View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15790_low_5 (Length: 341)

Name: NF15790_low_5
Description: NF15790
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15790_low_5
NF15790_low_5
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (68-341)||(19189-19460)
scaffold0197 (67-341)||(14333-14606)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (67-341)||(148980-149252)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (70-341)||(16838536-16838805)
chr6 (67-341)||(33330469-33330743)
chr6 (70-341)||(6005209-6005478)
chr6 (67-326)||(5343269-5343527)
chr6 (70-341)||(33335966-33336237)
chr6 (95-341)||(28155593-28155837)
chr6 (69-341)||(6438293-6438562)
chr6 (67-341)||(14737600-14737869)
chr6 (95-341)||(14742460-14742702)
chr6 (95-341)||(28184320-28184566)
chr6 (98-341)||(22010721-22010960)
chr6 (68-341)||(11856763-11857035)
chr6 (282-341)||(5674806-5674865)
chr6 (15-69)||(14796256-14796310)
chr6 (281-341)||(5757514-5757575)
chr6 (281-341)||(21356036-21356097)
chr6 (280-341)||(10077201-10077263)
chr6 (124-190)||(30125979-30126044)
chr6 (280-341)||(31086509-31086571)
chr6 (280-341)||(31979512-31979574)
chr6 (281-341)||(4629954-4630015)
chr6 (312-341)||(22709050-22709079)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (67-341)||(35745180-35745452)
chr8 (67-341)||(10684288-10684561)
chr8 (95-341)||(39784846-39785091)
chr8 (100-341)||(6311121-6311358)
chr8 (95-341)||(25328302-25328545)
chr8 (100-341)||(7289950-7290188)
chr8 (265-341)||(10689179-10689254)
chr8 (265-341)||(18853204-18853279)
chr8 (265-341)||(33037842-33037917)
chr8 (265-341)||(36979363-36979438)
chr8 (265-341)||(18870598-18870673)
chr8 (281-341)||(26287902-26287962)
chr8 (281-341)||(26301159-26301219)
chr8 (281-341)||(26313153-26313213)
chr8 (281-341)||(30655647-30655707)
chr8 (281-341)||(4760111-4760171)
chr8 (281-341)||(1261990-1262050)
chr8 (280-341)||(26403266-26403328)
chr8 (302-341)||(4456050-4456089)
chr8 (283-341)||(9765855-9765914)
chr8 (280-341)||(4696632-4696694)
chr8 (281-341)||(31071265-31071326)
chr8 (284-341)||(7412344-7412402)
chr8 (281-341)||(19175790-19175851)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (69-341)||(31401874-31402144)
chr5 (70-341)||(2785167-2785436)
chr5 (67-341)||(31397017-31397289)
chr5 (67-341)||(33791105-33791377)
chr5 (69-341)||(33767970-33768240)
chr5 (70-341)||(37561468-37561740)
chr5 (67-341)||(37556646-37556921)
chr5 (70-341)||(28807596-28807868)
chr5 (100-341)||(1457186-1457423)
chr5 (120-341)||(43592120-43592340)
chr5 (100-341)||(27444793-27445031)
chr5 (100-341)||(27449637-27449875)
chr5 (100-341)||(43598547-43598785)
chr5 (100-341)||(43604039-43604277)
chr5 (100-341)||(43609531-43609769)
chr5 (120-341)||(30631249-30631467)
chr5 (95-341)||(15044507-15044747)
chr5 (265-341)||(31180200-31180275)
chr5 (281-341)||(38192174-38192234)
chr5 (281-341)||(38219399-38219459)
chr5 (281-341)||(24135849-24135909)
chr5 (281-341)||(35387663-35387723)
chr5 (281-341)||(9353368-9353429)
chr5 (281-341)||(36932386-36932447)
chr5 (280-341)||(17003996-17004058)
chr5 (281-341)||(10281751-10281812)
chr5 (281-341)||(15464532-15464593)
chr5 (282-341)||(11917008-11917068)
chr5 (280-341)||(28832258-28832320)
chr5 (285-341)||(4410244-4410301)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (70-341)||(2275-2544)
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (67-341)||(8516884-8517158)
chr3 (70-341)||(8512007-8512278)
chr3 (69-341)||(2677111-2677383)
chr3 (68-329)||(10207723-10207983)
chr3 (70-341)||(32475276-32475546)
chr3 (69-341)||(2672955-2673227)
chr3 (67-341)||(32480130-32480404)
chr3 (128-341)||(24967957-24968168)
chr3 (95-341)||(18656251-18656496)
chr3 (98-341)||(22173219-22173458)
chr3 (124-341)||(2671622-2671836)
chr3 (124-341)||(7167092-7167305)
chr3 (265-341)||(8739099-8739174)
chr3 (265-341)||(9091337-9091412)
chr3 (265-341)||(28503900-28503975)
chr3 (265-341)||(40372831-40372906)
chr3 (281-341)||(8477363-8477423)
chr3 (281-341)||(1305949-1306009)
chr3 (281-341)||(26928627-26928687)
chr3 (281-341)||(8370512-8370573)
chr3 (281-341)||(27974978-27975039)
chr3 (281-341)||(27986472-27986533)
chr3 (280-341)||(6794739-6794801)
chr3 (280-341)||(18552909-18552971)
chr3 (280-337)||(21711222-21711280)
chr3 (281-341)||(16264350-16264411)
chr3 (281-341)||(25795781-25795842)
chr3 (281-341)||(30709816-30709877)
chr3 (281-341)||(32143321-32143382)
chr3 (281-341)||(33386692-33386753)
chr3 (282-341)||(36029094-36029154)
chr3 (244-341)||(40592808-40592903)
chr3 (280-341)||(1417516-1417578)
chr3 (284-341)||(1736331-1736389)
chr3 (280-341)||(3716028-3716090)
chr3 (281-341)||(27452958-27453019)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (67-341)||(16884717-16884990)
chr7 (69-341)||(16879863-16880134)
chr7 (67-341)||(24261347-24261620)
chr7 (70-341)||(24266226-24266496)
chr7 (70-341)||(21812262-21812532)
chr7 (70-341)||(19992104-19992374)
chr7 (95-341)||(24024350-24024594)
chr7 (95-341)||(4866548-4866791)
chr7 (95-341)||(31109607-31109849)
chr7 (95-341)||(12406150-12406392)
chr7 (95-341)||(12396730-12396972)
chr7 (124-341)||(20357583-20357797)
chr7 (265-341)||(2057951-2058026)
chr7 (281-341)||(18408764-18408824)
chr7 (281-341)||(21639809-21639869)
chr7 (281-341)||(1533480-1533540)
chr7 (281-341)||(18413641-18413700)
chr7 (281-341)||(21646007-21646067)
chr7 (282-341)||(21983285-21983345)
chr7 (280-341)||(9190044-9190106)
chr7 (280-341)||(20284088-20284150)
chr7 (280-341)||(29159802-29159864)
chr7 (280-341)||(49091660-49091722)
chr7 (280-341)||(2580389-2580451)
chr7 (280-341)||(33332486-33332548)
chr7 (280-341)||(46516346-46516408)
chr7 (281-341)||(44848720-44848781)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (69-341)||(181988-182259)
[»] chr1 (28 HSPs)
chr1 (69-341)||(43988488-43988760)
chr1 (69-341)||(39445291-39445561)
chr1 (70-341)||(25445113-25445382)
chr1 (70-341)||(1055035-1055304)
chr1 (95-341)||(44023897-44024140)
chr1 (67-341)||(41398029-41398297)
chr1 (214-341)||(24787400-24787525)
chr1 (281-341)||(24202805-24202865)
chr1 (265-341)||(41390567-41390642)
chr1 (95-176)||(41386566-41386646)
chr1 (281-341)||(19358879-19358939)
chr1 (281-341)||(19361468-19361528)
chr1 (281-341)||(19380108-19380168)
chr1 (280-341)||(47703972-47704034)
chr1 (281-341)||(19072928-19072989)
chr1 (281-341)||(19120818-19120879)
chr1 (281-341)||(26644933-26644994)
chr1 (280-341)||(9476260-9476322)
chr1 (281-341)||(3281708-3281769)
chr1 (281-341)||(13604659-13604720)
chr1 (243-341)||(16124552-16124648)
chr1 (280-341)||(775671-775733)
chr1 (280-333)||(13598397-13598451)
chr1 (311-341)||(21536605-21536635)
chr1 (311-341)||(27104408-27104438)
chr1 (280-341)||(29651810-29651872)
chr1 (281-338)||(37069770-37069828)
chr1 (280-341)||(47098860-47098922)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (67-341)||(19349067-19349340)
chr2 (70-341)||(19344212-19344482)
chr2 (70-341)||(32246577-32246849)
chr2 (95-341)||(39812012-39812255)
chr2 (98-341)||(44312648-44312887)
chr2 (172-341)||(14291382-14291549)
chr2 (265-341)||(11098963-11099038)
chr2 (281-341)||(3491751-3491811)
chr2 (265-341)||(9296437-9296512)
chr2 (281-341)||(25398496-25398556)
chr2 (281-341)||(25403634-25403694)
chr2 (280-341)||(8040059-8040121)
chr2 (281-341)||(40738844-40738903)
chr2 (280-341)||(10445480-10445542)
chr2 (284-341)||(13569331-13569389)
chr2 (280-341)||(14699043-14699105)
chr2 (280-341)||(21629943-21630004)
chr2 (280-341)||(34682370-34682432)
chr2 (281-341)||(28259213-28259274)
chr2 (280-341)||(17865202-17865264)
chr2 (280-341)||(20522219-20522281)
chr2 (311-341)||(25407653-25407683)
chr2 (282-341)||(34388859-34388919)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (70-341)||(18855519-18855788)
chr4 (70-341)||(3813816-3814085)
chr4 (95-341)||(5732481-5732726)
chr4 (67-341)||(9224431-9224701)
chr4 (70-341)||(45347841-45348109)
chr4 (70-341)||(45357320-45357588)
chr4 (95-341)||(9229218-9229460)
chr4 (100-341)||(51520280-51520518)
chr4 (99-341)||(56146735-56146974)
chr4 (265-341)||(24741926-24742001)
chr4 (265-341)||(29760627-29760702)
chr4 (281-341)||(28468565-28468625)
chr4 (280-341)||(10047378-10047440)
chr4 (280-341)||(36315265-36315327)
chr4 (280-341)||(36329474-36329536)
chr4 (280-341)||(38152475-38152537)
chr4 (280-341)||(39245993-39246055)
chr4 (281-341)||(5396707-5396768)
chr4 (243-341)||(16623329-16623425)
chr4 (282-340)||(5143260-5143319)
chr4 (280-341)||(5269227-5269289)
chr4 (281-341)||(31985670-31985730)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (67-341)||(152-424)
[»] scaffold0355 (2 HSPs)
scaffold0355 (95-341)||(9666-9907)
scaffold0355 (95-241)||(13-148)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (95-341)||(35086-35328)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (281-341)||(17988-18048)
scaffold0188 (281-341)||(24081-24141)
[»] scaffold0777 (1 HSPs)
scaffold0777 (68-118)||(6291-6341)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (69-158)||(13140-13228)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (95-176)||(34136-34216)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (281-341)||(8455-8516)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (282-341)||(85684-85744)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (281-341)||(133316-133377)
scaffold0006 (280-333)||(5682-5736)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (280-341)||(10728-10790)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (311-341)||(45284-45314)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (281-341)||(43997-44058)


Alignment Details
Target: scaffold0197 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 68 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19460 - 19189
Alignment:
Q  68 attgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatgg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19460 attgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatgg 19361  T
Q  168 ccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaccatgaaagaaaacgaa 267  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  19360 cctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagc-aaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaacgataaaagaaaacgaa 19262  T
Q  268 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19261 c-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccattgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 19189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 67 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14606 - 14333
Alignment:
Q  67 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatg 166  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14606 aattgttgtgaatccggttcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatg 14507  T
Q  167 gccttcaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaccatgaaagaaaacg 265  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14506 gcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaat-ccacactaagagctaacaagcatacaagataaacgataaaagaaaacg 14409  T
Q  266 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14408 aacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 14333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 67 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 149252 - 148980
Alignment:
Q  67 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatg 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  149252 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatg 149153  T
Q  167 gccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaccatgaaagaaaacga 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  149152 gcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagc-aaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaacgataaaggaaaacga 149054  T
Q  267 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  149053 ac-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaat 148980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 70 - 341
Target Start/End: Original strand, 16838536 - 16838805
Alignment:
Q  70 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16838536 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatatgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 16838635  T
Q  170 ttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaccatgaaagaaaacgaaca 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  16838636 ttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagc-aaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaacgataaaagaaaacgaac- 16838733  T
Q  270 aaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16838734 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaatctgggggagagagcagctctccaat 16838805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 67 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 33330743 - 33330469
Alignment:
Q  67 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatg 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33330743 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaattagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatg 33330644  T
Q  167 gccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcat-acaagataaaccatgaaagaaaacg 265  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |    
T  33330643 gcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcataacaagataaaccatgaaaagaaaag 33330544  T
Q  266 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33330543 aac-aaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 33330469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 70 - 341
Target Start/End: Original strand, 6005209 - 6005478
Alignment:
Q  70 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6005209 tgttgtaaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 6005308  T
Q  170 ttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaccatgaaagaaaacgaaca 269  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||     
T  6005309 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagc-aaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaacgataaaaggaaaagaac- 6005406  T
Q  270 aaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6005407 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 6005478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 67 - 326
Target Start/End: Original strand, 5343269 - 5343527
Alignment:
