View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15802_high_20 (Length: 305)

Name: NF15802_high_20
Description: NF15802
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15802_high_20
NF15802_high_20
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (27-305)||(2985-3262)
[»] chr1 (61 HSPs)
chr1 (19-305)||(50210039-50210325)
chr1 (11-305)||(34509789-34510083)
chr1 (19-305)||(22532278-22532564)
chr1 (29-305)||(27250565-27250841)
chr1 (29-298)||(21026696-21026965)
chr1 (19-305)||(20135196-20135482)
chr1 (19-238)||(22354399-22354616)
chr1 (29-178)||(22356010-22356159)
chr1 (29-178)||(22357696-22357845)
chr1 (72-305)||(22468576-22468808)
chr1 (23-305)||(433018-433298)
chr1 (23-299)||(16758664-16758942)
chr1 (136-305)||(23593722-23593891)
chr1 (149-305)||(13988872-13989028)
chr1 (149-305)||(21923291-21923447)
chr1 (23-305)||(21346967-21347249)
chr1 (149-295)||(45574842-45574989)
chr1 (149-305)||(21475087-21475243)
chr1 (149-305)||(21840773-21840929)
chr1 (149-305)||(31612319-31612475)
chr1 (23-305)||(21342102-21342384)
chr1 (23-295)||(35260910-35261180)
chr1 (29-305)||(38801227-38801499)
chr1 (149-305)||(29298143-29298298)
chr1 (149-305)||(29776694-29776850)
chr1 (136-295)||(21861512-21861672)
chr1 (136-295)||(21896198-21896358)
chr1 (136-305)||(16361923-16362092)
chr1 (193-302)||(21754057-21754166)
chr1 (189-302)||(22921864-22921978)
chr1 (149-305)||(16275363-16275520)
chr1 (193-305)||(21707173-21707285)
chr1 (193-305)||(21711715-21711827)
chr1 (213-305)||(20847173-20847266)
chr1 (168-299)||(33681022-33681153)
chr1 (149-305)||(13212861-13213018)
chr1 (29-134)||(20847055-20847160)
chr1 (168-299)||(22237642-22237773)
chr1 (200-302)||(20248291-20248394)
chr1 (204-305)||(15860064-15860165)
chr1 (149-305)||(22123067-22123224)
chr1 (166-295)||(50614088-50614219)
chr1 (166-295)||(50621916-50622047)
chr1 (107-305)||(21714551-21714754)
chr1 (200-298)||(20918620-20918719)
chr1 (233-305)||(20454593-20454665)
chr1 (200-294)||(14295557-14295652)
chr1 (98-177)||(48603652-48603730)
chr1 (217-299)||(52927993-52928076)
chr1 (204-305)||(40389160-40389261)
chr1 (193-295)||(41050033-41050138)
chr1 (193-295)||(16368284-16368388)
chr1 (48-295)||(16093738-16093987)
chr1 (131-287)||(21787979-21788136)
chr1 (140-265)||(33797570-33797694)
chr1 (166-295)||(50686630-50686761)
chr1 (244-295)||(21533923-21533974)
chr1 (200-265)||(22130913-22130978)
chr1 (23-77)||(27653052-27653106)
chr1 (24-77)||(52940708-52940761)
chr1 (169-293)||(26064959-26065084)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (19-305)||(39486-39771)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (19-305)||(75041-75326)
[»] chr8 (73 HSPs)
chr8 (19-305)||(28648870-28649156)
chr8 (11-305)||(22626745-22627038)
chr8 (19-305)||(22875074-22875360)
chr8 (11-305)||(18818228-18818521)
chr8 (21-305)||(16092169-16092454)
chr8 (11-305)||(6759267-6759559)
chr8 (11-305)||(7372787-7373072)
chr8 (29-305)||(20536217-20536493)
chr8 (19-305)||(21923755-21924040)
chr8 (19-305)||(23648562-23648848)
chr8 (19-305)||(23406388-23406675)
chr8 (29-305)||(18879073-18879343)
chr8 (29-305)||(21918836-21919112)
chr8 (29-305)||(31971266-31971540)
chr8 (29-305)||(45130834-45131108)
chr8 (29-305)||(16199482-16199756)
chr8 (169-300)||(26219728-26219858)
chr8 (169-305)||(26225268-26225403)
chr8 (23-305)||(41598194-41598475)
chr8 (23-305)||(13507914-13508197)
chr8 (30-177)||(25362977-25363123)
chr8 (149-305)||(14409444-14409600)
chr8 (149-305)||(16413316-16413472)
chr8 (23-305)||(13597446-13597729)
chr8 (149-305)||(1484408-1484564)
chr8 (149-305)||(5853292-5853448)
chr8 (149-305)||(20403233-20403389)
chr8 (149-305)||(22001759-22001915)
chr8 (192-305)||(21285606-21285720)
chr8 (149-305)||(4483287-4483442)
chr8 (149-305)||(15203231-15203387)
chr8 (149-305)||(20046195-20046351)
chr8 (23-295)||(19801257-19801527)
chr8 (49-305)||(17611968-17612222)
chr8 (93-305)||(21389353-21389562)
chr8 (149-305)||(4542373-4542529)
chr8 (98-305)||(21395888-21396092)
chr8 (98-305)||(21790381-21790585)
chr8 (189-305)||(38855246-38855363)
chr8 (149-305)||(19896271-19896430)
chr8 (137-305)||(21778722-21778888)
chr8 (149-305)||(14823780-14823935)
chr8 (136-295)||(20498581-20498741)
chr8 (189-302)||(21673716-21673830)
chr8 (197-305)||(6520377-6520486)
chr8 (111-295)||(17439423-17439609)
chr8 (204-298)||(15070571-15070665)
chr8 (149-305)||(45290694-45290851)
chr8 (149-305)||(26223925-26224081)
chr8 (194-302)||(26355699-26355807)
chr8 (163-305)||(18678071-18678214)
chr8 (189-299)||(23760839-23760950)
chr8 (200-305)||(5866280-5866386)
chr8 (212-305)||(17140925-17141019)
chr8 (204-305)||(19937061-19937162)
chr8 (200-305)||(21491004-21491110)
chr8 (166-295)||(37116366-37116497)
chr8 (149-305)||(25484275-25484424)
chr8 (192-295)||(17266990-17267096)
chr8 (163-305)||(32121741-32121884)
chr8 (197-299)||(983407-983512)
chr8 (192-295)||(24353039-24353144)
chr8 (200-305)||(21249393-21249500)
chr8 (200-305)||(21255231-21255338)
chr8 (235-293)||(22525579-22525637)
chr8 (99-151)||(26222987-26223039)
chr8 (235-295)||(19154928-19154989)
chr8 (131-287)||(23776772-23776929)
chr8 (192-262)||(40492849-40492921)
chr8 (99-155)||(26219862-26219918)
chr8 (247-295)||(28397569-28397617)
chr8 (246-295)||(20502154-20502203)
chr8 (107-187)||(19983218-19983297)
[»] chr6 (75 HSPs)
chr6 (19-305)||(29060549-29060835)
chr6 (19-305)||(25629181-25629467)
chr6 (19-305)||(18409653-18409939)
chr6 (19-305)||(19303367-19303652)
chr6 (11-305)||(17287615-17287908)
chr6 (19-305)||(20593782-20594068)
chr6 (11-305)||(22780046-22780339)
chr6 (19-303)||(20360787-20361070)
chr6 (29-305)||(20638119-20638395)
chr6 (23-299)||(25644335-25644613)
chr6 (148-305)||(20076709-20076863)
chr6 (149-305)||(22782233-22782389)
chr6 (29-295)||(18456735-18457000)
chr6 (189-305)||(16496253-16496370)
chr6 (149-305)||(12742323-12742479)
chr6 (149-305)||(18334592-18334748)
chr6 (149-305)||(19005052-19005208)
chr6 (149-305)||(19858919-19859075)
chr6 (149-305)||(24422553-24422709)
chr6 (149-305)||(30676710-30676866)
chr6 (149-305)||(33861800-33861956)
chr6 (149-305)||(33864284-33864440)
chr6 (149-305)||(2291180-2291336)
chr6 (149-305)||(8055035-8055191)
chr6 (149-305)||(25754815-25754971)
chr6 (149-305)||(26924640-26924796)
chr6 (149-305)||(34963379-34963535)
chr6 (29-305)||(16920469-16920742)
chr6 (149-305)||(25656635-25656791)
chr6 (169-305)||(25688508-25688644)
chr6 (166-305)||(1540928-1541067)
chr6 (168-299)||(20109153-20109285)
chr6 (168-305)||(1595555-1595692)
chr6 (166-295)||(18461895-18462024)
chr6 (149-305)||(20556894-20557048)
chr6 (49-305)||(8227366-8227623)
chr6 (29-293)||(22831524-22831787)
chr6 (149-305)||(16448526-16448683)
chr6 (149-305)||(3852017-3852173)
chr6 (192-302)||(19652207-19652317)
chr6 (72-287)||(15041430-15041644)
chr6 (131-295)||(18821782-18821946)
chr6 (140-305)||(35245595-35245758)
chr6 (192-295)||(23019425-23019529)
chr6 (200-305)||(1561312-1561418)
chr6 (197-299)||(19668386-19668491)
chr6 (200-297)||(28496477-28496575)
chr6 (200-297)||(29808888-29808986)
chr6 (217-305)||(27333241-27333330)
chr6 (217-305)||(27393981-27394070)
chr6 (200-299)||(9098518-9098620)
chr6 (31-287)||(25603223-25603478)
chr6 (29-295)||(11185524-11185787)
chr6 (29-105)||(18821655-18821731)
chr6 (63-140)||(5834367-5834443)
chr6 (189-305)||(19847990-19848107)
chr6 (63-140)||(20177089-20177165)
chr6 (63-140)||(22158826-22158902)
chr6 (253-305)||(25714426-25714478)
chr6 (200-302)||(4185827-4185930)
chr6 (235-293)||(33443068-33443126)
chr6 (163-305)||(23992436-23992576)
chr6 (131-206)||(25642120-25642196)
chr6 (235-295)||(23076749-23076810)
chr6 (196-265)||(27415943-27416011)
chr6 (235-295)||(35008167-35008228)
chr6 (200-302)||(4186379-4186482)
chr6 (267-305)||(22080799-22080837)
chr6 (246-287)||(21766718-21766759)
chr6 (262-302)||(4738626-4738666)
chr6 (107-203)||(19863089-19863184)
chr6 (226-305)||(19873125-19873205)
chr6 (107-203)||(19873231-19873326)
chr6 (226-305)||(22432254-22432334)
chr6 (226-305)||(22438804-22438884)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (19-305)||(38770-39055)
scaffold0145 (97-305)||(32951-33158)
scaffold0145 (193-305)||(9755-9867)
[»] chr5 (68 HSPs)
chr5 (11-305)||(24529229-24529523)
chr5 (19-305)||(25421541-25421827)
chr5 (11-305)||(24493578-24493871)
chr5 (19-305)||(9077961-9078247)
chr5 (19-305)||(13025320-13025605)
chr5 (19-305)||(13095504-13095789)
chr5 (19-294)||(25431414-25431689)
chr5 (29-305)||(8286678-8286955)
chr5 (29-305)||(23390332-23390608)
chr5 (29-305)||(1096476-1096752)
chr5 (29-305)||(22075028-22075304)
chr5 (99-305)||(22412193-22412388)
chr5 (11-211)||(21985965-21986164)
chr5 (29-305)||(21292806-21293081)
chr5 (23-295)||(22144068-22144341)
chr5 (30-179)||(22107210-22107358)
chr5 (23-305)||(36154658-36154936)
chr5 (148-305)||(21808343-21808501)
chr5 (189-305)||(21729059-21729176)
chr5 (23-305)||(11581075-11581355)
chr5 (149-305)||(264768-264924)
chr5 (149-305)||(39363390-39363546)
chr5 (166-305)||(10732957-10733096)
chr5 (107-305)||(37723912-37724108)
chr5 (207-305)||(21997547-21997646)
chr5 (99-300)||(18418594-18418793)
chr5 (99-248)||(20766035-20766174)
chr5 (149-305)||(20909018-20909174)
chr5 (149-305)||(29329940-29330096)
chr5 (149-305)||(42245365-42245521)
chr5 (149-305)||(29345986-29346142)
chr5 (149-305)||(32027399-32027555)
chr5 (166-305)||(39245142-39245281)
chr5 (193-299)||(20902053-20902159)
chr5 (149-305)||(29348459-29348615)
chr5 (149-305)||(29350932-29351088)
chr5 (149-305)||(18319033-18319190)
chr5 (204-305)||(38619440-38619541)
chr5 (193-305)||(2154658-2154770)
chr5 (168-302)||(21565554-21565688)
chr5 (149-305)||(10775675-10775832)
chr5 (197-295)||(20026942-20027043)
chr5 (204-305)||(23064517-23064618)
chr5 (204-305)||(31061074-31061175)
chr5 (200-302)||(22959538-22959641)
chr5 (197-305)||(21329500-21329609)
chr5 (166-295)||(22178192-22178323)
chr5 (192-299)||(26012033-26012141)
chr5 (196-305)||(21502158-21502268)
chr5 (218-305)||(20918017-20918104)
chr5 (163-305)||(17517170-17517313)
chr5 (200-302)||(19668910-19669013)
chr5 (99-305)||(40725862-40726069)
chr5 (200-305)||(19660841-19660947)
chr5 (204-305)||(24067113-24067214)
chr5 (217-305)||(36314586-36314675)
chr5 (166-265)||(29448052-29448152)
chr5 (107-287)||(21873277-21873453)
chr5 (196-265)||(18356364-18356432)
chr5 (196-265)||(20910801-20910869)
chr5 (245-298)||(26732884-26732937)
chr5 (226-305)||(26704080-26704160)
chr5 (226-305)||(26973813-26973893)
chr5 (259-305)||(20806852-20806898)
chr5 (245-295)||(26740697-26740747)
chr5 (19-77)||(26740472-26740530)
chr5 (246-295)||(23469822-23469871)
chr5 (32-84)||(22120033-22120085)
[»] chr4 (74 HSPs)
chr4 (19-305)||(16377348-16377633)
chr4 (19-305)||(16239796-16240081)
chr4 (19-305)||(14038657-14038943)
chr4 (11-305)||(7893712-7894003)
chr4 (11-305)||(22636444-22636736)
chr4 (29-305)||(44052838-44053114)
chr4 (29-305)||(12902766-12903042)
chr4 (11-305)||(7088886-7089179)
chr4 (97-305)||(16270140-16270347)
chr4 (29-305)||(23374195-23374471)
chr4 (131-305)||(7798783-7798958)
chr4 (99-305)||(54798669-54798866)
chr4 (23-305)||(44928753-44929036)
chr4 (143-305)||(6899900-6900062)
chr4 (99-305)||(14280322-14280518)
chr4 (29-305)||(14053138-14053413)
chr4 (23-305)||(44102220-44102501)
chr4 (23-299)||(52243023-52243302)
chr4 (169-297)||(8574844-8574971)
chr4 (190-305)||(52873363-52873479)
chr4 (149-305)||(18215274-18215430)
chr4 (30-177)||(17047909-17048055)
chr4 (149-305)||(12307-12463)
chr4 (149-305)||(15118352-15118508)
chr4 (149-305)||(19618172-19618328)
chr4 (149-305)||(44615294-44615450)
chr4 (149-305)||(44773087-44773243)
chr4 (149-305)||(52312516-52312672)
chr4 (143-305)||(1837503-1837665)
chr4 (149-305)||(3515013-3515169)
chr4 (149-305)||(19242705-19242861)
chr4 (149-305)||(50222339-50222495)
chr4 (136-295)||(13793-13953)
chr4 (166-305)||(18239436-18239575)
chr4 (29-295)||(6190481-6190747)
chr4 (149-305)||(23803265-23803421)
chr4 (149-305)||(51463868-51464024)
chr4 (149-305)||(15355324-15355481)
chr4 (29-178)||(3096781-3096928)
chr4 (149-300)||(14970707-14970858)
chr4 (74-305)||(17046496-17046724)
chr4 (136-299)||(43198495-43198661)
chr4 (49-305)||(15371211-15371467)
chr4 (49-305)||(15373492-15373748)
chr4 (149-305)||(12610956-12611105)
chr4 (205-305)||(39706299-39706400)
chr4 (197-299)||(12288211-12288316)
chr4 (193-302)||(12774019-12774128)
chr4 (19-117)||(15091093-15091191)
chr4 (49-305)||(16223541-16223797)
chr4 (166-295)||(21815602-21815731)
chr4 (229-305)||(3096302-3096379)
chr4 (149-305)||(7641192-7641338)
chr4 (99-305)||(15367699-15367905)
chr4 (99-305)||(15402712-15402918)
chr4 (204-305)||(15370027-15370128)
chr4 (200-305)||(15551826-15551932)
chr4 (211-302)||(8846368-8846460)
chr4 (149-295)||(22353852-22353999)
chr4 (23-241)||(15464760-15464978)
chr4 (204-305)||(20149835-20149936)
chr4 (193-295)||(46640453-46640558)
chr4 (166-295)||(53082124-53082254)
chr4 (140-265)||(43256106-43256230)
chr4 (131-175)||(15093911-15093955)
chr4 (99-151)||(8574784-8574836)
chr4 (235-293)||(17333298-17333356)
chr4 (17-58)||(7798953-7798993)
chr4 (107-200)||(13569624-13569716)
chr4 (212-276)||(16596686-16596751)
chr4 (247-295)||(15791793-15791841)
chr4 (32-84)||(20157130-20157182)
chr4 (32-84)||(24028970-24029022)
chr4 (107-187)||(44675757-44675836)
[»] chr2 (70 HSPs)
chr2 (11-305)||(22337124-22337418)
chr2 (19-305)||(23076451-23076736)
chr2 (19-305)||(23660032-23660317)
chr2 (19-305)||(23060522-23060805)
chr2 (19-305)||(22738007-22738291)
chr2 (19-305)||(22731060-22731346)
chr2 (29-305)||(23285874-23286146)
chr2 (29-305)||(23654222-23654498)
chr2 (30-305)||(37953-38226)
chr2 (29-305)||(298650-298927)
chr2 (29-305)||(20309117-20309390)
chr2 (23-299)||(23708448-23708725)
chr2 (149-305)||(22105418-22105575)
chr2 (149-305)||(32214921-32215077)
chr2 (23-305)||(19671839-19672118)
chr2 (29-160)||(27753730-27753860)
chr2 (29-295)||(32451765-32452031)
chr2 (149-305)||(18808949-18809105)
chr2 (149-305)||(23130868-23131024)
chr2 (149-305)||(23133335-23133491)
chr2 (149-305)||(23709532-23709688)
chr2 (149-305)||(23712013-23712169)
chr2 (149-305)||(26505385-26505541)
chr2 (149-305)||(26507863-26508019)
chr2 (149-305)||(34402522-34402678)
chr2 (149-305)||(39682319-39682475)
chr2 (166-305)||(23135596-23135735)
chr2 (149-300)||(24367785-24367936)
chr2 (146-305)||(23103348-23103507)
chr2 (149-305)||(571403-571559)
chr2 (149-305)||(6726001-6726157)
chr2 (149-305)||(21155060-21155216)
chr2 (166-305)||(45029871-45030010)
chr2 (149-305)||(24898195-24898352)
chr2 (149-305)||(24900678-24900835)
chr2 (149-305)||(24903155-24903312)
chr2 (149-305)||(24905632-24905789)
chr2 (149-305)||(24908107-24908264)
chr2 (149-305)||(32039498-32039654)
chr2 (149-305)||(28577105-28577261)
chr2 (149-305)||(43137305-43137461)
chr2 (149-305)||(24529528-24529685)
chr2 (189-302)||(28405988-28406103)
chr2 (189-302)||(25175862-25175976)
chr2 (168-295)||(7707-7835)
chr2 (149-305)||(38967380-38967537)
chr2 (234-305)||(8946666-8946737)
chr2 (23-295)||(20520022-20520295)
chr2 (217-305)||(23071972-23072061)
chr2 (163-305)||(25616194-25616337)
chr2 (93-295)||(22413035-22413240)
chr2 (193-295)||(23207296-23207401)
chr2 (197-305)||(7679594-7679702)
chr2 (194-302)||(22134208-22134315)
chr2 (192-295)||(23791292-23791398)
chr2 (251-305)||(23040247-23040301)
chr2 (200-299)||(18786907-18787009)
chr2 (131-287)||(22799063-22799220)
chr2 (253-305)||(24643054-24643106)
chr2 (192-295)||(23004767-23004873)
chr2 (192-295)||(24697603-24697709)
chr2 (131-203)||(22758652-22758725)
chr2 (131-206)||(22740897-22740973)
chr2 (131-276)||(23019643-23019789)
chr2 (235-293)||(23287384-23287442)
chr2 (149-226)||(24642856-24642933)
chr2 (166-295)||(25108906-25109037)
chr2 (245-293)||(26392403-26392451)
chr2 (131-293)||(23038048-23038217)
chr2 (251-287)||(21916156-21916192)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (11-305)||(22892-23185)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (23-305)||(17045-17329)
scaffold0056 (23-295)||(79159-79430)
[»] chr3 (91 HSPs)
chr3 (11-305)||(18438543-18438837)
chr3 (19-305)||(25476211-25476497)
chr3 (19-305)||(14972863-14973149)
chr3 (19-305)||(40213547-40213832)
chr3 (11-305)||(11424581-11424871)
chr3 (19-301)||(14576659-14576940)
chr3 (11-305)||(26686896-26687189)
chr3 (11-305)||(43840941-43841234)
chr3 (19-301)||(14572602-14572883)
chr3 (23-296)||(42386428-42386702)
chr3 (17-305)||(23083186-23083473)
chr3 (29-305)||(13442283-13442559)
chr3 (29-305)||(17487865-17488141)
chr3 (29-305)||(17499347-17499623)
chr3 (29-305)||(20698272-20698547)
chr3 (99-305)||(24153115-24153320)
chr3 (29-305)||(12399218-12399494)
chr3 (169-305)||(36166604-36166739)
chr3 (169-300)||(21618460-21618590)
chr3 (29-299)||(30029855-30030124)
chr3 (23-295)||(52523557-52523831)
chr3 (23-296)||(23274705-23274979)
chr3 (149-305)||(17672632-17672788)
chr3 (149-305)||(29172583-29172739)
chr3 (149-305)||(9707607-9707763)
chr3 (149-305)||(17463184-17463340)
chr3 (49-305)||(24340578-24340835)
chr3 (149-305)||(34159332-34159488)
chr3 (149-305)||(45606907-45607063)
chr3 (23-295)||(53070528-53070799)
chr3 (149-305)||(55476497-55476653)
chr3 (166-305)||(28848628-28848767)
chr3 (149-300)||(38961891-38962042)
chr3 (149-305)||(7781347-7781503)
chr3 (149-305)||(8899100-8899256)
chr3 (149-305)||(12567566-12567722)
chr3 (149-305)||(13544031-13544187)
chr3 (149-305)||(16454281-16454437)
chr3 (149-305)||(41123896-41124049)
chr3 (149-305)||(13151790-13151947)
chr3 (149-305)||(13154255-13154412)
chr3 (193-305)||(6469178-6469290)
chr3 (149-305)||(10247723-10247879)
chr3 (149-305)||(16282811-16282967)
chr3 (149-300)||(50242833-50242984)
chr3 (198-305)||(55500948-55501055)
chr3 (30-177)||(16796685-16796831)
chr3 (149-305)||(17446655-17446810)
chr3 (168-295)||(43550497-43550625)
chr3 (168-302)||(16097340-16097474)
chr3 (193-305)||(15977521-15977633)
chr3 (192-299)||(15470939-15471047)
chr3 (136-302)||(16103792-16103957)
chr3 (171-305)||(27165256-27165391)
chr3 (204-305)||(12119780-12119881)
chr3 (204-305)||(15412435-15412536)
chr3 (193-302)||(32307689-32307798)
chr3 (23-253)||(2051029-2051260)
chr3 (171-305)||(53301527-53301663)
chr3 (204-305)||(8499524-8499625)
chr3 (200-305)||(13210333-13210439)
chr3 (189-302)||(12174257-12174368)
chr3 (192-305)||(10556991-10557105)
chr3 (99-305)||(37642170-37642377)
chr3 (197-305)||(14234496-14234605)
chr3 (192-295)||(43925977-43926083)
chr3 (163-305)||(46822274-46822417)
chr3 (193-295)||(37251165-37251270)
chr3 (212-305)||(44494815-44494908)
chr3 (209-302)||(49668091-49668185)
chr3 (98-177)||(14179570-14179648)
chr3 (213-305)||(17737242-17737337)
chr3 (209-302)||(9512932-9513026)
chr3 (209-302)||(9520907-9521001)
chr3 (193-295)||(22110349-22110454)
chr3 (193-302)||(1644674-1644782)
chr3 (163-305)||(12511066-12511209)
chr3 (99-305)||(22147431-22147637)
chr3 (259-305)||(45577948-45577994)
chr3 (199-295)||(12377940-12378039)
chr3 (261-305)||(28194699-28194743)
chr3 (193-295)||(606324-606428)
chr3 (38-80)||(12339985-12340027)
chr3 (244-293)||(13919350-13919399)
chr3 (99-155)||(21618594-21618650)
chr3 (99-151)||(36166747-36166799)
chr3 (131-203)||(15877984-15878057)
chr3 (29-75)||(17248122-17248168)
chr3 (246-287)||(23077530-23077571)
chr3 (107-200)||(23408544-23408636)
chr3 (32-84)||(4588628-4588680)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (19-305)||(25891-26177)
scaffold0122 (169-305)||(44682-44819)
scaffold0122 (50-190)||(33352-33491)
[»] chr7 (77 HSPs)
chr7 (19-305)||(3564190-3564476)
chr7 (19-305)||(38227490-38227775)
chr7 (19-305)||(12698840-12699126)
chr7 (29-305)||(9509198-9509474)
chr7 (19-299)||(15143863-15144143)
chr7 (99-305)||(18456319-18456524)
chr7 (29-305)||(26212005-26212281)
chr7 (23-299)||(2279948-2280225)
chr7 (29-298)||(10589055-10589323)
chr7 (29-305)||(16386083-16386360)
chr7 (99-305)||(48273398-48273594)
chr7 (29-305)||(40443400-40443674)
chr7 (29-305)||(27847669-27847942)
chr7 (149-295)||(13647344-13647491)
chr7 (23-305)||(17061790-17062071)
chr7 (166-305)||(24275177-24275316)
chr7 (149-305)||(456327-456483)
chr7 (149-305)||(11393287-11393443)
chr7 (149-305)||(11972502-11972658)
chr7 (149-305)||(14949122-14949278)
chr7 (149-305)||(15376713-15376869)
chr7 (149-305)||(16232526-16232682)
chr7 (149-305)||(18640278-18640434)
chr7 (149-305)||(20385123-20385279)
chr7 (149-305)||(21189595-21189751)
chr7 (149-305)||(32125497-32125653)
chr7 (149-305)||(41522923-41523079)
chr7 (149-305)||(41525385-41525541)
chr7 (23-305)||(44116515-44116796)
chr7 (169-305)||(16410065-16410201)
chr7 (149-305)||(18430718-18430874)
chr7 (149-305)||(24702244-24702400)
chr7 (149-305)||(27216866-27217022)
chr7 (143-305)||(16213690-16213852)
chr7 (149-305)||(38898376-38898533)
chr7 (149-305)||(3386339-3386495)
chr7 (149-305)||(24704694-24704847)
chr7 (193-305)||(67754-67867)
chr7 (193-305)||(13831379-13831491)
chr7 (192-305)||(22072922-22073037)
chr7 (23-292)||(12255621-12255892)
chr7 (204-305)||(13869352-13869453)
chr7 (189-302)||(18005658-18005772)
chr7 (23-295)||(12756546-12756817)
chr7 (49-305)||(19486599-19486856)
chr7 (202-302)||(44014190-44014291)
chr7 (196-299)||(16219719-16219823)
chr7 (93-299)||(1867895-1868101)
chr7 (93-291)||(15008398-15008597)
chr7 (200-305)||(16495411-16495517)
chr7 (200-305)||(34200795-34200901)
chr7 (197-305)||(47831816-47831925)
chr7 (149-305)||(20110562-20110708)
chr7 (205-302)||(811142-811240)
chr7 (217-305)||(28505321-28505410)
chr7 (200-305)||(11996033-11996139)
chr7 (200-305)||(15754893-15754999)
chr7 (192-299)||(16056343-16056450)
chr7 (146-305)||(14932685-14932846)
chr7 (146-305)||(15356120-15356281)
chr7 (146-305)||(15360234-15360395)
chr7 (131-305)||(18154773-18154953)
chr7 (189-296)||(10063813-10063921)
chr7 (149-305)||(26355983-26356150)
chr7 (149-305)||(26358435-26358602)
chr7 (209-299)||(12901338-12901431)
chr7 (202-295)||(20220194-20220290)
chr7 (233-299)||(14044761-14044828)
chr7 (233-299)||(14354791-14354858)
chr7 (235-295)||(18203831-18203891)
chr7 (131-203)||(19649421-19649494)
chr7 (235-288)||(48991206-48991260)
chr7 (196-265)||(2530140-2530208)
chr7 (49-78)||(10063678-10063707)
chr7 (247-295)||(9033400-9033448)
chr7 (32-84)||(9751390-9751442)
chr7 (247-295)||(20619399-20619447)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (19-305)||(339777-340059)
scaffold0003 (149-305)||(158450-158606)
scaffold0003 (196-265)||(71350-71418)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (11-305)||(352-645)
scaffold0292 (20-305)||(3479-3763)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (19-305)||(39922-40207)
scaffold0080 (194-295)||(19883-19987)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (19-305)||(25905-26190)
scaffold0026 (19-305)||(39867-40151)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (17-305)||(51922-52208)
scaffold0011 (29-305)||(167815-168090)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (22-303)||(4519-4799)
scaffold0228 (22-303)||(12101-12381)
scaffold0228 (22-303)||(22053-22333)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (19-305)||(16426-16712)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (11-305)||(8351-8641)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (29-305)||(13220-13496)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (29-305)||(1860-2136)
scaffold0016 (32-84)||(207359-207411)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (11-305)||(8488-8777)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (29-296)||(24137-24406)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (29-305)||(5957-6236)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (17-262)||(13144-13388)
scaffold0175 (200-305)||(34132-34238)
scaffold0175 (259-305)||(282-328)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (29-305)||(885-1160)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (19-234)||(27911-28125)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (21-293)||(4545-4816)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (11-255)||(781-1021)
scaffold0395 (248-305)||(4888-4945)
[»] scaffold0120 (5 HSPs)
scaffold0120 (17-305)||(32783-33068)
scaffold0120 (17-305)||(45937-46222)
scaffold0120 (103-305)||(16122-16323)
scaffold0120 (11-78)||(16323-16390)
scaffold0120 (253-305)||(17389-17441)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (110-305)||(3103-3298)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (29-305)||(4858-5134)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (29-304)||(13507-13780)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (29-305)||(1961-2237)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (29-305)||(20919-21196)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (88-251)||(3424-3588)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (19-305)||(4721-5006)
scaffold0358 (19-249)||(1-230)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (29-305)||(32076-32349)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (29-305)||(10262-10535)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (29-305)||(15301-15575)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (12-178)||(124722-124886)
scaffold0021 (131-304)||(174776-174949)
scaffold0021 (245-305)||(121775-121835)
scaffold0021 (197-295)||(136370-136471)
scaffold0021 (197-295)||(145078-145179)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (99-305)||(116436-116631)
scaffold0022 (192-295)||(128967-129072)
scaffold0022 (193-291)||(78345-78445)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (30-305)||(7275-7547)
scaffold0106 (30-305)||(1298-1570)
scaffold0106 (246-305)||(15291-15350)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (29-255)||(6669-6895)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (23-295)||(13147-13421)
scaffold0357 (23-299)||(15929-16206)
scaffold0357 (235-295)||(2680-2741)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (29-305)||(16291-16564)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (168-299)||(8481-8613)
scaffold0621 (189-302)||(6547-6661)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (29-295)||(51720-51985)
scaffold0034 (192-299)||(32551-32658)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (23-295)||(20255-20524)
scaffold0031 (148-305)||(128760-128917)
scaffold0031 (131-200)||(65730-65800)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (19-155)||(10323-10458)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (30-177)||(1052-1198)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (29-305)||(888-1161)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (196-305)||(28423-28533)
scaffold0046 (200-305)||(11301-11407)
scaffold0046 (200-305)||(2006-2112)
scaffold0046 (261-305)||(4561-4605)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (29-305)||(4967-5240)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (30-156)||(3640-3765)
scaffold0165 (30-156)||(7704-7829)
scaffold0165 (108-299)||(27663-27855)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (166-305)||(44460-44600)
scaffold0023 (149-305)||(17440-17596)
scaffold0023 (149-305)||(94417-94573)
scaffold0023 (189-302)||(100386-100500)
scaffold0023 (189-302)||(40169-40283)
scaffold0023 (243-305)||(119884-119947)
scaffold0023 (238-302)||(101511-101576)
scaffold0023 (107-287)||(38394-38573)
scaffold0023 (107-175)||(23581-23647)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (149-305)||(20753-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (149-305)||(37827-37983)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (149-305)||(136686-136842)
scaffold0028 (149-305)||(139155-139311)
scaffold0028 (149-305)||(144093-144249)
scaffold0028 (149-305)||(134217-134373)
scaffold0028 (149-305)||(141624-141780)
scaffold0028 (189-296)||(62216-62321)
scaffold0028 (237-302)||(132670-132736)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (149-300)||(4705-4856)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (166-305)||(13398-13537)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (19-134)||(17814-17927)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (23-257)||(225465-225698)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (149-305)||(10779-10935)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (149-305)||(13953-14109)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (149-305)||(501090-501246)
scaffold0001 (189-302)||(160696-160809)
scaffold0001 (108-305)||(85539-85736)
scaffold0001 (246-295)||(497445-497494)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (33-305)||(47004-47267)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (49-305)||(17882-18139)
scaffold0247 (108-300)||(2088-2280)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (149-305)||(16790-16946)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (149-305)||(82078-82234)
scaffold0037 (168-299)||(22645-22776)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (149-305)||(11294-11450)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (29-295)||(51601-51864)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (189-302)||(19276-19390)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (149-305)||(12249-12405)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (149-305)||(9248-9404)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (149-305)||(40406-40562)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (23-295)||(60544-60818)
scaffold0010 (168-302)||(129917-130051)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (29-125)||(11349-11445)
scaffold0235 (198-305)||(11447-11555)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (136-295)||(53491-53651)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (168-302)||(141-275)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (189-302)||(2801-2915)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (149-305)||(112-268)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (149-305)||(4303-4459)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (29-122)||(20595-20688)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (168-299)||(10516-10647)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (189-295)||(1051-1158)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (171-305)||(38679-38814)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (149-305)||(4220-4377)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (190-295)||(12587-12693)
scaffold0413 (23-78)||(15445-15500)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (149-305)||(12070-12220)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (189-302)||(5655-5769)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (204-305)||(1336-1437)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (149-297)||(29946-30094)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (192-299)||(10542-10650)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (99-305)||(11473-11680)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (197-299)||(12954-13057)
scaffold0138 (166-253)||(18210-18298)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (149-298)||(161089-161239)
scaffold0007 (108-232)||(164550-164674)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (192-305)||(1091-1205)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (197-302)||(12778-12884)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (200-305)||(15670-15776)
scaffold0261 (131-200)||(1452-1522)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (189-302)||(2640-2754)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (200-305)||(1075-1181)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (136-305)||(38198-38368)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (189-302)||(14692-14806)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (205-305)||(15788-15889)
scaffold0020 (247-305)||(178903-178961)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (35-299)||(25121-25385)
scaffold0123 (23-265)||(586-828)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (207-305)||(6620-6719)
scaffold0333 (207-305)||(14000-14099)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (107-305)||(23848-24048)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (193-302)||(45791-45901)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (197-305)||(1037-1146)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (136-293)||(8001-8161)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (205-305)||(6134-6235)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (197-299)||(8075-8180)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (166-295)||(6255-6386)
scaffold0420 (249-295)||(13793-13840)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (166-291)||(38339-38466)
scaffold0139 (131-305)||(19985-20165)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (200-302)||(6824-6927)
scaffold0556 (192-242)||(8088-8138)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (209-299)||(23898-23989)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (166-295)||(97024-97155)
scaffold0006 (166-295)||(106302-106433)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (189-259)||(2213-2283)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (193-295)||(267679-267784)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (140-265)||(15362-15486)
scaffold0107 (246-295)||(36199-36248)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (238-302)||(28813-28879)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (197-295)||(569-669)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (193-295)||(1795-1900)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (212-302)||(32110-32202)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (107-287)||(16264-16442)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (253-295)||(11982-12024)
scaffold0503 (23-78)||(12165-12220)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (209-295)||(2694-2783)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (197-299)||(103632-103737)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (150-305)||(29563-29720)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (107-305)||(36459-36662)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (107-203)||(69905-70000)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (96-203)||(32544-32650)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (146-287)||(29117-29262)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (235-293)||(206566-206624)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (107-200)||(15584-15676)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (166-227)||(13092-13153)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (133-172)||(1166-1205)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (166-262)||(57-154)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (23-77)||(24427-24481)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (246-291)||(813-858)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (251-287)||(9536-9572)


Alignment Details
Target: scaffold0540 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 27 - 305
Target Start/End: Original strand, 2985 - 3262
Alignment:
Q  27 gtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaa 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  2985 gtttttgcgacctgtgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaa- 3083  T
Q  127 gatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattatta 226  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3084 gatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattatta 3183  T
Q  227 tgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3184 tgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 3262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 61)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Original strand, 50210039 - 50210325
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210039 cttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 50210138  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50210139 tgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttga 50210237  T
Q  219 tattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210238 tattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 50210325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 34510083 - 34509789
Alignment:
Q  11 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 110  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34510083 cagagtgtcatgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 34509984  T
Q  111 tgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 210  Q
    | ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34509983 tttgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgactt 34509885  T
Q  211 gcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509884 gcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 34509789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22532564 - 22532278
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  22532564 cttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgatgatgttatttatgaactgtgaagc 22532465  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| | ||    
T  22532464 tgtttaa-gatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatgga 22532366  T
Q  219 tattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22532365 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaaga 22532278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 27250565 - 27250841
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27250565 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattgatacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgttt-aaga 27250663  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  27250664 tgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatg 27250763  T
Q  229 tcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27250764 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 27250841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21026965 - 21026696
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21026965 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaa-ga 21026867  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttga--attatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattatta 226  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||  |||||   || |||||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||    
T  21026866 tgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatt--tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatattta 21026769  T
Q  227 tgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026768 cgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21026696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20135482 - 20135196
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20135482 cttgttaggtttatgcgacctttgttgtacgagttgttgagagttgaaccttagggtagtagtaagacctaatgatgttgttaattataatctgtgaagc 20135383  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| | | | || ||| || |||||||||||| |||||  |||    
T  20135382 tgttt-aagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaagatgttgttgaattgcacatga 20135284  T
Q  219 tattattatgtcatgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20135283 tattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaaga 20135196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Original strand, 22354399 - 22354616
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22354399 cttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttaggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagc 22354497  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  22354498 tgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattga 22354596  T
Q  219 tattattatgtcatgctgtt 238  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  22354597 tatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Original strand, 22356010 - 22356159
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22356010 ttttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctattt-aaga 22356108  T
Q  129 tgtgttaatg-ttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaa 178  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22356109 tgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 22356159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Original strand, 22357696 - 22357845
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22357696 ttttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctattt-aaga 22357794  T
Q  129 tgtgttaatg-ttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaa 178  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22357795 tgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 22357845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 305
Target Start/End: Original strand, 22468576 - 22468808
Alignment:
Q  72 gggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcatt 171  Q
    ||||||||||||||| |  ||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22468576 gggtagtattgagaccttttgaagttggtaattataatctgtgaagctgtttaa-gatgtgctgatgta-attatgatgtgatataatgttatgtgcatt 22468673  T
Q  172 acttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgttgttattta 270  Q
    ||||||  ||| | || ||| || |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  22468674 acttgagatattattgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattta 22468773  T
Q  271 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22468774 actaagttgcatgagtcagtctaagttgattaaga 22468808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 433298 - 433018
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||   |||   || || ||||| || |||||| |||||| |    
T  433298 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagctatgaatattataaataatattaatgatgatctgtaaagctgat 433199  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
    | | ||||  || |||||| ||||  |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433198 ttatgatgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatatt 433099  T
Q  223 attatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  433098 attatgtcttgatgtttttgtatactgcct---gtgttgccgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 433018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16758942 - 16758664
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   ||  | ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  16758942 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtcgtaatgaagattgtttatgatattaatgatgatctgtgaagctgtt 16758843  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
      || |||  ||  ||||| |||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||  ||| ||  ||| ||||||||||  ||| ||||||||||    
T  16758842 ataatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaat-gttgtgatgttgttgtattgtatttgatatt 16758744  T
Q  223 attatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
     |||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16758743 gttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 305
Target Start/End: Original strand, 23593722 - 23593891
Alignment:
Q  136 atgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 235  Q
    |||||| ||||  |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593722 atgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 23593821  T
Q  236 g-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | ||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23593822 gtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 23593891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13989028 - 13988872
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13989028 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13988929  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13988928 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 13988872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 21923291 - 21923447
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21923291 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21923390  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21923391 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 21923447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21347249 - 21346967
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||   ||||| || || |||||  |    |||||||||| |    
T  21347249 ttaggtttttgcgatcgttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtggttatgaatattaattataatattaatgctgtattgtgaagctgat 21347150  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatat 221  Q
    | | ||||  || |||||| ||||  |||||||||||   || ||||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21347149 ttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatat 21347051  T
Q  222 tattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21347050 tattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 21346967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 149 - 295
Target Start/End: Original strand, 45574842 - 45574989
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   |  ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  45574842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatact 45574941  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45574942 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 21475087 - 21475243
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21475087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21475186  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  21475187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaga 21475243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840773
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||| ||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21840829 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 21840773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31612475 - 31612319
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31612475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 31612376  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
       | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31612375 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 31612319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21342384 - 21342102
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||   ||||| || || |||||  |    |||||||||| |    
T  21342384 ttaggtttttgcgatcgttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtggttatgaatattaattataatattaatgctgtattgtgaagctgat 21342285  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatat 221  Q
    | | ||||  || |||||| ||||  |||||| ||||   || ||||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21342284 ttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatat 21342186  T
Q  222 tattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21342185 tattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 21342102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 295
Target Start/End: Original strand, 35260910 - 35261180
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattg-agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgt 121  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||| || ||| |  || ||||| ||||  ||||| ||||||| |||    
T  35260910 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagatgttatgagttgaacattggggtagtaatggagattgtat-atgatattaacgataatatgtgaagttgt 35261008  T
Q  122 ttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatat 221  Q
    |  ||||||  || |||||| | || ||||||| ||||   || |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |   |||||||||||||    
T  35261009 tataagatgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatat 35261105  T
Q  222 tattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261106 tgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 38801227 - 38801499
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||| | |||||| ||| ||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||  | ||||    
T  38801227 ttttgcgacctttgttgtacgagttgtcggaagttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataatttgtgaagctgaat-aaga 38801325  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    | ||||  ||||||||| |||||| ||||||||  | |||||||||||||  || | ||||||| | | |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||    
T  38801326 tatgttgttgttgattacgatgtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaataattgtatatataatatgttgatgaattgaatttgatataattatg 38801424  T
Q  229 tcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    || |||||  ||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  38801425 tcttgctg--ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaaga 38801499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 29298298 - 29298143
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  29298298 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatact 29298200  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29298199 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 29298143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 29776850 - 29776694
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  29776850 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatact 29776751  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29776750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 29776694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 136 - 295
Target Start/End: Original strand, 21861512 - 21861672
Alignment:
