgagtcggtc 238  Q
     ||||||||||||||||||    
T  8520 caagctgcatgagtcggtc 8502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 237
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11540
Alignment:
Q  146 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 11540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 11383 - 11440
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctg 70  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  11383 tgaacctttgggtagaattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctg 11440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1052
Alignment:
Q  20 ttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcat 118  Q
    |||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1158 ttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcat 1059  T
Q  119 tacttga 125  Q
    |||||||    
T  1058 tacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 28081 - 27912
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat- 111  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  28081 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 27982  T
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatg 181  Q
    |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  27981 tatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 3732 - 3640
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatat 105  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  3732 tgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 7796 - 7704
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatat 105  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7796 tgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 27770 - 27847
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27770 ttgatattgttatatcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 27847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 2045 - 1977
Alignment:
Q  93 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaa 161  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2045 tatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttgatgaattgaa 1977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 161
Target Start/End: Original strand, 21721 - 21824
Alignment:
Q  57 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 156  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21721 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 21819  T
Q  157 ttgaa 161  Q
    |||||    
T  21820 ttgaa 21824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 161
Target Start/End: Original strand, 29613 - 29716
Alignment:
Q  57 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 156  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  29613 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 29711  T
Q  157 ttgaa 161  Q
    |||||    
T  29712 ttgaa 29716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 89 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12931 - 12859
Alignment:
Q  89 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaa 161  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12931 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa 12859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11308
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  11350 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtc 11308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Original strand, 53498 - 53640
Alignment:
Q  92 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt-- 188  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |      
T  53498 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgc 53597  T
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatga 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53598 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 53640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 208
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15483
Alignment:
Q  89 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-t 185  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt 15460  T
Q  186 tgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    ||||| |||||||||||| ||||    
T  15461 tgtatgctgcctatgttgatgtt 15483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32636 - 32559
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32636 ttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 32559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 162 - 238
Target Start/End: Original strand, 51903 - 51981
Alignment:
Q  162 attgatattattatgtcatg---ttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||| ||   || ||| || |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  51903 attgatattattatgtcttgctatttttgaatgctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtc 51981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 1055
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||| | | | |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1151 agatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 1055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8613 - 8489
Alignment:
Q  116 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgtta 213  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8613 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtta 8514  T
Q  214 attaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  8513 tttaactaagctgcatgagtcggtc 8489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6607 - 6558
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6607 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 6558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12687 - 12591
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  12687 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtc 12591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 6)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 100493 - 100397
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| ||| ||| | | ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  100493 agatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 100397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119898
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 119898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17582
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    || | ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17540 gc-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 17582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 234
Target Start/End: Original strand, 40224 - 40268
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  40224 tactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtc 40268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 94558 - 94431
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  94558 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 94460  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  94459 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 94431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 101571 - 101522
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  101571 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtc 101522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15759 - 15684
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15759 gatattattatatcatgatggtttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtc 15684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4739 - 4547
Alignment:
Q  48 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 146  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | | | |||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  || |||  |||||    
T  4739 gttaattataatttgtgaggctgtttta-agatgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaaga 4641  T
Q  147 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtc---atgttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||  | |||||||||| || ||    || ||||| |||||||||||| || || |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  4640 tgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 4547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 237
Target Start/End: Original strand, 60761 - 60813
Alignment:
Q  185 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  60761 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 60813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 130024 - 129928
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  130024 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtc 129928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 10414 - 10323
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgata 104  Q
    |||||| | |||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  10414 tgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaataataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4714
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4756 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 4714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38389 - 38339
Alignment:
Q  188 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38389 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25179 - 25129
Alignment:
Q  188 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25179 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 25129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 2808 - 2904
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2808 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 2904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 10543 - 10639
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  10543 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtc 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13247 - 13151
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13247 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 13151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 16121 - 16198
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16121 ttgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 16198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2684
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 2684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 8119 - 8172
Alignment:
Q  185 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8119 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtc 8172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19336 - 19287
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19336 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 19287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11562 - 11491
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11562 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtc 11491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 186
Target Start/End: Original strand, 3434 - 3574
Alignment:
Q  48 gttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | ||    
T  3434 gttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgag 3533  T
Q  146 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 186  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  3534 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 3574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Original strand, 1092 - 1167
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1092 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 1167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 234
Target Start/End: Original strand, 38279 - 38350
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38279 gatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtc 38350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Original strand, 14747 - 14795
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14747 tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtc 14795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 573
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  619 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4317
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||  ||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  4459 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4360  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     | | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4359 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 4317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 6332 - 6382
Alignment:
Q  188 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6332 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtc 6382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 238
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13836
Alignment:
Q  195 cctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 13836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 78391 - 78345
Alignment:
Q  192 ctgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  78391 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 78345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Original strand, 129021 - 129068
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  129021 tactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtc 129068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 116544 - 116450
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  116544 agatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 116450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 160784 - 160707
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  160784 ttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 160707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501104