Q  67 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatg 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5343269 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataagtcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatg 5343368  T
Q  167 gccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaccatgaaagaaaacga 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  5343369 gcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaaagtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaacgataaaggaaaacga 5343468  T
Q  267 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggaga 326  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  5343469 ac-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggaga 5343527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 70 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 33336237 - 33335966
Alignment:
Q  70 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33336237 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 33336138  T
Q  170 ttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcat-acaagataaaccatgaaagaaaacgaac 268  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  33336137 tccaaactaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagtaaaaaccacactaagagctaacaagcataacaagataaaccatgaaaagaaaagaac 33336038  T
Q  269 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33336037 -aaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 33335966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28155837 - 28155593
Alignment:
Q  95 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagc 194  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28155837 aaccttcacaccaatgc-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagc 28155740  T
Q  195 ctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgac 292  Q
    ||| | ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28155739 ctatgacttgtgtatagcaaaa-ccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaatggaaa-gaacaaaacaccgaacaagattgttgac 28155642  T
Q  293 ccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155641 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 28155593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 69 - 341
Target Start/End: Original strand, 6438293 - 6438562
Alignment:
Q  69 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 168  Q
    ||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  | ||||||    
T  6438293 ttgttgtgattccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaaccaatggc 6438390  T
Q  169 cttcaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaaccatgaaagaaaacg 265  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  | |||| ||| |    
T  6438391 ttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa-g 6438486  T
Q  266 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438487 aacaaaacaccgagcaagattgttgtcccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 6438562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14737869 - 14737600
Alignment:
Q  67 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatg 166  Q
    ||||||||||||||||| |  |  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  14737869 aattgttgtgaatccggtttca--aataaaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatg 14737774  T
Q  167 gccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacac-taagagctaac-aagc-atacaagataaaccatgaaagaaaa 263  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||||||||  ||||| || | |||| | ||||||||| |  | |||||||     
T  14737773 gtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagc-aaaaccacacaaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaagaaa- 14737676  T
Q  264 cgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737675 -gaacaaaacaccgag-aagattgttgatccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 14737600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14742702 - 14742460
Alignment:
Q  95 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagc 194  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  14742702 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcatacaacaacaaaacagc 14742605  T
Q  195 ctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaac-aagc-atacaagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgac 292  Q
    |  || ||| |||||||| |||||||||| ||||| || | |||| | ||||||||| |  | |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14742604 cctagactagtgtatagc-aaaaccacacaaagagatatcaaagcaaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgac 14742509  T
Q  293 ccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14742508 ccagttcagccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaat 14742460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Original strand, 28184320 - 28184566
Alignment:
Q  95 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaa--tggccttcaagctaacaacaacaaaaca 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||  ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  28184320 aaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaca 28184418  T
Q  193 gcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgtt 289  Q
    |||  || ||| |||||||||||| |||||| ||||| |  ||| |||||  |||||||| |  | |||  ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  28184419 gccctagactagtgtatagcaaaa-ccacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaaagaaa-gaacaaaacaccgag-aagattgtt 28184514  T
Q  290 gacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28184515 gacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 28184566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22010960 - 22010721
Alignment:
Q  98 cttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagccta 197  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||| | |||      
T  22010960 cttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccct 22010863  T
Q  198 agcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcata-caagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 295  Q
    || | | |||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||| | |||||||| | || |||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22010862 agacaagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgaccca 22010767  T
Q  296 gttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010766 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 22010721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 68 - 341
Target Start/End: Original strand, 11856763 - 11857035
Alignment:
Q  68 attgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatgg 167  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  |||||||    
T  11856763 attgttgtgaatccggttcaaaaaaaaaaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatgg 11856860  T
Q  168 ccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaac-aagc-atacaagataaaccatgaaa-gaaaac 264  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||| ||||| || | |||| | |||||| || | || ||| ||| |     
T  11856861 tctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagc-aaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagacaagcgataaaaggaagaa 11856959  T
Q  265 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
     || |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11856960 caaaaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaat 11857035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 282 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5674865 - 5674806
Alignment:
Q  282 agattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5674865 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 5674806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Original strand, 14796256 - 14796310
Alignment:
Q  15 tcagtgtccgtgtcatgtgtaaccctatacccttaaagcgataaatcaagcgaat 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  14796256 tcagtgtccgtgtcatgtgtaaccctaaacctttaaagtgataaatcacgcgaat 14796310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5757575 - 5757514
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757575 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 5757514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 21356036 - 21356097
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21356036 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaat 21356097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10077263 - 10077201
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10077263 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaat 10077201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30126044 - 30125979
Alignment:
Q  124 gatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaa 190  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  30126044 gatgtgtggagcaagaggtagtgataatctatgag-ccaaatggtctccaagctaactacaacaaaa 30125979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31086571 - 31086509
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  31086571 caagattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctccaat 31086509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Original strand, 31979512 - 31979574
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31979512 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaat 31979574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 4629954 - 4630015
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4629954 aagattgttgactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaat 4630015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 341
Target Start/End: Original strand, 22709050 - 22709079
Alignment:
Q  312 ctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22709050 ctaatctgggggagagagcagctctccaat 22709079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 67 - 341
Target Start/End: Original strand, 35745180 - 35745452
Alignment:
Q  67 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatg 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35745180 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatg 35745279  T
Q  167 gccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaccatgaaagaaaacga 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||    
T  35745280 gcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagc-aaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaacgataaaaggaaaaga 35745378  T
Q  267 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35745379 ac-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 35745452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 67 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10684561 - 10684288
Alignment:
Q  67 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatg 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  10684561 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatg 10684462  T
Q  167 gccttcaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaccatgaaagaaaacg 265  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  10684461 gcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaat-ccacactaagagctaacaagcatacaagataaacgataaaagaaaacg 10684364  T
Q  266 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684363 aacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 10684288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 39785091 - 39784846
Alignment:
Q  95 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagc 194  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  39785091 aaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaataacaacaaaacagc 39784993  T
Q  195 c-taagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttg 290  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| |  | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39784992 cctaagc-tagtgtatagcaaaa-ccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaa-gaacaaaacaccgagcaagattgttg 39784897  T
Q  291 acccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39784896 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 39784846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 341
Target Start/End: Original strand, 6311121 - 6311358
Alignment:
Q  100 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaag 199  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  | ||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  6311121 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 6311218  T
Q  200 cctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 296  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||  |||||||| | | ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6311219 actagtgtatagcaaaa-ccacactaagagataacaaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccag 6311313  T
Q  297 ttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311314 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 6311358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25328545 - 25328302
Alignment:
Q  95 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagc 194  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||| |    
T  25328545 aaccttcacaacaatga-aataaatcaatgatgtgcggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 25328447  T
Q  195 c-taagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaag-cataca--agataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttg 290  Q
    | |||  ||| |||||||||||| |||||| ||||| || |||  |||| |  ||||||||  | || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25328446 cctaa--ctagtgtatagcaaaa-ccacac-aagagataccaaaacataaacgagataaacggtaaaggaaaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttg 25328353  T
Q  291 acccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328352 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 25328302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7290188 - 7289950
Alignment:
Q  100 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaag 199  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| || ||| | |||||||||||| |||||  ||    
T  7290188 tcacaccaatga-aataaa-cattgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaacaaacaacaacaaagcagccctag 7290091  T
Q  200 cctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagc---atacaagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 296  Q
     ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| |   | |||||||||   || |||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7290090 actagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataacaaaccataaacaagataagtgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccag 7289995  T