Q  136 atgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 235  Q
    |||||| |||| ||||||||||||   || | |||||||||||||||  ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21861512 atgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct 21861611  T
Q  236 gttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21861612 gttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 136 - 295
Target Start/End: Original strand, 21896198 - 21896358
Alignment:
Q  136 atgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 235  Q
    |||||| |||| ||||||||||||   || | |||||| ||||||||  ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21896198 atgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct 21896297  T
Q  236 gttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896298 gttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16362092 - 16361923
Alignment:
Q  136 atgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 235  Q
    |||||| ||||  |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16362092 atgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 16361993  T
Q  236 g-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | |||| |||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16361992 gtttttatatactg-ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 16361923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 193 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21754166 - 21754057
Alignment:
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 291  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754166 ttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21754068  T
Q  292 taagttgatga 302  Q
    |||||||||||    
T  21754067 taagttgatga 21754057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 302
Target Start/End: Original strand, 22921864 - 22921978
Alignment:
Q  189 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22921864 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 22921963  T
Q  288 ggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||| ||||||    
T  22921964 ggtctaagatgatga 22921978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 16275363 - 16275520
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatac 246  Q
    ||||||||||||  || ||||||| ||||||| |   || ||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16275363 tgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16275462  T
Q  247 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  16275463 tgc-tatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaaga 16275520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 193 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21707285 - 21707173
Alignment:
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 291  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707285 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactat-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21707187  T
Q  292 taagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||| ||||    
T  21707186 taagttgattaaga 21707173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 193 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21711827 - 21711715
Alignment:
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 291  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711827 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactat-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21711729  T
Q  292 taagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||| ||||    
T  21711728 taagttgattaaga 21711715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 305
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847266
Alignment:
Q  213 atttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 20847266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 168 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33681153 - 33681022
Alignment:
Q  168 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgtta 266  Q
    |||||| |||||||||  || |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  33681153 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgtta 33681055  T
Q  267 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33681054 tttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 33681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 13212861 - 13213018
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatac 246  Q
    |||||||||||   || ||||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13212861 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 13212960  T
Q  247 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||  |  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13212961 tgt-tgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 13213018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 134
Target Start/End: Original strand, 20847055 - 20847160
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||| ||| ||||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  20847055 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaaccataatctatgaagctgtttaaaga 20847154  T
Q  129 tgtgtt 134  Q
    ||||||    
T  20847155 tgtgtt 20847160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 168 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22237773 - 22237642
Alignment:
Q  168 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gtta 266  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||| ||||||||| | |||| ||||    
T  22237773 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgtcgctgtttgtta 22237675  T
Q  267 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22237674 tttaactaagcttcatgagtcggtctaagttga 22237642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20248394 - 20248291
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20248394 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 20248295  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  20248294 atga 20248291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 204 - 305
Target Start/End: Original strand, 15860064 - 15860165
Alignment:
Q  204 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15860064 ttgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 15860162  T
Q  303 aga 305  Q
    |||    
T  15860163 aga 15860165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 22123067 - 22123224
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct-gttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || ||||||||||||||||    || ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22123067 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 22123166  T
Q  248 gcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22123167 g-ttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaaga 22123224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 166 - 295
Target Start/End: Original strand, 50614088 - 50614219
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttg-tt 262  Q
    |||||||| |||||||| || | || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||||||||||| || ||    
T  50614088 tgcattacatgaattataaaag-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgttt 50614186  T
Q  263 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614187 gtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 166 - 295
Target Start/End: Original strand, 50621916 - 50622047
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttg-tt 262  Q
    |||||||| |||||||| || | || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||||||||||| || ||    
T  50621916 tgcattacatgaattataaaag-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgttt 50622014  T
Q  263 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50622015 gtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21714754 - 21714551
Alignment:
Q  107 aatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgt--aatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgt 204  Q
    ||||||||||||||||   ||||||  || |||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||     
T  21714754 aatctgtgaagctgttatgagatgt--tagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaat-tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgc 21714658  T
Q  205 tgacttgcatttgatat-----tattatgtcatgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |   ||  |||||||||     ||| ||||||| ||||| |||||  ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21714657 ttgtttttatttgatatcgttatatgatgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttg 21714558  T
Q  299 atgaaga 305  Q
    || ||||    
T  21714557 atcaaga 21714551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20918719 - 20918620
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918719 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 233 - 305
Target Start/End: Original strand, 20454593 - 20454665
Alignment:
Q  233 gctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20454593 gctgttttatgtgctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 20454665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 294
Target Start/End: Original strand, 14295557 - 14295652
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 294  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295557 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14295652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 48603730 - 48603652
Alignment:
Q  98 gttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttga 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  48603730 gttaattataatctgtgaagctgtttaa-gatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 217 - 299
Target Start/End: Original strand, 52927993 - 52928076
Alignment:
Q  217 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52927993 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 204 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40389261 - 40389160
Alignment:
Q  204 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| |    
T  40389261 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-atgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgatta 40389163  T
Q  303 aga 305  Q
    |||    
T  40389162 aga 40389160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 295
Target Start/End: Original strand, 41050033 - 41050138
Alignment:
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 289  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  || |||| |||||||||||||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||    
T  41050033 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcgg 41050132  T
Q  290 tctaag 295  Q
    ||||||    
T  41050133 tctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 295
Target Start/End: Original strand, 16368284 - 16368388
Alignment:
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc--tgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||   |||||| ||| |||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  16368284 ttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 16368382  T
Q  290 tctaag 295  Q
    ||||||    
T  16368383 tctaag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 48 - 295
Target Start/End: Original strand, 16093738 - 16093987
Alignment:
Q  48 cgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattg-agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattat 146  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||| |||| ||| | ||| || |||||| | || |||||||||||||||  ||||||  | |||||||||| |    
T  16093738 cgagttgatgtgagttgatccttggggtagaattggagattgaat-ataatgttagtgatgatctgtgaagctgttataagatgattgaatgttgatttt 16093836  T
Q  147 gatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgtt-gacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgta 243  Q
     |||||||||| |   || | |||||| |||||||   ||| || |||||||||||||| || ||||||| |||||| |||| |||||  ||||||| ||    
T  16093837 aatgtgatatatttgtatatacattacatgaattacctatg-atgtttgagatgttgtttgatttgcatt-gatattgttatatcatgagctgttttcta 16093934  T
Q  244 tactgcctatgttg-ttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||| |  |||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16093935 tactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 16093987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 287
Target Start/End: Original strand, 21787979 - 21788136
Alignment:
Q  131 tgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 230  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||| | || ||  || ||||||||||||  || | |||||||||  | |||    
T  21787979 tgttgatgttgattatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagtc 21788078  T
Q  231 atgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    |||||||| ||||   ||||||||| || | | |||||||||||||| ||||||||||    
T  21788079 atgctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatgagtc 21788136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797570
Alignment:
Q  140 tgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattactt--gaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||   || |||||  |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||     
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatt--tgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg- 33797598  T
Q  238 tttgtatactgcctatgttgttgttgtt 265  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  33797597 tttgtatgctgcatatgttgctgttgtt 33797570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 50686761 - 50686630
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttg-tt 262  Q
    |||||||| ||||||||  ||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||  || |||| |  |||||||||||||  | ||    
T  50686761 tgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatgaactattttatgaactgcctatgttgccgttt 50686663  T
Q  263 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  50686662 gtttattaactaaactgcatgagtcggtctaag 50686630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 295
Target Start/End: Original strand, 21533923 - 21533974
Alignment:
Q  244 tactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  21533923 tactgcgtatgttgttgttgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 21533974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 265
Target Start/End: Original strand, 22130913 - 22130978
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgtt 265  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22130913 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttggatactgcctatgttgctgttgtt 22130978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 77
Target Start/End: Original strand, 27653052 - 27653106
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtag 77  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||    
T  27653052 ttagggttttgcgatctttgttgcacgagatgttatgagttgatccttggggtag 27653106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 77
Target Start/End: Original strand, 52940708 - 52940761
Alignment:
Q  24 taggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtag 77  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||    
T  52940708 taggtttttgcgatctttgtcgcacgagatgttatgagttgatccttggggtag 52940761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26065084 - 26064959
Alignment:
Q  169 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc--tgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gtt 265  Q
    ||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||| | |||| |||| |||||   | |||| | |||||||||||||| |||| |||    
T  26065084 attacttgaattatatatg-atctttgagatgttgttgatttgcattgg-tattgttatatcatgaattattttatgtactgcctatgttgctgtttgtt 26064987  T
Q  266 atttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
      | ||||||||||||||||| ||||||    
T  26064986 tatcaactaagctgcatgagttggtcta 26064959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 39771 - 39486
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||| ||| |||||||| || ||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  39771 cttgtcaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagc 39672  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39671 tgtttaa-gatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 39573  T
Q  219 tattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39572 tattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 39486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Original strand, 75041 - 75326
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||| ||| |||||||| || ||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  75041 cttgtcaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagc 75140  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75141 tgtttaa-gatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 75239  T
Q  219 tattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75240 tattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 75326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 73)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Original strand, 28648870 - 28649156
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28648870 cttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagc 28648969  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28648970 tgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttga 28649068  T
Q  219 tattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649069 tattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 28649156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22627038 - 22626745
Alignment:
Q  11 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22627038 cagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatc 22626939  T
Q  111 tgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||| ||    
T  22626938 tgtgaagctgtttaa-gatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgattt 22626840  T
Q  211 gcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626839 gtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 22626745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22875360 - 22875074
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    |||||||||  ||||||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22875360 cttgttagggctttgcgatctatgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagatgtaatggtgatgttaattataatctgtgaagc 22875261  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22875260 tgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 22875161  T
Q  219 tattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22875160 tattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaaga 22875074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Original strand, 18818228 - 18818521
Alignment:
Q  11 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 110  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18818228 cagagtgtcttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaatttagggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatc 18818326  T
Q  111 tgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||| ||||| |||||||||    
T  18818327 tgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgactt 18818425  T
Q  211 gcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
     || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818426 acaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 18818521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 305
Target Start/End: Original strand, 16092169 - 16092454
Alignment:
Q  21 tgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg 120  Q
    ||||||| |||||||| || |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||    
T  16092169 tgttaggattttgcgatctgtgtcacacaagttgttaagagttgaaccttggggtaatattgagacttaaggatgatgttaattataatatgcgaagttg 16092268  T
Q  121 tttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgata 220  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092269 ttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgata 16092368  T
Q  221 ttattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092369 ttattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 16092454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6759559 - 6759267
Alignment:
Q  11 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 110  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | || ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759559 cagagtgtcttgttaggattttgcaatctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 6759460  T
Q  111 tgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||    
T  6759459 tgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgagat---gttgactt 6759363  T
Q  211 gcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759362 gcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 6759267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7373072 - 7372787
Alignment:
Q  11 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 110  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7373072 cagagtgtcttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtggtagtgagacttaatgaggatgttaattataatc 7372974  T
Q  111 tgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||        |||||||||||| ||| | || |||||| ||||| |||||||||    
T  7372973 tgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa--------gcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgactt 7372883  T
Q  211 gcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372882 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 7372787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20536493 - 20536217
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20536493 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagtgttgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagttgttt-aaga 20536395  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  20536394 tgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatg 20536295  T
Q  229 tcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536294 tcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 20536217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Original strand, 21923755 - 21924040
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923755 cttgttaggtttt-gcgacctttgttgcccgagtagttgagagttgaaccttgaggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 21923853  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||  | |||| || |||||||||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21923854 tgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattga 21923952  T
Q  219 tattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923953 tattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21924040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23648848 - 23648562
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23648848 cttgttaggtttatgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacctaatgatgatgttaattataatctgttaagc 23648749  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | | || |||||| |||||||||||  |||||  |||    
T  23648748 tgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatga 23648650  T
Q  219 tattattatgtcatgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23648649 tattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaaga 23648562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23406675 - 23406388
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  23406675 cttgttaggtttt-gtgacctttgttgcacgagttattgagagttgaactttgggataatattgggacttaatgaggatgttaattataatatgtgaagt 23406577  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgtt--gttgacttgcattt 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||| ||||| |  ||||||||||| ||    
T  23406576 tgtttaa-gatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgacttgcaatt 23406478  T
Q  217 gatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406477 gatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 23406388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 18879073 - 18879343
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||    
T  18879073 ttttgcggcctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcatcaagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgat--aaga 18879170  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  18879171 tgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatg 18879270  T
Q  229 tcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879271 ttgt----ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 18879343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 21918836 - 21919112
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  21918836 ttttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacccttgggtaagattaagacttaacgatgaggttaattacgatctgtgaagctgtttaa-ga 21918934  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaat-gtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 227  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  || | | | |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21918935 tgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattat 21919033  T
Q  228 gtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21919034 gtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 21919112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31971540 - 31971266
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  31971540 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagctgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagatgtataa-ga 31971442  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  31971441 tatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatg 31971343  T
Q  229 tcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31971342 tcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 31971266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 45130834 - 45131108
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  45130834 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagctgtat-aaga 45130932  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg-acttgcatttgatattattat 227  Q
    | ||||  || ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  || | ||||||  | |||||||| || | ||| | |||||||||||||    
T  45130933 tttgttgttgatgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaaattgatattattat 45131031  T
Q  228 gtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  45131032 gtcatgctg-tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 45131108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 16199482 - 16199756
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  16199482 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtat-aaga 16199580  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    | ||||  ||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||||| | ||| ||| | ||||||||||||||    
T  16199581 tatgttgttgttgattatgatgtaatataatgt-ttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgtagatgaattgaaattgatattattatg 16199679  T
Q  229 tcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||| || |||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16199680 tcatgttg-tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 16199756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 169 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26219858 - 26219728
Alignment:
Q  169 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||| | ||||||||||    
T  26219858 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatt 26219760  T
Q  269 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219759 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26219728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 169 - 305
Target Start/End: Original strand, 26225268 - 26225403
Alignment:
Q  169 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  | ||| | ||||||||||    
T  26225268 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgttttgtatattg-ttgtgtcgctgttgttatt 26225366  T
Q  269 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26225367 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 26225403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 41598475 - 41598194
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   |||   || || ||||| || ||||||||| ||| |    
T  41598475 ttaggattttgcgatctttgccgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattatatataatattaatgatgatctgtgaaactgat 41598376  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
    | | ||||  || |||||| ||||  |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41598375 ttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 41598277  T
Q  223 attatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41598276 attatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 41598194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 305
Target Start/End: Original strand, 13507914 - 13508197
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||  |||   ||||| || || ||||| || ||||||||| |||      
T  13507914 ttaggtttttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaatcgtgggatagttatgaatattaattataatattaatgatgatctgtgaaactgaa 13508013  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
    | | ||||  || |||||| |||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  13508014 ttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatatt 13508113  T
Q  223 attatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||| ||||| |||| || ||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  13508114 attatatcatgatgttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 13508197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 177
Target Start/End: Original strand, 25362977 - 25363123
Alignment:
Q  30 tttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagat 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25362977 tttgcgacctttcttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgttt-aagat 25363075  T
Q  130 gtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttga 177  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  25363076 gtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 14409444 - 14409600
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14409444 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14409543  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14409544 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 14409600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413472
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16413416 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 16413472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 305
Target Start/End: Original strand, 13597446 - 13597729
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||  |||   ||||| || || ||||| || ||||||||| |||      
T  13597446 ttaggtttttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaatcgtgggatagttatgaatattaattataatattaatgatgatctgtgaaactgaa 13597545  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
    | | ||||  || |||||| |||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||||||| ||||||||| |||||| || ||||||    
T  13597546 ttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatatt 13597645  T
Q  223 attatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||| ||||| ||||||| || |||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  13597646 attatatcatgatgttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 13597729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1484564 - 1484408
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1484564 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 1484465  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1484464 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 1484408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 5853292 - 5853448
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5853292 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 5853391  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5853392 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 5853448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20403389 - 20403233
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20403389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20403290  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20403289 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 20403233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22001915 - 22001759
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22001915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22001816  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22001815 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 22001759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21285720 - 21285606
Alignment:
Q  192 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21285720 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggt 21285621  T
Q  291 ctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||| ||||    
T  21285620 ctaagttgattaaga 21285606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4483442 - 4483287
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4483442 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 4483343  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4483342 g-ttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 4483287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 15203231 - 15203387
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15203231 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15203330  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15203331 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaaga 15203387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 20046195 - 20046351
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20046195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 20046294  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20046295 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 20046351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 295
Target Start/End: Original strand, 19801257 - 19801527
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| |||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||   ||    || |  ||||| || ||||||||||||| |    
T  19801257 ttaggatttttcgatctttgtcgcacgagtcattgagagttgaaccttggggtagttatgaatattgtatataacattaatgatgatctgtgaagctgat 19801356  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
    | | ||||  || |||||| ||||  |||| ||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19801357 ttacgatgacttgatgttg-ttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatatt 19801455  T
Q  223 attatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801456 attatgtcatgctgttttgtatactg-ttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 49 - 305
Target Start/End: Original strand, 17611968 - 17612222
Alignment:
Q  49 gagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatga 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||| | |  || ||||| || ||||||||||||| || | ||||  || |||||   ||| |    
T  17611968 gagttgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattatttacaatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgtt---tataa 17612064  T
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg 248  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  17612065 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactg 17612164  T
Q  249 cctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  17612165 cctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 17612222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 305
Target Start/End: Original strand, 21389353 - 21389562
Alignment:
Q  93 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatat 192  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||  ||| ||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||  |||  ||||||     
T  21389353 atgaagttaattgtaatatgtgaagctgaataa-gatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatac 21389450  T
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 291  Q
     | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389451 ataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21389548  T
Q  292 taagttgatgaaga 305  Q
    |||| || ||||||    
T  21389549 taagatgttgaaga 21389562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 4542373 - 4542529
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || ||||||||||||| |||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  4542373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat-ct 4542471  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
       | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4542472 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 4542529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 305
Target Start/End: Original strand, 21395888 - 21396092
Alignment:
Q  98 gttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgag 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||  | |||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||  |||  ||||||  | ||    
T  21395888 gttaattgtaatctgtgaagctgaataa-gatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataag 21395985  T
Q  198 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21395986 atgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 21396083  T
Q  297 tgatgaaga 305  Q
    || ||||||    
T  21396084 tgttgaaga 21396092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 305
Target Start/End: Original strand, 21790381 - 21790585
Alignment:
Q  98 gttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgag 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||  | |||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||  |||  ||||||  | ||    
T  21790381 gttaattgtaatctgtgaagctgaataa-gatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataag 21790478  T
Q  198 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21790479 atgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 21790576  T
Q  297 tgatgaaga 305  Q
    || ||||||    
T  21790577 tgttgaaga 21790585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 305
Target Start/End: Original strand, 38855246 - 38855363
Alignment:
Q  189 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  38855246 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 38855345  T
Q  288 ggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  38855346 ggtctaagttgattaaga 38855363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19896430 - 19896271
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattat---gtcatgctgtttt-gtat 244  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  19896430 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtat 19896331  T
Q  245 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    || |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19896330 accgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 19896271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 137 - 305
Target Start/End: Original strand, 21778722 - 21778888
Alignment:
Q  137 tgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg 236  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||  |||  ||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21778722 tgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg 21778820  T
Q  237 ttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21778821 tt--gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 21778888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14823935 - 14823780
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14823935 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14823836  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  14823835 g-ttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaaga 14823780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20498741 - 20498581
Alignment:
Q  136 atgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 235  Q
    |||||| |||| ||||||||||||   || | |||||||||||||||  ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20498741 atgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct 20498642  T
Q  236 gttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
     ||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20498641 attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21673830 - 21673716
Alignment:
Q  189 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  21673830 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtc 21673731  T
Q  288 ggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||    
T  21673730 ggtctaagttgatga 21673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 197 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6520486 - 6520377
Alignment:
Q  197 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520486 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6520387  T
Q  296 ttgatgaaga 305  Q
    ||||| ||||    
T  6520386 ttgattaaga 6520377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 295
Target Start/End: Original strand, 17439423 - 17439609
Alignment:
Q  111 tgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 210  Q
    ||||||||||||  || |||  ||||||||||| || |||||||||| |   || |||||||| ||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||    
T  17439423 tgtgaagctgttataatatgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgattt 17439521  T
Q  211 gcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||| |||| |||||  ||||||| | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17439522 gcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 204 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15070665 - 15070571
Alignment:
Q  204 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070665 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 45290694 - 45290851
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatac 246  Q
    |||||||||||   || ||||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45290694 tgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 45290793  T
Q  247 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||  | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45290794 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 45290851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26224081 - 26223925
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct-gttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || ||||||| || ||||||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  26224081 tgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatatt 26223982  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | || | ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  26223981 g-ctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaaga 26223925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 194 - 302
Target Start/End: Original strand, 26355699 - 26355807
Alignment:
Q  194 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 292  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || || || |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26355699 tgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcgtgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtct 26355797  T
Q  293 aagttgatga 302  Q
    ||||||||||    
T  26355798 aagttgatga 26355807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 305
Target Start/End: Original strand, 18678071 - 18678214
Alignment:
Q  163 atgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgt 261  Q
    |||||||||||||||  ||| | || |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| || | |    
T  18678071 atgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctat 18678170  T
Q  262 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18678171 tgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaaga 18678214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 299
Target Start/End: Original strand, 23760839 - 23760950
Alignment:
Q  189 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||| ||||| || |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23760839 atatttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgatttacatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 23760938  T
Q  288 ggtctaagttga 299  Q
    ||||||||||||    
T  23760939 ggtctaagttga 23760950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Original strand, 5866280 - 5866386
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5866280 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 5866379  T
Q  299 atgaaga 305  Q
     ||||||    
T  5866380 ttgaaga 5866386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 212 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17141019 - 17140925
Alignment:
Q  212 catttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17141019 cattcgatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 17140925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 204 - 305
Target Start/End: Original strand, 19937061 - 19937162
Alignment:
Q  204 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  19937061 ttgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 19937159  T
Q  303 aga 305  Q
    |||    
T  19937160 aga 19937162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21491110 - 21491004
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21491110 gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21491011  T
Q  299 atgaaga 305  Q
     ||||||    
T  21491010 ttgaaga 21491004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 166 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37116497 - 37116366
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttg-tt 262  Q
    |||||||| ||||||||  ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||||||||||| || ||    
T  37116497 tgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgttt 37116399  T
Q  263 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116398 gtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 25484275 - 25484424
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  25484275 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac- 25484373  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
           | | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  25484374 -------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaaga 25484424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 295
Target Start/End: Original strand, 17266990 - 17267096
Alignment:
Q  192 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcg 288  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  | ||||| | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  17266990 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 17267089  T
Q  289 gtctaag 295  Q
    |||||||    
T  17267090 gtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 32121884 - 32121741
Alignment:
Q  163 atgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgt 261  Q
    |||||||||||||||  ||| | || |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| || | |    
T  32121884 atgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctat 32121785  T
Q  262 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  32121784 tgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaaga 32121741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Original strand, 983407 - 983512
Alignment:
Q  197 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||  ||  |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983407 gatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 983506  T
Q  294 agttga 299  Q
    ||||||    
T  983507 agttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24353144 - 24353039
Alignment:
Q  192 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 288  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||  ||||||| | |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  24353144 tttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 24353046  T
Q  289 gtctaag 295  Q
    |||||||    
T  24353045 gtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21249500 - 21249393
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgtt--atttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||| | || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249500 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21249401  T
Q  298 gatgaaga 305  Q
    | ||||||    
T  21249400 gttgaaga 21249393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21255338 - 21255231
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgtt--atttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||| | || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255338 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21255239  T
Q  298 gatgaaga 305  Q
    | ||||||    
T  21255238 gttgaaga 21255231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22525637 - 22525579
Alignment:
Q  235 tgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22525637 tgttttatgtactgcctaagttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 22525579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 151
Target Start/End: Original strand, 26222987 - 26223039
Alignment:
Q  99 ttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgt 151  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  26222987 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 26223039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 295