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||| |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  501146 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 501104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 85646 - 85722
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  85646 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 85722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1105
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1154 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 1105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6884 - 6835
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  6884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtc 6835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6683 - 6634
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6683 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 6634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14063 - 14014
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14063 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 14014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5715 - 5666
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  5715 atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtc 5666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 6172 - 6221
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6172 atactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 6221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2743
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 2743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 23932 - 23981
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  23932 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtc 23981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 38704 - 38800
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| ||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  38704 agatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtc 38800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 22672 - 22768
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22672 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 22768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82092
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     | | |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  82134 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtc 82092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 20394 - 20520
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt--gtatactgcctatgttgctgttt 209  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||     
T  20394 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactga-tgtgttgctgtt- 20491  T
Q  210 gttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20492 gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128827
Alignment:
Q  97 atgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 186  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  128917 atgtgatataatg-ttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 128827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 15826 - 15875
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15826 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 15875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 234
Target Start/End: Original strand, 18050 - 18121
Alignment:
Q  165 gatattattatgtcatgttgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18050 gatattattatatcatgatgttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtc 18121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 62270 - 62222
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  62270 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggt 62222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 134358 - 134231
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  134358 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 134260  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  134259 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 134231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 136827 - 136700
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  136827 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 136729  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  136728 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 136700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 139296 - 139169
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  139296 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 139198  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  139197 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 139169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 144234 - 144107
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  144234 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 144136  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  144135 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 144107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 132722 - 132681
Alignment:
Q  197 tatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  132722 tatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtc 132681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 141765 - 141638
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgt---tgtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||   |||||||||  | ||||||||||    
T  141765 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 141667  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  141666 -gttatttaactaagctacatgagtcggtc 141638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 84
Target Start/End: Original strand, 17857 - 17928
Alignment:
Q  13 tgaacccttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 84  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17857 tgaacctttgggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 17928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10793
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10835 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 10793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2748 - 2698
Alignment:
Q  188 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  2748 tatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtc 2698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1132
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 1132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 201
Target Start/End: Original strand, 881 - 1021
Alignment:
Q  61 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg 159  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||  ||  ||| |||  | |||| ||| ||| |||    
T  881 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttg 980  T
Q  160 aaattgatattattatgtcatgttgttgtatactgcctatgt 201  Q
     | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  981 ca-ttgatattattatgccatgctgttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 45841 - 45890
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45841 atactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 45890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10550
Alignment:
Q  144 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtc 10550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12884 - 12789
Alignment:
Q  145 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12884 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtc 12789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16880 - 16804
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16880 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12962
Alignment:
Q  145 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtc 12962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 97076 - 97028
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  97076 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtc 97028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 106354 - 106306
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  106354 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtc 106306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13539 - 13412
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  13539 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13441  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13440 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 13412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20894 - 20767
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  20894 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20796  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20795 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37968 - 37841
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  37968 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 37870  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37869 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 37841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 126
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg---ttgtatact 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  268 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 169  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
       | |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  168 -attgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcataagtcggtc 126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 103679 - 103729
Alignment:
Q  188 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  103679 tatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtc 103729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 267733 - 267683
Alignment:
Q  188 tatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  267733 tatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtc 267683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 201 - 152
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  201 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtc 152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 235
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206619
Alignment:
Q  190 tactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcg 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgtt-gtttattaactaagctgcatgagtcg 206619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 30028 - 29952
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30028 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 29952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14094 - 13967
Alignment:
Q  112 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 208  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  14094 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13996  T
Q  209 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  13995 -gttatttatctaagctgcatgagtcggtc 13967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Original strand, 8059 - 8159
Alignment:
Q  142 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgt--tg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggt 237  Q
    |||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||   ||  ||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  8059 taagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggt 8158  T
Q  238 c 238  Q
    |    
T  8159 c 8159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9262
Alignment:
Q  98 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt---atact 193  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |   |||||    
T  9404 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 9305  T
Q  194 gcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9304 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 9262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 28818 - 28868
Alignment:
Q  189 atactgcctatgttgctgtt-tgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28818 atactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtc 28868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32162 - 32121
Alignment:
Q  197 tatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  32162 tatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtc 32121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 192997 - 193070
Alignment:
Q  164 tgatattattatgtcatgttgttgt----atactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 234  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||    || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  192997 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgtt-gttaattaactaagttgcatgagtc 193070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40496 - 40420
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40496 ttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcacgagtcggtc 40420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 161156 - 161232
Alignment:
Q  163 ttgatattattatgtcat---gttgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtc 238  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| | ||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  161156 ttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtc 161232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 70000 - 69930
Alignment:
Q  57 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatta--tgcattacttgaa 126  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  70000 aatctgtgaagctgt-tatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 69930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University