Q  297 ttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289994 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 7289950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10689254 - 10689179
Alignment:
Q  265 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10689254 gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 10689179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18853279 - 18853204
Alignment:
Q  265 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18853279 gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 18853204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 33037917 - 33037842
Alignment:
Q  265 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037917 gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 33037842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 341
Target Start/End: Original strand, 36979363 - 36979438
Alignment:
Q  265 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36979363 gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 36979438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 265 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18870673 - 18870598
Alignment:
Q  265 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18870673 gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcatccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 18870598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 26287902 - 26287962
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26287902 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 26287962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 26301159 - 26301219
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26301159 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 26301219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 26313153 - 26313213
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313153 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 26313213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 30655647 - 30655707
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655647 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 30655707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4760171 - 4760111
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4760171 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaat 4760111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1262050 - 1261990
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1262050 aagattgttgacccagttcaaccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 1261990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26403328 - 26403266
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26403328 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 26403266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 341
Target Start/End: Original strand, 4456050 - 4456089
Alignment:
Q  302 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4456050 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 4456089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765855
Alignment:
Q  283 gattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 9765855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4696694 - 4696632
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagtta-agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4696694 caagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaat 4696632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31071326 - 31071265
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||| ||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31071326 aagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 31071265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 341
Target Start/End: Original strand, 7412344 - 7412402
Alignment:
Q  284 attgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||  | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7412344 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaat 7412402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19175851 - 19175790
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||| ||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19175851 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaat 19175790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 69 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31402144 - 31401874
Alignment:
Q  69 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31402144 ttgttgtgaattcggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 31402045  T
Q  169 cttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaccatgaaagaaaacgaac 268  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  31402044 ctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtaaagc-aaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaacgataaaagaaaacgaac 31401946  T
Q  269 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31401945 -aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatatgggggagagagcagctctccaat 31401874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 70 - 341
Target Start/End: Original strand, 2785167 - 2785436
Alignment:
Q  70 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2785167 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 2785266  T
Q  170 ttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaccatgaaagaaaacgaaca 269  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||     
T  2785267 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagc-aaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaacgataaaaggaaaagaac- 2785364  T
Q  270 aaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2785365 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 2785436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 67 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31397289 - 31397017
Alignment:
Q  67 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatg 166  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31397289 aattgttgtgaattcggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatg 31397190  T
Q  167 gccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaccatgaaagaaaacga 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  31397189 gcctccaagctaacaacaacaaaacatcctaagcctaatgtaaagc-aaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaacgataaaagaaaacaa 31397091  T
Q  267 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31397090 ac-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 31397017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 67 - 341
Target Start/End: Original strand, 33791105 - 33791377
Alignment:
Q  67 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatg 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33791105 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacatcaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatg 33791204  T
Q  167 gccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaccatgaaagaaaacga 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||    
T  33791205 gcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagc-aaaaccacatatagagctaacaagcatacaagataaacgataaaaggaaaaga 33791303  T
Q  267 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33791304 ac-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggaaagagcagctctccaat 33791377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 69 - 341
Target Start/End: Original strand, 33767970 - 33768240
Alignment:
Q  69 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33767970 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacatcaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatgac 33768069  T
Q  169 cttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaccatgaaagaaaacgaac 268  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||    
T  33768070 ctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagc-aaaaccacatatagagctaacaagcatacaggataaacgataaaaggaaaagaac 33768168  T
Q  269 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33768169 -aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggggagagcagctctccaat 33768240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 70 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37561740 - 37561468
Alignment:
Q  70 tgttgtgaatccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  37561740 tgttgtgaatccggttcaactaatcaaaccttcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggc 37561641  T
Q  169 cttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcat--acaagataaaccatgaaagaaaacga 266  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | || | ||| ||    
T  37561640 ctccaagctaacaacaacaaaacagcctatgacttgtgtatagc-aaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaatggaaa-ga 37561543  T
Q  267 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37561542 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 37561468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 67 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37556921 - 37556646
Alignment:
Q  67 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaac-cttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaat 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37556921 aattgttgtgaatccggttcaactaatcaaatcttcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaat 37556822  T
Q  166 ggccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcat--acaagataaaccatgaaagaaaa 263  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | || | |||    
T  37556821 ggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctatgacttgtgtatagc-aaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaatggaaa 37556723  T
Q  264 cgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556722 -gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 37556646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28807868 - 28807596
Alignment:
Q  70 tgttgtgaatccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 168  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  28807868 tgttgtgaatccggttcaactaatgaaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggc 28807770  T
Q  169 cttcaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaa-ccacactaagagctaacaagcata--caagataaaccatgaaagaaaac 264  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||  | |||| |||     
T  28807769 ttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaaaaccactcaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa- 28807673  T
Q  265 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807672 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 28807596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 100 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1457423 - 1457186
Alignment:
Q  100 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaag 199  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  1457423 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 1457326  T
Q  200 cctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaccatgaaagaaa--acgaacaaaacaccgagcaagattgttgaccc 294  Q
     ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||     ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1457325 actagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataacaaagcataaacaagataa-----gaaagaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgaccc 1457233  T
Q  295 agttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457232 agttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 1457186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 120 - 341
Target Start/End: Original strand, 43592120 - 43592340
Alignment:
Q  120 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaacc 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||    
T  43592120 caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaa-cc 43592218  T
Q  220 acactaagagctaacaa-gcata--caagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaat 316  Q
    |||| ||||| |||||| |||||  ||||||||   || |||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  43592219 acacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaat 43592315  T
Q  317 ctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  43592316 ctgggggagagagcagctctccaat 43592340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 341
Target Start/End: Original strand, 27444793 - 27445031
Alignment:
Q  100 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaag 199  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||| ||||||| || ||||| |||||||||| | |||||  ||    
T  27444793 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctag 27444890  T
Q  200 cctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 296  Q
     ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||   || |||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27444891 actagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccag 27444986  T
Q  297 ttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    || || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27444987 ttcaggcaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaat 27445031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 341
Target Start/End: Original strand, 27449637 - 27449875
Alignment:
Q  100 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaag 199  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||| ||||||| || ||||| |||||||||| | |||||  ||    
T  27449637 tcacaccaatga-aataaa-caatgatatgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctag 27449734  T
Q  200 cctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 296  Q
     ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||   || |||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27449735 actagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccag 27449830  T
Q  297 ttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449831 ttcagccaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaat 27449875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 341
Target Start/End: Original strand, 43598547 - 43598785
Alignment:
Q  100 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaag 199  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||| ||| || ||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  43598547 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 43598644  T
Q  200 cctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 296  Q
     ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||   || |||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  43598645 actagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttggtccag 43598740  T
Q  297 ttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598741 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 43598785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 341
Target Start/End: Original strand, 43604039 - 43604277
Alignment:
Q  100 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaag 199  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||| ||| || ||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  43604039 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 43604136  T
Q  200 cctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 296  Q
     ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||   || |||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  43604137 actagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttggtccag 43604232  T
Q  297 ttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604233 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 43604277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 341
Target Start/End: Original strand, 43609531 - 43609769
Alignment:
Q  100 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaag 199  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||| ||| || ||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  43609531 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 43609628  T
Q  200 cctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 296  Q
     ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||   || |||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  43609629 actagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttggtccag 43609724  T
Q  297 ttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609725 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 43609769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 341
Target Start/End: Original strand, 30631249 - 30631467
Alignment:
Q  120 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaacc 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| |     
T  30631249 caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagaacaaatggttttcaagc-aacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaatc- 30631346  T
Q  220 acactaagagctaacaa-gcata--caagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaat 316  Q
    |||   | || |||||| |||||  ||||||||   | ||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30631347 acatatatagataacaaagcataaacaagataagtaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccaag-aagattgttgactcagttcagccaatgtggcctaat 30631442  T
Q  317 ctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  30631443 ctgggggagagagcagctctccaat 30631467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Original strand, 15044507 - 15044747
Alignment:
Q  95 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagc 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  15044507 aaccttcacaccaatga-aata---caatgacgtgtagagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaaccaacaacaacaaaacagc 15044602  T
Q  195 ctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttga 291  Q
    |  || ||| |||||||||||| |||||| ||||| |  ||| |||||  |||||||| | |  |||| ||  |||||||||||| || |||||||||||    
T  15044603 cctagactagtgtatagcaaaa-ccacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaggaa--gaacaaaacaccaag-aagattgttga 15044697  T
Q  292 cccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15044698 cccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaat 15044747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 341
Target Start/End: Original strand, 31180200 - 31180275
Alignment:
Q  265 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31180200 gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 31180275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 38192174 - 38192234
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38192174 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 38192234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 38219399 - 38219459
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38219399 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 38219459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 24135849 - 24135909
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24135849 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctatccaat 24135909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 35387663 - 35387723
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35387663 aagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 35387723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9353429 - 9353368
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9353429 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 9353368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 36932447 - 36932386
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36932447 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 36932386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17004058 - 17003996
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17004058 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaat 17003996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 10281751 - 10281812
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10281751 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaat 10281812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 15464532 - 15464593
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15464532 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaat 15464593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11917068 - 11917008
Alignment:
Q  282 agattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11917068 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaat 11917008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Original strand, 28832258 - 28832320
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||| |||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28832258 caagattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaat 28832320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4410301 - 4410244
Alignment:
Q  285 ttgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||  | ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4410301 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaat 4410244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 70 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2544 - 2275
Alignment:
Q  70 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  2544 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgataaagataatccatgagtgcaaatggcc 2445  T
Q  170 ttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaccatgaaagaaaacgaaca 269  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||     
T  2444 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagc-aaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaacgataaaggaaaacgaac- 2347  T
Q  270 aaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2346 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaat 2275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 67 - 341
Target Start/End: Original strand, 8516884 - 8517158
Alignment:
Q  67 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatg 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8516884 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatg 8516983  T
Q  167 gccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaaccatgaaagaaaacg 265  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || |||||||    
T  8516984 gcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtgtagc-acaaccacactaagagttaacaagcatacaagataaaacgataaacgaaaacg 8517082  T
Q  266 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8517083 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 8517158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 70 - 341
Target Start/End: Original strand, 8512007 - 8512278
Alignment:
Q  70 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  8512007 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggct 8512106  T
Q  170 ttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaaccatgaaagaaaacgaac 268  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  8512107 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtgtagc-acaaccacactaagagttaacaagcatacaagataaaacgataaacgaaaacgaac 8512205  T
Q  269 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8512206 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 8512278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 69 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2677383 - 2677111
Alignment:
Q  69 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatgg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2677383 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatgg 2677284  T
Q  168 ccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcat-acaagataaaccatgaaagaaaacga 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||    
T  2677283 cctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagc-aaaaccacactaagagctaacaagcataacaagataaaccatgaaaagaaaaga 2677185  T
Q  267 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677184 ac-aaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 2677111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 68 - 329
Target Start/End: Original strand, 10207723 - 10207983
Alignment:
Q  68 attgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatgg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10207723 attgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatgg 10207822  T
Q  168 ccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcat-acaagataaaccatgaaagaaaacga 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||    
T  10207823 cctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagc-aaaaccacactaagagctaacaagcataacaagataaaccatgaaaagaaaaga 10207921  T
Q  267 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagag 329  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10207922 ac-aaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagag 10207983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 70 - 341
Target Start/End: Original strand, 32475276 - 32475546
Alignment:
Q  70 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32475276 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcc 32475375  T
Q  170 ttcaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaccatgaaagaaaacgaac 268  Q
    | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  32475376 tccaaactaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaat-ccacactaagagctaacaagcatacaagataaacgataaaagaaaacgaac 32475473  T
Q  269 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32475474 aaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 32475546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 69 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2673227 - 2672955
Alignment:
Q  69 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatgg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2673227 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagtaaatgg 2673128  T
Q  168 ccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcat-acaagataaaccatgaaagaaaacga 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||    
T  2673127 cctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagc-aaaaccacactaagagctaacaagcataacaagataaaccatgaaaagaaaaga 2673029  T
Q  267 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2673028 ac-aaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 2672955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 67 - 341
Target Start/End: Original strand, 32480130 - 32480404
Alignment:
Q  67 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatc-aatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32480130 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatccaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaat 32480229  T
Q  166 ggccttcaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaccatgaaagaaaac 264  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  32480230 ggcctccaaactaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaat-ccacactaagagctaacaagcatacaagataaacgataaaagaaaac 32480327  T
Q  265 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32480328 gaacaaaacaccaaccaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 32480404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 128 - 341
Target Start/End: Original strand, 24967957 - 24968168
Alignment:
Q  128 tgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24967957 tgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagc-aaaaccacactaag 24968055  T
Q  228 agctaacaagcatacaagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagag 327  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||    
T  24968056 agctaacaagcatacaagataaacgataaaagaaaacgaac-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaattttggggagag 24968154  T
Q  328 agcagctctccaat 341  Q
    || |||||||||||    
T  24968155 agtagctctccaat 24968168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Original strand, 18656251 - 18656496
Alignment:
Q  95 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacag- 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  18656251 aaccttcacaccaatgaaaata---caatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagc 18656347  T
Q  194 cctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaac-aagcatacaagataaaccatgaaagaa--aacgaacaaaacaccgagcaagattgttg 290  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  | || |||  ||| || ||||||| || |||||||||||    
T  18656348 cctaag-ctagtgtatag-aaaaaccacacaaagagctaacaaagcaaacaagataaacggtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgttg 18656445  T
Q  291 acccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656446 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 18656496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22173458 - 22173219
Alignment:
Q  98 cttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagccta 197  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||      
T  22173458 cttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccct 22173361  T