Target Start/End: Original strand, 19154928 - 19154989
Alignment:
Q  235 tgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19154928 tgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 287
Target Start/End: Original strand, 23776772 - 23776929
Alignment:
Q  131 tgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 230  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||| | || ||  || ||||||||||||  || | |||||||||  | |||    
T  23776772 tgttgatgttgaatatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtc 23776871  T
Q  231 atgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    |||||| | ||||   ||||||||| || | | |||||||||||||| ||||||||||    
T  23776872 atgctgatgttgtgatctgcctatgctgctatagttatttaactaagttgcatgagtc 23776929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 262
Target Start/End: Original strand, 40492849 - 40492921
Alignment:
Q  192 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttgtt 262  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  40492849 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcatatgatgttgtt 40492921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26219918 - 26219862
Alignment:
Q  99 ttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgata 155  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  26219918 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgtcata 26219862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28397617 - 28397569
Alignment:
Q  247 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28397617 tgcctatgttgttgttgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaag 28397569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 295
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502203
Alignment:
Q  246 ctgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgttgtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaag 20502203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19983297 - 19983218
Alignment:
Q  107 aatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatg--taatgtgcattacttgaattatgaatg 187  Q
    ||||||||||||||||  | ||  |||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||    
T  19983297 aatctgtgaagctgtt--atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaat-tgcattacttgagttatgaatg 19983218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 75)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 29060835 - 29060549
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29060835 cttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagc 29060736  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29060735 tgtttaa-gatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttga 29060637  T
Q  219 tattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29060636 tattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaaga 29060549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Original strand, 25629181 - 25629467
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25629181 cttgttaggattttgcgacttttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgttgttaattataatctgtgaagc 25629280  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25629281 tgtttaa-gatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttga 25629379  T
Q  219 tattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629380 tattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 25629467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Original strand, 18409653 - 18409939
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18409653 cttgttaggattttacgacctttgttgcacgagttattgagagttgaaccttagggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagc 18409752  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18409753 tgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttga 18409851  T
Q  219 tattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409852 tattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 18409939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Original strand, 19303367 - 19303652
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303367 cttgttaggattttgcgatctatgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagcactgagaattaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 19303466  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19303467 tgttgaa-gatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttga 19303565  T
Q  219 tattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19303566 tattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaaga 19303652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Original strand, 17287615 - 17287908
Alignment:
Q  11 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 110  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17287615 cagagtgtcttgttagggttt-gctatctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataacc 17287713  T
Q  111 tgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||| ||||| |||||||||    
T  17287714 tgtgaagctgttt-aagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgactt 17287812  T
Q  211 gcatttgatattattatgtcatgctgt-tttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17287813 gcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 17287908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20594068 - 20593782
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20594068 cttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgataatgataattataatctgtgaagc 20593969  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20593968 tgtttaa-gatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttga 20593870  T
Q  219 tattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20593869 tattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaaga 20593782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Original strand, 22780046 - 22780339
Alignment:
Q  11 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 110  Q
    ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22780046 cagagtgtcctgttaggtttt-gtgacctttgttgcacaagttgccgagagttgaaccttggggtagtataaagacttaatgatgatgttaatcataatc 22780144  T
Q  111 tgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||| | || |||||| ||||| |||||||||    
T  22780145 tgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgactt 22780243  T
Q  211 gcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22780244 gcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 22780339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 303
Target Start/End: Original strand, 20360787 - 20361070
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20360787 cttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgaggattgaacctttgggtagtattaagacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagc 20360885  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  20360886 tgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattga 20360984  T
Q  219 tattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20360985 tattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaa 20361070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 20638119 - 20638395
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20638119 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggataacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aaga 20638217  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||  || |||||  |||||||| | | ||||| ||||||||||||||    
T  20638218 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatg 20638317  T
Q  229 tcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20638318 tcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaaga 20638395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25644613 - 25644335
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagt-attgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgt 121  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||| |  || ||||| ||||| || |||||||||||||     
T  25644613 ttaggtttttgcgatctttgtcgcacgagttgctgagagttgaaccttggggtagttataaagattatat-atgatattaatgatgatctgtgaagctga 25644515  T
Q  122 ttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatat 221  Q
    |  | ||||  || |||||| || ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||  ||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25644514 tatatgatgatttgatgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatat 25644415  T
Q  222 tattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    | |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644414 tgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 148 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076709
Alignment:
Q  148 atgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatact 247  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| | || || ||| |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttact 20076767  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076766 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 20076709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22782389 - 22782233
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || ||||||||||||||||||  || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22782389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22782290  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22782289 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 22782233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18457000 - 18456735
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||   |||   || || ||||| || ||||||||||||| || | ||    
T  18457000 ttttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggcagttatgaatattatatataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatga 18456901  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    ||  || |||||| ||||  |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456900 tgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatg 18456802  T
Q  229 tcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||| |||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456801 tcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 189 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16496370 - 16496253
Alignment:
Q  189 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496370 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 16496271  T
Q  288 ggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  16496270 ggtctaagttgttgaaga 16496253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12742479 - 12742323
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12742479 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12742380  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12742379 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 12742323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 18334592 - 18334748
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18334592 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18334691  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18334692 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 18334748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19005208 - 19005052
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19005208 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19005109  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19005108 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 19005052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 19858919 - 19859075
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19858919 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19859018  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19859019 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 19859075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24422709 - 24422553
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24422709 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24422610  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24422609 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 24422553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676866
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30676810 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 30676866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 33861956 - 33861800
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33861956 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33861857  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33861856 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 33861800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 33864440 - 33864284
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33864440 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33864341  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33864340 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 33864284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 2291180 - 2291336
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  2291180 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 2291279  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2291280 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 2291336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 8055191 - 8055035
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8055191 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8055092  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
       | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8055091 -tttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 8055035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754815
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
      || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25754871 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 25754815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 26924640 - 26924796
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26924640 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26924739  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
       | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26924740 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 26924796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963379
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34963435 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaaga 34963379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 16920469 - 16920742
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||  ||| ||    
T  16920469 ttttgcgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataa-ga 16920567  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    |  |||  |||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| | | |||||||||  |||||    
T  16920568 taagttgttgttgattatgatgtggtataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatacttatg 16920666  T
Q  229 tcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  16920667 tcatgatgtt--gtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaaga 16920742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25656791 - 25656635
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || || |||| |||||||||   || ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25656791 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25656692  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25656691 g-ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 25656635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 169 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25688644 - 25688508
Alignment:
Q  169 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttat 267  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  25688644 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttatgttgctgttgttat 25688546  T
Q  268 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25688545 ttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaaga 25688508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 305
Target Start/End: Original strand, 1540928 - 1541067
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgt 264  Q
    |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  | ||||| ||||||    
T  1540928 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgt 1541026  T
Q  265 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1541027 tatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaaga 1541067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 168 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20109285 - 20109153
Alignment:
Q  168 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgtta 266  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||     
T  20109285 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttt 20109186  T
Q  267 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109185 attaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20109153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 168 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1595692 - 1595555
Alignment:
Q  168 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgtta 266  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  1595692 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgttgtta 1595594  T
Q  267 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  1595593 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaaga 1595555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 166 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18462024 - 18461895
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgt 264  Q
    |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||| ||||||    
T  18462024 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgt 18461926  T
Q  265 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461925 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 20556894 - 20557048
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||  ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20556894 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattat--atgtgaaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 20556991  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20556992 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaga 20557048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 305
Target Start/End: Original strand, 8227366 - 8227623
Alignment:
Q  49 gagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatga 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||   ||||| || || ||||| || ||||||||||||| || | ||||  || |||||| |||| |    
T  8227366 gagttgttgagagttgaaccttagggtagttatgaatattaattataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataa 8227465  T
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg 248  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  8227466 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactg 8227565  T
Q  249 cctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||| |||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  8227566 cctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaaga 8227623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22831787 - 22831524
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||    
T  22831787 ttttgcgacctttgtcgcacgattcgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaat-aaga 22831689  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtat--atttgagatgttgttgacttgcatttgatattatta 226  Q
    | ||||  |||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||  |||  |||||  || | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||    
T  22831688 tatgttgttgttgattatgatgtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgatta 22831590  T
Q  227 tgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    |||||||  |  ||| | | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831589 tgtcatgtcg--ttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22831524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 16448526 - 16448683
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatac 246  Q
    |||||||||||   || ||||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16448526 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16448625  T
Q  247 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16448626 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaaga 16448683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 3852017 - 3852173
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3852017 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3852116  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
       | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3852117 -attgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 3852173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19652317 - 19652207
Alignment:
Q  192 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19652317 tttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggt 19652219  T
Q  291 ctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||    
T  19652218 ctaagttgatga 19652207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 15041430 - 15041644
Alignment:
Q  72 gggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcatt 171  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||| ||| || | ||||||| ||||||||    
T  15041430 gggtagtaatgagacctaatgatgatgttagatacaatctgtaaagctgtttaa-gatgtgttgatgataattaagatttggtttaatgta-tgtgcatt 15041527  T
Q  172 acttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgttgttattta 270  Q
    ||||||  | | | || ||| || ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| |  | ||||||||||    
T  15041528 acttgagattttattgaatacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttattta 15041627  T
Q  271 actaagctgcatgagtc 287  Q
    |||||| ||||||||||    
T  15041628 actaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 295
Target Start/End: Original strand, 18821782 - 18821946
Alignment:
Q  131 tgttaatgttgatt-atgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatg-ttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||| | | |||| ||| |||||||| |||||| ||||| || |||||| |||||    
T  18821782 tgttaatgttgatttatgatgtgatataatgta-tacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcgtt-gatattgttatg 18821879  T
Q  229 tcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
     ||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821880 gcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245595
Alignment:
Q  140 tgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 239  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||     
T  35245758 tgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt- 35245661  T
Q  240 tgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
     ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  35245660 -gtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 35245595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23019529 - 23019425
Alignment:
Q  192 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| || |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  23019529 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggt 23019430  T
Q  291 ctaag 295  Q
    |||||    
T  23019429 ctaag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1561418 - 1561312
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1561418 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 1561319  T
Q  299 atgaaga 305  Q
     ||||||    
T  1561318 ttgaaga 1561312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19668491 - 19668386
Alignment:
Q  197 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  |||||||| |||||  |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19668491 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 19668392  T
Q  294 agttga 299  Q
    ||||||    
T  19668391 agttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 297
Target Start/End: Original strand, 28496477 - 28496575
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496477 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 297
Target Start/End: Original strand, 29808888 - 29808986
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808888 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 305
Target Start/End: Original strand, 27333241 - 27333330
Alignment:
Q  217 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27333241 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 27333330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 305
Target Start/End: Original strand, 27393981 - 27394070
Alignment:
Q  217 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27393981 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 27394070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 299
Target Start/End: Original strand, 9098518 - 9098620
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc--tgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||   ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098518 gttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 9098617  T
Q  297 tga 299  Q
    |||    
T  9098618 tga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 25603223 - 25603478
Alignment:
Q  31 ttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatg 130  Q
    |||||| || ||| ||| |||||| | ||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||| ||||||    
T  25603223 ttgcgatctgtgtcgcatgagttgcttagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgacgatgtttaatagaatctgtgaagctgttt-aagatg 25603321  T
Q  131 tgttaat-gttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgt 229  Q
    | ||| |  |||||||||||||||||| ||||  | | ||||||||||| | | | || ||| ||||||||| | ||| ||  |  ||||||| ||||||    
T  25603322 t-ttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgt 25603419  T
Q  230 catgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||| || |||||||| |||||||||  |||||||||    
T  25603420 catgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25603478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11185787 - 11185524
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||  | | ||| | |||||| ||| |||||||||  ||| |||||   |||||||||||| ||  ||| ||    
T  11185787 ttttgcgacctttgttgcatgggttgtcgaggatcggacccttgggtaggattaagacttaatagtgaggttaaccgtaatctgtgaagatgaataa-ga 11185689  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    | ||||  || ||||||||| ||| ||||| ||  | |||||||||||||  |||  ||||||    ||||| || ||| ||| ||||||||| ||||||    
T  11185688 tatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatgaattgaatttgatataattatg 11185590  T
Q  229 tcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||| ||||  ||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185589 tcatgttgtt--gtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 105
Target Start/End: Original strand, 18821655 - 18821731
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaatta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||| |||||||    
T  18821655 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggggtagcattaagacttgaatatgatattaatta 18821731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 140
Target Start/End: Original strand, 5834367 - 5834443
Alignment:
Q  63 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgtt 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  5834367 tgaaccttggggtagtattgggacttaatggtgatgctaattataatatgtaaagctgttt-aagatgtgtcaatgtt 5834443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 305
Target Start/End: Original strand, 19847990 - 19848107
Alignment:
Q  189 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt-tgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||||  ||||  ||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19847990 atatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 19848089  T
Q  288 ggtctaagttgatgaaga 305  Q
     |||||||||||| ||||    
T  19848090 agtctaagttgattaaga 19848107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20177165 - 20177089
Alignment:
Q  63 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgtt 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  20177165 tgaaccttggggtagtattgggacttaatggtgatgctaattataatatgtaaagctgttt-aagatgtgtcaatgtt 20177089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 140
Target Start/End: Original strand, 22158826 - 22158902
Alignment:
Q  63 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgtt 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22158826 tgaaccttggggtagtattgggacttaatggtgatgctaattataatatgtaaagctgttt-aagatgtgtcaatgtt 22158902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714426
Alignment:
Q  253 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 25714426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4185930
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttg 4185926  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  4185927 atga 4185930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 33443126 - 33443068
Alignment:
Q  235 tgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33443126 tgttttatatactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23992576 - 23992436
Alignment:
Q  163 atgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt-tgtatactgcctatgttgttgt 261  Q
    |||||||||||||||  ||| | || |||||| ||||||||   | ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| || | |    
T  23992576 atgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttg---aattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctat 23992480  T
Q  262 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23992479 tgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaaga 23992436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 206
Target Start/End: Original strand, 25642120 - 25642196
Alignment:
Q  131 tgttaatgttgattatgatgtgatataatg--taatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||    
T  25642120 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaat-tgcattacttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttg 25642196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23076810 - 23076749
Alignment:
Q  235 tgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076810 tgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 265
Target Start/End: Original strand, 27415943 - 27416011
Alignment:
Q  196 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgtt 265  Q
    |||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27415943 agatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 27416011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35008228 - 35008167
Alignment:
Q  235 tgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008228 tgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186379
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttg 4186383  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  4186382 atga 4186379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 305
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080837
Alignment:
Q  267 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaaga 22080837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21766759 - 21766718
Alignment:
Q  246 ctgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21766759 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 21766718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 302
Target Start/End: Original strand, 4738626 - 4738666
Alignment:
Q  262 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4738626 tgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4738666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19863184 - 19863089
Alignment:
Q  107 aatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatg--taatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg 203  Q
    ||||||||||||||||   ||||||  || |||||| | |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  19863184 aatctgtgaagctgttatgagatgt--tagtgttgaatgtgatgtgatataatgattaat-tgcattacttgaaatatgaatgaatgattgagatgttg 19863089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19873205 - 19873125
Alignment:
Q  226 atgtcatgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  19873205 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaaga 19873125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19873326 - 19873231
Alignment:
Q  107 aatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatg--taatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg 203  Q
    ||||||||||||||||   ||||||  || |||||| | |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  19873326 aatctgtgaagctgttatgagatgt--tagtgttgaatgtgatgtgatataatgattaat-tgcattacttgaaatatgaatgaatgattgagatgttg 19873231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22432334 - 22432254
Alignment:
Q  226 atgtcatgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| || | |||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  22432334 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaaga 22432254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22438884 - 22438804
Alignment:
Q  226 atgtcatgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| || | |||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  22438884 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaaga 22438804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 39055 - 38770
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39055 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 38956  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  38955 tgtttaa-gatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttga 38857  T
Q  219 tattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38856 tattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaaga 38770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 97 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 33158 - 32951
Alignment:
Q  97 tgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttga 196  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||| |    
T  33158 tgttgattataatctgtgaagctgtttaa-gatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaa 33060  T
Q  197 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  33059 gatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaact 32960  T
Q  297 tgatgaaga 305  Q
    |||||||||    
T  32959 tgatgaaga 32951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 193 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 9867 - 9755
Alignment:
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 291  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9867 ttgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 9769  T
Q  292 taagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||| ||||    
T  9768 taagttgattaaga 9755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 68)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24529523 - 24529229
Alignment:
Q  11 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  24529523 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcactagtagttgagagttgaaccttggggtagtattgaaacttaatgatgatgttaactataatc 24529424  T
Q  111 tgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24529423 tgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgactt 24529325  T
Q  211 gcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529324 gcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 24529229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25421827 - 25421541
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421827 cttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 25421728  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  25421727 tgttt-aagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattga 25421629  T
Q  219 tattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421628 tattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 25421541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24493871 - 24493578
Alignment:
Q  11 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24493871 cagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaataatgatgttaattataatc 24493772  T
Q  111 tgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 210  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||    
T  24493771 tgtgaagctatttaa-gatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactt 24493673  T
Q  211 gcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24493672 gcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 24493578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 9078247 - 9077961
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078247 cttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 9078148  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  9078147 tgtttaa-gatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttga 9078049  T
Q  219 tattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9078048 tattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaaga 9077961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13025605 - 13025320
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13025605 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagt 13025506  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13025505 tgtttaa-gatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttga 13025407  T
Q  219 tattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13025406 tatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 13025320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13095789 - 13095504
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13095789 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagt 13095690  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13095689 tgtttaa-gatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttga 13095591  T
Q  219 tattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13095590 tatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 13095504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25431689 - 25431414
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25431689 cttgttaggattttgcgacctttgttacacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 25431590  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25431589 tgttt-aagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattga 25431491  T
Q  219 tattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431490 tattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 8286678 - 8286955
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  8286678 ttttgcgacctttgttgcttgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattatattatgtgaagctgttt-aaga 8286776  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  8286777 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatg 8286876  T
Q  229 tcatgctg--ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286877 tcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 8286955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 23390332 - 23390608
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23390332 ttttgtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctattt-aaga 23390430  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  23390431 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatg 23390530  T
Q  229 tcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390531 tcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 23390608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1096752 - 1096476
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  1096752 ttttgcgatctctgtcgcacaagttgttaaaagttggaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataacctatgaagctgtttaa-ga 1096654  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1096653 tgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatg 1096554  T
Q  229 tcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | ||| || ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096553 ttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 1096476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22075304 - 22075028
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22075304 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaa-ga 22075206  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttga--attatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattatta 226  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||  |||||   || |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22075205 tgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatt--tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattatta 22075108  T
Q  227 tgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22075107 tgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttgttgaaga 22075028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 99 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412193
Alignment:
Q  99 ttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||             ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaa-gatgtgttgatgttgattatgatgtcatactt----------attacttgaattatgaatgtatatttgaga 22412300  T
Q  199 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22412299 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 22412200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 211
Target Start/End: Original strand, 21985965 - 21986164
Alignment:
Q  11 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||     
T  21985965 cagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattcagacttgatgatgatgttaactataatt 21986064  T
Q  111 tgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 210  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||  ||||||| |||| |  |||||||||||||||    
T  21986065 tgtgaagttgttt-aagatgtgttgatgttgaatatgaggtgataaaatgttatatgcattacttgagatatgaatttataatgaagatgttgttgactt 21986163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 21292806 - 21293081
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| | |||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  21292806 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgggagttggacccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtat-aaga 21292904  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg-acttgcat-ttgatattatta 226  Q
    | ||||  || ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  || | ||||||  | |||||||| || | ||| || ||||||||||||    
T  21292905 tatgttgttgatgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattatta 21293003  T
Q  227 tgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  21293004 tgtcatactg-tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaaga 21293081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22144341 - 22144068
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||   ||  | ||||| ||||| || | |||||||| ||||    
T  22144341 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtcgtaatgaagattgtttatgatattaatgatgacctgtgaagttgtt 22144242  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
      ||||||  || |||||| |||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22144241 ataagatgaattgatgttgtttacaatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatatt 22144142  T
Q  223 attatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
     |||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144141 gttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 179
Target Start/End: Original strand, 22107210 - 22107358
Alignment:
Q  30 tttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22107210 tttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagatgaacctttgagtagtattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgttt-aaggt 22107308  T
Q  130 gtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaat 179  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  22107309 gtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaat 22107358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 305
Target Start/End: Original strand, 36154658 - 36154936
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   |||   ||  | ||||| || || |||||||||| |    
T  36154658 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattatatatattattaatgatgatatgtgaagctgat 36154757  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
    | | ||||  || ||| || ||||  |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36154758 ttatgatgatttgatgatg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 36154856  T
Q  223 attatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36154857 attatgtcatgctgtttttgtatactgc---tg-tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 36154936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 148 - 305
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808501
Alignment:
Q  148 atgtgatataatgtaatgtgcattacttga--attatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtat 244  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||  |||||   || |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatt--tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtat 21808440  T
Q  245 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21808441 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 21808501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 189 - 305
Target Start/End: Original strand, 21729059 - 21729176
Alignment:
Q  189 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729059 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 21729158  T
Q  288 ggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  21729159 ggtctaagttgttgaaga 21729176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 305
Target Start/End: Original strand, 11581075 - 11581355
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| |||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   |||   || || ||||| ||||||||||||| || |    
T  11581075 ttaggattttgcgatctttgtcgtacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattatatataatattaatgataatctgtgaagttgat 11581174  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
    | | ||||  || |||||| ||||  |||||||||||   || | |||||||||||||||   || ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11581175 ttatgatga-ttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatatt 11581272  T
Q  223 attatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11581273 attatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 11581355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 264768 - 264924
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  264768 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 264867  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  264868 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 264924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 39363546 - 39363390
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39363546 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39363447  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39363446 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 39363390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 305
Target Start/End: Original strand, 10732957 - 10733096
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgt 264  Q
    |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||    
T  10732957 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgt 10733055  T
Q  265 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10733056 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 10733096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 107 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 37724108 - 37723912
Alignment:
Q  107 aatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgt--aatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgt 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||  || |||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||     
T  37724108 aatctgtgaagctgttttgagatgt--tagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaat-tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttga 37724012  T
Q  205 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 303  Q
    ||| ||  ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  37724011 tgaatttaatttgatataatcatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaa 37723914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 207 - 305
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997646
Alignment:
Q  207 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21997646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 99 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18418793 - 18418594
Alignment:
Q  99 ttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | | | || ||| || |||    
T  18418793 ttaattataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaata-ttaaga 18418695  T
Q  199 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  18418694 tgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagtt 18418597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 20766035 - 20766174
Alignment:
Q  99 ttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||        ||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20766035 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgtc-------gtactt---attacttgaattatgaatgtatatttgaga 20766124  T
Q  199 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20766125 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg 20766174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20909174 - 20909018
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20909174 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20909075  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20909074 g-ttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 20909018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 29330096 - 29329940
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29330096 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 29329997  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29329996 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 29329940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 42245365 - 42245521
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42245365 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 42245464  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42245465 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaaga 42245521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 29346142 - 29345986
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29346142 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29346043  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  29346042 g-ttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaaga 29345986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 32027555 - 32027399
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32027555 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32027456  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  32027455 g-ttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaaga 32027399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 39245281 - 39245142
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgt 264  Q
    |||||||||||||||||   || ||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||||    
T  39245281 tgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgt 39245183  T
Q  265 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39245182 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 39245142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 193 - 299
Target Start/End: Original strand, 20902053 - 20902159
Alignment:
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 291  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902053 ttgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20902151  T
Q  292 taagttga 299  Q
    ||||||||    
T  20902152 taagttga 20902159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 29348615 - 29348459
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29348615 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29348516  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | || || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  29348515 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaaga 29348459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 29351088 - 29350932
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29351088 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29350989  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | || || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  29350988 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaaga 29350932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 18319033 - 18319190
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatac 246  Q
    |||||||||||   || ||||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18319033 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 18319132  T
Q  247 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18319133 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaaga 18319190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 204 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 38619541 - 38619440
Alignment:
Q  204 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38619541 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 38619443  T
Q  303 aga 305  Q
    |||    
T  38619442 aga 38619440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 193 - 305
Target Start/End: Original strand, 2154658 - 2154770
Alignment:
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 291  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154658 ttgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 2154756  T
Q  292 taagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||| ||||    
T  2154757 taagttgattaaga 2154770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 168 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21565688 - 21565554
Alignment:
Q  168 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gtta 266  Q
    |||||| |||||||||  || |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| | || ||||    
T  21565688 cattacatgaattatgtttg-atatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttggatactgcctatgttgctatttgtta 21565590  T
Q  267 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565589 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 21565554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 10775675 - 10775832
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatac 246  Q
    |||||||||||   || ||||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10775675 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatac 10775774  T
Q  247 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||| | ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10775775 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 10775832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027043
Alignment:
Q  197 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20027041  T
Q  294 ag 295  Q
    ||    
T  20027042 ag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 204 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23064618 - 23064517
Alignment:
Q  204 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23064618 ttgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 23064520  T
Q  303 aga 305  Q
    |||    
T  23064519 aga 23064517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 204 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31061175 - 31061074
Alignment:
Q  204 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  31061175 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 31061077  T
Q  303 aga 305  Q
    |||    
T  31061076 aga 31061074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Original strand, 22959538 - 22959641
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959538 gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 22959637  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  22959638 atga 22959641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 197 - 305
Target Start/End: Original strand, 21329500 - 21329609
Alignment:
Q  197 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329500 gatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21329599  T
Q  296 ttgatgaaga 305  Q
    ||||| ||||    
T  21329600 ttgattaaga 21329609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 166 - 295
Target Start/End: Original strand, 22178192 - 22178323
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgttttgtatactgcctatgttgttg-tt 262  Q
    |||||||| ||||||||  ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  22178192 tgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgttt 22178290  T
Q  263 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22178291 gtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Original strand, 26012033 - 26012141
Alignment:
Q  192 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 290  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26012033 tttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgctttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 26012132  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||||||||    
T  26012133 ctaagttga 26012141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 305
Target Start/End: Original strand, 21502158 - 21502268
Alignment:
Q  196 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 294  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  21502158 agatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 21502257  T
Q  295 gttgatgaaga 305  Q
    |||||| ||||    
T  21502258 gttgattaaga 21502268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 218 - 305
Target Start/End: Original strand, 20918017 - 20918104
Alignment:
Q  218 atattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20918017 atattattttgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 20918104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 305
Target Start/End: Original strand, 17517170 - 17517313
Alignment:
Q  163 atgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgt 261  Q
    |||||||||||||||  ||| | || |||||| |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| || | |    
T  17517170 atgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctat 17517269  T
Q  262 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17517270 tgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaaga 17517313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19669013 - 19668910
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||| | || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19669013 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgatgatttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttg 19668914  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  19668913 atga 19668910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40726069 - 40725862
Alignment:
Q  99 ttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 198  Q
    ||||| || ||||||||||||| || | ||||  || |||||| |||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||   ||  |||||||||    
T  40726069 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 40725970  T
Q  199 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    ||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| |||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  40725969 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtc 40725870  T
Q  298 gatgaaga 305  Q
    | ||||||    
T  40725869 gttgaaga 40725862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Original strand, 19660841 - 19660947
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||| ||  ||| ||||| ||||| ||| | || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19660841 gttgttgatttatattcgatatcattatatcaagatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 19660940  T
Q  299 atgaaga 305  Q
     ||||||    
T  19660941 ttgaaga 19660947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 204 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24067214 - 24067113
Alignment:
Q  204 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | ||| | |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |    
T  24067214 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgatta 24067116  T
Q  303 aga 305  Q
    |||    
T  24067115 aga 24067113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314586
Alignment:
Q  217 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 36314586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29448152 - 29448052
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgttttgtatactgcctatgttgttgttg 263  Q
    |||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29448152 tgcattacatgaattacgtatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgttg 29448054  T
Q  264 tt 265  Q
    ||    
T  29448053 tt 29448052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21873453 - 21873277
Alignment:
Q  107 aatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 206  Q
    ||||||||||||||||  | ||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| | || ||  || |||   |||||    
T  21873453 aatctgtgaagctgtt--atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatggttaaga---tgttg 21873359  T
Q  207 acttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    |  ||   |||||||||| | ||||||||| | |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21873358 aaatgagattgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18356432 - 18356364
Alignment:
Q  196 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgtt 265  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18356432 agatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctg-tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 18356364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 265
Target Start/End: Original strand, 20910801 - 20910869
Alignment:
Q  196 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgtt 265  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  20910801 agatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-tttgtatgctgtctatgttgctgttgtt 20910869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  245 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26704160 - 26704080
Alignment:
Q  226 atgtcatgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  26704160 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaaga 26704080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26973893 - 26973813
Alignment:
Q  226 atgtcatgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  26973893 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaaga 26973813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 305
Target Start/End: Original strand, 20806852 - 20806898
Alignment:
Q  259 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20806852 tgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaaga 20806898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 295
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  245 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 77
Target Start/End: Original strand, 26740472 - 26740530
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtag 77  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  26740472 cttgttagggttttgcgatctttgtcgcaagagatgttgtgagttgatccttggggtag 26740530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469822
Alignment:
Q  246 ctgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 23469822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 84
Target Start/End: Original strand, 22120033 - 22120085
Alignment:
Q  32 tgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgag 84  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22120033 tgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttgaaccttgggatagtaatgag 22120085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 74)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Original strand, 16377348 - 16377633
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgt-tgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaag 117  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16377348 cttgttaggattttgctacctttgttgcacgagttttatgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtggag 16377447  T
Q  118 ctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttg 217  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16377448 ctgtttaa-gatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttg 16377546  T
Q  218 atattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377547 atattattatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 16377633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Original strand, 16239796 - 16240081
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16239796 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgcgaagc 16239895  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| || ||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16239896 tgtttaa-gatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttga 16239994  T
Q  219 tattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16239995 tattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaaga 16240081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14038943 - 14038657
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14038943 cttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagc 14038844  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14038843 tgtttaac-atgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttga 14038745  T
Q  219 tattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14038744 tattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 14038657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7894003 - 7893712
Alignment:
Q  11 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  7894003 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcatgagttgccgagagttgaaccttggggtaatattaagacttaacgatgatgttaattataatc 7893904  T
Q  111 tgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||   || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||| | || |||||| ||||| |||||||||    
T  7893903 tgtgaagctgttt-aagatgtgt---tgctgattatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgactt 7893808  T
Q  211 gcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7893807 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaaga 7893712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22636736 - 22636444
Alignment:
Q  11 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 110  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  22636736 cagagtgtcttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagacttaacgaggatgttaattataatc 22636638  T
Q  111 tgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 210  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||    
T  22636637 tgtgaagctgtt--aagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 22636540  T
Q  211 gcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636539 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 22636444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 44053114 - 44052838
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44053114 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aaga 44053016  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  44053015 tgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatg 44052916  T
Q  229 tcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44052915 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaaga 44052838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12903042 - 12902766
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12903042 ttttgcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgttt-aaga 12902944  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  12902943 tgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatg 12902844  T
Q  229 tcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12902843 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 12902766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7089179 - 7088886
Alignment:
Q  11 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 110  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  7089179 cagagtgtcttgttagatttt-gcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaacctttgagtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatc 7089081  T
Q  111 tgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||  || | ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||   || |||| | |||||||| ||| ||    
T  7089080 tgtgaagttgtttaa-gatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaatt 7088982  T
Q  211 gcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088981 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 7088886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 97 - 305
Target Start/End: Original strand, 16270140 - 16270347
Alignment:
Q  97 tgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttga 196  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||| |    
T  16270140 tgttgattataatctgtgaagctgtttaa-gatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaa 16270238  T
Q  197 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  16270239 gatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaact 16270338  T
Q  297 tgatgaaga 305  Q
    |||||||||    
T  16270339 tgatgaaga 16270347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 23374195 - 23374471
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||| ||    
T  23374195 ttttgcaacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaa-ga 23374293  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttga--attatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattatta 226  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||  |||||   || |||||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||    
T  23374294 tctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatt--tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatattta 23374391  T
Q  227 tgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  23374392 tgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaaga 23374471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 131 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798783
Alignment:
Q  131 tgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 230  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  231 atgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 7798783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 99 - 305
Target Start/End: Original strand, 54798669 - 54798866
Alignment:
Q  99 ttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||             ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54798669 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatactt----------attacttgaattatgaatgtatatttgaga 54798758  T
Q  199 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54798759 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 54798858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 305
Target Start/End: Original strand, 44928753 - 44929036
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||   |||   || || ||||| || ||||||||||||| |    
T  44928753 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttgtggtagttatgaatattatatataatattaatgatgatctgtgaagctgat 44928852  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
    | | ||||  || |||||| ||||  |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  44928853 ttatgatgattttatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacatt 44928952  T
Q  223 attatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44928953 attatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 44929036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899900
Alignment:
Q  143 ttatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgt 242  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgt 6899963  T
Q  243 atactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6899962 atactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 6899900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 99 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14280518 - 14280322
Alignment:
Q  99 ttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||             |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14280518 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatactt----------attacttgaattatgaatctatatttgaga 14280429  T
Q  199 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280428 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc-gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14280330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 14053138 - 14053413
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  14053138 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagccgtat-aaga 14053236  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgag-atgttgttgacttgcatttgatattattat 227  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  ||   |||||   | || |||||| ||| ||| | |||||||||||||    
T  14053237 tatgttgttgttgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattacttgaagaatatttgtatgcataagaatgttgatgaattgaaattgatattattat 14053335  T
Q  228 gtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||    
T  14053336 gtcatgctg-tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaaga 14053413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 44102501 - 44102220
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||   |||   || || ||||| || ||||||||||||| |    
T  44102501 ttaggattttgcgatctttgtagcacgagtcgttgagagttgaaccttgggatagttatgaatattatatataatattaatgatgatctgtgaagctgat 44102402  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
    | | ||||  || ||| || ||||  |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  44102401 ttatgatgatttgatgatg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatatt 44102303  T
Q  223 attatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44102302 attatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 44102220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 299
Target Start/End: Original strand, 52243023 - 52243302
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattga-gacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgt 121  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||| || |  || | ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  52243023 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgtaaagagttgaactttggggtagtaatgaagattgtataa-gatattaatgatgatctgtgaagctgt 52243121  T
Q  122 ttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatat 221  Q
    |  ||||||  || |||||| |||| ||||||||||||   || ||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  52243122 tataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatat 52243221  T
Q  222 tattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    | |||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243222 tgttatatcatgaactgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 169 - 297
Target Start/End: Original strand, 8574844 - 8574971
Alignment:
Q  169 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| | ||||||||||    
T  8574844 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatt 8574942  T
Q  269 taactaagctgcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574943 taactaagctgcatgagtcggtctaagtt 8574971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 190 - 305
Target Start/End: Original strand, 52873363 - 52873479
Alignment:
Q  190 tatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 288  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873363 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 52873462  T
Q  289 gtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||    
T  52873463 gtctaagttgatgaaga 52873479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 18215274 - 18215430
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18215274 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18215373  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18215374 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 18215430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 177
Target Start/End: Original strand, 17047909 - 17048055
Alignment:
Q  30 tttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  17047909 tttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagagactaattacaacctgtgaagctgttt-aagat 17048007  T
Q  130 gtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttga 177  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  17048008 gtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 12307 - 12463
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12307 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12406  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12407 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 12463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 15118352 - 15118508
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15118352 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15118451  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15118452 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 15118508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618328
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19618272 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 19618328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 44615450 - 44615294
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-tttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44615450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 44615351  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44615350 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 44615294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 44773087 - 44773243
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44773087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44773186  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44773187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 44773243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 52312672 - 52312516
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52312672 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 52312573  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52312572 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 52312516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Original strand, 1837503 - 1837665
Alignment:
Q  143 ttatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttg 241  Q
    |||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1837503 ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 1837602  T
Q  242 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1837603 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 1837665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515013
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3515069 g-ctgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 3515013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242705
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19242761 g-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 19242705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 50222339 - 50222495
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  50222339 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataat 50222438  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50222439 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 50222495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 136 - 295
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13953
Alignment:
Q  136 atgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 235  Q
    |||||| |||| ||||||||||||   || | |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  13793 atgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgtt 13892  T
Q  236 gttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13893 gttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 305
Target Start/End: Original strand, 18239436 - 18239575
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgt 264  Q
    |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | || || ||||||    
T  18239436 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgctgctgttgt 18239534  T
Q  265 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18239535 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 18239575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6190747 - 6190481
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||| |  ||||| ||||||| |||  |||||||||||  | ||    
T  6190747 ttttgcgacctttgttgcacgagctgtcgagagttgaaccttggcgtagcattaagacttgaatatgatattaattacaattcgtgaagctgtt--atga 6190650  T
Q  129 tgtgttaatgttgat-tatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatg-ttgttgacttgcatttgatattatta 226  Q
      ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||| | | |||| ||| |||||||| |||||  ||| || |||||||| |||    
T  6190649 gatgttaatgttgatgtatgatgtgatctaatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttcgcttaca-ttgatattgtta 6190552  T
Q  227 tgtcatgct-gttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||  ||||| || |||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190551 tgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803421
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
     | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23803365 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 23803421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464024
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 247  Q
    |||||||||||   || ||||||| |||||||||   || ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
     | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51463968 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 51464024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 15355324 - 15355481
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatac 246  Q
    |||||||||||   || ||||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15355324 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15355423  T
Q  247 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15355424 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 15355481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3096928 - 3096781
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3096928 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggataaatacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgttt-aaga 3096830  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaa 178  Q
    ||||||  || ||||||||||| |||| |||||  | |||||||||||||    
T  3096829 tgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgt-ttatgcattacttgaa 3096781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 149 - 300
Target Start/End: Original strand, 14970707 - 14970858
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || || ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  14970707 tgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 14970806  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    | || | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14970807 g-ctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 14970858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17046724 - 17046496
Alignment:
Q  74 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattac 173  Q
    |||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||  | | ||||||    
T  17046724 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataa-gatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtt-tatacattac 17046627  T
Q  174 ttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaac 272  Q
    |||||  |||  ||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |  ||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  17046626 ttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttct--atactacctatgttgctgtttgttatttaac 17046529  T
Q  273 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  17046528 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 17046496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 299
Target Start/End: Original strand, 43198495 - 43198661
Alignment:
Q  136 atgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc- 234  Q
    |||||| |||| ||||||||||||   || | |||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||||      
T  43198495 atgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaa 43198594  T
Q  235 -tgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
     ||||||| ||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198595 ttgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15371467 - 15371211
Alignment:
Q  49 gagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatga 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||| | |  || ||||| || ||||||||||||| || | ||||  || |||||| ||||      
T  15371467 gagttgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattatttacaatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatat 15371369  T
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatac 246  Q
    |||||||||||   || ||| ||| |||||||||   || ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15371368 tgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15371269  T
Q  247 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  15371268 tg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 15371211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15373748 - 15373492
Alignment:
Q  49 gagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatga 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||| | |  || ||||| || ||||||||||||| || | ||||  || |||||| ||||      
T  15373748 gagttgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattatttacaatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatat 15373650  T
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatac 246  Q
    |||||||||||   || ||| ||| |||||||||   || ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15373649 tgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15373550  T
Q  247 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  15373549 tg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 15373492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12611105 - 12610956
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg 248  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||    
T  12611105 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt------tg 12611012  T
Q  249 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
      | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12611011 -ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 12610956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 205 - 305
Target Start/End: Original strand, 39706299 - 39706400
Alignment:
Q  205 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 303  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39706299 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 39706398  T
Q  304 ga 305  Q
    ||    
T  39706399 ga 39706400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Original strand, 12288211 - 12288316
Alignment:
Q  197 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288211 gatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12288310  T
Q  294 agttga 299  Q
    ||||||    
T  12288311 agttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 193 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12774128 - 12774019
Alignment:
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 291  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774128 ttgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 12774030  T
Q  292 taagttgatga 302  Q
    |||||||||||    
T  12774029 taagttgatga 12774019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 15091191 - 15091093
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaag 117  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15091191 cttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagtttctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaag 15091093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16223797 - 16223541
Alignment:
Q  49 gagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatga 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||| | | ||| ||||| || ||||||||||||| || | ||||   | |||||| ||||      
T  16223797 gagttgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattatttacgatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatgtgatgttg-ttatat 16223699  T
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatac 246  Q
    |||||||||||   || ||  ||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16223698 tgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16223599  T
Q  247 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  16223598 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 16223541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 166 - 295
Target Start/End: Original strand, 21815602 - 21815731
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgt 264  Q
    |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  | ||||| ||| ||    
T  21815602 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacag-ttgtgttgctgtcgt 21815700  T
Q  265 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815701 tatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 229 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096302
Alignment:
Q  229 tcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 3096302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 7641192 - 7641338
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg 248  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||            
T  7641192 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-------- 7641283  T
Q  249 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
      | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7641284 --tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 7641338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15367905 - 15367699
Alignment:
Q  99 ttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 198  Q
    ||||| || ||||||||||||| || | ||||  || |||||| ||||  |||||||||||   || ||| ||| |||||||||   || ||| ||||||    
T  15367905 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15367807  T
Q  199 tgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15367806 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15367708  T
Q  297 tgatgaaga 305  Q
     | ||||||    
T  15367707 cgttgaaga 15367699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15402918 - 15402712
Alignment:
Q  99 ttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 198  Q
    ||||| || ||||||||||||| || | ||||  || |||||| ||||  |||||||||||   || ||| ||| |||||||||   || ||| ||||||    
T  15402918 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15402820  T
Q  199 tgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15402819 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15402721  T
Q  297 tgatgaaga 305  Q
     | ||||||    
T  15402720 cgttgaaga 15402712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 204 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15370128 - 15370027
Alignment:
Q  204 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  15370128 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttga 15370030  T
Q  303 aga 305  Q
    |||    
T  15370029 aga 15370027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15551932 - 15551826
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||| || | || ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551932 gttgttgatttaccttcgatattattatatcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15551833  T
Q  299 atgaaga 305  Q
     ||||||    
T  15551832 ttgaaga 15551826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8846460 - 8846368
Alignment:
Q  211 gcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8846460 gcattcgatattgttatctcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatga 8846368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22353999 - 22353852
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt-tgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||| ||||  |  |  ||    
T  22353999 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatct 22353900  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22353899 gcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaag 22353852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 241
Target Start/End: Original strand, 15464760 - 15464978
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| |||||| | |||||| |||| |||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| ||    ||||| ||||| || || |||||||||| |    
T  15464760 ttaggattttgcaatctttgtcgcacaagttgttatgagttgaaccttggagtagtaatgagaattgtatatgatattaatgatgatttgtgaagctgat 15464859  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
      | ||||  || |||| | |||  || |||||||||   || |||| ||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15464860 atatgatgatttgatgtcgtttaaaatttgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 15464959  T
Q  223 attatgtcatgctgttttg 241  Q
     |||| ||||||| |||||    
T  15464960 gttatatcatgctattttg 15464978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20149936 - 20149835
Alignment:
Q  204 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| | ||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  20149936 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-atgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgatta 20149838  T
Q  303 aga 305  Q
    |||    
T  20149837 aga 20149835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 295
Target Start/End: Original strand, 46640453 - 46640558
Alignment:
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 289  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  46640453 ttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 46640552  T
Q  290 tctaag 295  Q
    ||||||    
T  46640553 tctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 295
Target Start/End: Original strand, 53082124 - 53082254
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttgtt- 262  Q
    |||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||| ||||||| ||||     
T  53082124 tgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcttatgttgctgttt 53082221  T
Q  263 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082222 gtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 265
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256230
Alignment:
Q  140 tgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattactt--gaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt 237  Q
    ||||||| |||||||||||| | || ||||||||||  |||||||   || |||||  |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||     
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattacttaagaattatt--tgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg- 43256202  T
Q  238 tttgtatactgcctatgttgttgttgtt 265  Q
    || |||| |||||||||||| |||||||    
T  43256203 ttggtatgctgcctatgttgctgttgtt 43256230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15093955 - 15093911
Alignment:
Q  131 tgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattactt 175  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15093955 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattactt 15093911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 151
Target Start/End: Original strand, 8574784 - 8574836
Alignment:
Q  99 ttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgt 151  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  8574784 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 8574836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17333356 - 17333298
Alignment:
Q  235 tgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    |||||| | ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  17333356 tgttttatgtactgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtcta 17333298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 7798993 - 7798953
Alignment:
Q  17 gtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttga 58  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  7798993 gtcttgttaggtttt-gcgacctttgtttcacgagttgttga 7798953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13569716 - 13569624
Alignment:
Q  107 aatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgt--aatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatg 200  Q
    ||||||||||||||||  | ||  |||||||||||| |||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  13569716 aatctgtgaagctgtt--atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgtttaat-tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatg 13569624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16596751 - 16596686
Alignment:
Q  212 catttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaag 276  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16596751 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15791841 - 15791793
Alignment:
Q  247 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  15791841 tgcctatgttgttgttgtcttttaattaaactacatgagtcggtctaag 15791793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 84
Target Start/End: Original strand, 20157130 - 20157182
Alignment:
Q  32 tgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgag 84  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20157130 tgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttgaaccttgggatagtaatgag 20157182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 24029022 - 24028970
Alignment:
Q  32 tgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgag 84  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24029022 tgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttgaaccttgggatagtaatgag 24028970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44675836 - 44675757
Alignment:
Q  107 aatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatg--taatgtgcattacttgaattatgaatg 187  Q
    ||||||||||||||||  | ||  |||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||    
T  44675836 aatctgtgaagctgtt--atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaat-tgcattacttgagttatgaatg 44675757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 70)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22337418 - 22337124