Q  198 agcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcatac-aagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 295  Q
    || ||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||| |  ||||||| |  | |||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22173360 agactagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataccaaagcaaaataagataagcggtaaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgaccca 22173265  T
Q  296 gttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173264 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 22173219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2671836 - 2671622
Alignment:
Q  124 gatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaa-cagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccaca 222  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||  || ||| |||| || ||||||||||    
T  2671836 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagag-aaaaaccaca 2671739  T
Q  223 ctaagagctaacaa-gcata-caagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgg 320  Q
    | ||||| |||||| ||| | |||||||| | | ||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2671738 caaagagataacaaagcaaaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 2671643  T
Q  321 gggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2671642 gggagagagcagctctccaat 2671622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 124 - 341
Target Start/End: Original strand, 7167092 - 7167305
Alignment:
Q  124 gatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacac 223  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||   ||||||  | ||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||| ||||||    
T  7167092 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacagccctagactagtgtagagcaaaa-ccacac 7167188  T
Q  224 taagagctaacaa-gcata--caagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgg 320  Q
     ||||| |||||| |||||  |||||||| | | ||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  7167189 aaagagataacaaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 7167284  T
Q  321 gggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7167285 gggagagagcagctctccaat 7167305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8739174 - 8739099
Alignment:
Q  265 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8739174 gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 8739099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9091412 - 9091337
Alignment:
Q  265 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9091412 gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 9091337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28503975 - 28503900
Alignment:
Q  265 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28503975 gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggaagagagcagctctccaat 28503900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 40372906 - 40372831
Alignment:
Q  265 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40372906 gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 40372831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 8477363 - 8477423
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8477363 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 8477423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 1305949 - 1306009
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1305949 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagatagcagctctccaat 1306009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26928687 - 26928627
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26928687 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaat 26928627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8370573 - 8370512
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8370573 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 8370512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27975039 - 27974978
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27975039 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 27974978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27986533 - 27986472
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27986533 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 27986472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6794801 - 6794739
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6794801 caagattgttgacccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaat 6794739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18552971 - 18552909
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18552971 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaat 18552909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 337
Target Start/End: Original strand, 21711222 - 21711280
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctc 337  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21711222 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctc 21711280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 16264350 - 16264411
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||| ||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16264350 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 16264411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 25795781 - 25795842
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||| ||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25795781 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 25795842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 30709877 - 30709816
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30709877 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaat 30709816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 32143321 - 32143382
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||| ||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32143321 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 32143382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 33386753 - 33386692
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||| ||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33386753 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 33386692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 341
Target Start/End: Original strand, 36029094 - 36029154
Alignment:
Q  282 agattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36029094 agattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaat 36029154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 40592903 - 40592808
Alignment:
Q  244 agataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  40592903 agataagcaatgaaagaaaaggaacaaa-cac--accaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctccaat 40592808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1417578 - 1417516
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1417578 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaat 1417516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1736389 - 1736331
Alignment:
Q  284 attgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1736389 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaat 1736331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3716090 - 3716028
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  3716090 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctccaat 3716028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 27452958 - 27453019
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||| ||||||  | ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27452958 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaat 27453019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 67 - 341
Target Start/End: Original strand, 16884717 - 16884990
Alignment:
Q  67 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatg 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16884717 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatg 16884816  T
Q  167 gccttcaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaccatgaaagaaaacg 265  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16884817 gcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaat-ccacactaagagctaacaagcatacaagataaacgataaaagaaaacg 16884914  T
Q  266 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16884915 aacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 16884990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 69 - 341
Target Start/End: Original strand, 16879863 - 16880134
Alignment:
Q  69 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16879863 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggc 16879962  T
Q  169 cttcaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaccatgaaagaaaacgaa 267  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16879963 ctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaat-ccacactaagagctaacaagcatacaagataaacgataaaagaaaacgaa 16880060  T
Q  268 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16880061 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 16880134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 67 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24261620 - 24261347
Alignment:
Q  67 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatg 166  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24261620 aattgttgtgaatccggttcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatg 24261521  T
Q  167 gccttcaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaccatgaaagaaaacg 265  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24261520 gcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaat-ccacactaagagctaacaagcatacaagataaacgataaaagaaaacg 24261423  T
Q  266 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24261422 aacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 24261347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 70 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24266496 - 24266226
Alignment:
Q  70 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24266496 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcc 24266397  T
Q  170 ttcaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaccatgaaagaaaacgaac 268  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  24266396 tccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaat-ccacactaagagctaacaagcatacaagataaacgataaaggaaaacgaac 24266299  T
Q  269 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24266298 aaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 24266226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 70 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21812532 - 21812262
Alignment:
Q  70 tgttgtgaatccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 168  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  21812532 tgttgtgaatccgattcaactaatgaaaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggc 21812434  T
Q  169 cttcaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaaccatgaaagaaaacg 265  Q
     | |||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||  | |||||||| |    
T  21812433 ttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagttaacaagcataaacaagataaacggtaaaagaaaa-g 21812338  T
Q  266 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21812337 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctttccaat 21812262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 70 - 341
Target Start/End: Original strand, 19992104 - 19992374
Alignment:
Q  70 tgttgtgaatccggctcaactaatg-aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 168  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  19992104 tgttgtgaatccggttcaactaatggaaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaggtgatagtgataatcaatgagaacaaatggc 19992202  T
Q  169 cttcaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaaccatgaaagaaaacg 265  Q
     | |||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  | |||| ||| |    
T  19992203 ttccaagcttacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa-g 19992298  T
Q  266 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19992299 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 19992374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24024594 - 24024350
Alignment:
Q  95 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagc 194  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  24024594 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 24024497  T
Q  195 ctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcat--acaagataaaccatgaaagaaaacgaac-aaaacaccgagcaagattgttga 291  Q
    ||| | ||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | |  |||| ||  |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  24024496 ctatgactagtatatagc-aaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaaggaa--gaacaaaaacaccgaacaagattgttga 24024400  T
Q  292 cccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024399 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 24024350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Original strand, 4866548 - 4866791
Alignment:
Q  95 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagc 194  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||     
T  4866548 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaggacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagt 4866645  T
Q  195 ctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcata-caagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgac 292  Q
    |  || ||| ||||||||||||||||||| || || || ||| ||| | |||||||| |  | |||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4866646 cctagactagtgtatagcaaaaaccacacaaaaagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgac 4866742  T
Q  293 ccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866743 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 4866791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31109849 - 31109607
Alignment:
Q  95 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagc 194  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  31109849 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtgcagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagc 31109752  T
Q  195 c-taagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttg 290  Q
    | |||  ||| |||||||||||| |||||| ||||| |  ||| |||||  |||||||||| |  |||| ||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  31109751 cctaa--ctagtgtatagcaaaa-ccacac-aagagattccaaagcataaacaagataaacaagaaaaggaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 31109658  T
Q  291 acccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31109657 acccagttcagccaatatggcctaatctaggggagagagcagctctccaat 31109607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Original strand, 12406150 - 12406392
Alignment:
Q  95 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagc 194  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||    
T  12406150 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagc 12406247  T
Q  195 ctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcata-caagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgac 292  Q
    |  || ||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||| | |||||||| |  | |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12406248 cctagactagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgac 12406343  T
Q  293 ccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12406344 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaatagctctccaat 12406392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Original strand, 12396730 - 12396972
Alignment:
Q  95 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagc 194  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||    
T  12396730 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagc 12396827  T
Q  195 ctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcata-caagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgac 292  Q
    |  || ||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||| | |||||||| |  | || | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12396828 cctagactagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaagggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgac 12396923  T
Q  293 ccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12396924 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaacagctctccaat 12396972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20357797 - 20357583
Alignment:
Q  124 gatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaa-cagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccaca 222  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||| ||||||| |||||    
T  20357797 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagctaacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaa-ccaca 20357700  T
Q  223 ctaagagctaacaa-gcatacaagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctggg 321  Q
    | ||||| |||||| ||| ||||||||| | |  |||| ||  |||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  20357699 caaagagataacaaagcaaacaagataagcaagaaaaggaa--gaacaaaataccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttggg 20357603  T
Q  322 ggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20357602 ggagagagcagctctccaat 20357583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 341
Target Start/End: Original strand, 2057951 - 2058026
Alignment:
Q  265 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2057951 gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 2058026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 18408764 - 18408824
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18408764 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 18408824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 21639809 - 21639869
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21639809 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 21639869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1533540 - 1533480
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1533540 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcatctctccaat 1533480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 18413641 - 18413700
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18413641 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-ggggagagagcagctctccaat 18413700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 21646007 - 21646067
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21646007 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctagggaagagagcagctctccaat 21646067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 341
Target Start/End: Original strand, 21983285 - 21983345
Alignment:
Q  282 agattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21983285 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 21983345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9190106 - 9190044
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9190106 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaat 9190044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Original strand, 20284088 - 20284150
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20284088 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaat 20284150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Original strand, 29159802 - 29159864
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29159802 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaat 29159864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Original strand, 49091660 - 49091722
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  49091660 caagattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctccaat 49091722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Original strand, 2580389 - 2580451
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2580389 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaat 2580451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 33332548 - 33332486
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagtta-agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33332548 caagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaat 33332486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 46516408 - 46516346
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  46516408 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaat 46516346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 44848781 - 44848720
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagc-caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||  |  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44848781 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagagagcagctctccaat 44848720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 69 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 182259 - 181988
Alignment:
Q  69 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  182259 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggc 182160  T
Q  169 cttcaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaccatgaaagaaaacgaa 267  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  182159 ctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaat-ccacactaagagctaacaagcatacaagataaacgataaaagaaaacgaa 182062  T
Q  268 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  182061 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 181988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 28)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 69 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 43988760 - 43988488
Alignment:
Q  69 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43988760 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacgccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggc 43988661  T
Q  169 cttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaaccatgaaagaaaacgaa 267  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||    
T  43988660 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagc-acaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaa 43988562  T
Q  268 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43988561 caaaacaccaagcaagattgtttacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 43988488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 69 - 341
Target Start/End: Original strand, 39445291 - 39445561
Alignment:
Q  69 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 168  Q
    ||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||||||||    
T  39445291 ttgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatggc 39445389  T
Q  169 cttcaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaaccatgaaagaaaacg 265  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  | |||| ||| |    
T  39445390 ttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa-g 39445485  T
Q  266 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445486 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 39445561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 70 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25445382 - 25445113
Alignment:
Q  70 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 169  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||     
T  25445382 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagcgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 25445284  T
Q  170 ttcaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaaccatgaaagaaaacga 266  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||  | |||| ||| ||    
T  25445283 tccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagctaacaagcgtaaacaagataaacggtaaaaggaaa-ga 25445188  T
Q  267 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445187 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 25445113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1055304 - 1055035
Alignment:
Q  70 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 169  Q
    |||||||||||||| || || |  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  |||||| |     
T  1055304 tgttgtgaatccggttctacaatcgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatgtct 1055206  T
Q  170 ttcaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaaccatgaaagaaaacga 266  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  | |||| ||| ||    
T  1055205 tccaagcttacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa-ga 1055110  T
Q  267 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1055109 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcaactctccaat 1055035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 44024140 - 44023897
Alignment:
Q  95 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagc 194  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||| | ||||| |||||||||||| ||||    
T  44024140 aaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaactgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagc 44024043  T
Q  195 c-taagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttga 291  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||   | || ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  44024042 cctaagc-tagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaatggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgagcaagattgttga 44023947  T
Q  292 cccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44023946 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 44023897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 341
Target Start/End: Original strand, 41398029 - 41398297
Alignment:
Q  67 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatg 166  Q
    ||||||||||||||||| || |  ||  ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  41398029 aattgttgtgaatccggttcca--aagaaaccttcacaccaatga-aataaaccaattatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacatatg 41398125  T
Q  167 gccttcaagctaacaacaacaa---aacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaa-ccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaccatgaaa 258  Q
    | || ||||| |||||||||||   ||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||| |||||  ||||||||     |||     
T  41398126 gtctccaagcaaacaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataa-----gaag 41398218  T
Q  259 gaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398219 gaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccaggtcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 41398297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 214 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24787525 - 24787400
Alignment:
Q  214 aaaaccacactaagagctaacaa-gcatacaagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcc 312  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||| | |  |||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24787525 aaaaccacacaaagagataacaaagcaaacaagataagcaagaaaaggaa--gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcc 24787429  T
Q  313 taatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24787428 taatctgggggggagagcagctctccaat 24787400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24202865 - 24202805
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24202865 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 24202805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 265 - 341
Target Start/End: Original strand, 41390567 - 41390642
Alignment:
Q  265 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390567 gaacaaaacatcgag-aagattgttgacccagatcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 41390642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 176
Target Start/End: Original strand, 41386566 - 41386646
Alignment:
Q  95 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagc 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| || |||||    
T  41386566 aaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagc 41386646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19358939 - 19358879
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19358939 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaat 19358879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19361528 - 19361468
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19361528 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaat 19361468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19380168 - 19380108
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19380168 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaat 19380108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 47704034 - 47703972
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47704034 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 47703972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 19072928 - 19072989