Alignment:
Q  11 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  22337418 cagagagtcttgttaggtttttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatt 22337319  T
Q  111 tgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 210  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22337318 tgtgaagttgttt-aagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtctt 22337220  T
Q  211 gcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337219 gcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 22337124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23076736 - 23076451
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076736 cttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggattttatgatgatgttaattataatctgtgaagc 23076638  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  23076637 tgttt-aagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattga 23076539  T
Q  219 tattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23076538 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaaga 23076451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23660317 - 23660032
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23660317 cttgttaggtttttgtgacctttattgcacgagttattgagagttgaaccttggggtagtattgagacttattgatgatgttaattataatttgtaaagc 23660218  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23660217 tgtttaa-gatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttga 23660119  T
Q  219 tattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23660118 tattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaaga 23660032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23060805 - 23060522
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23060805 cttgttaggtttt-gcgacctttgtt-cacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagc 23060709  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |  |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23060708 tgtttaa-gatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattga 23060610  T
Q  219 tattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060609 tattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 23060522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Original strand, 22738007 - 22738291
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22738007 cttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagc 22738105  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  22738106 tgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattga 22738204  T
Q  219 tattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22738205 tattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaaga 22738291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Original strand, 22731060 - 22731346
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgggg-tagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaag 117  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22731060 cttgttaggtttt-gcgatctttgttgcacgagctgttgataattgaaccttgggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaag 22731158  T
Q  118 ctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttg 217  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||   || |||||| | |||||| ||| ||||| |||    
T  22731159 ctgtttaa-gatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattg 22731257  T
Q  218 atattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22731258 atattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaaga 22731346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23286146 - 23285874
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23286146 ttttgcgacctttgttgcatgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaagctgttt-aaga 23286048  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  |    || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  23286047 tgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatg 23285948  T
Q  229 tcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    || ||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285947 tc-tg--tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 23285874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 23654222 - 23654498
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23654222 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgttt-aaga 23654320  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  23654321 tgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatg 23654420  T
Q  229 tcatgctgt-tttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23654421 tcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 23654498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Original strand, 37953 - 38226
Alignment:
Q  30 tttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||     
T  37953 tttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctctgaagctgtataa-gac 38051  T
Q  130 gtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgt 229  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||  ||||||  | ||||| || ||| | | | |||||||||||||||    
T  38052 atgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgatgatgaatcgaaattgatattattatgt 38150  T
Q  230 catgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38151 catgctgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 38226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 298650 - 298927
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||    
T  298650 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatatgtgaagctgtataa-ga 298748  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttga--attatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattatta 226  Q
    ||||||  | || ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||  |||||   || |||||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||    
T  298749 tgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatt--tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatattta 298846  T
Q  227 tgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  298847 tgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 298927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20309390 - 20309117
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||    
T  20309390 ttttgcgacccttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaat-aaga 20309292  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    | ||||  |||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||    
T  20309291 tatgttgttgttgattatgatgtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatg 20309193  T
Q  229 tcatgctgttttgtatactgcctatgttg-ttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  20309192 tcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 20309117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 299
Target Start/End: Original strand, 23708448 - 23708725
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||   ||  | ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  23708448 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgatagttgaaccttggggtcgtaatgaagattgtttatgatattaatgatgatctgtgaagctgtt 23708547  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
      ||||||  || |||||| |||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||   || || |||||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  23708548 ataagatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatatt 23708647  T
Q  223 attatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
     |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23708648 gttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga 23708725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22105575 - 22105418
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  22105575 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 22105476  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22105475 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 22105418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215077
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32215021 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 32215077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19672118 - 19671839
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||   ||| | || || ||||| |||||||||||||||| |    
T  19672118 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggg-tagttatgaatattatttataatattaatgataatctgtgaagctgat 19672020  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
      | ||||  || |||||| |||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||| |||||| || ||||||    
T  19672019 ctatgatga-ttgatgttg-ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatt-gagatgttgtttacttgcgttcgatatt 19671923  T
Q  223 attatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  19671922 attatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 19671839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27753860 - 27753730
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  27753860 ttttgcgaccttcgttgcacgagttgtcgagagttgaagcttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaaactgttt-aaga 27753762  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatg 160  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27753761 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 27753730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 295
Target Start/End: Original strand, 32451765 - 32452031
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||||  | |     
T  32451765 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaaccttggggtagcattaagacttgaatatgatattaattacaatttgtgaagctgtt--atgg 32451862  T
Q  129 tgtgttaatgttga-ttatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatg-ttgttgacttgcatttgatattatta 226  Q
      |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  |||||||||||| | | |||| ||| |||||||| |||||| |||||| |||||||| |||    
T  32451863 gatgttaatgttgatttatgatgtgatattatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgca-ttgatattgtta 32451960  T
Q  227 tgtcatgct-gttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||  ||||| || |||||||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451961 tgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18809105 - 18808949
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18809105 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18809006  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18809005 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 18808949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23131024 - 23130868
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23131024 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23130925  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23130924 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 23130868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23133491 - 23133335
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23133491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23133392  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23133391 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 23133335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 23709532 - 23709688
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23709532 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23709631  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23709632 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 23709688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 23712013 - 23712169
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23712013 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23712112  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23712113 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 23712169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26505541 - 26505385
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct-gttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26505541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26505442  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26505441 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 26505385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26508019 - 26507863
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct-gttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26508019 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26507920  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26507919 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 26507863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 34402522 - 34402678
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34402522 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34402621  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34402622 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 34402678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 39682475 - 39682319
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39682475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39682376  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39682375 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 39682319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23135735 - 23135596
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgt 264  Q
    |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||    
T  23135735 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgt 23135637  T
Q  265 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23135636 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 23135596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 149 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24367936 - 24367785
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24367936 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24367837  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367836 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24367785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 146 - 305
Target Start/End: Original strand, 23103348 - 23103507
Alignment:
Q  146 tgatgtgatataatgt--aatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgta 243  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  23103348 tgatgtgatataatgtttaat-tgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt-gta 23103445  T
Q  244 tactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23103446 tactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 23103507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 571559 - 571403
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  571559 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 571460  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  571459 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 571403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6726157 - 6726001
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6726157 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6726058  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6726057 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 6726001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 21155060 - 21155216
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21155060 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21155159  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21155160 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 21155216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 305
Target Start/End: Original strand, 45029871 - 45030010
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgt 264  Q
    |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  | ||||||||||||    
T  45029871 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-tgtgttgttgttgt 45029969  T
Q  265 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45029970 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 45030010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 24898195 - 24898352
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24898195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24898294  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24898295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 24898352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 24900678 - 24900835
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24900678 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24900777  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24900778 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 24900835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 24903155 - 24903312
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24903155 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24903254  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24903255 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 24903312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 24905632 - 24905789
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24905632 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24905731  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24905732 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 24905789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 24908107 - 24908264
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24908107 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24908206  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24908207 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 24908264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 32039498 - 32039654
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32039498 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32039597  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32039598 g-ttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaaga 32039654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 28577261 - 28577105
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  28577261 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 28577162  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28577161 gt-tgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 28577105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 43137461 - 43137305
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  43137461 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 43137362  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
     | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43137361 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 43137305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 24529528 - 24529685
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgta-tatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatac 246  Q
    |||||||||||   || ||||||| |||||||||  ||| | || |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24529528 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 24529627  T
Q  247 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24529628 tga-tgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 24529685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28406103 - 28405988
Alignment:
Q  189 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28406103 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 28406004  T
Q  287 cggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||||    
T  28406003 cggtctaagttgatga 28405988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 25175976 - 25175862
Alignment:
Q  189 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  25175976 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatc 25175877  T
Q  288 ggtctaagttgatga 302  Q
     ||||||||||||||    
T  25175876 tgtctaagttgatga 25175862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 168 - 295
Target Start/End: Original strand, 7707 - 7835
Alignment:
Q  168 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgtta 266  Q
    |||||||||||||||  ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||     
T  7707 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttt 7806  T
Q  267 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
     ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7807 attaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 38967537 - 38967380
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatac 246  Q
    |||||||||||   || ||||||| |||||||||   || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||     
T  38967537 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatat 38967438  T
Q  247 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||  | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38967437 tgt-tgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 38967380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 234 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 8946737 - 8946666
Alignment:
Q  234 ctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8946737 ctgttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 8946666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 295
Target Start/End: Original strand, 20520022 - 20520295
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattg-agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgt 121  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||||| | || ||  |  || ||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  20520022 ttagggttttgcgatctttgttgcacgagatgttatgagtttatccttggggtaggaatggaggttgtat-atgatattaatgataatctgtgaagttgt 20520120  T
Q  122 ttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatat 221  Q
    |  ||||||  || |||| | | || |||||||||| |   || |||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20520121 tataagatgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatat 20520218  T
Q  222 tattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    | |||| |||||  ||||||| | |||||| ||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520219 tgttatatcatgaactgttttatgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 217 - 305
Target Start/End: Original strand, 23071972 - 23072061
Alignment:
Q  217 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23071972 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaaga 23072061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25616337 - 25616194
Alignment:
Q  163 atgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgt 261  Q
    |||||||||||||||  ||| | || |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| || | |    
T  25616337 atgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctat 25616238  T
Q  262 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25616237 tgtaatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaaga 25616194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 295
Target Start/End: Original strand, 22413035 - 22413240
Alignment:
Q  93 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataa-tgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtata 191  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||  ||||||  || |||||| | || ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||  ||| ||     
T  22413035 atgatattaatgttaatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgta-tatgcattacatgaattatttatg-atg 22413132  T
Q  192 tttgagatgttgttgacttgcatttgatat--tattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagt 286  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||  | |||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||    
T  22413133 tt-gagatgttgttgatttgcatttgatatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagt 22413231  T
Q  287 cggtctaag 295  Q
    |||||||||    
T  22413232 cggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23207401 - 23207296
Alignment:
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 289  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  23207401 ttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 23207302  T
Q  290 tctaag 295  Q
    ||||||    
T  23207301 tctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 197 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7679702 - 7679594
Alignment:
Q  197 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7679702 gatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 7679604  T
Q  296 ttgatgaaga 305  Q
    ||||| ||||    
T  7679603 ttgattaaga 7679594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 194 - 302
Target Start/End: Original strand, 22134208 - 22134315
Alignment:
Q  194 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134208 tgagatgttattga-ttgcattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22134306  T
Q  294 agttgatga 302  Q
     | ||||||    
T  22134307 tgatgatga 22134315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23791398 - 23791292
Alignment:
Q  192 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcg 288  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||||    
T  23791398 tttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcg 23791299  T
Q  289 gtctaag 295  Q
    |||||||    
T  23791298 gtctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 251 - 305
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040301
Alignment:
Q  251 tatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 23040301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 299
Target Start/End: Original strand, 18786907 - 18787009
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||  ||| |||| ||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786907 gttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactggtttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 18787006  T
Q  297 tga 299  Q
    |||    
T  18787007 tga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 287
Target Start/End: Original strand, 22799063 - 22799220
Alignment:
Q  131 tgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 230  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |  ||| | || ||  || ||||||||||||  || | |||||||||| | |||    
T  22799063 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgccttacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtc 22799162  T
Q  231 atgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||| |||| ||||   ||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22799163 atgatgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 22799220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643106
Alignment:
Q  253 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24643054 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 24643106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23004873 - 23004767
Alignment:
Q  192 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcg 288  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  || |||| | |||| ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||    
T  23004873 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcctgaactattttatgtactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 23004774  T
Q  289 gtctaag 295  Q
    || ||||    
T  23004773 gtttaag 23004767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 295
Target Start/End: Original strand, 24697603 - 24697709
Alignment:
Q  192 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcg 288  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||  | ||||||||| ||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||    
T  24697603 tttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgtttgatgtactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcg 24697702  T
Q  289 gtctaag 295  Q
    |||||||    
T  24697703 gtctaag 24697709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 203
Target Start/End: Original strand, 22758652 - 22758725
Alignment:
Q  131 tgttaatgttgattatgatgtgatataatg--taatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  22758652 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaat-tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 22758725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 206
Target Start/End: Original strand, 22740897 - 22740973
Alignment:
Q  131 tgttaatgttgattatgatgtgatataatg--taatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||    
T  22740897 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaat-tgcattacttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttg 22740973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 276
Target Start/End: Original strand, 23019643 - 23019789
Alignment:
Q  131 tgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 230  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |  ||| | || ||  || ||||||||||||  || | |||||||||| | |||    
T  23019643 tgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtc 23019742  T
Q  231 atgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaag 276  Q
    ||| |||| ||||   ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  23019743 atgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaag 23019789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23287442 - 23287384
Alignment:
Q  235 tgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23287442 tgttttatgtactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 226
Target Start/End: Original strand, 24642856 - 24642933
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattatta 226  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24642856 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25109037 - 25108906
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttgtt- 262  Q
    |||||||| ||||||||  ||| || |||||||| ||||||| ||   ||||||||| |||| |||||  || |||| | |||||||||||||||||||     
T  25109037 tgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatattgttgattttgctttgatattgttatatcatgaactattttatgtactgcctatgttgttgttt 25108939  T
Q  263 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25108938 gtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  245 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23038217 - 23038048
Alignment:
Q  131 tgttaatgttgattatgatgtgatataatgt--aatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatat-----ta 223  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |   ||  |||||||||     ||    
T  23038217 tgttagtgttaaatatgatgtgatataatgtttaat-tgaattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttata 23038119  T
Q  224 ttatgtcatgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    | ||||||| ||||| |||||  ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23038118 tgatgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtccgtcta 23038048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 251 - 287
Target Start/End: Original strand, 21916156 - 21916192
Alignment:
Q  251 tatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21916156 tatgttgtttttgttatttaactaagttgcatgagtc 21916192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23185 - 22892
Alignment:
Q  11 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23185 cagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttatttataatc 23086  T
Q  111 tgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||    
T  23085 tgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactt 22987  T
Q  211 gcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22986 gcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 22892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 23 - 305
Target Start/End: Original strand, 17045 - 17329
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17045 ttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttaaaccttggggtagtattgagacttaatcatgatgttaattataatctgtaaagctgtt 17144  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17145 taa-gacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 17243  T
Q  223 attatgtcatgctg---ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17244 attatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 17329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 295
Target Start/End: Original strand, 79159 - 79430
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||   ||    || || ||||| || ||| ||||||||| |    
T  79159 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcattgagagttgaaccttggggtagttatgaatattgtatataatattaatgatgatcagtgaagctgat 79258  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
    | | ||||  || |||||| ||||  ||||||||| |   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  79259 ttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaatt 79357  T
Q  223 attatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79358 attatgtcatgctgtttttatatactgtc-gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 91)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18438837 - 18438543
Alignment:
Q  11 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18438837 cagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagtgttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaactataatc 18438738  T
Q  111 tgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||    
T  18438737 tgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgactt 18438639  T
Q  211 gcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18438638 gcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaaga 18438543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Original strand, 25476211 - 25476497
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25476211 cttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgaggatgttaattacaatctgtgaagc 25476310  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25476311 tgtttaa-gatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttga 25476409  T
Q  219 tattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25476410 tattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaaga 25476497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14973149 - 14972863
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14973149 cttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagc 14973050  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14973049 tgtttaa-gatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttga 14972951  T
Q  219 tattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972950 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 14972863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Original strand, 40213547 - 40213832
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40213547 cttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtaaagc 40213646  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40213647 tgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttga 40213745  T
Q  219 tattattatgtcatgctgttt-tgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  40213746 tattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaaga 40213832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Original strand, 11424581 - 11424871
Alignment:
Q  11 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11424581 cagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgagacttaatgttgatgttaattttaatc 11424680  T
Q  111 tgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||   |||||| ||    
T  11424681 tgtgaagctgttt-aagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga---tgttgattt 11424776  T
Q  211 gcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11424777 gctattgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 11424871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 301
Target Start/End: Original strand, 14576659 - 14576940
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14576659 cttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagatttaatgatgatgttaattataatctgtgaagt 14576758  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14576759 tgtttaa-gatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattga 14576857  T
Q  219 tattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 301  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14576858 tattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgatg 14576940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26687189 - 26686896
Alignment:
Q  11 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 110  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26687189 cagagtgtcttgttaggtttta-cgacctttgttgcacgaatcgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataatc 26687091  T
Q  111 tgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  | |||||| ||||| |||||||||    
T  26687090 tgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgactt 26686992  T
Q  211 gcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26686991 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaaga 26686896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 43841234 - 43840941
Alignment:
Q  11 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 110  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  43841234 cagagtgtcttgttaggtttt-gcgacctttgttacacgagttgttgagagtttgactttggggtagtattgggacttaacgaggatgttaattataatc 43841136  T
Q  111 tgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||| ||||| |||||||||    
T  43841135 tgtgaagctgtttaa-gatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgactt 43841037  T
Q  211 gcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43841036 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaaga 43840941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14572883 - 14572602
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  14572883 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagt 14572784  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||  | | ||||| ||||| ||| | || |||||| ||||||||||||||  || ||||    
T  14572783 tgtttaa-gatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattga 14572685  T
Q  219 tattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572684 tattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 14572602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 23 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 42386702 - 42386428
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42386702 ttaggattttgcgaactttgtcgcacgagttgttgtgagttgaaccttggggtagtattgggacttgtttatgatgttaatgataatctgtgaagctgtt 42386603  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
    | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42386602 ttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 42386503  T
Q  223 attatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42386502 gttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 305
Target Start/End: Original strand, 23083186 - 23083473
Alignment:
Q  17 gtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaa 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23083186 gtcttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttcagagttgaaccttgaggtagtattaagacttagtgatgatgttaattacaatctgtgaa 23083284  T
Q  117 gctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcattt 216  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | || |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  23083285 gctgttt-aagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaatt 23083383  T
Q  217 gatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083384 gatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 23083473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13442559 - 13442283
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13442559 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatgacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aaga 13442461  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  13442460 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatg 13442361  T
Q  229 tcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442360 tcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 13442283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17488141 - 17487865
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17488141 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaatctgttt-aaga 17488043  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  17488042 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatg 17487943  T
Q  229 tcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487942 tcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 17487865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17499623 - 17499347
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  17499623 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaatctgttt-aaga 17499525  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  17499524 tgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatg 17499425  T
Q  229 tcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499424 tcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 17499347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 20698272 - 20698547
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  20698272 ttttgcgacctttgtggcacgagttgtcgagagttgaacctttggatagaattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-ttcaaga 20698370  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  ||   || |||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||||| |    
T  20698371 tgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacg 20698469  T
Q  229 tcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698470 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 20698547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 99 - 305
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153320
Alignment:
Q  99 ttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||| | || |||||| |||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaa-gatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaaga 24153213  T
Q  199 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153214 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  299 atgaaga 305  Q
    || ||||    
T  24153314 attaaga 24153320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12399494 - 12399218
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |  || | |||| |||||| ||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  12399494 ttttccgacctttgttgcacgagttgttggggattaagcctttgggtagcattaagacataatgaagaggttaactataatctgtgaagctatttaa-ga 12399396  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttga--attatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattatta 226  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||  |||||   || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12399395 tgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatt--tgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattatta 12399298  T
Q  227 tgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12399297 tgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 12399218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 169 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 36166739 - 36166604
Alignment:
Q  169 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||    
T  36166739 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatt 36166641  T
Q  269 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36166640 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 36166604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 169 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21618590 - 21618460
Alignment:
Q  169 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||||||||||    
T  21618590 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatt 21618492  T
Q  269 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618491 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 30030124 - 30029855
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  30030124 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgatgatgtttaatataatatgtgaagctgttt-aaga 30030026  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    ||| || |  |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | | | || |||||| ||| |||| ||| |||||  ||||||| |||||    
T  30030025 tgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatatttaagacgttg-tgaattgcaaatgatattcttatg 30029927  T
Q  229 tcatgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||| |||||  ||| ||||| || | |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30029926 tcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 30029855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 295
Target Start/End: Original strand, 52523557 - 52523831
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattga-gacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgt 121  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| || |  || | ||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  52523557 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcattgagagttgaactttggggtagtaatgaagattgtataa-gatattaatgatgatctgagaagctgt 52523655  T
Q  122 ttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatat 221  Q
    |  ||||||  || |||||| |||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  52523656 tataagatga-ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatat 52523754  T
Q  222 tattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    | |||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523755 tgttatatcatgaactgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 23274979 - 23274705
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||   ||||| || || ||||| || |||||||||||||      
T  23274979 ttaggtttttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgagccttgggatagttatgaatattaattataatattaatgatgatctgtgaagctgaa 23274880  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
    | | ||||  || |||||| |||| ||||||| ||||   || | | |||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  23274879 ttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatatt 23274780  T
Q  223 attatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23274779 attatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672632
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 247  Q
    |||||||||||   || ||||||| |||||||||   || ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17672688 gc-tatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 17672632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 29172583 - 29172739
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29172583 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29172682  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29172683 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 29172739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 9707607 - 9707763
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9707607 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 9707706  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9707707 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 9707763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17463340 - 17463184
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17463340 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17463241  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17463240 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 17463184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 305
Target Start/End: Original strand, 24340578 - 24340835
Alignment:
Q  49 gagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatga 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||| | |  || ||||| || ||||||||||||| || | ||||  || |||||| |||| |    
T  24340578 gagttgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattatttacaatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataa 24340677  T
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg 248  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||| || ||||||    
T  24340678 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgtgcatactg 24340777  T
Q  249 cctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  24340778 catatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 24340835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 34159488 - 34159332
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34159488 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34159389  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34159388 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 34159332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 45606907 - 45607063
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45606907 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 45607006  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45607007 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 45607063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 295
Target Start/End: Original strand, 53070528 - 53070799
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   ||    || || ||||| || || |||||||||| |    
T  53070528 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattgtatataatattaatgatgatttgtgaagctgat 53070627  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
    | | ||||  || |||||| |||   |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53070628 ttatgatgatttgatgttg-ttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 53070726  T
Q  223 attatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||| || || ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070727 attatgtcttgttgtttttgtatactg-ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 55476653 - 55476497
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55476653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 55476554  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55476553 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 55476497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 305
Target Start/End: Original strand, 28848628 - 28848767
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgt 264  Q
    |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||    
T  28848628 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgt 28848726  T
Q  265 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28848727 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 28848767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 149 - 300
Target Start/End: Original strand, 38961891 - 38962042
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38961891 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 38961990  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961991 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38962042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 7781347 - 7781503
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7781347 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7781446  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7781447 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 7781503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 8899256 - 8899100
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8899256 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8899157  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8899156 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaaga 8899100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567566
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12567622 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 12567566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544031
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13544087 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 13544031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 16454281 - 16454437
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16454281 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16454380  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16454381 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaaga 16454437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 41124049 - 41123896
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41124049 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41123950  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41123949 g----ttgtgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 41123896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 13151790 - 13151947
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13151790 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13151889  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13151890 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 13151947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 13154255 - 13154412
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13154255 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13154354  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13154355 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 13154412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 193 - 305
Target Start/End: Original strand, 6469178 - 6469290
Alignment:
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 291  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469178 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 6469276  T
Q  292 taagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||| ||||    
T  6469277 taagttgattaaga 6469290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 10247723 - 10247879
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10247723 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 10247822  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10247823 g-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaaga 10247879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 16282811 - 16282967
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16282811 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16282910  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16282911 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 16282967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242833
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
     | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242884 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 50242833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 198 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500948
Alignment:
Q  198 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 55500957  T
Q  297 tgatgaaga 305  Q
    |||| ||||    
T  55500956 tgattaaga 55500948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16796831 - 16796685
Alignment:
Q  30 tttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagat 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  16796831 tttgcgacctttgttgcacgaattgttaagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgttt-aagat 16796733  T
Q  130 gtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttga 177  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16796732 gtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 17446655 - 17446810
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||| ||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17446655 tgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17446754  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17446755 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaaga 17446810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 168 - 295
Target Start/End: Original strand, 43550497 - 43550625
Alignment:
Q  168 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgtta 266  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||| |||  |||    
T  43550497 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcatta 43550596  T
Q  267 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550597 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 168 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16097474 - 16097340
Alignment:
Q  168 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gtta 266  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | ||| || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  16097474 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgtta 16097376  T
Q  267 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097375 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 16097340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 193 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15977633 - 15977521
Alignment:
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 291  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977633 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 15977535  T
Q  292 taagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||| ||||    
T  15977534 taagttgattaaga 15977521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15471047 - 15470939
Alignment:
Q  192 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggt 290  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471047 tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggt 15470948  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||||||||    
T  15470947 ctaagttga 15470939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16103957 - 16103792
Alignment:
Q  136 atgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 235  Q
    |||||| |||| |||| ||||||| | || | |||||  |||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |    
T  16103957 atgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttg-atatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgat 16103860  T
Q  236 gttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103859 gatttgcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 16103792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 27165391 - 27165256
Alignment:
Q  171 tacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttattt 269  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||    
T  27165391 tacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgttttgcatactgtctatattgctgtttgttattt 27165292  T
Q  270 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27165291 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 27165256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 204 - 305
Target Start/End: Original strand, 12119780 - 12119881
Alignment:
Q  204 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12119780 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 12119878  T
Q  303 aga 305  Q
    |||    
T  12119879 aga 12119881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 204 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15412536 - 15412435
Alignment:
Q  204 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15412536 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 15412438  T
Q  303 aga 305  Q
    |||    
T  15412437 aga 15412435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 193 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 32307798 - 32307689
Alignment:
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 291  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307798 ttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 32307700  T
Q  292 taagttgatga 302  Q
    |||||||||||    
T  32307699 taagttgatga 32307689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 2051029 - 2051260
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||   ||  | ||||| ||||| || || |||||||||| |    
T  2051029 ttaggattttgcgatctttgtcgcatgagttgttgagagttgaacattgaggtcgtaatgaagattgtttatgatattaatgatgatttgtgaagctgct 2051128  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
      ||||||  || |||||| |||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2051129 ataagatga-ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 2051227  T
Q  223 attatgtcatg--ctgttttgtatactgcctat 253  Q
     |||| |||||  |||||||| |||||||||||    
T  2051228 gttatatcatgaactgttttgcatactgcctat 2051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 305
Target Start/End: Original strand, 53301527 - 53301663
Alignment:
Q  171 tacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgt-tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatt 268  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  53301527 tacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatt 53301626  T
Q  269 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  53301627 taactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaaga 53301663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 204 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 8499625 - 8499524
Alignment:
Q  204 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8499625 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 8499527  T
Q  303 aga 305  Q
    |||    
T  8499526 aga 8499524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Original strand, 13210333 - 13210439
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210333 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13210432  T
Q  299 atgaaga 305  Q
     ||||||    
T  13210433 ttgaaga 13210439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 189 - 302
Target Start/End: Original strand, 12174257 - 12174368
Alignment:
Q  189 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||| |||||||   ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12174257 atatttgagttgttgtt---ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 12174353  T
Q  288 ggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||    
T  12174354 ggtctaagttgatga 12174368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10557105 - 10556991
Alignment:
Q  192 tttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 289  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557105 tttgagatgttgattggcttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 10557007  T
Q  290 tctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||| ||||    
T  10557006 tctaagttgattaaga 10556991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 305
Target Start/End: Original strand, 37642170 - 37642377
Alignment:
Q  99 ttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 198  Q
    ||||| || ||||||||||||| || | ||||  || |||||| |||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||   ||  |||||||||    
T  37642170 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 37642269  T
Q  199 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    ||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  37642270 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtc 37642369  T
Q  298 gatgaaga 305  Q
    | ||||||    
T  37642370 gttgaaga 37642377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 197 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14234605 - 14234496
Alignment:
Q  197 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14234605 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaag 14234506  T
Q  296 ttgatgaaga 305  Q
    ||||| ||||    
T  14234505 ttgattaaga 14234496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 43926083 - 43925977
Alignment:
Q  192 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcg 288  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||||||| | |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||    
T  43926083 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 43925984  T
Q  289 gtctaag 295  Q
    |||||||    
T  43925983 gtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 46822417 - 46822274
Alignment:
Q  163 atgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt-tgtatactgcctatgttgttgt 261  Q
    |||||||||||||||  ||| | || |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||| || | |    
T  46822417 atgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctat 46822318  T
Q  262 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  46822317 tgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaaga 46822274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 295
Target Start/End: Original strand, 37251165 - 37251270
Alignment:
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 289  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  37251165 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcgg 37251264  T
Q  290 tctaag 295  Q
    ||||||    
T  37251265 tctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494815
Alignment:
Q  212 catttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaaga 44494815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 209 - 302
Target Start/End: Original strand, 49668091 - 49668185
Alignment:
Q  209 ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49668091 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatga 49668185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14179648 - 14179570
Alignment:
Q  98 gttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttga 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  14179648 gttaattataatctgtgaagctgtttaa-gatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 213 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737242
Alignment:
Q  213 atttgatattattatgtcatgctgtttt----gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |    ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 17737242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 9513026 - 9512932
Alignment:
Q  209 ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9513026 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatga 9512932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 9521001 - 9520907
Alignment:
Q  209 ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9521001 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatga 9520907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 295
Target Start/End: Original strand, 22110349 - 22110454
Alignment:
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 289  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  22110349 ttgagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 22110448  T
Q  290 tctaag 295  Q
    ||||||    
T  22110449 tctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 302
Target Start/End: Original strand, 1644674 - 1644782
Alignment:
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 292  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||| |||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  1644674 ttgagatattgttga-ttgtattcgatattgttatataatgatgatttgcatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagcaacataagttggtct 1644772  T
Q  293 aagttgatga 302  Q
    ||||||||||    
T  1644773 aagttgatga 1644782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12511209 - 12511066
Alignment:
Q  163 atgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt-tgtatactgcctatgttgttgt 261  Q
    |||||||||||||||  ||| | || |||||  |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||| || | |    
T  12511209 atgtgcattacttgagatattattgaatattgaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctat 12511110  T
Q  262 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  12511109 tgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaaga 12511066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 305
Target Start/End: Original strand, 22147431 - 22147637
Alignment:
Q  99 ttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 198  Q
    ||||| || ||||||||||||| || | ||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||   ||  |||||||||    
T  22147431 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattta-tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 22147529  T
Q  199 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    ||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| |||| || |  |||  |||||||||||||||| |||||| ||||     
T  22147530 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagtc 22147629  T
Q  298 gatgaaga 305  Q
    | ||||||    
T  22147630 gttgaaga 22147637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 305
Target Start/End: Original strand, 45577948 - 45577994
Alignment:
Q  259 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45577948 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 45577994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12378039 - 12377940
Alignment:
Q  199 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  || |||| |||||||||||||||| ||||  | | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12378039 tgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 28194743 - 28194699
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28194743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 28194699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 295
Target Start/End: Original strand, 606324 - 606428
Alignment:
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||  ||| ||| | | |||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  606324 ttgagatgttgttgaattgcatt-gatattgttatatcatgaactgatttatgtgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 606422  T
Q  290 tctaag 295  Q
    | ||||    
T  606423 tataag 606428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 12340027 - 12339985
Alignment:
Q  38 ctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtat 80  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12340027 ctttgtcgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtat 12339985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919350
Alignment:
Q  244 tactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21618650 - 21618594
Alignment:
Q  99 ttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgata 155  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  21618650 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgtcata 21618594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 36166799 - 36166747
Alignment:
Q  99 ttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgt 151  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  36166799 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 36166747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 203
Target Start/End: Original strand, 15877984 - 15878057
Alignment:
Q  131 tgttaatgttgattatgatgtgatataatg--taatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg 203  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  15877984 tgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattt-cattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 15878057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 75
Target Start/End: Original strand, 17248122 - 17248168
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggt 75  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  17248122 ttttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttaaaccttggggt 17248168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 287
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077571
Alignment:
Q  246 ctgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23077530 ctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtc 23077571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23408636 - 23408544
Alignment:
Q  107 aatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatg--taatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatg 200  Q
    ||||||||||||||||   ||||||  || |||||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  23408636 aatctgtgaagctgttatgagatgt--tagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaat-tacattacttgaattatgaatgaatgattgagatg 23408544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 84
Target Start/End: Original strand, 4588628 - 4588680
Alignment:
Q  32 tgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgag 84  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4588628 tgcgagctttgtcgcacgagttgttatgagttgaaccttgggatagtaatgag 4588680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Original strand, 25891 - 26177
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25891 cttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagc 25990  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||    
T  25991 tgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttga 26089  T
Q  219 tattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 26177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 169 - 305
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44819
Alignment:
Q  169 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttat 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttat 44781  T
Q  268 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  44782 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaaga 44819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 190
Target Start/End: Original strand, 33352 - 33491
Alignment:
Q  50 agttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  33352 agttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagctgttt-aagatgcgttgatgttgattatgat 33450  T
Q  150 gtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtat 190  Q
    |||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||    
T  33451 gtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtat 33491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 77)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Original strand, 3564190 - 3564476
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  3564190 cttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagt 3564289  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  3564290 tgtttaa-gatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttga 3564388  T
Q  219 tattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564389 tattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 3564476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 38227775 - 38227490
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  38227775 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaaga 38227676  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    | ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38227675 tatttaa-gatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttga 38227577  T
Q  219 tattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38227576 tattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaaga 38227490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12699126 - 12698840
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12699126 cttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgatagttgaaccttggggtagtattaagagttaatgaggatgttaattataatctgtgaagc 12699028  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  12699027 tgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattga 12698929  T
Q  219 tattattatgtcatgc--tgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698928 tattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 12698840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 9509474 - 9509198
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9509474 ttttgcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgttt-aaga 9509376  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  9509375 tgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatg 9509276  T
Q  229 tcatgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509275 tcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 9509198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 299
Target Start/End: Original strand, 15143863 - 15144143
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  15143863 cttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagttgaacctcggggtagtactaagacttaatgatgatgtttaatataatctgtcaagc 15143962  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15143963 tgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatatgatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttga 15144062  T
Q  219 tattattatgtcatgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||| || || ||||||| ||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144063 tattatgatatcttgctgttattgcatactg-agatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 99 - 305
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456524
Alignment:
Q  99 ttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||| |||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaa-gatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 18456417  T
Q  199 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456418 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  299 atgaaga 305  Q
    || ||||    
T  18456518 attaaga 18456524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26212281 - 26212005
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26212281 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaa-ga 26212183  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttga--attatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattatta 226  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||  |||||   || |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26212182 tgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatt--tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattatta 26212085  T
Q  227 tgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  26212084 tgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgttgaaga 26212005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 299
Target Start/End: Original strand, 2279948 - 2280225
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   ||| | ||||| | ||| || |||||||||||||||    
T  2279948 ttaggattttgcgatctttgtcacacgagttgttgagagttgaaccttggggtcgtaatgaagattatttatgatatcaatgatgatctgtgaagctgtt 2280047  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
      ||||||  || |||||| |||| |||||||||||| | || || |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2280048 ataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 2280147  T
Q  223 attatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2280148 attatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 2280225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10589323 - 10589055
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  10589323 ttttgcgaccttttttgcacgagttgtctagagttggacctttgggtaggattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctattt-aaga 10589225  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||  ||   || | |||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  10589224 tgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattgcttgaagaatatttgaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatg 10589126  T
Q  229 tcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10589125 tcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 10589055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 16386083 - 16386360
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  16386083 ttttgcgacctttgttgcatgagttgtccagagttgaacctttgggtaacattaagacttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgttt-aaga 16386181  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||    ||  || |||||| |||||||| |||  | || |||||||  |||||    
T  16386182 tgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttgaatatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatg 16386281  T
Q  229 tcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16386282 tcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 16386360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 99 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 48273594 - 48273398
Alignment:
Q  99 ttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||             ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48273594 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatactt----------attacttgaattatgaatgtatatt-gaga 48273506  T
Q  199 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48273505 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagtt 48273406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40443674 - 40443400
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  40443674 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtat-aaga 40443576  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    | |||   |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  40443575 tatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatg 40443477  T
Q  229 tcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  40443476 tcatgctg-tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaaga 40443400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 27847669 - 27847942
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||  | ||||    
T  27847669 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataatctgtgaagctgaat-aaga 27847767  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    | ||||  ||||||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||  |||  ||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||    
T  27847768 tatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgt-ttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatg 27847866  T
Q  229 tcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||| |||  ||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  27847867 tcatactg--ttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaaga 27847942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 149 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13647491 - 13647344
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13647491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 13647392  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647391 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 305
Target Start/End: Original strand, 17061790 - 17062071
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||   |||   || || ||||| || ||||||||||||| |    
T  17061790 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccatggggtagttatgaatattacatataatattaataatgatctgtgaagctgat 17061889  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
    | | ||||  || |||||| ||||  |||||||||||   || |||||||||||||||||   |  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17061890 ttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatatt 17061988  T
Q  223 attatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17061989 attatgtcatgctattttgtatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 17062071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24275316 - 24275177
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgt 264  Q
    |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||    
T  24275316 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgt 24275218  T
Q  265 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24275217 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 24275177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 456483 - 456327
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  456483 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 456384  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  456383 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 456327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 11393287 - 11393443
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11393287 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11393386  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11393387 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 11393443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11972658 - 11972502
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11972658 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11972559  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11972558 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 11972502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 14949122 - 14949278
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14949122 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14949221  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14949222 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 14949278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 15376713 - 15376869
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15376713 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15376812  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15376813 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 15376869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16232682 - 16232526
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16232682 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16232583  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16232582 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 16232526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18640434 - 18640278
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18640434 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18640335  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18640334 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 18640278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 20385123 - 20385279
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20385123 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20385222  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20385223 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 20385279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 21189595 - 21189751
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21189595 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21189694  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21189695 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 21189751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 32125653 - 32125497
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32125653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32125554  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32125553 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 32125497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 41523079 - 41522923
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41523079 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41522980  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41522979 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 41522923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 41525541 - 41525385
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41525541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41525442  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41525441 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 41525385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 44116796 - 44116515
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||    ||   || || ||||| || || |||||| ||| |    
T  44116796 ttaggattttgcgatctttattgcacgagtcgttgagggttgaaccttggggtagttatgaataatatatataatattaatgatgatatgtgaaactgat 44116697  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
    | | ||||  || |||||| ||||  |||||||||||   || |||||| ||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44116696 ttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 44116598  T
Q  223 attatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44116597 attatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 44116515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 169 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16410201 - 16410065
Alignment:
Q  169 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttat 267  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||||||    
T  16410201 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttat 16410103  T
Q  268 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16410102 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 16410065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18430874 - 18430718
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  18430874 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 18430775  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18430774 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 18430718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24702400 - 24702244
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24702400 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 24702301  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24702300 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 24702244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 27217022 - 27216866
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27217022 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27216923  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27216922 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaga 27216866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16213852 - 16213690
Alignment:
Q  143 ttatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-g 241  Q
    ||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  16213852 ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16213753  T
Q  242 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16213752 tatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 16213690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 38898376 - 38898533
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttg-tatac 246  Q
    |||||||||||   || ||||||| |||||||||   || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  38898376 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatac 38898475  T
Q  247 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  38898476 tgc-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaaga 38898533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 3386495 - 3386339
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || || ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3386495 tgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3386396  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
       | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3386395 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 3386339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24704847 - 24704694
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg 248  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  24704847 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtt--tttgtatactg 24704750  T
Q  249 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
      | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24704749 t-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 24704694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 193 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 67867 - 67754
Alignment:
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 291  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  67867 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 67768  T
Q  292 taagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||| ||||    
T  67767 taagttgattaaga 67754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 193 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13831491 - 13831379
Alignment:
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 291  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13831491 ttgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 13831393  T
Q  292 taagttgatgaaga 305  Q
    ||| ||||| ||||    
T  13831392 taaattgattaaga 13831379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22073037 - 22072922
Alignment:
Q  192 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22073037 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcag 22072938  T
Q  290 tctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||| ||||    
T  22072937 tctaagttgattaaga 22072922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Original strand, 12255621 - 12255892
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattga-gacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgt 121  Q
    ||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| || |  || || || ||||| || |||| ||||| |||    
T  12255621 ttaggattttgcgatctttgtcacacgagttgttgagagttgaattttggggtagtaatgaagattgtataat-atattaatgatgatctatgaagttgt 12255719  T
Q  122 ttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatat 221  Q
    |  ||||||  || |||||| |||| ||||||||||||   || || ||||||||||||||  ||| || ||||||||||||| || || ||||||||||    
T  12255720 tataagatga-ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatat 12255818  T
Q  222 tattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 292  Q
    | |||| |||||   || |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255819 tgttatatcatgaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 204 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13869453 - 13869352
Alignment:
Q  204 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13869453 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 13869355  T
Q  303 aga 305  Q
    |||    
T  13869354 aga 13869352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18005772 - 18005658
Alignment:
Q  189 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18005772 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttccatactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 18005673  T
Q  288 ggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||    
T  18005672 ggtctaagttgatga 18005658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 295
Target Start/End: Original strand, 12756546 - 12756817
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   ||    || || ||||| || |||||||| |||| |    
T  12756546 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattgtatataatattaatgatgatctgtgatgctgat 12756645  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
    | | ||||  || |||||| ||||  |||||||||||   || ||||||||||||||| |   || ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12756646 ttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatatt 12756744  T
Q  223 attatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12756745 attatgtcatgttgtttttgtatattg-ttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 305
Target Start/End: Original strand, 19486599 - 19486856
Alignment:
Q  49 gagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatga 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||   ||||| |  || ||||| || ||||||||||||| || | ||||  || |||||| |||| |    
T  19486599 gagttgttgagagttgaaccttagggtagttatgaatattaattaaaatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataa 19486698  T
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg 248  Q
    |||||||||||   || ||||| |||||||||||   ||  |||||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  19486699 tgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactg 19486798  T
Q  249 cctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  19486799 cctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaaga 19486856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 202 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 44014291 - 44014190
Alignment:
Q  202 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014291 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44014192  T
Q  301 ga 302  Q
    ||    
T  44014191 ga 44014190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Original strand, 16219719 - 16219823
Alignment:
Q  196 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 294  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16219719 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 16219818  T
Q  295 gttga 299  Q
    |||||    
T  16219819 gttga 16219823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 299
Target Start/End: Original strand, 1867895 - 1868101
Alignment:
Q  93 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatat 192  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| ||||  || |||||| | || |||||||||| |   || |||||||| ||||||||  ||| || |    
T  1867895 atgatattaatgatgatctgtgaagctttttaa-gatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgt 1867992  T
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 289  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  1867993 ttgagatgttgttcatttgcatt-gatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcgg 1868091  T
Q  290 tctaagttga 299  Q
    ||||||||||    
T  1868092 tctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 291
Target Start/End: Original strand, 15008398 - 15008597
Alignment:
Q  93 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatat 192  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||  || |||||| | || |||||||||| |   || |||||||||||||||||  ||| || |    
T  15008398 atgatattaatgataatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgt 15008496  T
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 289  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15008497 ttgaggtgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 15008595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16495517 - 16495411
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16495517 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 16495418  T
Q  299 atgaaga 305  Q
     ||||||    
T  16495417 ttgaaga 16495411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 34200901 - 34200795
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200901 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 34200802  T
Q  299 atgaaga 305  Q
     ||||||    
T  34200801 ttgaaga 34200795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 197 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 47831925 - 47831816
Alignment:
Q  197 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || | || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831925 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatatgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 47831826  T
Q  296 ttgatgaaga 305  Q
    ||||| ||||    
T  47831825 ttgattaaga 47831816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20110708 - 20110562
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  20110708 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtata-- 20110611  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
             | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20110610 ---------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 20110562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 205 - 302
Target Start/End: Original strand, 811142 - 811240
Alignment:
Q  205 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811142 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 811240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 217 - 305