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072928 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 19072989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 19120818 - 19120879
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19120818 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 19120879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26644994 - 26644933
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26644994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 26644933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Original strand, 9476260 - 9476322
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9476260 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaat 9476322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 3281708 - 3281769
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||| |||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3281708 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 3281769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13604720 - 13604659
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagc-caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13604720 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaat 13604659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16124648 - 16124552
Alignment:
Q  243 aagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||| |||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16124648 aagataagctatgaaagaaaaggaacaaa-cac--accaagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaat 16124552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Original strand, 775671 - 775733
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  775671 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaat 775733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 333
Target Start/End: Original strand, 13598397 - 13598451
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagc 333  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13598397 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 13598451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21536635 - 21536605
Alignment:
Q  311 cctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21536635 cctaatctgggggagagagcagctctccaat 21536605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27104438 - 27104408
Alignment:
Q  311 cctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104438 cctaatctgggggagagagcagctctccaat 27104408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Original strand, 29651810 - 29651872
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||| |||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29651810 caagatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaat 29651872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 338
Target Start/End: Original strand, 37069770 - 37069828
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcc 338  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37069770 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 37069828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 47098922 - 47098860
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  47098922 caagattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaat 47098860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 67 - 341
Target Start/End: Original strand, 19349067 - 19349340
Alignment:
Q  67 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaat 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||    
T  19349067 aattgttgtgaatccggttcaactaatgaaaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaat 19349165  T
Q  166 ggccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaccatgaaagaaaacg 265  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |    
T  19349166 ggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaa-ccacactaagagctaacaagcatacaagataaacgataaaaggaaaag 19349264  T
Q  266 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19349265 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaat 19349340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 70 - 341
Target Start/End: Original strand, 19344212 - 19344482
Alignment:
Q  70 tgttgtgaatccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 168  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  19344212 tgttgtgaatccggttcaactaatgaaaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggc 19344310  T
Q  169 cttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaccatgaaagaaaacgaac 268  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||    
T  19344311 ctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaa-ccacactaagagctaacaagcatacaagataaacgataaaaggaaaagaac 19344409  T
Q  269 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19344410 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaat 19344482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 341
Target Start/End: Original strand, 32246577 - 32246849
Alignment:
Q  70 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 169  Q
    |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||| |    
T  32246577 tgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtc 32246675  T
Q  170 ttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaac-aagcat--acaagataaaccatgaaagaaa--ac 264  Q
    | |||||||||||||||||||||| |  || ||| |||||||| |||||||||| ||||| |  | ||||||  ||||||| || || |||| |||  |     
T  32246676 tccaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatagc-aaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagat-aagcaagaaaaaaaggaa 32246772  T
Q  265 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32246773 gaacaaaacaccgaacaagattgttgaccttgttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 32246849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 39812255 - 39812012
Alignment:
Q  95 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagc 194  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  39812255 aaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagc 39812157  T
Q  195 c-taagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa---gcatacaagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttg 290  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| |  | |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  39812156 cctaagc-tagtgtatagc-aaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttg 39812063  T
Q  291 acccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812062 aaccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 39812012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 44312887 - 44312648
Alignment:
Q  98 cttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagccta 197  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||| | |||      
T  44312887 cttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccct 44312790  T
Q  198 agcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcata-caagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 295  Q
    || | | |||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||| | |||||||| | || |||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44312789 agacaagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgaccca 44312694  T
Q  296 gttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312693 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 44312648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 341
Target Start/End: Original strand, 14291382 - 14291549
Alignment:
Q  172 caagctaacaacaacaaaa-cagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcata-caagataaaccatgaaagaaaacgaac 268  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||| ||| | |||||||| | | ||||| ||  ||||    
T  14291382 caagcaaacaacaacaaaaacagccctagactaatgtagagcaaaa-ccacacaaagagataacaaagcaaaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaac 14291477  T
Q  269 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291478 aaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 14291549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11099038 - 11098963
Alignment:
Q  265 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11099038 gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 11098963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 3491751 - 3491811
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3491751 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 3491811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 265 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9296512 - 9296437
Alignment:
Q  265 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9296512 gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaat 9296437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 25398496 - 25398556
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25398496 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 25398556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 25403634 - 25403694
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25403634 aagattgttgactcagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 25403694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Original strand, 8040059 - 8040121
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8040059 caagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 8040121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Original strand, 40738844 - 40738903
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40738844 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggggg-gagagcagctctccaat 40738903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10445542 - 10445480
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||| ||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10445542 caagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 10445480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 341
Target Start/End: Original strand, 13569331 - 13569389
Alignment:
Q  284 attgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13569331 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 13569389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14699105 - 14699043
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14699105 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaat 14699043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Original strand, 21629943 - 21630004
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21629943 caagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaat 21630004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 34682432 - 34682370
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34682432 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaat 34682370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28259274 - 28259213
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28259274 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaat 28259213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Original strand, 17865202 - 17865264
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaagcc-aatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  17865202 caagattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaat 17865264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Original strand, 20522219 - 20522281
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20522219 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaat 20522281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 341
Target Start/End: Original strand, 25407653 - 25407683
Alignment:
Q  311 cctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25407653 cctaatctgggggagagagcagctctccaat 25407683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 341
Target Start/End: Original strand, 34388859 - 34388919
Alignment:
Q  282 agattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||| ||  | ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34388859 agattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaat 34388919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 341
Target Start/End: Original strand, 18855519 - 18855788
Alignment:
Q  70 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 169  Q
    |||||||||||||| || || |  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||     
T  18855519 tgttgtgaatccggttctacaagcgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 18855617  T
Q  170 ttcaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaaccatgaaagaaaacga 266  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  | |||| ||| ||    
T  18855618 tccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa-ga 18855713  T
Q  267 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855714 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 18855788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 70 - 341
Target Start/End: Original strand, 3813816 - 3814085
Alignment:
Q  70 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 169  Q
    |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |    
T  3813816 tgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtc 3813914  T
Q  170 ttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcat--acaagataaaccatgaaagaaaacgaa 267  Q
    | ||||| |||||||||||||||| |  || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || || ||||| ||  |||    
T  3813915 tccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatcgcaaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagat-aagcaagaaaggaa--gaa 3814011  T
Q  268 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3814012 caaaacaccatgcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 3814085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Original strand, 5732481 - 5732726
Alignment:
Q  95 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacag- 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  5732481 aaccttcacaccaatgaaaata---caatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagc 5732577  T
Q  194 cctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaac-aagcatacaagataaaccatgaaagaa--aacgaacaaaacaccgagcaagattgttg 290  Q
    |||||| ||| |||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  | || |||  ||| || ||||||| || |||||||||||    
T  5732578 cctaag-ctagtgtatag-taaaaccacacaaagagctaacaaagcaaacaagataaacggtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgttg 5732675  T