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505410
Alignment:
Q  217 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaaga 28505410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Original strand, 11996033 - 11996139
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11996033 gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttg 11996132  T
Q  299 atgaaga 305  Q
     ||||||    
T  11996133 ttgaaga 11996139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Original strand, 15754893 - 15754999
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15754893 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 15754992  T
Q  299 atgaaga 305  Q
     ||||||    
T  15754993 ttgaaga 15754999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16056450 - 16056343
Alignment:
Q  192 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||| ||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16056450 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttg-tttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggt 16056352  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||||||||    
T  16056351 ctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 305
Target Start/End: Original strand, 14932685 - 14932846
Alignment:
Q  146 tgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgac-ttgcatttgatattattatgtcatgctgtt-ttgta 243  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | | || |||||| |  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14932685 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 14932784  T
Q  244 tactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
      || |||||| |  | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14932785 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaaga 14932846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 305
Target Start/End: Original strand, 15356120 - 15356281
Alignment:
Q  146 tgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgac-ttgcatttgatattattatgtcatgctgtt-ttgta 243  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | | || |||||| |  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15356120 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15356219  T
Q  244 tactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
      || |||||| |  | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15356220 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaaga 15356281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 305
Target Start/End: Original strand, 15360234 - 15360395
Alignment:
Q  146 tgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgac-ttgcatttgatattattatgtcatgctgtt-ttgta 243  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | | || |||||| |  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15360234 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15360333  T
Q  244 tactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
      || |||||| |  | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15360334 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaaga 15360395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 305
Target Start/End: Original strand, 18154773 - 18154953
Alignment:
Q  131 tgttaatgttgattatgatgtgatataatgt--aatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattat 227  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||  ||  |||||||||  ||||    
T  18154773 tgttaatgttgaatatgatgcgatataatgtttaat-tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt--atttgatatcgttat 18154869  T
Q  228 gtcatg-----ctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    || |||     ||||| |||||  |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18154870 gtgatgtcatactgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaaga 18154953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 296
Target Start/End: Original strand, 10063813 - 10063921
Alignment:
Q  189 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| |||| || |||| |||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10063813 atatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtc 10063912  T
Q  288 ggtctaagt 296  Q
     ||||||||    
T  10063913 agtctaagt 10063921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 26355983 - 26356150
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26355983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26356082  T
Q  248 gcc----------tatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |            | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  26356083 gttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaaga 26356150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 26358435 - 26358602
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26358435 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26358534  T
Q  248 gcc----------tatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |            | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  26358535 gttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaaga 26358602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12901431 - 12901338
Alignment:
Q  209 ttgcatttgatattattatgtcatgc--tgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||||| |||| |||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12901431 ttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 295
Target Start/End: Original strand, 20220194 - 20220290
Alignment:
Q  202 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20220194 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14044828 - 14044761
Alignment:
Q  233 gctgttttgtatactgcctatgttg-ttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||| | |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044828 gctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14354858 - 14354791
Alignment:
Q  233 gctgttttgtatactgcctatgttg-ttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||| | |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354858 gctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18203891 - 18203831
Alignment:
Q  235 tgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18203891 tgttttatgtactgtctatgttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatctaag 18203831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 203
Target Start/End: Original strand, 19649421 - 19649494
Alignment:
Q  131 tgttaatgttgattatgatgtgatataatg--taatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg 203  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  19649421 tgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaat-tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 19649494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 48991260 - 48991206
Alignment:
Q  235 tgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcg 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  48991260 tgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 48991206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 265
Target Start/End: Original strand, 2530140 - 2530208
Alignment:
Q  196 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgtt 265  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||    
T  2530140 agatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tttgtatgttgcctatgttgctgttgtt 2530208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 78
Target Start/End: Original strand, 10063678 - 10063707
Alignment:
Q  49 gagttgttgagagttgaaccttggggtagt 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10063678 gagttgttgagagttgaaccttggggtagt 10063707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 295
Target Start/End: Original strand, 9033400 - 9033448
Alignment:
Q  247 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9033400 tgcctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 9033448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 84
Target Start/End: Original strand, 9751390 - 9751442
Alignment:
Q  32 tgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgag 84  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9751390 tgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttgaaccttgggatagtaatgag 9751442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20619447 - 20619399
Alignment:
Q  247 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20619447 tgcctatgttgttgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 20619399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Original strand, 339777 - 340059
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  339777 cttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagtcgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgacgttaattataatctgtgaagc 339875  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  339876 tgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttga 339973  T
Q  219 tattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  339974 tattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttg-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaaga 340059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 158450 - 158606
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  158450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 158549  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  158550 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 158606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 71418 - 71350
Alignment:
Q  196 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgtt 265  Q
    |||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  71418 agatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 71350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 645 - 352
Alignment:
Q  11 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  645 cagagtgtcttgttaggtttttgcaacctttgttgcatgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataata 546  T
Q  111 tgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 210  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  | |||||| |||||||||||||||    
T  545 tatgaagctgtttaa-gatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgactt 447  T
Q  211 gcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
     || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  446 ccaattgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaaga 352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 3763 - 3479
Alignment:
Q  20 ttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagct 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3763 ttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctatgaagct 3665  T
Q  120 gtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgat 219  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  3664 gttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgat 3566  T
Q  220 attattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3565 attattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaaga 3479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40207 - 39922
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40207 cttgttaggtgtttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 40108  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    | ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    |||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  40107 tcttt-atgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttga 40009  T
Q  219 tattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40008 tattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaaga 39922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 194 - 295
Target Start/End: Original strand, 19883 - 19987
Alignment:
Q  194 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 290  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  19883 tgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggt 19982  T
Q  291 ctaag 295  Q
    |||||    
T  19983 ctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26190 - 25905
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26190 cttgttaggattttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagc 26091  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26090 tgtttaa-gatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttga 25992  T
Q  219 tattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25991 tattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaaga 25905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40151 - 39867
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  40151 cttgttatgattttgcgacctttgttgcacaatttgttgagagttgaaccttggg-tagcattgagacttaatgaggatgttaattataatttgtgaagc 40053  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40052 tgtttaa-gatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttga 39954  T
Q  219 tattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  39953 tattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaaga 39867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 52208 - 51922
Alignment:
Q  17 gtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaa 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52208 gtcttgttaggtttt-gcgacctt-gttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaa 52111  T
Q  117 gctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcattt 216  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  52110 gctgttt-aagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaatt 52012  T
Q  217 gatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52011 gatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 51922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 167815 - 168090
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  167815 ttttgcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgttt-aaga 167913  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  167914 tgtgttttggttgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatg 168012  T
Q  229 tcatgct-gttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  168013 tcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 168090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4799 - 4519
Alignment:
Q  22 gttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgt 121  Q
    |||||| |||||||| |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4799 gttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgt 4700  T
Q  122 ttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatat 221  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4699 ttaa-gatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatat 4601  T
Q  222 tattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 303  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4600 tattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaa 4519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12381 - 12101
Alignment:
Q  22 gttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgt 121  Q
    |||||| |||||||| |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12381 gttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgt 12282  T
Q  122 ttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatat 221  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12281 ttaa-gatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatat 12183  T
Q  222 tattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 303  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12182 tattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaa 12101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22333 - 22053
Alignment:
Q  22 gttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgt 121  Q
    |||||| |||||||| |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22333 gttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgt 22234  T
Q  122 ttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatat 221  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22233 ttaa-gatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatat 22135  T
Q  222 tattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 303  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22134 tattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaa 22053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Original strand, 16426 - 16712
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    |||||| || |||||||| || ||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16426 cttgttgggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaggagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagc 16525  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  16526 tgtttaa-gatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttga 16624  T
Q  219 tattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16625 tattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaaga 16712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Original strand, 8351 - 8641
Alignment:
Q  11 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgggg-tagtattgagacttaatgatgatgttaattataat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  8351 cagagtgtcttgttaggtttt-gcgaccttcgttgcacgagttgttgagagttgaacgttgggggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataat 8449  T
Q  110 ctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgact 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||| ||||| ||||||||    
T  8450 ctgtgaagctgtttaa-gatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgact 8548  T
Q  210 tgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8549 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgccta---tgttgctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 8641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13496 - 13220
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13496 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagctgttt-aaga 13398  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  13397 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatg 13298  T
Q  229 tcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13297 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 13220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2136 - 1860
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2136 ttttgtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctattt-aaga 2038  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  2037 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatg 1938  T
Q  229 tcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1937 tcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 1860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 84
Target Start/End: Original strand, 207359 - 207411
Alignment:
Q  32 tgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgag 84  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  207359 tgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttgaaccttgggatagtaatgag 207411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 8777 - 8488
Alignment:
Q  11 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 110  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8777 cagagtgtcttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattacaatc 8679  T
Q  111 tgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 210  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||| ||    || || ||| |||||||||||||||    
T  8678 tgtgaagctgttt-aggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgactt 8584  T
Q  211 gcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8583 gcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 8488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 296
Target Start/End: Original strand, 24137 - 24406
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24137 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaactttgggatagtattaagacttattgaggatgttaattataatctgtgaagctgttt-aaga 24235  T
Q  129 tgtgttaatgttg-attatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 227  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||    
T  24236 tgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttat 24335  T
Q  228 gtcatgc--tgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24336 gtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 5957 - 6236
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  5957 ttttgcgacctttgttgcacgagttatcgagagtggaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataaaatgtgaagctgttt-aaga 6055  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||| |||    
T  6056 tgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatg 6155  T
Q  229 tcatgctg-ttttgtatactgccta---tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6156 tcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 6236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13388 - 13144
Alignment:
Q  17 gtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaa 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13388 gtcttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaagatgttaattataatctgtgaa 13290  T
Q  117 gctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcattt 216  Q
     |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  13289 actgttt-aagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaatt 13191  T
Q  217 gatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgtt 262  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13190 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 34238 - 34132
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34238 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttg 34139  T
Q  299 atgaaga 305  Q
     ||||||    
T  34138 ttgaaga 34132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 328 - 282
Alignment:
Q  259 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  328 tgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaaga 282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 885 - 1160
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  885 ttttgcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgttt-aaga 983  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  984 tgtgttttggttgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatg 1082  T
Q  229 tcatgct-gttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1083 tcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 1160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28125 - 27911
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||| ||| |||||| | || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  28125 cttgtcaggattttgcaatctgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagt 28026  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28025 tgtttaa-gatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 27927  T
Q  219 tattattatgtcatgc 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  27926 tattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4816 - 4545
Alignment:
Q  21 tgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4816 tgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttgaggtagtattgagacttattgaagatgttaattataatttgtgaggctg 4717  T
Q  121 tttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgata 220  Q
    ||| ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||| ||  ||||||||    
T  4716 ttttaaga--tgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgata 4619  T
Q  221 ttattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    |||| || || ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4618 ttatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 255
Target Start/End: Original strand, 781 - 1021
Alignment:
Q  11 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatc 110  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||     
T  781 cagagagtcttgttaggatttttcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatggtgatgctatttatgata 880  T
Q  111 tgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  881 tgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgactt 979  T
Q  211 gcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgt 255  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  980 gca-ttgatattattatgccatgctg--ttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 248 - 305
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4945
Alignment:
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaaga 4945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 5)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 305
Target Start/End: Original strand, 32783 - 33068
Alignment:
Q  17 gtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaa 116  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||    
T  32783 gtcttgttaggattttgcgatctgtgtcgcaccaattgttaagagttgaaccttggggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataatctgtgaa 32882  T
Q  117 gctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcattt 216  Q
    ||| ||| | ||||   | |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| ||| ||| |||| |||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  32883 gctattttatgatgc--tgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtat-aatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatt 32979  T
Q  217 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32980 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 33068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 46222 - 45937
Alignment:
Q  17 gtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaa 116  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||    
T  46222 gtcttgttaggattttgcgatctgtgtcgcaccaattgttaagagttgaaccttggggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataatctgtgaa 46123  T
Q  117 gctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcattt 216  Q
    ||| ||| | ||||   | |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| ||| ||| |||| |||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  46122 gctattttatgatgc--tgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtat-aatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatt 46026  T
Q  217 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46025 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 45937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 103 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16323 - 16122
Alignment:
Q  103 ttataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgtt 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  16323 ttataatctgtgaagctgttttaagatgt--tgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgat 16226  T
Q  203 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 301  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16225 gttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 16126  T
Q  302 aaga 305  Q
    ||||    
T  16125 aaga 16122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 16390 - 16323
Alignment:
Q  11 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagt 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16390 cagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagt 16323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17441
Alignment:
Q  253 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaaga 17441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 110 - 305
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3298
Alignment:
Q  110 ctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgact 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  3103 ctgtgaagctgtttaa-gatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaat 3201  T
Q  210 tgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3202 tacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 3298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 5134 - 4858
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||| || ||| | | ||||||||||| |  ||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  5134 ttttgccacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttggctagcaataagacttaatgaaggggttagctataatctgtgaagctgtttaa-ga 5036  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttga--attatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattatta 226  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||  |||||   || ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5035 tgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatt--tgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattatta 4938  T
Q  227 tgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4937 tgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 4858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 13780 - 13507
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  13780 ttttgcgacttttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttcggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataa-ga 13682  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    | |||   |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||  ||||||  | |||||||| ||| | | | |||||||||| |||    
T  13681 tatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatcgaaattgatattatcatg 13583  T
Q  229 tcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 304  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13582 tcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 13507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2237 - 1961
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | |||| | ||||| ||| ||||||| | | ||    
T  2237 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgataaggttattaataatatgtaaagctgtat-atga 2139  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    | ||||  |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  2138 tatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatg 2039  T
Q  229 tcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2038 tcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 1961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21196 - 20919
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21196 ttttgcgacctttgttgcacgagttgatcagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataacctgtgaagctgttt-aaga 21098  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |  |    || |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21097 tgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatg 20998  T
Q  229 tcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||| || ||||| ||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||    
T  20997 tcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaaga 20919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 88 - 251
Target Start/End: Original strand, 3424 - 3588
Alignment:
Q  88 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatg 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||    
T  3424 taatgatgatgttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtg 3523  T
Q  188 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcct 251  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3524 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 5006 - 4721
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||     
T  5006 cttgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagt 4907  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||| ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||  ||   ||||||  | |||| ||| ||| ||||| ||||    
T  4906 tgtataa-gatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattga 4809  T
Q  219 tattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4808 tgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 4721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 230 - 1
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||     
T  230 cttgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagt 131  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttga 218  Q
    ||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||  ||   ||||||  | |||| ||| ||| ||||| ||||    
T  130 tgtat-aagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgt-ttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattga 33  T
Q  219 tattattatgtcatgctg-ttttgtatactgc 249  Q
    | |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  32 tgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 32349 - 32076
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  32349 ttttgcgacctttgttgctctagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataa-ga 32251  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    | |||   |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  32250 tatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatg 32152  T
Q  229 tcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32151 tcatgttgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 32076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 10262 - 10535
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  10262 ttttgcgaccattgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtat-aaga 10360  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    | |||   || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||   |||||| || |||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  10361 tatgtcgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatg 10459  T
Q  229 tcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10460 tcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 10535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 15301 - 15575
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15301 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgactcgttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataa-ga 15399  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    | ||||  || |||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||  ||   | ||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  15400 tatgttgttgatgattatgatgtgatataatatt-tatgcattacttgaagaatatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatg 15498  T
Q  229 tcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15499 tcatgttgttttgtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaaga 15575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 124886 - 124722
Alignment:
Q  12 agagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatct 111  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  124886 agagtgtcttgttagatttt-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatct 124788  T
Q  112 gtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaa 178  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  124787 gtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaa 124722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 131 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 174949 - 174776
Alignment:
Q  131 tgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgt-gcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgt 229  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||    
T  174949 tgttagtgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgt 174850  T
Q  230 catgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 304  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  174849 catgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 174776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121775
Alignment:
Q  245 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 121775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 136370 - 136471
Alignment:
Q  197 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||||| | || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  136370 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtcta 136469  T
Q  294 ag 295  Q
    ||    
T  136470 ag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 145078 - 145179
Alignment:
Q  197 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||||| | || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  145078 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtcta 145177  T
Q  294 ag 295  Q
    ||    
T  145178 ag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 99 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 116631 - 116436
Alignment:
Q  99 ttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||        ||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116631 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatatgttaatgttgattatgatgtc-------gtactt---attacttgaattatgaatgtatatttgaga 116542  T
Q  199 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116541 tgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 116443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 295
Target Start/End: Original strand, 128967 - 129072
Alignment:
Q  192 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc--tgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcg 288  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||   |||||| | |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  128967 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcg 129065  T
Q  289 gtctaag 295  Q
    |||||||    
T  129066 gtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 78445 - 78345
Alignment:
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  78445 ttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 78347  T
Q  290 tc 291  Q
    ||    
T  78346 tc 78345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7547 - 7275
Alignment:
Q  30 tttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||  | |||||    
T  7547 tttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaat-aagat 7449  T
Q  130 gtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgt 229  Q
     ||||  |||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||  |||  ||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |    
T  7448 atgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattattt 7350  T
Q  230 catgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  7349 catgttg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 7275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1570 - 1298
Alignment:
Q  30 tttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||  | |||||    
T  1570 tttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaat-aagat 1472  T
Q  130 gtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgt 229  Q
     ||||  |||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||  |||  ||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||    
T  1471 atgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgt 1373  T
Q  230 catgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||| ||  ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  1372 catgatg--ttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 1298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15350
Alignment:
Q  246 ctgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15291 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaaga 15350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6895 - 6669
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| | | ||    
T  6895 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagatttaatgataaggttatttataatctgtaaagctgtat-atga 6797  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  6796 tatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatg 6697  T
Q  229 tcatgctg-ttttgtatactgcctatgt 255  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||    
T  6696 tcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13421 - 13147
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||  | ||    ||||| | ||| || |||||||||||||||    
T  13421 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttaaaccttggggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgtt 13322  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtata-tttgagatgttgttgacttgcatttgatat 221  Q
      ||||||  || |||||| |||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||  ||| ||  ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  13321 ataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatat 13222  T
Q  222 tattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13221 tgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 299
Target Start/End: Original strand, 15929 - 16206
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||  | ||    ||||| | ||| || |||||||||||||||    
T  15929 ttaggattttgcgatctttgtcgcacaagttgttatgagttgaacctttgggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgtt 16028  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
      ||||||  || |||||| |||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||  | | || |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16029 ataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatatt 16128  T
Q  223 attatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
     |||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16129 gttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2741 - 2680
Alignment:
Q  235 tgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2741 tgttttatgtactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16564 - 16291
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||    
T  16564 ttttgtgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaacgcttgggtaggattaagacttaataatgaggttaactataatctgtgaagctgaat-aaga 16466  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    | ||||  |||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||  |||  ||||||  | | |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||    
T  16465 tatgttgttgttgattatgatgtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataatatgttgatgaattgaatttgatataattatg 16367  T
Q  229 tcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16366 tcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 16291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 168 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8613 - 8481
Alignment:
Q  168 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgtta 266  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  8613 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtta 8514  T
Q  267 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8513 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 6661 - 6547
Alignment:
Q  189 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6661 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 6562  T
Q  288 ggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||    
T  6561 ggtctaagttgatga 6547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 295
Target Start/End: Original strand, 51720 - 51985
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||||  | ||    
T  51720 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggggtagcattaagacttgaatatgatattaattacaatttgtgaagctgtt--atga 51817  T
Q  129 tgtgttaatgttga-ttatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatg-ttgttgacttgcatttgatattatta 226  Q
      | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | | |||| ||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  51818 gatattaatgttgatttatgatgtgatataatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgca-ttgatattatta 51915  T
Q  227 tgtcatgct-gttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||| ||||  ||||| || ||||||||||  |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51916 tgtcttgctatttttgaatgctgcctatgtgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32658 - 32551
Alignment:
Q  192 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32658 tttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 32560  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||||||||    
T  32559 ctaagttga 32551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 295
Target Start/End: Original strand, 20255 - 20524
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||   ||    || |||||||| || ||||||||||||| |    
T  20255 ttaggattttgcggtctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccttgggatagttatgaatattgtatataatgttaatgatgatctgtgaagctgat 20354  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
    | | ||||  || |||||  ||||  |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20355 ttatgatgatttgatgtt--ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 20452  T
Q  223 attatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20453 attatgtcatgttgttttgtatactg-atgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128760
Alignment:
Q  148 atgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatact 247  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |    
T  128917 atgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttttttt 128818  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
       | ||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  128817 ttttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaaga 128760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 200
Target Start/End: Original strand, 65730 - 65800
Alignment:
Q  131 tgttaatgttgattatgatgtgatataatg--taatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatg 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  65730 tgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaat-tgcattaattgaattatgaatgaatgattgagatg 65800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10458 - 10323
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10458 cttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaataataatctgtgaagc 10359  T
Q  119 tgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgata 155  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10358 tgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1198 - 1052
Alignment:
Q  30 tttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1198 tttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacttttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagatgttt-aagat 1100  T
Q  130 gtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttga 177  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  1099 gtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 888 - 1161
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||| || |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  888 ttttgcaacctttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagtcttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgtataaa-a 986  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    | ||||  |||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||    
T  987 tatgttgttgttgattatgatgtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataattatg 1085  T
Q  229 tcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  1086 tcatgatg--ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 1161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 196 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 28533 - 28423
Alignment:
Q  196 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 294  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28533 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 28434  T
Q  295 gttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||    
T  28433 gttgatgaaga 28423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11301
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11407 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 11308  T
Q  299 atgaaga 305  Q
     ||||||    
T  11307 ttgaaga 11301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2112 - 2006
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2112 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 2013  T
Q  299 atgaaga 305  Q
     ||||||    
T  2012 ttgaaga 2006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4561
Alignment:
Q  261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 4561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Original strand, 4967 - 5240
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||| ||||| || | |||||||||||| |||||| |||  |||| |    
T  4967 ttttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagatttaataataaggttaattataatatgtgaaactgaataaa-a 5065  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    | ||||  ||||||||| |||||| ||||||||  | | |||||||||||  |||  ||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||    
T  5066 tatgttgttgttgattaagatgtgttataatgt-ttatacattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatg 5164  T
Q  229 tcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||| ||  ||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  5165 tcatgatg--ttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 5240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3765 - 3640
Alignment:
Q  30 tttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagat 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3765 tttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgttt-aagat 3667  T
Q  130 gtgttaatgttgattatgatgtgatat 156  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||    
T  3666 gtgttgttgttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 7829 - 7704
Alignment:
Q  30 tttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagat 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7829 tttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgttt-aagat 7731  T
Q  130 gtgttaatgttgattatgatgtgatat 156  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||    
T  7730 gtgttgttgttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 299