Q  291 acccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732676 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 5732726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 67 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9224701 - 9224431
Alignment:
Q  67 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatg 166  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||    
T  9224701 aattgttgtgaatccggttcaaaaaaaaaaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatg 9224604  T
Q  167 gccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaac-aagc-atacaagataaaccatgaaagaaaac 264  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||| ||||| || | |||| | ||||||||| |  | |||| ||      
T  9224603 gtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagc-aaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaaggaa-- 9224507  T
Q  265 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224506 gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 9224431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 45348109 - 45347841
Alignment:
Q  70 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 169  Q
    |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||| |    
T  45348109 tgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtc 45348012  T
Q  170 ttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa---gcatacaagataaaccatgaaagaaaacga 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  || ||| |||| ||| |||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| |  | |||| ||| ||    
T  45348011 ttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagc-aaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaa-ga 45347915  T
Q  267 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347914 acaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcttaatctgggggagagagcagctctccaat 45347841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 45357588 - 45357320
Alignment:
Q  70 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 169  Q
    |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||| |    
T  45357588 tgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtc 45357491  T
Q  170 ttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa---gcatacaagataaaccatgaaagaaaacga 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  || ||| |||| ||| |||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| |  | |||| ||| ||    
T  45357490 ttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagc-aaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaa-ga 45357394  T
Q  267 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357393 acaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcataatctgggggagagagcagctctccaat 45357320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9229460 - 9229218
Alignment:
Q  95 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagc 194  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  9229460 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 9229363  T
Q  195 ctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcata-caagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgac 292  Q
    |  || ||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||| | |||||||| |  | |||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  9229362 cctagactagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttaac 9229267  T
Q  293 ccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229266 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 9229218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 341
Target Start/End: Original strand, 51520280 - 51520518
Alignment:
Q  100 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaag 199  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  51520280 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 51520377  T
Q  200 cctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 296  Q
     ||| |||||||||||| ||| || ||||| |||||| |||||  ||||||||   || |||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51520378 actagtgtatagcaaaa-ccatacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccag 51520473  T
Q  297 ttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520474 ttctgccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 51520518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 56146974 - 56146735
Alignment:
Q  99 ttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaa 198  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||| ||| || ||||| |||||||||||| |||||  |    
T  56146974 ttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagcccta 56146877  T
Q  199 gcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 295  Q
    | ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||   || |||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  56146876 gactagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttggtcca 56146781  T
Q  296 gttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56146780 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 56146735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 341
Target Start/End: Original strand, 24741926 - 24742001
Alignment:
Q  265 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24741926 gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 24742001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 341
Target Start/End: Original strand, 29760627 - 29760702
Alignment:
Q  265 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29760627 gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 29760702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28468625 - 28468565
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28468625 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaat 28468565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Original strand, 10047378 - 10047440
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10047378 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaat 10047440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 36315327 - 36315265
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36315327 caagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 36315265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 36329536 - 36329474
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36329536 caagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 36329474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 38152537 - 38152475
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38152537 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaat 38152475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Original strand, 39245993 - 39246055
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39245993 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaat 39246055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5396768 - 5396707
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5396768 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaat 5396707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16623425 - 16623329
Alignment:
Q  243 aagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagc-caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||  |  |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16623425 aagataagcaatgaaagaaaaggaacaaa-cac--accaagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaat 16623329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 340
Target Start/End: Original strand, 5143260 - 5143319
Alignment:
Q  282 agattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 340  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5143260 agattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaa 5143319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5269289 - 5269227
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||| ||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5269289 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaat 5269227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31985730 - 31985670
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31985730 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaat 31985670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 67 - 341
Target Start/End: Original strand, 152 - 424
Alignment:
Q  67 aattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatg 166  Q
    ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||  ||||||    
T  152 aattgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatggtgataatcaatgagaacaaatg 250  T
Q  167 gccttcaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaaccatgaaagaaaa 263  Q
    || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  | |||| |||    
T  251 gcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa 347  T
Q  264 cgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  348 -gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9907 - 9666
Alignment:
Q  95 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacag- 193  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||     
T  9907 aaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtctccaaccaaacaacaacaaaacagc 9809  T
Q  194 cctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcat--acaagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttga 291  Q
    |||||| ||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || || ||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  9808 cctaag-ctagtatatagc-aaaaccacac-aagagctaacaagcataaacaagat-aagcaagaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttga 9716  T
Q  292 cccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9715 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 9666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 148 - 13
Alignment:
Q  95 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacag- 193  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||      ||||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||     
T  148 aaccttcacaccaatta-aataaaccaatgatgtgtggagcaagt------gataatcaatgagagcaaatggtctccaagtaaacaacaacaaaacagc 56  T
Q  194 cctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcata 241  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||   |||||||||||||||    
T  55 cctaag-ctagtgtatagc-aaaaccacac---gagctaacaagcata 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 35328 - 35086
Alignment:
Q  95 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagc 194  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  35328 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 35231  T
Q  195 ctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcata-caagataaaccatgaaagaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgac 292  Q
    |  || ||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||| | |||||||| |  | |||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  35230 cctagactagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttaac 35135  T
Q  293 ccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35134 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 35086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18048 - 17988
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18048 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 17988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24141 - 24081
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24141 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 24081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0777 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0777
Description:

Target: scaffold0777; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 118
Target Start/End: Original strand, 6291 - 6341
Alignment:
Q  68 attgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6291 attgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaa 6341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 158
Target Start/End: Original strand, 13140 - 13228
Alignment:
Q  69 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgag 158  Q
    ||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  13140 ttgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatatgtggagcaagtgatagtgataatcaatgag 13228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 34216 - 34136
Alignment:
Q  95 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagc 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| || |||||    
T  34216 aaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagc 34136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8516 - 8455
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8516 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 8455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 341
Target Start/End: Original strand, 85684 - 85744
Alignment:
Q  282 agattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  85684 agattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctccaat 85744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 133377 - 133316
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaagc-caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  133377 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaat 133316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 333
Target Start/End: Original strand, 5682 - 5736
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagc 333  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5682 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 5736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Original strand, 10728 - 10790
Alignment:
Q  280 caagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||| |||||||||||  | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10728 caagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaat 10790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 341
Target Start/End: Original strand, 45284 - 45314
Alignment:
Q  311 cctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45284 cctaatctgggggagagagcagctctccaat 45314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 44058 - 43997
Alignment:
Q  281 aagattgttgacccagttaag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 341  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44058 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctccaat 43997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University