Target Start/End: Original strand, 27663 - 27855
Alignment:
Q  108 atctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttga 207  Q
    |||||||||||||||  ||||||  || |||||| |||| ||||||||||||   || ||||||||| |||||||   || || ||||||||||||||||    
T  27663 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttga 27762  T
Q  208 cttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
     || ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27763 tttacatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 44600 - 44460
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--ttttgtatactgcctatgttgttgttg 263  Q
    |||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||| |||||    
T  44600 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactg-ttgtgttgctgttg 44502  T
Q  264 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44501 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 44460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17596
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17540 g-ctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 17596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 94573 - 94417
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  94573 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 94474  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  94473 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 94417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 189 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 100500 - 100386
Alignment:
Q  189 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  100500 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 100401  T
Q  288 ggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||    
T  100400 ggtctaagttgatga 100386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 302
Target Start/End: Original strand, 40169 - 40283
Alignment:
Q  189 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||  |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  40169 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtc 40268  T
Q  288 ggtctaagttgatga 302  Q
     ||||||||||||||    
T  40269 agtctaagttgatga 40283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 243 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119884
Alignment:
Q  243 atactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 119884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101511
Alignment:
Q  238 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatga 101511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 287
Target Start/End: Original strand, 38394 - 38573
Alignment:
Q  107 aatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 206  Q
    ||||||||||||||||  | ||  |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |  ||| | || ||  || |||||||||||    
T  38394 aatctgtgaagctgtt--atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttg 38491  T
Q  207 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    |  || | |||||||||  | |||||| |||| ||||   ||| ||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38492 aaatgaaattgatattaagaagtcatgttgttgttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 38573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 175
Target Start/End: Original strand, 23581 - 23647
Alignment:
Q  107 aatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattactt 175  Q
    ||||||||||||||||  | ||  |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23581 aatctgtgaagctgtt--atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattactt 23647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20909 - 20753
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20909 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20810  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20809 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 20753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 37983 - 37827
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 37884  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37883 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 37827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 136842 - 136686
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-tttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  136842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 136743  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  136742 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 136686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 139311 - 139155
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-tttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  139311 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 139212  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  139211 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 139155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 144249 - 144093
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-tttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  144249 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 144150  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  144149 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 144093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 134373 - 134217
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-tttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  134373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 134274  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  134273 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaaga 134217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 141780 - 141624
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-tttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  141780 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 141681  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  141680 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaaga 141624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 62321 - 62216
Alignment:
Q  189 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  62321 atatttgagatgttgttg---tgcattcgatattattataccatgatgtttttcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtc 62225  T
Q  288 ggtctaagt 296  Q
    ||| |||||    
T  62224 ggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 132736 - 132670
Alignment:
Q  237 ttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  132736 ttttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatga 132670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 149 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4705
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4756 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13537 - 13398
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgt 264  Q
    |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||    
T  13537 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgt 13439  T
Q  265 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13438 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 13398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Original strand, 17814 - 17927
Alignment:
Q  19 cttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagc 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17814 cttgttaggtttt-gcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagc 17912  T
Q  119 tgtttaaagatgtgtt 134  Q
    ||||| ||||||||||    
T  17913 tgttt-aagatgtgtt 17927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 225698 - 225465
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   |||   ||||| ||||| || | ||||||||||| |    
T  225698 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagttatgaagattatatatgatattaataatgaactgtgaagctgat 225599  T
Q  123 taaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatt 222  Q
      | ||||  || |||||| |||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  225598 atatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatatt 225500  T
Q  223 attatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttg 257  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  225499 attatatcacgctgttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10779
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||| ||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10835 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 10779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14109 - 13953
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14109 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14010  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14009 g-ttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501090
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  501146 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 501090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 160809 - 160696
Alignment:
Q  189 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  160809 atatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtc 160711  T
Q  288 ggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||    
T  160710 ggtctaagttgatga 160696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 305
Target Start/End: Original strand, 85539 - 85736
Alignment:
Q  108 atctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttg 206  Q
    ||||||||||||| || | ||||  || |||||| ||||  |||||||||||   || ||||||| |||||||||   || ||| || ||| |||| |||    
T  85539 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattg 85637  T
Q  207 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  85638 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaaga 85736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 497494 - 497445
Alignment:
Q  246 ctgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  497494 ctgcctatgttgttgttgtatattaactaagctgcatgtgtcggtttaag 497445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 47267 - 47004
Alignment:
Q  33 gcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||  ||||       |||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  47267 gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgag------tataatctgtgaagctgtataa-gatatg 47175  T
Q  133 ttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 232  Q
    ||  || || |||||||||||||||||||  | ||||||||||| |  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  47174 ttgttgatgtttatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcat 47076  T
Q  233 gctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||| |  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  47075 gctgct--gtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaaga 47004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 305
Target Start/End: Original strand, 17882 - 18139
Alignment:
Q  49 gagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatga 148  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||   ||| | |  || ||||| || ||||||||||||| || | ||||  || |||||| |||| |    
T  17882 gagttgttgaaagttgaaccttggggtagttatgaatattatttacaatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataa 17981  T
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg 248  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||| || ||| ||    
T  17982 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgtgcataatg 18081  T
Q  249 cctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  18082 catatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaaga 18139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 300
Target Start/End: Original strand, 2088 - 2280
Alignment:
Q  108 atctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttg 206  Q
    ||||||||||||| || | ||||  || |||||| ||||  |||||||||||   || ||||||| |||||||||   || ||| |||||| |||  |||    
T  2088 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattg 2186  T
Q  207 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2187 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgat 2280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16946 - 16790
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16946 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 16847  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
     | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16846 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 16790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82078
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
      || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  82134 -actgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaaga 82078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 168 - 299
Target Start/End: Original strand, 22645 - 22776
Alignment:
Q  168 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gtta 266  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||| | |||| ||||    
T  22645 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtcgctgtttgtta 22743  T
Q  267 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22744 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11294
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||| ||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11350 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaaga 11294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 51864 - 51601
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaaga 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||| | |||||| ||| ||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||  ||| ||    
T  51864 ttttgcgacttttgttgcacgagttgtcgagaattggacccttgggtaggattaagacttaagagtgaggttaactataatctgtgaagctgaataa-ga 51766  T
Q  129 tgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatg 228  Q
    | ||||  |||||| ||||| ||| ||||||||  | |||||| ||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||    
T  51765 tatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtt-tatgcatttcttgaaggatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgttataattatg 51667  T
Q  229 tcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51666 tcatgatgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19390 - 19276
Alignment:
Q  189 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19390 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 19291  T
Q  288 ggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||    
T  19290 ggtctaagttgatga 19276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 12249 - 12405
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 247  Q
    |||||||||||   || ||||||||||||||||    || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  12249 tgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattct 12348  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12349 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaaga 12405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9248
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttg-tatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||| ||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  9404 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 9305  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9304 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 9248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40562 - 40406
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 247  Q
    |||||||||||   || ||||||||||||||| |   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  40562 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatact 40463  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  40462 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaaga 40406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 295
Target Start/End: Original strand, 60544 - 60818
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattg-agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgt 121  Q
    ||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| | || ||| |  || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  60544 ttagggttttgtgatctttgtcgcacgagatgttatgagttgaaccttggggtaggaatggagattgtat-atgatattaatgataatctgtgaagctgt 60642  T
Q  122 ttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatat 221  Q
    |  || |||  || |||||| | || |||||||||| |   || |||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  60643 tataaaatgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatat 60741  T
Q  222 tattatgtcat--gctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  60742 tggtatatcatgagctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 168 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 130051 - 129917
Alignment:
Q  168 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgt-tgtta 266  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  130051 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtgtgtta 129953  T
Q  267 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  129952 tttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatga 129917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 125
Target Start/End: Original strand, 11349 - 11445
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11349 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtagagagttgaacctttgggtagaattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctgattaa 11445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 198 - 305
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11555
Alignment:
Q  198 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 296  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 11546  T
Q  297 tgatgaaga 305  Q
    || ||||||    
T  11547 tgttgaaga 11555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 295
Target Start/End: Original strand, 53491 - 53651
Alignment:
Q  136 atgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 235  Q
    |||||| |||| ||||||||||||   || | |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  53491 atgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgtt 53590  T
Q  236 gttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  53591 gttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 168 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 275 - 141
Alignment:
Q  168 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgtta 266  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||     
T  275 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttg 177  T
Q  267 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  176 tttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatga 141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 302
Target Start/End: Original strand, 2801 - 2915
Alignment:
Q  189 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  2801 atatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 2900  T
Q  288 ggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||| ||||||    
T  2901 ggtctaagatgatga 2915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 112
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  268 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 169  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
       | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  168 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaaga 112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4303
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   ||  || |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4459 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4360  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
     | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4359 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 4303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20688 - 20595
Alignment:
Q  29 ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20688 ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggaatagcattaagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtt 20595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 168 - 299
Target Start/End: Original strand, 10516 - 10647
Alignment:
Q  168 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgtta 266  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  10516 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgtta 10614  T
Q  267 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10615 tttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1051
Alignment:
Q  189 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||||||| ||| | | |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 1059  T
Q  288 ggtctaag 295  Q
    ||||||||    
T  1058 ggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 305
Target Start/End: Original strand, 38679 - 38814
Alignment:
Q  171 tacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttattt 269  Q
    ||||||||||||  ||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  38679 tacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttattt 38778  T
Q  270 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  38779 aactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaaga 38814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4377 - 4220
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatac 246  Q
    |||||||||||   || ||||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4377 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatac 4278  T
Q  247 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||| | ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4277 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaaga 4220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 190 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12693 - 12587
Alignment:
Q  190 tatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcg 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||| |||||||||    
T  12693 tatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcg 12594  T
Q  289 gtctaag 295  Q
    |||||||    
T  12593 gtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Original strand, 15445 - 15500
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagt 78  Q
    ||||| |||| ||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15445 ttaggatttttcgatctttgtcgcacgaatcgttgagagttgaaccttggggtagt 15500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12220 - 12070
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 247  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12220 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatact 12121  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||   ||    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12120 gc---tg----tgttgctgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 12070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 5769 - 5655
Alignment:
Q  189 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||  ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  5769 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttcatactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtc 5670  T
Q  288 ggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||    
T  5669 ggtctaagttgatga 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 204 - 305
Target Start/End: Original strand, 1336 - 1437
Alignment:
Q  204 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1336 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-catgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 1434  T
Q  303 aga 305  Q
    |||    
T  1435 aga 1437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 149 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 30094 - 29946
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 247  Q
    |||||||||||   || || |||| |||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30094 tgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29995  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29994 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10650 - 10542
Alignment:
Q  192 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 290  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10650 tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggt 10551  T
Q  291 ctaagttga 299  Q
    |||||||||    
T  10550 ctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11680 - 11473
Alignment:
Q  99 ttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 198  Q
    ||||| || |||||||||||||  | | ||||  || |||||| |||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||   ||  |||||||||    
T  11680 ttaatgatgatctgtgaagctgagtgatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 11581  T
Q  199 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 297  Q
    ||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||     
T  11580 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtc 11481  T
Q  298 gatgaaga 305  Q
    | ||||||    
T  11480 gttgaaga 11473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12954
Alignment:
Q  197 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaag 12958  T
Q  296 ttga 299  Q
    ||||    
T  12957 ttga 12954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 253
Target Start/End: Original strand, 18210 - 18298
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgttttgtatactgcctat 253  Q
    |||||||| ||||||||  ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||  |||||||| ||||||||||||    
T  18210 tgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctat 18298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 149 - 298
Target Start/End: Original strand, 161089 - 161239
Alignment:
Q  149 tgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatac 246  Q
    |||||||||||   || ||||||| |||||||||   || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  161089 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatac 161188  T
Q  247 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    ||| | ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  161189 tgc-tgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 161239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 232
Target Start/End: Original strand, 164550 - 164674
Alignment:
Q  108 atctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttg 206  Q
    ||||||||||||| || | ||||  || |||||| ||||  |||||||||||   || ||||||| |||||||||   || ||| ||||||||||| |||    
T  164550 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattg 164648  T
Q  207 acttgcatttgatattattatgtcat 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  164649 acttgcatttgatattattatgtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 192 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1205 - 1091
Alignment:
Q  192 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 290  Q
    ||||| |||||| |||| || ||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1205 tttgaaatgttgatgacctgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 1106  T
Q  291 ctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||||| ||||    
T  1105 ctaagttgattaaga 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 197 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12884 - 12778
Alignment:
Q  197 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12884 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaag 12785  T
Q  296 ttgatga 302  Q
    |||||||    
T  12784 ttgatga 12778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15776 - 15670
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15776 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttg 15677  T
Q  299 atgaaga 305  Q
    || ||||    
T  15676 attaaga 15670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1522 - 1452
Alignment:
Q  131 tgttaatgttgattatgatgtgatataatg--taatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatg 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  1522 tgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaat-tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatg 1452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 302
Target Start/End: Original strand, 2640 - 2754
Alignment:
Q  189 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||  |||| || |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2640 atatttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgatgatttacatactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 2739  T
Q  288 ggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||    
T  2740 ggtctaagttgatga 2754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Original strand, 1075 - 1181
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1075 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 1174  T
Q  299 atgaaga 305  Q
     ||||||    
T  1175 ttgaaga 1181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 305
Target Start/End: Original strand, 38198 - 38368
Alignment:
Q  136 atgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 235  Q
    |||||| |||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| |    
T  38198 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 38297  T
Q  236 gttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||    
T  38298 gttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaaga 38368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 302
Target Start/End: Original strand, 14692 - 14806
Alignment:
Q  189 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| || |||   |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14692 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttcttactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtc 14791  T
Q  288 ggtctaagttgatga 302  Q
    |||||||||||||||    
T  14792 ggtctaagttgatga 14806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 205 - 305
Target Start/End: Original strand, 15788 - 15889
Alignment:
Q  205 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 303  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15788 tgacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 15887  T
Q  304 ga 305  Q
    ||    
T  15888 ga 15889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 178961 - 178903
Alignment:
Q  247 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  178961 tgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaaga 178903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25385 - 25121
Alignment:
Q  35 gacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgtt 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||   || |  || || ||||| || |||||||||||||||  |||| |  ||    
T  25385 gacctttgtcgcacgagttgttgtgagttgatccttggggtagaaatgaaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataagacgattt 25286  T
Q  135 aatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg- 233  Q
     |||||| | || |||||||||| |   || | |||||| ||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||     
T  25285 gatgttg-taataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcatga 25189  T
Q  234 -ctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
     ||||||| |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25188 gctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 828 - 586
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattg-agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgt 121  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||| | || ||  | ||| || || ||| | || ||||||||||||||    
T  828 ttagggttttgcgatctttgttgcacgagattttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaat-ataatattactgatgatctgtgaagctgt 730  T
Q  122 ttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataa-tgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgata 220  Q
    |  || |||  || |||||| | || ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  729 tataatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgta-tatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgata 633  T
Q  221 ttattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttgttgtt 265  Q
    || |||| |||||  ||||||| | || || ||||||||||||||||    
T  632 ttgttatatcatgaactgttttatgtattgtctatgttgttgttgtt 586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 207 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6719 - 6620
Alignment:
Q  207 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6719 acttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 6620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 207 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14099 - 14000
Alignment:
Q  207 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14099 acttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 14000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24048 - 23848
Alignment:
Q  107 aatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 206  Q
    |||||||||||||||| | ||||||  || |||||| |||||||||||||||||| |  | ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||    
T  24048 aatctgtgaagctgttaagagatgt--tagtgttgaatatgatgtgatataatgttaatttcattacttgaactatgaatgaatgattgagatgttgctg 23951  T
Q  207 acttgcatttgatattattat-----gtcatgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 300  Q
      ||  |||||||||| ||||     ||||| ||||| |||||  ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23950 tttt--atttgatattgttatatgatgtcatactgttgttgtaatctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23853  T
Q  301 gaaga 305  Q
     ||||    
T  23852 caaga 23848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 302
Target Start/End: Original strand, 45791 - 45901
Alignment:
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 291  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45791 ttgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 45890  T
Q  292 taagttgatga 302  Q
    |||||||||||    
T  45891 taagttgatga 45901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 197 - 305
Target Start/End: Original strand, 1037 - 1146
Alignment:
Q  197 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| || |||| ||||| || | || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1037 gatgttgatgacttgcattcgatgttgttatatcatgatgatctgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1136  T
Q  296 ttgatgaaga 305  Q
    ||||| ||||    
T  1137 ttgattaaga 1146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 293
Target Start/End: Original strand, 8001 - 8161
Alignment:
Q  136 atgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--g 233  Q
    |||||| |||| |||||||||||| | || | |||||||||||||||  ||| || ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |    
T  8001 atgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgag 8100  T
Q  234 ctgttttgtatactgcctatgttg-ttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    ||| |||| |||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8101 ctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 305
Target Start/End: Original strand, 6134 - 6235
Alignment:
Q  205 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 303  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6134 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 6233  T
Q  304 ga 305  Q
    ||    
T  6234 ga 6235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Original strand, 8075 - 8180
Alignment:
Q  197 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||  ||| |||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8075 gatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggtttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtcta 8174  T
Q  294 agttga 299  Q
    ||||||    
T  8175 agttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 166 - 295
Target Start/End: Original strand, 6255 - 6386
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgttttgtatactgcctatgttgttg-tt 262  Q
    |||||||| ||||||||  ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||  |||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  6255 tgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgttt 6353  T
Q  263 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6354 gttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 295
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13840
Alignment:
Q  249 cctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 166 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 38466 - 38339
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgttttgtatactgcctatgttgttg-tt 262  Q
    |||||||| ||||||||  ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||  |||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  38466 tgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgttt 38368  T
Q  263 gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 291  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38367 gttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20165 - 19985
Alignment:
Q  131 tgttaatgttgattatgatgtgatataatgt--aatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatat-----t 222  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || |||  ||  |||||||||     |    
T  20165 tgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaat-tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgatgcttg--ttttatttgatattgttat 20069  T
Q  223 attatgtcatgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
    || ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |  | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  20068 atgatgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctactattgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaaga 19985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 6927 - 6824
Alignment:
Q  200 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  6927 gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatg 6828  T
Q  299 atga 302  Q
    ||||    
T  6827 atga 6824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8138 - 8088
Alignment:
Q  192 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8138 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgt 8088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 209 - 299
Target Start/End: Original strand, 23898 - 23989
Alignment:
Q  209 ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 299  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23898 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 23989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 97155 - 97024
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttg-tt 262  Q
    |||||||| ||||||||  ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||||||||||| || ||    
T  97155 tgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgttt 97057  T
Q  263 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
     ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  97056 atttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 106433 - 106302
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttg-tt 262  Q
    |||||||| ||||||||  ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||||||||||| || ||    
T  106433 tgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgttt 106335  T
Q  263 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
     ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  106334 atttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 259
Target Start/End: Original strand, 2213 - 2283
Alignment:
Q  189 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgtt 259  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  2213 atatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgtt 2283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 267784 - 267679
Alignment:
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 289  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  267784 ttgagatattgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcgg 267685  T
Q  290 tctaag 295  Q
    ||||||    
T  267684 tctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 265
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15486
Alignment:
Q  140 tgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattactt--gaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||   || |||||  |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||     
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatt--tgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg- 15458  T
Q  238 tttgtatactgcctatgttgttgttgtt 265  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15459 tttgtatgctgcctatgttgatgttgtt 15486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 36248 - 36199
Alignment:
Q  246 ctgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36248 ctgcctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 36199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 28813 - 28879
Alignment:
Q  238 tttgtatactgcctatgttgttgt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28813 tttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 28879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 669 - 569
Alignment:
Q  197 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  669 gatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 571  T
Q  294 ag 295  Q
    ||    
T  570 ag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 295
Target Start/End: Original strand, 1795 - 1900
Alignment:
Q  193 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 289  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  || |||| |||||| ||||||||  |||| |||   |||||||||||||||||||||    
T  1795 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactacctatgttaatgttagtttaataactaagctgcatgagtcgg 1894  T
Q  290 tctaag 295  Q
    ||||||    
T  1895 tctaag 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 32202 - 32110
Alignment:
Q  212 catttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 302  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32202 cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatga 32110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 287
Target Start/End: Original strand, 16264 - 16442
Alignment:
Q  107 aatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 206  Q
    ||||||||||||||||  | ||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| | || ||  || |||||||||||    
T  16264 aatctgtgaagctgtt--atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttg 16361  T
Q  207 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtt-ttgt-atactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    |  |  | |||||||||| | |||||| |||| |||| ||| |||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16362 aaat-taattgatattatgaagtcatgatgttgttgtgata-tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  253 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 12220 - 12165
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagt 78  Q
    ||||| |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12220 ttaggattttgcgatctttgtcacacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagt 12165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2783 - 2694
Alignment:
Q  209 ttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 295  Q
    |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||  | | || |||||||||||||||||||||||||    
T  2783 ttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Original strand, 103632 - 103737
Alignment:
Q  197 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc--tgttttgtatactgcctatgttgttgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||   |||||| |||||| ||||||||| ||||  | | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  103632 gatgttgttgttttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttttatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtcta 103731  T
Q  294 agttga 299  Q
    ||||||    
T  103732 agttga 103737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 29720 - 29563
Alignment:
Q  150 gtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgac-ttgcatttgatattattatgtcatgctgtt-ttgtatact 247  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | | | || |||||| |  | |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  ||    
T  29720 gtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtcttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatct 29621  T
Q  248 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 305  Q
     |||||| |  | ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| ||||    
T  29620 acctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaaga 29563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 36662 - 36459
Alignment:
Q  107 aatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatg--taatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgt 204  Q
    ||||||||||||||||   ||||||  || |||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||     
T  36662 aatctgtgaagctgttatgagatgt--tagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaat-tgcattacttgaactatgaatgaatgattgagatgttgc 36566  T
Q  205 tgacttgcatttgatat-----tattatgtcatgctgtt-ttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 298  Q
        ||  |||||||||     ||| |||||||  |||| |||||   |||||||| |  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36565 gtgtttatatttgatatcgttatatgatgtcatattgttgttgtaatttgcctatgctactattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttg 36466  T
Q  299 atgaaga 305  Q
    || ||||    
T  36465 atcaaga 36459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 70000 - 69905
Alignment:
Q  107 aatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatg--taatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg 203  Q
    ||||||||||||||||   ||||||  || |||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  70000 aatctgtgaagctgttatgagatgt--tagtgttgaatatgatgtgatataatgattaat-tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 69905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 32650 - 32544
Alignment:
Q  96 atgttaattataatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatg--taatgtgcattacttgaattatgaatgtatatt 193  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||||||| ||  |    
T  32650 atgttaattgcaatctgtgaagctgtt--atgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaat-tgcattacttgagttatgaatgaatgat 32554  T
Q  194 tgagatgttg 203  Q
    ||||||||||    
T  32553 tgagatgttg 32544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29262 - 29117
Alignment:
Q  146 tgatgtgatataatgtaatgtgcattacttgaattatgaatg--tatatttgagatgttgttgac-ttgcatttgatattattatgtcatgctgtt-ttg 241  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||| | | | ||  ||||||| || ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  29262 tgatgtgatataatgttgtgtgtattacttgaagttttattgaatatatttaaggtgttgttaaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttg 29163  T
Q  242 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||  || |||||| |  | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29162 taatctacctatgctactattgttatttaactaagatgcatgagtc 29117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 293
Target Start/End: Original strand, 206566 - 206624
Alignment:
Q  235 tgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 293  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  206566 tgttttatgtactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 200
Target Start/End: Original strand, 15584 - 15676
Alignment:
Q  107 aatctgtgaagctgtttaaagatgtgttaatgttgattatgatgtgatataatg--taatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatg 200  Q
    ||||||||||||||||  | ||  |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  15584 aatctgtgaagctgtt--atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgagataatgattaat-tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatg 15676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13153 - 13092
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 227  Q
    |||||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13153 tgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 172
Target Start/End: Original strand, 1166 - 1205
Alignment:
Q  133 ttaatgttgattatgatgtgatataatgtaatgtgcatta 172  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1166 ttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcatta 1205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 154 - 57
Alignment:
Q  166 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgttttgtatactgcctatgttgttgtt 262  Q
    |||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  154 tgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgcatctgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtt 57  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 77
Target Start/End: Original strand, 24427 - 24481
Alignment:
Q  23 ttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtag 77  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||    
T  24427 ttaggtttttgcgatctttgtcgcacgagatgttatgagttgatccttggggtag 24481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 291
Target Start/End: Original strand, 813 - 858
Alignment:
Q  246 ctgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 291  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  813 ctgcctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 251 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9572 - 9536
Alignment:
Q  251 tatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 287  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9572 tatgttgttattgttatttaactaagttgcatgagtc 9536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University